1BLFA

Structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 angstroms resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
685
structure length
685
Chain Sequence
NVRWCTISQPEWFKCRRWQWRMKKLGAPSITCVRRAFALECIRAIAEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRKSCHTGLGRSAGWIIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCIDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSSREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNSRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSRSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTTLKNLRETAEEVKARYTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVKQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Three-dimensional structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron-binding protein
total genus 207
structure length 685
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA03
1RYXA 4YMAA 3KFMA 4MLQA 2DWJA 4F3GA 4U1OA 2XXXA 1GV8A 3CI8A 1IXHA 3S9LC 3UN6A 5DVIA 1A54A 5EHSA 2F35A 3T9VA 3O9PA 3RT8A 5TPAA 4N07A 1LAFE 1PB9A 3PPRA 1MDP1 3FXQA 2DE2A 2Q9TA 1POTA 4DXUA 1B1XA 4HCYA 4LZ5A 3OENA 1B40A 5CMKA 4MFIA 1ZJLA 3KOTA 4H8IA 1IXGA 2DVZA 5TPAB 4KYSA 5CMCA 2CMOA 2I49A 3B6QA 4H67A 2XD3A 4XKPA 1SW5A 5DVJA 2DQVA 2RC7A 2H99A 3PPPA 1A8FA 3B6WA 4C1UA 1NNTA 2I6EA 1NFTA 1KWHA 4OFOA 4FE8A 3T9UA 1JVXA 4IO5A 4ESWA 4G68C 3SKPA 1N7WA 2RCAA 3H3GA 3R26A 3ZKKA 2NOOA 3MP6A 3DP6A 2D3IA 1MXWA 2ZXTA 3O29A 5FTIA 3K4UA 3MBPA 3FASA 1HSJA 4G77A 4POWA 1VSOA 1NNPA 3N6UA 1USYH 4OXVA 3T9XB 4M4GA 4WKMA 2OWTA 4AB6A 2XD2A 4U21A 3HO7A 1B3FA 2E0SA 2NUVA 3OSRA 4G8NA 4YMBA 3KJTA 5FHOA 4F22A 5AA2A 1MXYA 4NMYA 3MZBA 4X48A 3PPNA 2F7AA 4DXBA 3BFUA 2O7IA 3G7WA 2XXVA 4ZE8A 4R6KA 1ATGA 1B9JA 3FVKA 1DPEA 3OXNA 3CR9A 5AA2B 4GL8A 1GVCA 1M5CA 4QFPA 3TCFA 2H9BA 4RPNA 4ELOA 5J1DA 1N3WA 4G8HA 2D5WA 5L9OA 5FHNA 4ZEFA 2RINA 1YCJA 2F7BA 4TLMB 4KYEA 3RT6B 3GLBA 4GLIA 1LFHA 3FVGA 2ONSA 3DP4A 4OETA 3FJMA 3MZ9A 1MG1A 3FJGA 2ZYOA 1ZKBA 2HXWA 3H4ZA 4UACA 4OTEA 2ZMBA 1YTVA 2DXRA 4XXUA 