1YYZA

R-state amp complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
IVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase
publication title R-state AMP complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
source organism Sus scrofa
total genus 108
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1yyzA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1yyzA02
2FIXA 1AWBA 1YYZA 2FBPA 5EYGA 4AS4A 2FVZA 1FPFA 2BJIA 3LUZA 4GX3A 4QXDA 1LBZA 1DK4A 1RDXA 1Q9DA 1NV6A 1FSAA 1IMFA 4MJOA 2Y5KA 4O7IA 5ET5A 2HHMA 5EQ9A 4I3YA 1NUXA 2R8TA 1NUWA 1FBGA 4FBPA 2QVUA 3RPLA 3RPLB 4GX4A 1FPDA 5IZ3A 5IZ3B 1NV7A 1KA0A 3FBPA 1FTAA 1FPKA 4G61A 3KC0A 4HE0A 1LBWA 1FPIA 4I40A 1SPIA 1DBZA 5FBPA 4GWXA 2FIEA 5ET6A 1FBPA 1KZ8A 1FPJA 1NV1A 5ESYA 1LEVA 2PCRA 2GQ1A 1G0HA 3IFCA 1NV0A 2P3VA 1EYJA 1NV4A 3KBZA 4N81A 1FPBA 1FPEA 1CNQA 1LBYA 1NI9A 1XI6A 2OX3A 1YXIA 5J16A 1NV2A 1EYKA 3ROJA 3T0JA 1NUYA 1FBDA 2QVVA 4GWUA 5A5LA 2WEFA 2OWZA 3BIGA 2Y5LA 3IFAA 1QGXA 4GBVA 1FJ9A 1DCUA 5LDZA 4AS5A 2F3DA 2FHYA 5F24A 1K9YA 5EYHA 1NUZA 3A29A 4H46A 2QVRA 1IMBA 5ET7A 5I3SA 3RYDA 4PTKA 2JJKA 2DDKA 3QMFA 1RDZA 4HE2A 5EQ7A 1LBXA 2QFLA 4GBWA 3LV0A 1INPA 1FJ6A 2F3BA 1IMEA 4GWWA 5DW8A 1FBHA 3KC1A 5EQ8A 1IMAA 1IMCA 1LBVA 1NV3A 4GWSA 1JP4A 4HE1A 3B8BA 1G0IA 1VDWA 2CZHA 2Q8MA 5EQAA 2CZKA 1KA1A 1K9ZA 1FPGA 1EYIA 1BK4A 2P3NA 2Q74A 1NV5A 5ET8A 4H45A 1RDYA 2CZIA 1FRPA 2WBDA 4GWZA 4KXPA 1FBFA 2VT5A 1YZ0A 4I3EA 5T3JA 5IZ1A 4IR8A 4GWYA 1D9QA 4GX6A 1FPLA 4HXVA 1IMDA 1FBEA 1FBCA 3D1RA 2WBBA 3BIHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WDNA 4RK2A 4YZZA 4AS4A 3NOHA 4G8HA 4PFIA 3LUZA 5L9SA 3THIA 4OZ9A 1LSTA 4XFEA 3MVZA 2RC8A 3VDFA 1SBPA 3FVNA 1SI1A 1OVBA 1LAFE 3IOWA 4R6KA 3RT8A 4N91A 4GX4A 1ZKBA 4BDQA 2KR0A 4MBPA 2XWIA 2H25A 4OVPA 2DYXA 1JVXA 4NF6B 2VP1A 2P1SA 1BTJA 1Y20A 3H3GA 3JYRA 3FVKA 5ITPA 3KBZA 4IO4A 1IEJA 4U23A 1LBYA 2OWTA 1YCJA 4OANA 3LC8A 3R7XA 5CI5A 1N3WA 4QFKA 2XX9A 4EUOA 2UVIA 4QBAA 4FATA 1JEVA 5F24A 4P0IA 1MQHA 