1M5CA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with br-hibo at 1.65 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA01
4OXVA 4XXUA 2B3BA 3IL1B 4JB7A 4OEVA 3N94A 3KOTA 5DVJA 2QJEA 4XKRA 4DLDA 2UXAA 1Z7NE 3Q26A 3IOTA 2PYYA 3IR1A 3ECRA 5DYHA 3O2AA 4OFJA 5LOMA 3FXUA 1B1XA 2O1LA 2RCAA 2X26A 1IIWA 1T0KA 2VGQA 1SQYA 2IEEA 3TFLA 2RC9A 2HAVA 4BDRA 4HTGA 2X7QA 4N07A 2DYXA 1YCJA 2PX1A 3T93B 3RY3A 4GD5A 5FTHA 4O3CA 1P1WA 4UA8A 5ISUA 4OHNA 1IXCA 4NF6B 1UIUA 2Z8EA 3VV5A 1MXYA 2DS9A 2DVCA 3S9EA 5HBCA 3S9MC 2A5SA 5I2KB 1NL5A 2F36A 1FQBA 2F97A 1RYXA 4NF8B 4LVQA 4YKPA 1MXVA 4F22A 1US4A 1BTJA 1VR5A 4OWDA 3ONMA 1MRPA 1SW4A 4GVOA 3TTNA 3I5OA 4I8CA 5H8SA 2QS2A 4NF4A 3PUZE 2Z8FA 4RK9A 1URSA 4ONYA 4JSDA 3RLFE 2OZZA 1SVXB 5F7VA 4ZZEA 5TP9A 3C9HA 1BLFA 3H6VA 2GFEA 1PDAA 5ICTA 2YPNA 3HO7A 4NMYA 3FXRA 1IUDA 2O69A 3B6TA 1MG1A 3KSXA 4YKKA 4LZ5A 2R9JA 4PFWA 1GV8A 1MM6A 5CC2A 3PMVA 3QSLA 4R2BA 3PUYE 2VP1A 4KYEA 4I9DA 2WKYA 4ISUA 3GXAA 2QRYA 1TWYA 1N04A 2P1SA 1M5CA 5KDTA 3O97A 1N84A 3KEIA 4OVJA 3K2DA 1SW2A 5FHOA 4OERA 3V5AA 1AOVA 4LZ7A 2DE4A 4POWA 5DTBA 3OO9A 3C34A 1QUIA 1SW5A 4R74A 1JNFA 4QHQA 4HS7A 1Y20A 1ZU0A 4Z7EA 2OCUA 4ZEDA 1LCFA 4QSEA 3TDJA 1B7UA 4F39A 3H6TA 3T9UA 2D5WA 1B32A 3VXCA 3UK4A 4FORA 1MQJA 1B4HA 2OBGA 4Q0CA 4LQ5A 3U1OA 1B0HA 4YMBA 4F2OA 4N13A 1DPEA 1B3LA 1Y3NA 1L5TA 1VFEA 4NF5B 2ZYNA 4PE5B 1FQFA 1URGA 1JW4A 4FECA 4JSOA 4O3AA 3SEVA 2DWAA 3BBRA 3B7DA 1B3EA 4TOZA 3A09A 1GGGA 3TELA 1H45A 2I3WA 3RQTA 2ZNTA 1SI0A 3TUSA 1PB7A 3K1MA 4OYVA 4XKNA 4Z0IA 2ABHA 1VSOA 1JEVA 5KCJB 3AXFA 4X9TA 2Q89A 4C1UA 1USYE 2Q2AA 1D3KA 4IO6A 3EQ1A 3TQLA 4DIGA 4E0XA 2E1SA 1MH4A 1SD3A 3SEXA 4IGTA 3V89B 2P2AA 3FGSA 1B5IA 3MAMA 2ESNA 4U22A 1MPCA 3VFJA 4OETA 4OTEA 1AL3A 4NF6A 4R6KA 3K6WA 1MQDA 2I49A 1MY0A 5I57B 4KYDA 1FTLA 2IA4A 5I2KA 3FZVA 3IK6B 2ZYMA 2Y7IA 2F5XA 4NF8A 4F31B 4QFOA 1ZMGA 3PU5A 4F3PA 1D9YA 2VOZA 1II5A 4KD5A 2DXYA 1B46A 1LBCA 1MM7A 1A54A 3TEPA 3OD7A 2I4BA 1MXUA 5JEIA 1DSNA 1SW1A 1JEUA 4HCWA 2OJTA 4EXKA 4ZDMA 4ZEKA 3H4ZA 3HHFA 3IB2A 1A7LA 4GXSB 4FE8A 1B3FA 4X1BA 2UVHA 