2XXUA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) m770k lbd dimer in complex with glutamate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPKGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
total genus 86
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxuA02
1DTGA 5I57B 2XXHA 2E1SA 4G4PA 3K02A 2Z23A 3CSGA 1P1WA 4U1OA 3EF7A 5H8FB 2Z8EA 2WKYA 1USYH 3OSRA 5B70A 1USYE 1MY2A 4IO2A 1MXVA 3JV9A 2O7UA 4ELPA 1SYIA 5BUUA 3RLFE 2DS9A 3M3LA 2PX1A 4X1DA 4PQJA 5AA2A 3PPOA 1SW2A 3KOSA 4OFJA 4LZ8A 2NVUB 4OERA 3IB2A 3T22A 3JYRA 1MXZA 2I48A 2QSXA 2R71A 3G3HA 1LFGA 4U4SA 3U1OA 4ZE9A 1H44A 1S9TA 1GR2A 1N7XA 4UA8A 2E0SA 5KDTA 3CRBA 1PBQA 1I6QA 4H0WA 3F11A 4NF4A 4F39A 1YPNA 3ZS6A 4MBPA 3A3CA 3L6GA 2ABHA 4ZEFA 3MQ9A 1MH3A 2F5XA 2P1SA 3O6IA 4R9FA 3OEKA 2D3IA 3PUYE 3GLBA 1UTBA 2Q89A 4MF3A 3FVGA 1LBBA 4LZ7A 3MZBA 3TTNA 4BDMA 3GXAA 4MFIA 3CVGA 2O69A 4IO3A 3SEWA 3W9WA 4YKIA 4KD5A 3VFJA 4OYVA 3CG3A 2O1MA 4GXSB 3KG2A 3HHGA 2PT2A 5AA4B 4XTCQ 1GV8A 2H5YA 3DELB 2YLNA 1NNPA 4QSDA 2XXUA 4NF5A 1ZLQA 4WEPA 3QYTA 2OJTA 4G68B 1Y4CA 3HO7A 2HXWA 4P0IA 3O66A 1P99A 1QKAA 2I6EA 4BLAA 4DDDA 1A54A 4YU0A 1OLAA 4H5FA 2XXIA 2I0BA 3FJ7A 1EZ9A 4OXVA 4GD5A 1B52A 3OMBA 3N6UA 5I59A 4FEDA 1RYXA 2ZNTA 1WVJA 4OETA 4UACA 1ZIUA 2XX9A 1NNKA 5A5XB 3SEYA 2UVIA 3HV1A 1AL3A 1N7WA 2Y7PA 4F18A 1URGA 5I56B 3B6WA 5I2NB 2FYIA 5J1DA 4AQ4A 1T0KA 1US5A 1UTHB 4KR5A 1YTVA 4KYEA 4M1VA 2RF1A 4ZZEA 3VVEA 1XC1A 1LAHE 2D5WA 4BDNA 2PVUA 2VD2A 3OO9A 1IXGA 3S4UA 4GQOA 4X48A 1ELJA 3IOUA 2XXQA 1B32A 2OCUA 5DTBA 3EHUA 1B3LA 2O6AA 4RXLA 5H8NA 1ZMGA 3IAZA 2A5SA 2DWIA 2F7AA 1PB8A 2V84A 3KZGA 3FXUA 3KFMA 5FHNA 4RJZA 4IY6A 3S9NC 1SYHA 2V3QA 4JSDA 1N3XA 1OQHA 4GLIA 3IJOB 4IO6A 3WAFA 3UIFA 5CBSA 1QVSA 2AL5A 3FJGA 4EF1A 3MP6A 2RC7A 1BLFA 3V8XB 3V5AA 2OK2A 4ELQA 1HSEA 3K6UA 3G7WA 2XXWA 5I2KA 2GH9A 4GL8A 3ILUB 3IO6A 4ZECA 2XXYA 5H8HA 1S50A 4QF9A 3SERA 1L5TA 5TP9A 3ODBA 2OWSA 4RNSA 5FHOA 3TQWA 4YAHX 3H6UA 2PT1A 2QS1A 2A5TA 1FCKA 1SDXA 5ISUA 1A7LA 2CZLA 3TEPA 2THIA 1TWYA 5HBCA 1POY1 4YMBA 3LSFB 3OO8A 2QPQA 3N6TA 1SVXB 4IO4A 4F3SA 1MPDA 3Q29A 1LAXA 3U8QA 