1BLFA

Structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 angstroms resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
685
structure length
685
Chain Sequence
NVRWCTISQPEWFKCRRWQWRMKKLGAPSITCVRRAFALECIRAIAEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRKSCHTGLGRSAGWIIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCIDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSSREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNSRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSRSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTTLKNLRETAEEVKARYTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVKQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron-binding protein
publication title Three-dimensional structure of diferric bovine lactoferrin at 2.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 207
structure length 685
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1blfA03
1D3KA 5KDTB 2D3IA 4HCYA 2XXVA 1MXUA 2KLFA 3N26A 5TPAA 3M3KA 1B40A 1H45A 5TP9A 2F6PA 5DEXA 4PP0A 2HZKA 2QSXA 2F8DA 3DP6A 4GFRA 4JDFA 2F7BA 4RK9A 5J1DA 1JVXA 1PB8A 2ABHA 3PUWE 4ZEIA 3MZBA 1B1HA 1JW4A 3PUVE 4MF3A 4MBPA 4R75A 4X1DA 1II5A 2DOJA 2O7IA 1N76A 3RLFE 3EPEA 3VV5A 1ANFA 3PPPA 3O6HA 5ELVA 3UA8A 3U92A 3VE1B 3K1PA 4GOTA 4R74A 2F7CA 3O2AA 1MG1A 1B46A 1IIWA 4AQ4A 1A40A 1TFDA 5HM4B 4NF5B 4XKPA 4OZ9A 1Y9UA 4IGRA 5CI5A 2F7AA 4G8MA 3SEYA 4AB5A 1LFGA 1Y1MA 2QJEA 1JQFA 1UIVA 3IB2A 2RKMA 5A5XB 5IKBA 4KPTA 1XHYA 4F1UA 1TWYA 1QW0A 4X48A 1AL3A 3KFMA 4G8HA 1OVBA 2Z8DA 2VHAA 1NNFA 2Q89A 4EQBA 3O6IA 4P0IA 1JNFA 4HW8A 3MQ9A 2HFBA 3W9WA 3TODA 4KCCA 3DELB 3P7IA 2D5WA 2Q9TA 3RQTA 4P0GA 2A5SA 1S7YA 1B5IA 2DQVA 3TCGA 3KOTA 1FQCA 4XTCQ 1Y4CA 5BWJA 4KYDA 4ZDMA 3RTFB 4IO6A 2PMSA 1B3FA 1FTKA 3CI8A 4R6HA 4LONB 2Z23A 1MDQA 1D4NA 2XXHA 2UVIA 2Z8FA 4DE8A 5FHMA 3LSFB 1B0HA 3TQLA 2Q2CA 4LZ8A 4ZEKA 3PUYE 3V5AA 2UVJA 1BLFA 1GGGA 2OJTA 3FXUA 4ND9A 3IB0A 4R2BA 4KI0E 3PPQA 2DE4A 4FIMA 3OSQA 3PPOA 4MLVA 3QYTA 4NF6B 3R7XA 3CFZA 3TTLA 1B5HA 