4H8IA

Structure of gluk2-lbd in complex with gluazo
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
publication title A photoswitchable neurotransmitter analogue bound to its receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8iA02
2Q2CA 2Q2AA 5BWJA 4TQUQ 4NF4A 3IB1A 3CFLA 1QULA 2ABHA 3TCGA 5I56B 4DZ1A 4BLAA 4MLVA 3T93B 1MPCA 3RUMA 3L6GA 3KBRA 3A3UA 2RF1A 4KPTA 2P2AA 4U21A 3QUFA 1RYOA 2Z8EA 4MFIA 2CMOA 3HN0A 3TTRA 3U94A 3OOAA 4TLLB 1ZKBA 1B52A 1DMBA 3FXUA 1OQHA 4F2OA 4NF8A 3FXQA 5ITOA 3FXRA 5K2YA 3H6VA 1P1UA 1N76A 4RPOA 5I56A 4BDRA 1LAXA 1IXCA 4YKPA 3K0VA 5DVFA 2ONKE 2QMWA 2O6AA 3A09A 3OXNA 4OENA 3CSGA 5M2VA 1POY1 2GFEA 4RXLA 4YMAA 3KN8A 5DVJA 3T96B 1MDP1 4C1TA 3EHSA 3DM0A 3EHUA 4OYVA 3ODBA 4KFQA 5I2KB 3OO7A 4IO4A 4R9FA 3V5AA 1LFIA 3CG3A 1I6AA 1B2HA 3KOTA 3ZKKA 4OFJA 1A8EA 3KG2A 2DXYA 5HBCA 4MBPA 3IAZA 4N6PA 3G3IA 1ELJA 5KDTB 1MDQA 4G68C 1LLSA 3IO6A 3CI8A 3O66A 1OLCA 1H3DA 4GXAA 3S9LC 4FORA 4U4SA 2I0CA 1B0HA 3TKDA 4NF5B 3I3VA 5I2KA 4LA9A 3ILTB 1SYHA 3Q26A 3TFLA 5AA2A 2WKYA 4DE8A 2DYXA 3CSBA 4R74A 1B3FA 1SW4A 5KDTA 2QS2A 3C9HA 2ZNSA 2XD2A 3O9PA 2REJA 3GZGA 2NVUB 3HHFA 4PFUA 4YMBA 1FTOA 3K1NA 4YB5A 2O68A 4U23A 3PPRA 3ZS6A 1D9YA 5L9OA 4I8CA 4FEBA 2O69A 2ONSA 3RT8A 5HM4B 2H5YA 4JB7A 3FV1A 3FJ7A 4M4GA 2ZYNA 2ANJA 2VD2A 1QUIA 3F11A 4GVOA 4EF1A 4R6KA 4ELRA 2G93A 4QFKA 3KJTA 1A7LA 4FIMA 3CIJA 3H03A 1YAEA 1D4NA 4JWXA 1YPNA 3UP9A 3SEWA 4F1VA 1FQEA 4I9DA 2O84X 3UK4A 2XXTA 4PFYA 2I4CA 2QS3A 2B3BA 1B5JA 5CRYA 1D9VA 2RKMA 3KSXA 4X1BA 5H8SA 1B5IA 3VLVA 2O7UA 3S9MC 2Z8FA 4UACA 3LSWA 3T9UA 4PE5B 2UVJA 4ESWA 3K00A 1SYIA 2NWJA 4P11A 5AA1A 3PPPA 4FECA 5EHMA 3RTFB 3KN7A 4BDMA 4JDFA 3B6WA 