4LVQA

Crystal structure of the m. tuberculosis phosphate binding protein psts3
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
319
structure length
319
Chain Sequence
TLKASGSTAQANAMTRFVNVFEQACPGQTLNYTANGSGAGISEFNGNQTDFGGSDVPLSKDEAAAAQRRCGSPAWNLPVVFGPIAVTYNLNSVSSLNLDGPTLAKIFNGSITQWNNPAIQALNRDFTLPGERIHVVFRSDESGTTDNFQRYLQAASNGAWGKGAGKSFQGGVGEGARGNDGTSAAAKNTPGSITYNEWSFAQAQHLTMANIVTSAGGDPVAITIDSVGQTIAGATISGVGNDLVLDTDSFYRPKRPGSYPIVLATYEIVCSKYPDSQVGTAVKAFLQSTIGAGQSGLGDNGYIPIPDEFKSRLSTAVNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 3
publication title Crystal structure of the Mycobacterium tuberculosis phosphate binding protein PstS3.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 96
structure length 319
sequence length 319
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA02
2XXWA 5K2YA 4O3CA 3RTWB 3HO7A 1A8EA 1OVBA 1QUIA 1DOTA 2XHDA 2DXRA 1LAXA 1NL5A 2IA4A 4MLVA 2DOJA 3LR1A 3FVGA 1XVXA 2GRVA 2D21A 2P1SA 5CMMA 4HS7A 4NF4B 3S9NC 1ANFA 1B3EA 5TPAA 1ATGA 1Y20A 3K0VA 3QYTA 2GHAA 4PP0A 1B3GA 3W9VA 3O66A 1UTHA 1B05A 1US5A 5I58B 4JWXA 3TEPA 5TP9A 3DP6A 2QS2A 4GXSB 3CRBA 2I0BA 3IO4A 3OO6A 5CBRA 2ONSA 1D3KA 4RJZA 4ZEKA 1JQFA 4RK9A 4R72A 4XTCQ 3PUYE 3USDA 2HZKA 1GGGA 2DWHA 1DTZA 5DEXB 3THIA 1ZMGA 3I6VA 2X7QA 2RCAA 2NXOA 1S50A 4JWOA 4KYSA 4NWDA 1Y9UA 4G8HA 1IUDA 4E0WA 4WEPA 4FAJA 3M3FA 3TDJA 4MBPA 1I6BA 4JSDA 4NF5A 1P1UA 4O3AA 1POTA 3K6WA 1VR5A 4QFOA 2O1LA 1A55A 1UTBA 2XXPA 5H8SA 2O6AA 4GL8A 1GTKA 3E4RA 1B0HA 3IOWA 3EHTA 1GR2A 1Y4TA 4H0WA 3RT8A 1M5BA 2OZZA 5I84A 1B4ZA 3V89B 4FIMA 1P1QA 4G8MA 5ISUA 4EXKA 4IO2A 3U92A 3KZGA 3O29A 4ZEBA 2ZYKA 3SETA 1IXHA 3FGSA 3MVZA 4QSCA 2P2AA 3FVNA 1A7LA 1OVTA 2NOOA 1MS7A 2DS9A 2X7PA 4KCCA 4GXAA 1FQDA 3MW0A 4OERA 4PETA 5FHMA 1URDA 3PD9A 1M5FA 3PPOA 4EQBA 