2I49A

Crystal structure of apo form of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
398
structure length
398
Chain Sequence
MPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
total genus 140
structure length 398
sequence length 398
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i49A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i49A01
2A5TA 2ZYNA 2QJEA 4OEUA 2PT1A 1IITA 1DPEA 3CFLA 3C31A 4IO6A 4ZEFA 4XKNA 3VVDA 4LZ8A 4ONYA 2OBGA 3VV5A 4ZEKA 3GBBA 4EQ7A 4DZ1A 1NNTA 3K6VA 3RPWA 1M5CA 2P0SA 1DMBA 1MY3A 4GVOA 1B3HA 2Q89A 4GD5A 4MH5A 3V5AA 1P1OA 3C32A 5I2NA 2Y84A 3D4CA 5JK4A 3PPRA 3CFZA 3H03A 3TTNA 4JDFA 2THIA 4JB7A 3SETA 3OO9A 4YB5A 2ZMBA 3LSWA 2REGA 1FTKA 1M5FA 2ZNTA 4HS7A 3GXAA 5I57A 1N7XA 1NH7A 4NF5A 3SEWA 1ZTYA 2Z8DA 1IIWA 3BFUA 2DE3A 5CI5A 2XXRA 4YICA 4GIZA 3M3FA 3E9XA 5H8NA 3P7IA 4LUBA 3Q28A 1MQIA 5A5XA 3Q29A 1QUKA 3V83A 1DPPA 2ONKE 4BDQA 1B05A 2O84X 1FTMA 3K6UA 4GQOA 2X7PA 3TKDA 3FXUA 3H6VA 2XX9A 4F2QA 1POY1 2A5TB 1Z7ME 2RCBA 4N13A 2HCAA 3DELB 3LSFB 1MDQA 2PMSA 1VFDA 4QFLA 2QSXA 3G3HA 3VXBA 2AL5A 4FEDA 4ZEBA 3SERA 2ANJA 3MP6A 1B58A 3E13X 3FV1A 1NL5A 2UVJA 4OFLA 1MXUA 3T22A 4P0GA 4G8HA 3IOTA 3O2AA 3S2VA 1I6AA 3UA8A 4DIGA 1D4NA 5CBRA 3MZBA 1NNFA 4GXAA 1XS5A 3OSQA 4IB2A 1GVCA 1SW5A 5AA1A 1QUJA 3KBRA 4ZECA 2O68A 4YMBA 4ZZAA 5I58B 3FUZA 3TQLA 1XVYA 2D21A 3BBRA 2DE4A 4H67A 1US4A 2CZLA 3TELA 2ABHA 1MXZA 1P99A 4Q5TA 5H8QB 1MY2A 4KPTA 1B0LA 4ESXA 5I57B 3PGFA 4U2RA 1MPBA 3T9UA 1T0KA 3TTRA 3H3GA 1LFHA 2DE2A 2O6AA 1PBPA 1JW1A 1O7TA 1YTVA 1JVXA 4RK9A 1URSA 4H8IA 2BJJX 3OEMA 4P0IA 5I59A 3THIA 1IXIA 4DDDA 1SI0A 2R6GE 3IL1B 4YB7A 3H4ZA 2F78A 3JV9A 4OVJA 1MQDA 3U1OA 4PE5B 4R6HA 3KGCA 3A3UA 