1N3WA

Engineered high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 120
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n3wA01
1R1NA 3FZVA 5F7VA 2DE2A 3IOUA 3SKPA 4YAHX 1P99A 5K2YA 3CI8A 4RYAA 1GTKA 1NMUA 1DTGA 2V3QA 5TP9B 3M8UA 3K6XA 3N6TA 1H45A 4QF9A 3MBPA 3GBAA 1M5BA 2AL5A 1B1XA 4HCWA 2F5XA 3GLBA 2QPQA 2OLBA 4IY5A 5DVIA 4Q0CA 1D9YA 3FD3A 1A7LA 1AL3A 2I4BA 3TCFA 4WEDA 2I48A 1SBPA 5KDTB 1BTJA 2F8DA 2XXWA 2NWJA 4NE4A 5KCJA 4KFQA 3N5LA 1AOVA 1QVSA 3KN3A 3SEVA 5JEIA 3KZGA 3TTMA 3OEMA 3OEKA 3BFUA 3TTLA 1UIVA 4LQ2A 4WKMA 3SEXA 1N76A 4HS7A 3QSLA 3MP1A 1H43A 1OMPA 4QFPA 3GBBA 3OELA 2QL3A 2HZKA 1FQDA 3ECRA 3IK6B 5AA2B 3H4ZA 3MZ9A 4QSEA 3C36A 3D4GA 3UORA 2DXYA 3U72A 3IR1A 2AYSA 3DP6A 4NF8B 1POTA 4ZZEA 2UYFA 1SD3A 3MWBA 3O28A 3TCHA 3H7MA 4KQPA 3KN8A 4E0XA 1B6HA 5AA1A 2PX1A 2RC8A 1B58A 4QFOA 2XD3A 4OFJA 4BLAA 2DWAA 4EF1A 1TWYA 4OVJA 5I2NB 3I3VA 3IX1A 1SI1A 2F7CA 2UVHA 1EH3A 4ESXA 1L5TA 4ZEBA 3G3FA 2B3FA 2Q2AA 3K1NA 4RNSA 1BIYA 3T96B 3EF7A 3E9XA 2GHAA 2B65A 4OERA 2GFEA 5A5XB 1US4A 5EHMA 2O1MA 1Q1KA 4QRZA 4F3BA 2Z22A 4KYDA 1XHYA 4THIA 1CB6A 1SVXB 3OSRA 4F18A 4UA8A 4QFKA 3VVEA 2GHBA 3LUYA 1PB7A 2HEUA 4PFUA 3PMWA 4LZ5A 3TODA 2ZNUA 3VXCA 1VSOA 3FVNA 1MDP1 4ZE9A 1XOCA 5I59B 3UP9A 4RY1A 3SERA 3R26A 3CSBA 3QXMA 1SW5A 3RPWA 3C34A 4RA1A 2IA4A 4F39A 2QJEA 4F1UA 4LATA 5FHMA 4F1YA 1MY4A 4KCDA 3C4MA 3CFZA 1LGBC 5L9SA 3T93B 4O3CA 3QIMA 4U1OA 2DWHA 3R6UA 2ZMBA 2M8CA 3FVKA 3TAJA 3VXBA 1Y20A 4R6KA 3UA8A 4BDOA 4MF3A 1ZLQA 4R6YA 4PFWA 2CZLA 2O6AA 1T0KA 4G4PA 3H6UA 1QKBA 2QS1A 3Q29A 3H6TA 2P2AA 1B4HA 4JSDA 4LUBA 3FGSA 1MQIA 2NUVA 4GQOA 4AB5A 5M2VA 2YJPA 4EDPA 2F97A 4LONB 5CM6A 1LFIA 3OO8A 1P1QA 4F22A 4JXIA 2LAOA 1QKAA 3Q27A 2Q89A 2UXAA 4PFYA 3MPKA 2XXVA 3GZGA 1IEJA 5I57A 3OXNA 4YKIA 2OBGA 1OLAA 4F3GA 3M3LA 2DP8A 1B2HA 3FUZA 2Y7PA 1URGA 3VLUA 3W9VA 5CMKA 1IXGA 4KPTA 4IB2A 2RC9A 3U93A 