4OZ9A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with isoleucine
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
426
structure length
424
Chain Sequence
PTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with isoleucine
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
total genus 143
structure length 424
sequence length 426
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oz9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oz9A02
1B5IA 1BP5A 4P0IA 3EN3A 2HAUA 2XXUA 2AL5A 3SEUA 3RUMA 1URGA 1O64A 3THIA 1B7HA 2RC9A 4LVQA 4MFIA 4C1UA 2O69A 5L8DA 2XXVA 4L17A 4BDNA 3VVFA 4GWOA 3SEVA 5KCJA 2X26A 3A09A 4RPNA 2IA4A 1VR5A 1BLFA 4F2OA 5I2NB 3VV5A 3MP1A 4H67A 4YB5A 2O7UA 2PBWA 4R74A 1Y4TA 1XVYA 3MC2A 4FORA 2NXOA 2OLBA 4GL8A 4OERA 3H06B 1A40A 4G8HA 2XXXA 2P0SA 3IL1B 4FECA 2DP8A 2I4CA 3PUWE 4C0RA 1OQHA 5I59A 3EHUA 2B3BA 3IORA 3CFXA 4OVJA 5I84A 5CMKA 2ANJA 2Z22A 3SDFA 1N0TA 3EQ1A 3LUYA 3ONMA 3ZKKA 4F1VA 5AE4A 4R9GA 2Y7IA 1JETA 3TUSA 2DSFA 4EQ7A 4HCWA 2GHBA 3M8UA 2O1MA 4G2ZA 3ZKLA 4X48A 1B32A 5KZTA 4Z0IA 1M5FA 4H5GA 4MBPA 1US5A 3VVDA 3Q28A 4YKIA 1SW5A 2QS3A 4BDQA 5CC2A 1LFIA 1QKAA 3ZSFA 5JEIA 3KJTA 3K6VA 1FQFA 3T9HB 5KCJB 3FVKA 2ABHA 1CB6A 1PBPA 1MG1A 1JVYA 4U4XA 4UA8A 1FTLA 2H4IA 2UVGA 3UORA 1BTJA 2GHAA 4XKNA 3L6GA 3FXUA 3K1MA 2A5SA 1FTOA 2ZMBA 3MAMA 1GTKA 3CSBA 5I59B 2XXIA 3UN6A 4XKPA 1Y20A 2Q2AA 3FATA 3LSWA 3B6TA 4DCXA 4H6DA 4RXLA 3TCHA 1PB9A 1SI0A 3PPQA 1N84A 2XXTA 3M3LA 4DCYA 5B70A 4R6YA 3JZJA 4QFLA 4HW8A 4QF9A 1ZTYA 4OESA 3S9EA 3HO7A 3PUXE 5TU0A 1GR2A 4X1BA 2YLNA 4F3GA 4NWCA 4FEDA 3FIRA 4YICA 2QMXA 3UA8A 3MPLA 4H1XA 1NNTA 4IO2A 2XX9A 1TFDA 3FD3A 1URSA 5DEXA 1T0KA 1XHYA 1RYOA 3QUJA 3U72A 3EF7A 3O28A 1NMUA 2XX7A 3OEMA 2KLFA 5AA3A 1M5BA 1HSLA 4BDMA 1EZOA 4OXVA 2Q2CA 3VLWA 1H76A 1JNFA 1B2HA 1P99A 3PMXA 2Z8EA 2QPQA 4H8JA 2XD2A 2Z8DA 3MVZA 3MQ9A 4FAJA 4TOZA 2XD3A 5JK4A 3V83A 4MLQA 4G8NA 3OENA 2F36A 3FXQA 3MUQA 3UIFA 