1SD3A

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with 2s,4r-4-methylglutamate at 1.8 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A02
5L9OA 1RYXA 4F31B 3DLNA 2RF1A 3IO4A 4YB6A 2ONKE 2F35A 4G68C 5TPAA 4H1XA 3QUFA 2O6AA 3TAJA 4Q0CA 4XKQA 3GBBA 1PEBA 5EHSA 4POWA 1YAEA 5JEIA 2O51A 1JQFA 1SI0A 1QW0A 2NXOA 1SYHA 3SESA 2Y84A 1B5HA 2CMOA 3ILUB 4BDNA 5HPQA 3AXFA 3I6VA 4NF8B 4TOZA 5FTIA 3MVYA 3W9WA 4OTEA 1US4A 4JDFA 5TP9A 4FJPA 4PETA 3FATA 3FJGA 3TTRA 3G3FA 1LB8A 2QS2A 1H43A 1QJMA 1SDXA 4FE8A 5H8HA 3H3GA 5HM4B 4C1UA 4NF5A 2XD2A 1JEVA 1I6QA 1A7LA 3HSTA 5CMBA 1M5DA 3TTMA 1IITA 3C35A 4ECFA 4GOTA 3F11A 2XXPA 5JTYB 3P7IA 1A99A 2B3BA 3EHSA 4EQBA 1MY1A 3G3GA 1DSNA 4LA9A 4IY6A 2R9JA 4E0WA 5KCJB 1JEUA 1LB9A 4GXSB 3K0VA 4KYSA 2XXUA 4F1YA 1MS7A 3RLFE 5ICTA 1B0LA 1ZU0A 4EDPA 2B65A 2F34A 2VGQA 4C1TA 3CIJA 4GQOA 3CG1A 1A54A 2F36A 2DWIA 3E4RA 3C34A 1S7YA 2OBGA 3C33A 3R6UA 2I6EA 3OENA 4JBZA 1A8FA 1B32A 2NOOA 4LQ5A 4R9FA 4DCYA 3UIFA 1N7XA 3MJNA 3Q27A 4NF6A 1Y1MA 4H65A 4NF4B 1POY1 2UYEA 4RA1A 5CRYA 2VD3A 3VDFA 3IOWA 3D4GA 4O3BA 2H25A 3H6UA 4U4XA 3G7WA 2QL3A 3H6WA 4TQUQ 1DPPA 1GGGA 3SEWA 4KFQA 3FUZA 5DVIA 2F7BA 2F5XA 2RCAA 4LZ5A 5JK4A 4TLMB 4O3AA 1URDA 5H8SA 4BDLA 4WXJA 1H44A 1MG1A 4EUOA 1CB6A 1SVXB 4ISUA 1UTBB 1B0HA 4QSEA 5EYFA 3CRBA 2FNCA 2XXHA 1HSJA 4EXKA 3KBRA 2M8CA 3IR1A 4RXLA 2XXWA 1FQCA 2ONRA 4G8HA 5I57A 2DWAA 3DP4A 5H8NA 4BDQA 1XHYA 4ZEDA 3MVWA 4U22A 1USYH 2QRYA 1MXXA 4LONB 5TPAB 3KZGA 3O28A 1LAGE 2LAOA 1MRPA 3IOVA 1Y3PA 4OZ9A 4POXA 3OSQA 5DYHA 1PDAA 1MPDA 1WVJA 2Q8JA 3PPQA 4YKKA 2F6PA 4YAHX 4ZZAA 4DZ1A 2ZMBA 1LCTA 1BIYA 1Y4CA 1N7WA 3U93A 2I58A 3N6TA 2GHBA 3SDFA 2H98A 3IX1A 2REJA 1N04A 2F7CA 3BFUA 2H5YA 5EHMA 4F1VA 1MQIA 1FTLA 3KN3A 5TP9B 3EF7A 4F3PA 2Y7RA 2UVIA 3RT6B 2I0CA 3IAZA 1XVYA 1QUJA 2PBWA 4FECA 3CSGA 4NWCA 4R73A 5H8HB 4ELPA 4ELRA 2P1SA 3MP8A 3O6IA 1GV8A 3T66A 3IORA 1IEJA 3IO6A 1NNTA 5L8DA 2ZNSA 4MF3A 1YPNA 1UIUA 4OEVA 1JVXA 1B3LA 3UA8A 2HQ0A 3CR9A 4X1BA 2QMWA 1MY4A 3IJXB 4XKRA 3O6GA 3TQLA 4H67A 1XOCA 3PMWA 2ZYOA 1SQYA 1WODA 4R2FA 1I6AA 2DP8A 3ZKLA 