3OSQA 1B2HA 3SERA 1IMBA 4H8JA 5TP9A 5IGAA 2HFBA 4BDNA 3A3UA 3MJNA 4K3FA 1LBXA 4EQBA 3HHFA 1B46A 1Y3QA 4F18A 1OIBA 1VDWA 4OESA 2V84A 3MWBA 3TDJA 2FA7A 4QRZA 2VT5A 1J1NA 3PGFA 1POY1 3K6UA 1B5IA 2HCAA 4THIA 4X04A 1Y4TA 5FHNA 3TTRA 4N6DA 2QSXA 2XXWA 4F2QA 1SVXB 3OMBA 2HHMA 3K00A 3G3KA 4PF8A 2NOOA 3VXBA 2Y7RA 3ZS6A 2V3UA 2X26A 1H45A 1SPIA 4BDRA 1MXUA 3TTLA 3IORA 5ET6A 3K6XA 5DVJA 1SW5A 2PFZA 3G3IA 2XD2A 3MZ9A 2ONKE 3R6UA 3VLWA 4MCOA 4F31B 1MY3A 1Q1KA 1B9JA 4QFOA 2HPGA 4HTGA 3MQ9A 3KN7A 2VPOA 4PGPA 3OSRA 5I7IA 4RK9A 2OK2A 3N6TA 4JSDA 3H4ZA 2OWSA 1Y3NA 5ITOA 2I58A 5TP9B 2DDKA 3QUJA 3QIMA 5EYFA 2Q9TA 1IXCA 3B6QA 4L17A 2O1MA 3SDFA 1DPPA 3T96B 3PV0E 5I2NA 4N8GA 5JK4A 2G93A 4DLDA 3K02A 4QF9A 4HCWA 3K01A 1FBEA 4KI0E 3UA8A 3UORA 2QRYA 3C36A 1LAXA 2QL3A 1XT8A 4YKPA 3H03A 2F6PA 3B50A 1H76A 1DK4A 5B7DA 4MJOA 4C0RA 1NUXA 2QVUA 1SD3A 4JVDA 2G29A 2DE2A 3O6IA 3FATA 3LBSA 4YB7A 2RC9A 2UYFA 5HBCA 4GWXA 4PDDA 4F3PA 3FASA 2Q8JA 5CC2A 3S9NC 4GF8A 3CIJA 2O69A 2ZZVA 4NF0A 3EKIA 2OBGA 1DPEA 1MQGA 4IGRA 4XKPA 1LAHE 3TKDA 1VFDA 4H6DA 3IFAA 3RQTA 1US4A 3TCFA 4PETA 1LBCA 2V4CA 4Q30B 1NMUA 1LCTA 2F8DA 4U22A 4KFQA 1MQDA 1PB7A 1B0LA 4MHFA 3DP6A 3TFLA 5IZZA 1B7ZA 4F1YA 1EU8A 2OJTA 2ONRA 2JJKA 3SEYA 1NFTA 5CBSA 1ELJA 1GGGA 4POWA 5K2XA 4WKMA 4OTEA 5BWJA 3EHUA 2GHBA 1DOTA 4WEPA 3VXCA 4MMPA 5I2NB 4QSEA 3OEMA 1FRPA 2XWKA 1JEUA 3PUYE 2AL4A 4YB5A 4FAJA 4OFOA 4MX6A 2GFEA 2VPNA 3IO4A 3ZKKA 1OLCA 2VHAA 3D1RA 1EH3A 1Q35A 4IO2A 2VGQA 2B4MA 2E1SA 3OEKA 1B3GA 3CVGA 3EHTA 4ONYA 5AA4B 5EQ9A 1O63A 2XWOA 1MY1A 4ELRA 4YAHX 2Q2AA 2ABHA 2ZXTA 5DVIA 3OD7A 3W15C 4OA4A 3IOTA 3WAFA 5HM4B 1TWYA 1FPJA 5ESYA 4IY5A 1B4HA 4XEQA 1NV0A 3H7MA 1B7UA 2Z8EA 4LVQA 1JW4A 2DXYA 3L6HA 2QS1A 4ELQA 4PGNA 4RNSA 4YU0A 1NV2A 3T0JA 2FNCA 3FJ7A 5A5LA 4IO7A 5FHMA 3KJTA 3PMVA 1A8FA 4ELPA 1QW0A 3T66A 1DCUA 4OYVA 2O7IA 1SYIA 1BKAA 2QVRA 5ET7A 2F6GA 3RYDA 2ANJA 3GZGA 1QUJA 2VD3A 5EQ7A 4GBWA 2P2AA 1XC1A 3PTYA 1FBHA 5IAIA 3M3KA 3LUYA 1NV3A 4PQJA 4P9KA 4PFBA 1TFDA 1G0IA 3A09A 