4LVQA

Crystal structure of the m. tuberculosis phosphate binding protein psts3
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
319
structure length
319
Chain Sequence
TLKASGSTAQANAMTRFVNVFEQACPGQTLNYTANGSGAGISEFNGNQTDFGGSDVPLSKDEAAAAQRRCGSPAWNLPVVFGPIAVTYNLNSVSSLNLDGPTLAKIFNGSITQWNNPAIQALNRDFTLPGERIHVVFRSDESGTTDNFQRYLQAASNGAWGKGAGKSFQGGVGEGARGNDGTSAAAKNTPGSITYNEWSFAQAQHLTMANIVTSAGGDPVAITIDSVGQTIAGATISGVGNDLVLDTDSFYRPKRPGSYPIVLATYEIVCSKYPDSQVGTAVKAFLQSTIGAGQSGLGDNGYIPIPDEFKSRLSTAVNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 3
publication title Crystal structure of the Mycobacterium tuberculosis phosphate binding protein PstS3.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Transport protein
total genus 96
structure length 319
sequence length 319
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lvqA02
3IOWA 3IX1A 1BP5A 3KN8A 3QK6A 1B5JA 3DELB 1MPCA 2Y84A 2A5TA 2ZMBA 4OENA 4H8JA 4TQUQ 3V83A 4LA9A 2F5XA 4MFIA 1I6BA 5H8FA 2IA4A 3CFXA 1MY2A 3IOVA 3K6XA 4IO6A 4JBZA 1WDNA 2H5YA 1B3GA 1ZMGA 3CFLA 3PGFA 2V84A 1UTHB 3TTRA 3TTNA 1B6HA 2GRVA 5L9MA 1FQFA 1M5BA 3UGWA 1H45A 4H67A 1MY3A 1TXFA 3JYRA 3O2AA 3FZVA 4YU0A 3TAJA 3W15C 2PVUA 1R9LA 2I4CA 4POXA 4ZECA 4MBPA 3USDA 1VR5A 1MXVA 3VVDA 4F29A 2QSXA 1XS5A 3F11A 1FTJA 3OO9A 4MH5A 4O3AA 3MPLA 2ESNA 2Z8DA 3T9VA 4EF1A 1GR2A 4I62A 3SESA 1OLAA 3CG1A 2OJTA 4U2RA 4OMBA 3L6GA 3E9XA 1FQBA 2DWHA 4IB2A 4BDNA 3O28A 3KGCA 1WODA 5FHMA 1H76A 5CMCA 4IY5A 4P11A 4THIA 1LAGE 2O84X 4JSOA 2Z8FA 1P1UA 2VP1A 3M3LA 3PD9A 5FTIA 5K2YA 2NXOA 5JK4A 2VOZA 4F3SA 4Z0IA 1B51A 4WKMA 4OEVA 4U4XA 4F39A 3ZKLA 3KEIA 1H43A 4YKJA 3V89B 1NH7A 5TPAB 1DTGA 3MQ9A 3T66A 5DYHA 4KR5A 2AL4A 2P0SA 4IGTA 5L9OA 4HCYA 1IXGA 4GIZA 4NF6B 4R75A 1ZBMA 3Q25A 2O68A 3H6VA 3MVWA 2DVCA 3FV1A 1VFEA 1NMUA 4ZZEA 1P1WA 2V3TA 4MF3A 5H8NB 3PUZE 3IJXB 1Y4TA 4JWXA 3O9PA 3B6TA 1OVTA 3BFUA 5I2KB 3SDFA 1EZ9A 4GRKA 3H6TA 1Y3QA 4EQBA 1LSTA 3IL1B 1B7UA 4XIGQ 4IO3A 2OZZA 1FCKA 1B32A 4G8NA 2ZNSA 4OZ9A 3I5OA 3UN6A 3CG3A 