1P1NA

Glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with kainate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA01
4X1BA 2Y84A 5L8DA 3L6HA 3PUVE 3RT8A 1B2HA 3HSTA 4JSOA 2Y7WA 3O28A 2QRYA 3KGCA 3FVOA 1ZMGA 4DIGA 3IOWA 1RYOA 4RJZA 4YMBA 1USYH 1B1XA 1D3KA 2VP1A 1LFIA 2ALUA 4AQ4A 4F39A 2O6AA 1ELJA 1MS7A 4BLAA 3MWBA 3TTRA 1JW5A 3UK4A 2PVUA 2X7PA 2XXRA 1PBQA 1LAFE 3GLBA 3KJ7A 5DVFA 1TXFA 1IZ1A 4TOZA 4DE8A 2YPNA 1ATGA 4OXVA 1P1UA 3V83A 4IY5A 1OIBA 1URSA 1P1OA 1B5JA 3PPQA 3B6TA 4NTLA 4XKPA 2DVZA 1IQ7A 4RA1A 1LSTA 1LCTA 2QSXA 3UGWA 1D9VA 3JZJA 3KG2A 3PUXE 3TCFA 4GF8A 1MQDA 1ANFA 4OQOA 2YLNA 2F7BA 4FEDA 5CMBA 1M5DA 5ICQA 1QVSA 2QJEA 2UYEA 4I1DA 3EHSA 1N0TA 3TZAA 4DXUA 1VR5A 3H03A 4THIA 4WKMA 1JNFA 3I3VA 3KFMA 2V84A 4QF9A 3Q29A 5L9MA 2D3IA 2Z8FA 3K1PA 3Q28A 3T96B 4LVQA 5B7DA 4OFLA 5CC2A 5H8HA 1I69A 4PFWA 5I2KA 5I2KB 2REJA 4KHZE 5FHNA 1IXGA 4KI0E 1Y3QA 5H8QA 2HZKA 5H8QB 2B3BA 4FORA 2DWAA 1JVYA 2VD2A 3VVEA 1NNPA 1US5A 3QUJA 1DPPA 4DCXA 3FJ7A 2ZXTA 1S9TA 2Q8JA 4MLQA 1B7ZA 4MLVA 4ZDMA 4KR5A 4O3AA 5I2NA 3PGFA 3VFJA 2DE3A 2ZYMA 1IITA 5I2NB 2B65A 1AOVA 3SEYA 1CE2A 3MQ9A 1LB8A 1ZTYA 1NL5A 1MDP1 4QSCA 3JYRA 3CIJA 4PFTA 4H5FA 3PMVA 1SYIA 1J1NA 4YKJA 2G93A 5AE4A 4ZEDA 3HN0A 4EXLA 2FA7A 3OMBA 1MXUA 2GHAA 2NUVA 3RPWA 4GWOA 4BDQA 4OVJA 3G3FA 4M4GA 4YZZA 1LB9A 1A40A 4R74A 4IB2A 2ONKE 3S4UA 1B4ZA 1A54A 4YKIA 3E3KA 5H8FA 4F3GA 5H8FB 3H6UA 1N3XA 3PU5A 1B3FA 3D4CA 4Q30B 1B40A 3CSBA 2XX9A 1XT8A 1TFAA 4N6PA 4ZEKA 1PBPA 3CG3A 1RYXA 4IGTA 3MC2A 3LUYA 2I4BA 1NH8A 5AA4A 3VVDA 1SBPA 2VHAA 1QKBA 4BDLA 5AA4B 3C4MA 4OERA 4KYSA 2P2AA 2GRVA 3Q27A 3MW0A 2Y7KA 3IX1A 4GL0A 4F3SA 1Q1KA 2Q2CA 3PUWE 3VXCA 1N3WA 4ZZAA 3W15C 4HCWA 1B32A 4H0WA 4H1XA 3TKDA 3R26A 4G68C 4EUOA 5EHMA 3SKPA 1FTLA 3V89B 3O6HA 3KN8A 4F1YA 2GFEA 3MVYA 2DVCA 2XXUA 3H7MA 3QAXA 4OFJA 4EQ9A 2Q2AA 4QRZA 4KQPA 4LATA 4OESA 3RLFE 