3O28A

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o28A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o28A02
5J1DA 1OLAA 4YB5A 4ZEDA 1IZ1A 1LFGA 4ZZEA 1MG1A 1MXVA 3LBSA 2I58A 3H7MA 2KLFA 3S9EA 4UACA 4R6KA 4OVJA 2PX1A 4LONB 4JSDA 1B58A 2QS2A 4BDNA 3TDJA 1TWYA 3FZVA 3CG1A 4ZE9A 1MPCA 3CR9A 1B7UA 4GL0A 3U92A 1B52A 1XHYA 4HS7A 3VFJA 5I58B 1XS5A 4UA8A 4TQUQ 2Q2CA 5EYFA 5I58A 1FW0A 2CMOA 3PMWA 4P0IA 1LSTA 1TT1A 1QUKA 3QYTA 3MPLA 2XX7A 3H6VA 1RYOA 5DTBA 3VXCA 4ZS9A 1MY1A 3BFTA 4TLMB 1I6QA 2V84A 4G68C 4GWOA 3A3CA 4M4GA 3K1PA 1JVYA 3UA8A 1FQEA 2DOJA 3TCGA 1QUIA 1QULA 2F97A 3A09A 5FTHA 1EZ9A 4I9DA 3N5LA 1PDAA 4U4XA 2I3WA 4JWOA 1Y20A 3T93B 3PPRA 2XX8A 4IGTA 3KJ7A 4F3BA 1LAGE 2M8CA 3B7DA 3KZGA 1US5A 1JEVA 4BDOA 4GD5A 5TP9B 3O28A 1MM7A 4ND9A 1ZIUA 4QSDA 1SD3A 5AA2D 4IY6A 5TP9A 4U1OA 4LQ5A 4M1VA 4JXIA 4OTEA 3H4ZA 4ELOA 2PVUA 1GR2A 1FQAA 4JBZA 4MH5A 3TUSA 1USYH 1UTBB 4RA1A 2QS4A 2VD2A 3FVKA 3EHUA 2R71A 1I6AA 5L8DA 3MPKA 4ELRA 3S9MC 3GLBA 3TYHA 4ZEKA 5H8QB 4OHNA 2BJJX 1AL3A 2HAVA 3RPWA 2DP8A 1N3WA 2OBGA 4ZEIA 5CM6A 3CG3A 3N94A 4DXBA 1YCJA 4OQOA 3PPPA 3ZKLA 3IO4A 3EN3A 1MH3A 1CB6A 2UYEA 3ONMA 4U21A 2F6PA 3PUVE 4F1UA 3HCQA 3MVWA 1L5TA 3TKDA 2FNCA 4ONYA 4U23A 4HW8A 3D4CA 4R72A 3SEYA 2O1MA 2V25A 3EPEA 5B7DA 3IOUA 1PBQA 3DP6A 3K0VA 4QFKA 4X48A 1NFTA 4LZ7A 3IOWA 5DVJA 1LCTA 5FHNA 3FV1A 4OWDA 3MVZA 1ZKBA 1M5FA 2R9JA 5JEIA 2QL3A 1EZOA 2O69A 3W9WA 2RKMA 4XXUA 3I5OA 1NNKA 1RKMA 1P1QA 1AH5A 4K3FA 4GXSB 4OEUA 3HV1A 4QHQA 3SEUA 3PD9A 4KCCA 1XOCA 3B6QA 3HO7A 4G77A 4GLIA 3GXAA 1MM6A 2Y7IA 4RXLA 5B70A 4OENA 3DP4A 3QXMA 5CC2A 4H8JA 3TFLA 1M5DA 1MXWA 1MRPA 4F31B 4FAJA 2XXPA 3RNNA 4BDQA 2NUVA 4O3CA 1MPDA 3SEXA 3U8QA 5CMKA 3A3UA 1LBCA 1D4NA 1D3KA 3K01A 5BUUA 4TOZA 3WAEA 3K1NA 3O66A 1HSLA 3O9PA 1N7WA 2UVIA 1J1NA 3DLNA 1JW4A 3IL1B 4AB5A 2D5WA 3PUXE 4YKIA 1GVCA 3T9XB 3P7IA 2D3IA 1R6ZA 3KEIA 4C1TA 3GBAA 4FJPA 2V93A 1AIVA 3FXQA 1ZBMA 1IXGA 1NKXA 1WDNA 5I56B 3EHSA 3CVGA 4G8HA 3V89B 2W7YA 5L9SA 3M3KA 2I4BA 5I56A 3G7WA 4I8CA 2GRVA 4U22A 3K02A 2HEUA 4LATA 1XVYA 5DYHA 1Y4CA 