1YYZA

R-state amp complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
IVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title R-state AMP complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
source organism Sus scrofa
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase
total genus 108
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1yyzA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1yyzA02
1YZ0A 3D1RA 2QVRA 5EQ9A 2OWZA 4H45A 5EQAA 1SPIA 4IR8A 2FVZA 2FBPA 4FBPA 1FBPA 1NV0A 1INPA 3LUZA 5ET7A 1QGXA 3FBPA 1FRPA 1FPEA 1NV2A 2P3NA 2WBBA 5EYGA 1EYKA 2Y5LA 4GBVA 4AS5A 2QVUA 3KBZA 1FBFA 3RPLA 5T3JA 4GWSA 1K9ZA 3BIHA 1YYZA 5DW8A 4GWWA 1AWBA 2WEFA 1KZ8A 1FTAA 1NUXA 2F3BA 4H46A 1NV1A 4MJOA 1IMAA 1IMDA 1IMFA 1KA1A 1EYJA 1VDWA 2WBDA 4N81A 1FPGA 3ROJA 2PCRA 1Q9DA 1FPDA 1NV6A 1BK4A 4O7IA 4HE1A 1RDZA 1LBXA 5A5LA 5EYHA 1FPIA 2HHMA 2FIEA 1LBWA 4GBWA 2Y5KA 1FBDA 1FBHA 3KC1A 3B8BA 1FBGA 3QMFA 1NV5A 1FBCA 4GWXA 1YXIA 1RDYA 5EQ8A 1NUYA 2QFLA 1LBVA 4GWZA 4GX4A 1NUWA 2CZHA 2R8TA 1NUZA 4KXPA 2P3VA 1CNQA 1LBYA 3A29A 2FHYA 5F24A 3IFAA 4G61A 4I40A 1IMBA 3BIGA 3IFCA 3T0JA 1DK4A 1NV7A 1D9QA 1LBZA 4GX6A 4HE0A 3RYDA 3LV0A 1FPBA 2F3DA 4HXVA 1NV4A 5LDZA 4I3EA 5ET8A 4HE2A 2DDKA 1FPJA 4QXDA 1IMCA 2VT5A 2CZKA 1FJ9A 1NV3A 2Q8MA 2BJIA 2FIXA 1FPKA 1KA0A 5I3SA 1LEVA 4GWYA 4AS4A 5ET5A 4PTKA 1NI9A 2QVVA 1FBEA 1JP4A 5J16A 1K9YA 1FPFA 1G0IA 4GX3A 4I3YA 2CZIA 1EYIA 1FSAA 1RDXA 2OX3A 1FJ6A 2JJKA 2GQ1A 5FBPA 5ET6A 5IZ3A 1FPLA 3RPLB 1IMEA 5IZ3B 3KC0A 5EQ7A 1G0HA 2Q74A 5IZ1A 5ESYA 1XI6A 1DBZA 4GWUA 1DCUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MH4A 2DXYA 3U8QA 4JSOA 2VPNA 1SQYA 3M3FA 4G2ZA 2Z22A 2XWOA 1AOVA 3SDFA 1NL5A 4PFWA 1NV2A 2AIXA 3FJ7A 1ATGA 1B51A 4LATA 3E9XA 1FQEA 3RTWB 1POTA 1MRPA 1NH8A 1D3KA 4EQ9A 4GRKA 1JNFA 1KZ8A 4H46A 5H8HA 5A5XA 1Y4CA 4THIA 4IY5A 3IORA 1B1HA 3U92A 1ZMGA 2HZLA 4F1YA 2E0SA 4IO6A 3KGCA 3QUJA 4R74A 1IUDA 2XXTA 5LTCA 5EYFA 1US5A 4R6YA 3AXFA 4EDPA 2WYPA 4WXJA 1NV5A 