3HHFA

Structure of crga regulatory domain, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
PQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
molecule tags Transcription regulator
total genus 52
structure length 204
sequence length 204
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhfA01
1DSNA 3JV9A 4OFJA 2ESNA 3TTLA 3TTKA 3PMWA 2VD3A 4L17A 3L6HA 5K2XA 3MW0A 1NL5A 3O2AA 3DP8A 4YB7A 3PUYE 3FXQA 1B46A 3O97A 1SQYA 1A54A 4FECA 5CMCA 3MAMA 2Q2AA 4ZS9A 3OO9A 5B7DA 1B3GA 3QYTA 4LVQA 4LZ7A 4YAHX 1UIVA 1M5FA 3O29A 5AA3A 3QUFA 2AYSA 4M1VA 4OXVA 4G8HA 4U4SA 3IOUA 3PMVA 3WAFA 3U72A 3TQLA 5CMBA 1NNKA 2XX7A 4K3FA 4DLDA 4JDFA 4OZ9A 4QRZA 2Y7KA 1YTVA 3M3FA 3VFJA 3FATA 3C9HA 4NF4A 3IOVA 3K0VA 5TPAA 1QULA 3THIA 3QXMA 3RT8A 2Q9TA 4RPNA 1P1WA 3U8QA 2O69A 4QFOA 3W9WA 2Q88A 4N13A 5I58B 1B7HA 3OSQA 4QSCA 3CG3A 3MPKA 2V3UA 1USYH 5F7VA 1Q35A 1A99A 5I2KB 5I2NB 3KOSA 4EXKA 3HCQA 1B51A 1B0LA 1SBPA 4OTEA 1UTHA 4YB6A 1B4ZA 2PT2A 4BDNA 1VSOA 4XKRA 3QK6A 4R75A 4IO7A 1LAGE 3K6WA 1A8FA 4DCXA 3PPPA 2OCUA 5DEXB 4ESXA 4FATA 4JSDA 1BP5A 4X9TA 3GXAA 4NF6A 1SVXB 3FVNA 3Q28A 2XXUA 1N04A 1POTA 3MUQA 1KWHA 2I58A 3EPEA 3BKIB 1A55A 2XD2A 3E9XA 3VV5A 3CSBA 1QUJA 3N94A 1I69A 3M3KA 2ZXTA 3O66A 2O68A 2GH9A 2QMXA 1T0KA 4LONB 2F7AA 4NF5B 4ZEFA 1OMPA 4U1ZA 3FV2A 4KR5A 2I3WA 1FTLA 2RC8A 1LBBA 2I0CA 3MBPA 3TMGA 4EUOA 1XVYA 1GV8A 2BJJX 3U94A 4PFTA 3PD9A 4R72A 1FQDA 2RKMA 5TP9B 3O28A 3G7WA 4E0WA 4N07A 4IY5A 4RYAA 3LR1A 1NNTA 2UVHA 1MXXA 1ZTYA 1BTJA 1B32A 1R6ZA 3EHSA 3SESA 3VE1B 3LUYA 1FQAA 3IOWA 1MPDA 3K1NA 2ONKE 4ZEDA 2B3BA 5FTHA 1OLCA 1UIUA 3TYHA 2UVGA 3MVYA 5EHSA 1WVJA 3KJTA 1GGGA 2P2AA 1VFDA 1NH7A 4ISUA 2DYXA 3SEXA 1CB6A 1B52A 