3T9VA

Cnqx bound to a reduced double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA02
5KCJA 4DCYA 3VV5A 3B6WA 1USYE 4OFOA 4LA9A 3RT8A 4F3SA 4U22A 3O6GA 1MG1A 3K6WA 2RC9A 2XD3A 4EF2A 3IO4A 3TZAA 1KWHA 2DVZA 3K6UA 3S4UA 1VFEA 2GFEA 3IL1B 4LUBA 2H5YA 3UP9A 4YKPA 2XX8A 1DOTA 5CBSA 5I57A 3JZJA 4F1YA 4DE8A 3HHGA 3FJ7A 1MPCA 3A3UA 3ILUB 3MVWA 2QMWA 2H9BA 3N6UA 3H03A 3H6TA 1OQHA 1JVXA 2I0BA 3H3GA 4ELPA 5I84A 5JTYB 4K3FA 5H8SA 4JWOA 4P0GA 1Q35A 5DTBA 1FTKA 5F7VA 4KYDA 4MFIA 3ZS6A 3K6XA 1NNTA 3QK6A 5K2YA 3O97A 2F35A 1EZ9A 3FVKA 1AL3A 4F3PA 3KZGA 4FECA 3TUSA 1DMBA 5H8NB 4IO5A 1M5EA 4ZZAA 3RNNA 3FXQA 4QFLA 4C0RA 5CMMA 1LAHE 1ZKBA 1IXIA 1R9LA 1B1XA 3OEKA 1Z7NE 3PPRA 2DXYA 3EHUA 2D5WA 1IEJA 1WDNA 4ONYA 1DSNA 4MF3A 4RPNA 4POXA 1WODA 4AQ4A 1R9QA 3WAEA 2OWTA 3HO7A 1LFHA 3O66A 3O2AA 1B5IA 2IA4A 4GQOA 1PB7A 1QKAA 3LSLA 3SEWA 2H99A 2Z8EA 1B5HA 3VXBA 1S7YA 1VSOA 3OELA 1JW4A 4PFUA 1IXCA 2E1SA 3VVFA 1NNPA 4XKNA 3TMGA 4IY5A 2XXXA 1A40A 1MXZA 3KBRA 3H06B 2F36A 3N5LA 2QJEA 3PD8A 2XX7A 3BBRA 3E4RA 4I62A 3RTWB 4QFPA 3C9HA 5AA2B 3SEXA 3SEYA 3MAMA 1F9BA 3K1NA 5BUUA 1HSEA 4Q5TA 3MP8A 1N76A 3RGYA 4RPOA 1A8EA 4ZE8A 3TCHA 4HS7A 2O7IA 2GHBA 2F7AA 1H3DA 1QJMA 2UYFA 3MP6A 1TT1A 1QUKA 2Y7IA 3UIFA 1MY3A 4BDRA 1YAEA 1MS7A 2DQVA 3FUZA 4F2OA 3OSQA 2Y7KA 4DCXA 4FEDA 5FTHA 1LFIA 3EHTA 1MY4A 4DXCA 5AE4A 3FD3A 4YB5A 3ODBA 2PX1A 3M3LA 1OVTA 3CSGA 3IR1A 3EF7A 2HFBA 4OQOA 5I59B 2P2AA 4PFYA 2UVHA 3KN3A 1MY0A 4GVOA 3TCGA 4GXAA 3KEIA 2XXPA 3G7WA 3A09A 3DP8A 1XT8A 1MRPA 3UORA 3TTMA 1B7HA 4YKKA 3S9MC 5H8NA 2A5TB 2Q88A 3TDJA 4BDQA 3G3HA 4BDOA 4ZE9A 3C33A 1MXVA 2X7PA 2HCAA 2VGQA 3QIMA 2AL4A 4H6DA 1D9YA 4R2BA 1SW2A 2ZNUA 4O3CA 1SQYA 3IAZA 1SBPA 4KCDA 3FVNA 3SEUA 4Q0CA 3TCFA 4TLLB 3MZ1A 1M5BA 4N07A 1US5A 2Z22A 2G93A 2RC7A 5FHNA 1MXYA 3FASA 2I4CA 2PMSA 2R71A 3PUYE 1LGBC 1FTMA 3MQ9A 4RK9A 3WAFA 1N84A 3TODA 4AB5A 1FQEA 3T9HB 3SKPA 1ZJLA 5KCJB 2V25A 3CI8A 3PUVE 1Y4TA 1B4HA 2DE4A 4YZZA 2ONRA 3R6UA 3PPNA 1YCJA 1VFDA 4EXKA 1SYHA 4HTGA 3N6TA 3LSXA 5DVIA 4NF6A 4R75A 2RCAA 1A8FA 1GGGA 3C4MA 4I8CA 