1FQBA 4I8CA 4IO3A 2F7CA 3MJNA 2H5YA 3G3GA 1H43A 2IEEA 2Y7KA 3IB1A 1A8FA 5DVJA 2I58A 4GFRA 3B6QA 5BWJA 3MC2A 5DTBA 5H8QB 4F1UA 2ONRA 3R26A 2UYEA 2OWTA 4RY1A 2D3IA 1OMPA 3R6UA 4ECFA 4LP2B 4YKJA 4HW8A 2F6PA 4G4PA 1FW0A 3HV1A 4U22A 1MG1A 3FJ7A 2DSFA 4PFWA 3C36A 3OEMA 5L9OA 1R6ZA 4ZEDA 5F1QA 3T9VA 3KSXA 4YAHX 3KGCA 4R75A 3KN3A 2F34A 3G3JA 1I69A 1B5HA 3U94A 1FTMA 4RPNA 4KYEA 3TODA 1B7HA 2M8CA 3MP8A 4NTLA 3TZAA 1N0TA 1UIVA 3PV0E 2UYFA 3C31A 1MM7A 3RY3A 4DIGA 3K01A 3UK4A 3KN7A 1M5DA 1MDQA 1JVYA 3OELA 5AA4B 1N3XA 3OO7A 1PBQA 4ZECA 1MPBA 2HXWA 4WXJA 5I59A 3V8XB 3SERA 4P0GA 1EZ9A 1HSLA 3MPLA 1NH7A 3D4CA 2H98A 1CB6A 1N04A 4ISUA 4U4SA 4QSDA 5H8HB 3A3UA 1SD3A 3JV9A 1YPNA 1YTVA 3F11A 3G3HA 4G68B 2Z8DA 3S9LC 3C33A 3RUMA 3Q27A 4H5GA 3KEIA 2XXXA 4KHZE 3HN0A 3FV1A 1MXVA 1QUKA 3TUSA 4KYDA 5ITPA 1B5IA 5JK4A 2QS4A 2Z22A 4LZ5A 5I57A 3KJ7A 1PB8A 1JVXA 2HEUA 4X48A 4H1XA 3CFZA 1P1NA 4MH5A 4R2FA 3ODBA 4U2RA 3VVDA 4FEDA 3QXMA 3BFTA 2V3UA 3TTNA 2QMWA 1LAGE 4U4XA 3N94A 2W7YA 2XXHA 2OWSA 1Q1KA 1IZ1A 3H7MA 1Y3QA 4TLMB 2PX1A 1NNPA 1OQGA 2PMSA 3IK6B 4ZZEA 3G3KA 4R73A 4YZZA 2RC7A 1AMFA 1EH3A 2V93A 2AL4A 3L6HA 4M4GA 3FATA 4FJPA 4YKKA 4R9FA 2I3WA 3IOTA 1EZPA 4IB2A 4F3PA 4I1DA 4RK2A 3KFMA 4OEUA 1DTGA 1JW4A 2V25A 4EQ9A 4Z7EA 5A5XA 3I3VA 2R9JA 3IX1A 3MPKA 1UTHB 4NF8A 4YMBA 2Z8EA 3K6UA 1II5A 2I48A 2VHAA 4FORA 1IITA 4P0IA 1A54A 1SW4A 2PT1A 4GRKA 3MBPA 5CM6A 3S9MC 1URSA 4DDDA 2DE3A 1AIVA 1ZTYA 1B3HA 4H5FA 4POXA 4ELPA 4LATA 2HAVA 1SW2A 1VFEA 3GLBA 4LA9A 4F29A 1XHYA 1LAHE 5IAIA 1QJMA 4ZDMA 3KG2A 4FEBA 3C9HA 1B0LA 4F1VA 1N76A 3G7WA 3TFLA 1YCJA 4O3BA 1BLFA 2F78A 3EF7A 1OLAA 4KI0E 2CMOA 4U1ZA 5H8NA 3SDFA 3PPPA 3DLNA 3RN8A 5I56B 2X26A 4IGTA 2A5SA 3O6IA 4N07A 1I6QA 1MY4A 3OENA 2H25A 4WEDA 3OO9A 1B4HA 3GXAA 3LC8A 5KCJA 1H76A 3OOAA 4OQOA 