5DEXA

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
282
structure length
269
Chain Sequence
RLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 70
structure length 269
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexA02
4ELRA 4QSDA 5BWJA 2LAOA 1LBCA 3Q25A 3F11A 1Y4CA 2F36A 5H8NA 3VE1B 3H6WA 4I62A 3KOTA 1EH3A 4KFQA 4LZ7A 3TQWA 1Y20A 3PPQA 5A5XA 2ZNUA 2DVZA 2IEEA 1DTGA 3FJ7A 4U1OA 1P1QA 3E13X 1P99A 1CB6A 4IO7A 3KSJA 1SBPA 3THIA 2O7UA 5TPAB 4QFOA 3SERA 2OCUA 1IIWA 4ZZEA 1ZJLA 5ISUA 1MH4A 2VD3A 4TLMB 5F1QA 2PYYA 1FTMA 4M4GA 1FW0A 1OQGA 4AQ4A 4F3BA 1B52A 3S9MC 2DWAA 1Q35A 4F22A 4IO4A 2R6GE 1ZIUA 2I0BA 3SETA 1TFAA 2I58A 3CI8A 4R6HA 2FA7A 4F31B 2DWHA 4GL8A 4IGTA 2RCBA 1B3FA 3O97A 4QFKA 3N6UA 3C33A 4OFLA 4DCYA 3K02A 3M3KA 2Y7PA 4IY6A 4H0WA 1B40A 2HAUA 4JSDA 1ELJA 1I6QA 2ZXTA 3VFJA 3C34A 3MW0A 3KOSA 4QFNA 4R75A 3H7MA 1PBQA 1PBPA 1MDP1 3TZAA 3R6UA 4G68A 3FJGA 2PBWA 5FHMA 1D9YA 1Y1ZA 4N13A 1DTZA 2A5SA 1Z7NE 1YTVA 4H65A 2FNCA 4IB2A 1PB9A 1MY0A 5DT6A 3MPLA 2X26A 3EF7A 3M3FA 1MPDA 2XXQA 1J1NA 4THIA 3ONMA 1IEJA 3TTRA 1FQBA 3EPEA 3T9XB 2V3TA 3U8QA 1IITA 2Y84A 3VLWA 2ANJA 4ZEFA 5B7DA 1O64A 3R7XA 4F1UA 1NKXA 3PMXA 4YKJA 1EZPA 5JEIA 3U72A 3PMWA 3ZSFA 4TQUQ 4YMBA 3HCQA 5DVIA 2NOOA 4QHQA 5ITOA 3W9VA 1EU8A 5FTHA 4OFOA 1ZLQA 5FHOA 1XC1A 1FQFA 3ILUB 3TEPA 1IXCA 2DWJA 3IX1A 5KCJB 4DXUA 1Y4TA 3OOAA 2F7AA 4R2FA 1QKAA 4YZZA 4YMAA 1JEVA 4ISUA 4IO3A 1B7UA 2A5TB 2OLBA 3Q28A 1B9JA 1Y3NA 5I57B 1A55A 2Y7WA 2E1SA 2DP8A 3HV1A 3V5AA 4ESXA 3TPAA 3K2DA 5JK4A 3TTMA 2DXYA 2REJA 1UIVA 3MJNA 2I0CA 3QIMA 1WODA 3OSRA 3C4MA 3RPWA 4OYVA 4X1BA 3BKIB 2B3BA 2F6PA 4DXCA 1QVSA 2DSFA 4BDNA 5FHNA 1XHYA 1AL3A 4KPTA 2O51A 3QK6A 4C1UA 3MVYA 2HZKA 2NWJA 1MQHA 3C31A 3TKDA 1B2HA 3SEUA 4R6KA 4OEVA 3ECRA 1A40A 1YAEA 1NH7A 2OBGA 4JBZA 5I56B 5B70A 3HSTA 3RQTA 1QJMA 3EQ1A 3T93B 2HAVA 5H8QA 3MZ1A 5DEXA 1B3HA 2GHBA 2GH9A 3VVDA 1QULA 