3T9VA

Cnqx bound to a reduced double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA02
3SDFA 3IOTA 1H43A 3P7IA 3Q26A 4JWYA 4EQBA 3ILUB 2A5SA 3HV1A 1LB8A 3IR1A 1LGBC 3RGYA 2VD3A 2RC8A 2R6GE 4IO2A 3V8XB 4EF1A 2ZYOA 2V93A 3TTRA 3FXUA 3CFLA 3FZVA 4GD5A 5FTHA 4N13A 4KYDA 3ZSFA 1PB9A 1LAFE 3DLNA 5M2VA 3UP9A 4BDRA 1EZOA 1PBPA 5I59B 4QSCA 3RLFE 4YKJA 2QS3A 1US4A 4ZEKA 3PV0E 2I48A 3RUMA 5K2XA 3ZKLA 1B46A 1FTLA 2H98A 1MPDA 3CSGA 4WEPA 4MFIA 1P1QA 1QKBA 4DLDA 3UGWA 3IK6B 5LOMA 4I9DA 2I49A 2UXAA 1DTGA 3K6WA 4EUOA 4NF5A 4YICA 4H6DA 3MVYA 3IO4A 1SW2A 1MPBA 1H45A 2DS9A 1Y1ZA 2DP8A 1IXHA 3Q28A 3KSJA 4GL0A 2F35A 3CI8A 4ND9A 3ECRA 2O6AA 1O63A 1JW1A 2H25A 4X1BA 3KSXA 3LSFB 2F34A 1S7YA 4R6KA 3EN3A 3R26A 5L9MA 2F8DA 3QXMA 3VFJA 3T9VA 1NL5A 5J1DA 4U4XA 3UA8A 3C9HA 5HPQA 4F2OA 3L6HA 2DVCA 4NF8B 4QFNA 2FYIA 4ESXA 1AIVA 5H8NB 2XX7A 3FVOA 1B0LA 1VSOA 3K4UA 1JW5A 5JTYA 1OMPA 4LA9A 3BBRA 2DYXA 2B65A 4LQ5A 1FQFA 3JYRA 3TQWA 4R9GA 3N6TA 3PUWE 3PUVE 4HCWA 4LVQA 5DVJA 2F78A 1IIWA 3OO9A 1NH8A 5F7VA 2GFEA 4GQOA 2G29A 3I5OA 3MZ9A 3M3KA 3VXBA 3O6IA 3K6VA 1B7ZA 4IO5A 2XXPA 4LQ2A 4DE8A 5ITOA 5AA4A 1MY1A 2I4CA 4ZE9A 2V3UA 4R73A 3MJNA 4R9FA 3TELA 4F3SA 1NNTA 3R7XA 1R6ZA 4RK2A 4OHNA 5DYHA 3TUSA 4RY1A 2V25A 4Q30B 4WXJA 2XX8A 3ODBA 1T0KA 2HAUA 5KCJB 2XXWA 3FXQA 2DWAA 3K00A 1ZMGA 1MY3A 3TEPA 4U4SA 3CVGA 1URSA 1SD3A 2O68A 4DXCA 4XKRA 5F1QA 5H8FA 3TDJA 2P0SA 2B3FA 1II5A 3KFMA 5TPAA 1B6HA 2E0SA 2W7YA 4ZZEA 1N7XA 3K0VA 3K1NA 4OTEA 2HQ0A 4JWXA 5AA2D 1CB6A 4NF4A 2Z8EA 3R6UA 4MH5A 2VHAA 2Q89A 1B0HA 1BLFA 1ZU0A 1URDA 1RYOA 4OFLA 4E0XA 3BFTA 3U1OA 1MY4A 3JZJA 2XXVA 1PC3A 1TFAA 3OD7A 5L9OA 1P1NA 4JB7A 3VVFA 2ONRA 3RN8A 1XOCA 3TCHA 4YKIA 4X48A 2XXXA 4GF8A 4ELOA 4YKKA 4R2FA 1ZJLA 1B4HA 4GXAA 4GOTA 5BUUA 1OQGA 3Q27A 4TLLB 4EQ9A 1A7LA 3DM0A 1D9VA 1ZKBA 3H6VA 2QRYA 3M8UA 4RPOA 4F1VA 4GL8A 3G3HA 3OMBA 3OENA 2GH9A 3MP6A 2Q9TA 2Y84A 4BDQA 3MUQA 3S9NC 4H5FA 5AA2B 4OFOA 3JV9A 4LONB 3IB2A 2I3WA 2R71A 3ONMA 5JEIA 3M3LA 4Z0IA 1IITA 1NNFA 4IO6A 1N76A 2Z8DA 4IO4A 1PBQA 3KN3A 1A40A 3FUZA 1MQDA 1FCKA 