1M5CA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with br-hibo at 1.65 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA01
2Z22A 1QUJA 3PUWE 2O7UA 1B3GA 1GV8A 3MAMA 2ONSA 4K3FA 4NWDA 4ZS9A 4YB6A 4EUOA 3TTRA 3TCHA 2X26A 3TTKA 2HQ0A 3TTNA 5ITPA 1I6AA 4DCXA 3FD3A 3PPNA 4Q5TA 1QJMA 5I2NA 1POTA 4RY1A 1JVYA 2DQVA 3UIFA 5L9MA 2XXHA 3MW0A 2AL4A 1MDQA 1MPDA 1D3KA 3JYRA 3FATA 3F11A 1RKMA 1B7ZA 2GH9A 3K1MA 4OETA 4U1OA 5ITOA 4FORA 4G4PA 4IGTA 3USDA 5I58B 1D4NA 3U93A 2QJEA 4POXA 1IEJA 3TZAA 3ECRA 3JZJA 2REJA 1I6BA 2GHBA 3H6VA 4NMYA 4KI0E 4KCDA 5DTBA 4H8JA 2BJJX 4JWOA 4LZ8A 1A40A 3O6IA 3FGSA 3FV2A 3GZGA 3Q29A 4UA8A 1TT1A 1B6HA 1SVXB 1AL3A 5J1DA 4LP2B 1EZPA 3O6GA 3FV1A 1PB7A 3E4RA 2HEUA 2GRVA 1PC3A 2REGA 1N84A 5H8QA 1B3HA 2DWHA 4ZE9A 3FVGA 3MVWA 1Y1ZA 2Y84A 3EQ1A 4G68C 4YMAA 5FTIA 4ZDMA 1IXIA 4HCWA 5CBRA 1TWYA 4U2RA 4DZ1A 3RTFB 4BDNA 5ISUA 2VHAA 3E3KA 2FYIA 1FQDA 1O63A 5KDTB 1FTKA 1DPEA 5K2YA 1MQGA 3C33A 2Y7WA 2F34A 1SQYA 4OXVA 3UP9A 3KJ7A 4H5FA 2D5WA 1MQDA 2XXIA 3PPPA 3MVXA 3B7DA 3IO6A 4LA9A 3SEUA 3FVKA 2FNCA 5B7DA 4XTCQ 2RC9A 1UTBB 4N6PA 3OO8A 3K02A 3MVZA 4BDQA 2CMOA 5TPAB 1NH7A 2XX8A 4IO5A 4GWOA 1Q35A 1ZBMA 1Y4CA 3RTWB 1LFGA 4R74A 4ELPA 3IB1A 3IAZA 2GFEA 5DT6A 3CSGA 2ONRA 3TODA 2NWJA 3M8UA 4F19A 2F35A 4LZ5A 3TKDA 3CFZA 5I2KB 3CFXA 3CFLA 3RT6B 4EXKA 2A5TA 4LQ2A 2OBGA 2HZKA 3ZS6A 2H5YA 3WAFA 2XXQA 3KOSA 3QIMA 2OCUA 1PBPA 5ICTA 1EZOA 1P1QA 2ZMBA 3PU5A 3Q25A 3M3KA 4PFTA 3H4ZA 1SW4A 2I3VA 1PBQA 2QS2A 4HW8A 4I9DA 5LOMA 4OFJA 2UVIA 4LZ7A 2XHDA 3T93B 1P1OA 1MQIA 3FZVA 4LQ5A 4ELRA 2AYSA 4AQ4A 4F39A 1N3WA 3K6UA 3UN6A 1IQ7A 3KSJA 3EHUA 1A8EA 4ISUA 1JW4A 2I4CA 2XX9A 4KHZE 5AA3A 5CC2A 1MXXA 2H25A 2F7BA 2VD2A 4IO7A 1MH4A 1JNFA 1FTMA 2RKMA 3OO9A 1FTLA 2Q89A 3D4CA 3QSLA 3H06B 1MY1A 2AL5A 5A5XB 5CMMA 4G68B 1R9LA 3KOTA 5JTYA 1OLCA 1UTBA 4IO3A 3G3IA 5I59A 2UXAA 3HHFA 5TPAA 2QS3A 5CBSA 3A3CA 4PQJA 3IB0A 3Q27A 4NF6A 5CMKA 3S4UA 3TTMA 4YB5A 1UIUA 4MBPA 4FECA 2VGQA 1D9VA 3O28A 3R26A 1SBPA 3RLFE 3ILTB 1LGBC 5I2KA 2F7CA 3A09A 1MG1A 3CVGA 4EF1A 3FXQA 2Y7RA 4RJZA 3KN7A 4IO2A 