5FHOA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-chlorobenzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 2.3 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
254
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 254
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA02
5I56A 4F29A 3IR1A 1BP5A 1AIVA 1QW0A 3MBPA 2ZNUA 2O7UA 3FJGA 3JYRA 5HM4B 2ZXTA 4FAJA 4IO5A 1SI1A 2NVUB 2QS1A 4YKJA 5FTIA 2F36A 3ILTB 4ZEIA 2FYIA 2DWHA 5TPAA 3TUSA 3HO7A 3IB1A 3C9HA 2HFBA 4YB5A 2ZNTA 2KLFA 2H9BA 3W9WA 1I6BA 4YICA 3UGWA 3G3GA 4IGRA 3UP9A 2AL4A 4EXLA 3DP6A 2CZLA 4KCDA 1FQFA 4RPNA 3PPPA 4QFLA 2QMXA 5DYHA 3V5AA 3H06B 3ZSFA 2I48A 3O6IA 1NFTA 1II5A 1VFEA 1UIVA 4R6KA 4XKQA 4ZEBA 4NF4B 1MY1A 3MPKA 2H4IA 3GLBA 2Q88A 3E3KA 2Z23A 3L6GA 1M5FA 4DCYA 3H03A 2O1LA 1B3FA 5ICQA 2QJEA 4OMBA 2BJJX 4OETA 2Y7IA 3PUWE 4UA8A 3S9LC 1B7HA 1RKMA 5CMCA 5CM6A 1EH3A 1YPNA 5ITPA 2HXWA 1OLCA 4EQ7A 1B7ZA 5CRYA 5LOMA 5F7VA 3A3UA 1DPPA 1MDQA 3N94A 2D3IA 4TOZA 1R9QA 3S9NC 3OSRA 4ESWA 4KR5A 1OMPA 4ELRA 1MM6A 1XVYA 3KZGA 4JBZA 1HSEA 1A99A 3K6XA 4QSDA 5FHNA 4AB6A 2XD2A 3T9VA 3IJOB 4GXAA 2O51A 4F22A 1IQ7A 4RY1A 1MQJA 5CBRA 3N6UA 2NUVA 2P1SA 3LSXA 3BKIB 4EQBA 2RC9A 1XT8A 4ND9A 2XD3A 1LFIA 2B3FA 3DP4A 5L8DA 3IO6A 2GHAA 1B3LA 3USDA 4OEVA 4RYAA 3TAJA 3TTKA 1I6AA 3BFUA 4ELQA 4N07A 5EHMA 5CMBA 3PU5A 2UVHA 4WEPA 1DTZA 1PB8A 4PQJA 1Y3NA 1TFAA 2XXYA 2XXPA 2XXUA 3LBSA 4NF5B 5CC2A 4P0IA 4OQOA 1M5DA 3TQLA 4ZEKA 3N26A 4PE5B 5DEXA 4KYEA 1IXIA 3Q25A 3E13X 4HS7A 2ANJA 3FIRA 4XTCQ 5BUUA 3MQ9A 1ELJA 4U22A 3SDFA 4RNSA 4AQ4A 4PFUA 3B7DA 3CSBA 4GVOA 4G4PA 3LSLA 3VXBA 4JDFA 1IIWA 4O3CA 3QYTA 1IXGA 4O3AA 3EHSA 4R74A 4QFOA 4WXJA 3IORA 3UIFA 5BWJA 3IO4A 4KYDA 2UXAA 3VLUA 2ZYOA 1O63A 3MJNA 1MH3A 3KN7A 3PGFA 4RXLA 3TTLA 1QKBA 3MWBA 4I62A 2NOOA 3TTRA 1URGA 4YKKA 3A3CA 5HPQA 1B3EA 4Z7EA 1QUIA 5H8QB 4KPTA 3KOSA 3FZVA 4G68B 3K1PA 1BLFA 3N5LA 3SEXA 1YAEA 3C32A 3C31A 2ZNSA 2DQVA 3TPAA 2DXRA 4R75A 3KJ7A 3Q26A 2ONRA 4F2OA 1D9YA 1SW2A 5B7DA 2A5SA 3K0VA 2GHBA 4DLDA 2Q89A 1B5HA 4HCWA 1FCKA 4I1DA 4U4SA 2PYYA 2GRVA 2HZKA 3O28A 2Y7WA 2H98A 1MY4A 1SD3A 2Z22A 