4IO3A 5F1QA 3CFXA 1NH7A 4H65A 2GHBA 3GBAA 4PETA 3PUZE 2XXWA 2DS9A 5L9OA 4FATA 4ZS9A 4GFRA 3SEXA 3U92A 1OMPA 1FQAA 5DEXA 1NFTA 5DEXB 4OEUA 4U1ZA 4QHQA 2HXWA 4ZEIA 2XXHA 2B3FA 1OQGA 3TPAA 1FQFA 2NVUB 2RF1A 4OWDA 3UORA 4RNSA 1MXVA 4P11A 3AXFA 5BUUA 4R72A 3ILTB 3S2VA 2ZNUA 3TTLA 4FAJA 4U2RA 2O51A 4BDOA 3C9HA 2V3TA 4FJPA 2PBWA 3MVXA 5I59A 3TDJA 5I59B 5A5XA 3DP8A 1MQHA 2X7QA 3HO7A 3L6GA 3FIRA 4MF3A 5A5XB 3RUMA 4Q0CA 1MY4A 3GBBA 4U4SA 2AL4A 3H6TA 1B6HA 3TTKA 1IXCA 3IO6A 3O29A 1GVCA 4GXAA 4H8JA 1FQEA 3C36A 5K2YA 1GV8A 2I58A 1MQGA 1ZBMA 4XTCQ 1N76A 1UIUA 4YB6A 4X48A 2OZZA 4IO6A 1MM6A 4FIMA 1O7TA 3G3HA 4I9DA 3IR1A 4GRKA 1XHYA 3G3KA 1VSOA 3KBRA 2Q88A 3QUFA 4EQ7A 1A8FA 2Z22A 3ZKKA 2G29A 4U1OA 4GXSB 4R6HA 3O97A 1TT1A 1AMFA 2OLBA 3EPEA 1II5A 4NF4A 1Y1MA 2I3VA 5B70A 4NF4B 3FJMA 3K00A 3OOAA 3QSLA 3SEWA 3A09A 3C35A 3G3IA 3O9PA 4ZE9A 3EHUA 2F36A 4QFPA 2THIA 1BTJA 1GTKA 1ZLQA 2FNCA 3CG1A 3IB1A 3R7XA 3IL1B 4N13A 1MPDA 1Z7NE 3U93A 4MFIA 1B1HA 2O84X 3WAEA 5ITOA 3ZSFA 4QSDA 4P0GA 5CMMA 3DM0A 4OMBA 4KD5A 3F11A 3IB2A 5TPAA 1MY1A 3FD3A 5TPAB 4P0IA 3OXNA 1SW2A 5FHMA 4QFLA 4R6KA 3E9XA 3BFTA 4FECA 2A5TA 2DWHA 4ZEBA 2A5TB 3CVGA 4NEDA 4OTEA 1N7WA 2QMWA 4WEPA 3TODA 1Y9UA 1S50A 2HFBA 1MPBA 3CFLA 4XIGQ 3VLUA 1IXIA 2OK2A 1AH5A 3BKIB 2Q9TA 2DQVA 3TTNA 2O7UA 2CMOA 2OWSA 1UTBA 2REGA 4GOTA 3TUSA 1UTBB 2ANJA 5TU0A 4U21A 4EQBA 2I49A 1P1QA 4N07A 2F35A 1HSEA 3A3CA 2F7CA 2D21A 3FXRA 1URGA 2XXVA 3EF7A 5KCJA 4ZZEA 1DSNA 5KCJB 1Y3NA 1FW0A 2O69A 5EHSA 3C34A 3CSGA 3PMXA 4H6DA 5FTHA 3VVFA 1Y20A 2XX8A 5KDTA 5HBCA 5KDTB 4BDNA 3TEPA 1OVTA 1Y1ZA 4GL8A 1LCFA 1M5FA 3RTWB 5H8HB 1SVXB 3SEUA 1MDQA 1FTMA 4NF6A 4NF6B 3OSRA 3MZ9A 1I6QA 4NWCA 1MG1A 3U72A 4GVOA 3G3JA 4E0XA 1M5CA 3K6UA 3FJGA 1FTKA 4KFQA 3LSFB 2F6PA 5EYFA 2P1SA 2ZYNA 1PC3A 2DSFA 4H8IA 4RYAA 1ZJLA 4F1UA 2VGQA 3U8QA 1TWYA 1GR2A 4TQUQ 1HSJA 2X26A 1GGGA 4JB7A 3MAMA 