3RTWB

Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtwB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtwB02
5EYFA 1FTJA 3VLUA 4IO4A 1RYOA 4C1UA 4F3PA 4DCXA 3PUVE 4AB6A 4BDOA 4KI0E 3TCGA 2I48A 1H43A 3E3KA 1F9BA 1FCKA 3Q26A 5I2KA 5HM4B 4QFLA 4OENA 3EHSA 4QFOA 2OK2A 3IJXB 1FQFA 3RLFE 3EHUA 4PFWA 1URDA 1TFDA 1B9JA 2O51A 5CI5A 4ZEFA 2A5TB 3T96B 3IR1A 3QUFA 4HCWA 1B5IA 3V83A 3O29A 5FTHA 2QRYA 1A99A 4WEPA 1O7TA 2ZYOA 1FTKA 2HFBA 4X48A 3U72A 3TTMA 3KEIA 4MLVA 3PMWA 4GOTA 3MZ1A 1WVJA 3GBBA 3DM0A 4M1VA 2G29A 1PEBA 4GVOA 3TEPA 5K2XA 3TPAA 3IOWA 5JTYA 5M2VA 4O3BA 1M5CA 2YLNA 3EHTA 4EXKA 3UK4A 4HW8A 4U2RA 3HO7A 2F7AA 2PYYA 3V8XB 3P7IA 3G7WA 3KN3A 5H8SA 3UP9A 1LAXA 4E0XA 4IO3A 1USYE 4PQJA 4GL8A 1D4NA 1B58A 3L6GA 1UTBB 1N3WA 1XVXA 3MZBA 3D4GA 3O97A 1B2HA 3JZJA 1QUIA 3FJMA 3VDFA 1Y1MA 2W7YA 4NEDA 4RYAA 1H76A 1HSEA 4POWA 3T66A 1P1OA 1B6HA 1LSTA 3KJTA 1B1XA 2P2AA 3Q27A 3GZGA 3F11A 2I6EA 2PVUA 4XKQA 1LBBA 5I58A 1SVXB 1DMBA 2I58A 1XVYA 3QK6A 4NF4B 4P0GA 4Q30B 3OO6A 3PUZE 1OLCA 3H6WA 3HCQA 4ESXA 4ND9A 5BUUA 4DE8A 2DQVA 3PPOA 4Z7EA 3RGYA 4THIA 3G3IA 1AIVA 2WKYA 3MC2A 4OWDA 3E4RA 4KHZE 2H9BA 3KSXA 1MQJA 3C32A 4LONB 1HSJA 4HTGA 4RXLA 1MDP1 3LSLA 3TTRA 1QW0A 3MUQA 4FECA 1OMPA 1US4A 1IUDA 1URSA 1OVTA 5DVIA 3VV5A 1PC3A 4G8HA 3JV9A 5IKBA 1GV8A 3FIRA 3U94A 4U4XA 4F2OA 2R9JA 3EPEA 4FEDA 3K6VA 4NF5A 3JYRA 1I6QA 4MBPA 4DZ1A 4EQBA 5BWJA 2XXWA 3WAFA 1JETA 2V3UA 1RKMA 4EDPA 3VXBA 4H67A 1JEVA 1B32A 2RCAA 5ICTA 1VFEA 3K2DA 1B7HA 1AH5A 5JK4A 4YKIA 1SW4A 1NNKA 3VVDA 2H98A 3SEYA 5CMKA 2O69A 3FD3A 4O3AA 3H06B 3G3HA 4IGTA 4GLIA 1GR2A 3CFLA 4F39A 2F34A 3LSFB 2ONSA 1SI0A 4TLMB 1OQGA 3MAMA 1B05A 4ZECA 4KYDA 4DDDA 3KG2A 1JVYA 3S9MC 2THIA 4Z0IA 3KBRA 1Y1ZA 3CG3A 1Y3QA 4BDNA 1A54A 3QUJA 1R9QA 5KDTA 4EUOA 3TCHA 3OEMA 4UACA 3G3KA 2XXHA 2DE4A 3N94A 3ILTB 1H3DA 2PT1A 3THIA 5AA4B 5DYHA 3U92A 2HEUA 4OXVA 3LC8A 3CG1A 2IEEA 4KQPA 5AA2A 2DXRA 4DXCA 3O2AA 1LFHA 3B7DA 3IX1A 1MQIA 1LGBC 3ZS6A 2OCUA 1B0LA 3TUSA 1N84A 3PPQA 5AA2D 3W9WA 3K6WA 1VE4A 3MVYA 4R9GA 4ESWA 3G3FA 5K2YA 4ZEBA 4JBZA 1R1NA 