3C36A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with ammonium ions at 1.68 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A02
1LAXA 1US4A 3B6QA 1N3XA 2I3WA 3TELA 4IGRA 4BDNA 4IO3A 4G68A 1USYE 1FW0A 3U8QA 3HV1A 3H06B 1PB9A 4NF8A 1B51A 4F2OA 3MVXA 2FNCA 3C9HA 2XX7A 3IORA 2RF1A 1NMUA 3K1MA 3RT8A 2A5TA 4XTCQ 4OZ9A 2Q2CA 3E13X 3DELB 5FTHA 4F1UA 1WODA 5AA1A 2REGA 1B0LA 2VOZA 1URDA 1NNTA 4MLQA 4YZZA 1MXXA 3U92A 3K1PA 5B70A 1UIVA 2ONRA 1ANFA 2I6EA 4QFNA 1B4HA 1SW5A 4OFLA 3O6IA 4ELRA 3MBPA 3RLFE 4F3GA 1H44A 1LB9A 4QHQA 2YPNA 1MPCA 4R6YA 3JYRA 2Y7RA 1IXIA 4E0XA 2F6GA 4ZZAA 3VV5A 3R7XA 5L8DA 5DYHA 3MZBA 4F19A 1FQAA 5EYFA 4F3SA 1H76A 4U1OA 3B7DA 3OSQA 3T96B 3O29A 2DWAA 3G3GA 1Z7NE 1SD3A 4XKRA 3VVEA 4KD5A 4G8MA 5L9MA 3CFLA 3TUSA 2XXUA 2I0BA 1EZPA 1EH3A 4UA8A 4PP0A 3SKPA 5I59B 4ELQA 2ZNTA 4ND9A 2ZMBA 3IB1A 4NE4A 1USYH 3TEPA 4JXIA 3SDFA 4EF2A 4DXBA 4GD5A 3SEWA 1FQEA 3IR1A 4BLAA 3H03A 3FVGA 1LCFA 2LAOA 2V3TA 4PE5B 2F7CA 5I2KB 2DE2A 3K6UA 5AA2B 3S9EA 3PPNA 4FE8A 2QS4A 3C4MA 4N6PA 1ZTYA 3IX1A 2RINA 1UTHA 3KOTA 2H25A 3TQWA 3SEUA 3TTKA 4JWOA 5H8SA 2F7AA 5HM4B 3TPAA 2UXAA 4RK2A 2UVIA 4HW8A 2NWJA 1LLSA 4YMBA 4KFQA 2GFEA 3DP8A 1DTZA 2XXIA 3MVYA 2OZZA 3QIMA 3L6HA 3ODBA 4R2FA 1B40A 4YKJA 3T9UA 1SQYA 2OJTA 3N94A 1OVTA 5ELVA 3K02A 4YKPA 3RPWA 1OVBA 3G3KA 1LAGE 4GLIA 4JDFA 3H6WA 4ELOA 3K6WA 2ZNUA 4TOZA 1BTJA 1JNFA 2I4CA 2DS9A 3MAMA 4FORA 4PFYA 2DWIA 2FYIA 2H98A 3RQTA 3KN7A 5BWJA 2E1SA 4AB5A 2ONSA 4I8CA 2UYEA 5L9SA 4NTLA 2DOJA 3UA8A 1OLCA 4OEUA 1D9VA 4Q8RA 4LVQA 4F39A 3W9WA 3RY3A 4G8NA 1N04A 4LZ7A 2XD3A 1JW5A 1WDNA 1N0TA 4EQ7A 5KDTA 3SEVA 1MQJA 5ITPA 3DP4A 2P1SA 2QS1A 4H5FA 5AA2D 1MXWA 2Z8FA 2THIA 3C36A 3THIA 4GL8A 4ESWA 4EUOA 4FIMA 2CMOA 4QFKA 3OENA 2F36A 3PUVE 3E9XA 3FD3A 2HZLA 1HSJA 1ZU0A 2REJA 1O63A 3HN0A 3T93B 5F1QA 4KQPA 3CSBA 3EF7A 3FJMA 4GIZA 1D3KA 1B3GA 2X26A 4G77A 2Z22A 1QUKA 4H0WA 1DPEA 4X9TA 4N07A 1EZ9A 1LSTA 1O64A 3T66A 2G29A 1HSLA 2D3IA 1MRPA 1Y1ZA 4NEDA 4KCDA 5JTYB 3LC8A 3MWBA 5FHMA 1ZKBA 4KCCA 4HS7A 3MPKA 1MG1A 5CC2A 2HCAA 3EHTA 4PFWA 2F34A 3MPLA 