3IOUA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c94
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
416
structure length
402
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQPPPPPPPPPPPQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Signaling protein
total genus 102
structure length 402
sequence length 416
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA02
1LFGA 1URSA 1JEVA 1D4NA 2XHDA 4H8JA 5CMMA 2NWJA 2Z8EA 1I6BA 3C34A 1US5A 3IORA 4L17A 1A99A 3H4ZA 4ESWA 1Y3NA 1YPNA 3OO9A 1OMPA 3N94A 2QS3A 4DLDA 1FQBA 2HFBA 1FQCA 1HSEA 4R6HA 3SETA 1MY2A 3T9UA 1M5CA 4NE4A 4DIGA 1B4HA 2DXYA 1B5HA 2Z23A 4YB6A 1Q35A 1H43A 1SYHA 4EF2A 1VR5A 1XC1A 5DVFA 3KN8A 3ILUB 3LSXA 4LQ5A 2VHAA 3FUZA 3O9PA 2H25A 3H6TA 3PUVE 3VVFA 4WXJA 3IK6B 1MM7A 2O84X 4JSDA 3HHFA 1MRPA 3TTNA 4F1VA 4F39A 5FHMA 3FZVA 4JWOA 5AA3A 3OEMA 5L9SA 4GD5A 2VGQA 3IJXB 4I8CA 3TODA 3ODBA 3O2AA 4KCCA 3PPNA 1N7XA 1MQIA 3A09A 4NTLA 1JW5A 2UVIA 4F2OA 4ELRA 1Q1KA 3T9HB 3C35A 3IR1A 2AL5A 3KGCA 3ONMA 1FW0A 4QFLA 2DS9A 2ABHA 3U94A 1Y3PA 2GRVA 1VSOA 1B3GA 1SYIA 5FTHA 3N6TA 4G68C 4NF6A 4UACA 4RPNA 1SW1A 4QSDA 3C33A 2NUVA 4ESXA 5KDTA 3N26A 1UIUA 1M5EA 1SW5A 5DVIA 3PUYE 1I6AA 2W7YA 1XVXA 1A8EA 4UA8A 4EUOA 4NF8B 1J1NA 2QMWA 3QXMA 3KSXA 1ELJA 1AMFA 4R6YA 3B6WA 1A55A 5FHNA 4X9TA 3WAFA 4FAJA 4F3PA 3OENA 3HCQA 3SEXA 2F34A 4H8IA 2H4IA 1FTLA 3V89B 4F3BA 3FXQA 3CG3A 1R1NA 2Y7KA 2ALUA 2RCBA 3CRBA 2ZMBA 4U1OA 4ECFA 1EZOA 2R6GE 2YJPA 3MP6A 4O3CA 1N3XA 2G29A 1JVXA 5H8FA 4ZEIA 2DQVA 3I3VA 4M1VA 3FIRA 1LFHA 1IUDA 1PEBA 3VVEA 2Q9TA 2Q89A 4POWA 4YU0A 4IB2A 4DXBA 3HN0A 4F1UA 4YKPA 4YKJA 4ZDMA 2VD3A 4IO7A 3PV0E 4PFUA 2OZZA 3T22A 3IJOB 3GBBA 4MH5A 4KD5A 4R2BA 1QUIA 3S9NC 2XXXA 3OXNA 3SESA 3FV1A 4Q5TA 4FEBA 1B3LA 2A5SA 5I2KB 3SEVA 5I2NA 3RUMA 3TZAA 3MPLA 5DVJA 1PB7A 2H98A 1QUKA 2DWAA 2F6GA 3P7IA 1YCJA 4RK9A 1XOCA 3CR9A 