1NL5A

Engineered high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATAENAAKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 119
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nl5A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nl5A01
4ZEKA 3TKDA 3KSJA 2F78A 4DZ1A 4R74A 1B05A 3MBPA 1LB9A 2ALUA 4OENA 3PMVA 4QSDA 3MVYA 5AA2D 3GXAA 4ZEIA 3N26A 3THIA 4I9DA 4HTGA 1MY0A 4IO2A 3T9UA 1MQDA 3C33A 4OEUA 1EZ9A 4XIGQ 3C9HA 3RQTA 3UN6A 1B1HA 3VVEA 3OO8A 3LC8A 2O6AA 4R6KA 3Q28A 2PBWA 2H9BA 3VXBA 4PFTA 2PYYA 3V8XB 3IOWA 1Z7NE 2GFEA 3OEKA 1UTHB 1ZJLA 5F7VA 4I1DA 2BJJX 3OSRA 5AA4B 2XXVA 4KYDA 1Q35A 1B0LA 3CSGA 4U23A 5H8FA 1B32A 2B65A 3S9EA 1SBPA 4H5GA 5L8DA 1TWYA 3IK6B 4GQOA 1FTKA 4TQUQ 4JSDA 3TTNA 3H7MA 3K1NA 1BKAA 2VD3A 1QUKA 4F19A 1KWHA 4OESA 5A5XA 3TUSA 5DT6A 2YJPA 4ELRA 4G68C 1LAGE 4JWYA 1SYIA 2ZXTA 4NF4B 1LFGA 3EN3A 2ANJA 4FE8A 4EDPA 2Z8EA 2ZYKA 3FASA 3PPNA 3TDJA 1PB7A 1PBPA 5K2YA 2ZYOA 4OFOA 2QSXA 4F29A 4G8NA 4F22A 3TTLA 3QAXA 1HSEA 4LP2B 4QFNA 2F97A 3SKPA 1YCJA 1YAEA 5H8QA 5I56A 1HSLA 4NE4A 1B0HA 4JWXA 3IOVA 4YMAA 1SVXB 5L9OA 1USYH 1B46A 2ONSA 1IUDA 4OQOA 3GBBA 2G93A 4LZ8A 4R75A 3U94A 4MF3A 4EXKA 5I57A 3O9PA 2I3VA 3PUWE 1N7XA 4X1DA 1JEVA 3CFLA 1NL5A 4DXBA 3ZSFA 1B40A 3T66A 2XXHA 4KCCA 1NH7A 4KHZE 1JVXA 4NWCA 1B4ZA 4NF6B 1WDNA 4RXLA 3K0VA 3HSTA 3RN8A 4LATA 1ZKBA 5CI5A 5DVJA 2RC7A 3U1OA 1N0TA 1VE4A 1H76A 4H8JA 5DEXB 3K6UA 3C31A 3H3GA 5I84A 3UIFA 2Z8FA 5ICQA 4U4XA 2XXQA 4POWA 1NKXA 3O28A 1AL3A 4QF9A 2GRVA 2THIA 2NVUB 1TT1A 3HO7A 2DWIA 1A99A 4WEDA 1MY4A 3FGSA 5J1DA 2DXYA 4G68A 3H03A 1SW2A 1FCKA 4YKIA 4U21A 3UGWA 2I58A 3G3KA 1NFTA 1PEBA 4OTEA 4F1UA 2O51A 1P1UA 2QS2A 2HEUA 4L17A 1FQAA 4R6HA 2M8CA 4YAHX 1GTKA 3TYHA 2Q2AA 3PUZE 2XXXA 2FYIA 3LSXA 1SI0A 3V89B 2OBGA 1XT8A 3HN0A 4R72A 4ZS9A 3WAEA 3FIRA 2O84X 1IXGA 4QFPA 4EUOA 3CSBA 2V3QA 4YB5A 4OETA 4G77A 2Y7IA 1MH3A 4QSEA 1Y20A 4LUBA 