2Y7RA

Dntr inducer binding domain
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
MDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Crystal Structures of Dntr Inducer Binding Domains in Complex with Salicylate Offer Insights Into the Activation of Lysr-Type Transcriptional Regulators.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
total genus 63
structure length 212
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7rA02
2Y7RA 1POTA 1S7YA 4YICA 4RJZA 4G68C 3AXFA 4DIGA 3OELA 4DXBA 3FVKA 1JNFA 1B7UA 3CVGA 4IO3A 2HFBA 2AL4A 3K02A 2X7QA 3FATA 2XD2A 4H6DA 4F3BA 3IJOB 2DWJA 2I3WA 4ZEDA 4G68B 4KPTA 4FATA 3OEMA 1JW4A 1MY3A 5DVJA 4DE8A 4ZEKA 2Z8EA 4Z7EA 3O97A 3O6GA 1B6HA 1HSJA 3FVNA 5A5XB 1MG1A 4O3AA 2P0SA 4F39A 2Q2CA 1IITA 1UIUA 1MPDA 4QFKA 2F8DA 3T22A 3IOTA 3RTFB 4OFJA 5H8FA 1XHYA 4NE4A 4ZZEA 3OOAA 3MVXA 4R9FA 2I6EA 2R71A 2ABHA 4ONYA 2O6AA 3KEIA 4P11A 4I9DA 3M3KA 3TUSA 3TTLA 4EQBA 2A5SA 5M2VA 1MM7A 3KN8A 1GR2A 5H8HA 5A5XA 3MP6A 3TODA 4R2BA 1FW0A 5KZTA 2I49A 4ZE9A 4AB6A 3OSRA 5B7DA 3B6QA 3FD3A 1XS5A 2DYXA 3KOSA 3OSQA 4F1VA 1H3DA 3L6GA 1VFEA 4LVQA 1B0LA 1SI1A 1MXYA 4N13A 5AA2B 3ILTB 3F11A 1IQ7A 3OEKA 5CI5A 2Y7IA 1LAXA 5AA1A 1B40A 3RT8A 1USYH 3FVOA 3B6WA 4FECA 2M8CA 5I84A 2DVCA 1Z7ME 3IL1B 4F3PA 4UACA 1HSLA 5JTYA 2ONKE 2V84A 1N3WA 2O51A 1I6QA 2HZKA 4EXLA 3C32A 3HHFA 5AA3A 2OWSA 3GZGA 2E0SA 1F9BA 4OZ9A 4TLLB 2DE4A 1MY2A 2DWIA 1YCJA 2H4IA 1SYIA 3RN8A 3RNNA 4DDDA 5B70A 1LSTA 2QJEA 1MM6A 2XXIA 3CSBA 4HS7A 5KCJA 2XXQA 1GTKA 3FJ7A 4U1ZA 1Y4CA 3O9PA 4IO6A 3PUXE 2D21A 1US4A 1B58A 1LGBC 4ELRA 1ZIUA 2OBGA 5HM4B 4DLDA 3H3GA 5DT6A 3C35A 1OIBA 1QUKA 3S4UA 4XXUA 3QSLA 1EH3A 4R72A 3C36A 1OVTA 3OXNA 3MVZA 5J1DA 1Y1MA 2DE2A 3FJGA 1H43A 4DZ1A 1P99A 5HBCA 3IOUA 4QF9A 4YAHX 1TWYA 2Q8JA 2RC9A 1SW4A 2REJA 1SVXB 1QKAA 2H9BA 1ZU0A 2B3BA 1PBPA 3PMVA 4IO4A 3O28A 3PUWE 3MC2A 1EZ9A 1J1NA 4PFUA 3TMGA 2XXYA 3G3HA 4F2QA 4F29A 3N5LA 1B1HA 2VHAA 