2RF1A 4NF4A 4HTGA 1B0LA 1MXYA 2I3WA 2RC7A 4PFWA 5JTYB 2P0SA 3MPKA 5AA2B 3K6XA 1MQGA 2RC8A 4YB5A 4OETA 1VFDA 3MC2A 4MH5A 4LQ5A 1US5A 2W7YA 2QS1A 2ZYMA 3RTWB 3SEVA 1XOCA 2CMOA 1EZPA 4KQPA 5L9SA 2OK2A 2I49A 5FTHA 1LAXA 1MY4A 4ESWA 3OENA 3IL1B 1VSOA 1JW1A 3SETA 3C36A 2VP1A 3TUSA 5AA4B 4QFKA 5I59A 3HSTA 5I57B 1UQWA 3K1NA 1M5BA 3FIRA 4O3AA 1ZKBA 3VVFA 5H8NB 5TU0A 4OQOA 5I2NB 1A7LA 3Q27A 2V84A 3H6UA 4H6DA 1MY2A 4JB7A 1UTBB 4QF9A 1DOTA 3IJXB 3FZVA 2NVUB 2F35A 4JBZA 4Q8RA 3KBRA 4P11A 1MH4A 3FJ7A 3O66A 2AL4A 1YPNA 1J1NA 2XD3A 3A3UA 3T9XB 4R6YA 2G29A 3H6TA 3MVYA 5AA3A 3OEKA 2NUVA 3TEPA 2NWJA 1NH8A 2ZYKA 4TLMB 3N6UA 3M3LA 1ZIUA 4BDQA 2ANJA 2RCBA 4M4GA 2OBGA 3D4CA 3HHGA 3FJGA 3IO4A 2REJA 1MQHA 1A8FA 1SQYA 5DT6A 3KN7A 3E4RA 3KG2A 1Y4TA 1GTKA 4ZE9A 3F11A 4G68C 3K6UA 4R9FA 4F29A 5KDTA 3VLVA 4U22A 1FTJA 1D9VA 4IO7A 1B3HA 4IB2A 4ZEFA 1A99A 3M3FA 2Y7RA 3HN0A 2IA4A 2VGQA 1NNKA 4RY1A 5JEIA 4WEPA 3PPNA 1P1NA 2OCUA 2O6AA 5ISUA 4XKQA 3LSLA 2F78A 5FHNA 4GVOA 4UA8A 2CZLA 1H43A 3C31A 3VLUA 2DXRA 4N6PA 4X1BA 1MXVA 4JWXA 5CM6A 5M2VA 3VFJA 1POY1 3GXAA 2QPQA 4XKNA 2GFEA 3EHSA 2O1LA 1Q1KA 4U21A 3O9PA 4IGTA 3QIMA 1IITA 1SW2A 5B7DA 2VD3A 5H8HB 4O3CA 1B3EA 4R6KA 2NOOA 1MM6A 4O3BA 2P2AA 3K0VA 3EHUA 1LBCA 4OMBA 4F3GA 3EN3A 1P99A 5H8SA 3MP6A 3R6UA 4IO4A 1B4ZA 4F39A 4QSDA 3PMVA 4DDDA 1DPEA 1M5CA 3Q25A 3UGWA 3TFLA 1XVYA 1AH5A 2O7UA 1Y1ZA 4YU0A 3V83A 4NF5A 1OIBA 3PMWA 3T9VA 3S9MC 2IEEA 1CE2A 4F31B 1NL5A 3G3FA 2HZLA 2XXUA 3VVEA 4QFLA 3N6TA 1B1XA 1R9LA 5HPQA 4JXIA 4OFJA 3MJNA 5A5XA 4GL8A 1VFEA 2O68A 5L8DA 3DM0A 3MP8A 4ELPA 1JETA 3KN8A 3QUFA 2XXPA 4DXUA 1MQJA 2LAOA 2HXWA 3Q26A 3PPRA 2B3BA 2HAVA 1PEBA 2H4IA 4GF8A 5ITPA 2WKYA 4F18A 1QUKA 1LFHA 1BKAA 1B58A 3BFTA 5FTIA 3T96B 5DVJA 3RPWA 5I84A 1H44A 5CC2A 4EF1A 4POXA 1DPPA 4YKKA 4DLDA 4WKMA 1TXFA 3T93B 3E13X 3C33A 4EQ7A 3TCFA 1N84A 1SI0A 4AB6A 3MPLA 3BKIB 4F2QA 3VVDA 4BDMA 1MH3A 1PB9A 1GV8A 3HPIA 1PDAA 2O1MA 2DWJA 4WXJA 1JEVA 3Q28A 3FATA 4NF6A 1O63A 3RNNA 3QK6A 4U1OA 3PMXA 1IXIA 3N94A 4FECA 1OMPA 5F1QA 5HBCA 5JTYA 3JYRA 