4NF4B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with dcka and glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 88
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B02
4JSOA 3C4MA 5KDTA 1HSLA 5H8NB 3OEMA 1WODA 5L9OA 1FTKA 3PPPA 4MBPA 2DP8A 4OEUA 1B5JA 5F1QA 3MUQA 2PYYA 2V3UA 4NWCA 4Q30B 3MVWA 1IITA 2ABHA 4IO7A 1EZOA 2REGA 2ZXTA 2A5SA 4BDNA 1P1WA 2IA4A 1JW4A 2UVHA 3EF7A 2NOOA 2QS2A 3L6GA 1A7LA 3HSTA 3UP9A 1Z7NE 3R26A 2HZLA 5H8NA 2Y7WA 5I57A 4EQBA 4R2BA 2O1LA 3FZVA 1B0LA 1N7WA 1LAFE 1TFAA 4FJPA 2O7UA 3KJTA 3C34A 2UXAA 2DOJA 4Z0IA 4HCYA 3KN7A 1NNKA 4QRZA 4P0GA 1B7ZA 3KZGA 4BDLA 3ECRA 1N04A 4TLLB 3IOTA 1RYXA 3TCGA 1P99A 2Q89A 4FIMA 4C1UA 4MF3A 4H65A 3D4GA 3C9HA 3HO7A 3PGFA 1PB8A 2O1MA 4XIGQ 5CI5A 5ICQA 2W7YA 5JK4A 2AYSA 4NF6B 3K1PA 1US4A 1ZTYA 1URSA 5I56B 1OLAA 3OO6A 4AB5A 2PT1A 4MH5A 1D9YA 3LC8A 3LR1A 4BDOA 2F6PA 4DCXA 3I5OA 4E0WA 2DWHA 1NNPA 1TT1A 2RINA 3CG1A 2O69A 1A8FA 1XVXA 2R71A 4HW8A 2ZYNA 2ZYKA 2E0SA 4WEDA 1MY3A 2XX8A 1JW1A 4OQOA 3PPRA 4NF8B 4YAHX 5I56A 2HAVA 4LQ5A 2BJJX 4LUBA 5H8FB 3CI8A 3EHUA 4RK2A 1MQJA 4FECA 3WAEA 4H0WA 1J1NA 1TWYA 1FTOA 4KPTA 3N6TA 2I6EA 4OYVA 3O9PA 3PPQA 3E4RA 4OTEA 5AA4A 5DVIA 1NKXA 2QS3A 2XD3A 1IZ1A 1OQHA 1MG1A 1H3DA 5L8DA 5DVJA 1LFIA 1MH4A 3FXRA 4OXVA 2ZYMA 3MP8A 3SEXA 4KI0E 3S9EA 2VD3A 3KG2A 2YJPA 1IXGA 3BKIB 4NF8A 4L17A 2RC8A 4YKJA 1BKAA 5H8FA 2G93A 2QMWA 1RKMA 3KN3A 4QFPA 3U94A 4OETA 1JVYA 4U2RA 2FYIA 1LBBA 4U21A 4KYDA 5H8HB 3RUMA 4F1UA 2RCAA 1B0HA 4NF5A 5CMMA 3IK6B 3O29A 2QRYA 4UA8A 3N94A 3R6UA 1XHYA 2P0SA 2Y84A 4O3CA 1FQAA 4JWOA 1OIBA 1B2HA 1II5A 4QSEA 3TUSA 4KHZE 4PFWA 2X7QA 3DP4A 2Z23A 3PUXE 4ZE9A 5ITPA 2ANJA 1DOTA 4DCYA 3DLNA 4XKNA 2YLNA 3TFLA 4R6KA 4ZZAA 3GBAA 2M8CA 3K1NA 1D4NA 3KJ7A 5H8HA 1B05A 1Y20A 5I58B 2P2AA 2F6GA 1B58A 2V3QA 5H8SA 1I6QA 1Z7ME 4ELOA 2OZZA 2XXVA 4OESA 1QJMA 1MQDA 1CB6A 1UTHB 2I3WA 1A54A 3IO6A 3PUYE 1O64A 1IQ7A 3E3KA 3PU5A 4R75A 3O66A 1GR2A 3C32A 3H3GA 3C36A 3MVZA 3MBPA 4X9TA 5I58A 5TU0A 4NTLA 2NUVA 3U92A 1ELJA 1UTHA 4H8JA 3CSGA 3Q27A 2HAUA 3CRBA 3ZKLA 2Y7RA 1LB8A 4G2ZA 1MXXA 1B3GA 