4LONB

Crystal structure of monomeric sulphate free form of ligand binding domain of cysb,an lttr from salmonella typhimurium lt2
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
b'EHTWPDKGSLYIATTHTQARYALPGVIKGFIERYPRVSLHMHQGSPTQIAEAVSKGNADFAIATEALHLYDDLVMLPCYHWNRSIVVTPDHPLAATSSVTIEALAQYPLVTYTFGFTGRSELDTAFNRAGLTPRIVFTATDADVIKTYVRLGLGVGVIASMAVDPLADPDLVRIDAHDIFSHSTTKIGFRRSTFLRSYMYDFIQRFAPHLTRDVVDTAVALRSNEEIEAMFQDIKLPEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of monomeric sulphate free form of ligand binding domain of CysB,an LTTR from Salmonella typhimurium LT2
rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator CysB
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Gene regulation
total genus 68
structure length 239
sequence length 239
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lonB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lonB02
3FJ7A 3FJGA 5B7DA 3EPEA 4ZZEA 2PYYA 3SERA 1P1NA 3K1PA 4NF6A 3U93A 2UYFA 2P2AA 3CIJA 2DOJA 3TDJA 3OSQA 4OFLA 4NF6B 2ABHA 5L8DA 3JZJA 2AYSA 4GL0A 3TFLA 3KOSA 2LAOA 3TMGA 1SW5A 1HSLA 3RTWB 1A99A 2F7CA 1JW5A 3QIMA 1QUJA 2PBWA 1JW4A 4PFTA 1URGA 3T66A 3GBAA 4PFWA 4C1UA 1BTJA 3IAZA 1ZJLA 1ZKBA 3S4UA 3MPKA 3IO6A 1I6BA 3I6VA 3KOTA 4XKQA 3TCHA 2I6EA 1LCTA 5CBSA 3UN6A 1N76A 1B0HA 1CB6A 2ONKE 4IY6A 4YKJA 4U4SA 3KN7A 4JWOA 1Y1MA 4HCWA 4HS7A 4EDPA 2F8DA 2UVGA 1RYOA 3MW0A 2XXVA 1MY3A 5EHSA 3T22A 3UORA 5H8FA 2V25A 3HO7A 1B1XA 5B70A 4H0WA 4R6HA 5H8FB 2DE4A 2A5TA 3G3IA 3L6HA 4ESWA 2O69A 1PB7A 4POWA 2Q88A 4POXA 5A5XB 2A5TB 4LA9A 5I56B 3KG2A 3HHFA 3MC2A 5HBCA 4F2OA 4ND9A 4FE8A 3IOVA 1IIWA 2DVZA 4N07A 4AB5A 1MXWA 2F5XA 3Q27A 4ZECA 3MVXA 3MQ9A 3Q25A 2IEEA 4R6KA 3VFJA 1GR2A 3VXCA 3SESA 4OVJA 2FA7A 3QSLA 2ONSA 3K6WA 2BJJX 2NUVA 4YAHX 4NMYA 5KDTB 3OO9A 4ESXA 