2PX1A

Crystal structure of the complex of bovine lactoferrin c-lobe with ribose at 2.5 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title crystal structure of the complex of bovine lactoferrin C-lobe with Ribose at 2.5 A resolution
rcsb
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2px1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2px1A02
1VE4A 4IO4A 2AYSA 1URSA 1NL5A 5KDTA 2QL3A 4F18A 4JSDA 3K4UA 1TXFA 1MY3A 4IY5A 5H8SA 5JTYB 3TQWA 3MPKA 3HCQA 4NTLA 1B4ZA 3CR9A 1FTLA 3CFLA 1FW0A 4WXJA 3I6VA 1MY2A 3IOWA 5CMCA 3RQTA 3IJXB 1ZKBA 3A3CA 1UTHB 3ILTB 3KSXA 2I3VA 4YB7A 5I57A 1MQJA 3H6TA 1MXZA 1AMFA 3RN8A 4KR5A 3OSQA 3VXBA 3KJTA 4BDOA 3O29A 1A40A 5DVJA 4NF8B 3H3GA 4EF1A 3K1PA 1MH3A 3K1NA 5CMMA 2XX8A 1MXWA 3GBAA 4QSCA 3FXRA 3O6GA 4BDQA 4OETA 2Z22A 4F39A 1B6HA 3QSLA 2DWAA 3EHSA 4ZZAA 4EDPA 4WEPA 2DE2A 4BDMA 4RNSA 1ELJA 3PPOA 3SETA 4GWOA 1RYXA 2NXOA 5EHMA 4NF5A 1R6ZA 1NNPA 1SDXA 3PGFA 5H8QB 3PPQA 1XHYA 3C34A 2AL4A 3VLWA 5H8FA 4HTGA 3H4ZA 3HO7A 4AB6A 2RCBA 4POWA 2RC8A 2Z8FA 3IX1A 5ITPA 2GRVA 3V83A 3KFMA 1MY1A 4Z0IA 3TMGA 1SQYA 5I2KA 3N5LA 5JK4A 1UIVA 4O3CA 3LSWA 3R6UA 4ZE8A 3IOTA 3OD7A 1URDA 3TEPA 1J1NA 4FEBA 1Z7NE 4Q30B 1Y3PA 1Y4TA 1ZTYA 3HPIA 1I6BA 1B3LA 2QMWA 3L6HA 2V25A 1S50A 1GR2A 4YICA 4BDLA 2A5TA 3MZ1A 1PBQA 1MM7A 1NFTA 4NWCA 3TELA 4NF4A 1MY4A 4H65A 5CI5A 1B4HA 4XXUA 1Y3QA 2VOZA 3FATA 1B32A 3H6VA 1POTA 3CSBA 2XD2A 3DP8A 2OBGA 4R2FA 2XXYA 2HZLA 3TPAA 3TTKA 2NWJA 3ILUB 4X1BA 3H7MA 2YPNA 4WEDA 1N7XA 2DE3A 3SDFA 1P1QA 3PU5A 3D4CA 2H25A 5CRYA 3FJMA 3KOTA 1TT1A 4ZZEA 1Z7ME 1NNFA 1XVYA 3W9WA 3TTRA 4R74A 5I58A 5KCJA 1B3FA 3CVGA 3U92A 3VV5A 2V3TA 2ONKE 2DYXA 3LSFB 3VVDA 1EZ9A 4ZEFA 4Q0CA 4R75A 