4JSDA 3FATA 3FV2A 3IB2A 1B3FA 1BLFA 2Z22A 1MXWA 2H25A 4EDPA 3KOTA 5KCJA 3O6IA 2RCAA 1TFAA 3IK6B 3K0VA 4OWDA 3FVNA 4YZZA 1LCTA 5I84A 5ITPA 4P11A 4JWXA 4EXLA 4OMBA 2X7QA 2RKMA 1B3LA 2V3UA 2OCUA 4OZ9A 1VE4A 2NUVA 3C34A 3DP4A 1OMPA 5FHOA 4ZZEA 1I6QA 1UIVA 3OENA 3EN3A 3H6WA 1SW1A 2YJPA 3IJXB 2Q2CA 2Z8FA 3K02A 2HAVA 2DOJA 2I48A 1S7YA 3MVWA 4MLVA 1UIUA 3MUQA 4F3SA 2R9JA 4WEPA 3DLNA 3KSJA 4JWOA 4AQ4A 1Y3PA 4C1UA 2WKYA 3AXFA 4C0RA 1LAFE 1MQJA 3FVOA 4KQPA 4BDRA 4XKPA 4GF8A 4KI0E 3GBAA 1LBBA 4TLMB 1UTBA 3MVXA 3K4UA 5FHMA 1RYXA 3ILTB 3PPPA 1TFDA 3IB0A 2XXIA 3W15C 2ALUA 2F6PA 2Q8JA 2VOZA 4EF2A 1R9LA 3QUFA 1USYH 4NF8B 3S4UA 3GZGA 3RTFB 3R26A 3VXCA 1B4HA 4IY6A 2D5WA 3CSBA 5TP9A 5HPQA 2HAUA 3G7WA 1OVTA 1XVXA 4GL8A 1S50A 2ONSA 1O63A 3ONMA 3U93A 4POXA 1AMFA 1MQHA 4NWDA 5J1DA 1FCKA 1MQGA 1LFIA 4ZE8A 2QL3A 2RC9A 5BUUA 4NF6B 3ZS6A 3SEVA 5DEXA 3N26A 4I8CA 1EZ9A 4POWA 2DVCA 4XXUA 1B5HA 1SD3A 2HZLA 5IKBA 2CMOA 4LONB 4KFQA 2F7CA 3HN0A 2QS4A 5KDTA 3VLWA 4LQ5A 3KN8A 4Z7EA 4YKJA 1J1NA 3PMWA 2UVIA 4GRKA 4X48A 2UYFA 5EYFA 1MM7A 1L5TA 1VFEA 3K2DA 5AA3A 3ZKKA 3O29A 3TZAA 3K6XA 3K1PA 2KLFA 1P1NA 4F1YA 3VLVA 4MBPA 1N04A 4LA9A 2DWJA 1NKXA 4RA1A 4DLDA 3S9EA 5CM6A 3SEUA 1FQDA 1SVXB 5ISUA 4FIMA 2UXAA 4U1OA 1CE2A 1UTBB 3QK6A 5ICTA 1B51A 3PUZE 4DXBA 1R6ZA 1Y1ZA 2Y7RA 3OD7A 5K2XA 4U22A 4EQ9A 1NFTA 1M5DA 4FEBA 2V93A 3UORA 2M8CA 3SEXA 2DYXA 2D3IA 4ESWA 1ZKBA 1IXCA 3FJGA 4QSCA 3K6WA 1A54A 5HBCA 3N94A 3U92A 1JEUA 2Q9TA 4H6DA 4GOTA 1P1UA 1ZIUA 4F39A 3ILUB 3S9MC 5F7VA 4QFNA 1LAGE 3TTKA 1B5IA 2I0BA 4R75A 5CBSA 3O6GA 1LBCA 1LGBC 3FD3A 2RC7A 2AYSA 3EF7A 4PP0A 3S9NC 4ELPA 2DVZA 1MM6A 4OFOA 4OERA 5AA2B 1JNFA 2O1MA 5I2KA 4KYEA 1NH8A 2F5XA 3RQTA 3TFLA 3IORA 