3K6VA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in citrate-bound open form
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 107
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA02
2Q88A 2HEUA 3C9HA 3IO6A 5A5XA 4YKPA 5ITPA 4EQ9A 3PU5A 3DP8A 2GHBA 5H8QB 2ABHA 2XXPA 4YZZA 3SESA 1QKBA 1QULA 3S4UA 1B58A 3MZBA 3EQ1A 3KSJA 3O9PA 1M5DA 3ILTB 1IXCA 5KDTA 2DE2A 4O3CA 4R72A 4C1TA 1H3DA 2XX8A 3OEMA 4LATA 4LQ5A 1B3FA 1US4A 2QMXA 4H5GA 2PT2A 4R2FA 1SI1A 3H6TA 2ZYNA 2BJJX 3W15C 4ZECA 1A8FA 1Y9UA 3MP1A 4JBZA 2A5TB 4LQ2A 4G4PA 3H06B 1P1NA 1MG1A 5KCJA 2UVJA 4F1VA 2D5WA 3TDJA 3N6TA 3FATA 3QAXA 3V8XB 4H1XA 4JWOA 4KYEA 2GRVA 1B40A 2REGA 4NMYA 1SYHA 3OSQA 3QK6A 3IL1B 2R71A 4G8NA 1TXFA 2V84A 2HFBA 1DTZA 3K4UA 1OLCA 2O51A 3CFXA 1TFDA 2I3WA 4OETA 3KN3A 1MXXA 1YAEA 4N13A 3OO7A 4NWCA 3MPLA 2HQ0A 2VD3A 1B3EA 4R6HA 4KFQA 2PBWA 2XXQA 3H6WA 1EZOA 2XXTA 1MDQA 3MC2A 4G8MA 3FZVA 1T0KA 1O64A 1LGBC 1Y4CA 2AL4A 3L6GA 3ZS6A 2M8CA 1USYH 5FTIA 1MY3A 3IOUA 2HCAA 5H8QA 1VFDA 5ITOA 5H8HB 2XXVA 3FV1A 1DPEA 4GRKA 4YICA 1HSEA 1PC3A 3ZKKA 3U94A 1EH3A 5TU0A 4LUBA 1N3WA 2W7YA 3CFZA 5ICQA 4K3FA 3K6UA 2VHAA 3RNNA 3S9NC 4ELOA 3RQTA 4U21A 3Q28A 3VV5A 2O1LA 3VVDA 1TWYA 1WDNA 3BFTA 3G3JA 2UYFA 3O97A 4FATA 1B2HA 3MVWA 1BKAA 4BDOA 4BDNA 3EHTA 5F7VA 3FVGA 3IJXB 3IK6B 2A5TA 1EZ9A 1BTJA 3FVKA 2O68A 4JXIA 4FEBA 5TP9B 4H8JA 3RLFE 3T66A 1MM6A 2NVUB 3H6VA 1MXUA 2V3TA 2PYYA 1MQJA 3EPEA 4GQOA 3IR1A 4I62A 5EYFA 2O1MA 3IB1A 2F35A 4PFYA 3LSWA 4KD5A 4XKQA 3T9UA 5I56B 3T93B 1LB9A 1O7TA 4E0XA 1FTJA 2XXIA 3WAFA 1UIUA 4ZEKA 1ZTYA 4R75A 3LSLA 3K01A 2XXHA 3B6QA 4L17A 5KZTA 4BDMA 2I0BA 2OJTA 4RPNA 3SKPA 1MY4A 4IO3A 4FE8A 4JWYA 1HSLA 3QSLA 5TPAB 1PB9A 4AB5A 3JYRA 2HAUA 3PUZE 2VGQA 1FQBA 4HTGA 4H6DA 4YKKA 4U23A 3QYTA 4MLVA 1H45A 2H98A 4OEVA 1MQIA 3C31A 5H8HA 3HHFA 3T9VA 1NNKA 1LFGA 4HW8A 3GZGA 3B6WA 1AMFA 4RY1A 3LSFB 2HXWA 3O66A 3H7MA 