3T9VA

Cnqx bound to a reduced double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA02
4X48A 3PV0E 5DEXB 1XVYA 3SEYA 4PETA 3G3KA 2OLBA 4NWCA 4NWDA 2NOOA 3H6WA 1JEUA 3MVYA 4YMBA 2PYYA 1MG1A 5CMBA 1LCFA 4IO2A 2H5YA 3GXAA 4GFRA 4XKQA 3PPNA 2PVUA 2LAOA 2XD2A 3U93A 1HSLA 3UN6A 4KI0E 3B6QA 4LZ5A 3ONMA 5H8HA 3CRBA 1IXCA 3FXRA 1DSNA 4H8JA 5H8NB 3O29A 2XXHA 5H8FB 5TP9A 2Y84A 3VLWA 3PPRA 1Y1ZA 5JTYA 4BLAA 4FJPA 3O6HA 4BDMA 2Y7RA 4OFJA 4IB2A 4FE8A 4U4XA 2Z23A 3CSGA 3K02A 3LSXA 1Z7NE 1B3FA 3C31A 1Z7ME 1FTOA 5FHNA 1US4A 1YCJA 2RC9A 1Y3QA 1LAXA 2ANJA 4XXUA 1MH3A 3KG2A 3TCFA 2O6AA 3VXCA 4FATA 4POXA 2REGA 5M2VA 2OJTA 3GZGA 3PUXE 1MQGA 3SEXA 4NF8B 2V3QA 4ONYA 4YZZA 4LATA 1A55A 2XXXA 5CMCA 1WODA 5ICTA 2O84X 2GHBA 1N76A 4R6HA 4G8NA 3RNNA 3SEUA 5ITOA 2XXPA 4AB6A 2XXYA 4JWYA 2QL3A 1QW0A 4ELOA 3CFZA 1MY3A 3MAMA 4GRKA 4KYSA 3FZVA 4TOZA 1J1NA 5FTHA 3R7XA 4XTCQ 2FA7A 4TQUQ 3HHFA 2F78A 3IAZA 4MBPA 2R71A 2RINA 5AA4A 2ONRA 1M5FA 3C9HA 2V3TA 3MWBA 5TPAA 4EF1A 4F3GA 1AL3A 1B32A 4ZEIA 4NE4A 2X7QA 3OEMA 3VVEA 5I57A 3WAEA 1SVXB 4HCYA 1RKMA 4ZE9A 5DVIA 4G68C 2F97A 5I2KB 4X1BA 1JVXA 2DVCA 1II5A 1AIVA 1OIBA 1MH4A 4OMBA 2V25A 3MP1A 2DE3A 4F1UA 2FNCA 3D4CA 3HO7A 2I6EA 3Q27A 3TTKA 1B6HA 4U21A 4LVQA 2R6GE 3K2DA 5ICQA 3ECRA 2OCUA 1FW0A 4H8IA 5J1DA 2NWJA 1I6BA 3HPIA 3AXFA 1R9LA 4OTEA 1MRPA 1SDXA 4R9GA 3KGCA 4GXSB 3CR9A 4DCYA 1F9BA 4EXLA 2IA4A 1I6AA 1NNTA 4UA8A 3MW0A 2H98A 4OETA 2Y7IA 4MLVA 3V83A 1Y4CA 2I49A 3TFLA 5I58A 4YAHX 4OFLA 4H65A 4XKRA 1DPEA 4JWOA 3M3FA 3MPKA 1B7HA 4NF5A 3FIRA 4K3FA 1B3HA 3GBBA 2HEUA 1LB9A 4C1TA 4Q8RA 3IOWA 3B7DA 4YKIA 4JDFA 3F11A 3UIFA 3Q25A 3PPQA 3VVFA 4AQ4A 4IO7A 4YICA 1FTKA 4F2OA 4RNSA 1SI0A 3BFUA 3UP9A 3MJNA 3TTLA 3DP6A 5FTIA 3PU5A 2RF1A 1GTKA 4PFYA 4N6PA 4KCDA 2Z22A 1A40A 2F8DA 1B1HA 1LLSA 3PMXA 4F3PA 2UVGA 2QJEA 4ZEFA 3U1OA 2ZYNA 4DXBA 4Z0IA 1SBPA 1URSA 4FAJA 5AA2A 