3CRBA 4OMBA 3CFZA 4JWOA 4RYAA 1LAFE 3MPLA 4G77A 4DXUA 5I57B 4LZ5A 5AA4B 1MXVA 3T9HB 1FQAA 4ISUA 3WAFA 1HSJA 2XXVA 2HXWA 4DDDA 2THIA 3CVGA 2X7QA 3SDFA 1ZMGA 4PETA 1M5DA 4L17A 2F7BA 2XX8A 3RY3A 3LBSA 1B3GA 3V8XB 3U72A 2OZZA 1Y4CA 2PMSA 4XXUA 3R26A 1HSLA 2X7PA 4H65A 4R9GA 2O1MA 2PBWA 5I57A 5L9SA 4H8JA 2BJJX 1TFAA 4ZZAA 5AA4A 1IIWA 3G7WA 4XKPA 1LSTA 2QPQA 3HSTA 2P1SA 2VOZA 4WKMA 5JTYB 5CMBA 4R2BA 3JYRA 5KZTA 3FD3A 1B7ZA 1FQBA 4ZDMA 1B6HA 1MY2A 3S9EA 3KOSA 1HSEA 1NH7A 1MQIA 3TTMA 3KGCA 1GVCA 1XC1A 3UGWA 3MUQA 5DEXA 2X26A 1SD3A 3S9NC 3MZ9A 2RCBA 3IJOB 4M1VA 3IOTA 4N07A 5B70A 3K1PA 4PQJA 3TCFA 2XXPA 3TEPA 2DE2A 4X48A 1MS7A 2UVIA 5ITPA 2LAOA 1ZU0A 4NF6B 5TP9B 5FHOA 2VP1A 2GHAA 2KLFA 1FTMA 2QSXA 3VV5A 3TTKA 1ANFA 1AH5A 3DELB 4FE8A 3DP4A 3VE1B 1MY4A 1IITA 5I2NB 3UA8A 2QS4A 3M8UA 1FTJA 4OQOA 1US5A 3W9VA 2Y7WA 4Q5TA 4GOTA 4WEDA 1MRPA 3MVWA 4F1YA 4DCXA 4O3AA 5TP9A 3ZKLA 1Z7NE 1L5TA 1NNTA 4H0WA 1JQFA 4NF4B 1NH8A 4KHZE 1TWYA 1B05A 2VD3A 1PB7A 1B4HA 4IY5A 1S50A 2UYEA 2F34A 4GQOA 5JK4A 4QRZA 4X1DA 4JSDA 4I62A 3R7XA 2UYFA 4DCYA 4MF3A 4RNSA 1T0KA 3G3JA 3MP6A 1R9QA 1MM7A 2YPNA 3EN3A 4F3GA 4NF8B 1I69A 2PT2A 3IO4A 1B1XA 3IJXB 4FJPA 3LR1A 3UN6A 1II5A 3SEYA 1O64A 2CZLA 2AL5A 3CR9A 3VXBA 3MVYA 3K4UA 1QVSA 3JZJA 3K6XA 1MY3A 3MW0A 3H3GA 3I5OA 2H98A 3OO6A 4GL8A 4LATA 2R71A 5BUUA 2H4IA 3R6UA 4IB2A 4Q8RA 4ELPA 3C32A 3K6VA 5ICQA 3OEMA 3FJMA 3U8QA 4GRKA 1R1NA 5CC2A 1MXXA 2F7CA 2I6EA 3LSXA 2FNCA 4F22A 4GFRA 3MP8A 4ZE8A 4F2QA 2H25A 2RC8A 3CFXA 4IO3A 1YTVA 3VLUA 3N5LA 2IEEA 1IZ1A 1BIYA 3QUJA 3VFJA 3IB2A 3VDFA 2HEUA 1YCJA 4QF9A 1NNPA 2XHDA 2NOOA 5AA2B 5CBRA 1VFDA 1H44A 4LQ2A 4ZZEA 4UA8A 1IEJA 3LC8A 4G68B 2ZNTA 1PB9A 