1M5CA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with br-hibo at 1.65 a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5cA01
4NF6A 3Q25A 2XXUA 1Y9UA 1XC1A 3IB0A 1B51A 2V93A 4NWDA 2XX8A 3WAFA 3OXNA 1B5IA 1NKXA 3TELA 4RK2A 2I58A 1XS5A 4FECA 3VDFA 2DVZA 2F7CA 3OSRA 1TFDA 3E9XA 4OWDA 1XVXA 1QW0A 4O3BA 3N6TA 5H8HB 1A54A 2HZLA 4U4XA 3RTWB 5IAIA 3SETA 3QK6A 3U72A 3RUMA 4HW8A 2H98A 1ZJLA 4BDQA 3W9WA 3OSQA 2H9BA 2HAVA 2QJEA 4XTCQ 4H67A 3JV9A 3VLUA 3LUYA 5AA1A 2V3QA 3SESA 4IO3A 3A3UA 3VVDA 3CFZA 4RPNA 4AB6A 2DE2A 3S9NC 3DLNA 2VGQA 1MQHA 4H6DA 2DE4A 3OEMA 2P0SA 1R6ZA 2HCAA 4LUBA 1EZOA 3TCFA 1B32A 4OFOA 4C1TA 3S9LC 4JWXA 5EHSA 1AL3A 3VVEA 1B7HA 1AIVA 3F11A 3MUQA 3C9HA 2E0SA 1DMBA 4DXCA 3L6HA 2O68A 2QMXA 4KCDA 1RKMA 4ZS9A 1NNFA 1AOVA 4DIGA 2QS1A 1UIUA 1VR5A 4MLQA 3FIRA 4JWYA 2GHAA 1QVSA 5I2NA 1QUJA 1PC3A 4DCYA 5H8QA 5CBSA 4JBZA 3DM0A 2Q89A 3OENA 3IAZA 3FJ7A 2F36A 1MS7A 4FATA 4YKJA 1FQEA 2UVGA 4NF4B 4JDFA 4RK9A 3KSJA 3H6TA 3UIFA 4G68B 1LGBC 4IY6A 5AA3A 5TP9A 3SERA 2NWJA 4QSCA 3G3KA 3T9HB 4FJPA 2V84A 4X9TA 3VE1B 3TUSA 4GVOA 1PB7A 3C32A 4M1VA 5A5XB 3EHSA 2OWTA 3G7WA 3PPPA 3U94A 1POTA 4F1VA 5JEIA 3FJGA 1B1HA 3S9EA 4ZECA 5TPAA 5JK4A 3Q29A 2AL5A 3S2VA 3PD8A 4GF8A 4F3SA 3USDA 4MH5A 1M5EA 5KDTA 3PUVE 4FIMA 3M3LA 1UTHA 1LCTA 4U4SA 4O3CA 2ZMBA 4FEBA 3FXQA 3O28A 3OMBA 4IGRA 2DVCA 1TWYA 2PX1A 3FGSA 2F7AA 1MQGA 4H8JA 3CFXA 4PFYA 4U22A 1DTGA 2REJA 3QYTA 1OLCA 4U23A 4LATA 3QIMA 3RGYA 1Q1KA 1VFEA 4R6HA 4KD5A 4MFIA 4AB5A 1LSTA 1OIBA 1N0TA 1DTZA 2AYSA 4BDNA 3FZVA 3K1NA 4HCYA 2LAOA 1FCKA 2DXYA 1B58A 1VE4A 2XD3A 4QFKA 1JEVA 1LB8A 4OTEA 4KCCA 4THIA 3DP8A 4RJZA 1MY2A 2AL4A 4OESA 3LBSA 1LB9A 4IY5A 3Q27A 1JVYA 1Q35A 3GBBA 2ONKE 3OEKA 2RC9A 4FORA 4OEUA 1UTHB 3G3GA 3I3VA 4XKPA 1LBBA 5FTHA 1B52A 2DXRA 1N76A 3K1MA 1PBPA 4F3BA 4ELOA 3T22A 4ELQA 2GFEA 3FXUA 3OO6A 2A5SA 5I57A 3RY3A 1S7YA 1LAFE 4KI0E 1ZMGA 3M3KA 3FVGA 4Q5TA 2OWSA 5I59A 2Q8JA 4GIZA 1IITA 4N07A 5AA4B 3RT6B 1NNKA 5I58A 3KG2A 5DTBA 2B3BA 4U21A 4YKIA 3B6WA 4I8CA 1B3FA 3V89B 1YPNA 4NF5A 4IO6A 3M8UA 3V5AA 1B1XA 4HS7A 