4GVOA

Putative l-cystine abc transporter from listeria monocytogenes
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
VQTITVGTGTQFPNVCFLDENGKLTGYDVELVKEIDKRLPGYKFKFKTMDFSNLLVSLGAGKVDIVAHQMEKSKEREKKFLFNDVAYNNFPLQLTVLDSNNSINSTKDLAGKRVITSATSNGALVLKKINEEQGNNFEIAYEGQGSNDTANQLKTGRADATISTPFAVDFQNKTSAIKEKVVGDVLSNAKVYFMLGKDETKLSKKVDEALQSIIDDGTLKKLSEKWLGADYSKEQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Putative L-Cystine ABC transporter from Listeria monocytogenes
rcsb
source organism Listeria monocytogenes
molecule tags Transport protein
molecule keywords Lmo2349 protein
total genus 85
structure length 236
sequence length 236
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gvoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gvoA01
1NNFA 1B52A 1IUDA 1QUJA 4OEUA 4JSOA 1BLFA 3CRBA 1FQDA 3K2DA 1POY1 2YJPA 1A54A 3KFMA 2DE2A 5K2XA 1LB9A 3GLBA 1M5CA 3VVEA 1WVJA 1H45A 1Y4CA 3VE1B 4ZZEA 1UQWA 2RC9A 3RUMA 2OK2A 2NWJA 2HXWA 5IKBA 2X26A 3DP6A 3N5LA 3RLFE 1FTOA 2RCBA 4OFJA 3DELB 3U1OA 2X7QA 2HEUA 4TQUQ 3PMWA 1DSNA 2UVJA 4QFPA 3IOWA 3KN8A 1FQEA 2GRVA 4JWXA 1FQFA 2ESNA 1A40A 3E9XA 1SDXA 3O97A 4DCXA 4EQ9A 1B9JA 4EQ7A 5B70A 2AL4A 2DWIA 4GL8A 4EQBA 2V3QA 3VFJA 5I58A 3OEKA 3TKDA 3UK4A 1NNKA 3K6WA 3PPRA 4MF3A 4U4XA 1Y3NA 2G93A 4U4SA 3ZSFA 5I57A 2DE3A 4QFOA 4KCCA 2GH9A 2Q9TA 1O64A 2UYEA 2PMSA 3B6WA 3LBSA 1M5FA 1SW5A 3IL1B 4POXA 4PFTA 4R2BA 4U1OA 3USDA 4DCYA 4C0RA 1PDAA 3CFXA 1JVXA 1A99A 3R6UA 3EHSA 4JXIA 3N94A 4P11A 1PBQA 3O66A 4G77A 3WAFA 4I1DA 2QJEA 3IJXB 1MRPA 3DP4A 3QUJA 3C9HA 4JBZA 5L9MA 4KR5A 5LOMA 2REJA 1GTKA 2QPQA 3O6IA 2R6GE 3PPQA 3FJGA 4OFLA 3QXMA 1SW2A 2PBWA 3FJ7A 1DMBA 4NEDA 4R72A 2VD2A 1N7XA 2E1SA 4X48A 4QSDA 3U92A 3A3CA 3IB1A 1Z7NE 2OBGA 4XTCQ 2XXYA 3K02A 3ONMA 4EXKA 5CC2A 