1BLFA

Structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 angstroms resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
685
structure length
685
Chain Sequence
NVRWCTISQPEWFKCRRWQWRMKKLGAPSITCVRRAFALECIRAIAEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRKSCHTGLGRSAGWIIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCIDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSSREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNSRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSRSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTTLKNLRETAEEVKARYTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVKQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Three-dimensional structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron-binding protein
total genus 207
structure length 685
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA03
5I58A 3EHSA 3F11A 2I4BA 4U1ZA 4YKPA 3H6VA 1M5BA 1UTHA 3OO7A 4IO3A 4GVOA 3R7XA 4KCCA 5K2YA 1OQGA 4OEVA 3V8XB 5CBRA 1JEUA 3FXUA 3MVYA 2I49A 5CMCA 4NWDA 5H8FB 1ZJLA 4LQ2A 2O6AA 3O97A 2Q2CA 2GH9A 4EUOA 4AB5A 4HS7A 5DEXA 2HQ0A 3MVZA 1B0LA 2V3UA 4M4GA 3K6VA 3MP1A 3H6TA 2HAUA 4G8NA 4F1VA 4G77A 2VP1A 3UA8A 2LAOA 4LZ5A 3CRBA 4R2FA 1Y3QA 3IAZA 2I58A 2G29A 3OXNA 4IGTA 4ISUA 2OCUA 5I84A 3LSFB 1LB9A 4RNSA 4NTLA 2XXPA 2RCAA 4H6DA 4H5FA 5JEIA 3KEIA 3RT6B 3HHGA 1M5FA 4AB6A 4O3AA 1MXZA 2QS2A 4ELRA 5H8FA 3SDFA 1LLSA 3VFJA 3IK6B 3FV1A 4IY5A 3O6GA 1POTA 1Y4TA 1I6AA 1B46A 1JQFA 3Q25A 1BTJA 3I5OA 3OMBA 3LSWA 3PUXE 4H0WA 3SKPA 3T9HB 1SYHA 5AA4A 1OVBA 3ZKLA 5I56B 2XHDA 4ZEBA 2RCBA 2IA4A 3HO7A 2D5WA 1YPNA 2THIA 3KBRA 2H5YA 1EH3A 1LFGA 4G68B 1DOTA 1MM6A 4FJPA 1IXHA 3WAEA 1LSTA 1DPPA 1MY0A 3FXRA 3PMXA 3USDA 3CG3A 1AIVA 1XS5A 5ITOA 3KOTA 1LBCA 3V89B 2QS1A 1JNFA 1N3WA 4H8IA 3Q28A 4U23A 4ESXA 2Z22A 4JWYA 1PBQA 2RC7A 3H06B 2DQVA 2XXVA 2GFEA 3S2VA 3V5AA 1JW5A 4ELQA 3W15C 4KR5A 2Q89A 2ZYMA 4IO2A 4R2BA 1M5DA 3VXCA 1LFIA 3ONMA 4X9TA 1AH5A 3SEWA 2QS4A 3E4RA 1LAHE 1LAGE 2H99A 4NE4A 