3IOUA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c94
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
416
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQPPPPPPPPPPPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 102
structure length 402
sequence length 416
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iouA02
3H6TA 2A5TB 3PPPA 4RK9A 3EHTA 2O1LA 3WAFA 3S2VA 3G3FA 2RKMA 3I5OA 1R1NA 3FJMA 1B58A 4NMYA 2XXYA 4LQ2A 1IEJA 4G68C 2QS1A 1MPCA 3U72A 1SBPA 5KCJB 1AIVA 1SI0A 4GQOA 1JVYA 4WXJA 2Y84A 3W9VA 3W9WA 3MP6A 1MG1A 1N0TA 2ZNSA 1USYE 3TYHA 3ZKKA 1LLSA 1NH8A 2O6AA 2DYXA 3PPOA 5HBCA 1JVXA 3D4CA 3CIJA 4X48A 3FV1A 4DXUA 4NF4B 2G93A 3TFLA 4PFTA 4GVOA 5KDTB 5FTIA 1LCFA 3PV0E 3QUFA 3RTWB 4OEVA 5EHSA 1QUKA 2P1SA 1MY1A 3IAZA 1PB8A 4IO7A 4IY5A 4Q30B 4EXLA 2H99A 1ZTYA 1PC3A 3ONMA 1B1XA 4OFJA 3MVYA 4OESA 3TEPA 1EZOA 1H44A 1YCJA 3EPEA 1AOVA 3PPRA 5CMMA 3B6QA 4RJZA 1ZMGA 3K02A 3PUXE 1DOTA 2I3VA 1Y3PA 4X1BA 5AA4A 2V84A 4NF8B 4FJPA 3FATA 1DPPA 3KN7A 2YJPA 4R2FA 1P99A 4TOZA 3L6HA 3H7MA 1TFAA 1WVJA 3QSLA 4DIGA 3LSFB 2I0BA 1ZJLA 4XKQA 4Q8RA 5J1DA 3V5AA 4KFQA 4QRZA 4O3BA 4PQJA 1A7LA 4RY1A 4O3CA 4QSCA 3RT6B 1XS5A 5BWJA 1MQDA 2ONRA 2REJA 3KFMA 5H8FA 2ALUA 3C9HA 4QFPA 1URSA 2YLNA 1OIBA 1B6HA 4OTEA 4LQ5A 4MBPA 1PB9A 1B2HA 1WODA 1Y1ZA 5I57A 3OENA 5H8QB 4PFYA 3TDJA 3HN0A 4EQ7A 1D3KA 3OEKA 4ONYA 3G3IA 3O29A 3DLNA 2NXOA 3CR9A 5CMKA 1LSTA 2UVIA 3GLBA 3VLUA 1AMFA 2OWTA 1MDP1 5CBSA 1B3GA 4BDRA 3VFJA 4I9DA 4XIGQ 3MP8A 1LAFE 1MXVA 1T0KA 4YMAA 1SW4A 4PFWA 3O66A 3KJ7A 4O3AA 5AA1A 5CI5A 1B32A 4ECFA 1A8EA 1IQ7A 3IO4A 2XX9A 2Y7WA 2QS4A 1LB9A 4H5GA 4Q0CA 2ONSA 1QKBA 3K4UA 1POY1 4U2RA 4ZECA 1JNFA 3UIFA 1P1WA 4FAJA 4FORA 2RCBA 2UYFA 2RC8A 4GFRA 4IO5A 2A5TA 4LUBA 3N94A 3RQTA 2Z23A 2P2AA 3U1OA 2NWJA 3SEYA 1USYH 3BKIB 1A54A 2Z8DA 1NL5A 1N3XA 1F9BA 4QFNA 1RYOA 3VDFA 4ZZAA 1D4NA 2B3BA 2CZLA 1B3HA 1EZPA 2F34A 4IO2A 5KCJA 2THIA 