3G3GA 1ZIUA 1ZBMA 1LGBC 3ONMA 2ABHA 4R6YA 2O1LA 2ONSA 1JVXA 2O84X 3OENA 2PBWA 1M5CA 5ICTA 5DVIA 2QS4A 3FJMA 1Y4CA 3PUZE 2XX9A 1YPNA 1H44A 2DXRA 2OJTA 4PP0A 5CBRA 4KFQA 2ZYOA 4MBPA 2OBGA 2XHDA 1MQDA 3D4GA 4R73A 1OIBA 2HAVA 1N7WA 2REJA 3MP6A 3H4ZA 5TU0A 4R2FA 1ANFA 4LZ5A 4F3BA 1B6HA 4NWDA 4RY1A 3FJGA 3MVZA 4WEDA 2V93A 2RC7A 1IEJA 3U93A 4QF9A 1HSEA 4OQOA 1SI0A 4H1XA 4O3AA 3G3KA 1N3XA 1MY4A 2DVCA 3IOTA 5H8SA 3HSTA 1MY0A 1AMFA 4H0WA 2ZYMA 2D5WA 2H9BA 4UA8A 2F8DA 3SEYA 4THIA 4BDOA 3EF7A 2FA7A 5EYFA 1S50A 3V8XB 1ZMGA 5I58A 1B40A 3DELB 3TKDA 1XOCA 3KN3A 1LSTA 1A8EA 2QSXA 1B5HA 5I84A 1P1UA 1QUKA 5I2KA 5I2NA 3PPNA 2HCAA 3S9NC 1PB9A 2I49A 1BLFA 2I4BA 1OVBA 1XHYA 3QUJA 1XVXA 4LQ2A 4PE5B 4QFLA 5ITPA 4ESWA 1FQEA 1NMUA 3JYRA 5L9SA 1AL3A 3K6XA 4N6PA 1JEUA 4IO2A 3VXCA 3B6QA 4QSDA 1JVYA 3TTMA 1SDXA 5CMMA 3UGWA 4IO6A 2HXWA 3E4RA 1H43A 1A7LA 3UIFA 1HSLA 3VLVA 2W7YA 3PMXA 2QS2A 3T93B 3TELA 1D9YA 1IQ7A 4YB5A 3H3GA 1GVCA 3I5OA 3HPIA 4GXAA 5I57A 1XC1A 4P11A 1RYOA 2D3IA 4KI0E 1MH4A 5CC2A 2QJEA 1LAFE 4F2OA 2HAUA 1B9JA 3OO8A 2P0SA 1Y1MA 4ZECA 2R71A 4JWXA 1LB8A 2DE4A 2A5TA 5TP9A 2XXRA 4JSOA 3CR9A 1QW0A 1VFEA 2THIA 4F18A 5I56B 2H4IA 3RTFB 3ZKKA 5HPQA 3GLBA 5CM6A 3TTRA 3GBAA 4C1TA 2VOZA 3K6VA 3KJ7A 1WODA 4RPOA 4ZEKA 5CBSA 1ZLQA 2YJPA 1MG1A 3H06B 3UP9A 4MLQA 1NKXA 3S9MC 2NOOA 3IL1B 3ILUB 2Y7PA 1LLSA 5F1QA 1DPPA 3OOAA 1IXGA 3QAXA 4AQ4A 5CMKA 4E0XA 2ZYNA 5FHMA 4EQ9A 3PV0E 3MZBA 4ND9A 2IA4A 1Z7NE 3TFLA 1PB7A 2V3TA 4FE8A 4FORA 4GQOA 5CRYA 1DMBA 2Q2CA 4MLVA 4OESA 2X26A 4OEVA 4P0IA 1BIYA 3M8UA 3C31A 2M8CA 4WEPA 2H25A 2HZKA 2Z8DA 1I6BA 1N7XA 2E0SA 3O6IA 2QPQA 3K01A 2NUVA 2DOJA 4IB2A 1PC3A 1B05A 4Z7EA 3KG2A 4YKPA 4PFWA 2VP1A 3E13X 