3TEPA 4DCXA 1GR2A 5L8DA 1N0TA 5EHSA 5H8SA 3FVNA 5I56A 3G3JA 4JWOA 3ECRA 1A54A 1B9JA 1TFAA 1SI0A 2V3TA 1DSNA 1NL5A 1F9BA 5ICTA 4G68A 3N6UA 5DYHA 3K1PA 4JBZA 3CIJA 1KWHA 3TPAA 5I2NB 4GWOA 5DVJA 1YTVA 1OQHA 3BFUA 3H4ZA 3FVKA 4RPNA 2I3VA 3FV2A 3VVEA 2QMWA 4FIMA 1MY4A 3T96B 3M3LA 1UTBB 2AL5A 1R9QA 2D21A 5KZTA 2UXAA 2ANJA 2XXIA 3T9XB 2ABHA 3K6XA 2E1SA 1XVYA 3IB2A 1JEVA 1EZPA 2PVUA 1EU8A 1ZU0A 2ONRA 5A5XB 2PYYA 4NF5B 2F6GA 4ECFA 5TU0A 1SW2A 1B32A 3S4UA 1Y1MA 2UVGA 2UVIA 3OSQA 3C31A 1LB8A 2F7BA 3K02A 2P0SA 4OVJA 4LVQA 4MF3A 1B7HA 4OESA 2B3BA 2VHAA 1SD3A 2XX7A 1XOCA 3M8UA 4XTCQ 3U92A 3IO4A 1UTBA 4YAHX 3SEYA 2IEEA 5F7VA 4Q8RA 2BJJX 1B7UA 1MQIA 2F35A 1OLAA 4KCDA 2O84X 2F97A 2XXTA 2OJTA 1PEBA 4IO5A 3RNNA 1IUDA 3MW0A 1HSJA 4Q5TA 3N26A 4LATA 3TKDA 5A5XA 3RY3A 3PUZE 4RYAA 4NF5A 2QPQA 4EQ7A 3JZJA 4AQ4A 1FTMA 2NVUB 2KLFA 2X7PA 2D3IA 2HXWA 1MXWA 3KN3A 1QW0A 1TT1A 1QKBA 1MDP1 1SQYA 5B7DA 1OMPA 3IB0A 3C9HA 4QFOA 4ZE8A 4QFLA 1RYXA 2I3WA 1SW5A 1II5A 5FTIA 1XC1A 3FZVA 3TYHA 3GXAA 4IB2A 5JK4A 3C34A 3DP8A 3MZ1A 1SDXA 3DELB 1VFEA 4YKJA 3W9WA 4GQOA 4F3GA 5F1QA 2O1LA 4E0XA 4PFYA 3OSRA 1USYH 3FJ7A 5K2XA 2FNCA 3MP6A 4OQOA 4YZZA 4BDOA 3T9UA 4ZZEA 2X7QA 5DVIA 3U8QA 3QAXA 1QUIA 4LQ5A 4QFNA 2PT1A 4PFUA 4QRZA 4YB6A 2DE4A 1PC3A 2QMXA 4YICA 1A8EA 1YCJA 4JB7A 3EPEA 4OWDA 1H45A 1MH4A 4FE8A 4UA8A 3T93B 4KPTA 1Y1ZA 3S9NC 3PPNA 1O63A 1UIUA 3G3KA 4P0GA 1JETA 3TFLA 4YB7A 1RKMA 2DSFA 2DOJA 4N07A 3SERA 4F3PA 1QUKA 1O7TA 3G7WA 2HCAA 3MUQA 4QFKA 4O3BA 1MY3A 2AIXA 4PE5B 3ZS6A 2V93A 1ZIUA 2HZKA 2R71A 1SW4A 3V83A 1QJMA 1WODA 3GBAA 4QSCA 1B58A 2I6EA 3HPIA 4FAJA 5M2VA 3MBPA 5AA2B 4XIGQ 2I48A 4PFTA 3MC2A 4GL8A 2OWSA 4NF6B 1R6ZA 4ZDMA 3CFLA 3IORA 4OFLA 1AMFA 3RTFB 1URDA 2XD2A 3UIFA 1ANFA 4ELPA 2OK2A 2Y7IA 3M3KA 3ODBA 1A8FA 3M3FA 2F7CA 2UYEA 4XKRA 1B3HA 2PMSA 2RINA 2O68A 3C32A 3Q29A 4QF9A 4DE8A 3THIA 4NWCA 3TCFA 1FW0A 2H98A 3IX1A 3PMVA 3C35A 3KSXA 1GGGA 4I1DA 4N13A 4OFJA 3ILTB 4DLDA 3TTRA 1GV8A 3MJNA 5AA2A 4MBPA 1P1UA 2Z8FA 2YLNA 2Q8JA 3B6TA 4ZE9A 1DPEA 2YPNA 3E13X 