4NF4B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with dcka and glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 88
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B02
2REGA 4H67A 4WEDA 3RQTA 2HAVA 3GBAA 4OVJA 4NF4A 5AA3A 4PFYA 2QMXA 4OHNA 5TP9A 2UYEA 1DPEA 5H8NA 3OELA 2F36A 3TELA 3DP8A 1JVXA 2ZYNA 3FV2A 1N0TA 4P11A 4ELOA 1LFHA 1PB9A 4KR5A 3OEKA 2DYXA 4BDOA 4EUOA 2F7AA 5EHMA 4YKIA 2Q2CA 2VOZA 3IOTA 2Q89A 4F31B 3MWBA 1ZTYA 2Y7RA 2YPNA 3IAZA 1QKBA 2REJA 1IXHA 3C35A 4G2ZA 1ZJLA 2QMWA 3KJTA 4JB7A 5I58B 4GXAA 3UP9A 1Y4TA 5DVFA 1YAEA 4F2OA 4PFTA 1N3WA 2OJTA 1QW0A 1B51A 1F9BA 2DE3A 3IO6A 5DEXA 3PMXA 1LBCA 3W15C 1JW4A 2CMOA 2DWHA 4KHZE 1DMBA 3LSLA 2GHAA 4LZ5A 3WAEA 3V83A 1R1NA 1MQJA 1II5A 3MC2A 2XXVA 2VGQA 3H6VA 4DCXA 1OQHA 2F6PA 3IB1A 1B1HA 4ZZAA 4KI0E 3K6WA 4NF6B 4GQOA 4PE5B 1PDAA 3O6IA 4E0WA 1B7UA 3IOUA 5I2NA 4JWYA 3FATA 3C9HA 4F18A 1ATGA 1OIBA 4NF8B 1FQFA 1M5DA 3K6VA 1NMUA 1POTA 3RT8A 5BWJA 4H0WA 3FVKA 2I4BA 1H3DA 5H8FA 3TODA 2ZMBA 3TTLA 1P1OA 3EQ1A 5CMBA 2F97A 1NH7A 4ONYA 1FTMA 2RCBA 1DTGA 1NNFA 5KZTA 4E0XA 5L9SA 1B3FA 2V84A 4U1OA 3OXNA 2G93A 2KLFA 1R9QA 5K2YA 2Y84A 4LQ2A 3G3IA 2XXTA 5K2XA 2B3FA 5F1QA 3KN3A 4ZDMA 1IXGA 1CB6A 1PBQA 3LSWA 1A7LA 4YMBA 1NNKA 4AB6A 2D21A 3OOAA 3PUVE 3RGYA 4ZEIA 1KWHA 4YZZA 3FGSA 2O84X 3PUYE 3K6UA 2O6AA 3UN6A 3D4CA 2ZNUA 1B3EA 3PUZE 2I49A 2I58A 1QUKA 1MQDA 3EHUA 4C1TA 2RC9A 4QFLA 3KN8A 4OZ9A 3F11A 3D4GA 2NXOA 2XD3A 5CBRA 4I62A 4R9FA 1UTHA 2RC8A 3DP6A 3OO9A 2QL3A 2ONRA 2XXWA 3GXAA 3PGFA 5L9MA 3TQWA 4DXBA 3O6HA 4H5FA 1B5HA 3VLUA 4RJZA 1DTZA 1MY1A 1US4A 4GIZA 2HCAA 3RPWA 1H43A 3UGWA 1WDNA 1B46A 3IJOB 3MPKA 3SETA 1XVXA 2Q88A 1YPNA 1LAXA 1J1NA 3W9VA 3DLNA 4QSCA 1LFGA 3MJNA 3IK6B 2E0SA 3B6TA 5CMKA 4FATA 4EF2A 4XKNA 1LAHE 2DE4A 4L17A 1EU8A 2AIXA 2DWAA 2DSFA 4UACA 5JEIA 3BFTA 4EQBA 1JQFA 1Y3QA 5KDTA 2CZLA 2ESNA 1IUDA 3S9EA 1B0LA 1YTVA 3FJMA 3WAFA 3KSXA 4GL8A 4FJPA 3EF7A 3FV1A 3FXUA 3SKPA 3KEIA 2F5XA 2PBWA 3U93A 1Z7ME 2XXUA 5FHOA 4NTLA 3K01A 1DPPA 1WODA 2UVIA 4OTEA 3UK4A 4F1UA 4H8JA 2P2AA 1PBPA 4N13A 3IOWA 5KCJA 2XXRA 4G8HA 