3CG1A

Crystal structure of p. furiosus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
EVTLIVFHAGSLSVPFQEVEKEFSEYAERNLGIKVSFQDEASGSVMAVRKVTDLGRKADVIGVADYTLIPQLLIPNYTDFYVLFATNEIVIAFTDKSRYVEEMKSNPDKWYEILAREDVRFGFSDPNQDPCGYRSLMVIKLADLYYGKEIFKELIEENTNIYSNGTQIYAPKEITVNPGKIVIRPKETDLLGLVESGSIDYIFIYKSVAKQHNLSYITLPSEINLGDFSKEKFYGQISITLGSTGKTIKAKPIVYGVTVLKDAPNREVAIEFLRYLLSENGKRIFEKNHQDFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords UPF0100 protein PF0080
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
molecule tags Transport protein
total genus 105
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cg1A01
1ZJLA 3TTKA 3RTWB 4NF5B 2XXWA 5AA2A 1T0KA 1LAFE 1SBPA 3M3FA 3VXBA 4XTCQ 4KD5A 5FHNA 2VP1A 2X7QA 3E9XA 5AA2D 4X1DA 2OZZA 3TTRA 3H03A 4PFTA 1N7XA 4Z7EA 1II5A 3LUYA 4HW8A 1MXXA 1RYOA 2H5YA 4RA1A 3EHUA 1JVXA 4N07A 1NNFA 2HZLA 1MDP1 3PMVA 2XD3A 2O84X 4X48A 2X7PA 3CR9A 1AMFA 5H8HB 2DWAA 5KDTB 1SVXB 4BLAA 3V8XB 3EHTA 3HN0A 1JETA 3C4MA 2DVCA 1LAXA 4R75A 4F2OA 5CMCA 3WAEA 2E0SA 4U1ZA 2ONRA 3QUFA 3RTFB 4H67A 4LZ8A 2HAVA 1SQYA 1M5BA 2DYXA 3IOUA 3L6HA 2OJTA 2B3FA 5H8FA 3ECRA 4PFUA 3HSTA 1J1NA 4JSDA 1B4HA 3T9VA 1MS7A 3OO8A 4LZ7A 1ZLQA 3Q27A 1NMUA 4R9FA 5AA4A 5I57A 3O28A 3GLBA 2AIXA 2OBGA 1FTLA 1MQHA 3SETA 4FJPA 3A09A 4XKPA 3DLNA 3E13X 4OESA 3M3KA 3LC8A 3B6QA 3S9LC 3C33A 3QSLA 1PEBA 3W9WA 3ZS6A 5FHMA 5DVFA 1EZPA 4YB6A 1SDXA 3FV2A 1AIVA 4H1XA 5AA1A 1TFAA 1IXHA 2PT1A 1MRPA 1LFIA 3JZJA 2QPQA 5I59B 1PDAA 3TFLA 4TLMB 2Q89A 1EH3A 2ALUA 1B2HA 5JTYA 1Y4CA 4KYSA 1O63A 5CC2A 4G8MA 2OWSA 3MWBA 3N94A 1MM7A 1Y1ZA 3IX1A 5TPAB 3IOTA 1ATGA 3LR1A 1QUKA 2REGA 2XX9A 3SEYA 1OIBA 3B7DA 2Z23A 4KQPA 5CMMA 3KN8A 3CIJA 4O3AA 3DELB 4ZS9A 4BDLA 3IB2A 3KN7A 3K0VA 3K00A 3H7MA 5H8FB 