3C36A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with ammonium ions at 1.68 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A02
3PD9A 4GFRA 1PBQA 1QVSA 3TODA 3V8XB 5H8NA 4EUOA 2XXTA 2CMOA 3TCHA 1MY0A 1JW5A 2G29A 1Y9UA 4YICA 4MLQA 4LQ2A 4ND9A 3LSXA 3UN6A 3PUYE 1M5CA 2HAVA 3OO8A 2XXUA 4G68C 4IY5A 1B32A 3B6WA 2ANJA 2FYIA 1US5A 2H4IA 2ZNSA 1Y20A 2FNCA 1H43A 5KZTA 3TFLA 1M5DA 1NFTA 1P1WA 3FVNA 3IB0A 1UTHB 3PMXA 5AA2D 4ONYA 4GF8A 1M5FA 4LA9A 4RNSA 4YKIA 5AA1A 2I0BA 5IKBA 4C1UA 2F6PA 1Y4CA 1MQDA 2NXOA 4XKNA 1MQGA 5FTHA 3RGYA 5IAIA 2O6AA 3MJNA 4IY6A 1IQ7A 3S4UA 3K6WA 4ZEIA 3MBPA 2GH9A 4NF5A 4QFOA 5H8QA 1MG1A 3F11A 1UTBB 3C35A 4IO6A 4OVJA 3QXMA 4F31B 4OTEA 1AH5A 2X7QA 3H3GA 2KLFA 2UVGA 3AXFA 4H65A 1MY1A 4RXLA 3S9EA 2PT2A 4ZE9A 1A99A 2Z8EA 5CC2A 4BLAA 2D5WA 3RT6B 1DSNA 1ELJA 3K02A 1USYH 1B4ZA 2I49A 4ELQA 1JNFA 3ILTB 1SD3A 2RC9A 1H76A 2X26A 3G7WA 4ZDMA 1LFGA 4I62A 5I2KA 1DTZA 3N6UA 2Y7PA 4O3AA 5HBCA 3D4GA 4ZZAA 5K2YA 1B51A 1N7WA 2XXQA 1TFDA 2DWJA 2O68A 2Y7IA 3OXNA 5CM6A 3N26A 3K01A 4FEBA 3G3HA 3RTFB 4MBPA 3FV1A 4U21A 2A5SA 1BLFA 5CMCA 1Q35A 4X48A 2I3WA 5F1QA 1EH3A 1A54A 4RA1A 1URSA 1URGA 4NF4A 2HEUA 3MQ9A 2HAUA 1DPEA 3MZ9A 4R73A 1FQCA 2YPNA 2V25A 3OSQA 2O84X 1XVXA 2Y7RA 3TCFA 3DP4A 3O6GA 3CI8A 4C0RA 3O6HA 3OD7A 2QS3A 4QSEA 2QMXA 3W9WA 3FD3A 2PYYA 4RPNA 1MM6A 1PBPA 2REJA 4NF6A 1LAHE 1B0LA 1LFHA 4HTGA 3KEIA 3CFZA 4FECA 1QJMA 1MXXA 1XHYA 4JB7A 5JK4A 4DXUA 4PP0A 3QUFA 2ABHA 3G3IA 2GRVA 3MVYA 4FEDA 1UTHA 1A40A 4F1YA 3QK6A 3QUJA 3B6TA 3BKIB 3IB2A 3Q25A 4LUBA 1FQFA 5TPAA 2UVIA 2Y7WA 3O97A 4R9GA 1IXHA 2FA7A 1OVBA 3QAXA 3SETA 2H9BA 2ZNUA 1LBCA 4RYAA 1QW0A 2BJJX 1FQBA 1ZU0A 2NOOA 3EHSA 3O28A 4IB2A 3SKPA 2Q9TA 1BIYA 1R1NA 4LATA 4C1TA 1NNTA 1UTBA 3VLWA 5H8NB 1SI0A 1XOCA 2P2AA 3CFXA 2I3VA 5I57B 4BDOA 2GHAA 3K00A 5JTYA 1PB7A 4H5FA 5EHSA 1JEVA 2DWAA 3O2AA 2Q89A 3T93B 4G8HA 3IO6A 2ZNTA 4G8MA 2RC8A 1MRPA 4KFQA 1H44A 2XX8A 1D9YA 2DE3A 2Q2AA 2PX1A 2PBWA 1O63A 5I56B 2Z23A 3Q28A 3K6XA 3B7DA 1Z7NE 3MZBA 4KD5A 3PUVE 2H25A 4XKRA 1SW4A 2VP1A 4G2ZA 2OLBA 4DXCA 4F1UA 2Q88A 