3K6VA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in citrate-bound open form
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
total genus 107
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA02
4KR5A 5F1QA 1MXZA 3IO6A 2GRVA 1EH3A 4LZ5A 4RA1A 3O6GA 3PUYE 4PFYA 3PPNA 3CFXA 1D9YA 1MXUA 1MDQA 1B5IA 4HCWA 1TFDA 2I0BA 1IIWA 1POY1 2UVHA 3FVNA 2RKMA 5ICQA 1XT8A 5H8QB 2ZXTA 3DP8A 3KN7A 1MM7A 2XXHA 1B46A 3EF7A 4IO6A 3MP1A 4Z7EA 3G7WA 5ICTA 4ELPA 4RYAA 2KLFA 4M4GA 3IAZA 3UGWA 2DP8A 3Q27A 2VHAA 3H4ZA 3WAFA 2DE2A 1NH7A 3HO7A 4YMAA 2PT2A 2XHDA 2NUVA 3PUWE 2OLBA 4LONB 3RGYA 4OQOA 3SEWA 4GL0A 4JSDA 1DSNA 5H8QA 5AA3A 5KCJB 3B6WA 3H7MA 4DXBA 1PB7A 4U1OA 3IOUA 2VP1A 4X9TA 4F1YA 1B5HA 1BTJA 2PT1A 1BKAA 3OO8A 4F1VA 2QMWA 3QIMA 2Q8JA 1NNTA 1HSEA 2H98A 2Y7RA 2E1SA 3DLNA 2I58A 3Q26A 1EZOA 1LFGA 1D4NA 3LUYA 5KCJA 4N6PA 2I4CA 4KHZE 4R6HA 4QRZA 1N76A 3U92A 1AL3A 1QKBA 4F18A 4GRKA 5CMMA 3TCFA 1FW0A 3C34A 5I58B 5I57B 2ABHA 4R75A 4ELRA 3W9WA 4O3AA 4ZEFA 5J1DA 5K2YA 3F11A 4F3PA 5DVIA 5EHMA 1DPEA 3TFLA 2QMXA 2REJA 1URSA 1A8FA 2Z22A 4LVQA 4KPTA 4YB7A 1A99A 4IB2A 1SD3A 3RPWA 2F7AA 3PD9A 4KCDA 2Q88A 3GBAA 3JYRA 3S2VA 3DP4A 1MQDA 4IO3A 5I58A 2IA4A 5I57A 3TKDA 1VFEA 3LSWA 4DE8A 3S4UA 3R7XA 2PX1A 2M8CA 2Y7PA 4R2FA 4LA9A 3IB2A 1GVCA 3TMGA 4EF1A 2Y7KA 4MFIA 3TEPA 3TODA 2XD3A 3KGCA 2P0SA 4ZDMA 3K6UA 4YU0A 3U8QA 1B1XA 3T66A 1FTJA 4MLVA 4ELOA 4X1BA 2RC7A 3E4RA 3FUZA 3V89B 3VLVA 5JK4A 1MY2A 5CRYA 3SKPA 2ONRA 4O3CA 1H76A 2UVIA 3SEYA 3FV1A 2AL4A 4KQPA 1YPNA 2UVJA 2F78A 1I6AA 4OENA 1XC1A 4FECA 4EUOA 2ONKE 1GR2A 3IR1A 3VXCA 2DE3A 5IKBA 1UIUA 5L9MA 3ILTB 4QHQA 3C35A 5JTYB 3C31A 3T96B 2CZLA 2X7QA 4FORA 4QFKA 2ONSA 5H8HB 1PB9A 1MY3A 3H6WA 1Q1KA 3KBRA 4U22A 3OOAA 2UYEA 2QRYA 4TLLB 1P1WA 4KYEA 3OELA 2XXRA 3DP6A 3FASA 3E13X 3MVXA 3PPPA 2DXYA 4EF2A 1NL5A 1FQAA 1EZPA 3PV0E 5JTYA 3K4UA 2DYXA 1SI0A 3VXBA 1UTBA 4ZS9A 3FJMA 4G68C 5H8HA 3A3UA 1ZLQA 5ITOA 4POWA 1OLCA 3KOSA 5BUUA 1US5A 1NNPA 3QSLA 4OETA 4H67A 1PBQA 1MQJA 2DQVA 4XKNA 2XXVA 3O28A 4NE4A 3KSJA 4NF8A 2O84X 5AA2B 2FA7A 5AE4A 2RF1A 3EQ1A 1S50A 1WDNA 