2YLNA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the closed conformation
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
AISGSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords PUTATIVE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO
publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 90
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ylnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ylnA02
3PMWA 2OK2A 2UYFA 1N0TA 4XKPA 3MVXA 1S50A 1LAHE 1WODA 2GH9A 4OZ9A 4UA8A 3A3UA 1LCTA 5FTHA 3E13X 5I2NB 1AOVA 1YCJA 4PQJA 4ELQA 2FA7A 1FW0A 3C36A 4NE4A 1XHYA 4O3BA 5DVJA 4H5GA 2XXRA 3P7IA 4KI0E 3THIA 2A5TB 3FXQA 5LOMA 3G3FA 1USYH 3CRBA 3FVGA 5M2VA 3SESA 3FUZA 4ZS9A 1MH4A 1EH3A 3F11A 3ZKKA 1B7UA 2UVJA 4OHNA 2OZZA 1QKAA 1A40A 3M8UA 3L6GA 3V83A 4QSCA 4X1BA 4ZE9A 1SYHA 1Y3QA 4GF8A 3CSBA 4YMAA 1B1XA 2XXQA 1IXGA 4XIGQ 1BIYA 1N3XA 1YTVA 3HHGA 3U72A 1JQFA 3T9XB 2Q9TA 3K2DA 3KSJA 3MUQA 3HO7A 4MFIA 4BDQA 1LBBA 2H99A 3KN8A 4EQ7A 1MXVA 2W7YA 5I57B 2P2AA 5L9SA 3EN3A 4FEBA 1POTA 3HCQA 3KOSA 2P0SA 1LGBC 4QF9A 3FZVA 1AIVA 4OETA 2NVUB 1RKMA 4NMYA 4F3SA 2D5WA 5I2KB 1EZOA 1H45A 2YJPA 3KGCA 5AA4A 3TQWA 3TTMA 3EPEA 3FIRA 1IITA 1SI1A 1MY3A 4GLIA 3A3CA 5AA3A 3M3LA 1SW2A 2V25A 3IAZA 4M1VA 3AXFA 1N7WA 3H6WA 3QK6A 1LFIA 5AA2A 1NNTA 4DXCA 4EF1A 4ZEBA 4DXBA 4F2OA 3UORA 1P1WA 4QFKA 1URSA 5I59B 3EF7A 4OERA 1LFHA 2XD3A 1DOTA 4TLMB 1EZ9A 3M3FA 1O64A 1OQHA 1MXYA 3TAJA 1VR5A 1MXUA 4ZZAA 1P1OA 2O69A 2V3QA 5F1QA 4H8JA 1KWHA 1QJMA 4KYDA 2R71A 2X26A 2Y7IA 3N94A 2DE4A 2QPQA 4XKNA 1I69A 4U4XA 1NL5A 1LBCA 2F7BA 3FJ7A 3MPKA 4ECFA 2F7CA 3KJTA 2HCAA 1SD3A 3O28A 4JDFA 4KPTA 4ELPA 4EQBA 3U1OA 1OQGA 5BUUA 4YICA 1B7ZA 1MS7A 3TCFA 1JNFA 1XVXA 5H8QB 5EHMA 4DIGA 2F78A 4C1TA 4THIA 4E0XA 4IGRA 4WKMA 4XTCQ 5F7VA 4K3FA 3HHFA 1Z7ME 3SKPA 3H4ZA 4NF5B 4PE5B 3IO4A 4AQ4A 3N5LA 4R2FA 4PFTA 1FQFA 2O68A 2PVUA 3OD7A 1OLCA 2XXPA 4YKJA 4FIMA 3PU5A 1MY2A 2ANJA 4R6KA 2XX9A 5CMBA 3K00A 2XXXA 1VE4A 4F39A 1ZTYA 4KCDA 1GTKA 3RUMA 1UTHB 1XC1A 3OOAA 1AMFA 4IB2A 1LFGA 3UGWA 3MVYA 3PUVE 1UIUA 1TWYA 2Z8FA 1NNKA 3N6UA 2AL4A 2QS2A 4FE8A 2QS4A 4C1UA 1B1HA 3LBSA 4H6DA 3PPOA 