4Q30B

Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2 at ph 3.5
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Thermodynamics and mechanism of the interaction of willardiine partial agonists with a glutamate receptor: implications for drug development.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2 CHIMERIC PROTEIN
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q30B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q30B02
5HBCA 1LGBC 3VVEA 3C35A 3S9MC 4EDPA 1P1QA 1EH3A 5FTIA 3G3KA 3S9LC 1NL5A 3KFMA 3SDFA 3U92A 3T93B 1M5FA 3FZVA 5TP9B 5I58A 4KR5A 4TLLB 1POY1 3KN8A 4H5GA 2REGA 3C9HA 1AOVA 3RTFB 3ILUB 3S9EA 2I4BA 5I56B 2HCAA 4G68B 4I8CA 2ESNA 4N13A 4IO6A 1IIWA 1SD3A 2PYYA 4PFTA 3PMVA 1B7UA 5TPAB 1JW1A 3MP1A 3S4UA 2F97A 2RC7A 3PPNA 4ND9A 1DPEA 3TYHA 4TOZA 2UVHA 2G29A 2RINA 5EYFA 2B3FA 4ELRA 4RNSA 5H8SA 3SEYA 2HFBA 1JW4A 3PPPA 1UQWA 3MJNA 3O97A 4EQ7A 2VD3A 3FVGA 4KYSA 3WAEA 4P0GA 3H06B 3MPLA 3FJ7A 4ESWA 4X48A 3O28A 4H0WA 3FUZA 3N94A 2DVZA 3BFTA 3DP8A 3CVGA 3RY3A 1L5TA 2O1LA 1B3EA 1FCKA 4NE4A 4QFOA 5BWJA 1P1WA 4NF6B 5DYHA 1MG1A 1USYE 1MY1A 4U22A 1B52A 2IA4A 3N6UA 3PGFA 2O6AA 4OWDA 3IR1A 4F31B 3H3GA 2F6PA 3RQTA 1TFAA 5M2VA 1OIBA 5ICTA 4ZECA 5CMKA 3Q27A 1MQGA 3CSBA 2D5WA 2DVCA 5H8NA 2DE2A 3CFZA 3GXAA 4IO3A 4YZZA 3CSGA 4JB7A 1KWHA 1N84A 2DP8A 2QSXA 5DEXB 3BBRA 3TTRA 5TU0A 4LUBA 3IL1B 1IXCA 1Y9UA 1VE4A 2XXWA 5H8QB 3SETA 4IO2A 4F2QA 2X7QA 1UTBA 1VFDA 3LC8A 1FTJA 1ATGA 4MBPA 4Z0IA 4FEBA 3U72A 4HW8A 4C0RA 1QULA 2AL4A 4QSCA 3LR1A 2PT1A 1NH7A 1PB9A 3MUQA 1QUKA 3KOSA 1MM6A 4XIGQ 3IJXB 1ZMGA 4WKMA 1HSLA 1QKBA 4F39A 3MVZA 2NWJA 2UVGA 4C1UA 4QHQA 1VR5A 4NF8A 4NF5A 3TDJA 3VLVA 3KN3A 4EF1A 1JQFA 3K1PA 2I3VA 2CZLA 