4KCCA 2HCAA 3C31A 1CB6A 1VFEA 3CI8A 4KCDA 5ISUA 2UVIA 2F5XA 1EH3A 3MP8A 3FVKA 3KN3A 1R9LA 1YAEA 3KOTA 1I6AA 1A8EA 4MBPA 3V8XB 3H6VA 5J1DA 2H9BA 2I48A 3MJNA 4UACA 4UA8A 1PDAA 1UIVA 1Q35A 3QXMA 4AB6A 2Z8DA 3UIFA 1JEVA 3LC8A 3I6VA 3QIMA 4WXJA 3IO4A 3RY3A 4ISUA 3FGSA 1WODA 4OEVA 5DTBA 3P7IA 4ELOA 2HQ0A 4RXLA 2FYIA 1HSLA 5IKBA 5DYHA 2XXTA 3PD9A 4Z7EA 2XD2A 3VE1B 3A3UA 2UYFA 4HS7A 1JQFA 3TTMA 4RPOA 4KPTA 1B5IA 3K1MA 1FCKA 1N7XA 4R9FA 4LZ8A 1BKAA 2ONSA 1H45A 3MVZA 3VLWA 1MY0A 3EN3A 5TP9A 2Z23A 2ONRA 5TP9B 1FQBA 5LOMA 4JSDA 2ZYKA 4LONB 2RCBA 3MZ1A 5IAIA 4TLLB 4ESXA 4DZ1A 3FVNA 1MY2A 1R9QA 1Z7ME 1P1NA 3FATA 1SW5A 4K3FA 2I0CA 2NOOA 3UP9A 2H4IA 4LP2B 3K6XA 3MUQA 4QSEA 4U4XA 4YAHX 4H67A 4POWA 5JTYA 5JTYB 4IY6A 4QFKA 1LFHA 4R2BA 3HCQA 4JBZA 2BJJX 2I3WA 1MQIA 2XXYA 1NKXA 3IOVA 2F8DA 4L17A 1LAGE 3S9MC 4C1TA 1QUIA 1KWHA 1EZPA 1LLSA 1RKMA 5AA2D 4R75A 5I56A 1MQJA 4PQJA 1L5TA 5I56B 4GD5A 3VLVA 1D4NA 4FE8A 4F18A 4AB5A 1XOCA 4XKNA 5ITPA 3FXQA 4LZ5A 2P0SA 3PPNA 1IIWA 4LZ7A 3TELA 2V93A 5HPQA 3Q25A 3MP1A 3T9HB 5M2VA 3RGYA 1IEJA 1A99A 4G68A 4ECFA 3HPIA 3OEMA 4G68B 3CRBA 4IO2A 3ILUB 3BFUA 4OHNA 1YPNA 3QYTA 3T9UA 2F97A 3H3GA 4Q8RA 2Q89A 3C32A 2O68A 2F34A 3E4RA 1XVYA 5I58A 5I58B 1US4A 3LR1A 3VDFA 3KOSA 1IUDA 1N84A 3M3FA 5CBRA 1LAXA 3IORA 3K6VA 3T9XB 1F9BA 2V3QA 1JW4A 4EF1A 3KZGA 1FTOA 2OWTA 3M3KA 2OCUA 1QUKA 1BP5A 4KYEA 3PD8A 4ZE8A 1UTHA 4O3CA 2DP8A 3IAZA 1UTHB 3PPPA 4PFUA 3RT6B 3FXUA 3KSXA 3TMGA 1B4HA 3SETA 2H98A 4C0RA 4PP0A 3S9NC 2I4CA 1IXHA 3OSQA 2A5SA 1MY3A 4ELRA 2O7IA 3ODBA 3O2AA 4XXUA 3SDFA 2ZNTA 1DOTA 1B0LA 3DLNA 2DE2A 1NNKA 4YU0A 1H43A 4GQOA 5AA2A 1DTZA 1H44A 5AA2B 1JW1A 1XS5A 1Y4CA 1ZU0A 1PEBA 2RC9A 4DLDA 2D5WA 1MM7A 3PV0E 4BDRA 3HHGA 4XKRA 1B3EA 4FEBA 1O64A 3OO8A 4ELPA 3TQLA 4HTGA 4X9TA 4ZECA 4M1VA 2IA4A 3K01A 3C33A 1LGBC 1SI0A 2QPQA 3S9LC 4MH5A 2RINA 3LSWA 3KN7A 4DXCA 3FVGA 3U1OA 