2PX1A

Crystal structure of the complex of bovine lactoferrin c-lobe with ribose at 2.5 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title crystal structure of the complex of bovine lactoferrin C-lobe with Ribose at 2.5 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2px1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2px1A02
4F1YA 2XXWA 4NF5B 1Y9UA 4ND9A 1B3LA 1TWYA 4LVQA 3RGYA 5FHNA 3SEVA 2Z8FA 1KWHA 3SETA 1S9TA 1TXFA 1US5A 1N7XA 2HZKA 1S7YA 1WVJA 1GVCA 4IY5A 3MBPA 4ZS9A 1XHYA 3MWBA 4WKMA 4NMYA 5AA1A 4U2RA 4OHNA 3PPPA 3TUSA 2CZLA 4OMBA 4P0IA 5I84A 3K6UA 4ZEFA 5KZTA 3OO8A 2RC7A 4F1VA 1RYOA 1LAHE 1MM6A 4H8JA 3BKIB 4ZEIA 3TTLA 4QSEA 4R6YA 3E13X 4M4GA 4WEPA 1M5DA 5K2YA 4LA9A 4YKPA 1MY4A 5FTIA 3GXAA 3U72A 4KYDA 3D4GA 2F6GA 4LZ5A 3O2AA 4X1BA 2UYEA 4KR5A 1MH4A 1SDXA 3T9UA 3R26A 1P1UA 1MQIA 1MPCA 4R9GA 3HHGA 2H4IA 1N0TA 1TFDA 2IA4A 2QPQA 4JB7A 4PFTA 5AA3A 3A3UA 1N7WA 1D9VA 3DP6A 1URGA 4ELQA 5CMBA 5L9MA 3K01A 4E0WA 1R9QA 1SYIA 3GZGA 4F18A 1P1NA 1I6AA 3T9XB 2QSXA 3OENA 3CIJA 3IK6B 1AOVA 4GFRA 5M2VA 4FATA 3CSGA 3K1PA 3I5OA 3QXMA 4XKNA 3KJ7A 3H6VA 3IOVA 2D21A 4G77A 3VXCA 3TTKA 2XXIA 5BWJA 1A55A 1ZKBA 4RPOA 3TYHA 5I57B 2UYFA 1SW2A 2QRYA 2XXHA 1II5A 2DOJA 3DM0A 4JWOA 1NL5A 5HBCA 1DOTA 4PP0A 4IO6A 5H8NA 1WDNA 2DWIA 1DTZA 3H4ZA 5I58B 3T93B 3IB2A 1B7UA 4FAJA 2DXYA 1LLSA 5L8DA 3O29A 3G3HA 1MPBA 4JWXA 4KCCA 3K6VA 3MVWA 1B40A 3U93A 2RINA 4NF6A 2ALUA 4YAHX 1P1WA 1EZOA 4H0WA 2HAUA 1XS5A 5ICTA 5DVFA 5L9OA 2AYSA 1NKXA 3FIRA 1SQYA 5F7VA 1GTKA 3TODA 1Q1KA 4GXAA 1VSOA 1LAFE 3L6GA 2Z8EA 2PMSA 4QFOA 4F3SA 1ZMGA 4R6KA 4NF4B 5H8QB 2FYIA 3TQLA 2XXXA 5A5XB 4X1DA 5H8HA 4MBPA 1PDAA 3PPRA 1A54A 2UVIA 1B3GA 2THIA 4FJPA 