1OVTA

Refined crystallographic structure of hen ovotransferrin at 2.4 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
682
structure length
682
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
publication title Crystal structure of diferric hen ovotransferrin at 2.4 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 203
structure length 682
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA03
4OWDA 5L8DA 2Y7WA 4IO2A 1UTHA 3O6GA 2ZNUA 1Y20A 4RK9A 1FQDA 3Q28A 3K1MA 4ELOA 3H3GA 5FHNA 5F7VA 3QXMA 4UACA 4OEUA 1Y1MA 2DWJA 3U72A 4ESXA 4F1VA 3GBAA 5AA1A 4F1YA 1FQFA 3K6WA 4RNSA 3PV0E 2GHAA 2I0CA 1MQJA 1MQGA 3GXAA 2ABHA 2F6GA 3VV5A 3LSWA 1NL5A 4IGRA 2I3WA 1I6BA 2Z8DA 1YPNA 1A55A 3Q27A 4P0IA 1A54A 1QW0A 2F97A 2XXYA 4H0WA 1SW1A 1VFDA 3R26A 1LB9A 4FEBA 3KN8A 4JDFA 5DEXA 1IIWA 3FJ7A 2Z23A 1I6QA 3FASA 1RYXA 1VR5A 3FIRA 3O2AA 5CMMA 3K2DA 3RLFE 3D4CA 4RPOA 3VLWA 1JEVA 1EZPA 1FTJA 1OQGA 1Y4CA 2GH9A 3C34A 1P1WA 2ZYNA 5I57A 2BJJX 2QL3A 4M1VA 3O6IA 1NNKA 2NVUB 4G8MA 3TMGA 1B58A 2B65A 2XXQA 4U21A 2A5TB 1AIVA 3QAXA 3MQ9A 4ZZAA 3FXQA 2X7QA 4G4PA 4THIA 4OETA 3DP6A 3KBRA 2Y7KA 3BFTA 3LC8A 3TCFA 4RY1A 1MY1A 4OYVA 1PEBA 4NF4B 5I2NB 3IJXB 3N5LA 3B6QA 2XXHA 1LFGA 2I49A 5DTBA 1M5BA 3IORA 3HN0A 3I6VA 4GD5A 4N07A 5H8HB 5BWJA 3T96B 4ZDMA 4XTCQ 1JVYA 4U23A 4U22A 4ZZEA 1MS7A 3DELB 3T22A 4PP0A 1US4A 3FV2A 5H8NA 3VXCA 4H1XA 1OLAA 5AA4B 1B51A 4YAHX 3VVFA 3M3FA 5KCJA 4R73A 4FEDA 5L9MA 5AA2A 1XS5A 2DP8A 5ICQA 2XXUA 4H65A 4MLQA 1SBPA 1B3EA 1ZTYA 4RK2A 5L9OA 3RUMA 3BFUA 3MVZA 1ELJA 1A99A 4EXLA 3VFJA 2I3VA 4TLMB 4GIZA 1BKAA 1TXFA 2XD3A 3JYRA 4DIGA 4ESWA 4YB7A 1L5TA 3OO7A 3FXUA 5TPAB 4GL0A 3IO6A 4GRKA 3CFZA 4ELQA 2OCUA 1MDQA 2I48A 4EXKA 4ISUA 2OBGA 2R71A 4LZ7A 4LP2B 3E4RA 1P1QA 2O69A 1JNFA 4G8NA 3EPEA 3GZGA 4NF8A 2Y84A 5HM4B 5H8FB 4ND9A 3Q25A 1IEJA 4LQ5A 3U8QA 5CMBA 4F39A 3MW0A 1DPPA 1AOVA 4G68C 3LSLA 1QVSA 3E13X 2DOJA 2NWJA 5JK4A 1SD3A 3FV1A 3T9VA 