4LZ7A 3MPLA 5ICQA 5CMCA 3PMVA 5FTHA 3Q26A 4F3GA 3VE1B 3O66A 1SI1A 2QSXA 1RKMA 3TMGA 5HM4B 3N6TA 3V89B 1OLAA 1OLCA 1MPDA 2E1SA 2RF1A 1N3XA 2AL4A 5AA2D 1MH3A 3IOVA 1M5FA 1I6QA 4PFUA 4ZEFA 1D3KA 4RA1A 4ZE9A 4R6KA 1SYIA 2VP1A 4WXJA 1S50A 3KJ7A 1ZMGA 4KCCA 2Z8DA 5I84A 4NEDA 5CRYA 3CG1A 4H6DA 3RY3A 4G8NA 1A8FA 1OMPA 4UA8A 5F7VA 1UIUA 1JW5A 1N84A 5CC2A 3I6VA 3IJXB 1EH3A 1FTOA 1P99A 4QF9A 1EZPA 3TTRA 3LR1A 4OWDA 1BKAA 3K6XA 5CI5A 4IY5A 3T9UA 4H5GA 2H9BA 4I9DA 3M3LA 2ABHA 2O68A 4OESA 1MY0A 3USDA 3QXMA 4QFPA 3TKDA 3EPEA 1TXFA 4QFNA 2FA7A 1LB9A 4ECFA 2XX9A 2HZKA 3MP1A 3T22A 4G77A 2F78A 3CI8A 5IKBA 3PPOA 2ALUA 1L5TA 1B7ZA 3N6UA 5B70A 1AL3A 1AMFA 4ELQA 4LUBA 4U2RA 4OETA 2Q8JA 3VVFA 3Q27A 4HCWA 2HFBA 3KOSA 2I4CA 1A40A 3KG2A 3B7DA 3HSTA 1SBPA 1JETA 1B9JA 5AE4A 3U1OA 4HCYA 2P0SA 3RNNA 4DE8A 1IEJA 2XXHA 4FE8A 1R6ZA 1MXUA 3TTNA 1IZ1A 4RXLA 2DVZA 3KOTA 1PB7A 1US5A 3U8QA 2RKMA 2F7BA 2O7UA 2V93A 3EN3A 5HPQA 3N26A 4R2BA 2V3UA 4U21A 2HEUA 1UTHB 3OENA 3U92A 1LAFE 4P0GA 3H6TA 3DELB 4ZEBA 5H8HA 1USYE 2W7YA 4X48A 3Q28A 1QUJA 2ZYKA 2PMSA 3RLFE 2P1SA 2QS4A 3DM0A 4NWDA 3H06B 3O97A 4JWXA 2D5WA 4NE4A 3R26A 2UVGA 3ZS6A 3JYRA 1MM7A 4KYDA 2OWTA 3C33A 4M1VA 2BJJX 4JWOA 1OQGA 1B4HA 2PT2A 1B5IA 1Y1ZA 2DE2A 3MZ1A 1GR2A 4GF8A 5KDTB 3H4ZA 4Q8RA 2V3TA 4GXSB 3PUWE 3MVYA 5ISUA 2DXYA 3TZAA 2GH9A 2THIA 1ELJA 4XKPA 1M5CA 2Y7WA 1O7TA 3IORA 4FIMA 2XXQA 4ZZEA 1A99A 1AIVA 3JZJA 2M8CA 3QUFA 4IO4A 1MXXA 2XX7A 3U94A 1Y3NA 3BKIB 4AQ4A 1R9LA 4YKPA 2VD2A 1FCKA 3HO7A 1MY4A 2DP8A 3TPAA 3FUZA 4MFIA 1PEBA 3VV5A 3G3KA 5KCJB 4XKRA 3VVDA 1MDP1 4H1XA 4QSEA 2NUVA 2I6EA 3VVEA 3O2AA 4R75A 3TEPA 3GZGA 3LBSA 2F7CA 1URGA 2Z8FA 1Q35A 1LSTA 4FECA 4IO2A 3S9LC 3C32A 4K3FA 3ZSFA 2DWJA 2VD3A 1AH5A 1VFEA 1HSJA 3GBBA 1MDQA 2IEEA 4QRZA 3CG3A 4YU0A 1NNTA 3ZKKA 1VFDA 3FJ7A 3PU5A 3S9MC 1D9VA 4NF5B 1M5BA 4ND9A 4JSDA 3FXQA 4GWOA 1B7HA 2OK2A 2XXYA 3H7MA 3PD8A 4NWCA 4F1VA 1URSA 1ZLQA 2Q2AA 2Q9TA 4QFKA 2I0BA 1TT1A 1B0HA 1DSNA 1IXIA 2HAUA 2OLBA 3TUSA 3DP4A 3QYTA 4JBZA 2XXIA 2H25A 4EQ9A 4ISUA 1MG1A 3TTMA 5B7DA 1B6HA 2ONSA 1HSLA 3O28A 1MXVA 4GFRA 1DOTA 