4OYVA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with leucine
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
424
structure length
424
Chain Sequence
PTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGAAADASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with leucine
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 143
structure length 424
sequence length 424
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oyvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oyvA02
5KZTA 3IOVA 4QSCA 3LUYA 5DTBA 3SEWA 1SW5A 3O28A 2XXRA 1VFEA 1ZTYA 4JBZA 4PFWA 4Q5TA 1LGBC 4O3AA 2PT2A 3TQWA 4OZ9A 3PPOA 3H03A 3G3JA 5HM4B 3OO7A 4C0RA 3TPAA 1MY4A 4ZS9A 4OXVA 4OWDA 1ZIUA 2Q89A 4RYAA 3B6WA 4F3SA 1B5HA 1A40A 3FUZA 5IKBA 5I56A 1AOVA 4LONB 3T9XB 3FXRA 4IGRA 4F3GA 1R1NA 2Q9TA 1B1HA 4EQ9A 3CIJA 2OWSA 2Y7WA 5I57A 3K00A 3IOWA 1USYH 4POXA 1B0HA 3SKPA 3LR1A 1QUJA 1VE4A 1MPDA 4GFRA 2CZLA 4QFOA 1B5IA 4EQBA 4OQOA 1N76A 1MXWA 1Y9UA 2NXOA 3LBSA 3TTRA 1LSTA 1S9TA 1M5FA 2HZLA 3O29A 1B3EA 2DWJA 3ODBA 3TCFA 5ISUA 3DM0A 3OSQA 4X1DA 3KGCA 1EU8A 3IL1B 4BDMA 4H6DA 5HBCA 3CI8A 4DE8A 1P99A 2O68A 4IGTA 4QFKA 5CI5A 4FATA 2RCBA 4TLMB 2X26A 3TTKA 1SYHA 2QMXA 3K01A 5AA4B 4TOZA 5CBRA 2OK2A 1QW0A 3MAMA 1OIBA 4F29A 4KYDA 2VD3A 1LLSA 2DWAA 2DWIA 3MP1A 3N5LA 4H65A 4O3CA 4FAJA 4U22A 4R6HA 4YKIA 4XKRA 3BBRA 3VXCA 2Y7PA 2A5TA 2YPNA 1MRPA 3ZSFA 1Y3PA 2I6EA 4GL8A 3R26A 3C35A 1MH4A 3KN3A 4UA8A 1OMPA 1MDQA 2Z22A 4LQ2A 3Q27A 2Z23A 4F1VA 2DE4A 1MY2A 2RINA 3O97A 3Q26A 1MXZA 2KLFA 1I6QA 2XXXA 4NF8B 1BP5A 2OZZA 3BFUA 3F11A 1FQFA 1HSLA 1SQYA 3QK6A 1LB9A 4PFYA 3T9HB 3VV5A 1H45A 4KCDA 2HXWA 1GGGA 3TYHA 1JETA 1A54A 2E1SA 1SI1A 3O2AA 3K1PA 3KEIA 3IB1A 2VOZA 2PX1A 1B9JA 3RGYA 5ELVA 2DXRA 5A5XB 4LZ7A 4ECFA 5L8DA 2P1SA 3FV2A 3DP4A 4KD5A 2REJA 4P11A 3OEKA 4OTEA 3N94A 1MY1A 3H4ZA 4ZE9A 3ILTB 3E13X 5H8HB 5FHMA 4C1UA 1IXHA 3MZ1A 3E9XA 4IY6A 1ZLQA 3H3GA 1B1XA 2UYFA 1MS7A 2ZYNA 1Q1KA 