2D21A

Nmr structure of stereo-array isotope labelled (sail) maltodextrin-binding protein (mbp)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Optimal isotope labelling for NMR protein structure determinations.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d21A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d21A01
4EF2A 3MZ1A 1MQHA 1NNKA 3MC2A 3VXBA 2Y84A 1O7TA 4YB5A 2ALUA 1B0LA 3MBPA 4KYSA 5DTBA 3Q28A 1PBQA 1MXWA 1H3DA 4G68B 3FZVA 1I6QA 3I5OA 3CG3A 2ZMBA 4ESWA 1VE4A 4IO4A 3HO7A 4H5GA 3S9MC 4FEDA 5ICQA 3RLFE 1URDA 2Y7IA 3TKDA 5AE4A 3OEMA 4OQOA 4IO7A 1MY1A 1H43A 2R71A 3H03A 2V84A 1MG1A 3CSBA 2AL4A 5AA2D 3IOUA 2Y7PA 3TUSA 2A5TA 3TYHA 3E13X 3USDA 1LFHA 1MDP1 4RJZA 1JVXA 1YTVA 4OFLA 3BFTA 4GXSB 1MPCA 3GZGA 3FVNA 4KQPA 1DTZA 3HHFA 3U8QA 1B3LA 4ELQA 2Y7KA 1LBCA 3JZJA 1ZLQA 4YAHX 4F1UA 1S9TA 3C35A 4BDQA 4IO5A 1Y1ZA 1II5A 2F34A 3K1NA 1LCFA 4AB6A 4DXBA 3L6GA 1FQFA 2HXWA 1AIVA 1IZ1A 4OERA 3TTMA 5AA4A 4R72A 2DXRA 1B1HA 4FIMA 4IGRA 1LBBA 4YKPA 4F1VA 2KLFA 4F3PA 4FORA 3K2DA 2R9JA 5M2VA 3PUYE 3U92A 2QPQA 2B3FA 3V8XB 1ZTYA 2XXQA 3BFUA 4DDDA 1MPDA 4E0XA 2B3BA 2M8CA 3CFXA 3GXAA 2DE2A 3IORA 1B46A 2CZLA 2O1LA 4U22A 2DOJA 3S4UA 4G68A 3H6UA 1TFDA 1QULA 2I58A 4X1BA 3BBRA 3N26A 3ECRA 3WAFA 1IXHA 4I62A 2V25A 1FW0A 1B40A 1O64A 5LOMA 4H65A 2YPNA 3P7IA 3TDJA 1XT8A 1NH7A 2ONKE 2B65A 4G77A 4PFWA 4LQ2A 1RYXA 3MVXA 4QFOA 5JTYB 1I69A 2AIXA 2RCBA 5H8HB 1MXXA 4TOZA 5EYFA 3MPLA 1P1QA 1BIYA 3K02A 4BLAA 3TELA 4BDMA 5CRYA 5A5XB 1P99A 2ZYMA 4NWCA 2F6PA 4PQJA 1Q35A 1BTJA 3IX1A 3ONMA 1YCJA 5AA3A 1BP5A 3C31A 1OLCA 1KWHA 2W7YA 2UXAA 2Y7WA 4POWA 5AA2B 3TQWA 4EDPA 4GL8A 1GVCA 2F5XA 1MDQA 1MXUA 4TLLB 2H5YA 5TPAB 3T9VA 1LLSA 4ZEDA 3LSWA 3HN0A 2IA4A 1N3XA 4OEUA 3H6TA 3EF7A 2DQVA 1UTBB 2QRYA 4U1ZA 1GTKA 1GV8A 3K00A 4OEVA 2Z23A 4OWDA 4DIGA 5DVJA 4R73A 1AOVA 3MVYA 3G3GA 4F1YA 4JBZA 1Q1KA 3PUWE 3OO6A 2PBWA 4XIGQ 1IXCA 4PETA 5DEXA 1EH3A 2ZNUA 3PPQA 2R6GE 3V83A 4NF4B 1B6HA 3EHSA 