3CG1A

Crystal structure of p. furiosus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
EVTLIVFHAGSLSVPFQEVEKEFSEYAERNLGIKVSFQDEASGSVMAVRKVTDLGRKADVIGVADYTLIPQLLIPNYTDFYVLFATNEIVIAFTDKSRYVEEMKSNPDKWYEILAREDVRFGFSDPNQDPCGYRSLMVIKLADLYYGKEIFKELIEENTNIYSNGTQIYAPKEITVNPGKIVIRPKETDLLGLVESGSIDYIFIYKSVAKQHNLSYITLPSEINLGDFSKEKFYGQISITLGSTGKTIKAKPIVYGVTVLKDAPNREVAIEFLRYLLSENGKRIFEKNHQDFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords UPF0100 protein PF0080
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 105
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A01
2X26A 4N07A 3ZS6A 3H6WA 1JEVA 2H5YA 1OQHA 4OFLA 5KCJB 4OEVA 3QK6A 4F22A 4IO6A 1B05A 1QVSA 1B1XA 2DE4A 2ZYNA 3K0VA 3KG2A 3C4MA 3CR9A 1QULA 4FAJA 1SW1A 4PE5B 4R75A 3V8XB 5J1DA 2RINA 3PUXE 1FCKA 1JW4A 2IEEA 3Q26A 2Y7KA 3KJTA 5IAIA 2NWJA 3ZSFA 2O1LA 2Y7WA 2QS1A 3MZBA 3FXRA 1GTKA 4RYAA 5FTHA 1FQCA 1SI0A 3IB2A 3HHGA 4JWOA 3BFTA 4IY5A 1MY0A 3O97A 4YB7A 3KOSA 3DLNA 4U1ZA 3LC8A 3K6WA 5CMMA 4ISUA 4WEPA 3AXFA 4QFPA 3VXBA 3OO6A 1N3XA 4GL8A 4F3PA 4H0WA 1LB9A 1RYXA 3L6HA 4BLAA 4ZEDA 3USDA 2UVIA 2NUVA 2A5TA 3RT6B 4P11A 4THIA 4IY6A 1IUDA 2XD2A 3TTLA 5I59B 1SW4A 3EHUA 2X7PA 3B6WA 4AQ4A 4C0RA 3MVYA 5I2KA 1II5A 4C1TA 5FTIA 4LZ5A 3VXCA 2XX8A 1US4A 4WKMA 1OQGA 4GL0A 1POY1 4YAHX 5I2NA 1MXXA 4KYSA 3KEIA 3O6IA 4F1YA 5A5XB 4DXUA 4NWCA 3S9EA 1URGA 4AB5A 5HM4B 1P1QA 4NMYA 1URDA 1B40A 5L9SA 2ZMBA 3GBBA 2NVUB 4G8MA 1WVJA 3FVKA 3V5AA 1EU8A 4U21A 1ZIUA 1EZOA 2XXRA 5AA2D 3QAXA 1IEJA 4OQOA 1JETA 3PGFA 3HCQA 4MH5A 1YPNA 2I4CA 4TOZA 2P1SA 2AL5A 1M5CA 1Q35A 2GRVA 2WKYA 3T66A 3E9XA 2Q2AA 3F11A 4H8JA 5CI5A 4I8CA 3LUYA 5F7VA 4UACA 4F1VA 4R6YA 4R6HA 2DXYA 3RUMA 4GF8A 1B3GA 3JYRA 1NFTA 4PP0A 1DSNA 4QFNA 5AA4B 3IL1B 5TU0A 3N94A 2ONSA 1MM6A 4PFWA 1UTHA 1GGGA 1M5DA 2NOOA 5H8SA 1N76A 3N26A 4OFJA 3SEYA 3PMWA 2D3IA 3FD3A 3M3FA 1I6BA 4OETA 4XKRA 1N84A 5B7DA 1QJMA 5I57A 3TPAA 4F2OA 2XXTA 1HSLA 1KWHA 1UQWA 4KPTA 1MQIA 1B58A 2VHAA 