5DEXA

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
282
structure length
269
Chain Sequence
RLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 70
structure length 269
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexA02
3OXNA 3PPPA 5EYFA 1LB8A 2CMOA 1OLAA 1VR5A 2F5XA 2Q8JA 5FTHA 1Q1KA 5L8DA 4EQ9A 3QK6A 4LQ5A 3TMGA 1A54A 3RT6B 4BDMA 1UTHB 4C1TA 3TTRA 1B40A 5H8QB 1A55A 4OETA 1MQIA 4EDPA 3B6QA 1YTVA 2RCAA 4G77A 4JWYA 4KR5A 3VXCA 4JSDA 1LFIA 1PBQA 3IL1B 4UA8A 1P1UA 2D3IA 4F3GA 3OOAA 5I2KA 1FTMA 2HEUA 1NL5A 2XD2A 3MVZA 1LGBC 3M3KA 4ND9A 3B7DA 4R75A 1OVTA 2NUVA 2V3QA 2Q2CA 3LBSA 1TXFA 3G3IA 5I84A 5FHMA 2HQ0A 4XKPA 3T9UA 1R1NA 3H7MA 3PPOA 1OMPA 1WVJA 2DXRA 2QS2A 3TZAA 2HZLA 3G3JA 4GWOA 3WAEA 3TPAA 4H6DA 1D9YA 2DWJA 1H3DA 3C33A 5CBRA 1JW5A 2DE3A 2GRVA 3EHTA 4XKQA 2XXIA 4O3CA 1UTHA 1B1XA 5H8QA 4OQOA 1IXIA 3UGWA 3KEIA 2DOJA 5CMKA 2RC7A 3IB1A 4JBZA 1SW5A 2XX7A 3PD8A 3MJNA 3LC8A 2O69A 5K2YA 3FASA 1MDQA 2ZNSA 3GZGA 5ELVA 3VV5A 3A3UA 1TT1A 1FQFA 2R6GE 1Y3NA 2Y7IA 3EQ1A 4GLIA 4G4PA 3MP1A 4RK2A 4LP2B 5BWJA 3O29A 3U92A 2F35A 1FTKA 1GVCA 3ILUB 4MLQA 3SERA 1S9TA 2PX1A 3KGCA 1A7LA 4GQOA 2QS1A 4X1DA 1FTJA 2E0SA 1M5DA 1MG1A 2XXXA 2FA7A 4YMBA 3V8XB 1TWYA 3OEMA 1GV8A 2O7UA 1AIVA 4F2QA 2H98A 1QW0A 2QL3A 4ZEDA 4PFWA 1H76A 3UN6A 2QMXA 4U22A 1MY2A 4ESXA 3K1NA 3WAFA 3VDFA 4IO6A 1AL3A 4RNSA 4NTLA 5CC2A 4I9DA 1OQHA 1PEBA 3O28A 2V25A 4JB7A 1SYIA 4HCWA 3TAJA 4H8JA 2GH9A 3K4UA 2Y7KA 1HSJA 5H8HA 2X7QA 3O6GA 3SDFA 2QS4A 1OVBA 1H44A 1FW0A 4P0GA 2GHBA 1SD3A 2XX9A 2I3WA 1WODA 1N3XA 5BUUA 4JDFA 3PMVA 2Q89A 1EZPA 1FCKA 3PUXE 3F11A 1RYXA 2M8CA 2PYYA 3TTKA 2XXTA 1ELJA 3KOTA 3FXUA 3OMBA 1B7HA 5CI5A 5K2XA 4N6PA 1CB6A 2FNCA 4IO2A 3TELA 4N07A 4IO5A 3KN7A 2XXQA 1Y9UA 3RNNA 2IEEA 4POWA 2ONSA 2R71A 3TCHA 3IOUA 3PPQA 4PQJA 1QUKA 3N26A 4AQ4A 4MFIA 4WKMA 3G3GA 4IGTA 2F36A 4F1VA 4EF1A 4ZZEA 1FQDA 1XVXA 4RJZA 5AA1A 4ELOA 