3K6VA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in citrate-bound open form
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
EVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
total genus 107
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6vA02
3BFUA 3K4UA 3QIMA 5ISUA 1I6AA 4IY6A 4U22A 4KCDA 2GHAA 4LZ5A 4NE4A 1OLAA 2ANJA 4OFJA 4ZZEA 1SD3A 1TT1A 4ECFA 5J1DA 4BDMA 4P0GA 4EQ9A 1TXFA 2XXPA 2QS3A 3IOWA 1S50A 4O3BA 3H6WA 1LAXA 4X9TA 1FQAA 1LFHA 1OLCA 2DWAA 3Q27A 1IXCA 1PDAA 3TCHA 4FJPA 5M2VA 3SDFA 1MQHA 4GQOA 4H65A 4H8IA 4BDQA 2P2AA 2I49A 1SW2A 5IAIA 4HTGA 3MP8A 4OHNA 2XXRA 4R6YA 4POWA 1II5A 1QUKA 3Q28A 3V89B 1SI1A 2P1SA 1RYOA 4AQ4A 1MH3A 4BDLA 4FEDA 4OXVA 3DP6A 5I2NB 3A3UA 1FQEA 1B5HA 2HFBA 2Q88A 3HN0A 2BJJX 3O2AA 2B65A 2NXOA 3OEMA 1MQGA 2RC8A 2W7YA 2H4IA 3B6QA 3K1PA 4R72A 3IOVA 4BDRA 4YICA 1OVBA 2UVHA 2UVJA 4LQ5A 2E0SA 2F36A 3H03A 2R71A 4X1DA 2I0BA 5EHMA 2AL5A 5I2KB 1B1XA 1D4NA 3FXRA 4F2QA 1B1HA 1MDP1 4ISUA 4G2ZA 4I1DA 2GRVA 1LFIA 2RF1A 3KJ7A 3CSGA 2HAUA 1Y20A 3T9UA 3VLVA 1NKXA 3MPKA 4EQBA 3KFMA 4PP0A 4QFNA 5CMKA 3V8XB 1R9QA 4IO3A 5TPAA 1NL5A 2B3BA 1B46A 1SQYA 3MQ9A 4LVQA 4PETA 3A09A 3R26A 3WAEA 3K00A 3OEKA 4EXKA 3O9PA 3G3GA 4OENA 1MXYA 2XXQA 1YCJA 5FTHA 2ZYOA 1IZ1A 4IB2A 2OWSA 1SYHA 4F31B 4F2OA 4ZEKA 1ZJLA 2ESNA 3O28A 1IQ7A 1HSEA 4ZZAA 4F18A 5I58B 5I58A 3FASA 4GFRA 1M5BA 1NFTA 2A5TB 2QPQA 1D3KA 2Y7IA 3VLUA 3GXAA 4M4GA 4ELQA 4EF2A 5H8FB 2OBGA 4JBZA 1B6HA 2PMSA 3RT8A 2VD3A 3K1MA 1HSLA 4PFTA 3RGYA 2UYFA 2A5SA 2UYEA 5KCJA 1NH8A 2VD2A 3TTKA 3UIFA 2CMOA 1ZKBA 3IJOB 4WKMA 2OZZA 4WXJA 5H8SA 2F6PA 4Z7EA 1FQDA 1ATGA 3PGFA 1A54A 1LB9A 1MXXA 1QULA 1ZU0A 4PE5B 1M5EA 5DTBA 4H1XA 1B40A 2KLFA 1PC3A 3PPRA 3VVFA 5KDTB 3D4GA 1LSTA 2QS2A 1NNKA 3FJGA 3TELA 1QJMA 3C31A 3TQWA 4ESXA 2O1MA 5I56A 1DPPA 3C36A 4HS7A 3MP1A 1P1UA 3MBPA 4NF5A 3TPAA 3ODBA 1B9JA 5AA3A 1MY3A 1LBBA 1Q35A 2F7BA 4QSDA 3CG1A 3F11A 4Q5TA 4U1ZA 3K6VA 1YAEA 2XD3A 3S9EA 5LOMA 3E3KA 4LUBA 3ZS6A 3N6TA 3ILUB 4I9DA 2ZYKA 1WDNA 3GZGA 4NF6A 4U4XA 1O64A 3G7WA 3IB0A 1EU8A 3PPQA 4FECA 5BWJA 5F7VA 5CMMA 2XXVA 4OQOA 4G8MA 5ICTA 