3B6QA 3T9VA 1NMUA 3H4ZA 3PMWA 2XHDA 1ZKBA 5AA1A 2DXRA 5CI5A 1PB8A 1MH3A 4X1DA 3JV9A 2O1MA 2R9JA 3K6WA 1O63A 4NWDA 5F7VA 2DXYA 3O6GA 4F3BA 2QS1A 3K02A 3N5LA 5BWJA 3B6WA 5FTIA 1FTJA 2DOJA 3CFZA 4NE4A 2Y7IA 4PFYA 2UVHA 1N04A 3MPLA 4I62A 1B7HA 3H06B 1TFDA 1WDNA 3T22A 1DTGA 1SDXA 4GLIA 2UVGA 2PX1A 4LQ5A 2ZYOA 3K2DA 2QMXA 1OLAA 4F29A 3O6IA 2RKMA 2XXQA 1SI1A 1VFDA 3OO7A 3N26A 4EDPA 3RTFB 2E1SA 3RNNA 1PB9A 2F6GA 4F19A 1POY1 1POTA 4DCYA 3MZBA 5I84A 3T93B 1NNFA 1BIYA 1Y3PA 3LSXA 1H76A 2WKYA 3RN8A 2XXIA 2XXPA 4HCYA 5I57A 2Z8EA 3H6WA 3THIA 5I57B 1MXYA 4PE5B 1MRPA 2F78A 4H5GA 3OENA 2PT1A 3GZGA 5K2XA 3HHFA 3O66A 2UXAA 1MXZA 2NWJA 3UA8A 4G2ZA 1LFGA 2PT2A 1QW0A 3SESA 4IO4A 4G8MA 4F31B 3ECRA 2E0SA 1H3DA 3DP4A 4LUBA 3G7WA 1B52A 2I6EA 4GIZA 2XXXA 3OD7A 1I6BA 3TFLA 3OO6A 1OLCA 1P99A 3FASA 3TCHA 5CM6A 1XVXA 3IK6B 3TCGA 1LBBA 1FQDA 5H8NA 3EQ1A 2ZMBA 4WEDA 4DXBA 5H8NB 3PUYE 2M8CA 2OJTA 4Z0IA 5FHOA 1B0HA 1JEUA 2QS2A 3FV1A 3SERA 1B46A 4F22A 2YJPA 4F2QA 1MPCA 3DELB 3KJTA 2AL5A 1B3HA 2R6GE 3QK6A 2NXOA 1FQCA 4R9GA 1JVXA 3G3GA 1EZ9A 4TLMB 4ND9A 4EF2A 4OETA 3FUZA 1SD3A 2XX7A 2Y7RA 2RC8A 4XKQA 2Y7PA 2DWIA 3R6UA 3HV1A 5CRYA 3MBPA 3I5OA 2O1LA 3CR9A 2V3UA 2H5YA 4EXKA 1BLFA 3TAJA 5CBSA 2RCAA 3V5AA 2HEUA 4Q5TA 1SW4A 1M5BA 3IOUA 1EU8A 2PYYA 1QULA 3MPKA 1B7UA 4NMYA 4F3PA 1D9YA 3PPOA 3S9EA 4ELQA 1B05A 4YICA 5H8SA 1VE4A 3IOTA 3T66A 3W9VA 1AL3A 2AYSA 4YMAA 3LSLA 2QS3A 4LA9A 1M5EA 4YB5A 4C1UA 2VOZA 1QUJA 4YB7A 3WAFA 1MXWA 2I0BA 1SQYA 2UVJA 1S7YA 3DP6A 1XC1A 2V25A 2PMSA 2RC7A 4G77A 2CZLA 5JK4A 4HW8A 3TQWA 2ABHA 4YKPA 4ESWA 3EHTA 4NF5A 3N6TA 2DYXA 4NF5B 4JXIA 1R6ZA 1URDA 1B3GA 2W7YA 3KSJA 5HM4B 3USDA 1UQWA 1USYE 3FZVA 1A7LA 3ONMA 4U23A 3K1NA 2ESNA 3OO9A 1MH4A 4YKKA 5DT6A 1B5HA 2VD3A 1SW1A 1DMBA 3MVWA 3UN6A 4RK9A 4LQ2A 2KLFA 2ZNSA 5KZTA 4POXA 2HAUA 2AIXA 3OEKA 4G4PA 1YCJA 3M3LA 4IO7A 1LBCA 1Y4TA 4QFOA 4R2FA 