1YYZA

R-state amp complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
IVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title R-state AMP complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase
molecule tags Hydrolase
source organism Sus scrofa
total genus 108
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1yyzA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1yyzA02
5EYHA 4GX6A 1NV2A 1NUXA 4N81A 2F3DA 1RDZA 1JP4A 1G0IA 4GX4A 1FPGA 3RPLA 1FJ9A 1QGXA 2WBBA 2PCRA 1FBHA 2Q74A 2R8TA 4GBVA 5IZ3A 4I3YA 5IZ1A 1FPFA 4I40A 1NV0A 4I3EA 1LEVA 1DCUA 1DBZA 1RDXA 2VT5A 4GWSA 4HE2A 3BIGA 4HXVA 1IMCA 1G0HA 2CZKA 4GWXA 3KC0A 4H46A 1FPJA 3BIHA 1IMAA 4H45A 1IMFA 3FBPA 2FIXA 1FPKA 1NUWA 1LBZA 4HE0A 5T3JA 1XI6A 3ROJA 1FBCA 1IMBA 2FBPA 1NV3A 1EYJA 1NI9A 2CZHA 4GBWA 1NV1A 1FBEA 2JJKA 2QVVA 1FTAA 1D9QA 5EYGA 4GWYA 5DW8A 3QMFA 4IR8A 1FPLA 2FVZA 1VDWA 2CZIA 1CNQA 3KC1A 4GX3A 1LBVA 3LUZA 3LV0A 1BK4A 1FPIA 5ET5A 1EYIA 3RPLB 3RYDA 4GWWA 2HHMA 5ET8A 1FBPA 2OWZA 5EQAA 1SPIA 3T0JA 1FBFA 2WEFA 4AS4A 1KA1A 1LBWA 1Q9DA 5IZ3B 4G61A 1K9YA 5A5LA 2BJIA 2QVUA 1NUYA 1K9ZA 5ET7A 2Y5LA 2QVRA 1RDYA 3B8BA 4GWZA 5EQ8A 2GQ1A 1NV7A 1LBXA 1NV6A 2FIEA 1YXIA 1IMEA 2DDKA 1IMDA 2OX3A 2P3VA 2FHYA 5J16A 5EQ9A 1AWBA 1EYKA 1LBYA 4FBPA 1FBGA 1FPEA 4PTKA 4QXDA 1KZ8A 5EQ7A 3IFCA 4AS5A 1YYZA 2WBDA 4MJOA 1FPBA 1NUZA 1YZ0A 3A29A 4GWUA 5LDZA 4O7IA 1FJ6A 2Y5KA 5F24A 1FRPA 1KA0A 1FBDA 2P3NA 2Q8MA 1FSAA 1NV4A 3KBZA 1INPA 1FPDA 5I3SA 5ET6A 3D1RA 1DK4A 1NV5A 2F3BA 4HE1A 3IFAA 5FBPA 2QFLA 5ESYA 4KXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H8NB 3HO7A 1JVXA 2B3FA 3U8QA 4QSEA 4BDNA 1YTVA 3MVXA 2Q8JA 1P1NA 1SBPA 5H8HA 5A5XB 2O6AA 4OESA 1LFGA 1MH4A 3MZ1A 2DWAA 1DBZA 3T9UA 1LGBC 4PAFA 1ATGA 3FBPA 3SEUA 3P7IA 2XHDA 3G3KA 4OYVA 5EYFA 4IO4A 3CG3A 2A5SA 1ELJA 4EQ7A 2XXXA 3N6TA 4RYAA 5ITPA 1B1HA 4JB7A 2YPNA 1B7ZA 2H4IA 1SYHA 5DW8A 2A5TA 3PD8A 1B9JA 4H0WA 1R6ZA 3KC1A 2DOJA 4JBZA 3LUZA 3O2AA 2OWZA 3PUWE 1SI0A 1MQJA 3TMGA 3PMXA 1FTMA 