3H6WA 4I8CA 5AA3A 4X1BA 4H1XA 3S9MC 3W9VA 1S9TA 4QHQA 3CIJA 1XC1A 4DXCA 4AB6A 3PV0E 5ITOA 4IO2A 1GV8A 5BUUA 5DEXA 3Q28A 3IX1A 2QS4A 4G4PA 1SD3A 4JDFA 1SW4A 2H98A 2VD2A 4NMYA 5JEIA 2O51A 3OXNA 4DXUA 3SEUA 3TPAA 1P1QA 3HPIA 3KOTA 1N84A 5DTBA 1D9VA 3E9XA 4OEVA 3EPEA 3TTKA 1OVBA 1PB7A 4QF9A 3U1OA 1DPEA 1XVYA 4QFNA 4DZ1A 4ZEDA 5FHNA 4P11A 3CFXA 1YCJA 3C35A 4ESXA 4LATA 3TKDA 3CVGA 3TEPA 2Y7PA 4OENA 4LONB 5ELVA 2UYFA 5IAIA 1ZJLA 2F97A 3B6QA 4MLQA 3FV2A 4BDQA 3MWBA 2ONKE 2OLBA 1FQDA 2RC9A 4ECFA 2X26A 1IXIA 4HCWA 1B52A 1HSEA 2DWAA 1P1OA 4PFYA 3C33A 2DSFA 4N6PA 5IKBA 1Y1MA 5L9MA 4Z7EA 4FORA 3SETA 1QUIA 3EQ1A 2Z8EA 3PUZE 1ZBMA 2PBWA 4EDPA 4LA9A 4XKQA 1LSTA 1NFTA 2I0CA 3G3GA 1LGBC 4KFQA 4ZEBA 3OO9A 4Q8RA 3V83A 1UQWA 3TAJA 3OD7A 3O6GA 3LSWA 1ZU0A 3H6VA 2THIA 2V84A 2XXYA 4LZ8A 3I6VA 5I59B 2XX9A 2ESNA 2F7AA 5AA2B 2I58A 2Q9TA 2VGQA 3V8XB 1QUKA 3FVNA 1XOCA 4G68C 3QUFA 4RYAA 2QL3A 4OHNA 4WEPA 5A5XA 4JWYA 4G8NA 3K6UA 5LOMA 5JTYB 5M2VA 4O3BA 2I49A 1MPCA 2DS9A 2CMOA 2Q8JA 4RY1A 5KCJB 3FV1A 4GRKA 3RT6B 3PUVE 3CR9A 3VDFA 4KQPA 3H4ZA 2ZNUA 5AA2A 3MZ1A 2QS1A 2OWSA 1TFDA 1M5EA 1ZLQA 3Q29A 1IIWA 1POTA 1FCKA 3MC2A 3S9NC 4OFOA 3SKPA 5ICTA 2Y7KA 5B7DA 1DTZA 1VE4A 2B3BA 3TCFA 2GHBA 4TLMB 3W15C 2AL5A 4U1ZA 1OMPA 3HHFA 4GVOA 2RKMA 4H67A 4K3FA 4FAJA 4LP2B 3TMGA 4R74A 4TQUQ 4OERA 3DELB 4ND9A 1FTJA 4X1DA 4GOTA 4LVQA 2F5XA 4F3GA 3TZAA 5BWJA 3MP6A 2PVUA 3DM0A 1B6HA 1YTVA 3HCQA 4GL8A 4C1TA 1MPDA 1B3EA 3M3FA 3UA8A 2FA7A 3H6UA 3GBBA 3RPWA 4ONYA 1A55A 3A3CA 3TTNA 2YPNA 4NF6A 3RNNA 2CZLA 2F78A 3S2VA 4ELQA 3PD9A 3MZ9A 3EN3A 2ZYOA 3PD8A 4I9DA 3K6VA 4M4GA 1SVXB 1L5TA 3RQTA 1LCTA 3H6TA 2ZMBA 4Q5TA 3K6WA 4EF1A 3PUWE 4E0XA 2G29A 1ATGA 2GH9A 2R9JA 3TELA 3QXMA 2RF1A 1BTJA 3HHGA 2F36A 2AIXA 4DLDA 3VE1B 4MLVA 2I4BA 4GXSB 4RNSA 2QJEA 5DYHA 1MM6A 4GD5A 3IOWA 3KGCA 1AOVA 1H44A 1LAGE 3IOUA 4EQ9A 1LB9A 4F1VA 4YB7A 4GF8A 1O63A 1S7YA 3R7XA 1NNFA 2GRVA 1AH5A 3JV9A 4ZEIA 3DP8A 2OBGA 3S4UA 3QUJA 4G68B 1LFHA 4KYSA 3UK4A 4GL0A 1QULA 3SERA 3GXAA 2PMSA 2E1SA 3MPKA 3GZGA 4H6DA 4F3SA 4YB5A 4YKPA 1N7XA 2HZKA 2XHDA 2H5YA 3TTLA 1B3LA 