4NF8B 3VXCA 2QMWA 3HHFA 1RYOA 4YKKA 4IGRA 4PE5B 1MM7A 3EHSA 3I3VA 1BIYA 4OZ9A 2O1LA 3RUMA 1MPCA 3R7XA 3IJXB 3H06B 4NEDA 3RY3A 2NWJA 2HZKA 2B3FA 1B7UA 1VFDA 1NNFA 1MXXA 1JW5A 1B0HA 2REGA 5TU0A 4NF6A 2DOJA 2V3UA 3IOVA 3AXFA 2W7YA 1AIVA 4PFWA 3CI8A 3S9EA 1DPPA 3RNNA 3RT8A 3TUSA 3LSWA 5L9MA 1FTJA 4PP0A 1IQ7A 5F7VA 1B9JA 4I9DA 1XHYA 5BWJA 2DE3A 2DWJA 1EU8A 3MJNA 1JEVA 4LA9A 4DIGA 2HAVA 3LBSA 5FHMA 2I58A 1I69A 1JVXA 1LSTA 1O63A 3MP1A 5B7DA 1EZOA 3CFZA 4H1XA 4E0XA 3CIJA 1XVYA 4KI0E 5I58A 3SKPA 1OVBA 1UIVA 1B1HA 3MUQA 4PETA 3A3UA 3RPWA 1A8EA 5TPAB 5I84A 3S9LC 3TCFA 4F2QA 1B40A 2PYYA 3MZ9A 1R9LA 4DXCA 4R9GA 3HPIA 3FXQA 2AL4A 3C4MA 4H8IA 1MQDA 3A09A 3N26A 3Q27A 3C35A 4U22A 1IXCA 4OFOA 3T9VA 4MLVA 3UP9A 4X1BA 3OEMA 2DYXA 4EQ9A 1LB9A 3FD3A 4KFQA 4HCYA 3TELA 4QFOA 4JSOA 4Z7EA 4IO7A 1SW1A 3E3KA 4MLQA 3QAXA 3TFLA 4U1ZA 4OENA 5DEXA 2DWAA 1LAFE 1SW4A 1A8FA 3TKDA 2XD2A 3SESA 3MZ1A 1OIBA 3ZKKA 2OLBA 3PD9A 2ESNA 1MXYA 1AOVA 3D4CA 3PUXE 4F31B 2KLFA 5H8QB 4YZZA 3FATA 5EYFA 1B5IA 4KHZE 1JW1A 5KCJA 1WODA 4LQ2A 4YMAA 1EH3A 4OMBA 2PBWA 3TTMA 3T9XB 3RQTA 1JVYA 1PDAA 1B3HA 4ZE8A 4G8HA 4DCYA 3E9XA 3H6WA 1P1OA 2DQVA 5CMCA 2Q88A 3T66A 4N13A 2AYSA 1OQGA 2ZYKA 3KSJA 1SBPA 1NKXA 2RKMA 5DYHA 2X7QA 4Q30B 3MAMA 2Y7KA 2DP8A 3H3GA 3TCHA 3PPRA 5FTIA 2P2AA 1SQYA 4FECA 3PUWE 2CMOA 1MQHA 1BKAA 5EHMA 4ZEBA 4YB7A 2I4BA 4FATA 4YICA 4GRKA 1I6AA 3PD8A 2HFBA 4P11A 3TMGA 1CE2A 3MWBA 4X9TA 3EHTA 4GWOA 1PEBA 4DXUA 4P0GA 3K6WA 3H7MA 4HTGA 2BJJX 1B3EA 1I6BA 2Q2AA 1H76A 4BDLA 3O6HA 4EQ7A 1BP5A 2XHDA 4POWA 3HSTA 1SD3A 5FTHA 2ZMBA 3K1NA 5DVIA 2F6PA 3K6VA 2H4IA 1FQAA 3O28A 1Y3NA 4JXIA 3SEUA 3U93A 2D21A 2X7PA 3OOAA 4KCDA 4RK2A 5JTYA 1QUIA 4F1YA 1IXIA 2XXTA 4ND9A 4F22A 4QFLA 5CC2A 3TCGA 4DXBA 4IO5A 1AMFA 3KGCA 1D3KA 4DZ1A 4H6DA 4H65A 1IXHA 5F1QA 3O29A 4Q5TA 3ZKLA 4RYAA 4ISUA 3MVWA 4JWOA 4F3BA 3H03A 4R6KA 1A55A 4DLDA 5AA2B 3FIRA 2ONRA 2GHAA 4OFLA 2DWHA 1PB7A 2Y7IA 2V25A 4QHQA 5ICQA 3MVXA 3RTWB 1VE4A 4OEVA 3T9HB 4G8NA 1M5BA 4M4GA 2Q9TA 4HS7A 3TAJA 3PU5A 3JZJA 4FEBA 5DT6A 4F3GA 3VLUA 2VD3A 2HZLA 1D9YA 3C33A 3KJ7A 3VDFA 5IKBA 4R2FA 2G29A 1Z7NE 2H9BA 