3HHFA

Structure of crga regulatory domain, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
PQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
molecule tags Transcription regulator
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
total genus 52
structure length 204
sequence length 204
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhfA01
1M5CA 1ZJLA 5HBCA 3CSBA 2AL4A 1H45A 3K1MA 3G3FA 4G4PA 2RCAA 1FTLA 4MFIA 4F19A 2GH9A 3CSGA 4MBPA 1MXYA 4JSDA 3SESA 3UN6A 1UTBB 4QFLA 5LOMA 3MVYA 1AIVA 1UTHB 1LLSA 3TAJA 2VHAA 1OVTA 2FYIA 4DXBA 4EXKA 3E3KA 2ZYMA 5CMBA 5KDTB 4EQ7A 1S7YA 2UVHA 4DLDA 1IXIA 1Y3PA 3RTWB 2F8DA 5TPAA 3OD7A 4KQPA 3MWBA 2A5TA 3M3LA 3H6WA 4GF8A 4NF8B 1R9QA 4ZE8A 2F6PA 3HHFA 2DVZA 1VSOA 3HN0A 5CRYA 3KOSA 3VVFA 3PPRA 4YB5A 4ELQA 1N3XA 2XXUA 3KZGA 3QYTA 4KFQA 4TLLB 3TMGA 3K1NA 4I1DA 5H8FB 5F1QA 3RTFB 3R26A 3TTNA 1MRPA 1H43A 3U72A 2VP1A 1P1WA 4R72A 1P99A 2HZKA 4RYAA 2QL3A 3I3VA 3U93A 1SW2A 1MXVA 4PFUA 1XC1A 2I4CA 2O51A 4R6YA 2PBWA 1O63A 3TCHA 3T9UA 4QSCA 5TU0A 2DWHA 2V3QA 4EXLA 1B4HA 3G3GA 3FJMA 1RYXA 1LAHE 3U94A 5CM6A 1M5DA 1IXHA 4U4SA 3FXRA 2Y7WA 3K1PA 3T96B 4YKKA 1POTA 2REJA 3A3UA 2ZMBA 4NF5B 3OENA 1XS5A 4H8JA 3UA8A 2H99A 3IOWA 3I6VA 1ZTYA 1UIVA 5DT6A 1MY0A 3MAMA 5I58B 1D3KA 2V84A 4QFPA 5ELVA 4U21A 3O2AA 3CI8A 5AE4A 4LZ5A 1JVYA 4ESWA 1P1OA 2XX7A 2HFBA 1N3WA 2I58A 4FEDA 4BDLA 1B6HA 4YKIA 4GD5A 1N7XA 4JSOA 2PT1A 4GL0A 1QKBA 1ATGA 1QULA 1EZOA 4WKMA 4EF2A 4U1ZA 2F36A 4JXIA 4IO2A 1QUKA 4DCXA 2WKYA 1BIYA 1H3DA 4G68B 3TTLA 3D4CA 3U8QA 4QSDA 5A5XA 4G8NA 1UIUA 2YLNA 3C36A 3QK6A 4XKPA 1IXCA 1H76A 5ICQA 4NEDA 2VD2A 3OEMA 2XXXA 1MQIA 5J1DA 4I62A 3A3CA 1B3EA 4H5FA 4TOZA 2AL5A 3QUJA 1GGGA 1XVXA 