2O68A

Crystal structure of haemophilus influenzae q58l mutant fbpa
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTELTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
publication title The role of the synergistic phosphate anion in iron transport by the periplasmic iron-binding protein from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
total genus 113
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o68A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o68A02
3SKPA 2PBWA 1NH7A 4NF8A 5TP9A 1B0HA 1H43A 4P11A 1L5TA 1AL3A 3QXMA 1OLCA 2H9BA 3E4RA 3AXFA 3S9LC 2Y84A 3IK6B 3A09A 5K2YA 3RGYA 2PT2A 4HW8A 2GHAA 3ECRA 2R6GE 3QK6A 4DIGA 5K2XA 1ATGA 2O6AA 1JNFA 4GD5A 3G3FA 1I69A 1Y3PA 4QFOA 2GFEA 1LGBC 2UYFA 2ONRA 1WVJA 5CMKA 3LSFB 5FHMA 3A3UA 3EHTA 4POWA 2HXWA 1ANFA 3FASA 1XOCA 3PPNA 4ZS9A 4H0WA 3FXRA 3VE1B 3SDFA 1IIWA 4EQ9A 2DXYA 3K6WA 2F5XA 1MPCA 4TQUQ 3N94A 2F6PA 2VD2A 2NVUB 1FQFA 3PD8A 3KBRA 3KSJA 3L6HA 3DP8A 1A8FA 2AL5A 4G8MA 5JTYB 4QSDA 4RK2A 1H3DA 2DE4A 4H5GA 2XXRA 3SEXA 1YCJA 4KR5A 2Y7PA 2ZNUA 3H3GA 3RQTA 1VR5A 1B5HA 1EZOA 4GFRA 1IQ7A 4DZ1A 1MM7A 1GTKA 3LC8A 3O6IA 2QMWA 2H5YA 1B9JA 2XXIA 4NF6B 3LSWA 2V3UA 3USDA 2M8CA 1B58A 1H45A 1J1NA 2X7QA 1P1NA 4OWDA 3VXBA 3GXAA 1POY1 2DOJA 4UA8A 4FECA 1LBCA 5DT6A 4DDDA 1MM6A 1NL5A 1N3XA 1GVCA 2XX9A 3I3VA 5CI5A 4QSCA 3B6QA 3TELA 3TYHA 4OTEA 2XXHA 4OEVA 4PE5B 3EF7A 1JEVA 3C4MA 3IOUA 2XX8A 1B1HA 4LONB 3N6TA 1II5A 3O29A 1DPPA 4GXAA 3S4UA 1TFAA 4F3GA 5ITPA 1MQDA 3PUZE 3CIJA 3MZ9A 3V8XB 4X1BA 4ZEDA 3IR1A 4WKMA 1ZIUA 4G68A 3ZSFA 2RC8A 1AMFA 1JW4A 4O3CA 2RINA 4WEPA 3T96B 2XX7A 1LAGE 3EQ1A 3K1PA 5AA3A 3BFTA 4U22A 3KG2A 4ESWA 1IEJA 2KLFA 3PMWA 4LVQA 3BFUA 4NF8B 3TKDA 5TP9B 2QMXA 1B3EA 