3K6VA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in citrate-bound open form
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Methanosarcina acetivorans
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
total genus 107
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA02
4NF4B 1YCJA 2O68A 4NF8B 3TTMA 5EHMA 1Y1MA 4U23A 4UACA 1VFDA 2XXYA 1GR2A 1JW1A 3PMWA 4ZE8A 5KCJB 4O3AA 3F11A 2DE4A 2F34A 4RXLA 4FECA 5CI5A 2E1SA 4KYEA 5DT6A 3K1PA 3EHUA 2QRYA 4O3CA 2F6PA 3IJXB 1N3WA 1UIVA 2P0SA 2R9JA 4GOTA 2ONKE 3CFZA 3FVKA 2XX7A 3K1MA 1HSLA 5JTYB 3TFLA 1ZTYA 3PPPA 2V3UA 3FXRA 1B2HA 3SETA 5M2VA 1GV8A 3S2VA 2IEEA 1DPEA 3MAMA 4KFQA 2OWTA 3KGCA 3M3FA 1A55A 3DP6A 4YZZA 1B3GA 4QHQA 4Z0IA 1QUJA 1H45A 4IGTA 4UA8A 4R75A 4ZEBA 3FJ7A 4F2OA 1FTKA 1Y3NA 4MLVA 3ILUB 3PUYE 2B3BA 1A54A 4G8MA 1RKMA 4F3BA 1XT8A 3MBPA 1A7LA 2Y7KA 3VLVA 1DMBA 3W15C 1UTBB 4ZS9A 1B5JA 1B51A 5I57A 3G3GA 3SEVA 2FYIA 3HPIA 4DXBA 5ITOA 4M1VA 1B0LA 1BTJA 2H5YA 3IK6B 3V5AA 2WKYA 1VSOA 5AA1A 1N0TA 3CSGA 2GH9A 4U4SA 4YB7A 3T9XB 3MVZA 3HCQA 3IORA 4IB2A 3K01A 3PU5A 3MQ9A 1H76A 1P99A 4I1DA 3OD7A 3TELA 4EF2A 1MH3A 3CG1A 4MF3A 3MWBA 1B05A 2I49A 3I5OA 5KZTA 4NF5A 3FV2A 4POXA 4Q30B 4F19A 3C33A 5H8NA 4FEDA 2NXOA 3TUSA 4DDDA 1MXVA 3RTWB 3K00A 5ELVA 1Z7ME 2V3QA 4OESA 4IGRA 3RUMA 2F5XA 3HV1A 2AL4A 4K3FA 4OMBA 4BDOA 3L6GA 2RF1A 3TTRA 4JB7A 2FA7A 4GRKA 1I6BA 1IEJA 2DXYA 4GWOA 4YMAA 3OO7A 5CMMA 3GBAA 3USDA 4N07A 2VP1A 1LFGA 4EQBA 1FQEA 3E3KA 3T9VA 3QYTA 1ZLQA 1SW4A 3FJGA 3PPRA 2A5TB 2GRVA 3PUWE 2HXWA 3B7DA 3L6HA 1Q1KA 3M3LA 2V25A 2UVHA 3RQTA 2ZYKA 4YKPA 5AA3A 1SW1A 3E4RA 3UORA 3CR9A 1ZKBA 2PBWA 1JW5A 1SVXB 5ICQA 1OIBA 3KSXA 3KBRA 3S9EA 4FORA 5L8DA 3B6QA 2HAVA 1PBQA 4ELOA 4QSDA 3WAFA 5AA4B 1EZOA 5J1DA 3LR1A 4JWOA 4KPTA 2O6AA 3DLNA 2NVUB 4PFWA 3VXBA 5I2KA 1MQDA 1B46A 2Q9TA 3C35A 1YAEA 4QFPA 2UVJA 2H98A 4P0GA 3Q27A 1PB7A 1FTLA 1TT1A 2Q8JA 3M3KA 3D4CA 3VVFA 