4LONB

Crystal structure of monomeric sulphate free form of ligand binding domain of cysb,an lttr from salmonella typhimurium lt2
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
EHTWPDKGSLYIATTHTQARYALPGVIKGFIERYPRVSLHMHQGSPTQIAEAVSKGNADFAIATEALHLYDDLVMLPCYHWNRSIVVTPDHPLAATSSVTIEALAQYPLVTYTFGFTGRSELDTAFNRAGLTPRIVFTATDADVIKTYVRLGLGVGVIASMAVDPLADPDLVRIDAHDIFSHSTTKIGFRRSTFLRSYMYDFIQRFAPHLTRDVVDTAVALRSNEEIEAMFQDIKLPEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of monomeric sulphate free form of ligand binding domain of CysB,an LTTR from Salmonella typhimurium LT2
rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator CysB
molecule tags Gene regulation
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 68
structure length 239
sequence length 239
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lonB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lonB02
2F34A 5TP9B 3HO7A 5CBRA 4NE4A 5I84A 1QUJA 4YAHX 2I3VA 1B3HA 3KN7A 1H44A 1LB9A 3CR9A 2DWAA 3H03A 1Y3PA 1SW4A 5F7VA 3TODA 4NEDA 3UK4A 2ZNSA 2DVCA 3N5LA 3W9VA 3S9LC 1FQDA 3C32A 4IO6A 1B58A 1P1NA 3C31A 4JWYA 1JVYA 1M5BA 2DXRA 1MPBA 4R2BA 1B3EA 3TPAA 4OYVA 4DZ1A 4NF4A 1N04A 1IQ7A 2OK2A 3K6WA 1FTMA 4MFIA 3L6HA 3O29A 3FUZA 5AA2D 3O6IA 4LATA 4X1DA 1EZOA 5H8QB 4IGRA 4F3PA 1P1WA 2V93A 1USYH 5IAIA 4HW8A 3A09A 5HM4B 4DXBA 3ZSFA 2Z23A 5CMBA 3F11A 1A7LA 1ZTYA 2RCBA 1POY1 3FVGA 3FATA 5I57A 4RA1A 3OO6A 4JDFA 4IO3A 1QVSA 3CI8A 3CVGA 3CG3A 3HV1A 4OWDA 4BDNA 5DT6A 3PGFA 2UVJA 3H6TA 1IZ1A 3FASA 4MLVA 4LZ5A 3K0VA 3PPNA 4P0GA 4OQOA 5ITOA 1VE4A 3R7XA 4H67A 4MBPA 4R74A 5DVIA 4ZDMA 4GRKA 4RYAA 5AA4A 3OO9A 2BJJX 3FJMA 2Q89A 1DSNA 1B0HA 2Y7RA 4ZS9A 2OWTA 2DS9A 3MAMA 1B9JA 2V25A 5TP9A 3SKPA 1MQJA 3KOTA 4U22A 4MLQA 2F36A 3FJ7A 1MXYA 1UTHB 2F35A 5HPQA 1MPCA 3K6VA 