1P99A 1RYOA 4GL8A 2ZNUA 3TMGA 2DQVA 4PFWA 1UTHA 1I6AA 5TP9A 3LC8A 1A55A 3MBPA 1YAEA 2Q2CA 1Q1KA 4KYEA 2NVUB 1MQJA 3ODBA 3S4UA 2I6EA 2R71A 2H98A 4TOZA 3FXUA 1DTZA 1RYXA 1MY4A 3DP6A 4GL0A 3K6WA 1MQDA 3PPOA 1B1HA 2HCAA 4BLAA 5IAIA 2OLBA 3H7MA 1NL5A 4KFQA 2UYEA 2XXXA 3I3VA 4NF4B 2Q88A 4F1VA 3H06B 4NF5B 4OETA 2OCUA 4I8CA 4GQOA 4QFLA 4OQOA 4EXKA 1Z7NE 3MVXA 3PMVA 4ZEDA 3I6VA 3H03A 2ALUA 3SEVA 1IZ1A 2AL5A 5DTBA 3GBAA 3PUYE 3MPKA 3CVGA 4LVQA 4TLMB 3DLNA 3K1NA 2CMOA 1A8FA 3PPQA 3U94A 1O64A 1SW4A 2Y7PA 2Z23A 5ISUA 5CM6A 2UVGA 2XHDA 1J1NA 3OENA 1Y9UA 3PUWE 4HW8A 4OFJA 1R6ZA 1MQHA 1SW5A 4POWA 1MPDA 1USYE 1AL3A 3Q28A 5ELVA 1XVYA 2VD2A 1NNTA 1LBCA 1LB8A 1LGBC 2XXIA 1D9YA 2DP8A 4ECFA 3RTWB 3QYTA 3MVYA 3FJMA 2G93A 5AA2D 3VLWA 2F6PA 4RYAA 1JQFA 2Z8EA 2V93A 1B0HA 4EDPA 5ITOA 3OO6A 2HZKA 3IAZA 3IK6B 2UVHA 4FIMA 4ELRA 3HSTA 5I2NB 4DCXA 2XXYA 5KDTB 1FQDA 2E1SA 3VXCA 1DPPA 3P7IA 1NKXA 1VE4A 3G7WA 1UIUA 3HHGA 2DWIA 2DWJA 4ZE8A 2F78A 4DE8A 3OD7A 2H99A 4PP0A 5KZTA 3ZS6A 3UA8A 4X1DA 5I59B 1NH8A 3RNNA 3TFLA 4GOTA 4M1VA 1MPBA 4KCCA 4RPOA 1DSNA 3CFZA 3PPNA 2CZLA 3CR9A 3S9MC 1N7WA 3Q27A 4NF4A 4C1TA 3QXMA 4F3BA 3VXBA 1DOTA 3UIFA 4NF5A 4PFTA 4WXJA 3BFTA 4KD5A 3VVFA 4DXCA 4BDRA 5FTHA 1IXCA 1TT1A 1IQ7A 3HO7A 3KN3A 4U21A 1FQCA 5JTYB 4DIGA 4G68C 2RCAA 4ZEBA 3A3CA 1LBBA 3PU5A 4I9DA 4RJZA 4MLVA 3MZ1A 2FNCA 3WAEA 4LP2B 4JWOA 1MY1A 3T9XB 3T9UA 3K01A 3TEPA 3RT8A 1RKMA 3TQWA 4F1UA 1MDP1 4KQPA 2RF1A 5I57A 4U4SA 3SEXA 3VVEA 5B7DA 3O6IA 2P2AA 4RK2A 1LB9A 1OQGA 2OWSA 4L17A 4NWCA 4IO5A 2QRYA 2D3IA 5I58A 4F1YA 4X9TA 2QS3A 2XXQA 2DXRA 4DLDA 1B0LA 4EQ9A 3FIRA 3OELA 1I6QA 2GH9A 4XKPA 4ESXA 4K3FA 4H8IA 1Y4CA 1JNFA 3G3GA 1A99A 1OMPA 4G2ZA 3CI8A 5CMKA 1B2HA 1M5EA 5KCJB 1ZIUA 5BUUA 1SQYA 1HSLA 4NF8B 4ELQA 2O69A 3A09A 1FW0A 4BDOA 1MDQA 2Y7KA 3CRBA 5I2NA 5A5XB 3PV0E 3V8XB 1LAFE 4Q8RA 2XD2A 1SYIA 5KDTA 3KSXA 4O3BA 2IEEA 1UTBA 1A54A 3E4RA 2QL3A 5H8SA 1DMBA 4BDMA 1B52A 1ZKBA 3OOAA 3FVKA 1CE2A 3IR1A 3IOUA 3B7DA 3WAFA 1LAHE 5L9SA 4YKIA 3N6UA 3TELA 3UORA 1N84A 2NWJA 