4QFLA 4ZEFA 3TUSA 3C31A 4ZEKA 3EHSA 4FIMA 4OFLA 2NOOA 1B4ZA 2QMWA 3UP9A 1OLCA 3OSRA 2XXVA 2REJA 3SERA 3PD8A 5BUUA 4YB5A 3ZKLA 2V3UA 1NFTA 2DQVA 1MQDA 3GZGA 2KLFA 1MRPA 4PE5B 1Y1ZA 4R75A 2UYFA 3PD9A 1WDNA 1Y3QA 2HAVA 2Z22A 3VE1B 1GV8A 3TTMA 3B6WA 3HPIA 1B3FA 5EHMA 2D3IA 1A7LA 1B6HA 4KQPA 3MBPA 2BJJX 1ZIUA 4ZZEA 2F78A 4NF4A 4OVJA 2ZNUA 1LBBA 2XD3A 2ZYOA 3TODA 3WAFA 4GQOA 5FTHA 1D9VA 4GL0A 1LBCA 5CBSA 3MVXA 1LAFE 2VOZA 3VLUA 3A3UA 2VHAA 3TCFA 2H98A 3IB2A 2HEUA 5JTYB 2G93A 1LLSA 1LCTA 4DXBA 2Y7PA 1LAGE 3PPRA 2Y7IA 1MPBA 2ZXTA 3ILTB 3VV5A 5AA2D 1PB7A 3MVWA 2I3WA 1J1NA 3G3IA 4Q5TA 5KDTA 3TTNA 3VDFA 3PMXA 4ZS9A 2R9JA 1N76A 3VVFA 4K3FA 5I2KB 3UA8A 3VXBA 4ZE8A 5JK4A 3IOVA 3HSTA 5AA1A 2I0CA 4OMBA 2RF1A 4DLDA 2X7PA 3L6GA 2QRYA 5H8FB 3PV0E 4DXUA 5KCJB 4QFKA 1IXGA 5L9SA 1FQCA 3OMBA 3HCQA 3N26A 1QUJA 3CR9A 4AB5A 5IAIA 4OEVA 1MQJA 2UVIA 2HAUA 1BIYA 3K1MA 4R2BA 4LATA 3FJGA 2XXYA 3T66A 2F34A 3VVDA 3THIA 4DZ1A 3I5OA 3I3VA 3FXQA 2I49A 3MW0A 1ZJLA 3H6UA 3DM0A 5TP9A 1XHYA 3HHGA 3DELB 3TCHA 2V3QA 4H1XA 3K0VA 1B32A 3TCGA 4RA1A 4R9GA 4YKKA 3MZ1A 4F1VA 1AL3A 1LAXA 5I56A 1RKMA 4G68A 1XS5A 1SYIA 2NXOA 1FQEA 1M5CA 4H5FA 2V84A 5TPAA 4GVOA 3OXNA 2UXAA 4OTEA 1SDXA 4U4SA 2F5XA 1A55A 1US4A 2DYXA 3KGCA 2Q2AA 3C32A 4IO7A 1JVXA 3IO6A 5F1QA 1PEBA 5H8HA 2E1SA 3RT6B 2XXUA 1FQBA 1OMPA 3N6TA 2DWHA 3ODBA 3SKPA 1F9BA 1O63A 2OBGA 2QMXA 3UK4A 4EUOA 1MM7A 3EF7A 2V25A 1A99A 4ELQA 4EQ9A 5AA4B 4NF6A 1Q1KA 3DP6A 4THIA 1JEUA 2F7BA 1JETA 4QF9A 5CRYA 1P1NA 2ZYNA 1QUIA 3UORA 4L17A 2ONKE 2XXXA 1A8EA 1FQAA 3QXMA 4GLIA 2NVUB 1CE2A 1MQIA 3KSXA 4TQUQ 3E4RA 4YKJA 1QJMA 2AL5A 4QFNA 4X9TA 1B51A 5J1DA 4YKPA 1EZ9A 3IB1A 3K6UA 3T9XB 1DOTA 3G7WA 2D21A 3B6TA 4GRKA 4DXCA 5DEXA 3RPWA 3ZSFA 