3TCGA 4ND9A 4H65A 2O84X 3T9HB 1ELJA 1DPEA 4M1VA 3WAEA 5FTHA 3S9EA 1GV8A 3CVGA 4QFNA 1B7UA 3HHGA 3HHFA 2ZYNA 3TCHA 4R6HA 3C34A 4NF6A 3K1NA 4THIA 1RKMA 4QF9A 2ABHA 4ESXA 4MF3A 2HAUA 3FVOA 5JTYB 5B70A 1GVCA 4PFYA 1P1OA 2R71A 5CBSA 5L9MA 2XXQA 5HPQA 1ZJLA 1IIWA 5FTIA 5AE4A 1N7XA 3K02A 2Q2AA 2WKYA 4H8JA 1WODA 1ZLQA 2QMXA 2DWAA 3EHSA 4BDMA 5BUUA 5AA1A 2A5TB 3M3LA 3B6WA 1NMUA 2OLBA 5DVIA 2UVHA 4H8IA 1SQYA 3SEUA 3TAJA 1B40A 2Y7IA 2R6GE 1TT1A 5I2KB 1NFTA 3SEXA 2H99A 4PE5B 3ZSFA 3N6UA 5H8FA 1AL3A 1FQCA 2XX9A 5M2VA 4FECA 4RXLA 4ESWA 2ZYOA 3CI8A 4ELQA 4N6PA 3TKDA 3W15C 4GLIA 4OENA 4F22A 1IEJA 3QAXA 1D9VA 5CI5A 3PU5A 3LSWA 1DMBA 1SW1A 4KR5A 3VXCA 3TPAA 1MXYA 1FTLA 3R7XA 5CMKA 4YB5A 1A99A 2HZLA 4DLDA 1IXIA 4GWOA 3V83A 1LFGA 4KFQA 1Y1ZA 5TU0A 2QRYA 3FJMA 2ZXTA 4BDRA 5ELVA 2QJEA 2LAOA 5I58A 3U8QA 2OCUA 3MAMA 2PVUA 2Q2CA 3LBSA 1EZOA 2HQ0A 3PUWE 3O97A 1MQHA 2F5XA 5J1DA 3MZ1A 4ELRA 4TLLB 4IO4A 1KWHA 2XXVA 4JBZA 2XD2A 1AH5A 4OTEA 4IO7A 3E9XA 3H3GA 2Z23A 1S7YA 3EQ1A 4F3GA 3VVEA 4Z0IA 2DVCA 1N84A 3RTFB 5I2NA 4F39A 2ANJA 2THIA 1B46A 5FHNA 3MP1A 2QPQA 4L17A 3CSGA 3CFXA 2DVZA 1MQGA 2YLNA 3O2AA 3TTMA 1QKBA 4R6YA 4F1YA 2O7UA 2REGA 3H06B 3GBBA 4BDNA 1TXFA 3RQTA 5ITOA 1JEUA 3EHUA 1O63A 2F36A 4GQOA 1JEVA 3PPQA 1H45A 3PPRA 4MFIA 4C1UA 3VV5A 1O64A 1Y4CA 4OFJA 2F6GA 3EPEA 4KQPA 4XXUA 1IXCA 2E1SA 2Q88A 4AB5A 3K6XA 3M3KA 3LUYA 2OBGA 1B5JA 4OYVA 3SEWA 4U21A 1NH8A 2ZNUA 4DXCA 2XXIA 4HTGA 1B1XA 2I0CA 4R9GA 3G3FA 5AA3A 3KBRA 2I4CA 1XOCA 4H67A 1J1NA 5DVFA 4POWA 1S9TA 3K00A 2CZLA 1SI1A 4JWYA 1B51A 1N3WA 1Y3PA 1MXXA 1O7TA 5A5XB 2PBWA 2PT2A 1B9JA 2XXTA 3S4UA 3ONMA 3TQWA 1FQFA 4ZE9A 1FTOA 1LLSA 5IKBA 2F7AA 1P99A 2F97A 1JW5A 2UXAA 3T9XB 3IOVA 2P0SA 3PMVA 3HCQA 3IJXB 3CR9A 3CG1A 4QHQA 4X1BA 4N13A 4DXBA 5H8QA 1SDXA 1R1NA 1UQWA 1PDAA 3VLVA 