1WODA 4RY1A 4Q5TA 3Q25A 1VE4A 5F1QA 4FJPA 4ZECA 2NVUB 1H44A 4H0WA 3H6TA 4BLAA 1A40A 2H5YA 3A3CA 1FTKA 4OWDA 5AA4B 5ELVA 3EHSA 4YB6A 3UIFA 4U4SA 1MQDA 4Q30B 5CMKA 5L9OA 3SERA 4RK9A 2LAOA 4HW8A 2E1SA 3MZBA 2NWJA 3VVFA 5FTIA 1GGGA 1MDQA 2H25A 4BDQA 3C31A 3MVYA 2G93A 2D5WA 1MXXA 3KJTA 1WDNA 4YZZA 3WAFA 5EHMA 1MH3A 4RA1A 4BDRA 3JYRA 5FHMA 3K00A 5K2YA 1RYXA 1R1NA 3KN7A 1B5JA 1SW5A 4OFOA 1A7LA 4I62A 4EUOA 3BFUA 4WEPA 2HQ0A 1B3EA 4OESA 4U4XA 5HPQA 2QRYA 3A3UA 3EHUA 4F3GA 1EZOA 4R6KA 5JK4A 1XVXA 3RLFE 4LZ8A 2RINA 1IXGA 3I6VA 3SKPA 3BBRA 3K6WA 4MBPA 4MFIA 1MY1A 1MXWA 2QS3A 1Y3QA 1LCFA 3CIJA 4FIMA 2DQVA 4YU0A 3PGFA 4EQ7A 1ZKBA 3TDJA 3UGWA 1A99A 1PBQA 3D4GA 4GIZA 3FXRA 1TFAA 3MP8A 4KR5A 1LFIA 1TT1A 1LAHE 4N07A 1UTHB 1N76A 4EF1A 3A09A 3H6VA 3S9LC 2FYIA 4EQ9A 3CG3A 1OQHA 5F7VA 4R9GA 1DTZA 3EN3A 3W15C 2P2AA 4XIGQ 3U94A 1UQWA 4DCYA 1Y9UA 4F19A 4NF5A 3VXCA 4X9TA 3TKDA 1JQFA 5CMMA 2FNCA 4ZEBA 1B0HA 1Q35A 1Y1ZA 1A8FA 3E9XA 4NEDA 2IEEA 1UTHA 2UVHA 1LCTA 3VLUA 2Z23A 3K6UA 1YTVA 1MXUA 2ZNUA 3IAZA 3G3IA 3USDA 4G77A 4H5GA 4NWCA 2AIXA 2I0BA 3MVWA 4JWXA 1Y3NA 5BUUA 2VP1A 4H1XA 4OENA 1A8EA 3IK6B 1TFDA 2ZXTA 3VVDA 4OQOA 2VD3A 2YLNA 1FTLA 2Z8FA 3U92A 3MW0A 4RYAA 1SD3A 5H8QA 3O2AA 4PQJA 1EZPA 3PV0E 5DEXB 1SW1A 2XXUA 4ZZAA 3O6HA 4F2OA 3ONMA 5AE4A 3FV1A 5H8FB 4ISUA 5IAIA 5CMCA 3K6XA 2XXPA 4JB7A 3ODBA 3CRBA 1MY4A 2AL5A 3G3KA 2O7IA 2F7CA 2O7UA 3SEWA 3RT6B 4U2RA 4XKQA 2GFEA 2RCBA 2THIA 3LSFB 3S9MC 4P0GA 4QSEA 5H8HB 1N0TA 3GBAA 3EHTA 3QK6A 1P1OA 5DEXA 1Y3PA 3LSXA 3FIRA 4F18A 4AQ4A 1IUDA 4WXJA 5TPAA 2UVJA 3P7IA 5ICQA 4GL8A 2DWAA 1M5FA 4G4PA 4F3SA 4FEDA 1NNKA 1P1UA 4NF4A 3PMWA 1ANFA 2Z8DA 3K1PA 1O7TA 3CFLA 4NTLA 1B2HA 5I59A 1MPBA 4XKPA 3VDFA 3TPAA 3PPNA 1B3HA 4F31B 5JTYB 3UORA 2ALUA 4BDLA 2F7AA 1MDP1 4JSDA 4ZEIA 4HCYA 4G2ZA 3LBSA 4FEBA 4K3FA 4YMBA 3I3VA 4R2FA 3K1NA 3N6UA 2Q89A 4RPOA 4KI0E 4IGTA 1ZMGA 1AH5A 4UA8A 2QMXA 3HCQA 4F1UA 2ZYNA 5KCJB 2DWHA 3DLNA 4LQ5A 2X26A 