1B1XA 1A99A 1M5CA 4JWXA 1H76A 2FNCA 3O6GA 4JDFA 3O9PA 3TMGA 3PUVE 4R9GA 4ZEBA 3DM0A 4R6KA 2NXOA 4OETA 2PX1A 2ONKE 5FTHA 2HFBA 5HPQA 5BWJA 1B40A 1FQCA 4XIGQ 2D3IA 1LB9A 1JETA 5ICQA 4KYEA 4OVJA 2AYSA 3R6UA 2XD3A 4THIA 1S50A 3U8QA 5I59A 3ZKLA 4OHNA 4ZEKA 4KHZE 3C9HA 1B5JA 3FIRA 3EHUA 4YB7A 4F3PA 3F11A 3V5AA 1OMPA 2B3FA 1KWHA 1GV8A 2O7UA 1B5IA 3TTNA 1YAEA 3SERA 5CBSA 2O51A 4LATA 2DYXA 4JB7A 3O66A 3K6UA 3T93B 1VE4A 1MXWA 3MVZA 1NKXA 2LAOA 3ILUB 3OMBA 5H8QA 3FGSA 3OO8A 4U1OA 2REJA 4RPNA 4GIZA 4KD5A 3VVFA 5I58A 1VFDA 3MUQA 4GLIA 4IO2A 2F97A 3PUYE 2HAVA 1P99A 4F29A 3OELA 3OSRA 4NWCA 4DXBA 4KQPA 4OESA 1SW4A 1FTKA 1B51A 5AA2A 2HZKA 3H6WA 3K2DA 3GZGA 4JSOA 2G29A 4KPTA 2Z8FA 1NNKA 1QKBA 1MXUA 5H8FA 4JWYA 4BDLA 3CSBA 3H6VA 1FTOA 3MBPA 2XXQA 4TOZA 3ZKKA 2P0SA 3V89B 4F22A 3TQWA 5B7DA 3RTWB 4OYVA 4OZ9A 4BDQA 3OEMA 1O7TA 1TT1A 4WXJA 1GGGA 3IOVA 2UVHA 4Q5TA 4EXLA 4GXSB 3P7IA 3UA8A 2DXRA 3FVOA 1NNTA 3PPOA 4XKPA 3A3CA 1TFDA 1ZBMA 2Y7KA 5ELVA 3JZJA 4IY5A 3FV2A 4C1UA 4G8NA 1A54A 4G68B 1B4ZA 3DP6A 4PFWA 1QVSA 2I58A 4X48A 2O69A 5KCJA 4IGRA 5FTIA 1IUDA 2YLNA 3IORA 1POTA 2P1SA 2WKYA 2OBGA 2RKMA 3HHGA 2B65A 1PBPA 2GH9A 4QHQA 3H7MA 4RA1A 3UN6A 3MVXA 4F39A 3KEIA 1A8EA 3OOAA 4H5FA 3VXCA 4PETA 2RC9A 1FQAA 2QS3A 3MVYA 4HCYA 5I2NA 4E0WA 3CR9A 3FV1A 2QS2A 3IO6A 4GL8A 1URGA 4PP0A 4G2ZA 4BDOA 1FQEA 3SESA 2I4CA 1MY1A 3PV0E 2B3BA 3SEVA 1A7LA 4OFLA 2I3WA 5I59B 3QAXA 3U1OA 4KI0E 3CI8A 4OERA 4F1UA 3CFXA 4FE8A 2RCBA 4JSDA 4N13A 4QF9A 4YU0A 2YJPA 4QFKA 1LB8A 1UTHA 3MQ9A 3TTMA 3H6UA 3HO7A 4JBZA 1IITA 3W9VA 3SEUA 5H8QB 3QIMA 4LZ5A 1B6HA 3FJMA 1Y1ZA 2FA7A 1EH3A 2CMOA 2H25A 5I58B 4RPOA 4GQOA 3SEWA 4ZDMA 4MH5A 4F2QA 1B7ZA 2DWIA 5AA2D 5DTBA 1N76A 4N6PA 3W15C 1OQGA 2ALUA 2QJEA 