5J1DA 4LQ2A 4P11A 3KOTA 4Q8RA 4ELQA 4OETA 1AOVA 2NUVA 3GZGA 5HBCA 3U93A 3TTKA 2UVJA 1LBCA 2XXRA 2DXRA 2I4BA 2HXWA 3KN7A 2R9JA 1LFGA 4NF4A 4QHQA 1PBPA 3OO9A 4R6HA 1QVSA 2IEEA 2I58A 1LLSA 5DVFA 3PPPA 4OFJA 3UK4A 3M3FA 3KOSA 3VLVA 2E0SA 3LUYA 4FEBA 1QKBA 2O51A 1CE2A 3PMWA 3SDFA 1R6ZA 2NWJA 4H67A 4G68A 1BKAA 1FQBA 4R9FA 4DXUA 4ZEKA 1QW0A 1SI1A 1I6QA 4UA8A 3BKIB 1UIVA 4OEUA 3KJTA 3KJ7A 4ZZEA 4GL8A 4R74A 2Q9TA 5CI5A 1SW4A 2FA7A 2O6AA 1USYH 1MY1A 1B7ZA 1B3LA 1I6BA 2R6GE 3U94A 3KSXA 3AXFA 2O1MA 2CZLA 1LAXA 2RCBA 4YB6A 5F1QA 2QMXA 3M3KA 3SESA 4JDFA 3GLBA 4KPTA 2KLFA 4ZDMA 3MZ9A 2DWJA 3QUJA 5L9OA 3PUWE 2Q2AA 4PQJA 1SVXB 1P99A 2NXOA 1XC1A 1AH5A 4I9DA 3TKDA 1TWYA 1OQGA 1SW5A 2H4IA 3OMBA 4OVJA 2V84A 2HZLA 1FTJA 1H43A 3GBAA 3N26A 3DLNA 1ZMGA 2VHAA 1S9TA 1MXWA 4G68C 2F97A 2XXVA 4I1DA 3IB1A 4O3BA 4NTLA 3FJGA 1N3XA 1JETA 1MPDA 4H5FA 3B7DA 4LZ8A 4NWDA 5EYFA 3L6GA 2FYIA 5ELVA 4R73A 4OXVA 1UQWA 3DP6A 4RY1A 4QFNA 2QS1A 3I5OA 1NMUA 3QSLA 2QS3A 2ZMBA 3IOWA 4KCCA 4LATA 1EZOA 4QFOA 3USDA 3U72A 3OD7A 3SETA 5DVJA 3VVDA 4GF8A 3PD9A 3K4UA 3IJOB 4DLDA 1SW1A 5CMKA 4C1UA 2W7YA 3THIA 1OMPA 3MVZA 5CM6A 1ZIUA 1A7LA 1TFAA 5EHMA 2BJJX 1NNFA 3W15C 4IGTA 1T0KA 5JEIA 5CMBA 1IIWA 1B0LA 2XHDA 1D4NA 3P7IA 3CG3A 3I6VA 1I6AA 2NOOA 4U1OA 4RYAA 4HW8A 1N7XA 4G8MA 2I48A 3OENA 3ONMA 4GWOA 3FV2A 4YMAA 4OWDA 2PBWA 5H8HA 2V3UA 2VOZA 2XXHA 2OZZA 1O64A 3IB0A 2AYSA 1ZTYA 2RC8A 3IORA 2O84X 5ITOA 3VFJA 4OHNA 1FQDA 2OJTA 2OWSA 3VXCA 1I69A 3QUFA 4QSCA 2RF1A 3LSFB 4ZS9A 3E13X 1B3FA 3DM0A 1B6HA 1NNKA 4FAJA 4YMBA 4ZECA 5CMCA 2UVIA 4H8IA 3HV1A 1N3WA 4IO7A 4H0WA 4F31B 4TOZA 4NF5A 4NF6B 3T93B 3UA8A 2UXAA 1B40A 1NH8A 2AIXA 3CFZA 3FATA 1BTJA 1NH7A 2OK2A 3PU5A 4WKMA 5I58A 3W9VA 3IJXB 1OLCA 3S9EA 4E0XA 4U4XA 2HZKA 3L6HA 1JW5A 2QRYA 4H8JA 4IO4A 4DDDA 3K2DA 3O6HA 5AA3A 3V8XB 4EQBA 1O63A 2DE3A 4NF4B 3C34A 3RN8A 3IK6B 3CRBA 4IGRA 1B1HA 1EU8A 3IB2A 1WVJA 2I6EA 3LC8A 3H6UA 1QULA 3FVGA 2UYEA 3G3JA 1FQAA 3H4ZA 3T96B 1B7UA 5DYHA 2OLBA 1FW0A 4YAHX 4EXLA 1MXXA 5HPQA 4G68B 3PPQA 4U21A 3S9NC 4FORA 3GBBA 2AL5A 3MBPA 2B3FA 