3W9WA 2QS4A 4I1DA 1JW4A 3CIJA 3CG1A 1B3FA 2O7IA 3MZ1A 3K02A 2OJTA 1CE2A 3FJMA 3LSXA 3RT8A 1LAHE 5EHMA 1LB9A 1XS5A 4OYVA 5AA1A 4N6PA 1ZJLA 1B58A 4YMAA 3TKDA 3JV9A 1B3HA 1MS7A 4XIGQ 3W15C 5DEXB 3K00A 1WODA 4RA1A 4EF2A 1MQHA 4JWOA 1DOTA 3TTNA 4GFRA 5ICQA 1O7TA 1POY1 4ELRA 5F7VA 1LLSA 3O6HA 4ZS9A 1SI1A 3G3HA 3TPAA 4GIZA 1H43A 4QFOA 4O3CA 1D9VA 3O6GA 2Z23A 4ESWA 4WEPA 1IXCA 2VD3A 5I57A 4EUOA 3T22A 1MPBA 3TMGA 3U8QA 3CVGA 1OLCA 3T66A 4M4GA 4GOTA 1P1QA 3FJGA 3PPPA 3TDJA 3MWBA 3KGCA 2PT1A 1MDP1 4ELQA 1AMFA 3H7MA 3C31A 1ZKBA 3IO6A 1LAGE 4LP2B 3PGFA 3HN0A 3E3KA 5I58A 2DQVA 4R6HA 3WAFA 5CRYA 3KSXA 3IOTA 4YKJA 2G93A 1H3DA 1POTA 2XXHA 3G7WA 1SW2A 5HM4B 3PMVA 4I62A 4NF4B 4FE8A 1YCJA 3CRBA 3DM0A 5L9MA 3K6XA 3S9MC 4DXBA 2DWAA 5H8NA 2IEEA 3H6WA 3O66A 2HXWA 4OWDA 2D21A 2ONKE 4I8CA 4OETA 4OEVA 4Q8RA 3Q26A 1H45A 2UYFA 1FW0A 4BDRA 1MDQA 4ELPA 5CMBA 1MY1A 1QULA 5H8HA 3G3KA 4KCCA 3Q27A 2F35A 4Q5TA 1O63A 5I57B 1FTJA 1AH5A 2OZZA 2E1SA 1IITA 1MM7A 3WAEA 3TEPA 2PVUA 3RTWB 2HAVA 4HTGA 3OO8A 1A55A 3MVXA 1MRPA 2P1SA 3KG2A 1B5HA 2DE2A 1D4NA 2QRYA 3DLNA 4PP0A 3OD7A 4OFJA 5I58B 2F97A 1NFTA 2OWTA 3N6TA 2CZLA 4KFQA 1B05A 4GQOA 1NH8A 1MY0A 1FTKA 2ZYOA 4DIGA 3PUYE 3PU5A 5TPAA 3OELA 3IB2A 3SKPA 3S4UA 4R9FA 5H8NB 2NVUB 2NWJA 1PB7A 3EHTA 2QSXA 1ZIUA 4U21A 5KDTA 4JDFA 4LZ7A 2A5TA 1L5TA 2ONRA 1Z7NE 4OFOA 4QRZA 5H8HB 5HPQA 2D5WA 3OO6A 2YPNA 2I3WA 2O1LA 2O6AA 3BFUA 4LQ2A 2F78A 1AIVA 1N3WA 5CBRA 4QSDA 4FEBA 4XKQA 3MBPA 1US4A 3E13X 1R9LA 3K1PA 3H6TA 1UIUA 1QJMA 3K01A 2H5YA 1EZ9A 3RPWA 4WXJA 2DWJA 1P1OA 3K1NA 1NNKA 2AL4A 4OTEA 1QUJA 3K2DA 2I0BA 2PMSA 1ZBMA 2V93A 3SEYA 2YJPA 2Q89A 4E0XA 4LA9A 4WKMA 2Q8JA 2Y7PA 1XOCA 3A3UA 5ELVA 1SD3A 4RK9A 4AB6A 3RY3A 1WDNA 1MY2A 5JTYA 2GFEA 1B51A 5FTHA 5KDTB 3MZ9A 2A5TB 5J1DA 2QJEA 2DXRA 4O3BA 5ITPA 1N76A 1MXYA 1IQ7A 4NF8A 4R2BA 1DTGA 2BJJX 1IXGA 4X9TA 3BBRA 2X7QA 1BKAA 3EHSA 2REGA 3C35A 1YPNA 4UACA 2F7BA 4QSEA 2QMWA 1DPPA 4MF3A 2X7PA 4PFTA 