1SD3A

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with 2s,4r-4-methylglutamate at 1.8 angstrom resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sd3A02
2AYSA 3M3LA 1DTGA 2OLBA 3VVDA 5L9SA 3DP8A 2XD3A 3E3KA 3IO6A 4IY5A 3EPEA 4IY6A 2VD3A 4H65A 1P1UA 1OIBA 5CM6A 3R26A 3QK6A 4X48A 2XXIA 1HSEA 1DPEA 5KDTA 1QULA 4NF4B 1B51A 2ANJA 3H6UA 2DVZA 2I49A 1B6HA 4FEBA 3MWBA 3R7XA 4NF8A 4U4SA 1B3FA 1USYE 5CBRA 5A5XB 2HFBA 4R9GA 3JV9A 3LSLA 4IB2A 3CG3A 4FJPA 4F22A 1F9BA 1VFEA 4WXJA 3RTWB 3LSXA 4EXLA 2DVCA 1XT8A 1L5TA 1NH7A 2XX8A 3OOAA 4F39A 2UVGA 5FTHA 1MM7A 3EHTA 5H8FB 2OWSA 1EU8A 4HS7A 2F34A 2UVIA 2PT1A 3KN3A 5M2VA 3VLVA 2DWHA 4JDFA 3FJGA 2DYXA 1LB8A 3PUVE 3W15C 3K1MA 5AA4B 2AL4A 5H8QA 1LBBA 3PUWE 3KZGA 1P1OA 1DOTA 1P1NA 3FVNA 3VFJA 3K02A 3TTMA 4F3GA 3Q26A 1WODA 1B5JA 2DWJA 3S9EA 1PC3A 4GLIA 3VVFA 2ZNUA 2XXVA 4PFTA 4RPOA 4M4GA 1O63A 1Y1MA 5DVFA 1FTJA 4XTCQ 2XXRA 3OO7A 2I4BA 4RYAA 1Y3QA 3V8XB 5BUUA 3KN8A 3H3GA 3HPIA 4L17A 4NF6A 3BFUA 4K3FA 4N6PA 3SEXA 3TEPA 2RC8A 2DE2A 3QXMA 2Y7KA 3SDFA 1URSA 3BKIB 2NWJA 4R9FA 3O66A 4FATA 3UA8A 1AH5A 1OMPA 4XKRA 2Q88A 2DWAA 3IB1A 1Y3NA 4KYEA 3TMGA 1O64A 2RCAA 5ICQA 1FQAA 1US5A 3FATA 1SW4A 4KYDA 1US4A 1MH4A 1POY1 2OK2A 4G77A 3UIFA 2HZLA 1UIUA 1IXCA 3PUXE 3C32A 4NTLA 4YKJA 1MY0A 2WKYA 4F19A 2OCUA 4C1TA 3PPRA 1AMFA 1N3XA 4LZ8A 1RKMA 4GFRA 1XC1A 4H8IA 3I6VA 2P2AA 3DM0A 4LZ7A 4TLMB 3Q29A 3LSFB 4KR5A 3H7MA 2XXTA 3UGWA 3SKPA 1MH3A 2E0SA 4E0XA 5FHNA 2W7YA 3FXQA 2OWTA 3PPOA 2RKMA 3B7DA 4YB5A 1D9VA 2O6AA 2Y7RA 3TYHA 3N5LA 3KOSA 1SD3A 3PGFA 4YB6A 4FECA 4YAHX 3U72A 1NNTA 2DXYA 1YCJA 3VXBA 5ELVA 4NE4A 3ZKKA 4BDRA 4M1VA 3N94A 4GXAA 3N6TA 4KYSA 1B1XA 1QKBA 5DVJA 1YAEA 3CFZA 2KLFA 3V83A 4KPTA 4BDLA 4PE5B 4FEDA 3T93B 5EHMA 3OEKA 3EF7A 3VLWA 4KI0E 3S9LC 4GXSB 1ANFA 4HCYA 1FQEA 1EZPA 1FTKA 1PDAA 4P0GA 3RT8A 2F8DA 4HTGA 1MPDA 3IORA 1OQHA 4ISUA 3SEVA 1M5BA 5F7VA 3PPNA 4POXA 2Z8DA 2Q2AA 2QS3A 3KJTA 2ZYMA 3ODBA 2P0SA 1NH8A 1II5A 4DLDA 2ZYKA 3CG1A 4KHZE 3W9WA 5AA2B 3IX1A 3RNNA 2DWIA 1B40A 1MG1A 4U22A 5CMCA 2ONSA 1OLAA 1B32A 1JW5A 3TTRA 4NF5A 5KCJA 