1XVXA 3RN8A 3OO6A 3C35A 1B5HA 1ANFA 1D9YA 2XXWA 3FXQA 3MP8A 4POWA 3CIJA 2Z23A 4NF8B 4R73A 4KQPA 1H44A 5CMBA 1B3LA 3HN0A 3K1PA 3TEPA 1DTGA 1SW1A 1MPDA 2F7AA 5TP9A 1RYOA 3UORA 3G3KA 4HCYA 2ZNTA 3IOVA 2XHDA 4ZEDA 4LZ8A 1S50A 3RY3A 3A09A 2F36A 5B7DA 3T96B 2UVHA 2Q89A 3DELB 3DP4A 1XC1A 1SYIA 1ELJA 3OO8A 3VVEA 4ZZEA 3Q25A 5CMMA 1ZIUA 4R9GA 5I56A 1DOTA 2DSFA 5IKBA 1Y3PA 4PE5B 4DXUA 1Y4TA 2F97A 5CRYA 4YB5A 3KFMA 3I5OA 4F29A 4GLIA 4U2RA 4UACA 4OERA 1H43A 4ZEIA 3MZ1A 1LAGE 2QS2A 4NF4B 1L5TA 1MXWA 2VOZA 4N07A 1B3HA 1MY2A 2ONSA 4MBPA 3E4RA 1ZKBA 1ZBMA 5TPAA 3FJGA 3RGYA 1CB6A 3TAJA 2B3BA 2YPNA 2O7IA 1FCKA 4I1DA 3SDFA 4OMBA 1VFEA 2DWHA 1WODA 1PEBA 2Y84A 3ZKLA 1SW5A 2I58A 4BDLA 4XKRA 1MXZA 1Y20A 4JSOA 1D4NA 1LB8A 4WEPA 3OSRA 4F31B 2QS1A 5L9SA 1SW2A 3M3LA 3Q29A 3G3IA 5F1QA 1QUJA 1Q35A 4XKNA 1MH4A 3O28A 3IX1A 1B3GA 4U1OA 1Y1MA 2DWAA 3MZ9A 4NF5B 4KI0E 4NF8A 4F3PA 1SVXB 4ZE9A 5BWJA 3TKDA 1FQDA 5AE4A 2FNCA 1LBCA 2OLBA 4FIMA 3FJ7A 3HPIA 3PV0E 3M8UA 5DEXB 3PMXA 4ONYA 1B0LA 4HCWA 2X26A 2A5SA 1RYXA 2G93A 2H4IA 2DP8A 2Q9TA 2XXUA 1GTKA 2DVCA 4GD5A 1XHYA 2ANJA 3VFJA 5I2KB 2OWTA 1DMBA 3N94A 4G68C 4ZZAA 1MRPA 4PFWA 1B51A 3PGFA 4QFNA 3QXMA 1MS7A 4Q0CA 3MVZA 3LSXA 1TT1A 2DQVA 3LUYA 5BUUA 4GL8A 5K2YA 3L6HA 1QJMA 3TQLA 5ELVA 3U93A 1MDP1 2CMOA 3CR9A 4NF4A 2F6GA 1ZJLA 3MQ9A 5AA1A 4F39A 1NL5A 1BLFA 4LZ5A 3OEKA 2I6EA 3T9XB 3IOTA 3G3FA 4GXAA 3RTWB 1NH8A 1FQEA 2Y7WA 1MQHA 3B7DA 1XVYA 3KGCA 4I9DA 1US5A 4OENA 1ATGA 1NNTA 3FXRA 2XD3A 1Y3NA 3E3KA 3R6UA 1VSOA 5CBRA 4M1VA 4LONB 3TCGA 3ONMA 2Q8JA 2OK2A 3FXUA 2UXAA 1B5JA 3WAEA 4GL0A 5JTYB 4ELRA 3EN3A 3PD9A 3E9XA 2R6GE 2CZLA 1ZMGA 1LFHA 1B32A 4NF5A 3B6TA 2P2AA 1MQDA 1M5BA 3SEWA 4U4SA 2AIXA 2GH9A 3KN8A 1A99A 3TCHA 1NMUA 1M5CA 1JW4A 3FASA 4F2OA 3DP6A 1UQWA 3PPQA 4GVOA 5CMCA 3BBRA 4R2BA 5DEXA 5LOMA 4KYDA 1B7ZA 4QFLA 5I59B 4F19A 1P1WA 5ICTA 4M4GA 4EUOA 3UIFA 4R6YA 5I2KA 4LVQA 