2GFEA 3LUYA 4R9GA 2CMOA 3KSJA 3FASA 4JWYA 1HSJA 2F7BA 5B7DA 4HCYA 1MPBA 1L5TA 1IXGA 3G3FA 3VV5A 4BDRA 3FGSA 1I69A 4G68B 3VFJA 4WKMA 3VLUA 2Q2CA 1B3HA 2DOJA 3FD3A 1UTHA 3GLBA 1TXFA 1FTOA 2LAOA 5DT6A 1MXWA 4QFOA 1B46A 1MM6A 2HXWA 1IIWA 2RC7A 5ICTA 1P1NA 5I58A 4RNSA 5L8DA 3VVDA 1ANFA 3PMXA 4LUBA 3OSRA 4KCDA 1B4ZA 3D4GA 4Z0IA 3RTFB 2XXPA 2RC9A 1PB9A 3S9LC 3PPQA 3U8QA 1IXCA 5AA2A 3U93A 4KYEA 4E0WA 3IB1A 3DLNA 3T9XB 3K1NA 1FTKA 2XXRA 4YICA 3VE1B 1H76A 1YAEA 2YLNA 3TCFA 1SW4A 2DSFA 3FATA 4RXLA 1TT1A 4AB5A 3B6TA 3EHUA 1WODA 3MC2A 1B0LA 5H8SA 3KEIA 3HV1A 2XD2A 1QW0A 3KFMA 4IO4A 4LVQA 2FA7A 1EU8A 2KLFA 1O7TA 4C1TA 1PBPA 2DWJA 4IGRA 2O7IA 4GFRA 4U1ZA 4TQUQ 3N6UA 1QKBA 4DCXA 1LCTA 3FV2A 2OJTA 4H67A 2DVCA 5EHSA 3R26A 2FYIA 2B65A 1Z7NE 2ONSA 2ZYKA 3CFLA 4OMBA 1XT8A 3PD8A 2D5WA 3EHTA 3USDA 1B7UA 4I1DA 3W9VA 4PP0A 3RT8A 2F7AA 3TQWA 5K2YA 5I57B 3M8UA 5CI5A 3MP1A 2F97A 2VOZA 2I4BA 3U72A 3ZKLA 4F3GA 4H0WA 4OESA 2X7QA 2GH9A 3S2VA 1M5BA 2RC8A 1LFIA 1DTZA 3PU5A 2Z8DA 5ITOA 1R9QA 1D9VA 2XD3A 2Y7PA 1B51A 3I5OA 2V93A 1LLSA 2Y7IA 3MBPA 3KOTA 4BDQA 5F7VA 1FQDA 1EZPA 3MVYA 3CFZA 3O6HA 4YKKA 1B9JA 1N0TA 3PUXE 1OQGA 4EQ9A 1NNKA 1B2HA 4DE8A 3RTWB 1S7YA 1ATGA 1H44A 4ISUA 3IOWA 2I3VA 1QULA 2RCAA 1NNTA 1RKMA 4K3FA 5JEIA 2REGA 2AIXA 3SERA 3KBRA 3MP8A 2V84A 4XTCQ 3C4MA 4ZECA 3LC8A 3C9HA 3UK4A 2XXQA 3V8XB 3FVOA 3QUJA 2PT1A 3IO6A 3T66A 2V3QA 2NVUB 1QVSA 2XXHA 2DE2A 5AA2B 1JNFA 3RY3A 2P1SA 4F22A 1OLCA 2P2AA 3IOTA 3Q25A 1IXHA 4OERA 3RN8A 3UA8A 4DCYA 1ZIUA 3O97A 3MZ9A 4R75A 3V83A 3B7DA 3G3HA 3W9WA 4R9FA 5DEXB 4LONB 1SDXA 1GR2A 2F7CA 3TFLA 3G3IA 4BDOA 2OWSA 1HSLA 3OO6A 4C0RA 4EQBA 3OO7A 1URDA 3E4RA 3EN3A 3HSTA 2XX8A 3F11A 1S50A 1B1XA 2VD2A 4KQPA 4O3AA 4G4PA 2ESNA 5HM4B 3E3KA 5FTIA 3MWBA 1F9BA 3SKPA 1R9LA 1SD3A 4QSCA 3C36A 3B6QA 3HO7A 1CB6A 2REJA 1DPPA 1FTJA 1FQFA 5I56A 4NF4A 2ZNTA 1H45A 1N76A 1VFDA 