1N3WA

Engineered high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3wA01
1VFEA 2E1SA 1ELJA 1XS5A 3K6VA 4KI0E 3E13X 5DEXA 1JVXA 2QSXA 3TCFA 1NL5A 1EZOA 1MQJA 1ZIUA 4G8NA 3MUQA 4KD5A 4TQUQ 3LR1A 4U4XA 2ALUA 1B7UA 2P1SA 4JWXA 1Z7ME 4TLMB 3FZVA 3LSWA 3T9VA 4GLIA 4BDOA 1SYIA 3CG3A 2O84X 2Y7IA 1OIBA 2Q9TA 3Q28A 5CMCA 5FHMA 1GV8A 1NNKA 2XXQA 1MXZA 3GLBA 3BBRA 4G68B 2Z8DA 5CMBA 3I6VA 4JXIA 3DLNA 3S9EA 1B32A 1FQAA 3RGYA 2HEUA 2F6PA 3ZKKA 1Y1MA 1B5IA 3TMGA 3WAFA 4DXCA 1B7ZA 3IOWA 1B3EA 3VVEA 2ONKE 3TKDA 4QFKA 3H6WA 5CBSA 3HO7A 4XXUA 5FTIA 4YICA 3G3FA 4GRKA 5ICTA 2UXAA 4GF8A 4KCDA 4H5GA 3D4CA 3E4RA 1QJMA 4JBZA 3USDA 1QUIA 4OETA 2G93A 1M5FA 2QS4A 3IL1B 4BDNA 4F31B 4P11A 1IXHA 5L9SA 3FV1A 4PQJA 2FA7A 3SEVA 4AB6A 4OQOA 4X1DA 3TFLA 4IO3A 2Q2CA 3T9XB 1T0KA 3GXAA 1O63A 3QUJA 5CM6A 2V3QA 3TELA 3IO4A 4YB7A 4THIA 4F3BA 3O9PA 1Q35A 2UVHA 2DWAA 3N26A 2UVJA 1I69A 1UTHA 3KN3A 3DELB 3A3CA 4XKNA 2F78A 2VGQA 3K4UA 2IEEA 5AA2A 2XXHA 3IR1A 4H8IA 2XXPA 3MW0A 4K3FA 5H8HB 1TT1A 4NF4B 4FAJA 4OERA 3CR9A 3K1MA 5ITPA 1PBQA 2QMXA 1N7WA 4IB2A 4GOTA 4R2FA 3SEYA 3OMBA 2H5YA 4OFLA 1JEVA 1EZ9A 3PV0E 4ELQA 1ATGA 2O1LA 2D5WA 3VLVA 3BFUA 1H76A 4YMBA 5CMKA 2ESNA 2ZNTA 3GBAA 4BDQA 3P7IA 1LB9A 1MXVA 3FVOA 2PVUA 3H3GA 3FVGA 4EF2A 3CFZA 2Z22A 1NH8A 3RY3A 4F3SA 1IXCA 4G77A 5F1QA 3IAZA 4ZEIA 2R71A 1OQHA 1WVJA 4F29A 4I8CA 3T9HB 4QFPA 3KJTA 3V8XB 1B3FA 4QF9A 1DMBA 4X48A 4NF6A 1MH4A 1Y4CA 1Y3NA 1FTKA 3MP6A 1TFDA 2XX8A 3IJXB 5AA4B 3RN8A 4PFYA 4EF1A 5HPQA 3FXUA 4RPOA 3R7XA 3QK6A 3VVDA 3QIMA 4NWDA 2PYYA 3UORA 3TPAA 3HSTA 2RCAA 1YCJA 4RNSA 2NXOA 3O6GA 1XOCA 3ZKLA 1VSOA 2RC8A 4RJZA 3U92A 1N3XA 3M3FA 2Y7KA 4ZECA 3PPQA 3FV2A 1SBPA 4U2RA 4ZDMA 3W9WA 4U1ZA 4R9GA 2H4IA 2O68A 1D4NA 4ND9A 2HAUA 1AH5A 4FEDA 4F2QA 5H8FB 2OK2A 1B3HA 1SW5A 4Q0CA 3T9UA 2QS1A 2GFEA 2B65A 4U22A 4I1DA 1Y9UA 4L17A 1D9YA 3RT8A 3IOVA 3KOSA 