4R74A 1EZOA 4NF4B 3R6UA 4THIA 4NE4A 3W9VA 3LUYA 1VR5A 4EUOA 4LVQA 5AA4B 5AE4A 3EPEA 1IUDA 4F18A 1UQWA 3FJMA 1AOVA 1B5JA 2HQ0A 1TT1A 4BDLA 4RXLA 2Y7KA 1JETA 4JSOA 3UP9A 1BIYA 4G68B 4PFUA 3C33A 2QS3A 2V84A 5JTYA 4KD5A 3T9XB 2XXWA 4BLAA 1B1XA 4PETA 4QFOA 1MDP1 1MY1A 2XD3A 4F19A 2PBWA 4XTCQ 3WAFA 3CI8A 1B3EA 1GGGA 5I56A 3TQWA 3LSLA 2XXVA 1SW4A 4I1DA 5HM4B 1DTGA 3C35A 2QRYA 1IXHA 2R71A 3K00A 2I3VA 2ZNSA 2V3TA 2YPNA 1ZJLA 3RGYA 3RT6B 4FJPA 3H7MA 1LAHE 5DVIA 3EHUA 1Y3QA 2Q88A 2F7BA 4WXJA 4O3BA 3KFMA 4MFIA 1NNKA 2VP1A 3G3KA 4ELQA 1QULA 1B7ZA 1UTHA 3N6UA 4OENA 3T96B 2VD2A 2XXQA 3Q25A 5EHMA 5ICQA 1OQHA 3TEPA 2XXXA 3I6VA 4OETA 4U4XA 3OO6A 5I2NB 4O3AA 4Q0CA 3PUWE 3H6UA 3IJOB 1A40A 4FORA 4PFYA 3PUXE 1LCFA 1IEJA 1EU8A 2O7UA 1Q35A 4QRZA 4HCYA 2OWSA 4HTGA 4RYAA 1AIVA 3EQ1A 1B7UA 1MY0A 2QMXA 1D3KA 3TMGA 4R2FA 1FQEA 4YMAA 4NF5B 4U4SA 2H5YA 2RF1A 2H99A 2GFEA 3RN8A 5H8NB 4LP2B 3E3KA 2DQVA 2PVUA 3TDJA 2REJA 4G68C 5K2YA 5A5XB 4GLIA 4QHQA 1HSEA 4HW8A 3IOUA 2I4BA 1H43A 1I69A 1SYHA 4H65A 1B0HA 1MH3A 2NOOA 3MP8A 4XKRA 1MY4A 1IXGA 3ECRA 4YU0A 5TPAA 4QF9A 1GR2A 3WAEA 1A7LA 4DCYA 4Q8RA 3OO7A 1IQ7A 4DXCA 3HSTA 5H8FA 5CRYA 5F1QA 2DSFA 3EHSA 3PU5A 4U23A 4H8JA 2GRVA 4MLQA 4RK2A 5DVJA 1B32A 3PPQA 3JZJA 3G3GA 4R6YA 4DXUA 3FXQA 3HHGA 2XXPA 1AH5A 2DXYA 2I0CA 1A8EA 1HSJA 3FXRA 1QKAA 2H98A 2PYYA 1QVSA 2XHDA 4LZ7A 4ELRA 3DM0A 4G4PA 2O69A 1TWYA 4ZEDA 1LFGA 3LC8A 1O64A 4IO5A 1XT8A 4F3PA 4G77A 3DP6A 3IOWA 1LSTA 1M5BA 3MBPA 3MC2A 2AIXA 3TPAA 5H8HA 1FTJA 1BTJA 1Y20A 1D9YA 4DCXA 2O7IA 3EHTA 3V89B 2HEUA 3QIMA 1NNPA 4ZS9A 4BDOA 4QSDA 3KJTA 1XC1A 3MWBA 5L9OA 3CFXA 1POTA 3KEIA 1MH4A 1YCJA 1TXFA 1WVJA 1B4ZA 3U72A 3U8QA 3T66A 4X9TA 4E0WA 3IOVA 4YKKA 2AL4A 