2F7BA 1PEBA 2O7IA 4JB7A 4EXLA 3QUJA 4G8HA 3KN7A 4FECA 1Y20A 3TTLA 1QW0A 5CMMA 2HZLA 3DM0A 4E0WA 5K2XA 5DEXA 3MVZA 1JETA 3MUQA 1MQGA 2AYSA 1UIVA 2ANJA 4F22A 4FEBA 4HTGA 2QJEA 3B6WA 5JTYA 2RKMA 4AB6A 1B05A 1JVXA 1MXUA 3C9HA 3KSJA 3IB1A 3M3FA 5DT6A 3K4UA 2DSFA 5J1DA 1SI0A 5EYFA 3LSLA 4G4PA 3SEWA 3LR1A 1M5FA 2H4IA 3KOTA 3LSXA 3RPWA 5FHOA 2F6GA 2X7QA 4H5GA 4H65A 5EHSA 5FHNA 1O7TA 1B46A 1IUDA 3RGYA 2DS9A 1QULA 4WEPA 5I56B 1XVXA 4UACA 4LATA 4KYSA 4ZEFA 2QMWA 1OIBA 4YKPA 1DPEA 3C33A 3OO7A 5CMBA 4ONYA 1LFHA 3K6VA 3TQLA 3KFMA 5M2VA 4YKKA 4F3GA 1OQHA 1YCJA 3K2DA 3OO8A 2Y7WA 2DOJA 3EHSA 1A40A 4U1OA 4EUOA 2W7YA 2NOOA 4ZEIA 3QIMA 4GFRA 3HHFA 4KPTA 4LONB 2YPNA 4IO2A 1N0TA 5HPQA 4JXIA 3C34A 3IB0A 2DVZA 3IB2A 5A5XA 2HQ0A 4X1BA 4QFNA 3VLUA 4DXUA 3K1PA 2ZYKA 4ZS9A 2XXPA 1MM6A 3HCQA 1SYHA 5B70A 3QAXA 4QF9A 1FTKA 3W9WA 1WVJA 3R26A 3RT6B 3TCFA 4ELPA 4XKRA 2XXVA 2FYIA 4QSEA 1QUKA 2HEUA 3N26A 3O66A 1S7YA 3LUYA 2V3UA 3O6GA 1B5IA 2QS2A 3FD3A 4F18A 2B3FA 2VHAA 2OWTA 5CBSA 3OEKA 3VV5A 2NUVA 4QRZA 3FVNA 1MM7A 3U93A 2ONRA 3KBRA 1XT8A 3MJNA 1MXYA 5EHMA 1T0KA 2Z22A 3TTKA 1B9JA 2X7PA 2X26A 1BKAA 4EF2A 2Q9TA 5H8HB 3SKPA 2ZNTA 5TU0A 4EQ7A 4IY6A 1P1QA 4IO7A 4R6KA 2PT2A 2I0BA 3N94A 4XXUA 2Q89A 5TPAA 4AQ4A 4LUBA 1SD3A 1EU8A 2REJA 3SETA 4ZE9A 1R9QA 5I56A 4U22A 2A5SA 3SEUA 4NF6A 4OESA 2V25A 1AOVA 1D9VA 2OK2A 1IEJA 1POTA 4C0RA 4TLLB 1XHYA 1NNKA 1JVYA 1BLFA 4G68B 4FJPA 1AIVA 5H8NA 2RC8A 3H6WA 5I2KA 3SERA 2D21A 2P1SA 4FORA 2B65A 3RLFE 5CRYA 5L8DA 3TDJA 2GFEA 1SW1A 4YMBA 3GXAA 4NMYA 3FJ7A 3QSLA 1N3XA 3N5LA 4DZ1A 2A5TB 1FTLA 3T93B 1M5CA 3ZKKA 2PX1A 2O7UA 1O63A 1EZOA 1MH3A 3ECRA 3EQ1A 2LAOA 2QPQA 4OERA 5HBCA 3BKIB 4FATA 4ESWA 5AA2B 5ITPA 2ZYOA 5H8QB 4GLIA 4RXLA 4P0IA 2H9BA 4KHZE 1URGA 3FUZA 4HCWA 4GWOA 1B4HA 4N13A 5F7VA 5AA1A 2XX9A 4U1ZA 4LZ5A 4NTLA 2UVIA 3PUVE 3TZAA 1N76A 3UP9A 2RC9A 3JZJA 1B5HA 4GXSB 3MW0A 4I1DA 1MS7A 4ZDMA 2XXWA 2AIXA 4H1XA 5ICTA 2I3WA 4NE4A 3VE1B 4ISUA 4PETA 5F1QA 4ZEKA 1GV8A 1LLSA 4GVOA 3CSBA 1P1OA 4RK9A 2Q2AA 2HAUA 2THIA 