2Y7KA

Dntr inducer binding domain in complex with salicylate. monoclinic crystal form
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
DPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFTELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Crystal Structures of Dntr Inducer Binding Domains in Complex with Salicylate Offer Insights Into the Activation of Lysr-Type Transcriptional Regulators.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp. dnt
total genus 69
structure length 211
sequence length 211
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7kA02
2Z8DA 4MH5A 1H43A 4EDPA 4IGRA 3MAMA 1LB9A 2RKMA 3UN6A 2X7QA 1YTVA 2QPQA 1PEBA 2ZYKA 3MZBA 4U23A 1H44A 2BJJX 2XX7A 4P0GA 4G4PA 3C31A 2DSFA 3VFJA 2DXYA 4YKKA 2FYIA 2GHAA 1FTMA 3SDFA 4MFIA 2PBWA 4YB6A 3QAXA 2ZNTA 3TQLA 4K3FA 4H8JA 4OETA 4G68C 2O68A 3FASA 2XXUA 2PX1A 2V84A 3TAJA 3IOTA 1XOCA 2Z8EA 1LAHE 3MUQA 1GV8A 1I6AA 5AA2D 4IY6A 1POY1 4WEPA 5AA3A 4ESWA 5CMBA 4G68A 1MXVA 5CMCA 1XHYA 2YPNA 3A3CA 1A7LA 4DCYA 1B52A 3S2VA 4XTCQ 3P7IA 2Q89A 4EQ9A 4H65A 1MXXA 3EN3A 2UYEA 4Q0CA 3U94A 4XIGQ 4KYEA 3Q27A 2F5XA 1QULA 1GR2A 3TDJA 4FATA 4BDRA 3KG2A 1R6ZA 4IO3A 1I69A 3QUJA 3ZS6A 1J1NA 1FQCA 5DVJA 3RN8A 2G93A 3T9HB 3CG1A 1DMBA 3H4ZA 4EF2A 3O29A 2ANJA 1JNFA 3IB2A 3IJXB 3EF7A 3IX1A 3H3GA 4JWXA 1SBPA 4BDOA 5TU0A 3DP4A 3ILUB 1NNTA 2I4BA 3PPPA 3LUYA 1LAXA 4OYVA 1LCFA 3O6IA 3TCGA 4GL0A 4LVQA 3ZKLA 5JTYB 4N13A 3DLNA 1B46A 3OO9A 3SEVA 5IAIA 3C36A 5BWJA 5JK4A 3TYHA 1I6BA 3VVFA 4NF8B 1B5JA 5FHOA 1MQDA 5I56A 3M8UA 4QFPA 2XX9A 2X7PA 4NWDA 1PC3A 3KN3A 4EF1A 3D4GA 3EHTA 1VFEA 1CB6A 1M5EA 1HSEA 5AE4A 4I62A 2IA4A 3EQ1A 2R9JA 1URDA 2FNCA 1USYH 1WDNA 4OESA 3PV0E 4JB7A 2NXOA 3TTNA 1TWYA 3T22A 2PMSA 4DXUA 1Q1KA 