1LAXA 1ZMGA 5FTHA 4RK2A 4DXUA 3A3UA 1MQIA 4F2QA 1B7UA 1PB7A 2XD3A 3TMGA 3H7MA 1QUIA 2H99A 1JW5A 1F9BA 3K02A 1JNFA 1RYXA 3HN0A 1UTHB 4U1ZA 5I2KA 1DPEA 3FJGA 3OEMA 3KJ7A 2Q2AA 3FXQA 3PD8A 2V84A 3C32A 1B58A 1A8FA 1M5DA 4KCCA 3RNNA 4U4XA 4GLIA 3VE1B 4OFJA 1Y4TA 2B65A 4HCYA 4OESA 1N0TA 3GBBA 4NF4B 1LCTA 3FV1A 4U4SA 2D5WA 1JVXA 2AL5A 3IAZA 3M3LA 3T22A 4IO5A 1R9LA 1B6HA 3B6TA 5K2YA 1TXFA 4ZZAA 1OLAA 1UIUA 4H8JA 2QMWA 3KSJA 1YCJA 2QSXA 4DCXA 1ZJLA 4RPOA 4R9FA 2F36A 4JDFA 1URDA 4H67A 5FHOA 3FVKA 3GZGA 3MQ9A 4ELPA 1T0KA 1XS5A 1IUDA 1M5CA 1BIYA 1CE2A 3EF7A 2QL3A 3PD9A 1QKAA 3QYTA 1LFIA 4YU0A 4G8NA 5H8NB 1N84A 4XXUA 2ZNTA 3TQLA 3IB2A 4GRKA 1B4ZA 2RC8A 3PGFA 5F7VA 1B32A 3KN7A 5DEXB 1QULA 4F3PA 4KYEA 4GWOA 2HFBA 4PQJA 2I48A 4THIA 2P0SA 5M2VA 1IXCA 3CRBA 1O63A 2WKYA 3SEUA 2DE3A 3WAFA 3I5OA 1MPCA 4QRZA 3GBAA 4WEPA 1PDAA 4FJPA 3TFLA 3ECRA 4BDNA 3UP9A 1DTGA 3JZJA 2ZNUA 3TELA 4OENA 2B3FA 5LOMA 1JQFA 3ZKLA 3C4MA 4X48A 4U2RA 2F35A 4NWDA 4ZEFA 4ZEKA 1URSA 1VSOA 3MPKA 1MM6A 3MPLA 3SDFA 2R9JA 1SI0A 1B5JA 1FQBA 3MVXA 4HCWA 1PEBA 3E4RA 4PFTA 4Z0IA 3QUFA 1MY0A 2O51A 3OOAA 5EYFA 1B0LA 1OQGA 4FE8A 5AE4A 2UVHA 3O6GA 4E0XA 4NF5B 2XHDA 1SW4A 3KSXA 1Y3NA 4IO3A 4BLAA 4EXLA 1A8EA 4WEDA 5CMKA 2PBWA 1OVBA 2XXVA 1JVYA 2O7IA 2Y7IA 4YZZA 3C34A 1FCKA 1ELJA 4MFIA 4YB7A 1LFHA 2UVGA 2ZXTA 4KHZE 3UN6A 1UTBA 5AA1A 1QKBA 1HSJA 3VXBA 3LC8A 4NF8A 2Z8EA 3HV1A 4LA9A 2HAVA 5L9SA 4LP2B 4I9DA 3U93A 1SW2A 1N7XA 3KOTA 2G93A 1N04A 1N3XA 3HHGA 2GH9A 3PUXE 3W15C 3IORA 2BJJX 3KFMA 5JK4A 4IY5A 3EHTA 3O6HA 4UACA 4LVQA 1NMUA 1Y4CA 3GLBA 4QFPA 3TTMA 2ONRA 5A5XA 1L5TA 2H25A 1B05A 3T9UA 2F34A 4F22A 1BTJA 1II5A 4AQ4A 1SVXB 3HSTA 3SESA 3MVZA 3HCQA 3HHFA 1ZU0A 4PFUA 3H06B 2I4CA 5H8HA 1NNFA 3MZBA 1Y3QA 3VVDA 1FTOA 4NTLA 4H0WA 4F3BA 4JXIA 2XX9A 4XIGQ 3IJXB 3H6VA 3H6UA 2O7UA 4RPNA 1DSNA 4H5FA 4EF2A 1D4NA 5H8QB 4N07A 2F97A 4OEVA 2DVCA 4U21A 1UTHA 4RXLA 4AB5A 1VR5A 2M8CA 4F1UA 2ZYKA 1OVTA 4MBPA 5KCJB 2DQVA 4YAHX 