1I6QA

Formation of a protein intermediate and its trapping by the simultaneous crystallization process: crystal structure of an iron-saturated intermediate in the fe3+ binding pathway of camel lactoferrin at 2.7 resolution
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
ASKKSVRWCTTSPAESKKCAQWQRRMKKVRGPSVTCVKKTSRFECIQAISTEKADAVTLDGGLVYDAGLDPYKLRPIAAEVYGTENQPQTHYYAVAIAKKGTNFQLNQLQGLKSCHTGLGRSAGWNIPMGLLRPFLDWTGPPEPLQKAVAKFFSASCVPCVDGKEYPNLCQLCAGTGENKCACSSQEPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKDSTVFESLPAKADRDQYELLCPNNTRKPVDAFQECHLARVPSHAVVARSVNGKEDLIWKLLVKAQEKFGRGKPSAFQLFGSPAGQKDLLFKDSALGLLRIPKKIDSGLYLGSNYITAIRGLRETAAEVELRRAQVVWCAVGSDEQLKCQEWSRQSNQSVVCATASTTEDCIALVLKGEADALSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAESQQSPESSGLDCVHRPVKGYLAVAVVRKANDKITWNSLRGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGPLFKDTDSCRFDEFFSQSCAPGSDPRSKLCALCAGNEEGQLKCVPNSSERLYGYTGAFRCLAENVGDVAFVKDVTVLDNTDGKGTEQWAKDLKLGDFELLCLNGTRKPVTEAESCHLPVAPNHAVVSRIDKVAHLRQVLLRQQAHFGRNGEDCPGKFCLFQSKTKNLLFNDNTECLAKLQGKTTYDEYLGPQYVTAIAKLRRCSTSPLLEACAFLMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
publication title Protein intermediate trapped by the simultaneous crystallization process. Crystal structure of an iron-saturated intermediate in the Fe3+ binding pathway of camel lactoferrin at 2.7 a resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 171
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6qA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6qA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6qA03