2QS3A 3A3UA 2FA7A 3RT6B 4KCCA 4MH5A 2OBGA 3VLVA 3MUQA 3Q27A 1S9TA 3EHUA 2F6PA 1URSA 3H6UA 3U8QA 4YMAA 1B05A 4KYSA 1YTVA 1JEUA 3U1OA 1DSNA 1PDAA 2AL5A 5L9OA 1JEVA 4JDFA 3TYHA 4DCXA 2B65A 4AB6A 4BDRA 2Y7RA 4ZEFA 1NNFA 3VXCA 2I0CA 3S9MC 4RXLA 4EF2A 3CG3A 3LC8A 2QSXA 3EF7A 4XIGQ 5FHMA 1PBPA 1XT8A 1FTKA 1BIYA 2NWJA 1OMPA 4XXUA 5HM4B 3TTKA 1AOVA 1O63A 2D21A 4RA1A 3PMVA 1EU8A 3K6VA 4UA8A 2H99A 4C0RA 1B1HA 4LZ7A 3TTRA 4OQOA 3PPPA 3BKIB 1EZPA 3E13X 2XXXA 1N76A 2DYXA 3C4MA 1N84A 2Y7IA 2UVGA 2VP1A 5JTYA 3K0VA 3PUWE 1LCFA 3M3FA 3H4ZA 1SW4A 3K6XA 1JVYA 4IY6A 3N5LA 3MJNA 2V3UA 4QF9A 4YAHX 1R9QA 4F18A 4OXVA 3TMGA 1I6BA 5AA2B 1Y1ZA 3KZGA 4EF1A 4H8IA 1JW1A 3ECRA 1R1NA 3PUXE 5I59A 3MVYA 1S7YA 4KR5A 1URGA 1SQYA 3TTLA 3LR1A 1LAHE 3RUMA 3PUVE 5HBCA 2I3VA 4RK2A 2DWJA 1A8EA 1Q1KA 4G68B 1IXIA 2I4CA 2X7QA 3MW0A 1QUIA 3OOAA 4R74A 1AIVA 3K2DA 3RPWA 3O6GA 4F22A 2REJA 1CE2A 2WKYA 3T9HB 4X1DA 1B9JA 1N7WA 4OWDA 3DLNA 4OEUA 2OWSA 1LSTA 3O2AA 1FTOA 4IO2A 2KLFA 1P1QA 4WEDA 2DOJA 3CSGA 3W9VA 3O6IA 3G3GA 1OLAA 1MXVA 1B6HA 3VXBA 3FUZA 4PQJA 2XXYA 1F9BA 2PX1A 5HPQA 4PETA 2DE4A 1BP5A 1QUKA 3OELA 4TLMB 3QUFA 4H5FA 1A40A 3JZJA 3O6HA 4IO6A 4R9FA 4O3AA 1VE4A 4YKJA 3S9EA 5EHMA 2DWIA 4P0IA 4OVJA 5M2VA 2V25A 1PB7A 3UP9A 3IB2A 3TTMA 3A3CA 4P11A 4MFIA 1MY1A 1SBPA 3N6UA 5AA2A 2YJPA 4R6KA 5AA4B 1JW5A 1J1NA 4IO5A 5K2XA 1AH5A 3IO4A 3HCQA 1Y3QA 1YPNA 4YB6A 2DS9A 2RF1A 4POXA 5KDTB 2P0SA 1IIWA 3KG2A 3QIMA 4NTLA 4G68A 4RYAA 3K00A 3I6VA 3MP6A 5H8NB 2THIA 3FIRA 3PPOA 2ZYOA 3U72A 2DXRA 4QFKA 2ZNUA 4O3BA 1JNFA 1Z7ME 4RJZA 3OXNA 1YCJA 2QMWA 2Z8FA 1IUDA 1MPCA 1B4ZA 3C32A 3UGWA 1QVSA 1IXGA 5KCJB 3U92A 3PMWA 2G29A 1R9LA 3MPKA 1AL3A 2E1SA 4ZE8A 5AA2D 4YB7A 4NF6B 1P99A 3HO7A 2RKMA 3TZAA 2O7UA 2O84X 4H65A 4NWDA 3RTFB 3M3KA 1A7LA 5JEIA 2RINA 1Z7NE 5L9MA 1IZ1A 2H25A 4MLQA 3USDA 3IB0A 2X7PA 4QFOA 1SI0A 1R6ZA 1I6AA 4OESA 5CM6A 1MH3A 1IITA 4GXSB 