4F1VA 2O69A 3KG2A 3N26A 3CSBA 4LP2B 3FVGA 3PV0E 4U4XA 4PETA 3IOUA 3KGCA 4RK2A 3E9XA 3FV1A 1YPNA 4GOTA 4U21A 1B5HA 4YMBA 2YJPA 1MS7A 2XXQA 1QKAA 4ELRA 3G3GA 1GTKA 1H3DA 3H6WA 3TZAA 3TTKA 4U1ZA 4JB7A 1LFIA 3W9VA 2DOJA 1N7WA 2DXRA 1OVTA 4ZEDA 3OMBA 2Y7PA 3HHFA 2PYYA 4YB7A 5ICTA 2GHBA 5I84A 5DYHA 3O6HA 1IUDA 3GXAA 2FNCA 2VOZA 5AA2D 1N84A 4F2QA 1JVYA 3Q25A 1JEVA 3IB2A 4PQJA 3ZS6A 4O3CA 3O29A 3UK4A 1B0LA 3L6GA 1TXFA 4OYVA 1DSNA 1LCTA 2YPNA 1VSOA 4EDPA 4RK9A 2R9JA 1LFGA 4OFLA 4KFQA 4G68B 4RA1A 1VE4A 1P1WA 2HZKA 2IA4A 3FZVA 3BBRA 2F36A 2Z23A 5I58B 4GF8A 2CZLA 1ZU0A 2UYEA 2H5YA 1QUIA 3K00A 3U8QA 1B52A 3UP9A 4BLAA 1CB6A 1QUKA 4R2FA 1FCKA 3V89B 2Q2CA 4ZZEA 5TP9A 1LLSA 3HN0A 4LQ2A 1UTBA 2PBWA 3GLBA 4KCDA 1AL3A 3IB0A 1B05A 1ZBMA 3RPWA 1B0HA 3MC2A 4YU0A 4EQ7A 4ZEIA 5TU0A 4DCYA 3L6HA 4H1XA 4OTEA 1H44A 1SI0A 1POTA 1LAXA 2I3VA 4ESXA 3MVXA 3O6GA 4U2RA 2D3IA 4I62A 4U1OA 3SETA 1MY3A 4G8NA 3DP6A 5I59B 4EQBA 1B3LA 3PUZE 1MXVA 1LFHA 2UYFA 4LZ5A 5AE4A 5L9MA 3SEWA 2H98A 3C31A 3DP4A 1UQWA 2F5XA 1Z7NE 1A54A 3RTFB 3K6UA 2GRVA 4F3BA 1B7HA 1IQ7A 3LSWA 4PP0A 5DEXB 2QL3A 4X9TA 1I6QA 2H25A 3LBSA 2H99A 5H8NB 2V3UA 1WVJA 5I57B 1I6AA 1TT1A 3QIMA 3PMXA 3K0VA 2O84X 2RC7A 4Q0CA 4F1YA 4O3AA 4OHNA 3OXNA 2HQ0A 3VV5A 5I2NA 3WAFA 3MZ1A 3EQ1A 3HSTA 1TFAA 3TCHA 1KWHA 1H76A 1MPCA 4DXUA 1I69A 4DXCA 1R6ZA 5JTYA 1N76A 4AB6A 4KQPA 5DT6A 1P99A 2F6GA 4R75A 4F31B 1MXZA 1M5FA 2D5WA 1MXYA 2NVUB 2G29A 3PD9A 3ZKLA 3G3JA 4H5FA 2PX1A 2NXOA 1IXGA 3EHSA 4OVJA 1Q1KA 1N3WA 3CR9A 5CMBA 3K4UA 5CMMA 1IEJA 3OSQA 4QSCA 4ND9A 5H8HB 3E13X 3E4RA 1H43A 3QUFA 1FW0A 2AL5A 2FA7A 4ONYA 1UTHB 1URDA 1PB7A 3UORA 5CBSA 4ELPA 2O51A 3CVGA 4IO2A 3SESA 2O68A 1B4ZA 4GL0A 4LONB 4DIGA 3H4ZA 3TFLA 4R73A 2ESNA 3FASA 1LAGE 1OQGA 2HAUA 1IIWA 4OWDA 4ZE8A 3VLUA 3ONMA 2Z8FA 4QSEA 1MDP1 1OVBA 1ZKBA 2OZZA 3JYRA 5H8SA 1GV8A 4ELQA 4I8CA 3VE1B 3OO6A 1B3HA 2ZNTA 4KCCA 2RCBA 2F7CA 1ELJA 4EUOA 4IGRA 1NL5A 2I6EA 4PFYA 4RY1A 3CSGA 3M3KA 4OERA 4GRKA 2V3QA 3IJOB 3B6QA 4I9DA 3C34A 3MP8A 1PB9A 3G3KA 4YKKA 4LATA 1XVXA 5I56A 4EF2A 2F7AA 5KDTB 1JETA 2F97A 2QS2A 2RF1A 