4GVOA

Putative l-cystine abc transporter from listeria monocytogenes
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
VQTITVGTGTQFPNVCFLDENGKLTGYDVELVKEIDKRLPGYKFKFKTMDFSNLLVSLGAGKVDIVAHQMEKSKEREKKFLFNDVAYNNFPLQLTVLDSNNSINSTKDLAGKRVITSATSNGALVLKKINEEQGNNFEIAYEGQGSNDTANQLKTGRADATISTPFAVDFQNKTSAIKEKVVGDVLSNAKVYFMLGKDETKLSKKVDEALQSIIDDGTLKKLSEKWLGADYSKEQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Lmo2349 protein
publication title Putative L-Cystine ABC transporter from Listeria monocytogenes
rcsb
source organism Listeria monocytogenes
total genus 85
structure length 236
sequence length 236
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gvoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gvoA01
1URDA 3PMXA 1QKBA 5K2XA 3IAZA 3MW0A 4RYAA 2ZYMA 3ZSFA 4DXCA 4YKPA 4EF1A 1XVYA 2HFBA 3E4RA 3IB2A 4R2BA 3C4MA 3UORA 3LUYA 2A5TA 5DEXB 2PMSA 2H5YA 1L5TA 3HHGA 2NXOA 4YMBA 5J1DA 3KSJA 5FTIA 3ODBA 1B5HA 2PT2A 1B3FA 2REGA 3OEMA 1NKXA 3N94A 3DM0A 1Y4CA 1B3EA 3PU5A 3K02A 4BDQA 4OVJA 4I62A 1LSTA 2CZLA 4LATA 4RPOA 3MPKA 1DPEA 2I3WA 1HSLA 3V8XB 3MBPA 4F2QA 5CMBA 1P1NA 1P99A 5M2VA 2O51A 4DXUA 4EQ9A 1D9VA 4H8IA 1B1HA 1M5CA 1O63A 3L6HA 4QSDA 3OO8A 1M5EA 3Q28A 5L9SA 2G93A 4OMBA 5DEXA 1MQDA 2ONKE 3KZGA 2Z23A 1PDAA 1S7YA 2H9BA 1B0HA 2DYXA 1EZOA 1MY4A 3WAFA 5HPQA 5H8FA 4YU0A 3B6QA 3U1OA 1Y4TA 1LB9A 3MC2A 1JEVA 1MPCA 1NMUA 2I4CA 1FTMA 2WKYA 2Y7PA 1I6QA 1BP5A 1NNFA 1LCFA 1US4A 1R6ZA 5CI5A 3RY3A 4DLDA 4L17A 5CMKA 1IUDA 4U22A 5A5XB 4RY1A 5TPAB 3FV2A 2Y7IA 5ELVA 3OSRA 4OWDA 4RNSA 1PB7A 5L9OA 4JSOA 3MP6A 3H4ZA 3K6VA 1QUJA 4ZEKA 4IO3A 1UTHA 3I5OA 3C32A 2DXYA 2VD2A 2QS1A 1A8EA 3SKPA 3VXCA 4NF5B 2D3IA 2F6GA 1AL3A 4NTLA 1Y3QA 2VGQA 1DTZA 1NNTA 1J1NA 1R9QA 3FXQA 5DVIA 5LOMA 1ZU0A 3G3KA 4LP2B 