5FHNA 2R6GE 4RY1A 4I8CA 3SEUA 2VD2A 4ND9A 4LQ5A 4C0RA 2O7IA 3RT6B 1USYH 3QAXA 3MVWA 4I62A 4YKJA 1AH5A 3OEMA 2XXPA 1MS7A 5AA2A 5FHMA 4ESXA 4Q5TA 4QFOA 4EQBA 4ZE9A 1LCTA 4DDDA 4RK2A 2B65A 1XVYA 4ONYA 4PP0A 3TZAA 1H3DA 4QFPA 1LAHE 1XS5A 3I5OA 4I1DA 4F2QA 1RYOA 4O3BA 1OQGA 4OFLA 2XD2A 5H8SA 1ZJLA 3OEKA 4F1UA 4JWOA 3MC2A 3I3VA 3O9PA 1L5TA 3D4GA 4H8JA 3FJGA 3PPQA 3VLUA 4C1UA 2XXXA 1SW5A 5CMBA 3T93B 3S9NC 2QSXA 3VV5A 2FYIA 3HV1A 4ZEKA 2HCAA 4XKRA 3PU5A 4ELQA 3IO4A 1N3XA 4GWOA 1KWHA 4NF6B 3OSRA 1JW4A 3K00A 3V83A 2GHBA 5L9SA 3T9UA 2F34A 1URDA 3MZ1A 1MXWA 2A5TA 1O64A 1DOTA 1SW4A 4ZZAA 4LZ8A 2ANJA 4U1ZA 3LSXA 1M5EA 1OQHA 3LBSA 2F35A 3TTNA 3PUVE 1JVXA 1MY0A 2B3FA 4P0GA 4XTCQ 2F6PA 3O29A 4NF6A 1ZMGA 5CC2A 3N6TA 4QFNA 1FTKA 1P1QA 3Q29A 2DWIA 5TP9B 4WEPA 2XXTA 4IO5A 4IGRA 1N3WA 4BDMA 3TAJA 1FCKA 4ZEDA 2UXAA 2B3BA 5I2NB 1B4ZA 5AA4B 3OO7A 1NNKA 1BIYA 2AIXA 2F7BA 4JDFA 1VSOA 1B4HA 1ZIUA 3UP9A 2Z8DA 4IO2A 5TP9A 3TPAA 3CR9A 3ECRA 4PETA 3PPRA 3PMVA 4E0WA 3SESA 3SERA 3K6WA 3ILUB 1WODA 5I2NA 1SVXB 3QYTA 2A5SA 5AA4A 5KDTB 3VFJA 3WAEA 4OTEA 3FGSA 4GXAA 3GBBA 3TYHA 2NOOA 2Q9TA 3ODBA 4N13A 3FXUA 2OWTA 4F19A 4N07A 2UYFA 1MM6A 1Y4TA 4OERA 3N94A 2QS3A 3BFTA 5KDTA 3TTRA 2V84A 3C33A 4G2ZA 4U2RA 2Z23A 2I49A 1URGA 2XXUA 3IJXB 3RTWB 3TUSA 2Y84A 1OLAA 4F31B 3ZKKA 3CFLA 3PD8A 4EXLA 4LUBA 1B9JA 2R71A 3MP6A 4YMBA 1IXGA 2V93A 5FTHA 2O7UA 4EDPA 4R9FA 2NVUB 1A8EA 5B70A 1HSJA 3OXNA 1LB8A 4U21A 1MXXA 3TQWA 3OMBA 3SEXA 1USYE 3KN3A 2Z8FA 1R9LA 3O66A 5I84A 3GZGA 3EHUA 4TOZA 1MH3A 1MXYA 1UIVA 3IOTA 2HXWA 5M2VA 4R2BA 3USDA 1EU8A 1P1OA 2QL3A 4QSEA 1M5BA 3T9VA 4Q0CA 4ZZEA 2H9BA 2D21A 3KEIA 2IEEA 1PB8A 3T22A 4LATA 4BDOA 2O68A 4H6DA 5CMCA 2D3IA 2DS9A 1MG1A 1UTHB 2Z8EA 4OZ9A 4L17A 1JEVA 4BDRA 2WKYA 2QPQA 2QS2A 1B05A 2OBGA 4FEBA 1IXCA 3RT8A 3IK6B 3A3CA 1VE4A 1FQEA 1SW2A 1YCJA 2X7PA 1BLFA 2ALUA 1M5CA 2RC8A 2YPNA 3N6UA 1UTHA 3V8XB 2I48A 3M3LA 4KYSA 5CMKA 2F6GA 2I0CA 1B58A 1IITA 1QULA 5L8DA 4GLIA 1MDP1 1IQ7A 3RTFB 1NKXA 2HAVA 5JEIA 5TPAB 2CMOA 1S7YA 3CRBA 4YKPA 1B7HA 1B2HA 1LGBC 1M5DA 5I59B 3VVEA 4THIA 1HSLA 4GOTA 3R26A 2O51A 