4FEBA 4U23A 2ZYNA 2Q2AA 2XX9A 1B2HA 3PV0E 1FTLA 4JXIA 5DVIA 1OIBA 1VR5A 3S2VA 3T9VA 1MPBA 1OQGA 2DSFA 1D9VA 3FZVA 3O6GA 4G8NA 5AA1A 3EN3A 4ZE8A 5HM4B 1SVXB 3K01A 4LA9A 5CI5A 1LBCA 1UIUA 3MP6A 4NF4B 3TUSA 1DTGA 4GOTA 4XKNA 4NMYA 4F3PA 3S4UA 4MBPA 1FQBA 1LFGA 1URGA 5ELVA 4MH5A 3U8QA 4ZECA 2VP1A 4RK9A 3SETA 5I2NA 2Z8EA 3LSFB 2R6GE 3CIJA 3IL1B 4DXCA 2PX1A 5HPQA 3ZSFA 5TP9A 2Q2CA 1B7ZA 1LLSA 4LZ7A 1JEVA 4RY1A 1IXGA 1LGBC 4YB5A 3TODA 1GR2A 3FVKA 2ALUA 1US5A 1Y3QA 3LSWA 2PYYA 5H8HA 4IO6A 1P1QA 1Y4TA 4EF1A 3EF7A 2O68A 4G8HA 3TMGA 3O29A 1BP5A 3JZJA 4R74A 4R9FA 3MC2A 4TQUQ 4U1OA 2P0SA 4OYVA 3SKPA 5ITOA 3E9XA 4IGTA 3RT6B 1SI0A 3QXMA 2AIXA 4ELOA 3B6TA 4PFYA 3AXFA 4H6DA 1IITA 3MVXA 3BBRA 2XXWA 1XVXA 2QS4A 3KSXA 3M3KA 1MDQA 2X7QA 3Q29A 4KPTA 1MQIA 5I56B 1QKAA 3MJNA 5A5XA 3LBSA 3MZ1A 3T22A 2H98A 3KJTA 2R9JA 1GV8A 3VDFA 2UVGA 1EH3A 1SBPA 3D4CA 4DCXA 5ITPA 4GLIA 5KCJB 5KDTA 5DVFA 4NWCA 3K6UA 4O3CA 2Z8FA 2O69A 1OMPA 1YTVA 1B7UA 2ZMBA 3O6HA 1MH4A 3PUVE 3PPNA 4GIZA 2F6GA 2I6EA 2YJPA 3ILTB 4IO7A 4JDFA 4POXA 4DXUA 5JK4A 2GFEA 1B4HA 1B7HA 1AMFA 2A5TA 1AH5A 2Y7WA 3HHFA 4FE8A 3RTWB 1LAHE 1LAGE 4KR5A 4WEPA 3S9MC 2DOJA 1I6BA 1B32A 3CI8A 3U93A 1SW4A 3C35A 3W15C 5CBSA 3IOTA 3UGWA 3TTNA 1Y9UA 1IXIA 3H3GA 4IGRA 5H8NA 1MQDA 2RCAA 3EQ1A 2QL3A 2QS1A 1I69A 1XS5A 2I0CA 2XHDA 3O6IA 4UACA 5CMCA 4DXBA 5IKBA 5I57B 2VHAA 1H44A 1PEBA 5DEXB 3TYHA 1UTHA 4R6KA 1MM6A 2Z8DA 4TLLB 2PT2A 3SERA 3CFZA 3HCQA 3I3VA 1XT8A 1B3EA 4R75A 3RUMA 4F1YA 3PUWE 4YMAA 2UVIA 4N13A 1PB7A 1PB9A 1Y1MA 3O97A 3HO7A 4G68B 4IO4A 4JSOA 2DS9A 2HEUA 4NF8B 4RPOA 3TCGA 1AIVA 4OVJA 2AL4A 1R1NA 1IXHA 4X1BA 3VXBA 4FATA 3RNNA 3IOUA 1MG1A 2V93A 4GVOA 1B4ZA 1POTA 2I48A 3UN6A 1P99A 4RNSA 5I59A 2RINA 2DWHA 3QUJA 5H8QA 4ZE9A 1NH7A 2QSXA 3V83A 4GXSB 4G68C 4DDDA 5JEIA 3HHGA 2UXAA 4F39A 1QVSA 1OVTA 4HCWA 3VVDA 1DTZA 2NWJA 4OZ9A 4HCYA 3PUXE 4G4PA 2Y7PA 2PT1A 1MPCA 2ONSA 3B6WA 4IY5A 4OWDA 3GLBA 1SW1A 1UTBB 4N6PA 3KN7A 3VE1B 1MPDA 3TTLA 1Y4CA 2FYIA 3K02A 3ECRA 3IB1A 1B05A 4R6HA 4OFOA 4YKPA 4ESWA 4Q8RA 3DLNA 3VFJA 3FJMA 1KWHA 4H67A 3G3FA 5CRYA 3IK6B 4ELRA 2V3UA 2F8DA 4Z0IA 