1B9JA 3MUQA 1B32A 5F1QA 3T66A 1GV8A 3O97A 3ZKKA 4G2ZA 4N6PA 1QVSA 1MY4A 3H03A 2F6GA 3PMVA 4AB6A 3RQTA 5FHMA 3OELA 1QUJA 1H3DA 1YAEA 3FD3A 1LAFE 1MH4A 4KPTA 5CBSA 3M3LA 3PU5A 4POXA 2AIXA 3N6TA 1POTA 2ZMBA 4KD5A 5ELVA 1B46A 1SYIA 4BLAA 3C33A 3ODBA 1NNFA 2F7BA 3T96B 3H6TA 3K4UA 5DVIA 4Z7EA 3IX1A 2DSFA 1P1NA 4FATA 2XXWA 3K6VA 1M5EA 3OENA 4HTGA 2HFBA 5AE4A 3RGYA 3BKIB 1S7YA 1PB7A 4KYSA 3FUZA 3SEWA 1I69A 3ECRA 3O6GA 4YKJA 3IJOB 3ILTB 5KDTB 4R73A 4H6DA 3K6XA 4ZDMA 4H1XA 3MZ1A 2F5XA 1BLFA 3KN7A 2F8DA 4XTCQ 3K6WA 5ITPA 3C35A 4FORA 3IB0A 4EF2A 3OO8A 2YJPA 1H76A 2H9BA 3Q25A 4F1YA 2HZKA 4LVQA 4RYAA 2O7UA 2PT1A 4YB6A 2Y7PA 1FTJA 4EQ7A 3TTKA 3IR1A 3KN3A 1MPBA 2I0CA 1PBPA 1WVJA 1NNPA 4N13A 2Y7WA 1ANFA 5AA3A 1MXXA 3K00A 1FQBA 2DWIA 4X9TA 5BWJA 4MF3A 5A5XB 2ZXTA 3MP1A 1B1XA 3G3JA 3OD7A 4KR5A 2ONSA 4YKPA 3RUMA 5A5XA 2QMWA 3CFXA 3E13X 3LSXA 2O6AA 5DEXB 3G3FA 3SDFA 3UK4A 4XIGQ 2Q9TA 2A5TB 3S9LC 1FQCA 4ZE8A 2Q8JA 5DEXA 3LR1A 1ATGA 2A5TA 4C0RA 3VV5A 1BKAA 3O2AA 1IITA 1DMBA 3VXBA 3CRBA 4LQ2A 5KCJB 1DOTA 4QSCA 3MAMA 3R6UA 3E3KA 1Y3NA 1WODA 3H6UA 5I59B 4H5GA 1IEJA 5KCJA 5F7VA 3MBPA 3THIA 1SW2A 1H44A 1O64A 5I59A 1MQIA 4LP2B 1URDA 2P1SA 4PFWA 4Q5TA 5H8FB 1A55A 3FJMA 4IO2A 4DCYA 4DXCA 1H45A 3L6GA 3R7XA 1OVTA 3FV2A 2ZYKA 2E1SA 2OJTA 5H8FA 3RT6B 2CZLA 3SESA 2HCAA 4EUOA 1AOVA 2B65A 2GH9A 2V3TA 4IO3A 4OERA 3TCFA 3Q28A 3LSLA 2UVJA 3MC2A 4ZEBA 1MDP1 4RK9A 5CI5A 5CMBA 4OFJA 1JVXA 1B5HA 1QW0A 4WEDA 4RPOA 1B51A 3R26A 2ZYNA 5JTYB 3V83A 1D9YA 4G68B 2OZZA 1UTBA 1Y3PA 5JTYA 1BTJA 2FA7A 5ICTA 4G68A 1NH8A 3EF7A 1ELJA 2O68A 4OMBA 3K1MA 5I2NB 5I57B 2RCBA 3KN8A 5L9OA 1QKBA 2H98A 4R2FA 3UGWA 3LC8A 3ZSFA 3RY3A 4DDDA 1SI1A 2H99A 1IXHA 5I2NA 3JV9A 5I57A 2QJEA 2V3QA 3VE1B 3IORA 5H8QA 4IGRA 2UXAA 4ZZAA 3G3IA 1B7HA 1ZLQA 4I1DA 4L17A 2GHAA 4GL8A 3TTMA 2X7QA 2VD3A 2RC7A 4QF9A 2R6GE 1LLSA 1R9LA 1DPPA 1N7XA 1FTOA 3JYRA 1B3HA 3VLVA 4YU0A 3PPOA 3PD8A 1NMUA 2QS1A 3H6WA 1SDXA 3PUZE 2FYIA 3PMXA 1Y1MA 2B3BA 2XD3A 1EU8A 1B5JA 1JEUA 3T22A 3FJGA 5CBRA 3DM0A 4ZEFA 1MS7A 4OETA 3KJTA 2REGA 3OO6A 1IQ7A 4ESWA 3GBBA 