3HPIA 3PMWA 2VHAA 2ZYMA 1LAHE 4DIGA 3QIMA 1R9QA 3O6IA 1NNPA 3IO4A 1FQAA 2REGA 4H1XA 3T9VA 1AL3A 4G68B 4NF4A 2OCUA 3C9HA 3SEXA 4PETA 1RKMA 1TWYA 4EQ7A 2OJTA 3RN8A 2XX7A 1OLCA 4G77A 3TCGA 4F2OA 4F39A 2IA4A 1NKXA 3DP8A 4NE4A 1EZPA 2FNCA 5H8FB 5JEIA 1MH3A 3THIA 3OO9A 1SD3A 3MP6A 3IR1A 1DPPA 3PMVA 2FA7A 3EHUA 2XXUA 4OETA 3IO6A 3K6VA 5L9OA 2I58A 4R73A 3VVEA 5I59B 1FTLA 1O64A 4LZ8A 4N13A 5TU0A 2XX8A 1AMFA 3T96B 2O6AA 2V3TA 5CMBA 1SDXA 3G3FA 2UYEA 1Y1MA 3L6HA 4XKNA 3MJNA 5I84A 4BDLA 2DWHA 5DT6A 5FHNA 2I4BA 4P0IA 4NF6B 1B4HA 2ALUA 4ND9A 4R74A 3IB0A 5AA2B 1FTJA 1A55A 2HCAA 1B51A 3EN3A 4GIZA 5H8NA 1GVCA 4R75A 4GD5A 4AB6A 4G2ZA 2F6GA 1I6AA 1NFTA 2F7CA 2X7QA 1XHYA 5ICTA 2B3BA 2VGQA 3CR9A 3TTLA 1MXVA 3VLUA 2QS3A 1B7HA 4ZEIA 4N6PA 1WDNA 4HW8A 1M5BA 2R71A 3HO7A 3SEVA 2DOJA 1P1NA 2THIA 1POY1 4FIMA 3S9LC 3MP8A 3MBPA 2UXAA 3PUWE 3G3KA 1Z7NE 1P1OA 1WVJA 2XXYA 5AA2D 3TEPA 4U1OA 3S9MC 3CFZA 1IITA 3JYRA 3RY3A 3A3CA 3EHSA 4PE5B 3CSBA 3FJMA 4WKMA 5TP9B 2H4IA 3N6TA 3G3IA 4QSDA 1MXXA 4RA1A 2I3VA 3K6WA 2F7AA 4QFLA 1IXIA 2GFEA 3RLFE 5EHSA 3RPWA 4BDRA 5CBSA 2ZYOA 4JB7A 1AIVA 4H5GA 3RTFB 4OHNA 4OMBA 4KPTA 4PP0A 2HAUA 2XXTA 2DYXA 3KN8A 4ISUA 3N26A 4YB6A 5DYHA 1OQHA 1TFDA 3VDFA 4QFNA 1A99A 1TT1A 1NNKA 1EZOA 3I6VA 5KDTB 3KZGA 3FASA 1XVYA 1P1QA 3E3KA 4OFOA 2Y84A 4WXJA 3FXUA 1DMBA 3FVGA 2D3IA 4FEBA 1FQCA 4G68C 2RF1A 3SEYA 1H3DA 3T66A 4DXCA 4Q30B 4ELRA 4C1TA 1PB9A 4ZECA 1IZ1A 3K0VA 1POTA 1D9YA 3U1OA 5TPAB 4F19A 1A7LA 4G8MA 4ESXA 1MXUA 1JW1A 2F6PA 3CG1A 4BDQA 2V93A 2F8DA 2OBGA 4FORA 4LQ5A 4QF9A 2F5XA 4KYSA 1DOTA 1LFGA 4JWOA 4K3FA 5FTIA 3U92A 3FVOA 4F31B 5ITOA 1MM7A 2QS4A 4JWXA 4IO2A 1LB8A 1SYIA 3H6TA 1GTKA 3PUYE 2X7PA 5JTYB 1PB8A 3EPEA 4DXBA 5ICQA 1WODA 3FATA 4YMBA 4IO7A 3TAJA 2NUVA 1MQJA 3ILUB 4XKQA 2OLBA 2F7BA 2RC7A 3CSGA 2ESNA 4KI0E 3OO8A 3KG2A 3V89B 3DELB 2G29A 3FD3A 3ONMA 2H9BA 2GRVA 5I2NB 4ESWA 3IOUA 4DLDA 3TKDA 4HS7A 3VLVA 2UVIA 2HQ0A 3TUSA 1P1UA 4QSEA 3CFLA 1EH3A 