2PMSA 1IQ7A 2DXRA 4JWXA 2A5TB 5A5XB 5DVJA 1B0LA 1B9JA 1B1XA 4YICA 1MPDA 4KCCA 3H6TA 1DMBA 2QPQA 1H43A 2X26A 3HV1A 3IORA 1WVJA 1BKAA 1PBPA 2ONRA 1B3HA 1SW2A 1BTJA 4ELPA 1N7WA 1HSJA 1MXYA 1OVBA 4JXIA 3CI8A 1AMFA 3O6GA 5HPQA 3C34A 1B2HA 1OVTA 3CIJA 3A3CA 5I58B 4GXAA 1MQHA 3VFJA 1LFHA 5I59B 1PB8A 1DTGA 5K2YA 1B46A 2PX1A 4F18A 1DPPA 3C33A 4NWDA 2I48A 1TWYA 4HS7A 4LP2B 1S9TA 2H5YA 3LSWA 2OJTA 3K6VA 2W7YA 4G4PA 1PBQA 3PMWA 4GXSB 3O29A 3MZ9A 5CM6A 2P2AA 4PETA 2XXIA 4OFOA 5KZTA 3IOWA 3MP8A 3SESA 1LB8A 3Q25A 1XC1A 3IO4A 1R1NA 3GLBA 4N6PA 4LVQA 3VLWA 3Q28A 3B7DA 1S7YA 1EZOA 5I57B 1Y4TA 3OO7A 1GGGA 4ONYA 4QSDA 2A5SA 4HCYA 4QFPA 1A54A 1POTA 3HO7A 3LSFB 3QUFA 3TKDA 2XD2A 4DDDA 4QRZA 2GHBA 4RYAA 2H25A 2F35A 4G68C 1DTZA 4F22A 1H45A 3E13X 4IGTA 4P11A 2Y7WA 3MP6A 3KEIA 3IX1A 1UIUA 1GVCA 3UN6A 1TT1A 1B5JA 1IITA 3K6XA 3FXUA 1NKXA 4GWOA 3OSQA 3AXFA 4M1VA 1B3LA 2FNCA 2Z8EA 4IGRA 3ECRA 3W15C 1XVYA 1MDP1 3S9NC 2OLBA 1P99A 5JTYA 1O7TA 3M3FA 3SEUA 4KYDA 2RKMA 1MH4A 4ISUA 2O1MA 1MY2A 1B40A 3RLFE 4U1ZA 1D9YA 2XXPA 1JVYA 3K02A 4KFQA 4F29A 2O7UA 4OENA 1R9QA 1UTBB 3VXCA 3MZBA 2DE3A 3FGSA 2OZZA 3PUYE 3IAZA 3KZGA 3M3KA 3V89B 4YMBA 5I2KA 3LSXA 4R72A 3TFLA 3ZKKA 1YTVA 4N07A 2XXRA 4LZ5A 5H8FA 4G77A 5EHSA 3V83A 3D4CA 4POWA 1RYOA 3EHTA 5KCJA 1B5HA 3LSLA 2Z8DA 4NWCA 3U1OA 1D3KA 2VGQA 3M8UA 1AIVA 2P0SA 3RN8A 2DWAA 3H6WA 4YMAA 3FIRA 4JDFA 4KD5A 4I9DA 2H99A 3QUJA 5B7DA 2XX9A 1B05A 1SW5A 3C36A 3EPEA 1ANFA 4R74A 4O3BA 1USYH 3T9VA 5ITPA 1TXFA 1NH8A 4KHZE 4MFIA 3G3FA 4POXA 4ECFA 3RNNA 1FTOA 2OWTA 2HQ0A 5CI5A 4HCWA 4H6DA 2E0SA 5FHNA 4I62A 1OQGA 2QS2A 3T9UA 1N04A 3TQWA 1A40A 3KSJA 3TTKA 4GOTA 3TAJA 1IUDA 1ZLQA 3W9VA 1SW4A 3H7MA 1NNTA 3F11A 4HTGA 1O64A 1N3WA 1Y20A 3K00A 