1QKBA 3K01A 1MPBA 3C33A 3FJGA 3G3JA 3E13X 3CIJA 3FVKA 5H8FA 4MBPA 1LB9A 3T0JA 2OZZA 4KHZE 3RYDA 3I6VA 4GXAA 4JWYA 4LZ8A 5CMKA 2Q8JA 4HCWA 2E1SA 1URDA 2HAUA 4EF2A 1UTHA 5TP9A 1DPEA 3Q25A 4R6KA 4BDRA 1FPLA 2PT2A 5EQ7A 1LB8A 1R6ZA 1P1UA 3FVNA 4ELPA 3O28A 5KCJB 2ONKE 4ISUA 4F3PA 5TP9B 3RTFB 1FBPA 5I58A 4I1DA 4U1OA 3TAJA 3QSLA 2PFYA 4KYDA 3KBZA 2F97A 4OFLA 3P7IA 2GFEA 1YYZA 2X7PA 1MQGA 3S4UA 2HQ0A 4R9FA 4O7MA 3H3GA 3IO6A 4LZ5A 3LR1A 4PFYA 1MXYA 4AB5A 1SYIA 1B3FA 3RN8A 1LAFE 2D3IA 3GZGA 4NAPA 1TFDA 1H43A 2O1MA 4YKJA 2HHMA 2DWAA 4R75A 4EUOA 5CMMA 2F8DA 1MY3A 4PFUA 1LBVA 1D9YA 4AQ4A 2CZHA 3V8XB 3DM0A 2VOZA 3O6IA 3SEWA 3GXAA 2XD2A 3BIGA 2PVUA 1B4HA 1DK4A 3SERA 4GX6A 4F2OA 2DE2A 2YPNA 2P2AA 2ZNSA 4QRZA 3UK4A 4I62A 1IQ7A 4MX6A 3U1OA 2BJIA 3WAFA 2DP8A 3HFUA 1FQDA 4LUBA 2CEXA 1K9YA 1FPFA 3Q29A 4TLMB 1EYIA 3T9HB 4GFRA 3T9VA 1OVTA 4IO7A 1QKAA 3OSQA 3PUWE 4UA8A 4GWUA 4WEDA 3D1RA 3TODA 1SPIA 3H6UA 5CMCA 2IA4A 4Z7EA 3LUZA 2QSXA 3KOTA 1IXHA 2XWIA 1YAEA 3FBPA 2BJJX 4NF0A 3H4ZA 3DP4A 5I2KA 3HSTA 3PPNA 4MNIA 4IO5A 1NUXA 1SDXA 2ZYKA 3KZGA 4QBAA 5JTYA 1UIUA 3TQLA 1IMAA 1IEJA 3SESA 2PCRA 1Z7NE 1IXGA 3E3KA 4N4UA 3O2AA 1TXFA 1MY1A 4GBWA 2XX8A 2XXXA 1Y3PA 3QMFA 5JTYB 4ZS9A 1UTHB 3LSXA 1BKAA 2P1SA 1EH3A 4KXPA 3H06B 4FIMA 1OLCA 2ESNA 4PAIA 4RK2A 2FA7A 4PAKA 3A09A 1B3HA 3CRBA 3E79A 3FXQA 1B7ZA 1FW0A 2H5YA 1FJ9A 2Q8MA 3OSRA 4AS4A 3N5LA 1N04A 2DSFA 1JW1A 1GTKA 3OMBA 4I3YA 2I0CA 3L6HA 1RDXA 2CEYA 2HEUA 2GQ1A 1LBBA 4P0IA 3OO7A 1QUKA 4ZEBA 1IMEA 3GBAA 4PBQA 5DEXA 1DCUA 5AA2A 3MPKA 3RT8A 4G68C 3MC2A 4IR8A 2FVZA 2ZZVA 2H25A 4IO3A 4FBPA 3TTNA 4P1EA 4QFOA 1INPA 2GHAA 3F11A 2XWKA 3T1BA 3A3CA 2PBWA 4YZZA 3RQTA 3CR9A 3M3KA 4DZ1A 1FQBA 5DVFA 3TTLA 1MDP1 3MW0A 4KD5A 1EYJA 1JW4A 2R9JA 2XD3A 3KN3A 5ELVA 3MVYA 1MM7A 1NV6A 1B3EA 3IK6B 3TELA 2DYXA 3L6GA 2Y5KA 1WDNA 5CMBA 5BWJA 5IZZA 3IOVA 1B7UA 3RY3A 1Q35A 1H3DA 1PBPA 3IB1A 2I0BA 2Y7WA 2FHYA 1B3LA 1CB6A 2I48A 3MZ9A 1ELJA 4MHFA 3SZPA 3VLVA 1Y3QA 3S9NC 3THIA 3TPAA 2XXWA 4RA1A 5AA4A 