2F7AA 2NOOA 3FV1A 4TLLB 5CI5A 4EQBA 1MY4A 3PUZE 2PT2A 2E0SA 3MJNA 4ZDMA 4OFLA 4U1OA 4ZEFA 5L9OA 3OMBA 2ALUA 3MZBA 4YMBA 1FQAA 2THIA 4G4PA 3KJ7A 3QAXA 3O6IA 1M5EA 5JTYB 4H5FA 3VLUA 2O84X 4NF6A 2FNCA 3SEWA 3IB1A 1LCTA 3H4ZA 1OMPA 2ZNSA 4QFKA 4JWYA 1SW4A 3SESA 4R75A 3Q29A 1JQFA 4ELOA 4NF8B 3T96B 1B4HA 4R72A 1NL5A 2F6PA 4Q30B 1A99A 4BDLA 4YU0A 4G8MA 1UQWA 2F34A 4ONYA 4K3FA 3D4GA 1DSNA 4R2FA 2XX8A 3VXCA 5CMMA 4NEDA 3EPEA 4THIA 1MPDA 4GVOA 5M2VA 3ZS6A 3LSLA 3U92A 1B52A 3D4CA 3KFMA 3TCFA 1F9BA 4PETA 1OVTA 4KYEA 3M3FA 1USYH 2RCAA 5I56A 2DYXA 5DVJA 3LC8A 3I5OA 4RYAA 4MLVA 1M5DA 4IY6A 4U1ZA 1LAFE 3JYRA 3CSGA 1UTBA 4KCDA 2V3QA 3LSFB 3N26A 2HZKA 2R9JA 1PC3A 1MY3A 1SW1A 4EXLA 1B46A 3MW0A 4NF6B 4F2QA 2M8CA 1QVSA 4QHQA 3MP8A 3HV1A 3KSJA 2AYSA 1B40A 3VVEA 3CR9A 2Y7RA 2ESNA 2VP1A 5HBCA 2I48A 2Y7WA 3ECRA 3KN7A 5F1QA 3I6VA 3FZVA 1IZ1A 3K4UA 3CFZA 2ZYNA 4EQ9A 1P1UA 1UIVA 1ZU0A 3KN3A 1KWHA 4POWA 5FHMA 2V84A 3FVGA 3QK6A 4FATA 4DLDA 1P1NA 4RK2A 4IO4A 2UXAA 1VFDA 3OO7A 1N3XA 3M3KA 5ITOA 1JW1A 2RC7A 4PQJA 3VDFA 5EYFA 5DT6A 4TQUQ 2DWIA 3G3JA 1YAEA 3F11A 3DP6A 4JSOA 4BDOA 4ZEKA 3K0VA 4GXAA 4F22A 2ZXTA 5I56B 3C36A 2VD2A 3MPKA 1A54A 1B0HA 4P0GA 4ECFA 2I0CA 4GLIA 1FCKA 1FQEA 1SDXA 2CMOA 3CG3A 1MQJA 2B65A 4I9DA 4N07A 3G3IA 2I58A 4XXUA 4OHNA 3MVWA 5AA2A 1MXXA 3ODBA 3O29A 1Y9UA 4WEDA 3SERA 4RPOA 3HSTA 4DXUA 1DPEA 1MQGA 4U4SA 4IGTA 3TZAA 5I2KA 5A5XA 3KOTA 3TTMA 2P2AA 1MQIA 4RJZA 4GD5A 3H3GA 2GH9A 4FJPA 1IIWA 4IB2A 1JEVA 3C9HA 3V89B 1MH3A 4KYSA 4DXCA 1LAXA 1XT8A 1HSJA 2DXYA 2DWHA 3IO4A 3HPIA 5IKBA 2Q88A 1LBCA 3G3FA 3H6VA 4YZZA 3FUZA 3PUVE 3GBAA 3T9VA 5DVIA 3IB0A 2VHAA 1MPCA 3FXRA 1ZLQA 3RTFB 4U2RA 1VFEA 1MXVA 4F18A 1B4ZA 2XXPA 3C33A 2XXRA 2VOZA 5B7DA 2F6GA 1BIYA 4ZEIA 1Y1ZA 3RQTA 2AIXA 3KN8A 4KHZE 3TTLA 2R6GE 5CM6A 2DE4A 3U93A 5TP9A 4OQOA 1TFAA 3Q25A 3P7IA 3RGYA 3OXNA 5AA2B 2O51A 3PPNA 2V3UA 4F3BA 3TTRA 4LONB 4IO6A 4ZE8A 3KEIA 3FASA 1Y1MA 2ZNUA 5I2KB 4TLMB 3IAZA 