3PUYE 4OQOA 3MC2A 4P11A 2G93A 2ANJA 4F1YA 4OENA 4F2QA 1B7UA 4PFUA 2REGA 4N6PA 4OEVA 4TQUQ 1SQYA 4I62A 4NMYA 4H8JA 3GXAA 5A5XB 4MF3A 1LLSA 4ZEBA 3EHTA 3H7MA 1BP5A 4KCDA 4H5GA 1D4NA 1EZ9A 3FXRA 1MXZA 1AOVA 3O97A 3UN6A 1B5JA 1VFEA 1XVYA 1UTBB 2I6EA 3T9XB 2BJJX 1UTHB 4QFPA 4KYSA 2OZZA 3UORA 1SYIA 5B70A 4FIMA 4ELPA 4RYAA 3DP6A 3TAJA 4PFWA 4Z7EA 3A09A 3FIRA 3UK4A 1B3GA 1M5FA 3B6TA 1MXWA 2Y7WA 1LFGA 4QFLA 3OSQA 2XXQA 1O7TA 4FE8A 3CFXA 2O1LA 2AIXA 5DEXA 2RINA 4FEDA 1SDXA 3USDA 1LCTA 5I2NB 2UVJA 3HN0A 5I58B 2DWHA 4NE4A 3PGFA 4HCYA 4QF9A 5CC2A 4RPNA 4JSOA 1OIBA 5CM6A 4RNSA 1PDAA 5CBSA 1OVTA 2O1MA 2OBGA 2QS1A 2O7IA 3FVGA 1ANFA 2VGQA 3MVWA 5IKBA 4DXUA 1AH5A 3FVNA 4GXSB 3PPRA 4AQ4A 5AA3A 3S9MC 2O84X 3MVXA 2I4BA 1YAEA 1MY2A 3K1PA 3O66A 3IOUA 1Y3PA 1OQHA 4R6HA 3TTNA 4BDMA 4YB5A 3WAFA 4DCYA 4DIGA 2DSFA 4XKPA 1JETA 4F3BA 5EYFA 1BIYA 4ZE8A 4LZ5A 1POTA 3ZS6A 1URGA 4F31B 2VP1A 4YKPA 4EXKA 2OK2A 3G3GA 4KFQA 1B05A 2H99A 4NF5B 4Q0CA 1JQFA 1YCJA 4OMBA 2PYYA 3OXNA 1SVXB 5ICQA 5KDTA 4H67A 1MH3A 1YTVA 3E4RA 2THIA 2P1SA 1IZ1A 3A3CA 4IB2A 4KD5A 1DPEA 2QS2A 2NVUB 4RK9A 2DXRA 3PD9A 2ZNTA 4ZDMA 3HPIA 2A5TA 2YLNA 4H65A 4PFTA 2V3QA 1B9JA 3L6GA 5DVIA 3T93B 2DXYA 2ZYMA 3TODA 3OEKA 3C33A 2REJA 3KOTA 2ESNA 4F3GA 2ALUA 3QSLA 3OELA 1A99A 4DZ1A 3KG2A 3TTLA 1JNFA 3K6XA 4G4PA 4UACA 1US5A 1ZLQA 3HSTA 4FATA 5JTYB 1I6AA 1VFDA 2ONKE 2UVIA 3LSXA 1FQDA 1MQGA 2D5WA 3EF7A 3HO7A 3G3KA 4R2BA 1Y3NA 3EHUA 4X9TA 5FHOA 3U8QA 3IO6A 4GLIA 1FTJA 4WEDA 3CG1A 3KJ7A 4XXUA 2D21A 5HM4B 5H8QA 1N3WA 5K2YA 2QSXA 2Q8JA 5I56A 4C1UA 2FA7A 3RPWA 4F18A 3FJMA 4G8HA 1NH7A 3GLBA 4G77A 5AA4B 4E0WA 4G68C 4JWOA 3CR9A 1A8EA 2GHAA 1ZTYA 3TTKA 1HSJA 3G7WA 2DE2A 2I3VA 1NKXA 4G68A 3LSWA 2HXWA 2YPNA 4NTLA 4PQJA 4LP2B 4H8IA 3MBPA 4HW8A 3O9PA 1QJMA 4F19A 2UVHA 4JXIA 4XKQA 3MAMA 3IAZA 3PD8A 2M8CA 2GHBA 2DVZA 2RC9A 1IQ7A 3CIJA 4OEUA 3IX1A 3M3FA 3Q25A 1YPNA 2X7QA 1USYH 1N7WA 1L5TA 1B51A 4LZ7A 2UVGA 5H8FB 4O3BA 2Z23A 2ZMBA 4H1XA 2KLFA 3I6VA 1Y4CA 3D4GA 2PX1A 4PFYA 5TPAB 3T66A 3RTWB 4HTGA 5H8SA 4ZS9A 4F22A 5KZTA 4AB6A 4ZEDA 3RT6B 