3C36A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with ammonium ions at 1.68 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c36A02
3FIRA 3TFLA 1BTJA 3I6VA 4PFTA 1DPPA 4KHZE 2Z8EA 4U2RA 2ZYNA 3FATA 5H8NA 1JVXA 3ZS6A 2UXAA 2REGA 5ITPA 3UA8A 2P2AA 3USDA 3Q25A 3K1PA 4IGRA 3UORA 4DXUA 4ZEIA 1Z7ME 3VXBA 4ELPA 3VVFA 3KG2A 4LQ5A 3IB1A 1N76A 4DIGA 1A40A 1TXFA 1B1XA 4EDPA 1XOCA 2ANJA 3V83A 2Q8JA 3PMWA 2H98A 3FVGA 2G93A 3RPWA 3FV2A 4Z7EA 2PT1A 4NF5B 1GVCA 1B2HA 4ELQA 1HSJA 3WAEA 1LAHE 2NWJA 4U1ZA 3I5OA 4RYAA 2UVGA 3H6TA 3T9UA 3OEMA 4C1TA 1FTJA 4DXBA 2IA4A 3PPNA 5K2YA 4JDFA 2HCAA 4H8JA 1AOVA 4L17A 1B3FA 4KR5A 1CB6A 5HPQA 3EQ1A 1Y1MA 5KDTA 1FW0A 1Q35A 3HV1A 3K0VA 3CR9A 3IB2A 1EZOA 4OMBA 2XXIA 2RF1A 2P1SA 2O7IA 3G3JA 5AA2B 3DELB 2UVIA 4UACA 5ITOA 3DP8A 4JWOA 3RLFE 3GLBA 2XXQA 4WXJA 4ZEFA 4DE8A 1MXYA 1URSA 1JW5A 2F34A 5EHSA 2WKYA 2QS3A 4GL0A 1H76A 4ZEBA 4MBPA 1MQIA 1QKAA 1I69A 3CI8A 2QRYA 4OZ9A 4ZZEA 3ODBA 3PUWE 2H25A 3EPEA 2HZLA 3T66A 1AL3A 4R6YA 4FEDA 1IXGA 4Q8RA 4LQ2A 3RT8A 4NF5A 3ILTB 2DE3A 4LZ8A 4YMAA 3SETA 5DEXB 3H03A 1EZ9A 5H8QB 1UTHB 5DTBA 2HFBA 3N94A 4LZ7A 3K2DA 4R2BA 1Y1ZA 3OENA 4TLLB 3K00A 3UP9A 1H44A 1O7TA 3DM0A 2PYYA 2VP1A 4DCYA 1B1HA 4QRZA 3LUYA 3U1OA 2XXUA 4OFJA 1D3KA 1P1QA 5AA2A 4ECFA 4R73A 4H67A 4MF3A 4OEUA 3E9XA 3C31A 2DE4A 4GF8A 3UGWA 4BDMA 4AQ4A 1P1OA 1MG1A 3BFUA 1B5HA 2PVUA 1IQ7A 1MXXA 4OERA 3A3UA 2DWAA 2QS2A 4NWCA 3W9VA 2DWHA 4HCYA 4WEPA 3QK6A 1VE4A 3TEPA 5F7VA 4MLQA 5TP9B 3K1NA 4GWOA 1SW5A 5DT6A 1JVYA 1B46A 1SBPA 1HSLA 4F18A 1ELJA 4FECA 4F1YA 3KOSA 1D4NA 1ATGA 3OMBA 1MDQA 3FZVA 3RGYA 4MFIA 2VOZA 3C36A 4I62A 5DEXA 1XVYA 2GFEA 4EXLA 5JEIA 5H8QA 1UTHA 4ONYA 5I58A 1B7UA 4F39A 2PMSA 5I2NA 2HEUA 1NNKA 4R9GA 3GXAA 3TQWA 4KFQA 3UIFA 3QUFA 4RNSA 2DVZA 4ZZAA 2RCAA 2XX9A 4NF8B 5I84A 3B6QA 5A5XB 3CSGA 3H3GA 2RC9A 5H8SA 1R9QA 4RXLA 1QVSA 3BKIB 4G8HA 4Q30B 1FQAA 1OVBA 5HM4B 3TAJA 2M8CA 5J1DA 2UVHA 4F2QA 3IOWA 4TLMB 4QFKA 4ESWA 2NVUB 5DVIA 4YB6A 1USYH 1QUKA 3VLUA 2XXRA 2I3VA 4JSOA 3MP8A 3IO6A 3RNNA 1DOTA 4U23A 3FASA 2NUVA 1FTOA 4QF9A 4KPTA 3FD3A 