1D9YA 4MF3A 3OO6A 2DP8A 3HPIA 4F19A 4KCCA 3T9HB 2I4BA 5I59B 4E0WA 2Y84A 2H25A 3BFTA 3CRBA 3IORA 4YZZA 3SESA 1M5DA 3FVGA 1A8FA 2ONKE 1N7WA 2QMXA 3BKIB 4OTEA 5L9OA 1MM7A 1L5TA 2LAOA 3LSLA 2H99A 3PPOA 1JNFA 1P1OA 1ZIUA 3TFLA 5AA4B 2HXWA 2DXYA 3MVZA 1MXZA 4G77A 1JW5A 3MZBA 4GRKA 3PMWA 4KYEA 3KG2A 2PBWA 1GGGA 2F97A 4C1TA 3EHTA 1YPNA 1A40A 1UTHB 4DCYA 5AA4A 3H6VA 3K0VA 4OETA 1MY4A 4BDOA 4QFOA 3N5LA 1B52A 4DLDA 4BLAA 2XXXA 1Z7NE 4YKIA 1WODA 3LSXA 3OD7A 4YKJA 5KZTA 4F3SA 1UIVA 3IJXB 5DYHA 4THIA 4X48A 1SW5A 3JYRA 1NNFA 1N3XA 1N04A 5AA2B 2IA4A 3EHUA 1H43A 3C9HA 3K6WA 4NF5B 1M5CA 4PQJA 2HZKA 4O3AA 3K6XA 2XXYA 4F29A 2QJEA 4U21A 3RPWA 1ZLQA 2OWTA 2Y7RA 4LATA 4U2RA 2Y7KA 3ONMA 3FV1A 3TKDA 2RC7A 3N94A 4YKKA 1FW0A 4JB7A 3MAMA 4EQ7A 1B5JA 4Q0CA 3E13X 4QFKA 3TTRA 3S9LC 3H4ZA 2D5WA 4C0RA 3I6VA 3IO4A 3QK6A 2B3FA 3TZAA 4KFQA 3WAFA 2QMWA 5K2XA 3TEPA 4QHQA 1AOVA 1QUJA 3P7IA 3PD9A 3VXCA 4DIGA 3ZKKA 5H8NB 1MY0A 2PVUA 3TQLA 5H8QB 2DQVA 1VSOA 2I58A 3FIRA 2NVUB 5H8FA 2V3TA 2Q8JA 3MVYA 5K2YA 1MS7A 2RKMA 1DMBA 1FCKA 3Q26A 4FAJA 2F7CA 3MPLA 4ONYA 5JTYA 3G3IA 3IR1A 4QSCA 3C4MA 3MWBA 1TFAA 2H9BA 5CMBA 2HQ0A 3UA8A 5FTIA 4OFLA 1F9BA 1LCTA 2XD2A 3FXUA 1CE2A 1ZMGA 3G3KA 1R9LA 3PUYE 4LP2B 3RQTA 4YB7A 1ELJA 3O66A 1SYIA 4EUOA 4K3FA 3PMVA 4QFPA 5CM6A 1TFDA 2H5YA 2OJTA 2O7IA 2ZYMA 4BDNA 5L8DA 4C1UA 3SEVA 4QF9A 4QFLA 1URDA 3GBAA 2REGA 4ZEIA 3W9VA 4GXAA 3T96B 4RXLA 3H06B 3OO7A 4NTLA 4XKPA 1POY1 5AE4A 1B3HA 1VFDA 5TP9B 4EDPA 4LQ2A 3OOAA 1BTJA 2NOOA 4IO5A 5AA2D 2VGQA 3B7DA 3PD8A 3KGCA 1JW4A 1H45A 3G3HA 2XXIA 3K2DA 1SDXA 1XC1A 2Q9TA 2REJA 3L6HA 3QYTA 4OEVA 3RN8A 1TWYA 5L9MA 3CFXA 1FQFA 2DE4A 2F35A 3U1OA 4TLMB 1I6QA 3IO6A 4NEDA 5DVJA 3LC8A 4F3GA 5CBRA 1AL3A 4NF4A 4AB6A 1IIWA 1O63A 4L17A 1N76A 3SEUA 1JVXA 4KQPA 5EYFA 3VVEA 3JV9A 5H8HB 3SEYA 4RYAA 2ONRA 4P11A 3MW0A 1ZBMA 4JSDA 4XKQA 4M1VA 4ZEFA 2I3VA 1XVYA 4ELPA 1PB8A 1H3DA 1UTBA 4MLVA 3EPEA 5BUUA 1RKMA 2RC9A 3SEXA 2DWIA 1P1NA 2Q89A 2XX7A 2ZNTA 3KN8A 4LZ8A 2ABHA 4R2FA 1BKAA 2G29A 5F1QA 3UP9A 1B51A 3OO8A 4GL0A 4JWXA 2DWJA 2V84A 3FXQA 4GF8A 2HAVA 1N0TA 2QRYA 4PFUA 1B5IA 4RPNA 2X26A 