1ZLQA 4OYVA 3CVGA 1URDA 1MPDA 1FTOA 5I59B 3MAMA 1Z7NE 4IO7A 2LAOA 3FZVA 4ZEIA 3R7XA 4H5FA 4DE8A 3F11A 3T9HB 2XXHA 3H6TA 4E0XA 3V8XB 2Q2AA 3CR9A 4UACA 1SW2A 4PFTA 1PC3A 3QXMA 4EQBA 1N84A 2QS2A 4N07A 3PPNA 1URGA 2FYIA 2F6GA 1SYIA 1JW4A 2HZKA 1MS7A 3OXNA 3QUJA 3VFJA 3HV1A 2UVHA 2XD2A 4RPNA 5KCJB 4U21A 2ZYOA 3USDA 3OELA 2DS9A 3JYRA 4K3FA 2P2AA 3D4GA 3TODA 2GHAA 1ZMGA 4IO2A 3RNNA 4YKIA 5CC2A 2OZZA 3N5LA 1H3DA 4UA8A 3ZSFA 3FVGA 1H45A 4JBZA 1B40A 1QJMA 3UN6A 2Y7IA 5ELVA 1USYE 4AB6A 3TYHA 4F3GA 3HCQA 1BKAA 2ESNA 3MPLA 1US5A 3RLFE 1YAEA 2QS1A 4R72A 1OLCA 3Q27A 5L9MA 4X1BA 4RNSA 2OK2A 5FHNA 4F1VA 1AL3A 5ITOA 1SQYA 2E0SA 1PB8A 4OHNA 5CMKA 2B3BA 2RC8A 2QPQA 3T9VA 4XIGQ 3BFTA 1LB9A 1QUIA 4F22A 4KCCA 1PB7A 4EF1A 1JVYA 1XHYA 1A8FA 5TP9B 3C36A 4NTLA 3FASA 3G3IA 4FE8A 3C9HA 2XX8A 1NMUA 4I9DA 1Y4CA 3RUMA 1IZ1A 4TLLB 1M5EA 2F35A 4EXKA 1P1WA 2F7AA 4LQ2A 3GLBA 4AB5A 4F1UA 1PDAA 4F31B 4F3BA 3IO4A 3RTWB 2DWHA 4PFWA 1LB8A 5DEXB 4OTEA 3PV0E 4N6PA 3PMVA 2GHBA 2OLBA 3TCHA 3MVYA 5I58A 2B3FA 3FGSA 3A3CA 4H1XA 4KHZE 1R9QA 5KDTB 3SKPA 3VLUA 2Z8EA 3VE1B 4F29A 5IAIA 4OXVA 5L9SA 5H8QA 1EZPA 1PBQA 4KR5A 2FNCA 3MZ1A 4M4GA 2IA4A 3HHFA 5LOMA 3N6TA 2Z23A 4QFPA 1GV8A 1SI1A 3M3LA 2I4CA 1XOCA 2V25A 3IAZA 1SDXA 1N3XA 2I49A 3G3FA 3TCGA 3FJ7A 5KZTA 1WDNA 3KN7A 2DWIA 2V3QA 1MXYA 2E1SA 1ANFA 3KN3A 2YLNA 4G8MA 3OSRA 3U94A 3RY3A 3I5OA 2VD3A 3CG3A 1D9VA 3B6QA 3O9PA 3T93B 3IB1A 2VGQA 1MRPA 3OEKA 4JXIA 4IGTA 1ZU0A 3LBSA 4Q30B 3PMXA 1HSLA 1S9TA 2O51A 3CRBA 2B65A 1JQFA 3KZGA 4FECA 2NWJA 4RY1A 3VDFA 4QFKA 2XXTA 4RPOA 3O6HA 1N7WA 1PB9A 3MZ9A 5DVFA 2XXUA 3UK4A 3IX1A 4LZ5A 3MW0A 2F97A 4OESA 4GWOA 1RKMA 3B6TA 2ZYMA 2Y7PA 3QAXA 3KG2A 4U1ZA 4H0WA 3M8UA 2VHAA 1FQFA 