2H4IA 1VFEA 4XKRA 1MG1A 1B3LA 4JBZA 3S9MC 4OMBA 1MDQA 1Q1KA 4GL8A 1QUJA 1PC3A 2O7UA 1B3HA 3V89B 3SDFA 4ZZAA 3MVZA 4I1DA 2XD2A 2F34A 5ITOA 4ONYA 3U92A 5I57B 1UTBA 1TWYA 4GVOA 4IO4A 2VGQA 3MPKA 4ZEFA 1A99A 3VLUA 4C1UA 1PB8A 2G29A 1M5DA 4FEDA 3TQWA 1DOTA 2D21A 2F5XA 3WAFA 3CFXA 2Y7WA 3ILUB 4YMBA 3O66A 3PUWE 3GXAA 2F35A 3T9UA 3OO7A 4JWYA 4ZEDA 3K6VA 1B5IA 2ZYMA 3BKIB 5ITPA 1FQAA 1AOVA 3QAXA 1MY2A 1IXGA 2DXRA 3N26A 1XT8A 3FD3A 5ELVA 4MLVA 3HO7A 1MPDA 1YAEA 2UVGA 1LGBC 3S4UA 2A5TB 1JW5A 4O3BA 2ZYKA 4ZDMA 2XXPA 3KOSA 1ANFA 4JB7A 1B3FA 3H3GA 4QHQA 5DYHA 3U72A 3IJOB 3VDFA 1HSEA 2I6EA 4RPOA 4U2RA 3PMXA 1H3DA 5CBRA 3K1MA 3RN8A 4OHNA 4OQOA 4NF8B 2Y7IA 3N5LA 3PUZE 4ELPA 3FJ7A 4XXUA 4DZ1A 1OMPA 2AL4A 5DTBA 4OFOA 3DP4A 3KJ7A 3PUYE 1SYIA 5L9OA 2O1LA 1UTBB 2F6PA 4WEPA 3FJMA 4YKJA 1JEVA 4F1YA 2XXUA 1Y4TA 1GTKA 2FNCA 1I6QA 2P1SA 2QS1A 3SKPA 4UA8A 2IA4A 2YLNA 1DSNA 1XVXA 1PB9A 4R9GA 1US4A 1BKAA 1UTHA 5CRYA 3FXQA 2UYFA 4LATA 2UVIA 1SW5A 4I9DA 5I56A 3T9HB 4JDFA 1IXIA 3KBRA 1N84A 1BLFA 1B05A 3KEIA 1XHYA 4MH5A 3JV9A 1B7ZA 2I4CA 5ISUA 3O6IA 1R9LA 4LP2B 4HTGA 2V3TA 4N13A 3MBPA 2Q8JA 4FEBA 3MZ9A 4G2ZA 4GFRA 3I3VA 1P1NA 2QSXA 1MPCA 4ELOA 4U23A 3FJGA 2ZNUA 3G3JA 4KPTA 2DXYA 4MF3A 3W15C 1Y3QA 3T9XB 5EHMA 3CFLA 2RCAA 1M5FA 1B3EA 5H8QA 3TZAA 3VLVA 5H8NA 1MXUA 3KSJA 1PBPA 3MJNA 1SI1A 3CVGA 3C9HA 1Q35A 3CSGA 1LCTA 2DE4A 3O6HA 2AL5A 2QRYA 4LQ5A 3RNNA 4ZZEA 1H45A 2HXWA 2O68A 2O1MA 4ISUA 1WODA 1ZIUA 1TFDA 4RJZA 4WKMA 3O9PA 4ND9A 2RINA 3PPOA 4R6KA 2F7BA 3OELA 2D5WA 3C34A 1NH7A 3ODBA 3Q28A 1DPEA 3R26A 2OLBA 2O6AA 1AH5A 5I58A 4Q8RA 2Z22A 3LSWA 4EF1A 2ONKE 3TCGA 1PB7A 5I56B 1Z7NE 1EZ9A 1ZBMA 2GHAA 3K4UA 5I84A 2KLFA 1OQGA 2VOZA 3VVDA 3HCQA 3IJXB 3VVFA 3T96B 3FIRA 4THIA 4ELQA 1P1QA 4AB6A 1US5A 1SI0A 