4OFJA 4PE5B 4OXVA 5I2NB 4BDRA 3L6GA 1IZ1A 4YZZA 3PGFA 4WEDA 1A55A 3N94A 3PMVA 4OWDA 4KQPA 2XX7A 1B58A 3JZJA 4KR5A 1GVCA 2DQVA 1NKXA 1NH8A 2QS1A 1UIVA 2VHAA 3G3GA 1NNPA 4I9DA 3HO7A 3MP6A 3PV0E 4FE8A 2H98A 3RPWA 3G3JA 5H8FB 2I4BA 1QUKA 4OYVA 3TTNA 3W9VA 2O7UA 4FAJA 3BFUA 1DTGA 3A3UA 4GLIA 1UIUA 2XXYA 3T9VA 1OQGA 4JSOA 3K1PA 1FW0A 1O7TA 1SBPA 1B52A 2QS4A 2DE4A 4NWCA 1I6AA 4KYDA 1YAEA 3LSLA 3TCGA 2F34A 3HSTA 1N3WA 2D21A 5I2KB 3ZS6A 4F22A 1JVXA 4F19A 5BUUA 4GQOA 5AA4A 1YCJA 2I4CA 5FHMA 1BKAA 5A5XB 4G68A 2UYEA 4OFOA 4NE4A 3RY3A 3PMWA 4NMYA 1LBBA 4IO3A 4WKMA 3QSLA 4POXA 3T22A 3UA8A 4KHZE 1QULA 1N0TA 3LSWA 1DOTA 2AL5A 1O64A 3SERA 1DMBA 2PVUA 3CRBA 1CE2A 4OETA 3RQTA 4M4GA 4U23A 3C34A 3A3CA 3VDFA 3PPPA 3EQ1A 4PFWA 1LCTA 2ZYNA 1H3DA 2F8DA 4ZS9A 3IO4A 1WDNA 3C32A 4EF1A 3P7IA 4ZZEA 2QL3A 2WKYA 4Q30B 2DVCA 5I57A 4JSDA 1FCKA 4R6HA 3OO6A 4NF6B 4PFYA 2DXRA 1QUIA 1LAXA 1N7XA 4AQ4A 5CBSA 4ESXA 4LZ7A 2V3TA 1MXYA 3IR1A 3UIFA 3OOAA 4XTCQ 5I56A 3RT8A 4JWYA 3UK4A 2OJTA 3GLBA 1EU8A 3H6UA 2A5TB 3TQWA 5M2VA 4MF3A 5EHMA 3VE1B 1XC1A 5TPAB 5HM4B 2HZKA 2R6GE 2GHBA 5EYFA 3K6UA 1AIVA 4XIGQ 3HPIA 1I6BA 2REGA 4RJZA 5I2NA 3H4ZA 4R9FA 3R26A 4F2QA 3CR9A 4Q0CA 1P1NA 4LZ8A 2HQ0A 2DYXA 2ONKE 3FVGA 5JEIA 1ZIUA 5AA2A 4YKPA 3JV9A 1B3FA 3OEMA 3TQLA 3KBRA 4OMBA 3MP1A 4QF9A 4OEUA 1TFAA 4F1VA 1NNFA 4YMBA 4DCYA 1PC3A 3HCQA 1SI1A 3M3LA 3I6VA 2THIA 3H6WA 5KCJB 3K0VA 1JEUA 5JTYB 5H8FA 1USYE 5DTBA 3FV2A 2P1SA 3IL1B 1MY3A 5CBRA 5L8DA 1B5IA 1JW1A 4EQBA 2OCUA 4POWA 1FQAA 1VE4A 3T9UA 4R2BA 2ONSA 4HS7A 4OZ9A 4GL0A 4Q5TA 1MXWA 4YKKA 4GXAA 4MLVA 2PT1A 1WODA 3HN0A 3WAEA 3BFTA 5A5XA 1PEBA 4E0WA 1ZBMA 2O1LA 1FQDA 2R71A 3CFLA 3H6VA 2HZLA 3VXBA 4H8JA 3UGWA 5J1DA 3KFMA 4ECFA 3S9LC 2AIXA 1LLSA 2R9JA 2NWJA 4QFPA 5ISUA 3GBAA 2DE2A 1ZJLA 5I84A 4QFKA 4LZ5A 4RK2A 5H8SA 3IOTA 3OO9A 5DYHA 1PB9A 3E3KA 1S7YA 2OK2A 2YLNA 1FTOA 1F9BA 3MVZA 3U92A 4RK9A 3VVFA 3RUMA 3OEKA 1RYOA 3JYRA 3L6HA 1WVJA 1YTVA 3QYTA 1P99A 2Y7KA 5FTIA 1PDAA 4EXKA 1A8EA 1I6QA 3KOTA 2QMWA 4U2RA 1MXZA 3DLNA 3G3KA 5AA4B 4F3PA 2B3FA 2H99A 2A5TA 4G68B 3KSJA 1M5BA 