3PPNA 1JEVA 3HHGA 2HZKA 2Y7IA 1D9YA 4NF4B 1I6BA 3WAEA 1XHYA 4U1OA 3N5LA 1S50A 5JK4A 1GGGA 1POY1 3GBBA 1B5IA 1LAHE 5TU0A 5ELVA 4OYVA 4FORA 2Q88A 3VV5A 1DSNA 3MZBA 4JSDA 1MXXA 3QK6A 1N04A 1B2HA 1MXVA 5I57A 1EU8A 3IOVA 5L9SA 1OVBA 1EH3A 4IO7A 3LSLA 2P2AA 5H8HA 3V83A 4OESA 3T22A 2RKMA 4GIZA 3TQLA 1B5HA 2DQVA 3QUFA 3VLWA 1BTJA 4NWDA 3K6UA 4NF6A 3MWBA 3MW0A 3QUJA 3MZ1A 3FVKA 3SESA 3U92A 4NWCA 1Y20A 2QPQA 1MPCA 4F29A 5HBCA 3DELB 3F11A 3MPLA 3VLVA 1N3XA 1OLAA 1PB8A 2QS4A 1LCFA 4JBZA 4YMBA 4P0GA 3DP4A 1SYHA 2H4IA 4U22A 2FNCA 3KJTA 4QHQA 3Q29A 3VVDA 3FASA 4K3FA 1LB9A 3PMXA 4KQPA 1DPPA 4PETA 3N6UA 5TP9A 3SEXA 4MLQA 4R72A 5CMBA 1TFDA 4ONYA 1MQHA 2F7CA 4LZ8A 3O6HA 1AL3A 1XC1A 2I0CA 1GR2A 4PP0A 4JDFA 3OO7A 3QIMA 3IB1A 4C0RA 1MDP1 1VE4A 2Q2CA 1MRPA 1H3DA 4I1DA 2QMXA 2HEUA 3K1MA 2HAVA 1B32A 4THIA 1SW5A 4MBPA 4OZ9A 3AXFA 2NWJA 5DTBA 3FD3A 2H9BA 1MDQA 1UIUA 1HSEA 2XXRA 1LSTA 1A8FA 3SEVA 1LAGE 4XTCQ 2OJTA 4KCCA 1JVYA 2OWSA 1TXFA 3G3JA 1IXIA 4AB5A 1NMUA 3H4ZA 3S9LC 2O7UA 4DXBA 1N84A 1RYXA 2QL3A 3VE1B 1SI1A 4ZEIA 2DE4A 2R9JA 2NOOA 1SW1A 4RJZA 1SW4A 2IA4A 5I2KA 2ONSA 2PVUA 1FTMA 2VOZA 5CMCA 3W9WA 5DEXB 3C35A 4R75A 1QW0A 2Y7KA 1AMFA 2RCBA 3HHFA 3E3KA 2UYEA 1LAXA 3FV1A 1FTOA 1JEUA 3TCFA 4U1ZA 2AL4A 1JVXA 3HCQA 3PPPA 1MXYA 3VDFA 3TFLA 2X26A 3RTFB 2RCAA 3OEMA 1TT1A 3A3UA 4KYEA 3CSBA 1JW4A 1B3LA 1IEJA 5B7DA 1M5CA 4IO3A 4C1TA 5I59A 4LUBA 2H5YA 1Y3QA 3C36A 5EHSA 3T9UA 3N26A 1GVCA 3SEWA 3BFUA 1IUDA 4YAHX 4EXLA 3LR1A 2Z8FA 3LBSA 3SEYA 2X7PA 4G2ZA 3RY3A 3K01A 3OSRA 2DE3A 5AA1A 1WVJA 2ZNSA 1IXGA 1QVSA 4TLMB 4M1VA 1Q35A 3FGSA 4BLAA 2NUVA 4GWOA 1LFIA 2E1SA 5L8DA 1B1XA 2V3TA 3TYHA 4FJPA 1A55A 4OERA 2F7AA 1SI0A 2CZLA 5KDTB 1FW0A 1LBBA 2OCUA 2F36A 2HCAA 1EZPA 1B3FA 3VLUA 3VVEA 3FATA 3TPAA 1HSLA 4U21A 3MVZA 3KOSA 5CBRA 2XD3A 4IY5A 2DWIA 4DCXA 3H6TA 2A5TB 2XX9A 3B6WA 3LC8A 1QULA 1B3HA 2I58A 3O28A 3QAXA 1LBCA 5EHMA 1CE2A 4HS7A 1P1OA 5FHNA 3CFZA 3MP1A 4IGRA 3C31A 1F9BA 2ABHA 4NF8A 5CMKA 2YJPA 1Z7ME 4YZZA 3IJXB 5H8NA 1MH4A 2WKYA 1Y1MA 4YB7A 2Z22A 1VR5A 1R9QA 4H0WA 3H06B 3O29A 5FHMA 