1N76A 5A5XB 4PP0A 4G4PA 2V93A 2PBWA 5AA4A 2UVHA 3N26A 1VR5A 3QXMA 3SESA 1JW4A 2QJEA 4H6DA 1A8EA 2Z8EA 3TDJA 4AQ4A 1DPPA 4F3GA 4IO6A 2QS1A 4LA9A 4ELRA 3C36A 2E0SA 2VOZA 3S9EA 4U22A 1H44A 1MY2A 1Y4CA 2GFEA 5DEXB 3VFJA 1OLAA 1DTZA 2Y7RA 2I4BA 4LP2B 2F36A 1B4HA 4OQOA 5H8HB 4KFQA 4FIMA 1Y4TA 4U21A 3SERA 3VXCA 3I5OA 3OSQA 4F1UA 1SYIA 1LFIA 3HHFA 3FV2A 4YMAA 2NOOA 1MXVA 2REGA 3T93B 5CC2A 3S9LC 1AMFA 4JSOA 1J1NA 3D4CA 1M5FA 3IK6B 4F2QA 1Z7ME 2XXPA 2VD3A 5DTBA 4WEDA 4DLDA 5KCJA 1EZ9A 1NMUA 1EU8A 1GVCA 1N0TA 4G68C 4RK9A 4TLLB 1B0HA 5DEXA 3O28A 4NF6A 3BFTA 1B1HA 3I3VA 1BP5A 4NF8B 3FJ7A 2RC7A 4NWDA 3M8UA 4OHNA 2ZYNA 1O64A 1ZIUA 4FJPA 5I84A 3SEUA 1I6AA 2F6GA 1MQDA 5TPAA 1FQAA 4U1OA 5L9SA 1MY1A 4JXIA 1SW5A 2P1SA 4Q8RA 3C4MA 5CM6A 4KCDA 2R6GE 4I9DA 1R9LA 2VHAA 3RUMA 2QPQA 5LOMA 4NE4A 2NWJA 3MW0A 4NF8A 2O1MA 5CMBA 2Z8FA 3OO8A 4F31B 1NH7A 2GRVA 4ZEKA 3VVEA 1ANFA 3G3GA 4MF3A 5DVFA 5TU0A 4Q0CA 4GF8A 1P1WA 1VSOA 5H8NB 3FXUA 1B3LA 2ZXTA 3R7XA 2AIXA 2ZYKA 5I59A 2XXYA 1TWYA 2Q88A 4EF1A 3H6UA 5CMMA 3PPPA 2GH9A 1KWHA 1POTA 3FVOA 2H5YA 3S2VA 4DXUA 3T9HB 1MPDA 1EZPA 3IO4A 4JSDA 3CSBA 3PPRA 3IORA 3Q25A 3USDA 2O84X 3KSJA 2Q89A 3MP8A 2XXXA 1NNFA 3A09A 1EH3A 1Y3PA 1BLFA 3LSXA 2DVCA 2B65A 1PB8A 2A5TA 2YJPA 3A3CA 2IA4A 5HPQA 1CE2A 3FVNA 2Q8JA 1S50A 2ANJA 4BLAA 2Y7KA 2ESNA 1B52A 4QFNA 1S9TA 2DWAA 1NFTA 3OMBA 4GRKA 4OTEA 1IXIA 4YKPA 4R6HA 3FV1A 1PDAA 3C33A 2HXWA 1IXCA 4PFUA 5I56B 2REJA 2I0CA 1PBPA 1SBPA 1FQCA 2M8CA 2UVGA 3SDFA 5ITOA 4IB2A 4JB7A 1DSNA 4LQ2A 4WKMA 4ECFA 4N6PA 4QF9A 2AL4A 2XX8A 3SETA 3GXAA 4H5GA 4NWCA 3LBSA 3C34A 4OEUA 1UTBA 1MXYA 1D9VA 4ELOA 2D3IA 4KYSA 2F6PA 3RN8A 3S4UA 5CRYA 1B40A 1I69A 4DCYA 4FATA 5I2NB 4KCCA 2XXVA 4RA1A 2QMXA 3DELB 5TP9B 3HSTA 2HZLA 3TYHA 3OXNA 2D21A 2H25A 5I57B 4ZEDA 4GFRA 2ZNSA 4NF4A 1RYXA 1MM7A 4MH5A 3LR1A 1DOTA 1LB9A 3FASA 1M5EA 4F22A 4R75A 1D3KA 4ZZAA 4NTLA 2R71A 3V89B 5AA1A 3OSRA 1IQ7A 3VVFA 4QFKA 2Y7IA 3RNNA 3PMVA 2D5WA 2DSFA 4OVJA 4F1VA 2F78A 2FA7A 5I2NA 1O63A 4OFJA 2XXTA 3FZVA 4YAHX 2UYEA 3K6UA 2PX1A 3UORA 5F1QA 4IY5A 5I57A 4PFTA 