4U4SA 4R6HA 1VFEA 2QS2A 1JNFA 3N94A 3UGWA 5I59B 2Q9TA 3E9XA 3G3GA 1TFAA 3VVFA 4C0RA 2XD2A 3K00A 1B7HA 5TPAB 1LFIA 3PMVA 3O6IA 4JSOA 4LQ2A 4U4XA 2Q2AA 1XC1A 2I0CA 1YCJA 4H6DA 3KSJA 4O3BA 4OFLA 5AA2A 1O64A 4FIMA 1FTOA 4MLQA 3W9VA 1B6HA 2HCAA 2XXYA 1HSJA 2I0BA 2W7YA 2RKMA 5IKBA 3QYTA 1SI0A 2OLBA 3CR9A 2XD3A 3WAEA 3CI8A 3IB0A 4G4PA 1FQDA 4ZE9A 3T66A 3EHUA 5ITPA 3E4RA 4IO5A 5CRYA 4KYSA 1B32A 1M5CA 3LSXA 1MXVA 2H9BA 1B51A 2NXOA 3H6UA 4NF5A 3MP8A 3B6QA 2PT2A 2R6GE 1JEUA 4RK9A 4GOTA 4NTLA 5ITOA 3PPNA 2NWJA 3C9HA 3H7MA 1ZJLA 3ODBA 1A40A 1NH8A 3Q29A 5H8FB 1R9LA 3QUFA 4L17A 1JW4A 4ECFA 1ATGA 4P0GA 1HSLA 3QAXA 4LZ7A 3PUWE 1MPDA 1BP5A 3MP1A 4R2FA 3SERA 1SI1A 2ZYNA 4KPTA 4WXJA 3MZ9A 1D3KA 1QKBA 4XKQA 1NNTA 3QK6A 1ZLQA 2R9JA 4KHZE 3VLWA 3FXQA 4YU0A 4HCYA 3H6TA 1PB8A 4FEBA 5JTYB 3UORA 4PETA 4NF8A 5FHMA 1JQFA 4GWOA 1SYHA 3U92A 5EYFA 4OYVA 4LUBA 3MP6A 2V3TA 1PBQA 4U22A 2ZNSA 1AIVA 1JEVA 3IB1A 2XXUA 4U1OA 3R6UA 1B4ZA 3TMGA 3TCFA 1BTJA 5FHOA 1EZPA 3QIMA 4EXKA 4F3PA 1MH3A 2HEUA 3ZS6A 3PV0E 3TKDA 1LFGA 1MM7A 2DQVA 3EQ1A 3QSLA 5H8SA 3OXNA 3ZSFA 1R1NA 3CG1A 3KN8A 4FORA 1B46A 1ANFA 3VV5A 4IO7A 2OK2A 3TPAA 2DE2A 4KD5A 1MQGA 3OO9A 3N5LA 1Q35A 3O6HA 4BDRA 1SW1A 2O1LA 2G93A 4U1ZA 4QFNA 4BLAA 4C1TA 3IO6A 2DWAA 1FW0A 3LSWA 3MZ1A 4PFWA 3RPWA 1LBBA 1URSA 4X48A 2F7CA 1B52A 2RF1A 4RY1A 1OLAA 4ZZEA 2XXVA 3ILUB 2ZYMA 3UK4A 2YPNA 5TU0A 4TLMB 1GGGA 4YICA 1Y4CA 2I48A 4QHQA 1CE2A 1QJMA 3O6GA 3MQ9A 1QW0A 4G68B 4JBZA 1LB9A 4BDOA 2VGQA 3PUXE 3F11A 5KDTB 4F3GA 4ELOA 4GF8A 4H67A 4YKKA 4GQOA 4M1VA 2ESNA 4BDQA 4LZ8A 4HS7A 4BDNA 1DPPA 2Q89A 5CBSA 3K2DA 4ESWA 4NF4A 2F97A 3K6WA 1PC3A 5AA2D 2DWHA 1DTGA 4KFQA 3CRBA 4XXUA 5LOMA 1UIUA 1OLCA 3M3FA 4YZZA 