5HBCA 3D4GA 3O29A 1Y9UA 4DCXA 4HCWA 1UIUA 3IB2A 1B0HA 3T9HB 3HN0A 3VLUA 3RLFE 1T0KA 3FJ7A 1N0TA 5CMCA 1S50A 1B5IA 5K2YA 4QRZA 2Z8DA 4RNSA 3KGCA 2NWJA 1FTKA 2DWAA 3C34A 3E4RA 3PV0E 3UP9A 1MXYA 1O7TA 3IOVA 4IO5A 1D9VA 1B3LA 3JZJA 4PFYA 4F18A 2LAOA 3RTWB 1OMPA 4NWDA 4Q0CA 4RJZA 4ZECA 1XVXA 4R2BA 3CSBA 2ANJA 3WAFA 3UN6A 4JDFA 5ITOA 1YPNA 1Y3QA 4PFTA 4H67A 2Q89A 4F19A 4IY5A 4F1VA 4DE8A 1M5CA 1PB9A 1H43A 2XXUA 3CI8A 1DSNA 4NF5B 3AXFA 4F2OA 1MY0A 4Z0IA 4MBPA 3MVYA 4DZ1A 4JWXA 4XKRA 3CFLA 1JW5A 3T9UA 3EHTA 1Y1ZA 4O3BA 4WKMA 3SKPA 5AA2B 3FVGA 3HHGA 5CRYA 3TTLA 4TLLB 4POWA 1IUDA 1B05A 3HSTA 3C31A 5AA2A 5I2KB 5I84A 3FASA 3PPNA 3FXRA 2DQVA 1Z7NE 1FQFA 2O51A 4XKNA 5I2KA 1LAHE 3BBRA 4OXVA 2Y7RA 4R6YA 3UORA 2VGQA 3I6VA 4FEDA 4THIA 4XKPA 5IKBA 4EQ9A 2I4CA 2ONRA 4EQBA 3MP6A 3TQLA 5HPQA 4MLVA 1ZTYA 2HAUA 2Z23A 3W15C 1PB8A 2OCUA 1B1HA 4G8NA 4X1DA 3CIJA 4R6HA 4LA9A 3FGSA 1B0LA 1A40A 1US4A 2F7CA 3V8XB 2X26A 2XXXA 4KCDA 4R9FA 4G8MA 1XT8A 2OK2A 1A99A 1CE2A 2Q88A 3B6WA 5HM4B 2G93A 3N26A 1R1NA 5KDTA 1P99A 1LFIA 1URGA 2YPNA 3CSGA 1JETA 1Q1KA 2I0BA 4PQJA 2ALUA 2ZYOA 2AYSA 3PGFA 4KHZE 3MW0A 3H06B 4YZZA 2WKYA 1LCFA 1P1UA 4BDMA 2QPQA 4U2RA 3C36A 1VE4A 2I49A 4NF4B 1MXZA 4R9GA 4NTLA 4ELPA 2IA4A 3QUFA 1I6BA 1JNFA 4NF4A 2Z8FA 3H3GA 3M8UA 3T9VA 1POY1 3FVOA 4NEDA 2VP1A 2QRYA 4YKKA 1OVBA 2F34A 2A5SA 1IXIA 1KWHA 3B6TA 3G3GA 1P1OA 4E0WA 3OXNA 3LSFB 1TFDA 3MQ9A 4GXAA 3TELA 5TPAB 4JSOA 1VSOA 3L6HA 3OEMA 3QAXA 4F3PA 4LUBA 4O3AA 3FVNA 2I6EA 5TPAA 4YAHX 4ELQA 4WXJA 3E9XA 2I3VA 5DT6A 5FTIA 1LB8A 2AL5A 4DLDA 2D21A 1DTZA 2QMXA 3I3VA 3ILUB 3Q27A 4QFPA 5L9MA 1LBBA 2X7PA 2E0SA 4R75A 2XX9A 4EXLA 2VHAA 4G4PA 3RTFB 2DS9A 3C9HA 3OSQA 5EHSA 1N84A 2XXIA 1NNTA 1II5A 1DPEA 3V5AA 3TZAA 4OYVA 3PUWE 3KFMA 1MY3A 2NXOA 4NWCA 4QFLA 4XKQA 1LFHA 1B3GA 3HHFA 1SBPA 1UTHB 3SERA 4KI0E 4GRKA 3EQ1A 3VVEA 3TQWA 4X1BA 4JB7A 2F7AA 1UTHA 4NE4A 2DWHA 2Y84A 4EXKA 3VDFA 2GFEA 3OOAA 3TAJA 3GZGA 1B4ZA 5H8HB 4H0WA 4F2QA 3FIRA 3C4MA 1B3FA 1BP5A 3Q26A 3Q29A 1ZU0A 5H8HA 2XD2A 4I62A 3TPAA 4F39A 2ZNUA 3QK6A 2QSXA 1B2HA 2H25A 4PFUA 