1P1NA

Glur2 ligand binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with kainate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1nA01
4U4XA 3H4ZA 2OK2A 1BKAA 3HV1A 4AB5A 2XXXA 4F22A 3VLVA 2ZYKA 1LAXA 4I9DA 1B7UA 3B7DA 5JTYB 4UACA 3TTKA 1N84A 1JW1A 4LQ5A 2I3VA 1NNPA 4KCDA 4F18A 3C35A 1EH3A 1M5EA 1SI1A 4I1DA 4TOZA 2RF1A 3K0VA 4DCYA 2PX1A 3KSJA 3O6HA 2FA7A 1TXFA 3TQLA 4FATA 3OXNA 1M5DA 2HEUA 3PMXA 3IL1B 3HHFA 1N76A 4ESWA 1GV8A 1L5TA 3JZJA 4YMBA 1M5CA 1SW1A 3CSBA 3V89B 3DELB 3C34A 5H8FB 3RLFE 2FNCA 4JWOA 1R9QA 4PP0A 3B6WA 4KYSA 3BKIB 4C0RA 2XXTA 3Q28A 4EDPA 2GHAA 1B0HA 3MP8A 4X9TA 2PYYA 4Z7EA 1TT1A 3FV2A 5I2KB 4KYEA 5H8FA 2Q89A 3TZAA 3FGSA 1FTOA 4ZEDA 3A09A 1LAFE 1OMPA 3O29A 4PQJA 4X1DA 4NTLA 2F7BA 1D4NA 2DWIA 3ODBA 1Y20A 2UYEA 2E0SA 2D3IA 1IITA 3T9HB 5I2KA 1Y9UA 2ZYOA 3USDA 4OZ9A 4IO5A 3H06B 4F39A 1B6HA 3E3KA 2O69A 1N3XA 2QJEA 1B2HA 3P7IA 4KHZE 2Z22A 3CVGA 1QJMA 3M3KA 2RCAA 4KI0E 1MPCA 2REJA 2WKYA 3L6HA 2IEEA 2QPQA 3UN6A 4GL8A 4BDQA 3HPIA 1CE2A 1LAGE 4IO7A 1B51A 3DP8A 3TELA 3G3KA 5KDTB 4QFLA 1SW5A 5L9SA 1D3KA 3EQ1A 2VGQA 4LQ2A 1B3LA 1BP5A 2PT2A 2F6GA 3N6TA 3V5AA 2QRYA 3KGCA 3FD3A 5AE4A 4LVQA 2ONKE 3B6QA 5CMMA 2NWJA 4DXCA 5KDTA 4U23A 3TFLA 4F3SA 1NKXA 2A5TB 3PPRA 4OEVA 2XX9A 3RTFB 5HM4B 4POXA 2ZNSA 1MH3A 3QIMA 3SEVA 3MW0A 3RT8A 3GXAA 3U92A 4NE4A 5HBCA 3HN0A 2CZLA 2XD2A 1LSTA 4XKQA 2F78A 3TPAA 2A5TA 1A99A 2I49A 2UVJA 5HPQA 2RCBA 3O2AA 1MM7A 3VV5A 1O64A 1IEJA 3Q29A 1B7ZA 3H7MA 3LSXA 1JW5A 5AA4B 2XHDA 3U93A 3G3IA 1FCKA 4KD5A 1DTGA 1Y3NA 3SESA 2YPNA 3I5OA 2DXRA 2Y7WA 4PE5B 3K01A 4MF3A 2D21A 2B3FA 4ZEKA 1VFDA 3MZBA 3QSLA 5AA4A 3K6VA 4YB5A 1NNTA 1SW2A 1T0KA 4OMBA 2NVUB 2H98A 1JVYA 4GOTA 4EF1A 1POY1 1O7TA 3K6UA 4OESA 4LZ5A 3MWBA 4FAJA 3N94A 3U72A 1QUIA 2F35A 3IJOB 1B58A 1XHYA 1Y3QA 4OTEA 3CFZA 2LAOA 5TP9B 2GHBA 3PD8A 4QFNA 1B1XA 1ZTYA 1B3GA 3K4UA 4H1XA 1I6BA 4BDLA 4H65A 3M3FA 4KQPA 4M4GA 3TCFA 4R75A 4AB6A 2F8DA 1LBCA 4ZE9A 2X7QA 1AMFA 4F19A 2W7YA 5TP9A 3FVKA 4NF8B 2ESNA 3KN7A 3CFXA 1BTJA 1YCJA 3KJ7A 4H8JA 3V8XB 3MZ1A 1OQHA 5K2YA 5K2XA 3SEYA 4RJZA 