5FHOA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with (s)-2-amino-3-(5-(2-(3-chlorobenzyl)-2h-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 2.3 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
254
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tweaking Subtype Selectivity and Agonist Efficacy at (S)-2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-isoxazol-4-yl)propionic acid (AMPA) Receptors in a Small Series of BnTetAMPA Analogues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 254
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fhoA02
4XKPA 1US5A 4FJPA 1VFDA 3S9LC 4HCYA 3CSGA 3RTFB 4MH5A 3RLFE 1PBPA 4JWYA 3Q27A 3KJ7A 5CBSA 1B7HA 2HEUA 1DTGA 2YJPA 3BKIB 2Y84A 4F2QA 2RCBA 3DELB 3G3IA 4POWA 1XS5A 3M3FA 1S50A 1SDXA 4ZDMA 1MXZA 1NL5A 5DTBA 4Q8RA 3I6VA 2DP8A 3FXRA 2NVUB 5CRYA 4YKJA 2GHBA 1P99A 3KN8A 2Z8DA 4ELOA 1O63A 5EYFA 2RC7A 3CRBA 4AQ4A 2RC9A 3K6WA 1N0TA 1DOTA 3TUSA 4R75A 1Z7NE 3S4UA 3U94A 3HCQA 4OQOA 3FXUA 1MPBA 2HAUA 3EQ1A 1HSLA 2I4CA 2PYYA 4I62A 2F97A 4K3FA 2PVUA 4XIGQ 4U21A 3C9HA 3PPPA 4LATA 3VLVA 3PU5A 3G3KA 5I56A 1R9QA 5K2XA 4PFTA 1O64A 4UA8A 3O66A 4YB7A 2UVGA 4GLIA 5KDTA 1P1UA 4GXSB 3EHUA 1JW5A 3GXAA 1LBCA 2DVCA 4EUOA 4U1OA 1A8EA 4BDRA 1QUIA 3TKDA 2LAOA 1Y4TA 3K6UA 2I6EA 3MWBA 4OWDA 3E9XA 5IKBA 2H98A 4OHNA 3LC8A 3LSWA 3IB2A 1M5EA 4NF4A 4U4XA 1R6ZA 4HCWA 4OETA 1H45A 1US4A 3IJXB 3VVFA 4NMYA 1P1WA 4GOTA 3OSRA 4RA1A 5I84A 4LUBA 5TPAB 2F34A 3L6HA 4POXA 2Q9TA 5AA1A 1A99A 1FTKA 1LAGE 3GZGA 1H3DA 2F8DA 3EHSA 3IOTA 2GH9A 4C1UA 2REGA 3FJMA 3P7IA 3TMGA 4MF3A 4OFOA 1FQEA 1YAEA 1H43A 4HS7A 5A5XB 2NOOA 1B32A 3ODBA 3VXCA 4JXIA 5AA3A 5ITPA 5ICQA 1MH4A 4F1YA 1MG1A 4ECFA 1LLSA 2DSFA 4QSDA 2ABHA 2HXWA 2UVIA 4H6DA 