2Y7KA

Dntr inducer binding domain in complex with salicylate. monoclinic crystal form
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
DPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFTELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Crystal Structures of Dntr Inducer Binding Domains in Complex with Salicylate Offer Insights Into the Activation of Lysr-Type Transcriptional Regulators.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp. dnt
total genus 69
structure length 211
sequence length 211
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7kA02
5CI5A 4JWXA 2VOZA 2RC7A 1N3WA 2QL3A 1MDP1 1FQBA 3FJ7A 4KQPA 2I4BA 1D3KA 2H5YA 5EHMA 4QFKA 3K6UA 4NWDA 4YKIA 1BKAA 4P0IA 4R6KA 4OERA 5I58B 3JZJA 1DTGA 2B3FA 4F2OA 2HAUA 1IEJA 1F9BA 1M5BA 4GLIA 4U21A 3RGYA 1FW0A 4ZZEA 3OELA 3EHUA 1SW4A 3TAJA 1ZMGA 3TPAA 4HTGA 2DVZA 4G68A 2UVHA 3TTMA 1WODA 5JEIA 1PB7A 3W9VA 3MVXA 4IY6A 2AYSA 2GHAA 4M4GA 3EHSA 3G3FA 3G3GA 4FORA 1ELJA 3B6WA 3DM0A 1Y3QA 4F29A 3HO7A 2VP1A 2XX8A 3H7MA 3PMVA 3G3IA 5I56B 4LZ7A 1SBPA 4RK9A 1B5IA 2CZLA 3G7WA 2DOJA 4XKQA 1FQAA 4MLQA 4JSOA 4H8JA 3RQTA 2NVUB 3OO8A 1UTBA 1PEBA 1HSLA 3UA8A 1MXWA 3W9WA 1JEVA 1QUKA 3RY3A 2Y7WA 4MH5A 2XXWA 3D4GA 1LAFE 4RPNA 2G93A 4OXVA 4F2QA 1HSJA 3M3LA 2QSXA 3T9XB 2ZXTA 5M2VA 3G3JA 4QSDA 3H6VA 4XKRA 1DMBA 2O1MA 3G3HA 1B2HA 4QSEA 2DS9A 1USYE 2REJA 4X1BA 2OCUA 4RA1A 1AH5A 2DYXA 5H8NA 2RC8A 2X7PA 3BFUA 3U8QA 2IA4A 4U23A 4F19A 4R74A 3AXFA 3VVDA 4WXJA 1WVJA 3C4MA 3S9MC 4G68B 2Q9TA 3N6TA 4EQBA 1LB8A 3RLFE 3C32A 4OVJA 4IO7A 3TODA 4DXCA 3QSLA 1DOTA 3S9EA 3UIFA 1Y3NA 2YLNA 2PYYA 3ILTB 3TEPA 5KCJA 1OLCA 1B4ZA 1FQDA 3VLWA 1LCTA 1P1OA 1B3GA 2OBGA 5HPQA 1FCKA 4Q0CA 1ZLQA 1UTBB 2E1SA 3W15C 4AQ4A 3CR9A 5HBCA 