5DT6A 3EHSA 3GLBA 2DXRA 2H98A 1B0HA 1B3HA 3PV0E 5KZTA 3RLFE 1H76A 3O6IA 1GV8A 2F97A 4IGTA 1EZPA 3OO6A 3ECRA 1XOCA 2PT2A 4H0WA 3QXMA 1A8EA 2I0BA 3Q26A 3KN3A 1B46A 2I49A 4X9TA 2XD2A 1Y4TA 3IO6A 1P1UA 1JEVA 2UXAA 1TXFA 3RY3A 2E0SA 5H8HB 2Q89A 1PEBA 1B52A 1Y1MA 2DYXA 3IX1A 2NXOA 1B7HA 5JTYB 5J1DA 3FGSA 2PT1A 3TTRA 2V93A 4KR5A 2Y7RA 3IB1A 1P1NA 3VVDA 2LAOA 2FYIA 1B58A 3O66A 4KYEA 4G68B 3R6UA 4YB7A 3KJ7A 5TU0A 1B5IA 2DSFA 2F6GA 4OYVA 4KCCA 4P0GA 4F3PA 4QSDA 1A7LA 3LR1A 5AA2D 2O1MA 3R26A 3FD3A 5KCJB 3E4RA 2RKMA 3U92A 3D4CA 1DTGA 2V3TA 3PD8A 4NF6A 3SEVA 1F9BA 2G93A 4IY5A 2O6AA 4YB5A 2XXUA 4OWDA 5ITOA 3O6HA 4Z0IA 4DXUA 1NKXA 4Z7EA 2RC8A 3T9VA 1OIBA 3MVZA 2F5XA 1I6QA 3OSRA 4ESXA 5DEXB 2ONKE 1IUDA 2VD3A 5ITPA 1ZBMA 3IOWA 4AB6A 1R1NA 5IKBA 5ICTA 1DSNA 3G3HA 5CMKA 1BTJA 3K6VA 1P1QA 4YAHX 5FHMA 4ZE8A 5BWJA 1FQEA 3PPNA 1ZKBA 4QHQA 4DZ1A 4H1XA 2QSXA 5FHNA 2F36A 4JSOA 3RTWB 3PD9A 2YLNA 1B3GA 4JWYA 3VV5A 1SVXB 2DWIA 3LC8A 1MXXA 5I58B 4IO5A 4WEPA 1LB8A 3K6XA 2VHAA 4PFYA 3EHTA 4TOZA 3H3GA 1MPCA 1N76A 5KDTA 1IXIA 1A54A 4U2RA 2ZYKA 2DP8A 2QL3A 5ICQA 1QULA 3O9PA 1MDQA 4P0IA 1H3DA 1VSOA 1H44A 2NOOA 2H9BA 4QSEA 3W9VA 4OQOA 2A5SA 2CMOA 4R72A 4POXA 4OFJA 2UVIA 3CFZA 4PP0A 3ILTB 3VVEA 3TUSA 1UTBB 2AIXA 1ZLQA 1MPDA 5ISUA 4EDPA 3U8QA 2I4CA 5CC2A 3B6TA 3B6QA 4R73A 1NFTA 1DTZA 3TKDA 2THIA 5JK4A 3Q29A 3HN0A 1QKBA 4EQ9A 3OEKA 4FEDA 4FAJA 5H8FB 4YU0A 5I56B 1LAXA 1DPPA 1Y9UA 2ONSA 3QUJA 4EXLA 2O84X 4YMBA 2XX8A 3VLVA 1JEUA 1MQJA 4U22A 3VLUA 4G2ZA 1B6HA 4KYSA 4LATA 3SEUA 1SW4A 3C9HA 3FV1A 4RYAA 3O29A 1P99A 2I48A 3VE1B 3PMXA 1B3FA 3I6VA 2Y7WA 3TZAA 2F7AA 3LUYA 4L17A 3G3JA 1M5DA 1TFDA 3S2VA 2Z8EA 4OTEA 4U1OA 2XXHA 2ZNUA 3TELA 4KD5A 4YZZA 1OMPA 3C31A 4MLQA 1MY4A 1BLFA 4P11A 5DYHA 2Z8DA 3TCHA 3CR9A 3LSLA 1DPEA 3SEWA 3C33A 3KZGA 3RT8A 4ZEFA 3LSWA 3ILUB 5B70A 3MZBA 4F1UA 3C35A 3FATA 1VFDA 4N07A 4GD5A 3G7WA 3QAXA 4HW8A 1H43A 4NF8B 1M5BA 2ZMBA 3OSQA 1B5HA 1JVXA 2REGA 1D4NA 1Q35A 3O6GA 3QIMA 1OVBA 1POY1 4KQPA 1QVSA 5AA4B 3OO8A 2GRVA 1FTOA 5TP9A 3K4UA 1AH5A 5H8SA 1YAEA 5H8QA 1EU8A 2DVCA 1S9TA 2ZYNA 2R6GE 3BBRA 2Q2CA 5L9MA 4Q30B 1HSLA 4ELRA 1YPNA 1S7YA 3IJXB 4LQ2A 2DXYA 