2QL3A 3KFMA 3MZ1A 2QS1A 3ZKKA 2PT1A 3TCHA 2O84X 1QVSA 2QSXA 4LATA 1GV8A 1CE2A 1QW0A 3H4ZA 5LOMA 4E0XA 3U1OA 3TQLA 1AMFA 3HO7A 3CSGA 3JZJA 2QMWA 1LAFE 4OHNA 4ZDMA 2DXYA 4MLVA 3GLBA 4KCCA 1QKBA 5CBSA 3E13X 1MRPA 1UTBA 1IZ1A 2Q2AA 1VR5A 2Y7KA 1NNPA 3HSTA 1D9YA 5L8DA 5I58B 4X48A 3QYTA 1ATGA 5TP9B 4MH5A 1JETA 1SDXA 4C0RA 2Y7PA 1Z7NE 3ZSFA 3OO8A 4RK2A 1B05A 3H6UA 4YKPA 5KDTA 3MUQA 5DVFA 1MQJA 3OO6A 3U72A 1DOTA 4ND9A 4RPNA 5FTHA 3DP6A 2I4BA 4YKKA 2OWTA 3T9XB 2UXAA 4GQOA 2OCUA 5I58A 4WKMA 2XXTA 4MLQA 4Q0CA 4ESXA 1HSEA 5DVIA 3O6IA 4OVJA 2O1MA 5TP9A 2X7PA 1FQAA 1H45A 2HCAA 3CFXA 2QS4A 1S9TA 1BLFA 3E4RA 3HHGA 3PUYE 4H65A 4QSDA 3OO9A 4DCXA 1KWHA 4ELOA 4GOTA 3K6VA 1PDAA 2DP8A 4XKRA 2H99A 5CBRA 4M4GA 4IGRA 4KHZE 2F6GA 5CRYA 1P1WA 1BKAA 3SEYA 3IORA 5H8SA 2NXOA 4EDPA 2XX8A 3H06B 3PUZE 4ELPA 3VE1B 1A54A 2G29A 3FVGA 2B65A 3FXQA 3K1MA 2XXVA 2I58A 3OO7A 4GXAA 1AOVA 4M1VA 3M8UA 4LZ5A 3IX1A 3PPPA 1II5A 3CR9A 3N94A 4H8IA 1JEUA 3RGYA 2V3TA 3PPQA 3T9UA 3ZS6A 1LB9A 3ECRA 1PC3A 2I0CA 4BDNA 4GWOA 2I3VA 1H76A 2XXXA 4FE8A 1FQBA 5IKBA 1ZBMA 3FZVA 4QFLA 3C34A 4OEVA 5BWJA 4E0WA 3VLVA 4X1BA 3R6UA 2F97A 4OERA 2ONRA 1MXZA 2FA7A 1OLCA 4U22A 4C1TA 1M5BA 4LQ2A 1US5A 1QUIA 3B6TA 1S50A 2XX9A 3IB0A 4IY5A 4JWYA 1D4NA 2OLBA 1I6BA 4OXVA 3TTRA 3PPOA 2DOJA 4MF3A 1IEJA 4BDMA 4BDOA 2ANJA 3TELA 5I57B 1MQIA 4NF5B 4RNSA 3LC8A 2Q88A 4YB7A 1N84A 3JV9A 3BFTA 2ZNSA 4OTEA 1FCKA 2UVIA 1P1QA 2VOZA 3TQWA 2PX1A 1B32A 1FQCA 5FHOA 4PFWA 5I56B 4EXKA 2PT2A 3ILUB 3IO6A 4GFRA 2UVGA 5I57A 1NL5A 1RKMA 3S9NC 1NH7A 1B4HA 2I48A 3OMBA 3D4CA 1URSA 3FUZA 1FQDA 4U1OA 1FTJA 1B52A 1B3GA 5FHNA 3HPIA 4OFLA 3THIA 2F5XA 3W9VA 1PB9A 5EYFA 2CMOA 4PP0A 5H8QB 4KCDA 1OLAA 5I56A 4GL0A 3EF7A 2KLFA 1N3XA 4G8NA 3S9EA 2AYSA 2W7YA 4KYDA 2DE3A 3UP9A 3G3FA 1LLSA 3C33A 1M5CA 3IB2A 2B3FA 2Y7WA 1MS7A 4PE5B 4R73A 1O64A 4N6PA 1DTGA 4KFQA 1Q1KA 3U93A 5ICTA 4Z0IA 3TZAA 5CC2A 4KD5A 1A55A 1USYE 3LUYA 5TPAB 1IXCA 1OVBA 2F35A 