2LAOA 2Q88A 3KN3A 4Q30B 3DELB 1LAHE 4NMYA 3N5LA 2DVCA 1LAGE 3O29A 3IORA 3K00A 2ZYOA 3K2DA 1MXXA 4R6YA 3T9HB 4NE4A 1MH4A 5DTBA 4YAHX 1B3HA 2R6GE 3QK6A 5KZTA 3WAFA 2O51A 2F7CA 1IXGA 4KPTA 3O66A 3M3FA 3P7IA 3FVGA 1JW1A 1LCFA 3L6HA 1B5JA 3IOWA 1XOCA 4FECA 3SESA 1N84A 3C36A 5ICTA 3TCFA 4ZE8A 1EZ9A 1GTKA 4R72A 4BLAA 2V3QA 1MQIA 4OENA 1GVCA 4O3AA 4OWDA 1PC3A 4GVOA 3PPRA 1S9TA 4DZ1A 1ZJLA 1ANFA 2F6GA 4YKJA 3FXRA 2Q8JA 3GBBA 1ATGA 5KCJB 3C9HA 1B3LA 4OFJA 4LONB 4DXBA 4OEUA 3IOVA 2OLBA 1B3FA 3TMGA 3FXUA 2Z8DA 3HSTA 2UVJA 2ZYKA 3ODBA 3O6HA 1XC1A 1BTJA 1MXVA 4ZEKA 4EF1A 2F78A 3OO9A 3FATA 4EDPA 3MC2A 2ONKE 3Q25A 2VGQA 1N7WA 3H03A 3RT8A 1NL5A 3HHGA 3FGSA 3FV2A 1M5FA 4LA9A 2OK2A 1VFDA 3H6UA 5B70A 1MY0A 2QS1A 1B51A 5LOMA 3TFLA 3A3CA 1YPNA 5CRYA 1FQFA 1MXYA 3FVOA 3MQ9A 4PE5B 1A54A 4C0RA 3FD3A 2X26A 3VFJA 1RYXA 2QS3A 4FIMA 4JBZA 3TCGA 3Q28A 3CFLA 1UTHA 5H8FA 1JETA 5L9MA 2XXUA 1FTMA 3FJMA 2XX7A 4ZEBA 2HEUA 4KI0E 4ZDMA 2ZNUA 5FTHA 3FV1A 4NF8A 1R6ZA 2DE2A 1YAEA 1FQCA 2UYEA 2ABHA 2F97A 2FNCA 5IKBA 1XVXA 2NUVA 5B7DA 3DP4A 5DYHA 1MPCA 2V93A 1OQHA 3PD9A 2B3BA 3PUVE 4PETA 4NF5A 4QHQA 3D4CA 2AL4A 3CIJA 3QYTA 2Y7PA 3EHTA 3FJGA 4TLLB 1D9VA 4ECFA 4C1UA 2ZNSA 4NWCA 4EQ9A 1Y4CA 3UK4A 3PU5A 3VLVA 4YMBA 1A40A 5KDTB 2QPQA 2RINA 1A99A 2O68A 1MS7A 4P0GA 3PUXE 3K01A 5L9OA 1P1WA 3KJTA 1B0LA 1QUIA 2H99A 3B7DA 1MM7A 3QXMA 1O63A 4ZEIA 3MVYA 2VD3A 4F31B 1LB9A 2QMWA 4XTCQ 3OEKA 4YICA 1AIVA 4F18A 1TXFA 2HCAA 3TQWA 3B6TA 3T66A 3MAMA 2F5XA 3VE1B 3CVGA 3VV5A 5CMKA 3O6GA 2ONRA 1UTHB 5H8FB 4R6HA 1VSOA 4G8HA 4TOZA 1P99A 4RY1A 1RYOA 4U1ZA 2ESNA 4H67A 2PBWA 2DE3A 2I48A 2DE4A 3LBSA 1I69A 5JK4A 1BP5A 4AB6A 3IR1A 4GL8A 4NF8B 4DCYA 4HCYA 2HZLA 2P1SA 2Z22A 2REGA 4E0XA 1UIUA 4GRKA 4IO4A 3GBAA 2XD3A 3JV9A 5CMBA 