2VD3A 4C0RA 4H1XA 4G2ZA 3S9EA 3QK6A 2AYSA 3IOVA 2HCAA 4N07A 2RINA 3CVGA 3IORA 1WVJA 2I0CA 2QRYA 1LAFE 3MPKA 2DWIA 3O66A 1GGGA 1PB7A 3ECRA 5K2YA 3CSGA 2ZNUA 4R6HA 5ICQA 1NH8A 1H45A 2CMOA 3UORA 3HN0A 1MH3A 5I2KB 2Z22A 1XVYA 1B6HA 3PD8A 2F7CA 5ICTA 3KSJA 5I58A 4G77A 5DVFA 4EUOA 3A09A 2B3BA 3S9MC 3PPNA 3QYTA 5CC2A 1RKMA 3IAZA 3TFLA 1FTKA 4Q30B 2R71A 3V5AA 1D9YA 5ISUA 1LBCA 4BLAA 3THIA 1Z7NE 4GXSB 1Y4CA 2DE2A 1TXFA 3WAEA 3PMWA 1UTHB 2QS3A 1MXWA 4RA1A 1N3WA 4FAJA 5H8NA 4DDDA 1SW5A 5DEXA 3PMVA 3N26A 3N6TA 1HSLA 1S7YA 3BFTA 1Q35A 3FJGA 1FCKA 2QL3A 3MVXA 4XXUA 5B7DA 3KN7A 2FA7A 3OSQA 4ZS9A 4ISUA 2W7YA 1NFTA 4QF9A 3OD7A 2VHAA 3TPAA 2O69A 3G3JA 5H8FA 2CZLA 4EXLA 3MC2A 2F8DA 2RCBA 3RUMA 4OQOA 3SERA 3S9NC 3FUZA 2I6EA 2XXPA 3G3FA 3LSXA 5TPAA 5H8SA 3OENA 3FVOA 3N5LA 4DZ1A 5CMKA 4NTLA 3MBPA 5H8HB 3OEKA 3VE1B 4ZEIA 1ZU0A 2QJEA 3TEPA 3JV9A 5M2VA 2A5SA 1B3LA 3C34A 5L9SA 2NUVA 1KWHA 3IO4A 3VVDA 3ILTB 2X26A 4KCCA 5HBCA 4H8IA 4H5FA 1OLCA 2OJTA 1M5FA 4QSCA 3Q25A 3IB1A 3TUSA 1HSJA 3LBSA 2I3WA 1R1NA 3KEIA 1DOTA 2ESNA 2GRVA 3I6VA 3FD3A 4OFLA 1QUKA 2QS4A 2XHDA 3PGFA 5TP9B 2PT2A 4DXBA 4KD5A 5CBSA 1O64A 4E0WA 1NL5A 3TCFA 3UGWA 2H9BA 4F3SA 4ZDMA 4EQBA 4NF6A 3C4MA 1QVSA 2HEUA 1NH7A 3FJMA 3HSTA 4QFLA 1OMPA 4FEBA 5AA4B 3T9VA 1AL3A 4GRKA 4JBZA 3PPRA 1N3XA 3MZ9A 2F7BA 3CFXA 2Y7KA 1Y9UA 1A99A 2DWJA 2ABHA 4F3GA 2AL5A 4Z0IA 1UTBB 2A5TA 1MM7A 2F7AA 1B05A 3U1OA 4DIGA 3VVEA 4NMYA 1PBPA 4H5GA 4OTEA 3OO7A 2PT1A 3H6VA 3U72A 4TQUQ 3IO6A 3E3KA 3K1PA 2KLFA 3H03A 4YMBA 3SKPA 5FHNA 3K0VA 1Y20A 3RPWA 1IZ1A 1FTJA 2F34A 4UACA 4DE8A 2Y7WA 4GQOA 2F35A 4R2BA 2DP8A 1AH5A 1VSOA 5L9MA 3PUZE 4LATA 3S9LC 2O1LA 5L8DA 1IEJA 1AOVA 2QS1A 2O6AA 4IO6A 4WXJA 2I3VA 4P0IA 1Y3PA 1PDAA 2OWTA 3FGSA 4XKPA 5HPQA 1FQDA 3QUFA 