3QXMA 1LAGE 4NF6B 3VLWA 4NF4B 2O68A 3VV5A 3TCGA 1IXIA 2V25A 3KG2A 1JW5A 2GRVA 3GXAA 1NNTA 3T66A 1B51A 1Y4TA 5I59B 2V93A 2HAUA 1XVYA 1ZJLA 4L17A 3VVEA 4GVOA 4ELQA 4TLMB 3UN6A 4DXCA 2F78A 2NUVA 3BKIB 3KBRA 1M5EA 1VSOA 3MZ9A 1YAEA 1L5TA 4NF6A 1SYHA 3TFLA 1URGA 5L9MA 3SDFA 3CI8A 4OMBA 5TU0A 4H5FA 3IJXB 5H8NB 2D3IA 2Q9TA 3KN3A 3TCFA 3RQTA 1VFDA 1N7WA 4G68A 2RC8A 2UYFA 1JW1A 3K0VA 1MQHA 4GXSB 4DXUA 1MXVA 4H8JA 4ZE8A 5JEIA 1XT8A 4FORA 2DVZA 4KYEA 4F22A 2RCAA 2ESNA 4I8CA 1I69A 2V3QA 3O29A 3KSJA 4QFPA 1NH8A 1D9VA 3QUFA 4IO5A 1NNFA 3MBPA 3PUVE 4NF8B 2ZYKA 5H8NA 3Q28A 3OENA 2I4CA 3FGSA 3OD7A 3H03A 4ECFA 1WVJA 4O3CA 1LB8A 3LSWA 5CMBA 3KJ7A 1JEVA 4NMYA 2F6PA 3KSXA 3LR1A 4LUBA 1ZLQA 3IB1A 4QFNA 1UTBB 3MWBA 1LBBA 3IR1A 5EHSA 4QHQA 4LZ7A 4P0IA 3K2DA 2XXRA 3MP1A 1OMPA 3RY3A 4NF8A 4POXA 1I6AA 1SBPA 4OYVA 1MPCA 5AA2A 4TQUQ 2O69A 3M3FA 3TYHA 3TTMA 3GBBA 1B7HA 4YB5A 2OK2A 3CG1A 5KDTB 4HCWA 1LFGA 1D3KA 1RYOA 1M5DA 4QFOA 2Y84A 3SEXA 4ZEFA 3PD9A 4YKIA 4THIA 2DSFA 4JBZA 3V8XB 1P1NA 2DXRA 4U21A 3TEPA 3PU5A 2XX7A 1OQGA 3N26A 3PPRA 4YKJA 4WEDA 3HN0A 3H7MA 1NFTA 3K4UA 3SEVA 3G3JA 3FV2A 3MPKA 1POY1 1O63A 3CFZA 2ONSA 1B7ZA 3M3LA 4TOZA 3MPLA 3UK4A 4GLIA 2ZYOA 3I5OA 3W9WA 4F1YA 4JSOA 1R9QA 1B5IA 1N04A 1B4ZA 4GD5A 1BIYA 1UIVA 2PVUA 3IOWA 3S2VA 2ZMBA 4O3BA 1SW2A 5AA2D 2A5TB 3R7XA 2F36A 4PFTA 2O1LA 2ZNTA 2P1SA 3QUJA 3SEUA 5L9SA 3RTWB 3FXUA 1ELJA 1QJMA 3SETA 3MAMA 2PYYA 4IY6A 5K2XA 5ITOA 4IO2A 1XC1A 1N7XA 1SQYA 2HZLA 1TXFA 3O66A 5I2NB 4KQPA 3KZGA 1MH4A 4H67A 3UA8A 2A5TA 3TTNA 2IA4A 3HV1A 3C4MA 2HAVA 2RKMA 3FASA 2HEUA 2HXWA 2R6GE 4R74A 3C9HA 1ZTYA 1SI0A 3B7DA 3QIMA 4LP2B 4Q8RA 3V89B 4U23A 1EU8A 1R6ZA 2V3UA 1DPPA 3WAEA 4POWA 3KGCA 4G8HA 2OZZA 1NKXA 4JWOA 3G3GA 1LBCA 3ZKLA 5I2KB 1CB6A 1AL3A 4FAJA 1Y20A 3Q29A 1BP5A 3VFJA 5I2NA 1PEBA 1JVYA 4EF2A 2OJTA 3IOVA 3E3KA 3LSLA 4QRZA 3MQ9A 3PD8A 1NMUA 2QPQA 1FQEA 4HTGA 2R9JA 5AA4A 3VXBA 3T93B 1QUJA 3H6WA 4IB2A 3K01A 4X1DA 2VGQA 