1BLFA

Structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 angstroms resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
685
structure length
685
Chain Sequence
NVRWCTISQPEWFKCRRWQWRMKKLGAPSITCVRRAFALECIRAIAEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRKSCHTGLGRSAGWIIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCIDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSSREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNSRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSRSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTTLKNLRETAEEVKARYTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVKQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron-binding protein
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Three-dimensional structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 207
structure length 685
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA03
1Y1ZA 1WVJA 1AL3A 3OXNA 2OK2A 4UA8A 1MY3A 2RC7A 3VVFA 1J1NA 4JWXA 2UVGA 3CI8A 5DEXB 1JNFA 2Z23A 3BKIB 5ICQA 3CFZA 1VR5A 5TP9A 2I6EA 4E0WA 1MH3A 4QFOA 4R6YA 3V83A 4QFKA 4R73A 4G2ZA 1OLAA 4ELRA 2XX8A 4L17A 2DS9A 3IB1A 1JVYA 1MQIA 4AB6A 4FEDA 4MLVA 2XXYA 1XVYA 4R9GA 1LAGE 5I56A 1QKAA 1IXHA 1JW5A 1M5BA 3MPKA 4PFWA 1Y9UA 2ZYMA 1H76A 1UTBA 2O1LA 1N04A 3K1NA 1IUDA 1AMFA 1LLSA 4YB7A 4KCCA 3MQ9A 2LAOA 5I2KA 4U22A 2XD2A 2DWJA 2DQVA 4GOTA 2DVZA 3A09A 2M8CA 1B05A 1PBPA 1US4A 1B1XA 3G3JA 4XKQA 4NEDA 4XIGQ 4ZEBA 4M4GA 5M2VA 3ZSFA 1LFHA 1B3EA 2H99A 1SW4A 1VE4A 3EQ1A 4FAJA 3IOTA 1QUJA 3KN7A 2DXYA 2DP8A 4KD5A 2HXWA 3QXMA 2NXOA 2F7AA 3HCQA 1II5A 4LONB 1NNTA 3KSXA 5FHOA 3LSLA 4NF4A 2HAUA 4IGTA 4U4XA 2QPQA 1FCKA 3UP9A 1A8FA 3T66A 4H6DA 3RTFB 4WKMA 5HM4B 1Y4CA 3PV0E 3QUFA 2P2AA 1I6QA 4P11A 1DMBA 4TQUQ 4LVQA 1NH8A 3I6VA 3K02A 4HS7A 2E1SA 1P1WA 1ZU0A 1SDXA 4Q5TA 3B7DA 4E0XA 1I6AA 3W9WA 3C9HA 3S9EA 1OIBA 2B3BA 1S9TA 2DVCA 5HBCA 2I0CA 1IEJA 4EQBA 4NF8A 1NKXA 1LB9A 3KZGA 5I58A 1IXIA 4LUBA 2GHAA 2VOZA 3LSWA 1Y3NA 3HV1A 3KG2A 5TP9B 1D9YA 