5I58A 3CIJA 1NH7A 5K2YA 3Q26A 1A55A 2Q89A 4O3AA 3R7XA 4RJZA 1AIVA 1FTOA 4OEVA 4QFLA 3K1NA 3ZKLA 3OEKA 1PBQA 4IY6A 1F9BA 1NNKA 4F1YA 1MDP1 3U72A 5I56A 3W9WA 4NWCA 1B7HA 4P0GA 4F3BA 4ZE8A 3OXNA 4LONB 1BLFA 2ZNSA 4NF5A 2GHAA 4QF9A 3DP6A 2O1LA 5FHMA 1WDNA 5ISUA 2V25A 4FE8A 1B5JA 3VXBA 1CE2A 3C35A 2V3TA 3T66A 4G2ZA 4IO7A 5AA2B 4YAHX 4IO5A 3QK6A 2QPQA 3T9HB 3O6HA 1H44A 5H8HA 4U1OA 4I9DA 3TDJA 4AB5A 1FW0A 1LCTA 2PBWA 4LZ5A 3JZJA 3EN3A 4PFTA 3MQ9A 2XXPA 1LAGE 3E3KA 3KSXA 1XVXA 1OVBA 2ONRA 1SYHA 4OESA 1O7TA 1BKAA 4BDLA 1QW0A 1ZLQA 1FTJA 1HSEA 3HHFA 3G3JA 3B7DA 2YPNA 3K4UA 4GWOA 3P7IA 1A99A 4R9FA 4U4SA 1VFDA 4G68B 2UVHA 1A8FA 5AA2A 1AOVA 2RC8A 4MF3A 4F22A 2UXAA 5KDTB 2O84X 5EHMA 2UYFA 2OWTA 1II5A 4POXA 1SW2A 3KJTA 5KZTA 3PPQA 1LGBC 3PPNA 2XXVA 1H76A 4NF4B 3QXMA 3VVEA 1SW5A 1SVXB 4Q0CA 2ZYKA 2DOJA 1OLCA 4C0RA 4I1DA 1OVTA 1GV8A 2F78A 3ECRA 1LFHA 4KI0E 2KLFA 1US5A 4MH5A 3OENA 2O69A 3IOVA 4LUBA 4F3PA 3FXUA 2AYSA 2P0SA 1JW1A 4QFPA 1EU8A 2HQ0A 4LQ5A 1LAXA 1UTBA 3FJ7A 5B7DA 1H3DA 4ELOA 4BDMA 4N6PA 1QVSA 2UYEA 1FTKA 3I3VA 1NFTA 2DQVA 4ELRA 2IEEA 3FVNA 3PD8A 4QSEA 3K6UA 5JTYB 4G8HA 2F36A 1R9LA 2I0BA 5FHOA 1VR5A 1S50A 1TFDA 4F19A 1IQ7A 4OFOA 4H65A 3TPAA 3CR9A 1RYOA 1MQGA 1TWYA 1R1NA 4LQ2A 4JWYA 3FVKA 3O6IA 3S9MC 1A54A 1DTGA 3PUWE 2DVCA 2R71A 3THIA 3N6UA 3RTFB 3GLBA 1D3KA 2CMOA 3KG2A 5DVFA 2ABHA 3BKIB 4IO6A 1B46A 3KN7A 3PPRA 1WVJA 3SERA 4FEBA 4EQ7A 3LSWA 4F3GA 5JTYA 3OO6A 1IEJA 1SD3A 2XX8A 5CMCA 3VE1B 4EQBA 1B3HA 4LZ7A 4PE5B 1HSJA 5I2KA 4QFKA 2ONSA 2DWHA 1P1UA 3LC8A 4R6KA 3UN6A 4U4XA 4KYEA 2DWJA 3TYHA 3FASA 3TUSA 4F2OA 3MUQA 5I57B 3IB1A 2F7AA 2RC9A 3IJOB 2V3QA 5TP9B 3T96B 3TFLA 1XHYA 5I2NB 3C36A 2LAOA 2NUVA 2DP8A 4Q8RA 3DP4A 2F34A 1IITA 4JSDA 1Y9UA 4HCYA 4X1BA 4DCXA 3V89B 4OENA 1MPDA 2GRVA 2I6EA 