4EDPA 3VE1B 3H6UA 1BTJA 4DE8A 5L9SA 1D9YA 5EHSA 3MVWA 1B1HA 5AA2B 4IGRA 1MRPA 2I4BA 2DWJA 4LZ8A 1FTKA 1L5TA 3QSLA 4X9TA 4P11A 4JSOA 2F8DA 3T96B 1PC3A 5JEIA 1R9LA 4F18A 4C1TA 3UN6A 2VOZA 4F2OA 1TFDA 4OESA 4Q30B 3FUZA 3VDFA 1PB7A 4YB6A 4JXIA 3K1MA 4WKMA 2O69A 5HBCA 2RC9A 3JZJA 4QFLA 2Y7RA 3SKPA 1RYOA 3B6TA 4OZ9A 2Q9TA 2DE4A 4IO6A 1AOVA 3RLFE 5TPAB 5DYHA 2I6EA 2XXRA 2F35A 4GF8A 3TELA 2B3BA 2F7BA 2B65A 1MQIA 4JB7A 4XIGQ 1FTJA 1USYE 1MH4A 5TP9B 4OHNA 1B2HA 2XX7A 3I5OA 1MQDA 2VP1A 4DCXA 1M5EA 3K6VA 5KZTA 3FD3A 1XVYA 5H8HA 3T9UA 4ZE8A 1TWYA 2ZNTA 3ZKLA 4XKPA 2GH9A 1MPDA 3TCFA 2FNCA 3QK6A 3TTKA 2E0SA 2GHBA 3DELB 2RF1A 3IOUA 4EF2A 4GIZA 4G68A 3UIFA 4OVJA 5B7DA 4NWCA 1MY3A 3OXNA 1MH3A 1NKXA 1FQEA 2XX8A 3VXBA 1Y3NA 4K3FA 3K1PA 4NF5B 2ESNA 4EUOA 1LBBA 3M8UA 3Q29A 4Q5TA 1BIYA 3H6VA 1UTBB 4BDLA 1XS5A 3IL1B 3FJGA 4YKPA 4R74A 1SYIA 2DP8A 4JDFA 4EQ7A 2DXYA 1H3DA 4AB6A 3DP4A 1B58A 5EYFA 5HM4B 4PQJA 3E3KA 4ZZAA 2Z8FA 5K2XA 2Y7WA 4H6DA 1VSOA 3L6GA 3OSQA 4OWDA 4QFKA 4LZ7A 4IY5A 4OXVA 1IXGA 3C4MA 4QRZA 1MXZA 2YJPA 4F2QA 2RCBA 3GBAA 4RPOA 1JW1A 1R9QA 2AIXA 3IO6A 2V84A 3BFUA 1MM6A 1FCKA 5CMBA 3Q26A 1OQHA 4BDQA 4I62A 3PPNA 4G77A 1LB8A 3KN8A 3DP8A 4ZS9A 5KDTA 4F3BA 2B3FA 3KJTA 3PUZE 1QUJA 4UA8A 3IR1A 1DSNA 4E0XA 2BJJX 3IORA 4F31B 4OFOA 3T66A 3O6GA 1FQAA 3KOTA 3PMXA 4Q8RA 3B7DA 4Q0CA 3TMGA 3TTRA 4ELOA 2QS3A 1F9BA 1Z7NE 1USYH 2AL5A 3FVKA 2O7IA 4F3SA 3U1OA 5I2NB 2KLFA 2O68A 1MY0A 1US4A 4BDOA 2XD3A 1T0KA 1B3FA 1LAFE 4PFTA 3VLUA 4BLAA 4FE8A 3BBRA 4RYAA 3VFJA 1MDP1 2G29A 5I56A 4X1DA 4U23A 3H6WA 3OMBA 1LFIA 5CRYA 3BKIB 5EHMA 4DZ1A 1QW0A 2D5WA 3PMWA 2QSXA 4RA1A 3VLWA 1VFDA 1MY1A 4RNSA 3FZVA 2UVIA 3AXFA 4R6KA 3E13X 3UP9A 3CFLA 3LSLA 2DE2A 4OEVA 4NF4A 4KCDA 3T22A 4ONYA 5CC2A 2HFBA 3W9WA 1YAEA 4TQUQ 3O6HA 3H03A 1SI0A 3ILTB 4R2BA 