4OVJA 4EF1A 3K4UA 4GXSB 2F6GA 4IO3A 3C36A 3A3CA 5KCJB 4EDPA 3CFLA 2Y7IA 3K1MA 4BDLA 1B7UA 2VHAA 3UORA 4H5GA 4KQPA 2HFBA 3R7XA 1DTZA 4XKNA 1A40A 4GL0A 3CVGA 3G3FA 1I6QA 3LSFB 4JXIA 2WKYA 4F19A 5HM4B 3K00A 1AH5A 3C4MA 2O7UA 4YKJA 1Y4TA 4ELOA 4OEUA 2YPNA 4NF8B 2F34A 2F78A 4G77A 1LB9A 2OK2A 4TOZA 3MWBA 4Q5TA 5I57B 1L5TA 3FV1A 1D9VA 3N26A 1FTMA 4DCYA 1TWYA 5IAIA 1PEBA 4MF3A 1QUIA 1OQHA 1B2HA 2Z22A 1EH3A 1POY1 4JBZA 1JQFA 5A5XB 3IJXB 3T9HB 1J1NA 4F3GA 4X1DA 2A5TB 2QRYA 3V5AA 2XXHA 3O6HA 2VGQA 2O1MA 2PMSA 4HS7A 1UTBA 1SD3A 4GFRA 1PDAA 2DS9A 5CI5A 1XS5A 2OLBA 2ALUA 4NEDA 2I4CA 5I59B 1B3EA 1H76A 3DLNA 3HHFA 3TAJA 4BDRA 1EZ9A 1D4NA 3ZS6A 1ZKBA 4KCCA 4EQ7A 3OSRA 2DVZA 3K02A 1EZPA 1MXZA 1Y9UA 1N76A 1FTKA 3PPQA 3TZAA 3FVOA 4GOTA 5I56A 4GD5A 4RJZA 1MQGA 3P7IA 3T9XB 3H03A 3U1OA 3RUMA 3A3UA 2Z23A 3ODBA 1MS7A 4F1YA 1GR2A 3Q27A 1GTKA 2XXVA 2Y7WA 4M4GA 4ECFA 2NVUB 4QHQA 2GHAA 4R6KA 1M5BA 4U22A 2XXPA 4KYSA 5KDTB 4GVOA 4R6HA 1B3FA 2CZLA 4G68C 3BFUA 3CSGA 3FGSA 1NFTA 4O3CA 2HEUA 3K1PA 1FCKA 5JTYB 3OO6A 3TTNA 4MFIA 5H8NB 5EHMA 1II5A 1Y1ZA 4DXUA 5M2VA 3MZ1A 4I1DA 4Q0CA 1MXVA 4H6DA 4OFLA 5FHNA 5AE4A 1IXIA 3OELA 1MY3A 3H6UA 4QFNA 3TCHA 3PD8A 3KGCA 3M3LA 3N6UA 2ZNSA 3CFXA 1MQJA 1SW1A 1FQCA 4BDMA 3LSWA 4FEBA 4GIZA 3OEMA 1N0TA 3SERA 2F7CA 2ZMBA 3EHTA 2F7BA 3N6TA 3V89B 1IZ1A 5H8QA 1EZOA 1O7TA 3KN7A 2DE3A 3BFTA 4G68A 2QMWA 1PB8A 4NTLA 1ZU0A 2UYEA 3KFMA 2UXAA 1Z7ME 4Q8RA 3UK4A 1D3KA 2I0BA 1LCFA 4YKIA 4C1UA 1MDP1 2DSFA 4IO5A 3MC2A 4BLAA 2G93A 5IKBA 3C35A 1M5DA 1SYHA 3IR1A 2OWSA 1B3LA 1RYXA 1S7YA 2OWTA 4AB6A 4TLLB 4RA1A 5KCJA 4G8MA 3S9LC 4DZ1A 3DP4A 2OZZA 1LFIA 4QSEA 3C33A 1Y20A 5L9OA 4I9DA 5K2YA 2XXXA 2XXQA 1MQIA 3FASA 4TLMB 