4DXBA 3UK4A 2F5XA 3LR1A 4TLMB 5I56A 4WXJA 3TQWA 1B3LA 5H8HA 1WVJA 3SEVA 3CRBA 3RY3A 4LONB 1B5JA 4F3PA 2Q2AA 2IA4A 3MP8A 1MPCA 2NUVA 1YAEA 4MLQA 5ICQA 1FQFA 3O97A 3EF7A 4M1VA 3SDFA 3I5OA 5L8DA 1LLSA 2QPQA 4FAJA 2XX7A 3CG3A 5I57B 1B4ZA 3VLVA 1NNTA 1NH8A 3MUQA 4F3BA 4RYAA 3B6TA 2O84X 4BDRA 1SYIA 3I6VA 1SYHA 4KYEA 1PB8A 1B7UA 1H3DA 1Y3NA 4XIGQ 2R9JA 1Z7NE 1MPBA 1IITA 5A5XA 1XT8A 3T66A 1VFDA 2X7QA 4G68A 2XXXA 1URSA 4GOTA 4ESWA 3QYTA 4EQ7A 4KQPA 4BLAA 2RF1A 2V84A 1H45A 2AIXA 1M5FA 2O69A 3L6GA 3MBPA 1I6QA 1MS7A 4WEDA 4ZZAA 1GR2A 4GRKA 3GBBA 4Q0CA 2F7AA 3KSXA 1LFIA 1OQHA 4FJPA 5IAIA 1H44A 3U8QA 2UYEA 1JEVA 3N6UA 1JW1A 1NNKA 1DPPA 1Y1MA 1H76A 2Z23A 2ZYKA 1MY0A 1B0LA 4QSEA 3MZ9A 3GBAA 3IOWA 3V89B 4GFRA 3IJXB 3U1OA 3PV0E 4BDLA 5FTHA 5H8FA 1USYH 1JW5A 3G7WA 5I57A 2OJTA 3LC8A 3RGYA 1LBCA 1SI1A 5K2XA 4R6KA 3VLWA 3C4MA 2ZXTA 4U4XA 1BTJA 2I4BA 4KYDA 1N0TA 4DDDA 1MY3A 1B0HA 2DYXA 1N7WA 4YAHX 3H7MA 3G3KA 3LBSA 2F97A 2Y7KA 2UVJA 1LAGE 5CMBA 4JWXA 1B32A 1SW2A 2ONKE 3HHGA 4O3BA 4OVJA 1MRPA 4EQBA 2F6PA 2ZYOA 3LSLA 4NWCA 1OLAA 4AB6A 3EHTA 4ELOA 5DVIA 3QK6A 1MXYA 1YCJA 3RN8A 4EXLA 2ALUA 2VP1A 4NF8A 4ZEFA 3N94A 4C1UA 1IXCA 3Q26A 3BBRA 3QAXA 2G29A 3TCFA 5FHNA 3TYHA 4ZEBA 3CSBA 5BWJA 4RNSA 4QRZA 4F1VA 4FATA 4N07A 4XKRA 2CZLA 4TQUQ 1ZMGA 3HPIA 2R6GE 4RPNA 2RCAA 4X1DA 1Y3PA 3OSRA 4G8NA 3U92A 1NFTA 3CR9A 3G3FA 1R1NA 5AA1A 2O1LA 4NTLA 1AMFA 4MF3A 3MVYA 3FVOA 5DEXB 3O66A 3K01A 4G77A 4GL0A 4I8CA 3S9EA 1ZJLA 4ONYA 1PDAA 3PD9A 4FIMA 4R2BA 4QFOA 1SDXA 1JVXA 2I6EA 1US4A 2Q8JA 1M5DA 2DXRA 1B4HA 3QUJA 5AA2B 1N3XA 2PMSA 3VDFA 3V5AA 2I0CA 4C1TA 1BIYA 4I1DA 3SESA 1J1NA 4LUBA 5DVJA 3E9XA 3O29A 4GL8A 1MDP1 5I58A 3O9PA 4EF2A 3C35A 3N26A 4IGRA 5L9SA 1A7LA 1CB6A 1OQGA 1ANFA 2QSXA 2DE2A 4P0IA 3FJMA 1DTZA 3RUMA 4ZEDA 3C32A 4YKPA 4XKPA 4WEPA 2HXWA 3V8XB 4DIGA 1US5A 2QRYA 3WAEA 1M5EA 3O2AA 1YTVA 2B65A 1GGGA 1WDNA 4XKQA 1B46A 3T96B 4R6HA 3FJGA 2OWTA 4U23A 5DEXA 2XXVA 3PUXE 3LUYA 3OD7A 4R9FA 3T22A 3K0VA 1POY1 2F36A 1H43A 1P1UA 2DOJA 4JB7A 1LCTA 4BDMA 4KPTA 2Y7IA 4KR5A 3OENA 1A99A 1LSTA 3MQ9A 4RPOA 