1D9YA 4YMAA 1Q35A 3KFMA 4GQOA 1LB9A 3SERA 2A5TA 3FUZA 4NF8B 1B3GA 5ISUA 4JBZA 1SW1A 2ZMBA 4YKPA 4Q8RA 5I2KB 1ZIUA 3T66A 2O1LA 3IJXB 3KBRA 1BIYA 2QS1A 3FV2A 4QFNA 4IO5A 5HM4B 3C36A 5CI5A 2O1MA 1MM6A 4XXUA 1SW5A 2BJJX 3MPKA 3OEMA 1MXUA 1MY4A 4OESA 1O7TA 3ZSFA 3TELA 5B70A 1MRPA 5AA1A 3V5AA 1MXWA 3CRBA 4LA9A 1N0TA 1MQIA 1B4HA 4R74A 1MQJA 5H8QB 5K2YA 2GFEA 4OEVA 4ZECA 3H6VA 4H0WA 1ZLQA 2QS4A 1PBPA 3RUMA 2PVUA 1B58A 3KN7A 1PB8A 3CFLA 2Z22A 2V84A 2DE4A 3MVYA 2F78A 1FQBA 3UN6A 5TPAB 5F1QA 3Q28A 3QAXA 1BTJA 4NF4A 2XX7A 4U23A 4OETA 1IXHA 4DE8A 4ZZAA 4UA8A 2RC9A 2QMXA 4NF6B 1IZ1A 5A5XA 4GWOA 5KZTA 1A7LA 4F29A 1D3KA 2VP1A 3S4UA 1M5CA 4F18A 1SBPA 5DVIA 1DPPA 3D4CA 5H8FA 4P0IA 3MPLA 1B5IA 3G3HA 1NMUA 3RN8A 1SI1A 5JEIA 2X7PA 1HSJA 3H06B 3FXRA 5EHSA 4GIZA 2Y84A 3OENA 4EF1A 4XKNA 5AA4A 2QSXA 4G8HA 4R6KA 4UACA 3KSJA 3O6IA 1GGGA 3HCQA 2A5SA 3MW0A 5FTIA 2P1SA 4G4PA 4GL8A 1DMBA 4QFOA 3O28A 1JEUA 2NOOA 3S9MC 1EH3A 3ECRA 2V25A 4MBPA 3TQWA 4WKMA 3K1PA 4RPNA 2ZXTA 4GD5A 2B65A 4R2BA 1Y20A 2VHAA 2PT2A 1Y9UA 3DLNA 1AOVA 2M8CA 2GHAA 3PPPA 4DXBA 3PU5A 3M3FA 4YKIA 3EN3A 1RYXA 1JVXA 2OJTA 1R9LA 3IL1B 1FQDA 3A3UA 2I48A 4IO7A 3TUSA 3FIRA 1OLCA 1UIVA 4ZDMA 4JWXA 4Q5TA 5JK4A 3C9HA 2DP8A 3O2AA 5CMKA 1S50A 4QF9A 3O9PA 4F3SA 4PFUA 4QHQA 3B6TA 4N07A 4EQ9A 3QYTA 3SEUA 1MDQA 4C0RA 3C35A 2ZYOA 1S7YA 3T9HB 3RY3A 1XOCA 3FJ7A 2I4CA 2HEUA 4NMYA 1B2HA 1MQDA 1A8EA 3IK6B 1MXXA 4FORA 1R9QA 1VR5A 4G8MA 4R6HA 1LAFE 3GBAA 3KJ7A 2ZNSA 4OFJA 4DCXA 1USYH 4OZ9A 3RQTA 2D21A 3T9UA 5ITOA 2FYIA 3ILUB 1NKXA 1LAHE 4XIGQ 2XXYA 4E0WA 4IO4A 3MBPA 4FAJA 3Q27A 4DDDA 3M8UA 5IKBA 4ESWA 1R1NA 2G93A 4NF5B 2ABHA 5KCJB 2DSFA 3U94A 1JQFA 1NFTA 2GH9A 4YICA 3I3VA 1M5DA 2RINA 2I58A 5I2KA 1LSTA 4MLQA 4BDQA 2XXXA 3R6UA 3P7IA 4RJZA 5L8DA 1TFDA 3DELB 2F7BA 1N04A 3T9VA 1LGBC 4O3BA 1LBCA 1B3EA 1XVYA 3FVOA 4BDOA 3I5OA 2DE3A 3MJNA 5L9OA 3TODA 4I1DA 3U93A 3CFXA 4G68C 4IO3A 3S2VA 1QJMA 3TPAA 1IXIA 4MFIA 2B3BA 4LVQA 1MQHA 4R6YA 3FJMA 2HCAA 3IOVA 2Z8EA 1ZTYA 2ONRA 2VD2A 4BDNA 3AXFA 3K01A 5ITPA 1FTLA 3OO9A 4F3PA 1SW2A 1A55A 3FGSA 4FIMA 5B7DA 