5H8FB 3T22A 4H8IA 4R72A 1MH4A 2Y7WA 3TFLA 4XIGQ 3MPLA 4M4GA 3AXFA 3UIFA 3RPWA 5ELVA 3GBAA 1URGA 4EQ9A 3H03A 3VE1B 5ICQA 5H8QB 4MFIA 1US5A 3K01A 3MZ9A 4I8CA 1ZLQA 3FJGA 1XOCA 3A3UA 4IO7A 4N13A 2XXIA 4F18A 1SW1A 3BFUA 1HSLA 4P0IA 5AE4A 4IO2A 2DXYA 3K1NA 1BIYA 3PUWE 1QKAA 4P11A 1IITA 4LQ5A 2B3BA 3PV0E 4O3CA 3M3KA 3H6VA 4JWOA 1EZOA 4H8JA 1JQFA 3TZAA 2RC8A 2Z22A 2I49A 3BBRA 1JW5A 1LAHE 1QJMA 4BDLA 3E13X 3MVXA 3K6XA 2V25A 1NNPA 4ELQA 2DWIA 2P0SA 3FXRA 2DOJA 2HAVA 4ELPA 5H8QA 1ZKBA 2I3WA 3KFMA 3BKIB 1MXWA 1ZTYA 3TQLA 4U23A 2GHBA 4FEBA 1MXUA 2XHDA 1JVXA 3TKDA 3IAZA 1N04A 1Q35A 1XHYA 1LCFA 2RINA 1QUJA 2UVIA 5CBSA 4POXA 2OWTA 1B3GA 4RPNA 3TELA 2UXAA 4YB5A 3PGFA 2F7BA 3H6TA 1MQGA 3KJ7A 4OMBA 1Q1KA 1B7ZA 4C1TA 3H4ZA 1YPNA 3R26A 3CIJA 1UIVA 1LBCA 3DP6A 4ONYA 2RF1A 4NMYA 4ZDMA 1QKBA 3C31A 3FUZA 3UGWA 1QULA 3T9XB 2CMOA 4LZ7A 1MRPA 1TXFA 2F5XA 2VP1A 3SKPA 3PMXA 3EN3A 2DWHA 5A5XA 1UTHB 3RTFB 4E0WA 4JWXA 3OOAA 3EF7A 4KPTA 2ZNUA 1FTLA 2VGQA 1WODA 1P1QA 3ZKKA 4JWYA 2NXOA 3RQTA 3MP6A 3O66A 3PUYE 5B7DA 3ZKLA 3G3JA 1M5BA 1A40A 1LLSA 1Y9UA 4F3SA 3K1PA 2Y84A 3S9NC 3OENA 2XXUA 1MH3A 3K0VA 4N07A 1ZMGA 5H8HA 1MXZA 3FVGA 1IEJA 4YKKA 1Z7NE 5IAIA 3RT8A 3MVZA 5CMCA 5DT6A 1USYH 3OD7A 3OEKA 3IO6A 4ZE8A 1OIBA 2HAUA 3RTWB 4F19A 2OZZA 2BJJX 2O7IA 4OERA 4YICA 4ZS9A 4YB7A 4OZ9A 3H7MA 3N6TA 5DVJA 1YTVA 1MPBA 3U93A 1NKXA 3K00A 5FHMA 2F97A 4F29A 4BDRA 4R6KA 3ONMA 2I0BA 4GD5A 3U8QA 2V3TA 3IOUA 4XKRA 4U4SA 1AOVA 1FQEA 1WDNA 4YZZA 5JTYB 2UYFA 2UVJA 1S7YA 3KN8A 4LUBA 3O6HA 1YAEA 1BTJA 4U1ZA 3MP1A 4MLQA 5CBRA 1T0KA 4TOZA 4RPOA 2HZKA 3MVWA 4OYVA 4OFOA 1II5A 4YKJA 3SEWA 3FXQA 4I1DA 1POY1 3KGCA 4R73A 3SEXA 3N5LA 1PB9A 4LVQA 1B51A 4RNSA 3KOTA 2O7UA 3MBPA 1I6BA 4ZE9A 2VD2A 4TQUQ 2ZNTA 5ISUA 2HCAA 3PD9A 3HHGA 1MM6A 1IIWA 2XD3A 1AL3A 1GTKA 4DXBA 1TT1A 2ZYMA 3KOSA 1MPCA 2DP8A 5H8NA 5L8DA 1SI1A 3QSLA 3R6UA 4LZ8A 2OBGA 4R6YA 1FQDA 2E1SA 5I58B 3WAEA 3HPIA 2XXQA 2QMWA 2HQ0A 5FHNA 1B3FA 2DVZA 3IL1B 4LATA 4KR5A 3K1MA 2KLFA 1ZU0A 3UN6A 2V3QA 4G8NA 3TTKA 2RKMA 4GWOA 3OO7A 1DTGA 1L5TA 1XS5A 2V84A 1UQWA 5F7VA 