1SD3A

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with 2s,4r-4-methylglutamate at 1.8 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
b'NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A02
3VXBA 1OVBA 3LSFB 3UIFA 4G68B 4OHNA 2VGQA 3R7XA 1GV8A 1TFDA 4AB5A 4KYEA 5CI5A 4G68A 1VFEA 5DYHA 1H45A 4POXA 4GXSB 1XVXA 1MY4A 3PUWE 3RTWB 3R26A 3IORA 4GQOA 2ONRA 1WVJA 1MPCA 5LOMA 1BLFA 1M5FA 4JBZA 3SKPA 4DLDA 2F7CA 3IO6A 2F97A 4FE8A 3IR1A 3I3VA 2IA4A 3CG3A 2XXIA 3W15C 3RLFE 3EHTA 1FTLA 1LAFE 2XXRA 1NNKA 4JWYA 4QFPA 1SD3A 2I3WA 4G68C 1MQDA 3CR9A 2OJTA 3OELA 4OYVA 3UP9A 1R1NA 3LSLA 3T9UA 3IOVA 3PMWA 2XXQA 4C1UA 4WKMA 3SEXA 1A40A 3N26A 3IX1A 2Z22A 3CFZA 3KSJA 3W9VA 3VVDA 4NF5B 4EXKA 3IL1B 3FXRA 3S9EA 1HSJA 4AQ4A 1QUIA 2DE2A 5L9SA 3MVYA 3LR1A 3KZGA 1N3WA 2REGA 1SBPA 3G3GA 1DOTA 3OMBA 1UIVA 1XVYA 2GHBA 1JEVA 2HZLA 4ZEDA 2RC9A 1URGA 2F6PA 4NF5A 4LZ7A 4DCXA 1PB8A 2XD2A 2RF1A 3U94A 1Q35A 1LB9A 2D21A 3QK6A 1JW4A 3P7IA 3V5AA 2LAOA 1XHYA 1ZU0A 4YB7A 1LGBC 1XT8A 4N13A 3RN8A 5I56B 1FTKA 1S50A 5I59A 4NF6B 3CFLA 4KR5A 4LONB 1LAGE 5H8FB 3B7DA 1B3GA 2XXWA 4F3GA 4I62A 2XXXA 3G3IA 5I56A 4I9DA 3CIJA 2UVGA 1IUDA 1QKBA 3MWBA 4NF6A 5AA4B 2ONSA 3DLNA 4OENA 5H8FA 4LQ5A 2G29A 1MXUA 3VDFA 1OQHA 4G4PA 4N6PA 5B70A 4EQBA 5AA4A 5B7DA 1P1QA 3AXFA 1II5A 4QSCA 3B6WA 5I57B 2I49A 1POTA 3RT6B 5FTIA 5K2YA 4XKNA 1Y9UA 1L5TA 5CBRA 2F6GA 2OWTA 1EZPA 1URDA 5I57A 4FORA 4O3BA 1DSNA 3MVZA 2RINA 4WEPA 2G93A 3USDA 3RTFB 4GVOA 2H99A 3LSXA 1USYH 3KN7A 2Z8EA 4C1TA 4ESWA 4GD5A 1IXIA 3PUZE 3K1PA 4FECA 4OFLA 4I1DA 1ZBMA 4ELPA 1B3HA 1JNFA 1IXCA 5TP9B 3PUYE 4BDMA 3Q27A 3C36A 3IB1A 2BJJX 4U2RA 5ICTA 4X9TA 5TP9A 1HSLA 2YJPA 3MBPA 4RYAA 3CG1A 2DOJA 1QJMA 1B58A 4ZEIA 3RPWA 3WAFA 1MDP1 4MLVA 3IAZA 1A8EA 1US4A 2Z8DA 4IO5A 4QRZA 1D3KA 2FA7A 1M5EA 5BUUA 3KN3A 4YAHX 3THIA 2DE3A 2Q2AA 3OEMA 4U1ZA 1NL5A 4I8CA 1GTKA 3K2DA 1QW0A 3MQ9A 2DP8A 3FJMA 2Y7IA 3H6UA 5JEIA 1NNTA 3OO8A 2F35A 4R73A 5JTYB 5FHMA 3C9HA 4LA9A 3MP6A 2B65A 4LQ2A 4Q5TA 4GF8A 3OO6A 4ESXA 1SYHA 4X1DA 5JTYA 1XC1A 5CMBA 3MJNA 4ZDMA 3I6VA 1B9JA 5A5XB 2F8DA 4GOTA 2DVCA 