5A5XB 1MXUA 2F5XA 1SBPA 3W9VA 4ZZEA 3MP6A 2UVHA 3VE1B 2H98A 4NWDA 2O68A 3DP4A 4GXSB 3OEKA 4F1UA 1VSOA 4YKPA 4KPTA 1IEJA 2HCAA 4N13A 1D9YA 3KBRA 1OIBA 2ONSA 1Q1KA 3E4RA 4IO5A 3R6UA 1RYXA 2HFBA 2UVIA 3B7DA 4YB6A 5H8SA 4ZZAA 1OQGA 3PD8A 1R9QA 1PB8A 1LFHA 1YTVA 2RC8A 3FGSA 3CI8A 4IY5A 1XVXA 4ND9A 1HSEA 3FJ7A 1SQYA 2QS1A 3N5LA 3BFTA 2I49A 1EH3A 1URDA 4NTLA 3K6WA 3H6UA 1IUDA 4GL0A 4X1DA 3QIMA 4PFUA 5TP9B 1B5JA 2XXQA 4OENA 1JEUA 1S7YA 2DS9A 3FV2A 3K6UA 2OBGA 1GV8A 2UVJA 4P11A 2DOJA 3N94A 4OMBA 1A8EA 4ESXA 2PX1A 2FA7A 3HHFA 1B3GA 2HEUA 2OCUA 1DTZA 4G68C 3KOSA 3HCQA 5TPAB 3FVNA 3SEXA 1FQBA 1B7UA 3QSLA 1I6QA 1FQDA 4IO7A 2D3IA 2Q9TA 2XHDA 2Y84A 4YKKA 5AA2D 1I69A 5BWJA 4R6KA 3R7XA 1Y3QA 1IXHA 1FTMA 1Y4CA 4EDPA 3AXFA 1ANFA 1Y3PA 3IK6B 4F31B 3ILUB 2DE3A 1OVBA 4NMYA 3IR1A 1QKBA 2UYEA 1OLAA 4G68A 3T93B 1I6AA 1B1HA 1B3EA 4F3SA 1B0LA 1AOVA 3V8XB 5DTBA 4QFNA 3C4MA 1N04A 3QYTA 3UK4A 5BUUA 3T9XB 3LBSA 4BLAA 4LUBA 1S50A 5AA4A 2REJA 2DVCA 4JXIA 4C1TA 4LATA 3OSQA 1MH4A 1ELJA 1P1WA 3TQWA 4KYDA 3USDA 1M5CA 2HZLA 4PE5B 4U22A 4DE8A 1B1XA 1GGGA 3DELB 4JWXA 1R1NA 2RKMA 4LZ5A 4LZ8A 3VLVA 1SYIA 2GRVA 3BKIB 4JB7A 3TYHA 2LAOA 1NH7A 3C32A 4PFYA 5K2YA 3U1OA 4DDDA 4KD5A 2V25A 5FTIA 4NF5A 4Q0CA 3MVYA 2QL3A 3H03A 2I3VA 3S9NC 2ZYMA 1MXZA 4PFWA 2XXYA 1II5A 4U23A 1PEBA 3RN8A 4XTCQ 1NNFA 2F8DA 2RCBA 4IGRA 2PYYA 1J1NA 3PPOA 4G68B 3UP9A 4HS7A 2Z8FA 2XXWA 3OOAA 1UTHA 4QFPA 1LBBA 4KQPA 5AA4B 3SETA 1TT1A 1TWYA 2F7CA 2NUVA 4RY1A 3QXMA 3A3CA 2W7YA 4DZ1A 5ISUA 3GZGA 3LR1A 1S9TA 1WVJA 3G3GA 3IX1A 3GXAA 3C34A 1NNPA 4F1YA 1SVXB 4OEUA 5H8FA 3PD9A 1LGBC 3V5AA 1JW5A 3DP8A 5FHOA 4H0WA 4JBZA 3TFLA 4HCYA 3L6HA 3KZGA 3TTKA 1Q35A 2H99A 4NF5B 3S2VA 1SYHA 2Y7KA 3PV0E 3TELA 4H8IA 1R6ZA 3RT6B 1B9JA 4ZE9A 2ZYKA 3OSRA 4ZEBA 5LOMA 4NF4A 2VGQA 1H44A 1LB8A 3I3VA 4RNSA 2HQ0A 4EF1A 1A7LA 1N7XA 3IOUA 3IJXB 3T9UA 5FHNA 2OWSA 4E0WA 4F29A 2H9BA 1B6HA 4O3AA 4F3PA 4R73A 1JVXA 3FVOA 3IOWA 1LSTA 4M1VA 5DYHA 