1I69A 4PFUA 4F1UA 3OMBA 3TUSA 3HV1A 3CVGA 4ZEBA 1B0HA 1B52A 1FQFA 3FD3A 1RKMA 5H8FB 2LAOA 4H0WA 3I3VA 2ZNSA 2H9BA 3PPNA 2QL3A 4RNSA 5H8SA 1B1XA 5CMKA 1GV8A 4GIZA 4F3BA 5FHOA 4XKPA 1P1OA 3DM0A 4FORA 4ZDMA 1FQAA 5AA4A 3GBBA 4Z7EA 4ECFA 3SEVA 4QRZA 1GR2A 4LP2B 4EDPA 3K6WA 1PB8A 3KEIA 3FVNA 3OENA 4OFJA 2XX7A 3MBPA 1UTBB 2RCAA 4EXLA 3VLWA 4PFTA 1LFIA 5H8NA 3V89B 2UVIA 1KWHA 1DPPA 4YMBA 5I57B 2AYSA 2E0SA 4IY5A 1I6QA 1MXYA 1OQGA 1B4HA 1IEJA 4OTEA 2F34A 2RC8A 1II5A 1VR5A 4TOZA 4ISUA 4Q8RA 4ND9A 4NF6A 4C1UA 4QHQA 1N3XA 2V93A 2ZYKA 4F3SA 1JVXA 2RC9A 2HZLA 3AXFA 2ONKE 1B7UA 3QUJA 2PT1A 1LCTA 3KOSA 5DT6A 3G3HA 3KN7A 5J1DA 1GGGA 1FTLA 4X9TA 4RPOA 2DXYA 3KJTA 1LLSA 1H76A 2QPQA 3VE1B 1UTHB 1ZLQA 4OFLA 1IQ7A 2IEEA 3CI8A 5H8FA 1A55A 2QS4A 1IXHA 3OD7A 4YKIA 4G77A 4JSDA 4JWXA 3UK4A 3KJ7A 1OQHA 2F5XA 4IB2A 1B5IA 3S2VA 1B7HA 4U4XA 1MQGA 4N6PA 3TCFA 1NKXA 5B70A 3G7WA 4FECA 1A54A 4PP0A 4DZ1A 3KOTA 3CSBA 3HHGA 3KBRA 1OIBA 2Z8DA 3FV2A 4MF3A 4FAJA 5I58B 1UTBA 5DVJA 2F7CA 1M5FA 2F78A 2PMSA 2DVZA 4DE8A 5I57A 1M5EA 2Z22A 5IAIA 4FEDA 3SEUA 1FW0A 1N0TA 5DYHA 2Q2CA 2Z8EA 3V83A 4Q30B 1NFTA 1N7XA 2H5YA 2HZKA 1POY1 5DVIA 3H3GA 4EQ7A 3VLUA 4AQ4A 4E0WA 1ZU0A 1POTA 2XXRA 1N04A 2B3FA 5DTBA 3SEXA 3Q26A 5I84A 1LAFE 3SETA 2VD2A 3C36A 4QSDA 1QKAA 2OZZA 1UIVA 4HS7A 4WKMA 3VDFA 3P7IA 2V3QA 3CRBA 3LBSA 4GF8A 2XX9A 1NNPA 2QRYA 4IO7A 4BLAA 1UTHA 4OZ9A 5I2NB 3OO9A 4DXBA 1SD3A 4KCDA 3F11A 2ALUA 5CC2A 5EHSA 3D4GA 4I8CA 2O69A 3GXAA 3K1MA 5JK4A 5FHNA 2I4BA 4FJPA 1HSJA 2NXOA 4X48A 2QJEA 3PUYE 3JV9A 4ELQA 2F8DA 3GBAA 4QFPA 3PD8A 2R9JA 2RCBA 4IO4A 4RK9A 3H03A 3CG1A 4TLLB 2OCUA 5I58A 3TODA 2Y7KA 3MAMA 4DXCA 1FTMA 1P1UA 1XOCA 3R7XA 4Q5TA 2IA4A 3FVOA 1D3KA 4IGTA 1JETA 4G8HA 3TQWA 4ELPA 4F1YA 3HSTA 3TFLA 2D3IA 2ZYMA 4TQUQ 4GFRA 2I48A 3S9LC 2Q2AA 1D9VA 2ESNA 2ZXTA 5FTHA 4U22A 1SDXA 2P1SA 1PBQA 1WVJA 3D4CA 4JB7A 3BFUA 5A5XB 2ONRA 4ZS9A 2YLNA 