3ONMA 4EF2A 5ITPA 2RF1A 1MPDA 4N13A 1MS7A 3EN3A 4X1DA 2V84A 4OFLA 5TU0A 1B3GA 3SEVA 2XD3A 2YJPA 2F5XA 3S9NC 3V83A 4IO4A 5HPQA 3OELA 3VVDA 3PD8A 2NVUB 4I1DA 1TXFA 5ICQA 4ESWA 4TQUQ 1N76A 3OO7A 3IORA 4QSCA 4Z7EA 1URDA 4BDNA 3TYHA 1SQYA 3U94A 4XXUA 4R75A 1MH4A 3CG1A 5KCJA 4WEPA 3U72A 1N04A 3LC8A 3IAZA 2DVZA 2ZYKA 4KYEA 4H8IA 3KG2A 1B4HA 2ZYMA 3PUXE 3RLFE 3N6TA 3IOVA 5L9OA 3KJTA 5L9SA 4R2FA 2E0SA 3MPKA 4O3BA 1XVYA 5CMKA 5FHNA 4DDDA 4GOTA 2B65A 4TLMB 3OMBA 4ZEFA 4U1ZA 3R6UA 3IK6B 3MPLA 4IO2A 1B6HA 4K3FA 4I8CA 3T96B 1MDP1 3IX1A 1R9QA 1DPPA 4UA8A 1B46A 1GV8A 3U8QA 3Q26A 3KN3A 2XX9A 1MDQA 1B7HA 1FTLA 3D4CA 5AA2B 3K2DA 3TELA 3ILUB 2RC7A 3CIJA 4UACA 4JBZA 4E0XA 3EPEA 4BDMA 4H5GA 1HSJA 1MY2A 3BBRA 3VLVA 5LOMA 2F78A 3K6VA 4U22A 1CB6A 4YB5A 3MP8A 1LB8A 2Q8JA 3A09A 5DVFA 2Q2CA 1IXGA 1BP5A 5CRYA 4QFLA 1OLAA 1NNKA 1D4NA 2H5YA 1I69A 3THIA 4F18A 1OMPA 5DEXA 1TT1A 1SDXA 4THIA 3LUYA 4OERA 2AL4A 1MM7A 4ZEBA 3PPOA 2V3UA 5I58A 2VOZA 4MH5A 2I6EA 3FXQA 4KCDA 3I3VA 1POY1 1JW4A 3FASA 5DT6A 1N3XA 4GVOA 1N84A 5FHOA 1ZMGA 1LGBC 3FVKA 2NUVA 2RINA 4GIZA 2LAOA 3IB1A 1B3EA 3VLUA 3V5AA 2UYFA 3EHUA 1LFIA 2F6GA 1SW5A 1P1UA 4DZ1A 2V93A 4KPTA 2X7PA 3CSGA 3TTMA 2D3IA 4ZEDA 2ZXTA 1QKBA 3TUSA 3TMGA 4EXLA 4NF8B 2ALUA 3E4RA 3TTLA 2UXAA 1VFEA 3M3KA 3FIRA 5B70A 1B0HA 5F7VA 2GFEA 3ZKKA 1Y3QA 4OESA 2ESNA 3HHGA 5AA3A 1IIWA 1B40A 4NWDA 5AE4A 4P11A 3TDJA 1XT8A 3C31A 1QKAA 3FJGA 4PFUA 4YAHX 3USDA 1D3KA 4DE8A 2VD2A 1US4A 5ITOA 3GZGA 5CI5A 2F7AA 5DVJA 3LBSA 4G8NA 3OENA 3MVXA 3PPNA 4ISUA 1FQEA 1OQHA 4X9TA 3K1MA 3EF7A 1B1HA 3RTWB 1JQFA 1OVTA 3LSFB 1FTKA 3C4MA 3GBBA 4EQ7A 3HHFA 4FJPA 3C36A 4NEDA 2UVJA 5H8HA 2IEEA 2DWHA 3DP8A 3KGCA 4JWOA 5CMBA 3FJ7A 2HXWA 3M3FA 3KJ7A 4PQJA 4R6YA 4RPOA 3GXAA 1EZ9A 3MUQA 2I0CA 2RCAA 4ZEKA 3MWBA 1JETA 1MQHA 1ZLQA 1IUDA 2QSXA 4LQ5A 4IGTA 5ICTA 1IEJA 3VFJA 1LAGE 4RY1A 1VFDA 1SYIA 3VVEA 1IITA 1MQJA 4DIGA 2OWTA 4F2OA 3K4UA 1B3LA 1B1XA 1FTMA 2DXYA 2QRYA 3O9PA 3E9XA 4EDPA 3O29A 4TLLB 2OBGA 1GGGA 1LCFA 2XD2A 3SEXA 1XS5A 4FATA 4HW8A 2B3BA 5K2XA 3FVOA 4Z0IA 5B7DA 1MQIA 2F97A 1FTJA 