1LSTA 3G3KA 3SKPA 3O29A 4YB6A 1A40A 3W9VA 3MVWA 3TTKA 4G4PA 4U1ZA 3IOWA 3DP4A 4HW8A 2XXHA 4M4GA 3OSRA 3QUFA 2KLFA 3PPNA 3RUMA 4MH5A 3MP1A 3U93A 2THIA 2HZKA 3K4UA 1Y9UA 3M3KA 2QMWA 4U2RA 4PQJA 1B1HA 2O6AA 4FJPA 5EHMA 1AIVA 3ZS6A 1MY3A 3MW0A 1OQHA 3TKDA 1P99A 2FNCA 2X7PA 2VD2A 1M5BA 1R6ZA 1BIYA 3E3KA 3OEMA 5KDTB 2Y7KA 1Y3PA 2Q2CA 3PV0E 4H8JA 3UIFA 3S4UA 4NF5A 1O63A 5HM4B 3CSGA 2GHBA 3LSFB 1ZLQA 4EF1A 3OEKA 2HAUA 3L6HA 1Y1MA 3G3FA 4LA9A 4R2FA 1FQAA 4FEBA 4U23A 4YZZA 3UORA 5K2YA 4BDOA 3PMXA 2QMXA 3PPPA 1QJMA 3O6IA 3VVEA 4WEDA 1N7WA 3CI8A 3EHSA 3SERA 4IY5A 1ZJLA 3JV9A 3K1NA 1IXHA 1SI1A 5KCJA 3V83A 3S9LC 2AIXA 4IB2A 5CMKA 3MVYA 4QF9A 2Q8JA 3K01A 2B3FA 4IO7A 4H6DA 1DMBA 4U4XA 1NNKA 4F29A 4F1VA 2Q88A 5IAIA 1UIVA 4PP0A 1CB6A 1LB9A 1MS7A 4FAJA 4BDNA 3IX1A 4NE4A 2GH9A 3FD3A 5I57A 1YPNA 4MFIA 4OENA 2Y84A 4LP2B 5ITPA 3O9PA 5I58B 5KZTA 4PFTA 3H03A 3LSXA 4RY1A 4G68B 2XXPA 1B5HA 1XC1A 2NUVA 3RNNA 1RYOA 3IJXB 4TQUQ 3RTWB 1FTJA 3HCQA 1S7YA 4AB6A 3FJGA 2XX7A 4GFRA 1MY1A 2O51A 2Z22A 5L9MA 1S50A 2QL3A 3EF7A 4I62A 5AE4A 3U72A 4G77A 3N5LA 1MXWA 2XXWA 3KG2A 1QUJA 3K00A 4F3SA 3G3JA 2V25A 1UTHA 2DP8A 4H5GA 1LAHE 2QS1A 5FHMA 3KN8A 1A8EA 1P1OA 2UVGA 4YMAA 4P0IA 1B05A 4YKJA 1MXXA 3ODBA 4JXIA 4ZEBA 3PGFA 3HPIA 2ONSA 3OO8A 1ZBMA 1FCKA 1WODA 3CFXA 4RPOA 2F34A 2E0SA 1MXZA 4R9FA 1MH3A 3VVFA 4F1UA 3H6UA 3Q28A 3C31A 1UTBB 2CZLA 3DP8A 1CE2A 4ND9A 4C0RA 3KN3A 2DWIA 2BJJX 3FJMA 4GL8A 1R9LA 4G8MA 4MLVA 3O28A 2H25A 4Q5TA 4X1DA 4LATA 1N76A 1B58A 2O84X 3JZJA 4DCXA 1LCTA 3SEWA 3IB1A 1PB8A 4OESA 3FV2A 3QXMA 5AA3A 1ZTYA 2XD2A 1J1NA 2I0BA 3IJOB 3PUWE 4N6PA 2DWJA 5JK4A 4MF3A 3LC8A 2NVUB 4QFNA 3T9XB 1O64A 2UYEA 5B7DA 5CBSA 1NNFA 4RYAA 3KOSA 1XOCA 1EZPA 3A3UA 4F2QA 2V3QA 1TFAA 3VLWA 4GLIA 1FQCA 3T9VA 3TYHA 3CVGA 4XKPA 5AA2D 1QKAA 3U94A 1LAFE 3Q25A 1SYHA 1B40A 3K6XA 3ZKKA 1AH5A 4GOTA 4ECFA 4P0GA 3LSLA 2HEUA 3OENA 1ZIUA 4H65A 4OFOA 3TQWA 5DEXB 3MVZA 1FQEA 4IO4A 4NTLA 5DVFA 3W15C 4OZ9A 3SEYA 2F35A 2ZMBA 4GF8A 3N6UA 4E0WA 4KHZE 3RT8A 4Q30B 5CBRA 3A3CA 1OLCA 3H3GA 4FIMA 3IAZA 4EQ7A 2HXWA 4EDPA 2R71A 