1LGBC 4WEDA 4X1BA 3EF7A 3Q25A 3G3IA 2Z8DA 3FGSA 1N04A 1LSTA 2NXOA 3IJOB 3PMVA 1EH3A 1B1HA 5FHMA 3S2VA 3IO6A 4X9TA 1NNKA 4QFLA 4GVOA 3OMBA 1DTZA 4POXA 4JWXA 2VHAA 1MXVA 1JW1A 5CMMA 1SD3A 2XXYA 3C9HA 2DE3A 2R6GE 5KDTB 4U4XA 4QRZA 4GD5A 2HAUA 4OHNA 1D4NA 4G68A 4AB5A 3K6UA 3PPOA 1P1NA 3DM0A 1I69A 3ECRA 1LLSA 4QHQA 2UVHA 1SYIA 3LUYA 4OESA 4OFLA 1BKAA 4R75A 5CRYA 1LFGA 5ICTA 2XXIA 2OJTA 2IEEA 5ELVA 3ZS6A 5JTYA 1SI0A 2F7CA 3MJNA 5AA1A 1VR5A 1UQWA 2YJPA 3PUWE 2PT2A 4P11A 1JETA 3M8UA 1B7HA 4MH5A 4F1UA 3THIA 4XTCQ 1MM6A 4MBPA 1XVYA 3IL1B 3FUZA 5I59A 3TQLA 3T22A 1MXXA 5JTYB 1USYE 1EZ9A 5F7VA 1ANFA 1MPDA 1LB9A 3IAZA 3PMWA 4ZZEA 1D9YA 3N26A 2I4BA 4OZ9A 2DS9A 4WXJA 1UIUA 1Y4TA 2AL4A 1OIBA 1IQ7A 3A3CA 3FVOA 3VVDA 3C4MA 4NF8A 1VE4A 2ANJA 4JSOA 3MC2A 4DCYA 3EPEA 1B7ZA 5DEXB 4KI0E 4RJZA 2UXAA 3TQWA 1OLAA 3G3FA 3K0VA 4NF8B 1IEJA 2NWJA 2I0BA 2DVCA 3IX1A 3UGWA 2D21A 1EZOA 2Q8JA 4QSEA 3KN8A 2X7QA 1B2HA 3C32A 1IITA 2PX1A 4KHZE 2F6GA 3TCHA 1R9QA 1PB8A 1RKMA 4LQ2A 1D3KA 3GZGA 3CRBA 4PFTA 3OD7A 5DTBA 1US5A 2UYFA 3EQ1A 2GH9A 1DMBA 1PEBA 3N6TA 5AA4A 4FEBA 3U92A 5HBCA 1VFEA 3QYTA 2B3BA 4LQ5A 4LP2B 4XIGQ 3CSGA 2ZYMA 5HPQA 3JZJA 5CI5A 3QAXA 5DT6A 3K2DA 4MLVA 4GIZA 2ZNUA 2F34A 4OVJA 4EUOA 1LFIA 4RYAA 5LOMA 4LVQA 5TP9B 3LBSA 3IORA 2O1LA 3TAJA 5I58A 5H8QA 2ZNSA 2O69A 3LSFB 1SW1A 2V84A 4YKIA 1MY3A 3D4GA 3VLVA 3U8QA 4YKKA 3RNNA 4DIGA 1Y3PA 1B3LA 3V89B 3KG2A 1GR2A 3VLUA 1P1OA 4OEUA 1T0KA 5H8QB 4GL0A 4DCXA 3AXFA 1Y9UA 3MP1A 3MPKA 3USDA 3TELA 2QSXA 1B0HA 4RXLA 3TTRA 4XKNA 3JV9A 4FJPA 1EZPA 2O84X 5DVFA 1S7YA 1FQBA 1NH7A 4DE8A 3IK6B 4ELQA 4F1VA 4LUBA 3C34A 1UTHB 2VP1A 4U1ZA 2O6AA 3O2AA 1DPPA 4ESXA 1NNFA 2O7UA 3FATA 1LCFA 2UVGA 1B4HA 4NF4A 3QIMA 2DXYA 2XXQA 3QK6A 2I58A 3P7IA 1MPCA 3FV2A 3SEUA 1CB6A 5K2YA 1MY1A 1Q1KA 3MVZA 3W15C 3O6HA 4NF4B 4EQ7A 4LONB 1J1NA 2HEUA 1B5IA 2HFBA 4BDRA 3MPLA 1P1WA 3F11A 1URSA 2Z8EA 3UIFA 4R2BA 5KCJA 1A7LA 2VD3A 2X7PA 1H43A 1FQAA 2OWSA 4QSCA 3GBBA 3LSXA 4HCWA 2XXTA 3EHUA 1SYHA 4F18A 3PGFA 1M5BA 2GHAA 4IO7A 1SI1A 1US4A 1QUKA 