1D9YA 1N3WA 3KGCA 2Z22A 5AA2A 2HEUA 3ILTB 3VXCA 1MPCA 1EH3A 2XXYA 1B3GA 3QUJA 5DVFA 4Q0CA 1B05A 4BDNA 3CSGA 1DSNA 1R9QA 3CFLA 1VR5A 3CG1A 1I69A 5B70A 4RPOA 1IZ1A 5K2YA 4BDRA 4YKPA 4Z0IA 1BP5A 4OERA 4LATA 1WODA 1Z7NE 1FQDA 2G93A 4XKRA 4DCYA 1UIUA 1NNPA 1FTOA 4H1XA 1LB9A 5AA4A 1M5FA 4YMAA 1FQFA 3A3CA 5I57A 3KJ7A 2OWTA 5H8NA 1JEUA 2PT2A 5L9MA 2BJJX 1Y3NA 4C1UA 4YB7A 5I2NA 4H65A 2HAUA 2PBWA 5H8QB 1DTZA 5ITOA 1FCKA 1UTBA 4MLQA 3IOWA 3THIA 3MUQA 1QKAA 4JWOA 1USYE 1SYHA 1ATGA 4C0RA 3PD9A 3FASA 4H5FA 3SERA 3G3KA 2UYEA 1SW4A 1HSEA 4GRKA 3G3IA 1MY1A 2GRVA 1H76A 1RKMA 3PU5A 3FXRA 3TKDA 3GLBA 3QAXA 4Q30B 4I62A 4NF8B 3S9EA 3RN8A 3KEIA 5I2KB 5H8FB 5EHMA 3MZ9A 1IXGA 3RGYA 3D4GA 1Y3PA 3TTRA 5FHOA 4XXUA 3ZSFA 2DP8A 1B9JA 1SYIA 2O84X 1FTMA 1M5EA 2Y84A 4G4PA 2GHAA 1NKXA 3SEUA 2V3UA 1SW5A 4FAJA 5BUUA 2V93A 3FV2A 3B6TA 2O69A 4YAHX 1XC1A 4XIGQ 4Q5TA 1DTGA 1JVYA 1USYH 3H6WA 2H99A 2ONRA 2DYXA 1B7ZA 1MDP1 3TDJA 2GH9A 4YKJA 4ISUA 2UVGA 1N3XA 3AXFA 3MVXA 2XD2A 3H06B 2R9JA 3ZS6A 1B6HA 3JV9A 5CMKA 5K2XA 3U1OA 4OHNA 3G3GA 1OQGA 5L9OA 4YZZA 1QUIA 4ZZEA 2UYFA 5AA1A 1SD3A 4BDOA 2DWIA 1B7UA 4ELOA 4ONYA 2X26A 4N07A 1ZU0A 3K6WA 3QXMA 3FVOA 3C34A 3IOVA 1NMUA 2REGA 1LFIA 4GLIA 1LAHE 3SEXA 1YCJA 3U94A 5I56B 2F36A 4C1TA 4F22A 3C35A 3PD8A 1I6QA 3OSRA 5H8HA 4U1ZA 4ZE8A 4TQUQ 3LSWA 3OOAA 1PBQA 3USDA 3T9HB 2XXIA 4NMYA 4YB6A 3FVGA 2X7PA 2I3VA 4OXVA 3GBBA 3T22A 5KZTA 2I4BA 4H8JA 1P1UA 4EF2A 3V89B 2PX1A 3OMBA 5CMCA 3UK4A 1M5DA 3OXNA 4FORA 3UN6A 4LZ7A 1MPDA 2F6GA 2ZNTA 3TELA 4EUOA 3IB1A 5KCJB 4I8CA 4Z7EA 2QS4A 1ELJA 4BDLA 4QSCA 2V25A 1Y20A 4N13A 3HV1A 2ONKE 1A8EA 4RNSA 4EDPA 2FA7A 4PQJA 4F1YA 2I6EA 2ZMBA 4ZS9A 4E0XA 4BLAA 3W15C 1IXHA 2E1SA 4THIA 3GZGA 2RCAA 2PYYA 4LA9A 1RYXA 1VE4A 3CRBA 3SKPA 1S9TA 2FYIA 4DZ1A 1AIVA 4G68B 1LGBC 4H0WA 4FEDA 1UTHA 3IX1A 3A09A 2DE3A 1S50A 3G3HA 4MFIA 1SDXA 5CBRA 5ICTA 1N0TA 3N5LA 1QJMA 4FJPA 4GXAA 4GXSB 5DYHA 4M1VA 4OVJA 5CMMA 2RC9A 1Z7ME 1XVXA 4YICA 4NWDA 4DCXA 3T9UA 2QMWA 3RY3A 4H5GA 2ESNA 1PC3A 3HHFA 3IORA 4F19A 1MRPA 2Z8EA 4EXLA 1YTVA 