3C32A 3VV5A 4BLAA 1A8FA 2XXUA 1QUKA 3PV0E 2V3TA 3PUYE 2ONRA 2H99A 1B2HA 4GQOA 1NNKA 3O6IA 4MFIA 4GVOA 1MQDA 3MP6A 1Y1ZA 3WAFA 2ALUA 4ZEFA 5L9OA 1N0TA 3GBBA 1MPCA 3FXRA 4KYSA 1XVYA 1MH4A 4G68B 4BDOA 5I56B 1VFDA 4ZE8A 5H8HA 1B58A 5JEIA 1Y3PA 3IL1B 1NL5A 4H5GA 1MM6A 2ZNTA 2O7IA 4EF2A 1ATGA 4BDLA 3VVFA 3Q26A 3GLBA 4RJZA 5DVJA 4H0WA 4OENA 3MPLA 4TLLB 1MXVA 1EU8A 3K1PA 3FASA 4WEPA 4X1BA 4BDMA 3G7WA 1MG1A 3PUWE 1FQDA 1YPNA 3DELB 4POXA 4OEUA 1FQBA 3KGCA 5FHMA 3VLVA 4KR5A 4NF5A 4O3BA 5CRYA 1VE4A 4RPNA 4OETA 1NH8A 4F1VA 1MY3A 1B7ZA 3OELA 1GV8A 1TFAA 4P0GA 1B32A 3S2VA 4H5FA 1JQFA 2Q8JA 4Q30B 4OWDA 1YTVA 4U1ZA 1FTJA 4OEVA 3OOAA 2NOOA 3B6QA 2V25A 3EHUA 2RC9A 1P1QA 3CIJA 1B4ZA 5H8SA 3BFUA 3KJ7A 2F5XA 1B0HA 4F3BA 4QF9A 2G29A 4LVQA 5F7VA 1PB8A 3RN8A 4OTEA 3TQLA 4DXBA 5DEXA 4JWOA 4IO3A 5DTBA 1RKMA 1DTGA 3TTRA 1LAGE 3BFTA 4DIGA 3PPOA 1I6QA 2A5SA 5I2KA 1MXXA 3U94A 4OZ9A 4DCXA 5TU0A 4BDNA 4XXUA 3KSXA 1SI0A 4AB6A 1LGBC 4Q5TA 2D5WA 1JW1A 4HS7A 4TLMB 3SEVA 1S50A 3SEYA 1ZTYA 2DQVA 3H6TA 3CVGA 4U21A 4KCCA 3T66A 5IKBA 4OHNA 3E13X 1JEVA 1MQJA 3OSRA 1JVYA 4EQBA 4G68C 1NMUA 1N76A 4XKRA 1FTMA 2V84A 4OYVA 5L9SA 4F29A 1FQCA 1IEJA 4Z7EA 1TXFA 2ONKE 3H6VA 2FYIA 3T9XB 3RUMA 3G3JA 4QFLA 3VE1B 2M8CA 2DXYA 2OCUA 1FTOA 1JEUA 3RLFE 1Y20A 4F19A 2BJJX 4IO5A 1QUIA 3FJMA 2ZNSA 2I0CA 1MQGA 1ZU0A 4X48A 5AA1A 1NNTA 1SYIA 3ZS6A 2Z22A 3QIMA 2QMXA 2QMWA 4FECA 4YMBA 5EYFA 3O29A 4H67A 2Q2AA 1R6ZA 5I59B 3FVKA 2I49A 1H43A 2XX9A 1B5IA 3KJTA 2OWSA 4RYAA 5ICQA 5AA2A 1LLSA 1FTKA 3RNNA 1SBPA 3G3HA 4UACA 4TQUQ 3TTKA 1JVXA 4Z0IA 4OFOA 2O51A 1IXCA 1URSA 4G8MA 3KBRA 4GXAA 1B05A 3IOWA 2VGQA 3UN6A 2XXPA 2HAUA 3TCHA 4F22A 1SDXA 3PPPA 4L17A 2ANJA 2UYFA 4GWOA 3ZKLA 4XKNA 3CFLA 2RCAA 1BP5A 4U23A 3BBRA 3H3GA 5KDTB 3TUSA 5L8DA 3MJNA 4NF8B 1WVJA 1EH3A 3R26A 4MLQA 1NNFA 3KG2A 2Q2CA 1QUJA 1Z7ME 2OK2A 3TCGA 4U4SA 3PMXA 2XXRA 3MVXA 1H3DA 5H8NB 4C1UA 2THIA 4XIGQ 3FATA 2OLBA 1MXWA 3G3KA 3OXNA 4NWCA 1NNPA 4N6PA 3Q29A 4LZ8A 5LOMA 3ODBA 5J1DA 4R9FA 1N7XA 