4EQ9A 2ZXTA 4F19A 2NOOA 3TPAA 3PPRA 1Y3QA 4YMAA 4IO3A 3RT6B 2V3TA 2XX8A 1QULA 1MY4A 2PT1A 1FTMA 2YLNA 4XKQA 2OLBA 4GXAA 4WEDA 1B5IA 3H6VA 4BDMA 3MUQA 4PFTA 1MY3A 4GF8A 3H7MA 4OFOA 5AA3A 4H8JA 3UA8A 5KDTA 4LA9A 2HAUA 2DWIA 4BDQA 1Y3NA 3QUJA 3O28A 4EQ7A 4U4SA 3SDFA 2P2AA 4OESA 1USYE 1JW1A 2IEEA 4LZ5A 4IY6A 3OEKA 3GLBA 3EHUA 1UTBB 3FVNA 2DE2A 4BLAA 5CBRA 3RGYA 4EF1A 4C1TA 3MZ9A 2DS9A 1ZU0A 3LUYA 1DMBA 3K4UA 3HHFA 4MF3A 1MQDA 3F11A 4NF6B 4KR5A 1XVYA 3M3LA 3C36A 1B1HA 1KWHA 1SVXB 1IXGA 3EF7A 3FUZA 5M2VA 1TT1A 3IO4A 2FA7A 4ZEKA 2ESNA 4HS7A 4GWOA 4TLLB 2D5WA 4OZ9A 2REJA 5JTYA 2UVHA 4AB6A 3FGSA 1NH8A 5I2KA 3KGCA 2RF1A 3CR9A 3C4MA 4OENA 3TDJA 2UVJA 2QPQA 3OOAA 3S9EA 4TOZA 4OHNA 3G3JA 5H8QA 3SETA 4FAJA 1AMFA 4ELRA 1A8EA 4JWXA 1QUIA 3SEVA 1JVXA 1GTKA 1LFHA 2X7PA 1UQWA 4XKNA 3DLNA 1JW5A 3M8UA 3CFXA 5LOMA 2Y7IA 1N04A 4LVQA 1Z7NE 1B4ZA 2LAOA 3T93B 3KSJA 5BUUA 3K0VA 4YU0A 3WAEA 1SYIA 4XIGQ 1MPCA 1B3GA 4O3AA 3I5OA 2YJPA 1P1NA 2B3FA 4ZE8A 3MBPA 5CRYA 3N6UA 3OXNA 4JWYA 2XD2A 2E0SA 1DTGA 2DE3A 4PFWA 1MDP1 2PMSA 2RINA 1EU8A 4LUBA 2DXYA 3PMWA 1N76A 4PETA 1IXIA 4RYAA 1FQBA 3IL1B 3BBRA 3LSXA 3ZKKA 4OVJA 4EF2A 4ELPA 4F31B 5DT6A 1FQCA 1USYH 3DM0A 3TKDA 3KEIA 1MQIA 2Q2CA 3CFLA 1Q1KA 2H25A 3OO9A 2V3UA 4PFUA 1HSJA 4NEDA 1DTZA 1D3KA 5J1DA 1MRPA 3U94A 4YMBA 1XC1A 4GXSB 4DXBA 2UVIA 2GFEA 3N94A 2RC8A 1GR2A 1QUKA 3MPKA 2O1LA 1LCTA 5DYHA 1D9YA 4RPNA 3FD3A 3W15C 4ONYA 1EZ9A 3IOTA 3MP6A 4MBPA 2DVZA 2R9JA 3SEXA 1S9TA 2RC7A 4H5FA 1R9LA 5K2YA 2QMXA 4KD5A 3FVGA 2A5SA 1SYHA 4R9GA 4DXCA 1URGA 5B70A 3CRBA 3UP9A 1XHYA 5CMCA 5I59A 3EHSA 3MP8A 3V8XB 3SESA 1MPBA 4I9DA 4QFKA 3V5AA 4FE8A 3OSQA 3D4GA 3IK6B 2PT2A 5I84A 1IXHA 1JW4A 5IKBA 5CC2A 4F29A 4QFOA 5KZTA 1ZKBA 2D3IA 3B7DA 2HCAA 4QFPA 4XXUA 5A5XA 3IX1A 1B2HA 1D4NA 4HW8A 3V83A 2W7YA 1XVXA 2OK2A 4G77A 2E1SA 1BLFA 1UTBA 1VSOA 5H8SA 2F6PA 3A09A 4FORA 4DXUA 3RT8A 3O6HA 3ILTB 1MXYA 2ONKE 5TP9A 2ZYOA 2ONRA 2O6AA 3E9XA 