1B9JA 2Q2CA 2VD2A 5M2VA 1P1NA 3HSTA 4IO3A 1ZTYA 3C34A 3IOTA 4EF2A 1B3HA 1B5JA 2QS4A 4JSDA 3TFLA 1J1NA 5B70A 1VFDA 4LQ2A 3DM0A 1SBPA 4GL8A 3I6VA 1NMUA 2HQ0A 3QSLA 3PUXE 4ELPA 3TEPA 4H1XA 4C1UA 4DXUA 5CI5A 2H99A 4NWDA 2DWJA 3TCFA 1IUDA 1B58A 2H25A 3B6TA 1MPDA 3H7MA 4LZ8A 3AXFA 3ZKLA 4Q8RA 3T9UA 4RPOA 3CFLA 5FHOA 4ZS9A 3HN0A 3C35A 3O29A 3W15C 1GR2A 1ZMGA 2ZYKA 4KQPA 1XVXA 3CIJA 1NKXA 3PD8A 1N7WA 2FNCA 1UIUA 4G68C 3U1OA 3ZS6A 4NF6B 4IO4A 4R6HA 1S50A 1LAGE 1ATGA 2UVGA 1TXFA 4R9FA 4MBPA 3FVNA 3DELB 5H8QA 4OXVA 2O6AA 3UK4A 2Y7KA 1Z7NE 4O3BA 2OK2A 1MM7A 1GGGA 3PPQA 4F3BA 4G68A 3O6GA 2XXHA 2OBGA 3O2AA 5L9MA 4C1TA 4NE4A 4POWA 2REGA 4MF3A 4XIGQ 5H8FB 1XOCA 1NNTA 3RY3A 1SYHA 2E1SA 3QIMA 3T66A 1Y4CA 4E0XA 2XX8A 4KD5A 2CMOA 1N3WA 1A8FA 3PPRA 3FJ7A 3PPNA 2A5TB 1OQHA 5IKBA 4QFPA 2I58A 3TELA 3ILUB 2I3VA 3SEVA 2OCUA 2E0SA 4MFIA 2XXTA 4FE8A 3MAMA 4THIA 3FXRA 1LCTA 3OOAA 1DPEA 1FTKA 1SYIA 4OZ9A 3LC8A 3MC2A 1RYOA 3HCQA 3KG2A 3HHGA 2DOJA 4GOTA 4BDRA 3IL1B 3SEYA 1H76A 2ONSA 4IO7A 5I59B 4DXCA 3K1NA 3HPIA 1PBQA 4RK2A 1D9VA 4R6YA 4DZ1A 1O64A 5AA1A 2I0BA 3T93B 1B7UA 3CI8A 2RC8A 2RC7A 2F8DA 5JK4A 3B6WA 3U94A 5AA2D 4BDOA 3PMXA 3THIA 4PFTA 4R73A 2VGQA 3EHUA 1SW4A 1MY0A 3V83A 4G8HA 1BIYA 4NF6A 1B4HA 3IB2A 3S4UA 5DEXB 4KI0E 3KSJA 3OEKA 2QS3A 3ZKKA 1QKAA 1NNKA 3GBAA 2WKYA 4PFWA 3IOVA 2QRYA 3KN8A 4WKMA 4LA9A 3PUVE 1KWHA 1USYH 4OTEA 3U72A 2DE4A 5CMMA 3MPLA 4KYSA 4YB6A 1BTJA 3TTMA 1TFDA 5H8FA 3IOWA 2P2AA 2GFEA 3U93A 2V3TA 3G3IA 1QUKA 4F19A 3H6WA 5HBCA 4XKPA 1H44A 1N3XA 4JXIA 3Q27A 5JTYB 5L9SA 4ESXA 1B1XA 2Z8FA 4MLVA 4OVJA 4EXKA 2ALUA 2A5TA 4F2QA 1FTOA 1OLAA 2H5YA 3A09A 4ECFA 4IY6A 3EHTA 4I9DA 1HSJA 4GWOA 2PX1A 5DTBA 3E9XA 3K2DA 2XX9A 3G3JA 1M5CA 1A7LA 3FGSA 3KEIA 4NTLA 4R2FA 2YPNA 3H6UA 2O1MA 5I59A 2I6EA 2G29A 1LFGA 1BKAA 3PMWA 2F34A 3CSGA 3TCGA 4P0GA 1MPCA 5L9OA 4ISUA 2DWIA 3FXUA 2DXYA 1ZIUA 4G8NA 1A54A 2F7CA 3H6TA 3EF7A 3IJXB 4YMBA 3RT6B 1D4NA 4FORA 4PP0A 3IB0A 4N13A 4N6PA 4OEUA 3SEWA 2IA4A 3TDJA 3O66A 1P1QA 4HTGA 2B65A 3MVWA 4GD5A 3ODBA 1SVXB 1GV8A 2XXRA 3OO6A 3QUFA 5H8HB 1DSNA 5AA3A 1MXZA 1P1UA 4DDDA 1JETA 3CRBA 2HCAA 2XXIA 