4NF6A 1SW2A 2I4CA 4RNSA 4KYEA 4LP2B 4AQ4A 2DS9A 4YB6A 3CG3A 4E0XA 3FGSA 3CG1A 3U92A 4ESWA 2E0SA 1H44A 3B7DA 3QUFA 3IJOB 3A09A 3VFJA 3LR1A 3KEIA 1LBBA 1ANFA 2H9BA 5ITOA 4GLIA 1B7UA 2F36A 5HBCA 1SI1A 5ICTA 3B6WA 2DWHA 4G4PA 3KOSA 4WXJA 5HM4B 2XX7A 1ELJA 4O3CA 2QS4A 3TKDA 2RC7A 1OVTA 1XT8A 4U2RA 1JW4A 4FE8A 3Q28A 2B65A 1MY2A 4KPTA 3HHFA 1POY1 4R6KA 4EXLA 5I2NB 4KYDA 5CBSA 4GFRA 3K6VA 3HCQA 1S7YA 1UIUA 5DVIA 1XC1A 3D4CA 3K6WA 2ZYMA 1UTHB 1LAHE 5JTYB 3SKPA 2HAVA 3H7MA 4HCYA 1FQEA 3TPAA 4N07A 4H6DA 4RPOA 4YKJA 3KSJA 2ZMBA 4U4XA 5FHNA 2HFBA 1ZBMA 1P1NA 3IO6A 4OVJA 2XXHA 3P7IA 1A99A 3IORA 4DE8A 3QAXA 1L5TA 3DP8A 3ILUB 1D9VA 1MPBA 2Y7IA 2Y7RA 3EF7A 1RYXA 2H98A 5FTIA 5HPQA 4M4GA 2DWJA 4MBPA 2OWTA 2X26A 5I57A 4ZEIA 3C9HA 4RK2A 3MQ9A 3SERA 1MPDA 3MW0A 4EF1A 1MDP1 4C1TA 4DZ1A 3CI8A 3H6UA 3T22A 3K0VA 3TFLA 3W9WA 3VDFA 4G2ZA 4NF8A 5CM6A 3HN0A 3O97A 3ECRA 3V8XB 4LZ7A 3SEXA 3IB2A 4G77A 3VLUA 3FVNA 2XXWA 3LC8A 1MY1A 1ZMGA 1SYHA 4FEDA 4F2QA 1B3EA 2FA7A 1AMFA 4HTGA 2AL4A 1XOCA 4KFQA 5AE4A 3W9VA 3VLWA 2DYXA 3MVZA 5FHOA 1LB8A 4PFUA 3TTMA 4JXIA 2UVGA 1I6BA 1OIBA 4GD5A 1UQWA 2PBWA 2HXWA 3RY3A 3HV1A 4F39A 4NMYA 4N13A 5A5XA 4P11A 1D4NA 3HHGA 1LFIA 2XXTA 3CFZA 2GHAA 4IY6A 1R9QA 3I3VA 3QXMA 3ZSFA 3IJXB 3MUQA 4R74A 1DSNA 3M3FA 1US4A 2I4BA 4BDQA 2IA4A 4F3SA 4ZS9A 1VFEA 5CMCA 3CR9A 2OBGA 1A40A 4U22A 3LSLA 1Y1MA 3RQTA 2B3BA 5EHMA 5I2NA 3FXUA 5EHSA 4UA8A 4ONYA 4GL8A 3I6VA 4LQ2A 2CMOA 4I1DA 1VSOA 1UTHA 2UYEA 1QVSA 5JTYA 3FVGA 4ESXA 3MAMA 5ISUA 2QPQA 2DVCA 1MS7A 2A5TA 3PU5A 4G8HA 4RA1A 4FORA 3K1MA 4E0WA 2VD3A 4I9DA 2DE2A 3S9MC 4Q8RA 2P0SA 3K01A 3N6UA 1XS5A 4PFTA 3C33A 5CBRA 4QFOA 4THIA 4YKPA 3I5OA 4PFWA 4LQ5A 1MM7A 4PETA 3G3FA 2Y7KA 3LUYA 1URDA 4IY5A 1USYE 5K2XA 4G68A 2PVUA 5I56A 2ZNUA 2G93A 2O1MA 1NH7A 4I8CA 1P1OA 4YICA 4KD5A 3PUZE 3LBSA 