2XXUA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) m770k lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPKGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxuA02
4G77A 1B1HA 2E1SA 5CI5A 3TCHA 4F18A 4JDFA 3H3GA 4BDNA 4DIGA 3I5OA 1I69A 4FIMA 1FTMA 1O63A 2CZLA 4HCYA 3A3UA 4YZZA 4OFOA 2ABHA 3RTFB 4M1VA 4KFQA 3OOAA 2GH9A 2DQVA 1PBQA 1GGGA 2Z8DA 3T9VA 4OQOA 1BP5A 3PMXA 1PB8A 4RJZA 3R26A 2O1LA 1SW5A 4BDMA 3IJOB 2DOJA 3T22A 4ZEKA 1UQWA 5FHOA 4NWCA 3U93A 2NWJA 3TDJA 4JXIA 4F1YA 1EZPA 1Q35A 2P0SA 4EXKA 2OK2A 1P99A 4QSEA 3MZBA 5I58B 2FYIA 3K6WA 5ISUA 4GXAA 3MVWA 1JQFA 2H9BA 1NH8A 4JBZA 2X26A 1MY1A 3TZAA 2QMWA 1B3LA 1S7YA 3M8UA 1Y20A 1BTJA 5EYFA 3CIJA 1WODA 1I6BA 1B05A 2Y7IA 3G3IA 3K2DA 3MAMA 1URSA 1AMFA 3G3GA 2G93A 3F11A 2LAOA 4PQJA 2HAUA 2QPQA 1RYXA 2F7CA 3W15C 3KSXA 1QUKA 4E0XA 3JV9A 5AE4A 1NMUA 1SYIA 4QFLA 2Q88A 1MQHA 4YB5A 4F31B 3TODA 5CM6A 1Q1KA 3FUZA 3OMBA 3KN8A 4XKRA 3V5AA 5I56B 2HAVA 4YAHX 1B6HA 3O6HA 3MPKA 1ZTYA 4H5GA 3TTLA 5A5XA 3KJ7A 1D4NA 4F1VA 4OEUA 3CR9A 5DT6A 4MLQA 1SD3A 1M5DA 3E13X 3W9WA 1O64A 3GBBA 1IQ7A 2QJEA 4FAJA 2XX8A 5EHSA 3O66A 2QL3A 3ONMA 2NUVA 3ILTB 2ZYOA 3C31A 4C1UA 2UVJA 1NNPA 4R74A 5I2NB 3OELA 3PUWE 1MDP1 2OWTA 4BDRA 4DE8A 3EHSA 1FQDA 3Q28A 4XXUA 4AQ4A 1S50A 1GVCA 2XHDA 4GRKA 4FEBA 4DXCA 2I49A 4IO2A 4R2BA 1N0TA 4R73A 1PBPA 3OO9A 2NXOA 5FHNA 1B7ZA 1B0HA 3MVXA 5K2YA 2HCAA 4G68C 1LLSA 3MP1A 5CMBA 3CFLA 4NF5B 1VFDA 3KSJA 1FQFA 2W7YA 2XXWA 3H4ZA 3BFUA 3C4MA 2DE2A 3IR1A 3VVDA 3VLUA 3H06B 3H6VA 5FTIA 5AA4B 1MQDA 4ND9A 4O3BA 3Q26A 3ZS6A 3FVGA 5CMCA 4FORA 1WVJA 4OETA 2I4CA 5JTYA 3O29A 5AA2A 2RC9A 1D9VA 3DP6A 1DSNA 4RYAA 5LOMA 3I3VA 2O51A 4DDDA 3SETA 2DVZA 4MF3A 5TP9A 1VFEA 2ONSA 4K3FA 2OJTA 1R9LA 4WEDA 1ZBMA 4IO3A 2QMXA 1MM7A 1CE2A 3MUQA 3MVYA 3VFJA 4PFUA 1LBBA 2UYEA 2DS9A 4G8HA 3K4UA 1UIVA 4U1ZA 2AYSA 3MW0A 4GVOA 1HSLA 1IEJA 2O7IA 4F39A 4ESXA 