4AQ4A 3MZ9A 4FJPA 4LZ8A 4TOZA 3O9PA 3CG1A 2XXQA 4X1DA 4XXUA 4KD5A 1VSOA 2P2AA 4R6HA 5ICQA 3VV5A 1NNPA 5I57A 4PQJA 4ZECA 1MXUA 4DE8A 4IO4A 1RKMA 1MM6A 1AH5A 1N84A 1JNFA 1H43A 5TP9A 5AA3A 3K0VA 3K6WA 3GBAA 5I2NA 3KN3A 5TU0A 1KWHA 1B0LA 3K2DA 3EHSA 4M4GA 1N0TA 1XC1A 2QMXA 3H3GA 1I6AA 5L8DA 1FTLA 1DSNA 1LLSA 1OQGA 3QAXA 2XXXA 1QULA 2HCAA 2Q8JA 2Y7KA 3SETA 1MH3A 3RTWB 1ATGA 4POWA 4YB5A 4IB2A 3KBRA 2Y7WA 3S2VA 4BDOA 1IZ1A 4G8MA 4U23A 4KYDA 5DT6A 2OCUA 3U8QA 1MXVA 4RPNA 1EZPA 2I4BA 2YJPA 3H03A 4AB6A 1D9YA 1QUIA 4PFWA 1LBCA 3UP9A 5DVJA 1YPNA 1B1XA 4GL8A 1JVYA 3U92A 4WEPA 2DE2A 4DZ1A 1N04A 1B51A 1DOTA 1ZBMA 1NH8A 2NWJA 1B7ZA 4F29A 1YAEA 3O29A 1N3XA 4Z0IA 1OMPA 4R74A 2I0CA 3TAJA 5KCJB 4O3BA 4F1VA 2F8DA 4LA9A 3UIFA 1SI0A 2B3FA 3OMBA 1PEBA 2VP1A 3LBSA 2O7IA 4JXIA 2PT1A 3SEUA 3PGFA 3OD7A 3PD9A 3TCGA 1A7LA 2ZYNA 2F5XA 3TKDA 4ZEBA 2XX7A 3T93B 3G3IA 3PPOA 1IXGA 1TXFA 4E0XA 5A5XA 5TPAA 3HCQA 2Z8DA 3IL1B 3LR1A 5CBSA 1PBPA 1YCJA 5BUUA 5H8QB 2H99A 1WODA 2H4IA 1B3GA 3EPEA 2ZMBA 3JV9A 2V93A 1XOCA 2DWAA 2PVUA 4NEDA 3TODA 4H5FA 3TCFA 4KHZE 1NL5A 2YLNA 4I8CA 1B52A 3KFMA 1GR2A 5F1QA 4ZEDA 1ZIUA 1PB9A 4GF8A 5FTHA 1MS7A 3MJNA 1DPPA 3SEVA 4KFQA 2AL4A 3HO7A 4H1XA 1XT8A 2O68A 2RCBA 2M8CA 3MWBA 3U94A 2X26A 2Y84A 3RPWA 2OK2A 1M5BA 3T9UA 3UA8A 3HN0A 4FIMA 4DDDA 1H45A 1B58A 4H0WA 1B32A 2HZKA 5H8NB 3I6VA 5CBRA 2UVIA 1OIBA 2GFEA 2Z8EA 3TZAA 4OTEA 5DYHA 5JK4A 4FECA 4H5GA 4NMYA 3CSBA 4HTGA 4NF6B 3FXRA 1MXYA 4N13A 1BIYA 2PX1A 4OFJA 3GBBA 3G7WA 3Q29A 4QSCA 1TFAA 4F31B 2UVJA 5ITOA 4QFOA 2FYIA 2QL3A 1FQEA 1B5IA 5IAIA 4FAJA 2V84A 1POY1 1FQDA 4E0WA 3MVZA 3IOTA 4ZDMA 4YKKA 2Y7RA 4F18A 4KQPA 3U93A 1LB8A 3TEPA 4NF8B 4OYVA 1PB8A 5H8NA 3O28A 3OO9A 3ZS6A 1IXCA 3TTKA 2ALUA 1MRPA 3IK6B 3VLWA 1URSA 4ELPA 4G68A 4WXJA 3A3CA 5BWJA 