4I1DA 2R9JA 2UVIA 3CFLA 1HSJA 2V25A 1POTA 1LB8A 3PUYE 1S50A 1B05A 5L9SA 4ZEBA 3IO4A 3OEKA 3EHUA 4H8JA 1VE4A 2QS1A 4NMYA 3HPIA 3IOTA 2RINA 4Z0IA 1B0HA 3WAEA 2QRYA 4XKQA 3B6WA 2ZMBA 4YAHX 4BLAA 4XTCQ 1Q1KA 3O6HA 2ZYMA 3KZGA 4OMBA 5H8NB 4TOZA 1I6BA 4HS7A 1SW1A 4BDOA 3E3KA 1SW2A 1OVBA 5A5XB 5AA2A 3K4UA 4HW8A 4MFIA 5DYHA 2OWTA 3G7WA 4F1VA 4NEDA 3PUWE 2RC8A 1AOVA 4WXJA 1MM7A 4XXUA 3HO7A 1SYHA 4FIMA 5I59A 4U1ZA 1UTBA 3W15C 1BLFA 3U93A 3KGCA 3LSXA 2Q9TA 1P1UA 3FXRA 4YB7A 1Y3PA 1B58A 1POY1 1MPBA 1URDA 2I3WA 1PB7A 3EN3A 1YPNA 4OFJA 3O29A 3VXCA 2XD3A 4GOTA 1N84A 1L5TA 1GGGA 2YLNA 2Q2AA 2XXVA 1N7XA 3O6GA 3V83A 4RK9A 1B1HA 1OVTA 2XXXA 5H8SA 4EQ7A 2PT1A 2RKMA 1JEUA 2ZNTA 4G68B 4LA9A 5CBRA 5CM6A 3T9VA 1O63A 4DXBA 4R74A 1LAFE 2Y7RA 5HBCA 3VLUA 3KJ7A 3QUFA 4WEPA 4LZ5A 1SD3A 3RN8A 2XHDA 4X48A 4DIGA 3CFZA 1ATGA 4ZE9A 3N6TA 5TU0A 1AH5A 2F35A 3K6XA 4IO5A 3K6VA 3E9XA 4TLLB 1MY2A 1WDNA 4HCWA 2V84A 1N04A 2QMWA 3QUJA 5DVJA 1N7WA 1VR5A 3G3JA 3HN0A 1MY3A 4C0RA 3FXQA 3TTNA 2UXAA 2NXOA 4YKKA 4DE8A 3MBPA 3KEIA 2WKYA 2Q89A 3BBRA 2M8CA 2YPNA 1M5CA 4GIZA 1FTOA 4H5GA 3T96B 4NWDA 3K0VA 4R73A 1US4A 3SESA 1LFHA 4NTLA 1MY1A 3B6TA 4G68C 3IOWA 5I2NA 2DQVA 3KBRA 1T0KA 4LVQA 4ECFA 3RT6B 4JXIA 1NH8A 3K1PA 4QFLA 2UVGA 5AE4A 3MAMA 1TFDA 4POWA 5AA4A 2I6EA 3ILTB 4LQ5A 3FZVA 4EQBA 1LAHE 3O2AA 4OZ9A 4F3PA 4ELPA 4KR5A 3SEWA 1MXZA 3K1NA 3MVXA 3MP1A 3WAFA 4H8IA 2OJTA 4G4PA 3C36A 3PU5A 2AL4A 3PUVE 3DELB 1XS5A 4KI0E 4HCYA 2CMOA 3ZKKA 4IO6A 1SQYA 1XT8A 2THIA 2YJPA 1URSA 3IR1A 3OXNA 3HHGA 5H8QB 4IGRA 3UP9A 4ELOA 3FD3A 5DEXB 4BDMA 4U4SA 1B1XA 1DPEA 3K6WA 1OLCA 1NMUA 2VOZA 5BUUA 1PEBA 1VFEA 2F8DA 3O9PA 2PX1A 3MZBA 3IO6A 2H99A 3GZGA 4ZDMA 3S4UA 3H4ZA 2ESNA 3CR9A 4K3FA 1M5EA 3LC8A 3KJTA 1UTHA 1RYXA 3Q26A 4U23A 1OIBA 1UIUA 5EHSA 1H76A 2QSXA 2D3IA 2H4IA 1HSLA 1QUIA 4BDLA 3GXAA 2Z8EA 1A54A 1LCFA 4YB5A 4OHNA 3IAZA 2W7YA 1N3WA 5JTYA 3I3VA 4ESWA 