1O7TA 1D3KA 4PFWA 4F1VA 3Q27A 4XIGQ 3WAFA 1QKBA 1YPNA 1NMUA 3OO9A 4KPTA 2HAVA 4QFPA 4U4SA 4WKMA 4F31B 2DSFA 1CB6A 5AA2B 1MRPA 1SI0A 3G3JA 4AB5A 4HW8A 3QAXA 2M8CA 1ZBMA 4JDFA 2HAUA 3A3UA 2Z8DA 5DT6A 3G7WA 2F36A 1LGBC 1B5IA 4F29A 1ZMGA 3RLFE 3MW0A 3KJ7A 4KFQA 1LFIA 2V3QA 3E3KA 4XKQA 3KBRA 2ZYKA 2GHAA 1SW2A 3N6TA 3KG2A 2ONSA 3B6TA 4ZEDA 3B7DA 3H03A 1B40A 3LUYA 2FYIA 1DMBA 4HCWA 2PT2A 3CSGA 1P1OA 4QF9A 3IB2A 4YU0A 2DOJA 4E0XA 3FASA 3TTMA 2P0SA 3IK6B 3S9EA 4NF6B 1H76A 3HN0A 3LR1A 3DP4A 3R26A 3D4GA 4ESXA 1MPBA 2PYYA 2RKMA 1OVTA 4OMBA 1OLAA 2F7CA 4C1UA 5JEIA 4RY1A 5JTYA 5AA4B 2F8DA 4H8IA 5L8DA 1URGA 4P0IA 4LQ5A 3O6HA 3TCFA 1DSNA 4P0GA 3TODA 3IAZA 2G93A 2PVUA 1A8FA 2QSXA 2ZNTA 3ONMA 3IORA 2THIA 1UTHA 1XT8A 4Q8RA 3O97A 1OQHA 1SW4A 1P1UA 4GLIA 3SERA 5ELVA 1B7ZA 2RC9A 1TFAA 2AIXA 3CI8A 3FIRA 3PMVA 1B3GA 3GZGA 4F22A 4BDNA 4TOZA 2XXXA 2DVCA 5KZTA 5TP9B 3O28A 4ELOA 4NF8A 3MP1A 1B58A 4QSDA 3BKIB 3K6WA 1MY0A 3O6IA 2Q2AA 1JNFA 5J1DA 5I59B 2Q88A 4XKPA 4Z7EA 3CFZA 1N0TA 1LCTA 4F3SA 1N3XA 3FXUA 5HBCA 2UVHA 2QJEA 4U22A 1POY1 2P1SA 3TDJA 2Z8EA 3RT6B 5FHMA 3N26A 4FATA 5FHOA 3TYHA 3I5OA 2X7PA 2D5WA 4OENA 4DXCA 3TKDA 4LZ5A 1WDNA 2RINA 1P1NA 4XKNA 2X7QA 5FTHA 3Q26A 3B6WA 4R9FA 5H8QA 3OENA 3IB1A 2VHAA 1PBPA 1Q35A 2E0SA 1Y1ZA 2GFEA 3FVOA 1N84A 4IY6A 3E4RA 3FV2A 1A54A 4O3BA 3JZJA 4YB5A 1BTJA 1USYE 1B5JA 1HSLA 2OZZA 1JEUA 3K01A 4H6DA 1A8EA 5F1QA 3CIJA 1XOCA 3T96B 3MWBA 4THIA 3MJNA 1IIWA 5H8HB 1N76A 1H44A 1AOVA 5HM4B 4N13A 1XC1A 3GBBA 1B46A 3T9VA 4EXLA 1H43A 5HPQA 1NH7A 1PDAA 2ABHA 3PV0E 1LB8A 4M1VA 3FVGA 2KLFA 3V8XB 4GQOA 3U94A 1M5DA 4YZZA 1B7HA 3UP9A 4UA8A 4BDRA 5ISUA 1O64A 4U2RA 1H3DA 2UYEA 3SEXA 3DLNA 1H45A 2XX9A 3MVZA 4ZDMA 5FTIA 