4BDOA 2BJJX 3VLWA 3IO4A 4BDNA 3G3HA 3S9LC 3C32A 3LUYA 3PU5A 5H8FB 4MF3A 5I56B 1A8FA 3N5LA 4U2RA 4ELQA 1VFDA 1N3WA 4QSEA 1KWHA 4QFKA 4QSCA 4AB5A 1Y20A 3MZBA 4XTCQ 5EHMA 1ATGA 1LAXA 2DQVA 4QFPA 4Q0CA 3H6UA 2O1MA 3OD7A 2I58A 3RTWB 3SEXA 1B9JA 3R7XA 1DOTA 1MY0A 2XXWA 4IO4A 1MY4A 3TKDA 1DSNA 2V93A 3KJTA 5HPQA 3CG1A 4EXKA 1Y1MA 2HAUA 3O6IA 3HPIA 1J1NA 5I56A 3QAXA 4BDRA 5CMMA 2H9BA 2P0SA 2RINA 2OCUA 2QRYA 3L6HA 1B0HA 2UYFA 4R6YA 5FHOA 1OLCA 3R6UA 4PP0A 1B05A 3THIA 1A8EA 4R9FA 2O84X 5IAIA 3KJ7A 1T0KA 1IEJA 3H6VA 1QULA 1WDNA 4GIZA 1JEUA 4LATA 1LLSA 1US5A 2PT1A 3LSLA 4R73A 3I3VA 1XC1A 4PFTA 1BP5A 4RXLA 4WXJA 4KQPA 3KFMA 3Q26A 1QKAA 4POXA 4XIGQ 1UIVA 3DM0A 4YB5A 3E3KA 5CBSA 1LAFE 3K6XA 2I0CA 2AL5A 3DP4A 4TQUQ 1II5A 3PUVE 3O9PA 4QFNA 4IGRA 3IAZA 3Q27A 2I49A 4E0XA 4F1UA 3H06B 5F7VA 2XXRA 3MVWA 3K1MA 3IO6A 1EH3A 4Z7EA 2DYXA 3CFLA 1SYHA 3K01A 3U1OA 4THIA 2A5SA 4GFRA 4KFQA 1LB9A 1B51A 3C31A 1JETA 1MY3A 1POTA 2DE2A 3FXQA 3G3KA 4JWOA 1US4A 1B7ZA 5FHNA 3HCQA 3IB2A 4I8CA 3OSRA 4Q8RA 1RYOA 2RC9A 2ZYNA 5HM4B 3VLUA 1S7YA 2HFBA 3K6VA 1JNFA 1I6QA 4NWCA 1YCJA 4U4SA 1O63A 1JW4A 2RF1A 3PPRA 1D4NA 4GVOA 4IY6A 1Y4TA 4DCXA 1B5IA 4FEDA 4PETA 3V5AA 1H45A 1LFGA 2ZYKA 2UVIA 2RC8A 1NNPA 2PMSA 4XXUA 3USDA 3RY3A 1MXVA 4HCYA 2ZNTA 3E13X 1NFTA 2XXHA 1QVSA 3CR9A 3GBBA 3V89B 1B3FA 2UYEA 4HS7A 4ZEBA 4F18A 3HHFA 4KYDA 5JK4A 1TFDA 4KCCA 1SI1A 1NKXA 2Q88A 4ZE9A 1B2HA 3QIMA 5AA3A 2W7YA 3L6GA 3RN8A 2VP1A 3CG3A 3EN3A 3FIRA 4FE8A 2Y7WA 3KBRA 4R72A 1XHYA 3HSTA 3T9HB 3FV1A 3HN0A 5A5XB 3ZS6A 4OZ9A 3B6TA 1UIUA 3MZ1A 3Q29A 3N6TA 1ZJLA 4O3AA 1LBBA 3A09A 3FGSA 3FVKA 4ISUA 1URSA 4K3FA 2NOOA 3MP6A 4KI0E 2ZXTA 3ZSFA 4DE8A 4H0WA 4KCDA 4OWDA 2B3FA 3H4ZA 4YB7A 3QYTA 2QMWA 1I69A 3AXFA 3FV2A 4H65A 1NNTA 5ICQA 4TLLB 3BFUA 5M2VA 1Z7NE 3KN8A 3JZJA 1UTBB 5L9OA 5A5XA 4DLDA 1MPBA 2YLNA 4EQ7A 1MQDA 3QUFA 4OFOA 4U1OA 1XT8A 2PBWA 1MXUA 1N84A 4TLMB 1POY1 