3G3GA 3KN3A 4GQOA 3I6VA 4F3SA 1JNFA 4R6YA 4F2OA 3PUZE 4JDFA 2Y7IA 4YU0A 2F5XA 3QSLA 1WVJA 1FCKA 3S9LC 2VD2A 1SI1A 3MUQA 1A7LA 5I2KA 5AA2B 3KG2A 3IK6B 3VXBA 1H43A 2O68A 4FORA 1MY4A 1ZBMA 4PE5B 1H44A 1RKMA 4G8MA 4P0IA 1MQDA 4QF9A 3S2VA 4NF6A 3BFTA 3ZS6A 2I4BA 5ITPA 3RNNA 5I59B 3G3FA 3B7DA 1B0LA 2I49A 1BP5A 5F7VA 5TP9A 1IZ1A 1UTBB 4Z7EA 4OENA 1XOCA 1GV8A 5ICTA 4LP2B 2XXUA 5L9MA 4KYDA 3RY3A 1EZ9A 4MLVA 1LBBA 2DOJA 5I84A 2AYSA 4F3GA 2AL5A 4H5FA 1DPPA 4OESA 1TWYA 3TCGA 1BIYA 2PMSA 1GR2A 3IL1B 4U22A 4Q5TA 4ZECA 1B6HA 3A3CA 3LBSA 4ZEKA 4G77A 1FTKA 1MXVA 1QW0A 5KDTA 4NF5A 4RK2A 2B3FA 4OQOA 3IB2A 2H25A 1IXIA 4G2ZA 3IB0A 2Q8JA 4FECA 4I8CA 3IJOB 1JVYA 1YCJA 4LQ2A 5EHMA 3U1OA 4G8NA 3MPKA 4ZEIA 3O66A 2F78A 4JB7A 5CI5A 3S9NC 3A3UA 3T9UA 3JV9A 2UVJA 3H03A 2G93A 4OWDA 1B4ZA 2RC9A 3JYRA 2DXRA 3MC2A 1NL5A 2VHAA 1LAXA 3MVZA 5DVFA 1A8EA 5FTIA 3U92A 1B5HA 2XXWA 4AB5A 1USYH 4I9DA 4IY5A 4Q0CA 4P11A 3KFMA 4UACA 2O69A 3N26A 3QXMA 3H6UA 1N0TA 1VFDA 3FATA 2PVUA 2QS3A 3GBBA 4RPNA 4ZE8A 5CRYA 3OELA 2X7QA 4U21A 3R26A 1XVYA 3DM0A 1ZMGA 3ZKLA 1A8FA 4RY1A 4F2QA 2O1LA 4RYAA 3IORA 2D21A 4GXSB 1OLAA 2O84X 5J1DA 1IXHA 2UYFA 1LGBC 5CC2A 4EQ9A 4R9FA 4JWOA 4ELQA 1DMBA 1HSEA 5I2NB 2ONKE 5CMMA 1FTJA 3GBAA 3L6HA 3IOVA 1M5FA 4MLQA 3RT8A 4OVJA 4QSCA 2RCAA 2CZLA 4FEDA 3UORA 1LSTA 1PC3A 1SVXB 2ZNSA 2G29A 3K01A 3MQ9A 5AA4B 2GHAA 1B3LA 3FVGA 1P1OA 5AA1A 2HEUA 1NFTA 1MXXA 2XX7A 3V89B 4FATA 3CG3A 4LONB 3E4RA 4NF8A 1LCTA 4DCXA 3CRBA 2DS9A 4NWCA 3OO9A 4ND9A 2ZYOA 1F9BA 5DTBA 3FVOA 2XXPA 1MRPA 2O6AA 3LSWA 4NF4A 2V3UA 4GL0A 1N76A 2VGQA 3FGSA 2AIXA 4JSOA 3OSQA 2OWSA 2NUVA 1SW4A 1JETA 1US5A 1KWHA 4U2RA 1UQWA 3UN6A 3DP8A 1UTHB 2ONSA 3PMVA 4MBPA 1LB9A 4EXLA 5M2VA 4GLIA 3G3IA 3VVFA 3IOUA 4KYEA 3UK4A 3P7IA 1JW1A 1A99A 3D4CA 4MH5A 4PFYA 4PFTA 3H6TA 3T66A 2O1MA 4YB6A 3FJMA 3L6GA 5JTYB 2B65A 1O7TA 2P2AA 4GRKA 4Q8RA 4R2BA 1BKAA 2XD2A 2QJEA 2DE2A 2V3QA 