1MPBA 3N6UA 4HW8A 1UIUA 4YB6A 3CG1A 2PT2A 4E0WA 3FJGA 2RC9A 4ZEFA 5CMBA 2H99A 2VD2A 1MM6A 5KCJB 5TPAA 3VV5A 2XX7A 2AL4A 4Q8RA 4GIZA 2V25A 3CFZA 3CVGA 4UACA 4N13A 3MVWA 2W7YA 3M3LA 4I8CA 3OD7A 4DXUA 2QMXA 3UA8A 3WAFA 2X7PA 4GXAA 4BDMA 1MY1A 3RT6B 1I69A 3UP9A 2UXAA 4FEDA 1BP5A 5AA4A 3PMXA 2X26A 1LLSA 3VLVA 3U92A 1AH5A 3SDFA 3K6VA 2I6EA 2UYEA 4GLIA 1GV8A 1QKAA 2REGA 4JB7A 3RY3A 3T96B 3I6VA 2HZKA 5BUUA 3C32A 5BWJA 3HV1A 1LCFA 4H1XA 4U1ZA 4FAJA 5FHOA 3MWBA 2VGQA 1NNTA 5HM4B 2V3TA 3MPLA 1D4NA 3UORA 1FTJA 4RK9A 3TFLA 3LR1A 4F3SA 1JETA 4KFQA 4ISUA 2D5WA 3DELB 3Q29A 3TZAA 1MQIA 5M2VA 4N6PA 1I6QA 5DVFA 3HHGA 4DE8A 3UK4A 2UVGA 4ESXA 3O6IA 3SEYA 1XS5A 1MG1A 5DVIA 3U72A 1URDA 1TFDA 1WODA 1JNFA 4BDRA 4DLDA 2RF1A 3H6VA 2DE3A 3N94A 4U4SA 1DPEA 3MW0A 3VLUA 3EPEA 4YICA 1AMFA 3PV0E 3OO9A 5H8SA 3QIMA 4JDFA 3MC2A 5LOMA 4LZ7A 2X7QA 2V93A 4F1YA 1N84A 2GH9A 3IOTA 4ZDMA 4FJPA 1B58A 5I58B 3A3CA 4G2ZA 3T93B 3K02A 1N7WA 3ECRA 4ESWA 5DEXA 1N04A 3KGCA 3S2VA 2I48A 2A5TA 2DXRA 1B52A 4ELQA 3E9XA 3BKIB 4WEPA 3ZKLA 3CG3A 1PC3A 2NOOA 2O1LA 3TQWA 3KEIA 3B6TA 2NUVA 1B7ZA 1RYXA 4OHNA 3A09A 3B6WA 3BFTA 4PFUA 3FZVA 3JV9A 1Y3QA 2QRYA 1ZTYA 5H8NA 4O3AA 1POTA 1QW0A 2V84A 4XKRA 3PMWA 1MXUA 2F6PA 1FTLA 3HCQA 3G3IA 3TCGA 4XKNA 2F36A 2Y7KA 1M5FA 1A8EA 2F5XA 3LUYA 4FATA 4NF5B 5F1QA 3Q26A 2ZNTA 1B5IA 3H6WA 3R7XA 4M4GA 3RLFE 5L9MA 2OJTA 1LAFE 2DS9A 1NNKA 2H4IA 1DTZA 3PPOA 4AB5A 3VVDA 1CB6A 1XHYA 1QKBA 4PFWA 2OWTA 3MVXA 3ODBA 4JBZA 1ATGA 4MBPA 3CRBA 2VOZA 4Z7EA 3IR1A 1GVCA 2B3FA 2XXIA 5ICTA 2D21A 1Z7ME 2IA4A 1I6BA 2HFBA 4NF8B 3SESA 2O7IA 4NEDA 4THIA 3L6GA 4MH5A 1O63A 1O7TA 1Y4TA 3QUFA 3MPKA 2F35A 1LBCA 4E0XA 4OZ9A 4Z0IA 1NMUA 3TELA 4HCWA 3MJNA 4Q30B 5I2KB 2Q8JA 4ND9A 2ZYMA 1XC1A 5ITPA 4QSCA 1Y4CA 5I59A 4MFIA 1FQFA 4F1VA 3IJXB 3LSLA 5FHMA 3R26A 2I0CA 3HHFA 2UVHA 1MM7A 5EYFA 4Q0CA 2PVUA 4RJZA 2RINA 1EU8A 4PP0A 4F2OA 1FTOA 1S7YA 2YPNA 3G3JA 4EF2A 