2CZKA 3U65A 3U93A 1SW2A 3KN3A 2Q74A 1B5JA 5ET8A 1RDYA 2ALUA 2DVZA 2XXIA 4DCXA 1UTHB 3G7WA 3HHGA 5IZ1A 3TTKA 2B4LA 2HXWA 3E9XA 4U4XA 1USYH 1I6QA 4NQ8A 1B58A 3T93B 4RPNA 5AA1A 3V83A 2I49A 1FPFA 1BIYA 2BJIA 1JVYA 4JDFA 4H5GA 5I56B 3M3LA 3RNNA 4I3YA 1M5EA 1NUWA 1FBGA 1Y4CA 1QUKA 1QKBA 4IGTA 5DEXA 1NNFA 2QS4A 5HPQA 1LBWA 4NEDA 4E0XA 1KZ8A 4QFLA 3E3KA 4QSDA 5A5XA 1NNPA 1M5DA 1LFHA 4YB6A 3GYYA 2P3VA 4N6PA 1FTOA 3KSXA 2DVCA 3PPQA 3TUSA 4N4UA 4LATA 3V8XB 1UIUA 2H99A 3S9LC 1ZU0A 1IUDA 3CHGA 2F35A 4H65A 5DYHA 3IJXB 1QGXA 1MXWA 2HXRA 3U1OA 3C33A 3PD8A 1NNKA 2CZLA 3A29A 4H46A 3KG2A 2XWVA 4UA8A 3PMWA 3VLVA 4XXUA 1MH4A 4U1OA 1IZ1A 1B1HA 3FGSA 2F3BA 4O8MA 3FXBA 1MS7A 4LQ5A 3O97A 3JZJA 2OLBA 4N6KA 4XF5A 2P3NA 3GBAA 4JBZA 4F22A 3PUWE 4R73A 1AH5A 1MH3A 4P56A 4EXKA 4DE8A 2F97A 4X1DA 1B3EA 4GWYA 3C9HA 1XS5A 2WBBA 5F1QA 2A5SA 1R6ZA 3MP6A 4XKRA 2FIXA 2BJJX 1PBQA 3G3HA 2E0SA 3H6TA 2DWHA 4O7MA 2RCBA 3KZGA 5ET5A 1P1NA 1LB9A 4ND9A 3TPAA 1IITA 4G4PA 3VLUA 2Y7WA 4PCDA 5DEXB 2L5VA 3RPWA 4F39A 1ZIUA 4P47A 4HE0A 4I40A 1MPBA 3EPEA 4IO3A 5FHOA 5A5XB 1FQEA 3K0VA 4R6HA 2WYPA 1NV4A 2X7PA 1MPCA 1VSOA 1H43A 1XI6A 4MF3A 3K6VA 4POXA 4ZEIA 1IXGA 4OXVA 5LOMA 2GHAA 4ZECA 4OFJA 3RUMA 3OO6A 1XVXA 1D3KA 1UTBA 2XHDA 3QMFA 1PBPA 3HO7A 4NG7A 2ZNSA 3VVEA 4PAKA 5L8DA 4GWSA 3I5OA 1I6BA 2CZHA 3MPLA 2W7YA 1GR2A 2PYYA 4P3LA 3H06B 5TPAA 1BP5A 4IY6A 4IR8A 1RYXA 1LGBC 4MIJA 1A55A 1IMDA 1MY0A 3IO6A 2Z8FA 5EYGA 3FVGA 1ANFA 1LBZA 3MP1A 1RDXA 2DWIA 2V3TA 4BDOA 1IMFA 1A7LA 4PF6A 3U8QA 5ICQA 2R8TA 2I6EA 2UYEA 4YKKA 5IZ3A 1HSJA 3EF7A 3DP8A 3M3FA 2O6AA 4ZEBA 3DLNA 1QKAA 2B65A 1LEVA 2NUVA 4NN3A 4MNIA 2XXVA 4F29A 2B3BA 3FV1A 4XKQA 3TTMA 3KOSA 3QAXA 3WAEA 3SESA 3B6TA 3L6GA 4N81A 3PPNA 1CNQA 3RY3A 1JQFA 4OVRA 2I4CA 4PFTA 1SDXA 1FBDA 3KGCA 4GWUA 3UN6A 5ELVA 4MLVA 4ESWA 1VE4A 5L9OA 1YPNA 3IB0A 2NVUB 2FHYA 3IJOB 3PPOA 3HN0A 1UTBB 5FTIA 2F7CA 1URGA 3PUXE 2DWAA 2RKMA 4GWWA 4GD5A 5EQ8A 3TCGA 2GRVA 4KPTA 3UP9A 3HCQA 1JETA 3QUFA 4RJZA 1EYIA 3KFMA 4Q8RA 5TPAB 1D9YA 