1T0KA 1FTKA 1A7LA 1EZ9A 4HW8A 4KHZE 1DOTA 1MXVA 3CSBA 3DM0A 4P0IA 2DE3A 4WEDA 3FVNA 1FTJA 1J1NA 5DT6A 3OENA 4H5FA 4PFWA 1DSNA 3KOSA 3T9XB 5A5XB 4XIGQ 4KI0E 4QRZA 3R6UA 2CZLA 4NF8A 4OEUA 1S7YA 4Q30B 5CC2A 4R2BA 2IEEA 4AB5A 3MZ9A 2DE2A 2V3QA 4NWDA 3SEWA 3OXNA 2Z22A 4ZEBA 4U4SA 3N6UA 2HZLA 2F5XA 1RYXA 2DXRA 2XX8A 1VE4A 1LB8A 1LAFE 1A99A 1JQFA 1NMUA 2VOZA 4R9GA 3FD3A 5DEXA 3W9WA 2RCBA 1P1WA 4NF6B 3UK4A 1EZOA 1FTOA 4H0WA 2M8CA 1JW1A 1N3WA 3MVWA 2X7PA 2YPNA 2V25A 1M5FA 3DP8A 2DVZA 4IO2A 3VV5A 2E1SA 3CVGA 3FVOA 3R7XA 3RLFE 3KBRA 1GVCA 4MLQA 3KEIA 1PBPA 4XTCQ 3TTMA 3OMBA 4DE8A 3QSLA 4I8CA 4F1VA 4YAHX 1VFEA 3IAZA 1UQWA 1JEUA 2I3WA 2D3IA 4FIMA 1NNTA 3V5AA 1MY1A 1USYE 4EXLA 3RTFB 1DPEA 4F1UA 3GBBA 4E0XA 3DELB 1ANFA 1BLFA 3FV2A 1O7TA 4FORA 4H8JA 4GL8A 2FA7A 4LONB 4N07A 1IEJA 3ZKLA 4F22A 3N26A 4KD5A 2G93A 2THIA 1A8EA 2Z23A 2YLNA 3H6UA 1WVJA 3KOTA 2OK2A 1MXUA 3KZGA 4GWOA 4RK2A 1QKBA 2D21A 5TPAB 5I57A 1CB6A 5B7DA 3L6GA 1R6ZA 4YMBA 2NUVA 3FUZA 3T66A 1Y1ZA 2FNCA 2GHBA 1B0HA 2O6AA 3CFLA 1BIYA 3C33A 3Q25A 3RY3A 5EHSA 4DZ1A 2O7UA 3FGSA 3LUYA 5JTYB 3PPPA 4ZEDA 1N84A 1B3LA 4JWOA 4QSEA 3KN3A 3H7MA 3UORA 3E4RA 4KYDA 3T93B 5I84A 4OERA 3C34A 1FQCA 4YB6A 1HSJA 1MY2A 2DYXA 2WKYA 4RA1A 5L9SA 1ZTYA 2XXTA 1IUDA 2I4CA 3CG3A 3IB2A 3HV1A 2O51A 3OSRA 3TCFA 4G68A 4F3BA 1LCFA 1B3GA 1MXWA 1A55A 1JETA 1Y3PA 5FHOA 2ZNUA 2GH9A 3HSTA 4XXUA 1URSA 4UA8A 1USYH 1QUIA 3A3CA 3FJ7A 1B3FA 2O1LA 1B58A 1XHYA 3LR1A 3OSQA 3QUFA 4OMBA 4KYSA 1B0LA 3MUQA 4R73A 4MFIA 3VLWA 3IX1A 2XXUA 3OO9A 2F34A 1NNPA 2O84X 3H6TA 1EZPA 3M3FA 5TU0A 1Y3NA 3U72A 1XOCA 2F78A 1OQHA 1PBQA 3USDA 4H5GA 3M8UA 4RJZA 3QAXA 5ICQA 4XKRA 3PUZE 1MQJA 3PMXA 4JWYA 1S9TA 5AA2A 2F7AA 5I2KA 3FATA 2XXHA 3PU5A 2HCAA 2ZXTA 3C32A 5FHMA 5B70A 2OCUA 1N7XA 3G3JA 1FTMA 3EHSA 3THIA 4I62A 2ZNSA 1GTKA 1MRPA 1QW0A 2DVCA 1Q1KA 3CR9A 2AYSA 4OESA 4YU0A 5FHNA 1US4A 3TAJA 3U94A 4ZDMA 3TDJA 3I5OA 3M3LA 4ND9A 3K1NA 3DP4A 1Z7ME 1H76A 1JVYA 3OELA 4TOZA 2OLBA 3U92A 3S9NC 5HBCA 4ZS9A 4GD5A 3KSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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