1UTHB 4POXA 2DVZA 3RLFE 2ZNTA 4AQ4A 1Z7ME 3O9PA 1B3LA 2B3FA 1TXFA 4LQ5A 2RINA 4YB7A 1UTBB 3E9XA 4GRKA 1XC1A 3TODA 3GBBA 5H8QA 4F19A 4JSDA 3TQLA 2I4BA 1N7WA 1QW0A 5DVFA 3B6QA 5H8FB 3IJOB 3ILTB 1EU8A 4ISUA 1LCFA 3OO9A 1GVCA 1ZMGA 3HHGA 2R71A 3UGWA 1MQDA 1MXWA 3PMWA 3O97A 4KI0E 3O2AA 2RF1A 3VFJA 1DMBA 1ATGA 4GF8A 3IOVA 3TCGA 4IO3A 1QUKA 2G29A 3U94A 3TAJA 3VXBA 4OZ9A 4G77A 4ZEDA 1I6BA 4H65A 3CFLA 1FQCA 2QS2A 2WKYA 3N6UA 1VE4A 1PDAA 3RNNA 4NE4A 2I6EA 5I2NA 1IXIA 5L9SA 4ZECA 4KR5A 1NKXA 5K2XA 5CBSA 2FYIA 5EHSA 1RKMA 1PBQA 1MM6A 3PPRA 1D3KA 4FIMA 1QUIA 5H8QB 1LFGA 1EZPA 4EXKA 5ICTA 2V3TA 1Y3NA 4Z7EA 3B6WA 3GLBA 2OK2A 4QSCA 4F39A 3S9LC 1A8FA 1B7ZA 4XKRA 1USYE 5IAIA 5CMCA 4MH5A 2H25A 4YAHX 3QUFA 1AL3A 3R26A 4AB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B5IA 1BP5A 4P0IA 3EN3A 2HAUA 2XXUA 4GWZA 2AL5A 3SEUA 3RUMA 1URGA 2QVUA 1O64A 2QVRA 3THIA 4N8GA 1B7HA 4AS4A 2RC9A 4LVQA 1IMCA 4MFIA 4C1UA 2O69A 5L8DA 2XXVA 3RYDA 4L17A 4BDNA 3VVFA 4GWOA 3SEVA 5KCJA 2X26A 3A09A 4RPNA 2IA4A 4MHFA 1VR5A 1BLFA 4F2OA 1FPFA 5I2NB 3VV5A 3MP1A 4H67A 4YB5A 2O7UA 2PBWA 4R74A 1Y4TA 1XVYA 3MC2A 4FORA 2NXOA 2OLBA 4GL8A 4OERA 3H06B 1A40A 1IMAA 4G8HA 2XXXA 2P0SA 3IL1B 4FECA 2DP8A 2I4CA 3PUWE 4C0RA 1FPLA 1Q9DA 2WEFA 1OQHA 2FHYA 5I59A 3EHUA 2B3BA 3IORA 3CFXA 4OVJA 5I84A 5CMKA 2ANJA 2Z22A 4GX6A 1BK4A 3SDFA 2ZZVA 1N0TA 3EQ1A 3LUYA 3ONMA 2Q74A 3ZKKA 4F1VA 5AE4A 4R9GA 1IMEA 2Y7IA 1JETA 3TUSA 2DSFA 4EQ7A 4HCWA 2GHBA 3M8UA 2O1MA 2PFYA 2VPNA 4G2ZA 3ZKLA 3MSTA 4X48A 1B32A 5KZTA 4Z0IA 1M5FA 4H5GA 3NOHA 4MBPA 1US5A 3VVDA 1G0IA 3Q28A 4PCDA 4YKIA 1IMFA 1SW5A 2QS3A 4BDQA 5CC2A 4OVSA 1LFIA 4I40A 1QKAA 3ZSFA 5JEIA 3KJTA 3K6VA 5IGAA 1FQFA 5ET6A 3T9HB 5KCJB 2XWOA 3FVKA 2ABHA 1CB6A 1PBPA 2FIEA 1NUXA 1MG1A 1JVYA 4XF5A 4U4XA 4UA8A 1FTLA 4OVPA 2H4IA 2UVGA 3UORA 1BTJA 2GHAA 4XKNA 4P1LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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