2ONKE 1WDNA 5TP9A 1D9VA 5I56B 1B7HA 2CMOA 4Z0IA 3Q26A 1MXZA 3TTNA 2ABHA 4U21A 1S50A 4F3PA 3ZKLA 1LAXA 1POTA 3C4MA 4QFNA 2I48A 1VSOA 4E0WA 5AA4B 3VVEA 1PC3A 3MZBA 3QIMA 1QJMA 5CMBA 1Y20A 3RT6B 1US5A 3LR1A 1MPBA 2F7BA 4OXVA 3IOUA 1M5BA 4U22A 5CMCA 4R2FA 1SD3A 2QSXA 4OQOA 3RY3A 2HXWA 4YKPA 4NF8A 2OZZA 4OTEA 1PB7A 5A5XA 1B32A 4FJPA 4EQBA 2Z23A 1I6AA 4IY6A 4THIA 1PBPA 3CG3A 2VGQA 3EN3A 3MQ9A 3MBPA 3TELA 1LBBA 5H8FB 3VDFA 3FXUA 1LCTA 1FCKA 5CI5A 2QL3A 1OMPA 1Q1KA 2ZNTA 5KDTB 4KCDA 1VFDA 4IO3A 2QS1A 4GL8A 1ZLQA 3F11A 4ISUA 3C35A 1OQGA 2E0SA 3M3FA 2F6GA 5CMMA 1WODA 1RYXA 4YKKA 3S4UA 2Z22A 5I56A 3O29A 3ZKKA 5JTYB 2ZYOA 2CZLA 1FQEA 3K02A 2PX1A 4G4PA 1XHYA 5AA4A 2E1SA 1H43A 4TOZA 4PE5B 2ONSA 5F1QA 2PT2A 2AIXA 3RTWB 2FA7A 4R72A 3OO9A 3G3GA 4LATA 5L9OA 2DS9A 4QFOA 2V3TA 3DLNA 1A8EA 1Y9UA 4ELOA 3C33A 3LSLA 3VV5A 1DTZA 1R1NA 2P0SA 3G3IA 2F7CA 3PD9A 4AB6A 3K6UA 4R6HA 4R75A 1ZJLA 3CFXA 1YAEA 1UQWA 3WAFA 1TFDA 2QPQA 2HZKA 1ZKBA 3EHSA 1VFEA 3SERA 4OYVA 2DYXA 4G8NA 4BDRA 4KYSA 3O2AA 4ZE9A 4F3GA 5CBRA 3TCHA 3G3KA 3PV0E 4XTCQ 4ND9A 5H8HB 4F1UA 5H8FA 4XIGQ 3PU5A 1Y3QA 3R6UA 4H65A 4ZE8A 1FTKA 1SW4A 3OSQA 2F5XA 2F36A 2Y7IA 1B9JA 3TODA 1OLCA 2UYEA 3G3HA 1B4ZA 1N04A 1CE2A 3TUSA 2ZMBA 4WEDA 1JEVA 3T22A 2GRVA 1FQFA 1ZU0A 5BWJA 5JTYA 2Q9TA 1DPEA 3IJOB 3OELA 5CMKA 1I6QA 4X1BA 4I1DA 3JYRA 1MQDA 2XXHA 4YICA 1IZ1A 1MM7A 1MS7A 4FE8A 2B3FA 2DVCA 2OBGA 1SW2A 3D4GA 4QSDA 1SVXB 3SEWA 3IOVA 4LONB 3T9XB 1YTVA 2O7UA 5CM6A 5KCJB 4XXUA 3TTLA 3Q28A 1IXCA 5B7DA 1LB8A 2Y7WA 4OWDA 5CRYA 4LP2B 3T9HB 5EHMA 4NWDA 3TYHA 2R6GE 5I58B 2DWIA 4P11A 3KFMA 5I2NB 5FTHA 2GHBA 3QXMA 4G77A 4ZDMA 3M8UA 4UA8A 1MQGA 2D5WA 4YKIA 4LA9A 1GV8A 1FQDA 4JXIA 5H8HA 5IAIA 3CRBA 3ONMA 3VE1B 3O66A 4OHNA 4QSCA 4GLIA 1D9YA 4RPNA 2H4IA 4IO7A 2YPNA 4QSEA 4JWXA 4NF6B 3QSLA 4QFPA 4YB5A 1B52A 2ZNUA 3S9EA 3FGSA 4F3BA 3PD8A 3PUVE 2QMXA 3EHTA 1B51A 1B5JA 1B58A 2UVJA 4RA1A 1MY1A 3M3LA 4H6DA 1SYHA 1IXIA 1ZMGA 1IXHA 1GGGA 4X48A 2H9BA 1S7YA 3B6WA 4GVOA 2DXYA 4KD5A 2Q89A 4R9FA 3IK6B 3PMXA 2X7PA 4OVJA 3IOTA 4RJZA 4JSDA 4H0WA 3TMGA 1QKBA 