3V8XB 2ZXTA 3THIA 2Y5LA 1RYXA 1DPPA 2XD2A 4ELRA 3RY3A 1LB9A 1NKXA 3CI8A 3PMWA 2P0SA 2I48A 1CB6A 2OLBA 5I84A 1NUZA 4RPOA 4E0XA 2O7UA 3ZS6A 4F18A 1NV4A 5KDTB 2KR0A 1INPA 2DE2A 3D1RA 4H65A 3EHSA 1PB9A 4FE8A 3TPAA 1QUKA 5HBCA 5JEIA 4IGTA 2I4BA 3TQLA 2NOOA 2KLFA 3C31A 3K6WA 3IOTA 4YB7A 3KBRA 5FTHA 2B4MA 2VPNA 1NV0A 4F39A 1LEVA 4LZ5A 4G8MA 3FVOA 4I62A 4OVSA 1ZBMA 3EPEA 2L5VA 4YKKA 1FPJA 2WKYA 2F6PA 3RTFB 4DI4B 3ROJA 3CSBA 3K6XA 5IGAA 2FBPA 2DE3A 3IOWA 2I0BA 3TTKA 5H8FA 3CHGA 3O28A 2CZIA 1UQWA 2UXAA 2FNCA 2F36A 3EKIA 4FJPA 1UIUA 4M1VA 2GHAA 5AA1A 2XWIA 3TZAA 4F2QA 1O63A 5M2VA 1US4A 4P56A 4I1DA 4G61A 1K9YA 4P47A 3T22A 2PYYA 2BJIA 1ZU0A 3VLVA 4EF2A 5I2KA 4GF8A 3IAZA 5FTIA 3JZJA 4ZEIA 4QXDA 1IXHA 1XHYA 1YYZA 2THIA 3EN3A 3E4RA 2P3NA 2QJEA 2XXYA 3IO6A 3PPNA 1BTJA 1LSTA 3FVKA 1USYH 3RPWA 4NF0A 4P0GA 2IEEA 3K1NA 1MY4A 3GBBA 4DXBA 1FPGA 3JV9A 3FIRA 4N15A 5CRYA 2PX1A 2Q74A 3G3GA 2NWJA 5ICTA 3M3KA 3O66A 5DTBA 1MH3A 4IO2A 1TFAA 3WAEA 3FVGA 3KEIA 1HSJA 1OVBA 4HE0A 4FIMA 3D4CA 3IR1A 1B58A 4EXLA 1YAEA 3C35A 4Q5TA 1FQAA 5I57A 1OQGA 1LCFA 2XWVA 3PMVA 3EHUA 5LTCA 1FQEA 3TYHA 2CEXA 1I6QA 1NNPA 4O3BA 1B46A 5ET7A 1IXCA 2DWHA 1OIBA 2XX8A 5KZTA 3DP8A 5TP9B 2UVHA 1KWHA 4PGNA 2OX3A 3K1MA 4GL0A 4F1VA 1IQ7A 1LFHA 4H8IA 4QBAA 3IFCA 4QFOA 3FJ7A 5LDZA 2QMWA 5AA2D 3MW0A 4NF5B 1OLAA 3MVYA 4IO7A 4AB5A 4PAIA 5FHMA 2QFLA 2XXPA 1QKBA 4NG7A 4N81A 4KXPA 2RINA 4OFJA 4OFLA 3SEXA 1EZOA 1B5HA 5KCJA 5K2YA 2OK2A 4G4PA 1R9QA 3TCHA 3RPLA 3H3GA 2F78A 1JW1A 4ONYA 4ZZEA 4GRKA 2DQVA 4BDQA 1ZIUA 2Q88A 3PUXE 5CM6A 3T9HB 2AL4A 4DXUA 1P1OA 4HXVA 5HM4B 1DSNA 4R73A 4YKIA 4YAHX 4LZ8A 1IMFA 4NEDA 4WKMA 4R9GA 1N04A 1Z7NE 2DSFA 1EU8A 1GV8A 3W9WA 1R1NA 2Z8EA 5CC2A 5K2XA 3IB0A 3VXBA 4ECFA 3CFXA 2REJA 4PBHA 3R6UA 4GWWA 3FGSA 2XXVA 3T0JA 2ZNUA 4OVRA 4THIA 4NMYA 3MZ9A 4RPNA 4GFRA 1H3DA 4I8CA 1GGGA 4R6HA 1D9YA 4O8MA 1FQDA 2DWJA 1LBYA 4JSOA 1FPEA 4EQ9A 1PBPA 1KZ8A 1MPCA 4ZEKA 3M8UA 4KYDA 5I56B 4BDLA 1BP5A 3IOVA 1FSAA 3KBZA 3U72A 4F2OA 1NV5A 4LONB 4OFOA 3TODA 