1FQBA 3H06B 2F36A 1KWHA 5I2KB 3SEYA 4QSEA 4L17A 1A55A 1DTZA 4IO3A 4MF3A 3DP8A 4YKPA 2H9BA 1JW5A 2P1SA 3HPIA 3O97A 1WODA 1B9JA 5CMCA 1VSOA 3SESA 3KSXA 4ZDMA 4XKQA 3OO8A 5JTYB 1QW0A 2F8DA 4IO4A 4OEVA 3TTLA 3K1MA 4R73A 1GTKA 1SBPA 5DTBA 2PT2A 2H4IA 3M3KA 4KYSA 4R2BA 4NF8A 5I56B 1Y1MA 3L6GA 4TOZA 4G8NA 1DSNA 5B7DA 1FQAA 2FA7A 3TUSA 3HO7A 3C4MA 1H76A 2Y7WA 1Y4TA 3OMBA 4YB6A 2ZNUA 2W7YA 3Q26A 4R9GA 3LR1A 3IR1A 4H5GA 4NWCA 4C1TA 3CSGA 3O28A 1B7HA 2DP8A 5B70A 1H44A 3VVFA 1UTHB 3TTMA 4NF6A 4Z0IA 3QSLA 4FATA 3E4RA 4GXSB 2ONRA 1B6HA 1MXXA 3ODBA 1OLAA 2X26A 3MQ9A 4M1VA 1B52A 2PX1A 1JEVA 3UIFA 3MP1A 3MJNA 2QMWA 2UVGA 5FTHA 1N0TA 4TQUQ 2DWAA 3MVZA 4IY5A 3ZKLA 2DXRA 5CMBA 5DT6A 2GH9A 3CIJA 2HXWA 2HFBA 4GL0A 1PEBA 2ZYKA 5EHSA 3I3VA 4R6KA 3KOSA 5AA2D 5M2VA 4OFJA 2G29A 3QYTA 4IGRA 3K01A 3S9LC 4WEDA 1CB6A 2I58A 2UYEA 2RINA 4KCDA 2F34A 2XXYA 4KYDA 5H8SA 1LLSA 2ZXTA 1FTLA 1YPNA 1B46A 3K1NA 1QKBA 3PPOA 4OQOA 4I62A 4ELOA 4ZE9A 1OQGA 2I6EA 4G2ZA 3IO6A 1Y9UA 1ATGA 3B6WA 3KJ7A 3UGWA 4ISUA 2XX7A 1BP5A 3CG1A 3BKIB 4RJZA 5CMMA 3PD8A 5TPAB 3SDFA 3PUVE 3FVKA 3RT8A 1MXVA 1RYOA 1B2HA 5H8FB 4R9FA 1DOTA 4X1DA 5TU0A 3G3JA 2NVUB 5BWJA 4JWYA 4F2OA 1OIBA 1FQCA 4PQJA 3FIRA 4FAJA 1MPCA 1B3GA 2NXOA 5JEIA 2IEEA 1R1NA 2OWTA 1F9BA 5AA2A 4O3CA 4BDNA 1II5A 1B1HA 3B7DA 2O1LA 3MPKA 4NF4A 3L6HA 1EH3A 5FTIA 4NMYA 1N3WA 1Y3NA 2I3WA 3PUYE 5H8HB 5AA4A 4HCWA 3W9WA 2OJTA 1LAXA 3TAJA 1ZBMA 1MG1A 4LATA 4G68A 4WKMA 1P1QA 4YAHX 5L8DA 4NEDA 1ELJA 1FW0A 5DYHA 4GFRA 4ECFA 4BDMA 3OOAA 1A99A 4ND9A 3O66A 1OVBA 2A5SA 3TCFA 3PD9A 1N76A 3LSXA 1I6BA 2G93A 3VVEA 1Q1KA 3A09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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