3O28A

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o28A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o28A02
3OEKA 5L9MA 4GLIA 3QUJA 1HSEA 2DVZA 3OMBA 4MF3A 2F35A 4Q30B 4LZ7A 3OSQA 4FAJA 3LR1A 2QSXA 3LSLA 1JEVA 2X7QA 1NL5A 4YKIA 4YKJA 4NF5A 3H6TA 1B3EA 4RPNA 1D9YA 1B4HA 4G8NA 1BP5A 5FHNA 1R1NA 2XXTA 2AYSA 1VFDA 2ANJA 4FORA 2XXYA 1B32A 1IXIA 1M5EA 4NF4B 2B3FA 3KFMA 4HS7A 2Q2AA 4AQ4A 3TELA 4RPOA 5DTBA 5I59B 1DSNA 3VV5A 1B7ZA 4IO2A 2RKMA 3PV0E 5CRYA 1IUDA 3V8XB 5ISUA 2CZLA 4H5GA 5FTIA 3CSGA 1LCFA 4P0IA 1MRPA 4F1UA 3HPIA 4H0WA 3K00A 1VE4A 2V84A 5HBCA 4NE4A 3JYRA 2H25A 4ZE9A 4OTEA 2XXWA 4R6KA 3IOWA 5H8HA 1YPNA 2F7BA 3DELB 4YMBA 1DTGA 3RT6B 2X7PA 4C0RA 2V93A 4NWCA 1SD3A 3C9HA 2H5YA 2Y7IA 4WXJA 1DPEA 5CBSA 1QVSA 5FTHA 4U22A 2X26A 1UQWA 5ICTA 4FEDA 3FD3A 3FVNA 1N0TA 4U1OA 4KYSA 2A5SA 2OWTA 3ILTB 3G3JA 1FW0A 1UIVA 2HEUA 3GXAA 5TP9B 3CG3A 1MM6A 1LCTA 1FQEA 3B7DA 1ZU0A 2P0SA 2OZZA 3UA8A 2OCUA 2Y7RA 1SVXB 3MAMA 2RINA 1M5CA 2ONKE 3C31A 3PPOA 1MPDA 1I6QA 2RC8A 1P1UA 3V89B 1PDAA 2YLNA 4YU0A 2ZYNA 1GTKA 4FATA 4H5FA 4OQOA 3SEUA 1PBPA 3H3GA 3FIRA 2ONRA 4ZECA 2F5XA 1SW2A 1P1NA 4ZZEA 4IB2A 5CMKA 3A3CA 2BJJX 4NMYA 1XVXA 3G3HA 4GL8A 5JTYB 1FTKA 1PC3A 4IO7A 2QS3A 2ZYKA 1FQDA 1MS7A 4R72A 4QF9A 2GHAA 3QUFA 3G3IA 2Z22A 3IL1B 4ECFA 2I0CA 3K2DA 4KR5A 3O6HA 3A3UA 4HCWA 1JVXA 3KN3A 3MP1A 1AH5A 2REGA 5ELVA 3O97A 3Q27A 3H7MA 1O64A 2PX1A 4LATA 2QS2A 3K6UA 3N94A 4MFIA 3SEVA 4WEPA 1Y20A 5TU0A 1MPBA 1USYE 4I9DA 1JEUA 1LGBC 1QKBA 2NWJA 1D3KA 1ZKBA 4NF8B 1B5IA 4BDLA 4KI0E 2R9JA 1LFGA 1B3FA 2YPNA 2DP8A 3IB2A 2UVGA 4XKPA 3PUYE 2AL5A 3RPWA 4H6DA 1IZ1A 4XTCQ 4NF5B 2I3VA 2O68A 1H43A 3R26A 4EDPA 3FASA 3USDA 3K6WA 5L8DA 1MY1A 3IO6A 3B6TA 2A5TA 4GF8A 1L5TA 3K6VA 1A8EA 4HTGA 3C35A 5KZTA 5AA2A 4HCYA 4EUOA 1T0KA 3E4RA 4RA1A 4IO3A 3RLFE 2DXRA 4QFPA 1Q35A 3PPNA 3H4ZA 4FE8A 2Y7KA 1PB8A 3EN3A 1S7YA 3D4GA 2HZLA 5B70A 1NNKA 3GZGA 3RN8A 4XIGQ 4ZZAA 1MPCA 2Q8JA 4EQ9A 2UYEA 4PQJA 2RCAA 1TXFA 1JETA 1MH4A 1MQJA 3OEMA 3VXCA 4UA8A 3FVGA 1GV8A 2ZXTA 5H8HB 4KFQA 4ELOA 1EU8A 2I4BA 1P1QA 5CM6A 