5FHNA 5CC2A 1N04A 3RTFB 3EN3A 1TWYA 1TXFA 2Q2CA 3O28A 3RNNA 3MVYA 2H99A 3TMGA 2W7YA 1MXWA 2VGQA 3O9PA 4XKQA 2HAUA 3UIFA 3G3KA 1JNFA 2XX8A 1Z7NE 1FTMA 2HFBA 1B4HA 2NUVA 5TP9A 3A09A 4ZEIA 3KN7A 3SEYA 4G68B 2O69A 3SEXA 3OSQA 4DIGA 3ZS6A 3ONMA 3TQLA 2Y7PA 2E0SA 2F36A 4F31B 3H03A 4ZE9A 1SW2A 2F7BA 2QS4A 4RNSA 1DSNA 4JSDA 3JZJA 1XVXA 3PPOA 3FVNA 3BKIB 4OYVA 5DVFA 3MUQA 1B3LA 3B6TA 2G93A 3RT6B 4LZ7A 5DTBA 4NE4A 3PD9A 3KN3A 2Z22A 1PEBA 1IUDA 1AH5A 1N76A 1ZIUA 3IJOB 3VFJA 3ZSFA 4C1TA 1LAGE 3T96B 1BKAA 3KN8A 1UTHB 2CZLA 3T93B 4R2FA 4F1VA 2NOOA 2ONRA 1ANFA 3K2DA 2AL5A 3TCHA 1D3KA 3SERA 3GZGA 3K1NA 2XD3A 1B5IA 3IO6A 3IOUA 2ZNSA 3O66A 3U8QA 4XKRA 1LB9A 4NWCA 3S9MC 1P1QA 4NF5B 3K6UA 1P1OA 3AXFA 3TQWA 3K4UA 1DTZA 1LFIA 5I58A 4DCXA 3MW0A 3VLWA 2I48A 3PPNA 4N13A 3FXQA 4TOZA 3ILTB 3C34A 1ZU0A 1D9YA 1IXGA 3H3GA 4U21A 3GBBA 3PPQA 2ZXTA 1MQJA 1B32A 2OCUA 3KFMA 4PE5B 5TPAB 2Z8EA 4PFUA 1JEUA 4YKIA 4AQ4A 1AIVA 4FAJA 4MFIA 1WVJA 1M5EA 3KJTA 3OXNA 1LAXA 2XX9A 2F78A 3QAXA 4GF8A 4H8IA 1MS7A 5IAIA 1FCKA 3P7IA 5B7DA 4GLIA 3QSLA 3IAZA 5A5XA 5L9MA 3LC8A 4U2RA 3V83A 4YAHX 1L5TA 4IO7A 4OTEA 3UGWA 3I3VA 4HCWA 4OERA 3GXAA 5CMCA 2G29A 1M5BA 2DE2A 3G3IA 4ZEDA 2RKMA 4R9GA 2RC8A 4H0WA 2QMWA 5EYFA 3UP9A 2NWJA 2D3IA 3TEPA 2F6GA 5I2KB 4TLMB 3TCFA 2QS2A 4ZZEA 4KR5A 4Q8RA 5H8FB 3QUFA 3IX1A 4I8CA 2ALUA 3LSFB 3T9UA 5FTIA 1B40A 1FQCA 3KEIA 3TZAA 2DS9A 4R73A 3SEWA 2QL3A 5CM6A 1A8FA 2DE3A 4XXUA 5I59B 1LLSA 3MPKA 4X1BA 1AL3A 3D4GA 1II5A 4H8JA 4NWDA 5K2XA 2KLFA 4H65A 3N5LA 4XKNA 4NEDA 4TQUQ 2RINA 3OOAA 1B58A 4BDMA 1LCTA 1NNPA 2DVZA 1NH7A 4LZ8A 2F8DA 3OMBA 2YPNA 3U92A 4F3SA 1HSEA 3LSLA 4YMBA 1EZPA 3LUYA 4BDRA 1B3HA 1VR5A 4LA9A 1BIYA 1S9TA 3FGSA 4C1UA 5CMKA 2O51A 3JYRA 3K6WA 2I4BA 3PUVE 1NMUA 2Q88A 5I56B 4YU0A 4KYSA 1URDA 3OEMA 4U4XA 1MPCA 2XHDA 3FD3A 3SESA 3IOVA 5L9SA 3CI8A 2Q2AA 4R6HA 1NNFA 2HZLA 3LSXA 5B70A 4G77A 1QUIA 1MXZA 4LATA 3E13X 4L17A 