4ZEBA 2UVGA 2QS1A 2REGA 1B7UA 1OQGA 4M1VA 3I5OA 5ELVA 4WEPA 2P0SA 3VFJA 5JTYA 1O64A 5I84A 3GBAA 1IIWA 1AH5A 4NF6B 1Y20A 1JW4A 1QUKA 3C32A 4X9TA 4IO4A 4I1DA 2Q88A 3UN6A 2ESNA 1FQAA 3GZGA 1PBQA 3EHUA 4THIA 3SKPA 1R9LA 4BDOA 3Q26A 1Y1ZA 4ZDMA 3UORA 4F1UA 1P99A 4F3SA 5KDTA 1GVCA 4YMBA 3TTLA 2GFEA 4U1ZA 5F1QA 4OESA 4R2BA 1D4NA 2AIXA 3OMBA 3VVEA 4E0XA 1PB7A 1MY3A 3D4CA 3ZKKA 4LZ8A 3N94A 4LZ7A 2OJTA 3MAMA 1H3DA 4XKPA 3TELA 4AB5A 5I57B 4KYEA 2ABHA 4Q5TA 3FVKA 2UXAA 1LAXA 1MM7A 1MDQA 2PYYA 4HCWA 1L5TA 4Q8RA 3MPLA 4KYDA 3MPKA 3U94A 3PMVA 1ZLQA 4ELQA 4G8MA 3KOSA 2GRVA 3PD9A 2Y7PA 4DLDA 1UTBA 2HCAA 3CVGA 2I4CA 2VP1A 4GL0A 3R26A 3OO6A 1N3XA 2YPNA 4UACA 3TEPA 3KN8A 1SBPA 3KSXA 2X26A 1FQFA 3PUWE 1BLFA 1EZ9A 2UVJA 3E3KA 2X7PA 1B3FA 3ZS6A 3B6TA 5KZTA 1B58A 2PT1A 3OEMA 4XIGQ 4KR5A 1AOVA 4QSCA 2HZKA 4F2OA 2O7IA 3RT8A 3SETA 2I3VA 4N13A 2IEEA 3H4ZA 5H8QB 1NL5A 2ZNUA 2DE2A 2I3WA 1VSOA 4PP0A 3T9VA 4R72A 5IKBA 4QSDA 4GWOA 3EHTA 3FXUA 4IGRA 3FVOA 1IZ1A 3HCQA 4U2RA 2ALUA 2F78A 3FJ7A 2R71A 3PUXE 1A55A 2V25A 3FV2A 1DTZA 2ZYMA 3T9XB 3S9LC 3O9PA 1H76A 5L9MA 1ZTYA 3U8QA 4I9DA 1XT8A 5DT6A 2Z22A 1ZBMA 1NNFA 1FQEA 1LCFA 2O1MA 3B6QA 3CFZA 4F3GA 4MBPA 4DCXA 3OD7A 2G29A 4ZEIA 3VVFA 5HBCA 2DVCA 4R6HA 1MXVA 1Q1KA 1I6BA 4UA8A 2OK2A 3L6HA 4MFIA 3TKDA 3MZ1A 2Z8EA 3MP1A 2DXRA 5CC2A 2NWJA 1GR2A 2Y7WA 5AA3A 4JWYA 1EZOA 4OFJA 2ZNTA 3S9MC 3IL1B 3K6WA 4ZS9A 4RJZA 4M4GA 3MZ9A 1GTKA 4F18A 5KDTB 4K3FA 3UGWA 1AL3A 1MQDA 3N26A 5F7VA 2UYFA 3RN8A 3S2VA 1B3HA 2AYSA 4HCYA 2V3UA 1A8EA 2Z8FA 3KG2A 3OO8A 2QMXA 3VLUA 5CMMA 3MP6A 1IXGA 1DOTA 2ONSA 4YMAA 3H6TA 3G3KA 5I2KA 4GXAA 2BJJX 4RPNA 2XX8A 3TODA 2I0BA 4G68A 4H8IA 3DELB 1FTJA 3EN3A 2D5WA 4QRZA 2VOZA 3TPAA 3CFLA 4R9GA 3FASA 5CMKA 3QAXA 1B7ZA 5I58B 5ITOA 3S9EA 3QUJA 4GD5A 4F22A 3PPPA 1URSA 1JW5A 2D3IA 5FHOA 1JETA 4YZZA 1OIBA 2OCUA 1IXHA 2CZLA 3LSWA 4X1DA 2I49A 3SEVA 5FHNA 1NNKA 1TFDA 1UTHA 3PPNA 1MPBA 3A3CA 3G3IA 3K4UA 1NNPA 3OO9A 3DP8A 3S9NC 5AA4A 4PFUA 4R74A 1FTMA 3H03A 4IO3A 3U92A 1JNFA 4LATA 3IB1A 4G4PA 4JWOA 4JSOA 1N84A 3C9HA 4OMBA 1FQBA 4YB7A 4RYAA 2ZYNA 