3C36A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with ammonium ions at 1.68 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
b'RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A02
4E0WA 1GVCA 3UORA 1IITA 1A8FA 3PD8A 1B3GA 4KI0E 3BFUA 3ILTB 3MBPA 2B3FA 3RGYA 1ZIUA 4ZEKA 1MQDA 1FTKA 3T96B 3K6XA 4ZEBA 4R73A 5L9OA 4XIGQ 4LONB 4WEDA 1R9LA 3DP8A 3FXQA 2H99A 4DE8A 2KLFA 3CFZA 4ONYA 1Z7ME 1XHYA 4WEPA 5HBCA 4TLLB 2Y7KA 4FEBA 3LSWA 1JVXA 4JSOA 1B7ZA 5EYFA 3TELA 4GXSB 1IZ1A 5IKBA 2V93A 1XOCA 2UYFA 1IIWA 4NWCA 1MQGA 4ISUA 1MY3A 3B6TA 4R6HA 4QF9A 3FVNA 2XXUA 1B0HA 5EHSA 3MP8A 2FYIA 3KEIA 3PMWA 2HXWA 5AA3A 1JNFA 2O69A 3UK4A 1Y3PA 1YPNA 2UVHA 5I2KB 2Z8EA 4P0GA 5KCJA 1MRPA 1MDQA 1YTVA 2QRYA 2THIA 4OVJA 1B0LA 3OXNA 4YKPA 4WXJA 4F3SA 4U1OA 1JW5A 3T66A 4GRKA 4LZ8A 2XXIA 3M3KA 4PFUA 4AB5A 1CE2A 1IXHA 3R6UA 4PETA 3K2DA 2HCAA 2XXWA 4R75A 4M4GA 4G68B 3SEUA 4EF1A 2YPNA 1GV8A 2Y7PA 4KCDA 2D3IA 3QIMA 2O84X 5AA4A 4YMBA 5ICTA 3C34A 4Q30B 2FA7A 1TT1A 4H8IA 1LCFA 2ZNUA 5JTYB 5TP9B 2GHAA 3OO8A 4DDDA 3M3FA 4IO4A 4NF8A 1MXUA 3CSBA 1N84A 3N6TA 2PYYA 2P0SA 3TTKA 3VV5A 3UIFA 1NNPA 5CMCA 2VGQA 2ZMBA 5B70A 3M8UA 3P7IA 1FTJA 4EQ9A 3T9UA 5I57B 3VLWA 3RT8A 3RPWA 3SESA 4TOZA 2DVZA 1B1HA 1JEVA 2V84A 2Q89A 3IO6A 4UA8A 3IOVA 2O6AA 2XX7A 4YB5A 4P0IA 1RYOA 3MC2A 4BDMA 1M5FA 3S4UA 3PGFA 4TQUQ 4Q0CA 4G8MA 1AIVA 1OIBA 1AOVA 3S9EA 3CG1A 2AYSA 3VDFA 4DCXA 1NH7A 3U72A 5J1DA 2B3BA 2OBGA 1US5A 5DVJA 3HHGA 3QSLA 1OLAA 5CMKA 1D4NA 3V5AA 2O1MA 1H45A 2F7CA 3MWBA 1FQCA 2ZNSA 4QFLA 3PUZE 3WAFA 3MJNA 2OJTA 3ZS6A 3B6QA 3CSGA 4PFYA 2UXAA 4MF3A 1VE4A 3VXBA 1N76A 3N26A 3PU5A 2RC8A 3KN7A 3Q25A 2RINA 2Q9TA 1BP5A 4YKIA 3SETA 4RYAA 1SI0A 3CG3A 1B4HA 4EF2A 1I69A 4POXA 1GGGA 4LATA 3MVXA 4OHNA 3OSRA 2Q8JA 1FQEA 3PPOA 3U93A 3O6IA 1MS7A 4XKNA 5A5XB 4GIZA 1EH3A 4R9GA 3IO4A 3O29A 4U1ZA 1LFGA 1LBBA 4ELOA 5CMMA 1EZ9A 2D21A 4ZZEA 3K6VA 4XKQA 3VLVA 3C4MA 4QSDA 3KJTA 3JZJA 4KD5A 1SVXB 3I3VA 4QFNA 1MXYA 3LUYA 1DOTA 4NWDA 2GFEA 4KYEA 3N94A 4NF6A 1POY1 5FTIA 2PVUA 2P2AA 5L9MA 1B3FA 5I56B 3GZGA 4JSDA 2O7IA 3FVGA 3H6VA 3OO6A 4QHQA 