3SEUA 3W15C 1MDP1 2XXIA 3EHSA 3MJNA 1ZIUA 4GFRA 2OZZA 1MY3A 5H8QA 4KI0E 4MLVA 4Q8RA 1B51A 1XVXA 2F6GA 3OSRA 4GF8A 3TTRA 4RJZA 1FQAA 4F18A 2D3IA 1LLSA 4QFNA 3JZJA 4LA9A 3TCHA 2GHBA 4MF3A 3CR9A 4U1ZA 1SDXA 2AIXA 1SYIA 1VR5A 3VXBA 1YCJA 2H25A 3LC8A 3UA8A 1MQGA 3IK6B 1ZBMA 1ATGA 1TFDA 4X1BA 2RC8A 3PPQA 3ZKKA 4R72A 3H6UA 4NF5B 3MVWA 3FVKA 1YPNA 4YKPA 3Q29A 3K6VA 2DS9A 3SESA 1Y1ZA 2E1SA 5JTYA 2WKYA 5I2NA 5CM6A 4Q5TA 3IR1A 4RPNA 1B3GA 2DE3A 4PFWA 1FW0A 4NF8A 4R74A 4QFOA 3T9XB 4POWA 2XXWA 1H3DA 3W9VA 4ELOA 1IXGA 4DLDA 1ZKBA 4R6YA 4X48A 3OMBA 3IJOB 2D21A 4F1UA 1LAGE 4QHQA 1MM6A 3K6XA 4PFYA 1SQYA 3TKDA 4ZEFA 4NE4A 4ZECA 1H76A 1YAEA 4ZEKA 3K2DA 4R6KA 3T9UA 3SETA 2Q2CA 4JXIA 3EHUA 3KGCA 5AA1A 3G3IA 4KYSA 1VFDA 3E4RA 3OO6A 4YAHX 4AB5A 2F97A 5I59B 4QSDA 1IITA 1N84A 1SW4A 2DQVA 3KOTA 1EZPA 3BFUA 4DXCA 4KQPA 3MP6A 2H4IA 5BUUA 1IXIA 2ONKE 2DWHA 3O97A 1NMUA 5CI5A 3SEXA 1FQFA 3PD9A 2Q8JA 1IXCA 3H06B 3R26A 4ZEDA 4EQ7A 2QSXA 4R9GA 3BKIB 1FTOA 3GXAA 1P99A 2I49A 1JEVA 3HHFA 4KYDA 4JDFA 4F19A 3IL1B 4N6PA 1UIUA 3K6UA 3OOAA 3GLBA 4YMAA 4JWYA 4QSEA 5A5XA 1MY1A 3RY3A 1M5CA 4XKQA 1R9LA 3GZGA 2NWJA 4C1TA 3USDA 2GH9A 4U22A 2VOZA 1JETA 4U2RA 2QMWA 3HCQA 3CG3A 3E13X 1UTHA 3M3FA 3RTWB 4FECA 3U92A 1TFAA 2ZYOA 4PFUA 1B0HA 1FQBA 2THIA 4ZE9A 1UIVA 4I8CA 4IB2A 3SEYA 1EH3A 3R6UA 3VLVA 3U93A 4KR5A 4R2FA 2VD2A 2E0SA 4IO5A 1FQEA 1MY2A 1CE2A 1OVBA 3C9HA 2D5WA 5ITOA 1SI1A 4FIMA 4OERA 3RLFE 1Y1MA 1EZOA 5HM4B 3ZSFA 4FE8A 3TZAA 2OCUA 1MXUA 2XXRA 3V89B 2OBGA 3U8QA 2DE4A 3CIJA 3TMGA 1IUDA 1Z7ME 2V93A 5H8HA 1Y3NA 4KCDA 1D9VA 4GL8A 3MQ9A 4OVJA 3W9WA 5KCJB 2H99A 1MPBA 2P0SA 4KFQA 3FVGA 4M4GA 1BLFA 2O51A 3LSLA 4R73A 3MW0A 4YZZA 1T0KA 1ZTYA 1B3FA 1D3KA 3M3KA 3HPIA 5H8NB 1B3EA 2UVIA 1OQHA 4U4SA 3TQWA 