1QULA 1PDAA 1NV2A 3QUFA 4HCWA 3U93A 4YKPA 4R75A 4KCCA 5ELVA 3C33A 3PV0E 4GVOA 3H7MA 1Q1KA 5CMBA 1Y4CA 1Y20A 2XXKA 4MCOA 1YCJA 4FECA 5DEXB 2O84X 4PBQA 1JQFA 4PFBA 3I3VA 4WEDA 4U2RA 1A54A 3PPOA 3DELB 2CZKA 2I3WA 3ISPA 3S9LC 1IXGA 2H98A 1FPKA 3MYUA 4MH5A 1SI1A 3VVFA 3HSTA 1UTBB 4WEPA 2CEYA 4AB6A 2QPQA 3MVWA 3MC2A 1MY0A 3Q27A 1MM6A 4KHZE 5H8NA 4ESWA 5I2NB 2F5XA 3CIJA 4NWDA 4YZZA 1FTKA 4MIJA 2DVZA 1KA1A 2NXOA 3G3FA 3KN3A 5A5XA 3KN7A 1B3EA 1XT8A 3S9MC 4PE5B 2GQ1A 5I5PA 1NV7A 4MHFA 4F1UA 1JW5A 4FBPA 1B4ZA 4AS5A 3FD3A 3HN0A 2WBDA 3MUQA 3SERA 2VD2A 1IXIA 3VXCA 1KA0A 3N26A 3U1OA 3SETA 4L17A 3MSTA 3FJGA 2D5WA 2XXTA 4ZZAA 4I9DA 4QFKA 5CMKA 1NUXA 4ZEDA 2Y7KA 3RQTA 3MWBA 1LLSA 4IB2A 4C1UA 1Z7ME 3OELA 3U65A 5EHMA 3PD9A 4JVDA 4XF5A 4MNCA 4ISUA 3I6VA 5B7DA 4GWSA 2ONKE 1B4HA 2R9JA 4R72A 1B0LA 1AIVA 1J1NA 2O7IA 3E3KA 4G68B 4G2ZA 4KYSA 2MKZA 1H43A 2PFZA 2FIXA 1B52A 5JK4A 2OCUA 1NUWA 1FBCA 3TELA 3ZSFA 4Z0IA 3LSWA 1IIWA 1MXYA 1AMFA 4DDDA 3KSXA 1FBEA 3H6VA 3C36A 4FAJA 4OERA 1MM7A 5KDTA 3OOAA 1I69A 4GWYA 4G8NA 2OZZA 1CNQA 3QXMA 4XKRA 4GQOA 4XEQA 3U94A 1N7XA 4GX3A 1TT1A 1EYIA 4X48A 2HHMA 5I58B 1LBWA 5IZZA 2GRVA 5CBRA 1IITA 1RDYA 1FCKA 3M3FA 2FIEA 1F9BA 5EQ9A 2O1MA 1MG1A 3N5LA 2VOZA 5AA2A 1H45A 1USYE 1B0HA 2Q8MA 3W15C 3MBPA 1N7WA 5ISUA 1GVCA 4P1LA 3RLFE 2ONRA 4ZDMA 5ICQA 1BIYA 2V25A 3KGCA 5TPAB 1BKAA 4TOZA 3LR1A 5TU0A 2HZKA 3IJXB 2Z8DA 4OVPA 3QSLA 4R2FA 4ELOA 2I0CA 1D3KA 5LOMA 4HE2A 3PPQA 3B6TA 1OLCA 2I58A 1B2HA 1LAXA 4MFIA 4GLIA 3KN8A 1XI6A 3FJMA 1ZLQA 3B6QA 3C32A 2ESNA 1PBQA 1FTLA 3TQWA 3TTRA 2KQZA 1XVYA 1XVXA 1LAFE 4OXVA 3H6TA 3UGWA 1H44A 2DXRA 1UTHA 3LV0A 1B3GA 3TUSA 4QFLA 1AL3A 1TFDA 3RTWB 3B7DA 1A40A 4DLDA 2V3TA 5AA4B 1B3HA 1QUIA 4H67A 1DPEA 1B3LA 3MVZA 2A5TB 1MQDA 3FV2A 1MDQA 4PAKA 4F3GA 1II5A 1YXIA 3ILUB 5L8DA 4F3SA 2ZYOA 3C4MA 2QMXA 4GXSB 2I6EA 4PF6A 2CMOA 4YMBA 2P2AA 4KQPA 2V3UA 3E13X 4G77A 1H76A 2QRYA 3LUYA 4KI0E 4GX6A 1B40A 2FYIA 4PGPA 1RYOA 2QS4A 4ELQA 3T66A 1O64A 3K6VA 2FA7A 3TCGA 4DZ1A 3K00A 3IOUA 