1UTHA 1B0HA 2XXUA 4LQ5A 3KSJA 1OLCA 1YPNA 5H8FA 3PPRA 4P0GA 1B7ZA 3MZ9A 3OOAA 1H43A 4G8MA 3LUYA 4NMYA 1B3FA 3MAMA 3O66A 3OMBA 1MXYA 1LAXA 2CMOA 1WODA 1P99A 3PPQA 2F7CA 1ZJLA 1OVBA 1NL5A 4YZZA 1RYXA 1MPBA 3C33A 4O3AA 3AXFA 2B65A 4N07A 1IIWA 3TFLA 2XXHA 2NVUB 3S9MC 3PUYE 1SW1A 2ZYNA 4RPOA 2ZNUA 3CG1A 1N7XA 3PMVA 1N3XA 3G3FA 4LA9A 4GQOA 4OTEA 3IO6A 1XHYA 1B7UA 1FTJA 4X1DA 1B58A 2RKMA 4OXVA 5HPQA 4OERA 1PB9A 3RPWA 2UYFA 4G68A 4GF8A 2AYSA 1DTGA 3IORA 3IB0A 1BKAA 4IGRA 4DLDA 2A5TA 1ZLQA 1EU8A 1LAFE 1ATGA 1B52A 1QULA 5KDTA 3RQTA 1FW0A 4R9FA 4YU0A 3FVGA 4U2RA 2PT1A 1A8EA 1R9LA 3G3HA 1Q35A 4GLIA 3Q27A 4JWOA 3IJXB 3TKDA 1XVXA 3C36A 4PETA 4XTCQ 4ZE8A 4QSDA 4F3GA 3W9VA 5I58B 2ANJA 3PD8A 2V93A 5JEIA 2X26A 3GZGA 1UTHB 2F36A 3USDA 3IX1A 4KHZE 5H8FB 1NNFA 1R9QA 4JSDA 2XXRA 4U23A 1O7TA 1ZIUA 4YKIA 3T9XB 4NE4A 4OYVA 4ZE9A 3MP8A 3N94A 2RCBA 2D5WA 3T9UA 4ZZAA 4QFLA 1GR2A 4JBZA 4AB5A 2Y7PA 1BIYA 3QSLA 4POWA 3P7IA 2ONRA 2RINA 1A7LA 3IOUA 4GFRA 4N6PA 4M1VA 3TTRA 4OHNA 1URSA 4KYDA 3FXRA 3K4UA 1PB8A 5CMMA 5DTBA 3MVXA 4KPTA 2THIA 5ITOA 4EQ7A 2HZLA 3K0VA 3PPNA 2DXRA 4U21A 4ZS9A 3H6VA 2OBGA 4C0RA 2ZYKA 1MXUA 4X48A 4NWDA 4F39A 1P1OA 2O6AA 5L8DA 1B32A 2V84A 4ZZEA 4RNSA 3CSGA 5KDTB 1Y3QA 1TT1A 3JYRA 1GGGA 4G68C 1MY1A 3MJNA 4KQPA 3OENA 1FTKA 3FZVA 5TPAB 2BJJX 3VLWA 3S4UA 4ZEIA 3B6QA 1D9VA 1PC3A 2DWIA 5I57A 1IXGA 5CC2A 2XD3A 1ZTYA 4HCWA 4IO2A 1GTKA 1YCJA 1LAHE 3LBSA 3RGYA 3FJGA 1MY4A 4PFYA 2UVJA 4IO6A 2ZNTA 1JETA 1F9BA 2ONSA 2I49A 3MW0A 2XX7A 4R6HA 3QYTA 3O2AA 4ELPA 4IY5A 2REGA 2GH9A 3Q28A 1N3WA 2XXVA 4EUOA 1EZ9A 2QRYA 3FIRA 4ESWA 2I58A 3K6UA 3M8UA 4GWOA 5EHSA 4EDPA 3K1PA 3U94A 2H4IA 2VP1A 1UIVA 5L9SA 1SQYA 4QSCA 3OEKA 1UIUA 4Q0CA 2G29A 2UVHA 4IO5A 1JEVA 1R1NA 3VLVA 5CI5A 3TCFA 3O97A 3EHTA 4BDMA 3G3GA 3TELA 1QJMA 4P0IA 4G4PA 3HN0A 3PMWA 5H8SA 2OJTA 2PYYA 3M3KA 1MQGA 5BWJA 1POY1 1Y3PA 3LR1A 3ECRA 4OMBA 2QS4A 4MF3A 3KEIA 4K3FA 4YICA 1MXXA 3RTWB 1QW0A 4IO7A 4F19A 3DP4A 4F29A 4IB2A 5I84A 4RJZA 3UORA 3PUXE 5F7VA 3HO7A 3MVZA 4NF5A 1JW4A 3B6WA 4JXIA 3MWBA 1B46A 