4IY6A 4YAHX 1HSEA 3OO6A 5TU0A 1NNPA 3CFLA 3QIMA 4POXA 3IX1A 1MQHA 1UQWA 3QSLA 3VFJA 5H8QA 2ONKE 3IB0A 1SDXA 1H76A 1B3GA 4OFOA 3KZGA 4IO7A 2AYSA 1FTJA 3SERA 3CFZA 4EF1A 3THIA 1SI0A 4THIA 3K1NA 4RPOA 2V3QA 1JNFA 2F34A 3MZBA 3PPQA 2R9JA 4N07A 3N5LA 4OFJA 4PQJA 2O1LA 1P1NA 1H45A 2QS2A 2R71A 4OQOA 4X9TA 4TOZA 4LVQA 3CSBA 1FTKA 4DZ1A 2PVUA 1BP5A 4U4XA 4R72A 3ECRA 1SW2A 1GTKA 3FASA 4C0RA 4U4SA 4QSDA 3MAMA 4F3BA 3CSGA 2DQVA 5ITOA 5H8HB 2O51A 4GD5A 3G3GA 4PFWA 4G68A 4YKKA 2QS3A 3PD9A 3K0VA 4ZEKA 1UIVA 1N76A 1UTBB 1LLSA 4RK2A 3FJGA 3IO4A 3KN7A 4NF5A 1O64A 4YB5A 3LSXA 1Q1KA 5I57B 4FEBA 2YLNA 4KCDA 1M5EA 4GVOA 3K4UA 1QJMA 1SW5A 3HCQA 2I3VA 4HS7A 1MPBA 3S9NC 2NWJA 2V25A 5DT6A 3ZKLA 1FTLA 1WVJA 4Z7EA 2I0CA 3SEWA 5A5XA 3I5OA 4WKMA 5CMMA 4H65A 3S2VA 3CIJA 4BDMA 3G7WA 2Z23A 3CVGA 4OEUA 4Q5TA 1Y3PA 4TLMB 3U72A 1Y20A 3C4MA 1B5JA 3V5AA 3ILTB 3M3KA 5AA2A 2F35A 1XC1A 2QS1A 4R73A 4RYAA 4U23A 5BUUA 3QUJA 3G3JA 3BFUA 1FQEA 4N6PA 1I6BA 3MVXA 1IITA 5H8SA 2Z8EA 2Z22A 2UXAA 4XIGQ 1OVTA 3KBRA 4F3SA 3IB2A 1XT8A 4OEVA 1RYOA 2LAOA 2PYYA 3M3FA 1VR5A 4QHQA 1XVYA 4DLDA 1ZU0A 3PUXE 1IXCA 5J1DA 3OEMA 4TLLB 4IO3A 4O3AA 1MM6A 3VLVA 5JTYA 5I59B 5AA1A 1SVXB 5LOMA 3B6WA 3MP6A 3C36A 3OSQA 2WKYA 5DYHA 4ZECA 4I8CA 4R9GA 1B05A 4BLAA 3KGCA 3MP8A 3I3VA 3HPIA 4JSOA 3UIFA 1Y4CA 5M2VA 2XXPA 5ELVA 3K1PA 3BBRA 3EHTA 4C1UA 1ZBMA 1NH8A 3B6QA 1VE4A 5ITPA 2FNCA 4DDDA 2XD2A 1SYHA 2I3WA 3IL1B 5ICTA 1MH4A 1OVBA 3MZ9A 5CM6A 2GRVA 3MBPA 3P7IA 3O6GA 4LQ5A 4EXLA 3SEYA 3HN0A 2FYIA 3IR1A 2ZNSA 1LCTA 4R6YA 1AOVA 4M4GA 4JDFA 4ELPA 4TQUQ 4X1BA 3G3HA 4PP0A 4LATA 4AB5A 3CRBA 3H3GA 3ILUB 1UTBA 1P1WA 3KFMA 5H8QB 2ZXTA 2O69A 5I56B 1D9YA 4F22A 1LFIA 5I57A 4XTCQ 3T9XB 1BLFA 1NKXA 4BDRA 3JV9A 4LP2B 1LAGE 4RPNA 4NMYA 1XHYA 1MPCA 2H4IA 1S9TA 1QULA 3K2DA 3LUYA 3O29A 3UA8A 4MF3A 2O7IA 2DWIA 3O9PA 4POWA 4QFOA 1VSOA 4IB2A 2D3IA 5DVJA 1D4NA 3MW0A 3PPPA 1B40A 4KYSA 3FIRA 3Q29A 2QJEA 2O1MA 4KQPA 3HHFA 3N94A 1N7XA 4U1ZA 3UORA 3FXRA 4BDNA 4G68C 4FAJA 2IA4A 1S7YA 1MY3A 4YB6A 4P0IA 1I69A 4IGRA 1P1UA 1LBBA 1MRPA 5DVIA 1SD3A 3SESA 4DIGA 2HXWA 3FVGA 3VDFA 