2ABHA 4IY6A 3KOSA 2RINA 3HHGA 2OJTA 2FNCA 2PMSA 3OMBA 4NEDA 2GH9A 3K02A 2UYEA 2X26A 2PT2A 3IJXB 1JW1A 3RLFE 5CMCA 1WVJA 2ONKE 3PPRA 5KZTA 4DIGA 4ND9A 4YZZA 4LA9A 2ZNSA 2H99A 2B3BA 1UQWA 3RT6B 4NF4B 4U23A 3OENA 1UTBB 4X1BA 3TTRA 3DLNA 2YLNA 1I6BA 4KD5A 4ZEIA 3IOVA 4X1DA 3SEUA 2V25A 5I56A 1Y1ZA 1NH8A 4N13A 4Z7EA 5HBCA 2ZNTA 2Z8FA 3EPEA 5AA4B 5HM4B 4F1VA 4EQBA 1S9TA 3LC8A 4BDMA 2UVIA 1M5DA 1US5A 3D4CA 2XX9A 1MY1A 5I2KA 2HFBA 3JYRA 4GLIA 1P1UA 2D5WA 1QJMA 3C33A 2O84X 3TCGA 1LLSA 4YKJA 3MC2A 1H3DA 5TP9A 3WAEA 1OQGA 3CFXA 1JEVA 2IEEA 4ZE8A 3BBRA 3MW0A 4ISUA 1NNFA 1Y3PA 2Z8DA 1AMFA 1NFTA 4F2QA 4BDLA 4R9FA 1FCKA 4G8NA 4PQJA 1MDQA 5DYHA 5KDTA 2ONRA 3K1PA 4G68C 2YPNA 1DMBA 1FW0A 5CC2A 4G68B 5DVFA 4OEVA 4PP0A 3FXQA 4IGTA 1MH4A 1JQFA 4FATA 4JB7A 3V89B 2ONSA 3N6UA 1MXYA 3EN3A 1IXCA 5H8QB 1B7ZA 1LAGE 4PETA 5ICTA 4FJPA 1GGGA 1ZBMA 3A09A 4YMBA 4R2BA 1A8EA 4FORA 1N0TA 4ZEDA 1JW4A 3PPQA 1B52A 3OO6A 5AA2A 1MM6A 1ZKBA 4L17A 1RYOA 3PMXA 2DE3A 1URSA 4F2OA 1PDAA 4MLQA 4NF8A 1A99A 3RN8A 2XXUA 4P0IA 4F3PA 4NMYA 1ZTYA 2ESNA 5FHNA 3DELB 4Q30B 1A40A 4OYVA 1R9LA 3K01A 4POXA 1DPEA 4XKNA 2XXRA 3FJ7A 3HN0A 1GR2A 1O63A 4O3AA 4NWDA 4LZ8A 4XIGQ 2ZYOA 3ZS6A 5I2NA 3RTWB 2W7YA 3JV9A 1O7TA 1TFDA 1J1NA 1IUDA 4HTGA 1NNKA 1A8FA 4K3FA 1JETA 3KFMA 4ZEFA 4H1XA 5A5XA 3MP8A 3N94A 4NF6B 2UVGA 4M1VA 4PFTA 2BJJX 4BDNA 2I49A 3K6VA 5H8HB 2F35A 1IXHA 3AXFA 5FTHA 3T9VA 4RXLA 2F7BA 4U21A 1FQFA 1BLFA 2H9BA 4U2RA 2DXRA 4YB5A 1I6QA 5IKBA 1ELJA 2XHDA 3HO7A 5I59A 2F7AA 1GVCA 2RCBA 4JSOA 2VD2A 1BP5A 2RC7A 2A5TB 3K1MA 1B3LA 3S9NC 5TPAB 4N07A 4DDDA 1D3KA 1QUIA 4OFOA 1MQJA 4HW8A 1PBPA 3O2AA 3V83A 4ZECA 3HSTA 2F78A 1MS7A 4IO5A 2DVCA 1UTHB 1RYXA 3Q28A 4QHQA 5AA2D 2A5SA 1TFAA 4X9TA 3EHTA 2Y7KA 4ZDMA 2Q8JA 2OWSA 2PBWA 4EXLA 3TMGA 3T9HB 5ICQA 2REGA 4RK9A 1NNPA 1HSEA 5H8SA 3EQ1A 1N7WA 3T9UA 5BUUA 1JW5A 4I1DA 2F34A 3TDJA 3UGWA 1N3WA 