4LP2B 1AOVA 3TTMA 1Q35A 1SI1A 5AE4A 2QS3A 4JSDA 3H7MA 1IEJA 1EZ9A 4LUBA 3HO7A 4TOZA 3MZ1A 3GBAA 2Y7IA 3K1MA 3KN3A 3OEMA 4OWDA 1FQEA 2ONSA 1P1OA 3FJMA 5EHSA 3CR9A 1MQDA 2Y7WA 3MP1A 4ELRA 3LR1A 2Y7PA 3KOSA 2F34A 5LOMA 3TTKA 2A5TB 4IO3A 3E9XA 1I6BA 3O28A 4PETA 4IO2A 4DIGA 2D21A 2XHDA 3H03A 1TFAA 4IY5A 3W9VA 2DWHA 1FQAA 4F3PA 2ZNSA 1EZOA 1A55A 4OFOA 3KJTA 4RXLA 2YJPA 3I6VA 1UTHB 4WEDA 2AIXA 2PT1A 3B6QA 2VOZA 3SESA 2ZYNA 1MXWA 1LSTA 1QVSA 3G7WA 4POWA 3UP9A 2OLBA 4NWCA 4QFNA 1NNTA 4ZEBA 1IQ7A 3B7DA 4UACA 3MWBA 1NH7A 3C32A 1R1NA 3H4ZA 3K2DA 2I58A 5ICQA 4RYAA 1SVXB 5I58B 2F97A 1SW1A 4KFQA 5EYFA 3S4UA 1P1WA 3OO7A 1BTJA 3O29A 4H67A 1B51A 3B6WA 3VLWA 5H8QA 1DMBA 3KZGA 5DVIA 4DXCA 2XX8A 3IOUA 2B65A 3DLNA 3TAJA 2DXYA 2I4CA 2XXTA 4HCWA 4U4XA 3TQWA 3DP8A 2XXRA 1FTLA 1H3DA 2R71A 3S9NC 4OEVA 1LB8A 4NF8A 3MW0A 2E0SA 3CVGA 4JWYA 5I2KA 5H8FA 1WVJA 3UIFA 1URSA 3CFXA 3RT8A 3CIJA 3WAFA 2Q88A 1HSLA 5TPAB 4OYVA 2B3FA 4R2FA 1CB6A 5TP9B 3KSXA 4R9GA 3HCQA 4G77A 3TTNA 1N7WA 3KSJA 5DEXB 3E3KA 3RUMA 1MXZA 4R72A 4GL0A 4RK2A 1MM7A 2RINA 3SEWA 3ONMA 4OESA 2H98A 1EU8A 3EQ1A 2XXWA 2ZYOA 2QRYA 1MY0A 1B7HA 3FD3A 2THIA 3FGSA 3BFUA 3LC8A 4I9DA 1O7TA 3L6HA 4PFTA 3FUZA 2XX7A 3LBSA 3QSLA 4F1VA 1OLCA 4FATA 2Y7KA 2ALUA 1FW0A 1LCTA 1B32A 3I5OA 4YKIA 1B3LA 1N7XA 3OO8A 2UVHA 3DP4A 3K01A 3IK6B 2OWSA 1POTA 2H9BA 2VD2A 1A54A 4ECFA 2V3TA 2FNCA 3LUYA 3FVKA 1PBPA 4KYEA 3FV1A 2O51A 3ECRA 3MBPA 3OELA 4I1DA 2DVZA 3S2VA 1Y3QA 5I56A 1MY3A 3PGFA 3R26A 2Q2AA 1B4HA 4PFUA 3U93A 4TLLB 5CMBA 4KYSA 1RYOA 2F5XA 4GQOA 2R6GE 1MPBA 4NEDA 3UORA 3JZJA 4GIZA 1URDA 4PE5B 3IAZA 4KHZE 4YMBA 2DWAA 4F3BA 3EF7A 1ZTYA 3K4UA 3MAMA 3ZKLA 1URGA 4GWOA 2H5YA 1F9BA 4U2RA 4G8NA 2V3QA 3TYHA 5KCJA 4ESXA 5F7VA 4ZECA 4RA1A 4QFPA 4ZZAA 1T0KA 1LBBA 2ZXTA 4K3FA 4LVQA 3LSXA 1ZMGA 4G2ZA 4LZ5A 4IY6A 3ZKKA 1OVTA 2HCAA 1QUJA 3MVZA 2AYSA 4F3SA 1KWHA 2QL3A 3H6VA 2PVUA 4G68A 4ZEDA 3MVWA 2AL5A 2ZNUA 4LQ2A 4R73A 1AMFA 1PB7A 5DTBA 4QFOA 4U4SA 2I0BA 1B52A 3ILUB 1BIYA 3T66A 4QRZA 2M8CA 3PV0E 1MS7A 3IOTA 5CRYA 5AA2D 4OEUA 1B2HA 