4H0WA 4DCXA 2REJA 1JW1A 1GVCA 1B4ZA 2Z8FA 3I3VA 3T66A 2DVZA 3IOUA 3K6WA 1B5IA 2REGA 2RCAA 4LQ5A 2B65A 1QUIA 3PUVE 1JW4A 1PB8A 5H8FB 4G8HA 2NVUB 4O3BA 2P2AA 3VV5A 5KDTB 1DTZA 5L9OA 4ONYA 1B40A 3PUWE 3L6GA 3T93B 4POXA 3RT6B 4RY1A 5TPAB 3Q26A 5FHMA 2R6GE 3F11A 5F7VA 4RPOA 3IB0A 5LOMA 1PB9A 3TTKA 4OWDA 3FZVA 5DTBA 1MH4A 4HTGA 1US4A 1Y4TA 1LFIA 4ZZEA 3C35A 5FTIA 4AB6A 5AA4A 1MXYA 1A40A 1N04A 4LZ7A 1LCTA 4GVOA 3M3LA 4GLIA 1OLAA 5K2XA 1NNKA 1ZJLA 4Z7EA 2HFBA 1P1OA 1B58A 1UTBA 3O6GA 2OK2A 3B6WA 1LBBA 2IEEA 1IXHA 4JSOA 1A8EA 4G8MA 4F22A 2Y7IA 2UYFA 2Y7PA 2F6PA 1IIWA 3CFLA 4MLQA 2VGQA 3A3UA 1A55A 2HAVA 1URSA 2O7UA 4NF4B 3T96B 3TTLA 4GOTA 1R9QA 1NKXA 3ODBA 2HAUA 2Q2AA 1DPEA 2V3UA 5I57B 1MQIA 2HZKA 3UIFA 1I6QA 5AA2B 5J1DA 4H6DA 3QSLA 1B5HA 3DELB 4P11A 1LB8A 2G29A 4C1UA 4O3AA 3ONMA 3FIRA 4YKJA 4ECFA 4PFTA 2UVGA 4PE5B 3PPOA 4OHNA 1B2HA 2HZLA 1B7HA 4XKNA 3QIMA 3IOWA 4LZ5A 4F3BA 3QXMA 3K1NA 4U4XA 3FV1A 2HXWA 5DT6A 5EYFA 4H67A 4PQJA 5CMMA 2NOOA 3MPLA 4THIA 2HQ0A 3UK4A 4IO4A 4ZE8A 1A8FA 3C33A 4BDLA 4HCWA 4F1VA 4F31B 5FTHA 1EU8A 2Q9TA 4LZ8A 1MY0A 5B70A 2UVHA 3AXFA 4IO7A 1B1XA 4RXLA 3TTMA 1QW0A 2I58A 3RTFB 1MQJA 5DYHA 4X9TA 1BP5A 5EHSA 3V83A 1QJMA 4ELPA 4OZ9A 1M5DA 1F9BA 2O7IA 4F39A 1BIYA 2ZYNA 2XX8A 3KOSA 1SVXB 3I5OA 4KPTA 1LSTA 4WEDA 3PUXE 3G3GA 3N94A 4NF5A 4OFOA 2ALUA 3Q28A 4I9DA 2O84X 2RC7A 2UXAA 1OVTA 1B4HA 4F3PA 4BDNA 3E9XA 2I48A 2DXRA 3DP8A 1URGA 3L6HA 3PMXA 3FXUA 4LP2B 1MPCA 4WKMA 3TODA 3HHGA 4M1VA 4LQ2A 1MXZA 2B3FA 5H8QB 4F2OA 4MBPA 3G3KA 4OEVA 1QKAA 1P1NA 3S4UA 1MY4A 3RQTA 4RK9A 3MP1A 1RYXA 4G68B 3CFZA 1MG1A 1JEUA 3KN8A 1ANFA 1N7XA 4OXVA 4YU0A 1O63A 3B6QA 3KJTA 2DOJA 4YB7A 3G3HA 3O28A 2AL4A 1S50A 4L17A 3CSBA 4O3CA 5I59A 3VXCA 4PP0A 3MVYA 3GBBA 3MP8A 3DP6A 