3K4UA 1FTOA 4JWOA 1NKXA 2GRVA 2I6EA 3TAJA 1D4NA 4OHNA 4WEDA 1A8FA 2F6PA 3M8UA 4NMYA 3QUFA 3IJOB 4OEUA 5KDTA 3KOSA 3IOVA 4JXIA 1LFGA 5I56B 3ODBA 1JNFA 3IOUA 1N3WA 4GFRA 4GL8A 1YTVA 4U21A 4FORA 2DE4A 4OFOA 4RNSA 3TQWA 2O1LA 3OXNA 4OMBA 1Y20A 3SEUA 1MM6A 1LBCA 2ESNA 3QK6A 1J1NA 3KEIA 2XXTA 3KBRA 1LCFA 1B2HA 3B7DA 3RPWA 1MQHA 3FXQA 4OTEA 4PFYA 2DWIA 3CFLA 4ELQA 2IA4A 4KR5A 4G8MA 1Y1ZA 4POWA 2XX7A 2O7UA 3ILTB 2R71A 3C34A 1PDAA 3IOTA 1AL3A 4XXUA 4YICA 4BDRA 2NOOA 4BLAA 5KCJA 1NNKA 2PT1A 3JZJA 5JTYA 4MH5A 4OXVA 4F3GA 2LAOA 5ICTA 3G3JA 1NNTA 4H8JA 2H98A 5K2XA 2O7IA 3V83A 3MZBA 4ELRA 4JSDA 3VVFA 1B4ZA 2F78A 5J1DA 1JQFA 4RJZA 2OLBA 2XXQA 3B6WA 4I1DA 4H0WA 4WKMA 3DM0A 3TZAA 4ZEFA 4FATA 4PQJA 3IK6B 5FTHA 1B3LA 1SYIA 5CM6A 3O66A 2V84A 1GTKA 1M5CA 4U1ZA 4HCYA 4F29A 1PB9A 1F9BA 3EHSA 3CSGA 2XX8A 4LUBA 2ZMBA 1VR5A 1SBPA 1MQDA 2P1SA 4H1XA 4LVQA 4JSOA 1P99A 2NWJA 4E0WA 4G2ZA 4BDOA 1QULA 4HTGA 5TPAA 2QPQA 2Y7KA 1O63A 2R6GE 3E4RA 1II5A 3OMBA 5H8FA 2QMXA 4DXCA 3RTWB 1UTHA 5KZTA 1AMFA 3G3HA 2RF1A 3TDJA 4NF4B 3O2AA 4OFLA 3DP8A 2QJEA 4NTLA 4ZEIA 1MDQA 3D4GA 3EPEA 3GZGA 1UQWA 1FTKA 3VE1B 3VFJA 4EQBA 2V3QA 1IXGA 1D9YA 3M3LA 2DSFA 4PE5B 1LAHE 2Z8EA 4QSCA 3JYRA 4C0RA 4FAJA 2M8CA 1OIBA 4Q30B 4ZZEA 2ZNUA 3SDFA 2VHAA 4XKNA 3SEWA 3ZKKA 5CMCA 4JB7A 2I4CA 2DQVA 1RKMA 4U23A 1DOTA 5CBSA 3QYTA 3VVDA 5EHMA 1XOCA 2VP1A 3TUSA 5I57B 4OFJA 4NF8A 5B70A 3O6HA 3PUXE 3TKDA 1B46A 2I49A 4QF9A 1DTGA 4TLLB 4LQ2A 5BUUA 1B0LA 1NFTA 3CIJA 3BFUA 3AXFA 1T0KA 3K2DA 3MPKA 1IEJA 3KGCA 4NF6A 1O64A 2X26A 1LFIA 1S7YA 3TTMA 2O1MA 1GVCA 2ZYKA 4H8IA 1FQEA 3I5OA 4ELOA 3GBAA 5AA4B 1BIYA 1SQYA 3QIMA 2UVHA 4G77A 3A3CA 4PETA 3K1NA 4Q8RA 2ZXTA 3PPRA 1H43A 2Q88A 2E0SA 1Y4TA 2A5TB 1ZBMA 2G93A 1Q1KA 3LUYA 3T93B 1NNFA 5DVFA 1YCJA 4O3BA 1WDNA 1XT8A 5I58A 1QKBA 3PUYE 3H4ZA 4ESWA 3Q28A 