1LFGA 3RQTA 3F11A 4I62A 1WDNA 1OQGA 3L6GA 3FIRA 3U92A 2Y7RA 2PYYA 3OD7A 5AA2B 4KPTA 4F29A 4OFOA 2UVJA 2DWIA 3TPAA 3T96B 4DIGA 2F6PA 4NF8A 2REGA 3C32A 2XXTA 1TXFA 1SYIA 4YZZA 3IX1A 4POWA 1TFDA 1JEVA 3VLWA 4GL8A 3B6TA 1MY2A 2Q8JA 1UTBB 4DDDA 3TODA 4ELPA 2A5SA 5JEIA 3LSLA 4GRKA 3SKPA 3FD3A 4XTCQ 1B0HA 4XXUA 5ISUA 3FVKA 5A5XA 2QS1A 4PFYA 1LFHA 4OENA 3I6VA 1US5A 3VVDA 4JWOA 3RTWB 2FYIA 3PPRA 4NMYA 4OMBA 4LP2B 4R9GA 1FW0A 2G29A 1NH8A 1DTGA 2ONRA 3R26A 4EXLA 1URSA 3MVWA 4FJPA 4ONYA 4POXA 4YKKA 3VLUA 5I59A 5L8DA 4HCWA 2PT1A 2X7PA 4LZ8A 4OYVA 3FVGA 2O51A 5DTBA 4OWDA 2GRVA 3JZJA 4XKQA 3KSJA 2XXWA 4PFUA 4RXLA 1P1OA 3TCFA 1ZJLA 1M5EA 3KEIA 3RY3A 5B70A 4KHZE 4IO4A 4R2BA 3OXNA 2O6AA 3VDFA 3TQWA 2Q89A 1UQWA 5H8HA 2DWAA 2B3FA 5KDTA 2F5XA 3KZGA 4YU0A 4OERA 2V84A 1LBCA 2H98A 3RT6B 2R6GE 2RINA 4KD5A 4F39A 3SDFA 2KLFA 5JTYA 1P1NA 3IB1A 2R9JA 2E1SA 4QFKA 5H8NA 5H8QB 1BKAA 4G68B 5HBCA 4U2RA 3CRBA 3G3JA 3FUZA 3IK6B 2ANJA 1CE2A 1B1HA 1QVSA 3CIJA 5ITOA 3Q25A 1N3WA 4P0GA 3IB2A 3ZKLA 1FTJA 4QFPA 1USYE 4TQUQ 3UA8A 1JW5A 4H67A 1H45A 3OO7A 4FIMA 5H8FA 2FNCA 3H7MA 3W9VA 3GZGA 2CMOA 4F2QA 1TFAA 3TEPA 4KCDA 1PBPA 5ELVA 3FXUA 1B3HA 1O64A 5L9MA 1P1QA 2AL5A 2VD2A 4H8IA 2NWJA 3T9VA 4RK9A 2GFEA 4H65A 3ECRA 4G4PA 2ZNTA 3G3IA 1EU8A 1PBQA 3KSXA 5AA4B 1VR5A 1LAXA 3B7DA 4ZDMA 4I8CA 2RCBA 3HV1A 1AOVA 1MRPA 3RGYA 2DXYA 2DWHA 4R9FA 3H6TA 1I6AA 1MXUA 2QS3A 4ZZEA 3IO6A 4EQBA 4X1BA 5KZTA 2IEEA 2X7QA 1DPEA 3SEWA 2UYFA 3T22A 3BBRA 4DE8A 3MZ9A 5ICQA 5DVFA 1HSJA 4ZZAA 3TCGA 1IITA 5AA2A 3RPWA 1URGA 1SW2A 3DP6A 1N84A 4JWYA 4ZE8A 5DYHA 4F3PA 1B5IA 5BWJA 1MPBA 3VVFA 1F9BA 4Q30B 1XT8A 1VE4A 1YCJA 4MH5A 3CI8A 3S2VA 2B65A 1FTOA 5AA1A 4ZEIA 4XIGQ 4LATA 