3F11A

Structure of futa1 with iron(iii)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
QEINLYSSRHYNTDNELYAKFTAETGIKVNLIEGKADELLERIKSEGANSPADVLLTVDLARLWRAEEDGIFQPVQSEILETNVPEYLRSPDGMWFGFTKRARVIMYNKGKVKPEELSTYEELADPKWKGRVIIRSSSNEYNQSLVASLVVADGEESTLAWAKGFVSNFAREPQGNDTAQIEAVSSGEADLTLANTYYMGRLLESEDPAQKAIAENVGVFFPNQEGRGTHVNVSGVGVVKTAPNREGAVKFIEFLVSEPAQAFLAQNNYEYPVLAGVPLNKSVASFGEFKSDTTSLDKLGPALAPATKIMNEAGWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Iron transport protein
publication title The structure of the iron-binding protein, FutA1, from Synechocystis 6803
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Metal transport
total genus 124
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3f11A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3f11A02
5CMKA 1R9LA 2ZNSA 2IEEA 3OENA 1B51A 2X7QA 1NKXA 4RY1A 2D21A 5I2KB 1N3WA 4F3PA 4LATA 1B3FA 1Q35A 2F7CA 4R6KA 3QYTA 2F97A 3D4CA 3EHSA 2O68A 3MWBA 3WAFA 4F3GA 5BUUA 1MM7A 3IJOB 3DP4A 2Q8JA 4R9GA 1DMBA 4IO2A 2XXXA 1OLCA 4GOTA 2D5WA 1WVJA 3VXBA 3RN8A 1B5HA 4NWDA 4G68B 2F35A 3IL1B 4F1UA 4NF4A 1CB6A 3JYRA 3S9LC 3TZAA 3RLFE 4U2RA 1MDP1 1PC3A 3K0VA 2PT1A 3PPOA 1I6QA 4IY6A 4YKKA 5JTYA 1N84A 3FATA 4F31B 2DWHA 2RF1A 3S9MC 5AA4B 3LSFB 3GXAA 4H65A 3T9XB 4AB5A 2Z22A 1VSOA 3UA8A 5H8QA 5M2VA 4H6DA 1NL5A 4JSDA 3FZVA 3CFZA 3GBBA 1MQJA 4FATA 2H4IA 3O2AA 1MXWA 3HO7A 2NVUB 3TAJA 3FXQA 4YKJA 4L17A 1FCKA 4E0WA 4GL0A 2B3FA 4KR5A 1FTKA 1Z7ME 3W9WA 4NF6A 3S9NC 2XD3A 3G3FA 5H8NA 3E9XA 1PBPA 2I3WA 5I56B 2ZXTA 3GBAA 2F7BA 3LR1A 3VVFA 1MQDA 4HS7A 3FJMA 3M3KA 4BDMA 1ZIUA 3B6WA 2I0CA 3OMBA 3MBPA 1FQEA 3LUYA 4THIA 4KI0E 4FE8A 4KYSA 4TOZA 4ISUA 3FASA 1II5A 4DXBA 3HCQA 3MC2A 5ISUA 4OETA 2UVIA 1R9QA 3HHFA 1P1WA 2GRVA 2G93A 4I1DA 4ZDMA 4IGTA 1XC1A 3SEUA 3DP6A 