2X7PA 1HSJA 2VD3A 3PV0E 1MY1A 4NF6A 1MH4A 3PUZE 2V3TA 3IB0A 2X7QA 3ODBA 5H8SA 4F2QA 1A99A 4RA1A 1Y9UA 3RN8A 3UN6A 1B5HA 2ZYMA 2V84A 3CFXA 5I2NA 4LP2B 4EQ7A 3MP8A 4E0XA 2YLNA 4BDLA 1TFDA 1Y20A 4ELQA 3H6UA 1MPBA 3BBRA 3FATA 4ELPA 2Q89A 3EHSA 1MXXA 1R9LA 3TODA 2RCBA 1BLFA 5I58B 4GL8A 2DOJA 1JETA 1UQWA 2DSFA 2DWJA 1IITA 4WKMA 2UYEA 3O6HA 4FE8A 4H67A 4NF4A 1B7UA 4Q0CA 4F1UA 4NF8A 4M4GA 5CBRA 3BFUA 2QPQA 3TKDA 1B7HA 1NL5A 1XVYA 4OXVA 4DLDA 2REJA 1I6QA 3UA8A 4WXJA 3H6VA 2I0CA 5L9OA 3VVEA 4EQ9A 4GXAA 3MJNA 2DYXA 3N6UA 1PC3A 3OO9A 4RPOA 3THIA 4JWYA 3C9HA 2XXXA 4ND9A 3A3CA 4U22A 1Y3QA 2VD2A 1NFTA 2VHAA 1EU8A 3PUXE 1RYXA 2OBGA 3O6GA 3S9LC 2LAOA 4RPNA 5JTYA 1B3FA 4MH5A 3R6UA 2Z23A 1B4ZA 3ZKKA 1MPDA 3CG3A 2O7IA 1USYE 4PFTA 1LSTA 4WEPA 1EZ9A 4IO4A 4PFYA 3PGFA 3MVXA 3N6TA 3T66A 3H7MA 2O84X 3MC2A 4ESWA 1P1NA 1QJMA 1P1WA 3TYHA 3U1OA 2ZYOA 2DVCA 1LGBC 1ZBMA 1JEVA 2D5WA 1LBCA 3FXUA 3Q28A 2GHAA 3CIJA 1B7ZA 3DELB 4LZ5A 4JXIA 4LQ2A 2AIXA 2DQVA 3C4MA 2M8CA 1UTBA 4OVJA 4ZECA 2F7AA 4PP0A 4BDQA 4X48A 2X26A 2HQ0A 3FZVA 3SKPA 3GLBA 2QMXA 3A3UA 1IXIA 2I3VA 1POY1 1DOTA 4RJZA 2OJTA 2Z8FA 1TFAA 1M5CA 3QK6A 1FQDA 3OO6A 4G8NA 4QRZA 3VVDA 3JV9A 4F29A 3MVWA 3BFTA 3WAEA 4AB5A 1SYIA 3TTNA 1QW0A 1MM6A 5I57B 2QS3A 4EUOA 4KYDA 5FHMA 2OWSA 2R71A 2HCAA 1LAHE 3S9NC 2F35A 4FJPA 1Q35A 3K6VA 2VOZA 2GFEA 4U1OA 3PMVA 5CMBA 1MQHA 4F39A 4ZEFA 1S50A 2OK2A 3HO7A 4ONYA 1USYH 3IOTA 2Z8DA 4F3PA 2ANJA 5HPQA 5BWJA 4IY6A 4OFJA 3CSBA 1YTVA 3U93A 3VE1B 4LONB 1FQFA 4G4PA 3K6XA 3Q29A 2ZMBA 4BLAA 5H8NB 5AA2D 4HTGA 5AA2A 2OLBA 3MPLA 5ICTA 1IZ1A 4C0RA 1SI0A 4QFOA 1M5FA 3B6WA 1SBPA 4ZEKA 1OVBA 2ZNUA 4HS7A 4DXUA 3LBSA 3TDJA 1MDQA 1IXHA 1PDAA 1M5DA 3U72A 3G3JA 3IL1B 2A5TA 4JDFA 2B65A 3O97A 1BP5A 3FV1A 4R2BA 3G3FA 2I3WA 2ABHA 1NNTA 3G3HA 4YB5A 2I0BA 2D21A 4GIZA 3KOTA 1SDXA 3FASA 5LOMA 3VDFA 4OFLA 5BUUA 4KI0E 3E9XA 3C36A 4I62A 2RC7A 1GGGA 1RYOA 3MP1A 1MQIA 1GVCA 3O29A 