1BP5A 1L5TA 4GFRA 3SEXA 3PPQA 3KBRA 1Y4TA 3VFJA 4KYEA 5CBSA 5FHOA 5KCJA 1EH3A 4O3BA 3KN3A 2I4BA 4U4SA 3LSWA 3M3KA 3AXFA 3CIJA 4FATA 2O51A 1B3LA 4LZ5A 3LSFB 2UYFA 3TDJA 3FUZA 1EU8A 5ELVA 4C0RA 2OJTA 5L9MA 2R71A 3OO7A 3E4RA 3PMVA 3L6GA 1FQCA 5M2VA 3N6UA 2F35A 4N07A 4ZS9A 4OESA 2O68A 4ESXA 3JV9A 2I6EA 2QS4A 3TZAA 1BLFA 3ECRA 4K3FA 3HCQA 4NF6A 1NNTA 3IJXB 1USYE 2REJA 5ICQA 2HAVA 2XXYA 3K6XA 2NXOA 1LCFA 1FTMA 4H5GA 2ZYKA 4HCWA 2O84X 3TTKA 1I6BA 1MPCA 4BDLA 2I58A 1M5FA 3W15C 3R7XA 3TTRA 3R26A 4RY1A 1B3HA 1Y3NA 5JK4A 4GQOA 4NEDA 4R74A 2VD3A 2Z8FA 2RINA 5LOMA 3O6IA 3IAZA 2ZXTA 4RK9A 2GH9A 3T9VA 4TQUQ 3OEKA 1OQHA 2PBWA 4X9TA 2XXWA 4P0GA 2O1LA 5AA1A 2V3QA 1MY4A 1B3GA 1XC1A 3H4ZA 1TWYA 2O1MA 3KSJA 1LLSA 1M5EA 2A5TB 1SW1A 1ZBMA 3IR1A 4FEBA 4X1DA 1R6ZA 3SEUA 3VXCA 2Y7KA 1NFTA 1MQHA 2AL5A 1B40A 3FJGA 4EUOA 4E0XA 2RC8A 1N3XA 1LB9A 2HQ0A 4QFLA 1LBCA 3B7DA 2KLFA 2F97A 3TTMA 4GOTA 3K6VA 3O6GA 3BFTA 1UIVA 1EZPA 4H5FA 3FXRA 5KZTA 1N7XA 3UK4A 1MPDA 4POWA 2XHDA 2OWSA 1AH5A 3CFLA 4F19A 3IX1A 3S9MC 5I59B 3BBRA 5DYHA 3O6HA 3C32A 1LAGE 1SQYA 1F9BA 5ISUA 1T0KA 5K2XA 2DWJA 1FQBA 4NF4B 3LSXA 3IO4A 5IKBA 1QUIA 3VLVA 3OO6A 3RUMA 3H6WA 4OFOA 1NKXA 3PUZE 5I2KB 2Z8DA 1RYOA 3IL1B 3CFZA 5DVJA 2QMWA 4IO2A 2H5YA 3T96B 1J1NA 1A55A 3G3FA 1MRPA 1B5IA 2A5TA 1MH3A 1O64A 1MM6A 3E3KA 1MXUA 3KGCA 4AB5A 3PUYE 2QJEA 2ZYMA 3B6TA 2V3UA 3RQTA 2R9JA 1SI1A 3HN0A 4KQPA 1TFAA 3W9WA 3TQLA 1NNFA 5AA2D 4H8IA 5FTIA 2DE2A 1MXVA 3QAXA 3HSTA 3HO7A 4DCXA 2OCUA 1JW1A 1ANFA 1URGA 1PEBA 1A54A 2I3WA 3PGFA 5HBCA 1MH4A 4N6PA 4F22A 3MUQA 5AE4A 3V8XB 1TT1A 4YU0A 1Y4CA 4NE4A 1AMFA 4U4XA 4GD5A 1P99A 5AA3A 1MXWA 2NOOA 3Q29A 5I59A 3KZGA 2VD2A 1UTBB 4NF4A 3I3VA 4DDDA 1OIBA 2ZNSA 1LFHA 3PPPA 3U8QA 1FTLA 2XX7A 1BKAA 2AYSA 4F2OA 2D21A 4F1VA 5I2KA 2FYIA 4ZECA 1RKMA 3OOAA 3SEVA 1B3EA 4M1VA 1IITA 1A7LA 1DMBA 2IEEA 3FVNA 2I0BA 1QW0A 1PB9A 4OFLA 3SDFA 1JQFA 3TCGA 5BUUA 3FVKA 4WKMA 5DVFA 2HAUA 1XT8A 3G7WA 4ZEKA 1ZIUA 2B65A 4N13A 3MZ1A 4LVQA 4HS7A 2DP8A 3ILUB 2DXRA 3OO8A 3JZJA 2XXVA 2O69A 4HW8A 3N5LA 3MVYA 3U94A 1YPNA 4OETA 3SKPA 4ELRA 