5K2XA 2E0SA 3USDA 3FV1A 2O51A 2I58A 1QVSA 5F1QA 2OK2A 4YB5A 4RPOA 3A3CA 4G68C 4X1BA 5LOMA 2DS9A 4RXLA 1FTLA 5AA3A 4JWOA 4GXSB 4MH5A 5I2NB 3Q25A 2DP8A 3CFXA 3IORA 3VFJA 2QL3A 5BWJA 2OWTA 4KPTA 4LONB 2B3BA 2OCUA 5I58A 3KSJA 5L9OA 5H8QB 3HN0A 3IAZA 2H98A 1OLAA 2O69A 3PPQA 3FJGA 1H43A 5FTHA 2XX8A 1XT8A 3IOTA 4MLQA 4GF8A 3U94A 1GVCA 1FQCA 3K1NA 2GH9A 3KSXA 4WEPA 3MVYA 1B58A 3SERA 2QJEA 3B6TA 1URGA 2R71A 4R9FA 4EXLA 1ZKBA 3MJNA 4NF6B 1T0KA 2Y7PA 2F7AA 5H8NB 5DEXA 4NTLA 5CI5A 3KBRA 3H03A 4H0WA 4I8CA 3K6XA 1MPBA 4H67A 2DOJA 2FYIA 4NF5A 4ELQA 5DVFA 2ESNA 1QULA 3IR1A 2UVJA 4KD5A 1FQDA 4Q0CA 2B65A 1EZPA 1EZ9A 2F6GA 2NOOA 4GQOA 4LA9A 3K01A 4RNSA 1MXXA 1AL3A 3TCGA 2REJA 1IXCA 4I9DA 4GRKA 1HSJA 1A8FA 2QMWA 3IOVA 1IZ1A 2Y7WA 4R2BA 2NWJA 3M3FA 3KOTA 2VP1A 4UA8A 5IAIA 4F29A 2QPQA 5B7DA 2I3VA 3OEMA 3KZGA 2YJPA 4ND9A 4KCCA 1N3XA 4N07A 1KWHA 5I58B 4BDQA 1ZLQA 2VD2A 3CSBA 5CMBA 1AIVA 1XHYA 2UYEA 2XXQA 3KOSA 4QSEA 1FW0A 1IEJA 1SW5A 1MG1A 1MXZA 4G8NA 2QMXA 4IO3A 4MFIA 1B40A 2H99A 3K02A 3PMWA 1UIVA 2DVZA 3I3VA 1QUIA 2P1SA 5DTBA 1QJMA 3HSTA 1YTVA 3QXMA 3O6IA 4O3CA 1O7TA 3V89B 1MQGA 1A54A 3T9HB 3PD8A 2XXWA 1N7WA 2RC7A 4R6YA 3KN8A 2V25A 4U23A 4LQ5A 1SYHA 1DOTA 1TXFA 4YKIA 1MY3A 2THIA 4NF5B 5H8FB 4G77A 1OMPA 4JSOA 3VV5A 2CMOA 4NF8A 3V83A 4LQ2A 3BFTA 1LFHA 1OQGA 1Y3QA 4TLLB 3H6WA 3LSLA 1SD3A 4OWDA 4F3SA 1B7HA 1LB9A 3RNNA 4QFOA 1Z7NE 3K4UA 3B6QA 2Q88A 5EHSA 3W15C 5FHOA 4JB7A 2H9BA 1JEUA 4LVQA 3SEXA 4YB7A 3N94A 1MY4A 1B5IA 3FXRA 2V3UA 4WKMA 4E0XA 4WXJA 5HM4B 1M5CA 3T9UA 3SKPA 5CBSA 4ELPA 1ZBMA 2PX1A 2Q2AA 4U4SA 4ZE9A 4F3BA 3OO8A 1SI0A 3GLBA 4EDPA 3K6VA 3T22A 3G7WA 3MZ1A 1IIWA 1B6HA 3C32A 4KYEA 3G3JA 2QS3A 1EU8A 1LB8A 5KCJB 3G3HA 4LUBA 1MXVA 1D9VA 2O7UA 2I4CA 4YICA 4XKNA 2DWAA 3R6UA 1R1NA 2KLFA 3TTRA 4DLDA 2WKYA 1PBQA 