4NEDA 3RQTA 3C31A 1DMBA 3TMGA 1WODA 3SESA 1GR2A 3G3JA 1N76A 1FW0A 1OVTA 5A5XA 1MY0A 1Y3NA 3T66A 3MZ1A 4PFUA 4XXUA 2H4IA 1UTBB 3GBAA 4F29A 4OFJA 2XXVA 3IJXB 4GWOA 2HAVA 3MZBA 4KPTA 1LAHE 2V93A 4U23A 3KJ7A 1R9QA 1UTBA 3HHFA 1Y1MA 4YKKA 1ZTYA 1IEJA 1MH3A 3N6TA 2GHAA 3OOAA 3V89B 5F7VA 2UVIA 4RNSA 3TTLA 3PPRA 1N7XA 1JW5A 1BIYA 2ONKE 2R9JA 1QKAA 3TCGA 3C4MA 3OSRA 1RKMA 1EZ9A 3ILTB 4FATA 2AL4A 1B32A 3VVEA 2AL5A 3M3LA 1TXFA 5AA2D 4IO3A 4EUOA 4KYSA 1UIUA 3FUZA 2E1SA 4OQOA 1FCKA 4KCCA 4RPOA 4E0WA 4MH5A 4R75A 2UVJA 1I6QA 3LSWA 4Z0IA 1MH4A 2QS2A 4X48A 2I48A 3K0VA 1MQHA 5I58B 3E13X 1LFGA 1MXXA 2F34A 4K3FA 3EQ1A 1P99A 1B5IA 2NOOA 3K01A 4RJZA 5I84A 3TCHA 4IO4A 1MQGA 4ZZEA 5I58A 5EYFA 2ANJA 2DWIA 1LAXA 2KLFA 1VR5A 4PQJA 2CMOA 3FGSA 2PVUA 5ITOA 4F1VA 2HFBA 2ESNA 1MXZA 4ZEBA 1QUKA 1B46A 2V3UA 2THIA 3N94A 1PC3A 4OWDA 3HHGA 3IB0A 4KHZE 5H8HB 4QHQA 4QSDA 2D3IA 2GH9A 4OEUA 1GGGA 4GRKA 1FTJA 3TZAA 1LFIA 4F1UA 3LBSA 2E0SA 3MP1A 3KOTA 2F78A 4YB5A 5H8HA 1LCTA 2V25A 4ND9A 3KJTA 3U8QA 3ONMA 1FQFA 4ELQA 1AL3A 3FASA 4U4SA 1FQCA 2FYIA 4XKQA 2O1LA 2RCAA 4G8MA 1I6BA 3L6HA 3IOWA 1USYE 3K1MA 5L9MA 3VLUA 2R71A 2Q88A 1SW1A 2VP1A 4GL8A 1IIWA 3KGCA 2O84X 3H4ZA 4TOZA 4R9FA 3RY3A 1TFAA 3A09A 3TKDA 2O51A 3KBRA 2O6AA 1B3FA 1B2HA 1GVCA 1Q1KA 1ELJA 1JVYA 3HSTA 4TQUQ 1SQYA 4G8NA 4M1VA 5HBCA 3E3KA 3BBRA 3MUQA 1HSEA 4YICA 4BDQA 3K6WA 3TQLA 1OLCA 3V83A 1JEUA 3OD7A 1B5JA 2O7IA 3EHUA 3T9HB 2HXWA 5DVFA 3SEUA 3T93B 3HCQA 1BKAA 2QL3A 2DXYA 2R6GE 4NTLA 3QUJA 2XX9A 1SVXB 4F18A 4P11A 3T22A 5DTBA 4R2FA 3K6XA 2Z23A 4PFTA 4RXLA 1T0KA 1FQEA 2VHAA 3TTRA 3O66A 3DP6A 4M4GA 5CBSA 3DM0A 3PV0E 4U1OA 5I2NB 4H5GA 4LVQA 3H6VA 1EU8A 1MRPA 4P0GA 1LSTA 2VOZA 1DTGA 5CRYA 1FTOA 4F2QA 5I2NA 2DVZA 2QMWA 4KCDA 1O63A 1NH7A 3FVOA 4TLMB 4BDRA 2NXOA 2XX8A 2Q8JA 5HM4B 4DE8A 4QFLA 5AA2B 2F7AA 3CI8A 2DWAA 3B6QA 3MZ9A 1QUJA 3PMXA 3VE1B 3BFTA 3DELB 4GXAA 3M3KA 3VXCA 3SETA 2V3TA 4NWDA 5AA2A 2ZNUA 3GBBA 1BP5A 4OESA 4OVJA 3R6UA 3C33A 1NFTA 3V8XB 2Y84A 4KQPA 1P1UA 2Y7PA 4EDPA 2ZYKA 2DSFA 3MC2A 2UVHA 2H5YA 4H0WA 5CC2A 3TTNA 1Z7ME 1PDAA 4NWCA 3SDFA 2PMSA 