1MH3A 4OFOA 1XC1A 4U4SA 2GHAA 2XXQA 1HSLA 3K02A 1MXWA 4MH5A 1B6HA 3LSLA 3IOTA 3KFMA 5L9SA 1P1OA 3T9HB 1B9JA 4GL8A 4L17A 1N76A 3EPEA 1I69A 1P1NA 2Z23A 1J1NA 1WDNA 1LGBC 1FQDA 3PPRA 3M3LA 4KCCA 2Q9TA 1OVTA 1MQJA 4XKNA 3RUMA 1UIVA 1A40A 5CBSA 4Z0IA 5IAIA 5I2NB 3OEKA 2XXTA 3N6UA 4EQ7A 2PT2A 2HXWA 2D21A 3IOUA 5H8QA 2DWJA 4IO6A 4KQPA 3CG3A 4PFTA 3SEYA 1XVXA 1D9VA 3TUSA 2B3FA 3HPIA 2AL5A 1TT1A 3O2AA 4H0WA 3HHGA 4BLAA 4NMYA 1USYE 4YKJA 5I56A 3Q29A 3VXCA 1B40A 1TXFA 4R6YA 3WAFA 4ZEFA 3BBRA 4FORA 1B3GA 3V83A 3RTFB 4PFYA 1NKXA 1PBPA 1R9QA 3IK6B 3QYTA 1NFTA 5M2VA 2V3QA 5B7DA 3HHFA 2X7QA 4PQJA 3Q25A 1OVBA 4FEBA 1YTVA 1B5JA 2DE4A 2RC7A 2H99A 3TYHA 3PMXA 5I2KB 3K6VA 1SW2A 1R1NA 1SW4A 3RTWB 4O3CA 5AA2A 4JWXA 1M5CA 4DXCA 4G68B 2F8DA 4NE4A 3PUYE 1LLSA 4FIMA 3M3FA 3DP6A 2QPQA 1TFAA 2E0SA 1B51A 3LUYA 4GFRA 1MY0A 1O7TA 3MWBA 5AA2D 1M5FA 4F39A 1EZPA 4OERA 4IY5A 1YCJA 1FCKA 3C36A 4MLVA 3FXRA 3L6GA 4LVQA 2R6GE 3T96B 2DQVA 4LUBA 2HAVA 4F19A 3TTNA 1UTHB 3HV1A 2HFBA 3K1PA 4GF8A 1EU8A 2HAUA 3TCFA 1SW1A 4QFPA 4ZE8A 5AA4B 3N5LA 3V8XB 1SW5A 2A5TB 1II5A 3HN0A 4H6DA 3VVDA 3C31A 1B3EA 5I58A 4XXUA 3IB0A 4I8CA 4G77A 3M8UA 1B5IA 4NEDA 4U23A 4OQOA 5BUUA 5J1DA 3PV0E 2V93A 1DMBA 1VFEA 3TZAA 2XXRA 2XXIA 4YKPA 2DWHA 4ZEKA 1OMPA 4G8NA 3LR1A 1MQHA 2PVUA 2KLFA 4QFOA 5ISUA 2A5SA 3RQTA 3K1NA 4ELOA 3RY3A 1B4ZA 2V3TA 2HEUA 1ELJA 3CFXA 4KI0E 4IO2A 5DTBA 2XX9A 1VFDA 3T22A 4F3BA 5B70A 1M5BA 1URGA 3MW0A 1RYOA 1PB9A 2DE3A 1LAFE 3C4MA 2O1LA 1QUIA 1NH8A 2O7UA 3R7XA 2Y7KA 1SD3A 3KJ7A 1D9YA 3MZBA 1MDP1 1MH4A 3ECRA 3G3HA 5DVJA 4IGTA 1B46A 3OOAA 4Z7EA 3OXNA 1Z7NE 2FA7A 1SI1A 3ZSFA 4EF2A 5I56B 1ZJLA 3H06B 4H5GA 1HSEA 5H8FA 4C0RA 2H4IA 5I2NA 3MBPA 2O84X 4GVOA 1VR5A 1S9TA 4OXVA 4RNSA 3LBSA 4OWDA 3RGYA 2DS9A 4H5FA 3MVXA 1XS5A 2XXXA 3Q28A 1N3WA 2THIA 3O29A 4GIZA 3H7MA 4DE8A 3U72A 2RINA 2RCBA 2E1SA 3QXMA 4FATA 4DXUA 3FD3A 5FTHA 1LFIA 1US5A 3PPOA 4P0IA 4YICA 4ONYA 2QS3A 5AA2B 4WEDA 2OWSA 2PX1A 3RPWA 4YU0A 3GLBA 3K6UA 1F9BA 4KD5A 1EH3A 1MPCA 1POTA 3T9UA 5BWJA 3O66A 2NVUB 4KCDA 4NWDA 1BTJA 1NMUA 1P1UA 4MLQA 1ZMGA 3WAEA 