1R1NA 1SDXA 1Y1MA 2P1SA 5CMBA 3SKPA 1B46A 4H6DA 3M8UA 5I2KB 5AA3A 3PPRA 4ZEDA 4X1DA 3FVNA 1MXUA 1MPCA 1P1WA 2OK2A 2QS4A 1OQHA 1GVCA 1IUDA 4L17A 2XXTA 2Z22A 1PB8A 1D4NA 2DWIA 4NF6B 3MWBA 5CBSA 2XX8A 2D5WA 1SW5A 2H98A 3FXUA 1NNKA 3Q27A 3B6QA 5TP9B 3SEYA 3T9HB 4QFPA 4N6PA 2O7IA 4O3BA 3OO7A 4UA8A 3DP4A 4YICA 3PD8A 3SDFA 3MP6A 4GVOA 4HTGA 3RTWB 3U94A 1OMPA 4AB6A 3QAXA 2REGA 1FQAA 4OETA 3TCFA 3CFXA 4H67A 3N5LA 5I58A 1NNTA 4O3CA 4FJPA 3TMGA 2ALUA 2F7CA 4RNSA 3IJXB 3T22A 1D9VA 3CSBA 2E0SA 4PP0A 4XKPA 4PQJA 1QKBA 3KSXA 4BDQA 4GD5A 5KDTB 4NF5B 4R9GA 4ZZAA 4MF3A 1ANFA 4RA1A 2F6GA 4FEBA 2Z8DA 3OENA 1TT1A 2Y7KA 4PFWA 4IO2A 3TELA 3OD7A 3RUMA 2DE4A 3AXFA 2HCAA 2UVHA 1LFIA 2Q88A 4X9TA 1B5JA 2QMXA 3I5OA 3SEXA 3EHSA 3PPNA 4EUOA 3PPOA 5H8HA 5H8FA 1B7HA 2FYIA 1NNPA 4KCCA 3TDJA 1VSOA 3VV5A 2RF1A 4GXAA 1B3EA 1MQJA 1GTKA 4KYSA 2IA4A 4XIGQ 1IQ7A 4WEDA 4F18A 1MQGA 4DZ1A 1URGA 1IXGA 4G8HA 3K1MA 3OMBA 2ZYKA 4EDPA 2DE3A 3BFUA 5ICQA 1RYOA 3FV1A 2HFBA 3H3GA 1QUKA 3LSLA 1SYIA 4ZS9A 5TPAA 3OO6A 1MS7A 3H6VA 3PUXE 3UA8A 3O6IA 5L8DA 3FV2A 2BJJX 3DLNA 4OERA 1JQFA 3G3HA 4LUBA 2F97A 4GF8A 3TUSA 1ZTYA 2XXIA 3LSFB 2KLFA 3PGFA 3C32A 2XXHA 1B4HA 5IKBA 1S9TA 3TODA 4RXLA 1LLSA 3LR1A 4QSEA 1TXFA 4F19A 2NVUB 4BDRA 3TTKA 2DVCA 4NF8B 4KCDA 1Z7ME 4O3AA 3K00A 2VP1A 3ODBA 1S7YA 1EZOA 1NNFA 3VVEA 1LAGE 3FASA 1II5A 4M1VA 3FIRA 3S9EA 3DP6A 4DDDA 1FQCA 3PD9A 4NF4B 3VDFA 1MDQA 4PFUA 2PT2A 3KN8A 2F34A 4KQPA 5CMCA 2XXYA 2F7BA 1R9QA 2R71A 2Q2CA 4E0XA 2QS2A 3OEMA 4XKRA 3H06B 1AIVA 4E0WA 4POXA 1Y9UA 2QL3A 3G3KA 3C9HA 3CVGA 2ABHA 4FE8A 1LFGA 3W9WA 2X7PA 1FQDA 1ZU0A 3QYTA 2ONRA 3IB1A 2GRVA 4PETA 4EF1A 1R9LA 4OTEA 4EF2A 3LUYA 1B3GA 5IAIA 3K6UA 1AMFA 4EXKA 4GWOA 3UIFA 2HZLA 4KHZE 1XVXA 1MXWA 2Z8FA 2I48A 1R6ZA 1SI0A 2Z23A 2XX9A 4LATA 1JW5A 1MG1A 5KCJA 1D3KA 2I4CA 4JWXA 4F39A 3TFLA 3CG1A 3CSGA 5HM4B 1B32A 4YKPA 3MP8A 4R72A 1M5DA 3TQLA 3OO8A 3Q29A 