3MC2A 2XX7A 1B32A 3MAMA 3K6UA 1FTMA 4NF5A 1MG1A 4QFPA 2PBWA 1FQCA 2UYEA 3ODBA 3IR1A 3OMBA 3MPLA 1PB8A 1LAFE 3BFTA 1O7TA 1D9VA 1MQIA 1Y3PA 1R6ZA 1M5EA 1A55A 3RT6B 4ONYA 4PETA 4GXSB 1ATGA 2X7QA 2VOZA 4F18A 5B7DA 1II5A 3ONMA 1AL3A 1UTHA 4DCYA 4DLDA 5I84A 3KN7A 1IIWA 2F34A 4EUOA 1NH8A 1QUKA 4ZEIA 3IL1B 3MP6A 4WXJA 1XVYA 5K2YA 4LQ5A 3Q25A 1GR2A 2HZKA 3EQ1A 3CFLA 3SEYA 1MM7A 5TPAB 3K1MA 1PC3A 5H8NB 2P1SA 3D4GA 2ONRA 2DQVA 2E1SA 3BFUA 2YPNA 3WAFA 1URGA 4NTLA 4H8IA 2OWSA 1I6AA 5CMCA 3FJMA 4JBZA 2NWJA 4OEVA 1N84A 2QRYA 2NUVA 1XS5A 3FASA 1LSTA 1SBPA 4QRZA 1Y3NA 3S9LC 3CG3A 1J1NA 2Y7KA 1Y4CA 5H8HA 4U21A 3K1PA 3TODA 2HXWA 2I3VA 3IJOB 2ABHA 1CB6A 2F35A 1SDXA 3KEIA 4LZ8A 2OCUA 3UIFA 1FQDA 4RK2A 3JYRA 5FHOA 5CBSA 1OVTA 1B05A 2RCBA 4G68A 4ZDMA 3MVWA 3UA8A 5DVFA 2QMWA 3U93A 5AE4A 2XHDA 3TDJA 3TTNA 2ALUA 5KCJA 2Q8JA 3UN6A 2HEUA 3QYTA 4RA1A 1Q1KA 1FTKA 3IORA 3GXAA 4H67A 4QFNA 1WVJA 3H06B 4G8NA 3CFXA 5EHSA 2QS3A 2I4BA 3T9HB 3LSFB 2X7PA 4DE8A 4OFLA 2ZNTA 1A99A 3KG2A 2I58A 3G3KA 3KOTA 4YKKA 1IEJA 2DWJA 5A5XA 2ZNSA 1MQDA 2O7IA 2PX1A 1PDAA 4U4SA 3TEPA 4X48A 4LZ7A 4G77A 1JW4A 1I6BA 4GQOA 4I1DA 2VD2A 1JW5A 3HV1A 1QW0A 3N6TA 3S9MC 2CZLA 1RYOA 3DP6A 4GXAA 4NF4A 1MM6A 3HPIA 2R9JA 4ZEKA 2RCAA 3OXNA 3CVGA 3LSXA 1WDNA 4R75A 3S9EA 1ELJA 4R2BA 3TTLA 3BKIB 4I62A 3WAEA 4RPOA 4R6HA 4XKRA 3KFMA 4XKQA 2XXTA 4NWCA 5I58A 1M5FA 4PFUA 4DDDA 3IK6B 1ZJLA 4GL0A 1GVCA 1B3EA 4G8MA 2OLBA 5EYFA 1B4ZA 2Q88A 4DCXA 4RNSA 1MH3A 2XXYA 4BDMA 2DE3A 1HSEA 1US5A 3S4UA 3JV9A 4RK9A 3K6WA 2FNCA 2ESNA 1B2HA 2Q2AA 1D3KA 1A8FA 1UTBA 4GL8A 4KFQA 4BDNA 5I2NA 4R6YA 3E3KA 3Q28A 1MXZA 1NH7A 4ELOA 3T9UA 2H5YA 4JWXA 4RJZA 1R9QA 2A5TA 4U1ZA 3HSTA 1FQBA 5HBCA 5AA1A 4O3CA 4F2QA 4TQUQ 5H8FA 5I56A 3RPWA 2D3IA 2Y84A 3IOVA 4OEUA 3V8XB 1ANFA 4N13A 2F8DA 1LLSA 5FTIA 4G8HA 3G3GA 3V89B 1VFEA 2VP1A 4GIZA 4BDLA 4F31B 5L9OA 2KLFA 4NEDA 4ZEDA 1N04A 4GWOA 5K2XA 2IEEA 4IO3A 3T66A 1MY0A 3RNNA 4ND9A 1RYXA 3MJNA 4H65A 3VDFA 5KDTB 3CIJA 3SEXA 1B9JA 2O1LA 3T22A 3FVNA 5I57A 3MZ1A 4FJPA 4JXIA 1TT1A 1MRPA 4IO4A 2HQ0A 4FECA 2B3FA 1M5CA 1MPBA 1BKAA 1PB9A 3C32A 3C4MA 4JWOA 1PBPA 2ZXTA 4G68C 3ZS6A 3VFJA 3E9XA 2RF1A 5I2KA 