3EN3A 5KDTB 2G93A 4NF4B 1HSLA 4EXKA 2F7BA 2UXAA 3B7DA 2B3BA 2NXOA 4HW8A 4F1VA 4Q8RA 3V83A 2IA4A 3G3KA 4YB6A 3R6UA 4OESA 4WEDA 4IY5A 1TXFA 2O7IA 4QFPA 2XX8A 3FVOA 1Y1MA 2Y7WA 1UTBB 2F97A 4R6YA 3ECRA 3L6HA 3MW0A 3G3JA 4RPOA 5ELVA 3OD7A 4XKNA 1BTJA 1RKMA 1VSOA 4I1DA 1TFAA 1PBPA 2GFEA 3CR9A 1PB9A 3TZAA 3EPEA 3PUZE 2HEUA 1Z7ME 1H3DA 4POXA 3I5OA 4EF2A 4KYSA 3KN8A 4DCXA 3OO6A 4ESWA 3H6VA 1FQCA 2QL3A 4GXAA 1D9VA 4NF5B 3IB1A 3LSLA 3VV5A 1B6HA 2H99A 3C9HA 2OZZA 1UQWA 3SETA 4GFRA 1LCTA 4I62A 1MS7A 4LP2B 1SW5A 1LFIA 3SEXA 3VXBA 1MH4A 3KSXA 2YJPA 3QIMA 2QJEA 3PMXA 1B5HA 4LVQA 2F78A 2QMXA 2R6GE 5I57A 5I59B 3RGYA 1FTMA 5H8FA 3K6XA 5K2XA 4OVJA 3K0VA 2OWTA 3TPAA 3BBRA 4R2BA 5CMKA 2DXRA 1P1UA 2Y7RA 3GZGA 3S2VA 5AA1A 3TTLA 3VVDA 2DVZA 2ZYMA 1ATGA 3C31A 1FQEA 4QSEA 4ELRA 4R72A 3KBRA 5EHSA 3U94A 4U2RA 2H98A 2PMSA 5JK4A 3OENA 4I8CA 5DVJA 2VHAA 2UVHA 3G3GA 1FTKA 2AIXA 4ZZAA 4F1UA 2F7CA 4NWDA 1O7TA 1B7ZA 1B1XA 1XS5A 5AE4A 3MPLA 1B4HA 5DVFA 2ALUA 3ZSFA 1R6ZA 4C0RA 2UYFA 4XKPA 1MDQA 1LGBC 5AA2D 1ZU0A 3OO7A 5H8NB 4N6PA 4O3AA 5CI5A 3FV1A 3IL1B 4NMYA 3K1PA 2UYEA 3QXMA 2RC8A 1N84A 3G3IA 1MXWA 3G3FA 2B65A 4XXUA 2XXRA 3Q28A 3OELA 4R75A 5I2KB 3TYHA 3T93B 3OXNA 4JWXA 1IIWA 2HCAA 1QUJA 5H8HB 1LLSA 1ZTYA 1ZKBA 2UVJA 4Z0IA 1M5CA 1QUKA 2DVCA 2F34A 3KEIA 4RY1A 3Q25A 5TP9B 1URDA 3FVKA 1SI1A 2XD3A 1GVCA 1GGGA 1N04A 2A5TB 5AA4A 3ONMA 1MY4A 3GBAA 3K01A 4TLMB 4RPNA 2YPNA 2RINA 5CBRA 1ANFA 1Y3PA 4G68A 4H67A 4KQPA 1DSNA 5CM6A 3SDFA 3LUYA 1TFDA 1N3WA 3B6QA 3SEVA 4G68C 1TT1A 4L17A 1MQIA 1J1NA 3GBBA 4ONYA 5L9OA 1M5DA 4EUOA 2XXVA 5HPQA 4PFYA 1MPBA 1AH5A 1OLCA 4IB2A 4U23A 1JW4A 4LUBA 5IAIA 2DE4A 4GIZA 1FQDA 3KN3A 4F2OA 3PGFA 5A5XA 1YCJA 1Y4TA 1PC3A 3KN7A 1MXUA 4NF6B 3QUJA 1H45A 1B46A 5I56A 5I2NA 5LOMA 2RCAA 4THIA 2I3VA 1NL5A 2OBGA 3W9VA 1B3FA 1FTLA 1B5JA 1UTHA 3CSBA 4YKPA 4LQ5A 4FE8A 5KZTA 1N76A 1MDP1 3DP6A 3T9UA 1XT8A 3DLNA 3K4UA 4YB5A 3V89B 4FIMA 3O9PA 1URSA 3RTFB 3IOWA 4YKJA 4PFTA 3O2AA 3FV2A 4LZ5A 2QS4A 2V93A 4XKQA 2VP1A 2Z8DA 3K00A 3MP8A 1WDNA 3PPNA 2XX7A 5K2YA 5M2VA 3EQ1A 4DE8A 4N07A 3HCQA 2F8DA 2XXXA 1B0LA 4U4XA 1XOCA 2FA7A 1IUDA 