3ODBA 4F2QA 5KCJB 3H03A 3WAEA 2O1MA 4QSDA 3CFLA 4OEVA 3SEVA 3TTMA 3W9VA 5BUUA 1P99A 3PV0E 4R73A 2XXUA 4RA1A 4R9FA 1XOCA 4BDQA 1O7TA 1R1NA 4OMBA 2DYXA 3E3KA 1FQEA 3BKIB 3QSLA 5ITPA 4Z7EA 4O3BA 3TUSA 1AH5A 3FIRA 3HSTA 2UVIA 1B4ZA 1B7UA 3TODA 3I5OA 2Y7IA 2R9JA 1L5TA 3I3VA 3C36A 4OERA 1XVXA 1BLFA 4BDMA 2XHDA 4IO6A 1H45A 5I56A 1B52A 1LAXA 5L8DA 1URGA 3O97A 3LSLA 3K02A 2V25A 5CM6A 3MAMA 3HHFA 3D4CA 3KSJA 3VLWA 1B58A 5I56B 3PUZE 3OEKA 4X1DA 5HM4B 4XKQA 1OVTA 1B5JA 3MVWA 3R7XA 1Y1ZA 2GHBA 4FORA 3OSQA 1JEUA 2G29A 1EU8A 4Q0CA 3UP9A 2F6PA 2ABHA 1RYOA 5I2KB 4IO2A 3U1OA 5H8NA 2OCUA 3C33A 2ZYNA 1JW4A 2H98A 1MXZA 3K1PA 4LATA 1ZIUA 4O3CA 4KPTA 3MWBA 1OQHA 3QUJA 4H5FA 1QKBA 5H8NB 1TWYA 2Q2AA 2AYSA 1SVXB 4EQBA 1CE2A 3S9MC 1MXUA 2M8CA 4EDPA 2ALUA 2I48A 1MH4A 3OO6A 4KCCA 3SEXA 2V3UA 2YPNA 5AA2D 3KSXA 3FJ7A 1QJMA 3Q28A 4RK2A 4YB6A 4ONYA 2HQ0A 4RNSA 5KDTA 3TZAA 1A55A 1XC1A 3MQ9A 4E0WA 3LC8A 1SW2A 1Y3NA 3RTFB 3IOUA 2F8DA 1Y20A 1MQGA 3IOWA 4OYVA 3G3HA 4ZS9A 5CBSA 2B65A 3OELA 4DLDA 4H8JA 1MQIA 3FD3A 3KZGA 3JYRA 1QW0A 5JEIA 2IA4A 1R6ZA 4ZEBA 1MQJA 1B05A 4PFUA 3RTWB 3DLNA 1I6QA 3M3LA 3N94A 3VVEA 3H6VA 2DP8A 2Q2CA 4P0IA 2W7YA 2XXWA 3MUQA 3H6TA 1PBQA 1LBBA 3IO4A 1ELJA 1XT8A 3A3UA 1Y3QA 2PT1A 4LZ8A 4JB7A 2R71A 4MF3A 4P0GA 5DEXA 4Z0IA 2F97A 3TEPA 3HHGA 3EHTA 1JEVA 3BBRA 5CC2A 5L9SA 3DELB 3Q26A 3SEWA 1Q35A 1JW5A 1GTKA 1IXIA 4H1XA 1YAEA 4PETA 5B7DA 1A8EA 3PU5A 3TTLA 3PUVE 3RGYA 4LA9A 3ILTB 5A5XB 4YKPA 1FTKA 1XS5A 1LAGE 4ZEKA 1OQGA 1II5A 5B70A 4U22A 2CZLA 4JWOA 2ZYKA 5DYHA 5ITOA 4PFYA 2I0CA 3T66A 4C1TA 3H7MA 2A5TB 4YB5A 4KR5A 3CSBA 1QUIA 3PPQA 1MQDA 3T93B 1AOVA 2QPQA 4JSDA 1M5FA 1JVYA 1N0TA 4H0WA 4G8MA 1N3XA 5H8SA 4BDLA 4IGRA 3VXCA 2HAVA 4FATA 3KGCA 1MS7A 1BP5A 4JDFA 3U94A 3H6UA 2KLFA 1QULA 3E4RA 3K00A 1HSEA 1ZLQA 3IB0A 5TP9A 2FNCA 3V8XB 2O51A 1FTJA 3QXMA 3MW0A 1B3GA 2I3VA 3T9HB 4THIA 3K01A 2F5XA 2PVUA 4EXLA 5L9MA 2PMSA 3SDFA 1S50A 4F31B 3GXAA 1QUJA 2QJEA 2OK2A 2BJJX 1BIYA 1MH3A 1FCKA 1AMFA 2QS1A 2QMWA 4U23A 3C35A 1Z7ME 3MVXA 3VFJA 2RC8A 3VE1B 