3TMGA 1MRPA 2VD3A 1VSOA 1ZJLA 1FQCA 1N84A 2HAUA 3O97A 1N0TA 2XXVA 2OWSA 2ZYMA 3KOTA 2YLNA 1P1OA 1SW5A 1QJMA 1B6HA 1VR5A 1Q35A 4FATA 4FEDA 1M5EA 3S2VA 2PMSA 2R71A 3KJTA 2X7QA 3IAZA 4H6DA 1LGBC 2DSFA 4F3PA 1SQYA 1B0HA 3H4ZA 5H8NB 1B51A 5JTYA 4LZ7A 2XXQA 1MS7A 1AOVA 3V89B 3VV5A 4QHQA 2QPQA 4WEDA 3LSFB 2OWTA 3MP1A 4QSEA 2I49A 3IK6B 4GFRA 3MZ9A 4JWOA 1N04A 1FW0A 3S9EA 4F3SA 1AH5A 1B05A 1ANFA 4QFKA 2RINA 4RA1A 2X26A 3RPWA 4GQOA 3TKDA 4F39A 2D21A 2XXWA 4PETA 2I3WA 2Z8EA 1EZ9A 1AMFA 3DLNA 3V8XB 3RQTA 4X1DA 3EQ1A 2Y7RA 4YKPA 2XX7A 1MQDA 4KFQA 1POY1 1Y20A 1TT1A 3FATA 2ZMBA 3TYHA 1IZ1A 1US4A 3OELA 2QSXA 4DE8A 4DIGA 3Q28A 5TP9B 4FJPA 5A5XB 3K6WA 2I4CA 3R6UA 2HZLA 5KDTB 3K01A 4HCYA 1PB7A 1IXHA 2DWAA 5I2KB 1LB9A 4RK9A 3FUZA 1OVBA 3LR1A 2YJPA 1PBPA 1MH4A 3WAFA 3VE1B 1MQGA 5H8HA 2AL5A 2F6GA 4G77A 2F97A 1L5TA 2ESNA 1JEUA 3T96B 2F7AA 4F31B 4NMYA 3CFZA 3GXAA 1VE4A 2QL3A 1B5IA 1D3KA 4NWCA 2AIXA 2F78A 4ELOA 3RT8A 3CFXA 1T0KA 4GXSB 2GH9A 1B46A 1IXCA 3D4CA 1Y3QA 3G3KA 3IOUA 2R9JA 3CG3A 5ICTA 1N76A 3OO8A 5H8SA 4Q5TA 1P99A 5H8NA 4IGTA 1DTGA 2DE3A 4FEBA 4Z0IA 3VFJA 2UYFA 2Y84A 2UYEA 2X7PA 5EHSA 4GIZA 3K6UA 4BDNA 3OO9A 5CBSA 2G93A 3F11A 5AA2B 2R6GE 3C36A 4XKNA 4KHZE 3UORA 4OWDA 1UTBB 1FQAA 1SI0A 3PUZE 1B4ZA 4F1UA 1DMBA 5DVJA 2M8CA 1O7TA 2F5XA 3M8UA 5EYFA 4R2BA 5I2NB 1US5A 1A55A 3TCHA 1R9LA 2DVCA 2VP1A 1Y1MA 3JV9A 4ONYA 4P11A 2V3UA 3MZ1A 2LAOA 4JWYA 1MXVA 4ZEFA 4M1VA 2QS2A 3MZBA 4IO2A 4ZE9A 3L6HA 5TP9A 3PD9A 2XXXA 5A5XA 2PVUA 1B3GA 5KDTA 3CVGA 3H6VA 3OSQA 4X48A 5I2KA 3RLFE 1B2HA 3VVFA 3N6TA 3T9HB 3IX1A 3K00A 4DCXA 3M3LA 3U92A 2THIA 2O7IA 1ZLQA 1YTVA 3TZAA 1NNPA 2Q2AA 1Y9UA 3C33A 5AA4A 1JW1A 1B52A 2O84X 1MQIA 1P1WA 2D5WA 4KCCA 3RN8A 5ELVA 3OD7A 4QF9A 3OMBA 3VLWA 3UA8A 2AYSA 3RTFB 3VXCA 4E0WA 1MDP1 3UN6A 3QUJA 4OENA 1ZU0A 3MW0A 5F1QA 4MH5A 3SETA 4EF1A 1IITA 1TWYA 1GTKA 3B6QA 1LCFA 1R1NA 4U21A 2V3QA 3KN3A 3Q29A 3H3GA 1R6ZA 1PEBA 4Q30B 4TLLB 4GL0A 1MXXA 4K3FA 3MUQA 4LVQA 3SESA 1HSLA 4POXA 1H3DA 3QAXA 4GF8A 1MG1A 4QRZA 2ABHA 1QUJA 4ZEDA 5AA2A 1FTJA 2UVIA 1UTBA 4XKRA 2DYXA 4YMAA 1FTLA 3G7WA 1JVYA 4YZZA 1MXUA 1MY3A 1URSA 