1M5FA 3OMBA 1QULA 3VDFA 1QVSA 1WVJA 2FNCA 2Y7KA 3OO6A 3BFUA 3VFJA 2F6PA 4C1TA 2QPQA 5B7DA 1FTJA 1EZPA 4OFOA 4EQ9A 5I2NB 4KYEA 2X26A 3BFTA 2QRYA 3Q29A 2IA4A 3MQ9A 4X48A 4HCYA 3KEIA 1A55A 3TFLA 4G68B 4JWXA 3T9UA 5AA2A 2YJPA 1S7YA 4R6YA 5TPAB 3M3KA 2I0BA 4XTCQ 2R9JA 3U93A 2DXYA 2H98A 3DELB 1B3HA 2I0CA 1UQWA 3FVNA 4JB7A 4ISUA 2O84X 4KI0E 3OOAA 2WKYA 1YTVA 1MXXA 2REGA 4LVQA 3PUZE 3IL1B 2OWSA 1FQBA 1IEJA 1T0KA 2B65A 3U72A 1HSJA 2Q2CA 2D21A 3K02A 3G3HA 4OVJA 4FAJA 1F9BA 4OXVA 2CMOA 2F5XA 2ZNSA 1VSOA 4KYSA 3TCHA 3QK6A 1B7UA 1IXHA 1Y4CA 4DLDA 2Q9TA 5DVIA 5AA3A 3T93B 3FD3A 3OO7A 4LZ7A 3UN6A 3PPPA 4PQJA 1I6QA 3BBRA 4O3AA 2V3UA 3K6UA 4G2ZA 3C36A 4ZE9A 4NF6A 1OLCA 1B5HA 4OWDA 4YAHX 3RY3A 1VR5A 3UK4A 1IXGA 4QHQA 4FORA 5K2YA 2XXPA 2RCAA 3CRBA 1FCKA 5BUUA 2Z23A 4RJZA 5DEXB 1IXIA 1DPPA 5TU0A 5AA4A 5L9SA 1N7WA 2DE4A 4R6KA 4R72A 1N3WA 4GXSB 3G3FA 4YKJA 1XVXA 1SBPA 2Q8JA 1IZ1A 1US5A 1WODA 2PMSA 1JW5A 3MAMA 4LZ8A 1EU8A 3G3GA 3S9MC 2ZYNA 3MZBA 4XKRA 1FQCA 4HS7A 1D9VA 3ECRA 1FTOA 2NOOA 1BP5A 3MP6A 4EQ7A 1ZJLA 5TP9A 4ECFA 2LAOA 4OYVA 2OLBA 4IO5A 4F1YA 3UGWA 3KN7A 1B0LA 3TUSA 3Q25A 4LA9A 3HSTA 3LSLA 5I59A 1PC3A 1FTKA 3RPWA 4F3GA 3LC8A 1ATGA 4YB6A 5I84A 1N04A 4LP2B 1SYIA 4DIGA 3PMWA 4LATA 1EZOA 3L6GA 4MF3A 1MQDA 1TFDA 2H9BA 4U21A 2H5YA 2ZXTA 4DCXA 4ZEBA 4G8MA 1M5CA 3M3FA 1MQHA 1MXYA 3B6QA 1OMPA 3IB0A 3ZS6A 4JBZA 1B2HA 5FHNA 2W7YA 1LCFA 1B9JA 4U1OA 4I9DA 3MVXA 4EQBA 1SW1A 4E0WA 1AH5A 1RKMA 4YKIA 3EHTA 2OWTA 3FVKA 3RTWB 1IXCA 3I3VA 3C31A 2OK2A 3N94A 1USYH 4IB2A 4NE4A 4OFJA 5H8HA 3TCGA 1JW1A 1MXVA 1Y3NA 4POXA 2XHDA 3C9HA 4OZ9A 2VD2A 5H8NB 2F7BA 1B1XA 3FUZA 4MBPA 4DZ1A 3H6WA 4KD5A 4TLMB 2I48A 4LONB 5L9MA 4H67A 2F78A 3PUYE 4F19A 1MPDA 