4G8NA 3VVDA 3C32A 3K00A 1B4ZA 3PD9A 3TKDA 3UK4A 2R71A 3HHFA 3RTFB 3KEIA 3A09A 1MM7A 3LBSA 3TTMA 1Y3NA 4NF5B 4H6DA 4E0XA 4MF3A 3GBAA 3N26A 4N13A 4POWA 4G2ZA 2GH9A 3UGWA 2PYYA 2I6EA 5ISUA 4ZDMA 3SETA 1POTA 1AH5A 2VD2A 4NF4A 3LSLA 5HM4B 5KDTA 3M3LA 1GGGA 4I62A 1FTMA 2HZKA 3D4GA 5CRYA 3DP6A 1A8FA 4MH5A 3LUYA 1RKMA 2ZYOA 4YKKA 2FA7A 4I1DA 2DOJA 2O1MA 3OEMA 1FQFA 1A55A 3C4MA 3MZ1A 1OQGA 4ISUA 5TU0A 2AYSA 2F8DA 4NF6B 4MLVA 1MXWA 2B65A 3FASA 3DP4A 1SDXA 1FTLA 3S9MC 4OEUA 3V89B 4NF8A 2W7YA 1IZ1A 5TP9A 1MQJA 4U23A 5AA2B 5F7VA 3KJTA 4IO3A 3USDA 2H5YA 4RXLA 2Q8JA 3N6TA 3RLFE 1B40A 3QIMA 5JK4A 3IX1A 3PUVE 3E3KA 2I49A 1XOCA 2F78A 3SDFA 1B7UA 2XHDA 4KQPA 4NWCA 4RK2A 2F5XA 1VSOA 5LOMA 2VGQA 5L9SA 3TQLA 4EUOA 1B3LA 3JV9A 4F39A 1YTVA 2HEUA 5L8DA 5B7DA 3IK6B 2HQ0A 5H8QA 3DP8A 3O2AA 5CBRA 1LAXA 3A3CA 3RPWA 1S7YA 3QXMA 2DE3A 1FTOA 3MWBA 4QFKA 1SW1A 4FEBA 4P0IA 1MH3A 1M5EA 3FUZA 4LZ5A 1JW5A 1FCKA 3UP9A 1FW0A 4YKPA 3FJGA 4LZ7A 3TTRA 2DSFA 3MPLA 1DPEA 2ZYKA 3MJNA 5K2YA 4JSOA 3U92A 4DXCA 5CM6A 3THIA 1TT1A 1M5BA 3UA8A 1QULA 1P1NA 3UORA 3R26A 4F19A 2R9JA 1XT8A 1ELJA 2UVGA 4U22A 1VE4A 3EF7A 4WEDA 2DVZA 3O6IA 4R2BA 3MC2A 1NFTA 3ODBA 1JW1A 3EN3A 3E13X 3U8QA 1I6AA 2ZYNA 2VP1A 3KSJA 3MZ9A 2UXAA 2H25A 3G3KA 3ILTB 3ZKLA 3TQWA 3PPQA 2QS3A 3VVEA 4G77A 4G68B 4RNSA 2O69A 4G4PA 3K1PA 2XXQA 1QUJA 4IGTA 4HS7A 4OERA 4M1VA 4R73A 4C0RA 2Z8FA 4LZ8A 2KLFA 2NVUB 2VD3A 4NF5A 1UTHB 4GXSB 4LATA 2A5SA 2O68A 3Q26A 3RNNA 2XXRA 3MW0A 3I3VA 3W15C 3G3GA 4AQ4A 4YKIA 1QKAA 2NUVA 3TZAA 3FIRA 3SEVA 4ZEDA 2OWSA 3V8XB 3U93A 2B3FA 4AB6A 2X26A 3T9XB 3ECRA 2XXPA 4OHNA 3S9NC 4NEDA 1DSNA 3UN6A 3HHGA 4C1UA 2XD3A 3KG2A 4YU0A 5L9OA 3TCHA 1LBBA 4QHQA 2ZNTA 4HW8A 4KR5A 1QUIA 3CI8A 2DWHA 1JW4A 3O6GA 2V93A 4NF6A 4BDQA 4F2QA 4U1ZA 2RC9A 1PBQA 3IB2A 3M3FA 1B05A 2PMSA 1MY3A 4DCXA 4LP2B 4F31B 1N7XA 3SEWA 3MQ9A 4KPTA 1MQGA 5TP9B 1OLCA 1OVTA 3CG1A 3K6VA 4KHZE 1II5A 3FVNA 4H8IA 4EQBA 