3I5OA 3HCQA 5BUUA 3OO6A 1L5TA 2O1LA 3MZ9A 4FECA 3N6UA 2G29A 3T9VA 2ALUA 4F22A 4ELPA 1NH7A 2B3FA 3ILUB 1N04A 3MP6A 4LQ2A 1P1UA 4EDPA 1AL3A 3IORA 3MVZA 3C32A 3USDA 1SW5A 3H6VA 4P0GA 3SDFA 5F7VA 3SETA 4PP0A 4X1DA 3ZKLA 1MPBA 5AA2B 3T9XB 1A8EA 4G8MA 4DE8A 4LA9A 4THIA 4EF1A 4LZ8A 1CB6A 2Y84A 4P0IA 1A7LA 3PUYE 1MPCA 4OFJA 4C1UA 3M3KA 4RXLA 3OEKA 4BDMA 3P7IA 1N0TA 2DWJA 1B5JA 2F7CA 1UTBA 1GR2A 1MH4A 1OQHA 1UTHA 3QIMA 5FHNA 1B58A 3C4MA 3S9NC 2QS2A 5B7DA 3TYHA 5KDTA 3PPOA 1SVXB 2Z22A 2ZYOA 2V3UA 3JYRA 1O7TA 5I59B 5HPQA 4E0WA 4ZEIA 3MJNA 2B65A 3N26A 2H25A 5H8SA 2UVJA 5EHMA 5ISUA 4NF8A 2XXPA 4WEDA 1LB8A 4I8CA 2I4BA 1QW0A 2UYEA 2DE2A 4C0RA 4KYEA 2ZYNA 3TTRA 3KN3A 5I57B 4GL8A 5JTYB 4Z0IA 1SW1A 3TCFA 4F31B 1IXGA 2AIXA 4F2QA 3O9PA 4R6HA 4KR5A 1S9TA 5H8FA 4HTGA 4GLIA 1B3FA 1FTKA 4QHQA 5CBSA 1T0KA 1S50A 4R9GA 4ISUA 3IO6A 3CIJA 3MUQA 2HAUA 2HCAA 4F3GA 4ECFA 2I6EA 1OLCA 3TTKA 1MY4A 3FXUA 3TTMA 3MQ9A 1B3HA 4OMBA 5CI5A 4XKRA 4Q8RA 3TEPA 1BTJA 1NL5A 1Q1KA 4OEVA 4GWOA 4DZ1A 3KN8A 1A99A 1MM7A 4YAHX 5FTHA 4KPTA 3OO8A 2YPNA 3D4GA 5I56B 1MDP1 4UACA 3EHUA 1B0HA 1DTZA 1WVJA 1B3GA 2ESNA 2R9JA 1DSNA 4LZ7A 4FAJA 4GFRA 2Q2CA 1JEUA 2CZLA 4Z7EA 1MS7A 1Z7ME 4YB6A 5ITOA 3IO4A 4KYDA 1JW4A 2THIA 4P11A 5I58A 1US5A 3IK6B 4DDDA 5B70A 3TQWA 2DWAA 1SBPA 1SYIA 3LSFB 3T93B 3R7XA 4F3BA 3IL1B 2Z8DA 3KEIA 1N76A 1SI1A 4F1YA 2DSFA 3PPQA 4KCCA 4F29A 1MQDA 4DXUA 1B1HA 3BFTA 3MVWA 1EZPA 2GFEA 4ZZAA 2PVUA 3UORA 2LAOA 3K6UA 2XXRA 4F3SA 2RINA 1QUJA 1QKAA 3H4ZA 3LSWA 3K6VA 3KSJA 4G2ZA 4U4XA 1D9VA 1LBCA 2PT2A 3SEYA 4ZECA 4G68A 4H8IA 3G7WA 2DS9A 2UVGA 4XIGQ 2D3IA 1VFEA 4NWDA 2E0SA 1OIBA 1MXUA 3MC2A 3VXBA 1IZ1A 1Y3NA 3L6GA 3HSTA 4F1UA 1YCJA 1Y3QA 3OELA 3TKDA 3LR1A 