2Q88A 4YKKA 3TEPA 1H76A 3OO9A 1R9LA 3EQ1A 3UIFA 5CC2A 3O6GA 3EPEA 1T0KA 4DDDA 5AA3A 4F1UA 3E4RA 3O66A 2V3UA 3OO7A 1LAXA 3UA8A 1MXYA 4NF4B 3U72A 2Y84A 4QRZA 3VVDA 3FUZA 3MVYA 1II5A 4OXVA 1VR5A 1B4HA 3LSXA 4IO6A 2XHDA 3QUJA 1US5A 3L6HA 4ND9A 2VOZA 2XXVA 2Z8FA 4KI0E 3MP8A 3PD8A 2HZLA 2DOJA 2P2AA 3CSGA 3U1OA 1B5JA 3O9PA 3SDFA 4YZZA 1URGA 3DM0A 3DP4A 3UP9A 3JV9A 3IK6B 2QSXA 2RKMA 4GIZA 4R9GA 4RY1A 3F11A 1UTBB 5I58B 1IXGA 3HSTA 2O84X 2D21A 2I6EA 1B3FA 4XKQA 5I84A 1PDAA 4DXCA 4OERA 1AL3A 2ESNA 4JB7A 4ZEKA 4JSOA 3MP1A 4NEDA 2REGA 3M3KA 3MPKA 2GHBA 4R75A 1IXIA 1I6AA 4QFKA 2O7UA 3TODA 4H8JA 3DP6A 3KZGA 2HZKA 5KZTA 1IZ1A 4ZEDA 4PE5B 1B3HA 1IUDA 2D3IA 3KN3A 5H8HB 4HCWA 4IO4A 4YB7A 3FJGA 1QKBA 2F7AA 1P99A 1N84A 3FV2A 4RK9A 3B6TA 1ZJLA 2XXIA 1O64A 2YLNA 2Z8DA 1KWHA 3IX1A 1B5HA 2V93A 1N3WA 1UIVA 3UK4A 2I3WA 3ILTB 4ZZEA 3HPIA 5IAIA 3T9UA 5H8FB 2O69A 2WKYA 4OMBA 1HSJA 1FQFA 4QFNA 4ZEBA 3SEUA 4NF5B 2PT2A 4H1XA 2ZYNA 4R6HA 1M5FA 2AIXA 2GRVA 2F35A 2F7CA 1MQHA 2F7BA 4OESA 3Q25A 1J1NA 1LCFA 2F6PA 2ZYOA 1BLFA 4NE4A 3MBPA 5B7DA 3L6GA 4QSCA 4NWDA 2RF1A 1MXUA 5CI5A 4YMAA 3FV1A 3N94A 3PPNA 3G3IA 3PMWA 4F3PA 3PUXE 1XHYA 2UVIA 1TWYA 1PBQA 2QS3A 3RTWB 4O3AA 3W15C 1SQYA 5I59A 3IB0A 4QSEA 1DTZA 1B46A 3TQWA 1LSTA 2F8DA 1IXHA 5JK4A 1Y4TA 1GVCA 3RTFB 2PMSA 4RXLA 3USDA 3H6WA 1FQAA 3T93B 3CSBA 2QRYA 4JWYA 3C35A 3FXQA 5CMMA 5DEXB 3TDJA 3RT6B 4F3GA 1B7HA 3V5AA 1B1HA 5F1QA 1Y3NA 3OENA 4TOZA 1Y3QA 1UTBA 5I58A 3U8QA 5I2KB 4QSDA 5KCJB 3H06B 2DXRA 3PPQA 4GOTA 2LAOA 5KDTA 3VVEA 4R2FA 4M1VA 1PEBA 1AH5A 1B0LA 2HCAA 4EQ9A 1ZLQA 3SETA 4FJPA 3KN7A 5H8QB 1OLAA 2Y7PA 3T96B 4ELPA 4YKIA 3FVOA 3UORA 4F18A 3EHTA 4R72A 1MY0A 2ABHA 5DYHA 3TTLA 2YJPA 3A3CA 2ONSA 3EHSA 2I48A 5H8NA 4PP0A 3K2DA 3VXCA 2DVZA 3OO8A 3FIRA 1USYH 4JBZA 4ELQA 1OMPA 3S4UA 3FZVA 4WEDA 4MH5A 