4G68B 3QUFA 1FTKA 4XKPA 1VR5A 1BLFA 1OMPA 5I58A 1JETA 3TTNA 4OTEA 2AYSA 3K1NA 2A5SA 4BDRA 1TFAA 3K00A 5H8FA 1H45A 1PC3A 3JV9A 3SEXA 2QRYA 1XVYA 4FATA 4U4XA 3A3CA 4H1XA 1JW1A 4H67A 2ABHA 4ZEIA 2XXRA 5ICQA 3IB0A 3ZSFA 1FTMA 4I62A 3KFMA 2Z23A 3I5OA 3OO9A 4F1YA 3Q27A 5B7DA 3UK4A 5ISUA 4EQ9A 1SI0A 3MQ9A 2IEEA 2PX1A 1B2HA 4DE8A 3PMXA 3O97A 5LOMA 2QJEA 3T22A 4EQBA 3IB2A 4PETA 2NOOA 3FJ7A 2ZNSA 2G93A 2XXPA 5H8NA 1N3WA 2GHAA 2M8CA 3KG2A 1MM6A 1US5A 1ZBMA 4XIGQ 2DYXA 1ELJA 3FXRA 3D4GA 3TYHA 5H8HA 3C32A 1MXZA 3LSWA 3MVWA 5FHNA 3G7WA 1LAFE 1ATGA 2UYFA 4O3CA 3KJ7A 2O84X 3FATA 2XXHA 3JZJA 5CRYA 1B5IA 4U1ZA 1B5JA 2OCUA 3O28A 4ZEBA 3N26A 1II5A 3BFTA 3N6UA 5K2XA 4FEBA 1N84A 3OO8A 2F7BA 1XC1A 4GRKA 2O1LA 3PPPA 1IZ1A 1B0HA 5JK4A 1VFDA 1UTBB 3I3VA 3H3GA 2AL5A 4MH5A 3IOUA 1MY4A 2R9JA 4U23A 3U93A 4ZZEA 1PDAA 4NF4A 3T9VA 5I56B 1B3LA 4Z0IA 5DEXA 3MVZA 4YKKA 3EN3A 1UQWA 3VE1B 4G68C 5CMCA 4U22A 3U72A 4C0RA 1XHYA 2DP8A 5CM6A 2QS2A 5EHSA 2DWHA 4X1BA 4ZEDA 4K3FA 3G3IA 3R6UA 2RC8A 5TP9B 3OO6A 4GXAA 2Q8JA 3PPRA 4MF3A 5AA4A 3IOTA 2RC7A 1P1UA 3CFXA 2DSFA 3WAEA 1P1OA 4R9FA 5A5XA 5I2NA 1MY2A 5H8QA 4L17A 1B3FA 3GBAA 3M3FA 3PPOA 2O1MA 1M5BA 4OESA 2UVHA 1H43A 5ITOA 3M3LA 3PD9A 2I48A 4QSEA 4YU0A 1MPDA 1POTA 4LQ2A 4OVJA 1IIWA 3PPQA 3MP6A 3BBRA 1XT8A 3V8XB 3FIRA 3IOWA 1H3DA 4ELPA 4OENA 4IO7A 3GLBA 2XXTA 3FVOA 1VE4A 2HAVA 1URGA 3PGFA 1XOCA 1OIBA 1B58A 3TODA 1NL5A 4QF9A 4FAJA 3QAXA 1P1NA 5CI5A 5KDTB 3PV0E 4H6DA 4JSDA 3ONMA 2HZKA 3FXUA 2OK2A 5HPQA 1Y20A 2F8DA 3Q26A 3USDA 1LCTA 1MQGA 4AQ4A 4KYDA 1R6ZA 2XX8A 2GRVA 3SETA 1QUIA 2O7UA 1GTKA 3D4CA 1A99A 1CE2A 1Y4TA 3PUZE 1HSEA 4BDLA 5CMKA 3CI8A 3PD8A 3MP8A 2DE4A 4WEPA 2AL4A 5K2YA 4QRZA 1OLAA 4EXKA 3C35A 3S9LC 1ZJLA 3FASA 1MDP1 1MY0A 5I57B 3C33A 2DVCA 1LFHA 2OBGA 4OETA 1LB8A 3SERA 2Y7KA 1CB6A 5F7VA 1EU8A 2ONKE 1IITA 3R26A 3U94A 1M5CA 4GXSB 2PBWA 5DVJA 4H8JA 2UVJA 2DE3A 3SESA 1A8FA 3KBRA 2ANJA 5CMBA 3QYTA 2RC9A 2NUVA 3ILUB 3HCQA 3FGSA 4WKMA 3KSJA 1YTVA 1B05A 1IEJA 4Q30B 5M2VA 3H6TA 4QFPA 3PUXE 4RJZA 4IY6A 4POWA 1MY3A 1SYIA 1B9JA 1FQCA 4JWXA 2HEUA 4IB2A 