1QULA 1N3WA 5BWJA 5CMMA 1FQDA 5F1QA 2Y7PA 1POY1 3KFMA 2XX9A 3PPOA 4P11A 2RC8A 1B9JA 1QKBA 2DE2A 1H76A 2ALUA 3E4RA 1B5JA 1QW0A 2UVIA 3GZGA 1IEJA 3S2VA 4IO2A 3MZBA 5I58A 1FTOA 4G68A 1NNPA 3DLNA 3SEUA 2LAOA 1JETA 3MZ1A 2H5YA 4R6YA 3Q27A 1LAGE 1XVYA 1QVSA 4KYSA 4EF2A 1B52A 1NH7A 3QYTA 1Q35A 4ELPA 1EH3A 1MY2A 3N6TA 4FEDA 3MJNA 4G68C 1Y4TA 2OWSA 3OELA 3RT6B 3H7MA 4DE8A 3DELB 4KCDA 2OLBA 1PC3A 3VDFA 2DOJA 1PBQA 4ESWA 3C32A 3M3LA 1P1NA 3IOVA 3M8UA 4IO5A 2V93A 3FV1A 1SDXA 4YB7A 1MY4A 2QS4A 1TFDA 3F11A 1DOTA 1MQHA 3RPWA 4JDFA 4EQBA 3EN3A 2ZNSA 4M1VA 3WAFA 3O6GA 4Q8RA 2NWJA 3MBPA 3KJ7A 2XXYA 2FYIA 1IXIA 3TPAA 3JYRA 1UTHB 1O7TA 2Z8DA 4UACA 2REJA 2DQVA 2PVUA 5B70A 1UTBA 3KJTA 1Y4CA 4DXCA 2D21A 3BKIB 4C1TA 4I1DA 2H98A 5H8FB 1B0LA 3RGYA 1M5DA 2G29A 4LONB 3T96B 3GBBA 5FTIA 4IGRA 2YLNA 4F19A 1XS5A 4XTCQ 1GTKA 2W7YA 2P0SA 5L9OA 3PD8A 3W9WA 1B4ZA 3UN6A 1B3GA 5H8QB 4THIA 3SDFA 1HSLA 3TCHA 3PUVE 3PPQA 4HCYA 1LFHA 5H8HB 2V3UA 4L17A 3CSBA 2GRVA 3EHTA 4DXUA 4KI0E 2PT1A 1Y3QA 3UGWA 1IXGA 1N7XA 3MC2A 3H06B 2XXQA 4ELQA 4RJZA 3HHGA 4GIZA 3SETA 3VLUA 2AYSA 4H8IA 2PMSA 5DEXA 3BFTA 5I2NB 3FASA 3LBSA 4R73A 3DP6A 3FATA 3H6WA 4K3FA 4H5FA 2XXRA 5L8DA 2AL4A 3QAXA 3VLVA 4LUBA 4KFQA 3T9HB 4ELRA 3TTRA 4BDMA 1YAEA 3B6WA 2ZNUA 3OO6A 4G8NA 3TZAA 2RC7A 2XD3A 3TMGA 1I6AA 1USYH 1ATGA 4DCYA 2Q9TA 5EYFA 3FVNA 4XIGQ 4F18A 2CMOA 1P1UA 1NNTA 1SYIA 3TTLA 2F6PA 4GXAA 1B7ZA 4ZEIA 2RF1A 3QUJA 3G3GA 5DT6A 3ZKLA 2ANJA 2GHAA 4F3BA 1LFIA 4YU0A 3ILTB 4YKIA 4GL0A 2A5TB 3IO6A 3E9XA 1FW0A 1DPPA 4QSDA 1OVTA 3KZGA 3CG3A 4ZS9A 1MQIA 3FJ7A 2O68A 3D4CA 2F78A 1XHYA 5CM6A 5IKBA 4OEUA 3P7IA 1LB8A 3IOUA 4RNSA 4GRKA 3TCFA 3T66A 1XT8A 4WEPA 3CG1A 4MBPA 4EQ9A 2AL5A 2ONRA 5TPAB 2B65A 2O7UA 4JWYA 4BDLA 1LBBA 3CFLA 4WKMA 5BUUA 2REGA 3G3IA 3O66A 3USDA 2H9BA 3D4GA 5ICQA 1P1QA 5AA2B 3KN7A 4AQ4A 3PMWA 4NEDA 1AMFA 5I59B 2RINA 2YJPA 3U92A 1B6HA 5FHNA 1IZ1A 3K1PA 1GR2A 2QS3A 2QSXA 3MPLA 4IY6A 2R6GE 1JVYA 3TAJA 3CRBA 5H8FA 5AA1A 1MDP1 1NKXA 4OFLA 3KGCA 3B6QA 4ELOA 4ZZAA 2OK2A 5CMBA 5JTYA 4DDDA 4DXBA 2I6EA 3OXNA 3U8QA 2FA7A 4QRZA 3CFZA 