4YU0A 3HHFA 2A5SA 4JB7A 2F6PA 4NF5B 4F1YA 4BDRA 3RN8A 3CSBA 2XXYA 3SEWA 3T9VA 4ZECA 5CMMA 4GWOA 4U1OA 1LFHA 3OEMA 4QRZA 2NWJA 3OSRA 2HZKA 3OO7A 2PX1A 2Y84A 1DTZA 2OZZA 5L9SA 2I0CA 5I57A 3V5AA 2Q2AA 1NFTA 2FYIA 5HM4B 4POXA 1H45A 1MY4A 3FUZA 2PMSA 2P2AA 4MFIA 4NEDA 4YB7A 2XXIA 1MQGA 2PVUA 1Y1ZA 4KYDA 3ECRA 1SW5A 1MXZA 5CMCA 4OQOA 5I84A 5ITPA 3V89B 4LZ5A 3S9LC 3KOTA 4AB5A 5FHNA 4H6DA 2GH9A 1ZIUA 1IZ1A 4R73A 3IJOB 4H0WA 3N6UA 4OFOA 3SEUA 1FTLA 5ELVA 1XS5A 3OENA 4PFTA 1TWYA 3K02A 4UACA 1B6HA 3PPOA 4MBPA 2Y7IA 3IOUA 4QFLA 3T96B 4GXSB 2H9BA 4KFQA 1LBCA 4LUBA 3EN3A 3KSXA 2DQVA 4BDQA 4IGTA 2GRVA 1URDA 1SYIA 3TDJA 2XX9A 3C33A 3VVFA 4JXIA 5FHOA 3KFMA 4R2BA 3O6IA 2Z8EA 2I3VA 1MH3A 3IB0A 3EQ1A 1OQGA 2G29A 4H8IA 1Y20A 1B7UA 4F39A 3KGCA 5I57B 3FZVA 2R71A 1BLFA 4OESA 1LBBA 2YPNA 5A5XA 5CBRA 1SQYA 2XXRA 3KJ7A 1B05A 1AL3A 1JVYA 5K2XA 3R26A 1OVTA 1QUJA 3ZKLA 1QKBA 4YB6A 4GFRA 3IO4A 4U4XA 5JTYA 1I6QA 1URSA 2QRYA 2WKYA 2W7YA 3A09A 4LZ8A 1A8FA 1ZKBA 5CM6A 2XXHA 4H65A 2F8DA 4OHNA 1AOVA 1IQ7A 2Z8FA 4H5GA 4FATA 1B3EA 4KCDA 2GHBA 3VXCA 1SD3A 1NH7A 1IXHA 1LFIA 3OD7A 4GQOA 5AA2D 4U2RA 1TFDA 3E4RA 2ALUA 2DXYA 1MQJA 3LSLA 1B0HA 3GXAA 3LC8A 3ONMA 1FTKA 3T93B 2OJTA 3PMXA 5H8NB 2E0SA 4R75A 2IEEA 3HPIA 3U1OA 4ESXA 5F7VA 4OZ9A 1LLSA 3TYHA 4GIZA 2XHDA 1Z7NE 3USDA 3ZKKA 4HS7A 1GR2A 1DPEA 2RCAA 2OWSA 3IAZA 4KYEA 2DWJA 5DEXA 3Q29A 3LUYA 2AIXA 1MPDA 1POY1 5TP9A 1LGBC 2RC9A 3A3UA 1NMUA 3S2VA 4IO5A 3OMBA 5A5XB 3PPNA 4N13A 4YKPA 5ICQA 3H6WA 4PFYA 3OXNA 4Z0IA 2ZMBA 1TFAA 4DXUA 1IIWA 5CBSA 3FIRA 3SETA 5JTYB 2BJJX 3QIMA 3MPLA 3O9PA 1BIYA 5EYFA 4BDNA 1XT8A 4FE8A 4IO6A 3SEVA 1JW4A 4POWA 4EF2A 1EU8A 4EUOA 2A5TA 1A7LA 3DP8A 4C1TA 3OSQA 3PUWE 1NNPA 3E3KA 4LATA 1SW2A 3SEYA 3WAEA 3O2AA 5EHSA 1B58A 