3A3CA 3VLUA 3SERA 3HHGA 3TTMA 2HEUA 5K2YA 1AH5A 3ZKKA 1Y20A 3SESA 4DZ1A 1H44A 4POXA 4XKPA 5I57B 5KZTA 1QKBA 4C1TA 1EH3A 1ZKBA 5L9OA 3TAJA 3PUZE 3SEUA 5ELVA 4LZ5A 1FTOA 1N0TA 3JZJA 4EXKA 4OENA 1O63A 1LFIA 4UACA 1UQWA 1LGBC 4ZEKA 3WAEA 3IK6B 2YPNA 3V89B 3UGWA 3CG3A 2REJA 3FVKA 3D4CA 1ELJA 3TPAA 1H3DA 1DPPA 1LB8A 1L5TA 1MQJA 4U4SA 2F8DA 2ZXTA 3LSFB 2XXIA 5CM6A 4ND9A 1VSOA 1A55A 3CSBA 1TFAA 3TYHA 4YAHX 4DE8A 1SI1A 4BDQA 2XXWA 4PFTA 4PFUA 4NTLA 1LCTA 4IO4A 3SDFA 3HHFA 3CR9A 3THIA 5ICTA 3O28A 3SEWA 4R6KA 5AA2D 1MPDA 4GL0A 2F6GA 2OLBA 3H03A 3VXCA 2XXPA 4ELOA 3VE1B 3RY3A 2AL5A 3N5LA 2PX1A 2DWHA 4HW8A 3IR1A 1OQHA 1HSEA 1POTA 5K2XA 4NF5B 4MBPA 1LBBA 1I6BA 4OETA 2OZZA 3MVYA 3KOSA 3K2DA 3T22A 1HSLA 2RC8A 5FHNA 4YKKA 4X9TA 4ECFA 3FATA 3GBBA 3KFMA 3VVDA 2Y7IA 1TFDA 1FQCA 3K01A 1MM6A 2V3UA 3KOTA 3RLFE 4IY6A 4PQJA 3GXAA 4DXCA 1XC1A 1ZBMA 2I0BA 5L9MA 2RC9A 4JB7A 4MH5A 3OO6A 3U93A 1P1QA 3RN8A 1OQGA 3QIMA 1B2HA 1B6HA 3DP6A 3SKPA 3ILTB 3PPOA 3IB2A 2HCAA 4F1UA 2F6PA 3UA8A 3C32A 3OO9A 4F3BA 3SEYA 2ALUA 2OCUA 3PUVE 2D3IA 2DSFA 2F97A 2I48A 4QSEA 4I9DA 4F3SA 2Y7WA 3Q25A 1DOTA 3V8XB 3N6UA 1URDA 2G93A 4LATA 1B51A 5TPAA 4KCDA 3K6XA 3PD9A 3FJMA 2DOJA 1A40A 2P1SA 4GXAA 1B5JA 2H9BA 2Q2CA 4OFLA 3U1OA 3SETA 1FQBA 5CMKA 4IO3A 3PGFA 4JSOA 1B7HA 4F31B 3L6HA 3U8QA 2PMSA 1S7YA 4F22A 4OZ9A 3O6IA 5KCJA 5DVFA 1B5HA 4OWDA 3ZS6A 2FA7A 4GXSB 4G77A 1MRPA 3OSRA 3BBRA 3EF7A 1BTJA 2NUVA 3QK6A 4H1XA 3T9VA 5F1QA 2D21A 4F2QA 2IA4A 2CZLA 1MY2A 3MZ1A 3LC8A 3MP6A 2OWTA 2O69A 3TTKA 5JK4A 3R6UA 1LBCA 3RUMA 3K6VA 5H8NA 3ODBA 3FVNA 2B3FA 5CBRA 2DE3A 3H06B 4R74A 2XXTA 1XOCA 2YLNA 4ZEFA 3T96B 3M3FA 3LSXA 4TLLB 4YB5A 3CVGA 1B3HA 2W7YA 1QUIA 1NNPA 1B0LA 1MDP1 4KFQA 2QMWA 3UK4A 1Z7NE 3QAXA 3TDJA 5A5XA 3N26A 1MS7A 3RT8A 1VFDA 1JVXA 2DE2A 2ZNSA 1D4NA 5IAIA 3G7WA 1SYHA 1B5IA 4LZ8A 3S9NC 2R6GE 3TTLA 4GIZA 3D4GA 3N6TA 3R26A 3TMGA 5DYHA 1MH4A 1RYOA 1SW5A 1BLFA 4TLMB 2NOOA 5CMBA 1MXWA 3TTNA 4GD5A 1LCFA 1A54A 3V5AA 3MVWA 3BFUA 1MXVA 4GVOA 5AA4A 2RF1A 4THIA 1GVCA 5EYFA 2HAVA 1MQHA 3M3LA 