4NF6A 1UQWA 4H1XA 4Q0CA 4RY1A 4LZ7A 1P1WA 1NNTA 1FQDA 5AE4A 2R9JA 3UP9A 1XVXA 3KFMA 4EF1A 3DP4A 3O28A 3EF7A 3KGCA 3PPOA 4KYSA 3EQ1A 3FVOA 3JV9A 4THIA 3TMGA 1POY1 3B6QA 4R73A 4H67A 4E0WA 4RXLA 4TQUQ 4XXUA 1FQEA 4ELOA 4MLQA 3KSJA 2F34A 1PB9A 2FA7A 4R72A 1Q1KA 3N6TA 4GFRA 3CR9A 2Y7PA 1B05A 1B4ZA 4C1UA 2QS3A 1FQAA 1MH3A 2DWIA 4OXVA 3FUZA 3RPWA 3RN8A 2Z8EA 5BWJA 3OOAA 1H44A 2RKMA 2XXWA 4POWA 3PD9A 1B5HA 2OBGA 2ZNUA 4F2OA 2QJEA 3KJTA 1CB6A 3HHFA 1LAXA 5AA3A 5TPAB 1FTLA 4F2QA 3KG2A 1FQFA 3MVXA 5AA2D 1Y3PA 3K6WA 5L9SA 2GRVA 1P99A 4DXBA 1B40A 5KCJB 2Z23A 4F31B 3I3VA 2QRYA 1N7WA 4GRKA 3PUVE 4R75A 1QUJA 1FTKA 4HTGA 4XKNA 2DVCA 4G68C 1RYOA 4BDRA 4QSDA 4KHZE 3OD7A 3OENA 5CC2A 2ZNSA 1B51A 1ZLQA 3GBBA 3C36A 3FXQA 1CE2A 1HSLA 1D4NA 1J1NA 4R6YA 4L17A 4RK2A 1SYIA 2DP8A 5L9OA 4OHNA 4ZEIA 4NF4B 3K00A 1SW1A 1IZ1A 2HAVA 2P1SA 3PUYE 5TPAA 3AXFA 2H4IA 1QULA 4YU0A 3U93A 1MQJA 3MQ9A 3PGFA 2XXYA 4YMAA 2OZZA 1FQBA 1S50A 2XXHA 1MQHA 5KCJA 4HCWA 1MXYA 3QSLA 3TTLA 3IOUA 4I8CA 3TQWA 4YKIA 2W7YA 2F36A 3PPRA 4YMBA 4U1OA 4R74A 3MZ9A 3TCHA 3FJMA 1GVCA 3HCQA 2YJPA 3O2AA 1PB8A 4TLMB 1IEJA 1VSOA 5I2NA 4GXAA 1NH8A 2B3FA 4U22A 3VLUA 1FTOA 4GLIA 2ONSA 4FEDA 3H6UA 2GHBA 4GD5A 2E0SA 3A3CA 2OLBA 3O6IA 4I9DA 1OVTA 3WAFA 4NF4A 1B1HA 3H7MA 1H43A 4EXLA 4LUBA 4ZEFA 3FATA 3JYRA 4IO7A 2QL3A 1Y20A 4OFOA 3U72A 3LSXA 4GF8A 5H8HB 4R6KA 2NUVA 3VLVA 4H8JA 3P7IA 4DXUA 1N84A 2Z8DA 4G8HA 1MM7A 1VFDA 2DE2A 3UK4A 3S9EA 4DDDA 2DXYA 1MG1A 1P1OA 4GIZA 1DTGA 3RLFE 2ZXTA 1WDNA 3A3UA 1US5A 2DS9A 2M8CA 4MFIA 5EYFA 4TOZA 4ZECA 1JVXA 4LZ8A 3HN0A 2VD3A 1R9LA 3S9LC 4KYDA 4ZZAA 2DYXA 3RTWB 2HZLA 1MRPA 1GTKA 1SVXB 4LONB 4PP0A 2XXUA 5DTBA 5KDTB 1B3FA 3QXMA 5IKBA 1Z7NE 3EN3A 3QIMA 3EHTA 3UORA 5H8HA 2WKYA 4WEPA 1A7LA 4G2ZA 1OLCA 3H3GA 4HW8A 4RPOA 3PD8A 3CFZA 4GL0A 4P11A 3R26A 4C1TA 3VE1B 2UYFA 2O7IA 1R1NA 4RA1A 1MPCA 2F7AA 1XHYA 4QFPA 2R6GE 2CZLA 1T0KA 3IJXB 2AL4A 3GLBA 3H03A 5HBCA 1TFDA 3C33A 2V25A 3G3IA 1IITA 1NNKA 4FEBA 4PETA 1DMBA 4F39A 5ISUA 3D4GA 1M5CA 2DVZA 1Y9UA 3MAMA 3UGWA 1TWYA 