3O6IA 1JVYA 1P1WA 5FHMA 2QPQA 5TPAA 3R26A 4PP0A 1MM6A 1OLAA 3PGFA 4RXLA 4QFKA 2F6PA 3KG2A 1BLFA 4QRZA 4Q30B 3W9WA 4HCWA 2YLNA 5I56A 3B6TA 2A5SA 1MY2A 4F18A 3MC2A 2DS9A 2ALUA 5ITPA 1Y4CA 2P0SA 3SERA 3MPKA 1RYOA 2GRVA 2YJPA 3KSJA 1FCKA 4F29A 2NVUB 3TQWA 3KFMA 4JWYA 1IQ7A 2DYXA 4IO2A 3IOTA 1FQCA 3MJNA 1MH3A 4GXSB 2DWIA 1P1QA 1A99A 3K00A 1MQDA 3V83A 1GR2A 1URDA 1LAGE 2D3IA 2PT1A 4LQ5A 1ELJA 3K01A 4NWCA 2HAUA 2B65A 1UTHA 1B3EA 3CFXA 4GL0A 1IITA 2HAVA 5KDTA 1RKMA 4TQUQ 4JB7A 4AB6A 3BFUA 3EHSA 4GLIA 3OO8A 4ND9A 3O28A 1B9JA 4R6YA 2Y84A 4X9TA 4MH5A 3CFLA 5IKBA 3SEVA 5B70A 1NKXA 2V3QA 4G8HA 4GD5A 2FNCA 3E9XA 1URSA 4ISUA 1GVCA 4RJZA 3H6WA 3B6QA 3E3KA 4U23A 4F39A 3OO6A 4X1BA 3JYRA 4G8NA 3MUQA 4EQ9A 1P1UA 4U1ZA 1PBQA 4EUOA 4M1VA 5IAIA 1TXFA 5AA4A 4EDPA 1ZLQA 2I49A 3HCQA 4KYEA 3ILTB 4XIGQ 1XVXA 4FJPA 4OTEA 1M5DA 4Z7EA 4PFWA 4H5GA 3OO7A 4NE4A 4TLMB 3QAXA 1D3KA 4RK2A 1O7TA 4FIMA 3MW0A 1YTVA 4LZ5A 1MM7A 5H8FA 4ECFA 1B58A 1N04A 4KHZE 3EPEA 3M8UA 1J1NA 2GHAA 1US4A 4IO3A 4O3AA 1R1NA 3TAJA 3FJMA 1IXGA 1A54A 4JSOA 2Z8FA 4XKQA 3TPAA 2XXIA 4NMYA 1GTKA 2O68A 4PETA 4YB7A 3VLWA 3G3KA 4RA1A 5CBRA 5TP9A 4GOTA 4F19A 4HCYA 2F6GA 5H8HB 1N7WA 3G3GA 5LOMA 3V5AA 2F7CA 1FTOA 1UTBB 3RTFB 5BWJA 3PUXE 1JEUA 4U4SA 3O9PA 3T9VA 1SD3A 3MZBA 1UIUA 1IXHA 1MQHA 3CR9A 5L8DA 3ECRA 3TTNA 1MQGA 1XOCA 1Y1ZA 4GRKA 3FZVA 4FE8A 1TFDA 2ZNTA 3D4GA 1OIBA 3TFLA 2OBGA 3D4CA 4OMBA 2F5XA 4M4GA 3VVEA 3HPIA 1ATGA 4NF5B 1Y9UA 4ESWA 3TYHA 1DTZA 2XXYA 3GXAA 4H65A 1P1OA 5I58B 3C36A 4YKJA 4F1VA 3U8QA 3RPWA 3LBSA 2ESNA 4F2QA 4BDLA 2I3VA 5I2NA 3MP1A 5A5XB 4U2RA 4X1DA 4OERA 3UN6A 2OCUA 3T66A 1LAFE 3BFTA 4WEDA 1JNFA 4ZEDA 4QF9A 3VDFA 4F1UA 1QUJA 2I0CA 1Y1MA 3K02A 2F34A 3KGCA 5L9SA 3JV9A 5K2XA 3HN0A 3Q28A 3H7MA 2VD2A 2D21A 2REJA 1VE4A 5DEXB 3IO6A 4JWXA 1HSLA 1Y3QA 3OSRA 4LP2B 5TPAB 4G4PA 1S50A 2O69A 2RINA 1JEVA 2F8DA 1B5JA 4JXIA 4POWA 4OENA 3QYTA 3ZKLA 3RT6B 2XXWA 2G29A 2Q89A 5I56B 5H8QA 1B46A 1Y3NA 4OFLA 1ZU0A 4KI0E 5EHSA 2H98A 2Z8DA 4EF1A 4XXUA 1GV8A 1M5CA 1H76A 2DVCA 3MVYA 3K0VA 4NF8A 4LZ7A 2ANJA 3T9UA 5I2KA 