3H4ZA 3KZGA 4JWYA 3MVWA 3BFTA 2Z8EA 1SVXB 1LFIA 2Y7WA 1A8EA 1UTBA 2F8DA 4ISUA 4OYVA 3UIFA 4XKQA 1A40A 5CBRA 5TPAA 3FATA 2GHAA 4WXJA 3LSFB 5H8QA 1DPPA 2I4BA 4P0IA 1LFHA 1IZ1A 2XD2A 2QS2A 1EZPA 2XXXA 4OFJA 1US4A 3IB2A 3FASA 4UA8A 3K6WA 1UIVA 4OEUA 3K6UA 3H7MA 4GXSB 1II5A 2XX7A 3VDFA 5FHNA 3C32A 2QL3A 2GRVA 1LSTA 5AE4A 2I49A 3PPPA 3PUWE 1OVBA 4ZEFA 3PMXA 5BUUA 1H3DA 2O7UA 4IO4A 4ZE8A 3CFXA 1I6BA 3U93A 4E0WA 2W7YA 1IXGA 4DXUA 1TWYA 3SETA 5KDTA 2HZKA 3W9VA 3EN3A 3TQLA 3LC8A 3A09A 4JWOA 2I3VA 3OEKA 1B3LA 3MP8A 2F6GA 2Q89A 2OJTA 4PE5B 4GIZA 3OEMA 2F7CA 2RF1A 4UACA 2REGA 4KYEA 3M8UA 2V3UA 4XIGQ 4GXAA 5K2YA 4OMBA 2X26A 2I58A 3PGFA 1PC3A 3SEXA 2DOJA 2THIA 3EHTA 4TOZA 5B70A 5B7DA 3MBPA 4DDDA 3VV5A 4BDLA 3O2AA 3VLUA 2DE4A 1US5A 1R1NA 3E9XA 1POY1 3FVNA 4E0XA 4YKPA 3VXBA 4C0RA 1M5DA 5M2VA 3VFJA 1M5EA 1PEBA 2XXYA 2PX1A 3H6UA 4NE4A 3TTKA 3AXFA 4NMYA 2OBGA 1B58A 4XTCQ 3MZ9A 3KN8A 2H9BA 1VFDA 4FECA 4ONYA 2I4CA 4BDMA 4POWA 4R6KA 4FJPA 3RPWA 3RTFB 4NF5A 4BDRA 3IB1A 3OO9A 1UIUA 4NF8A 1FQCA 4GWOA 3F11A 4U4SA 2CZLA 2A5TA 1QUJA 4C1TA 1MDP1 4U1OA 2F36A 1MQGA 1O7TA 3TEPA 3PD8A 3W15C 3C34A 4R9FA 1B3GA 1MXXA 4U23A 4F1YA 3O28A 3S9NC 3PU5A 3TUSA 3B6WA 1RKMA 4F1VA 1AOVA 2XD3A 1EH3A 4FEBA 1ZTYA 4KHZE 3PUYE 4G2ZA 5HM4B 5I57B 1GGGA 5LOMA 3MPKA 1N0TA 1LCFA 5I2NA 1MQIA 3TTMA 1XT8A 4IGTA 4M4GA 1SI0A 5JTYA 3OSRA 1MRPA 4ESXA 4PETA 3C9HA 1GTKA 3PMWA 2GHBA 1YTVA 3FJ7A 4YB6A 4NF6B 2Z8FA 4ZEBA 3KSXA 5TP9B 1IEJA 2GH9A 2O1MA 3CRBA 1TXFA 2PT1A 3O66A 1NNTA 1IQ7A 1A54A 1MQDA 2HQ0A 1BTJA 5L9OA 4YAHX 1LFGA 3K01A 1B1XA 1QKBA 4QFLA 1A99A 4X9TA 1JNFA 3Q25A 3TTLA 1MXWA 3K2DA 3MAMA 3OENA 1OVTA 4RY1A 4H67A 1B4HA 2P2AA 2V3TA 1A8FA 5DVJA 3CIJA 2O7IA 2VOZA 5A5XA 2B3FA 1ANFA 4JB7A 4P0GA 3O6IA 5KZTA 4IO5A 1P1OA 3PUXE 1LAXA 2CMOA 4R6HA 2FYIA 1N3WA 2YPNA 5H8SA 3RTWB 1DSNA 3G3IA 1QUKA 1P99A 5I59B 3MPLA 3LBSA 4HTGA 