2F5XA 3QYTA 4HS7A 3T22A 4GD5A 4DZ1A 1HSEA 3LR1A 3U92A 1MXZA 4OMBA 3D4GA 2HZLA 3EHSA 3QXMA 3SKPA 1RYOA 1Y1MA 1VE4A 1JVYA 1BIYA 4G68B 3G7WA 1H44A 3TODA 2O69A 1FQAA 3HPIA 2FNCA 3UK4A 1MY3A 5TPAB 1B3FA 2PVUA 4ONYA 4XIGQ 2RF1A 3MPLA 4X1DA 2I0CA 3Q28A 3KJ7A 2F35A 5KZTA 3IOTA 3K6XA 1Y3PA 1QUJA 3PD9A 1B46A 1O64A 1R9LA 3RPWA 1OMPA 4F1UA 2Z23A 3S4UA 5DT6A 1Y3NA 4FORA 4RK9A 4LZ8A 4X1BA 3TCGA 3OD7A 3IAZA 5L9OA 2E1SA 1Z7NE 2KLFA 2UVHA 3O29A 3RGYA 3MVXA 3LSWA 1IZ1A 3EN3A 3MW0A 2HAUA 2QJEA 4JDFA 1MXUA 3RN8A 1R1NA 1SVXB 2O7UA 2REJA 4FJPA 4EQ7A 3QIMA 1ZBMA 2PBWA 5I56B 3G3IA 4XTCQ 3PUYE 4YZZA 2M8CA 3RT8A 3C9HA 3M3KA 4Q0CA 4QSDA 3H6UA 3KFMA 3EPEA 4LA9A 1NL5A 3OSQA 4POWA 2Q8JA 1B4HA 4R9FA 4NF5B 4P0GA 4HCYA 2ABHA 3T93B 2OZZA 4NE4A 1MXVA 2AYSA 1MQJA 3U8QA 1MS7A 2B3BA 3LSLA 4FEDA 4PETA 3S2VA 1LFGA 3RTFB 4IO5A 1USYH 4ZEBA 5IKBA 1GR2A 1RKMA 1M5FA 2DVZA 1SW2A 4KFQA 1BKAA 5DEXA 4RPNA 2CZLA 3K1MA 4ZEIA 3U72A 2RCAA 2V3TA 2DP8A 3VLVA 3A09A 3PMXA 4N6PA 1B5IA 2UVGA 2OLBA 4G77A 2ALUA 1A8FA 2B65A 5AA3A 1FW0A 2QS3A 2ONRA 3H4ZA 2PYYA 3M3LA 1IQ7A 2Q2CA 1YCJA 2W7YA 1LFHA 3SEUA 1H76A 1MQGA 1S9TA 3MZ9A 4DCYA 3IB0A 1LFIA 3E4RA 5H8FA 4MLQA 3HSTA 2H99A 1FTKA 1HSJA 4OTEA 3TEPA 1P99A 1JW1A 3I3VA 1TFAA 4NEDA 4L17A 5I58B 5AA2B 3K1NA 4M4GA 1XVXA 3KN7A 4BDLA 2F7CA 1B3LA 1B9JA 1FQEA 2ZYMA 3DP6A 4YB6A 5JTYB 3W9WA 3GBAA 2Y7RA 1LCTA 4WXJA 1BLFA 2Y7IA 4NF4B 2QRYA 1N3WA 2VD2A 4PFTA 3PPQA 5HPQA 5JEIA 3Q29A 2HCAA 4OEUA 4ELRA 4KR5A 2DSFA 2RCBA 1B3EA 5LOMA 4LONB 3TCFA 4KHZE 4RJZA 3G3JA 5HBCA 1F9BA 4DXCA 4JBZA 3KSJA 3C33A 4FATA 3MP1A 2PT2A 4BDRA 3DP4A 2VD3A 4OWDA 3HHFA 1MDQA 2I4BA 1M5BA 2OBGA 2X7QA 5BUUA 3FIRA 3VVEA 3OSRA 3VLUA 3G3KA 2O51A 4MFIA 5DVFA 3IK6B 3SESA 2VGQA 5TP9B 2ZNTA 3TTRA 4OZ9A 1J1NA 2P2AA 3MUQA 2DS9A 3BBRA 4IO3A 4JSDA 4YU0A 4XXUA 4GFRA 3VV5A 2F8DA 3G3FA 3VLWA 5DVJA 3LSXA 4I62A 3UIFA 4F29A 3P7IA 2YLNA 3MPKA 2O6AA 3FUZA 3HV1A 2F34A 3FGSA 3SETA 4FEBA 4R9GA 3FV2A 3GZGA 5CMKA 2QPQA 4O3AA 1VR5A 1WDNA 