4YB5A 3Q28A 2GHBA 1B0LA 2XX7A 2R71A 4G8NA 4ZZAA 5DYHA 5CMBA 1N04A 1CB6A 3G3HA 1MY1A 4KYEA 3LSWA 5FHOA 4KQPA 3ZKLA 4E0XA 1Z7ME 4OMBA 4R9FA 3D4CA 3IB1A 3IO4A 1MRPA 3GZGA 4NMYA 5DVIA 1Y3QA 4HCWA 1DPPA 4NE4A 1MY3A 3MPLA 1H45A 2F7BA 4DE8A 1TT1A 3OELA 3FD3A 1F9BA 4FAJA 4OVJA 1SI1A 2DOJA 2REGA 3SEWA 4Z0IA 3VXCA 5I57B 3VLWA 1D9VA 1SI0A 4LONB 1S50A 3MAMA 3TQWA 1MH4A 2B65A 3UGWA 3O6IA 1J1NA 3LSXA 2V3TA 1BIYA 5H8HA 4IO5A 3EF7A 1MPCA 4P0IA 4H5FA 5CBRA 2V25A 3K6VA 3N26A 1WVJA 3FJMA 3HSTA 4GFRA 3CSBA 5J1DA 4R73A 4I9DA 5I2KA 1MXYA 4EDPA 3EQ1A 1M5DA 1NMUA 1MQIA 3FV1A 4UACA 3O6HA 4R74A 2X7PA 4O3AA 3K00A 2O6AA 1BLFA 1HSEA 4DCXA 3U1OA 1WDNA 2XHDA 5AA2D 1Y20A 4GRKA 2O1MA 4AQ4A 4QFLA 1I6BA 1LCFA 1IXCA 3DP4A 3PPRA 3BBRA 4MF3A 3TTRA 4ZDMA 1ZBMA 3TAJA 2ABHA 4QFPA 3ECRA 4MLVA 4GQOA 4POXA 1M5FA 4TLMB 3MP6A 1NL5A 1BP5A 1N7XA 4R6YA 4XKNA 2UYEA 3PUYE 3OO8A 3IOWA 1MPDA 4DDDA 2ALUA 4JXIA 3M3FA 1CE2A 5DVJA 1SW2A 2I49A 4H8IA 3N5LA 4R72A 4NF8A 5I2KB 1QKAA 3ONMA 5KCJB 2F78A 3IB2A 5HPQA 2Q2AA 2X26A 4QSDA 4DLDA 3D4GA 1FTJA 4UA8A 4G4PA 3FATA 2YLNA 4XXUA 3K0VA 3R6UA 4NF4A 1A8FA 5BWJA 3G3JA 5ISUA 4LZ8A 5JTYA 4X1BA 4G68A 1SD3A 2ZXTA 3O2AA 3V83A 3UP9A 2I3VA 4N6PA 4ZEKA 3IO6A 3CVGA 3PUXE 2DWJA 3OOAA 5A5XA 1NNPA 3TTNA 1R1NA 3K1PA 3TFLA 4LA9A 3CRBA 2HEUA 2Y7WA 3G3FA 1SBPA 4ZE9A 1P1QA 4R9GA 1FTLA 5ICTA 1MDP1 4R75A 5AE4A 1IXIA 2XXWA 4U2RA 3H3GA 3SKPA 4KYSA 3TDJA 4YMAA 1ELJA 1BTJA 1MQJA 4NF8B 2Q2CA 1MY4A 4ELPA 1KWHA 4HTGA 5K2YA 2QMWA 4WXJA 3RTFB 2ONRA 4PFTA 2KLFA 2ESNA 3H6UA 4F39A 1B4ZA 2QL3A 4PE5B 3K01A 1LAGE 1JQFA 1O63A 3UORA 4ECFA 5JTYB 4XIGQ 3V8XB 2DQVA 3H6VA 2Z22A 2RC7A 1GGGA 5EYFA 3EPEA 4TQUQ 5CRYA 2OZZA 4OXVA 3E13X 2XXQA 5H8FA 3IOTA 3C31A 3K6UA 4L17A 1B40A 3CG3A 1FQFA 2NVUB 1B9JA 1URSA 4OQOA 3PPNA 1GTKA 1MDQA 4JB7A 1SDXA 3PPQA 2W7YA 4EQ7A 4F19A 3H4ZA 2PMSA 2Y7RA 3BKIB 2AIXA 2ZYKA 3QAXA 4LP2B 2DWHA 3I6VA 1ZLQA 3IORA 3I5OA 3TQLA 2O7IA 4IO4A 1JW5A 4G8MA 2X7QA 4LQ5A 4LQ2A 4OFJA 4R6KA 3MP8A 1L5TA 3WAEA 4ZE8A 4ESWA 2Y7IA 3RNNA 4X48A 1MY0A 4GL0A 3KN7A 4YB6A 5AA4A 1IXHA 1P1WA 3EHUA 1A40A 2THIA 5ELVA 