5JTYB 2B65A 4QRZA 2OJTA 1O7TA 3TTNA 4P11A 3ONMA 2AYSA 4PFUA 4P0IA 1Y3QA 1MM7A 2IA4A 1B52A 1Y1ZA 2H5YA 4F29A 2HAVA 4NF5B 5ISUA 5L9SA 4KYSA 1Y4CA 2F8DA 4NWDA 3T93B 3EPEA 3VVFA 1N04A 4F39A 4WEDA 4C1UA 4MBPA 1B46A 5TPAB 3QXMA 1FQAA 3KSXA 3MVYA 5L9MA 3SEVA 2Y7RA 5ITPA 2DVCA 1ZLQA 4H8IA 4BDLA 1VFEA 5AA2B 2VHAA 1USYH 2F6GA 3VVEA 2VD2A 4DCYA 3T9XB 3MZ9A 4FEBA 3S4UA 2ALUA 4HW8A 4TOZA 3E4RA 3TTMA 4KPTA 5J1DA 5I57B 4YMAA 1LAHE 2DVZA 1FTOA 4ZECA 4ZE8A 1ANFA 4X9TA 1IZ1A 2O1LA 2ZMBA 3CFXA 4NF5A 5KDTB 4QFLA 1IQ7A 3T66A 3LSFB 3HHGA 4DZ1A 1LSTA 4F22A 3IORA 4ESWA 3IOWA 3OO7A 4R6KA 2VOZA 5TPAA 2YJPA 3FJ7A 1MPDA 5KCJB 4QFOA 4R6HA 4EF2A 5CMCA 4X1BA 4U1ZA 4XKNA 5FTIA 1QUIA 5AA2A 2Z22A 2D21A 3PPNA 3C35A 1PBPA 2RCBA 2O51A 3KOSA 1SBPA 1LBCA 2Y84A 2D5WA 5I57A 5KZTA 2NVUB 1QKBA 3C9HA 4LZ5A 3K2DA 1B6HA 4YICA 2QJEA 1B0LA 5DTBA 1LAGE 4LQ2A 4PFYA 5KDTA 1SDXA 2DWHA 2V3UA 1FQCA 3P7IA 1GGGA 1QUJA 2DXYA 2XXYA 4G8HA 5KCJA 3BKIB 3LSWA 4R74A 3RQTA 3TCFA 2Q2AA 3TDJA 3ZKKA 4I62A 4GF8A 1GTKA 4G68C 1IXCA 1DTGA 3N94A 1FQBA 2PVUA 4H1XA 3EHSA 3SKPA 4F1YA 1DMBA 3LSXA 4NF8B 2HCAA 1P1WA 5I2NB 2ZNUA 3MPLA 1DPEA 1SQYA 1AMFA 1MM6A 3TTLA 2DE4A 1A40A 4L17A 4YKPA 2LAOA 5H8FA 5LOMA 1B3HA 1NNKA 2ESNA 1SI0A 2UXAA 1N0TA 5H8SA 1DPPA 2DSFA 4YKKA 2B3BA 4EXLA 4OESA 3RPWA 3VXBA 2FYIA 4OVJA 2G29A 3OO9A 3PD9A 3C36A 4Z0IA 3UA8A 1MXYA 2I48A 3PUYE 4JSOA 3MVXA 4F3SA 3CSGA 5CMBA 4G2ZA 4GXAA 4JXIA 3O97A 3DLNA 4R9GA 4G68B 1PB7A 2UVGA 3S9NC 4NF8A 1L5TA 2GHAA 3OO6A 5I2NA 2F97A 3EHUA 3RGYA 3E9XA 1AH5A 2Z8EA 3PV0E 1PB9A 1BKAA 2H99A 5CM6A 1B3GA 4F3PA 3MC2A 5ITOA 3CFZA 1LFHA 5I58B 1MQJA 1MQGA 4OFJA 3M3LA 4DIGA 3T9VA 4PE5B 4KD5A 1B5HA 3OELA 1R6ZA 2THIA 3KZGA 1RKMA 4FATA 4OTEA 4LZ8A 4G8MA 1XS5A 1B58A 1SVXB 3K0VA 4ZDMA 1IXGA 3O2AA 1ZTYA 3N6UA 4G68A 2F7CA 4EUOA 4FORA 1PDAA 4ELPA 3O66A 1MXXA 2F7AA 5TU0A 1AOVA 2UVJA 4YKJA 2WKYA 4ZEIA 5IKBA 5I2KB 2VD3A 4RYAA 1VSOA 3KSJA 