1YPNA 2NOOA 2F34A 4OETA 4QSCA 3MJNA 3R26A 2DS9A 5DYHA 1FTOA 4JDFA 1BTJA 3U8QA 5I2KA 2GHBA 4XKNA 1MQGA 3TAJA 1B9JA 4NWDA 1FTMA 3DP8A 4PFYA 5DTBA 2XHDA 1PB7A 5CM6A 3EQ1A 1T0KA 4IO7A 1PB8A 4YMAA 3FJMA 4XTCQ 2CZLA 3RPWA 2H98A 4C1UA 4R75A 1B5HA 2WKYA 3PMXA 3KOTA 4JXIA 3EPEA 4R6YA 4RXLA 2XD3A 1DSNA 1URDA 2VD2A 2RC7A 4AB5A 2GHAA 3T9HB 2BJJX 3L6HA 1B3LA 1MY0A 1QULA 4OEUA 2RF1A 1GVCA 2REGA 2F7BA 2UYEA 4R6HA 2YPNA 4GF8A 1B1XA 4G8MA 3Q26A 3TTKA 4PETA 1IXHA 3V5AA 1AIVA 2PMSA 2YJPA 2ZYMA 1B46A 2Z22A 1DMBA 4I1DA 3SESA 2XXHA 4LONB 2GH9A 2XXWA 3V83A 3DP4A 4KYSA 3T9VA 1DPEA 3RUMA 1XOCA 4LA9A 3DM0A 2QS2A 3IO4A 4GRKA 1IIWA 3Q27A 3T96B 5ISUA 1JVXA 4ESWA 5ITPA 3N6TA 1R9LA 3G7WA 2PBWA 1FQFA 3DELB 1LFHA 4ZS9A 3QAXA 1B3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7RA 1POTA 1S7YA 4YICA 4RJZA 3GYYA 4G68C 3AXFA 4DIGA 3OELA 4DXBA 3FVKA 4I3YA 3BIGA 1JNFA 1B7UA 3CVGA 4IO3A 2HFBA 4XFEA 2AL4A 3K02A 2X7QA 2XXKA 1FBFA 3FATA 2XD2A 4H6DA 4F3BA 3IJOB 2DWJA 2I3WA 4ZEDA 4G68B 4KPTA 4FATA 3OEMA 1JW4A 1MY3A 5DVJA 4DE8A 4ZEKA 2Z8EA 4Z7EA 3O97A 3RPLB 3O6GA 1B6HA 1HSJA 3FVNA 1JP4A 1MG1A 5A5XB 4O3AA 2P0SA 4F39A 1NV5A 2Q2CA 1IITA 1UIUA 1MPDA 1G0IA 4QFKA 2F8DA 3T22A 3IOTA 3RTFB 4OFJA 1RDYA 1AWBA 5H8FA 1IMDA 1XHYA 4NE4A 4ZZEA 3OOAA 3MVXA 4R9FA 2I6EA 2R71A 4QBAA 2ABHA 4ONYA 2O6AA 3KEIA 3RPLA 4P11A 4I9DA 4NHBA 3M3KA 3TUSA 3TTLA 4N4UA 4EQBA 2A5SA 5M2VA 1MM7A 4HXVA 3KN8A 1GR2A 4OVRA 5H8HA 5A5XA 3MP6A 3TODA 4R2BA 1FW0A 5KZTA 2I49A 4ZE9A 4GWXA 2CEYA 4N6KA 4AB6A 3OSRA 5B7DA 3B6QA 3FD3A 1XS5A 4MJOA 2DYXA 3KOSA 3OSQA 4F1VA 1H3DA 3L6GA 1VFEA 4LVQA 1B0LA 1SI1A 1MXYA 4N13A 5AA2B 3ILTB 3F11A 1IQ7A 3OEKA 3T0JA 5CI5A 5IZZA 2Y7IA 1LAXA 5AA1A 1B40A 3RT8A 1USYH 3FVOA 4HE1A 3B6WA 4FECA 1RDXA 2M8CA 5I84A 2DVCA 1Z7ME 3IL1B 4F3PA 4UACA 1HSLA 4P8BA 5JTYA 2ONKE 4MNPA 4O94A 2V84A 1N3WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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