3W9WA 3IJXB 2IEEA 1LAHE 3ZS6A 3ZKLA 1B58A 5DVIA 5JEIA 3E13X 2DE4A 4JWOA 3B7DA 5CMCA 4RK2A 2OBGA 3SEVA 2LAOA 1B9JA 2F7AA 1DPEA 2HAVA 4R73A 4F1VA 3IJOB 1A55A 1B3LA 4KYDA 3IB0A 2DWJA 1OQHA 2QS4A 3BBRA 4RY1A 1NNTA 3MP6A 4OYVA 1ZIUA 3OELA 4BDMA 4ONYA 4NF8A 1WVJA 3D4GA 4I8CA 1T0KA 4NF8B 1P1WA 2QL3A 4G8NA 1EZOA 1QKAA 1OVBA 4U22A 4ZEFA 3VXBA 3GXAA 4JDFA 4RPNA 1MXXA 4OFOA 1PB7A 3U94A 3M8UA 3PPRA 2XD3A 3K0VA 2GH9A 5CMKA 4F2OA 3KEIA 3VV5A 3N94A 4DDDA 4JWXA 4JWYA 3K4UA 4QFNA 4OENA 2H25A 5AA3A 1QJMA 4G8HA 2H99A 1AIVA 5ICTA 3TYHA 1R1NA 5DVJA 2HZLA 3Q26A 5L9SA 3FV2A 4OZ9A 4IO5A 4E0WA 1YTVA 1SYHA 1JETA 5ELVA 3RQTA 4IGRA 4O3BA 1B51A 3LBSA 4R6YA 2R71A 3N6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PCRA 4H45A 4X1BA 3MSTA 2Y84A 5L8DA 3L6HA 3PUVE 3RT8A 4HE2A 1B2HA 3HSTA 4JSOA 3FXBA 1NV0A 2Y7WA 3O28A 2QRYA 3KGCA 3FVOA 1ZMGA 4DIGA 3IOWA 1RYOA 4RJZA 4YMBA 2WX9A 1USYH 1B1XA 1D3KA 2VP1A 3B50A 1LFIA 2ALUA 4AQ4A 4F39A 2O6AA 1ELJA 1MS7A 4BLAA 3MWBA 3TTRA 1JW5A 3UK4A 2PVUA 2X7PA 2XXRA 1PBQA 1LAFE 3GLBA 3KJ7A 5DVFA 1TXFA 1IZ1A 4TOZA 4DE8A 2YPNA 1FBHA 1ATGA 4OXVA 1P1UA 3V83A 4IY5A 1OIBA 1URSA 4MHFA 1P1OA 1B5JA 3PPQA 3B6TA 4JVDA 4NTLA 4XKPA 2DVZA 1IQ7A 4RA1A 1LSTA 1LCTA 2QSXA 4MNIA 1D9VA 3UGWA 3JZJA 3KG2A 3PUXE 3TCFA 4GF8A 1MQDA 1ANFA 4OQOA 1DCUA 2YLNA 2F7BA 4FEDA 5CMBA 1M5DA 5ICQA 1QVSA 2QJEA 2UYEA 4I1DA 3EHSA 4NN3A 1NV7A 1N0TA 3TZAA 4DXUA 4PFRA 1VR5A 3H03A 4THIA 4WKMA 1IMCA 3KBZA 1JNFA 3I3VA 3KFMA 2V84A 4QF9A 1EYKA 3Q29A 5L9MA 4H46A 2D3IA 2Z8FA 3K1PA 3Q28A 3T96B 4LVQA 5B7DA 1AWBA 4OFLA 5CC2A 5H8HA 1I69A 4PFWA 5I2KA 1DBZA 5I2KB 2CEYA 2REJA 4HXVA 4KHZE 5FHNA 1IXGA 4KI0E 1Y3QA 5H8QA 2HZKA 5H8QB 2B3BA 4FORA 2DWAA 1JVYA 2VD2A 3VVEA 1NNPA 1US5A 1LBWA 3QUJA 1DPPA 4DCXA 3FJ7A 2ZXTA 1S9TA 3KC0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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