1JW4A 1D3KA 1ZMGA 3H06B 4NEDA 1XOCA 2VOZA 1FTMA 1EZ9A 4ELPA 4ZS9A 1S7YA 3FUZA 2O1MA 3B6WA 3T9HB 4OTEA 4ZEBA 3TCFA 1B3HA 5I58A 1ZLQA 1ZIUA 3PPRA 1MY3A 3OO7A 2O84X 1DTZA 1YTVA 1UTBA 1GTKA 1PBQA 5I56B 3TELA 2H5YA 3K00A 1B4HA 2I3WA 1MXWA 1FCKA 3ZKLA 1POY1 2VGQA 2Y7RA 2XXIA 5BWJA 2F5XA 5KDTB 3G3JA 4OENA 3H6UA 2Y7KA 4TOZA 4ZEFA 1MQJA 1AL3A 3U92A 1B4ZA 1FTOA 1LSTA 2XX7A 4ELRA 4FE8A 3AXFA 1LCTA 4QFLA 5LOMA 4R72A 3UGWA 1D4NA 1JQFA 1QKBA 2DYXA 4HW8A 1PEBA 1IXHA 2V3UA 5I59A 2QS1A 1XT8A 4NF4B 4TLLB 2PMSA 4NF8B 3RNNA 4DZ1A 2QPQA 3C4MA 5CI5A 3V5AA 1ATGA 3E3KA 4OXVA 3PPNA 1QVSA 1TT1A 4GF8A 2XXTA 2AIXA 1MY2A 2I4BA 3IOWA 3MPLA 5CMMA 3G3HA 5JTYA 1RYXA 3E13X 2Q88A 3HO7A 1H76A 1SW2A 1PB8A 3SESA 2G93A 3VXBA 1IITA 3DLNA 1MXXA 4TQUQ 4PP0A 4QFOA 2OWSA 4F1VA 1UTHA 4KYSA 3CSBA 4EQ7A 1B1XA 4IY5A 3OO8A 2O6AA 3OMBA 4H8IA 1DPPA 2B65A 2HAVA 4KHZE 4LZ8A 1II5A 1ZJLA 3JV9A 4DCXA 3S9EA 3OOAA 4RPOA 1MPDA 2DE3A 3MZ9A 3GBAA 3K6XA 2H9BA 5H8NB 2Q2AA 2P0SA 5I57A 3MBPA 4YKIA 1IQ7A 4OEVA 4YB5A 2NWJA 2Z23A 4MLQA 5I58B 3SEXA 3T66A 4ZECA 4PE5B 1LB9A 3H6WA 1A40A 1R9LA 4BDNA 2G29A 1UTBB 1MXVA 3WAFA 3CFZA 3ONMA 1URGA 4TLMB 3N26A 3UA8A 3Q26A 4IO3A 2QSXA 3IL1B 1Y1MA 3G3FA 3PPOA 3N6UA 2Z8FA 1MXYA 1ZTYA 3C33A 4YZZA 2ONSA 2X7QA 2V3TA 2ZMBA 1LAHE 3TODA 3VVEA 3K1PA 4DIGA 2IEEA 2OWTA 3O28A 3MQ9A 3CVGA 5TP9A 4RK2A 4ZE9A 5I59B 4U1ZA 3WAEA 1SW5A 1Y20A 4G8HA 5HM4B 4EF1A 3IK6B 2I0BA 1MDP1 2I3VA 3MVWA 4GL0A 1VE4A 1WVJA 4JSOA 1NNPA 2YLNA 1NH8A 1ZU0A 4RPNA 2VP1A 5H8QB 4IO6A 5JTYB 3QYTA 1UIVA 4RXLA 3PUYE 1DMBA 3OEKA 3JZJA 3PGFA 3KJTA 4EXLA 4BDLA 5B7DA 3HPIA 4H67A 2F35A 1QW0A 4G8MA 3V8XB 1UTHB 5TPAA 3KZGA 2M8CA 3H6VA 2HZKA 1EZPA 3QUJA 1Q1KA 1EZOA 4ONYA 4KI0E 4GD5A 2RCAA 4THIA 4YU0A 1MXUA 4N6PA 1URSA 2DWAA 1AIVA 4R6HA 