2UVGA 4IO6A 3M3KA 1RKMA 4NMYA 4WEDA 1MXYA 4IO4A 3LBSA 1R9LA 4DXCA 5TU0A 1N7WA 4FJPA 2PT1A 3VLWA 3VLVA 2Q9TA 2O7IA 2XXVA 4LQ5A 1L5TA 2I3VA 2OWTA 1Y3PA 1NH8A 3G3HA 3QUJA 3S9NC 3HHGA 2QS3A 2OLBA 2H5YA 4Q0CA 3K6XA 4BDMA 3PUYE 1EZOA 3PU5A 3TCHA 4C1TA 3LR1A 2WKYA 3TZAA 2PYYA 3CRBA 3HPIA 3TFLA 4YMAA 1NNFA 4R75A 4GWOA 5I59A 4FEDA 2OWSA 5CMMA 4KPTA 3DP6A 1PB7A 2XHDA 4RY1A 1JW4A 4OMBA 5DTBA 5TPAB 2VHAA 4R6KA 2Q88A 1GGGA 1MPBA 5L9OA 1NNKA 3KN3A 1AIVA 4RK9A 1NKXA 1T0KA 5AA2A 1DPPA 2V25A 4P0GA 4NF6B 4GFRA 1B5HA 3AXFA 3MC2A 3VVFA 5ICTA 1JQFA 3CG1A 4E0WA 3IOVA 3F11A 4MLVA 2HFBA 4LA9A 1O7TA 1BKAA 3FVKA 5DVIA 3PMWA 3UP9A 3IJOB 4NF8B 3GBBA 2XD2A 4QSDA 3VXBA 1B52A 4KYSA 1QKBA 2A5TB 3MJNA 4I1DA 2H4IA 5AA4B 1JEVA 4M1VA 2DWJA 1AH5A 3TTLA 4DLDA 3N5LA 5I2NB 1A55A 3EHSA 1UIUA 3T9XB 1Q1KA 3S4UA 4FECA 1B4ZA 4U4SA 1LBBA 4DDDA 1M5DA 1RYOA 3P7IA 3M8UA 1GVCA 2F5XA 1DMBA 4JSOA 4ONYA 3CR9A 2Q89A 3KEIA 1B46A 4ZEFA 2FA7A 4DZ1A 2VGQA 4LONB 4ZE9A 5CBSA 3LSXA 4F29A 1MY1A 2B3FA 1D4NA 4BDQA 4DXUA 1N7XA 5KZTA 4HCYA 3OD7A 3K01A 4OERA 1SBPA 1D9YA 2I49A 1LGBC 3S2VA 2B3BA 3EPEA 2NXOA 3ECRA 4ZECA 3RUMA 4OWDA 1TWYA 4EDPA 2E0SA 3QXMA 2DXYA 1B1XA 4F3BA 2F35A 2QMXA 4OXVA 5BUUA 2VD3A 3ILTB 1QKAA 1XVXA 3GZGA 4F1VA 1AL3A 3B6WA 2QMWA 2X7PA 2V3UA 3E4RA 4N13A 1MQHA 4MFIA 1SW4A 4DCXA 1VSOA 3OELA 3V5AA 4NWCA 1ZIUA 5JTYA 3H4ZA 1I69A 3BFUA 3KSXA 4PFUA 1UTHB 3G3FA 2ZYKA 3O66A 4P0IA 1OQGA 1FQFA 5EHMA 4XKNA 1BIYA 4ZS9A 2Z8DA 3DM0A 5IKBA 3K2DA 3FV1A 1QUJA 4LUBA 4PQJA 1AMFA 1MH4A 4DCYA 1B7UA 1JVYA 4IO5A 4F31B 1R9QA 1XS5A 1B1HA 1MDQA 3K0VA 3ZKLA 5KCJA 2KLFA 3O6HA 4KR5A 4RYAA 2QSXA 3DLNA 4WXJA 1F9BA 1ZLQA 4GF8A 3IO4A 3EQ1A 4PFTA 3KGCA 1FTJA 2O68A 1Y1MA 2W7YA 4KYEA 3TCGA 3VFJA 3CVGA 1P1QA 1I6BA 2RKMA 3IK6B 2RCBA 3OOAA 4R74A 4ESXA 3MP1A 3WAFA 2D21A 3N6TA 1N76A 4TQUQ 1JVXA 4G2ZA 4OFOA 1PBPA 3VLUA 2XX9A 2ZYOA 2XXXA 2ZYMA 1GR2A 4M4GA 1VFEA 2AIXA 4NF5A 2P0SA 4BDOA 1S7YA 5AA3A 1I6QA 1SW2A 4ISUA 3W15C 1SI1A 2GH9A 2V93A 3B6TA 1MM7A 4IO2A 4R9GA 1SVXB 3OO7A 1J1NA 4TLLB 4G8HA 4U2RA 3OEMA 2NVUB 1LFIA 3UIFA 4QFOA 3IJXB 2F78A 1RYXA 