1PBPA 1MG1A 1UTBB 3MWBA 3H6WA 4WEDA 2DWJA 1N76A 1NH8A 4FEBA 3W9VA 3SERA 3H3GA 3QYTA 4IO6A 1QUKA 4GLIA 2I49A 1FTMA 4I9DA 1PEBA 2I0CA 3GZGA 4M4GA 3RTWB 1P99A 5CMBA 1RKMA 4IO7A 1I6BA 3TTKA 2XXIA 4NF4B 4LP2B 3ZKLA 5I2KB 5ICQA 1MM6A 1AH5A 5CM6A 4RK9A 4DIGA 3MPLA 3U72A 4YICA 3CG1A 1US4A 4BDNA 3FATA 1WDNA 3IORA 5I56B 5CI5A 5IAIA 1B5IA 3QIMA 5EYFA 1NMUA 1UTHB 3BFUA 4F19A 4F2OA 1B4HA 1B3EA 2I0BA 1LAGE 2VGQA 1LGBC 2F7BA 1UTHA 3VXCA 1IZ1A 1JETA 2F8DA 4XIGQ 5ITOA 4R6HA 3K1PA 4KD5A 4OYVA 5BWJA 4F1UA 4KYDA 3PUXE 1MY4A 1ZTYA 3Q28A 1MQGA 1H3DA 1ZU0A 1IIWA 1LLSA 5I57B 2DOJA 5AE4A 3C34A 1VE4A 3ZS6A 3TAJA 1MQHA 1MPDA 4EUOA 2D5WA 1LFIA 1MDQA 4MLQA 1B1XA 4O3BA 5A5XA 1FQCA 1D4NA 1ZIUA 3L6HA 3MC2A 2DXYA 4YKIA 2QMXA 1NL5A 4OWDA 1SW1A 2O6AA 4GVOA 2QL3A 4MBPA 2I4BA 2NUVA 4QSEA 2UVGA 4H1XA 2F5XA 4KI0E 4NWCA 5AA1A 3H6UA 1EZ9A 1CB6A 3CSBA 3K6VA 3MZ9A 4LA9A 3SEUA 4GRKA 5FTHA 1I6AA 4KQPA 3V8XB 3VDFA 1D3KA 3BFTA 2DP8A 2HQ0A 3CSGA 5DT6A 3TDJA 3ZKKA 3R7XA 3T93B 1VFDA 3PMVA 3RN8A 4ZDMA 3TTRA 4BDMA 3CI8A 1SQYA 2REGA 3P7IA 1JQFA 4R73A 4DXBA 2HAVA 5DVJA 1QULA 1LCTA 1HSJA 4R74A 1MY1A 2OJTA 3KN3A 1OLCA 1IITA 4JDFA 5EHSA 2Q8JA 2DWHA 2O51A 3IX1A 2H98A 5CMMA 2Y7KA 4LZ8A 2P0SA 3E3KA 4GWOA 3HSTA 3W15C 4NF8B 4G8MA 3MJNA 4OHNA 5L8DA 1ZBMA 5A5XB 2XXQA 4FORA 2ONRA 4NF8A 1PB9A 2F34A 2V84A 3SESA 4G68C 3PV0E 3O29A 4RNSA 1A7LA 3FD3A 2F78A 3FUZA 4FAJA 1QUIA 4FEDA 4KFQA 4RXLA 4OQOA 4R6YA 1L5TA 4KCDA 3LSFB 2P1SA 4IO2A 3M3FA 2QMWA 1B3FA 3W9WA 3S4UA 1Y3QA 2YPNA 3MP6A 1QVSA 4IY5A 3S9MC 4FATA 3PPPA 3N6UA 4FECA 3A3UA 4IGRA 3PPNA 1FTLA 1TXFA 3G3GA 4QHQA 5KDTA 3K01A 1B6HA 2DE4A 2PT2A 3HPIA 1MXUA 4N6PA 4OXVA 1J1NA 1QJMA 3UGWA 1FQAA 3KSJA 3MVXA 4PFUA 2XD3A 3G3HA 4NF4A 1DOTA 4YB6A 3VLWA 1NH7A 1YAEA 3MVZA 2YLNA 3LR1A 2RC7A 5DVIA 3THIA 5I56A 3TODA 