3PPPA 1Y3PA 3H6WA 3VLUA 2HAVA 3LSFB 5AA4B 3MZ1A 4NE4A 4R2FA 3RUMA 5KDTA 1B05A 4GL0A 1BTJA 1IXIA 3O66A 3BFUA 2GH9A 2VOZA 3W9VA 4GRKA 2F7BA 3SEYA 1EH3A 2R6GE 3PMWA 3FVOA 3QUFA 3H7MA 2OLBA 4GXAA 4NF4A 4Q30B 3DP8A 3H6UA 3CFZA 3EF7A 1JW5A 2UVGA 4NF8A 4UA8A 4C1UA 3RN8A 3M3LA 1MXWA 3WAEA 3OO7A 2F97A 4QRZA 3VLVA 3G3FA 2XD3A 2A5SA 2HZLA 3KOSA 4XKRA 1MDQA 5AA4A 3MP8A 3PMVA 1IIWA 1QKAA 2XXWA 1MY0A 1P1WA 4EXKA 4KCCA 2I48A 1JQFA 4THIA 1SI1A 2O7UA 3K00A 4R9GA 1MG1A 1SYIA 5AA2D 3FJGA 3IORA 4BDNA 3V5AA 4R73A 4U2RA 3QUJA 3CFXA 2QMWA 3HPIA 4YB6A 5FHNA 2XXHA 4O3CA 5EYFA 2NOOA 3MAMA 4IGTA 2R9JA 2OJTA 3C33A 3FVGA 3T22A 4H67A 2A5TB 1ZJLA 2O6AA 3MVYA 1FCKA 1JW4A 4C1TA 4XTCQ 3OELA 4YZZA 3TCHA 4UACA 4KCDA 2NVUB 2B3BA 4IGRA 3VDFA 3OSQA 4ESWA 1UIUA 3FATA 4OFLA 2I58A 4NWDA 4JB7A 1B7UA 4BDRA 1Y1MA 3GZGA 1QUKA 3S9LC 3RQTA 2DXRA 1ZMGA 3O97A 3H6VA 4F3SA 2Q9TA 2ZYOA 3QYTA 3VFJA 2DE3A 4MLQA 1GVCA 2QSXA 4YB7A 2HAUA 5H8SA 2DSFA 3PUYE 2XXUA 1LFIA 3QSLA 3ILTB 4R6YA 3FIRA 4U21A 4X48A 2G29A 3BBRA 1O64A 4GOTA 2E0SA 2F6PA 5CC2A 5ITPA 2ZNTA 4GLIA 4X9TA 2RCAA 3TQWA 2QS3A 4P11A 1YTVA 5CMMA 5L9MA 4MLVA 3G3GA 1SBPA 1VE4A 4ZS9A 5H8FB 1SQYA 4QFNA 3FGSA 4FEDA 1S9TA 2OZZA 4JWOA 3RGYA 2XXIA 2I3VA 1MXXA 1SW1A 2E1SA 2Q2AA 2X7PA 3Q27A 3CRBA 3TTMA 4GFRA 1TT1A 3M3FA 2ZXTA 4M1VA 4TLMB 3N6TA 3TTRA 3HV1A 3V83A 4OXVA 4R72A 4EDPA 3OOAA 4OZ9A 4RXLA 4ZE9A 1UTHB 3B6TA 3HSTA 4JWXA 3L6GA 3JYRA 1MQHA 4G4PA 3PV0E 4OEUA 1FQAA 5DTBA 5HBCA 1ELJA 4F1UA 4XKPA 3TTNA 1N3WA 1B40A 3MPLA 3AXFA 4KYSA 1MPBA 1IXHA 2DS9A 5I58B 3DELB 2GHBA 2XXTA 3SEXA 1FQCA 4MBPA 3CI8A 3BFTA 1P1QA 4KR5A 1Z7ME 4G68C 3EQ1A 1M5DA 4ZZEA 3IO6A 4OHNA 3FZVA 3E13X 3R26A 1N7WA 3S9EA 2P1SA 1OLAA 4FATA 4YMAA 3CFLA 3K6XA 5CRYA 1EZ9A 1Y20A 3T9VA 3B6WA 4YKJA 4ELQA 5I56B 2ZNUA 1CB6A 2ANJA 