4TLLB 5DT6A 3O29A 3RT8A 4GD5A 1MQIA 1HSLA 2DSFA 1D9VA 1M5BA 3G3GA 2QMWA 2I3WA 4YKKA 1B1HA 1NMUA 5KDTA 4OHNA 3I3VA 1SBPA 1LFHA 3MPKA 1MXUA 2THIA 2VHAA 5DEXA 1H76A 1H3DA 2O1LA 3TEPA 4RY1A 1ZJLA 1VSOA 3MPLA 2DOJA 1BLFA 1LAFE 5I84A 3TMGA 3PPPA 1WODA 3P7IA 1B4ZA 3E13X 5I56A 3H06B 3LSXA 4OEUA 2DE3A 2F7AA 1LAXA 2V25A 1Y9UA 3G3KA 1US4A 3SETA 3T9VA 5LOMA 5CI5A 3W9WA 4H1XA 1LFIA 1MDP1 4DIGA 3M3LA 3OO9A 3KSJA 2DQVA 2GH9A 4MH5A 1QW0A 2RF1A 3R7XA 2HAUA 4ZEKA 4DCXA 4PFTA 3DP8A 3U8QA 3VDFA 2W7YA 1ZTYA 1IEJA 3MZBA 2F8DA 4RJZA 2FA7A 4XKNA 5DVJA 3UORA 4U4SA 4GFRA 2DXYA 3IR1A 4JDFA 1QUJA 4ZE8A 3TAJA 2IEEA 3KEIA 4I8CA 1B52A 4L17A 2Y7PA 3EQ1A 1Y1ZA 2PT1A 1FTLA 4AB6A 2I6EA 2NOOA 1A55A 1VFEA 4GVOA 1Y3PA 3IOTA 1FQFA 4GXAA 3MBPA 3N6UA 2LAOA 3FJ7A 5BUUA 1LSTA 2V3TA 5H8FA 3UP9A 1R9QA 3C32A 1RKMA 4U1ZA 4R6YA 3UGWA 2A5TB 1N04A 3FATA 1FQCA 3K6XA 1SW1A 3LSFB 2Z8DA 5FHOA 1Y3QA 1AOVA 5AA2B 1QULA 2Z8FA 2VOZA 3TODA 2H98A 1BTJA 3GBBA 1OLCA 4OETA 4OESA 4G2ZA 4EQBA 4X1DA 3HO7A 3OXNA 1JVYA 1B3HA 3T9UA 4DLDA 1AL3A 2I0BA 1I6BA 4P11A 3A09A 4E0WA 4QFNA 5HM4B 3T93B 4JXIA 4C1UA 2PBWA 2H99A 3CIJA 3F11A 1P99A 4MBPA 1TFDA 4YMAA 2GFEA 5CMCA 3C4MA 3IO4A 3IAZA 3U93A 2XX9A 4NF6A 2O1MA 5I57A 4BDQA 4R9GA 3TQWA 3MVXA 4ZEDA 4ZEBA 3C34A 5KDTB 5K2YA 4C1TA 3M3KA 4IGRA 4LP2B 1BIYA 4G4PA 2OWSA 2Q89A 3CFLA 1XOCA 4PP0A 3Q26A 4LQ2A 3RY3A 2D21A 4IO4A 1TWYA 5DEXB 3TCHA 4G8HA 1MQDA 1B5JA 4R74A 2XHDA 5J1DA 3HHFA 4U4XA 3RNNA 2QPQA 1UIUA 2O69A 3MWBA 1IQ7A 5ITPA 3O6GA 4ELRA 1ZIUA 5I56B 4DE8A 2I49A 3MUQA 1POTA 4X48A 3UK4A 5CMBA 4ESWA 2KLFA 2XXVA 4MLQA 4QSDA 3T9HB 4R2FA 1II5A 1A7LA 4JWOA 1N7XA 2XX8A 1XHYA 3QXMA 1AIVA 1LLSA 1ZBMA 3TTNA 1NFTA 4ELPA 3EHUA 1B05A 2NVUB 4XKRA 4Z0IA 1Y1MA 1N76A 4OMBA 3OD7A 1LBCA 3KN8A 1N3XA 3V83A 3WAEA 3CVGA 2HAVA 1FQBA 4Q8RA 2Z8EA 3FZVA 3S2VA 2RC7A 5IKBA 1DOTA 4LA9A 2XXUA 3VLVA 3KBRA 3S9LC 2Y7WA 4P0GA 2GRVA 4JSOA 1MY4A 4EF1A 2QS1A 3N5LA 3QYTA 2F36A 2F78A 1B3LA 1J1NA 2NXOA 3GBAA 1B46A 2OLBA 3E3KA 2ZMBA 1DMBA 4N13A 4EF2A 2XXQA 3SEYA 1SQYA 3W15C 1PB9A 2PMSA 1IXGA 4JWXA 4F19A 1I6AA 4PE5B 1B58A 