2DOJA 1ZTYA 1LAHE 4BLAA 4EQ9A 3LR1A 3HV1A 1B3EA 1H76A 3V83A 3M3KA 4H5GA 2DWAA 3OO7A 2HCAA 2I3WA 4IGTA 1UTHA 3TFLA 3KN7A 3B6TA 2Z23A 4E0XA 3IR1A 4JBZA 1ZMGA 4BDOA 3H6WA 3EN3A 4GQOA 4IY5A 4RY1A 2HZLA 4GFRA 1SBPA 4F2OA 4I62A 1WDNA 1NH8A 3FV1A 3CFXA 1FTOA 1F9BA 4F1YA 2V3TA 4YICA 1I6AA 4NEDA 3CIJA 2H4IA 2OLBA 1Y4CA 1MQHA 4NF6B 3RQTA 1QKAA 4H65A 3TTNA 4F3PA 1LCTA 4R74A 1UTBA 2H25A 3A09A 1SDXA 4I8CA 1WODA 4FEDA 1FW0A 5IAIA 1QVSA 4JWYA 4NWDA 3O6IA 5H8FA 4FAJA 1H3DA 4U4SA 2DE4A 3O28A 4EF2A 3VV5A 4Q5TA 2ONKE 1UTBB 3K1MA 4N6PA 3TMGA 3S9NC 2REGA 2ESNA 2AL5A 1JQFA 3RY3A 5H8FB 3TKDA 3EHSA 1A99A 2DWIA 2FYIA 4KFQA 3HN0A 3OO8A 1YPNA 1FQDA 2WKYA 2QL3A 2QRYA 4YB7A 5H8HA 3RPWA 4IY6A 4AQ4A 2Y7KA 3Q29A 4DXCA 3WAFA 1B0LA 1PBPA 4GOTA 3K6VA 4U2RA 5H8HB 3MZ1A 3UA8A 4HTGA 3PD8A 5I84A 3CG3A 3GBAA 5AE4A 1IIWA 4PFWA 4I1DA 1IUDA 4KYDA 3ZKLA 5I2KA 3Q27A 3PUXE 1VFDA 3KJ7A 1Z7NE 2P0SA 3SESA 1FQCA 3BFTA 3OOAA 1O63A 4KQPA 4GWOA 3CVGA 4H6DA 2REJA 4EXKA 1GGGA 3IB1A 3VVFA 4QFNA 1N84A 3B7DA 1I6BA 1P1UA 4NE4A 3E9XA 1SW4A 4XKRA 3G3KA 1B32A 4OWDA 3CG1A 2I4CA 1S9TA 4R9GA 4RK9A 3T96B 4HW8A 3L6GA 4ECFA 1SQYA 4ZEDA 3W9WA 1R9LA 2H5YA 2P2AA 3N5LA 1B3HA 4YKJA 5ICQA 1AL3A 4TLLB 3L6HA 4ZEIA 1B51A 1IXCA 4BDNA 4JXIA 3FVNA 1POY1 3V5AA 5IKBA 1XHYA 4ZZAA 1D9VA 4QFKA 1TFAA 2Z22A 1ZU0A 2Y84A 1MDQA 2V3QA 2Q89A 2PBWA 3RLFE 4N13A 4YZZA 4ZDMA 4QF9A 5JK4A 1FTMA 1PDAA 2GRVA 4ND9A 2Q88A 2QS4A 2QS2A 1PC3A 3IOTA 4IO4A 1N7XA 3K1NA 3S4UA 3KBRA 1LBCA 2XXRA 4WEPA 3TYHA 4R6HA 1URDA 2DSFA 2RKMA 2XX8A 4ELPA 5K2XA 3ONMA 2ONRA 1DSNA 4YU0A 4KD5A 3FXRA 4DDDA 3IJXB 2OBGA 2GFEA 1NL5A 1B5HA 1H44A 1P1QA 3H06B 3G3GA 4GRKA 3S9EA 3TDJA 1WVJA 4G68B 5KZTA 1ZBMA 4FIMA 1NKXA 4PQJA 3FZVA 1M5DA 3SEYA 5TU0A 5CBRA 2AIXA 1BTJA 4RPOA 4PP0A 2F78A 2VGQA 2LAOA 2FA7A 4R2FA 2Y7WA 5I57A 1MY0A 4R72A 2XX9A 2YLNA 3O6GA 2UVJA 2F36A 4OQOA 4ZE9A 3LSWA 5A5XA 5EYFA 4HS7A 5F1QA 3U72A 5I59B 5I57B 3G3JA 2V93A 2X26A 1OVBA 4TOZA 4F3BA 2P1SA 4IB2A 1MM7A 2XXPA 3MP8A 4DZ1A 4ELRA 2DWHA 1AIVA 4ZECA 5M2VA 3OO9A 2A5TA 2Y7PA 4QFOA 