3WAEA 1QKAA 4EUOA 1WDNA 2UVHA 1A7LA 1R1NA 2XX8A 5BUUA 5AA4B 2Y7WA 3TMGA 1NFTA 5H8FA 2R71A 3BKIB 4OQOA 1D3KA 4R73A 4EQ7A 2E1SA 3TAJA 1MDQA 1WODA 3G3GA 5TPAB 1DPEA 5CMBA 1MH3A 3K1NA 3D4GA 1SW5A 4H8IA 4EXKA 1OQHA 1TFDA 3H4ZA 5AA2B 3O28A 3U93A 1GTKA 2V3QA 3K4UA 4R6YA 3O2AA 1B3LA 3PMVA 2IEEA 1EZ9A 4F2OA 1B52A 1A55A 4JWXA 1B6HA 4U1OA 4GL0A 4QHQA 3EN3A 3KN8A 2QS1A 2PT1A 3IB1A 4IO7A 3UGWA 4ECFA 1LB9A 5AA2D 4LA9A 3V89B 2UVJA 4DXUA 1M5BA 2PX1A 2XD2A 2O6AA 1AOVA 4ZDMA 1PB7A 2Q9TA 4ISUA 2F78A 3CRBA 4AB5A 1JW5A 2P1SA 1RYOA 2CZLA 4PFYA 2DP8A 3FD3A 4LONB 5DT6A 4FIMA 1A54A 3GZGA 1N3XA 3AXFA 2AL5A 2DE4A 1N04A 4ELOA 2QJEA 2ZXTA 4IGRA 3ZKKA 1AIVA 3OD7A 2VHAA 5CMKA 2ZYKA 1BKAA 5KCJA 2QS2A 5L9MA 3CFXA 3IR1A 2RCBA 3DLNA 1QJMA 4YAHX 1HSLA 1PC3A 4FAJA 3OO6A 4ZE9A 3RT8A 4FEBA 3Q27A 1O63A 1OLCA 5H8QA 2RINA 4H65A 2Z8EA 3K6UA 1OVBA 3RGYA 4NF6B 2YPNA 3ONMA 4WKMA 3FJ7A 1MRPA 3E9XA 3H03A 2XD3A 4OFLA 1F9BA 2FNCA 3MWBA 1M5EA 5ELVA 3LSFB 1QULA 1CB6A 3SESA 1NKXA 1YCJA 1QW0A 3TCFA 5TP9B 3MZ9A 4K3FA 2W7YA 3O6HA 2H25A 2R9JA 3MVWA 4QFPA 3OEKA 1BTJA 2XXQA 2UXAA 2VD2A 4I62A 2GH9A 3C4MA 1Z7NE 1Q35A 4R2BA 3K02A 2I0BA 1SW4A 3GXAA 2XXXA 1LCTA 3MZBA 5AA4A 2NVUB 3N26A 1IQ7A 1I69A 3OEMA 1FCKA 2DWIA 3MC2A 4BDRA 1IITA 1ZKBA 4F31B 4KQPA 4PQJA 5B70A 5TPAA 4KHZE 3A3UA 1B40A 4ZZAA 1PBPA 4XTCQ 1ZIUA 2OJTA 4G8NA 3PPRA 4MLVA 3K6XA 1MY4A 1DOTA 4ELRA 1Y9UA 4LUBA 2I58A 1OQGA 2H4IA 2O1LA 5FTHA 4JDFA 1SW1A 1Y4CA 3KFMA 4OFJA 3N5LA 1MXZA 3R6UA 3IOVA 2Q89A 1YAEA 2HQ0A 4GRKA 4ZECA 4LZ5A 5I57B 3IO4A 1JETA 1IIWA 4LATA 4GF8A 4IO2A 3E3KA 3OSQA 4X1DA 3TTNA 2KLFA 3M3LA 5K2YA 1D9YA 1GR2A 2PYYA 2QL3A 5M2VA 1FTLA 2DSFA 3PGFA 1POTA 1TT1A 3SEWA 1M5DA 3MZ1A 4HW8A 1DMBA 3QYTA 4C0RA 1B3GA 2AYSA 2DWAA 4XKPA 4DCYA 3TYHA 4P0IA 2XXYA 1FW0A 1P1UA 3PUVE 3V83A 3LSWA 3C36A 2R6GE 3TELA 2HEUA 