1UIUA 3EHSA 2OWSA 4MLQA 4N6PA 5I2NB 3MC2A 1B5IA 3PPOA 4H5FA 1IIWA 2QS2A 4NF8A 4OETA 2QL3A 1PBQA 2AL4A 1KWHA 4F31B 2HZLA 1BIYA 4ECFA 3VLUA 2ONSA 2UYFA 3U1OA 2V3UA 3S2VA 5KCJB 4ISUA 4DLDA 3DM0A 3I6VA 3T9UA 2Q8JA 2VOZA 1ZJLA 4YAHX 1IXGA 1QUJA 1IXCA 1MQGA 1N7WA 4G8NA 1AL3A 1IXIA 2PBWA 2VD3A 3VXCA 4U1ZA 5H8QB 4ZZAA 1RKMA 5KCJA 4OFJA 4R9GA 2DSFA 1LLSA 2O1LA 4EXKA 3OO6A 3JV9A 1QULA 2I0CA 4X1BA 3FJGA 4ZEIA 1DPPA 1CB6A 4L17A 2B3BA 3RN8A 2Z8EA 1OLAA 5JK4A 1A40A 4RPNA 3FATA 4JDFA 5H8QA 1Y4CA 5I57B 1H76A 3LUYA 2KLFA 1SVXB 3TDJA 1LGBC 1NL5A 3OEKA 4E0XA 3D4GA 3Q26A 5CBRA 4GVOA 4TLMB 5F1QA 3DP4A 2OZZA 2NXOA 2RKMA 4G77A 3T93B 3U8QA 4R2BA 4EUOA 2DE3A 3MUQA 4WXJA 3H6VA 2PMSA 3G7WA 3FJMA 3KSXA 3HO7A 3K6WA 3BFTA 4O3BA 2GFEA 3SDFA 2ZNUA 4ZS9A 4HW8A 4POWA 1MXWA 1OLCA 4G68C 1MQIA 5TPAB 3IO6A 4QFKA 1FQEA 1QVSA 1MG1A 2QS4A 5AA2B 3S9EA 3TAJA 1P1QA 2M8CA 4PFTA 4NWCA 5JTYA 3V83A 5ITPA 1R6ZA 4XKRA 5TPAA 5AA2D 5CC2A 5H8HB 1HSJA 4FEBA 4OFOA 3RUMA 5AA2A 3QUJA 4IO6A 4GD5A 2DWHA 3JYRA 3OSRA 1URGA 2BJJX 3CSGA 4QFOA 2I6EA 4LONB 1PB9A 1H45A 1FQFA 3MBPA 4GFRA 3K00A 4R6YA 2PT1A 2DQVA 5H8HA 3H6TA 3C31A 4RY1A 3MVWA 4ELRA 1MXUA 5ELVA 1MXXA 3CRBA 4FIMA 1Q1KA 2I4BA 3O28A 4R74A 2F97A 1Y1MA 3QUFA 5I56B 3TCGA 3T96B 5KZTA 3TTLA 3KJTA 2AIXA 3W9VA 3ZSFA 4DXUA 3IJXB 2YJPA 5EHMA 1FTLA 1JEVA 2F34A 3FXQA 2HXWA 1P1UA 2REGA 1NNKA 5FHOA 3LSFB 4ZDMA 5I56A 1DPEA 5I58B 2AL5A 1I6QA 1I69A 2XXYA 3E13X 3KEIA 3LSWA 2Y7PA 3HHGA 3FJ7A 2ZNTA 1A8EA 1AIVA 4F1VA 4IGTA 1MDQA 3O9PA 3KOTA 3SEXA 4EQ9A 3UA8A 2NOOA 1QUKA 3S9MC 1XOCA 3UIFA 1D9YA 1USYE 3VXBA 4ELPA 2HAUA 2GH9A 2R9JA 2RC8A 5B70A 4G4PA 1P99A 2YLNA 2F7CA 4F29A 1MH4A 1SW4A 1GR2A 2THIA 2ZXTA 4PFYA 4U1OA 3K1MA 3T9VA 5A5XB 5LOMA 1WDNA 2AYSA 5H8NB 1ATGA 1DMBA 1DTZA 1DOTA 2ANJA 4IO2A 4OERA 4MLVA 3KG2A 2DP8A 3OO8A 4QFPA 3G3FA 4KFQA 4R2FA 2HQ0A 4IY6A 2IA4A 4OHNA 2P0SA 5H8NA 3KN8A 5CM6A 3TTMA 1VFEA 2XXIA 1JQFA 4O3CA 3VFJA 2P2AA 4C1TA 2G29A 2O51A 5CMKA 4OENA 2I48A 5H8SA 2R6GE 1B1HA 4WKMA 3WAFA 3R26A 1FTKA 1XVYA 4MH5A 5L8DA 1LFHA 2RINA 4NWDA 4NMYA 3BFUA 4YB6A 3H6UA 4G8MA 3OO9A 