3OO8A 1B2HA 4JDFA 3QUFA 4NF8B 3ZSFA 3U1OA 3MVWA 1URSA 3T9VA 3OO9A 4C0RA 3K1NA 3KOSA 2ZYOA 2AYSA 5CI5A 3TTKA 3LBSA 3R6UA 1B1XA 3TODA 3W9VA 5KDTA 3N94A 4U21A 1MDQA 3G3GA 4OENA 5CRYA 3MZBA 4KI0E 2XXRA 4Z0IA 2I0CA 1QVSA 3CSBA 3IL1B 1LAFE 5I2KB 2HFBA 4OETA 4F18A 3VXBA 3QK6A 1BP5A 5IAIA 1B6HA 5JTYB 3FGSA 1A55A 5DVFA 4F19A 4ZEKA 4EDPA 3VLWA 1ZBMA 3IOWA 3BBRA 4JWXA 4OTEA 4NF8A 1FQCA 4G8MA 1I69A 3O6HA 3C4MA 4IO6A 4POXA 4KYEA 5HM4B 3K1MA 5AA4B 3FD3A 4M1VA 2Y7RA 5J1DA 3TTMA 5AA1A 4N6PA 3B6WA 3CI8A 3N5LA 1P1NA 4F3SA 4KD5A 1B4HA 4X1DA 4WXJA 3I6VA 5I2KA 3TELA 1S9TA 1IXCA 3GZGA 3OEMA 3SETA 2XXXA 3IOVA 4R9GA 2B65A 4JSDA 3IR1A 3O29A 1JW1A 5JTYA 4OYVA 3E9XA 1UIVA 4OMBA 3OO6A 5BUUA 5ITPA 2XX9A 1JVYA 4H65A 2O1MA 2I0BA 5FTHA 2ALUA 2Q2AA 2RC8A 3K2DA 3LR1A 4OZ9A 1MPDA 1SI1A 2A5TB 2XXQA 2ZMBA 3DP6A 3T66A 3LUYA 3ILUB 3RGYA 4U4XA 4XKQA 4EQBA 1MY2A 2Y7WA 4NMYA 4LA9A 3CFXA 1TXFA 1B7ZA 3MPKA 3IO6A 1LFHA 3G3FA 4PQJA 1US4A 2Y84A 5ICQA 1Z7ME 1B5JA 3TTNA 1ELJA 4ONYA 1B3GA 1BIYA 5CMKA 4KQPA 3FIRA 1MPBA 1S7YA 3A09A 4K3FA 1MQDA 1D9VA 1I6BA 3VDFA 5FHNA 4DCYA 1FTJA 4JXIA 1SBPA 3K4UA 4LP2B 3BKIB 1BKAA 2PBWA 2V84A 4MH5A 3SEVA 4FORA 5CMBA 1M5EA 3S9MC 5ELVA 4OEUA 3K01A 2ZYKA 3MPLA 2DWAA 1B5IA 2VD2A 4X48A 3TQLA 2A5TA 4R9FA 2P2AA 2VOZA 1MQGA 2H25A 5H8QB 3OEKA 2F5XA 2XX8A 4MLVA 4QHQA 1FCKA 4OERA 2NXOA 2Q88A 4R6HA 1A99A 1H76A 4TLLB 3G3HA 3KN7A 1VR5A 3ZKKA 1ZMGA 2F6PA 5B70A 4FECA 1D3KA 1LBBA 3TZAA 2ZYNA 2RC9A 4YKKA 3Q26A 1NMUA 3PPPA 3RQTA 4P0IA 1LGBC 4EXKA 3VVDA 1B3LA 1MXVA 2REGA 1AL3A 5CBSA 1VE4A 3OELA 1MY1A 1A40A 2ZNTA 3TCGA 3TAJA 4IY6A 1JW4A 3O66A 1NNFA 1MXUA 3FJGA 1B52A 1BLFA 1EZ9A 4NEDA 4ZEDA 1IQ7A 4HCYA 5H8QA 1AOVA 2NWJA 3TUSA 3PV0E 1OIBA 4O3CA 1IXGA 2OWTA 3VVFA 4DXCA 1H3DA 4H5GA 3DLNA 4I62A 4WEDA 1Y4CA 4IO4A 1P1QA 4BDNA 4DZ1A 2V3QA 1NFTA 3LSLA 3FASA 2DE3A 3IB1A 1N76A 4RK9A 3K6UA 1IIWA 2HEUA 1NNPA 3PPQA 4ZS9A 1QKAA 3SEXA 3B7DA 3UN6A 3KZGA 3SEUA 3U94A 2DXRA 3DM0A 1PBPA 1ATGA 1MS7A 3CSGA 1PB7A 2GHAA 5TP9B 2UVHA 5I57B 1PDAA 1WVJA 1N04A 2Q9TA 3HSTA 2QSXA 4XKPA 