4R74A 2UXAA 3MC2A 3TAJA 1Z7ME 2THIA 3PPPA 1B52A 2HFBA 3K6WA 4PFWA 3VE1B 1N3WA 3TTMA 4G8HA 3ZKKA 1IXCA 3S9EA 4YKKA 2XX8A 1BIYA 1EZOA 1I69A 1RKMA 4IB2A 2DWIA 4DCYA 1B1XA 2XXHA 4MLQA 3O6GA 2PBWA 2I48A 1MXVA 4GIZA 2PT2A 3CG1A 4QFNA 5FTHA 2F97A 1MY0A 2O51A 4FECA 3IOVA 2OWTA 4IGRA 2XXXA 1IEJA 1O7TA 4G4PA 5H8NB 1EU8A 1XVYA 4R2BA 4UACA 5I2KA 3ZKLA 4KR5A 3H6WA 2QS3A 4FORA 4GXSB 3EQ1A 2ABHA 1MY4A 4H5FA 3IR1A 3OO9A 4EDPA 2O7IA 4YICA 4YB5A 2Y7RA 2XHDA 1WDNA 5AA2B 3U94A 1XC1A 1CB6A 2IEEA 1IITA 5B70A 5F1QA 1N3XA 2R71A 4ZE9A 3R6UA 4O3CA 5I58B 1VFDA 1URDA 3BFTA 3DP6A 2DWJA 3IL1B 5F7VA 4F22A 3O2AA 4ZEKA 2Q88A 1N7WA 3T66A 1M5CA 1MPBA 4EQBA 3TKDA 3VV5A 2Y7PA 4TOZA 2YJPA 4ESXA 3N6TA 2ONSA 2F36A 4R6HA 1NNKA 4YAHX 2XXQA 1Y3NA 4M1VA 5AA3A 4H65A 3B6WA 3SEUA 3K01A 2ZNTA 4G8NA 2QJEA 4ZEIA 3TUSA 3PMWA 3CG3A 2HAUA 2H98A 3EN3A 2P0SA 4QFPA 3Q25A 4JXIA 4ZEBA 3ZSFA 3A3UA 3FATA 3I6VA 3UGWA 1VR5A 3K1PA 1MQDA 1AL3A 4LZ5A 1YCJA 4XIGQ 5AA4B 1LAHE 3PPNA 4Q30B 4FATA 5I2KB 3HHFA 2I3VA 1A55A 1A7LA 3E4RA 3FZVA 3VXCA 4E0XA 1MQGA 2Z8EA 1POY1 2PYYA 1SW4A 1QVSA 3O97A 2DS9A 4EF2A 5TU0A 3IOWA 2ZNSA 3G3KA 1XOCA 3IO4A 3MPLA 3DP8A 3LBSA 4F1VA 1BTJA 1MH3A 4GF8A 2QS2A 3CI8A 2HEUA 3T93B 4F18A 4GQOA 4IO5A 3JYRA 2HCAA 5JTYB 1NKXA 1B1HA 4PETA 4LONB 1D9VA 4OZ9A 3K1NA 3K2DA 5L9SA 1H76A 2FYIA 1B3GA 4KCCA 4QFOA 5A5XA 3OSRA 1CE2A 3OD7A 2GFEA 3MZ1A 1S9TA 1UIVA 1URGA 1B32A 1DMBA 1B40A 5HM4B 3RT8A 4BDQA 3VLWA 4G77A 5FHOA 1IZ1A 2E1SA 3R7XA 2PX1A 1MY1A 1A40A 4IY6A 3IB0A 3MUQA 2I3WA 3TELA 4F39A 4KCDA 4F3SA 3ONMA 2CZLA 2Z8FA 1I6BA 3FV1A 4OERA 3LSFB 2NVUB 4NTLA 4OTEA 5H8SA 2UVHA 1Y9UA 2RC9A 3H06B 4F3GA 4NEDA 4NMYA 1HSLA 1NH8A 4LVQA 1H43A 3KJTA 3QUJA 3PGFA 1B51A 3LSLA 5CMBA 1QUIA 1VSOA 1FTJA 1O64A 1JVYA 3OEKA 2XXYA 1FQFA 4L17A 