3FZVA 3VLUA 2DXRA 3KOSA 4R2FA 3VLVA 3RPWA 4BDOA 3G3KA 3B6WA 3KZGA 3UORA 5I56A 1HSEA 2PX1A 4Q8RA 4I62A 4O3CA 2G29A 4E0XA 1H45A 3IJOB 3RNNA 3HPIA 1OQHA 5I58A 2GRVA 1RYOA 1FCKA 4TQUQ 2HZKA 1Y3PA 2XX9A 1N3WA 4OEVA 3PUWE 2H9BA 1A8FA 4KYSA 3S4UA 4F3SA 4OXVA 2AL5A 1P1OA 2OWTA 3UK4A 4NTLA 3HV1A 3LR1A 3VVEA 1YTVA 3OO6A 3VVDA 2XXPA 4G8HA 2VHAA 1B9JA 3OO8A 4IO7A 2DWAA 4UA8A 1FW0A 4DZ1A 4RXLA 4WEPA 3IB2A 3CSBA 1ZJLA 2V25A 1MXWA 3A3UA 4OTEA 4R2BA 2Q89A 3GBBA 3K1NA 2I58A 3PU5A 3PPPA 3W9WA 5F1QA 1OMPA 3CG1A 4IO5A 2VD3A 4GVOA 4NF5A 1DSNA 5ICTA 2QS4A 3PUZE 1QJMA 2PVUA 4AB5A 2I4CA 4XKRA 4X1BA 3OMBA 3O29A 4RA1A 2UXAA 5HPQA 3MAMA 4WKMA 1LB8A 4DLDA 1HSLA 5ITPA 3C31A 1H3DA 1CE2A 1UTHB 3MVWA 4G68A 1N7WA 4LONB 1OLCA 1PB8A 1FTOA 3ZS6A 5L9SA 3DP8A 5JEIA 1B4HA 4WXJA 3KSXA 1NKXA 3LSFB 1B32A 1H43A 1BTJA 2D21A 1B40A 4OERA 3SERA 1S50A 1ATGA 2OWSA 1N84A 4NWDA 3QUFA 4R74A 4F3BA 2QS3A 1H76A 1R1NA 1ZLQA 3KN3A 3PUYE 5EYFA 4F2OA 3IOUA 3OD7A 2I4BA 1IXCA 1MQHA 4QHQA 4MLVA 3IR1A 1NNTA 3QK6A 4L17A 4U4XA 4HCWA 3G7WA 4KYDA 3HO7A 1EZOA 5CBSA 1PDAA 3TTLA 3Q29A 5DEXB 4O3BA 3PPQA 1WDNA 2QSXA 1YAEA 2HQ0A 3CVGA 3WAFA 3G3HA 2RKMA 3T9XB 1ZBMA 4H8IA 5ELVA 1JETA 3W9VA 2F34A 1O7TA 5K2XA 3N26A 2P0SA 2VD2A 4YB5A 4DCXA 2XXRA 3M3KA 2G93A 1SW5A 5I57B 2P1SA 2O1MA 4P0GA 3L6GA 3TAJA 2DSFA 4F3GA 4QSEA 3IB0A 5FHOA 3PMVA 2O51A 4FJPA 2XXTA 1Y1ZA 2ZYKA 1MH3A 2A5TA 1QKBA 4GQOA 3FVOA 3C33A 4ZEBA 4LQ2A 2UVGA 2AYSA 2F7CA 1B0LA 3R6UA 1MH4A 3SEWA 2DWHA 4BDRA 3B6TA 4NF4A 3THIA 5I2NA 3S9NC 5AE4A 1POY1 3RY3A 1PBPA 2QRYA 3TTRA 5HBCA 1M5EA 5H8HA 5FTIA 3MC2A 2CMOA 1JEUA 3TTNA 2Y7PA 2FNCA 2RCBA 2RC9A 2WKYA 4QRZA 3ILUB 4BDLA 2DE4A 3PMXA 5KCJB 4PE5B 4JSDA 5AA2B 5AA4A 4GL8A 4H5GA 4MFIA 4K3FA 3FJMA 3TCHA 3EQ1A 3H06B 4Q30B 2M8CA 2UYFA 4H6DA 3KFMA 4EQBA 5CI5A 1PBQA 3C9HA 2FYIA 1WODA 3PPOA 2GHBA 5ISUA 3S9LC 1N3XA 4JSOA 1MXZA 5B7DA 4HCYA 4GOTA 3RQTA 3I3VA 3TQLA 1B5HA 1XOCA 3VE1B 1EH3A 1SI0A 2F35A 1B7HA 1URDA 