4NEDA 3N26A 5TP9B 2XXHA 1B3HA 4P11A 4GVOA 3DM0A 3O6HA 2I48A 4OQOA 2X7PA 4FIMA 1PDAA 3SESA 4PP0A 4Q8RA 1LAHE 3MW0A 3G3GA 5TPAB 4RJZA 2LAOA 3H3GA 4ONYA 4BLAA 2O1LA 1O64A 2XX7A 5ELVA 3K2DA 4F1YA 4KQPA 1YAEA 2UXAA 5K2YA 5J1DA 1ATGA 4C1UA 1P1NA 2OBGA 5I59A 3U93A 3S2VA 3ILUB 1DTZA 5FTIA 4X9TA 5L9MA 3DELB 4JWXA 1FTOA 4QSCA 1VR5A 1ZTYA 2AYSA 3GZGA 3KFMA 3SEYA 2QRYA 3T9VA 3TEPA 5I84A 3ONMA 4ELRA 1AOVA 5CBRA 3V5AA 2ZNUA 1RYXA 4NMYA 1B3EA 1MPDA 4RYAA 5I57A 1UTBB 4GD5A 3QK6A 2QS1A 4GIZA 1B3LA 2BJJX 2DE3A 2DE2A 5JEIA 2A5SA 2P2AA 2XHDA 3PMVA 1MM6A 2I0BA 2REGA 4N6PA 1BP5A 3LC8A 1Y20A 4JXIA 4ZS9A 3H6TA 4YMBA 2DE4A 4KFQA 1XS5A 5DYHA 1LSTA 3PUVE 1R6ZA 3OD7A 5DVJA 3H4ZA 3TFLA 3MPLA 3H6VA 1LCFA 3G3KA 3KG2A 5AA1A 1M5DA 3PD9A 1P99A 4GLIA 5AA2A 4XIGQ 4ZEBA 2Z8EA 3O66A 4Q30B 3JZJA 1S9TA 2F5XA 1J1NA 2H25A 3PPPA 4AQ4A 3TPAA 3VLUA 1UTHA 1QKBA 1NMUA 2P0SA 4NF4B 4OVJA 5I59B 1IQ7A 3DP8A 1MS7A 3MP1A 4EUOA 3IOUA 4ELOA 4R6HA 4LZ8A 3O28A 3IK6B 3SDFA 3O97A 4ZEIA 5CM6A 2XX9A 2FNCA 1IXHA 4M4GA 2ONRA 5EHMA 1MPCA 3K00A 5JTYB 3W9VA 2NUVA 2PBWA 3WAEA 2D3IA 4OZ9A 3QAXA 4YB6A 3IO4A 3OXNA 4PFYA 1HSLA 1QUKA 1P1UA 5I57B 3TUSA 4POXA 1QW0A 2A5TA 1TWYA 4F2QA 1UQWA 4ZECA 1JNFA 1B4ZA 1Q1KA 3PUXE 1NNKA 4O3BA 1BKAA 4BDRA 1YCJA 2ZNTA 3EF7A 2YPNA 1O63A 1JVXA 4BDOA 4PE5B 1N76A 1I69A 3IJXB 2OWSA 2ZYMA 2HXWA 1B5JA 3ODBA 4ZZAA 5H8HA 4DDDA 1PB7A 3IX1A 4OFJA 5AE4A 5HBCA 3UN6A 4R74A 1DSNA 1TFAA 4OEVA 3S9EA 1JVYA 3MP6A 2YLNA 1B7UA 3O29A 3Q26A 1WDNA 1JEVA 1AH5A 4U22A 1FTMA 2V84A 1H44A 2AL5A 5F7VA 5AA2B 3P7IA 1JETA 2HZKA 4ECFA 1JW1A 1Y1MA 3EHTA 1LBBA 1MDQA 2XXIA 2DXYA 3PUYE 3KJTA 1SW1A 2AL4A 1MY2A 3T66A 1UTHB 3U8QA 2Y7IA 4OMBA 4MF3A 1B3GA 1LAFE 2ONSA 2RINA 3T93B 4ZZEA 3EPEA 4C0RA 4QRZA 4XTCQ 1IUDA 1POY1 4JBZA 2XXVA 1MQIA 3PU5A 4H8JA 1SBPA 3TODA 1I6BA 