2VP1A

Fe-futa2 from synechocystis pcc6803
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
RTINLYSSRHYNTDDALYDAFGEVNLIEASAEELIERIQSEGANSPGDILFTVDAGMLWRAEQAGLFQPVRSGKLNERIPENLRHPDGLWYGFTQRARVLYYSRDRVNPADLSTYEALADPQWRGKILVRPSSNVYNLSLTASRIAIHGEPETRRWLQGLVGNFARQPEGNDTAQIRAIAAGIGDVAIANSYYYIRLQKSTDPADQEVVEKVSLFFPNTGSGERGTHVNVSGAGVLKNAPNRDAAIAFLEYLASDDAQRYFAEGNNEYPVIPGVPIDPVLAAHGQLKGDPLNVSNLGRYQPDSARLMNEVGWQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Futa2 is a Ferric Binding Protein from Synechocystis Pcc 6803.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords PERIPLASMIC IRON-BINDING PROTEIN
total genus 114
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vp1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vp1A02
4GFRA 1I69A 4F39A 1GTKA 1ZU0A 3RQTA 4F22A 3Q29A 1B7UA 3EHUA 4GXAA 2F97A 2UXAA 3V8XB 1IXCA 1PB8A 5LOMA 5H8FA 4M4GA 4R2BA 4Q0CA 1USYH 3K2DA 4ZZEA 4R74A 2UVHA 3TFLA 1JETA 1D3KA 5FHMA 3W9VA 3VVEA 2QMXA 3MZBA 2XXHA 4IO4A 1YAEA 3GBBA 2P1SA 1HSJA 1N7WA 3TELA 1FTKA 4RXLA 1OMPA 3P7IA 1LSTA 4KYDA 3N26A 2NXOA 3IX1A 2ZYMA 2E1SA 4GL8A 2H5YA 2A5TA 1SD3A 2HEUA 5KCJB 2O69A 3TDJA 1UQWA 3ILTB 2H99A 2F34A 2RC9A 3C9HA 5H8SA 1NH7A 5L9OA 2DSFA 3O9PA 1P1OA 4XTCQ 3O6HA 1FQFA 1LFHA 2H4IA 3RUMA 3OSQA 2NWJA 1PBPA 5CMCA 2QS3A 2RKMA 2ZNSA 5KDTA 2R9JA 1QW0A 1DPPA 4F3SA 3H06B 4RPNA 3R26A 4PE5B 4AB6A 5CC2A 3M3LA 4EUOA 1PB9A 4LZ5A 5EHSA 3C32A 1SI0A 2QPQA 4FORA 2OJTA 3KOTA 5M2VA 2HAUA 1OVBA 1NNTA 5ICTA 5F7VA 4U23A 1TFAA 1MS7A 2UVJA 4MH5A 2F6PA 3DELB 4FAJA 3S9NC 1LAXA 1S9TA 3V5AA 5HM4B 3M3KA 3PV0E 1FQDA 3KEIA 1OLCA 2F6GA 4NE4A 3IOWA 1ZLQA 2XXQA 4DCYA 2I3WA 5I58A 4U1OA 3B7DA 3TAJA 2F7BA 5K2XA 3EPEA 4HCYA 2F5XA 3FV1A 4YB6A 3GBAA 1EZPA 1QVSA 1Z7NE 2ANJA 2F78A 3G3KA 2AL4A 3T96B 5B7DA 2XHDA 1J1NA 2RCBA 3E13X 2H9BA 3FVNA 4ELPA 4EXKA 4F3GA 2REGA 4X1BA 1MY4A 3MVWA 4C1UA 1Y3NA 1VFDA 3CSGA 4PFYA 4YMAA 3FD3A 5CMBA 5KDTB 3HV1A 2V3TA 2Q2AA 5AA1A 1LBBA 3H6UA 5TU0A 1FTJA 2Q8JA 3KOSA 1SBPA 4KD5A 1MXUA 