1II5A 2F6GA 1B5IA 3K01A 2NUVA 1FTMA 1M5EA 2DWJA 4NMYA 3T96B 4ZE9A 4QSEA 4G2ZA 3TEPA 3T9HB 4H67A 2XX8A 1FQDA 4IO5A 4YB7A 2ZYMA 1YAEA 5HM4B 5AE4A 3MPKA 3RT8A 4U1OA 4U4XA 4MLQA 2CMOA 1GR2A 4OFJA 3R26A 5DVFA 3K4UA 1BLFA 5AA2B 5IKBA 1EZPA 3RTWB 4YKIA 4XKNA 5L8DA 1IXIA 5FHOA 1XOCA 1FW0A 3DLNA 2GH9A 5AA4A 3CFLA 4ELOA 2GRVA 4TLMB 4BDOA 1B7ZA 2YPNA 3OOAA 2O69A 4DCXA 1D4NA 4BDNA 2R71A 1HSEA 1H76A 3QIMA 3TELA 2UYEA 1JEVA 2FYIA 3IK6B 3S2VA 3SEWA 2DXYA 4BDRA 3CRBA 4U2RA 4YAHX 4O3AA 1LB9A 1QW0A 2HXWA 3JYRA 5CMMA 4R6HA 1QVSA 2QS4A 4EXLA 1MXXA 4C1TA 2F7CA 4X1DA 3MQ9A 4WEDA 2XXHA 1URSA 1Y3PA 1MXUA 1EU8A 4E0XA 4RPOA 3QAXA 3SEVA 2O84X 4IO4A 5I2NB 4EQBA 4ESXA 4JWYA 4IY5A 3CFXA 2ALUA 3LBSA 3PUWE 4FEDA 4EF2A 3HHFA 4NEDA 2RC8A 3TQLA 4RXLA 3IOTA 2PT2A 3L6HA 4GF8A 4F3SA 4OETA 3CG3A 2F7AA 3FVKA 4IB2A 2O7IA 1JW5A 5CMCA 2FA7A 2Q88A 2Z8FA 2RCBA 3KJTA 2F8DA 1NNPA 3K6WA 3V8XB 5I59A 4AQ4A 4PQJA 1B1HA 3H6VA 5F7VA 4PP0A 1MXWA 4KYEA 1M5BA 5B70A 1UTHB 2ZMBA 1ZTYA 1LSTA 4BDQA 5LOMA 3H4ZA 4R73A 4OZ9A 2O51A 2Y7KA 3FASA 1ELJA 4BDMA 4RJZA 4GL8A 4UA8A 1Y1MA 4O3CA 1ZKBA 1B3GA 5H8QA 1I6BA 3RGYA 1URGA 4F2OA 5ICQA 3TTLA 4MF3A 2XHDA 3HN0A 5H8HB 4R9FA 1B4HA 4E0WA 4G8NA 5AA3A 4GFRA 2DS9A 4U23A 3O9PA 1SW1A 1PC3A 3FVNA 4ZZAA 5I57A 1Z7ME 4KPTA 4XKPA 3QYTA 3IOUA 1SI1A 2HZLA 3G3JA 1B0HA 3TMGA 4R6YA 1CB6A 3IB0A 1ZBMA 4F3BA 1OQHA 1N7XA 1LFGA 1YCJA 1MDQA 4OYVA 2F36A 3R7XA 1SBPA 2DSFA 2QS1A 1IEJA 4WXJA 2OK2A 5ISUA 1FQFA 4M4GA 2QL3A 2VD2A 2QS3A 2V93A 2PVUA 4GD5A 4H65A 3CG1A 1SVXB 2IEEA 3FJMA 3Q29A 4LQ2A 2ZYKA 4H8IA 1BP5A 2HZKA 4WEPA 3E9XA 2RCAA 2LAOA 1SI0A 3G3GA 3JZJA 4MLVA 1P1OA 4EXKA 1UIVA 3MAMA 3KOTA 5ITOA 3D4GA 2I4CA 1AH5A 2THIA 2Q89A 3QSLA 3B6QA 3LUYA 3PUXE 1N3XA 4F1UA 4I1DA 