4H8IA

Structure of gluk2-lbd in complex with gluazo
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A photoswitchable neurotransmitter analogue bound to its receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA02
1JQFA 2DQVA 1MM7A 1NKXA 1PB7A 4XKNA 4TQUQ 4NF6A 1FTMA 2YPNA 2A5TA 1J1NA 1N04A 1SI1A 4GIZA 3K1PA 1YTVA 2X26A 3PD8A 2B3BA 4F1YA 1FW0A 5H8NB 1GR2A 3R7XA 1RYOA 1DPEA 2QS1A 1B2HA 1O7TA 2F97A 3MPLA 2I4BA 3IJXB 3CIJA 5TPAB 3G3HA 1QW0A 3KZGA 5I59B 1P1NA 4GQOA 4FATA 5DYHA 4G8HA 3H6UA 1IZ1A 3G3FA 4H5GA 3HHFA 4OHNA 4O3BA 1D3KA 4PFWA 3UA8A 3IOVA 3MZ1A 1P1QA 1B9JA 4QFPA 1HSLA 1MQIA 2RKMA 1IXGA 1Y1ZA 4ZDMA 3CG1A 3E13X 5BWJA 1NNKA 3EQ1A 2AL5A 3KSXA 4HCYA 2OK2A 5B7DA 1VFEA 3F11A 3GZGA 4DDDA 3JV9A 4IO6A 2UVJA 5TP9A 3ZS6A 1Q1KA 1AH5A 1Y20A 3KG2A 3QUFA 3KOSA 4NWCA 5H8HB 3C34A 4RJZA 3OMBA 3ECRA 2V93A 3MPKA 1D4NA 1B6HA 5BUUA 3MVWA 3JZJA 4X1DA 1LFIA 3C4MA 1LCFA 2V3UA 1N0TA 4JBZA 5F1QA 1LBBA 1M5CA 4BDLA 2ONSA 1MM6A 4BDRA 3O66A 3V89B 4PFUA 4JSDA 4G2ZA 4FEBA 3O97A 3PPOA 4GVOA 2F7BA 3OD7A 1EZOA 1IEJA 1ZKBA 2NXOA 1BKAA 1F9BA 2I0BA 3AXFA 4R9GA 1LLSA 2V25A 1B5IA 2DXYA 2AL4A 3VFJA 5JK4A 1GTKA 2I6EA 1II5A 3K02A 4P0GA 2OLBA 1LFHA 4HTGA 3DM0A 4O3CA 2Q8JA 1OLCA 5I56A 3PV0E 2Z22A 1FCKA 1A7LA 2I3VA 5AE4A 2CZLA 2I0CA 3UGWA 1UTHB 4LZ5A 3D4GA 3ZKLA 1SBPA 3TUSA 5I84A 2XXPA 2D3IA 4OZ9A 1JW1A 2XXYA 4EF2A 4QSCA 4QSDA 4RK9A 4DXBA 4ZEDA 4R72A 3B6QA 4XKRA 4GL8A 4IGTA 4PFTA 4QRZA 1UTBA 3UK4A 3O6GA 4ND9A 1QUKA 2DS9A 5CMCA 2Q2AA 1B58A 5H8SA 2ANJA 1XS5A 4KHZE 3H06B 3KBRA 5CBSA 4KCDA 1S9TA 1CB6A 4KI0E 5ITPA 1B40A 2ZNTA 5IAIA 3DLNA 4N13A 5HBCA 1MXVA 3IORA 3E3KA 3U94A 4GOTA 1SW2A 2YLNA 1PBQA 3H4ZA 4IGRA 1H43A 2IEEA 2Z8DA 1ZLQA 3QAXA 1Y9UA 3U92A 2DP8A 3S9LC 4MLQA 2XD2A 1P1OA 3U8QA 4ZEKA 4Z7EA 3IOWA 3VLUA 4YU0A 1VE4A 4H8IA 2RC9A 4HS7A 5ELVA 4ZZAA 2ZNSA 4YMBA 4AQ4A 1Z7NE 1ZIUA 1ZJLA 3FUZA 3H6WA 3WAFA 1URGA 3TODA 1IIWA 