4BDMA 1MM6A 4NEDA 1N7WA 1TT1A 5KCJA 4IO4A 5DTBA 1Y3PA 3E13X 4MH5A 3C32A 1ZU0A 3KFMA 3G3FA 4QRZA 1B1HA 1S9TA 3MZ1A 1N0TA 3UIFA 4ZEBA 4F39A 1Y4TA 3TTNA 1F9BA 5H8HB 2DE3A 2QMWA 1FQCA 1VR5A 1PC3A 4H65A 2HCAA 1URDA 4YKKA 3OELA 2ZYMA 4F29A 4IO5A 1MY2A 4F1UA 4KQPA 3TCFA 4X9TA 1ELJA 2YPNA 3EHUA 3PD8A 3S9LC 4EQ7A 2V3QA 4RY1A 1LB9A 4R9FA 1M5EA 3OOAA 2Y7IA 1EH3A 4OFJA 2DVCA 1JVXA 3KBRA 3U94A 1MXYA 2O84X 2ZNUA 2Z8FA 3H6WA 3K1MA 1O7TA 2DXYA 5DVFA 1IXGA 2H4IA 4Z0IA 3TTLA 3CFLA 1LAFE 3MPLA 1GVCA 3ZS6A 2NWJA 4LQ5A 4F1VA 1SW1A 1H3DA 4KFQA 2XXUA 2DSFA 3KN8A 1BIYA 4PETA 4L17A 3TUSA 3K02A 1FQEA 1US5A 4IB2A 4OZ9A 2X7PA 2HAUA 5M2VA 3FXQA 2RCAA 1BLFA 2Y7RA 3G7WA 2GHBA 3Q29A 4U1ZA 2PT2A 2THIA 5I58A 3PD9A 4IO2A 3FIRA 5KZTA 4DCXA 2H98A 1LB8A 3EHTA 4F3SA 5I58B 4QFNA 1SW4A 3DP4A 2XHDA 5LOMA 4H1XA 4GRKA 3IO4A 4OXVA 3C9HA 3PUVE 1NNTA 1LGBC 2HZLA 4OESA 4JDFA 4OFOA 1MY0A 5F1QA 3S9MC 2CMOA 1P99A 4G68C 1MQJA 3VVEA 4ELOA 2REGA 1JETA 3JYRA 1M5DA 3K6VA 3T9HB 2E1SA 3TODA 4NF4A 3MVWA 3M3KA 4NWCA 1J1NA 1TFDA 3N6TA 3A3CA 4H8JA 4NF4B 5DVJA 2R9JA 3ZKKA 3PUZE 1QUKA 1YCJA 3C36A 1FCKA 4YB6A 3H03A 2O7UA 3SEXA 3H06B 2GHAA 2ZXTA 2PMSA 1PBQA 3C4MA 3HV1A 5K2XA 2HEUA 1MH4A 4GQOA 1B51A 4LATA 3Q28A 3EQ1A 1LAXA 3MVZA 3UP9A 4DZ1A 3K01A 1XOCA 3PPOA 1OLAA 1QKBA 1AMFA 3K0VA 3VV5A 1MDP1 3QK6A 2DWJA 4BDOA 2UVHA 2DWAA 4QFKA 2CZLA 4U22A 2H5YA 1MQDA 2QMXA 5J1DA 3FVNA 2RC8A 5I2NA 1LBCA 3FGSA 5CC2A 4LZ5A 4Q0CA 4I9DA 2OCUA 1IXCA 4Q5TA 4PE5B 3W9WA 1N3XA 4KHZE 4Q8RA 3KGCA 3ECRA 1N7XA 4ZE9A 1LBBA 3IK6B 1B0LA 3MJNA 5I59A 3K1NA 2GRVA 4ECFA 3KEIA 1JNFA 5I59B 2H25A 1H44A 1OVTA 5AA2A 1OVBA 2GH9A 2ZYKA 3TTRA 2FNCA 4XTCQ 3IX1A 2DE2A 2WKYA 3T9UA 4RPOA 1D9VA 1Z7NE 1Y3QA 2UYEA 2VOZA 4QFPA 1MY4A 1QJMA 1PDAA 1I69A 2D3IA 4IY5A 3OO6A 5BWJA 3MZ9A 1DPPA 4I62A 4QFOA 4PFUA 2DP8A 3TQLA 1AOVA 3OO8A 