4JWYA 1IQ7A 4NEDA 2GH9A 1B32A 4F29A 2O51A 1P1NA 1RKMA 5B7DA 4YKIA 2QL3A 1LAHE 4BDLA 1XOCA 2ONRA 3N6TA 4IO2A 4OESA 3TCHA 1JW5A 4I1DA 4JBZA 3T66A 2O1LA 2V3UA 1P1OA 2HAUA 3O6IA 4JXIA 3DLNA 3N6UA 1S9TA 3MBPA 5EHSA 1P1QA 2Z23A 5H8HB 4EXKA 2XXWA 4G68A 4Z7EA 1OVBA 1NMUA 5JEIA 5I59B 2D21A 3RQTA 1D3KA 2Y7PA 4Q0CA 3BFUA 3PV0E 4U1ZA 1MXUA 3FJGA 1SBPA 4LZ7A 4H5FA 2P0SA 3IK6B 1DTZA 1AMFA 3IL1B 4ZEKA 4POWA 5H8FA 2HCAA 4YAHX 1MQDA 5HPQA 5H8HA 1Z7ME 3PD9A 5L8DA 4XKNA 1EZOA 1GTKA 1MQJA 3TYHA 1LAGE 3TTLA 1VFEA 5A5XA 4F3SA 5I59A 3KEIA 2HFBA 2HZLA 3HV1A 4LUBA 3FIRA 3H6WA 4F3PA 4P0GA 3MQ9A 3P7IA 4EXLA 2Q89A 3THIA 2UXAA 3B6TA 3LSLA 1SI1A 1SW2A 2Y7IA 2F5XA 1B9JA 2XX9A 1B3EA 4LP2B 1VE4A 1Y4TA 3TELA 1NNKA 1ATGA 4RJZA 1AOVA 4G8NA 4ELQA 4ELOA 1IXHA 1B3LA 3QK6A 4KYSA 1B51A 1MH4A 4NWDA 4IO5A 5CMCA 1A99A 3B7DA 2DVZA 3OO9A 1P1WA 3FVNA 4IO6A 2YLNA 2ZNUA 1EZ9A 1MXYA 4OZ9A 2Y7KA 3M3KA 2F97A 4HCYA 2ZXTA 4N13A 4KCCA 5I58B 4O3CA 2I58A 3BFTA 3GBAA 3PPNA 1KWHA 4DIGA 3G3GA 3IOVA 2PX1A 4POXA 4H1XA 1JNFA 1JW4A 3GXAA 2OWSA 4F39A 1VSOA 4YU0A 4DXCA 3QIMA 4LZ8A 5CBSA 2AIXA 3EQ1A 4XIGQ 4H8IA 5DEXB 2ZYMA 5IKBA 3S4UA 1B7UA 4IY6A 3EHTA 2W7YA 3C35A 2HQ0A 2H9BA 2REGA 5I58A 1N7WA 1PBQA 1IXGA 3OSRA 3VVFA 2XX7A 3HCQA 3K2DA 1EZPA 3L6HA 3M3FA 5H8NA 2Q8JA 4RA1A 4C0RA 4YB7A 3W15C 3G3FA 1NFTA 3PUZE 4FATA 5IAIA 1NL5A 1PDAA 1FTLA 2R9JA 4BDNA 4G2ZA 3G3HA 3H7MA 4QSDA 2V93A 4H5GA 1LFGA 4EDPA 5KCJA 4F31B 4EF2A 2XXHA 2OLBA 1LB9A 1B5HA 2ALUA 3ECRA 2ESNA 2E0SA 3ONMA 1Q35A 2F78A 1B1HA 3KSJA 4EUOA 2OK2A 1MH3A 3TQLA 4TOZA 4OXVA 1NKXA 1Y1MA 2VHAA 4QFLA 3RTWB 5DVIA 4XKQA 1SI0A 3K6WA 1M5FA 1UTHA 3BBRA 3MWBA 5CI5A 1LBCA 3MC2A 3SESA 2ZYOA 3RT6B 4PFTA 1MXWA 