3UK4A 4LP2B 4GRKA 5IM2A 4TQUQ 3GBBA 1Y1ZA 5KZTA 4HXVA 1AL3A 4O3BA 2XXHA 1FBCA 2H98A 3MSTA 1ATGA 1D4NA 1NV6A 2Y5KA 2A5TA 3USDA 1US5A 3MC2A 3RPLA 1FPDA 5IZ3B 3TAJA 2F7BA 3K2DA 1N3XA 4F19A 5FBPA 2Y7KA 2Z23A 4WXJA 5AA3A 3HPIA 4MLQA 2CEXA 4H1XA 3T22A 4I8CA 5AA4A 5LTCA 3ZKLA 2THIA 3LSXA 3R26A 2OX3A 4YKIA 1YXIA 3LSLA 4Q0CA 1Z7ME 3MPKA 4OMBA 2OZZA 4U21A 1H3DA 4X48A 4KD5A 1N84A 2XXUA 1K9YA 3KBRA 2F5XA 2PX1A 1PDAA 4NF8A 4HE2A 1R9QA 4LZ8A 2D3IA 4F3SA 2Q2CA 4FE8A 3SEWA 4GFRA 4HE1A 3C4MA 4KYSA 2AYSA 5K2YA 2M8CA 1S50A 1TFAA 1NV5A 3PUZE 4FIMA 4I3EA 4QHQA 1A40A 3PD9A 1DSNA 4GX6A 3U72A 1DMBA 3P7IA 1L5TA 2QMWA 4DXUA 4R6YA 2R71A 1GVCA 3N94A 3S9MC 4PP0A 5DT6A 3N5LA 2R6GE 3UGWA 3G3FA 4H0WA 1FCKA 2A5TB 4PBHA 1MXXA 3D4GA 2WX9A 1OVTA 3BKIB 1UTHA 3RPLB 1NV7A 4NWDA 1O7TA 1EZOA 4P1LA 3HV1A 3OENA 3FXQA 1P99A 3FIRA 5J1DA 4O3AA 1G0HA 1Z7NE 5I56A 4XTCQ 1LCFA 2HZKA 4MEVA 4GOTA 1FPBA 3FJMA 1URSA 1B1XA 3C31A 3RTFB 4DDDA 1NI9A 1A99A 2DS9A 4AQ4A 1MXYA 2D5WA 4N15A 3H6WA 3Q25A 3BIGA 1TT1A 1FQBA 4YICA 2F3DA 4I1DA 4MNPA 3TQWA 4RXLA 5I3SA 3QXMA 3DELB 3OELA 2XXXA 2DE4A 4NF8B 4ZE8A 4G8MA 4NGUA 1XOCA 3K1NA 4R75A 3TTNA 3LV0A 1AIVA 1NKXA 4XKNA 4RYAA 2ZZWA 3PMXA 3D4CA 4FECA 3BFTA 4LZ7A 4ZE9A 2Q8MA 5I2KB 1QVSA 1NNTA 1BK4A 2X7QA 3O6HA 1RKMA 4H45A 4OVSA 1FQFA 2I3WA 4NF4B 5I57A 1B0HA 3MAMA 3TZAA 2PT2A 2OPEA 2DSFA 1DTZA 4EQ7A 4R72A 2F78A 1NH8A 4Z0IA 3G3JA 3BBRA 5F7VA 3T1BA 3VFJA 1YTVA 4LONB 1QUIA 4R9FA 1LLSA 3KJ7A 1ZLQA 4FEDA 3CFLA 3IK6B 4OQOA 1POTA 3FV2A 3CSGA 4G68B 4GXSB 1B05A 4OEVA 2UVGA 1Y3PA 1FTKA 1YAEA 4F2OA 2ESNA 3MZBA 1IQ7A 4ZEFA 1DTGA 3ECRA 2PVUA 4WEDA 3TYHA 3I6VA 1OQGA 3RGYA 4BDMA 4OVJA 5EYHA 2ZYKA 4N13A 4EDPA 3QSLA 5ISUA 3HSTA 1BLFA 5JEIA 3RTWB 4FJPA 4FEBA 5CMMA 3E4RA 3B8BA 2WKYA 2ZNTA 3S4UA 4OEUA 1K9ZA 1FPGA 1LFIA 2MKZA 3C35A 2F7AA 3PUVE 1ZBMA 5I57B 4TOZA 4O3CA 4YMBA 2IEEA 5BUUA 1D9QA 3VVDA 5B70A 5KDTA 1MG1A 4DZ1A 2XXTA 4JVCA 1B40A 4Z7EA 3W9WA 1OMPA 1N04A 4FBPA 4NF5A 1M5FA 1T0KA 4OWDA 1LB8A 2Q89A 2REGA 1P1WA 3QK6A 5H8NA 