3MAMA 4DCXA 3Q27A 1M5FA 2AL5A 2OK2A 2VHAA 1B1HA 2CZLA 3IJXB 2HFBA 4ZEBA 2R71A 2QRYA 1Y4CA 2O7UA 1IUDA 3BBRA 1Y3QA 4LP2B 3VXBA 1N84A 2Q9TA 1FTMA 5TP9A 2QS4A 3OEKA 4KCCA 3HHGA 2I49A 4PFUA 3H7MA 4R9FA 2IA4A 4GXSB 1PC3A 5I58B 4R75A 4G77A 1CE2A 3BFTA 3HHFA 3N5LA 3Q25A 4PFWA 3BKIB 4GWOA 3U93A 5CI5A 3S9LC 4YKKA 1MXZA 3JYRA 2O1LA 3T22A 4ZEDA 4KCDA 4OWDA 4TLLB 4XIGQ 3USDA 2XXVA 4NWCA 2AIXA 4HCWA 4OEUA 1H45A 1Z7ME 4DLDA 4OVJA 5CBRA 1GGGA 4EQ7A 2Z23A 3FXUA 4TLMB 2ZXTA 4LQ2A 3K1PA 1LFIA 4QFOA 2DQVA 3SETA 4ELQA 2OWTA 5I2KA 1LAFE 4I8CA 2ZNUA 3H6WA 1FQAA 2A5SA 2XXYA 2V3QA 3HCQA 4QSCA 3IK6B 2W7YA 1LCTA 3CVGA 4U22A 2VGQA 2DE3A 2PT2A 2XXUA 4UACA 3MVZA 4YKIA 4NEDA 4H6DA 4RK9A 3UK4A 1MXYA 4YICA 3CFZA 4NF5A 4ZEKA 2X7QA 5JK4A 3JV9A 1R9QA 3MJNA 1SYIA 4K3FA 4KFQA 1EZ9A 3KBRA 1SW1A 3IB2A 3H4ZA 4LUBA 1BP5A 1MDQA 1B3EA 3FGSA 5DVIA 4I1DA 4PQJA 2DWHA 4IO3A 3IOVA 3TQLA 4ZE8A 4JWYA 2D21A 2ONKE 1B0LA 1Y1ZA 1P1QA 1NNKA 1PDAA 4OZ9A 2VP1A 3ZSFA 4KYSA 1FW0A 5FHOA 1MQIA 4ZE9A 3E4RA 1MQGA 4OESA 3KN3A 3C33A 4H8JA 3TUSA 3SKPA 4AQ4A 5A5XB 3C34A 2YLNA 3G3FA 3TTNA 2FA7A 1A99A 1XT8A 5CMMA 1M5DA 3JZJA 2XX7A 4JBZA 4TOZA 2I4CA 1N3WA 2LAOA 1Q1KA 1Y9UA 2DOJA 3MQ9A 3MW0A 2CMOA 4G68C 2ESNA 4X1DA 3K01A 1UIVA 1AL3A 3VVDA 3VFJA 1MDP1 4NF5B 1GR2A 5CM6A 2I58A 3LSLA 1OQHA 1UTHA 1RYOA 3TCGA 1D9YA 2RC8A 4I9DA 4ZECA 4R6KA 4YAHX 1BKAA 1VFEA 4ONYA 3PUVE 4Z7EA 3ONMA 3HO7A 4F18A 3IORA 3T9VA 4XKQA 4IGRA 5DEXA 3W15C 4YKPA 4LQ5A 4N07A 1O7TA 2XXRA 3C36A 4POWA 2PYYA 2DVCA 3S9EA 1URGA 3RY3A 1SI1A 5AA2B 1XC1A 3KSXA 2O1MA 1S50A 1AMFA 1JW4A 3TTMA 1Y1MA 4F2QA 4Q30B 1IQ7A 2I4BA 1IZ1A 2PMSA 1MQDA 4O3CA 4U21A 3T9HB 2B3FA 3G3HA 1TXFA 3PGFA 1US5A 3RT6B 1AOVA 2D3IA 4GL0A 1NKXA 2OWSA 1XHYA 1EU8A 2ABHA 4OTEA 3W9WA 4NF4B 2V25A 3OO6A 4H8IA 1DPEA 1DTZA 5DT6A 3TQWA 4JWOA 1UTHB 1B51A 4PETA 4G8HA 2Z8EA 3FIRA 3KGCA 3C4MA 3B6WA 2B65A 4ISUA 3MPKA 1OIBA 2QJEA 2DWJA 4ZEFA 3OXNA 4GLIA 4U4SA 5H8HA 3D4GA 3DP4A 1JW5A 4HW8A 4PFTA 4H5GA 3O29A 1A8EA 1MY0A 4XKRA 3H3GA 4GD5A 4OFLA 3CFLA 