2XXTA 2DP8A 2NXOA 3N5LA 1XVXA 1LBBA 3FXRA 2Q2CA 5M2VA 3PPOA 5AA2A 5KDTA 2Q88A 2LAOA 3MPKA 2D21A 3PMXA 5L9OA 4OEUA 4U22A 4HTGA 3T9HB 4OFOA 2HFBA 1MXZA 2H4IA 3AXFA 4G8MA 4IY5A 3D4GA 2VOZA 3ZKLA 3PMVA 5FHMA 2XXYA 3UORA 2F78A 1B3EA 3MWBA 1DMBA 4BDOA 1M5CA 3K6WA 3PD8A 3KN8A 4QSCA 1BLFA 1II5A 1XS5A 2I3WA 3KBRA 1RYOA 1D9YA 4OENA 2NOOA 3HV1A 4FE8A 4U21A 3MC2A 2HZLA 1B40A 1FTOA 2ESNA 3FXUA 1SW5A 4ND9A 1JEUA 1QKBA 3S9MC 5DYHA 2P2AA 4E0WA 4FEDA 2H98A 3A3UA 4YMBA 3VV5A 2UYFA 4F22A 3C34A 4R9GA 1TFAA 2H99A 1B5IA 1SD3A 3OXNA 2DE4A 2XXWA 5KCJB 3SETA 2DXYA 5JEIA 4EDPA 2PT1A 4RA1A 3IB2A 2I48A 2Z8DA 1Y3QA 3N6TA 3TUSA 2ANJA 3PUVE 4OWDA 2QMWA 3K1PA 2D3IA 4IB2A 3CIJA 3MP6A 3RQTA 4U1ZA 3OMBA 2OZZA 2XXPA 5F1QA 4ZZEA 4KD5A 1LAXA 1IZ1A 4H5GA 1UQWA 2A5SA 4H67A 4KCCA 1QW0A 3TMGA 3BFUA 4OFLA 2ABHA 3M3LA 3RPWA 1B5HA 5F7VA 1S7YA 4DXUA 2O6AA 2Y7PA 3K2DA 1ZIUA 1CE2A 1EZ9A 3VLUA 3UA8A 1N7XA 4AB5A 5B70A 1MM6A 4JDFA 3HO7A 3DLNA 3IL1B 4OMBA 3MZBA 1OIBA 3K6VA 1SI0A 3T9VA 4F29A 2QS4A 4P0GA 3VXCA 1MY4A 3DP8A 1JQFA 3P7IA 3VXBA 2W7YA 1DTGA 4Q8RA 4L17A 1LAFE 2Z8FA 3ILUB 3SKPA 4EQ9A 2P1SA 2R71A 2OK2A 1IIWA 3PUYE 1VE4A 3HN0A 4GIZA 2UVHA 2WKYA 3KFMA 3L6HA 1MXUA 5CMCA 3T9XB 4ZEKA 4OYVA 2KLFA 4HS7A 3EPEA 2G93A 2I0BA 3G3JA 2HCAA 1AIVA 1LB8A 1XVYA 5H8NB 4TLLB 1M5BA 3QXMA 4R6YA 3TTLA 2IEEA 4OZ9A 1L5TA 4F1YA 1FCKA 3LSWA 1UTHB 1IXHA 2V25A 5EYFA 2O51A 3OO6A 3THIA 4RXLA 3VVFA 3H3GA 3CI8A 5TP9B 3FASA 5H8QB 2DS9A 2PVUA 1R6ZA 4ESXA 4R75A 4PE5B 3VVDA 1B2HA 2E1SA 2O68A 4QHQA 5TU0A 2RCBA 1USYE 1QULA 1Y4TA 3MPLA 3MJNA 4MH5A 3IJOB 4ZECA 3SEYA 4OERA 1SW1A 3KG2A 3E13X 1VSOA 1A54A 4ECFA 2DE3A 3IORA 3ONMA 2ZYNA 2VD3A 4LATA 2PT2A 3S2VA 4R2FA 4DXCA 4QFLA 2DVCA 4QFKA 2XXRA 4JBZA 1BP5A 3EHSA 3BFTA 3HSTA 3SEWA 2DVZA 3DP6A 1A8FA 4ZEIA 2E0SA 1XC1A 1ZU0A 3R6UA 1S50A 4P11A 4RK2A 2O1MA 3W15C 5H8NA 3TAJA 4PFYA 4NF5B 3RNNA 3IK6B 1B7HA 2M8CA 4H8IA 1UTHA 3TCGA 2DWJA 1PB9A 1ZKBA 3K4UA 4H0WA 1NL5A 3TFLA 2A5TB 3EN3A 1B05A 1XOCA 5TP9A 1QVSA 3TPAA 1ZLQA 1B9JA 2YPNA 2XXUA 2V3UA 1OMPA 1Y9UA 4M4GA 3FUZA 3LSFB 4YB7A 3C31A 2V3QA 3IX1A 4F2OA 