1Y4TA 2DWJA 3GBAA 2Y7RA 3RQTA 2XHDA 1FQEA 4F39A 4GRKA 1FQBA 4MLVA 2ZXTA 1UQWA 1H76A 3EQ1A 5ICTA 1I69A 1B1HA 5ITPA 2F5XA 3S4UA 4GFRA 1MQJA 1KWHA 1USYE 1GV8A 1OLCA 1H44A 4L17A 3EPEA 5H8QB 1ZBMA 4RXLA 4R74A 1S9TA 4O3AA 4RA1A 2PMSA 2RC7A 4G8NA 5I56B 4XIGQ 3G3FA 1N0TA 2F6PA 3T96B 4I8CA 1ATGA 4FECA 2F6GA 4QFOA 4OETA 2Y7PA 5BWJA 4WKMA 3KGCA 3SKPA 2IEEA 3V5AA 3S2VA 1TWYA 4BDNA 4G68B 2GRVA 5ISUA 1NFTA 3LUYA 4YMAA 4Q8RA 2DOJA 1MQIA 5KCJA 3TCGA 4M4GA 2F97A 4QRZA 2D3IA 4DDDA 1A54A 1Y9UA 4ZEFA 4F1UA 3U93A 1BKAA 3PUZE 3TTMA 3OO8A 3TKDA 1DMBA 4ESWA 4NEDA 3SETA 4KHZE 3KBRA 4N07A 3PMVA 1XT8A 1NNPA 1B52A 3C4MA 3E9XA 3E13X 4QFKA 3H3GA 3G3IA 4EQ7A 1DOTA 1WODA 3MP8A 1NNKA 1FQCA 1ZIUA 3FV2A 2XXTA 2V84A 4POWA 5CRYA 3TZAA 3O6GA 4F3PA 2NXOA 4ELQA 2ZYKA 2AL5A 1QUJA 1XS5A 3OO6A 3CRBA 3KN7A 2XD2A 4BDOA 1P1WA 3SERA 3ILTB 4FAJA 4FEBA 3ZKKA 4ZECA 4PE5B 1B3EA 1M5DA 3T9HB 1B7HA 5I57B 1ELJA 4O3CA 3OOAA 3C32A 1Q1KA 4EDPA 3VXCA 3U72A 3PPOA 5DVFA 2VD2A 3N94A 4XKNA 5H8HB 3QYTA 3FJ7A 4LATA 1P1UA 3H03A 3S9EA 1MY0A 1IXCA 1B58A 5FTIA 1Z7NE 3RT8A 4KI0E 4U2RA 4KPTA 2F7BA 2O69A 5AE4A 4KR5A 1UIVA 4NF6B 2HFBA 3KN8A 4ISUA 4TOZA 5DT6A 3W15C 1M5BA 3O2AA 4IGTA 3KEIA 3BKIB 5I84A 5CI5A 3SEUA 1O64A 5AA2A 2PBWA 3RNNA 3PPQA 4QSDA 1PEBA 2HZLA 1J1NA 1FTKA 3I3VA 3TMGA 1M5EA 2CMOA 4UA8A 2PT1A 2Q2AA 1SBPA 1I6QA 2XXIA 3H6UA 2LAOA 4OFJA 3IL1B 1MXUA 4POXA 3V89B 1MM7A 5TP9B 2QMWA 3CG3A 1GTKA 4ZZAA 3U94A 3W9VA 4U23A 3PUXE 4YB6A 1MG1A 3THIA 1D3KA 5CMMA 5A5XA 3MQ9A 3IB0A 4X1DA 3C34A 3UIFA 2PT2A 1R9LA 1PB7A 1P99A 4OVJA 3B7DA 4BDLA 3B6QA 3PMWA 4IY6A 1FQAA 2OLBA 2I0BA 1UTBA 3PU5A 3IJOB 3H6WA 4OXVA 1QUKA 1XVXA 2UYFA 3EHSA 4EF2A 1UTHA 3KZGA 3DP8A 1QKAA 4P0IA 1LFHA 1B40A 4ELRA 4ECFA 1MM6A 2ZNUA 2OWTA 4OWDA 2XXUA 4GVOA 3GZGA 2XXYA 3FJGA 2XXHA 4Q5TA 3D4CA 2O51A 1QUIA 2B3BA 1B4ZA 3IORA 1DTZA 4QSEA 2ZYNA 5I2KB 1MS7A 4R6YA 2QJEA 3IOWA 2AYSA 5IAIA 3K02A 5I2NA 5I58A 4YU0A 4G8MA 2RF1A 1WDNA 3MPKA 1RKMA 1R1NA 3K2DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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