2ALUA 3T9HB 4OEUA 3OO7A 1LAGE 1FQAA 1SD3A 1ZJLA 1TFDA 2F34A 2DVZA 2AL4A 3FJGA 3S9MC 4FORA 3O66A 1LAHE 3FD3A 3K6XA 4DE8A 4OHNA 1I6QA 4F3BA 1H45A 1T0KA 3CFLA 4JWXA 1JETA 3R6UA 3SETA 3THIA 4GF8A 2D3IA 1QUJA 1VFDA 2DQVA 1FTMA 4TLLB 1B3EA 3DP4A 1RYXA 5KDTA 3MBPA 2I58A 3KJTA 1HSEA 2ZYKA 2ZXTA 1NMUA 4ZS9A 2E0SA 4QHQA 3OO9A 1N3WA 4OFOA 4F22A 1LAFE 4IGTA 1BKAA 1RYOA 3U8QA 1EZOA 1MQIA 3K6WA 3TPAA 5L9MA 1OVBA 3ZSFA 3T93B 2A5TB 2DXYA 5I56A 3LR1A 5F7VA 1FQEA 3TMGA 1MY0A 3SESA 2YJPA 1FQBA 1XVXA 3UORA 4I9DA 1VR5A 3C33A 3OSQA 3MVWA 1IIWA 3ODBA 1B9JA 3T9XB 3QK6A 2Q8JA 3PUWE 4X9TA 3OELA 4EQ7A 2YLNA 4QSCA 1JNFA 3FV2A 1N3XA 3DM0A 2OBGA 2PT2A 4GOTA 3TQWA 1DPPA 3LSLA 1B7UA 2QS4A 2DXRA 2HQ0A 1MXWA 1JW4A 1BIYA 4HCWA 4U23A 4WKMA 4DDDA 1UTHA 1ZBMA 2AYSA 4QFKA 3BFTA 2O68A 3JYRA 1AOVA 5KCJA 1YTVA 4F2QA 2X26A 5K2XA 4Q5TA 4IO3A 4F29A 3FJ7A 4H6DA 4GL0A 3KFMA 4RXLA 5F1QA 4YMAA 5TP9B 3HN0A 4LZ8A 3CG3A 3A3UA 4R74A 4NEDA 5DYHA 3TTRA 4ZDMA 2F5XA 1GR2A 4I8CA 3IJOB 4BDRA 1B5JA 5B70A 1MQJA 1UTBA 4DCXA 4PP0A 3KN8A 3CSBA 1ZLQA 4ELPA 2NXOA 3MC2A 3OMBA 4KYEA 1IXHA 2Q2CA 3U92A 3TTMA 1O64A 1SYHA 3VV5A 3MVZA 3QAXA 4YB6A 3Q29A 3FV1A 5BWJA 1MXYA 3W9WA 1PDAA 2HXWA 2OK2A 5DEXA 4F19A 3K6VA 5KZTA 3LBSA 3C34A 2GHAA 3TODA 3RLFE 3QUFA 5CRYA 3VXBA 4ECFA 1ZIUA 1LB8A 2I4CA 4YKJA 3B6TA 3IB2A 3T22A 3I3VA 4GL8A 1DTZA 1I69A 1QVSA 2AIXA 3UGWA 4WEPA 1QKAA 4F1YA 4F18A 3TCHA 4QFNA 5H8NA 4F39A 2RC8A 3I6VA 5CC2A 5AA4B 4ZZEA 2HZLA 5H8FA 3I5OA 4YU0A 3MUQA 4BDNA 4DZ1A 1NFTA 3N6TA 1AMFA 2BJJX 3P7IA 2GRVA 3FASA 3JV9A 4GWOA 3H4ZA 4FECA 3IB1A 4RJZA 1A8EA 4ZEBA 3RT8A 1SYIA 4ESXA 4R2BA 1US5A 1MXXA 1LBBA 3H7MA 4YKPA 4LA9A 4LONB 1EZPA 3L6HA 3TQLA 1CE2A 2G29A 4ESWA 1VSOA 1YPNA 2ESNA 5ISUA 1FCKA 1OVTA 2UVHA 5I59B 1Y9UA 1LGBC 4WEDA 4E0WA 2I3WA 1S50A 1MQHA 1GVCA 1P1OA 3JZJA 2H9BA 1UIUA 3K4UA 5IKBA 4M1VA 3H6VA 3OD7A 2RC7A 1TT1A 3KSJA 5JK4A 