4X1DA 2X7PA 5I57B 4IY6A 5M2VA 5A5XA 1MQIA 5IAIA 4KCCA 3D4GA 2FYIA 2AL5A 2I58A 3VLWA 3PD9A 4G8NA 2F78A 4R2FA 5CC2A 1CE2A 4NE4A 1B51A 1Y3PA 1IXGA 2F7CA 5J1DA 1YPNA 4Z7EA 3BFUA 4GXAA 4OYVA 2RINA 1SI1A 3TTKA 5CBRA 1NFTA 1GV8A 1IIWA 4G68C 3B6TA 5JK4A 2UYFA 2XXQA 3MVYA 4L17A 5CMKA 4EQBA 2THIA 3FJ7A 1FQDA 1PB9A 1MQGA 1IUDA 4U22A 2DQVA 5TP9B 2QMWA 5DYHA 2H25A 1JW1A 1N84A 3E4RA 4X48A 3N5LA 4PFYA 3USDA 4LQ2A 3T93B 3H03A 1JETA 4QRZA 2DE2A 3MVZA 3PUVE 5BUUA 1I6QA 5H8FB 2DWJA 3FIRA 1LFHA 1Y3QA 2H99A 4ISUA 3S2VA 2PX1A 3K1MA 3TTNA 1JVXA 4RJZA 4IO2A 2O69A 2XX9A 3OEMA 4XKRA 4PQJA 3RN8A 3TCHA 4NF8A 4IO5A 2NUVA 5FTHA 1S9TA 1Y1ZA 4ELQA 1WDNA 1LB8A 4H0WA 2XXXA 4YMAA 1JNFA 1B05A 1O7TA 4FORA 1ELJA 2B3BA 3QIMA 2XX8A 3UN6A 3SEWA 3PUXE 1B2HA 3K01A 3HHFA 3DP4A 4KYEA 3RGYA 4FATA 4N13A 1JEVA 1P1QA 3KOTA 3GBBA 1J1NA 1SVXB 4X1BA 1MDQA 3C36A 1B5HA 5ICTA 4F39A 4JB7A 3OO6A 5F7VA 5AA4A 1MRPA 1A54A 3KBRA 5L8DA 4G68B 1LFIA 5H8NA 3SEUA 1M5BA 4F19A 1POTA 4QHQA 3TTRA 3U93A 2QS2A 2Y7WA 2XD3A 4H8JA 2ZXTA 3EHTA 1GR2A 2A5TA 1OVTA 1MM6A 2OLBA 2E1SA 4KD5A 2D5WA 5TU0A 3BBRA 4F18A 1RYOA 3FXQA 1JEUA 5KCJB 4YMBA 4DE8A 1AMFA 3OENA 3LBSA 5JEIA 4F29A 3VE1B 4WEPA 1BTJA 2O1LA 4C1TA 3N94A 3Q28A 1QJMA 4F2OA 3QAXA 3TPAA 1PB7A 3LSFB 3U1OA 2F36A 3R7XA 1UQWA 1B46A 2OCUA 2UYEA 3SKPA 1B0LA 4NF5B 4UACA 4IGTA 3TTLA 3S9NC 4R74A 2DE4A 5I2NB 4F31B 2F7AA 2ZNUA 2X26A 1CB6A 3R6UA 5I2KB 2XHDA 3KN7A 2DVZA 5H8QA 1A55A 2DWHA 2V3QA 2OJTA 3FV1A 3TEPA 2ZYKA 3FVGA 4Z0IA 3H4ZA 1AOVA 1BKAA 3T96B 4PFWA 4OMBA 4DDDA 1PDAA 3O6IA 3K4UA 1IXCA 3VLUA 1Y3NA 2PBWA 3OELA 4ZE8A 1FQCA 1VFEA 4AB5A 5AA4B 4H1XA 1NNKA 4GRKA 4LZ5A 2NXOA 4R9GA 3M3KA 3IAZA 4EF2A 3S9MC 2XXVA 3FV2A 3OXNA 1B9JA 2ESNA 4R6KA 3M3LA 5EHMA 3TQWA 5CM6A 2A5TB 4YB6A 3L6GA 