1NNTA 4P0GA 5KZTA 1B4HA 3VLVA 3PPOA 3V89B 1B51A 5L9MA 3K6XA 4ZE9A 2IEEA 2ZXTA 3MP8A 3O6GA 2Q8JA 3KG2A 2P1SA 4ZS9A 4QRZA 2RF1A 3LSFB 2KLFA 3IOVA 3W9VA 2F78A 3KOSA 2Z8EA 1Y1ZA 3S9MC 5ICQA 2HEUA 3FV2A 4IO6A 5H8SA 3S2VA 1VSOA 1PB9A 4YMAA 4IGTA 5HPQA 4IB2A 2NVUB 4PP0A 4R6KA 5KCJB 4PFTA 2I0BA 1N84A 1OVBA 3C36A 4WEPA 2M8CA 4Q5TA 4H6DA 3OENA 3LC8A 4LATA 4LA9A 4OFLA 4H0WA 3FVOA 4RNSA 4R9FA 1AOVA 4DLDA 4F3GA 3HPIA 3VV5A 4OENA 5FHMA 3G3HA 3K1NA 3DM0A 4GXSB 3ZSFA 2O69A 2Q2AA 3O28A 4RY1A 4KI0E 4GF8A 1NNFA 1PB7A 1US5A 3G3FA 4DXUA 2V3QA 5KDTB 1FTOA 1MM6A 2ZNUA 5I84A 5DEXA 3CRBA 4R72A 2RINA 3Q29A 2VP1A 1LCTA 4DCYA 1YCJA 3TKDA 4JSDA 1NFTA 2RKMA 5IAIA 1A8FA 3FGSA 3K1PA 2D5WA 5H8FA 3SEVA 1VE4A 2Q2CA 2YPNA 2GRVA 1UTHB 2GHBA 2HZKA 5L9OA 4UA8A 2DE3A 3ECRA 1L5TA 4O3CA 1XT8A 5HBCA 3LSLA 3FJGA 4YB7A 2DXRA 1SDXA 3N94A 3G3JA 5F7VA 4LP2B 4OXVA 3T9UA 1WDNA 3H6WA 4YKKA 1B4ZA 4NF8A 1AIVA 3UIFA 4R2FA 5ITPA 2F7AA 3ZKKA 4HW8A 2X7PA 4X1BA 2PYYA 1MY4A 2BJJX 4ZZEA 1MH4A 4GL0A 1UIUA 3O97A 1I6QA 1MPBA 3BFTA 3G7WA 4R75A 2I3VA 3UA8A 1UTBB 3Q27A 4EQ7A 3L6GA 5JEIA 4C1TA 1SI0A 4LVQA 3DELB 4F19A 1NKXA 1JEUA 1MG1A 1SYHA 3D4CA 3IORA 3S9NC 1OIBA 4U22A 1PC3A 1URGA 3MQ9A 3T93B 3OSRA 2D21A 1MXXA 1P1OA 1N3XA 1XC1A 2QRYA 3EN3A 4LZ8A 1QJMA 3PUXE 4OFJA 3E9XA 2ZNTA 3BBRA 1S9TA 2E0SA 4U1OA 1H45A 3U72A 4F3SA 3PMWA 2B3FA 3T66A 4OHNA 5I58A 3MVZA 4L17A 1XS5A 2AIXA 3QK6A 3R6UA 4NF6B 1ZJLA 3FXQA 3E4RA 3IX1A 1FTKA 4M4GA 2F5XA 5JK4A 3TTMA 4E0WA 2AL4A 4YICA 4Z7EA 3S4UA 3N6TA 5BWJA 4ELOA 3G3KA 4GIZA 2ESNA 4JWOA 2Y7KA 4FJPA 3QUFA 1II5A 1MXUA 4H65A 3TFLA 1GR2A 4ELPA 3QAXA 1YAEA 2H5YA 3THIA 2A5TB 2VD3A 1B7HA 1IXGA 1TFAA 1B3EA 2A5TA 1LFHA 3C33A 1URDA 3RGYA 4EXLA 1B1XA 1FQBA 3CFXA 4LQ2A 3FD3A 3USDA 2H98A 5K2XA 1B3HA 3VDFA 3MPLA 3FATA 4RK9A 3KOTA 5I56A 1ZIUA 3OO7A 2O6AA 3R7XA 3RQTA 1AL3A 3SEWA 2Q9TA 5CMKA 2PT2A 3IAZA 3K02A 2XXYA 1POY1 2PBWA 3HSTA 