1IXCA 5AA2A 3FXUA 3H6WA 2M8CA 1LAGE 4QF9A 4HCWA 4UA8A 2RINA 3R7XA 5DVIA 1P1OA 1B0HA 4F29A 1QJMA 4U4XA 1NNKA 2REGA 4FIMA 3H6VA 1NMUA 1A99A 1QVSA 3KOTA 2QJEA 3TMGA 4ZZEA 5H8SA 1GV8A 3BFUA 3H6UA 2Y7PA 5IKBA 5DTBA 1MQHA 2RCAA 2UVJA 2VHAA 4H1XA 5K2XA 1S50A 2D21A 1S9TA 3OXNA 1SD3A 1PB7A 1HSJA 4YMBA 3MAMA 3Q29A 1UIVA 4E0WA 4ELPA 4XKRA 1MPBA 1LFGA 3G3HA 1SQYA 4R6KA 4OMBA 1ZIUA 2ZYMA 1JEUA 4GRKA 1R6ZA 1UIUA 4Z0IA 3K6WA 4KCCA 1M5FA 1B52A 5ICTA 1WDNA 5HPQA 5F1QA 1D9VA 4N07A 1Z7ME 1B5HA 2OLBA 1FQAA 1FTJA 2Q9TA 5JTYB 3DELB 1CB6A 3V83A 1URGA 2Y7KA 2F7BA 4BLAA 3GZGA 4F1YA 3TUSA 1OVBA 1B7ZA 3PU5A 3LSXA 3IB0A 2XXUA 2G29A 4FECA 3FVKA 4F3GA 2DVCA 3HV1A 4TQUQ 2AL5A 5TPAB 1MXYA 3C36A 1Q1KA 3IO6A 3HO7A 4G68A 1LBCA 4YB5A 3KOSA 3B6WA 1MQIA 1NNPA 1DTGA 4EF2A 3WAEA 3T9VA 2GFEA 3RN8A 5ITPA 4H8JA 1UTHA 3CRBA 2RF1A 1MPDA 1N7WA 3LSWA 2I4BA 4KYDA 1MY4A 3TTNA 3B6TA 4ELOA 4EF1A 1VR5A 3GXAA 4ZEIA 4QSDA 1MRPA 3IR1A 2D3IA 2Q89A 1MXUA 3OSRA 3VVFA 2AL4A 1TWYA 1N04A 4WKMA 2F7AA 5FHMA 3IJOB 4QFLA 4GF8A 3OO8A 3OMBA 4TLLB 4F22A 1NNFA 5DYHA 3T9HB 5I56B 3K0VA 1CE2A 2GRVA 1Y3QA 2ANJA 1H76A 4AB5A 4U1OA 5BUUA 3PUWE 2PT1A 1QW0A 4DDDA 5I84A 2DP8A 1IIWA 5DVJA 4OFOA 2DE4A 1TFDA 4JWYA 4MLQA 4Q5TA 5I2KB 1ANFA 3H03A 4X9TA 1URDA 4F3PA 4YAHX 3C35A 2FYIA 4BDMA 2IA4A 3T93B 3OOAA 1LFIA 3PGFA 2QRYA 2UYEA 4XKPA 3RUMA 4F2OA 3QYTA 3S9LC 1I6QA 2DXYA 1FQCA 2E1SA 2XD2A 2O84X 4XTCQ 1SYHA 3TCGA 3G7WA 4KI0E 4ND9A 2XXIA 4JSDA 4ZE9A 3PPNA 1B1HA 4POXA 5DT6A 1MY2A 3B7DA 2HAUA 3PUYE 4EQ9A 1N84A 3FZVA 4YKJA 4IB2A 3OD7A 3OO6A 2H4IA 3H3GA 2HZLA 5M2VA 5AA3A 4PE5B 1JEVA 1Y4CA 1H3DA 2V3QA 1Y1MA 3BFTA 1XVXA 3K6XA 4GD5A 1GTKA 1IITA 3OELA 3N6UA 4YB6A 1ZKBA 4P0GA 2NOOA 4P11A 2XXTA 4R9FA 3VLWA 3SEXA 5H8HB 3ZS6A 3N5LA 4F3SA 2XXWA 5JTYA 3MBPA 2DXRA 4OYVA 3IOWA 1B4HA 1GVCA 3RGYA 3VV5A 3CG3A 2HCAA 4JB7A 4R9GA 1B5JA 4G8HA 4XKNA 1UQWA 3CSBA 2OK2A 3SKPA 4NTLA 3O9PA 4YICA 1Z7NE 2DE2A 3G3JA 4MFIA 