1WODA 1URSA 2DWJA 2Y7PA 3OOAA 2Y7IA 4X9TA 2QS3A 3FJGA 3PMXA 5DVJA 5L9MA 1FQAA 4RXLA 1DPPA 2H9BA 3T22A 4MF3A 2UVGA 3TQLA 1B5HA 5M2VA 1B3FA 4I62A 5KDTB 1NH7A 2H4IA 4HS7A 3I3VA 5ISUA 1MY1A 4L17A 3QSLA 4R9FA 1US5A 4JWXA 2PX1A 3T9HB 5EYFA 1WVJA 4Z7EA 4LONB 3N6UA 1A54A 1R1NA 3PMWA 2NVUB 3IJXB 2ZYOA 1H3DA 4KCCA 2F7CA 3MBPA 3W9WA 2PBWA 4G8HA 3MUQA 5ITPA 1N84A 2PYYA 1O7TA 4WEPA 1OLAA 1URDA 4YZZA 3PD9A 2ANJA 4ZE9A 2OWSA 3FGSA 1Y1MA 4QSDA 2VOZA 1B5JA 4GXAA 4EF1A 1PBPA 2VGQA 1AH5A 3RN8A 1GGGA 5KCJB 1P1OA 5JTYB 3JV9A 4QRZA 3B6TA 4M4GA 2P2AA 1MG1A 3LBSA 3K02A 1OVTA 3KG2A 1YAEA 2I0BA 1QW0A 5CMKA 4YB6A 3G3KA 4ONYA 2HZKA 3OO7A 1FQFA 1Y9UA 2H99A 3LSLA 2QS1A 5CI5A 3QXMA 3KJ7A 4PFWA 4GL0A 1JEUA 3TELA 1B51A 3DELB 3MZ9A 2REGA 1R9LA 2QMWA 2GHBA 1A8EA 5ELVA 1GR2A 2Z8DA 1D9VA 4OVJA 1ZU0A 4U4XA 1ATGA 3VLVA 4WXJA 3FD3A 3K1MA 4EQ7A 2A5TA 2OJTA 4N13A 3FVNA 2A5SA 3M3KA 4IO4A 4HCWA 2OZZA 4H5GA 5TPAB 3BKIB 5H8FB 4EDPA 1CE2A 4Q0CA 1LAXA 1XHYA 2QS2A 1EH3A 3VV5A 5CC2A 4QFNA 3RT6B 2FYIA 4YB5A 3RUMA 3E13X 2GH9A 1IXHA 5AA3A 4R2FA 2PT2A 4F22A 5L8DA 4FIMA 4KHZE 2FNCA 3TTLA 2PMSA 1LAFE 2XXRA 5JK4A 3S4UA 3IOWA 2DWHA 4IO7A 5ICQA 2XXHA 1FQCA 4NF5A 1OMPA 1PB7A 3PMVA 1LSTA 1LBBA 2OBGA 4BDQA 4ZECA 4Q5TA 1SW5A 1A55A 1TWYA 1B7ZA 4PFUA 4I8CA 1BP5A 2RINA 2DOJA 2Q2CA 2H25A 1OVBA 4THIA 1POTA 3T9UA 2YJPA 4DCYA 2H5YA 2XXIA 4NF8B 1VFEA 1RYXA 2XXUA 1HSLA 3H7MA 3G3IA 5DYHA 2XD2A 3GXAA 4ISUA 3PV0E 3PUWE 4R6YA 3ILUB 4ZE8A 2XD3A 4NF6B 2CMOA 1H45A 4OENA 5FTIA 2HZLA 1IXIA 1B6HA 1UTBA 3PPQA 3C35A 4EUOA 3UP9A 3Q29A 1LLSA 1ZMGA 3FXRA 2HCAA 1MXUA 1URGA 3TMGA 2VD2A 4AB6A 1SYHA 1JW4A 2RC7A 3U1OA 3O9PA 1USYE 2X7QA 3IORA 2ABHA 3FVOA 4QFOA 3ZS6A 1VSOA 1NH8A 3IAZA 4XTCQ 4U1OA 1OQGA 4F1UA 4G68B 4TOZA 3M3FA 5FHMA 4P11A 3V5AA 1DTZA 1EU8A 4ZEDA 3SERA 4OEVA 3QUJA 4KI0E 4TQUQ 3T9XB 