2VHAA 3SKPA 1B1HA 4H67A 4U1ZA 5I2NA 4YKIA 1S7YA 5J1DA 2VOZA 4F18A 3VLVA 4OESA 3FVKA 3FXQA 1XHYA 3HV1A 3T22A 3JZJA 4BDMA 1RYXA 2V93A 4X9TA 5I57B 1FTMA 4GLIA 2B3BA 3MVZA 3K02A 3BFTA 3RUMA 1OIBA 1OQGA 1UTHB 2RCAA 4R72A 3RTWB 3G3FA 3GBBA 1MXYA 1NL5A 2FA7A 4H65A 3PMVA 1UQWA 1I69A 2XHDA 3LUYA 1EZOA 4OFOA 3VVEA 4QSCA 1H43A 4JSOA 1LAHE 4R9GA 2Y7PA 4C0RA 3FVOA 1IEJA 3D4GA 4LONB 2O69A 3CG1A 4LP2B 4M4GA 5CMKA 5DVFA 3W9VA 1EU8A 1Y1ZA 4H8IA 3O9PA 3U8QA 2I4BA 3FASA 1A40A 4LUBA 1FQDA 3I3VA 1CB6A 1FQBA 4ZZAA 2Z8DA 1USYE 2IEEA 3I5OA 1WDNA 2V25A 3RNNA 2DE2A 2HEUA 3TQWA 3GZGA 1JW4A 4AB5A 4IB2A 1Q1KA 4I8CA 4NF4A 4X1BA 1M5BA 4ZDMA 1ZKBA 1MQHA 4FIMA 4IY5A 5KCJB 1MY2A 1LBCA 2PBWA 3K1MA 5ITOA 1N7XA 2V84A 4QFNA 4TLMB 2RF1A 4U23A 4U1OA 3K4UA 4LZ5A 1H45A 4BDLA 5K2YA 5IAIA 4OERA 1AL3A 3MVXA 5I57A 1Y3PA 1Y4TA 4ZE8A 3OENA 4LQ5A 4U2RA 3VVDA 3BBRA 1UTHA 3MP8A 5ISUA 4OYVA 5FHMA 3EN3A 1LBBA 3QXMA 4IO6A 3VDFA 1NH7A 4F1VA 1WVJA 1MPBA 1FQEA 1NH8A 2RCBA 3R26A 1PC3A 3R7XA 1YCJA 1S9TA 3FVGA 4F3GA 4DXBA 3T9XB 3LSWA 4G8MA 2F35A 4YU0A 3P7IA 1LSTA 3ONMA 1B0LA 2PT1A 4EQ9A 1A8EA 2P0SA 4G2ZA 3QK6A 3CR9A 5I58B 5K2XA 1JQFA 3K6VA 2NWJA 3OO7A 4H0WA 4NF8B 3PUYE 5I56B 4JB7A 3S9MC 1JEVA 1SDXA 2I0CA 2O68A 1WODA 1LB8A 3PPOA 5TU0A 1F9BA 4NF5A 2OZZA 3RGYA 2Q9TA 1MXWA 2F6PA 4H5GA 5KZTA 3MVYA 4HW8A 2DP8A 5AA4B 3O6HA 4Q0CA 1LAXA 5DT6A 5JEIA 3WAEA 2ONKE 5TPAB 1EZPA 3SERA 3OEMA 1DOTA 5KCJA 3ECRA 2OJTA 5AE4A 3FJMA 4ZECA 5I84A 3FV1A 4JWXA 4F1YA 2UVJA 3C4MA 3SEUA 1QULA 4YB7A 5FTHA 4NEDA 3KBRA 3KFMA 1LAFE 3M3KA 3TODA 2RKMA 3E4RA 4PFYA 4L17A 4LATA 2PT2A 2QMWA 1PB9A 2NXOA 2W7YA 2REJA 1QVSA 3G3HA 3FD3A 1POTA 1OVTA 2Q8JA 3KGCA 3FV2A 4BLAA 4GRKA 1JNFA 1PDAA 4H8JA 4OHNA 1Z7ME 2DS9A 1XC1A 3KSXA 3PV0E 3M3FA 4U4XA 1ZBMA 1JVXA 3OXNA 1I6QA 3DP8A 3MP6A 4YAHX 4XXUA 1CE2A 1GVCA 4TQUQ 1SW1A 5DVIA 3EPEA 4EUOA 1B40A 4OFJA 1JW5A 4OFLA 1NNFA 2DVZA 4RJZA 2F7BA 4FECA 1URDA 1XS5A 3TTNA 2ZYNA 2HAVA 3HHFA 4ZZEA 2OLBA 1LFHA 5I58A 4EDPA 1B32A 1LLSA 4MLQA 4UACA 4BDQA 4H5FA 4NF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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