3KOSA 3EF7A 1PB9A 1OVBA 3T96B 4F3PA 2M8CA 3C32A 2I4BA 4F31B 1ZJLA 4FEDA 1MY0A 1D3KA 2I49A 3K0VA 3FV2A 1QJMA 4GD5A 4R9FA 4OFLA 1XOCA 5IKBA 1LCFA 3RTFB 3MP6A 2V3QA 5HM4B 3H4ZA 2XXUA 4YB5A 3MWBA 1ZU0A 4C1UA 4XTCQ 3OMBA 4FAJA 3VLVA 1N3WA 3CSGA 4IO4A 1PDAA 1GVCA 2I3VA 1JW1A 3OEMA 4YICA 4G68A 1PBPA 5CI5A 4RNSA 3MC2A 3OSRA 1MH4A 1AH5A 2YJPA 3HN0A 3FJGA 1B3EA 2QS1A 1TWYA 2F7CA 3IOTA 4LQ2A 4IGRA 3FXRA 4KCDA 1JW5A 3UK4A 2WKYA 2DE4A 4ZZAA 1F9BA 1N04A 4R2BA 3G3JA 1SVXB 5AA2A 4WEDA 4ND9A 5H8QA 3U8QA 4F2OA 3TUSA 4PFYA 3RN8A 5CC2A 5TP9B 1M5DA 1SW2A 3A3UA 3D4CA 2GHBA 1EZPA 4H0WA 4XKNA 4QSCA 1LFIA 3KJ7A 3MZBA 4ELOA 5I59A 4OHNA 2RCBA 2QS4A 2UYFA 2XXRA 1B4ZA 2UXAA 2DWAA 1VSOA 4R73A 3ZSFA 2VD3A 4OEUA 5AE4A 4YAHX 1MXWA 4N6PA 3C31A 4RY1A 2HFBA 1L5TA 1PB8A 1HSJA 2F35A 5DVJA 2F7AA 3K00A 1P1NA 2D5WA 4KI0E 3L6HA 1VFDA 3TYHA 1Q35A 4LZ8A 3TODA 4R6YA 1PBQA 3GBBA 4YMAA 2KLFA 3RUMA 2XX7A 3G3HA 3V5AA 1B40A 3LSFB 2ZXTA 3K6UA 1FTOA 3TKDA 3O6HA 3ILUB 2VGQA 3N6TA 4YB6A 4R6HA 4BDQA 2UVJA 1MXZA 4QFOA 4P0GA 4HS7A 3E3KA 3TCGA 2PBWA 5DVFA 1QUJA 1YPNA 1B3LA 3O97A 3VFJA 1B7ZA 1FQEA 4Q30B 2DXYA 3H3GA 3R6UA 3IO4A 3PD8A 4H6DA 3FASA 1QUIA 4G8MA 4R2FA 2BJJX 2ONKE 3S2VA 1URDA 2ZYNA 2B3BA 2XXTA 5KCJA 1BTJA 4OVJA 3C4MA 4NF8A 3VDFA 4LQ5A 4QHQA 1NFTA 3K1MA 2RINA 1BIYA 1JEVA 1LFGA 3S9EA 1PB7A 1IIWA 3DP4A 1UQWA 3FGSA 3R7XA 3LSWA 2HAVA 4G77A 2R6GE 1URSA 2OBGA 1A7LA 3KZGA 1USYH 4NWDA 2O1LA 1TFDA 3LBSA 3K02A 4R72A 4U23A 1XC1A 1FTMA 1B3HA 4JSDA 2I48A 2I0CA 4X48A 4N07A 2F8DA 1MG1A 3AXFA 4DCYA 2DE3A 4PQJA 1JW4A 1B3FA 3MZ9A 1ELJA 5AA4B 1NNFA 3B6QA 5AA3A 3W9VA 1D4NA 2REGA 4Q5TA 1II5A 3FATA 3ONMA 3KG2A 1ANFA 5DVIA 5LOMA 4RPNA 2Y7IA 1H3DA 1OLCA 3FVOA 3H6UA 1KWHA 2PYYA 3EHUA 4M4GA 1Y3PA 4GXAA 1B1XA 4LZ7A 3THIA 3EPEA 4R9GA 3OSQA 4O3CA 1ZLQA 1Y1MA 1A8EA 1MQIA 5I57B 4DDDA 1AMFA 1QKAA 1POY1 1I69A 4OXVA 3IO6A 3KJTA 3FXQA 2I58A 1JEUA 3MP1A 2O6AA 1US5A 2GHAA 3M3KA 4YZZA 2Q8JA 2YLNA 3IORA 4JDFA 4R74A 4OYVA 5I58B 3U92A 3E13X 3U72A 4AB5A 1LCTA 4UA8A 5CBRA 2ONSA 2PT1A 4E0XA 3GLBA 