4M4GA 4RK9A 4TQUQ 2O51A 4DXCA 5IM2A 1FPFA 3UK4A 1EZPA 5I7IA 2CZLA 3PUYE 3OXNA 3RN8A 4KPTA 3Q28A 5TP9A 4OENA 4DIGA 2ONSA 4PE3A 1LBZA 2Q2CA 3O97A 3C9HA 3IX1A 2CZHA 4QF9A 2X7QA 2UYEA 3BBRA 4NF5A 2YJPA 3LSLA 4MAGA 1MY3A 5EYGA 3GXAA 3S9EA 4N13A 3QMFA 2RF1A 4O3AA 5BWJA 1FW0A 1A8FA 3HPIA 3IJOB 5ET5A 1M5BA 1IZ1A 3L6HA 1FQCA 5IAIA 1FBPA 2Y7PA 2RKMA 4C1TA 2REGA 3TFLA 2M8CA 4JVIA 1JEUA 5H8SA 4FORA 2QS2A 4GWZA 4HW8A 5J1DA 4ELPA 4JSDA 1SW2A 1MXVA 1EYKA 1LAGE 4POWA 4O7IA 3T96B 2Y5KA 1FTJA 1FRPA 1FTOA 3I5OA 2AL5A 3OD7A 2GH9A 2ANJA 1LB8A 4PFIA 4E0WA 4NF6A 4NQ8A 5FBPA 4LQ5A 1RKMA 3Q25A 4P9KA 3FXQA 5DVIA 2QL3A 4BDRA 4IO3A 1B51A 2V3QA 1G0IA 1LAHE 2ZNSA 2V84A 3TEPA 1PEBA 1OMPA 2R8TA 4GBVA 1MXWA 4EXKA 4OVJA 4LN5A 4BDOA 2IA4A 3MQ9A 2OPEA 4WXJA 3E9XA 1NH8A 3ODBA 5JTYA 3BIHA 2ABHA 3GYYA 4XKQA 1Y3QA 2B65A 3QYTA 2H5YA 1ANFA 1NV3A 3IL1B 1NI9A 4PFWA 1SQYA 4H5FA 1NV1A 3VLWA 1M5DA 3RUMA 4MLQA 1N0TA 3BFTA 3CVGA 2OWTA 4P11A 1LFIA 2HXWA 4PDDA 1UIVA 1SW1A 5L9OA 4IY5A 2HCAA 4NF8A 4PFTA 2W7YA 4EF1A 1I6AA 3M3LA 5DVFA 1BK4A 2XXWA 1IUDA 4EUOA 5IZ3B 4P8BA 2G93A 2WYPA 1JEVA 4DCYA 4MF3A 4PFUA 4HTGA 4YICA 3V83A 3ZKKA 2QVRA 5DEXA 3RT6B 5I57B 1M5CA 4LP2B 3LSXA 2PMSA 3CG1A 3UIFA 4O7MA 4GWOA 1OQHA 2F7AA 3DP6A 1IMDA 4X9TA 1AWBA 2R6GE 1FBGA 4P1EA 4MJOA 4YKJA 5DYHA 4N6DA 3H06B 1UTBA 1FPDA 4QHQA 2GHBA 4HE1A 3SEWA 1FQFA 4JXIA 3PPPA 2F6GA 3FV1A 4H6DA 1ZMGA 2Y84A 3BKIB 2XX9A 1SW5A 5CMCA 1SYIA 1Y4TA 5I59A 5I2NA 4HCYA 4GX4A 1ZTYA 2I4CA 5DVJA 2VGQA 3TTLA 4U21A 1FBHA 4QFPA 4F22A 2HXRA 2AYSA 3T1BA 2Z8FA 4MNPA 1I6BA 4OMBA 4KR5A 1IMCA 3VE1B 3HFUA 4N8YA 3HV1A 1LBCA 3ZKLA 2Q9TA 1P1UA 1POY1 2ZZXA 2UYFA 4XKNA 4ZECA 2YLNA 1VSOA 2DYXA 4P0IA 1PB8A 1B05A 1MPBA 2JJKA 3MP1A 1B1XA 1D9QA 3G7WA 4R2BA 1NFTA 4MMPA 4GOTA 5B70A 1LCTA 2BJJX 3K2DA 2HQ0A 3OO8A 4QSDA 1DTGA 5EQAA 3CSGA 1MXUA 1VFEA 2VPOA 3PPRA 1NNTA 3DLNA 1TWYA 4Z7EA 3B6WA 5EQ8A 1JW4A 2Y7WA 4XFEA 3HHFA 4JVCA 2P3VA 1QUJA 2Y7RA 4PQJA 1CE2A 4RXLA 2NUVA 4C0RA 1VE4A 4GIZA 2HAVA 3EHTA 3W9VA 3R26A 2QS3A 2F8DA 