1SI1A 1XVYA 1DPEA 3H6VA 5JK4A 3O6GA 3CG1A 3K01A 4MLQA 4ELOA 4JBZA 3DM0A 3MW0A 2THIA 2FNCA 3GXAA 1TFAA 1B6HA 1UTBA 2E0SA 3TCHA 3K2DA 1B40A 4XKRA 1MXXA 1B5IA 4P0IA 5TP9A 4IY6A 3CI8A 1NNFA 4OFOA 4TLLB 3K6UA 1AH5A 5CMBA 4JXIA 1AOVA 3ZKKA 4IGTA 2A5TA 3CSGA 3PGFA 3FXRA 3H3GA 3ILTB 2B3BA 4U22A 4G8MA 5H8HB 4U2RA 3MUQA 2M8CA 3L6GA 4U23A 4I62A 2OCUA 5A5XB 4GLIA 4KHZE 3MZBA 1B7HA 4U4SA 4FJPA 5CC2A 1JW4A 4TLMB 2XXWA 1B52A 5ISUA 2XXYA 2O1LA 5TPAA 2DVZA 5JTYA 4NMYA 2DWIA 4X48A 4F2QA 2GHBA 4BDNA 3R7XA 1JEUA 4NWCA 3BFUA 4ZEFA 1M5DA 3OEKA 3MPKA 2O51A 3UIFA 4QFKA 3QIMA 1GTKA 4MF3A 2PVUA 2H9BA 4YB5A 5IKBA 5J1DA 4PFWA 3K6VA 3KOSA 2Z22A 5CM6A 3DP4A 2UXAA 4H65A 4NF5A 1QUJA 2I49A 2Y7RA 1LB9A 1BKAA 4ZEDA 1DSNA 4OZ9A 4OFJA 5H8NA 1MDP1 3IOUA 3LBSA 3MVXA 1XS5A 1POTA 2H99A 2O68A 4GRKA 3FVKA 1XHYA 4EXLA 2OK2A 2R71A 1Y3QA 3K02A 2ZYMA 3O6IA 1OIBA 1GGGA 2ZNSA 1NH8A 3MJNA 1IXIA 4ZZAA 2HCAA 2XXIA 1N04A 1JW1A 4I9DA 3K4UA 3HPIA 1MY3A 2I58A 4NF6B 2QL3A 4GF8A 4EXKA 5I56B 1ZKBA 1EH3A 4KYDA 5F1QA 5KDTB 1BP5A 2F8DA 1MY4A 2QJEA 3PUZE 4LQ2A 3PPRA 3VLVA 1MDQA 1ZJLA 2RF1A 4IO5A 1P99A 4P11A 1ZMGA 4F29A 3U92A 2I3WA 2UVHA 3KJTA 1OLAA 3TTMA 1LAXA 4GVOA 1A7LA 3QSLA 4HCWA 3WAEA 1SW2A 4FATA 4ZZEA 1Y9UA 1DOTA 3E9XA 1OQHA 3PUWE 4H5FA 3BKIB 2Q88A 4HS7A 3BFTA 1II5A 1D9YA 3S9MC 5HBCA 3TTRA 4ELQA 1Y1ZA 4YAHX 1MXZA 5H8FB 3KN3A 1ZU0A 2WKYA 4EDPA 1BTJA 3DP6A 3OOAA 1B5JA 3SDFA 1AL3A 2NXOA 1WDNA 3TYHA 5H8QA 5I59A 4QRZA 5TPAB 5JTYB 2Y84A 4BDLA 5AA1A 3THIA 2D21A 3H03A 4WEPA 4HW8A 5I2NB 5AE4A 4IY5A 4NWDA 4F18A 2DP8A 1B0HA 2ONRA 4ONYA 4LA9A 2I6EA 1Y1MA 2HZKA 1MXUA 3EPEA 4R72A 3FVGA 1NH7A 3FJMA 3JYRA 3Q29A 4OYVA 5AA4A 2XXUA 2PMSA 1LB8A 1VE4A 3SEYA 4AB6A 4OHNA 4ZEKA 2R9JA 5H8NB 2UYEA 4ZE9A 1URGA 1Y20A 3MVWA 2V3UA 1UTHB 4GXSB 3IB2A 2DYXA 4PFYA 4ND9A 3DELB 1DTGA 4FEDA 4FORA 2F5XA 2P0SA 1TWYA 4LZ5A 1LGBC 3TTLA 1OVTA 3VDFA 3JV9A 5I58B 