1P1WA 3Q27A 2VOZA 2THIA 2V84A 1MXVA 4U2RA 5AA2B 2ZMBA 3VLVA 1IZ1A 2BJJX 4NE4A 5L9OA 5H8HA 5H8FB 5CBRA 1B3GA 3MP6A 3K00A 1RYXA 5EHSA 4U4XA 3C36A 2XHDA 5TPAA 3FVKA 3FJ7A 3CVGA 3E3KA 1N0TA 4ECFA 1MXYA 4GRKA 2UXAA 1QJMA 1MPBA 2ANJA 4YKIA 3FUZA 4POXA 3EHSA 1AIVA 5HBCA 5JEIA 2QS4A 3RUMA 3ONMA 4X9TA 2Y7WA 4MBPA 4G68C 4Z0IA 2ZYKA 5KCJB 4I8CA 3MWBA 2ONSA 4BLAA 2NOOA 1XT8A 3D4CA 4H65A 2XXWA 4F2OA 2DP8A 4NF4A 5B70A 3TQLA 3TCGA 3JV9A 1S9TA 2H4IA 5L9MA 2H99A 4GL0A 3IOTA 4PFYA 3H06B 5ICTA 1PBQA 1SYHA 2I48A 3KSXA 4IGTA 3MC2A 5I2NB 1A40A 4YAHX 3M3FA 1NMUA 3IJOB 1SYIA 2I6EA 4YB5A 3MP1A 3LR1A 4N07A 4EQ7A 2DS9A 2OWTA 4H67A 2ZYNA 3FZVA 4DE8A 1BP5A 4FIMA 1BKAA 3IB2A 3FXQA 4XXUA 1SBPA 3KOSA 4F3SA 4XKNA 4XKQA 4AB5A 3I5OA 2IEEA 4EQBA 4GF8A 2Q8JA 4OFOA 2ZNSA 4H6DA 4U4SA 3S9EA 1MDP1 3UIFA 4H8IA 1UTHB 4WEDA 3G3JA 4IO4A 1TXFA 5I56A 2XXTA 4YB6A 1QULA 3IO4A 2PT1A 2E0SA 2A5SA 4FORA 3CG1A 3MPLA 1M5BA 3TAJA 3M3LA 1S7YA 4IB2A 2QS1A 4UACA 1EZ9A 3C35A 5H8SA 1DSNA 1Y4CA 3PGFA 2UYEA 1BLFA 3V83A 2V93A 3T22A 1I6AA 1HSEA 2Z23A 3EN3A 2AL4A 1LFGA 4ZEIA 4LP2B 5ISUA 2OK2A 4ONYA 5H8HB 1F9BA 5I57A 4G77A 3WAEA 2O1MA 4QFLA 3MPKA 5TPAB 3S9NC 3WAFA 2QPQA 2XD2A 1ZJLA 2H98A 4G4PA 1IXIA 3RY3A 3HHFA 4ELOA 1VSOA 4OMBA 2W7YA 1MRPA 3Q29A 1CE2A 3GBAA 2R71A 4KYSA 3Q26A 1JW5A 3TCHA 3VFJA 2R9JA 3TCFA 3CSGA 2DQVA 4TLMB 1ZMGA 3C33A 1ELJA 5TU0A 1P1QA 3TDJA 1RKMA 5CMBA 2DVCA 3E13X 1RYOA 3MW0A 3E9XA 2Z8EA 1UTBA 3H03A 3VVDA 3DLNA 3N26A 5F7VA 1YPNA 4NF4B 2VD3A 3TODA 1PDAA 3QUJA 2OCUA 3RT8A 3KN8A 1FQBA 4RK9A 4EDPA 3IB0A 5DEXA 3M3KA 3VV5A 3IL1B 3N5LA 1SVXB 3O28A 4EF2A 3HN0A 1P1OA 3PPQA 4YICA 4ESXA 2HQ0A 2QRYA 5ITOA 5I2KA 4K3FA 2F34A 1D4NA 4LUBA 1B3LA 4KFQA 1SW2A 1IXCA 3RTFB 4ELQA 1MY2A 2Q2AA 1DTZA 