1IQ7A 1P1NA 4FEDA 3CSGA 1FTOA 2VOZA 2ZXTA 4OTEA 2P0SA 1PEBA 1IXIA 4NF5B 4JWYA 4IO6A 3IB1A 3MVWA 2V3UA 3I6VA 4U1ZA 3G3JA 3V8XB 4O3BA 1DOTA 1N7XA 4GF8A 2ZYMA 3HPIA 1LB9A 2Q88A 3B7DA 3SDFA 2Z8EA 2QS4A 2O7IA 3VVDA 3K6UA 3MAMA 3UK4A 5H8NB 2QMWA 3RY3A 3MVYA 3QK6A 1B0LA 3T22A 3RQTA 1B5JA 1LCFA 2I0CA 1RKMA 1DSNA 3KN7A 2O68A 4P0GA 2HXWA 3KBRA 1JEUA 1P1OA 4LZ7A 1MQDA 2DS9A 1Y1MA 4AB6A 3GXAA 3T66A 3C31A 1B4ZA 1VFDA 3UN6A 3S4UA 2E1SA 3LSFB 4QSCA 2VHAA 2NOOA 4KCCA 5CMMA 1II5A 3O9PA 4KR5A 1VE4A 1USYE 1SW2A 3L6HA 2O51A 3CVGA 2H4IA 4NF4A 4BDQA 3VFJA 4EXKA 1MPDA 4FECA 1EZ9A 3VLWA 2OZZA 3TQWA 5I58B 2RF1A 4LVQA 3ZKLA 3FASA 4R74A 4TLLB 4R9GA 3USDA 1AIVA 2I0BA 3FJMA 3PU5A 1XT8A 2I3WA 4H67A 5JTYB 3IAZA 3PMVA 4FIMA 1NL5A 2V3TA 4DCYA 5AA4A 1DPPA 3H6WA 3MPLA 1MY2A 1QULA 1Q35A 2THIA 2Y84A 4KHZE 2VD3A 3SEYA 2QRYA 1MXZA 5AA3A 4WEPA 3U92A 1B7UA 3FVOA 2FA7A 1I6AA 4YU0A 2PT1A 1D9VA 1YCJA 2WKYA 3K2DA 3PUXE 2F6PA 3PD9A 3I5OA 3KEIA 5B7DA 3H06B 3KJ7A 1B7HA 2PVUA 3VE1B 2FYIA 1YAEA 3OOAA 1FTJA 1B05A 4GRKA 4XKPA 3KSJA 3ZSFA 1B3EA 2V93A 1R9QA 3E13X 4G68A 1IZ1A 2QSXA 1NKXA 2Y7RA 3VDFA 1TXFA 3B6QA 3O66A 2XXTA 3E4RA 3B6TA 5H8QA 3ONMA 3ZKKA 1R6ZA 2ANJA 5ISUA 1MXWA 3S2VA 3S9EA 4JWXA 5DEXB 4QSDA 4KYEA 1MPBA 1Y3QA 1JNFA 1B40A 2HQ0A 4C1TA 4U22A 5L9OA 1SW4A 4IO3A 4N6PA 2I58A 2GRVA 2X7PA 3H6VA 4GIZA 4XXUA 1XC1A 4FAJA 4YKKA 3FIRA 4Q5TA 4H0WA 2REJA 1Y3NA 3G3IA 3PGFA 1H44A 2OCUA 2AIXA 1FTKA 3O6GA 4ONYA 1M5FA 1YPNA 4QFNA 2HZLA 3KSXA 4I8CA 1ANFA 1LFHA 1DTZA 4QFLA 3CG3A 4I62A 1XVYA 4OZ9A 4ZEKA 5K2XA 1VFEA 3TUSA 3K4UA 4IGRA 3OO7A 4I9DA 3UIFA 2H25A 5H8FB 4FEBA 3IB2A 4NF6A 3RTFB 4OESA 5H8HA 5L8DA 3W9WA 4GD5A 2E0SA 1Y9UA 2CMOA 4ELOA 5DTBA 1Z7ME 2H98A 1A55A 5L9MA 3TPAA 1LCTA 3PPNA 4R75A 4GFRA 4TOZA 3K0VA 1Z7NE 1N04A 3IB0A 1B1HA 1P1WA 3CFLA 4JBZA 4RPOA 1VR5A 3PD8A 1OIBA 3IL1B 3FATA 2A5TA 1ZJLA 4KYSA 5TPAA 1FQCA 1M5CA 3MZ1A 1MXUA 