1LAGE 1ZMGA 4F1VA 2X7QA 3GBAA 3H7MA 3TTNA 4P0IA 2P2AA 1Y4CA 2HZLA 3FV1A 3QXMA 1B5HA 1US5A 3RT8A 3MZBA 4DZ1A 4FIMA 4QFOA 3SDFA 3PUVE 5ITOA 2Z8EA 2UXAA 3A09A 1MS7A 3FGSA 1H76A 3KN8A 4IO7A 3CFLA 5CMKA 4QFNA 3OO7A 3E9XA 1B3FA 2VP1A 4E0WA 4NF4B 3UIFA 3FVGA 3OO9A 1M5FA 1I69A 3MP6A 4G68C 3O6HA 3S4UA 3RLFE 4YZZA 2LAOA 1MDQA 2H99A 1A55A 4WEPA 1MXZA 2XXRA 4OMBA 3QYTA 3IOUA 1IITA 3ODBA 2RINA 1JVXA 4G77A 4RXLA 4JXIA 4MF3A 5TPAA 5H8FA 2GRVA 4H0WA 4OFLA 5I59A 1LB9A 2BJJX 3N94A 4BDQA 4MH5A 1EZPA 3TELA 4R6YA 4DLDA 2XD3A 3T66A 4YB7A 4HW8A 1D9YA 1NNFA 2Q88A 3FJ7A 3GLBA 4G8MA 1FTKA 3PD9A 1KWHA 3LSXA 2VD3A 1LCTA 4F19A 2B3FA 3HV1A 3LBSA 4QHQA 1O63A 4ELOA 4LZ7A 3PUZE 3VXBA 3RGYA 1JEVA 1NFTA 1SW1A 4G68B 3FXRA 1WODA 2UVIA 3KN3A 2H9BA 1SQYA 1CE2A 2XXHA 1ELJA 1QKAA 4GL0A 4C1UA 3W15C 2E0SA 2F35A 1ATGA 4GXSB 5L9MA 3Q28A 2ABHA 3TFLA 1FQDA 2OBGA 4U2RA 2V84A 1XVYA 3TZAA 2VHAA 1GVCA 3LSFB 3IX1A 2PX1A 3C35A 4EXLA 4C0RA 1Y4TA 3V5AA 4ZECA 2O6AA 1RYXA 5KCJB 4LVQA 5M2VA 3A3UA 4GFRA 3A3CA 2Q9TA 3KGCA 4EUOA 5A5XB 5JTYB 5ICTA 4YKIA 4Q0CA 1MY2A 1Q35A 3TTLA 5KDTB 1EU8A 1A8FA 1DTGA 4KFQA 4GXAA 3JYRA 2DVCA 3QSLA 5DT6A 3RN8A 3MW0A 1SD3A 3G7WA 1UTHA 3O2AA 2IA4A 2UYEA 1B0HA 4U23A 1SYHA 2ZMBA 3K6VA 3IB2A 2DWIA 2O1MA 3MAMA 3C33A 4OYVA 3QUJA 4POXA 3PGFA 3FASA 2HAVA 3MVYA 1S7YA 4KR5A 4F31B 4H8JA 1MH3A 4G4PA 4ONYA 3IJOB 5CMBA 1TFDA 1MG1A 3HSTA 3SESA 2OWTA 5FHOA 3S9MC 3S2VA 3VLVA 3C31A 3SEVA 3KFMA 3K6WA 2GFEA 1DTZA 3EF7A 4FJPA 4RYAA 4H65A 1JW5A 3PMVA 5DVFA 2W7YA 1QJMA 1MY4A 4ESWA 3OXNA 4ELQA 4F39A 5DEXB 2UVHA 2I58A 4LONB 4FECA 3N6UA 3KOTA 2F8DA 4YB6A 2R6GE 3SERA 1NMUA 2HZKA 4PQJA 3MQ9A 3U72A 3EHTA 2QMXA 1T0KA 3MUQA 4XKQA 1Z7ME 2D21A 4EQBA 4POWA 4WXJA 2GHBA 3LR1A 1SDXA 5I58A 2REJA 4UA8A 3BBRA 5FTIA 5IKBA 3FVOA 4R9FA 2R9JA 3PUYE 5I2KB 1R1NA 2XXUA 3O29A 5AA2B 1IUDA 3K1NA 1SW4A 1USYE 1DOTA 1N76A 1URDA 4KQPA 3SETA 4H5FA 2WKYA 4XTCQ 5L9SA 