1PB7A 3CSGA 3TYHA 4HTGA 3QUFA 4OVJA 2AYSA 2M8CA 3Q27A 3H6UA 1QUJA 2PMSA 4F3GA 2V3UA 1FTJA 1Z7NE 2PYYA 2RINA 4XXUA 2B3BA 2UVGA 2V84A 1B0LA 3N26A 5I59A 4NF8A 1GGGA 3TQLA 2Y7PA 4PFWA 3L6HA 5CRYA 1PBQA 3K01A 1XT8A 4MF3A 4FATA 4E0WA 4O3AA 3QSLA 3GBAA 1SI0A 1B3LA 4BDOA 1DMBA 3FVKA 4F1YA 4IO6A 4F19A 4YKIA 1LCFA 1O63A 2RC9A 3DM0A 4G4PA 1D9YA 1MQGA 3MZ9A 2XXVA 5L8DA 1N3WA 1OLAA 1US4A 4F22A 1NMUA 1FTLA 1SW5A 4YKPA 3FV2A 2UVHA 4WEDA 2D21A 4LUBA 4IY6A 3OO7A 3UP9A 5AA2B 4FORA 4MH5A 1MQHA 2DE2A 3GBBA 3O97A 4AB5A 4R9FA 3IOUA 3OO9A 3VXBA 5DTBA 3MP8A 2ZYMA 4I8CA 3PMVA 2DVZA 3PPPA 1URDA 3B7DA 5TP9B 5TPAA 3V5AA 4LVQA 5H8NA 5IAIA 2H4IA 4BLAA 1B5JA 3OEMA 3FJGA 2Z23A 4ZECA 3VVFA 4OESA 3PUWE 4ZZEA 1SW1A 3R7XA 3TCGA 3PUZE 1MDP1 3G3IA 4HS7A 3FXUA 2OJTA 4HCYA 3RQTA 2IA4A 3IB0A 4EXKA 2F6PA 4GFRA 4R9GA 3TTKA 4F3BA 4OMBA 2OWTA 1LAGE 1ZU0A 2DWHA 4OFOA 3IB2A 4Q0CA 2VGQA 2H25A 3H03A 5HM4B 2OBGA 4QFOA 5JTYA 3MP1A 4OENA 1ZMGA 2I3WA 3TMGA 1N7XA 2HFBA 2GFEA 3ZKLA 1JW1A 4POWA 2GHAA 4R74A 1B40A 3VLWA 4JB7A 4QFLA 5CM6A 2REJA 4Q5TA 1ZIUA 3PGFA 1MY1A 4LONB 3H6VA 4LZ5A 2Z22A 3PUXE 3C34A 1IQ7A 1FCKA 2HAVA 1SQYA 3W15C 3MWBA 3SDFA 3PUYE 5JEIA 4BDRA 4GRKA 1Y1ZA 3B6WA 1UIVA 2DS9A 4I9DA 4HCWA 1JVYA 4LA9A 3T93B 5DVIA 4F29A 3I5OA 4JSDA 1TFAA 2B65A 1B51A 2WKYA 3VXCA 1L5TA 2DOJA 3CG1A 1SYIA 4NWDA 1CE2A 3SETA 3M3KA 3CI8A 5DEXA 2O7UA 3TPAA 4X1DA 3ZSFA 2XXIA 3GZGA 3U94A 1FQAA 3H6TA 4RPNA 1BP5A 3DELB 4C0RA 1IXHA 3KSXA 4YB6A 3USDA 3MBPA 5ELVA 3K02A 3I3VA 1IXCA 3FXRA 5CMMA 4H5FA 1B4HA 4LP2B 1Y20A 3MQ9A 1USYE 5CBRA 3S9NC 4KHZE 3TFLA 4GVOA 1MXWA 4ISUA 1R9LA 3O2AA 3DP8A 4GOTA 3PPQA 3SERA 3K1NA 2RC7A 2QMXA 3H7MA 2ZYOA 2HAUA 4EF2A 4M4GA 4MLVA 2GHBA 3W9WA 4IO7A 2QS1A 2BJJX 5A5XB 1JETA 3RN8A 3DLNA 4U23A 4NF6B 2G29A 4F1VA 4IO2A 1IZ1A 5HPQA 1HSJA 3FVOA 2HZLA 4OXVA 3OENA 3IOTA 1T0KA 4ESWA 3JZJA 1QUIA 4NF4B 2QJEA 2DWAA 2I6EA 3UK4A 4MBPA 2O51A 5CI5A 1NNPA 3RTFB 3MW0A 3EHUA 3RGYA 2AL5A 4RY1A 3DP4A 4N6PA 3KBRA 4Q8RA 1NNFA 3PPRA 3OELA 1UQWA 3T96B 2I0CA 1LB9A 4UACA 4RXLA 4TLLB 3K0VA 3A09A 2XXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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