1ATGA 3FV1A 5CMMA 1A54A 4U2RA 5H8FB 1XS5A 4RXLA 1N84A 3CI8A 1LB8A 3MZ1A 3IORA 4R2BA 5CBRA 4DCYA 3C36A 3O9PA 3K0VA 5JEIA 2AL4A 3TQLA 5IAIA 1EZ9A 1B2HA 4G77A 3TPAA 1Q1KA 3PUXE 3HSTA 1FQAA 3PMVA 3TTRA 4OYVA 1BKAA 4R6HA 3Q29A 2AIXA 2UVHA 4I1DA 2QRYA 2HCAA 3LSWA 4LZ8A 3TUSA 3BKIB 3FXRA 4LVQA 3PUWE 2DWJA 2V3QA 1NKXA 1FTJA 2ESNA 4ONYA 3IX1A 4GRKA 4F3SA 1QUKA 1LAGE 5AA1A 1UTBA 3KZGA 4WEDA 1MXZA 5H8NA 4F31B 3SEXA 2YJPA 3RTWB 1YAEA 2DWAA 2UVIA 4GL0A 1ZMGA 5BWJA 4G8MA 2ABHA 3TCFA 3EPEA 1NH8A 2XD2A 3OELA 1JW5A 4NF6B 3TTLA 3CSBA 3K02A 2VD2A 5I57B 4PFWA 3PPQA 1FTOA 5TPAA 1POY1 2Z23A 1A99A 4Z7EA 4IO5A 4GXSB 1MY3A 1WVJA 5L9OA 4LQ5A 3UN6A 3CG1A 4IO6A 1MQGA 2M8CA 4DZ1A 4POXA 4ISUA 3QAXA 3K1MA 4K3FA 5H8QA 4MLVA 3AXFA 1IITA 2Y84A 4X9TA 1TFAA 3IOUA 4AB5A 4YB5A 4QSCA 4F3PA 4YICA 4GQOA 3CR9A 4I62A 2QMXA 4QFOA 3PU5A 3IB1A 1DTZA 3EHTA 2QS4A 1PEBA 4F2OA 4JBZA 4OWDA 4R75A 3CRBA 3ODBA 3PPRA 4XXUA 3BBRA 1M5FA 1OQHA 3U1OA 4RNSA 2DE2A 1OLAA 4FJPA 1NNPA 2O6AA 3KSXA 1B1XA 5I2KA 1B7UA 5I58A 4F22A 1GGGA 3MP6A 5L9SA 1URSA 1SW4A 4F3GA 3DP4A 2D5WA 4UACA 2XX7A 1MM7A 3DM0A 1URGA 3O66A 3MQ9A 3VLUA 3VFJA 3HN0A 5JK4A 3FXUA 1OVBA 4F18A 2F97A 4KPTA 4QHQA 4ELQA 4ND9A 3B6WA 3MW0A 1KWHA 4TLMB 3S9EA 2UYFA 2V3UA 5DVFA 4QFKA 4IGTA 2O84X 1JNFA 1PBQA 3PUVE 2E0SA 3KOSA 3OO6A 3HCQA 1B5HA 1US5A 3DLNA 3VLWA 2ZNUA 1TT1A 3LC8A 4BDMA 4DXUA 3FJGA 1MY0A 1F9BA 2GHBA 4OFOA 2PT2A 1SI1A 3FUZA 3MVYA 4O3CA 5FHMA 1S9TA 1IXHA 3PMXA 4HW8A 2XXHA 1SYHA 1MXVA 1B51A 4F3BA 1FTMA 1Z7ME 2ZYMA 2HFBA 3FXQA 5K2XA 4ESXA 3L6GA 1UTBB 2H9BA 2FNCA 3G3FA 4U21A 1JW4A 5H8NB 5KCJA 2D3IA 3KJTA 4H8JA 1D4NA 3KJ7A 3SERA 3OENA 4KHZE 5M2VA 2XD3A 3HV1A 2DWHA 5AA2D 3MZ9A 4LUBA 3S4UA 2XXRA 1Z7NE 2VD3A 3VVFA 3ILUB 4EXLA 4Q0CA 5AE4A 5TPAB 1M5DA 3TYHA 1ZLQA 2DS9A 4WKMA 2R6GE 5F7VA 2Q2CA 2G29A 2REJA 3KG2A 2HXWA 1B6HA 2P2AA 2FYIA 4JWYA 3ZS6A 5H8SA 3RTFB 4DXBA 3G7WA 1SDXA 2E1SA 3WAFA 4EQ7A 3D4CA 5H8QB 4TOZA 3H6VA 3U94A 1MDQA 2I4CA 4GIZA 2H4IA 2O7IA 4YKPA 3IB0A 4THIA 3VE1B 1YTVA 1N7WA 4X1BA 2RC9A 4O3BA 3O28A 4EXKA 4DDDA 4QRZA 2F34A 4KYEA 4ZDMA 4BDNA 