1BLFA 5KCJB 1LLSA 1L5TA 1URDA 1B0LA 1LAHE 2YJPA 1QULA 1Y1ZA 4GL0A 4KR5A 4IY5A 3UA8A 3EQ1A 3IO6A 4JDFA 3UN6A 1H44A 3CSBA 1USYH 3DP8A 3MQ9A 3CG1A 3OD7A 2P0SA 1FTJA 3G3GA 1ZLQA 1JW5A 4H8JA 4M1VA 4KQPA 4IGRA 3TTRA 2UYEA 1LAGE 4GVOA 1WODA 4POXA 2YLNA 2DVCA 1GVCA 1LBBA 3FD3A 1MY0A 1QW0A 1I6QA 4R72A 3T96B 3MZBA 4G8HA 1IUDA 4DLDA 1NNPA 1NH7A 3Q26A 2ANJA 2QPQA 3ODBA 4ELRA 3EHSA 3MWBA 2DE3A 2XXIA 4N6PA 5I58B 5K2XA 4H6DA 2O69A 4LONB 2RINA 1UQWA 3KSJA 3G3KA 2AYSA 4DCXA 2V84A 4EQ9A 3RT6B 2QRYA 3DP6A 4DIGA 4NWCA 3IK6B 3U94A 2G29A 4HCWA 1JW4A 1YAEA 3SEWA 1DTZA 2Q8JA 2DWJA 4EXLA 3MVZA 1DTGA 3T93B 1B5HA 1WDNA 1O64A 5DT6A 1LB8A 4KCCA 3H03A 2OZZA 5H8NB 5H8HA 3T22A 2Z23A 2ZMBA 2DXRA 3RLFE 3QXMA 5CMMA 1B52A 2HAVA 1RYOA 2XXTA 3HV1A 1ZJLA 4ZZAA 3KJ7A 2XXWA 3CI8A 4GFRA 3Q27A 1JQFA 4O3CA 1N04A 4X1BA 3G3HA 4H65A 5HBCA 2UYFA 5I56B 2NUVA 4Z7EA 4OTEA 5CI5A 4R74A 3FJMA 4O3BA 1LGBC 4EQ7A 1MS7A 3HHGA 4NEDA 1MXYA 4IO7A 5DEXB 2D21A 3LSXA 2E0SA 5I2KA 4EQBA 4DZ1A 3ILTB 2PMSA 5L8DA 3OO8A 1FCKA 1N76A 4OZ9A 2QS3A 1B46A 3VE1B 1J1NA 2VHAA 3TCHA 4MLVA 1D3KA 2DS9A 4RA1A 1N84A 1EU8A 1HSEA 4LQ2A 2LAOA 3C33A 3ONMA 2D3IA 1B5JA 1VE4A 5IAIA 4NF5B 3KEIA 3TODA 4DE8A 4NF8B 5DVIA 1MM6A 5AA4A 4YU0A 1GR2A 2OWSA 2A5TB 3H6VA 3IOUA 3OXNA 2X7PA 1SYHA 1TFAA 1Y4TA 3I5OA 4QFOA 5ELVA 3B6TA 4PFWA 2DWIA 3KGCA 4FORA 2B3BA 2R9JA 4QSDA 3PD9A 2F5XA 2Y84A 4GD5A 2V93A 3DP4A 2WKYA 4WKMA 2XXVA 4OFOA 1SW4A 4OXVA 1P1WA 4H1XA 1HSLA 1Y3PA 1URSA 4QSEA 4JSOA 4ZZEA 3V83A 3K00A 2ZYOA 3U72A 1SD3A 5H8FA 3HCQA 3K1PA 5L9MA 3JYRA 5I2NB 1B40A 3PUZE 4U21A 2OWTA 3I3VA 5DTBA 1SW1A 4F1UA 4G4PA 1PDAA 1P1UA 3S2VA 5JTYB 1B0HA 4IY6A 2V25A 4DCYA 4OWDA 4F22A 2AL4A 1Q1KA 3BKIB 3FJGA 3U8QA 4YB5A 1M5BA 2ONRA 3OO7A 1HSJA 1B4ZA 3PUVE 5F7VA 3S9MC 4ZEKA 2ZXTA 3WAEA 2DXYA 1FQEA 3C36A 2UVIA 4I9DA 1QKAA 2QJEA 1UTHB 4ELOA 5DVFA 2O6AA 5AA1A 2BJJX 5J1DA 5AA2B 4EDPA 