3TELA 5CI5A 3RGYA 5I58B 3IO6A 4TLMB 3EPEA 2XHDA 3RT6B 3S9LC 1NH7A 3Q26A 3TCGA 1XHYA 4NF5B 4IY5A 3MP6A 1OLAA 3QUJA 1N7WA 4XIGQ 3LUYA 3ZKKA 1TWYA 5FHOA 3Q28A 1SW4A 1NNKA 3CIJA 4OQOA 1URDA 2ZMBA 3E3KA 1D9VA 1Q1KA 3EHSA 5DTBA 1H3DA 1JW1A 3E13X 3QYTA 4MF3A 3CVGA 2I48A 5I2NB 2DOJA 2QSXA 5A5XB 2F6GA 1H43A 4QSEA 5I2KA 1A8FA 2ZNUA 3PUZE 1POY1 1XT8A 2O1MA 2Q9TA 3PMVA 2UYEA 2DE4A 2O1LA 2XX7A 1LFHA 4O3BA 4RY1A 4WXJA 1PB7A 1B40A 4ZEDA 4JSOA 2B3FA 2XXWA 3CG1A 3E4RA 1B3GA 1MPCA 4KCCA 3C36A 3VVDA 3V5AA 1B4ZA 2DYXA 3A3CA 2XXVA 1LBCA 3HV1A 3ZS6A 3C32A 3LSFB 1JW5A 2F7BA 2ONSA 1H76A 3QXMA 1NNFA 5KDTB 4P0IA 3OEKA 4I1DA 1ATGA 4KYDA 2PMSA 1P1QA 5CMKA 2B65A 1EU8A 3VLVA 4G68B 3DLNA 3PUVE 2VHAA 5LOMA 1QUKA 4BDLA 3PD9A 5L9SA 4RPOA 4JBZA 3IK6B 1PEBA 1URGA 2DWJA 5HM4B 1H44A 4GLIA 3HHGA 4FEBA 5I56B 1B5HA 4DXCA 3T9UA 1IQ7A 3H6TA 3SEWA 2REJA 1USYH 1MXVA 4C0RA 3S9EA 5EYFA 3SEVA 3IJXB 3RUMA 3FJMA 4GXAA 1P1WA 3ILTB 1S9TA 1Y20A 1Y4TA 5EHSA 3G3IA 3U72A 4EDPA 3DELB 1B0LA 3HCQA 3H06B 4GQOA 2V3UA 3S9NC 3VLUA 4EXKA 2O7UA 2NUVA 3CI8A 4HW8A 3RTFB 5AE4A 3RN8A 4NF4B 3N6UA 3FUZA 1MDP1 4M4GA 1UTHB 1TFAA 4RPNA 3R26A 1USYE 5H8QB 1D3KA 1Y1MA 2RCBA 4NF6A 4GD5A 1FQCA 3OXNA 1DOTA 3TKDA 1MM7A 1MS7A 1NL5A 1XC1A 1B4HA 4QSDA 1FTLA 5AA2D 2D21A 5L8DA 3OO8A 5L9OA 1SI1A 3N5LA 1ELJA 5TU0A 4DLDA 4PFTA 2O69A 1PB8A 3LC8A 2THIA 2CMOA 2UVJA 1IITA 3TTNA 3PMWA 2QMWA 3OO6A 4ZE8A 3TEPA 4XKPA 3MVXA 3K6UA 2HZKA 4OWDA 1MY4A 3K00A 3TUSA 1JEVA 3KBRA 1LFGA 2G93A 4RA1A 3MP8A 4YB7A 3PPOA 1O7TA 4OZ9A 4LQ2A 4RK2A 5H8HB 1OMPA 2XX8A 1MPBA 4F31B 4AB5A 5CBSA 2R9JA 2ZYOA 2P2AA 2O51A 3E9XA 3W15C 4RK9A 5JTYB 2VD2A 2UYFA 4ND9A 2NVUB 5DVJA 1D9YA 4U22A 5HBCA 3MPLA 4FEDA 3K0VA 3GLBA 4U1OA 5FHMA 3IX1A 2OWSA 4R73A 1BLFA 2QS2A 5DVFA 2XX9A 1EZ9A 2P1SA 3QSLA 3KOTA 1GGGA 3N26A 4LQ5A 3PUYE 4F3SA 1A54A 3KN7A 2Z8FA 1B58A 2DSFA 2M8CA 3S2VA 1B0HA 3BKIB 1OQHA 