1GV8A 1Q1KA 3V8XB 5ITPA 2XXYA 1FTJA 3IB1A 3DP6A 1URSA 4LUBA 4DIGA 4F18A 3K6XA 5DEXB 3PPNA 2AL5A 2Q89A 4OMBA 2F6GA 4JBZA 5TPAA 3FVKA 3B7DA 1LSTA 4RK9A 5TPAB 1UIUA 4R2FA 4YZZA 4XIGQ 5JEIA 1FTKA 1PB8A 2OK2A 3BBRA 2XD2A 2V93A 3RNNA 4IO3A 2VHAA 2RC9A 3ZSFA 2RKMA 1B4ZA 1L5TA 1R1NA 1O64A 4XKPA 1SI1A 5I2KA 1SI0A 2XXIA 3BFUA 3TAJA 4MLVA 4LVQA 3QUJA 5I2KB 1FTMA 4H5GA 1B5JA 5A5XA 1NL5A 3V89B 1IQ7A 4KD5A 4N13A 4PQJA 2O51A 5I56A 2V3TA 1DPEA 1XC1A 1RYXA 5CMCA 3FXUA 2Z8DA 2ZNTA 2I48A 3T93B 3LSFB 3U8QA 3OENA 3G3JA 3H6UA 3PGFA 5K2YA 3FD3A 3AXFA 2YLNA 2NXOA 1SYIA 2OLBA 5HPQA 5BUUA 1JQFA 4F22A 3MP1A 4DCYA 1OIBA 3HN0A 3SEYA 3DP8A 4ZEFA 4RPNA 4G8MA 4EQ9A 4F3BA 1XVYA 1BKAA 3H7MA 5KDTA 3KN3A 3B6TA 1POY1 2XXWA 3S9NC 3PPQA 3U72A 4U21A 3CFZA 1ZMGA 1EZ9A 5CMKA 1DSNA 4E0WA 3SDFA 4GIZA 3VXBA 3UGWA 3CVGA 2F6PA 5IAIA 4PFYA 3FATA 3L6GA 3N5LA 1Y3NA 4OEUA 4MFIA 4H8IA 4F3GA 3K4UA 3M3LA 2ANJA 3MP8A 2W7YA 2B65A 3PUWE 1SVXB 1B5HA 5CM6A 5TP9A 5H8HA 4QFLA 3FVOA 1ZTYA 4U1OA 4EXLA 1Y9UA 2PVUA 3LUYA 1FW0A 3MVYA 2VP1A 5TP9B 5HM4B 3M3FA 2OZZA 4Z7EA 3FUZA 1ZBMA 3FXRA 1WODA 3DLNA 4HTGA 5L9OA 4OENA 1FQBA 1SQYA 1O63A 4TLMB 1UTHB 2PX1A 4RYAA 4OEVA 4K3FA 5DVIA 2ONRA 1B9JA 5CRYA 1QKAA 1IEJA 5FHOA 3RT8A 1MS7A 1AH5A 2AIXA 4R72A 1POTA 4U2RA 3QUFA 1MRPA 1Y4CA 2QSXA 3G3GA 3SEWA 3KJTA 4DLDA 3LBSA 3PPRA 4KI0E 2HZKA 5ELVA 2DXRA 3OEKA 2XX7A 1ATGA 3ZKLA 4JWXA 1IXIA 4MLQA 3BFTA 5AA3A 5I57A 3WAEA 1A55A 3S2VA 4WKMA 2DWHA 5I57B 4R2BA 3SKPA 5AE4A 3PMXA 1A8FA 2XD3A 2NOOA 4OYVA 1B7ZA 3VVFA 2Q2AA 3GBBA 3MUQA 3E4RA 4G77A 1DMBA 5CMBA 2I58A 4HCYA 1MM7A 1QUIA 4RK2A 4FAJA 4XKNA 1JW1A 2O6AA 4G8NA 3B6QA 5JTYA 1N3WA 4KR5A 4G68A 3RN8A 5JTYB 5FHNA 3SEVA 3SETA 4G68B 3CI8A 3R7XA 3OEMA 3IJXB 3QAXA 1HSJA 3HSTA 4LZ8A 2QS3A 4O3BA 1LFHA 3VVDA 4UACA 1B4HA 3H6VA 3ILUB 4R6YA 4TLLB 2I4BA 2REJA 