3CFZA 1MPDA 1EH3A 1XC1A 3PGFA 4OQOA 4RA1A 3PUVE 3GZGA 4HS7A 3UA8A 2F3DA 3BFUA 3LSFB 3VLUA 2B3BA 4Q8RA 1QKAA 4N6KA 1FJ9A 3TCFA 5I58A 4I40A 4I3EA 2PBWA 3K0VA 3DP4A 3USDA 3A3CA 1US5A 4JWYA 4GWXA 3KC0A 2AIXA 1MXXA 4FEBA 4NF4B 4H45A 4NE4A 1TXFA 1IMBA 1POTA 4PCDA 3S4UA 1B3FA 4G68C 2RC7A 2NVUB 4ZS9A 1D9VA 3FVNA 4OA4A 1S7YA 2V93A 2F34A 3K02A 4IR8A 2FVZA 3D4GA 3K4UA 1HSLA 1GR2A 1DMBA 2H99A 3KSJA 3PUZE 3OO7A 5TPAA 4U22A 4XXUA 2QSXA 3E78A 2E0SA 2QVUA 2OBGA 1N76A 3U92A 2F7CA 3N94A 4NAPA 4PF8A 3V5AA 3FXUA 5HPQA 1IMEA 4RK2A 5H8QB 1PC3A 3A29A 4UA8A 4LA9A 3H6UA 4ESXA 3HHGA 2VHAA 4IO5A 2F3BA 4NTLA 5L9MA 2DE4A 1MY1A 4UABA 4PFRA 3AXFA 4OTEA 1N3WA 2VP1A 3FUZA 2XXUA 5IZ1A 3CFLA 5AA4A 4OVTA 1URDA 4PC9A 2QS1A 2X26A 1DCUA 3V89B 1R9LA 2GFEA 2Q2AA 3OEMA 2LAOA 5BUUA 4H46A 1QW0A 3SEVA 4R74A 3H4ZA 3B50A 4U4XA 4H5GA 4OEVA 1MY2A 4FEDA 3SEYA 3UP9A 3IB2A 4YU0A 3Q26A 2WYKA 2D3IA 4JWXA 1GTKA 2XXRA 4F1YA 1M5EA 5H8HB 2ZYNA 3O29A 1FBFA 4AS4A 2XA5A 4XKPA 2Z22A 4N07A 3KJTA 1K9ZA 3RNNA 3B8BA 3IK6B 3MPLA 4Q30B 3OEKA 5ITOA 4X1DA 1S9TA 1NV6A 3O6HA 1EZ9A 1MXZA 1VFDA 2RCBA 2DDKA 2Y7IA 5F1QA 4IY6A 1SVXB 4PTKA 3S2VA 3VFJA 1D4NA 3EQ1A 4YMAA 3FASA 1FPBA 3QK6A 4MX6A 3OMBA 4PDHA 3T93B 4OHNA 4R9FA 1FQBA 2E1SA 5ET6A 1A8EA 2PFYA 4F31B 3QUJA 3IFAA 4Q0CA 5ESYA 3A09A 4FATA 4IO6A 5DT6A 2PT2A 4QRZA 4F19A 5AA2B 1A7LA 2I3VA 1ZKBA 1B32A 3G3JA 4I3YA 3MP6A 4F3PA 3CRBA 3SKPA 2O69A 3O6GA 3KOSA 1ZJLA 2VT5A 3K01A 4PP0A 3OO9A 3ECRA 5IKBA 4EDPA 4GD5A 2XD3A 3KFMA 3T9VA 3MZBA 5T3JA 1BLFA 2Z23A 1P1QA 4G8HA 4GBWA 3DM0A 3TTNA 3H03A 4R6KA 4U1OA 2OJTA 4KYEA 3VVEA 1N84A 2HFBA 4IGRA 3RYDA 4DCXA 1LBBA 4OANA 3MP8A 3JYRA 1SDXA 3IORA 1PB7A 4XIGQ 2HPGA 4BDMA 3RT8A 2G29A 3SZPA 4KD5A 2F7BA 3FZVA 2DP8A 2P1SA 3EF7A 1P1WA 1UTHB 4BLAA 4QFNA 4YB6A 3FATA 4OWDA 3A3UA 1Q35A 3VVDA 4GWUA 2HEUA 4O94A 1QVSA 1S50A 5EHSA 1Y1ZA 1B5IA 5I3SA 2V4CA 4H8JA 5H8FB 4MNIA 5CI5A 4F3BA 5EYHA 2DVCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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