2UVIA 3MZ1A 1SQYA 1N7WA 1MY3A 1D4NA 3CVGA 4E0WA 5AA4A 3RPWA 2B3FA 2A5SA 4XTCQ 3IO4A 4X9TA 1OVTA 1QUKA 2P1SA 2AYSA 4PETA 5EHSA 4DZ1A 1ATGA 4POWA 4GVOA 1IQ7A 1FQBA 3H6TA 1J1NA 4LQ5A 4RYAA 3CFLA 4H6DA 3W9VA 3TTLA 1QKAA 2I4CA 4XIGQ 2Y7WA 2QJEA 1XC1A 2R6GE 4XKPA 2THIA 4IO6A 4EXKA 1H43A 1OQHA 4R74A 2H9BA 3QXMA 4HW8A 4HCYA 4YB6A 1Y3PA 1OLAA 1P1UA 2O1MA 3FJMA 1B3EA 2Y7RA 4OZ9A 1VFEA 3V8XB 1URGA 4F1YA 4YKJA 2HEUA 4FEBA 2XXIA 4G68A 1XOCA 4F18A 3VLUA 2DP8A 3DP8A 2FNCA 5DEXA 5DVIA 3T22A 2QSXA 4JWXA 1MG1A 3OELA 2RCAA 5TU0A 1OLCA 3EQ1A 4LUBA 2PT1A 5H8QA 1B9JA 2UYFA 3N94A 5TP9B 4KHZE 3Q25A 2YJPA 1WDNA 1R1NA 1OMPA 4RK9A 1MXUA 5DYHA 3SEUA 4FATA 3H6WA 1ZMGA 3C32A 5IKBA 4OWDA 1MY4A 1O64A 3TPAA 4OENA 1AMFA 3R7XA 1UTHA 1H44A 5DVJA 2I6EA 3M8UA 3O6IA 3H4ZA 2XXRA 3KSJA 4KQPA 1N7XA 3FVGA 4QSEA 3FIRA 1NH8A 4YICA 4ECFA 4KCDA 1O7TA 1N84A 2UXAA 3SDFA 1PBPA 5H8HA 4YKKA 4ESXA 1Y1ZA 4R9FA 1Y4CA 4ISUA 3W9WA 3CRBA 2XXTA 2IA4A 3OO8A 1FQAA 4IO2A 4G68C 4F3GA 4I9DA 1SW5A 3ECRA 1ELJA 1F9BA 4QFNA 5FHOA 1CE2A 3KG2A 4O3BA 2UVGA 3KOSA 4ZZAA 2DWIA 4PQJA 2DWHA 2CMOA 1T0KA 4N6PA 1CB6A 3G7WA 1WODA 4IO3A 5KDTA 3OENA 3FVOA 2O7UA 3ZKLA 1R6ZA 3IB1A 5CBSA 5TPAA 5AA2B 4QSCA 4IY5A 5K2YA 1EH3A 4KD5A 1MQGA 1GTKA 5ITPA 1A40A 2REGA 1QULA 1N3XA 3EHTA 3S4UA 1LFHA 3MP6A 1US5A 4P0IA 1DTGA 1B1XA 3RLFE 2XD2A 3OSRA 2O1LA 4Z7EA 4P11A 5HM4B 3HHGA 1NKXA 3QIMA 5KCJA 1KWHA 3HHFA 3K02A 2RC9A 3IR1A 4RK2A 4BDNA 1O63A 4Q5TA 4RY1A 5FTHA 3RY3A 1SI1A 2Y7IA 4H5FA 2PT2A 4GFRA 1SD3A 3V89B 2ESNA 4TLLB 2PX1A 1DPPA 1XS5A 5CRYA 2H4IA 5A5XB 4H5GA 1R9QA 4OHNA 4X1DA 3LSWA 3K0VA 4U1ZA 3HSTA 4EF1A 3T9HB 1Y4TA 1LB8A 1I69A 5H8FA 4QF9A 1D9VA 3I6VA 5AE4A 1MDP1 2F7CA 3FUZA 3EPEA 3KZGA 4GXSB 3TAJA 3IOWA 1SYHA 4GL0A 3VXCA 3VV5A 1JVXA 1FTOA 5F1QA 5I59A 1IXCA 3RT8A 2XXVA 4FIMA 2PMSA 1LBBA 3O2AA 1B0HA 4GQOA 4OQOA 4EDPA 1B6HA 5I84A 1AOVA 1URSA 1A8EA 4NMYA 4QFLA 4F22A 2XXQA 3U94A 1IIWA 5DEXB 