1SBPA 4JWYA 3PUXE 1IXHA 2QMXA 1US4A 5BWJA 1TFAA 1B58A 5H8FB 2PMSA 4NEDA 3G3IA 2HXWA 2ABHA 4PE5B 3IJOB 1YTVA 2F34A 1MXXA 3DP8A 1QKBA 3CIJA 3S9NC 2H25A 4RA1A 3MAMA 3PMXA 1Z7ME 1GTKA 1PC3A 1IITA 2XD3A 3C35A 1UTBB 4F2QA 2DYXA 4KYDA 2Y7RA 2DE2A 4QSDA 3TCHA 4YB7A 4OFOA 3Q29A 1SDXA 1HSEA 2R9JA 1EH3A 3RQTA 3TTMA 1Y3NA 3FVGA 1MRPA 3MP8A 4OTEA 3PMWA 2XX8A 4OWDA 3G3FA 3S9LC 1SI1A 3PPRA 3SEYA 1CB6A 1N7XA 3Q26A 3U1OA 2E0SA 5ICQA 2F97A 3JV9A 1B7HA 5AA4A 5DEXB 2O1MA 5I84A 3HPIA 4MLQA 3G3KA 1H44A 2RC7A 3T9HB 1ATGA 5H8HA 3D4GA 1FQAA 4F19A 1LAXA 3M8UA 1S50A 1ZTYA 2FA7A 2F36A 4QFPA 3O29A 1QVSA 2O51A 1R1NA 3RY3A 4DXBA 3QUFA 3PPPA 3GZGA 1GGGA 4QFKA 3OXNA 5JEIA 1NNPA 4GF8A 1S9TA 3BBRA 1Y1ZA 4Q0CA 2XXHA 1IXIA 3T22A 3C36A 2G29A 4H5FA 4BDLA 3ILTB 3HV1A 3EN3A 2ZYMA 3EHTA 4FE8A 4Z7EA 3TPAA 4XKQA 4PFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IOWA 1BK4A 3IX1A 4O8MA 1BP5A 3KN8A 3QK6A 1B5JA 3DELB 1MPCA 2Y84A 3KBZA 2V4CA 4PAIA 2A5TA 2ZMBA 4OENA 4H8JA 4TQUQ 3V83A 4LA9A 2F5XA 2FVZA 4MFIA 1I6BA 5H8FA 2IA4A 3CFXA 1MY2A 3IOVA 3K6XA 3LUZA 4IO6A 4JBZA 1WDNA 2H5YA 1B3GA 1ZMGA 3CFLA 3PGFA 2V84A 1UTHB 4QBAA 3TTRA 3TTNA 1B6HA 2GRVA 5L9MA 4AS4A 1FQFA 1M5BA 3UGWA 1H45A 2CEXA 4JVDA 4H67A 4P1LA 1MY3A 1TXFA 3JYRA 3O2AA 3FZVA 4YU0A 3TAJA 3W15C 2PVUA 1R9LA 2I4CA 4POXA 4ZECA 4MBPA 3USDA 2WX9A 1VR5A 1MXVA 3VVDA 4F29A 2QSXA 1XS5A 4OVQA 3F11A 1FTJA 3OO9A 4MH5A 4O3AA 3MPLA 2ESNA 2Z8DA 3T9VA 4EF1A 1GR2A 4I62A 3SESA 1OLAA 3CG1A 2OJTA 3FXBA 4U2RA 4OMBA 2FHYA 3L6GA 3E9XA 1FQBA 2DWHA 4N8YA 4IB2A 4BDNA 1SPIA 3O28A 3KGCA 1WODA 2GQ1A 1FRPA 4PF6A 5FHMA 1H76A 5CMCA 4IY5A 4P11A 4THIA 1LAGE 2O84X 4JSOA 2Z8FA 1P1UA 4H45A 2VP1A 3M3LA 3PD9A 5FTIA 5K2YA 1LBVA 2NXOA 5EQ9A 5JK4A 2VOZA 4F3SA 4X04A 4Z0IA 1B51A 4WKMA 4OEVA 4GBVA 4OA4A 2Y5LA 3U65A 4U4XA 4F39A 3ZKLA 3KEIA 1H43A 4YKJA 3V89B 1NH7A 5IZ1A 5TPAB 2ZZWA 1DTGA 3MQ9A 3T66A 4NN3A 2HHMA 5DYHA 4KR5A 1FTAA 2AL4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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