2DWAA 3EQ1A 3FVNA 4H5FA 2P0SA 4EF2A 1MXUA 1OLCA 4KD5A 1OQGA 4IO6A 2XXIA 2UXAA 2F6PA 4YB5A 2F36A 3ILUB 4RYAA 1R9QA 1YAEA 1R6ZA 2Z8DA 3V8XB 2H99A 2PT1A 3KJ7A 4ZECA 4G8MA 4OXVA 1HSJA 5JEIA 1XS5A 4XKNA 4X1DA 3SDFA 4KPTA 3M8UA 1Y3PA 2WKYA 4OEVA 2QMXA 4GVOA 2Q88A 3EF7A 2HAUA 1WVJA 2DS9A 5TPAB 3IR1A 3EHUA 1JVYA 1Y3NA 1SW2A 1PBQA 4H0WA 5I57B 4OYVA 1FTJA 2I4BA 2V93A 1P99A 4DXUA 2DP8A 1MM6A 1B05A 3G3GA 4G77A 3QIMA 3KEIA 1Q35A 2F35A 3HSTA 5CMMA 3G3HA 1B7ZA 3O6IA 2RKMA 2XXTA 3K1NA 3U94A 2OZZA 4JB7A 3FXUA 3M3LA 4UACA 2V84A 2HAVA 1POTA 2F7AA 2ZNTA 2Q89A 2DE2A 2XXUA 2HFBA 3MQ9A 4P11A 3FVGA 2QS3A 4PFUA 2VOZA 3EHTA 4QF9A 4BDQA 4DIGA 2X7PA 1S7YA 2Z8EA 4R75A 2XXQA 3T96B 4R6YA 4NF8A 3L6GA 1A7LA 1LCTA 4G8HA 4OESA 1ANFA 4MLQA 1R1NA 4U1ZA 1B5IA 1MQDA 3FVKA 4JXIA 3K01A 3TZAA 1ZTYA 4Q30B 3DP8A 3TDJA 1A99A 3UK4A 1BP5A 4KQPA 3EN3A 5DT6A 3BBRA 3K1MA 4OVJA 2QS1A 5CM6A 2QPQA 3VFJA 3IOTA 3D4GA 2UVIA 3H6UA 3SERA 5BUUA 1MXZA 2Y7PA 4IY6A 4LZ7A 1MY2A 3PGFA 5I59A 1B2HA 2YPNA 3C4MA 4R2FA 2OWTA 3TYHA 1UIVA 1EH3A 2VGQA 2FYIA 3ZKLA 1D4NA 2VD3A 4ZZAA 4EQ9A 2ABHA 1PBPA 2F7CA 4NTLA 1FQDA 4QRZA 3W9VA 2DWHA 4Z7EA 5B7DA 3FGSA 2D5WA 1XOCA 4FIMA 3O6GA 1QJMA 1CB6A 1NNPA 5AA2B 4N07A 4H67A 1N0TA 3O9PA 1IXIA 3UA8A 4ELQA 3O97A 3FVOA 4GIZA 2ZYMA 3T9VA 1VE4A 5I84A 1M5BA 1M5DA 3MZ9A 3IL1B 4R6KA 4BDOA 1FQFA 1SQYA 3A09A 1QULA 3OOAA 3FATA 3USDA 4N13A 4IO4A 4OERA 3VE1B 2W7YA 1ZMGA 1MDQA 4P0GA 5H8SA 1B3LA 5K2YA 1N84A 3C35A 3CFXA 4H5GA 4LP2B 4PFWA 2XXRA 5I2NA 3H03A 1IUDA 3GBAA 5A5XA 1VFEA 1LSTA 3S4UA 3KZGA 4QFOA 4E0XA 5IAIA 2GH9A 1QKBA 3IORA 2ONKE 3KN3A 4IGRA 1B52A 3LSWA 4EUOA 1O63A 5HPQA 1B51A 2Y7KA 2RCAA 4Q0CA 3TAJA 1ZKBA 4QFLA 1PC3A 3RTWB 3G3FA 4C1UA 1AH5A 3T66A 2Q2AA 4EQBA 1IZ1A 2IEEA 5AA3A 4ZEKA 1L5TA 1BTJA 3H3GA 3M3KA 4U2RA 5AA1A 1DMBA 4NF6B 4IO5A 4HS7A 1N04A 3KSXA 3IOVA 3G3JA 2B3BA 1WDNA 3O2AA 3B6WA 1UQWA 3O28A 