1YCJA 3U92A 4QRZA 5JEIA 3FXQA 4DXCA 4YZZA 1Y3PA 4NF6A 5ELVA 2O68A 4MF3A 4G4PA 3L6HA 4RY1A 3UN6A 4IO6A 3OMBA 2H25A 1B3FA 4YKJA 3QSLA 2V3UA 4HS7A 4G8MA 4RA1A 2UYEA 3O2AA 3IB1A 3C35A 4IO7A 1QULA 1B1XA 1FTOA 3CR9A 3K02A 1LB9A 5DTBA 5H8FB 2QL3A 1T0KA 2ALUA 5JTYA 1N7XA 1MY1A 4WXJA 3IB0A 3O66A 1M5BA 1MPDA 1SYHA 1ZMGA 4JWXA 2UVIA 2I48A 2ONSA 1LLSA 3K4UA 1ZBMA 4OETA 2XD2A 4EQBA 2HXWA 4P11A 1B2HA 3SEYA 2F36A 5H8HB 4EQ9A 1WDNA 3VV5A 3GZGA 2Y7PA 2A5TB 1NFTA 1TWYA 4BDRA 1URDA 3EF7A 3ODBA 3A09A 1AH5A 3Q26A 4BDMA 5CBSA 3EHSA 1RKMA 2V84A 1ANFA 1ZTYA 3FJGA 4ND9A 3OSRA 3TCHA 3PUXE 1WVJA 1MM6A 1MQHA 2REJA 3G3JA 5L9SA 4P0GA 2GHAA 3TCFA 2Y7RA 1B7ZA 3PPQA 1H43A 1JQFA 5CMKA 4E0XA 4F29A 2ONRA 1USYE 4MLVA 1JEVA 3MWBA 2Z8FA 2PX1A 1XVXA 1A40A 1POTA 5EYFA 2DWIA 1MY3A 5I59A 3OENA 4GRKA 4X9TA 4JSDA 4IY6A 4BLAA 3VLWA 1B05A 3LR1A 2Y7IA 2F35A 4H5FA 3AXFA 3V89B 3PMWA 3A3UA 3SEUA 4GOTA 4H65A 1JVXA 4U4XA 2HQ0A 4JXIA 1GVCA 1IXHA 3S9MC 3K1NA 2QS2A 2XX9A 4XKNA 3RN8A 5L9MA 3PPPA 3CRBA 3RT8A 2VD3A 2Q2CA 2O84X 4KPTA 2I0CA 3RTFB 4THIA 1FTLA 4KYEA 3KN7A 2P2AA 3G3GA 1LGBC 2XD3A 3E9XA 2F7CA 2B3BA 5DYHA 1SW5A 3ILUB 4KHZE 1NMUA 4F1VA 3GLBA 5TP9B 2DXYA 1SW4A 1LBCA 1IXIA 2NVUB 4BDLA 3HSTA 4FEDA 4F2OA 5I59B 3RLFE 1JW1A 4C1TA 3N6UA 5L8DA 1LFGA 1ZKBA 4WEDA 3GXAA 4BDQA 2ZMBA 5I84A 1MXVA 3N6TA 3MP8A 3O97A 1TFDA 3LSFB 1VSOA 5CRYA 1R1NA 2O7IA 1B32A 4DZ1A 1PEBA 3PUZE 1EH3A 3ECRA 4DE8A 4R2FA 1TT1A 1P1UA 2X26A 5I2KB 2G29A 3OO8A 3FJMA 2OZZA 3QK6A 2YJPA 2F7AA 1BLFA 3CI8A 4GVOA 5KZTA 1L5TA 2HZKA 1I6AA 3UA8A 3B6QA 4R6HA 1IXGA 3K6WA 3TTRA 4KR5A 3PUYE 3FJ7A 4IO5A 4OMBA 4Q5TA 1B4ZA 1FQBA 2Q88A 1MXXA 4ESXA 4DXBA 4OXVA 5AE4A 3FVKA 2OCUA 3K6UA 1QKAA 2D5WA 4POXA 1NNPA 3SEVA 2XXPA 3O6IA 3KJ7A 4MFIA 5HBCA 1CB6A 4FATA 1N76A 3H6VA 1B5IA 4H1XA 1JNFA 2XXWA 4ZS9A 2F8DA 2H98A 3PMXA 3QIMA 3N94A 4FIMA 4KQPA 2DE4A 2Y7KA 3OO9A 4KI0E 4EXLA 1R9LA 4OYVA 1URSA 3THIA 1P1NA 4OQOA 2UYFA 3MBPA 1ELJA 1QUIA 1XOCA 1B46A 3IOTA 2V93A 3FASA 4YB7A 3M8UA 4L17A 4ELOA 1H3DA 2XXXA 