2QS2A 3PUYE 2Z23A 2DVCA 1DTGA 4GLIA 1ATGA 3A09A 5AA3A 4THIA 1ZU0A 3RT6B 3U8QA 3PPPA 4ELRA 1J1NA 2H99A 3RUMA 3VLWA 5I2NA 1VR5A 4RA1A 5TPAB 1BKAA 4PETA 4G8MA 4TLLB 3RN8A 1F9BA 1OMPA 3OEMA 3GZGA 1IZ1A 2I6EA 4OEVA 3PUZE 1MRPA 5H8HB 2RCAA 3KEIA 1ANFA 1N04A 3TELA 2Y7WA 4NMYA 4XKNA 4O3AA 4YKPA 2HXWA 4XTCQ 3T9HB 3I6VA 1A99A 4NF5A 1BLFA 2DWHA 3N26A 4HS7A 1B0LA 1P1UA 1DPPA 4TOZA 1R6ZA 3TQWA 5CBRA 3QXMA 1B58A 1TT1A 4KPTA 2ANJA 5AA4A 1Y4TA 3LR1A 3GXAA 1AH5A 1OLAA 2ONRA 3WAEA 4F3BA 2AL5A 3N5LA 2XXUA 2O84X 3VXCA 1MXYA 4QF9A 3CG1A 1B9JA 1Y9UA 2REJA 3CG3A 3Q25A 1XOCA 4KQPA 3HCQA 4KYDA 1NH7A 3TCGA 2XXRA 2ZYNA 2O1MA 3FZVA 1B46A 3OSQA 2PT1A 1LGBC 1QKAA 3HHFA 2Q89A 1N7WA 1B40A 2UXAA 4NE4A 3VVEA 4LONB 2X7QA 3OD7A 3EQ1A 4G68B 3VVFA 4KR5A 3EHUA 4QSDA 3FIRA 1MXWA 1JVYA 4U21A 3M3LA 4G2ZA 1OVTA 1OQGA 1LAHE 2VGQA 2I58A 3KN3A 2UYFA 2IA4A 1SW4A 5CMMA 3FXRA 1PDAA 4TLMB 1A55A 5H8QB 2ALUA 4XKPA 4IO4A 3M3FA 1EZOA 4HCWA 1KWHA 3KFMA 3GLBA 4MBPA 3RLFE 2UVHA 1PEBA 1FW0A 1ZLQA 5I59B 3SEYA 1B5HA 3TMGA 2VOZA 4AB6A 3C32A 4Q0CA 4G8NA 3B6QA 3MZ1A 3UK4A 2F35A 4H5FA 5KCJA 3K00A 5F1QA 1GTKA 3M3KA 4GD5A 4R6YA 3MZ9A 3TQLA 5ELVA 4N07A 2REGA 1SVXB 5FTHA 5DYHA 3KZGA 1H44A 1LSTA 4JWYA 2F6GA 1JW4A 2NOOA 2Z22A 3HO7A 4YKJA 4ZDMA 4ECFA 4XIGQ 1GV8A 2B3BA 1EU8A 4ZEFA 1XVYA 2DSFA 2I48A 4EF1A 3EPEA 3MBPA 3PPNA 1B52A 5KDTA 3RT8A 1NL5A 3PGFA 3DLNA 2F7BA 3FJMA 3SEUA 1SI1A 4NF4B 4QFOA 3K6UA 1POTA 4HTGA 4EDPA 2GHAA 3O2AA 4EUOA 2V84A 2VD2A 1QULA 3H6TA 4IO5A 2Y84A 1UTHA 5M2VA 2F34A 5I2KB 4YMBA 3RNNA 1QKBA 3DP4A 2HZLA 3PPRA 2XD2A 1OLCA 3FVNA 1M5EA 4Z0IA 1D9YA 3B6TA 4WKMA 4MH5A 1R9QA 2FA7A 5H8NB 1SW2A 3BKIB 5I57B 3EF7A 2CMOA 2YLNA 1QUIA 3V8XB 4AB5A 2O68A 1LB8A 3IB2A 2I4BA 4QFKA 4WXJA 4NTLA 2H4IA 3CI8A 1MS7A 3K0VA 4OMBA 3IK6B 3HHGA 1UTBA 4X9TA 1B5JA 2PMSA 3C35A 1B3GA 4F1UA 4IO7A 2R71A 2HQ0A 3IB0A 2P2AA 3UORA 1JETA 3TPAA 3B7DA 2ZYKA 3VE1B 4LZ5A 