4OXVA 3EN3A 5CBRA 2XX7A 4XXUA 5K2XA 4AB6A 1FTLA 1ZU0A 4F3GA 1NMUA 4FE8A 2AYSA 3OO8A 4DIGA 3H03A 4FAJA 4DE8A 3FD3A 1WODA 3P7IA 4PFWA 1S50A 3DP4A 3OO9A 4XKQA 1M5DA 2DWIA 2Q9TA 3OD7A 1QKAA 3EQ1A 5H8NB 4Q8RA 2UVJA 1XT8A 1MS7A 3PPOA 1H3DA 1XVXA 4PFUA 2O68A 2R6GE 3KG2A 4OESA 1URDA 1SQYA 2ZNTA 3FV2A 3K2DA 4NTLA 1VFEA 3UIFA 2Y7RA 3K1NA 3M3LA 4G8HA 3I6VA 4LZ7A 4YB6A 3W9WA 4XTCQ 4F3PA 1YPNA 4LZ8A 5CMBA 2XXTA 5DVIA 2Z23A 1MXZA 2OCUA 4PFYA 3UGWA 1VSOA 2PBWA 1R6ZA 3U8QA 1H44A 2DE4A 3N5LA 1I6AA 3PU5A 3QK6A 1NNKA 4P0IA 4JSDA 4RK9A 2GFEA 3ONMA 5I84A 2ZNSA 2QJEA 2V3TA 3FXRA 4NF8B 1Y3NA 4NF5B 3JV9A 2Q2CA 4ZDMA 2AIXA 4Q30B 2DOJA 1IXHA 4LA9A 4ZEDA 3O66A 1R9LA 1LCFA 5AA2A 4OERA 2RC9A 3GBAA 3KN7A 1MY4A 1T0KA 4ZEBA 2B65A 4BDLA 1US5A 4YU0A 4RY1A 1MPCA 1PDAA 1RYXA 1MY0A 3G3HA 4JSOA 4IY6A 2OWSA 4Q0CA 4KCDA 2I6EA 2I58A 4G8MA 3TPAA 2ANJA 1P1UA 4GIZA 3OEMA 1I6QA 1Q35A 4U21A 1Z7NE 3OENA 1I69A 3MC2A 1GTKA 4KI0E 2H9BA 4H8JA 1LFIA 2GHAA 2P1SA 5L9OA 1OLAA 3C4MA 3PPQA 3FV1A 4OHNA 4ZEIA 3RUMA 4LQ5A 4NF4B 4JWOA 1DSNA 2I0BA 2WKYA 2VP1A 4F19A 3IJOB 5I2NA 2XXQA 4LONB 5ELVA 3GBBA 5L9MA 3ZS6A 4FJPA 4FATA 5CC2A 3OO6A 5FHMA 1SYHA 1MH3A 3FVOA 5JEIA 3U94A 3EHUA 3Q26A 2B3BA 3OEKA 1NNFA 2M8CA 3MVYA 3USDA 2YJPA 3O6IA 4X1BA 3MWBA 4XKRA 1TFDA 3O2AA 1MY3A 3TZAA 2Q8JA 3A09A 2H4IA 4DCYA 3PUVE 4F1YA 4R6KA 4JBZA 5DT6A 4Z7EA 1JNFA 3KBRA 5KDTB 3OELA 1Y4CA 1LAHE 4OEUA 4MH5A 3FATA 3E3KA 3R6UA 4RPNA 3O6HA 4BLAA 1IZ1A 3KJ7A 2YLNA 3U93A 4R2FA 1UTHA 5DTBA 2ABHA 1FTKA 1N0TA 1A8FA 1B7HA 3BFUA 2Y84A 3SEXA 4FECA 3BKIB 3PUZE 1B58A 3V5AA 2ONSA 3T22A 2A5TA 5A5XA 4OQOA 4FORA 1MXVA 4UACA 4RK2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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