3QAXA 1OQHA 1BKAA 3TPAA 5I2NB 2ZXTA 2PT2A 3SEUA 4R75A 1B9JA 5DEXB 4IO4A 5TPAA 2HFBA 3TAJA 2HXWA 2ZMBA 1MS7A 3MPKA 1LFHA 4K3FA 3EQ1A 2HAVA 4R74A 5H8NB 1MY0A 3VXCA 3CFLA 2X7PA 1SVXB 5AA2D 3LR1A 4C1TA 2Q88A 2IEEA 1US5A 5KZTA 1MH4A 4NWDA 1UTBB 3O97A 4R6YA 4JBZA 2X7QA 4QSEA 3Q27A 5I59B 1IXIA 1BP5A 2RC7A 3MVXA 3MVWA 2VOZA 5ICQA 4PETA 1IXGA 2YPNA 1LCTA 1MDQA 4DE8A 5A5XB 1SW2A 4OXVA 3FD3A 3T96B 1B3EA 3AXFA 4WEPA 3ILUB 2Q2AA 1BLFA 1YAEA 3E9XA 1HSEA 2DWAA 1NKXA 1MXXA 2QS2A 5ELVA 4H5FA 1DTZA 3EHUA 2F6PA 4LA9A 4R6HA 4FATA 3PMXA 4OFLA 3IB1A 2O51A 2O7UA 3S9EA 1O64A 2QMXA 5I56A 1O63A 4UACA 3IOTA 1SYIA 1L5TA 2V3TA 3K01A 3FVGA 2OZZA 4KYSA 4DXBA 1XVYA 5DVFA 1FQEA 2DWIA 4F1UA 1Y9UA 5I2KA 1EZ9A 2AIXA 4KYEA 3MP1A 3MZBA 1GR2A 3T66A 3CFZA 3R6UA 4GL0A 2PVUA 4FE8A 1KWHA 4HTGA 4X1DA 1IUDA 4L17A 4DCYA 2ESNA 3Q28A 3LC8A 1VFEA 1NNTA 3K6UA 1I6BA 4BDOA 3DM0A 3IOUA 3M8UA 4N6PA 3K2DA 4F3BA 1H45A 4GIZA 4ZE8A 4EDPA 3CVGA 4XXUA 1AL3A 1N76A 3K1NA 5I58B 1OMPA 2F6GA 4OVJA 2ABHA 4PFUA 4THIA 3KN8A 5AE4A 2I58A 5B70A 1H43A 1M5DA 1RYXA 4ZEBA 5L9MA 3ZSFA 3FGSA 3RT8A 3IJXB 3OO7A 3PD8A 3HPIA 1R9LA 2XX8A 2DWJA 4QFOA 2CMOA 2Z22A 1EH3A 3Q25A 3T9UA 2D5WA 4JWXA 2P0SA 3F11A 2XXXA 2Y7RA 3KZGA 3P7IA 1MM6A 1B51A 3E4RA 5IAIA 4Z7EA 5EYFA 3TODA 4GXAA 5H8HA 3O6HA 3KN3A 3MVZA 1M5CA 1XHYA 3TTKA 1FQBA 4M4GA 2F35A 1US4A 4IGRA 2UVHA 2Z8EA 4U21A 4ELQA 2DQVA 3IL1B 3VE1B 2XXVA 4GWOA 3C31A 5I2NA 3PMWA 5FTHA 1SI1A 3KBRA 5DEXA 3L6GA 4FEDA 2QL3A 4I8CA 2BJJX 1HSLA 2GHBA 4H0WA 3BBRA 2V3UA 4GOTA 5H8NA 3MUQA 2E0SA 2WKYA 1J1NA 3C34A 1BTJA 2LAOA 1P1QA 1DMBA 1N3WA 3K1MA 5ITOA 1B0LA 1ATGA 2GHAA 1UTBA 3CFXA 3CSGA 2H9BA 3VLVA 3KGCA 5I59A 1TXFA 2I4CA 5JEIA 4OQOA 3FXRA 1Y4TA 3FVOA 2F97A 1ZLQA 3PMVA 2OCUA 4BDNA 4ZS9A 1B5IA 5A5XA 4H65A 4JWOA 4IO6A 2DS9A 4TLMB 2F7CA 3IORA 4GLIA 3H06B 2XX7A 4PP0A 3OSQA 2QSXA 4NE4A 1EU8A 4ZEFA 3KSXA 1VFDA 4EXKA 4RPNA 3FJ7A 4R72A 3S4UA 3GBBA 4BDLA 2H98A 1I69A 3QK6A 