2CZLA 2I0BA 4KYEA 4YU0A 3GBAA 5I58A 3C4MA 4OYVA 1H43A 3K00A 4NF6B 4FAJA 4DXBA 1TFAA 3MWBA 1O64A 3MW0A 3FJMA 3QSLA 2DWIA 4IB2A 4BDQA 3IB0A 1B1HA 1N7XA 3CI8A 2XXUA 3KN3A 4GL0A 4OEUA 3K02A 1MXZA 3RT8A 2I4CA 3C34A 1EZ9A 2E1SA 3SEUA 2P2AA 4Q30B 2P1SA 4RA1A 2QPQA 1F9BA 3VFJA 4RPOA 3SETA 3TQWA 4ZS9A 3CVGA 2OWSA 1JW1A 3OSQA 4H67A 4YB6A 4NF6A 4YKIA 2YPNA 1GR2A 3T22A 1UQWA 3SESA 1S50A 1MY1A 1I6AA 4U21A 3LR1A 4NF4B 4GD5A 1IITA 1YAEA 1Q35A 3S9EA 1BIYA 5I59B 4H5FA 3G3FA 2O7IA 4ELRA 1QJMA 2GFEA 2O68A 4FIMA 3U93A 2OLBA 5B70A 4AB6A 3RUMA 1BLFA 3ZKLA 3R26A 3GLBA 5H8NB 3T96B 4DDDA 3UIFA 2V84A 3TYHA 2I6EA 1P99A 1D3KA 1OIBA 3PGFA 2AIXA 1VE4A 3RLFE 2NWJA 3IK6B 5HBCA 4OENA 4O3BA 3TEPA 5H8HB 4DXUA 3MUQA 1MPCA 4U23A 1MXWA 4NF4A 4IY5A 3UP9A 4F3BA 3OENA 1M5CA 1USYE 3IOTA 5I59A 1URGA 2X7PA 1Z7ME 2ZYMA 2OBGA 3M8UA 2KLFA 1YPNA 4H5GA 1Y3PA 1EU8A 3KG2A 4GXSB 1FTLA 1P1OA 1UTBA 1N76A 2DP8A 3S2VA 4QHQA 3S9MC 5H8NA 5DT6A 1NNFA 5DVFA 3W9VA 1IUDA 4ZZAA 1CE2A 5AA4B 2O6AA 2HZKA 1JEVA 3G7WA 4QF9A 5JTYA 1DTZA 3PMXA 3TCGA 4N13A 3TQLA 1BTJA 3V83A 2REJA 1IIWA 1R9LA 2OWTA 1B4HA 2ZYOA 1R9QA 3MPKA 3QUJA 3A3CA 3ILTB 3FUZA 4OEVA 2DS9A 1EZOA 1JVYA 1B4ZA 1URDA 3IOVA 3K1PA 1M5EA 3K6UA 1ZIUA 3UK4A 1IXHA 2I4BA 4FECA 3ECRA 3U8QA 3FXRA 2QSXA 3OO8A 3IJXB 1XVYA 1MH4A 3TODA 4DXCA 2H4IA 3Q25A 3W15C 2R9JA 5EHSA 2XD3A 5AA4A 4LA9A 1D9VA 1P1NA 2Z8DA 3SEYA 2DWAA 4ZEFA 1ZU0A 2NXOA 2Q9TA 3MP8A 4GL8A 1ZKBA 2F34A 4MLVA 3BBRA 4IO7A 1NH8A 1LCFA 5DVJA 2REGA 4Q5TA 3HV1A 4LVQA 2XXPA 3CIJA 5CRYA 3H03A 2A5TB 3Q28A 1PC3A 3FVGA 2UVHA 5TP9B 4XKRA 1B5JA 3H6WA 3FVNA 1HSLA 1N7WA 1ZBMA 4OHNA 4F31B 4LONB 3PMWA 2ONRA 4OERA 1MQHA 2ANJA 4U4XA 3VE1B 2Z8FA 4R2BA 3DP8A 3RTFB 2PT2A 2VGQA 5AE4A 3M3FA 2G93A 4KHZE 4IO3A 3HO7A 5F1QA 1NH7A 3FD3A 3VVDA 3CRBA 4E0WA 4M4GA 4M1VA 1MRPA 3MBPA 3B6WA 3FZVA 5DYHA 1A99A 3PUZE 2A5TA 2F6PA 4GRKA 5TP9A 1I6BA 1B3LA 4QSDA 5DEXB 3H6TA 4C0RA 2AL4A 