2FNCA 1BIYA 1Z7NE 1SDXA 3V89B 1NL5A 4PFYA 5L8DA 3MZ9A 2F6PA 4OEVA 2Q88A 2YJPA 3VLWA 5CC2A 2XXTA 3IORA 4I9DA 4F31B 1M5CA 1AIVA 4LUBA 2AL4A 4PQJA 3C34A 2DOJA 1B0HA 1P1NA 1IUDA 3MP1A 3QUJA 4IO4A 5TPAB 1JETA 4BDNA 4BDQA 4YAHX 1Y3PA 1UTBA 1JEUA 2F8DA 4I8CA 3PUXE 3S9LC 3MPKA 4BLAA 4FAJA 1H45A 2OLBA 1IIWA 1ZTYA 3E13X 2X26A 4XKQA 3U72A 3A3CA 4P0IA 3KOTA 4C1UA 4M4GA 3SEYA 4FIMA 3RTFB 4XKNA 2XD3A 4IO6A 1R9LA 1LFIA 2F78A 3DP4A 4IGTA 1B6HA 4XKRA 5ICTA 3KSXA 4EXKA 3VVDA 4U1OA 3D4CA 2H99A 4RPOA 4YZZA 2ONRA 3S9NC 3MP6A 1A99A 1HSEA 1B4HA 2DSFA 3MWBA 3OD7A 5FHMA 4QHQA 3MAMA 1NH8A 2YLNA 1DTGA 5I57B 3MJNA 1II5A 2THIA 1N84A 3K01A 3L6HA 4YKJA 1B7ZA 2I0CA 4PFUA 2F7AA 2XX8A 4YMBA 2BJJX 4ZEDA 1NH7A 2DQVA 3S2VA 4IB2A 4F29A 3HHGA 5EYFA 3ZSFA 3QYTA 3UN6A 2RC7A 2XXXA 4JB7A 4YB7A 1LGBC 4EF2A 3C9HA 3MVWA 4PP0A 5TPAA 2XD2A 4G68C 1P1WA 4MLVA 3O9PA 1POY1 4IO5A 3H6VA 3O28A 2ALUA 1XS5A 1A8FA 3MVZA 4DLDA 3V5AA 3PPRA 3TCFA 4XKPA 3KJ7A 3HPIA 4RK2A 4G68B 1US4A 3Q27A 1LAFE 4Q5TA 3FJMA 3K1MA 3H6UA 3TKDA 2Y7RA 4DXCA 2RCBA 4POXA 3A09A 4KYDA 3U92A 4FORA 2Q2AA 3KN7A 1LFGA 5TU0A 4EQ7A 4NTLA 4BDOA 3CG1A 1N3WA 4EF1A 1SYIA 3T93B 1MY3A 1P1UA 3FVOA 1QUJA 3OXNA 2V93A 1JNFA 1JW4A 2V84A 3U93A 5FHNA 2RKMA 5I57A 2ESNA 5B70A 2I4CA 3N26A 2W7YA 3RN8A 3LC8A 2Q2CA 5L9SA 1GTKA 1URDA 3KJTA 1WVJA 1PBQA 4O3AA 2Y7PA 4GIZA 1PDAA 2VHAA 3IB0A 5H8NB 4MH5A 3SESA 1NMUA 4G2ZA 3EF7A 2A5SA 3MPLA 3MW0A 1OVTA 1N7WA 4O3CA 4DZ1A 1XVXA 1NNPA 1MQJA 3OSRA 1YCJA 4PETA 4Q0CA 3GZGA 3PPOA 4HTGA 2X7QA 1B0LA 1IEJA 3N6TA 4PFWA 3FV1A 2D3IA 3THIA 4NMYA 2Y84A 4KCCA 3O97A 1S9TA 2LAOA 4G68A 3LBSA 1SI0A 4EQ9A 1MY2A 3HHFA 2XXPA 3KEIA 2G29A 1MDP1 1GR2A 3EHUA 4KI0E 1LSTA 4OENA 4R6KA 1QULA 4F3SA 1M5DA 4G8MA 3TPAA 3FJ7A 1OLAA 3GBBA 4JWYA 3K4UA 1UIUA 1PB8A 3H7MA 4JBZA 3KN8A 4H1XA 4IY5A 3MC2A 2B3BA 4GXSB 1H3DA 1MY0A 2GHAA 2I49A 3FXQA 3P7IA 3CSBA 1B05A 3H06B 1DSNA 4GRKA 4GXAA 2O6AA 3CVGA 2OWTA 1KWHA 3MVXA 1N0TA 2OK2A 3DP6A 1VR5A 3K6WA 2V25A 1O63A 3GBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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