4OZ9A 4GXAA 3GXAA 4DCYA 1WDNA 1LB9A 2V25A 3FGSA 3PMVA 2AYSA 1XVYA 2DQVA 1ELJA 4AB6A 1FTJA 4TLMB 2XHDA 2ANJA 1MQGA 4EQ9A 1OVBA 3K02A 3VLWA 4X9TA 3IJOB 3OO7A 3CR9A 2OJTA 3FATA 5AA1A 2F5XA 4U2RA 1Y9UA 3FD3A 2DWIA 5AA2A 3TCGA 3HPIA 3ZKKA 5DVFA 4IO7A 3EN3A 4FE8A 3VVEA 4RK9A 1USYE 3ZS6A 5JK4A 3CFLA 1OLAA 2X7PA 3FVGA 1B52A 1TT1A 3TZAA 3MPKA 4M1VA 1FQFA 2O84X 1YAEA 2O7IA 4YZZA 1PEBA 4JWXA 4X48A 1B7HA 3Q28A 1II5A 3KJ7A 2DYXA 2ZNUA 5KCJB 1PB8A 1B2HA 3MZ1A 2XXVA 5K2YA 3U1OA 1MXZA 3GBBA 1I6AA 2ZYKA 3DP4A 3K6XA 5ITPA 3VLUA 5I59A 3H6UA 4YKJA 3IB2A 3N94A 1NNTA 3UIFA 4ZEDA 5L8DA 4IO6A 1RYOA 1NNKA 2B3BA 5FHMA 2NVUB 4QRZA 5I57A 1LFGA 3KSXA 2D21A 5JTYA 1VE4A 3KBRA 3OSQA 3JZJA 1FTOA 1LFIA 1SW4A 1PB9A 1FQEA 1TFAA 1MY1A 4H5GA 5L9SA 1IITA 1F9BA 1SYHA 4POXA 5I84A 5I2NB 3V8XB 4OENA 3MZBA 5DTBA 1Z7NE 3IOVA 5H8HB 2ONKE 3O29A 4JWOA 2RC9A 3KGCA 1LAGE 2QS1A 2R71A 3EHTA 1LFHA 2ZNSA 4LONB 2RC8A 4HS7A 2O69A 4L17A 4OHNA 3PD9A 1VR5A 5AA4B 4RA1A 1MDQA 3V89B 4WXJA 3UK4A 4YKPA 4R9FA 4ELRA 4OQOA 4RJZA 5AA3A 3T66A 1AH5A 4OWDA 5I56A 1FTMA 1OQGA 3SEVA 4RNSA 4MLVA 2I0BA 2QS3A 4ND9A 4OFLA 5I2KB 3HV1A 2VGQA 4PQJA 2IEEA 1AMFA 2Y7KA 3EHSA 2Z8EA 2O7UA 3RQTA 4NF6B 4OETA 4R75A 1B51A 1A54A 1JQFA 4R74A 3RY3A 4ONYA 2A5SA 4AB5A 4OESA 4OTEA 1NH8A 2UYFA 4BDQA 3S2VA 3TPAA 1URGA 1A8FA 4N07A 1ZIUA 1FQCA 2F35A 2P0SA 3VFJA 1B46A 3BBRA 4LQ5A 3B7DA 2GRVA 1LCFA 3QAXA 3OO9A 4ZDMA 3TUSA 5EHSA 2XXHA 1JEVA 3RT8A 2X26A 4QFNA 3QXMA 3EQ1A 1XT8A 3VV5A 4Q0CA 1M5FA 1ZBMA 2F34A 4DIGA 2PYYA 4G8HA 3UP9A 4GIZA 2W7YA 1LAXA 3O97A 1M5BA 3FIRA 3O6HA 1GTKA 5HM4B 3K6WA 2NUVA 5H8QB 2Z23A 1GVCA 3C31A 2ZXTA 1I6QA 3JV9A 4RPOA 3IAZA 1Y20A 1CE2A 3WAEA 4RY1A 2M8CA 3O6GA 1GV8A 3S9EA 4POWA 