3K00A 2ZNTA 1BKAA 3VE1B 1NKXA 2DSFA 5HPQA 5JK4A 4X9TA 1VFEA 2HAUA 1EH3A 2XD2A 3VVEA 4YZZA 3JV9A 4NF4B 1I69A 1AOVA 4PFWA 4OESA 1EU8A 4O3CA 5AE4A 1ELJA 1IUDA 2XD3A 2RC7A 1FQCA 1YPNA 4GD5A 1FQEA 4O3AA 3I3VA 4G8HA 2FA7A 3OELA 3O6HA 3KN3A 4E0XA 1GTKA 2B3BA 4X48A 5JTYB 3U72A 3H03A 5I59B 5EHMA 2HAVA 2RINA 2O7IA 1FTJA 4R72A 4RK9A 3ODBA 1B52A 4NF6B 1B58A 4DE8A 1QKAA 4NF5A 5KZTA 3U94A 4KFQA 3B6WA 3IOVA 3TDJA 4THIA 4TOZA 2DWIA 3IOUA 2QS1A 1GVCA 4HCYA 1B3FA 1AH5A 1LFHA 3R7XA 3IR1A 3GLBA 4GQOA 3G3HA 4Q30B 1MY2A 3GXAA 5I56B 3C36A 5H8SA 3VFJA 1JETA 1N04A 4KYSA 1IXGA 1OVTA 3KGCA 5H8HB 5FHOA 4F2QA 4XKNA 1NNPA 1MM7A 1B51A 2F8DA 1NMUA 3M3FA 4JWYA 4H6DA 4JSOA 2F6GA 2NVUB 4DCYA 2Q9TA 2H9BA 1O7TA 3BKIB 4F3GA 1QUKA 4UACA 4XXUA 3T9UA 4ELQA 4NF4A 1S9TA 4X1BA 4DLDA 1XHYA 1TXFA 3FJ7A 4OEVA 2PYYA 4WKMA 1FQBA 4QSDA 4G2ZA 1HSJA 4JXIA 3PPQA 1Y20A 4NE4A 1VR5A 3DM0A 3K6XA 3OEMA 4F1UA 3OEKA 3H6TA 3PPRA 1Z7ME 5DVFA 5I84A 4GVOA 3SEXA 5HBCA 4IO6A 3OSQA 3LSXA 4OQOA 1O64A 2X7PA 3FVNA 5CRYA 5IKBA 4YKJA 5AA4B 1T0KA 2I58A 3KZGA 1LB9A 4F3SA 4F31B 2OWSA 1DOTA 4I62A 1UIVA 1Q1KA 3CG1A 4YICA 4YU0A 4GLIA 1QUIA 3OO7A 3Q28A 1HSEA 5ELVA 2V93A 1P1NA 2QMXA 4C0RA 1URGA 3PGFA 4YKIA 2B3FA 1WODA 3ZKKA 1URDA 1HSLA 1MQHA 5H8FB 4Z0IA 3TQLA 3W9WA 2YLNA 2Z8EA 2PX1A 2THIA 1TFDA 3B6QA 1ATGA 5AA2D 4OTEA 3UGWA 2I49A 1MXVA 4LVQA 1B1XA 3QUFA 1PEBA 4R73A 4PETA 3ZSFA 4F18A 4ZE8A 1LCFA 3OOAA 2DWAA 3H6WA 5EHSA 3KEIA 4IY6A 5I2NB 4PFUA 4POWA 1RYXA 4GXAA 3TELA 4OHNA 1MH3A 2GHAA 3IOTA 2PBWA 2ZNUA 3RT8A 1FQAA 5CM6A 4YKKA 4MLVA 2RC8A 4MFIA 3HCQA 3W9VA 4N13A 3MP1A 5AA4A 2QL3A 4JSDA 1MQJA 4GXSB 5HM4B 4NF8B 3S9LC 1FW0A 1R9QA 4GF8A 2ZNSA 4PP0A 1F9BA 4Z7EA 4H1XA 1KWHA 3C9HA 3PUZE 4QFPA 2YJPA 3H6UA 5KCJA 2UVGA 1A55A 3PMWA 4H65A 1LAHE 3G3GA 4NEDA 2V3TA 5CI5A 5BUUA 3V83A 3DP4A 4U4SA 4IO4A 3DELB 3TEPA 1ZTYA 1MXWA 4QFNA 3SERA 3MZ1A 3K1NA 1P1WA 3KJTA 1OVBA 1N76A 1P99A 3S9NC 3IO4A 2ZYMA 1DSNA 1B1HA 1NNFA 2P0SA 2OLBA 4FEBA 3FIRA 4QF9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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