4EDPA 2F97A 1LFHA 1LBCA 1H45A 4JSDA 1PB9A 3T9HB 3R7XA 3N6TA 3HO7A 5A5XB 2GFEA 4POWA 1GGGA 1LFGA 2NWJA 3RPWA 1O7TA 3JYRA 2Z23A 1SVXB 4DLDA 3S9NC 1EZOA 5ITPA 5TP9A 4YB5A 3PD9A 3K00A 1HSEA 3C31A 4X9TA 4YU0A 4F1YA 3KOTA 4NF4A 2F6GA 2NUVA 3GBAA 2X7PA 2OZZA 2VP1A 3IAZA 3M8UA 3T9VA 1BIYA 1P1WA 1Q1KA 2NXOA 4IB2A 4MF3A 1B51A 4IGTA 3C34A 4KCDA 1DPPA 1EZPA 3JZJA 2X7QA 4Q0CA 2DE3A 3TZAA 3IOTA 3OMBA 3S9EA 1CE2A 1M5CA 3QK6A 2RC8A 1JNFA 1XVXA 2B3FA 3IOUA 4NTLA 3THIA 3VXBA 2A5TB 1SD3A 1N7WA 2O68A 2F34A 2H5YA 3QSLA 1S9TA 2REJA 4GXSB 3S9LC 1B1XA 1MQIA 1B9JA 2I3VA 1LAFE 5BWJA 4FATA 5DVFA 1A8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C32A 3VV5A 4BLAA 1A8FA 2XXUA 1QUKA 3PV0E 2V3TA 3PUYE 2ONRA 2H99A 1B2HA 4GQOA 4LN5A 1NNKA 3O6IA 4MFIA 4GVOA 1MQDA 3MP6A 1Y1ZA 3WAFA 2ALUA 4ZEFA 5L9OA 1N0TA 3GBBA 1MPCA 3FXRA 4KYSA 1XVYA 1MH4A 4G68B 4BDOA 5I56B 1VFDA 4ZE8A 5H8HA 1B58A 5JEIA 1Y3PA 3IL1B 1NL5A 4MNCA 5EYGA 4H5GA 1MM6A 2ZNTA 2O7IA 4EF2A 4I40A 1ATGA 4BDLA 3VVFA 3Q26A 2L5VA 1BK4A 3GLBA 4RJZA 5DVJA 4H0WA 1LBVA 4OENA 3MPLA 4TLLB 1MXVA 1EU8A 3K1PA 3FASA 4WEPA 1NUXA 4X1BA 4PGNA 4BDMA 2KQZA 3G7WA 1MG1A 3PUWE 1FQDA 1YPNA 3DELB 4POXA 4AS4A 3ISPA 4OEUA 1FQBA 3KGCA 5FHMA 3VLVA 4KR5A 4NF5A 4O3BA 5CRYA 4NX1A 1VE4A 1CNQA 4RPNA 4OETA 1NH8A 4N8YA 4F1VA 1MY3A 1B7ZA 3OELA 1GV8A 1FPGA 1TFAA 4P0GA 1B32A 3S2VA 4H5FA 1JQFA 2Q8JA 4MEVA 4Q30B 4OWDA 1YTVA 4U1ZA 1NI9A 1FTJA 4OEVA 3OOAA 2NOOA 3B6QA 3A29A 2V25A 3EHUA 2RC9A 1NV5A 4DI3D 1RDZA 1P1QA 1YZ0A 3CIJA 3LUZA 1B4ZA 5H8SA 4MMPA 3BFUA 3KJ7A 2F5XA 1B0HA 4FBPA 2QVVA 4F3BA 4QF9A 2XWKA 2G29A 4LVQA 5F7VA 1PB8A 3RN8A 4OTEA 3TQLA 2FIEA 4JVDA 4DXBA 5DEXA 4JWOA 3T0JA 4IO3A 5DTBA 1RKMA 1DTGA 3TTRA 1LAGE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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