4YMBA 3TDJA 1ZMGA 1DTGA 1ZKBA 3O66A 4NMYA 4I9DA 1I6BA 1URDA 3FVNA 4IO4A 2HQ0A 1XOCA 4F1VA 3HO7A 4IGRA 1BLFA 5IKBA 3FASA 2I3WA 2I48A 2XXYA 2I3VA 3OXNA 4LATA 5TP9B 3IOTA 3T22A 4PFWA 1P1QA 3PGFA 2DE3A 2QPQA 3CFXA 4JBZA 3W9WA 3K2DA 3FV2A 1EU8A 4LP2B 4N6PA 4ZEBA 1B32A 4F2OA 2NWJA 3Q26A 4IY5A 5BWJA 3FV1A 2XXWA 3RGYA 3CG3A 1B0LA 4FORA 3S9MC 4R6KA 2QMXA 1JETA 4KCDA 3IX1A 2OWTA 4OEUA 4R2FA 3FJGA 3H6TA 3ODBA 3TELA 5KCJA 4Q5TA 4OYVA 1LGBC 3M8UA 2Z8FA 1RKMA 4IGTA 2XD3A 1EH3A 4R73A 3FJ7A 3Q25A 4ZE9A 1N7WA 3RN8A 2QMWA 1MM6A 4NE4A 4H65A 3FUZA 2Y7IA 4X1BA 2HAVA 2KLFA 3K00A 4MLQA 3R6UA 5H8NB 4OXVA 3QSLA 4NWCA 2Y7RA 1DOTA 4OERA 1LAFE 2QRYA 1JNFA 4NF4B 2DXRA 4GOTA 4QFOA 2XXTA 1MQHA 5I2NA 1OMPA 1AOVA 5H8HA 1B5IA 4PFTA 1MY2A 2V3TA 2XD2A 3RLFE 4GRKA 3UGWA 4MH5A 3U92A 1WODA 3PUVE 3MPLA 2XXIA 3FVKA 1N84A 3E13X 1ANFA 1B1XA 1HSLA 1A40A 4JB7A 3FVOA 3K4UA 4YB7A 4RPNA 5CBRA 1PC3A 1ZU0A 1Y1MA 3SEUA 1FCKA 5AA4A 1B7ZA 1HSJA 3PPNA 2E1SA 4WEPA 4K3FA 3Q29A 3VVDA 1JW1A 2OK2A 2GHAA 3G3KA 1Y4CA 3T9HB 2REGA 3DELB 3K0VA 4H67A 3RT6B 3QUFA 1B7UA 3RNNA 3W15C 5I2KA 4HCWA 5ICTA 1MY3A 3B6TA 2HXWA 4QSEA 1IUDA 3IJXB 3DM0A 1A55A 1Q35A 2PX1A 4XXUA 4U1OA 4NF6A 1ZLQA 4G68C 3LSLA 3MBPA 3G3IA 4FEBA 3VXCA 2ONRA 3LUYA 3TODA 5IAIA 4TQUQ 5K2XA 1NKXA 2XXQA 4OVJA 5KZTA 2RCBA 3G3HA 1MG1A 2F7AA 1HSEA 2P1SA 2CMOA 1IQ7A 1TWYA 2H9BA 3OOAA 3MVXA 1URSA 3CVGA 3VLVA 4O3CA 3OSRA 1BP5A 4PETA 2Q89A 2F6GA 1BKAA 3H06B 3KFMA 3MP8A 4Q30B 3ONMA 3V5AA 3IB1A 2XX8A 4GVOA 3N6TA 5DEXB 1MXXA 2P2AA 1IEJA 3RPWA 1R1NA 3HHGA 2DVCA 5H8QA 3TFLA 3B6QA 3BKIB 4GXSB 1D9YA 4IO3A 3SEXA 1JW5A 2OLBA 1MQJA 4O3AA 3CFZA 1NNPA 2R6GE 4YICA 2O1MA 2ONSA 2FA7A 1P1NA 4QF9A 2Y7PA 3PUXE 3PPPA 3C9HA 1MPDA 1US4A 