3IJOB 4RJZA 1HSEA 1IXIA 3KN8A 4ND9A 4F22A 2DWHA 2F8DA 2O7UA 5CMMA 5H8NB 2FYIA 1MXXA 2O69A 4UACA 4JSOA 2ONKE 3MWBA 3RUMA 3D4CA 2I4CA 1B0HA 3QYTA 1N7XA 1B3EA 2G93A 3KJ7A 2X26A 4U2RA 2CMOA 3L6GA 2NOOA 1L5TA 5EHMA 3RT8A 5FHOA 3K0VA 3EHUA 4BDQA 5I59B 3CG1A 1D9YA 5TP9A 3PMWA 5I57A 3Q27A 1N3XA 4Q30B 1Q35A 1ZTYA 4GOTA 2PT2A 3IOTA 3QUJA 4F3BA 2RF1A 4BLAA 5I58B 2DWJA 2Y7KA 1ZKBA 2A5SA 2ESNA 5HPQA 3MP8A 2XD3A 1XT8A 1UTHB 1LCFA 1LCTA 3CVGA 1YAEA 5DT6A 3E3KA 5FHMA 1NKXA 4QSEA 5H8NA 4Z7EA 4F1UA 2PX1A 4DIGA 1Y3NA 1USYE 5LOMA 1URGA 5CM6A 3VV5A 1NH7A 1O64A 3BFTA 2VGQA 4GXSB 4BDMA 4ESWA 5DEXB 5L9MA 3HV1A 2O51A 2UVJA 2REJA 4BDLA 3TDJA 4PFWA 1DTZA 4YB5A 4KFQA 1EZOA 3L6HA 3T22A 5I59A 3FVGA 4IGRA 4WKMA 4G4PA 1I6QA 3H6WA 4U4SA 4EF2A 2F78A 4F1YA 3PU5A 3O9PA 4EQ9A 2H9BA 3SESA 4X1BA 4F29A 3LC8A 3PUWE 4FATA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I58A 3EHSA 3F11A 5IZ3A 2I4BA 4IR8A 4H46A 4U1ZA 4YKPA 3H6VA 5LTCA 1M5BA 2XWOA 1UTHA 3OO7A 4IO3A 4GVOA 3R7XA 4KCCA 5K2YA 1OQGA 4OEVA 3V8XB 5CBRA 1JEUA 3FXUA 3MVYA 4O94A 2I49A 1FRPA 5CMCA 4NWDA 5H8FB 1ZJLA 4LQ2A 2VT5A 4PGNA 2O6AA 3O97A 2Q2CA 4MJOA 4P8BA 2GH9A 4EUOA 4AB5A 4HS7A 5DEXA 1LBWA 2HQ0A 1JP4A 2FIEA 3MVZA 1NV1A 1B0LA 2V3UA 4H45A 4M4GA 3K6VA 3MP1A 4GX3A 3H6TA 2HAUA 2CEXA 4G8NA 4F1VA 4G77A 1G0IA 2VP1A 3UA8A 2LAOA 4LZ5A 3CRBA 4R2FA 1Y3QA 3IAZA 2I58A 2G29A 4X04A 1FPJA 3OXNA 4IGTA 4ISUA 2OCUA 5I84A 3CHGA 3LSFB 1LB9A 4RNSA 4NTLA 2Y5LA 2XXPA 2RCAA 4H6DA 4H5FA 5JEIA 3KEIA 3RT6B 3HHGA 1M5FA 1LBZA 4P1EA 4AB6A 4O3AA 1MXZA 2QS2A 4ELRA 5H8FA 3SDFA 1LLSA 3VFJA 3IK6B 3FV1A 4IY5A 3O6GA 1POTA 4PAKA 1Y4TA 1I6AA 1B46A 1JQFA 3Q25A 1BTJA 3I5OA 4N17A 3OMBA 3LSWA 3PUXE 4PFBA 4H0WA 3HFUA 3SKPA 3T9HB 1SYHA 5AA4A 1OVBA 3ZKLA 5I56B 5IGAA 1FJ6A 5EQ7A 2XHDA 4ZEBA 1IMDA 2RCBA 2IA4A 3HO7A 2D5WA 1YPNA 2THIA 3KBRA 2H5YA 1FPIA 1EH3A 1LFGA 4G68B 1DOTA 1MM6A 4FJPA 1IXHA 3WAEA 1LSTA 1DPPA 1MY0A 3FXRA 4P3LA 3PMXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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