4M4GA 1MY1A 2PBWA 4X48A 3THIA 3B6WA 1DSNA 3QK6A 1SVXB 2I48A 3ZSFA 1D9VA 2V3TA 4NF6B 2XXVA 1QULA 1MQGA 1MY3A 3LUYA 4PP0A 2A5TB 1MH4A 4OXVA 3SKPA 3S9NC 4KYSA 5ICQA 3T9UA 3PU5A 5DVJA 4JSOA 4R6HA 2PVUA 4F29A 3RTFB 3PUWE 3Q25A 3TQWA 4RA1A 1MXYA 1YAEA 1FQFA 1OLAA 4H6DA 2I49A 1XOCA 3VVDA 4OFJA 4U4XA 3ONMA 1MDP1 2Y84A 1B46A 3K4UA 4LATA 1FQBA 4QSEA 1QKBA 3UP9A 3SEXA 2F36A 4ELPA 4U4SA 4ISUA 1NH8A 4P11A 2X7PA 4ZZEA 2F6PA 1EH3A 3G3IA 1MRPA 4LP2B 1LBCA 4KPTA 4BLAA 3B7DA 1TFAA 1BLFA 3BFUA 4GRKA 4G68A 2XXIA 4RY1A 3TQLA 4ZEFA 4R75A 1B52A 2QJEA 4NF5B 3Q29A 2QS2A 4OFOA 2VOZA 2O1LA 1LAFE 1H3DA 1WVJA 4U1ZA 3MWBA 3PMWA 3FXQA 4R73A 3UN6A 2HAUA 3RUMA 2I4CA 3N26A 4F3SA 2D5WA 2O7IA 2XX9A 4OESA 3MBPA 1M5DA 1Y3NA 2H4IA 3VVFA 1TWYA 1US4A 3PUXE 1RKMA 2I3WA 1B3LA 4QFLA 1P1UA 1B1HA 1Y1MA 2XXWA 4M1VA 4ZE8A 5I57B 4MLVA 2HEUA 1R9QA 2DE2A 4LZ8A 3CRBA 4KCCA 4THIA 1XC1A 1B4HA 2DXRA 5KCJA 2O68A 3FJMA 3L6GA 2XXXA 1B05A 3RTWB 2CMOA 4JWXA 1PC3A 3OELA 4U1OA 5A5XA 3TCHA 1H45A 2UYFA 3K01A 1OVTA 1BP5A 2QL3A 1FTJA 5KDTA 2F6GA 1ZU0A 1FTOA 4BDMA 3OOAA 1POY1 4QFKA 3BFTA 1JVYA 2Y7KA 4OEVA 3H6TA 4H67A 3IO6A 2ZYOA 5H8NA 4DXUA 2Z8FA 1NNPA 1IQ7A 3EHSA 4YKPA 3FVKA 1MXXA 3ILTB 2O7UA 2XX8A 2A5SA 4F3GA 3TKDA 3PPQA 4TLMB 3OEKA 4ESXA 5J1DA 1FTLA 2AIXA 3L6HA 2HXWA 1ZTYA 3IOTA 1JEUA 4QF9A 3S9EA 2AYSA 4ECFA 3TAJA 1OVBA 5HM4B 3WAEA 5K2YA 1MQJA 4N07A 4YKJA 4OEUA 2O69A 1UIVA 4OWDA 3VE1B 3MZ9A 2OJTA 1OQGA 1N3WA 1PB8A 5H8HA 1LAXA 2DE3A 3TTRA 3B6TA 5DEXA 3GXAA 4F2OA 2RF1A 3FD3A 1DPPA 4LQ5A 5CC2A 4I62A 1L5TA 3TEPA 1IXCA 3R26A 1LB8A 1A54A 3BKIB 5TU0A 1B0LA 4YAHX 4GF8A 1SYIA 1B3GA 1R6ZA 1Y3PA 4IY6A 2FYIA 2ESNA 4F22A 5CRYA 3T9VA 1ZBMA 2ZYMA 1YCJA 1OMPA 2DOJA 5AA2D 5I2KA 5FTHA 4H1XA 3TDJA 5AA2A 4FORA 1MXWA 1MXUA 4YMAA 4JWYA 4RPOA 2OWSA 4R2BA 3UORA 4XIGQ 3MP8A 1XHYA 1SW5A 1FQAA 2RCBA 3IB0A 4NF8B 2YJPA 4YKKA 4FAJA 1B3EA 3U93A 3CFZA 3I5OA 4R6KA 2VD2A 4Q30B 