3OD7A 5I59A 3O9PA 1EU8A 3K0VA 5I2KB 5CMKA 3G3IA 5TPAA 1RKMA 3KOTA 3HCQA 1Y1MA 1USYE 3ZKKA 2V3QA 4F22A 3TTNA 3VVEA 5DVJA 3SKPA 1A99A 3MW0A 1Z7ME 4IGTA 5I2NB 2F8DA 2H98A 3OO6A 1LAXA 2ZNUA 2WKYA 2XXTA 4OESA 4MFIA 4G68C 5TP9A 2LAOA 3LR1A 2ZMBA 1MY2A 1JETA 2Y7PA 1IUDA 1NH7A 1I69A 4DCXA 4YMAA 3FVNA 1LBCA 3B6WA 2NVUB 1N3WA 3IX1A 1PEBA 4YB7A 2GRVA 4H5GA 3B7DA 3FD3A 3KGCA 3UP9A 2O7IA 5IAIA 5BUUA 2P0SA 4ONYA 4JDFA 3TTMA 4JSDA 1B5JA 2HZLA 4NE4A 3TFLA 4ZECA 4KCDA 2A5SA 2Y84A 3OO7A 2QMWA 3EN3A 1UQWA 1QKAA 3OEMA 1FTLA 4ZEKA 4BDLA 1MY0A 2QS3A 1OMPA 2ZYOA 3KFMA 1UTHB 1XT8A 3HN0A 3SEWA 1LCTA 5H8FA 4PFUA 3MUQA 5K2XA 3RN8A 4DDDA 2O68A 3M3KA 2QL3A 2QS4A 3W15C 1MXYA 3TCGA 1QULA 4DE8A 1IIWA 2F7BA 4E0XA 2OJTA 2G29A 4H5FA 3TQWA 1Y3NA 4LP2B 5F1QA 4XTCQ 4OXVA 4F19A 1DPEA 4OEVA 2FNCA 4WEDA 1B05A 1R6ZA 2B3FA 3HHFA 2PT1A 4GL0A 4EUOA 4F31B 2I3VA 5JK4A 1LB8A 3KN3A 2HAVA 4F39A 2ZNTA 1MS7A 3S4UA 1Y1ZA 2IEEA 4N07A 3MVZA 3MC2A 2V84A 3CVGA 4IO3A 4QSDA 1FCKA 4UA8A 5ICQA 3V83A 3TTRA 2OZZA 2O6AA 1I6BA 2RC9A 4G2ZA 4QFPA 2O51A 2DSFA 2QS1A 3AXFA 1RYXA 1FTJA 4AQ4A 1O7TA 1BIYA 1WODA 2OBGA 3SEXA 4R72A 4I8CA 2AIXA 1AMFA 3MPLA 3JYRA 5CMMA 3GBAA 1ZTYA 3TEPA 5EHSA 2QMXA 4LONB 3FXRA 3H3GA 4F29A 1A8EA 1YPNA 1J1NA 2AL4A 2XXRA 2DP8A 3FVKA 4NWCA 3MJNA 3RNNA 2F6PA 1LSTA 3H03A 3EHSA 3W9WA 2Q88A 4NEDA 5DEXB 4BDMA 4FECA 4EXLA 1B3HA 4DXCA 5AE4A 4RPNA 2E1SA 1M5BA 3PMWA 4UACA 1M5EA 3C32A 3JZJA 2P1SA 2RC8A 1H76A 2Z8DA 4EQ7A 2B3BA 4H1XA 3PD9A 1NNKA 4OERA 2D5WA 4QFLA 4RA1A 2RCBA 2A5TB 4OFOA 4XIGQ 3N6UA 2PX1A 1TT1A 3USDA 1UTBB 2ZYKA 4AB5A 4IY6A 4F2OA 2GFEA 3IORA 1EZ9A 2GH9A 4POWA 1Y3QA 2ANJA 3DP8A 1POTA 4PFYA 3MAMA 2F35A 1USYH 4R75A 5L9SA 2OWSA 4OVJA 1B1XA 3LSLA 3WAFA 