3O28A 4ZZAA 3QXMA 2GH9A 1MY0A 3G3KA 1L5TA 5LOMA 2NXOA 4G2ZA 2CZLA 3IJOB 4JWYA 3CRBA 2G93A 1M5DA 5AA2A 2X7QA 2HZKA 3G3GA 5H8FA 4GF8A 3HSTA 3SEXA 5KZTA 2DE3A 3MVWA 4YKKA 3TEPA 4YAHX 3RQTA 4H65A 3T9HB 3A3UA 3O97A 2PX1A 4WKMA 3EHUA 2OCUA 4IY5A 2REJA 4F2QA 2F97A 3H6WA 1DMBA 1XS5A 2F35A 3BFTA 4ZEDA 2XXYA 3VXCA 3KN3A 3K1PA 1LAGE 1UTHB 1B51A 1LGBC 3TMGA 3S9LC 4KHZE 1QUIA 4FATA 3CR9A 2E0SA 4M1VA 5ELVA 5CMBA 4NF5B 3E13X 4IO5A 1Y3NA 4NMYA 4C0RA 2A5TB 4TLMB 2ZYKA 1B2HA 1O63A 1MDP1 3OEKA 4R2BA 4RY1A 3MW0A 3H7MA 3I6VA 4GD5A 1AMFA 4EQBA 1JETA 5TPAA 2I58A 4X9TA 5F1QA 2AIXA 3C36A 5I2KA 4O3BA 3IOWA 1PBQA 1TXFA 2XXTA 3FASA 4G77A 4F29A 3TCFA 1MPCA 3CVGA 3KSXA 4OFOA 2XX8A 5AA1A 3CFXA 1RKMA 2ALUA 3RN8A 4RXLA 4R74A 1OLCA 4EUOA 3T93B 2ESNA 4YICA 3VLUA 3HCQA 1FQBA 1M5BA 4GVOA 1NNTA 3K4UA 4LP2B 2UYEA 4G68A 4X48A 1Y20A 3EPEA 1XVYA 3THIA 2OZZA 5K2XA 2H98A 3K1MA 1Y1ZA 1US4A 3H4ZA 4C1TA 2O51A 1A7LA 3KOTA 1A8EA 3KN8A 4BDRA 3MZ1A 3S9NC 2XD2A 2QS2A 5CRYA 5JTYA 4BDOA 5TP9A 1LAXA 2DQVA 1DTZA 4X1BA 3IL1B 5H8HB 2PT1A 3TTMA 3K02A 4THIA 2O7UA 4H8JA 2B65A 4OXVA 3W9WA 1H3DA 2XXHA 4HCWA 3QAXA 1XC1A 4R6KA 1R1NA 3KGCA 1FTLA 4GFRA 3G3HA 3VVFA 2QMWA 4LVQA 5I57A 1M5CA 4ESXA 1HSEA 3FXUA 3ZKLA 3IOUA 5EHMA 5I58B 2VOZA 1BLFA 1MM7A 2D5WA 2XHDA 1IEJA 3EHTA 2V3UA 3TAJA 2ONRA 4U21A 2M8CA 2LAOA 4DXBA 3RNNA 2Y84A 1MPBA 4IY6A 1RYXA 2Y7IA 1URDA 4KYDA 1ELJA 4NF4B 2ONKE 2Q2AA 4F1UA 1ZKBA 4F3PA 1SQYA 3E3KA 5DEXB 1I6QA 4U23A 2RKMA 4HS7A 4DLDA 2V3QA 4QFKA 2Z8FA 3SKPA 2Q2CA 2ZNTA 1TFAA 4U22A 2QPQA 1B32A 4ESWA 2AL4A 4YZZA 5KDTB 3OEMA 5H8SA 1VR5A 1T0KA 1Y4CA 3IR1A 2PBWA 4H1XA 2QL3A 5DTBA 3OMBA 4JDFA 2DS9A 3PUYE 2WKYA 1SBPA 1MXVA 2H5YA 3IX1A 2OWTA 2Y7WA 2UVIA 2R9JA 4ZE8A 4LQ2A 2QS3A 2VP1A 4HTGA 4LZ5A 4PE5B 5BWJA 1ZMGA 3TODA 4OETA 3ODBA 3I5OA 1LB9A 3A09A 2HAUA 5I84A 4FE8A 2I3WA 5A5XA 1J1NA 1NNKA 3TDJA 4I8CA 4IB2A 1QKBA 4PQJA 3IB0A 3O6HA 2ZYNA 1VFDA 4R9FA 1IQ7A 4DXUA 2I6EA 3K01A 2ABHA 5F7VA 3DM0A 4GL0A 4U4SA 2IEEA 4RJZA 2QMXA 1S7YA 2RC7A 5H8NB 5I59B 3R7XA 3RLFE 4MLVA 5I56A 3TZAA 3G3FA 3OO7A 5DT6A 1UTBB 1FQDA 3R26A 1B9JA 1SYIA 3V89B 