5H8QB 4G8HA 3FV1A 4H0WA 4YKJA 3GLBA 2OWSA 3FASA 4YKPA 3UN6A 5KCJB 3CFXA 3FGSA 3SEXA 1PBQA 5I2NA 4EXLA 3O29A 3OELA 4H65A 2R71A 4GRKA 1MM7A 3DM0A 2F34A 3CFLA 3C31A 3GBAA 3FV2A 4RYAA 2V3QA 1XT8A 2V25A 2UXAA 2Z8FA 4RK2A 3E9XA 4BDLA 4YMAA 3IJOB 2QSXA 3TEPA 2ESNA 3O6GA 1MY0A 5ITPA 4R72A 5H8NB 4PP0A 2I3WA 3H7MA 2QL3A 3DP8A 3RT6B 3FJ7A 2O1MA 2VD2A 4OESA 3C35A 1QUKA 3HPIA 3H6UA 3TCGA 2RCAA 4Q8RA 3ILUB 4FE8A 4FJPA 5A5XB 1B4ZA 4MLQA 1ZMGA 4C1UA 4BDNA 2GFEA 1YTVA 1D3KA 1GV8A 3ZKLA 1IXCA 3TCHA 2NWJA 4EF1A 2DYXA 2VHAA 3IOVA 3OSQA 1IITA 1O64A 4U1OA 3FXUA 4H67A 2PVUA 2Q89A 3MUQA 3MC2A 3PPPA 4EF2A 4H8IA 4G8NA 1Q1KA 4BLAA 5AA4B 4FATA 3R7XA 3KN3A 4BDRA 1T0KA 3IAZA 2Y7RA 3WAFA 4R2FA 4FECA 4JWYA 5AA2A 2X7PA 1WDNA 4H8JA 3TQLA 1Y1MA 5AA1A 2P0SA 1A99A 2VGQA 4DDDA 1MXZA 4I62A 4BDOA 5I2NB 5AE4A 4ISUA 2DWAA 3JV9A 4WXJA 1MQDA 4O3CA 2Z8DA 1P1UA 4KR5A 4I1DA 1MPCA 3Q26A 3SEVA 3H3GA 4RK9A 1R6ZA 1B40A 3MPLA 4YB6A 1SD3A 5CMCA 2O51A 1US5A 2V3TA 3HSTA 3K6WA 3I5OA 4KYSA 3TUSA 2XXXA 3OEMA 1RKMA 1P1NA 3FXQA 1TXFA 1M5DA 3O9PA 4PE5B 1M5EA 4NWCA 5LOMA 3EHUA 3OO7A 3FD3A 1B3LA 1M5FA 2F7BA 5BUUA 3S9LC 1VFEA 4Q30B 3G3KA 3PU5A 5IKBA 2ABHA 5AA3A 1LSTA 3VV5A 4ESXA 4EQ9A 1B1HA 4OQOA 3UIFA 4F2OA 4KI0E 5DT6A 1JEUA 2I4BA 5B7DA 2F78A 3TZAA 1B3GA 2Q88A 4XKNA 2QJEA 1FQFA 2F5XA 1OMPA 1JQFA 4ELQA 5H8HA 1Z7ME 5FTHA 3T93B 5I56B 3MBPA 2YJPA 4QF9A 5CRYA 3Q29A 4F1VA 1UTBB 4FORA 3C34A 3ONMA 2UVIA 5DVJA 2HQ0A 2QS2A 4F18A 5I2KB 3IL1B 4QHQA 2XX9A 4NF6A 3OD7A 2IEEA 2R9JA 2FYIA 3B6TA 3OO8A 1N84A 4DCYA 1FQDA 4AQ4A 4X1BA 5AA2B 5DVIA 2AIXA 3I3VA 3KN8A 2I3VA 1SW2A 5I59A 1B9JA 2QMXA 2QS3A 3MZBA 3A3UA 4LZ7A 4NF4B 1MDQA 1FQAA 4RPNA 2HFBA 2AL4A 3FVOA 3L6GA 1NMUA 4OFOA 4WEDA 3CRBA 1ANFA 1DSNA 2KLFA 4JDFA 3TQWA 1USYH 1AOVA 3VVEA 1MG1A 2Q9TA 4I8CA 4QFNA 4XXUA 4DXUA 3O6HA 4KYEA 4DCXA 2HZKA 2ZYOA 4RXLA 4HTGA 3EPEA 4ZEDA 2H25A 1N7WA 1SYIA 3H4ZA 3KJ7A 3U92A 2UYEA 3PUWE 1JW1A 4NF8B 5H8QA 4ZDMA 4DXBA 4RA1A 1AIVA 3E3KA 3DELB 4R75A 3W15C 2H5YA 1USYE 3VFJA 3IOWA 1DPEA 1BP5A 1B4HA 3KBRA 5EHMA 3U72A 4F3PA 3EN3A 