2F8DA 4LZ5A 1ATGA 1R9LA 3U8QA 2GRVA 3DELB 1N3XA 4QSEA 1II5A 1FTMA 1MXVA 1OVBA 1DSNA 3PV0E 4PETA 5H8FB 2F5XA 1IUDA 3TODA 4GXAA 5L9OA 2R9JA 3QSLA 3IJXB 4RXLA 4NEDA 1LFIA 3VFJA 4F3PA 1OVTA 1HSLA 4ONYA 4EF2A 1XHYA 2I48A 5F1QA 3HHFA 2XXYA 3MQ9A 2HFBA 1P99A 3G3IA 3IJOB 4F2OA 3ILTB 5DT6A 3UA8A 5CC2A 1UQWA 1A8EA 1MM7A 2O1LA 4EUOA 3LC8A 1BKAA 2FNCA 1AMFA 4GL8A 4IGTA 3B6TA 2I0CA 4GLIA 3IOUA 4U1OA 3T9XB 3HHGA 1USYE 4XKRA 3S4UA 3UN6A 3LSFB 2D3IA 2ZNUA 3LR1A 3SEXA 1YCJA 2FA7A 3SEVA 1EU8A 4RA1A 1YAEA 4P0GA 1LBCA 4EXLA 5I56B 1MPBA 2Q9TA 3PMWA 3KN8A 2DYXA 2NOOA 4JSOA 3VVFA 2PT1A 1O7TA 2XXHA 3R26A 2D5WA 4ESXA 2ZYMA 5CMCA 2ONSA 2QRYA 3GLBA 5CMMA 1GVCA 1I6AA 4KHZE 1M5BA 4I1DA 4OFLA 1POY1 2DS9A 4R2BA 3MC2A 2I4CA 1R9QA 3PGFA 3GBAA 3PD9A 3ZSFA 4BLAA 3KN3A 5CM6A 1MM6A 4OYVA 2DSFA 3HO7A 1USYH 1A99A 5EHMA 1P1NA 4PP0A 1Y1ZA 1YTVA 4F22A 3O66A 2O69A 2IA4A 1I69A 1LAHE 1IXGA 3GXAA 3E3KA 2UVIA 2A5TB 4N13A 5H8SA 1M5CA 1UTBA 4F18A 3B6QA 3TTMA 1TFAA 1P1OA 3K6WA 2VD2A 3JZJA 3H03A 4DZ1A 1Y3NA 3FASA 5ITOA 1D4NA 3KZGA 3T93B 4PFWA 1OQHA 4OEVA 1MXUA 1NFTA 1B7ZA 1H44A 2H99A 2XXPA 5KCJA 1PEBA 4Z7EA 1O64A 4WEPA 3W15C 3A09A 1UIVA 2UXAA 4DXUA 4OERA 3P7IA 2Y7KA 4C1UA 2ANJA 1ZKBA 4R2FA 1TXFA 5BUUA 3K02A 1B0HA 4I62A 4NTLA 5CMKA 4F31B 1H76A 3C34A 1LFHA 4BDMA 3PPOA 4GOTA 3TTKA 4C0RA 2XD2A 3O97A 3MP1A 1SW1A 1D3KA 4NWCA 5FHNA 3BFTA 2RCAA 1B3LA 3T9VA 2PYYA 1OLAA 2QSXA 2F34A 3QUFA 1PB9A 1MXZA 2CMOA 3MJNA 1SYHA 2P1SA 4QFOA 3CG1A 1US4A 3FV2A 4H65A 2XXRA 2F35A 3CR9A 2DE3A 1GV8A 4Q0CA 3K2DA 3KFMA 3ZKKA 2O51A 4G68C 4K3FA 3S9MC 4YU0A 3N6UA 4PFUA 1UTBB 2QS4A 2VHAA 3C35A 1XT8A 3TCHA 3DP6A 3RT8A 5AA2B 2PVUA 1H3DA 3CSGA 4YKPA 1B05A 3C36A 3FXRA 2Z8DA 1FTOA 1VSOA 3TZAA 4F2QA 1US5A 3CIJA 4IB2A 3T9UA 2D21A 4FE8A 4XKQA 3BFUA 1PDAA 1N84A 3QXMA 3IK6B 2ZYOA 4JWOA 1NH8A 5FTIA 2I4BA 4KFQA 4LZ7A 2HXWA 2IEEA 4F3GA 2G29A 1OQGA 5DEXA 2R6GE 3H6WA 4ELRA 4KYDA 1RYOA 1FW0A 1IQ7A 2RKMA 4OETA 2G93A 1IEJA 2QS3A 3EHTA 1NNTA 3KEIA 4QHQA 2QPQA 2RCBA 1B3GA 3PUZE 4ISUA 2RF1A 4RYAA 4YKKA 5H8NB 4NF6B 4FEDA 1P1UA 4OENA 2Z8EA 3KOTA 4POWA 5L9MA 