3N94A 4IO4A 2OPEA 4OMBA 4MLVA 3BBRA 4GX3A 4MF3A 4GLIA 4Z0IA 5FBPA 1H76A 1II5A 1ANFA 3KBRA 1NNKA 5IZ3B 3KC0A 3G3FA 5I56A 3DP8A 1PDAA 4F18A 2P0SA 3OEKA 3DLNA 2FBPA 1FQAA 1JVYA 1SI1A 4R72A 3T93B 1DTZA 4BDQA 4X48A 4I9DA 4O3AA 3K2DA 1FRPA 4ESXA 1D9VA 4BDLA 3ZS6A 4KQPA 1A8FA 1JEVA 2XXIA 4LN5A 4LP2B 3N26A 3C32A 3QAXA 1IMDA 1JETA 4JVIA 5L8DA 2KR0A 2VP1A 4PF8A 1QULA 4H5FA 1AIVA 1FTMA 3B6QA 4PBHA 4C0RA 4LZ7A 1EU8A 2O84X 1NUWA 2XXYA 3CHGA 4XEQA 4DI3D 2UVJA 2XXKA 4HCYA 3V83A 3D4GA 3G7WA 1DTGA 1FPBA 3JV9A 5DEXB 5I2NB 3LSWA 4BDNA 2UVHA 1Q1KA 5ET5A 4C1UA 4GQOA 1PB7A 3C36A 1A99A 2G29A 4U22A 1G0HA 3UORA 3OO9A 4M4GA 1YZ0A 1PBQA 4RXLA 4YICA 1PEBA 4NF8A 2AYSA 4ZEFA 2NWJA 5ET7A 2ZYMA 1CE2A 4U4SA 2O51A 2H99A 2QVUA 1MXZA 4GWSA 4N8YA 4NEDA 3CSBA 3IR1A 1B5JA 1B46A 1OQHA 2ZNTA 3O6HA 3FXBA 4MAGA 4LQ5A 4PC9A 3KJTA 1VDWA 2WBDA 5HBCA 4QSEA 1B1XA 4JXIA 4FE8A 3N6UA 3FUZA 3MP6A 4PFRA 4YU0A 3HO7A 1FBDA 2XA5A 4GIZA 4GX4A 4GWZA 2OJTA 4PFTA 2F34A 3UN6A 2OWTA 4XXUA 4UABA 4G8NA 5FHOA 1OVBA 1IMCA 4NF4B 4ECFA 1FPKA 1KWHA 1NI9A 3QIMA 1XS5A 3R7XA 1LFIA 4OTEA 3EHSA 5I57A 2WKYA 3GLBA 4FECA 3IB2A 3O9PA 2JJKA 5ET6A 3KFMA 2L5VA 2RC9A 1B40A 2WYKA 4F39A 5CBRA 2V3QA 1SYHA 3EPEA 2V93A 1ZU0A 3PTYA 4TQUQ 4BDOA 2AL5A 4N07A 3ZSFA 3RPLA 4JBZA 4PCDA 5DW8A 2FYIA 1FTKA 3K6VA 5DTBA 3UA8A 4OWDA 4GVOA 2O7IA 4WKMA 5TPAA 4R9GA 3OOAA 4P8BA 2D21A 2RCBA 3IL1B 5AA3A 1LBXA 2GHBA 2NVUB 1LBWA 3K0VA 1O64A 4G8HA 2KLFA 1DPPA 1FBCA 4HW8A 4PFBA 3SEYA 2HAVA 2R8TA 1CNQA 1M5EA 3TUSA 5F24A 3HV1A 1B9JA 2V25A 4MFIA 1NNTA 4H8JA 1NV7A 2HPGA 3LV0A 5LDZA 4PDHA 3PPQA 4N15A 2F5XA 4KI0E 1FQFA 2PYYA 3U93A 3PU5A 5I3SA 4H67A 4KCCA 4OVQA 4PP0A 1LLSA 1NH7A 1UTBA 2Q89A 4DXBA 3VXBA 1FSAA 2VD2A 3Q28A 5J1DA 2RC7A 1ZKBA 2Q88A 2Z8DA 5F1QA 1GVCA 4DE8A 2F78A 1A40A 4E0WA 3KJ7A 3G3IA 3K4UA 1UTBB 2NXOA 2V4CA 5B70A 4NF6A 2UVIA 3T9UA 5H8NA 1IITA 1MXUA 4YMBA 1ZBMA 5EYGA 5I84A 4AS5A 5T3JA 4LA9A 1ZIUA 4OFJA 4EQ7A 3BIHA 3FD3A 2O69A 2PT1A 1NNPA 4PE5B 4GD5A 5H8QB 3K00A 3IJOB 4GL0A 1MXVA 1FTOA 3SEUA 