1MDP1 3CSBA 1JQFA 1H45A 2X26A 2ZYMA 2THIA 1PDAA 3ZKKA 1UTBA 4MLVA 2LAOA 1B51A 4YICA 3TTLA 4KR5A 4IY6A 3FXRA 2DOJA 2UVGA 5B7DA 4G77A 2DWAA 2I3WA 3RLFE 1UTHB 2ONSA 3HHFA 5KDTB 5L9MA 3MVXA 4R9GA 3R7XA 4OESA 3C31A 1MPBA 1B3GA 4FATA 4WXJA 1EH3A 1A55A 4R2FA 4BDMA 4OEVA 1PEBA 1POY1 4PE5B 3Q27A 3ZSFA 3Q26A 1LB9A 3QXMA 2DE2A 3FGSA 5A5XA 2XX9A 1OVBA 3PUZE 4OZ9A 2Z23A 2PYYA 2YPNA 3RQTA 3RUMA 5AA4B 3FIRA 1IUDA 2WKYA 4PFTA 4THIA 3U92A 2M8CA 4E0WA 3DELB 5H8FB 5ICTA 3IOVA 4ZEIA 3TEPA 4G2ZA 4F22A 4DZ1A 2Y7PA 2DWHA 1P1NA 3I3VA 3IOUA 4XKPA 5JK4A 3UGWA 2PVUA 3PV0E 5DEXA 4KYSA 2Q8JA 3T22A 2V3TA 3MPLA 4ESXA 5JTYA 4EQ7A 2QL3A 4L17A 1D9VA 1BP5A 3VLUA 1H44A 1RYXA 3MWBA 1MDQA 1M5FA 2VD3A 5TP9B 4Z0IA 2CMOA 2Q2CA 5FTIA 4XKRA 4IO6A 1DTGA 1N0TA 3CIJA 3N94A 4P0IA 4IB2A 4DIGA 2DP8A 1Q1KA 3U1OA 1EZPA 1MQJA 1SDXA 3Q25A 4N6PA 4GIZA 1NL5A 2X7QA 1IZ1A 1B52A 1ZBMA 2ZYOA 1AMFA 1B32A 1L5TA 4R72A 4KQPA 2ABHA 4OYVA 4QSDA 4QSEA 3OXNA 1MXUA 2VP1A 3OOAA 2F78A 3VE1B 3PPOA 1B05A 1LBBA 4MLQA 1LCFA 2HEUA 2QS4A 2QSXA 4ELOA 5TU0A 4F3BA 4WEPA 1Y3PA 3T9XB 5AA2D 2RKMA 2QS2A 1B0HA 4DXBA 1URGA 5CC2A 4C1TA 5I2NB 4JBZA 1LSTA 2ONKE 3K6VA 5AA2A 2V93A 2ZYNA 3DP4A 1VR5A 4R6KA 5KZTA 3Q29A 5I57B 2P1SA 2O1LA 5FHOA 3K1MA 2XXUA 3CG1A 3LR1A 5HM4B 4NEDA 1POTA 1B2HA 3K1PA 1B3HA 3G3IA 3S2VA 3LSWA 1CB6A 3O29A 4F3GA 3V89B 1FTLA 2F7BA 4YKIA 5ISUA 3HSTA 1JW1A 3G3FA 5ICQA 3PMXA 2Y7RA 3OEMA 1AIVA 4RNSA 1NFTA 1YPNA 5H8QB 3TELA 4BLAA 1QUIA 2B3BA 1BIYA 4LVQA 3S9LC 4GFRA 3FV1A 4X48A 4KFQA 1DPEA 3RY3A 4ELRA 2REGA 5I59A 1Z7ME 3KN8A 4NF8B 4LONB 1B4ZA 1DPPA 1ANFA 1LB8A 5I2KB 4ZEBA 1SI0A 2H25A 3EN3A 3FVOA 4BDNA 3IX1A 4YU0A 2ZNSA 3TTRA 2A5TA 2XXQA 1SYIA 1XHYA 1MH4A 1PB9A 2Y7WA 4N13A 1LCTA 2XD2A 1FQFA 5M2VA 3C32A 3CVGA 2XXTA 4H1XA 2ZYKA 2GH9A 2ZXTA 5AA1A 2HQ0A 3H6VA 3PMVA 1PB8A 3FXUA 1II5A 5CRYA 1Y20A 1XS5A 4KD5A 1PC3A 3EQ1A 4MBPA 2O7UA 4JSDA 4XTCQ 4ZEFA 2PT2A 1MQIA 3A3CA 2DSFA 3C35A 3TQLA 1XVYA 5DT6A 1HSJA 3F11A 4UACA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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