5TPAA 1AL3A 2X26A 2R6GE 2OJTA 1Y9UA 3ODBA 3SEUA 3CIJA 4Q5TA 3EHTA 2PYYA 2NUVA 1XT8A 3H6TA 4NE4A 5CMKA 1ZIUA 1N0TA 2I0BA 5H8FA 3FVKA 4P11A 1H44A 3RTFB 1R6ZA 1VE4A 1TFDA 3JZJA 1ZMGA 1WVJA 4YKPA 1Z7ME 4IO6A 1OVBA 1MM6A 3K1PA 3O97A 2XHDA 2HEUA 1VFEA 2REGA 3K6UA 4G2ZA 3PGFA 3MVXA 1UIVA 1YCJA 1P99A 4YKJA 1LAGE 5KDTB 1UIUA 2F36A 1MPDA 3ZSFA 2H99A 3KG2A 2H98A 2QS1A 3IB1A 3FATA 2I6EA 2F8DA 2RCAA 4F1UA 3O9PA 4IY5A 2ZNSA 3K6XA 1ANFA 4R6YA 1Y4TA 5IAIA 1IQ7A 4R75A 4KCCA 2HFBA 3TZAA 3E3KA 1TFAA 2ZMBA 4KI0E 4PFYA 1B52A 1B7UA 1NH7A 3T9UA 4N6PA 4NF6A 1JQFA 1J1NA 4ZEIA 1Q35A 2XXIA 1SW2A 1LAHE 1B3HA 2NXOA 3TEPA 1CB6A 4GLIA 5JTYB 5EHMA 5I2KB 4JWOA 4YKKA 4F18A 3CI8A 1US5A 4MH5A 4ECFA 4KFQA 3PD8A 5H8QB 1GVCA 1M5CA 1FTLA 1SI1A 1QUJA 3FJGA 4C0RA 4EDPA 2Q9TA 1D9VA 3K00A 4LATA 1LFIA 3PUVE 2O68A 1F9BA 1S7YA 3O66A 1A7LA 1NNPA 4OFJA 2AIXA 4QF9A 4QSCA 1O64A 3Q26A 4BDNA 2HXWA 1RKMA 3OEMA 1NMUA 3K01A 3V89B 4N13A 1URSA 2XXVA 3UIFA 3G3GA 3QIMA 3QYTA 4KQPA 2H4IA 4F22A 4QFLA 3H03A 2UYEA 3L6HA 2VOZA 3MP1A 3EN3A 5DVJA 2O7IA 3TELA 3ZKLA 3ONMA 3C32A 1OVTA 1MG1A 3VXBA 1BIYA 4LZ8A 3MVYA 3AXFA 1N7XA 4I8CA 2B3BA 3T66A 1MXXA 1SW4A 3PUXE 4I1DA 4PQJA 3VDFA 1B0HA 1LLSA 2THIA 3QSLA 4R6KA 4QFNA 4KCDA 3IOWA 3RN8A 4XKPA 4QSDA 4GFRA 4DCYA 3U93A 3JV9A 3USDA 5FHMA 2CZLA 1B3LA 1SQYA 1IZ1A 2QMWA 4ZEDA 5ITOA 2DQVA 3FXRA 4H67A 3MWBA 1T0KA 3HHGA 5I59B 1LGBC 3P7IA 1B3FA 3MZBA 2QS2A 5CM6A 3N6TA 1O63A 5DVFA 4KPTA 2ONSA 1PB9A 4X9TA 2XXWA 2O84X 4JXIA 3H6WA 1MM7A 5A5XB 1MXUA 5AA2D 1SDXA 2HAVA 4ZE9A 3IOVA 1M5DA 5TU0A 4Q0CA 2XXXA 3SEYA 3OSRA 3C35A 3G3IA 3MJNA 2OZZA 3G3FA 4Z0IA 2QJEA 4R6HA 2VGQA 1FTKA 1NFTA 3MZ1A 3TQWA 4YB6A 5EHSA 4U1OA 4JB7A 1LBBA 4RJZA 5TP9B 3S9MC 1II5A 3IAZA 1AH5A 1B6HA 5DVIA 4YKIA 2Z8FA 4FATA 1LCFA 2VP1A 2Q8JA 3LBSA 2V3QA 3PPNA 1FQEA 4DE8A 4OQOA 4OFLA 5I56B 3KOTA 2H5YA 1MXVA 3CG3A 3UN6A 4OMBA 3R7XA 1LAFE 2HZLA 1IITA 2AL4A 2YPNA 2Z22A 2V93A 3HSTA 5I58B 3TCGA 1IUDA 