1MDP1 1PB9A 1GV8A 1MXZA 2DWJA 1JVXA 3VXBA 3V89B 2KLFA 3G7WA 2F7AA 2ONSA 3S9MC 5H8HB 5I2KA 2XXQA 3R7XA 5DT6A 1ZIUA 3IOUA 1VR5A 3S9EA 3FV1A 3QUJA 3FXUA 2I49A 3IOWA 2ONRA 1AL3A 1P99A 1B9JA 2Y7RA 3SEYA 3H6WA 1OVTA 1OQGA 1FTMA 3VFJA 2Y7WA 3PGFA 4YMBA 1IQ7A 4R73A 3OSQA 3S2VA 3UN6A 3GBBA 1NFTA 4YB5A 3U1OA 3T9VA 4P11A 5EHMA 2I6EA 1URDA 4IO2A 4OETA 4QRZA 4U21A 4DXBA 1PBPA 4N13A 2I58A 5B70A 1IXCA 3IO4A 1MQHA 4ZZAA 4POXA 2VHAA 4F2QA 3Q26A 3FGSA 2H99A 5I57A 4AB6A 4XKPA 4C1UA 2NOOA 1P1QA 2DXRA 1JW5A 1XVXA 5ISUA 1SW5A 2NUVA 5I58A 1FTKA 4X9TA 4YKJA 1ZBMA 1BKAA 1B1HA 4OTEA 3CG3A 1LAGE 1F9BA 3VVDA 1SBPA 3VE1B 2B65A 3C35A 1UTHA 4R2BA 2VP1A 3V8XB 1H45A 2HXWA 3OSRA 3SESA 3PUVE 3HPIA 1VFDA 3U8QA 3I3VA 4KYEA 3RT6B 3U94A 4EF2A 4F1UA 3FJGA 4JWYA 4Q8RA 3Q25A 1XOCA 4HCWA 2PBWA 1ZU0A 2HFBA 2Z22A 1SVXB 2XXPA 1SD3A 1I6QA 1N3XA 5H8QA 3G3FA 2R71A 5A5XA 1CB6A 3TDJA 4DLDA 2XX7A 1FQCA 4ZEDA 2F5XA 2HQ0A 3O97A 1MQJA 1B0LA 4G8MA 3G3KA 2Y7KA 3M3LA 3UIFA 1OQHA 2O84X 3CFLA 2VD2A 2DS9A 3DP4A 3G3JA 3ILTB 2X26A 1SW4A 3IOTA 3KEIA 2REJA 3PU5A 4FE8A 4NF8B 1MY3A 4KI0E 2GHBA 4I62A 1AH5A 4GLIA 3PUYE 3KSXA 1A8FA 3EPEA 1OVBA 5HM4B 4H8IA 2M8CA 2DE3A 3VLVA 5DYHA 1FQFA 3KBRA 1LFHA 1B0HA 3A3CA 3PMXA 4RXLA 1D4NA 3FJMA 2XHDA 2I3WA 4OFJA 3C34A 5DTBA 4GL8A 4RJZA 3TZAA 1IXHA 3S9LC 3Q28A 5AA4B 2F36A 5I56B 1PB7A 1VE4A 2QJEA 3KN7A 2ZXTA 4RYAA 1MXUA 4MF3A 4TLLB 4OQOA 1MY1A 1HSEA 3MVXA 2O7UA 1DMBA 3ECRA 5JEIA 1MQDA 1P1OA 5DEXA 2PYYA 3HV1A 3C4MA 5KCJB 4OZ9A 3FJ7A 3RY3A 4ESXA 3O66A 4QF9A 4Q30B 3MZBA 3T96B 1B5HA 4PQJA 3N6TA 4TOZA 1N84A 2REGA 3HO7A 1Y20A 2YJPA 2OCUA 1IITA 3RQTA 4EF1A 4DIGA 2A5TA 1O63A 3RUMA 3UA8A 4EDPA 1Y4TA 4EQBA 1UTBA 1QVSA 3RTFB 1QUJA 3GLBA 3BFUA 