3FGSA 3C34A 3RT8A 4U1ZA 4P0GA 4G2ZA 3VVFA 2F7BA 4OHNA 1OVBA 4OFOA 2I49A 3N26A 4GWOA 3IAZA 3TELA 3T22A 2FYIA 3EHSA 5I2NA 4ESXA 5ISUA 5AA3A 4XTCQ 3MVXA 3SEYA 1XS5A 3MWBA 5CBSA 1QW0A 3IOWA 4NEDA 3O29A 2HAVA 3K02A 2GFEA 3ILUB 2DE3A 4DCYA 5DVFA 3THIA 1LBBA 2GHAA 3ZSFA 1OVTA 2ZMBA 3ODBA 2Y7PA 4EQBA 1B46A 4NE4A 3KSXA 3GLBA 5CI5A 3UN6A 3C33A 4BDQA 4Z0IA 1MPBA 2RC7A 1NH7A 1JQFA 4H67A 4YU0A 4ESWA 4KHZE 3SERA 3IORA 1GVCA 3TTNA 2O6AA 4DDDA 5L8DA 1MM7A 4WXJA 2PVUA 4LA9A 4QSEA 3TPAA 2NOOA 3UA8A 1FQCA 1LAXA 4IGRA 4EXKA 4F2QA 3K1NA 4OYVA 3IJOB 4DLDA 4F3GA 4DIGA 2UYEA 1MY0A 3FJMA 3R26A 3PPRA 4QSCA 3V5AA 4X1BA 3CFLA 1URDA 1TFAA 2XD2A 4GOTA 4THIA 3W9WA 4KPTA 2NUVA 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ET6A 2Q88A 2HEUA 3C9HA 2FIEA 4NX1A 3IO6A 5A5XA 4YKPA 4AS5A 5ITPA 4EQ9A 3PU5A 3DP8A 2VPOA 1IMCA 2GHBA 2ZZWA 5H8QB 1YZ0A 2ABHA 4HXVA 2XXPA 4YZZA 3SESA 1QKBA 1LEVA 1QULA 4X8RA 3S4UA 3IFCA 2XWIA 1B58A 3MZBA 3EQ1A 3KSJA 3O9PA 1M5DA 3ILTB 1IXCA 5KDTA 2DE2A 4O3CA 4R72A 4C1TA 1H3DA 2XX8A 3OEMA 4LATA 4LQ5A 1B3FA 1US4A 4QXDA 2QMXA 4H5GA 2PT2A 4R2FA 1SI1A 3H6TA 2ZYNA 2BJJX 3NOHA 1FBEA 1SPIA 3W15C 4ZECA 1YYZA 1A8FA 1Y9UA 3MP1A 2GQ1A 4JBZA 2A5TB 4OANA 4LQ2A 4G4PA 3H06B 1P1NA 1MG1A 1IMDA 5KCJA 1FBCA 2UVJA 4F1VA 4GWWA 2D5WA 3TDJA 3N6TA 4P3LA 3FATA 3QAXA 3V8XB 4H1XA 4JWOA 4KYEA 2GRVA 1B40A 2REGA 4NMYA 1SYHA 3OSQA 3QK6A 1Q9DA 3HFUA 5I3SA 3IL1B 2R71A 4G8NA 1TXFA 2V84A 2HFBA 1DTZA 3K4UA 1OLCA 2O51A 3CFXA 1TFDA 2I3WA 4OETA 3KN3A 1MXXA 1YAEA 4N13A 3OO7A 4NWCA 3MPLA 2HQ0A 2VD3A 1CNQA 1B3EA 4R6HA 4KFQA 4GX3A 4O7IA 2FVZA 2PBWA 2XXQA 3H6WA 1EZOA 2XXTA 1MDQA 1G0IA 3MC2A 2HPGA 3FZVA 4G8MA 5LDZA 1T0KA 1LBVA 1O64A 1LGBC 1Y4CA 2AL4A 3L6GA 3ZS6A 4PDDA 2M8CA 1USYH 5FTIA 1MY3A 3IOUA 2HCAA 4PFRA 1VFDA 5H8QA 5ITOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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