2OCUA 1OVBA 3Q26A 4NF5A 4KFQA 1FW0A 4PP0A 4P0IA 4BDRA 2HZKA 4KYEA 4TLLB 4NWCA 3MVYA 2PMSA 1B7UA 2VD3A 4RNSA 1TT1A 4DDDA 1B4ZA 1QJMA 4F3PA 4DXBA 5J1DA 3PD8A 3GBBA 2UVJA 4X1BA 1B9JA 1I6AA 1SYHA 3CRBA 1N04A 1QKBA 4C0RA 4U4XA 1FQEA 1R9QA 3VFJA 2W7YA 4OYVA 2QMXA 1GVCA 1QW0A 4EUOA 3K6UA 5A5XB 3MW0A 2DP8A 5H8HA 2GRVA 4POWA 1SW1A 1MQJA 2OK2A 1B5JA 3S2VA 4ELRA 4NF6A 3RLFE 3T22A 3M8UA 5M2VA 1YPNA 1IUDA 3AXFA 2REJA 1IIWA 4JWOA 3OMBA 4F29A 4N6PA 3CSBA 2ZYOA 4P0GA 3PUVE 4YB7A 4Z0IA 4PE5B 3LSXA 5DEXA 4OFLA 5K2YA 1SW2A 1R1NA 2PVUA 1USYE 1D9YA 1HSJA 2GH9A 2DQVA 5JK4A 4HCYA 3GZGA 3S9NC 3UK4A 4QSCA 4LA9A 1QULA 3G3IA 4LQ2A 1S50A 4EQ7A 3FASA 3Q29A 4E0WA 4EXKA 4IO7A 3IK6B 3C31A 5LOMA 4G68C 4ESWA 1ZTYA 1FTKA 2D3IA 1B58A 1L5TA 4M4GA 1P1WA 3THIA 4C1TA 4FIMA 5K2XA 1PBQA 4H8IA 1UTHB 5TP9A 3MP8A 3OENA 1LBCA 2H99A 4BDOA 4FE8A 2V93A 4IY5A 3FUZA 2RKMA 4YKIA 4KHZE 2V84A 1P1OA 5I59A 2CMOA 3SERA 3KFMA 4IO3A 3MVWA 3QIMA 4PFYA 1P1UA 4HCWA 1DPPA 5I2NA 5DT6A 2XXTA 3KOTA 5DVIA 1GGGA 3FXRA 5HBCA 3G3HA 1WVJA 2F8DA 3BBRA 1SD3A 4H8JA 1LFGA 3UORA 4RK2A 5TPAA 2GHBA 3V83A 2Q2CA 1H44A 4QFKA 3KSXA 4GWOA 1MY3A 5KCJA 4NF6B 1NFTA 3MZBA 3MP1A 4GLIA 1Y20A 4QFLA 1QKAA 4OEUA 3OOAA 4GL0A 4R2FA 3HV1A 1MXYA 3TQLA 3TMGA 1OLCA 3SEVA 4RK9A 5H8QB 4PQJA 3HPIA 1LLSA 5DEXB 4DE8A 3EPEA 3TPAA 2I0BA 3A3CA 3BFUA 4F2QA 3H4ZA 3IB1A 1NL5A 1B6HA 3OSQA 2NWJA 3P7IA 2NXOA 1D4NA 2ZYNA 4JSOA 2I58A 1LCFA 4KI0E 4OWDA 2QL3A 1MXWA 2ZMBA 2QS4A 4U22A 4DXUA 1UQWA 3MVXA 5KZTA 3MAMA 4OEVA 2V3QA 2DWHA 2F78A 2F7AA 4I8CA 3C32A 1LBBA 3G3FA 2I49A 1ELJA 5L9MA 1RYXA 5DVJA 4OVJA 4H6DA 1BP5A 5TP9B 4QF9A 2XX7A 1URSA 3TTLA 1N0TA 2F7CA 3QYTA 3W9VA 2ZXTA 2M8CA 3KZGA 4R72A 3OEMA 2ANJA 4Q5TA 4YMAA 2F6GA 5ICTA 3K02A 3I5OA 1TXFA 3SESA 5I2NB 2DE2A 4IO2A 