2Y7WA 4IO3A 4G8NA 4YICA 3G3JA 4NMYA 1UQWA 2REGA 4I9DA 3HPIA 4GD5A 2O84X 3W9WA 1B1XA 1TT1A 3O9PA 1USYH 5F7VA 3SEUA 4X1BA 5ISUA 3ILUB 5H8FB 3IL1B 3I6VA 1B7ZA 3MC2A 1OQHA 4EQ7A 1OIBA 4F2QA 2F5XA 1EZ9A 1VFDA 5JEIA 1B3HA 4IB2A 3O28A 4MBPA 1O64A 5EHMA 4YB5A 3N6TA 1M5EA 1MY0A 4OTEA 4JDFA 4XKPA 5AA4B 3PPNA 4Q8RA 1B5JA 1UIUA 1PBPA 3OEMA 2XXTA 4F1UA 5H8QB 4DCYA 4EF1A 1P99A 4DE8A 2B65A 4PETA 4IY5A 1PEBA 2F7AA 3T22A 2NUVA 2G29A 3G3KA 3T96B 2NWJA 5I2NB 4NF5A 1XVXA 2P0SA 1MQDA 3IB1A 1B51A 3V8XB 1QUJA 4KD5A 5EYFA 3IO4A 3K00A 3G3GA 4MFIA 4BDOA 1A99A 4OERA 5CMMA 2QPQA 3IR1A 3SEYA 2V3QA 3FVNA 4R2FA 1BTJA 3HO7A 4EQ9A 1AIVA 3T93B 1SI0A 4RK2A 3CFXA 5I57A 2F34A 4NTLA 3MVXA 5KZTA 2HQ0A 4EDPA 4FE8A 5L9OA 2NOOA 4X9TA 3KN7A 2XHDA 5FHMA 2OZZA 2RC7A 4NF4A 1POTA 5K2XA 3M3FA 1MPBA 2O51A 3MJNA 4JB7A 4F3BA 2Y7RA 3EN3A 4ZE9A 3H3GA 5CBRA 3R6UA 3Q26A 2M8CA 2QS3A 3QIMA 5DTBA 3RNNA 3K2DA 4NWDA 1QUIA 4UACA 3VXCA 4IO4A 3IAZA 3MP1A 3FV2A 2H5YA 1URSA 2ZYKA 4OENA 4EXKA 3W9VA 4HCWA 3HN0A 4ZEBA 2HCAA 3VLWA 1BIYA 3LSLA 2FNCA 1JETA 2HFBA 2OCUA 2R71A 3OSQA 3KEIA 4OVJA 3V83A 4RPNA 1GV8A 2ONRA 4PFYA 2Q2CA 2RC8A 3IK6B 3P7IA 1N7XA 3HHGA 4C1TA 2UVGA 3EHUA 1P1WA 3CSGA 4K3FA 1NH7A 3CSBA 1IXHA 5TP9B 3FZVA 3RQTA 3ZKKA 3M8UA 3DP8A 2RCAA 2ZNUA 1VR5A 3MVZA 3M3KA 4WKMA 4NEDA 3PPPA 2ZXTA 3RT6B 5AA3A 2PMSA 3K6UA 1YPNA 1M5BA 3Q27A 4F3PA 1NL5A 3TTKA 2QS4A 3TCFA 3TMGA 4F18A 4N6PA 1B32A 4JWOA 5AA1A 4O3AA 2DVZA 2GHAA 3KJTA 1PB9A 2Q89A 2FA7A 1LGBC 3USDA 5I58B 1MQHA 3CR9A 2ALUA 3U1OA 2GH9A 1JW4A 4GWOA 2PYYA 2DWJA 3C32A 1B4ZA 1VSOA 4DXCA 2XX7A 5L8DA 1PDAA 5JTYA 5LOMA 4I1DA 4RNSA 4KYEA 2PT1A 1ANFA 4ZS9A 3N5LA 5I56B 3OO6A 1A8EA 1AL3A 4IO2A 1LFGA 3FIRA 4NF8A 2DYXA 2KLFA 4LQ2A 1MPDA 2Z23A 1HSEA 2DWAA 3KSJA 1R9LA 1LAHE 3DELB 2H98A 3D4CA 2NVUB 4IO5A 2H25A 3RY3A 4Z0IA 1I6AA 4AB6A 4DCXA 2VGQA 2P1SA 3K0VA 1B7UA 1XT8A 5DVIA 2ONKE 4NE4A 1WDNA 3E4RA 1IXIA 3VV5A 