3OMBA 4QFNA 1N3XA 1B7ZA 2QS3A 1A7LA 4U1ZA 3SEVA 3FATA 1O63A 2PT2A 2ZNSA 1BIYA 1HSEA 2OWTA 5AA4B 3CFZA 2XXRA 1TXFA 1RYXA 4GOTA 1JQFA 1SYHA 1A54A 3LSWA 1YTVA 3MJNA 5AA4A 3TEPA 2OLBA 3IAZA 4ISUA 4GF8A 5ISUA 3DP8A 5ICQA 3TTNA 4EF1A 1FQDA 2HQ0A 4IO4A 1OQGA 2RC9A 5H8SA 1NL5A 4R74A 2H5YA 4LZ5A 2Q2AA 2GHBA 4ESXA 4FEBA 1QJMA 4EDPA 2ABHA 2NVUB 2V3UA 3KOTA 3QUJA 1SQYA 2XXHA 1EZPA 1A8EA 1IIWA 3M3FA 1B3EA 1QKAA 4E0XA 3VVDA 2DWJA 1ZJLA 2OWSA 4NF8B 5KZTA 4PETA 2DE4A 2XXVA 3MZBA 1MQJA 3BFUA 4JWYA 1N04A 2RINA 4NF8A 4Q8RA 2UVHA 3OSRA 3IK6B 3K2DA 4KYDA 4F29A 3S9NC 2G29A 1MQGA 2THIA 4P11A 4F22A 1F9BA 1FTMA 2Z22A 1FCKA 2F78A 2HZLA 1SW1A 2F36A 1B6HA 4BDLA 3F11A 4NMYA 3RN8A 4RPNA 1SVXB 1LB9A 4FECA 4YICA 5LOMA 3TMGA 3S4UA 2UVGA 3OEKA 3O6HA 1A8FA 2P2AA 2HXWA 2DE3A 3G3HA 5M2VA 5K2XA 1TFAA 3TODA 4IO7A 3IJXB 3U72A 1SI0A 2ZYMA 5EHMA 4YMBA 5IAIA 2PMSA 1DTGA 3IO6A 4HCYA 4GQOA 4C1UA 2NOOA 2O84X 4DIGA 2Y7KA 4OZ9A 3KSXA 5TU0A 1Q35A 2IEEA 1PC3A 3QIMA 4PP0A 1HSJA 1SW5A 2XXTA 1OLCA 2XXQA 4NF5A 1GGGA 2H4IA 2O7IA 3UIFA 1ZMGA 5DVFA 1XC1A 2ZNTA 2DYXA 4GIZA 4F3SA 1P1WA 3S2VA 1PEBA 3IB1A 5JK4A 1MY2A 1FTLA 3KSJA 4GVOA 3OO7A 3MWBA 3KOSA 3OO9A 2XHDA 4AQ4A 1USYE 4LZ8A 1M5BA 4MLQA 4OESA 1EH3A 1VR5A 4N07A 3G3KA 4IB2A 4WEPA 1LAXA 4FIMA 4OFOA 5FHOA 3RT8A 4KQPA 3ZS6A 1OQHA 1MQHA 3C32A 3MZ9A 2P0SA 3PUYE 4OFLA 3KG2A 3KBRA 4Q30B 1OIBA 2DE2A 2RCAA 4PE5B 4U4SA 3QSLA 1UQWA 4BDRA 2ESNA 3IOTA 4DXUA 1VFDA 2RF1A 2YLNA 3TTRA 3VVFA 2DXRA 1N76A 2I48A 3DELB 4GFRA 3W9VA 5AA1A 3FXUA 2XXYA 3LUYA 2B3FA 1S9TA 4QFOA 1AMFA 2DVZA 2F35A 1MQDA 2PYYA 4QSEA 3TCHA 4ECFA 2Z8EA 5H8NB 4F3GA 1VFEA 4YMAA 1Z7ME 3PPQA 3MVXA 4OEVA 3USDA 1URSA 4H8IA 3VLWA 5H8NA 3N6UA 2REJA 1UIVA 2AL4A 1SW4A 4KYEA 2VOZA 1Y4TA 4H5FA 1IXCA 4RY1A 2PBWA 1B40A 2O1LA 3U1OA 4NF6B 3SETA 2UYFA 1B4HA 4RK2A 3MP8A 1GTKA 2RC8A 2DVCA 4NF6A 5CMMA 1MXUA 1LGBC 4YB7A 3K6UA 2DXYA 4KFQA 3HPIA 1NH7A 4FE8A 1JW1A 3O6IA 4P0GA 4H65A 4MFIA 1MDQA 3U94A 1R9QA 2ONKE 3U93A 4IO6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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