2H99A 3C31A 3TAJA 1FCKA 4OEVA 3A3UA 2BJJX 3H6UA 4EXLA 4YAHX 1NNPA 1B3EA 1UTBA 3HHFA 4LZ5A 1FQDA 3RT6B 1A54A 3EHUA 3PUWE 4RXLA 2PMSA 4Q5TA 1DOTA 1QVSA 4GQOA 2ZXTA 3OMBA 2R6GE 5I56A 4KHZE 2B65A 3V83A 1YAEA 3RN8A 1DTGA 3OEKA 1JEUA 3FZVA 4TLMB 3MZ1A 1PBQA 4GOTA 4X1DA 4R2BA 1MQIA 3FXQA 4GVOA 2DVZA 2CZLA 3ZS6A 1YCJA 1QW0A 1TFDA 4AB6A 4LATA 5TP9A 1P99A 5I58B 1MXVA 5FHOA 3UN6A 2Y84A 2I0CA 3Q25A 1GV8A 1A7LA 1OQHA 5H8FB 4YB6A 4Z7EA 2O51A 4YKIA 3VDFA 1Y4CA 1P1WA 4H65A 1FTLA 3TMGA 3MZ9A 4YB5A 1QULA 2F6PA 4OYVA 5FTIA 4F18A 4F3PA 1Y3QA 1IXCA 1URSA 1Q35A 5IAIA 4OQOA 4H5GA 4YB7A 3RNNA 4ECFA 4EF1A 1TXFA 2Z8EA 1MS7A 2XXWA 2XXQA 1IXGA 1IXHA 2ALUA 3H6VA 3IAZA 3Q29A 4R6HA 3KJTA 2QL3A 3K4UA 1LFGA 1S9TA 4I9DA 2I58A 4RPNA 1R1NA 1SDXA 1LBCA 4JWYA 3V89B 4OHNA 4ZDMA 1IQ7A 4HCWA 5H8NB 2GHBA 3TQLA 3TTMA 3RTFB 2IA4A 3K6VA 1NFTA 4LP2B 4NWDA 3QK6A 3FJGA 3LSLA 3TKDA 5H8HB 1YPNA 4QFLA 4GL0A 1PEBA 5J1DA 1KWHA 3LSFB 1AOVA 4ZEKA 1PB8A 1B3HA 3TTRA 5HBCA 3HSTA 2X7QA 4IGTA 3UORA 3MW0A 3CSGA 3HO7A 1SYHA 4OFJA 3I6VA 3CG3A 5I2KA 3Q28A 2YJPA 3L6GA 5I57A 2YLNA 3IL1B 3BKIB 1QJMA 1DSNA 1MH3A 1MQDA 2XXYA 3KOSA 2H9BA 1TT1A 4O3BA 4NF4B 4IY5A 5DEXB 4YICA 3FV2A 3UGWA 2PT2A 2Y7IA 3LUYA 3T9HB 3VVDA 3OSRA 1WVJA 1NH7A 3ZKKA 1SW1A 3O2AA 2HQ0A 1B6HA 1BP5A 2V84A 2QPQA 3RTWB 1FTOA 2Q2AA 2VP1A 1LAHE 2Y7PA 4HTGA 4X48A 3TCFA 3IO6A 5A5XB 1B7ZA 2DXRA 5H8QB 4MBPA 4KI0E 4C1UA 1B32A 2HAUA 5KCJB 1ZMGA 2O69A 4XKQA 4H8IA 4POXA 2D5WA 1MXUA 4THIA 5AE4A 3MUQA 3O9PA 2P2AA 2Y7WA 3CIJA 3FVNA 2I4BA 1S50A 3FUZA 4R73A 1M5EA 4F22A 3C34A 4RA1A 5DVFA 1B7HA 3CFZA 2ESNA 3H7MA 3S9MC 4JB7A 2O6AA 2PVUA 1Y9UA 4RNSA 4DIGA 4O3AA 3VXCA 4QSCA 2F97A 3O6GA 4NF5B 4F2QA 4ZE8A 3U1OA 4P11A 2DQVA 1A8EA 2V3QA 4G4PA 2ZYNA 4U21A 3OXNA 3E3KA 1Y3NA 1M5FA 3TDJA 4JBZA 3SEYA 3PMVA 2HXWA 5TPAA 1POY1 3GXAA 5CBRA 4UACA 1Z7ME 3W9VA 5JEIA 1I6AA 3KN8A 1A40A 4RPOA 5I84A 4XXUA 1IUDA 4LZ8A 2RCAA 5DT6A 3A09A 4NF6A 3QSLA 2VD2A 4R72A 2R71A 3G3JA 1FQBA 3KZGA 3RGYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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