4LZ5A 4PETA 3IOVA 5EYFA 2PYYA 1MXYA 4F1VA 3RGYA 1LAHE 5AA4A 3M8UA 4OENA 3CFZA 5F1QA 5I2KB 5A5XB 3S9NC 2ZYOA 3H6UA 3OOAA 5I58B 1LB9A 3RQTA 1O63A 3TFLA 2F6PA 1JW1A 1URDA 4O3AA 3S9MC 3PD9A 3IJXB 3U72A 4Q5TA 1NNFA 3PUZE 1YCJA 3TKDA 3PGFA 3QIMA 2HQ0A 5EHMA 2B65A 4R9FA 3H03A 4KCDA 1S50A 1PB7A 1UTHA 4OFLA 5CC2A 3SESA 4OFJA 4OZ9A 1QUIA 3OSRA 2UVJA 3PMWA 4G68A 5I2NA 3T22A 2I58A 4RYAA 2OK2A 4NWDA 1USYH 4M4GA 2Q9TA 5DVIA 2ALUA 1IIWA 1VR5A 3VXBA 3KOTA 3QK6A 4GOTA 1OVTA 5B7DA 1NH7A 3OO8A 1CE2A 1FCKA 1MY2A 2WKYA 5HPQA 1AMFA 1N3WA 1XVYA 1SI0A 1RYOA 1Y4TA 1ELJA 3MJNA 1XT8A 1IXCA 1H45A 1MXXA 4M1VA 3GLBA 1EZOA 3U92A 2ONSA 3LUYA 4F2QA 3TZAA 4F1YA 3N6TA 2O51A 3ONMA 4XKQA 4LONB 2UXAA 3KN7A 4BDOA 3TDJA 2OJTA 3EHSA 3E9XA 3L6HA 3K01A 5AA3A 3O6IA 3RUMA 3QSLA 4PFYA 4OEVA 5KCJB 3T96B 2DVCA 4YAHX 4E0XA 3SDFA 1B0LA 3JV9A 3O2AA 4JB7A 3BFUA 3MC2A 4BDRA 3ZSFA 1SW5A 3FVOA 1OMPA 4YZZA 1MH3A 3THIA 4OERA 3ECRA 2Q88A 2NUVA 4N07A 3T66A 1H44A 4F29A 2ZNTA 4FECA 4NF4A 3VVDA 1GVCA 3ZKLA 4FEBA 2G93A 4NTLA 4H65A 5I59A 1HSJA 1B7HA 1WDNA 1SYIA 3W9VA 4OXVA 4RK2A 2F7CA 3EF7A 4GWOA 3MVWA 4KCCA 3SKPA 1OIBA 2HZKA 2DYXA 4ZEFA 4H67A 1Y3NA 4U23A 3IK6B 3DP6A 3SEWA 3KGCA 2R71A 1QJMA 4FIMA 1B0HA 3T9XB 1P1OA 1A8FA 4KQPA 2CMOA 4POWA 1XC1A 2ZNSA 4KD5A 4ZS9A 3M3FA 4YB7A 2XXPA 3C33A 4QSEA 1B9JA 4JSDA 5AA4B 1B40A 4ZEIA 2PVUA 3UIFA 4QFLA 4IY5A 4G68C 5TP9A 1MXWA 1GR2A 1NNTA 3Q25A 3FVKA 1MG1A 3MVZA 1P1WA 4OVJA 4RK9A 5A5XA 1A40A 3IJOB 3JZJA 3PD8A 3CFXA 3R6UA 2XXIA 3FJMA 3TTMA 2QJEA 3VVEA 3V5AA 3H6WA 2B3BA 1I69A 1EZPA 1UTHB 1Y4CA 3I5OA 2I48A 4F39A 4BLAA 4H8IA 2OBGA 4NEDA 3K1NA 2QL3A 4G68B 3TTKA 5I2NB 3OO7A 1RYXA 2IA4A 1B3GA 4N6PA 5DYHA 4IY6A 2DWIA 4PFUA 2VP1A 4TQUQ 4KYDA 3FGSA 3LBSA 1DPPA 2RCBA 2VGQA 3BFTA 5JTYA 1ANFA 3MP8A 2DE4A 2O7UA 1EH3A 2P1SA 1LBBA 3I6VA 3TCGA 1OQGA 1CB6A 2F6GA 4YB6A 1QKAA 1MQHA 1R9LA 3HHGA 3B6QA 1R6ZA 3ZKKA 2XXXA 5ICQA 5EHSA 1O7TA 3K4UA 5ITOA 3FV2A 3Q28A 3N26A 4DXCA 1JQFA 4R73A 3K1PA 4NF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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