3VVFA 3PUWE 4QFNA 3PPNA 3R7XA 5BWJA 1YTVA 3QUFA 2DYXA 3O6GA 1B3LA 2FNCA 3IJOB 4ECFA 4P0IA 1QKBA 3VXCA 3OELA 4IY5A 3RNNA 1LAHE 3U8QA 4Z0IA 3I3VA 2IEEA 2Z22A 3IO4A 3EHTA 3K0VA 4MBPA 2Q89A 2RCAA 2DP8A 2KLFA 4NTLA 3QXMA 2NOOA 1Y4TA 4RPOA 4U1ZA 2G93A 5H8QA 5I57A 1A7LA 5I2NA 4O3AA 3TTKA 3OO7A 2Y7WA 1LCFA 3MP1A 2RF1A 1Q35A 1A8FA 1UTBA 4LA9A 4FE8A 1D4NA 3SEXA 3M3FA 2M8CA 3I6VA 4IGTA 1B0HA 2DE2A 3VDFA 1S7YA 3S4UA 2RINA 1LB8A 2Y84A 4IB2A 5DEXB 1P1WA 1MPBA 1A55A 3HPIA 4BDNA 2GRVA 3D4CA 5FTHA 2X7PA 3CG3A 3SERA 1SQYA 1NNFA 4H0WA 4FECA 3MZ1A 3LBSA 2ZYNA 3G3IA 3MVYA 3UGWA 3K00A 4Q8RA 4RYAA 3LC8A 3IR1A 1N04A 1P99A 1LAGE 1FCKA 2PVUA 3FXRA 4WKMA 4OERA 3H6TA 4QFLA 1SDXA 4MLQA 1I6QA 3PPOA 1VR5A 1N3XA 4F3BA 1HSEA 3E3KA 3PD9A 4PP0A 3TTLA 1POY1 4LVQA 1O64A 1MH4A 4R72A 3K6XA 5H8QB 5AA2D 5FHNA 5I57B 1OQGA 2Z8DA 3MVXA 5I2NB 3DLNA 1VE4A 3VE1B 5ITPA 1MRPA 2ZYOA 5H8NA 1UTBB 2I3VA 3WAFA 5I56A 1N0TA 3VLVA 3G7WA 2I0BA 2QS1A 5BUUA 5F1QA 3FVGA 4QFKA 1B5HA 4R73A 2OBGA 1XVYA 4FEBA 3RPWA 5TPAA 3PD8A 2O51A 1M5EA 1B9JA 4GQOA 2XXTA 2FYIA 1H76A 4ZZAA 4JDFA 2THIA 3T93B 3F11A 4NF6B 5B70A 1H44A 3DP8A 2PT1A 1DOTA 2HAVA 1MM7A 4LONB 4GF8A 3TEPA 4LZ8A 4HTGA 4M1VA 1US4A 3I5OA 3LSXA 1WODA 2RC7A 3QAXA 3IO6A 4JSOA 3KG2A 1UIUA 1XS5A 1B3HA 4NMYA 5K2YA 1QUJA 3ZS6A 5AA4A 2VD2A 2YPNA 5JTYB 1B5JA 4F3PA 1PBQA 3CG1A 4FJPA 3QYTA 4YMBA 4G2ZA 4QHQA 4WEPA 3HN0A 4N6PA 4R9GA 3EQ1A 5H8NB 3QUJA 3EN3A 5I56B 3OEMA 1GV8A 3B6TA 4UA8A 3U94A 4RNSA 3FATA 2XXIA 2OLBA 2GFEA 3FUZA 1EZOA 3CFXA 4QFPA 1B58A 4DDDA 3T9UA 5TPAB 1OVTA 2P0SA 4ELRA 4H67A 4E0WA 2ZNTA 5FTIA 2VOZA 5IAIA 4YU0A 1RYXA 3MZ9A 3V83A 2DVZA 3LSWA 3TPAA 4C0RA 2GHBA 2GH9A 4R6YA 4NWDA 4QSEA 4XKPA 4OFOA 4QSDA 5DVJA 3MC2A 4RK2A 5J1DA 5A5XA 2UVGA 1B6HA 1QJMA 3OD7A 5AA3A 5AA4B 3RTWB 3CSBA 3O28A 1I6BA 4NF8A 4TQUQ 1NL5A 1HSLA 5EHMA 4EF1A 1M5CA 1PB7A 4F31B 3S2VA 1AIVA 3TKDA 1A54A 3WAEA 4AB5A 3R6UA 4OHNA 1YPNA 3IAZA 1DSNA 4ZEIA 3T66A 3A3CA 1IEJA 1F9BA 4ZDMA 1DMBA 2R6GE 1B52A 1MQJA 3T9XB 3TMGA 2DXRA 1II5A 3PMVA 