4QHQA 5AE4A 1NKXA 1Q1KA 2DWIA 4G4PA 1MPBA 3K01A 5ICTA 1POTA 3PU5A 2XX7A 1H45A 3CVGA 2GFEA 4JB7A 3HO7A 2DVCA 4JWXA 4HTGA 4ECFA 3K1PA 1N7XA 4EXLA 3TDJA 4F3GA 1MY4A 2F7BA 4QFLA 4BDQA 2I0BA 4HCWA 1US5A 2P0SA 4Q30B 3CI8A 1FTLA 2I58A 3O6GA 4YMAA 5KCJA 3IORA 1H43A 4ESWA 4H8IA 1URSA 4ZEKA 1AMFA 4JSOA 1LAGE 2I3WA 1ANFA 1Y3QA 3K00A 1UTBB 2PMSA 4G68C 2THIA 4Q5TA 3EF7A 4X9TA 1O63A 4WEDA 4OHNA 4EUOA 3TFLA 4U2RA 3PPRA 4ZZEA 3OEKA 2Y7PA 3TUSA 3N6TA 2Z8EA 4KCCA 1QUKA 4I9DA 4F3BA 3UN6A 4OERA 4POXA 1DOTA 2DWJA 3MVWA 1EZPA 1MPCA 4TQUQ 3TYHA 1XOCA 1MPDA 2DYXA 2F97A 4QSCA 5B70A 1DTGA 3R6UA 4U23A 1ZTYA 2Z8DA 1Y9UA 1N0TA 1SBPA 1D9YA 2V84A 3FATA 3O28A 3QUJA 4LATA 4R2FA 3W9VA 3V83A 3Q27A 4H65A 2DE2A 4RNSA 1ZMGA 2DOJA 5CMCA 3TMGA 3H6VA 2G29A 3C32A 2RC8A 3CFLA 1B5HA 2O68A 2Q89A 4M1VA 5I59A 3ILUB 3PPPA 3MZ1A 4QFOA 3RTWB 2Y84A 3MWBA 2F6PA 2I3VA 4Q8RA 1B52A 3K2DA 2E0SA 4FECA 4H5GA 3RQTA 2ZNUA 4GXAA 1LB8A 1JNFA 1NNTA 5A5XA 4OENA 3MVZA 3T9UA 4R2BA 1FQDA 1XVYA 2RKMA 4P0IA 1SDXA 1JW5A 2UYEA 5H8HB 3IR1A 3FJMA 2V3UA 3A3UA 4JWYA 3PMVA 4MLVA 2H9BA 3IOVA 4EDPA 4YICA 3RNNA 2B3FA 3FJGA 4E0WA 5H8NB 1B51A 2XXXA 4C1UA 4NF6B 1DTZA 3K6UA 4E0XA 1MM7A 3I5OA 3UA8A 2QL3A 1PBPA 2DXRA 1JVXA 4DIGA 5FHMA 1O7TA 1JQFA 1A40A 1L5TA 4MF3A 3IX1A 3TCHA 3A3CA 4G8HA 4OVJA 1NMUA 2IA4A 1N04A 2OJTA 2DE3A 3KN8A 5AA4A 4GLIA 3PUVE 1ZJLA 3ILTB 4TLMB 3DP8A 4FE8A 4EQBA 2XXUA 1R6ZA 2R71A 4XKNA 2XX9A 4PQJA 2GHAA 4I1DA 3K02A 1UIUA 1B4ZA 3ONMA 4ZE8A 1D3KA 3JZJA 3WAFA 1IXIA 3DM0A 1SW5A 1TXFA 3VVDA 2CMOA 3FXUA 4F19A 1B7HA 3ZKKA 3RLFE 3CSBA 4R72A 2I6EA 3RY3A 5K2XA 4DE8A 3I6VA 1IXHA 1OVBA 3SEVA 1NNFA 1OIBA 1IXGA 1LBCA 1ZLQA 4LUBA 3MBPA 3CRBA 4H1XA 4RK2A 3UORA 2O7IA 3SEWA 4G68A 4QSEA 1B2HA 4PFYA 3W15C 2R9JA 3KN3A 3JV9A 5TPAA 2D21A 3PUWE 3M8UA 3CSGA 1I6QA 5ITPA 3KSXA 2A5SA 3SDFA 2A5TB 1PB7A 4GOTA 4OYVA 5L9MA 3MC2A 3TQLA 4BDMA 1SD3A 4ESXA 4YKPA 5DTBA 3VE1B 3KBRA 4F18A 1MH4A 1SI1A 3B6TA 1B5JA 3T96B 1B1HA 1NNKA 5I2KB 3OMBA 2XD3A 3UP9A 