4ZECA 5H8NB 1MM6A 1VE4A 1FPGA 1OLAA 2PX1A 3CI8A 4TLLB 5DT6A 5A5LA 5TU0A 5I7IA 4F19A 1JQFA 3OELA 4RPOA 2DQVA 4KYEA 4O3CA 2RINA 3PUYE 4O8MA 1SD3A 3MWBA 4R73A 3H7MA 3KSJA 4XTCQ 2XXPA 4NQ8A 1NUZA 5I57B 3VE1B 1SW2A 1B2HA 3PUZE 4KFQA 4DI4B 3UP9A 2HFBA 2F3DA 4OEVA 1LGBC 1MPDA 1FPJA 4GL8A 3W9WA 5DYHA 1Y1MA 1PC3A 3VLWA 2DXRA 1QUIA 1KA0A 4OVPA 4YB5A 2REJA 2Y84A 3U65A 2QS3A 3MBPA 1N7XA 4U2RA 4XKRA 3RPLB 3FGSA 1FQCA 4G68B 2VGQA 2XXHA 1S7YA 3TTRA 4OESA 5KCJA 4KYSA 2Y7PA 4NX1A 4OFOA 2ZYOA 3HPIA 2GH9A 2XXUA 4HTGA 2DWIA 4JWXA 4MMPA 4H65A 1FBFA 4ELOA 2Y7RA 1K9ZA 1JEUA 4RYAA 4I8CA 3B6TA 1IXCA 2MKZA 3VLUA 3LC8A 1B0LA 1URGA 4P3LA 2W7YA 5K2YA 4ZEIA 4JDFA 2RKMA 4GOTA 2QS1A 3PUVE 5KZTA 3E78A 1VR5A 5HM4B 2DE3A 3CSGA 3IOUA 3FV1A 4P0GA 1YXIA 3BFTA 3LUYA 1QW0A 2A5TA 3OENA 3KN7A 4F3GA 2AL4A 4KR5A 1A8EA 2X26A 4G61A 4G8MA 2B4MA 1H44A 4IB2A 5BUUA 4HE0A 1SW1A 3FZVA 1RYOA 3FJMA 2DWJA 2FIXA 4XF5A 4N13A 1GGGA 1MXWA 5H8HB 1LFHA 4O94A 1B05A 4NF6B 1I69A 2DWHA 1O7TA 1G0IA 4X04A 4F3BA 3NOHA 4P47A 4R2FA 2Q74A 4MH5A 3PPOA 4GWOA 2I3WA 3B7DA 1MG1A 2O7UA 2F36A 3LSLA 4PGNA 3M3LA 2OLBA 2V3TA 1XVYA 5FTIA 2F7BA 3FXRA 2I58A 1DMBA 1FPEA 2WBBA 3KN8A 4NWCA 4F1UA 4QFPA 5I2KB 4Q8RA 2XX9A 4XKNA 4EQBA 1SI0A 3W15C 3OXNA 3VDFA 4OA4A 4R2BA 1TWYA 3IO4A 1IZ1A 3K6XA 1AL3A 4WEPA 1AMFA 4P56A 1Z7ME 2PFZA 1YCJA 1NNFA 3MAMA 2QL3A 4MNCA 4ZZAA 4O7IA 4PGPA 1RDZA 5F7VA 3MZBA 3H6WA 5EYHA 3T66A 3A3UA 1EZ9A 1M5CA 4H8IA 2FIEA 3C35A 4OEUA 4YKIA 4GWXA 4JB7A 1FCKA 5EQ8A 3S9EA 1N76A 5I58B 4FORA 3IOTA 2P3VA 1N84A 3DELB 1IMBA 1O63A 5ICTA 4I3EA 2I49A 4QFLA 4FAJA 1IIWA 2DDKA 4G68A 4QXDA 4H5GA 5CM6A 1B0HA 1B58A 2PMSA 5AA2D 1M5BA 1MQDA 4FEBA 4PTKA 2B3FA 3TCFA 3HCQA 2DS9A 3EKIA 1MQJA 4OERA 1IXIA 3JYRA 2CZIA 4N6DA 2QS2A 1PB9A 3H6VA 1MPCA 1XOCA 4NE4A 2F7AA 3O66A 4IGTA 3TCHA 4H45A 5EQAA 4LONB 4E0XA 3ZKKA 4DDDA 1A55A 3S2VA 1P1QA 4X1DA 3CFZA 3GBBA 3WAEA 3UIFA 3TEPA 1GR2A 1R9QA 3K6UA 2O6AA 1Y1ZA 4OANA 1MXXA 4ELRA 1N0TA 2FNCA 5DVIA 2A5TB 3OO8A 2DOJA 3K1PA 1Y9UA 3PGFA 3I3VA 