1UIVA 3QAXA 1DPPA 1WDNA 1HSEA 4U4SA 4GXAA 1B7ZA 3IB2A 1Y3PA 3GLBA 1PDAA 2DSFA 3VDFA 4BDOA 1MDQA 3K6WA 1SDXA 5TP9B 3TTNA 3RUMA 1N04A 3UORA 1P1NA 4ZZAA 1B1XA 4I62A 1S50A 3BBRA 4TLMB 1GV8A 4GF8A 3LSWA 3TTRA 2HQ0A 2V3TA 4PFUA 5TU0A 4F3SA 5F1QA 3R7XA 4OTEA 2YJPA 1NH8A 4TQUQ 1N3XA 1R1NA 4G68C 1B1HA 3C35A 1MM6A 4NTLA 4N07A 5ISUA 1NNTA 1IXIA 2I6EA 4JWOA 3KBRA 1SW1A 4XIGQ 1MXUA 5J1DA 3K4UA 3UN6A 5I59A 1LFGA 1US5A 4LP2B 1LSTA 3K0VA 1MQDA 4H5FA 4OMBA 3TCHA 4DIGA 4PP0A 3RNNA 2I3WA 3PUYE 3ZS6A 1LAXA 2UVGA 2HFBA 3H3GA 3JYRA 1R9LA 2V84A 4WEDA 1FTJA 2F7AA 4EXKA 1VE4A 3CG3A 5DVFA 4M1VA 2UVIA 2D21A 2V3UA 2XD2A 3MZBA 3PUZE 1CB6A 2RF1A 1JVXA 2B65A 4LQ5A 3TZAA 5FTIA 1XVYA 4MLVA 3L6GA 3U72A 1NNKA 4IB2A 4DE8A 2Q2CA 3TQLA 4FJPA 1H3DA 4RXLA 5H8HA 3TKDA 2Y7KA 4KD5A 1PB8A 2THIA 3M3KA 5BWJA 1B46A 4F1UA 1L5TA 1J1NA 3MVZA 2F34A 3T22A 2RKMA 4KR5A 4DCXA 5AA1A 5L8DA 2QMXA 1RKMA 2Y7RA 2DWAA 3UGWA 3CFZA 3K1NA 1I6BA 3EPEA 4X9TA 5AA4A 2NXOA 1Q1KA 3LSFB 1N76A 2DWIA 4G8MA 2ANJA 3SKPA 3I3VA 1A55A 3R6UA 2OWTA 2DWHA 3V8XB 4I8CA 4NF4A 3MJNA 2CMOA 4JDFA 2F36A 4IY5A 4DDDA 3G3KA 5IAIA 2ZYNA 5I59B 2XXVA 3H6TA 1FQEA 1N0TA 3E13X 3ZSFA 5I2NA 4H1XA 2ZNTA 1MY1A 1MQHA 4IO2A 2VHAA 3N94A 2XXTA 3C31A 3B6QA 1MY2A 4XXUA 1B32A 2XXQA 4ONYA 2ONSA 2X7QA 3Q27A 1D9YA 2GFEA 4OEVA 5H8HB 4OFLA 4GD5A 3N26A 4ND9A 3Q26A 1MRPA 1CE2A 3IK6B 3LR1A 3F11A 1QJMA 2R9JA 4BDMA 1POTA 4F1VA 1O64A 1EH3A 1OLAA 3U94A 1QULA 4WEPA 3H06B 4XKNA 1M5EA 5AA4B 1Z7ME 3KEIA 3OO6A 4QFPA 1IITA 3MVWA 4FEBA 1OIBA 3PV0E 2QJEA 3MZ1A 1SVXB 4KHZE 4NF4B 1B7HA 1EZPA 3MP1A 4THIA 2PT2A 3H4ZA 4RJZA 3K1MA 4P11A 4YKKA 3KSJA 4ZS9A 2P0SA 1PBPA 1US4A 4F3BA 2O6AA 1T0KA 2V25A 4K3FA 3MZ9A 3SEXA 5I2NB 2O7UA 1D4NA 4G4PA 1B5HA 1JQFA 4E0WA 2I4CA 5DVIA 4WKMA 4I9DA 