2REGA 2ONKE 2HZKA 4UA8A 3U93A 5I2NB 1IIWA 1A55A 4BDNA 2O84X 4LVQA 1VFDA 2D5WA 3B6QA 4IGRA 4NF6A 4F31B 3CFXA 5I56A 4MBPA 5ISUA 1NNPA 3TTNA 2YJPA 2XXIA 3UGWA 4IB2A 2ZYKA 1GV8A 3Q25A 4G2ZA 4H5FA 4NF5A 2Z8FA 4NWDA 2AIXA 3MP8A 4GXSB 2DQVA 3H3GA 4LQ2A 3MJNA 3TKDA 3IB1A 4NTLA 5FHOA 3N6UA 2UXAA 3MP6A 2Q88A 3FVGA 3PV0E 1B7ZA 2V25A 2YPNA 2XXVA 2Z22A 2OCUA 1FTMA 2F6GA 3LBSA 1OLAA 5ELVA 4NF8B 3IOUA 2RC7A 4OESA 1T0KA 5EYFA 4ZZAA 3FXQA 4YMBA 1LAXA 1UTHB 2OK2A 4AB6A 3E13X 4ZDMA 4IGTA 3LSFB 4TLLB 2VOZA 1S50A 3L6GA 1ZKBA 3FZVA 3S9LC 2H4IA 1EH3A 5CM6A 5I57B 2XXWA 1P1UA 3PUZE 4R73A 3IO4A 2DWAA 2OWTA 1Y4CA 1YTVA 4Z7EA 2ZNSA 4GIZA 1LGBC 2GHBA 3QUFA 2XXHA 4QRZA 1TWYA 2XXYA 4ND9A 3EHTA 1PC3A 4ZE9A 1LBBA 4YKJA 3T9HB 1PEBA 4H6DA 3H6TA 2I49A 5I58A 5AA2A 3IJOB 3OXNA 2VP1A 1QKAA 3K4UA 1XT8A 3OO9A 2BJJX 3TELA 5AA1A 1LAHE 1AOVA 4DDDA 3K6VA 1MDP1 1QW0A 5JTYA 1FTOA 4QF9A 4IO2A 4EF2A 1BTJA 4JXIA 4NF4A 1ELJA 1B32A 1LCFA 3C36A 3ZKLA 3OOAA 1A54A 3D4CA 4F39A 5CMBA 3FVOA 3N5LA 3O9PA 3U1OA 3H03A 4GRKA 5KDTB 1VFEA 5H8QB 2UVJA 4YB5A 4H67A 3B7DA 2R6GE 3T9XB 4QFKA 3TQWA 3GXAA 2H25A 4LQ5A 4DXBA 1LSTA 4O3BA 1B0HA 3IJXB 5K2YA 2O1MA 4GVOA 3THIA 4G8NA 1R9QA 4RY1A 1ZU0A 3E3KA 1MG1A 3VDFA 5BWJA 5CBSA 5TP9A 2ZYOA 5CBRA 1FQBA 3OO7A 4FIMA 3EQ1A 4RXLA 1BP5A 2PX1A 4NF8A 1CE2A 3OENA 1PB8A 2QS2A 1CB6A 1P1NA 3PPOA 4BDOA 1N7WA 4GQOA 2OWSA 3C35A 4KYDA 5F1QA 4U1OA 3O6HA 1TFDA 2NXOA 2XXPA 4XKQA 3G3HA 1A8EA 3ODBA 1UIVA 2QS4A 3QSLA 3FV1A 5ITOA 2FYIA 3TTMA 1MQDA 1D4NA 5DEXB 2ANJA 4RA1A 4YKKA 3KGCA 1B0LA 1OLCA 1QUIA 1FQFA 1MQHA 1MXYA 4EXKA 3MAMA 2ESNA 1PDAA 3U94A 2AL4A 1FTJA 2G93A 4EF1A 2F7AA 1PB9A 4F2QA 4R6KA 2GH9A 4KCDA 3C31A 1IXCA 3R7XA 3IOWA 5H8FB 2UYFA 1DPEA 3VFJA 2HQ0A 4ELPA 1MY1A 4K3FA 4X48A 3C34A 2V3QA 4EQ9A 2FA7A 3TZAA 1QKBA 2ZXTA 5EHSA 1A7LA 4LZ7A 2HXWA 3KOTA 5KDTA 2QMWA 5H8QA 1MY2A 1SQYA 3R26A 1UTBA 1MXWA 3DELB 3FASA 1VSOA 3SERA 4Z0IA 2XXQA 4DCXA 4R74A 1DMBA 5I84A 1AL3A 4ELOA 3O66A 5DYHA 4KYEA 4IO7A 3OEMA 1ATGA 