4MBPA 4WEDA 2ONSA 4R6KA 4OEVA 5I56A 2XXPA 5H8QB 1US4A 4G2ZA 4H1XA 3PMXA 2XXHA 3C31A 5F7VA 4AB6A 1MRPA 4KCCA 1FTJA 2DXRA 5HBCA 4ZDMA 5JK4A 4LVQA 1PB8A 1POTA 2Y84A 3MZBA 1YPNA 1LCFA 2BJJX 2I58A 3DM0A 4OEUA 4DXCA 1JQFA 2GHBA 4THIA 1MY0A 2PYYA 2V93A 3RGYA 1I6AA 1ZJLA 3Q26A 3TTKA 1MM7A 2ZYNA 2OZZA 3N26A 3HN0A 1FW0A 5H8HB 4QFKA 4NF6B 2H25A 4R72A 2P2AA 1MXYA 2F97A 1JW4A 2ZNTA 4DE8A 3IB2A 1S7YA 1JVYA 1QKBA 4JSOA 1QVSA 3UK4A 2PVUA 1NNKA 3EF7A 5I2NB 2DWAA 3TCGA 1LAFE 3H06B 4ELRA 3DP4A 3QUJA 5ISUA 1PB9A 2XXUA 5JEIA 3R26A 3MZ9A 4EXLA 1VE4A 1XHYA 4JBZA 1B1HA 3KJ7A 5KDTB 4OFOA 4R6YA 1H3DA 1MY2A 4OETA 4NTLA 2HZKA 4MLQA 2XXWA 4G8HA 1B52A 2QS1A 1UIUA 3OEKA 4DCYA 4IO5A 1OQGA 4GD5A 3PD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LUZA 4NF4B 1YCJA 2O68A 4NF8B 3TTMA 1NUXA 2FIXA 5EHMA 1Y1MA 4U23A 3QMFA 4UACA 1VFDA 4X8RA 2XXYA 1GR2A 4NX1A 1JW1A 3PMWA 1NI9A 4ZE8A 5KCJB 3BIGA 4O3AA 3F11A 2DE4A 2F34A 4RXLA 4FECA 2CZKA 5CI5A 2E1SA 1RDXA 4KYEA 5DT6A 3K1PA 4NQ8A 1LEVA 3EHUA 4PGNA 2QRYA 1KZ8A 4O3CA 2F6PA 2ZZVA 3IJXB 1N3WA 1UIVA 2P0SA 2R9JA 4GOTA 2ONKE 1FPJA 3CFZA 3FVKA 2XX7A 3K1MA 1HSLA 5JTYB 1YXIA 3TFLA 1ZTYA 3PPPA 2V3UA 3FXRA 1B2HA 3SETA 5M2VA 4N81A 1GV8A 3S2VA 2IEEA 1DPEA 3MAMA 4KFQA 2OWTA 3KGCA 3M3FA 1A55A 3DP6A 4YZZA 1B3GA 5IZ3B 4MMPA 4GBVA 4QHQA 4Z0IA 4PCDA 1QUJA 1H45A 4IGTA 4UA8A 4R75A 4ZEBA 3FJ7A 4F2OA 1FTKA 1RDZA 1Y3NA 4MLVA 4PBQA 3ILUB 1INPA 4P1LA 3PUYE 2B3BA 1A54A 4G8MA 1RKMA 4N8YA 4F3BA 1XT8A 3MBPA 1A7LA 2Y7KA 3VLVA 1DMBA 3W15C 1UTBB 4ZS9A 4MNPA 1B5JA 1B51A 5I57A 3G3GA 3SEVA 2FYIA 3HPIA 4DXBA 5ITOA 3PTYA 4M1VA 1B0LA 1BTJA 2H5YA 3IK6B 3V5AA 2WKYA 1VSOA 5AA1A 3T1BA 1N0TA 3CSGA 2DDKA 2GH9A 4U4SA 4YB7A 3T9XB 4DI3D 3MVZA 3HCQA 3IORA 4IB2A 1FBEA 3K01A 3PU5A 3MQ9A 1H76A 1P99A 4I1DA 3OD7A 3TELA 4EF2A 3RPLB 1NV7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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