4NTLA 3HCQA 2E1SA 4F3SA 1A40A 4C0RA 4R6YA 1NMUA 4NWCA 4L17A 4UA8A 1MY4A 1TXFA 2B3FA 5AA3A 3HPIA 2Z8FA 3I6VA 1M5EA 3ILUB 2NVUB 3OEMA 4YAHX 3M3FA 3K6XA 1OMPA 2UYEA 1PB7A 1TT1A 3TCGA 3O66A 4Q30B 2OZZA 4NF5A 4IO3A 5FTHA 5BWJA 1DTGA 2G93A 1MRPA 3FXUA 4GXSB 3PMXA 4PE5B 2XX7A 1MPBA 1O64A 2Y7RA 4KCDA 4LZ7A 3RN8A 3C31A 4F19A 4M1VA 4NF5B 4TQUQ 1LB8A 3IB2A 3UORA 2RCBA 5EHMA 4I9DA 1FQFA 5AA4B 3SERA 3TTKA 3E13X 4F29A 4OFJA 2VOZA 3UK4A 1MY2A 3KOSA 2THIA 3PD9A 1IZ1A 3MVYA 2QMXA 5I2NA 4G4PA 3KN3A 3TPAA 5CMBA 2O68A 3ZSFA 3VDFA 2XXHA 1UIVA 2A5SA 4GXAA 2ZNTA 3VXBA 4OENA 1B6HA 5I2NB 1OLCA 1JNFA 4ISUA 3QUFA 3KEIA 4Q8RA 1N76A 4FECA 2RC9A 1DOTA 1HSLA 3K6WA 5I58B 3RUMA 5ISUA 1Y1MA 3SETA 4G2ZA 4K3FA 4O3AA 2PYYA 2RF1A 3PUYE 3U93A 2VD2A 2HZKA 4NF6A 2QS3A 3CFZA 4F39A 3DP8A 4GF8A 1FTLA 3IOVA 1B46A 4EF1A 3R6UA 1TFDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RYXA 4YMAA 1DK4A 3KFMA 4MLQA 2DWJA 4F3GA 4U1OA 2XXXA 4I3YA 2WYPA 1GV8A 3CI8A 1IXHA 3S9LC 3UN6A 5DVIA 1A54A 5EHSA 2F35A 3T9VA 3O9PA 3RT8A 5TPAA 4N07A 1LAFE 1PB9A 2JJKA 3PPRA 1MDP1 3FXQA 2DE2A 2Q9TA 1POTA 3KBZA 4DXUA 3SZPA 1B1XA 4HCYA 4LZ5A 3OENA 1B40A 5CMKA 4GWZA 4MFIA 1FPLA 1ZJLA 3KOTA 5T3JA 4H8IA 1IXGA 2DVZA 5TPAB 4KYSA 5CMCA 2CMOA 1LEVA 2I49A 3B6QA 4H67A 1QGXA 3A29A 2XD3A 4XKPA 4PCDA 3U65A 1SW5A 5DVJA 2DQVA 2RC7A 4PFIA 2H99A 3PPPA 3MSTA 1A8FA 3B6WA 4C1UA 1NNTA 5ET7A 2I6EA 1NFTA 4PC9A 4O7MA 1KWHA 2FBPA 3QMFA 4OFOA 4FE8A 4X04A 4GWWA 3T9UA 4P3LA 1JVXA 4IO5A 5IZ3A 4ESWA 4G68C 3SKPA 1N7WA 2RCAA 3H3GA 2QVUA 3R26A 3ZKKA 2NOOA 3MP6A 3DP6A 2D3IA 3MYUA 1MXWA 2ZXTA 3O29A 1K9ZA 5FTIA 3K4UA 3MBPA 3FASA 1HSJA 4G77A 4POWA 1VSOA 1NNPA 5LTCA 3N6UA 1USYH 4OXVA 4N6KA 3T9XB 4M4GA 4WKMA 3B50A 2OWTA 4AB6A 2XD2A 4U21A 3HO7A 1B3FA 2E0SA 2NUVA 3OSRA 4G8NA 1FSAA 4YMBA 3KJTA 5FHOA 4F22A 5AA2A 1MXYA 4NMYA 3MZBA 4X48A 3PPNA 2F7AA 4DXBA 3BFUA 2O7IA 2DDKA 3G7WA 2XXVA 4GBWA 4ZE8A 4R6KA 1ATGA 1B9JA 3FVKA 1DPEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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