3IFCA 5H8SA 1PB8A 3GXAA 5H8HB 5I58A 1PB9A 1IXIA 2V3QA 1FPEA 4KCCA 2XA5A 4RY1A 5J16A 5M2VA 3V89B 1HSEA 2QVVA 1FQDA 4PFRA 4U2RA 4GBVA 1FJ9A 4JB7A 5CRYA 4OVTA 5LDZA 3ODBA 1M5BA 4ZZEA 1SW4A 3OO9A 4PTKA 1N7WA 1JNFA 2YLNA 1FTJA 1NL5A 2CEYA 3IB2A 1GV8A 4QSCA 3SEXA 2RCAA 4ECFA 1B4ZA 3EQ1A 5I59A 4QFPA 3LR1A 3T9XB 4DXBA 3PPRA 2PFYA 3O9PA 1SQYA 2XX8A 2CZIA 4PE5B 5EHSA 3CFZA 1R1NA 4ELOA 4KXPA 3ZSFA 3KOTA 3MBPA 3IOVA 1MDQA 2XXYA 5H8FB 5JTYA 4OVQA 4C1TA 5KDTB 3IOUA 4GL0A 4N17A 5CMKA 4HCYA 4EF2A 2V93A 4QXDA 5L9MA 5I5PA 5AA2A 5AE4A 1LBBA 1MDP1 4NF5B 2O7UA 2HZLA 4EF1A 4UABA 3RLFE 1OQHA 1DBZA 1MRPA 4FORA 3ONMA 3U92A 3CG1A 2I4BA 2XXQA 2PCRA 1I6AA 2CMOA 1M5CA 2DWJA 5H8NB 1NH7A 3CFXA 3MW0A 2XXRA 4F3GA 5I58B 2NWJA 2HAUA 2Z8DA 4NWCA 2DOJA 4ESXA 1EYKA 1NUYA 3G3GA 4KYEA 1MY2A 1B51A 2OWZA 4F1VA 4YMAA 1MQJA 3DP4A 4R2FA 2HQ0A 3SEUA 4N07A 1LAGE 1FTLA 3LSWA 3UIFA 3FJGA 4EQ9A 1HSLA 2QJEA 4PDHA 1RDZA 2QMXA 3TODA 3KC1A 1AMFA 4DCYA 3O2AA 4GL8A 4TLLB 3FD3A 5I59B 1QULA 2ONSA 4DI3D 3SEVA 3K1MA 2Z22A 3FXUA 4XIGQ 4GWZA 1MM7A 1N7XA 1O64A 4G2ZA 5T3JA 3GLBA 3FUZA 3O28A 5JTYB 2XXPA 3N26A 4MH5A 2AL5A 3O29A 1YYZA 2FBPA 3CSBA 4GX3A 3T9HB 1Q9DA 5AA2B 3OO7A 1KWHA 2QS3A 3S2VA 1MM6A 3DM0A 2OCUA 2DE3A 3S9EA 1R9LA 3T9VA 2ZYNA 4M4GA 4H8IA 4NTLA 4KQPA 1B52A 2I3VA 1EYJA 4Q5TA 3W9VA 2V25A 1N76A 3CG3A 4LZ5A 4E0WA 2UXAA 4O94A 1MXZA 3RN8A 4KCDA 1AOVA 3KEIA 3E13X 4NHBA 4QFNA 1FW0A 2R9JA 1XHYA 1ZMGA 2QS2A 1WODA 3B7DA 1PEBA 3ILTB 1SYHA 3IX1A 5TU0A 2HEUA 5H8QA 1A54A 4JWYA 2QFLA 1INPA 3TQLA 5DW8A 4KR5A 5CMBA 2O51A 3Q27A 3N6UA 1MQIA 2VOZA 2Y7IA 3FXRA 3F11A 3MVYA 3T9UA 4H5FA 4X1BA 3M8UA 1MXVA 4YKJA 4F1UA 4LQ2A 3BIHA 5I2KA 1VFEA 4BDLA 3U94A 2IA4A 3MUQA 3O6GA 5ICTA 2ZNUA 4NF4A 3VVFA 4JSOA 4G61A 4HS7A 4GQOA 1ZTYA 3K4UA 2FIEA 4U1ZA 3Q29A 1FBPA 1B3HA 3PU5A 1P1UA 4NE4A 4MNCA 4R74A 2GQ1A 1B32A 1IXHA 4P0GA 4PAFA 4EXLA 2ZYOA 3I3VA 5CBRA 2DXRA 1UIVA 2VD2A 4IO5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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