2FNCA 4EUOA 3KOTA 4OFOA 4PFYA 4E0XA 1B5HA 3LC8A 3PV0E 3PMXA 5TP9A 2DE4A 4BDOA 1PB7A 3WAFA 1FQAA 2RF1A 2OBGA 4EQBA 1MXWA 2QJEA 2NOOA 3PMWA 4PE5B 1PDAA 5L9OA 1M5EA 4MF3A 1EZ9A 1B40A 2H5YA 4R2BA 2I0CA 3Q27A 4N13A 1Y4TA 2F97A 5TPAB 2XX9A 2G93A 1DPEA 2A5TB 3DP8A 1Y1ZA 3O6IA 1NNFA 4JDFA 1YTVA 4XTCQ 5DVIA 2Q8JA 1O64A 4HCYA 3E4RA 4H6DA 2O68A 3L6HA 3LBSA 3GLBA 3PUWE 4LUBA 2RKMA 4BDNA 1POY1 3MP1A 2D5WA 2QS4A 2O6AA 5H8NA 4F3PA 2VD3A 2YJPA 3SERA 3C35A 3M3FA 3MW0A 4IO5A 3S9LC 4NF4A 5JEIA 1MH3A 1XHYA 1QVSA 3C34A 1TXFA 3EPEA 3ILTB 2V93A 3F11A 2ABHA 4YU0A 1YPNA 4ELOA 5CMCA 2F7BA 5M2VA 1DPPA 1QJMA 3CRBA 2X7QA 4C1TA 3H03A 3GZGA 3DP6A 3ECRA 4ZZEA 4XKNA 1FW0A 3G3JA 3O28A 2HZLA 4AQ4A 3DLNA 1KWHA 1JVXA 4JWYA 1B3LA 1LSTA 1R9LA 3N5LA 3FXQA 2UVIA 2RC7A 3V83A 2OZZA 4IB2A 2Q88A 3KG2A 3IR1A 2H4IA 4NTLA 5CC2A 2GHBA 3B6WA 4FIMA 1NFTA 4G77A 5L9MA 1B9JA 3PD8A 1USYH 2Q2AA 3OMBA 1VFDA 1FQDA 1LBBA 2IA4A 1QUIA 1J1NA 3GBAA 2H98A 1SI0A 3SEWA 4DXCA 1SDXA 2F78A 2HEUA 5FHOA 3VDFA 3SKPA 2BJJX 4ZEFA 4U23A 2Q9TA 1TFDA 4HW8A 1SQYA 2OWSA 4KYSA 2QSXA 4ZS9A 2VOZA 3VE1B 3W9VA 3A09A 1B4ZA 1UQWA 4BDRA 4RK2A 4ESXA 3C33A 4KHZE 2PMSA 3K01A 3ZSFA 1SD3A 1DMBA 3S4UA 3AXFA 5CMKA 4FJPA 2OCUA 5A5XB 4F39A 3IB0A 3PUZE 3H7MA 4QFKA 3TQLA 2NXOA 1FQBA 1I69A 1LCTA 4ZEKA 4IY6A 4LVQA 4BLAA 3CG1A 1IIWA 5DEXA 5EYFA 1D4NA 1B05A 4GQOA 3KJTA 3EF7A 2DP8A 4YMAA 1R6ZA 4KD5A 3LSXA 3BFUA 2I49A 4M4GA 2DXYA 4XKQA 4NF5A 3KN7A 3H3GA 4H0WA 5FTIA 4FATA 2ZNTA 4H1XA 5DYHA 3E9XA 5DVJA 3PU5A 3THIA 4F18A 2DOJA 2UXAA 1PBPA 4O3BA 1PBQA 1NMUA 1H44A 3IOUA 3RUMA 3FZVA 4U22A 5AA2D 5CMMA 4KI0E 4UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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