2GHAA 2AL5A 3HSTA 4ZEBA 3C33A 3TELA 3FVOA 5FTHA 2RCAA 1B3FA 4R9FA 3IJOB 4IB2A 4QFKA 5JTYA 2I4BA 5CBRA 1YTVA 3L6HA 3IL1B 1DSNA 1H44A 3K02A 1A7LA 4EQ9A 1MRPA 3O28A 2O69A 3ONMA 4R74A 3EHTA 3IJXB 3LBSA 3FUZA 1T0KA 3LUYA 1MXWA 4IO4A 3RTWB 4YKIA 2F34A 3I6VA 4XKRA 2FA7A 3KZGA 4G8HA 2PVUA 3K1MA 3E3KA 1OIBA 2DYXA 1GR2A 1B4HA 3A09A 3TAJA 3FV2A 4ELPA 3KG2A 4ZDMA 4Z0IA 4YB6A 2XX8A 2V3UA 5CC2A 3VLUA 4OEUA 2F78A 4MH5A 1IEJA 4O3CA 2Y7IA 3H06B 3K4UA 1IXIA 4F3BA 3Q27A 3K1NA 2V25A 3OOAA 1US4A 5CI5A 5TP9B 1JW1A 1S50A 1H3DA 3IAZA 4QSCA 4MLVA 1Z7NE 3OELA 4ISUA 1Y3PA 1B2HA 1B5IA 4ZE8A 4GVOA 1EH3A 4TQUQ 1B3EA 4I1DA 1BLFA 3FZVA 3JV9A 1MXXA 1N04A 3ZKLA 4FEDA 5J1DA 4LATA 3D4CA 4GIZA 3P7IA 1MG1A 1LCFA 4RK2A 5CMCA 2V93A 2VD3A 4Q5TA 5DVIA 1JVYA 4G68A 4O3AA 4ELRA 5H8NB 3CFXA 2DVCA 2E0SA 3DLNA 3MVYA 5KDTA 3IR1A 4IGRA 4K3FA 2ABHA 4OWDA 4U23A 3FATA 4NF6B 3PPQA 1YAEA 4THIA 2BJJX 2ONKE 2DE4A 4GRKA 3BFTA 2XX9A 1QUIA 4GXSB 2Q8JA 4Q0CA 4N6PA 2H5YA 1FQAA 3PD8A 2VOZA 4I9DA 2Q2CA 1FQBA 3DELB 4G8NA 4LQ5A 4OENA 3M8UA 2X7PA 3C36A 2X7QA 3CSBA 1N76A 1QUKA 2I4CA 2UXAA 4DXUA 3LC8A 1B7ZA 1ELJA 2YLNA 4DZ1A 3K6XA 2O1MA 1M5FA 3LSFB 4PE5B 3N26A 5I2NA 2UVHA 5CM6A 3S9NC 2H25A 2DVZA 3MPKA 1B58A 3B6TA 3TCHA 3C31A 3RT8A 3BBRA 1NMUA 1NNFA 2UVGA 5B7DA 2P2AA 5AA2B 1FQEA 1NNPA 4KQPA 3PUZE 3EF7A 5ELVA 5AA4A 5I56A 4JXIA 4DCYA 3V5AA 3T22A 3KOSA 1XVYA 4Z7EA 4HTGA 2CMOA 1LGBC 3FASA 3SDFA 1UIVA 1D9YA 3FVGA 3THIA 1POY1 5HPQA 1L5TA 2D3IA 3KJTA 3PPOA 4GD5A 3RLFE 4HW8A 2OWTA 1H43A 5KCJA 1MDQA 3T9HB 4RNSA 3OEKA 3OMBA 4NWDA 2UVJA 2Z23A 3CFZA 1IZ1A 1IXGA 3SEUA 3VDFA 4H65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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