5AE4A 1Y3PA 1ZIUA 1LFHA 4OETA 3HHGA 1MY0A 3QYTA 4NWCA 1XVYA 3K1MA 2G29A 1DPEA 4HTGA 1QKAA 4AB5A 3RLFE 4C1UA 3PUVE 4YB6A 4RPNA 1F9BA 4E0WA 3IR1A 3U1OA 2XD3A 2DS9A 1TT1A 2IA4A 3Q28A 4YICA 1GR2A 3SEVA 1N7XA 2I4BA 4GLIA 1CE2A 4GF8A 4Q30B 4OFOA 1S7YA 1OQGA 5ELVA 1I6BA 4QSCA 3Q29A 1TFDA 1BKAA 5FTHA 4K3FA 4ND9A 3V83A 1MQGA 3MAMA 4ZEFA 5K2XA 4F3BA 1MXZA 4QFPA 1JEVA 5F1QA 1O7TA 4F19A 1SW5A 3MP1A 3MPKA 1B46A 3FVOA 3LUYA 2DE3A 1Q1KA 4U1OA 1B7HA 3TPAA 2DXRA 1MM6A 2I0BA 3VLWA 1PEBA 4GWOA 4DXBA 4YZZA 1OMPA 4OVJA 1RYXA 1PB8A 4QFOA 1N0TA 2RC9A 4FEDA 3VVDA 5CMMA 3TUSA 1DPPA 1UIUA 2F36A 3UIFA 2OJTA 1J1NA 1ZTYA 2HAVA 3V89B 2ZYKA 4P0IA 3UORA 1Y20A 2M8CA 5AA2D 2F35A 5L9MA 2B65A 1MG1A 1SDXA 3QSLA 4KI0E 2Y7RA 4MH5A 1B40A 3U93A 1Y3NA 1XHYA 3SETA 3TZAA 1IXIA 4EQBA 5AA3A 3RPWA 2UVHA 5TU0A 5TPAB 2XXRA 1QUKA 3OD7A 4LVQA 5FHNA 2OCUA 5H8QB 4IGTA 2A5TB 2DWIA 4R6YA 2DQVA 3IORA 3WAEA 1LBBA 3IX1A 5J1DA 4LQ5A 1SVXB 3MVZA 2FA7A 3O97A 5LOMA 3OSQA 2OWTA 1R9LA 3RN8A 1SW1A 1B4ZA 3D4CA 1JVXA 2XXQA 4KQPA 4ZECA 1FQCA 1USYH 3TDJA 3SKPA 3OENA 5H8FB 4PP0A 4U4XA 5TPAA 2XXIA 3FGSA 1URDA 4HCWA 3ILUB 3FVGA 3TQWA 3A3CA 1GGGA 2RCAA 2GHBA 3HO7A 4HS7A 3H6TA 5H8QA 2F7AA 2A5TA 5A5XB 1FCKA 4NE4A 4LONB 2QJEA 2PVUA 4GD5A 5CMKA 1M5BA 2ZMBA 3N26A 3E3KA 4ZEDA 4IO7A 4FAJA 3S2VA 2PT1A 1MPDA 3OMBA 2DWAA 1URGA 2Z8DA 3H4ZA 3TMGA 1PC3A 3MZ1A 4EQ9A 3K02A 3LSFB 2VGQA 1UTBB 4KYDA 4KYEA 5FTIA 4MLQA 3M3LA 4G4PA 1OVTA 4XTCQ 4OEUA 3Q25A 4ZEIA 1BLFA 1XS5A 4OFLA 4G8HA 4ESXA 1FW0A 3MVXA 4NF5A 3K6UA 4KD5A 2UVGA 1OIBA 2E1SA 2I3WA 3SEUA 1N84A 2DOJA 3QAXA 4OEVA 1USYE 4NMYA 1QKBA 1QJMA 1A54A 1N3WA 1Y9UA 3TODA 2QRYA 4KCDA 3TTNA 3GLBA 1A55A 2XXXA 1M5CA 4IGRA 3KN3A 