1F9BA 2I58A 3KOSA 3O2AA 5H8QB 3RUMA 3IJOB 2XHDA 4F2OA 4IB2A 4R74A 1MS7A 2VD3A 4ZZAA 2Y7WA 3G3HA 2HCAA 5L8DA 3DP4A 3LC8A 4NF4B 5H8QA 4R72A 3DP8A 4F39A 3C35A 4E0XA 3TODA 2QPQA 2GFEA 2ALUA 4NF4A 4GL0A 3PMVA 3HO7A 4YZZA 1WDNA 5EHMA 4LATA 1OMPA 3S9LC 1Y3QA 1LBCA 1Y4CA 1O64A 4FJPA 3Q28A 4IO2A 4RK2A 4QFNA 4THIA 3F11A 3S9NC 3Q26A 5HPQA 1D4NA 5FHNA 4EQ7A 1N0TA 4G8HA 2OLBA 3O97A 3IK6B 4Q8RA 2I4CA 3PGFA 1ZJLA 1ZMGA 3QYTA 2REJA 2V3QA 2A5TB 4UA8A 3PUXE 1YAEA 2UYFA 3EHSA 3U72A 4DXCA 1B7HA 3D4GA 2ZXTA 4ELOA 4IY6A 2A5TA 1MQIA 3OSQA 1BTJA 3OENA 2X26A 1FQAA 3OO9A 4ZE9A 5DEXB 4P0IA 4YB6A 4GIZA 1SYIA 2UXAA 4U22A 4PETA 3S4UA 3FVNA 1YTVA 1MPDA 3EF7A 3CRBA 5DEXA 4RPNA 1P1WA 4UACA 3PU5A 3N5LA 1MY3A 3FV1A 4ZEKA 4BLAA 1A54A 3FJ7A 3QAXA 1A7LA 3ZKLA 4EXLA 5KDTB 1M5BA 5FTHA 3CSBA 1PBPA 1JETA 3EPEA 3OXNA 5JK4A 1DTZA 3A3UA 3PD8A 5KDTA 3BFUA 2I0CA 2QS3A 3IOUA 3SERA 1NNPA 4N07A 3FJGA 3MPKA 2PYYA 1QULA 1B0HA 3G3FA 4HW8A 3PPQA 3S9MC 1B52A 4OTEA 1LBBA 2XD3A 3TDJA 4BDOA 4YMBA 4QSEA 1POY1 3VLWA 4HCWA 2F36A 3JZJA 1LLSA 3FV2A 5H8SA 2XXPA 4G2ZA 1EZOA 2DE4A 2O68A 2ZYMA 2QS4A 4FEDA 2OBGA 4F3BA 5F1QA 4F3PA 1B7ZA 4TLLB 3E9XA 5L9OA 3ILUB 2OK2A 1AMFA 4IGTA 4H65A 1N84A 4XIGQ 5ISUA 3UK4A 3FZVA 3A3CA 3B6TA 1OIBA 3M3FA 3VVFA 1SW2A 2O1MA 4XKPA 5AA1A 2DXRA 1Y3PA 1JQFA 1J1NA 1JW1A 5IKBA 4JSOA 3K6UA 2RC7A 4H6DA 4NMYA 1D9VA 3ODBA 4L17A 2P0SA 2XXTA 2HQ0A 2I3VA 3VFJA 1UTHB 4QFOA 4DXUA 3PPPA 3GZGA 2QS1A 3L6GA 3CSGA 3SEYA 1UQWA 3ZKKA 4IY5A 3PUVE 1EH3A 5ELVA 1UTHA 2DQVA 2ZNTA 4ONYA 3TELA 5ICQA 4X1BA 4RK9A 4IO7A 4FEBA 3U1OA 4GFRA 4JSDA 2QSXA 2QRYA 4IGRA 3HPIA 2ZMBA 1B51A 3T9XB 3Q29A 2H9BA 4KFQA 1DPEA 1IXHA 4LZ5A 4EF1A 1IITA 5I2KB 1Y20A 3MAMA 2V84A 4OZ9A 2HEUA 4IO6A 3N6UA 3TTMA 3KN8A 1MXWA 2A5SA 1N7WA 4JWXA 5H8NB 5I2KA 3TCFA 5DVIA 2XXYA 3RT8A 3O29A 2P2AA 1LB8A 3HN0A 2B3FA 2HAUA 1IQ7A 5H8NA 4JXIA 4YKIA 4ZE8A 3G3KA 1RYOA 3QIMA 4F22A 1LCFA 1I69A 1SW5A 3SEVA 4MFIA 1VE4A 4BDLA 4OEVA 3UORA 1URSA 3H03A 3K02A 2XXHA 1B4HA 2DWHA 1DPPA 4YKPA 3QXMA 4KI0E 3Q25A 5CMKA 3O28A 4H8JA 1LFHA 1AOVA 2D5WA 2Q2CA 3JV9A 4F1YA 4C0RA 4FIMA 2I4BA 2ABHA 3OEKA 