1FTJA 5AA1A 2QS4A 4F2QA 2I0CA 3OO8A 2R9JA 4YKIA 2V3UA 3JZJA 4BDLA 3FASA 4UACA 1Y3NA 3FVKA 1P1QA 3SEXA 2DWJA 4ZEBA 3TTKA 2OWSA 3K1MA 1EH3A 2F36A 2FNCA 4RK2A 4FATA 3IO4A 1EZ9A 5TU0A 4F29A 4OERA 2PVUA 5DVFA 3FXUA 2UVIA 2ONKE 2XD3A 1LB9A 1DPEA 2RC7A 1MQJA 1XVXA 1B3FA 3IL1B 4IY5A 5CC2A 4NF6A 1YTVA 2Y7PA 3VXBA 4NEDA 2G29A 1LCFA 1R1NA 1IIWA 1US4A 3TAJA 4R6HA 4H67A 1Y3QA 3PD8A 4H8JA 1Y3PA 4TQUQ 1MXZA 2XX9A 1DOTA 3N6UA 1M5BA 5DVIA 3UP9A 1MPCA 1Y4CA 1RYOA 4G4PA 2ZNSA 3LSWA 2HFBA 4KCDA 3WAFA 1M5CA 1MQIA 3E3KA 4YU0A 4JB7A 4U23A 1IXHA 1LFIA 3ODBA 4GL8A 3U94A 3PU5A 3C34A 1OQHA 2QS1A 3FJ7A 4KD5A 4X48A 3IJXB 5BUUA 4OZ9A 4U4SA 2V3TA 4F22A 4NWDA 1FQAA 4DZ1A 3QUJA 3HV1A 2XXIA 3PV0E 2F97A 1MXVA 4X1DA 1MY2A 5A5XB 1I6AA 4GFRA 1USYH 4ZEDA 3HN0A 3LBSA 4I1DA 1LFGA 1LAGE 1ELJA 4F2OA 3IOTA 2XXVA 4ZZAA 1JW5A 2R6GE 3RPWA 4KYSA 1FQCA 3H6UA 1JVXA 4U2RA 3T9XB 1N7XA 3FV1A 1N76A 5B7DA 4ZE8A 5J1DA 3CSBA 1A8EA 3MP6A 4ONYA 3JYRA 3CSGA 3O9PA 3PMVA 1BIYA 1FTLA 3LSXA 4RPNA 1B7UA 5TPAA 2XX7A 2XXTA 3MJNA 1IXCA 1IXIA 2DWIA 1RKMA 3SERA 2I3WA 5H8HA 4R9GA 2QSXA 1TWYA 3KJTA 4OYVA 3MC2A 1JNFA 4EF2A 3TCFA 3P7IA 2OZZA 1D3KA 4KYEA 4BLAA 5ICTA 4QFNA 4N6PA 4POXA 4POWA 4PFWA 1MY3A 2ZYMA 4JSOA 2ZMBA 3OEKA 1N3WA 3AXFA 3IOWA 1Z7NE 4DXBA 3TUSA 3PPQA 3QYTA 3S9LC 4LQ5A 5IKBA 1YPNA 4F3PA 5JTYB 5AA2B 2RCBA 2XXQA 1HSEA 4RPOA 1XHYA 3H7MA 1HSJA 3QSLA 2A5SA 4ZEIA 1MDQA 5HM4B 3IO6A 1USYE 5TP9B 4I9DA 1B5IA 3L6HA 4FEDA 4IGRA 4C0RA 5EHMA 1A7LA 1IUDA 2OLBA 3EHTA 4GQOA 5L9SA 2GFEA 2XXPA 4G68A 2F6PA 1MY0A 3OO6A 2XXHA 3TTRA 4JWXA 1B2HA 3H03A 1FCKA 3KBRA 5DVJA 2OBGA 4H8IA 1Y1MA 3QIMA 1TXFA 1QUJA 3TEPA 2Y7RA 1T0KA 4QSCA 1JEVA 1SQYA 4KHZE 4OWDA 3RTWB 5ITOA 5H8QA 4LUBA 2V93A 5CRYA 3O6IA 2RC8A 1NNKA 3SESA 2H25A 5I59A 3OXNA 4P0IA 2YJPA 4BDQA 1H3DA 4ELQA 4U4XA 3U1OA 1LAXA 1SBPA 4RXLA 4GWOA 2UVGA 3ILUB 1MPDA 3T96B 4LZ7A 3ZKLA 4PE5B 4FE8A 2DWAA 4XKQA 1ZMGA 