1LAXA 2YJPA 4OFOA 4DXCA 3EPEA 1LBBA 4NEDA 1FTLA 3K01A 4R72A 3MZBA 4M1VA 1UTBB 4RPOA 3UK4A 5TPAA 1QUIA 4HW8A 5DVJA 4FAJA 2PVUA 3TTMA 2Q89A 5ELVA 2ZYKA 2W7YA 5B7DA 3OD7A 3RNNA 5I59A 3C4MA 1DMBA 4MH5A 1MPDA 3IL1B 2DOJA 5CM6A 3B6QA 4NF8B 3THIA 4GL8A 1O63A 3K02A 3VVDA 2G29A 4RNSA 5IAIA 5I56B 5H8NB 1B40A 1QUKA 4YICA 2V3QA 1DTGA 3FZVA 3C9HA 1AMFA 2THIA 2F8DA 1B32A 3PGFA 1B6HA 3S9MC 5TU0A 4H65A 4LQ2A 1Y1ZA 3CG3A 3CSBA 1GTKA 5H8FB 3B6TA 4PQJA 2DVCA 4OYVA 2E0SA 3R6UA 4IO4A 4JBZA 4FEDA 1B3LA 2AYSA 4IY5A 1B7ZA 3TQLA 5I56A 4R74A 2QJEA 1NMUA 4R6KA 4YAHX 5H8NA 3OENA 3AXFA 3IB1A 4OVJA 4K3FA 5HM4B 1H44A 1LLSA 3IJOB 5DEXB 4POXA 4BLAA 1ANFA 3FJ7A 4LP2B 1JEUA 3SEVA 1MY4A 5H8FA 3UA8A 1MQIA 2VGQA 5I2KB 4KYDA 2I4BA 4KD5A 3MPKA 2O1MA 1IEJA 4NF4B 4ZE8A 3HSTA 3K1PA 3L6GA 1JQFA 1VFDA 4TQUQ 5DEXA 3ONMA 3K6XA 4PFUA 4DZ1A 2A5TB 1SYHA 1JETA 3G3HA 4PFTA 2DWHA 2V3UA 3LC8A 3A09A 4AQ4A 5I2KA 4NTLA 1NNFA 2XX8A 2Q2CA 3H6UA 4UACA 4NF4A 3MZ9A 4AB6A 1Z7NE 4WKMA 1PDAA 1OMPA 1B3GA 2BJJX 4JSOA 3RUMA 3SDFA 4R6YA 4QSDA 4P11A 4LZ7A 4H1XA 1LSTA 2HFBA 3KZGA 3KJ7A 2NWJA 2I6EA 1OIBA 2D5WA 4XIGQ 4DLDA 2Y7WA 5L9OA 4ZEBA 2ZNTA 1EZ9A 2VOZA 2Y7IA 5HBCA 3CFZA 3U1OA 3S9EA 1B7UA 4QF9A 1FQBA 1LFHA 2XX7A 2AL5A 3OO9A 1SQYA 3HHFA 3MWBA 3FXRA 5A5XB 4F3SA 4H5FA 4E0XA 2OWSA 2DWAA 4XKQA 3PMWA 2NXOA 1I69A 3UIFA 1R6ZA 3O2AA 1IXIA 1A55A 4WEDA 3QK6A 4H8IA 1QVSA 3EHSA 4OXVA 3OO6A 2OJTA 5A5XA 3BBRA 3I6VA 4Z0IA 4JWYA 2VD3A 1LB9A 2ZYMA 1WVJA 3PUXE 1BP5A 3K0VA 3FATA 4OMBA 3IOVA 3FV2A 3MW0A 3BFUA 1SYIA 4EQ9A 4KFQA 1XVXA 4DCXA 1S9TA 4G68B 5CI5A 3HN0A 1XHYA 2GH9A 3FXQA 1II5A 3H06B 4P0IA 1QJMA 1QUJA 4GD5A 4YB6A 3LSFB 4X48A 5DT6A 1SBPA 2I3VA 5CBSA 3Q28A 2ZNSA 2ZNUA 4HCYA 1A7LA 3ZS6A 4RJZA 3LR1A 2XXQA 4G68A 1ZTYA 4JWXA 1D3KA 1Y4CA 3TTLA 1B5JA 4GQOA 4NWCA 1LAGE 5FHOA 4IY6A 4G8NA 1Z7ME 3HHGA 5F7VA 1Y9UA 4OWDA 1GGGA 3IORA 2RCAA 4JB7A 2I3WA 3U93A 4X1DA 1Y1MA 3RLFE 4FATA 4DXUA 4IGTA 4XKPA 3FVGA 3SETA 1PBPA 4AB5A 1FTOA 1B52A 3KJTA 4F39A 2ZYNA 2UVGA 3TCGA 3MVYA 1JW1A 1Y3PA 2ESNA 3HCQA 1B1HA 1MXVA 3CSGA 4I9DA 3OSQA 3CG1A 4YB5A 2F36A 3Q25A 3ZSFA 2OCUA 