2DE4A 5ITPA 4WEDA 3TELA 3UGWA 4GQOA 3S4UA 3M3LA 3CVGA 1S9TA 5FHOA 1LAGE 4ZEBA 3KG2A 1NKXA 2F35A 4F1YA 3N5LA 4PETA 1B3EA 4LATA 2ANJA 2ZXTA 1PB8A 3RQTA 2PX1A 2XXTA 4POXA 1LCFA 1R6ZA 1IQ7A 3VXCA 3EQ1A 5I2KA 4RYAA 2X26A 4C1UA 1MQHA 4JSOA 1B1HA 2HEUA 2VP1A 3TQLA 4QFPA 3LSFB 1IZ1A 5EHMA 4KYSA 2GHAA 1PC3A 4RJZA 3G3GA 1EZ9A 4Q8RA 4H1XA 4ZS9A 1H3DA 2F78A 4MFIA 3H6UA 3UP9A 4BLAA 4N07A 3GBAA 3FJ7A 4R74A 4QHQA 4G68A 3V5AA 1LBBA 4N6PA 4Q30B 3PMWA 4FIMA 1NFTA 3R6UA 4OTEA 2QPQA 3LR1A 1QJMA 2UYFA 3D4CA 1MY0A 1KWHA 3O66A 3SEWA 5KZTA 3K6WA 4P0GA 2QSXA 3RT6B 4RPOA 5H8QB 4YZZA 1A40A 4KR5A 5I59B 1MXVA 4IO2A 1PBQA 1IEJA 5DYHA 1MH3A 3TEPA 2F36A 1N7WA 1P1WA 1SBPA 1ZBMA 3Q28A 4DXUA 4OFLA 1P1OA 5L9OA 3RLFE 2Q8JA 3M3FA 3H7MA 1A54A 5L9MA 4U4XA 3EF7A 3QUFA 3G3JA 5HPQA 4F3SA 4G8NA 3IB0A 3C32A 2NOOA 5AA4B 4RA1A 1JETA 3GZGA 3OSQA 4YKIA 4ELPA 1B32A 1SQYA 1US4A 3CIJA 4GOTA 3T93B 1FQEA 4KFQA 1POY1 3K6XA 3L6HA 4H5GA 3IL1B 3TDJA 2O6AA 3G3KA 2PT2A 5IAIA 4QFNA 2PBWA 3FJGA 3ECRA 3IX1A 4THIA 1D3KA 2H5YA 5B70A 1O63A 3IOVA 4KI0E 2Y7WA 1ZLQA 1PDAA 3ZSFA 2HAVA 1MH4A 4Q0CA 1MPCA 1DMBA 1MQGA 4AQ4A 1ZTYA 2AL4A 3OO8A 4GL0A 5KCJA 2RINA 3SEUA 4OXVA 2UVGA 3G7WA 4NEDA 1MQJA 4XXUA 1B7ZA 3U1OA 3AXFA 5I57A 4OEVA 4PFTA 4OETA 3TUSA 4R6KA 4IO6A 1FTMA 3KZGA 4Z7EA 2ZNUA 4H6DA 3A3UA 2BJJX 3H06B 2O7UA 4LP2B 4KPTA 2I48A 4TOZA 3T9VA 1SI0A 3OMBA 2OBGA 4N13A 5ICQA 1MY1A 2QS4A 2HAUA 4X1BA 5TU0A 4M4GA 3QYTA 4IO3A 5CBRA 1MQDA 2D3IA 4XKQA 5LOMA 2O1MA 3T96B 3FXUA 4PQJA 3LSWA 4LZ8A 3K00A 2XX7A 1YTVA 2V25A 2ZYOA 4GL8A 3O29A 2IA4A 1CE2A 1Z7ME 1OVBA 3TAJA 3RGYA 3BBRA 2B3FA 3KN7A 1N3WA 4G77A 2E1SA 2QS1A 3KJ7A 4QSEA 2DE3A 3Q27A 4OEUA 2IEEA 3UN6A 1B3FA 1A8FA 4FECA 4G2ZA 1NL5A 2AYSA 2I0BA 3K1PA 5CRYA 2PYYA 3QAXA 1LBCA 2XXVA 4NF4B 3RNNA 1WVJA 3VXBA 3MVZA 4GWOA 4OENA 4EQ7A 5EYFA 3C31A 3M3KA 3VLWA 4DDDA 5BUUA 2V3TA 3PPOA 2I0CA 1I6QA 3K0VA 