4OENA 3MVZA 2Y7IA 4OXVA 3TAJA 3Q25A 5L8DA 4KFQA 2A5TA 1NFTA 1LCFA 1SW1A 4ELRA 2DVCA 4O3BA 1MXWA 4G68B 4YB7A 5EYFA 2DS9A 1B32A 3OSRA 5I59A 1FQBA 4R74A 1B3LA 3PMWA 2B3BA 4U22A 1A55A 4JXIA 4RK9A 1XOCA 3A3CA 3TQLA 1B3HA 5FTIA 5AA4A 4IO6A 4FORA 3TDJA 1P1QA 2F8DA 3CFXA 4YMAA 3T9VA 1Y9UA 4MLQA 2ZYMA 1T0KA 3K02A 3KSJA 4LA9A 4HTGA 4KYEA 5A5XB 3L6HA 3C34A 4R6HA 2XX8A 1H44A 4LZ8A 1USYH 1ZKBA 4XXUA 2OWSA 1MS7A 2Y7PA 3TCHA 5AA2B 1EZOA 2RC7A 1LGBC 3R6UA 2GHBA 1QKAA 2X7PA 3R7XA 1B1XA 3T93B 2XHDA 1MXYA 3OO7A 1B58A 3MVWA 3H03A 2YJPA 3A09A 4Q30B 4BDLA 2HZLA 3EHSA 1N7WA 1QVSA 2QRYA 3E13X 3TCFA 4DXCA 1FQCA 2UYFA 5I58A 4O3CA 5I56A 3RTFB 3PPRA 2H98A 3G3FA 4GOTA 3HHGA 1IIWA 4OERA 4X1DA 3E4RA 5I2KB 3S4UA 3MUQA 3M8UA 5IAIA 5JTYB 1B52A 2ZYOA 3RT6B 2PX1A 3E3KA 1ZIUA 4F29A 3OO8A 2B65A 5CBSA 3E9XA 1I6AA 1PB8A 2DXRA 2OCUA 2G29A 1TFAA 1XS5A 1URDA 3FVNA 3SEUA 3TTKA 3L6GA 3V8XB 2RCAA 2H99A 2OZZA 4MBPA 4F2QA 1BIYA 5TPAB 1TWYA 4NF6A 1EZ9A 1MY2A 1TFDA 1MQIA 1PC3A 4ESWA 2NOOA 4F3PA 4NF4B 2I48A 1O63A 5TP9B 3T66A 4NF8A 1LB8A 3SDFA 3W9WA 5H8NB 3VXCA 4ZEDA 2A5SA 4MH5A 3FZVA 1NL5A 4DCYA 3FD3A 1FW0A 4FEDA 3ONMA 1N04A 3OD7A 1Z7NE 3VLWA 4HW8A 4GRKA 2RINA 3ODBA 1CE2A 1RYXA 4GL0A 1B2HA 1GVCA 1A8EA 5L9OA 4ESXA 4WEPA 1JVYA 2VHAA 3RUMA 3TYHA 2HQ0A 4G8MA 3LC8A 1JW1A 2AL5A 1B4ZA 1ANFA 3SEVA 1JEVA 3HV1A 1GV8A 2X26A 2UVHA 4KD5A 4PETA 4F19A 2UVJA 2ZNTA 2H5YA 3RN8A 5DEXB 1SQYA 2XXXA 1Y1MA 2Y7KA 3GLBA 5FHNA 3K1MA 1BTJA 2X7QA 4XKQA 3TCGA 3AXFA 1FQDA 3PV0E 3QK6A 3C31A 2NVUB 3H6UA 4Z0IA 4OYVA 1IQ7A 2GFEA 4F39A 5I2NB 4BDQA 3FVOA 4IO5A 3TFLA 2DOJA 2R6GE 3H6WA 4OMBA 3K00A 3CR9A 4YICA 4RY1A 4YKJA 3T96B 1GGGA 4GLIA 5H8FB 1FQAA 4IGTA 3RTWB 2A5TB 4LONB 4DXUA 4EXKA 4Q0CA 5HBCA 4G4PA 2PT1A 4ZS9A 4EDPA 2F6GA 5I2KA 1YCJA 1JEUA 4F1YA 2ANJA 3A3UA 4I1DA 5FHMA 5JK4A 2QPQA 4R2FA 4KPTA 3VXBA 3MQ9A 3QAXA 4EQ7A 4OFLA 5EHSA 5DTBA 3LSFB 3SEXA 3PPNA 1MQGA 4RNSA 5AA4B 1SW4A 3OMBA 4MLVA 3T9HB 4ZE8A 4H8IA 2OBGA 1POY1 1MXZA 1A54A 1QUIA 5TPAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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