1FQDA 1UTBA 1ZBMA 4THIA 1ZJLA 4PFWA 1H43A 2FYIA 1AL3A 2AYSA 4ZE9A 4OERA 3GBBA 3OELA 3PUXE 2A5SA 1WDNA 5EYFA 4OTEA 4RY1A 1EH3A 3O2AA 3ZSFA 1H76A 3QXMA 1QW0A 2F6GA 3OO8A 4KR5A 1LCFA 3JV9A 3PMWA 4O3BA 1UQWA 1LCTA 2QMXA 3O28A 1JW1A 4QFNA 4JSOA 1BP5A 2DE4A 1MQHA 2V3QA 5DYHA 1JETA 2D3IA 4AB6A 1WVJA 2V3TA 4R2FA 4ECFA 1JVYA 3EPEA 4G8MA 4ZEBA 3T22A 3G3KA 2D5WA 5F7VA 1DOTA 3RNNA 1IUDA 2Y84A 3MZBA 4OHNA 2DWJA 2F6PA 3H06B 2RINA 3PD8A 4R72A 5DT6A 3C34A 4Z0IA 1R6ZA 3KZGA 5ISUA 4NTLA 4HW8A 1WODA 5H8NB 3SEXA 4WXJA 3IOUA 3TAJA 2AL4A 4ONYA 3N94A 1B3HA 1MPBA 3H6UA 3BKIB 2OBGA 1Y3QA 1H45A 3PMXA 2V25A 2XXUA 2Q9TA 1XVXA 2B3FA 4RK9A 4H67A 1JEUA 1A40A 3I6VA 5KCJB 4XKRA 3PGFA 3EF7A 4QHQA 1N3XA 5I84A 4OWDA 3U92A 4U22A 2I49A 4R75A 2DWHA 4ZS9A 4RK2A 1UIVA 3CG1A 2NUVA 2DVCA 1B0LA 1CB6A 1M5EA 4F18A 1I6QA 2DP8A 4AQ4A 1US4A 2YJPA 2GRVA 3K01A 1UTHB 3SERA 3C36A 3FUZA 3D4GA 4BDOA 3Q27A 2H99A 2I3VA 1O63A 3DP8A 1NNFA 3FVKA 2DSFA 1VR5A 3T9VA 4F1UA 2O7IA 3O29A 3E4RA 1A8FA 3PU5A 1AIVA 3FASA 5FHMA 1GV8A 3IOWA 1SQYA 5JTYA 3PPQA 2XXYA 4DLDA 4R73A 1LB8A 2NXOA 3C33A 4U2RA 3USDA 1BTJA 5ICTA 4YKJA 1FQFA 1POTA 3VXCA 3DP6A 3KJ7A 3B6QA 4QSEA 4EQ7A 1LGBC 4H6DA 1PBPA 3FZVA 2V84A 1FTKA 1URSA 3AXFA 3FV2A 4YKKA 4X9TA 5CM6A 2HZKA 4WEPA 3KFMA 3PUWE 3PMVA 1QUJA 1ZLQA 1DTGA 2RC7A 4NF6A 3E13X 2Q88A 1B58A 1OLAA 4GIZA 3VVEA 1Y1ZA 2R6GE 2F8DA 4E0XA 3RGYA 1MY1A 3OEKA 3O6GA 2QS1A 1TXFA 3MJNA 1DSNA 3IB0A 1EU8A 5DTBA 3E9XA 3PUYE 4GL0A 2PYYA 4TLMB 5I2NA 4BDQA 1N04A 2I48A 3C4MA 3T9XB 3FATA 3PPOA 3O6HA 3W9WA 3HPIA 1P99A 4R6HA 4GXSB 2Z22A 3C31A 1XT8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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