3QUJA 1MY4A 1LLSA 3ECRA 1NNFA 4Q8RA 1XVXA 4H0WA 3RUMA 3MPKA 1B3HA 4IO6A 2DWJA 2QSXA 1MH3A 3MAMA 3LR1A 3IORA 1B3EA 2Q88A 5AA2D 3H03A 1A40A 1MM6A 2YJPA 4AQ4A 1H43A 4OWDA 4EXKA 4NEDA 1MXZA 3QK6A 1MXXA 1B40A 3CI8A 4PFWA 1QUJA 2V25A 2F36A 2VD2A 1WVJA 1P1NA 3O9PA 5H8QB 1VSOA 2XX9A 5L9SA 4R2FA 1XT8A 4ZE9A 5L8DA 1EZOA 4IO7A 5B7DA 3ONMA 4G8NA 4I62A 2RF1A 3FJGA 4JB7A 4QSCA 2ZYOA 5CM6A 3BBRA 1TFDA 3K6UA 4DXCA 1LAFE 4R6YA 1UTHA 3WAEA 1JW1A 5FHNA 3M3LA 3IB1A 2G29A 3U94A 3RT6B 3W15C 1R9QA 2I0BA 2F7BA 2ZXTA 3N6UA 4OZ9A 3C31A 3TTRA 3Q28A 3T9XB 1N7WA 4ZEIA 2I4BA 2A5TA 4FIMA 3W9VA 4N6PA 4EDPA 3QUFA 4JBZA 1B5IA 5M2VA 2ONSA 3JV9A 4DIGA 1USYE 3HV1A 4U2RA 1B3LA 3TQWA 3IJXB 4XTCQ 4IGTA 2GHBA 5FHMA 3TQLA 1Y3QA 2F5XA 2R6GE 3BKIB 1QULA 3OENA 4I9DA 3TYHA 4U4XA 1MQJA 4X1DA 3MP1A 4KFQA 3S9MC 4RNSA 4H67A 3IK6B 3U92A 5TU0A 2FNCA 3FVOA 4G8HA 3VVEA 1MY1A 3FUZA 1EU8A 1LFIA 3O6GA 4DZ1A 1USYH 2HAVA 2I0CA 3ILUB 1LAHE 1F9BA 3FGSA 5JEIA 4ZEFA 1I6AA 2F34A 3V8XB 4NTLA 1B5HA 4JXIA 3KJ7A 3L6GA 1D3KA 2DXYA 1HSJA 4C1UA 4O3CA 3ZSFA 1P99A 1O7TA 2F78A 2F7AA 5H8HA 3D4CA 3OELA 1QKAA 1N7XA 1NKXA 3E4RA 4FORA 3L6HA 3K1NA 2HEUA 2E1SA 3H06B 5I2NB 4FEDA 2OK2A 1SW1A 2H9BA 1Q1KA 2P1SA 4OEUA 1PDAA 1MQHA 4Z0IA 3LC8A 3TCGA 3LSXA 2PT2A 1P1UA 4JWOA 3TKDA 1H76A 2DSFA 5K2YA 5I58A 3CIJA 4QFPA 3FVKA 3EQ1A 3AXFA 2ZYMA 3VE1B 4FECA 1B46A 5DVIA 3H3GA 3VVDA 2X7PA 1JW4A 2OLBA 4N07A 2F6PA 4OEVA 2UVJA 1IUDA 4IO3A 1Y4TA 3HHFA 4L17A 4YU0A 2A5SA 4RA1A 4NF4A 4XKRA 1IXIA 1A55A 4YB7A 3TUSA 4FAJA 5DEXA 2XXPA 2NVUB 3USDA 4MLQA 2XXXA 3KZGA 1S50A 3LSLA 3MVYA 4Z7EA 4MFIA 4F2OA 2Z22A 1LCTA 1B52A 3DELB 2DE2A 5KDTA 1IXGA 3DP6A 3C33A 1LB8A 3SEYA 2HQ0A 1OMPA 2DVCA 3U1OA 3G3IA 2RC9A 4OENA 1SD3A 1H44A 3PUWE 3FV2A 1NFTA 1MH4A 3PMVA 3UA8A 2IA4A 3FATA 3UP9A 1B7UA 3PPNA 4F18A 4DCYA 1NL5A 5BUUA 1SDXA 4GWOA 1DPEA 1QUKA 2H25A 4PFTA 3B6WA 3DLNA 5TPAB 1ZLQA 2RCBA 1JQFA 2DWAA 4RPOA 4ELRA 3OSQA 1B4ZA 3UGWA 4OESA 2NWJA 5FHOA 2AL5A 5FTHA 1Y9UA 3C9HA 1URSA 2DWHA 4OFLA 4O3AA 1D9VA 4F3GA 3DP4A 1PC3A 5H8NA 5I59A 5DYHA 2I4CA 3EHSA 1QJMA 3KG2A 1UTBA 3GXAA 5HM4B 4G68C 1BIYA 