4RJZA 1OLAA 3IR1A 1USYH 3T9VA 1LAXA 4NWDA 5I2NA 5KCJA 3UORA 3TEPA 3HHFA 4F3PA 2IA4A 1MXXA 3EHTA 3K1MA 3N6TA 3PPOA 4OEVA 3CR9A 4OTEA 1II5A 3TCHA 2V3TA 3IOTA 5EHMA 2Y84A 3M3KA 3KGCA 3TTMA 3TMGA 1LB8A 1N04A 1POTA 1AL3A 2HFBA 2NVUB 2V25A 2BJJX 4ZEKA 3TTLA 3ILUB 1AOVA 2PYYA 4OERA 2E0SA 4I62A 4G2ZA 4H5GA 3Q25A 2O68A 4RY1A 5H8QA 4BDQA 1AIVA 3FIRA 4QF9A 2F6PA 3UA8A 3VV5A 4F22A 4KHZE 2OLBA 3FVGA 3V83A 1S9TA 5ISUA 3LSLA 3CG3A 4ISUA 4N13A 1LFGA 1N0TA 1LBBA 1D9YA 2FNCA 3U93A 3K4UA 3QK6A 4QFLA 4KYEA 4QFKA 1T0KA 3OXNA 5AA3A 2D3IA 2DYXA 3JV9A 3H06B 4OETA 5TP9B 4GF8A 3T9XB 4DXCA 4PFWA 2UVIA 5TP9A 2V93A 1JEUA 1GR2A 1MQIA 4DDDA 3C4MA 3SEYA 4F3SA 3VLVA 3OSRA 3E13X 3CIJA 2F36A 4G8HA 1XT8A 4HS7A 2H9BA 3PU5A 4TLLB 1SYHA 4R75A 5TU0A 3FVNA 3MZBA 5CRYA 4BDRA 5JK4A 3RT8A 1LAHE 1ATGA 4POWA 3V5AA 4R9FA 3RY3A 1B7ZA 1P1UA 1SD3A 2O7IA 3FVOA 2O84X 2PT1A 1PB8A 1P1NA 4LQ2A 5ITPA 4PETA 2XX8A 1Z7ME 2GFEA 1NNPA 3O2AA 3IB2A 5FHNA 4E0WA 1XC1A 5FHOA 2ZMBA 2XX9A 3B7DA 3M3LA 1OQGA 2DXRA 3K1NA 4PFYA 4YZZA 4GL0A 4AB6A 4C1UA 1PB7A 1USYE 2QS1A 4IY6A 4F1VA 3TZAA 5CMKA 4F2QA 3C35A 4WKMA 3MVWA 4K3FA 4XKNA 4YB7A 3VLUA 4KPTA 3N26A 4LZ5A 3GBAA 1IXGA 1N3XA 4M1VA 4ONYA 2F97A 2QS4A 4QFNA 5AA2A 3Q29A 5J1DA 1NNTA 1OIBA 1IEJA 2OWTA 4Q30B 3HN0A 1OVBA 1DPEA 1MY0A 1Y1ZA 3GXAA 3IOUA 3IO6A 4H65A 1R1NA 2OZZA 1VSOA 2ZNTA 3PMXA 2ONSA 2ZYKA 2RKMA 2VD3A 3FVKA 4IGTA 2ALUA 2I6EA 1DPPA 3K0VA 1US5A 1N3WA 3C31A 2XXXA 3IOVA 1KWHA 3UIFA 1B3LA 5ICTA 3OELA 2O1LA 4JWOA 4PQJA 1MDP1 4QSCA 4YU0A 3PD8A 3KG2A 3ODBA 3S9LC 1B5JA 2UYFA 4ZEDA 4OFOA 4NF5B 3VXBA 4ELRA 5KCJB 3JYRA 3KEIA 3D4CA 3TQWA 2H25A 4G4PA 1JNFA 2XD2A 2XXRA 3LUYA 3QUFA 3AXFA 4IB2A 2Q89A 4R2FA 4U23A 2F7AA 3EF7A 3TTNA 2HZLA 4H5FA 4RK2A 2XXTA 4XKPA 4N07A 3RTFB 1XVXA 3V89B 3G3JA 2ZYMA 4OVJA 5CMCA 3T9HB 