3LSXA 3CSGA 4HCWA 4HW8A 1QJMA 2BJJX 4K3FA 4TQUQ 2XX9A 3KOTA 1T0KA 4PP0A 3N26A 4ZEIA 5IKBA 3KJ7A 4IY5A 1UQWA 2ESNA 4ND9A 3C31A 4GXSB 1D4NA 2OBGA 2VHAA 4GQOA 3DLNA 4Z7EA 3UK4A 1N7XA 2W7YA 1PC3A 3O2AA 3UGWA 2DE4A 1B4ZA 3H06B 5H8HB 3GXAA 1ZTYA 5KCJA 3FJMA 4PFYA 1VFEA 1POTA 3K1MA 4FORA 2RF1A 1Q35A 2Q88A 1DMBA 4G77A 1N76A 1URGA 3A3UA 1AMFA 3PUVE 3QIMA 1JVXA 4BLAA 4ECFA 3PUZE 3USDA 3MP1A 2D5WA 5HM4B 4DCYA 4PFUA 4EF2A 4JDFA 3FD3A 5JEIA 2XXRA 3IO4A 5AE4A 5H8QA 4RK9A 4H8JA 4XKQA 1USYE 4QHQA 1Y1ZA 3KEIA 3TQLA 3VVDA 1M5FA 5I59B 1Y3NA 3SEWA 2D21A 1MH4A 5AA1A 4H6DA 3CG3A 4IO2A 4R75A 3FUZA 3RLFE 3MVWA 2DVZA 1B6HA 1I69A 3M3KA 4GIZA 4ESXA 5B70A 2RC7A 1A40A 4G8NA 4OERA 2XD2A 1FQBA 1MY1A 1LFGA 1MQJA 2HEUA 4ZEFA 3C34A 1GGGA 1LAFE 4XKNA 3IX1A 1ANFA 1Z7NE 2V3UA 4OETA 3N5LA 1UTBB 3KN8A 4GD5A 4PETA 5ICTA 4DXBA 5I59A 4P0IA 1B9JA 3IB0A 3TTLA 3TELA 3IOUA 3ONMA 4ISUA 1UIVA 3W15C 4GVOA 4ONYA 2Z8FA 5I84A 3RT6B 4NF6A 3K01A 3PUXE 4LVQA 2RKMA 3IR1A 3EHUA 3C9HA 3D4GA 3D4CA 4HS7A 2F7CA 3M8UA 2FA7A 2QJEA 3Q25A 1OQHA 2QS4A 1Q1KA 3FV1A 3EHTA 2VD3A 3ILUB 1I6BA 2X7QA 3T9XB 3MZBA 2F35A 3H6TA 2O1MA 1JETA 3S9NC 4Q5TA 2H98A 2PYYA 4MFIA 1MY2A 3CVGA 4TLLB 2B65A 2OWSA 4DIGA 3S4UA 3SESA 1LAHE 2XXYA 3G3HA 3KGCA 3K1PA 3ZKKA 3TMGA 1FQFA 1MM7A 1B4HA 1MY3A 4KPTA 2AIXA 2RINA 2XHDA 5CM6A 1SW4A 3RT8A 4YICA 5I2KB 2H25A 4F39A 2THIA 2IA4A 1MXZA 1GTKA 3O6GA 1MQIA 3VVFA 1B3LA 4EUOA 2HXWA 3SDFA 3RNNA 2REJA 1P1OA 4ZZAA 1LBBA 3E9XA 3LSLA 4RA1A 3R6UA 5EHSA 3F11A 1B2HA 4WKMA 4YKIA 2QS2A 2QRYA 4JBZA 1JEUA 4N07A 4WEDA 1SDXA 2AL5A 2Q2CA 4OQOA 2DWIA 1XS5A 3MVXA 1USYH 1ZKBA 2I49A 2FNCA 1RYXA 2Z22A 3IJXB 4RK2A 4U1ZA 5F7VA 4EXLA 3A09A 3IOWA 4XIGQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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