1JVYA 3GLBA 1XOCA 4QFLA 4NMYA 3UN6A 4OEVA 1N0TA 5FTIA 1IUDA 3QXMA 1LCFA 4YZZA 2ZMBA 3O6HA 1FQDA 1O7TA 4U4SA 4G77A 4G8HA 1Q35A 2F97A 2Q2AA 3IX1A 4F22A 1B0HA 1A40A 1YAEA 4FE8A 2H5YA 3KOTA 2XXIA 3TTKA 3QUFA 3M3KA 2O69A 1UQWA 1CE2A 2RINA 1B51A 1B3EA 3EHTA 1F9BA 5DTBA 3W9VA 3CVGA 3JZJA 1Y3QA 5K2XA 3MBPA 3MUQA 1US4A 1H43A 1OVTA 1MPCA 3H03A 4GXSB 4TLMB 3ZKLA 1JNFA 2RCBA 2F5XA 3BKIB 4RK9A 4YKIA 4Q8RA 3LSLA 4ZECA 3S9LC 5EYFA 3B7DA 2RC9A 4PFWA 4ESWA 4MLQA 5AA2D 4GF8A 1N04A 1NH8A 4BDNA 5ISUA 3RQTA 4KI0E 3VDFA 4H0WA 1SI1A 3TDJA 1FQFA 3C36A 1YTVA 4RPNA 3H6TA 3T9XB 3P7IA 1QW0A 1LBCA 2H4IA 5LOMA 5BWJA 4UA8A 3G3FA 3N5LA 4YKKA 3TELA 1SDXA 3N26A 4MF3A 4GFRA 1SW1A 1POTA 1CB6A 3EN3A 2HQ0A 3W15C 5DYHA 1TT1A 2V3TA 3CI8A 2X26A 4EQ7A 2GHAA 1I6BA 3RN8A 2QS4A 1RYXA 1QKAA 3VE1B 3U72A 1P99A 4OEUA 5KZTA 2HEUA 3MP8A 5DVFA 4R73A 3G3JA 2P2AA 1MY1A 3L6HA 3M8UA 2F7CA 2PBWA 3D4CA 1MRPA 3KSXA 1NFTA 3O97A 4U4XA 4BDQA 4IO7A 4NF5B 4F3GA 2OZZA 2DWJA 3H6VA 3IB0A 2V25A 3PMXA 1LFIA 3QUJA 5AA1A 1B0LA 4ISUA 3DM0A 4PE5B 1N84A 4OFJA 4HS7A 1I6QA 1JW5A 3VLWA 4U23A 1DPPA 4WXJA 2H25A 2PMSA 3KG2A 4ECFA 1ELJA 3FD3A 3RY3A 4FIMA 4BDLA 1ATGA 3G3KA 2OK2A 4DIGA 2G93A 3PUZE 1RKMA 4NF5A 5EHSA 4G4PA 1VR5A 2LAOA 4MBPA 3MQ9A 2XX9A 4QSCA 4GVOA 1B3FA 4KCCA 4OHNA 4XXUA 1H45A 3HPIA 3UORA 3H3GA 2DVZA 4G8MA 2HZKA 3MAMA 3K6VA 3MPLA 3O6IA 4JXIA 4ZEIA 1FTMA 1FQCA 5ITPA 3MJNA 4OESA 1MQHA 2GFEA 1IXHA 2PYYA 2REGA 1P1UA 3E9XA 3JV9A 2DSFA 4HTGA 3M3FA 3K2DA 3IOWA 4Q30B 1MQGA 2P1SA 3G3GA 1PEBA 2XXYA 3TCHA 3G3IA 1N7XA 4C1TA 4GIZA 3T9HB 1P1NA 3V5AA 1A54A 1TXFA 4EXKA 2ZYOA 1IZ1A 1ZKBA 3FVOA 3K1MA 4DCYA 3VVFA 4RXLA 1MPBA 1DTZA 4H5GA 3FVKA 2O6AA 1M5FA 3KN8A 5CBRA 1D9VA 1B3HA 1PC3A 1Y20A 3K1NA 1LAFE 3KFMA 3GXAA 1R1NA 5HPQA 1N7WA 3U94A 1ZBMA 1J1NA 1TWYA 2YLNA 3PPOA 2O1LA 1Y3NA 2HZLA 2R9JA 2DXRA 1MH4A 4NWDA 2QS1A 1AOVA 3DELB 2FNCA 3E3KA 1R9QA 1OVBA 3MVZA 2XXWA 1AIVA 1TFAA 4R9GA 1T0KA 3CIJA 3FIRA 3C32A 4F3BA 4F2OA 1ZU0A 2DE4A 1GV8A 2H99A 4F29A 2HAUA 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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