3WAEA 1MPCA 4F3BA 4Q0CA 1B32A 2XHDA 3KOTA 5B7DA 4ND9A 3E4RA 2H5YA 2ONKE 1FTKA 3K6XA 4WXJA 3RNNA 2DWAA 3KJTA 3SEXA 1A55A 1MPBA 1TT1A 1XVYA 5H8HB 3SDFA 3RT6B 1MXWA 4GXSB 5H8FB 3RQTA 5JEIA 4DZ1A 3K00A 3MZ1A 4OENA 4UA8A 2I3WA 5I2NB 1LFHA 2DQVA 1URSA 3KZGA 3OO9A 1SI1A 4NE4A 4YKJA 2HZKA 2QS2A 4NF6A 4MH5A 4U2RA 5H8SA 1P1QA 1SW4A 1XOCA 4LATA 4LONB 4ECFA 5CBRA 3IJOB 3OMBA 3S2VA 1SVXB 2W7YA 2Y7RA 3H6VA 3EN3A 4IO4A 3H6TA 3H7MA 2R9JA 3HO7A 4HTGA 4LVQA 3FV2A 2Z8FA 3TPAA 3GBBA 1HSEA 1R9LA 3O28A 4PP0A 3UP9A 5AA4B 1QKAA 2Z8DA 3IAZA 1MH3A 1JW4A 2OCUA 3TCGA 1HSLA 2I4CA 2F35A 2QRYA 1DTZA 1ZJLA 1B4ZA 5FTIA 3OO6A 4FE8A 1LCFA 2WKYA 3FXUA 4JB7A 4XKQA 3HV1A 1SYIA 4F39A 5BUUA 4F18A 1B3HA 4U22A 1FCKA 4NTLA 5AA2D 2H4IA 4HCYA 1YTVA 4E0XA 3T9UA 1B46A 1S50A 2D21A 2FA7A 1WODA 3IB0A 3MUQA 3G3FA 4LUBA 5H8HA 5F1QA 3CFLA 2ZNSA 1TFAA 4ZZAA 4ELOA 5H8FA 4ZEBA 1F9BA 1B0LA 2ZYOA 3F11A 3H03A 2I48A 3OENA 2ZYNA 4H8JA 1DTGA 3IO4A 4NF6B 4U21A 3QSLA 4I8CA 3T96B 1Y4TA 1EH3A 4KYSA 5TPAA 3HHGA 4GOTA 3DLNA 1ANFA 3FASA 1O63A 3T66A 3U8QA 1I6QA 1PC3A 2VHAA 3LC8A 3M8UA 4XXUA 4U1ZA 4X9TA 3FXQA 4X1DA 3VVDA 4EDPA 1M5DA 4GQOA 1EU8A 2XXPA 3HCQA 3C36A 3FXRA 3O9PA 5I59A 4G8NA 2HAUA 5DEXA 2Q2AA 2Y7PA 5M2VA 4C1TA 4Q5TA 4H6DA 4EF1A 5L9OA 3C32A 2Z8EA 1XHYA 3RPWA 1MXVA 5HPQA 3SEWA 4ZE8A 2PVUA 3RGYA 1UTBA 5HM4B 3TCFA 3D4GA 2DVCA 3G3KA 5I2KA 2OWSA 3OSQA 1BTJA 3R26A 3VVFA 2FYIA 3OO7A 1VFEA 3TELA 2I58A 2Q2CA 2O7UA 3C33A 1MS7A 3B6TA 1IQ7A 4HW8A 3LSWA 3TUSA 2NOOA 4P0GA 5HBCA 3CVGA 4FJPA 4GIZA 4GXAA 2Z22A 5FHMA 3SKPA 4QRZA 5AA4A 1S7YA 2QSXA 1Q1KA 1GGGA 2ABHA 3A09A 2B65A 4RA1A 2GHAA 4F1YA 4LZ7A 3PGFA 4THIA 2CMOA 1FW0A 2GHBA 2NXOA 5I84A 4AQ4A 1P1OA 4ZECA 4BLAA 4WEPA 4ZE9A 3MP8A 4F29A 2RCAA 1GVCA 1JW1A 1MQJA 1P1WA 3FGSA 4ZEIA 1MH4A 5DVFA 1OVTA 3EQ1A 4YB5A 