3PUVE 2OLBA 1IQ7A 4DIGA 4OETA 1B1HA 2RKMA 2XX7A 2RC8A 4ESWA 5CM6A 2NUVA 4KPTA 3PD8A 1DPEA 2XXVA 3BKIB 5AE4A 1B05A 1TWYA 3UP9A 1JW1A 4QFKA 3O6HA 3KOTA 5DEXA 5K2YA 4IO5A 3ILTB 3FGSA 4QFNA 1CE2A 4OFLA 4I62A 3IJOB 1LBBA 1Y3QA 4BDRA 3HO7A 1PB8A 4OENA 3TTKA 3JV9A 1Y3NA 1Q35A 5CMCA 5A5XA 1B4HA 2O68A 4BDMA 1B52A 5I59B 3E13X 1MXUA 4GRKA 4R6KA 1Y9UA 4YB5A 1IUDA 1QKAA 5LOMA 3FV1A 1B7HA 2XXYA 1LSTA 3A3UA 4HS7A 1FTOA 3KN7A 2A5TA 3K6XA 4TLLB 2F6GA 3KJTA 4GLIA 1AIVA 3TMGA 2HZLA 3VLWA 1BKAA 1OLCA 3B7DA 2VHAA 4F2QA 4ND9A 3EQ1A 4ZECA 2WKYA 5DVFA 1UQWA 1T0KA 2YJPA 3B6WA 3VXBA 4OVJA 3O97A 4IB2A 1JVYA 3FZVA 3K2DA 3TCHA 4EF1A 3FVGA 1MQGA 3JYRA 2O69A 4EQ9A 2Q2CA 4RY1A 4ZZEA 4FEDA 2FYIA 2AL4A 1ZIUA 3GXAA 3K1MA 1KWHA 3OSRA 4FAJA 3PGFA 4RK2A 2OWTA 2DYXA 1P1QA 3MQ9A 3PUZE 1LBCA 2YLNA 5H8FB 4G2ZA 2QSXA 4LP2B 3M3KA 4KHZE 4ESXA 4PE5B 4YKIA 1FTKA 4HTGA 3KGCA 3TFLA 2G93A 2IA4A 3MC2A 3A09A 1NH7A 2PMSA 2QS4A 1B2HA 1D3KA 4N6PA 4AQ4A 3OO7A 1QULA 3QIMA 3E9XA 5FHMA 3SEXA 3VLVA 1H45A 4PFWA 1DTGA 3W15C 3ODBA 4OHNA 4NF5B 3K00A 3KSJA 5ICQA 2ZXTA 1ZKBA 1MXZA 1MY2A 3VE1B 4NF8A 3U1OA 1AMFA 1LAHE 1Y4TA 1ATGA 2F97A 2VD2A 3QSLA 4P0GA 1OLAA 1RKMA 3V5AA 1R6ZA 4ZE9A 2I4BA 2W7YA 4P11A 4R75A 4X48A 4QHQA 2H9BA 1N0TA 1P1WA 2DVZA 4XTCQ 4N07A 5K2XA 3RNNA 1FW0A 3BFTA 2I48A 2OZZA 2Q89A 2QJEA 3UK4A 4WKMA 4LQ2A 2DOJA 5KCJA 3FIRA 3MUQA 4RPOA 4RK9A 1PC3A 4EXLA 1MXYA 3JZJA 4JB7A 1ANFA 2Q2AA 2F7AA 3PU5A 3LC8A 5DEXB 1OQHA 2Y7IA 5AA1A 3G3JA 3LSXA 3CSBA 3FVNA 3W9VA 1S50A 4F29A 1MM6A 3CI8A 3H6VA 1IXIA 3THIA 3TDJA 4Q30B 3V89B 2RC9A 2GH9A 1SYIA 4IO7A 5A5XB 3KEIA 3K01A 3DM0A 4NF4A 2V84A 3VV5A 4QFLA 5ITPA 1B1XA 3I3VA 3USDA 4OEUA 4U1OA 1QKBA 4U21A 2ZYKA 2XHDA 3FJMA 3LSFB 3T93B 5CI5A 5H8NB 3SERA 3TCGA 1LFHA 3QK6A 1VE4A 1M5EA 1QVSA 4DXBA 3TQWA 4JXIA 3S4UA 2ANJA 3ONMA 4DDDA 4JSDA 4QF9A 2P2AA 4H8JA 2DSFA 3OELA 2UVHA 2DXYA 5I59A 4NTLA 1LFGA 3IB2A 1BP5A 3MVZA 3FXQA 2Z8DA 5TU0A 5CBRA 1IXCA 2XD3A 4OYVA 1Z7ME 4AB6A 1O63A 3SEUA 4HW8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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