1B51A 2A5TA 1B7ZA 2QPQA 5I57A 1H45A 1BTJA 3TAJA 1MH3A 2H9BA 1I69A 4YKIA 4DLDA 1H3DA 4H1XA 3GLBA 4WKMA 2HQ0A 4QRZA 3TTLA 3SEVA 1CE2A 2DYXA 1JVXA 4KD5A 1QUJA 4ONYA 1P1NA 4NE4A 3C35A 4P0GA 1ZKBA 4GFRA 3TYHA 2UYEA 5K2XA 3PPPA 2H5YA 5ELVA 4N07A 3FVKA 4F1YA 3N94A 3MVWA 1FTLA 3RGYA 3RLFE 3TCHA 5I58B 1M5BA 4F29A 1MXYA 3EHTA 4RPOA 3A09A 3D4GA 3JZJA 1MM6A 1N3XA 1PDAA 3VLVA 5I56A 3HHFA 4Q30B 5L9OA 3V8XB 3MZ9A 5K2YA 1I6AA 3KN7A 4U4XA 4OEUA 4C1TA 1DSNA 1DOTA 5EYFA 4FAJA 2HXWA 3UGWA 1USYE 3RTFB 4XKNA 1JW4A 5KZTA 3CIJA 4LZ8A 1FQEA 5LOMA 5HPQA 4OXVA 3M3LA 4RJZA 3FUZA 3O28A 4JWYA 3USDA 2P0SA 2I3VA 1B5IA 5CMKA 1MQIA 3PV0E 5AA2D 2OZZA 2XXRA 2RC7A 5H8HB 1Y3QA 5H8FB 2ZYNA 2GFEA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2VPNA 1IEJA 3TTRA 1FQBA 2OWZA 3EPEA 1SPIA 3T9XB 2V3TA 3U8QA 1IITA 5DW8A 2Y84A 3VLWA 4NG7A 2ANJA 2B4LA 4ZEFA 5I5PA 5B7DA 1LBYA 1O64A 4JVCA 3R7XA 4F1UA 1NKXA 3PMXA 2CEYA 4YKJA 1FPJA 2FIEA 1EZPA 5JEIA 3U72A 3PMWA 3ZSFA 4TQUQ 4YMBA 2QFLA 3HCQA 5IZ1A 5DVIA 2NOOA 4QHQA 5ITOA 3W9VA 1EU8A 5FTHA 4GBWA 4OFOA 1ZLQA 5FHOA 1XC1A 1FQFA 3ILUB 4N15A 3TEPA 1IXCA 2DWJA 3IX1A 5KCJB 4OVSA 4DXUA 1Y4TA 3OOAA 2F7AA 4R2FA 1QKAA 4YZZA 4YMAA 1JEVA 4ISUA 4IO3A 1B7UA 2A5TB 4HXVA 2OLBA 3Q28A 1FPEA 5F24A 1B9JA 1Y3NA 2MKZA 5I57B 1A55A 2Y7WA 2E1SA 2DP8A 3HV1A 3V5AA 2XWOA 2FVZA 4ESXA 1NV4A 4GWZA 3TPAA 3K2DA 5JK4A 1FRPA 3TTMA 2DXYA 2REJA 1UIVA 3MJNA 1K9ZA 2I0CA 3QIMA 1WODA 3OSRA 4JVDA 3C4MA 3RPWA 4OYVA 4GX4A 4X1BA 4OANA 3BKIB 2B3BA 2F6PA 4DXCA 1QVSA 2DSFA 1RDYA 4BDNA 5FHNA 4MAGA 1XHYA 1AL3A 4KPTA 1VDWA 2O51A 3QK6A 1YYZA 4C1UA 3MVYA 2HZKA 2NWJA 3NOHA 1MQHA 3C31A 3TKDA 1B2HA 3SEUA 4R6KA 4OEVA 3ECRA 1IMDA 1A40A 3B8BA 1YAEA 1NH7A 2OBGA 4JBZA 5I56B 1NUYA 5B70A 4N6DA 3HSTA 1NV0A 3RQTA 1QJMA 3EQ1A 3T93B 2HAVA 5H8QA 3MZ1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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