5CMBA 2IEEA 5I2KB 4WKMA 5ISUA 4FEBA 2LAOA 3IL1B 2GFEA 1CE2A 4GQOA 1B51A 3FUZA 3SDFA 3D4CA 5I2NB 3AXFA 4QFKA 2Q88A 5F7VA 1R9LA 4BDRA 5CBRA 3ILTB 3N6UA 3MZBA 4G68A 4HTGA 4U23A 1POY1 3UORA 1MY4A 1UTBB 1I6AA 3QIMA 4MFIA 3G3FA 3ZSFA 3G3JA 1JEUA 2ALUA 3CG3A 1B46A 4IO3A 5I2KA 3H06B 4U4SA 2R6GE 1PBPA 1HSJA 4NEDA 4YMAA 1LCFA 3UIFA 3RTWB 4IY6A 1URGA 2XXXA 1GGGA 1D3KA 3F11A 4N13A 2VOZA 3OO8A 1MY0A 1Y4TA 4R2FA 3UN6A 4F2OA 1SQYA 1GTKA 4ZZEA 2XXIA 1MS7A 1B5IA 1Y1ZA 1KWHA 3FJMA 1FQBA 4LZ5A 4IB2A 1US5A 2DXRA 4YICA 3FVKA 4KYEA 4F39A 2UYEA 4YMBA 4I1DA 3P7IA 2ONSA 1BLFA 3OSQA 1H76A 4JB7A 2PT2A 3KBRA 2DWJA 2XXHA 3FVOA 2VP1A 1PBQA 4YZZA 1NNTA 1B9JA 3JZJA 3USDA 2NWJA 3U72A 4R73A 3VLVA 2OK2A 1USYH 2I4CA 4RK9A 5DT6A 1B3FA 2REJA 3QYTA 1H43A 3MP1A 1QKBA 2QPQA 4HS7A 4RJZA 2XXWA 4OFJA 3A09A 5EYFA 4GIZA 5EHSA 1R6ZA 1R1NA 3FASA 4QSCA 1RYOA 3IB0A 4YKKA 5H8QB 1R9QA 2OJTA 3BBRA 1Y9UA 1YAEA 1VFDA 1MQHA 1MXUA 1AL3A 4OVJA 1B32A 2XXRA 4KCCA 3LSLA 4FEDA 4RA1A 3O28A 3HN0A 5TP9B 1O7TA 4IGTA 1SYIA 4G77A 2Z8FA 4P0IA 2Q2AA 1QVSA 1M5CA 4FE8A 4M1VA 3BFUA 1I69A 2DE2A 4PP0A 1N3XA 3ODBA 4JWXA 1EU8A 1MXVA 3MAMA 3TYHA 1H45A 4ZDMA 5H8QA 3T9UA 2DE3A 4N07A 3T9XB 4POXA 1B40A 3IB2A 5KDTB 3IB1A 5K2XA 3KSJA 4F19A 5FHOA 5TP9A 1DPPA 2X7PA 2DVCA 2RCBA 3OENA 4IO5A 4FATA 3LBSA 4GWOA 5FHMA 1MQGA 1N76A 4F22A 2DE4A 2HEUA 3OMBA 1MRPA 3FATA 3B7DA 1IUDA 1T0KA 1MXWA 4POWA 1F9BA 4U22A 3ZKKA 3M8UA 3G3KA 2F7CA 3MW0A 1JVXA 1B1HA 4YU0A 4QSDA 5I57B 3T22A 2OCUA 1LAXA 2H99A 5FTHA 5TPAB 1JETA 3N26A 4LZ7A 4BLAA 2Z22A 1BIYA 3IJXB 3SESA 4EXKA 2XD2A 5I59A 2UVIA 4YKIA 3QK6A 2DYXA 1AMFA 4PFTA 3VV5A 2D3IA 3PMVA 4DIGA 4U1OA 4RPOA 1QUJA 1SDXA 1FQCA 3DP6A 4ESWA 4EQ7A 1M5DA 2QMXA 4KD5A 1OVTA 4EXLA 5TPAA 3FXUA 2HFBA 5JTYA 4DXBA 5KCJA 1WVJA 1MH3A 3HV1A 1UIVA 4ELPA 4GLIA 2XXTA 2O6AA 2B3FA 1JQFA 3C31A 2I0BA 1MXYA 2F35A 1FTMA 1Q35A 1NMUA 1XT8A 3B6WA 4ZEFA 4H5FA 3LUYA 2ONRA 4ZE8A 3CFZA 3MPLA 1I6BA 4RPNA 3BFTA 1ZMGA 4XXUA 3EHSA 4OWDA 1M5FA 2NVUB 3PPOA 5CMCA 1B7UA 3TODA 3SEVA 3ZS6A 3VLWA 4OZ9A 4JXIA 3IOVA 5CM6A 1MM7A 4XKPA 3M3LA 3G7WA 2O84X 3PPNA 3V5AA 2FNCA 