3HHFA 3R26A 5I58B 4I9DA 1XS5A 4IO5A 2B3BA 3FVKA 3G7WA 5H8HA 3Q26A 1N3XA 4ZZAA 4DE8A 1SI1A 2UYEA 4RPOA 2ZYNA 1PC3A 2THIA 3HHGA 3I6VA 3LR1A 2GHAA 2RC8A 3IO6A 1S9TA 1XVXA 2PVUA 5L9SA 3N26A 3VDFA 5I2KA 1B40A 1DPEA 4YKIA 4OZ9A 4F31B 4EF2A 2DE3A 4LZ7A 1H76A 3OENA 1Y4CA 3EHTA 2HEUA 5IKBA 3C4MA 4KYEA 4QHQA 4IO2A 4RY1A 3N94A 1MQIA 1ZLQA 4F3SA 3C36A 3RQTA 4KPTA 3ONMA 3U8QA 3KFMA 1B32A 1M5FA 2HAVA 2F97A 4R9GA 2XXYA 3PUVE 2G29A 1I6AA 4OESA 1MPDA 3OSRA 2B65A 3U94A 1VFDA 1IUDA 1B52A 3E3KA 3SESA 5I59A 5H8SA 2I3WA 3H6VA 1A40A 4IB2A 1TT1A 4PP0A 3O97A 2YLNA 3FV1A 3CFXA 3K6XA 2D3IA 1PB8A 3FIRA 1I69A 3FXUA 4KQPA 3CSBA 3LSFB 4FEDA 3MW0A 4YMAA 4OETA 3VXBA 3MP1A 2D5WA 4FJPA 4DLDA 3HPIA 3H6WA 5JEIA 2QSXA 4U4SA 1PEBA 2DVZA 3USDA 1MH3A 2F5XA 3OEKA 1MQGA 1GV8A 4M1VA 2F6GA 1L5TA 2F7BA 3MVXA 4KYDA 2RKMA 1SD3A 1B3GA 1ANFA 4Z0IA 1MDP1 4EXLA 3S9NC 3C33A 4G68A 1N76A 2VD3A 4YKKA 5AA1A 4JBZA 4FE8A 3SEYA 1SDXA 3MJNA 3EQ1A 4BDLA 1LAGE 1R9QA 1SW2A 2V3TA 3RLFE 4ZEBA 1FCKA 2XXWA 2ALUA 3DLNA 4LZ8A 3EN3A 5TU0A 5FHNA 3BBRA 4ZEKA 1MH4A 4IY6A 4GF8A 3Q27A 1N7XA 4LA9A 4ELPA 4ECFA 4NWCA 2AIXA 4NF5B 1EZ9A 4F1YA 3ECRA 1IIWA 4XIGQ 4QSEA 2CZLA 2P0SA 5I2NA 5DTBA 1MY3A 1TXFA 2ZYMA 3KSXA 4C1TA 3UA8A 1QUIA 3UIFA 3OSQA 1BKAA 1Q35A 4F18A 3CG1A 3MVYA 1QKAA 3OELA 3PPPA 4DDDA 3TTKA 4N6PA 4LQ5A 2I48A 4F1VA 4YKPA 4O3AA 3S2VA 1NL5A 3DP4A 5H8NA 4R73A 3IB0A 3G3FA 5AA2A 4UACA 1UTBB 2DE2A 2R9JA 3MC2A 3K1PA 3U93A 1MXVA 3S9MC 1MXZA 2W7YA 1KWHA 2XXPA 1RYOA 3OO8A 3PU5A 5LOMA 2XX9A 2ONRA 3RY3A 2Y84A 4GLIA 5AE4A 3H6UA 3V8XB 4F19A 5A5XA 3H3GA 3V89B 5CRYA 4ND9A 4QFPA 1B7UA 4GIZA 2XHDA 1FTJA 1Z7NE 1AOVA 2UVIA 4XKRA 2I0CA 5H8HB 2D21A 3RGYA 2AL5A 3HSTA 4P0IA 3TTRA 3L6GA 3KSJA 1LB8A 3G3GA 2O6AA 2RC9A 1FW0A 4KCDA 2HFBA 4GXSB 3MPLA 3RT8A 4GQOA 3HN0A 3MZ1A 2HAUA 1FQBA 2E1SA 3IL1B 3MVWA 2UYFA 