1FQEA 2YJPA 3PMXA 4MLVA 5CMMA 4GQOA 5AA4A 4DDDA 3UK4A 1XVXA 2XXIA 3JV9A 2QS1A 3OXNA 1YPNA 3D4GA 3MZ9A 1B3HA 2NVUB 3TCHA 2QPQA 3QSLA 4M1VA 3TDJA 5L9MA 1HSEA 5KCJA 1B52A 2O1LA 1N7WA 3M3FA 1P1WA 4Z7EA 4R2FA 3AXFA 2DP8A 4G68A 1B40A 2QRYA 4I8CA 3VVFA 3MWBA 1I69A 4YB5A 3L6GA 2HEUA 3IOTA 3RTWB 5DVIA 4FECA 5CRYA 2PMSA 1UIVA 2A5SA 1PBQA 1JW4A 5H8FA 3BFTA 3MVYA 3LSXA 3P7IA 4E0WA 5BUUA 2I0CA 3PV0E 4YMAA 5HPQA 3EQ1A 4F1YA 1S7YA 4GXAA 5I59A 3RT8A 4BDOA 3PUZE 3I3VA 3C33A 1S50A 4YKJA 3K1NA 3B7DA 1MPBA 4QHQA 4R6KA 3S4UA 1B46A 4U23A 2Q8JA 4KR5A 3W9WA 3IK6B 4ZE8A 4EXKA 1QJMA 4YKPA 1B7ZA 3G3GA 3H6WA 3LSWA 5CMCA 4NF6A 2E0SA 5AA2A 4OERA 1R6ZA 4EDPA 1IXGA 1Y1ZA 3PPNA 5B70A 3N6UA 1PC3A 3SETA 2ONSA 5I58B 4Q8RA 2ZNSA 3GXAA 1MXYA 1BKAA 4DZ1A 1ZKBA 4OVJA 5DVJA 3OD7A 2QJEA 3ZKKA 3S9EA 4Q0CA 3OSRA 3VLWA 3T93B 4NEDA 4IO4A 2CMOA 1CB6A 1IEJA 2UVJA 4GVOA 2QS2A 4RNSA 3MC2A 5EHMA 1USYE 3IX1A 1GR2A 2H5YA 1J1NA 1EZ9A 3M3KA 4KQPA 5TP9A 1Z7ME 2W7YA 4NMYA 4M4GA 3RQTA 2RC9A 2V3QA 3UORA 4IB2A 2AYSA 1MQGA 4MF3A 3U8QA 3LSLA 1D9VA 4JSDA 1GV8A 3G7WA 2FYIA 1UTBB 5I56B 3G3HA 4I1DA 1KWHA 4TLLB 4EF1A 4GXSB 5I57B 5KDTA 5CM6A 4O3BA 2HZKA 4R6YA 4DCYA 2Y7KA 3QUJA 1M5EA 3SERA 3Q29A 2ZMBA 4HTGA 1YAEA 4P0GA 4YICA 4KFQA 2AL4A 2PYYA 2ABHA 5K2XA 1XOCA 4LUBA 3U94A 3K6UA 4TQUQ 3PPPA 3K4UA 1H76A 3O66A 4LATA 2I49A 3IJOB 3KBRA 1XC1A 4GOTA 4NWCA 5TPAA 2F78A 4XTCQ 3MVWA 1LAGE 1BLFA 1XT8A 4ELOA 1MG1A 3Q25A 2NWJA 4F18A 4IO6A 3OO6A 5DEXA 1IIWA 2PVUA 2RCAA 3TODA 1Y20A 4I62A 4EUOA 1JEUA 1LCFA 4OFLA 3FJ7A 5JTYA 5DVFA 3FVNA 5F1QA 2R6GE 4ZZEA 1AH5A 1O7TA 4JSOA 4R9GA 3CG3A 2DVZA 2DS9A 4OYVA 5ITPA 2ONKE 3C31A 4RJZA 1SW1A 2IEEA 4H8IA 5B7DA 1H44A 1NL5A 3U72A 1ATGA 3WAEA 5I2NA 1VFDA 3S9NC 1DTZA 3K6XA 1ANFA 2AIXA 4YKKA 3BKIB 3RUMA 3FZVA 2A5TB 4XKPA 4RK9A 3UIFA 4POWA 3OMBA 3KOSA 2XD2A 2O69A 2V25A 1B2HA 1LBBA 1N3WA 3QAXA 3CFXA 2I3WA 2VD2A 2YLNA 4ZDMA 4R72A 4JWYA 3R6UA 4NF5A 3MUQA 5IAIA 3S2VA 5J1DA 1I6BA 1QVSA 3DP6A 2H98A 