2UVHA 4BDOA 4MFIA 3KOSA 1ELJA 1QKBA 4Z0IA 4DE8A 3PUWE 4JSDA 1B58A 1Y9UA 4EXLA 5DEXB 3I5OA 1Y20A 1Y3PA 2O1MA 5H8QB 1IXIA 1IXCA 3FZVA 4TOZA 4ZS9A 4YKKA 4AB5A 5CBSA 1QW0A 2R71A 5TPAB 1RYXA 1GV8A 3SETA 3KBRA 4DLDA 1ZMGA 3EHUA 3PUZE 4LQ5A 4F31B 1YPNA 3MBPA 3Q27A 1UIVA 2P2AA 4Z7EA 3TYHA 4IO5A 2UXAA 1R6ZA 3OD7A 2IEEA 1OMPA 2VOZA 3MW0A 1TFDA 1B2HA 5I58B 1B05A 2XXWA 4H0WA 2M8CA 3L6GA 1B5HA 1N84A 4O3AA 3ECRA 4YKPA 3H4ZA 4BDLA 1JVYA 4NMYA 3T22A 4ESWA 2DS9A 1M5EA 4PE5B 4Q8RA 2XXHA 2A5TA 1VR5A 2ZNUA 1MXYA 1M5BA 3OEMA 1IXHA 3PUVE 3FJMA 1FQBA 2F6GA 3KSXA 4RPNA 1B7HA 4F3GA 2H99A 1URDA 5JTYA 3DM0A 3MPKA 1BIYA 1JEVA 4EF2A 3BKIB 4P0IA 5DTBA 1MY2A 2V3UA 1NKXA 1I69A 1SBPA 2RC8A 1MXZA 1FTJA 3QAXA 4RPOA 3S9NC 1EZOA 2HCAA 2AYSA 3KJ7A 4YMAA 4R9GA 5I59B 4OMBA 2LAOA 1MM7A 5K2YA 4IO3A 4L17A 1BKAA 3BBRA 4ZEFA 4DXUA 3TQLA 3DP8A 1EZPA 1SI0A 2XXVA 1TWYA 5AA2B 1B1HA 4XKRA 4GD5A 1O7TA 4FIMA 2VP1A 4TLMB 1NFTA 3S9EA 2QS3A 2AIXA 2B3FA 1CE2A 2Z23A 4H8IA 2Y7WA 1LSTA 5L9SA 3O6HA 1ZLQA 2CZLA 5KDTB 2THIA 2B3BA 1D9VA 1R9QA 3B6QA 4H67A 4OZ9A 3I3VA 2O69A 4ELPA 2A5SA 4MLVA 3SEVA 3MAMA 3G7WA 2ZXTA 5ELVA 1H76A 3IK6B 5DYHA 1B3GA 1BP5A 5F7VA 4ELQA 3K6UA 2XX7A 1N7WA 1Q35A 1RYOA 1LBCA 3G3IA 1H43A 3KN7A 4JWYA 4NF5A 5H8NA 2PX1A 1ZKBA 2RINA 3FV1A 3ILTB 1XS5A 5H8NB 5JTYB 2A5TB 1B40A 1LAFE 3I6VA 2DSFA 2ANJA 3MQ9A 4HCWA 1B7UA 2F7CA 4UACA 3MP1A 3OOAA 3OO8A 3PUYE 3Q26A 4G68B 4ESXA 5KZTA 1UIUA 1OQHA 4YMBA 1B51A 3UN6A 2RF1A 1JW5A 3CFZA 4G68A 2Q88A 2DVZA 3JZJA 3LSXA 4GFRA 4YAHX 1A8EA 1AMFA 4O3CA 2KLFA 1B0HA 4R6KA 3MVYA 3PD9A 4X1BA 3TFLA 2X7PA 3EPEA 1MY3A 2XXUA 4RYAA 1URGA 1Y1MA 1A8FA 4OESA 2Y7IA 3U94A 2AL5A 2I3VA 3O6GA 1H44A 1YCJA 2G29A 1MQDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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