3PPRA 2DWHA 3V89B 2VD2A 4F39A 1FQBA 3UP9A 3RUMA 4F2OA 1KWHA 1MXUA 3K1NA 4YKJA 5A5XB 3R6UA 1LAFE 4F18A 1FQFA 2OLBA 4WEPA 3B6QA 4AQ4A 3M3LA 3VXCA 1NNFA 4YZZA 3N6UA 3RNNA 2XHDA 1NFTA 5ISUA 5AA2D 1SQYA 1R9QA 3KG2A 4ELPA 1FTMA 1PB7A 3K0VA 3HPIA 1M5CA 1OLCA 2IA4A 3IORA 2DQVA 3O97A 4GQOA 3U1OA 3SERA 1OMPA 3B7DA 1IITA 1XVYA 2R6GE 3IOTA 3JZJA 3THIA 4O3AA 4ZS9A 2X7QA 3PPNA 4GL8A 4LP2B 3IJOB 3KN7A 1H45A 3FUZA 4PP0A 4YKIA 1S9TA 3IB0A 2I3WA 3SEUA 4N13A 3C31A 1B51A 2DYXA 4BLAA 1F9BA 4ZEDA 2FNCA 2HFBA 4WEDA 4MLQA 4HS7A 4H0WA 2I6EA 1OQGA 2ZNUA 4FIMA 4KFQA 4RK9A 1ZU0A 3OSQA 1Y3QA 4IO6A 4EUOA 3TZAA 2ZYKA 1SDXA 3FIRA 3Q29A 4OHNA 1I6AA 3UGWA 2Q88A 5CRYA 4KYSA 1JEUA 3JV9A 3A3UA 3MJNA 4AB5A 1AMFA 4LUBA 3O29A 1MPBA 5BWJA 1R9LA 2O51A 1SW2A 3PPOA 3QUFA 3HHFA 1DOTA 5CC2A 1XHYA 1MY1A 1B05A 2Y7PA 4G68A 2KLFA 4LQ5A 2XXUA 1N7XA 1PB8A 5I84A 5IKBA 5JK4A 5ITOA 3KBRA 2HZLA 3CVGA 4C1UA 3ZSFA 1XC1A 2A5SA 1AL3A 1MG1A 1B1HA 3L6GA 2RCBA 4F19A 4JSDA 3TAJA 4KYDA 5ICQA 1BP5A 1OLAA 1MPCA 3UK4A 3HN0A 1BKAA 2M8CA 3DM0A 1P1NA 1Y20A 3TYHA 1IXIA 1FW0A 4MFIA 1S50A 1URGA 4R6YA 5I57A 2VD3A 1MQHA 1UTBB 4OVJA 4QRZA 1LCTA 4ESWA 1ZKBA 4MBPA 5TPAB 3FVKA 4Q30B 3GBBA 3ILUB 5I2KB 5H8QB 1A55A 1FTLA 2H98A 4QSCA 1MY3A 2F34A 4H5FA 3D4GA 1MY2A 3L6HA 4XKRA 1B9JA 2NWJA 4EXKA 3H06B 2I0CA 3VVFA 2UVGA 4LATA 2ZNSA 4OENA 3N94A 5TP9A 2H25A 4I62A 1CE2A 2H99A 1AIVA 3N6TA 4LZ5A 1FTOA 3ZS6A 3OELA 3SKPA 1USYE 1MDQA 3OOAA 3TCGA 4LA9A 1XVXA 1JW1A 2Y7RA 2RC7A 1NKXA 4F3GA 1MM7A 1A7LA 3MC2A 4RXLA 1FQDA 3SDFA 3FGSA 5KDTB 2REJA 1JVYA 1R6ZA 3KFMA 1MH3A 2DSFA 4RK2A 4YMAA 1IIWA 2PT2A 4ZE9A 3SESA 4NF4A 5DYHA 4OESA 1MPDA 3S9LC 3QYTA 1B2HA 1CB6A 1PB9A 3ECRA 3KOTA 4NTLA 3CSGA 4LVQA 2F7AA 2DE2A 1VR5A 1JETA 1ZBMA 4DXBA 4HW8A 1BIYA 4OEVA 4RPNA 4LZ8A 3S4UA 5I59A 4RYAA 5JEIA 1QVSA 4YKKA 5KCJA 2DP8A 3TDJA 1B6HA 5EHMA 2RC9A 2I0BA 3TQWA 4R2BA 2F7BA 