5TU0A 1SW4A 3T96B 4F19A 4PE5B 2Q89A 4ECFA 1XS5A 1IXGA 3MW0A 1XOCA 2AIXA 1H44A 1CE2A 1PB9A 1SDXA 2DYXA 1M5DA 4MF3A 1B7UA 5KZTA 2UYEA 3UN6A 3MP8A 1MM6A 4PFYA 1IZ1A 1ZIUA 4HS7A 3FD3A 1Y4TA 4WEDA 4DCYA 3KSXA 5I59B 3HV1A 1A99A 4Q30B 4PP0A 4OFOA 1VSOA 1N04A 3MVWA 4DIGA 2X7QA 4H1XA 5FHOA 4OERA 2PX1A 3BKIB 3E4RA 3H06B 1B05A 1P1NA 2QMXA 2OZZA 3IB2A 3KEIA 3UA8A 1R9LA 1PB7A 1PBQA 4GLIA 1B40A 4PFWA 1ZKBA 3U92A 1B3EA 3TEPA 2FNCA 2QJEA 2P1SA 3VV5A 4RY1A 4ZS9A 3O6GA 1TT1A 4JDFA 3CVGA 2AYSA 5DT6A 2XXUA 3K4UA 3O6HA 5AE4A 2GRVA 4LZ8A 2ZNSA 1KWHA 4F3SA 1ZLQA 1MDQA 5TPAB 1H43A 3MPLA 4YKJA 1YCJA 3FVGA 3TFLA 4DXBA 4Z7EA 5TPAA 4WXJA 2PT1A 4ZEFA 1I6AA 2Q9TA 1H3DA 4DDDA 1MM7A 1CB6A 3C34A 3IO4A 4BDNA 4EQ9A 3U93A 4MLQA 3K00A 3C32A 2Y7KA 1FTMA 1AH5A 3TQWA 3O9PA 3GXAA 4YMAA 3UGWA 4F31B 2F7BA 1B3LA 5K2XA 2H25A 4EF2A 1MG1A 3ZS6A 1R6ZA 2YPNA 4O3AA 4OMBA 2PBWA 3H6TA 4H8IA 1B4ZA 5EHSA 3OO7A 1RYXA 2RKMA 1NH8A 3VLVA 1OQGA 1H76A 1B0LA 1PEBA 2I6EA 3KG2A 3TYHA 3RGYA 3W9WA 3FIRA 2RCBA 4XTCQ 3G7WA 3PPNA 3JYRA 4LUBA 2DS9A 1B1HA 3TAJA 1SI0A 2NVUB 1O7TA 4QF9A 3O6IA 2YLNA 4Q0CA 1JVXA 1MXVA 4ISUA 1MPBA 4DZ1A 3ZSFA 3EN3A 3GLBA 5ITPA 4HTGA 4RA1A 1US5A 1MY1A 5BWJA 2NWJA 3SEWA 4POWA 4XKRA 2B3BA 1MQJA 4O3CA 3WAEA 2ZYOA 1A8FA 2O7UA 3S2VA 1P1OA 1VFDA 4U4XA 1ANFA 2WKYA 3M8UA 2HZKA 2RC8A 4MBPA 4R2BA 3H7MA 3K1NA 4ELRA 2OWSA 3FATA 1Y1ZA 1OLAA 4JB7A 2OCUA 4R6KA 5M2VA 5IAIA 4NF8B 1B6HA 3FXQA 4R9GA 5J1DA 3MVXA 3PPOA 1MY2A 3RNNA 4KYDA 3K6VA 2M8CA 3KFMA 2F5XA 2H98A 3IOTA 5KCJB 4NF8A 1D9YA 1N3XA 2PT2A 4YU0A 3H3GA 2VD2A 4NE4A 1B1XA 2IEEA 1MXYA 4AB6A 1NMUA 3QUFA 4OETA 1S9TA 2W7YA 3QSLA 4HCYA 3TUSA 4R6YA 5KCJA 3PD9A 4H5FA 1YPNA 4ZECA 4H67A 1FQBA 3FVKA 4G77A 3TPAA 2O69A 3D4CA 3H6WA 5AA3A 5CMMA 1NNFA 1A55A 1ATGA 3LUYA 1S7YA 4QFKA 2DWJA 3ECRA 2XX7A 2ZYNA 1QVSA 1Z7NE 5CM6A 1B5HA 1NKXA 3TTKA 2CZLA 4KD5A 1SI1A 3FXUA 1TWYA 4LP2B 4JWOA 2NUVA 1FQDA 4OXVA 3I5OA 2I0BA 2X7PA 5CMCA 4R6HA 1M5CA 4U21A 2Z8FA 4FAJA 2Y7RA 5DVJA 3CFXA 1AIVA 3T9VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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