3TYHA 2F6PA 4RYAA 4ELOA 2FYIA 3MVYA 5DVJA 2OCUA 1M5FA 4IO4A 3PD9A 2DS9A 4XIGQ 1LFIA 1GGGA 1MM6A 4F1UA 4LATA 2Q2AA 2O7UA 4NF4B 1TFAA 3QAXA 2UVIA 1MXVA 3QYTA 2I3WA 4WEPA 1JW4A 1Z7ME 1XVXA 3IORA 3OD7A 5DVIA 3GZGA 1OVBA 3S9LC 5L9MA 4PETA 1B5JA 1H44A 1PDAA 1EZPA 3UORA 1FQBA 5DT6A 1MQDA 3ONMA 2OWTA 1YTVA 2H9BA 3SKPA 2X7PA 3M8UA 3TTRA 4FEDA 4ZE8A 2QMXA 4NF6B 5DYHA 3E4RA 1P1WA 1B4HA 4RXLA 1P1OA 2V93A 4HTGA 1HSLA 4Z0IA 3CG3A 1MPDA 2Y7RA 4M1VA 3OEMA 1EU8A 3MP6A 4F1YA 3IB2A 4NF6A 1RYXA 2H4IA 4JBZA 1Q35A 3F11A 2DVZA 3OOAA 4ZEBA 3SERA 3IOVA 4ND9A 2QMWA 4C1UA 3PUWE 3OENA 3FUZA 4KR5A 2Y84A 3TEPA 2O7IA 3MPLA 4ZZEA 1MRPA 3OMBA 4YMAA 4LUBA 3S4UA 3G3GA 3HSTA 4FE8A 4FECA 3GBAA 1I6AA 4GXSB 3H6WA 1LAHE 3LBSA 3PUYE 4YZZA 1YAEA 5DTBA 4LP2B 3C36A 1Z7NE 5AA1A 3N5LA 1TWYA 4JB7A 4OEUA 1PC3A 1MY3A 3CIJA 4RA1A 2DE2A 5I2NA 3DLNA 3OO7A 4YKPA 3MP1A 3TMGA 4TLLB 3QK6A 4XKPA 3OSQA 4JWXA 3IX1A 1A55A 4QSEA 3G3JA 4R6KA 4OWDA 3MVXA 4OXVA 1NMUA 1XT8A 3C4MA 1NNFA 3HCQA 3TODA 1B7HA 2A5SA 1US4A 1AH5A 4QF9A 3CFLA 4NF5B 1B9JA 4TQUQ 2O1MA 2I4CA 3IB1A 3KOSA 1JETA 1OQGA 4YB7A 4HS7A 2Z23A 1O63A 3RNNA 3DP6A 4OFLA 3IOTA 1ZU0A 3FIRA 4Q5TA 4U22A 1DSNA 3EF7A 3UK4A 4LZ7A 3Q25A 4NF5A 4BDOA 2Q2CA 4PFWA 4F3GA 2DWAA 3FVNA 4YKJA 5I57A 1S7YA 5IAIA 4AQ4A 1N3WA 1Y1ZA 4N07A 2I58A 1SI0A 3KN3A 4GF8A 4JXIA 5CMCA 3MZ9A 1EZ9A 3KZGA 2HZKA 5AA3A 5M2VA 3E9XA 3VVEA 1FW0A 3TUSA 1JNFA 1SYHA 5ITOA 4BDMA 3VLWA 1QKAA 3A3CA 4G2ZA 3FXRA 1A54A 1EZOA 3ECRA 1MY1A 2QS1A 4XXUA 5FHMA 4RK9A 4DCXA 3PUZE 4XKNA 3MVZA 4WEDA 2XXQA 1LFGA 1UTHB 3SEWA 4LZ8A 4DIGA 4G8HA 4OVJA 1B05A 2VHAA 1B40A 4DXBA 1VE4A 3VDFA 3IO4A 1PB7A 2ABHA 4THIA 4GXAA 1F9BA 4H6DA 1B52A 4I62A 4UA8A 4LA9A 4RPOA 3LC8A 1YPNA 3EHUA 1UTHA 5I84A 4U2RA 1N04A 4X48A 5B7DA 2DXYA 3TTNA 3O66A 1R1NA 4DE8A 3K02A 1ZIUA 1SBPA 1GTKA 2G93A 1SD3A 2V84A 4ONYA 1D9VA 4KYDA 2ZMBA 3FV1A 3K6XA 2V25A 3Q27A 5IKBA 3LSLA 4GQOA 1WODA 1ZBMA 3CI8A 4GWOA 1II5A 2Q9TA 3RT6B 1PEBA 2ZYNA 2RC9A 5JEIA 3T66A 4RNSA 1H43A 1SDXA 1MQHA 3LR1A 1Y4TA 3VVFA 4U4SA 4P0GA 2DWJA 3PGFA 4IB2A 3PMVA 4G68B 1B5HA 2H5YA 1VR5A 3C9HA 