4KPTA 4Q8RA 1ZTYA 2P2AA 4E0WA 2XXTA 4RPOA 3HCQA 1Z7NE 1SQYA 1B6HA 2E1SA 3MBPA 3TKDA 4ZEFA 2XXXA 4ND9A 4LVQA 3IX1A 1IZ1A 5L8DA 2UVJA 1B5JA 4H1XA 5DVFA 3TEPA 1Y1MA 2FYIA 3KOSA 2ZYNA 3IR1A 2RINA 4IO2A 2DWIA 3KSXA 4BDRA 1XVYA 4U1ZA 2OBGA 5DEXB 1LLSA 3MPKA 1DOTA 2UYFA 3MWBA 2RC8A 3B7DA 2OK2A 2B3FA 3TMGA 3O9PA 4G77A 2Y7PA 3KBRA 1MXXA 3AXFA 3H06B 3T66A 1T0KA 3SDFA 2Z8FA 1FQCA 3JYRA 3E4RA 5ITPA 3MZ9A 3TTLA 4BDOA 4F1YA 4ZEIA 2WKYA 3FUZA 3HN0A 3HPIA 2VP1A 2XXIA 3RLFE 3SEUA 4GXSB 4H0WA 1B2HA 1LAXA 3PU5A 4DXBA 2F6GA 3MZ1A 2I0BA 2VOZA 3RQTA 4YMBA 2F6PA 4OHNA 1I6QA 2O84X 5TU0A 1RYXA 3K6XA 1S9TA 4P11A 2HZKA 3PMVA 5I2NB 3EN3A 1B3EA 5H8QB 4F1UA 1PB8A 3ILUB 4OZ9A 3KGCA 3ODBA 4GD5A 2HQ0A 3TCGA 4YICA 3O29A 1FQAA 2Y84A 3Q26A 1FQDA 5I56A 2H25A 5I84A 3W9VA 3SEYA 3TYHA 1VFDA 2H5YA 1B46A 3T96B 2I6EA 2QS2A 4TOZA 1Y4CA 3HV1A 4EXKA 2PT2A 3LSLA 5IKBA 1HSJA 1JW4A 5TP9B 3OO7A 1EZPA 5L9SA 2O7UA 4M4GA 2OLBA 3KJ7A 4GWOA 3UK4A 4WEDA 1DPEA 3TPAA 4G2ZA 4EQBA 5HBCA 1WODA 5TPAB 3K4UA 3FVKA 1ANFA 3MVYA 1URDA 5KDTB 1OMPA 3A3CA 2M8CA 2A5TA 4F29A 3RN8A 5KZTA 4EQ9A 4EF1A 2NUVA 3PMXA 4YB7A 1EZ9A 3FVNA 4YAHX 1B5HA 2PBWA 2CZLA 1H43A 1ZIUA 3RPWA 4ZEDA 4G8HA 4WKMA 4BDLA 5FHMA 1MH3A 3VLVA 2YJPA 2XXVA 2DWAA 1MG1A 3MZBA 1B7UA 4ZZEA 3OO9A 2HAUA 1JEUA 1MXWA 3FVOA 3MVZA 3VXBA 2BJJX 3U93A 1Y3PA 5HM4B 4QFNA 2VD3A 1B4HA 4QF9A 3MW0A 5LOMA 1GR2A 4RNSA 5B70A 2I3WA 1EH3A 5CI5A 1SW4A 1SW5A 2OJTA 4MBPA 4X1DA 4ZEBA 2F97A 4TLLB 3OD7A 1QKBA 3R7XA 3THIA 1A55A 5F7VA 4RY1A 1XOCA 3O6GA 5K2XA 2V3UA 3L6GA 3C33A 3KJTA 2GH9A 3PUWE 1Y4TA 3CI8A 1FQBA 1SVXB 1PBQA 1ZU0A 2XX9A 1LFGA 3U92A 5AA2A 2ZNTA 1JNFA 1QUKA 5B7DA 3C4MA 1JETA 4Q30B 2YPNA 1NH7A 4QRZA 1N7WA 5I59B 5ICQA 1JVXA 4JSDA 3IL1B 1A7LA 4YZZA 2Z23A 1FTKA 4KR5A 3CFLA 5I58B 1QUIA 3QUJA 1URGA 3H7MA 2ZNSA 1MQDA 1IIWA 2NXOA 2UVHA 3ZS6A 3IOVA 1N3WA 4NF5B 1QULA 3MVXA 1AH5A 2DP8A 1SYIA 4PQJA 1QJMA 2OCUA 2H4IA 4IO7A 1B3HA 3MVWA 4H5GA 3VV5A 1D9YA 2Q88A 5M2VA 1JW1A 3N94A 5H8NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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