3TDJA 3H03A 3VVEA 5BWJA 3VXCA 5TPAA 5AA2A 1A40A 2Q89A 3H6TA 1QVSA 3CI8A 3A3CA 2R71A 1B7ZA 4XKPA 3IOTA 4HCWA 3N6UA 3JZJA 2O7UA 2ZYNA 1LCFA 3B6WA 3USDA 2REJA 4Q30B 3S9NC 1SDXA 3PMVA 2Q8JA 4QFLA 4WEPA 1CE2A 2X26A 1FQCA 3RLFE 1Z7ME 3LC8A 3HO7A 2H9BA 3G3IA 1JW1A 3PD8A 4H8JA 4F2OA 1Y3PA 5TP9B 2XHDA 4NWCA 4H5GA 3MQ9A 3TAJA 1UTBB 4TQUQ 2F6PA 4JWOA 1H45A 4MH5A 4H6DA 2XXWA 2UVJA 4X1DA 3MP6A 3A09A 1Y4CA 4ZE9A 1BKAA 1MY2A 1T0KA 5AA3A 1BP5A 3LR1A 4OQOA 3D4GA 5FHMA 1TWYA 2XD2A 4ZS9A 4R72A 2OBGA 3GBBA 3U1OA 2Y7IA 2B3FA 3LUYA 4IGTA 2LAOA 1SVXB 3IOWA 4POWA 2IEEA 4DZ1A 3EHUA 2V93A 2Q9TA 4G68A 3MZBA 3TTLA 1SYIA 2CMOA 3MZ9A 2QRYA 5I58A 4QFKA 3FXUA 4GVOA 3TKDA 3TCFA 1FTOA 1M5EA 4X1BA 5LOMA 1MY1A 2I3WA 4BDMA 3U92A 1YTVA 4JSOA 2I0BA 1JNFA 3IAZA 1XHYA 2XX9A 3TQLA 3ILTB 2H4IA 1MPBA 5FHOA 3MP1A 1QW0A 4WEDA 2ONKE 4NEDA 4QRZA 1GVCA 5CRYA 1XS5A 1QUJA 1S9TA 1JW4A 3KEIA 3QSLA 4QSDA 3PMWA 1I6BA 1Y1ZA 1NNKA 2YLNA 2F35A 1FTMA 3OSRA 2NUVA 2E1SA 2QPQA 1ATGA 5I2NB 3T9XB 4FE8A 1A99A 4TLLB 2VGQA 3THIA 2DS9A 4OXVA 1URGA 2V3TA 2X7QA 5JTYB 4OENA 1Y4TA 2REGA 3MAMA 1N7XA 5I59A 4OMBA 4G2ZA 3F11A 4YZZA 4RNSA 1B46A 3GZGA 4QFPA 4NWDA 4N13A 4ELOA 2AIXA 3FVKA 2ALUA 1SQYA 4C1UA 2HXWA 5CC2A 2QMWA 3KSXA 2PMSA 1EZOA 4PFWA 1AIVA 4JWYA 3QUJA 3OD7A 4JSDA 4HW8A 3OO8A 2O7IA 5IAIA 4ZEBA 1NNFA 3CIJA 4AQ4A 3C33A 1B1HA 1B7UA 3IR1A 5DEXA 4ZEKA 1RYOA 1PBQA 4AB5A 3IO4A 1PEBA 1B9JA 5H8NA 1GR2A 2Y7WA 3RGYA 5I57A 1SYHA 2I0CA 2XXHA 4ECFA 3KOTA 3MVWA 1A8FA 3HHGA 4LUBA 1D4NA 4Z7EA 5HBCA 1NNPA 4OFOA 4JXIA 3K2DA 4KD5A 3PPQA 3K1NA 2DQVA 3SEYA 4LQ5A 4H67A 3C4MA 1VFDA 2XXPA 4MF3A 3T22A 2XXUA 3BFTA 3PUYE 3K6WA 4MLVA 1EZ9A 4RXLA 2UXAA 1J1NA 3OELA 1ZJLA 3T96B 5J1DA 2UVHA 4Z0IA 4EXKA 5I56B 1IITA 4F1UA 3FD3A 4OEUA 2HAVA 3RT6B 1FQFA 1WDNA 1BLFA 2A5TB 5H8HA 3TCGA 3MVZA 3VDFA 4THIA 1MQGA 3O97A 3WAEA 1ZMGA 3MUQA 3K6XA 1UTHA 3TTNA 3K6VA 4P11A 1DTZA 2QJEA 1HSLA 4TOZA 2R6GE 4ZEFA 4XKQA 3G3FA 1P1QA 5HPQA 2THIA 5K2XA 4IO6A 5DTBA 3G7WA 3HV1A 5EYFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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