5HBCA 1B5JA 2B3FA 4KD5A 1P1UA 1VFDA 4G2ZA 2H4IA 4Q5TA 2DS9A 3CRBA 1OVBA 3CR9A 4PETA 3HN0A 2F8DA 3SEVA 1PBQA 4H65A 2QSXA 4EF2A 2XX7A 2AYSA 2QS2A 4NF5B 1LFGA 2O6AA 2FYIA 1A7LA 1A55A 1SQYA 1ZBMA 3IOTA 1LAGE 1MQHA 4G8MA 3CSGA 5I56A 3MPKA 5L9MA 1LCTA 1SW2A 4QSCA 4C0RA 2OLBA 3TQWA 4RK2A 3M3LA 1D9YA 4R2FA 3KZGA 4IY6A 3FVKA 2DWJA 4HS7A 4KYEA 2ZMBA 2LAOA 4RY1A 4XKPA 2I3VA 3MQ9A 3T9VA 1N7WA 2XXRA 4OETA 4DIGA 3IB1A 3FGSA 4BDMA 1ATGA 3PD8A 3VLVA 3C9HA 3PUXE 5JEIA 1IXGA 4F1YA 1SDXA 2F7CA 3CI8A 4L17A 3IB0A 4YB6A 5EHMA 1SYHA 2OWSA 3M3FA 4K3FA 3IJOB 5TP9A 4JDFA 4PE5B 1N3XA 4RJZA 4OEVA 5KDTB 2XX9A 2ALUA 3K4UA 1P99A 4FORA 2RC9A 4PFYA 1DPEA 1CB6A 5AA2B 3B6QA 2QS4A 1MY4A 1QUKA 3HV1A 3PU5A 3ZSFA 2YPNA 3W15C 2Q9TA 4GL0A 3V5AA 1MDQA 4FE8A 4IO5A 5AA3A 4R9FA 4X9TA 2O68A 1LAFE 4GXAA 4GIZA 1MXXA 1TFAA 3CVGA 2DYXA 3ODBA 4ZZEA 5EHSA 2QL3A 3MJNA 1P1NA 5H8FA 3O6IA 3TAJA 3OO9A 3TODA 2PMSA 1B3EA 1JEUA 3E9XA 3B6TA 2Q2AA 2X26A 2O1LA 3DP4A 4FAJA 1UIUA 2QS3A 4ZEIA 2DE3A 3TTNA 4GXSB 4H5FA 1NL5A 4YMBA 3QAXA 1XT8A 1FQBA 3CFXA 3Q29A 2FNCA 3PPNA 2GHAA 4H1XA 1OQHA 3MWBA 1BKAA 2DE2A 4X1DA 3ECRA 3RT6B 1B4ZA 3UA8A 3TMGA 1FTMA 2ABHA 4EQ7A 1B7UA 2Q2CA 1QVSA 3DP8A 1YCJA 3O9PA 1MG1A 3K02A 4R2BA 1B5HA 4R74A 2ONRA 4G68B 3TCFA 3O6GA 5FTIA 3TTLA 4EXLA 1MY3A 2AL5A 3GLBA 4OESA 4XXUA 4QFPA 3L6HA 3LUYA 1ELJA 3IB2A 2Y7PA 3KN7A 5FHOA 5KCJB 1NNTA 3H3GA 4OFLA 1PB7A 1FTOA 2ONKE 2G93A 3EQ1A 1XC1A 2NVUB 1H45A 3CFZA 1MY0A 4NF6B 2CZLA 4UA8A 1LB8A 1IXHA 1R6ZA 2RCBA 1GGGA 4X1BA 3QYTA 2A5SA 3T9UA 2NUVA 4AB5A 4QHQA 3DLNA 1SD3A 4LZ5A 3OELA 2OJTA 5J1DA 4G68A 3RY3A 4I62A 2X7QA 3Q28A 1N7XA 4HCYA 4QSEA 2XD2A 4GQOA 5TPAB 1JW1A 4WXJA 3I6VA 4F3BA 5L9OA 1ZJLA 3VLWA 3IOVA 2Z23A 4G77A 2X7PA 3C35A 1JNFA 3LSWA 4IGRA 1B3HA 5I2KB 4ISUA 3U1OA 5B70A 5KZTA 4YU0A 4H0WA 1MS7A 4QSDA 1NH8A 1Y3NA 1UTHA 3FATA 3W9VA 2F35A 4XKNA 2PT2A 2H99A 2I4CA 4BDQA 5ITPA 1Y20A 1FW0A 4XTCQ 3QIMA 1B46A 1M5DA 3N6UA 5I59B 1IZ1A 2Z8DA 4QRZA 1A8FA 3B6WA 3ILUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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