4QFOA 1JETA 3H06B 4GRKA 2R6GE 2F7AA 3EPEA 5AA2D 3MVWA 2H99A 4N07A 3MC2A 2XXIA 3THIA 1GVCA 3AXFA 2PBWA 4Q5TA 5CM6A 2ALUA 2E1SA 3DM0A 4PE5B 4DXBA 2OJTA 1LLSA 4I1DA 4X1DA 3IOVA 3IOUA 2NUVA 5I56B 2VGQA 1BIYA 1CE2A 5I2NA 3SEWA 4JWOA 2O1LA 4G68A 3R7XA 1UIUA 3OXNA 5L9OA 3VVEA 2BJJX 3ODBA 2QS1A 4ELPA 4PP0A 5TPAA 4GIZA 2UVJA 1MQIA 2ONRA 4M4GA 1NKXA 4KCCA 3CFXA 1MPCA 4YKKA 1MXUA 5IKBA 2O6AA 3USDA 4F3PA 4ESWA 4IO7A 5F7VA 1PEBA 3QUJA 2HZKA 4OEVA 2G29A 4YMAA 4H5GA 3PD9A 2IEEA 5CMKA 1LAXA 4ELRA 2REJA 3DP6A 2I58A 4H1XA 3TTNA 3UA8A 1PB7A 3K0VA 5BWJA 1M5EA 2DS9A 3MBPA 2QS2A 3C35A 1LFHA 2XXVA 5A5XB 1R1NA 3FXQA 3G3KA 1LAGE 3O66A 1GGGA 2HQ0A 3K6VA 5M2VA 2ZYOA 3EHUA 3TQLA 4KYDA 1UTBB 4JSOA 3UORA 1FTMA 3T9HB 5ICQA 3VLUA 4TQUQ 4LQ2A 2ANJA 3EF7A 3HHFA 3PPNA 4IO2A 4MLVA 2DXRA 1R9QA 4MFIA 1R9LA 2R71A 1QW0A 1B51A 3KOSA 4U23A 3W9VA 3C33A 1Q1KA 1VFEA 2XXWA 2XXQA 1MG1A 4K3FA 3S2VA 1DTGA 2HEUA 3HHGA 1HSEA 2YLNA 2XD3A 1P1WA 5AE4A 4ZECA 4OESA 5DEXA 4MH5A 5DVFA 1XS5A 2QS3A 1ZU0A 1DOTA 1MQGA 5CMBA 1QUJA 4UACA 3FJGA 4ZEKA 4F3BA 3PUXE 2I4CA 4YMBA 1IUDA 4ND9A 2HCAA 1LBCA 4JWYA 1JQFA 3RTFB 3Q28A 4BLAA 3F11A 4KHZE 2AL5A 3K1MA 4OFLA 3M8UA 3KGCA 1OVBA 2F6GA 2HXWA 2OCUA 4C0RA 3S9NC 4IGTA 4RK2A 4AQ4A 3T22A 1A7LA 1MM6A 1NNTA 4U4XA 3S4UA 1M5BA 1PB8A 2DWIA 4GXAA 2FA7A 1LFGA 1B52A 1KWHA 5IAIA 4FEDA 1SVXB 3ZKKA 3S9LC 3JYRA 1JEVA 1DTZA 5KDTB 3KZGA 4FECA 4RXLA 3IJOB 1D4NA 4R6HA 4DCYA 5K2XA 3OEMA 3K2DA 1AL3A 2NVUB 2Y7PA 1US4A 3IO6A 4EXKA 2DVZA 3RNNA 5EHSA 5ICTA 4F2OA 1RYOA 1Y9UA 1QKAA 3WAEA 4PFYA 3CG3A 3K6XA 4LUBA 1A99A 4ONYA 5CBSA 2XXHA 5I57B 2VP1A 3U1OA 1LBBA 3RT8A 2H4IA 3TAJA 1B3EA 3M3LA 3SEYA 2ZMBA 3QUFA 4OEUA 2DWHA 2Q89A 4H0WA 3T66A 1I6AA 4U1ZA 5CBRA 