2DE4A 5FTIA 4OFJA 3RNNA 2VD3A 1YAEA 1IQ7A 5H8HB 3IO4A 1SI0A 1FTMA 1HSJA 4ZECA 2PT2A 2Y7KA 5JTYA 4H5FA 2Z22A 4OEUA 4MFIA 2O7UA 3G3IA 1PDAA 2O84X 1NNKA 4N13A 3KJTA 5J1DA 2Z8EA 4NF6B 2GRVA 4GL8A 3K00A 5DEXA 4ONYA 2O68A 1QVSA 2Q8JA 3E13X 4LP2B 4RY1A 5TU0A 3F11A 5B70A 5I59B 2GHBA 4U1ZA 3BFTA 3MP1A 3H6WA 3S2VA 1I69A 2PBWA 2XXQA 2I4CA 2ZMBA 4XKRA 4LQ2A 4G68B 5CBSA 4HCYA 3QUJA 4FIMA 5ISUA 2H98A 2A5TB 2O7IA 3VXBA 3FUZA 3DLNA 4Z7EA 1PEBA 3CIJA 4O3BA 4DIGA 4F1YA 1LFGA 1SVXB 1EZPA 1IZ1A 2X7QA 2ONKE 2QS1A 1NFTA 2Y84A 1H45A 4FEBA 2WKYA 4OEVA 3T9HB 4WEPA 4YMBA 2A5SA 3E4RA 3PMXA 3VDFA 2E0SA 3EHSA 3H6TA 1FQEA 1EZOA 1OVTA 1DTZA 1FTLA 1Y4TA 2FNCA 1PB7A 1S50A 3TODA 4QFPA 1TWYA 4OVJA 2Q2AA 4H5GA 2XHDA 1KWHA 1M5CA 2F35A 4TOZA 1CE2A 3K1MA 1SBPA 5JTYB 4QRZA 4R2BA 1NH7A 1N76A 4Z0IA 3C4MA 3KGCA 1URGA 5FHMA 1CB6A 1XS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y1ZA 1IMDA 1WVJA 1AL3A 3OXNA 2OK2A 4O7IA 4UA8A 1MY3A 2RC7A 3VVFA 1J1NA 4JWXA 2UVGA 3CI8A 5DEXB 1JNFA 2Z23A 3BKIB 5ICQA 3CFZA 1VR5A 5TP9A 4N17A 2I6EA 4E0WA 1MH3A 4QFOA 4R6YA 3V83A 4QFKA 4R73A 4G2ZA 1OLAA 4ELRA 2DDKA 2XX8A 4L17A 2DS9A 3IB1A 1JVYA 1MQIA 4AB6A 4FEDA 4MLVA 5ET5A 2XXYA 1XVYA 4R9GA 1LAGE 5I56A 1QKAA 1IXHA 1JW5A 1M5BA 3MPKA 1FPBA 4PFWA 1Y9UA 2ZYMA 1FBFA 1H76A 1UTBA 2O1LA 1N04A 3K1NA 2WBBA 1IUDA 1AMFA 1LLSA 4YB7A 4KCCA 4MNCA 3MQ9A 2LAOA 5I2KA 4O94A 4U22A 2XD2A 2DWJA 2DQVA 4GOTA 2DVZA 3A09A 2M8CA 1B05A 1PBPA 1US4A 1B1XA 3G3JA 4XKQA 4NEDA 4XIGQ 4ZEBA 4M4GA 5M2VA 3ZSFA 1LFHA 1BK4A 1B3EA 2H99A 1SW4A 1VE4A 3EQ1A 4FAJA 3IOTA 1QUJA 3KN7A 2DXYA 2HXRA 2DP8A 4KD5A 2HXWA 4P8BA 3QXMA 2NXOA 2F7AA 3HCQA 1II5A 4LONB 1NNTA 3KSXA 5FHOA 3LSLA 4NF4A 4GWZA 2HAUA 4IGTA 4U4XA 1D9QA 2QPQA 1FCKA 3UP9A 1A8FA 3T66A 1FPFA 4H6DA 3RTFB 1FRPA 2CZKA 1DBZA 4WKMA 5HM4B 1FPGA 1Y4CA 3PV0E 3QUFA 2P2AA 1I6QA 4P11A 1DMBA 4N91A 4TQUQ 4LVQA 1NH8A 3I6VA 3K02A 4HS7A 2E1SA 1P1WA 1ZU0A 1SDXA 4Q5TA 3B7DA 4E0XA 1I6AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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