5I58B 4NE4A 3E4RA 1MY0A 1LFHA 1M5EA 4XKRA 1B51A 1A99A 1POTA 3Q26A 2GRVA 1LCFA 2NOOA 1DOTA 1GTKA 2QS2A 1FQBA 1M5FA 3LC8A 3CFLA 4JB7A 3DP4A 3FJMA 2O84X 1F9BA 3FUZA 1UIUA 5L8DA 1KWHA 4WKMA 2XXPA 3M8UA 1MY1A 3IOTA 4RA1A 4GOTA 4ECFA 3TTRA 5ICTA 1US4A 2O51A 1FTOA 4EXLA 4R73A 4AB5A 1CB6A 4Q0CA 2ZYOA 5DEXB 3UA8A 4ZS9A 2I4CA 3D4GA 4QFNA 4LATA 4TQUQ 2H25A 4NF8A 3BKIB 2M8CA 2Y84A 1QJMA 4QSCA 2UVGA 3WAEA 4OQOA 1VR5A 3LR1A 1P1QA 4NWCA 1DPEA 5HM4B 4O3BA 3BFUA 3FGSA 4C1UA 5KCJB 3USDA 3M3FA 3PMVA 1B2HA 1JEUA 4K3FA 2I49A 2R9JA 4E0WA 3MBPA 4OHNA 3IB0A 3UN6A 1LAGE 5ITOA 2VOZA 3KOTA 3IORA 4JWYA 4KCCA 4EDPA 4F19A 1MQJA 4U21A 1R1NA 4LONB 3M3KA 3MVZA 3FASA 4BDRA 4NTLA 1OVTA 1VFEA 4OEUA 4OWDA 1O64A 3DM0A 3I6VA 2FNCA 5H8SA 3DP8A 3QUFA 2ZYNA 2HQ0A 3C36A 4TOZA 1II5A 5ITPA 1B3GA 2ONKE 2QS3A 3FZVA 4BDQA 5JEIA 2Z8FA 4HCWA 1LBCA 5CMBA 1NNTA 2RCBA 1NH7A 3LSXA 1R9QA 2I3WA 1MG1A 1OMPA 1B58A 3VE1B 4H5GA 2RC9A 3K2DA 1XVXA 4QFKA 2IEEA 3MVYA 3S9MC 1SI0A 3PMWA 3IO4A 3UORA 2F35A 3FVNA 3E13X 1NFTA 4FJPA 1Q35A 5CMMA 5TPAA 5CRYA 3N94A 2ZNUA 2LAOA 2REJA 4TLLB 4G2ZA 1QKBA 3U72A 3N5LA 1FQFA 1JETA 1MM6A 1LB8A 2ANJA 2X26A 4H8JA 4KPTA 3CG1A 5JTYB 2Q2CA 2DXYA 4IGTA 2F6GA 5AA3A 4EQBA 5L9SA 3H6TA 1NMUA 3RN8A 3O97A 3C34A 2DE2A 1H43A 4FAJA 3QSLA 1Q1KA 1JQFA 4RK9A 3PUVE 4GL0A 2F36A 1DTZA 2ONSA 3RT6B 3W15C 3TODA 1ZJLA 1MY3A 3PV0E 3ILTB 1JNFA 4O3CA 2HAUA 4R6HA 1MQGA 1NH8A 3UGWA 3U92A 1S7YA 3R26A 5H8QA 4OTEA 1IZ1A 2I0CA 3IR1A 4JDFA 3T96B 1B7HA 3O6GA 2VGQA 3HN0A 4ELOA 1EZPA 4ESXA 3H4ZA 4GF8A 1HSJA 2QRYA 2GHBA 3KJTA 2Z22A 1DMBA 2DSFA 3UK4A 1B4ZA 1FW0A 3OSQA 3K1MA 4WXJA 4GVOA 4AB6A 2Q8JA 4ZDMA 1D4NA 4KYDA 2ZXTA 2P0SA 3B6TA 3CFXA 1N0TA 3P7IA 4JBZA 1Y1ZA 3VVFA 2NUVA 3BFTA 3FXRA 4BDOA 1MRPA 4ZEIA 4XIGQ 3VLWA 3IK6B 3VLVA 3THIA 4QRZA 3TDJA 3PPQA 4G8MA 4ZEDA 3TTKA 1IEJA 3IX1A 3MPKA 1Y9UA 3MC2A 2ZNSA 1Y3QA 1QULA 1A40A 4F29A 1IITA 3TQLA 1YAEA 4R74A 1Y20A 4FORA 4C1TA 2V3TA 3PPPA 1ZBMA 2O68A 1QW0A 3QK6A 4MH5A 4PFUA 1P1NA 4F3PA 1B05A 4ZEKA 4G77A 3C32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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