2F97A 4ELQA 1IQ7A 3U8QA 3SKPA 5H8NA 1BLFA 1FQDA 4GF8A 3ZKLA 2O1MA 4L17A 3IR1A 3VXCA 4YKPA 3H6UA 2B3FA 2P2AA 2F35A 4KQPA 4ZS9A 1MH4A 3QYTA 3LBSA 4N6PA 4RA1A 5DYHA 1JVXA 1GTKA 4NF5B 5DTBA 2ZYMA 4DDDA 4OTEA 4QFLA 2Y7IA 4H5FA 4QFKA 3LSXA 5H8FB 2CZLA 3ZSFA 2F34A 2I3WA 2DQVA 4FIMA 5EYFA 3KN3A 2O7UA 1LSTA 4QSEA 1AIVA 1Y1MA 3JV9A 3EN3A 3A09A 3MPLA 5I2KB 2RF1A 2XXTA 3SESA 3UIFA 4R9GA 3OEKA 1NH8A 3VE1B 1ANFA 1LB9A 3GLBA 5I56A 3MZ9A 3O2AA 1D9YA 1LAFE 3T9XB 3E13X 4GL0A 3CG1A 2Y7RA 1QUKA 2PX1A 2QMXA 1FQAA 3V89B 4DE8A 3PMXA 4FE8A 1QJMA 2V93A 2I4BA 2A5TB 4QRZA 2I49A 1FQEA 4NF4B 2D3IA 5B70A 4PETA 1O63A 4RYAA 1B0HA 4GOTA 2UXAA 4EUOA 3RUMA 3PUWE 1S9TA 1MDQA 2O69A 3OELA 4G8HA 3E9XA 3QXMA 3N6UA 2QS4A 2PT1A 4GD5A 4IO3A 1ZIUA 2V84A 4P11A 1SW5A 4PFUA 1BKAA 3FZVA 2ZNUA 2DWJA 3MP8A 4FJPA 2RC7A 4G77A 4F2QA 2XXRA 3SEUA 5AA1A 1SYHA 4RPNA 1OIBA 5A5XA 3FGSA 4NEDA 4RPOA 3C32A 2O7IA 3G3IA 4GVOA 5I58B 5KCJB 1L5TA 3KN8A 1PB9A 1B05A 1QUIA 4ZEIA 3OO8A 4OHNA 2B3BA 4I62A 1UTBA 2ESNA 2UVIA 4NWDA 5LOMA 3QIMA 3EQ1A 3FJ7A 3PPRA 4IO6A 4R73A 2I6EA 1FQFA 3SEVA 2O68A 3GXAA 1JVYA 1YCJA 3VVFA 3K00A 1B1HA 3IO4A 4DXUA 1SI1A 4GFRA 3MVYA 4JXIA 4PFTA 4G68C 1VFDA 3TZAA 3W15C 2Y7WA 1ZLQA 2HFBA 4EF2A 4F1UA 1P99A 2GH9A 3C4MA 1Y20A 1JW4A 4RK9A 3HV1A 3VLVA 1DPEA 4OERA 1I69A 3OSRA 2DP8A 4I8CA 2VD3A 3P7IA 4G8NA 4GL8A 1II5A 1TWYA 1LAHE 1MDP1 3MUQA 1OQGA 1EH3A 4G4PA 5CC2A 4TLLB 3PD8A 2UVGA 4OQOA 4X9TA 2XXUA 2O51A 1MS7A 1SD3A 2GHBA 1NNKA 2Y84A 5ITOA 2A5SA 3RGYA 3V5AA 3KSJA 3O9PA 3PUVE 1YAEA 1IITA 1GV8A 3FV1A 2UYFA 2XX7A 4NMYA 4H8JA 4KCDA 4MLQA 4QFNA 4R2BA 3TTLA 4IGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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