4ONYA 3D4CA 1ZMGA 4NMYA 3H3GA 3IX1A 3CSBA 4RPNA 4BLAA 4RY1A 4ZEKA 3GXAA 2XX8A 2Z23A 4EQBA 4G8NA 4WEPA 4RK9A 1SW2A 1MS7A 1B32A 2QS3A 4NE4A 4F19A 5JEIA 5DVIA 2H25A 3MAMA 3O6HA 4YZZA 2F7BA 3DELB 1MH3A 3JV9A 2V3TA 3U94A 3PUWE 1FQEA 1M5BA 3D4GA 1B7UA 4YAHX 4UACA 3W9WA 3K6WA 3FATA 5B7DA 3ODBA 5DEXA 2XXVA 2OZZA 1NMUA 3IJOB 5ICTA 3DP6A 2HXWA 3FJGA 2OK2A 4R2FA 5AA2D 3TUSA 3UORA 1PB8A 2F78A 2X26A 4OFLA 1JQFA 4ECFA 3I6VA 4GOTA 1M5FA 4FJPA 4X48A 4NEDA 2Y7PA 1OQGA 4JWXA 2XHDA 4I1DA 1HSEA 3MQ9A 2ONKE 3I5OA 1SW1A 3VLVA 4LZ7A 4OMBA 2I3VA 3IR1A 3OEKA 1B3EA 2ABHA 3SEWA 3EF7A 1JVXA 1SW4A 3JYRA 3U72A 1XOCA 1P1QA 2RKMA 1MDP1 3FVOA 1LCTA 3BFTA 4MH5A 4F2OA 4OXVA 4HTGA 4LUBA 3TFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OXNA 3PPPA 4NAPA 5EYFA 1LB8A 2CMOA 1OLAA 1VR5A 2F5XA 2Q8JA 5FTHA 1Q1KA 5L8DA 4EQ9A 3QK6A 4PF8A 4LQ5A 4O7MA 3TMGA 1A54A 3RT6B 2DDKA 4BDMA 1UTHB 4C1TA 3TTRA 1B40A 5H8QB 1A55A 4OETA 5ET5A 1MQIA 4EDPA 3MSTA 3B6QA 1YTVA 2RCAA 4G77A 4JWYA 4KR5A 3VXCA 4JSDA 1LFIA 1PBQA 3IL1B 5EYGA 4UA8A 1P1UA 2D3IA 4F3GA 3OOAA 5I2KA 1FTMA 2HEUA 1NL5A 2XD2A 3MVZA 1LGBC 3M3KA 4ND9A 4PC9A 1XI6A 3B7DA 4R75A 1OVTA 2NUVA 2V3QA 2Q2CA 3LBSA 2XWKA 1TXFA 3G3IA 5I84A 5FHMA 2FIEA 4HXVA 2HQ0A 1FRPA 4XKPA 3T9UA 1R1NA 3H7MA 3PPOA 1OMPA 2XA5A 1WVJA 2DXRA 2QS2A 3TZAA 2HZLA 3G3JA 4GWOA 3WAEA 3TPAA 4H6DA 1D9YA 2DWJA 1H3DA 3C33A 2JJKA 5CBRA 1JW5A 1YZ0A 3GYYA 2DE3A 1FBPA 2GRVA 3EHTA 4XKQA 2XXIA 4O3CA 1UTHA 1B1XA 5H8QA 4OQOA 1IXIA 3TFLA 3UGWA 4MCOA 3KEIA 1JP4A 2DOJA 4JVIA 5CMKA 2RC7A 3IB1A 4JBZA 1SW5A 2XX7A 3PD8A 3MJNA 3LC8A 2O69A 5K2YA 2WYKA 3FASA 1MDQA 2KQZA 2ZNSA 3GZGA 5ELVA 4N17A 3VV5A 1QGXA 3A3UA 4I3YA 1TT1A 1FQFA 2R6GE 1Y3NA 2Y7IA 3EQ1A 4GLIA 4P56A 1RDXA 4G4PA 3MP1A 4RK2A 4GWUA 4LP2B 5BWJA 4PAKA 5ESYA 3O29A 3U92A 2F35A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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