4MFIA 2WKYA 3CI8A 2Q89A 1TFAA 1OVBA 1NH7A 1EU8A 1HSEA 1L5TA 5ISUA 4U4SA 3KSXA 3EN3A 3IX1A 1BIYA 4YICA 1D9YA 4XKNA 3IJOB 4IO7A 2Q8JA 2ZYNA 2QS4A 3O6GA 3K02A 1M5DA 1OMPA 3MP8A 5DVFA 1B7ZA 2DWIA 3GLBA 4NWDA 4FEDA 3U8QA 4R9FA 3B7DA 4H5FA 5HPQA 3B6QA 4OEUA 4KFQA 3MPKA 1FTLA 1SD3A 2Z8EA 3SDFA 3FVKA 2DS9A 2CMOA 1MY4A 4QFNA 1XVXA 1SQYA 4QFPA 4IO4A 2KLFA 2GHAA 1Q35A 1N7XA 2UVHA 1NKXA 4BDMA 3O2AA 3O9PA 1LCFA 1FW0A 1MPCA 2Q2CA 3G7WA 5AA2B 1KWHA 3HN0A 3T9VA 3IB0A 5H8FA 3I3VA 3PD8A 4G2ZA 5DEXB 4F3BA 5AA2D 4FECA 2A5SA 3LR1A 4OESA 2ONRA 3W9VA 3UP9A 3QXMA 4ZEKA 1B5IA 1N3XA 4E0XA 3RTWB 3SEYA 4NWCA 1MY1A 2P2AA 3C34A 3IO4A 1B0HA 1SYHA 2ZYMA 3D4CA 1RKMA 1OIBA 3K6VA 2ZYOA 4I8CA 5DT6A 2W7YA 4LP2B 2O51A 4Q30B 2R71A 1SI0A 4PETA 2HQ0A 3MVXA 4DLDA 3PMXA 3SEVA 1N7WA 4GIZA 3M8UA 2ONKE 4XKQA 4BLAA 1NMUA 3IR1A 3ZS6A 4OERA 3MAMA 4ZZAA 4F3GA 3TZAA 1B3FA 4QFKA 4I9DA 2HCAA 4JWOA 1B52A 1Y4CA 2O7UA 4F3SA 3HV1A 3RPWA 3TQLA 2R9JA 4HTGA 4H5GA 4G68A 3DM0A 1B5JA 1BLFA 3MP6A 2Z22A 1P1NA 4O3BA 1XVYA 4JWXA 3IOUA 1ZBMA 1I6AA 1M5FA 4OFLA 3Q29A 1I6BA 4KCDA 3DP6A 1Y9UA 5KCJA 2QS3A 3BFTA 3VFJA 2XD2A 1QULA 1MQHA 3JYRA 4YAHX 3VDFA 3TTMA 4GL8A 4GWOA 4RYAA 1USYE 3O97A 3K1NA 3C31A 3N6TA 1NNFA 4LA9A 4NF6B 4IB2A 4F22A 1IXIA 1BP5A 3G3GA 3A09A 4XXUA 3TDJA 3CFXA 3R26A 1Z7ME 1XHYA 3QUFA 5L9MA 3LUYA 1B3EA 4KQPA 3I5OA 2E0SA 4P11A 1N04A 4E0WA 2GFEA 1R1NA 4NF5A 3PV0E 1A8FA 4LZ7A 2UVJA 3H3GA 5H8SA 1ZKBA 5I2NA 4M4GA 3ECRA 1T0KA 3FD3A 1FQFA 1OLAA 4BDOA 5I2KA 3TAJA 1HSJA 2QJEA 1B6HA 1LAFE 3KGCA 1MY0A 4WKMA 4ZEIA 3W9WA 3MW0A 2B3FA 3O6HA 3THIA 4KR5A 4ESXA 5L9OA 1B3LA 1LBBA 4U23A 2H4IA 3OO9A 4JDFA 4OFJA 4F3PA 3FVNA 2XXWA 5H8HA 2R6GE 4QSCA 3EPEA 4LVQA 4R73A 1OQHA 2REJA 4GVOA 1B3GA 3ILUB 1M5CA 1MS7A 2GRVA 1B40A 4PFUA 4RK9A 