4TOZA 1UTBB 1LSTA 3EPEA 4U21A 3PPRA 1AMFA 3T9HB 3OO8A 5B70A 4OQOA 4KYDA 4ELRA 2QRYA 1I6BA 1N3XA 2Y7IA 3M3LA 2DSFA 3H6VA 3CI8A 4E0XA 3OENA 5CI5A 1MPCA 3H03A 2E1SA 2QMWA 3K1MA 1S50A 2XXQA 4Q5TA 1DMBA 5AA4A 2Y7PA 3RPWA 4TLLB 5H8QA 3T9XB 1JNFA 5FHNA 1AOVA 3DP6A 1QVSA 3KJ7A 4U22A 4R74A 3TYHA 1FQEA 2THIA 4GLIA 3FATA 2F78A 4LUBA 4BDNA 3VVEA 3K6XA 1N7WA 1N84A 3VDFA 5I2NA 2DWHA 3LC8A 3TCGA 5HPQA 4I8CA 2G93A 4WEDA 5CM6A 5EHSA 3CVGA 2DE4A 3I3VA 3LSWA 2F7CA 4XXUA 1GGGA 3FXUA 4ZEIA 3FJGA 4PE5B 2ZYNA 3C9HA 3CG3A 1H44A 3GBBA 1TXFA 1HSJA 1NNTA 3OSRA 3HCQA 1Y3QA 4LA9A 3SEWA 1I6QA 4L17A 3C36A 3PMXA 1B7HA 3TTMA 2PT2A 3O6IA 2QSXA 4DIGA 1FQCA 3DP4A 4OETA 4AB5A 1A40A 3TPAA 4FEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MIJA 1JQFA 2DQVA 1MM7A 1NKXA 1PB7A 4XKNA 4TQUQ 4NF6A 1FTMA 2YPNA 5ESYA 2A5TA 1J1NA 1N04A 1SI1A 4GIZA 3K1PA 1YTVA 2X26A 3PD8A 2B3BA 4F1YA 3T1BA 1FW0A 5H8NB 4MNPA 1GR2A 3R7XA 1RYOA 1DPEA 2QS1A 1B2HA 1O7TA 2F97A 3MPLA 2I4BA 3IJXB 3CIJA 5TPAB 3G3HA 1QW0A 4N8YA 3KZGA 5I59B 1P1NA 4GQOA 4FATA 5DYHA 4G8HA 3H6UA 1IZ1A 4OVPA 3G3FA 4H5GA 5A5LA 3HHFA 4OHNA 4O3BA 2WBDA 1D3KA 4PFBA 4PFWA 1LBWA 3UA8A 3IOVA 3MZ1A 4GWSA 1P1QA 1B9JA 4QFPA 4MX6A 1HSLA 1MQIA 2RKMA 1IXGA 1Y1ZA 4ZDMA 3CG1A 3E13X 3BIGA 5BWJA 1NNKA 3EQ1A 2WEFA 4GBVA 2AL5A 3KSXA 4HCYA 4IR8A 2OK2A 5B7DA 1VFEA 3F11A 3GZGA 4DDDA 3JV9A 4IO6A 2UVJA 5TP9A 3ZS6A 1Q1KA 1AH5A 1Y20A 3KG2A 3QUFA 3KOSA 4NWCA 5H8HB 1NUZA 3C34A 4RJZA 3OMBA 3ECRA 2V93A 3MPKA 5ET5A 1D4NA 1B6HA 5BUUA 3MVWA 3U65A 3JZJA 4X1DA 5IGAA 1LFIA 3C4MA 1LCFA 2V3UA 1N0TA 4JBZA 5F1QA 1LBBA 1FPFA 1M5CA 4BDLA 2ONSA 1MM6A 3RYDA 4BDRA 4AS4A 3O66A 3V89B 4PFUA 4JSDA 4N8GA 4G2ZA 2XWKA 3O97A 4FEBA 3PPOA 2VPOA 4GVOA 2F7BA 3OD7A 1EZOA 1IEJA 1ZKBA 2NXOA 1BKAA 1F9BA 2I0BA 3AXFA 4R9GA 1LLSA 2V25A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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