3W9WA 3VDFA 4OXVA 3FVGA 4HCWA 1LFIA 2YPNA 3Q28A 2UVJA 4MF3A 4O3AA 3TUSA 2PVUA 1Y9UA 4R6YA 4QRZA 1Y3QA 3HPIA 1MY4A 2Y7RA 3GBBA 3FATA 5I56B 1DTGA 2XXVA 2RCAA 2CZLA 1OIBA 3KJTA 5IAIA 1B05A 3N6UA 2O84X 2VHAA 3OEKA 1QUIA 2NUVA 2FYIA 1ZLQA 2F78A 2I0CA 2XXPA 1MQJA 2QL3A 4U1ZA 4GVOA 1FTMA 1YTVA 3G7WA 4RYAA 1MDQA 1MXXA 1JW1A 3K01A 3K1MA 1D9VA 4ISUA 4F31B 1LCFA 4YKKA 3TPAA 5I57B 3H4ZA 2PMSA 3RLFE 3B6WA 1Q35A 1GR2A 4PFUA 2O68A 1IXGA 3IX1A 4ZE8A 1UIVA 2Q2CA 1OVBA 1XHYA 2Z22A 2DWHA 1MY3A 3T9VA 4GOTA 3C34A 4ZEFA 4IY6A 1HSLA 1JQFA 4ND9A 2GHBA 2Q89A 5IKBA 3THIA 1SDXA 1N04A 3VLWA 3CRBA 4RJZA 1O63A 1FCKA 1H44A 4OEUA 5L9SA 4Q0CA 3BBRA 2RF1A 5CM6A 1MY0A 1QKAA 5EHMA 3OXNA 1UTBB 2V3QA 4R74A 3T9UA 4O3BA 5CMCA 1MS7A 1XVYA 3OD7A 4OENA 1MQHA 1B3FA 4QFNA 3O97A 1OVTA 2I4BA 4EF1A 1XS5A 1URDA 4RXLA 3FJGA 3B6TA 4U23A 1MQGA 4JXIA 3RN8A 1LLSA 4LQ5A 1B7HA 4U21A 2DE2A 1B2HA 4RY1A 5DEXB 1ZU0A 3FVNA 1R9LA 1IXHA 1BIYA 1LAXA 1PB9A 2A5TA 4FATA 2NWJA 5I2KB 1EZPA 4ZECA 4P0IA 3H6TA 5DYHA 3T9HB 3U94A 3PPRA 1US5A 5CC2A 4TLLB 5DVJA 3LBSA 1SI1A 3B7DA 1T0KA 2E1SA 1LBBA 1BTJA 1QUJA 1B7UA 4X1DA 3TTLA 4F1VA 4R73A 4H1XA 4C1TA 4ZE9A 1I6BA 1OQHA 1N3WA 3OO7A 3T66A 4NF5A 4XTCQ 3FXUA 2VGQA 4BDMA 2ZXTA 5KZTA 2Z8DA 3EPEA 4RNSA 4M4GA 2OZZA 2ESNA 2V3TA 1I6QA 4XKRA 4I9DA 1Q1KA 2XXYA 1MH3A 3IAZA 4OFJA 2Y7IA 4QFPA 1Y4TA 1ZTYA 3HCQA 4IO7A 5KDTA 4QSEA 4AB6A 4EXKA 3IOWA 3C32A 3MZBA 2Q88A 2F36A 4ELPA 3UP9A 3G3GA 1B52A 2F6GA 4HTGA 3ZS6A 1D3KA 5H8NA 4YKPA 5I84A 2HEUA 1D9YA 4OQOA 3JYRA 4DCYA 1FW0A 1Y20A 2G93A 3UORA 5AA1A 3LUYA 4NEDA 4F19A 3R7XA 2F7CA 3U92A 1Z7NE 2F35A 4F1YA 3U72A 5AA4A 3KN7A 2HCAA 3VVEA 2ZNTA 3MP8A 1JVYA 4JWOA 3CFZA 5A5XA 4GWOA 2O7IA 5DVIA 1USYE 1QW0A 2OLBA 3MAMA 2O1LA 1UQWA 4LZ7A 