4OZ9A 4RPOA 3HSTA 3SERA 1MXZA 2I3WA 4F18A 4HCYA 3HCQA 5AA4B 1PBPA 3JZJA 1LAHE 1FQDA 3A3UA 4DZ1A 4OENA 1B46A 1PDAA 4RA1A 1Y20A 1SW5A 4ZEKA 2QPQA 3T22A 2OJTA 3QUJA 3U94A 2FNCA 4JXIA 3OO9A 3TTLA 2PX1A 5EHMA 1OLAA 5H8FB 1JQFA 3RY3A 4LVQA 1A40A 4LONB 4F1VA 1LB8A 3TCFA 2Q2CA 1YPNA 1FTKA 2PBWA 1B3FA 1B7HA 4H67A 4JDFA 4ESWA 5I57B 3PUZE 1IXHA 5CC2A 3EHSA 1BIYA 3FXQA 2QMWA 4GL8A 4DLDA 2ZNUA 5I58A 1PEBA 4G8MA 2R6GE 4ESXA 5CMBA 2V25A 3IOVA 5FHOA 1JETA 4ELRA 1P1UA 1LGBC 1D9YA 3M3KA 2OBGA 4OETA 3VXBA 4U4SA 4YB7A 2F36A 1ZU0A 1R9QA 5FHNA 4KCDA 4OWDA 2I48A 1Q35A 4RYAA 1XC1A 3FV2A 3JYRA 4YZZA 3I6VA 1NH7A 2O7IA 1O7TA 3SESA 3H4ZA 3O28A 2Y7IA 3TELA 4KD5A 2I0CA 5CMCA 2XXHA 1ZBMA 2ONKE 3C33A 4IY6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NV4A 2KR0A 3H6TA 2A5TB 3PPPA 4RK9A 3EHTA 2GQ1A 2O1LA 3WAFA 1IMFA 3S2VA 3G3FA 2RKMA 3I5OA 1R1NA 3FJMA 1B58A 4NMYA 2HPGA 2XXYA 4LQ2A 1IEJA 4G68C 4GBWA 2QS1A 4DI4B 2CZHA 1MPCA 3U72A 1SBPA 5KCJB 1AIVA 5ET8A 1SI0A 4GQOA 5EYGA 1JVYA 4WXJA 2Y84A 4LN5A 3W9VA 5I7IA 3W9WA 1FPFA 3MP6A 1MG1A 1N0TA 2ZNSA 1USYE 3TYHA 3ZKKA 1LLSA 1NH8A 2O6AA 2DYXA 3PPOA 5HBCA 1JVXA 3D4CA 1KA0A 4GX4A 1FPEA 3CIJA 4X48A 3FV1A 4DXUA 4NF4B 2G93A 3TFLA 4PFTA 4GVOA 5KDTB 4JVCA 5FTIA 1LCFA 3PV0E 3QUFA 3RTWB 3QMFA 4OEVA 5EHSA 4OVQA 1QUKA 3FXBA 2P1SA 4FBPA 1MY1A 3IAZA 1PB8A 4IO7A 4IY5A 4Q30B 4EXLA 2H99A 1ZTYA 1FBEA 1PC3A 4PAKA 3ONMA 1B1XA 4OFJA 3EKIA 1G0IA 3MVYA 4OESA 3TEPA 1EZOA 1H44A 1YCJA 3EPEA 1AOVA 2WBBA 3PPRA 5CMMA 2L5VA 3B6QA 4RJZA 1ZMGA 3K02A 1NV3A 3PUXE 1DOTA 2I3VA 4O7IA 1Y3PA 4X1BA 1KA1A 5AA4A 2V84A 1YXIA 4NF8B 4FJPA 3FATA 1DPPA 3KN7A 2YJPA 4R2FA 1P99A 4MNIA 4PE3A 4TOZA 3L6HA 3H7MA 1TFAA 1WVJA 3QSLA 4DIGA 3LSFB 1LBVA 2I0BA 1ZJLA 4XKQA 4Q8RA 4KXPA 5J1DA 3V5AA 4KFQA 4QRZA 4O3BA 4PQJA 1A7LA 4RY1A 4O3CA 4QSCA 3RT6B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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