1KWHA 4G4PA 2Y7WA 1MPDA 4F1VA 2AL5A 2H4IA 3G7WA 3OENA 2QRYA 3RQTA 2A5SA 2VP1A 3VDFA 2DWIA 4G68A 3IB0A 2H25A 2PX1A 1NH8A 4I62A 4JSDA 1ZU0A 5ELVA 4KR5A 1NKXA 3OSRA 2O7IA 4O3CA 4NMYA 4R9FA 1SW1A 4THIA 4L17A 2GFEA 2ZNSA 3PD8A 2KLFA 5KCJB 1IEJA 4R72A 4YKKA 1B1XA 3MZBA 1QUIA 2CZLA 4U4SA 3KOSA 3PPPA 1MY1A 4POWA 2XD3A 1P1NA 3N94A 3MZ1A 4PQJA 4O3AA 1SW5A 3RPWA 4HTGA 1N7XA 1DTGA 1JQFA 1M5CA 4KHZE 1LFIA 4G2ZA 2I0CA 1P1UA 3FXQA 4ISUA 3IOUA 5CBRA 3K1PA 5ITPA 1UTBB 2A5TA 1B46A 3SKPA 4NF4A 3RY3A 2E1SA 2I0BA 5EHMA 4MFIA 4KFQA 4LUBA 4PE5B 1IXGA 5H8QA 4MH5A 2I3VA 1GV8A 3V89B 2HCAA 1M5EA 4OENA 4QFPA 2PBWA 1TXFA 4ELRA 1PB9A 4H1XA 3IO4A 3WAFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4X48 A;  3PV0 E;  5DEX B;  1FBP A;  1XVY A;  4P47 A;  4MMP A;  3SEY A;  4PET A;  4PDD A;  3G3K A;  2OLB A;  4NWC A;  4NWD A;  2NOO A;  3H6W A;  1JEU A;  3MVY A;  4PTK A;  4YMB A;  2PYY A;  1MG1 A;  5CMB A;  1LCF A;  4IO2 A;  2H5Y A;  3GXA A;  4XFE A;  4GFR A;  4O7I A;  4XKQ A;  2XWI A;  3PPN A;  2PVU A;  2LAO A;  2XD2 A;  3CHG A;  3U93 A;  1HSL A;  3UN6 A;  4KI0 E;  3B6Q A;  1DK4 A;  4LZ5 A;  3ONM A;  5H8H A;  1FPD A;  3CRB A;  1IXC A;  3FXR A;  1DSN A;  4H8J A;  5H8N B;  3O29 A;  2XXH A;  5H8F B;  5TP9 A;  2Y84 A;  3VLW A;  3PPR A;  1Y1Z A;  5JTY A;  1LBX A;  4BLA A;  4FJP A;  3ISP A;  3O6H A;  4PF6 A;  4BDM A;  2Y7R A;  4OFJ A;  4IB2 A;  4FE8 A;  4U4X A;  2Z23 A;  3CSG A;  4GBV A;  5IM2 A;  3K02 A;  4GWS A;  4JVI A;  3LSX A;  1Z7N E;  2KQZ A;  1B3F A;  4P1L A;  3C31 A;  1Z7M E;  1FTO A;  5FHN A;  1US4 A;  4DI4 B;  1YCJ A;  2RC9 A;  4GWZ A;  1Y3Q A;  1FPG A;  1LAX A;  2ANJ A;  4XXU A;  2ZZW A;  1MH3 A;  3KG2 A;  1FBG A;  1LEV A;  3TCF A;  2O6A A;  3VXC A;  4FAT A;  4POX A;  2REG A;  5M2V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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