4O3BA 2QMXA 1P1UA 3S9EA 3EHSA 1JQFA 1SVXB 3PD9A 4ZE8A 3W15C 1NMUA 4JDFA 1UTBB 3TCGA 4PE5B 4RY1A 1AIVA 1TFDA 1LSTA 3QK6A 5TP9B 3LSLA 4HTGA 5ELVA 3TMGA 5DEXA 4EF1A 4FE8A 1VFEA 2A5TB 3O28A 3MAMA 1JVYA 1USYE 2UVJA 2QS2A 4BDMA 4RK2A 2X7PA 3UORA 4YB7A 1MS7A 1RYXA 4R2FA 5K2XA 4F19A 2QRYA 4F31B 1MG1A 1LAHE 4DXCA 3MQ9A 4XKNA 4MLVA 3Q26A 1BIYA 4YMAA 1N84A 4OWDA 1O64A 4MBPA 1B05A 3TTKA 4OVJA 4JB7A 2ONKE 4G8HA 1T0KA 1BLFA 1NNPA 2O69A 3I6VA 4GIZA 3JZJA 1MXYA 1RYOA 3A3CA 2Z8FA 3CSBA 4X1DA 1UQWA 5KCJB 3DP8A 2XX9A 1Y4TA 1FQAA 1QKAA 2ZYNA 4DZ1A 3HHGA 2DXRA 2OLBA 1IITA 3FVNA 5I84A 2CZLA 2HZLA 2G93A 4XIGQ 3E13X 2F6PA 3OD7A 4LZ7A 5CMCA 5BWJA 1UIVA 3TPAA 4GXAA 4R73A 2RKMA 4NF8A 2YPNA 4YMBA 3MZ1A 3RPWA 1MPDA 5CMKA 2HQ0A 4NF5B 3PPPA 1P1QA 3IO4A 3OELA 3IAZA 4XKPA 1M5FA 4QF9A 4E0XA 2I4CA 4U21A 2Q2AA 4JWXA 1Y4CA 3ZS6A 1GVCA 3PMVA 2DWHA 1FCKA 1B58A 3H6WA 5M2VA 1GV8A 3TKDA 5CBSA 3CFXA 4OQOA 5H8HA 1LAFE 5AA2D 2OWTA 3K1MA 1USYH 5A5XA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2UVJA 2QS2A 4BDMA 4RK2A 2X7PA 3UORA 4YB7A 1MS7A 1RYXA 4R2FA 5K2XA 4F19A 2QRYA 4F31B 1MG1A 1LAHE 4DXCA 3MQ9A 4XKNA 4MLVA 3Q26A 1BIYA 4YMAA 1N84A 4OWDA 1O64A 4MBPA 1B05A 3TTKA 4OVJA 4JB7A 2ONKE 4G8HA 1T0KA 1BLFA 1NNPA 2O69A 3I6VA 4GIZA 3JZJA 1MXYA 1RYOA 3A3CA 2Z8FA 3CSBA 4X1DA 1UQWA 5KCJB 3DP8A 2XX9A 1Y4TA 1FQAA 1QKAA 2ZYNA 4DZ1A 3HHGA 2DXRA 2OLBA 1IITA 3FVNA 5I84A 2CZLA 2HZLA 2G93A 4XIGQ 3E13X 2F6PA 3OD7A 4LZ7A 5CMCA 5BWJA 1UIVA 3TPAA 4GXAA 4R73A 2RKMA 4NF8A 2YPNA 4YMBA 3MZ1A 3RPWA 1MPDA 5CMKA 2HQ0A 4NF5B 3PPPA 1P1QA 3IO4A 3OELA 3IAZA 4XKPA 1M5FA 4QF9A 4E0XA 2I4CA 4U21A 2Q2AA 4JWXA 1Y4CA 3ZS6A 1GVCA 3PMVA 2DWHA 1FCKA 1B58A 3H6WA 5M2VA 1GV8A 3TKDA 5CBSA 3CFXA 4OQOA 5H8HA 1LAFE 5AA2D 2OWTA 3K1MA 1USYH 5A5XA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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