3M3LA 1ELJA 3TQWA 3Q27A 4R73A 4BDLA 1M5BA 1OQHA 3M8UA 3L6HA 2A5TB 3EN3A 4H5GA 1GTKA 2X26A 2HQ0A 1VE4A 4P0GA 1Y4TA 4HW8A 4TQUQ 1H3DA 5L8DA 3TDJA 3TCHA 4FECA 4YZZA 4G2ZA 3U92A 4QFLA 1FQAA 3E3KA 4QHQA 1D3KA 3KEIA 1B4HA 5DEXB 4QFNA 5H8HB 3C9HA 1B1HA 3MUQA 2F78A 4PFWA 5H8SA 3ZSFA 3FGSA 1BLFA 4OEUA 1MRPA 1A55A 1LFGA 2OJTA 3ZKLA 2Q89A 2DQVA 3OEKA 2Z8DA 3K1MA 1SDXA 5HPQA 2CZLA 4YMAA 3OO9A 4YU0A 5B70A 5KZTA 4F22A 3K1PA 3C33A 1SW4A 4RPNA 3G3IA 2HEUA 2PVUA 3I5OA 3T96B 1B05A 3VLWA 2R9JA 1A99A 4QFKA 3R7XA 3UORA 3SEVA 3FIRA 4F19A 1DPPA 1DTGA 4IO5A 1JW4A 3KN7A 2O1MA 4F2OA 3OO7A 4GXAA 2O6AA 1I6AA 4ZEKA 3ZS6A 3JV9A 3VVEA 3TQLA 3VVDA 5AA4A 4XXUA 1YPNA 3TTNA 4Q5TA 2I4BA 1ZJLA 3I6VA 2I6EA 3FJ7A 4H8IA 3D4GA 1US4A 1SVXB 3DLNA 3RGYA 4RK9A 3N6TA 3TTKA 3OSQA 3E13X 4IB2A 2G29A 1NH8A 4R75A 3CI8A 2ALUA 4KYDA 4OYVA 1Y4CA 4FEDA 3O9PA 1A7LA 1MH3A 4LP2B 1LLSA 1LBCA 2QSXA 3CG1A 1SI1A 1XOCA 2Y84A 2Q2CA 2VHAA 2ABHA 3BFUA 4EQBA 4Z0IA 5JK4A 1B9JA 1L5TA 4FORA 4OXVA 5KDTA 4OTEA 2R6GE 5I56A 5TU0A 4MBPA 4Z7EA 4DE8A 4NE4A 4DCXA 3EHUA 4RK2A 4NF8B 3PUWE 4JDFA 2ONKE 3VLVA 3MVXA 3SETA 4POWA 4PETA 4WEDA 4PQJA 2VOZA 1EZOA 2VGQA 4U4XA 2UVHA 1FTJA 3PPRA 3RY3A 4EF2A 3RT6B 1UIUA 2Y7RA 1Y3NA 2XXTA 4OFLA 2ZYKA 1MY0A 1S50A 1GR2A 1NNPA 2E1SA 3MPKA 1QKAA 4R2FA 3TELA 4I62A 2V3QA 1Y3PA 3HHGA 1ZMGA 4ZE8A 3IB0A 3MZBA 3N6UA 5ICTA 3PUZE 1FQFA 3UP9A 5I2NA 1OIBA 1M5FA 4KCDA 4F18A 2XXPA 2V3TA 2FA7A 5L9SA 3N5LA 4HCYA 2V93A 3IB1A 1EH3A 3RPWA 1POTA 1B0LA 1H76A 4FEBA 4F39A 4R72A 2NXOA 3QIMA 4EQ9A 3CVGA 4EF1A 4GL8A 2ANJA 2F34A 1TFDA 2GHBA 4QFPA 3IO6A 2PT2A 3LBSA 4XKQA 3U72A 3U1OA 1B46A 1NH7A 4LZ7A 3K6UA 1D9YA 1USYH 2HFBA 4YAHX 1NNTA 4HCWA 3FVOA 1B1XA 5KDTB 3Q29A 1Y1ZA 3TMGA 3ILTB 4ZEDA 4HTGA 1JW5A 1H45A 5IKBA 1D4NA 1TT1A 1LFIA 4X1DA 3RUMA 3TCFA 3E4RA 