1B1XA 4IGTA 3UGWA 3KJTA 4C1UA 4DDDA 4U1ZA 4POWA 1I69A 3K6VA 5FTHA 2XX7A 2V84A 4U2RA 4FIMA 3TTKA 3TUSA 2DYXA 5H8NB 1B7ZA 1BP5A 1MY0A 2ALUA 1GGGA 2F7AA 4Z7EA 3TTMA 3S2VA 1LSTA 3MPLA 2Y7RA 4M4GA 4JBZA 2ZNTA 3TFLA 1B05A 1TWYA 1OIBA 4ZECA 1PB7A 3K02A 1I6AA 2F78A 2PBWA 1B46A 3SKPA 4ZEFA 1PC3A 3CSGA 3A3CA 1P1UA 3U1OA 4R72A 4X48A 1R9QA 3TYHA 4KHZE 4NWCA 4R9FA 4EUOA 3U92A 4F2QA 3KJ7A 3BKIB 1DOTA 2Z8EA 4X1DA 2KLFA 1GV8A 1DPEA 2Q88A 3TODA 1MY2A 4IB2A 4HTGA 1FQAA 4FECA 4F3PA 1A40A 2Q2AA 2DVCA 2F7BA 3H6UA 4YICA 1B5JA 4NF5B 2O7UA 4NMYA 1NNFA 4IO4A 1M5FA 3H4ZA 2IA4A 4YZZA 4E0WA 3T9HB 3PD9A 4KYEA 4NF8B 1LBCA 4ZS9A 4AQ4A 3KN7A 2ANJA 3DP4A 1POTA 2ZYMA 3OENA 3ECRA 3HCQA 3RTWB 2F5XA 1QKAA 4POXA 3OELA 1LAXA 4G68B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F3BA 4OWDA 4GBVA 5L8DA 2Y7WA 4IO2A 5ET7A 1UTHA 3O6GA 3RYDA 2ZNUA 1Y20A 3KC0A 4RK9A 1FQDA 1YXIA 3Q28A 3K1MA 4ELOA 1FBCA 3H3GA 5FHNA 5F7VA 3QXMA 4UACA 4OEUA 1Y1MA 2DWJA 3U72A 4ESXA 4F1VA 3GBAA 3IFAA 5AA1A 4F1YA 1FQFA 3K6WA 4RNSA 3PV0E 2GHAA 2I0CA 1MQJA 1MQGA 3GXAA 2ABHA 4HXVA 2F6GA 3VV5A 3LSWA 1NL5A 4IGRA 2DDKA 2I3WA 1I6BA 1G0HA 3D1RA 2Z8DA 1YPNA 1A55A 3Q27A 4P0IA 1A54A 1QW0A 2F97A 4N8YA 2XXYA 4I3YA 4P56A 4H0WA 1SW1A 1VFDA 1FJ6A 3R26A 1LB9A 4FEBA 3KN8A 4JDFA 5DEXA 1IIWA 3FJ7A 2Z23A 1I6QA 1FPDA 3FASA 1RYXA 1VR5A 3FIRA 1FBEA 3O2AA 5CMMA 3K2DA 3RLFE 3D4CA 4RPOA 3VLWA 1JEVA 1EZPA 1FTJA 1OQGA 4NAPA 1Y4CA 2GH9A 3C34A 1P1WA 2ZYNA 5I57A 2BJJX 2QL3A 1CNQA 4M1VA 3O6IA 1NNKA 4HE0A 2NVUB 4G8MA 3TMGA 2Y5LA 1B58A 2B65A 2XXQA 4U21A 2A5TB 1AIVA 4NQ8A 3QAXA 3MQ9A 4ZZAA 3FXQA 2X7QA 4G4PA 4THIA 4OETA 3DP6A 3KBRA 2Y7KA 3BFTA 2V4CA 3LC8A 3TCFA 2ZZXA 4RY1A 1MY1A 4OYVA 1PEBA 4NF4B 5I2NB 3IJXB 4NF0A 3N5LA 3B6QA 3ROJA 2XXHA 1LFGA 2I49A 5DTBA 1M5BA 3CHGA 3IORA 3HN0A 3I6VA 4GD5A 4N07A 5H8HB 5BWJA 3T96B 4ZDMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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