2XX8A 5ITOA 1ZJLA 3MP6A 3K1MA 2NUVA 1D9VA 4YB5A 3UIFA 2HCAA 1IITA 3Q28A 3UORA 5DVFA 3U1OA 1MH3A 4G68A 4JB7A 3TYHA 3FVOA 4N13A 4EDPA 3L6GA 2DWAA 5ICQA 5HPQA 4EF2A 3KZGA 4LZ7A 1MPCA 3ZKKA 3MPLA 1JEUA 4O3BA 4LATA 3PPRA 5AA2A 5ISUA 1BTJA 2O6AA 1SVXB 4F19A 3VLUA 2ZYKA 4IO2A 4G8NA 1ATGA 1QUKA 3TODA 1O63A 1FQCA 3C31A 3H03A 1B3GA 2DS9A 4NF8B 1MG1A 4DIGA 1B4HA 3RGYA 4OENA 4QF9A 2WKYA 1DTGA 4U2RA 5IKBA 4I62A 4GIZA 4RJZA 3KSJA 4NF4A 2BJJX 3U72A 1FQEA 3FV2A 2QSXA 1B40A 3DM0A 3CIJA 1IIWA 1NH8A 1MY2A 4OFJA 1SW2A 1MXWA 3KN8A 4F1YA 3UP9A 2I6EA 3DP6A 2QMWA 3KJTA 4ESWA 3BFUA 3MUQA 1KWHA 4G68B 3SESA 4OEVA 3ZKLA 2HZLA 4F1UA 5KCJA 2PBWA 3PU5A 3SDFA 2E0SA 4BDOA 1Y20A 3TZAA 1B7HA 3FZVA 1ZIUA 3SEWA 4XXUA 3OOAA 1BIYA 1JVYA 4DXUA 3LUYA 2AYSA 3IOUA 4X48A 1OLAA 1R6ZA 3KFMA 3IL1B 3K6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GFRA 1I69A 4F39A 1GTKA 1ZU0A 3RQTA 4F22A 3Q29A 1B7UA 3EHUA 4GXAA 2F97A 2UXAA 1FBDA 2FIEA 3V8XB 1IXCA 1PB8A 5LOMA 5H8FA 4M4GA 4R2BA 4Q0CA 1USYH 3K2DA 4ZZEA 4R74A 2UVHA 3TFLA 1JETA 4DI4B 1D3KA 5FHMA 4X8RA 1FPKA 3W9VA 3VVEA 2QMXA 1YYZA 3MZBA 2XXHA 4IO4A 1YAEA 2MKZA 3GBBA 2P1SA 1N7WA 1HSJA 3TELA 4PFIA 1FTKA 4RXLA 1OMPA 3P7IA 1LSTA 4KYDA 3N26A 2NXOA 3IX1A 4MNCA 2ZYMA 2E1SA 4GL8A 2H5YA 4HE1A 4PC9A 2A5TA 1SD3A 2HEUA 5KCJB 2O69A 3TDJA 3A29A 1UQWA 3ILTB 2H99A 2F34A 2RC9A 3C9HA 3D1RA 5H8SA 1NH7A 5L9OA 2DSFA 3O9PA 1P1OA 4XTCQ 3O6HA 1FQFA 1LFHA 2R8TA 2H4IA 3RUMA 1Q9DA 3OSQA 2NWJA 1PBPA 5CMCA 2QS3A 2RKMA 2ZNSA 5KDTA 4PGPA 2R9JA 1QW0A 1DPPA 4F3SA 3H06B 4RPNA 3R26A 4PE5B 4AB6A 5CC2A 3M3LA 2PFYA 4EUOA 1PB9A 4LZ5A 5EHSA 3C32A 1SI0A 2QPQA 4FORA 2OJTA 3KOTA 1K9ZA 5M2VA 2HAUA 2L5VA 1OVBA 1NNTA 5ICTA 5F7VA 4U23A 1TFAA 1MS7A 2UVJA 4MH5A 2F6PA 3DELB 4FAJA 3S9NC 1LAXA 1S9TA 3V5AA 5HM4B 2WBBA 3M3KA 3PV0E 1FQDA 4GWUA 3KEIA 1OLCA 2F6GA 1FBFA 4NE4A 3IOWA 1ZLQA 2XXQA 4DCYA 2I3WA 5I58A 4U1OA 3B7DA 3TAJA 4PDHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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