3VDFA 4IO5A 4NF4B 3IR1A 4E0WA 3EHTA 1TT1A 3TPAA 1ZLQA 3FXQA 2X7QA 2UXAA 2I48A 2DE2A 4OFLA 4F2OA 1P1QA 1IUDA 1NFTA 1WDNA 4DXBA 4KD5A 1L5TA 4L17A 4OENA 1OLAA 1N04A 3CG3A 4NE4A 2QS2A 3O6GA 2A5TA 1B5JA 4OTEA 2Q8JA 3S9LC 3L6GA 2QMXA 1IXCA 1O64A 1LLSA 3IO6A 5CBSA 1YAEA 2DVCA 4GD5A 1HSJA 3PUZE 3K00A 5I59B 3VXBA 2XXXA 1GVCA 4FE8A 1MXXA 5JK4A 2YLNA 3CSBA 1OQHA 2XXQA 3OD7A 3K02A 4RJZA 3TCHA 1SBPA 1LAFE 3C9HA 4QHQA 2GHBA 2DSFA 4NTLA 2XX9A 1JW5A 1R6ZA 3PUXE 3SDFA 2NXOA 3U72A 3TMGA 1LCFA 3U8QA 2OZZA 1XS5A 4KR5A 4H8IA 1I6AA 1GR2A 3C4MA 1FQBA 3V8XB 3G3JA 4RPNA 2P1SA 5I58A 4X9TA 3RT6B 3BBRA 3Q29A 2I0CA 3O97A 4FEBA 4U23A 3K6VA 1QKBA 1US4A 3IJOB 4JSOA 3TZAA 5IAIA 3OO6A 4PFYA 2H25A 3I3VA 1ZJLA 2YPNA 4EXKA 1XT8A 3ODBA 1ZBMA 3OO9A 2HQ0A 3H3GA 2DS9A 4KCDA 4QSEA 3WAEA 1MQIA 4HS7A 1QULA 3FVNA 4EQ9A 1LAGE 3M8UA 4ELQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D3KA 5KDTB 1FBEA 2D3IA 4HCYA 2XXVA 1MXUA 2KLFA 3N26A 5TPAA 3M3KA 1B40A 1H45A 5TP9A 3D1RA 2F6PA 5DEXA 4PP0A 3FBPA 2HZKA 2QSXA 2F8DA 3DP6A 4GFRA 3SZPA 4JDFA 2F7BA 4UABA 4RK9A 2VPNA 5J1DA 1JVXA 1PB8A 1NV7A 5I3SA 2ABHA 3PUWE 4ZEIA 3MZBA 1B1HA 1JW4A 3PUVE 4MF3A 4MBPA 4R75A 4X1DA 1II5A 2DOJA 2O7IA 4HXVA 1N76A 2XWVA 2PFYA 3RLFE 2XWOA 3EPEA 3VV5A 1ANFA 3PPPA 1NI9A 3O6HA 5ELVA 1DBZA 3UA8A 3U92A 3VE1B 3K1PA 4GOTA 4R74A 2F7CA 3O2AA 1MG1A 1B46A 4HE0A 4PGNA 1IIWA 4AQ4A 1A40A 1TFDA 4PDHA 5HM4B 4NF5B 4XKPA 4OZ9A 1Y9UA 4IGRA 5CI5A 2MKZA 5EYGA 2F7AA 4G8MA 3SEYA 4AB5A 1LFGA 2PFZA 1NV0A 1Y1MA 2QJEA 1JQFA 1UIVA 3IB2A 2RKMA 4PBQA 5A5XB 5IKBA 3BIHA 4KPTA 1XHYA 4F1UA 1TWYA 4O94A 1QW0A 4X48A 1AL3A 3KFMA 4G8HA 1OVBA 2Z8DA 3EKIA 2FVZA 2VHAA 1NNFA 2Q89A 4H45A 4EQBA 4PAIA 3O6IA 4P0IA 1JNFA 5ET7A 4HW8A 3MQ9A 2HFBA 3W9WA 3TODA 4KCCA 3DELB 3P7IA 2D5WA 2Q9TA 3RQTA 4P0GA 2A5SA 1FBFA 1S7YA 1B5IA 4N91A 2DQVA 3TCGA 3KOTA 1FQCA 4XTCQ 1Y4CA 2XA5A 5BWJA 4KYDA 4ZDMA 1FJ6A 3RTFB 4IO6A 2PMSA 1B3FA 1FTKA 3CI8A 4R6HA 4LONB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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