3LBSA 4OXVA 3PUVE 3MZ9A 1LBBA 2R71A 3FV1A 1DMBA 1JVYA 4RPOA 1SQYA 5H8HB 4IGRA 5KDTB 4JSOA 1EZPA 2ZNSA 3FD3A 4U1OA 2F7CA 5DTBA 4NWDA 5ITOA 1Q1KA 5L9SA 1UTBB 3KOSA 2Y7WA 3KN7A 2DE2A 2DOJA 4H5FA 5EHSA 4OMBA 2VHAA 3TTMA 2OK2A 2H25A 3IOUA 2P0SA 4YKJA 4O3BA 2HQ0A 1J1NA 4H67A 3DM0A 1M5CA 1S9TA 1LFIA 3OMBA 2XXRA 4O3CA 4MLQA 1OMPA 3CI8A 3OO6A 2Y84A 1B7UA 1XVYA 4FEBA 3PUYE 1JQFA 1OIBA 2ONKE 3QK6A 4N07A 2V3UA 3KN8A 4IO7A 1DSNA 4ZE9A 3VLWA 2Q89A 2OCUA 3TPAA 3TMGA 5FTHA 3OOAA 1PB8A 5IAIA 4IB2A 3H4ZA 3T9VA 1QVSA 3KZGA 1F9BA 1Y9UA 3N5LA 3FVOA 4X1BA 4P11A 1DPPA 5I2NA 3DLNA 3FXQA 1IXCA 1B4HA 4H6DA 2OWSA 2E1SA 5I58A 3MZ1A 4F2QA 3BBRA 1N3WA 3KG2A 5JTYB 3RUMA 3ILTB 4ECFA 1CE2A 3G7WA 1A7LA 1Y1ZA 2I49A 1RKMA 4QRZA 1LAHE 2LAOA 1B6HA 1EZOA 1MQGA 4IO4A 3IAZA 3FXRA 5HBCA 1XVXA 4FIMA 1B3FA 4LQ2A 2R9JA 3C36A 5H8FB 4R6YA 3CFXA 2HAUA 2O7UA 4X9TA 1MY3A 3S9LC 1FW0A 1OVTA 1QJMA 2P1SA 3TODA 2I0BA 1BIYA 4KI0E 2I3WA 1VSOA 3H6UA 3O6HA 5A5XB 1N3XA 1P1OA 3IORA 3G3GA 4R9GA 2DQVA 3OXNA 1I6AA 2RCAA 4IO5A 2F6GA 3KOTA 2ZMBA 4BLAA 3E4RA 5AE4A 5K2XA 1AIVA 3MVZA 4EQ9A 1UTHA 2AYSA 1M5EA 2CZLA 2RCBA 1LAXA 3KN3A 3OENA 1MH4A 4TLLB 4BDNA 5CBRA 5AA2B 4HCYA 5H8QB 3PU5A 3MP6A 1OQHA 2FNCA 2REJA 2XX9A 3TCHA 3M8UA 3K1MA 2DYXA 5TU0A 3PPQA 4YB7A 5CC2A 2DSFA 1MPDA 2KLFA 5I57B 4NF4A 4GRKA 1MXVA 4QHQA 1IZ1A 1A55A 2DVZA 2GHAA 1DTGA 3Q27A 1Y3PA 2G29A 3LSWA 1TXFA 3KSXA 3IX1A 3KBRA 3MAMA 1ZU0A 1ZLQA 3FJMA 4ZE8A 5ISUA 4XTCQ 3T9XB 1R9LA 4F39A 3DP6A 5TP9B 2H5YA 5I2KA 5JK4A 3D4GA 2Z23A 1D3KA 1FQBA 1MPCA 3FVGA 3C4MA 1USYE 2ZNUA 3W9VA 2VP1A 1ELJA 2ZYNA 4ONYA 3AXFA 4GWOA 4LA9A 3HPIA 4DIGA 4ZEDA 2HXWA 2O68A 1FQDA 4KYEA 1EH3A 2IEEA 3GLBA 3SETA 2XXTA 4GF8A 1Y1MA 5EHMA 4OFLA 1MQHA 3PD9A 3SEUA 1D9YA 4EF1A 4G68B 1R6ZA 5CMKA 3RTWB 4YKKA 4RK2A 2RC8A 3U8QA 4NF6A 3FXUA 1OQGA 4G4PA 4RPNA 3S4UA 2XXPA 3TAJA 2OLBA 4JXIA 3KJTA 5B70A 5CMCA 3EQ1A 1OVBA 3JYRA 4IO3A 3IB2A 3FATA 