3CFLA 3MVXA 1H43A 2ONSA 3H6TA 1NMUA 4QHQA 4FATA 4F3PA 4KPTA 3LUYA 3RQTA 4IO2A 2I48A 5EYFA 3FXQA 5EHSA 3FXRA 1D9VA 2F35A 5AA3A 5FHOA 1ZMGA 4FE8A 3T66A 3G3JA 3N5LA 3K6XA 4R75A 3IX1A 4Z0IA 3EF7A 2Q2AA 1DPEA 4ECFA 4TLLB 3MVYA 4Q5TA 4LZ7A 2RKMA 2NVUB 3LSLA 3QSLA 2DVZA 5I58A 2VP1A 2HCAA 1LBCA 2HXWA 2PBWA 3E3KA 4MF3A 3OO6A 2AL5A 2ZYNA 5FTHA 2F97A 1S7YA 1PBPA 3PMVA 3TTNA 4R73A 1RYXA 1YPNA 3EPEA 3QAXA 3MP1A 2XXRA 4G68C 1POTA 1MY4A 1P1QA 5TU0A 2ZYMA 2XX9A 3V5AA 3G7WA 3VLWA 5H8NA 4PFTA 4MH5A 2NOOA 3C4MA 4G8MA 2ABHA 4HCYA 4PFUA 3O6HA 3C35A 2OCUA 1Z7NE 1SI1A 4QFNA 3EHUA 4Q8RA 3R26A 4N07A 2AIXA 3GZGA 3M3KA 3MZ1A 5I56A 4XKPA 2QMWA 1B7HA 3K02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VFEA 4UABA 2E1SA 4PBHA 1ELJA 1XS5A 3K6VA 4KI0E 3E13X 5DEXA 1JVXA 2QSXA 3RPLB 3TCFA 1NL5A 1EZOA 2PFZA 1MQJA 1ZIUA 4G8NA 3A29A 3MUQA 4KD5A 4TQUQ 3LR1A 4U4XA 2ALUA 1B7UA 2P1SA 4JWXA 1Z7ME 4TLMB 3FZVA 3LSWA 3T9VA 4GLIA 4BDOA 1SYIA 3CG3A 1NV2A 2O84X 2Y7IA 1OIBA 2Q9TA 3Q28A 5CMCA 5FHMA 1GV8A 2XA5A 1NNKA 2XXQA 1MXZA 4O7IA 3GLBA 3BBRA 4G68B 2Z8DA 5CMBA 3I6VA 4JXIA 3DLNA 3S9EA 1B32A 1FQAA 3RGYA 2HHMA 2HEUA 2F6PA 2QVRA 3ZKKA 1Y1MA 2FVZA 1B5IA 3TMGA 1IMAA 3WAFA 3KC1A 4DXCA 4PGNA 1B7ZA 3IOWA 1B3EA 2QVUA 3VVEA 2ONKE 3TKDA 4QFKA 3H6WA 5CBSA 3HO7A 2CEXA 3MSTA 4XXUA 1FPFA 4I3EA 5FTIA 4YICA 1G0HA 3G3FA 4GRKA 1LBVA 5ICTA 2UXAA 1NV6A 2FIXA 4GF8A 4KCDA 4H5GA 3D4CA 3E4RA 1QJMA 4JBZA 3USDA 1QUIA 3NOHA 4OETA 2G93A 1M5FA 2QS4A 3IL1B 4BDNA 4F31B 4G61A 4P11A 1IXHA 2VT5A 5L9SA 3FV1A 4PQJA 2FA7A 3SEVA 2FHYA 4AB6A 4OQOA 4X1DA 3TFLA 4IO3A 2Q2CA 3T9XB 1T0KA 3GXAA 3GYYA 1O63A 3T1BA 3QUJA 2R8TA 2V3QA 5CM6A 3TELA 3IO4A 1NV1A 4YB7A 4THIA 4F3BA 3O9PA 4IR8A 1Q35A 2UVHA 2DWAA 3N26A 2UVJA 1I69A 1UTHA 3KN3A 1FSAA 3DELB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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