2M8CA 2O1LA 4MF3A 4QFNA 3PPPA 2D3IA 2F35A 3IB1A 1H44A 1B9JA 1MG1A 1M5DA 4JSDA 3E9XA 4R2FA 4HCWA 5TPAA 1SI1A 1JEUA 3MPKA 2RCBA 1GGGA 3CSGA 4LVQA 4Q5TA 2ZYMA 3K6XA 3U93A 1IUDA 3KN8A 4EQ7A 4ESWA 3MP6A 3RT6B 1JNFA 2HXWA 2AL5A 2VD2A 4F3GA 1ZU0A 2I49A 3O28A 4PQJA 5DT6A 3BFTA 4JWYA 2D5WA 5AA2A 3FVKA 2NOOA 3V83A 2F7BA 1URGA 1B4HA 1DSNA 4L17A 4IO3A 5CC2A 4IGRA 3K6VA 2UYFA 3BKIB 1B40A 2PT1A 1P1QA 1TT1A 3QUJA 5K2YA 3UP9A 4ELOA 4UA8A 1NNFA 3MWBA 5ITOA 4QF9A 3GZGA 1UQWA 5AA3A 4RPOA 4U22A 3FASA 3O97A 4ZEDA 2I0BA 3CG1A 1Y4TA 3IO6A 2QS4A 4PFWA 3PMWA 4GL0A 2DP8A 1Y9UA 3CI8A 4LQ2A 2Z23A 1OVBA 1I6AA 2XXPA 5TPAB 4KYSA 3FXQA 3DLNA 3PGFA 1AMFA 4G77A 3S4UA 5FHMA 3CRBA 4F3PA 3IOTA 4G8NA 1VFEA 1KWHA 4ZE9A 4Z7EA 3ILUB 4ELRA 5H8QA 1PBQA 1H76A 3OOAA 3U92A 4YMAA 1QW0A 5AA2B 1YCJA 5KDTA 3MUQA 1P1UA 1FTOA 4EXLA 2DXRA 4XKPA 1H43A 1YTVA 4OETA 4NF6A 4G2ZA 5DEXB 4I1DA 1QKAA 3MP8A 1R9QA 3C34A 1SYHA 1VR5A 3TELA 2UXAA 4DLDA 3KN7A 3SERA 4R9GA 4RNSA 1S7YA 4O3BA 1OMPA 3MW0A 1B52A 2Q89A 4BDLA 1EZOA 3TTLA 3FVNA 3RTWB 2HAVA 5I2KA 4X1DA 4FAJA 1IXCA 4RK2A 1ZTYA 2O7IA 1II5A 3I5OA 3CFXA 1SI0A 3T9UA 4QSCA 2H98A 3IL1B 3KOSA 3RTFB 2XXXA 4X48A 3QUFA 4YB5A 3PD8A 2A5TB 4ISUA 5H8SA 3THIA 3S9NC 1M5CA 4ELQA 5I58A 4ZEFA 1ZBMA 1MPBA 4R9FA 5H8QB 5AE4A 4YZZA 4FEDA 1Q35A 4QFOA 4F22A 5DVJA 4ELPA 3TTKA 1PB9A 3K1PA 4HW8A 1QVSA 3HV1A 3KG2A 1Y1MA 2H25A 3IJXB 3I6VA 4RYAA 3PPQA 2H4IA 1USYH 1XHYA 4NF6B 3M8UA 4Q8RA 1MY3A 3HCQA 3HN0A 3EF7A 1JW5A 5I56A 4N6PA 3RPWA 2O69A 3VVEA 2I58A 4OYVA 3KZGA 3DP6A 3MBPA 5BUUA 4O3CA 3VXBA 3TUSA 2QS2A 1O7TA 2O84X 3SDFA 4KCCA 3LSXA 4GOTA 3VLUA 1A8EA 3IX1A 1NKXA 5I2KB 2FA7A 1N7XA 2KLFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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