4U1OA 3H6VA 4QRZA 1GV8A 4DLDA 4BDNA 2ESNA 1OVTA 4HS7A 5CM6A 3M3LA 2A5TA 3QXMA 3E3KA 1USYH 2DOJA 5KCJB 3U93A 3DM0A 3F11A 4AQ4A 3N6UA 1MXZA 5CI5A 4XKQA 2Z8DA 1R6ZA 2VHAA 2RC8A 3MP6A 4FAJA 4R6YA 4AB5A 3FGSA 3H6UA 3PV0E 3PPQA 2G93A 4OENA 4DIGA 3EF7A 5ICQA 3H6TA 4NF8A 3TDJA 3TTNA 3RT6B 1DTGA 5JEIA 4QSDA 4BDMA 4YKPA 1A8FA 4P11A 2HQ0A 4GXAA 1JW4A 1M5EA 1FTOA 2DSFA 3FVGA 5FTIA 1DTZA 2DVZA 3EHSA 2P2AA 2FA7A 2NUVA 3B6TA 3UN6A 4GD5A 4GRKA 5L8DA 3PUXE 1B0HA 4ZE8A 4DCXA 5CMKA 4Q0CA 1F9BA 4H5GA 4TQUQ 2AYSA 4OETA 1FQDA 1Y1MA 4F3BA 1MQIA 3RPWA 1B5HA 2XXRA 1VE4A 1JNFA 2O69A 3SEXA 2Y7KA 1NNTA 2I0CA 3IAZA 1KWHA 1P99A 3FVOA 2B3BA 5B7DA 2RCBA 4RYAA 4I62A 2XXVA 3KG2A 2V25A 3O29A 4NF4A 3C36A 1NNPA 4G68A 3TEPA 5AE4A 3TODA 5HPQA 1D3KA 4NWDA 4IO6A 4WEDA 1JW1A 1GR2A 3OO6A 2BJJX 3IO6A 2LAOA 3RY3A 3UA8A 4RY1A 4WXJA 4U21A 1FTMA 4DXCA 2DE3A 4GOTA 1MH4A 2I4BA 1JEUA 3G7WA 3GBAA 1FQCA 3CFZA 3KGCA 3K6XA 3OXNA 2UYEA 3ILTB 4NE4A 2Y84A 1B46A 3KN3A 4X9TA 3QK6A 2R9JA 1ZU0A 1LFHA 5IKBA 1LSTA 3D4GA 5CBSA 4XKNA 3U8QA 3PD9A 3RUMA 1FCKA 2XXIA 1ZKBA 4U4SA 1MM6A 3MQ9A 4IGTA 4RXLA 1YTVA 3USDA 1A54A 1B7HA 3TYHA 2R6GE 1OQHA 2RC7A 2X26A 2WKYA 3D4CA 4JWXA 2Q9TA 5EHSA 4KYDA 3FVNA 1A8EA 2A5SA 4H0WA 2Q2AA 3PU5A 3FVKA 2VD2A 3G3GA 1B0LA 1ZMGA 4ZECA 4F31B 3TCHA 2YPNA 4NF4B 1LB8A 4G68B 5KDTA 1LB9A 4F1UA 1Y3PA 3L6GA 3VVEA 4R73A 4LUBA 2QMWA 3RGYA 5IAIA 1JQFA 5BUUA 4ECFA 2H9BA 4F19A 3UIFA 2V3UA 3V5AA 4QSEA 3SEWA 3U1OA 3RQTA 1S7YA 4OXVA 2RF1A 1OLAA 4EQ9A 3IORA 1POTA 3FXUA 1FQBA 4RPNA 4YZZA 3HHGA 4YU0A 5EYFA 2H25A 1LAGE 3UP9A 4EXLA 1IQ7A 2B65A 4POXA 3PPRA 4MBPA 5BWJA 1XS5A 3TCFA 4MFIA 1UIUA 3C35A 4OFJA 1N76A 2NOOA 4K3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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