3F11A 3P7IA 1IITA 1DTGA 3U1OA 4FEBA 2O68A 4WXJA 4N6PA 1R9QA 4FEDA 4X48A 2F36A 3BKIB 1JVYA 2Q2CA 1UTBA 2Z8EA 2UVIA 4DE8A 2IA4A 3TYHA 1MPDA 4QSEA 4KYDA 1IUDA 3IOTA 4ZEDA 4YKIA 4OWDA 5AA2D 1UTBB 3THIA 2QL3A 3RPWA 1MH3A 5H8QA 4JSOA 2NVUB 3MP6A 4ZEIA 2DYXA 3LC8A 2VGQA 1VFEA 1NH7A 1Z7ME 5H8QB 3SEUA 4IO6A 1QULA 1B52A 2I0CA 1OMPA 1AIVA 3HPIA 1XT8A 2F7BA 2O1MA 4BDNA 1LAGE 3FASA 1DTZA 1B5IA 3U92A 3RLFE 1A40A 2DWIA 2QS4A 2G93A 5F7VA 1SYHA 1MXVA 2E0SA 4XKRA 1MXXA 2HAVA 4KPTA 1MXUA 5H8NA 1QVSA 4P0IA 3O6IA 4FECA 3O6HA 3PPPA 1UIVA 1AL3A 2VD3A 5H8NB 4H5FA 1H43A 1M5BA 2ZYOA 2I3WA 4M1VA 3VDFA 4ISUA 3IOUA 2F97A 2XXTA 4FORA 2G29A 2Q9TA 3N6UA 4JB7A 1A8EA 3D4CA 4ZDMA 3CG1A 4GXAA 1MXZA 4XXUA 3O6GA 3EHSA 4YICA 4F3PA 4RXLA 3LSWA 3CSGA 1RKMA 2RCBA 3D4GA 1FQDA 4U4XA 4YMAA 3G3KA 4GXSB 3V5AA 1YPNA 4LQ2A 4ONYA 4BLAA 3S9EA 1B6HA 5DEXA 2XX8A 2I3VA 3MZBA 5ISUA 3C34A 1OQHA 1US4A 4I8CA 3O9PA 1LAHE 3H6TA 4LP2B 1PB9A 5FTHA 1II5A 1MDQA 3DELB 3I5OA 3LR1A 2ZNSA 4OQOA 1CE2A 1R9LA 3IR1A 1T0KA 4GWOA 3TQWA 4ZS9A 2R6GE 1B05A 2O1LA 4UA8A 3JV9A 4EXKA 3W9VA 1MPCA 3MBPA 1P1WA 3G3HA 3RUMA 2QS1A 3C33A 4NE4A 3IORA 4M4GA 4GVOA 4EQBA 2HXWA 2Z23A 1NKXA 1SD3A 3LSLA 2V84A 1NNKA 1OQGA 4G2ZA 1MY1A 1B7HA 4FJPA 3V83A 4IO7A 2F35A 4KCCA 2F7AA 4DXBA 5ICQA 1JEVA 1N84A 1FQAA 1B40A 1VSOA 1KWHA 4YMBA 4O3CA 5CI5A 4PP0A 1LCFA 1XVXA 1YTVA 5EHMA 3I3VA 1GTKA 3VLWA 5AA4A 1B7UA 4YB7A 1B32A 3FJMA 3MWBA 4QSDA 1BP5A 2I0BA 2XXHA 5AA4B 2P1SA 3PU5A 4BDQA 4LONB 3IB0A 2I49A 4NF8A 5ICTA 1M5FA 1VE4A 3C31A 3MAMA 3B6WA 1B3GA 4NF8B 2A5SA 5ITOA 1P1UA 3EF7A 4OHNA 1NNPA 1TXFA 3M8UA 1XHYA 3PUXE 3TZAA 1B3FA 3KSXA 2ZMBA 4QHQA 2RINA 2QJEA 1I6QA 4F19A 4AB6A 1SBPA 4KYEA 3W15C 1DOTA 2F78A 2X7QA 3IJOB 2OWTA 3PUYE 4GL8A 4NF5A 3TTKA 3GXAA 4THIA 1B46A 4G4PA 2I4CA 1NMUA 3CFXA 4NF5B 2OBGA 3H3GA 3OMBA 4P11A 4TOZA 