3FUZA 4R74A 2O1MA 2XXIA 2QJEA 2CZLA 1MH3A 4QRZA 2XXWA 1TWYA 1R9LA 3T66A 4YMAA 3EHTA 4ELRA 2O51A 2OZZA 2V3QA 4XKPA 3MW0A 5TP9B 1POTA 4ZE8A 4P0IA 3R7XA 3QIMA 3KOSA 3ECRA 4LVQA 1II5A 3S9MC 3FATA 4NF8A 4ELPA 4LONB 2VGQA 2AYSA 3C33A 4IO7A 1VSOA 2ZMBA 3N5LA 1Y1MA 2O69A 3C9HA 1MXUA 3TZAA 4BDLA 5DVIA 2DP8A 5I59A 2XXHA 4FORA 3U1OA 1J1NA 1B7ZA 1EZPA 4R6KA 4G4PA 1B2HA 4EQ9A 5DEXB 3IOWA 1B9JA 4TOZA 4G77A 4H1XA 3V89B 1Z7ME 4PETA 4OENA 4DXBA 1RKMA 4QSDA 4L17A 3SEWA 5I58B 2F36A 2DOJA 3S2VA 4KCCA 2O7IA 4KI0E 3IJOB 1OLCA 3KSXA 4YB6A 5CMMA 4KYSA 3DELB 3SEUA 1MY4A 1KWHA 3K1NA 2XHDA 2M8CA 4N6PA 4F3SA 4H67A 3TPAA 3ZKLA 4F39A 4HCYA 3HV1A 1AL3A 3FGSA 1B7UA 4U1OA 5KDTB 3WAFA 2F7BA 2QPQA 1SYHA 3SDFA 3UORA 1OIBA 1SVXB 4IGRA 1GTKA 1YPNA 1L5TA 3H03A 2F35A 4JDFA 2ONRA 2XXXA 1LAFE 5BWJA 5ELVA 3LR1A 4AB5A 3ODBA 3U93A 4NTLA 1ZKBA 3KN8A 3TTRA 3TKDA 4QHQA 4H0WA 2P0SA 4F3GA 1BTJA 1M5EA 3PUZE 2VD3A 3RNNA 4ZECA 3T9XB 1HSLA 3MVWA 1Y3PA 1JVYA 2Z8FA 1AOVA 1AMFA 4O3CA 1NH7A 3W15C 1IXCA 2XXRA 1B5JA 3CSBA 3CG3A 2PMSA 3PUWE 4GRKA 2Z22A 1QUJA 2HCAA 4HCWA 4OHNA 1SW2A 4H6DA 4PFTA 4F3BA 3FXUA 1B3HA 3H6TA 1MXVA 3PPQA 2IA4A 5H8HB 3I5OA 4YKJA 1T0KA 4JXIA 4WXJA 2ZYOA 3TAJA 2XXPA 1Y3NA 4DCXA 2I58A 4R72A 2XXVA 5TP9A 3O6IA 1GR2A 4LP2B 3FJMA 2DWIA 2HFBA 4BDQA 5L9MA 4XKQA 1RYXA 1VR5A 3TEPA 1Y4TA 3FXRA 3VV5A 1H45A 2RKMA 3FZVA 1A8FA 4NF5B 3SEYA 3SESA 5H8QB 1IXIA 3MC2A 2W7YA 2OWSA 1Q1KA 2DSFA 1S50A 4N07A 1R6ZA 3H06B 1P1QA 2DS9A 4P0GA 4GWOA 3PPRA 4U4SA 4Q8RA 3RN8A 1S9TA 1Y1ZA 1D9VA 4U4XA 3B6QA 1NMUA 4GXSB 3DP6A 3UP9A 2G93A 4GL8A 3TTKA 3MZ1A 1ANFA 1LSTA 3ZSFA 3KN7A 3IOUA 3OSRA 3O66A 2Z8DA 2F7CA 1B05A 4QFNA 4YU0A 4ELOA 3DM0A 1HSEA 1NL5A 1MPBA 4FIMA 1P1OA 4DLDA 2QS2A 3VXCA 1B5HA 3CVGA 3E13X 3IJXB 3T9HB 4YB7A 4OQOA 3G3FA 4OEVA 2Y84A 5KDTA 1LB9A 3KZGA 4X1BA 2RCBA 4JWXA 4F29A 1EZOA 3Q29A 1A7LA 4M1VA 3MAMA 1SW1A 3M8UA 4AB6A 2E1SA 3H7MA 5I59B 4NF4B 1PB8A 1UQWA 1ATGA 1MPCA 3Q27A 2I48A 1ZTYA 4MFIA 4GD5A 4IO5A 2UVHA 3PU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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