3FVGA 3E3KA 4OHNA 2XD2A 4TLMB 1OLCA 1MXXA 2NVUB 1B3GA 2Z23A 2X7QA 3QAXA 4ECFA 2F6GA 1B3HA 4H5GA 3ILTB 1UTHA 2NXOA 1B0HA 4EUOA 2G93A 2QS3A 3TEPA 4IO7A 4H5FA 1WDNA 1D4NA 3MJNA 5AE4A 3HV1A 4OQOA 1LBCA 4R72A 3U8QA 5EHSA 1PB9A 1F9BA 2G29A 3IOTA 1KWHA 1MRPA 1QW0A 3FJGA 3MVXA 1N3XA 3JZJA 1B5HA 1QUKA 2DQVA 3QYTA 3KGCA 4IO4A 3W15C 3QUJA 3G3GA 5TU0A 3R7XA 1GV8A 4OMBA 4OENA 5JK4A 4NF5A 3DP4A 1O64A 1B5IA 4OXVA 3CRBA 3OSQA 4F29A 2ZYKA 1ZMGA 4POWA 3T9XB 3TTKA 3Q25A 1UIUA 1LAXA 2Q2CA 3TQLA 1B51A 1EZOA 3RUMA 4DZ1A 3O97A 5KCJB 3VLVA 4DXUA 4DCXA 3Q26A 1HSJA 4F31B 4GWOA 5ELVA 3S9MC 1B46A 1POY1 3FXUA 2ZYNA 3TTNA 4RK2A 1OVTA 4Q8RA 3G3KA 4GXAA 5H8NA 5ITPA 2I4CA 2VGQA 4EQ7A 1LSTA 3F11A 1H76A 1N84A 5HPQA 4GVOA 3WAFA 3K00A 3KG2A 3HCQA 3FV2A 3V5AA 1YTVA 2XXHA 2KLFA 4R73A 1MQHA 3OO9A 3BFTA 3PUWE 2Y7WA 1A54A 3C35A 1FQBA 3MVZA 1MY3A 1NNTA 4U4XA 2XXIA 1XS5A 3O6IA 3CG1A 3PPOA 2RKMA 4DE8A 2V84A 1B9JA 3KJTA 2QS2A 5I58A 1S50A 4Z0IA 3O29A 1PBQA 2R9JA 4R2FA 4ZS9A 3P7IA 3O6HA 1FTLA 1LFGA 5LOMA 5JTYA 2XXPA 5FTIA 1B3FA 2OK2A 3LBSA 3LSWA 5IAIA 1EU8A 3N26A 5F1QA 2O7UA 1AH5A 5I84A 2XXXA 3SEWA 1S7YA 4NWCA 4MBPA 2DSFA 2DWJA 3M3KA 1MXVA 2PYYA 1SYHA 1IIWA 1BKAA 3TYHA 2P1SA 2XX7A 3C9HA 2DYXA 2H5YA 4X48A 4P11A 2UVJA 3K6WA 4JWOA 2HCAA 2Y7IA 1ATGA 1LBBA 3CIJA 1OVBA 3SESA 3U94A 4JDFA 4YMAA 1UTBA 4MH5A 2XXQA 1JVXA 3DP8A 3LSLA 4OWDA 4HCYA 3A3UA 2OWTA 1MY0A 1M5EA 1XVXA 3QUFA 4OETA 4R6HA 3THIA 5B70A 3H3GA 1Y4CA 3RNNA 4GL0A 4ELPA 4H6DA 4H8IA 1LAFE 4ELRA 3PPPA 1LAHE 3B6WA 4F3SA 4DXBA 2R71A 3ILUB 3L6GA 3SETA 1B32A 3EHSA 2QMXA 1SDXA 5DEXA 4ESWA 4RPNA 3HHFA 1NH7A 2I3VA 3TKDA 4G8MA 4AQ4A 3RGYA 3MUQA 4GXSB 3IJOB 3KOTA 5DT6A 2VP1A 3IORA 4RJZA 5ITOA 3TZAA 1URDA 1ZIUA 2AL4A 5CBSA 1SI0A 4C1UA 1PC3A 4DLDA 3TFLA 4NTLA 3TELA 4EF2A 4KI0E 3IO6A 1SW1A 4MFIA 3ODBA 4XTCQ 5BWJA 5CBRA 1MM7A 1JVYA 1QUJA 4LP2B 5CI5A 1IITA 3VV5A 3VVFA 3G7WA 