4KYEA 4U1OA 2DP8A 3VVEA 4GF8A 3KBRA 2H99A 4DXBA 2HQ0A 3PUXE 4RK2A 3CFZA 2I48A 4JB7A 4NWCA 3D4CA 1JNFA 5BUUA 3HN0A 4F3SA 3S4UA 2YLNA 1B5JA 2DWJA 3AXFA 2XXYA 3B6WA 4YMBA 4R74A 1MXWA 4F1VA 4Z0IA 2Z8EA 3K6UA 3MP8A 1IIWA 3FJ7A 5LOMA 2V25A 2ZYKA 2PX1A 4ZE9A 3A09A 3QIMA 3IORA 2QL3A 4DXCA 5H8HB 1Y3QA 4G8NA 1DOTA 3SEUA 1P99A 2RC9A 4G2ZA 4O3BA 3MVXA 3IO4A 1JETA 4H8JA 5AA2D 2I3VA 5J1DA 4ZEBA 3R6UA 3DM0A 1SW4A 3OMBA 2H5YA 3S9EA 4HW8A 1MM6A 2D21A 3PPOA 2O7IA 1MDQA 3RN8A 3PUWE 3G3HA 2DQVA 4RNSA 5FHOA 1NNPA 4OHNA 4EF2A 4WXJA 3UN6A 2I6EA 3QSLA 4OETA 2DE2A 4NF4B 4ELQA 3OEKA 3EN3A 5TPAB 1O63A 1S9TA 3VXBA 5H8FB 2XXIA 3O6GA 1B7ZA 1JW4A 1MPCA 3O9PA 1QKAA 1MM7A 4UACA 1IXCA 5JK4A 4KYDA 4U4XA 1MY1A 3Q29A 1TT1A 3IJOB 3Q26A 2AL4A 2XX8A 1ATGA 4LQ5A 2Z8FA 1UTHB 3LSXA 3FXRA 1OLAA 3PU5A 3USDA 5FTIA 3MPLA 1OVTA 1YAEA 4F1UA 4U23A 2RF1A 4YICA 1R9QA 3T9UA 3V83A 3MJNA 1JW1A 1SW5A 1SI1A 1QKBA 4NF6B 4FAJA 1ELJA 1AIVA 3MQ9A 4F22A 1R9LA 1US4A 3IAZA 1RKMA 4IY6A 3I3VA 3FZVA 2RCAA 4X48A 1QJMA 4WKMA 1MQHA 3EHUA 1Y3PA 5DT6A 2F97A 4C0RA 1B58A 3ZSFA 4IGTA 2ZNUA 2XD3A 3MP1A 3E3KA 4ELRA 4H5FA 5AA4A 5DEXA 3LBSA 3TDJA 1B1XA 4AB5A 1LAHE 1LCTA 4XKPA 3KN8A 1Y3NA 3SEVA 3PUVE 1B4HA 4U21A 3PGFA 4GWOA 3HHGA 3W15C 1MXYA 3HO7A 2P1SA 4LA9A 3SETA 3N5LA 3EQ1A 4NE4A 4PQJA 5DVJA 4BDQA 4PETA 3CG1A 4HTGA 2UVIA 3ILTB 3TUSA 3WAEA 2NXOA 2AIXA 3GBBA 1H3DA 2PVUA 1FQFA 3H6WA 2HZLA 4NF5A 1Q1KA 3K2DA 4YMAA 2F36A 2Y84A 3IB0A 4FEDA 2LAOA 4GLIA 3KOTA 4F31B 3RNNA 1R1NA 1FQBA 1URDA 3LC8A 3C34A 3T66A 4LUBA 1IUDA 1IXHA 3RLFE 2V3QA 2F35A 1NNFA 1MH3A 3H6VA 2GHBA 4HCYA 4IGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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