2HXRA 4N81A 4U23A 4KCDA 1R1NA 1F9BA 4YB7A 1BK4A 4YKKA 1ZLQA 4H1XA 1VFDA 3SEVA 3FVGA 3HHGA 5AA2B 1FPIA 1USYE 2ANJA 1B6HA 1EZOA 2NUVA 4OQOA 1LCTA 1RDYA 3IB0A 1MY0A 3I5OA 5I59B 2X7QA 3FV2A 1RKMA 2UYEA 4NG7A 2Q2CA 3IFAA 4Q30B 4I40A 1LAXA 1P1NA 3VVEA 3BFUA 2H9BA 4OZ9A 1SBPA 1JW5A 2CZKA 2REGA 2RF1A 1LEVA 5I59A 4BLAA 3TYHA 3TFLA 5J16A 3VFJA 1B5IA 1P99A 3PD9A 3CG1A 2OX3A 4F3SA 5EHSA 4QHQA 3ONMA 1FJ6A 1Y3NA 3EN3A 2GRVA 2XWVA 3LBSA 4ELQA 2OWZA 4F29A 4DLDA 1PB8A 4GF8A 4ZE8A 1LFGA 2DVCA 3TTMA 2F35A 2P3NA 1LCFA 1SW5A 4NF5B 1FTJA 4GBVA 4F1VA 3RPWA 3MJNA 2ABHA 5AA4B 1I6BA 2B65A 3E4RA 1KA1A 4OETA 2QPQA 4YAHX 3ROJA 1Q9DA 5ISUA 4OVTA 1FPDA 3S9MC 4POWA 4ESWA 2VPOA 2DE4A 4FATA 4UACA 3IOWA 3D4CA 3EQ1A 4NHBA 2RC8A 1J1NA 3MUQA 3G3GA 1HSLA 4F22A 1EZPA 4ZDMA 3TDJA 4U1ZA 1SVXB 1FTLA 4HS7A 3T96B 1NV4A 4PDDA 2QMWA 5K2XA 2ONSA 3H6TA 5KDTA 4NGUA 4YKPA 4OENA 1ZTYA 3PV0E 4OHNA 3M8UA 3MVWA 1Y20A 3JZJA 4K3FA 4ND9A 1B4ZA 2ZZWA 2QRYA 2HXWA 1TFAA 3GYYA 3DP6A 3RGYA 1UIVA 5M2VA 5FHMA 1MQHA 5KDTB 3EHUA 4NF8B 2D5WA 3ILTB 4Q0CA 5ITOA 4P9KA 1MY2A 1P1OA 4POXA 1XVXA 1EYKA 2Y5LA 1R9LA 3CFXA 3C34A 1H45A 4RY1A 2Y7IA 4X9TA 3IX1A 1L5TA 4KPTA 1NKXA 1N3WA 4Q5TA 4RPNA 1OQGA 3K02A 1BP5A 3MP1A 3O29A 3CFLA 1BTJA 3QK6A 3PMXA 5I56B 4G4PA 3BKIB 4EF1A 3TKDA 2M8CA 2B4LA 1TT1A 2QFLA 1DSNA 4N6KA 1LAGE 3B50A 4MNPA 3MPLA 3EHTA 4DXCA 5AE4A 1B5HA 2RCAA 5JEIA 1MS7A 4OXVA 4HXVA 1QUJA 4NF4A 3V89B 4N17A 4X1BA 5L9MA 2QVVA 4DCXA 5L9OA 4ZZEA 1M5DA 1JP4A 1RYXA 3HN0A 4JSDA 5CBSA 3RT6B 3KEIA 3N6TA 4RK9A 1T0KA 4NF5A 3MYUA 3H03A 2F7CA 2KQZA 2UVGA 5IZ3A 3TCGA 3Q26A 4PF6A 1AH5A 4XFEA 1LBCA 1SW4A 4LQ2A 3ODBA 3TQWA 5FHNA 1HSJA 3RNNA 1I6QA 2ZMBA 1XC1A 4MLQA 4XKQA 1VSOA 1NV0A 3CG3A 4P1LA 2ZXTA 4PQJA 4QFKA 4DXUA 5CRYA 5ICQA 3QUFA 5I2NA 2ZZXA 4RNSA 5CI5A 1B52A 2WEFA 2LAOA 2F3BA 3MVZA 4MCOA 5IAIA 4MJOA 4JWOA 5H8SA 4L17A 5IGAA 2HZKA 3OD7A 2NOOA 2THIA 4HE1A 2F6GA 2XHDA 4RJZA 3O97A 2I6EA 3SKPA 2XXVA 1DOTA 4MEVA 4NTLA 3FIRA 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