4ZEFA 3OO8A 4ZS9A 1P1WA 1AIVA 2QMXA 2F78A 5FHNA 1PBQA 1I6AA 3H06B 3T9VA 4OFOA 3PPNA 3G3GA 3WAEA 3VVFA 3CFZA 1D9VA 3IO6A 5L8DA 1H3DA 3ECRA 5CC2A 2DWHA 1MH3A 1GVCA 3SEXA 3O2AA 5ICQA 5DVIA 2F36A 1SYIA 2H98A 2V93A 2I48A 4ELQA 3TAJA 5JK4A 3CG1A 1LAFE 5CRYA 3BFUA 1NH8A 3CIJA 1TT1A 1SYHA 3TTKA 1M5EA 1NH7A 3FJ7A 2LAOA 4OXVA 2Q9TA 4U4XA 4DLDA 4U22A 2HAVA 4YKIA 2XHDA 3V89B 4U4SA 4F3SA 3H7MA 4KQPA 1MRPA 1B6HA 4KD5A 1WODA 2HFBA 1I69A 1EZ9A 1XC1A 4N13A 2PT1A 3PD8A 1IITA 1S7YA 5H8HA 1LLSA 3S9MC 3BKIB 4IO4A 4LP2B 1B7UA 1Y20A 4ZECA 1Y4TA 4XKPA 1JEUA 2HEUA 1XHYA 4O3CA 2QSXA 1USYE 1DPPA 1A99A 3HN0A 3GLBA 5H8NA 1B3HA 3OELA 1P1OA 4HW8A 1OVTA 1YAEA 4GWOA 4RPOA 1AH5A 1XS5A 1Y1ZA 1Z7ME 3KZGA 4PFUA 4KI0E 3CG3A 3MQ9A 5EHMA 3S9NC 2RC9A 3FVNA 5M2VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X26A 4N07A 1FRPA 1QGXA 3ZS6A 2ZZXA 3H6WA 1JEVA 2H5YA 1OQHA 4OFLA 5KCJB 4OEVA 5I7IA 3QK6A 4F22A 4IO6A 1B05A 1QVSA 1B1XA 2DE4A 2ZYNA 4X04A 2FHYA 3K0VA 3KG2A 4GWSA 3C4MA 3CR9A 1QULA 4FAJA 1SW1A 4PE5B 4R75A 3V8XB 5J1DA 2RINA 3PUXE 1FCKA 1JW4A 2IEEA 3Q26A 2Y7KA 2ZZWA 3KJTA 4GX6A 5IAIA 2NWJA 3ZSFA 2O1LA 2Y7WA 2QS1A 3MZBA 3FXRA 5EQ7A 2VPOA 1GTKA 4RYAA 5FTHA 1FQCA 1FBGA 1SI0A 3IB2A 3HHGA 4JWOA 3BFTA 4I3EA 1MY0A 4IY5A 4IR8A 3O97A 4YB7A 4JVCA 3KOSA 3DLNA 4U1ZA 3LC8A 3K6WA 5CMMA 4ISUA 4WEPA 3AXFA 4QFPA 3VXBA 3OO6A 1LBZA 1N3XA 4GL8A 4PDHA 4F3PA 4H0WA 1LB9A 1RYXA 1NUYA 3L6HA 4BLAA 4ZEDA 3USDA 2UVIA 2NUVA 3E78A 2A5TA 3RT6B 4P11A 4THIA 4IY6A 2QVUA 4XEQA 1IUDA 2XD2A 3TTLA 5I59B 1SW4A 3EHUA 2X7PA 1LBYA 1FBCA 3B6WA 4AQ4A 4C0RA 3MVYA 5I2KA 1II5A 2PCRA 4C1TA 5FTIA 4LZ5A 3VXCA 2XX8A 1US4A 4WKMA 3LUZA 5DW8A 1OQGA 4GL0A 1POY1 4YAHX 5I2NA 1NUWA 1MXXA 4KYSA 3KEIA 3O6IA 4F1YA 5A5XB 4DXUA 5IZZA 4NWCA 3S9EA 1URGA 4JVIA 4AB5A 5HM4B 1P1QA 4XFEA 4NMYA 4OVRA 1K9YA 4O94A 1URDA 1B40A 5EQ8A 4GX3A 5L9SA 2ZMBA 3GBBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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