2I48A 5DVIA 1OVBA 5H8QA 1HSEA 3LUYA 5HPQA 2G93A 3R26A 4GQOA 3FVKA 1LAXA 4GWOA 3OMBA 3E13X 3G7WA 1VFDA 1MQGA 5H8NA 2VHAA 3RTFB 1A8FA 3RN8A 5H8HA 1UQWA 4R6HA 4LQ2A 1US5A 3I3VA 4RXLA 4U21A 1N0TA 2UVJA 3FVGA 2ZYKA 3K0VA 2ZYOA 3C35A 4OQOA 3PD9A 4G8HA 4OMBA 1JW1A 1EZ9A 3PUXE 1MPBA 1D4NA 1URDA 2DVZA 2F7BA 3DM0A 3FVOA 3MVXA 3M3FA 4ZECA 1XVXA 1OLAA 4KQPA 1S9TA 4H0WA 2Y7RA 3TCGA 3K6UA 5I2NA 4WXJA 2M8CA 4KCCA 1Z7ME 3HSTA 3BFUA 3GLBA 3V8XB 4BDQA 1IQ7A 3ILUB 2XXXA 2RCBA 3QK6A 1PB9A 4YAHX 1WDNA 4MLQA 4ZE9A 3FUZA 3VE1B 1H3DA 4H67A 1F9BA 5J1DA 4PFYA 4F1YA 5I56B 5EHSA 2V3TA 1NH8A 3S9NC 5AA4B 3ZSFA 2O7IA 1QUKA 1I69A 3QIMA 2DE3A 1EU8A 3MUQA 3TTMA 1JW5A 5A5XB 4RPNA 1LLSA 1D9VA 1R1NA 2A5TA 5M2VA 4KPTA 3KBRA 3IO4A 1I6BA 3C4MA 4BLAA 1A55A 2I3VA 1PBPA 1POTA 5ELVA 3CR9A 4F3GA 2Y7WA 1BKAA 4R9GA 2Z23A 2DXRA 5TPAA 2OWTA 3VXBA 4H1XA 5CI5A 2H4IA 1KWHA 3O6HA 1H44A 3LR1A 3HV1A 1JQFA 4ZE8A 4TLMB 2XXIA 3SESA 5AA2A 3UP9A 2UYFA 2XX8A 2F7CA 3MP6A 2I4CA 2F7AA 3PPRA 4DZ1A 3FXQA 1R9QA 5K2XA 2HCAA 5I59A 2NXOA 3MWBA 1EZOA 2I58A 1MDQA 4G2ZA 2XHDA 1ANFA 1YTVA 4JWXA 3MQ9A 1RKMA 1IITA 1N3XA 2XXUA 1M5EA 3MP8A 3KSJA 4AB5A 1SBPA 3OOAA 4KR5A 2PT2A 4O3BA 1GVCA 1OQGA 1MPDA 1FTMA 4R72A 4ESXA 4QFLA 4QFKA 3I6VA 2F8DA 5L9SA 3C36A 2HQ0A 2HFBA 3IB0A 3G3HA 3FIRA 4QSCA 3R7XA 1WVJA 2ONKE 1H43A 3OSQA 3EHUA 1A99A 2XXVA 1PEBA 5JTYB 3L6GA 3MZ9A 2D3IA 4PFUA 3CIJA 2VD3A 4NWDA 4FATA 1B51A 1NFTA 1LGBC 4POXA 4X48A 3HN0A 3R6UA 1B7HA 4TLLB 3Q29A 3WAEA 1JVXA 4NF4B 4YICA 2RKMA 5H8NB 1B3HA 3K02A 5TP9B 1M5FA 2O1MA 4YB5A 3EPEA 4R75A 1I6QA 2I0CA 2ZXTA 4EUOA 2PBWA 5TU0A 4RA1A 3C33A 1OMPA 4RK2A 2HZLA 3LSWA 4QFPA 1TXFA 3UA8A 1ELJA 3K6VA 1DTZA 3GBAA 1VE4A 1FTKA 3THIA 4XKQA 5I56A 3N26A 1OIBA 1NMUA 2H99A 4PETA 5AA4A 1BP5A 4NWCA 3T22A 3IORA 3TODA 1Y1ZA 1LFGA 1B2HA 2XXTA 3VVDA 4JBZA 5A5XA 4U4SA 5ITOA 4LZ8A 5CMCA 2DSFA 2DWHA 2V84A 1Q1KA 3MPKA 4JWOA 1ZKBA 5CRYA 4ZEFA 4U1OA 4IO3A 5I84A 1TT1A 2F6GA 1DTGA 2QPQA 3OO7A 1HSJA 4EXLA 2NOOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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