3MP1A 3KFMA 1MDQA 3IJOB 3EHSA 1NNPA 1MY2A 1US5A 3QUJA 3VE1B 1P1WA 4P0IA 3O29A 3C34A 4RYAA 1NH8A 4BDLA 4X48A 4F31B 2DP8A 2O1MA 2WKYA 3IB0A 3GBAA 3RT8A 3KJ7A 4H65A 5TPAB 3T9HB 4M1VA 2Y7RA 1IXIA 1R1NA 1SW1A 5AA3A 1LCTA 4ELPA 4GL0A 4K3FA 3Q25A 4JWOA 4DDDA 3M3KA 4WKMA 4IGTA 2PX1A 3VXCA 1B3LA 3RPWA 1RYOA 4OEVA 2ONRA 4G8MA 5JTYA 1OLAA 1SI1A 4TOZA 3B7DA 1TFAA 1FTMA 3E13X 3TTRA 1PB9A 3VVFA 3IO6A 4H0WA 3U93A 3G3HA 4KQPA 1POY1 5KCJA 1US4A 4GD5A 1MXYA 4P0GA 4QFOA 4EQ7A 1H3DA 3R6UA 2RKMA 3TEPA 3TTKA 1MXXA 1SW5A 3V83A 1B2HA 1DOTA 4YU0A 4OFJA 1QULA 1A8FA 4QFLA 1B9JA 3PPPA 3IL1B 4IY5A 4YKPA 4WXJA 2Z8DA 3N6TA 2XD3A 4NMYA 5AA2A 4FORA 4I62A 3QYTA 3M3FA 4AQ4A 2XXWA 5FHNA 3RTFB 4R73A 3D4CA 2DE4A 3FV2A 4R9FA 1N76A 3S9NC 3QSLA 1D9VA 4POXA 1B5HA 1M5DA 3I5OA 3OO7A 2OZZA 1T0KA 2AIXA 1ZBMA 1VR5A 1AOVA 4U2RA 1ZMGA 1URGA 4KPTA 1MDP1 4NTLA 4IO6A 2O69A 2ABHA 4KYSA 2E0SA 2Q88A 3C35A 5TP9A 5CRYA 1UQWA 4ZZAA 3O2AA 5B7DA 1B3HA 1ANFA 3QXMA 3MZBA 4F3BA 2Z22A 3DP8A 3FUZA 3PUXE 3IO4A 1LGBC 4BDQA 2F7BA 2QS3A 2QMWA 1OLCA 3H06B 2F34A 1Y3NA 1B3EA 4GXSB 4ZZEA 2A5TB 2ESNA 4PE5B 5KZTA 3P7IA 3ONMA 1JW5A 3IB1A 3K6WA 1IEJA 3K6XA 3BFUA 3O66A 2AL5A 3K2DA 3SEVA 4LZ5A 3DP4A 3RGYA 3TQLA 3OSQA 1B7HA 3TCFA 4PFYA 1LSTA 3ZKKA 4R2BA 1M5BA 4IY6A 1H44A 4F3GA 1GGGA 4H8IA 5H8NB 4EXLA 3O97A 3O6GA 3MP8A 2HAVA 3RNNA 3SEXA 1MRPA 2QS1A 4LQ5A 2R6GE 4OVJA 4HS7A 1JEUA 1P1QA 1SYHA 1B5JA 3V5AA 2Y7PA 3CIJA 4QFKA 5CM6A 1YPNA 4RY1A 3CR9A 3A3UA 4ZECA 1A40A 1UIVA 1JW1A 4C1UA 1JW4A 4R2FA 4U22A 1IQ7A 1PBQA 3GZGA 2CMOA 3K00A 1L5TA 5FTIA 4ELOA 2DVCA 3K01A 1MQJA 2GHBA 1BTJA 4C1TA 1LFHA 1FQEA 2YLNA 5CBSA 1GR2A 1QUIA 2PMSA 2DWAA 3OELA 1WVJA 3SERA 4MLVA 4F18A 3G3FA 1MXZA 2B3BA 3I3VA 1IIWA 2XXUA 3EF7A 4UA8A 4RA1A 4NF5A 2F7AA 1A54A 2XHDA 1YTVA 2HCAA 4LVQA 5I56B 5I59B 2Q2CA 3F11A 1NNFA 2H98A 1H45A 4XXUA 3EHUA 3ILUB 1FQCA 1URSA 4GVOA 3USDA 4DCYA 1ZIUA 2QJEA 2DWHA 5DYHA 2UVJA 