3MQ9A 3ONMA 2UVGA 2Z8DA 3U8QA 5HPQA 3SEYA 5I84A 4ISUA 2HCAA 3OSRA 2DXYA 1SBPA 3K1MA 1A8EA 1Y3QA 1A40A 4IGRA 3OOAA 2DVZA 4PFUA 1WDNA 4OFLA 5AA4B 2Y7IA 2KLFA 4R6YA 4U4XA 2V93A 4GFRA 4H8IA 1FW0A 3H7MA 4IO4A 2V25A 3VXBA 2I48A 3H03A 5EHMA 5AA1A 1VFEA 1N0TA 3ILUB 1M5BA 1JEVA 2F8DA 5K2YA 1B7HA 1B3HA 3QSLA 4R6HA 5CMKA 3WAFA 1SYHA 5B70A 5AE4A 3EHTA 5L9SA 3O6HA 3O2AA 1SW2A 1Y4CA 4F18A 3FVGA 3K2DA 1FQFA 2O7IA 3VFJA 1XS5A 4G8MA 4NF5B 1DMBA 1NH8A 3IORA 2ZNTA 4PETA 3KN8A 3K02A 4KR5A 3RY3A 3FJGA 4DDDA 4R9GA 1BP5A 2RC7A 3TTRA 3CSBA 3T96B 4JSDA 3W9WA 4ELRA 4I62A 4JBZA 3GLBA 3FGSA 5HM4B 1SW5A 1LFGA 3PMWA 1A99A 3TDJA 3U93A 4F1YA 1B4ZA 2F34A 1S50A 5AA2D 3TCHA 4NF4B 3OO7A 3MVXA 3IR1A 3KOSA 3IO4A 4ZEKA 1OQGA 1EZ9A 1LAHE 4WXJA 5KZTA 4IY5A 4GXAA 4BDMA 4QFOA 2GHAA 1SI0A 4R9FA 1DSNA 4OMBA 1PC3A 3L6HA 4XKRA 3JYRA 1Q1KA 3VVFA 1IEJA 1EZPA 1YPNA 2XX7A 3T66A 3FJ7A 1IXCA 4X48A 2HXWA 4C0RA 3KEIA 3RLFE 2PX1A 5J1DA 3T9HB 3VVDA 5CBSA 3T9VA 3IAZA 4O3AA 4ZS9A 3K00A 4NF4A 5I2NA 3RT8A 4ZECA 1SW1A 1SI1A 2ZNSA 4DE8A 2UVJA 2A5TB 3I3VA 1UTBA 2NXOA 1AIVA 3LSFB 3TTMA 3TQLA 3TQWA 2HQ0A 1LBCA 3VLUA 3FD3A 3QAXA 3K01A 1MY2A 3RGYA 5DEXB 3T93B 4AQ4A 4IO6A 2H9BA 1NH7A 1MQIA 2QSXA 3K6XA 3VXCA 4YB6A 2WKYA 1N3WA 2A5TA 1FTLA 1MDQA 1Y3NA 2XXQA 1ZKBA 3FIRA 3G3HA 3G3IA 1PEBA 2DWIA 1LLSA 3KFMA 5CC2A 1EH3A 3Q26A 1QW0A 4F2QA 1URDA 4F3PA 4THIA 3E13X 3LSXA 1QKAA 2XXUA 4RXLA 4TOZA 2B65A 3S9LC 3VVEA 1DTGA 3UGWA 2XXPA 3CFLA 1B1XA 4QFLA 3PMXA 3K4UA 1OLCA 2P1SA 1TXFA 1PB9A 1PDAA 3K0VA 1MPBA 3B6TA 2DQVA 1USYE 1VSOA 1MY1A 1NL5A 2I3VA 2OWTA 4F3BA 1MDP1 3RTFB 1IXHA 5DVFA 1B4HA 3Q25A 1ZIUA 4EUOA 2VHAA 1MXZA 4UACA 3RN8A 1P1NA 1UIUA 1B5HA 2O68A 2V3TA 3THIA 4LQ2A 1VR5A 1JNFA 3M3KA 2D21A 5FTIA 2H4IA 5CRYA 1GVCA 1JW5A 3A3UA 3V89B 3OEKA 3FXQA 4H5GA 4NE4A 3IJOB 4F29A 4NWDA 3MJNA 2Q2CA 3O97A 1Y3PA 4R72A 4G8HA 3N5LA 5HBCA 1P1UA 3SEWA 3OELA 3KSXA 4KCDA 2H25A 2D5WA 5A5XB 1ANFA 4PE5B 2F7BA 4EF2A 4F31B 1FQEA 4PQJA 3MVYA 2AL4A 4XTCQ 3O6IA 4Q0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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