1OLCA 3A09A 4P0GA 3TKDA 4BDLA 2QS2A 4ZZAA 1EU8A 3EN3A 2HQ0A 1MPBA 3CRBA 1P1QA 3CR9A 1B3EA 1B3LA 1MQIA 4KYSA 3Q26A 1MQGA 2UVJA 4C0RA 2RC7A 1MG1A 4YB5A 4GFRA 3K2DA 2ESNA 1H45A 3O28A 1D3KA 1S7YA 4TQUQ 5H8SA 1GGGA 5KCJB 2FYIA 3E3KA 3ILTB 4AQ4A 1EZPA 4YU0A 5TU0A 2D21A 2DQVA 3O66A 2Y84A 4FIMA 1H76A 2R71A 1TFAA 4O3AA 1ANFA 3OXNA 1B3HA 4JSDA 4YKPA 3USDA 4IGTA 1UTHA 1M5CA 3IOWA 3KZGA 4ELPA 4KCDA 2B3BA 1LLSA 3KJ7A 5EYFA 3TPAA 2M8CA 3IL1B 4U23A 3VLUA 3LSXA 3TTMA 3KSJA 1WVJA 3O97A 1FQFA 4IGRA 4OETA 1I6AA 4MBPA 3GZGA 2XXRA 4JXIA 2GFEA 4F31B 4F1YA 4LZ7A 2AL4A 5CMMA 4H6DA 2KLFA 3UK4A 3TEPA 4X1DA 2VD2A 2HFBA 1FTLA 1TWYA 2H99A 1LFGA 3WAFA 3FV1A 3OSRA 2Y7KA 3RY3A 4ZE8A 3CG3A 5FHMA 1PBPA 1IZ1A 2O7IA 1IXHA 4RNSA 1D4NA 1A7LA 4ELQA 3RGYA 2UXAA 3ONMA 3N94A 4C1TA 2DS9A 2PT1A 2H9BA 2D5WA 1A54A 4RA1A 4BDRA 2RF1A 4WEDA 5I84A 1MQHA 1N04A 1XS5A 4NWDA 2QPQA 3C35A 3T9XB 1SDXA 1ZLQA 5FTIA 4GOTA 4H67A 3E9XA 1YAEA 1B2HA 4NTLA 2ALUA 1ZIUA 1UQWA 4GF8A 2XXQA 5L9MA 3A3UA 4WEPA 3T9VA 3GLBA 3OO7A 1D9YA 2OWSA 1HSEA 5DYHA 4ELRA 1FTOA 4EUOA 3H4ZA 3PV0E 4MF3A 1S50A 4DDDA 3HCQA 4FATA 4QF9A 3QXMA 4OTEA 2XX9A 3O29A 4I1DA 5L9SA 2Q8JA 1WDNA 3DM0A 3QYTA 2QRYA 3HHGA 3PMWA 2XXPA 3TELA 4GD5A 3TCGA 1JEUA 1P1OA 4HW8A 4DXCA 3FVGA 4EF1A 1Y20A 3R26A 4R9GA 3IB2A 2YJPA 4OERA 5DT6A 3K6UA 3FV2A 3N26A 1USYH 1NNFA 4QSCA 4E0XA 4F2QA 4G8HA 2X26A 1NH8A 2Y7PA 4X1BA 2Y7WA 1USYE 3UA8A 3VLVA 3ODBA 5JK4A 5AA1A 4Q30B 1LFIA 3RTFB 1Q35A 3O2AA 1VFDA 5I2NB 4R75A 2P0SA 1PEBA 3RQTA 2Z22A 4DXUA 1R6ZA 3K00A 1B58A 3PMVA 3VE1B 4R74A 2XXXA 1NFTA 3CSBA 2B3FA 2OJTA 4ZEKA 1Y1ZA 2F34A 3OD7A 2V3UA 1EZOA 3RT6B 5AA2B 4RJZA 3T96B 5CBRA 2ZYNA 4GLIA 1SW2A 3FZVA 5IKBA 4R73A 4JWYA 1QW0A 3R6UA 4EF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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