1WODA 3MZBA 1ZU0A 2HAUA 3LR1A 1CE2A 5DVJA 2XXYA 2DE4A 4BDRA 1FTMA 4U4SA 4C0RA 1OQHA 4G8HA 3LSXA 3U1OA 4XKQA 2DOJA 5I57B 3M3FA 1LB8A 4OFLA 3PUVE 4YB7A 4EQ9A 3IOWA 2F36A 3BKIB 2I6EA 4M4GA 4F19A 4YB6A 2DVZA 2D21A 1MPCA 4WXJA 4TQUQ 1HSLA 3DM0A 5H8FA 5CMBA 4FE8A 3S9LC 4ZZAA 3IO4A 5J1DA 1FQAA 4E0WA 2D3IA 1FQEA 4UACA 1SQYA 3MP6A 2HAVA 3EHUA 3H03A 3PUZE 2Q9TA 4YICA 3G3HA 2XX8A 2R6GE 4LQ5A 5EYFA 3PV0E 1MQGA 4H8JA 3CR9A 1MH3A 3C32A 4DXCA 1TT1A 3OD7A 1Y4TA 4YKPA 1EZPA 4MLVA 4OEUA 1SYIA 2DWIA 4G77A 3FXRA 5FHOA 5I56B 4G2ZA 2ALUA 4IO2A 3MQ9A 1PB8A 1I69A 1USYH 2RCAA 3A3CA 3RT8A 4PE5B 2O1LA 3FV1A 5CRYA 4GL8A 4H65A 4XKRA 2O69A 4ELQA 5I2KB 3PUYE 1MG1A 4GOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1R1NA 3FZVA 5F7VA 2DE2A 3IOUA 1LBYA 3SKPA 4YAHX 1P99A 5K2YA 3CI8A 4GBVA 4RYAA 1GTKA 1NMUA 1DTGA 2V3QA 5TP9B 1QGXA 3M8UA 3K6XA 3N6TA 1H45A 4QF9A 3MBPA 3T0JA 3GBAA 1M5BA 2AL5A 1B1XA 4HCWA 2F5XA 3GLBA 2QPQA 2OLBA 4IY5A 5DVIA 4PFBA 1IMFA 4Q0CA 1D9YA 3FD3A 4OANA 1A7LA 1AL3A 2I4BA 4NQ8A 3TCFA 4WEDA 2I48A 1SBPA 5KDTB 1BTJA 4KXPA 2F8DA 2XXWA 2NWJA 4NE4A 5KCJA 4KFQA 4PGNA 3N5LA 1AOVA 1QVSA 3KN3A 3SEVA 5JEIA 3KZGA 3TTMA 3OEMA 1YZ0A 4OA4A 1IMBA 3OEKA 3BFUA 3TTLA 1UIVA 4LQ2A 4WKMA 3SEXA 1N76A 4AS5A 2ZZWA 4HS7A 4O8MA 3QSLA 3MP1A 1H43A 1OMPA 4QFPA 3GBBA 3OELA 2QL3A 2HZKA 4GX3A 4P3LA 1FQDA 3ECRA 3IK6B 5AA2B 3H4ZA 2Y5KA 5LDZA 3MZ9A 4QSEA 3C36A 3D4GA 3UORA 4PGPA 2DXYA 3U72A 3IR1A 4LN5A 2AYSA 4PC9A 3DP6A 4NF8B 1POTA 4ZZEA 4PAFA 2UYFA 1SD3A 3MWBA 3O28A 2HPGA 2ZZVA 4HE0A 3TCHA 3H7MA 4KQPA 4N6KA 3KN8A 4E0XA 1B6HA 1NV2A 5AA1A 2PX1A 2RC8A 4I3EA 1B58A 1G0IA 4QFOA 2XD3A 4JVCA 4OFJA 4BLAA 2Q74A 2DWAA 4EF1A 1TWYA 4OVJA 5I2NB 3I3VA 3IX1A 1SI1A 2F7CA 2UVHA 1EH3A 1DK4A 4GWWA 4ESXA 1L5TA 4ZEBA 3G3FA 2B3FA 3CHGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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