3PPQA 2Y7RA 3CVGA 1US5A 3UA8A 5CC2A 2GHBA 1FTKA 2P2AA 1NH7A 3M8UA 3USDA 2LAOA 3KJTA 1MQHA 3FGSA 5BWJA 2Z8FA 4LZ5A 1FTMA 1MQDA 4OEUA 3C36A 4MLQA 3Q28A 1YTVA 4L17A 3OELA 3V83A 2DE2A 4X9TA 5H8SA 1UQWA 3R7XA 1MY3A 4GL0A 3QXMA 2VP1A 3V5AA 3PUVE 3LSFB 1B3LA 2O84X 4G8HA 3B6QA 3V8XB 1FW0A 2ANJA 2XXWA 1SBPA 3D4CA 2XXHA 2GHAA 4G4PA 4ELQA 1Q35A 1H43A 2DSFA 3UGWA 1D3KA 4ONYA 1B3FA 3TTNA 4X1BA 2XXPA 3PU5A 5I2KB 3FIRA 1NNTA 1PBPA 3K2DA 4ZEDA 2RKMA 5I58A 1QUKA 4MH5A 3OENA 1JEVA 1B3GA 2NOOA 1TFAA 3A09A 2XXQA 2Z8DA 3RT6B 1LBCA 2OWTA 1ZBMA 2PT1A 2V3UA 3MW0A 2DXYA 2I0BA 4ZEBA 4GF8A 5H8QA 1MDP1 3VFJA 1LAFE 1RYOA 1IQ7A 3ZS6A 3PPRA 2D21A 3TZAA 1NH8A 3DLNA 3K1MA 4FEDA 4RY1A 3O9PA 4R2BA 2O1MA 1US4A 1URGA 5AA3A 3W9VA 2Q2CA 2Q88A 1FQDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EQ7A 5KZTA 3IOVA 4QSCA 4NX1A 3LUYA 5DTBA 3SEWA 1SW5A 3O28A 2XXRA 1VFEA 1ZTYA 4JBZA 4PFWA 4Q5TA 1LEVA 1LGBC 4O3AA 2PT2A 4P1LA 3TQWA 4OZ9A 3PPOA 4MJOA 3H03A 1XI6A 3G3JA 5HM4B 3OO7A 4C0RA 3TPAA 1MY4A 4ZS9A 3ROJA 4OXVA 4OWDA 1ZIUA 2Q89A 4RYAA 3B6WA 4F3SA 1B5HA 1A40A 3FUZA 5ET7A 5IKBA 4OANA 4N6KA 5I56A 1AOVA 4LONB 4N81A 3T9XB 3FXRA 4IGRA 4F3GA 1R1NA 2Q9TA 2QVRA 1B1HA 3RYDA 4EQ9A 4MNPA 3CIJA 2OWSA 2Y7WA 1INPA 5I57A 3K00A 1YXIA 4NG7A 1FPDA 3IOWA 1USYH 4HE1A 4POXA 1B0HA 3SKPA 3LR1A 1QUJA 1VE4A 1MPDA 4GFRA 2CZLA 4QFOA 1B5IA 4EQBA 4OQOA 1N76A 2CZKA 4JVIA 4OVRA 1MXWA 1Y9UA 2NXOA 3LBSA 3TTRA 4OVTA 1LSTA 1S9TA 1M5FA 2HZLA 4XF5A 3O29A 1AWBA 1B3EA 4H46A 2DWJA 3ODBA 3TCFA 5ISUA 3DM0A 2QFLA 3OSQA 4X1DA 3KGCA 1EU8A 3IL1B 4BDMA 4H6DA 4GWZA 5HBCA 3CI8A 4DE8A 2FBPA 1P99A 2Y5LA 4GWUA 2O68A 4IGTA 4QFKA 5CI5A 4FATA 2RCBA 4N8GA 4TLMB 2X26A 3TTKA 1SYHA 2QMXA 2VT5A 2Q8MA 3K01A 2VPOA 5AA4B 4TOZA 3PTYA 5CBRA 2OK2A 1QW0A 3MAMA 1OIBA 4F29A 4GWWA 4KYDA 2VD3A 1LLSA 1JP4A 2DWAA 2DWIA 3MP1A 3N5LA 5ET8A 2XXKA 4H65A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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