2W7YA 3SEWA 1LBCA 3FV1A 3O2AA 2DWIA 4F3BA 2Y7RA 3VFJA 4OTEA 1ZJLA 4EQ7A 2PMSA 1SW2A 4H5GA 1MQIA 4UACA 1AL3A 1B5JA 1P1WA 4KPTA 1LFHA 2QS4A 4NE4A 3B7DA 1O64A 4QSEA 1SI1A 3H6UA 4ECFA 4F19A 1UIUA 1URGA 3D4GA 5H8QA 1PB9A 4F1VA 3EN3A 3PPRA 4PP0A 2XXRA 3OD7A 3G7WA 1IXCA 1FQFA 5CBRA 2I3VA 1ANFA 4BDNA 5KCJB 1UIVA 4HW8A 3TPAA 5ICQA 4P11A 1SYHA 2DP8A 1MG1A 1SW4A 4IGRA 3PMXA 3ZKKA 4GOTA 4ELQA 1OQHA 2HFBA 4RPNA 2O1LA 1BTJA 3GBAA 2CMOA 1FCKA 2F8DA 4KR5A 1DSNA 1YCJA 2BJJX 4OQOA 3G3JA 1P1OA 3HO7A 2XXVA 3U8QA 4ELPA 3OOAA 3N5LA 1QW0A 2VD3A 1S9TA 1BKAA 2QJEA 3T9VA 4EXLA 4RK9A 5AA4B 4BDQA 4OMBA 3MUQA 1WDNA 3Q26A 3TTNA 1JEUA 1YAEA 2DYXA 3EF7A 4G4PA 3JYRA 2RCAA 3QYTA 5JK4A 3Q29A 2NUVA 1GTKA 4NF8B 3K6WA 2V3TA 3C32A 2I49A 3GLBA 3FD3A 2Z8DA 2O68A 3TCHA 1A54A 1DTGA 1Z7NE 3RTWB 4E0XA 4KQPA 4BDLA 4LUBA 5AE4A 1FTOA 2I48A 4K3FA 5ISUA 3GBBA 4OFJA 4AB6A 3PUXE 3H6TA 1N0TA 5DVFA 3OO9A 3IB2A 2XXQA 4HCYA 3PPPA 1PBPA 1ZBMA 2REGA 1N04A 1JVYA 3PV0E 1A99A 1FTMA 2GRVA 4NF5A 3LBSA 4LZ7A 1N3XA 2DXRA 4ZDMA 1PB7A 3F11A 2DOJA 5I2NA 4KCCA 4YMAA 4H5FA 2OWSA 4N13A 4FJPA 2XD3A 1AH5A 5HPQA 3PPQA 1NMUA 1PB8A 3V83A 4YKJA 4QFOA 1KWHA 4IO2A 2QS1A 1MXWA 5CC2A 4ND9A 1VFEA 4GXAA 2UVGA 1FW0A 4MH5A 1OVTA 3RY3A 4F1YA 1WODA 2DE4A 2ANJA 1Q35A 4R72A 1QVSA 1LSTA 3SDFA 5IAIA 4F31B 4RK2A 3E9XA 1B7HA 2HZLA 4I1DA 1B58A 1ZU0A 1FQAA 1II5A 4ZECA 5CBSA 3LSFB 1ATGA 3FIRA 3K00A 3O66A 1NH8A 4QRZA 3FJ7A 2NOOA 4OYVA 3CFLA 2X26A 3KSJA 1UQWA 4KYSA 1M5EA 1MPDA 1EZPA 1OQGA 1B1XA 3MPLA 5CI5A 4MBPA 3FXRA 3RTFB 3PD9A 2Z23A 3PUVE 1P1QA 4OERA 3SEVA 3K0VA 3A3CA 4YB6A 3KOSA 3FZVA 4H6DA 2H4IA 3KBRA 4GLIA 3IAZA 4F39A 4LA9A 4JWXA 4XXUA 4BLAA 1SW5A 4NF6B 3SERA 1N3WA 4F22A 4GQOA 3HPIA 1Y1MA 5ITOA 2VHAA 1D9YA 4ZS9A 3MQ9A 3HN0A 3FJMA 3KFMA 1MY2A 1R6ZA 1B6HA 1DPPA 1I6BA 1ZTYA 3IOTA 4XKPA 3S2VA 3T22A 1GR2A 5AA2B 3MZ9A 5H8FB 4LQ5A 3TTLA 1B05A 3Q27A 4POWA 2YLNA 3MVZA 1CB6A 5ITPA 4GL8A 2R71A 1HSLA 3MZBA 2F6GA 1PEBA 3C35A 4Q5TA 1TWYA 3TFLA 3UN6A 3MP6A 1OVBA 1POTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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