3UGWA 1ELJA 2REJA 5I2KB 4KD5A 1DMBA 4RK2A 2FA7A 3KN3A 1IITA 1LFHA 4AB5A 1M5EA 1MXXA 3RTFB 4NWDA 4F39A 3EHUA 4X48A 4YB7A 4FEBA 3TYHA 2QS4A 3IX1A 2V3UA 1Y3NA 1B4HA 2NUVA 4TLMB 4E0XA 3PD8A 1N0TA 2I4BA 5DEXB 4C1UA 4ESXA 2ONKE 1MY2A 3H06B 3O6GA 5HBCA 2WKYA 1LGBC 2F7AA 4RK9A 4QFLA 4DCXA 2Q9TA 2QRYA 1CB6A 1ZJLA 1SI0A 2Z8FA 3MQ9A 1JVXA 3KJTA 4EQ9A 1MS7A 1N7WA 1NNPA 2AL4A 1MY0A 1OQHA 5I59B 1UIVA 4KYSA 4F3BA 3IO4A 3PUZE 3THIA 2NXOA 3UORA 2QL3A 3MP8A 3R6UA 3SEVA 3VVEA 4G8NA 3KN8A 2O68A 3Q25A 3WAEA 4GWOA 3S9EA 5H8QA 1SW1A 4DIGA 3IB1A 3E9XA 2DXYA 4R6HA 3OD7A 4O3CA 2AYSA 4YKJA 2Z22A 3MP6A 5B7DA 1HSEA 3N6TA 3GBBA 4LP2B 4POXA 3SETA 2HQ0A 3GLBA 2UXAA 2ONSA 3U72A 3IR1A 1IXCA 3VXCA 2F8DA 1LCTA 1JW5A 2YPNA 3FZVA 4FECA 4KFQA 3MWBA 1PBQA 2KLFA 3A3UA 2O51A 3SEXA 2ZNTA 3LSXA 2O69A 3MVZA 1B05A 3W15C 2DYXA 3WAFA 4EXKA 3LSWA 1AIVA 5FHOA 2I58A 1HSJA 4F2OA 3K6UA 3EF7A 4IGTA 1S50A 3PPOA 1P1UA 1OLCA 3TCHA 1I6QA 3K01A 1Z7ME 4AQ4A 4UA8A 2HXWA 5I2NB 1ZKBA 1JEVA 5K2YA 2DP8A 4GOTA 1QUKA 1SVXB 1MM7A 1ZIUA 3T9VA 1I6BA 1TFDA 3T96B 2GFEA 4G4PA 4PFTA 1MRPA 4XKPA 3BFTA 3C9HA 4F2QA 3VLUA 5DEXA 4R72A 3HCQA 4GD5A 2B3FA 3IB2A 4G68C 1EZPA 5CMMA 3CRBA 5F1QA 4N07A 1JW1A 2IEEA 4YU0A 5BWJA 4GVOA 4R75A 4RPNA 4H6DA 5I56A 5H8NB 2O84X 2OCUA 1MY4A 3B6QA 5AA2B 3T66A 4R6KA 1Y3QA 4YMBA 4IY5A 3ZKLA 3FV2A 1JETA 3D4CA 3U92A 1MXWA 1NMUA 1R6ZA 2Q8JA 4OERA 1UIUA 2XXVA 1A99A 3TEPA 1TFAA 3QAXA 1BTJA 1B7HA 1US4A 1B1HA 2Y7WA 3DP6A 1M5DA 3KZGA 3OEMA 3TCGA 5A5XB 4BDMA 1FTLA 1D3KA 3TFLA 1QJMA 2Q2AA 1P1QA 4XKQA 4H5FA 3P7IA 3CFZA 4U2RA 4K3FA 1B5IA 4DXUA 3VLWA 2XXXA 1XC1A 1YPNA 4X1BA 4H65A 3TTNA 1B1XA 4QFKA 5L9OA 5EHSA 1XVYA 3O28A 3K00A 2RCAA 3LC8A 3UN6A 1BLFA 2X7PA 3RNNA 3TCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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