1SI0A 1US5A 1FTLA 2UVJA 1ELJA 1B9JA 2RC9A 5I2NB 4ZEBA 1P1WA 2Z23A 3B7DA 1RYOA 1AMFA 4IY5A 2ONSA 1QKBA 3K1MA 5IKBA 2VP1A 2ZNSA 1N0TA 1TT1A 1OQGA 4F1YA 4QRZA 3KSXA 1JVXA 1PBQA 2O1MA 2I4CA 4OFJA 3K02A 3OXNA 1BTJA 3O6HA 3KJ7A 1ZLQA 3CRBA 1L5TA 4ELQA 3FATA 3PU5A 5I2KA 2PVUA 5I56B 3GBAA 1GTKA 4TOZA 4NEDA 1P1UA 5ELVA 1DSNA 1B1HA 1SW2A 1EZ9A 1POTA 4KHZE 3B6TA 4I1DA 1Y3QA 3H6WA 2I0BA 2QS2A 5I84A 4E0XA 3RNNA 5CBRA 4ESXA 2Y7RA 4LONB 3C32A 1N7WA 1IQ7A 4ELRA 1MS7A 3O9PA 2V3QA 3LSWA 3OEMA 4HW8A 3FVNA 3K4UA 4EXKA 1MRPA 2V25A 3G7WA 5A5XB 4GD5A 4YB5A 3DM0A 2ZYMA 2Y84A 4RYAA 2V3TA 4OENA 1SD3A 3MWBA 1USYE 5KCJA 5I58B 3LR1A 2H98A 4TLLB 1S9TA 1B0LA 1WODA 1JVYA 1AIVA 4RNSA 3R7XA 4JSDA 4F29A 1MQHA 3RT8A 3TELA 1XS5A 3K00A 2F36A 3HO7A 4F2QA 3LSFB 1B7ZA 2YJPA 4FEDA 1D4NA 2GFEA 5F1QA 4XKRA 1LFHA 4JWOA 5DEXB 1NNPA 3VDFA 4U1OA 5KDTA 3MZ1A 1DPPA 1B3HA 2OLBA 4OMBA 4ND9A 5CRYA 3SEWA 1P1QA 4GIZA 2LAOA 4QFKA 4R75A 2Q88A 3VLUA 3H7MA 1II5A 1MPDA 2DWAA 5TP9A 3K01A 3KFMA 1UQWA 3N6UA 4X1DA 2OWSA 4TLMB 2DYXA 2XD3A 2XXXA 1A54A 5KZTA 3KBRA 3MVZA 4G8NA 3FJ7A 1NNFA 2ZMBA 2XXQA 2H5YA 2RF1A 3EPEA 2ONRA 3KZGA 1O7TA 4GXAA 4PETA 3RGYA 4IO2A 2P1SA 4GWOA 1JQFA 1MDQA 5DVIA 4NWCA 4UA8A 3OELA 3HV1A 2ZXTA 1SW1A 4OEUA 4YKIA 1B7UA 2F78A 1XT8A 2XXHA 1JW5A 4YICA 4U21A 1LFGA 4NF4A 2YLNA 2QMXA 1VE4A 4R9FA 1QUJA 5JEIA 4FJPA 5ITPA 2PYYA 5I57A 1OIBA 3FV2A 4HCYA 5AA2A 3UP9A 4AQ4A 1ZMGA 3WAFA 4FORA 2XXVA 4IGTA 2XXTA 3FXRA 3JYRA 1SYHA 3FXQA 4NF6B 5EHMA 1B32A 3PUYE 4ZZAA 3OO8A 1XC1A 1M5BA 3CI8A 1DTGA 4RK2A 2M8CA 4HS7A 2DVCA 3BBRA 3VLWA 3V8XB 4LUBA 3D4CA 1LGBC 2XXYA 4BDMA 4BDQA 3H6TA 2XD2A 1BKAA 3O2AA 1N76A 2A5TB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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