3B6WA 1SW1A 2WKYA 2D3IA 1H76A 4OESA 2V25A 1B32A 3CFZA 1A54A 4ISUA 1Z7ME 2QS3A 3A3CA 3SDFA 1CB6A 1QVSA 4MFIA 5L8DA 1JW1A 1IITA 3RY3A 3GBAA 2F8DA 4OVJA 3MWBA 5DEXB 1FQEA 3SKPA 3DP8A 1TFDA 2DE4A 2XXXA 4EQ9A 4ZECA 4NF4A 4ESWA 4QHQA 3K6VA 5CBSA 4OTEA 5H8FB 2PX1A 3C9HA 3PUVE 4BDOA 3UGWA 2DP8A 1DMBA 1M5FA 2DYXA 4IY6A 4YB6A 1P1WA 2THIA 2O7UA 1MQGA 2B65A 3TYHA 3TTNA 4N13A 4FECA 4GOTA 4Q30B 5I2KA 1MH3A 1LAFE 5DTBA 3K01A 2OCUA 5H8NA 5I57A 3LUYA 3S9EA 1O7TA 3CVGA 3UN6A 4NF8B 1LBCA 3IOUA 4QFPA 3U92A 3PD9A 4MLVA 2VHAA 5B70A 4PFYA 4H1XA 3D4GA 1A40A 4P11A 4EQBA 1DTZA 3V83A 1ZKBA 4I8CA 2Z8FA 4I62A 3IB1A 2DXYA 1QW0A 4KCCA 4DCXA 5AA2D 3KGCA 4Q8RA 1P1NA 3KN7A 1H43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4G77A 1B1HA 2E1SA 4AS4A 2Y5LA 5CI5A 3CHGA 3TCHA 4JDFA 4F18A 3H3GA 4BDNA 4DIGA 3I5OA 1I69A 4FIMA 1FTMA 1O63A 2CZLA 4HCYA 3A3UA 4YZZA 4PC9A 4OFOA 2ABHA 4KXPA 3RTFB 4M1VA 4KFQA 3OOAA 2GH9A 1FBPA 2DQVA 1PBQA 1GGGA 2Z8DA 3T9VA 4OQOA 1BP5A 3PMXA 1PB8A 4RJZA 3R26A 2O1LA 1SW5A 4BDMA 4N6DA 1FBCA 3IJOB 2DOJA 3T22A 4ZEKA 1UQWA 5FHOA 4NWCA 3U93A 2NWJA 5EYHA 3TDJA 4JXIA 4F1YA 1EZPA 1KZ8A 1Q35A 2P0SA 4EXKA 2OK2A 1P99A 4QSEA 3MZBA 5I58B 2FYIA 3K6WA 3NOHA 4N91A 1DCUA 5ISUA 4GXAA 3MVWA 1JQFA 2DDKA 2H9BA 1NH8A 4JBZA 2X26A 1NV0A 2PCRA 1MY1A 3TZAA 2QMWA 1B3LA 1S7YA 3T0JA 1JP4A 3M8UA 1Y20A 4PTKA 1FPLA 1BTJA 3FBPA 5EYFA 3CIJA 1WODA 1I6BA 1B05A 2Y7IA 2QVUA 4P8BA 3G3IA 3K2DA 4P47A 3MAMA 4XFEA 1URSA 4G61A 1K9YA 1AMFA 1FBDA 3G3GA 2G93A 2FIEA 3F11A 2LAOA 4PFBA 3PTYA 4PQJA 2HAUA 2QPQA 1RYXA 2F7CA 3W15C 3KSXA 1QUKA 4E0XA 3JV9A 2XWKA 5AE4A 1NMUA 2Q8MA 1SYIA 4QFLA 2Q88A 1MQHA 4YB5A 4F31B 3TODA 5CM6A 1Q1KA 3FUZA 3OMBA 3KN8A 4XKRA 4GWZA 5EQ8A 1LBZA 3V5AA 5I56B 2HAVA 4YAHX 1B6HA 2FIXA 3O6HA 2CZIA 3MPKA 1ZTYA 4H5GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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