3MP1A 1FQAA 5AE4A 1N76A 1MQDA 3MUQA 2P1SA 1ANFA 3RT6B 2DOJA 3K2DA 4LONB 3UORA 5FHOA 3ZKKA 3FGSA 2OZZA 4XTCQ 1A7LA 4DXUA 4MLVA 3A3CA 4IGRA 4Q5TA 3F11A 1UIUA 3C35A 4ESWA 4WEDA 4EXKA 4DXCA 2VD2A 3PUZE 1QUKA 1GVCA 2PT1A 2F6PA 2XXPA 4FEBA 2OBGA 1OQGA 4H65A 3KOSA 2O68A 4RY1A 3IOVA 1TXFA 4NTLA 4LQ5A 4MBPA 3OD7A 1LGBC 2O7IA 2QL3A 3CR9A 3T22A 2OK2A 1I69A 2Y7IA 1B58A 2ALUA 1GGGA 3MZBA 3Q25A 3FVOA 2Y7PA 5B70A 1SW1A 1LAXA 1SBPA 1TFDA 1DSNA 5L9SA 3CG1A 2DXRA 4DCYA 2I48A 4G77A 3RUMA 3O29A 3K0VA 5K2YA 5F1QA 5HBCA 2XXUA 2RKMA 4Q0CA 3PPQA 1N3WA 3SETA 1D9VA 1JVYA 2XXRA 2D21A 4QF9A 3RY3A 5EHSA 3W15C 4AB6A 5AA2A 2HFBA 3U72A 2VHAA 3ILTB 5DEXA 1P1OA 4GFRA 2VD3A 1B1HA 3LSLA 2V84A 5FTIA 4GQOA 1FQBA 5H8HB 3UIFA 3FZVA 2HZLA 5CMBA 2QRYA 4U2RA 5DVJA 3MZ1A 5KZTA 4O3AA 3PMWA 2ANJA 2D3IA 3VV5A 4ZZEA 3V83A 3C32A 3A3UA 3IB1A 5CMCA 1LFGA 1QKAA 3TCGA 3MC2A 3CG3A 1SW4A 1FTJA 4DXBA 2YPNA 2F7BA 2I0CA 2CZLA 2ZNSA 3T9UA 4O3CA 4EQ9A 4X9TA 3DP8A 3H7MA 2DXYA 2UXAA 3CIJA 1EH3A 3EF7A 4WXJA 4F1UA 4P0IA 4P0GA 3PUWE 2RF1A 4R6YA 4KPTA 3LSXA 2BJJX 4YKPA 1XC1A 3IORA 1QUJA 3RT8A 3MJNA 3SERA 1PC3A 3VVDA 3ZSFA 2RC8A 4N07A 2FNCA 2F6GA 4ZEDA 1WODA 2I49A 5FHNA 3KFMA 2AYSA 1AH5A 3TYHA 3OSQA 3HSTA 4JBZA 4BDQA 2FA7A 1MH3A 3IO6A 1H44A 4JSDA 1IZ1A 3FJGA 3HHGA 2XXHA 4OVJA 4EDPA 4RNSA 1TWYA 2IA4A 4QSEA 1VSOA 4M1VA 4OZ9A 5ITOA 3FASA 4NF6A 3KSJA 3QSLA 3CFLA 3PMVA 3RQTA 1B7UA 5FHMA 4I1DA 5DVIA 4G4PA 1VR5A 3TFLA 2PT2A 2V93A 4R2BA 1USYH 3UK4A 4ND9A 1URDA 2AL4A 2V25A 3FATA 4C0RA 3QK6A 1DPEA 1F9BA 1IEJA 2QMXA 3KG2A 3H6TA 1YCJA 4FIMA 1NNTA 2ZNTA 3V89B 2XXYA 3T9XB 4YKKA 3KEIA 4KYDA 3KN3A 1SYIA 1OLCA 4FAJA 1MM7A 5ELVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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