1US4A 2I3VA 2RC7A 3MVWA 3KOTA 3TEPA 1FTLA 4I62A 3CFLA 3PU5A 2UVGA 3QSLA 1SW5A 4AQ4A 4R6HA 1Y3NA 3LSLA 2DVZA 4FEDA 1USYH 4IO5A 1URSA 1MQIA 1JVXA 4L17A 3BKIB 1MPDA 4YMAA 1CB6A 2D21A 4Q8RA 2AIXA 3IJXB 1MXZA 2A5TB 5M2VA 3PUXE 2HZLA 4NWDA 3S2VA 1Z7ME 4YKJA 1OLAA 4LZ8A 1MG1A 1R6ZA 2REGA 3M8UA 2XXUA 3U93A 1O64A 1N7WA 3SETA 5FHOA 4EUOA 4KCCA 3K02A 3Q25A 3KJ7A 1ZKBA 4LA9A 1PC3A 2DWAA 3RT6B 4NF5B 1A55A 1B0LA 3KZGA 5EYFA 4FEBA 4H8JA 3RNNA 4DLDA 4Q30B 1SI0A 1PB8A 1WODA 3MJNA 4G8HA 2I0BA 2VP1A 3OO6A 4KYDA 1DPEA 4KCDA 1PEBA 3TZAA 5LOMA 4BDRA 4MFIA 5JK4A 1MH4A 3PUWE 5L8DA 4R9FA 3GLBA 3KGCA 3G3HA 2Q9TA 5KDTB 2F7AA 3OO9A 4Z7EA 3IB1A 3K6XA 1WDNA 4C0RA 3KN3A 2ZYMA 2I49A 3HV1A 4LQ2A 4BDNA 5H8NB 4NMYA 3MZ1A 2D5WA 2HAUA 3KFMA 1QUKA 4PQJA 1PB7A 3ILTB 4FAJA 1SD3A 1XVXA 3PD9A 3QUFA 3ODBA 2ABHA 1LAFE 3K6VA 1M5FA 1R9QA 1SQYA 4MLVA 2F7BA 3G3IA 1R1NA 3DP4A 5AA4B 1B32A 4M1VA 3UGWA 1AOVA 4ELRA 4R2BA 3TTRA 5A5XB 2V25A 2QSXA 4YZZA 1Y1MA 1JEUA 2X26A 1LCTA 5FHNA 3I6VA 2GRVA 1EU8A 1LSTA 4FJPA 3TTKA 1B3HA 5DVFA 5JTYA 5J1DA 3L6GA 3O2AA 2P2AA 3R26A 3LSXA 2PYYA 4MLQA 1XC1A 3C31A 5BUUA 1M5EA 4R2FA 3HSTA 3FD3A 2DWJA 3S9MC 1DMBA 3SEYA 3O6HA 4P0GA 2OWSA 3D4GA 5CRYA 4F3BA 1SW1A 4NF6A 1P1UA 1NH8A 4I1DA 2X7PA 3CG3A 4NTLA 1HSJA 2XXXA 3DELB 1FQDA 2ZYOA 5F1QA 1M5DA 4E0XA 4F18A 3QYTA 3UK4A 2UVIA 4PFTA 3OSQA 1B46A 4DCXA 2DSFA 4IO6A 3T9XB 2IA4A 1N84A 1NNFA 4DXUA 3K4UA 3PMXA 1NNPA 3RPWA 1TWYA 1FTJA 1AH5A 4R75A 4HS7A 3OENA 1NFTA 3K1NA 1UIUA 3TFLA 3VLUA 2OJTA 2F8DA 5CMMA 4ZZAA 2DE3A 4ZZEA 3PPPA 4DXCA 1LAHE 4R72A 1LFHA 5AE4A 1VFEA 3G3KA 1DOTA 3K0VA 3PMVA 4YMBA 1B4HA 1N7XA 5HM4B 4IO3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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