1ELJA 3TCHA 1B32A 3TQWA 5FHNA 1PB8A 1NH8A 1IZ1A 5TU0A 5J1DA 3CR9A 2VD2A 1LCFA 4G68A 2X26A 3FZVA 3C32A 5I58A 1IXHA 3ZKKA 4E0WA 2ALUA 4JSOA 3S9NC 4YKIA 2HCAA 1ANFA 4OQOA 3MQ9A 4Q30B 2D5WA 1FQCA 1ZLQA 1GVCA 3RGYA 1SYIA 1MQJA 4QSDA 3QXMA 1IUDA 1URDA 2OLBA 4FJPA 3OELA 4GLIA 1WVJA 4H0WA 3ZS6A 2HFBA 4YICA 4R6HA 4H5GA 2Z8DA 2UVHA 4BDNA 1FQAA 5FTIA 2OBGA 5A5XA 2ZYMA 4HCWA 4JSDA 4F2QA 5L9OA 2B65A 3PPNA 2Z8FA 3T9XB 2GRVA 3FVGA 3RQTA 1HSEA 4FORA 2UXAA 1PBPA 4KPTA 2XD3A 4Q0CA 3TKDA 1LB9A 4O3AA 4MBPA 4ZECA 3U94A 1OIBA 1US5A 3PUVE 1IQ7A 3M3LA 4IGRA 1B3EA 3IAZA 5BWJA 2H99A 4KCCA 3C33A 1POTA 2V3TA 4QSCA 2XXVA 3N26A 5CMBA 4QRZA 2NUVA 1S9TA 2XXUA 2O68A 1VSOA 3MPKA 1RYOA 2XXPA 3ILUB 3R7XA 1B3HA 3IB0A 1SQYA 3ILTB 3I3VA 4ELQA 2F7AA 1B4ZA 3UGWA 3K1PA 1Y3PA 1FTJA 3SETA 3H03A 2QSXA 1BLFA 3FXUA 3R6UA 1XS5A 1P1NA 4DDDA 4F2OA 4PFUA 3B6TA 3VVDA 1LB8A 1A8FA 2Y7KA 1B0LA 1MDP1 2R71A 4NF4A 3D4CA 5DVFA 1LCTA 4QHQA 4K3FA 3GLBA 2PVUA 3FASA 5ICTA 3UP9A 1M5BA 4GRKA 3IOUA 2HAVA 5F7VA 3N6UA 1MS7A 4RK2A 2XXWA 3BBRA 1JEUA 3EPEA 4EQ7A 4EQBA 3O6IA 3SEUA 4H67A 3VE1B 4GL0A 1MY4A 2Q88A 4ESXA 3RTWB 1LBBA 1URSA 1ZMGA 1MXZA 3PPPA 1UTBB 1UQWA 1ZKBA 1N7XA 1FQDA 4F3BA 3G3HA 4P11A 1NFTA 4OYVA 1J1NA 4Q8RA 3RY3A 4IO3A 4JWYA 2V3QA 4IY5A 1UTBA 2OJTA 3MJNA 1S50A 4MFIA 4R73A 5ISUA 3PV0E 2UVGA 4GIZA 2E1SA 2ONRA 1N0TA 3PPQA 3K2DA 5CBSA 4BLAA 2VP1A 4N13A 1B46A 2XX8A 4HCYA 3PUXE 1NH7A 3MAMA 3T22A 4EXLA 1JVXA 5I59B 4R72A 3W9WA 4P0IA 1H3DA 3ZKLA 2P1SA 2H25A 1UIVA 1USYH 1B3FA 2O84X 2XXHA 3KBRA 1MXYA 3KFMA 4EF2A 3THIA 5I59A 4H8IA 1OVTA 3IK6B 1FTMA 2RC7A 1MPBA 3CG1A 2O6AA 2DE4A 3EHTA 3FVOA 4YKKA 5ICQA 3GBBA 3A3UA 3EN3A 3W15C 2F5XA 5FTHA 2QS3A 4F3PA 5CI5A 5EHSA 1AOVA 1MY0A 1MY2A 3L6GA 5DEXB 1QW0A 3WAEA 4U21A 2DVCA 4XTCQ 2DOJA 2CMOA 5CRYA 1R9LA 1TFDA 3IR1A 3RPWA 3K1NA 4R9FA 2XXRA 2I0BA 4DZ1A 2XX7A 5DEXA 4ZEFA 3AXFA 2DYXA 4NEDA 5BUUA 1QKBA 3PMWA 4YU0A 1A7LA 1XC1A 3O6GA 2Y7IA 5EYFA 4I8CA 2F36A 3O97A 3PU5A 3H3GA 4BDRA 3IOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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