4GOTA 3VDFA 1SD3A 4AB6A 4BDOA 1IITA 3T22A 4NF8A 2QS4A 2XXYA 1LB8A 4KCDA 4DXCA 4GL8A 2I4BA 2FA7A 4KR5A 4RNSA 2I4CA 4XKPA 3H6TA 4OWDA 4PQJA 4GFRA 4YZZA 4C0RA 5JEIA 2DWJA 1S50A 5ELVA 3PD8A 4EQBA 2UYFA 4LONB 3MUQA 2UVIA 5AA1A 3W15C 3K1PA 3EHTA 4KD5A 3PGFA 2D3IA 2XX8A 3PPRA 2NWJA 4TLMB 2PT1A 1SW4A 3B6QA 5CMMA 4G8HA 3OEMA 2NXOA 3E3KA 3FVNA 5H8HA 5KDTA 3FJ7A 2F8DA 4XKQA 1UTBA 3K4UA 1BLFA 1H43A 1VFEA 5HPQA 3L6HA 3SEWA 3ZS6A 4DCXA 2P2AA 4Q5TA 1SDXA 1B1XA 1IXHA 1MS7A 2QL3A 3VFJA 2Q9TA 5I2NB 2HZLA 1VFDA 3LSFB 1PDAA 1MXWA 4F3PA 1II5A 1XOCA 3W9WA 4OYVA 4FECA 1P99A 2XD2A 4PETA 1B51A 4OERA 1B3GA 4YMBA 1O64A 2A5SA 1HSJA 1P1NA 1QUJA 1R9QA 2QPQA 3FVKA 3S9MC 3JZJA 5IKBA 3MQ9A 4ZEBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEKA 3TKDA 3KSJA 2F78A 4DZ1A 4HE1A 4R74A 1B05A 3MBPA 1LB9A 2ALUA 4OENA 3PMVA 4QSDA 3MVYA 5AA2D 3GXAA 4GWUA 4OA4A 4ZEIA 3N26A 3THIA 4I9DA 4HTGA 1MY0A 4IO2A 3T9UA 1MQDA 3C33A 4OEUA 3EKIA 1EZ9A 4XIGQ 5EQ9A 2WYKA 3C9HA 3RQTA 3UN6A 1B1HA 3VVEA 4PGPA 3OO8A 3LC8A 2O6AA 4R6KA 3Q28A 2GQ1A 1NUWA 2PBWA 2H9BA 4GX6A 3VXBA 4PFTA 2PYYA 3V8XB 3IOWA 1Z7NE 2GFEA 3OEKA 1UTHB 1ZJLA 5F7VA 4I1DA 2BJJX 3OSRA 5AA4B 2XXVA 4KYDA 1Q35A 1B0LA 3CSGA 4U23A 5H8FA 1B32A 2B65A 3S9EA 1SBPA 4H5GA 4GWZA 5L8DA 1TWYA 3IK6B 4GQOA 1FTKA 4TQUQ 4JSDA 3TTNA 3H7MA 3K1NA 1BKAA 2F3DA 2VD3A 1QUKA 4O7MA 4F19A 2HHMA 4MHFA 1KWHA 4OESA 5A5XA 3TUSA 5DT6A 2YJPA 4ELRA 4G68C 1LAGE 4JWYA 1SYIA 2ZXTA 4NF4B 4PF6A 1LFGA 3EN3A 2ANJA 4FE8A 4EDPA 2Z8EA 2ZYKA 3FASA 1FPKA 3PPNA 3TDJA 1PB7A 1PBPA 5K2YA 2ZYOA 4OFOA 2QSXA 4F29A 4G8NA 1FPJA 4F22A 3TTLA 1NV7A 3QAXA 5EQ8A 1HSEA 4LP2B 4QFNA 4XEQA 2F97A 3SKPA 1YCJA 1YAEA 5H8QA 5I56A 1HSLA 4NE4A 1B0HA 4JWXA 3IOVA 4YMAA 1SVXB 5L9OA 1USYH 1B46A 2P3VA 2Y5LA 2ONSA 1IUDA 4OQOA 4PTKA 3GBBA 2G93A 4LZ8A 4R75A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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