2HAVA 1A8EA 3L6GA 2XXYA 2GHAA 3C34A 2O84X 1HSEA 3CG3A 2RC9A 1RKMA 3TTMA 2IA4A 3C36A 2PYYA 3MAMA 1VFDA 3IOWA 2DSFA 3KJ7A 1B7ZA 1LAGE 3A09A 1LCTA 3CRBA 3PV0E 2H5YA 4GWOA 3H06B 1IITA 2AIXA 1S7YA 4IO7A 1QUJA 1IXIA 4TLMB 5FHNA 1WODA 1URDA 4DIGA 3BKIB 3C31A 3R26A 2ZYOA 4DXUA 2DVCA 3KN3A 3MQ9A 1OVBA 4QF9A 3O6GA 4IY5A 2HAUA 5CMMA 1MQHA 1MXYA 1Y9UA 1CE2A 5ITOA 4ESXA 4OHNA 3TTLA 3UGWA 3H7MA 2XD2A 3MVZA 3IB2A 4JWYA 3RT8A 4C1TA 4GFRA 5A5XA 2M8CA 3KGCA 3ECRA 2RCBA 4UACA 2F36A 2OZZA 4H1XA 4O3AA 1US5A 3TYHA 3VXCA 1B52A 1B32A 4IO4A 1GGGA 3CFLA 1P1OA 3THIA 1B0HA 1DPEA 2OLBA 4U1OA 3PGFA 3HV1A 4ZEFA 1AMFA 3CR9A 2RC8A 2UYFA 5H8FA 3C35A 1B2HA 4IGRA 4NWCA 3AXFA 1JQFA 1MXUA 4OESA 2UVGA 4G8HA 4PFUA 5CRYA 3MZ9A 2DWIA 3FVKA 3QSLA 4DCYA 2I49A 3OO6A 1A40A 5EYFA 4KHZE 5DT6A 3A3UA 1BIYA 4P0IA 4LZ5A 1N04A 1XVYA 3H6UA 1PB9A 1VFEA 3QUFA 3TKDA 1FQBA 3F11A 3PPNA 1USYE 3FVGA 4M1VA 2HCAA 2RKMA 1PEBA 1N0TA 3VDFA 2Z23A 4XKRA 1PB8A 4K3FA 3RQTA 2F6PA 3CIJA 2GFEA 3FXUA 2ZYNA 4F1VA 4QSDA 3HPIA 5AA2D 3ZKKA 5DVIA 2VD3A 3C4MA 1SQYA 4H5FA 3SEWA 3CSGA 5KCJA 3BBRA 4OFOA 3K6WA 1SYIA 2ZMBA 1ANFA 2XXUA 4U1ZA 3RTFB 1P1QA 3VE1B 1LAXA 3EQ1A 5I2KA 1ZU0A 5TP9A 5A5XB 3QUJA 3RTWB 1BTJA 1N7XA 2W7YA 4FJPA 4MLVA 2DYXA 2RCAA 3OELA 2QS2A 4EQ7A 4BDNA 1IXGA 5TPAA 3OSRA 3FV2A 5CC2A 2F8DA 1GV8A 4PFTA 1RYOA 4G4PA 4AB6A 5CMCA 1NNFA 2Z8FA 3FVNA 4G68A 1SW2A 2Y7KA 3Q28A 3PMXA 4DZ1A 3FD3A 2XXRA 4OENA 4DXCA 4ESWA 4X48A 4N13A 4FAJA 2DWJA 1M5EA 4RA1A 2DXRA 3LSWA 2Q9TA 1MH4A 5FHMA 4U21A 2PMSA 1F9BA 4OERA 5ITPA 3B7DA 3MP8A 3LSXA 5ICQA 4EXKA 3MVWA 3OOAA 1UTBA 2HZLA 3FUZA 3UIFA 3UK4A 2QS4A 2O7IA 3V8XB 1MY1A 4G8MA 3S4UA 1URSA 4XKPA 4YKPA 1LGBC 1NFTA 1OVTA 1XVXA 4IO6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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