2Q89A 4KD5A 3G3IA 4LQ5A 4QFPA 3VVFA 4MLQA 3ZS6A 1MPCA 1B52A 5I59B 3T93B 2REJA 1SBPA 5JTYA 4YKIA 1B7ZA 4NMYA 4ZEIA 2Q8JA 2DYXA 3LSFB 5DEXA 1MXWA 2AYSA 3C32A 4F19A 1OIBA 2NVUB 4LVQA 2OJTA 3IJOB 3PD8A 4DXUA 2OK2A 4QSEA 3N5LA 3KOSA 3UGWA 4UACA 5FHOA 4U1OA 3SEVA 3IB2A 2QS1A 4IO5A 5L8DA 2A5TA 2VD2A 3OEKA 3FASA 4YB7A 4C0RA 1ZKBA 1NNTA 4NEDA 3MP6A 2YPNA 1EU8A 3CSBA 4DCYA 3RPWA 5I2KA 3KSJA 3HPIA 5I57B 2HCAA 1LSTA 3RGYA 2I49A 1HSJA 1SYHA 1ZIUA 1JNFA 3CIJA 3FV2A 1MXUA 3CG3A 1CE2A 1TFAA 3FXQA 3MUQA 3K2DA 2DWIA 3TQLA 3PGFA 4GL0A 2FYIA 4PFUA 3QUFA 4GD5A 2ONKE 2RC8A 3Q25A 4GVOA 1BKAA 3ECRA 2PYYA 4OMBA 4FATA 5ICTA 2I3VA 1LFHA 1SW5A 4XKNA 1WDNA 3C35A 3MVYA 3QUJA 2DQVA 1LGBC 3RT6B 2Y7PA 1PEBA 3A09A 4NF8B 1HSEA 4GOTA 2ZMBA 1B3LA 2Y84A 2UVJA 1VE4A 3MVXA 2FA7A 1PBPA 4G68C 2XXUA 4LUBA 2VGQA 3UA8A 1IQ7A 3FIRA 4TOZA 4IY6A 3U72A 4G8NA 3PUXE 3MWBA 3MQ9A 3O28A 1UIUA 2H9BA 3IB0A 2ALUA 1Q35A 2QL3A 1QULA 1LBCA 3MZBA 1I6AA 4OFLA 4YICA 3RNNA 3IAZA 3FXRA 1MY2A 3JYRA 1LB9A 5H8NB 3A3CA 1NNKA 2RKMA 1XC1A 4YMAA 3K4UA 3OO8A 1JETA 1POY1 5DT6A 3TTLA 4LONB 4EXLA 1LCTA 3O9PA 1SVXB 5KCJB 3H4ZA 1Z7ME 1WVJA 3D4GA 1QVSA 3DM0A 3N6TA 4XKQA 1ZU0A 4LQ2A 5CMCA 1B6HA 2V3QA 5AA4A 5ICQA 3TYHA 3QIMA 3ILUB 1M5CA 2O1MA 1ZBMA 2GFEA 1NNFA 1H44A 4XKRA 4NF6B 3WAFA 4G2ZA 1RYXA 3U93A 1A40A 3HSTA 5F7VA 4AQ4A 2RINA 2UVGA 2VD3A 3PUVE 2ZNSA 3UORA 2G93A 1D4NA 5LOMA 1PB9A 2XXYA 5KDTB 3OSRA 4EF1A 1LCFA 4NE4A 3Q28A 1XT8A 1OLCA 2NWJA 4ZEFA 1B32A 2O51A 1N7WA 2V3TA 4I9DA 1QKAA 4YU0A 5AA2A 1BP5A 2ZYMA 3FXUA 4OETA 4KPTA 3SEYA 3H6TA 1DPPA 1P1WA 3SESA 3S2VA 1Y1MA 3GZGA 4HCYA 5H8FB 3V5AA 3ZKKA 4HCWA 3MZ9A 2H4IA 3EN3A 1MQJA 3LSXA 3N26A 2NUVA 3P7IA 1URGA 3OD7A 5AA2D
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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