1XS5A 1EZ9A 4EQ9A 3OXNA 4LA9A 1PB8A 1M5BA 1LAXA 4EQBA 4KD5A 1SI1A 1FQCA 4NF5A 3BKIB 2XD3A 1DOTA 3UORA 2V3QA 3B6TA 3C33A 4HCWA 3O28A 5ITPA 5BWJA 1LFGA 3T9UA 1LAHE 4YKJA 3LBSA 5TP9A 1IQ7A 1H76A 4AB5A 4F39A 2F7BA 5JTYA 1A99A 3QK6A 4ZS9A 3MVWA 5H8HA 4GRKA 4ISUA 4LATA 3KN7A 3UA8A 3TODA 3H4ZA 2UYFA 3ODBA 3S9LC 3K4UA 1MY3A 4NF6B 5HPQA 4HW8A 2QS4A 1M5CA 5A5XA 3QAXA 5FHMA 3WAEA 1DMBA 1QW0A 1LAFE 4PE5B 2DWHA 4Q8RA 2QL3A 4RPOA 3SEXA 3VLUA 4YKKA 3OD7A 5IKBA 1PEBA 5H8SA 3KSXA 1OMPA 2DXYA 1JETA 3KJ7A 1Z7NE 3S9EA 3PPRA 4ECFA 1PDAA 1US5A 1LB9A 5AA2A 1SW1A 1ZU0A 3H6VA 2ZNSA 3FJ7A 1LAGE 5TPAA 3FXRA 1NMUA 2DVZA 2YLNA 3Q26A 4LUBA 2PX1A 1XC1A 3N6UA 2HAVA 1NL5A 3SESA 2OZZA 1FQEA 2IEEA 4MLVA 1VFEA 3CVGA 1EZOA 1HSEA 4R6KA 3TTLA 3MVZA 2GH9A 3OENA 2GFEA 3SKPA 4F22A 3OELA 4O3BA 4HS7A 3MP8A 2F78A 4HCYA 1B7UA 1PC3A 2F35A 2Q89A 3HHGA 5AA1A 1USYE 3IL1B 4F18A 3Q27A 4KI0E 2V93A 3TQLA 3LC8A 2AL5A 3PMVA 4X1DA 3UK4A 5I2KA 4P0GA 3ILTB 3KOTA 3GLBA 2Q9TA 3MQ9A 5KDTB 1B2HA 3EQ1A 1SW4A 3TEPA 1N7WA 4GF8A 4F3SA 2E0SA 3UP9A 1AMFA 4JXIA 1D9VA 3HCQA 1T0KA 4NF6A 3FXUA 3FASA 5FTHA 4QFNA 3FXQA 1ATGA 3TZAA 3PU5A 2PMSA 3CRBA 5CMBA 2RINA 3QYTA 4OFOA 3FUZA 3VXCA 2DWAA 3D4GA 4NEDA 1LCTA 1TT1A 1S7YA 4U23A 1SQYA 3RY3A 4GFRA 2HZKA 1UTHB 3EHUA 2HEUA 3I3VA 3SEYA 4OENA 1LB8A 4H8IA 2OWSA 2ONRA 3I6VA 4GVOA 1SYHA 2DWJA 3IB0A 1MQJA 3FD3A 1FTLA 2UYEA 5I2NB 3CI8A 5DVFA 3K6VA 2XXVA 3FV2A 2OJTA 3A3UA 1B05A 3V89B 3PPPA 4ZECA 3QUFA 5CMCA 3C4MA 1YAEA 1LFIA 2QS2A 2XXUA 2DP8A 3VE1B 1D9YA 2BJJX 1Y4TA 4ESXA 4N07A 1MPBA 1B58A 1XOCA 1SDXA 4OESA 2Q88A 4OZ9A 4NE4A 3CSGA 1M5DA 3JV9A 2I4CA 4H8JA 3LSLA 2VP1A 3PUVE 1A54A 3DP6A 4KR5A 1N84A 2XXPA 2ZNTA 2PYYA 3R26A 2H25A 2PT1A 2ZYNA 1JW1A 4LONB 5I56B 2VD2A 1NH8A 4G8HA 1US4A 4IO2A 5KCJA 1N3WA 3L6HA 3O6IA 2AYSA 1WODA 3IAZA 3IO4A 1TWYA 1B52A 4TQUQ 5CMMA 1FTJA 3MP6A 1POY1 1I6BA 3T9HB 4H67A 1N76A 3K6XA 5KDTA 1IEJA 3FIRA 4R2BA 1A40A 4RYAA 2ANJA 1AL3A 1IUDA 2RC7A 1MQGA 4KPTA 1BLFA 1Y9UA 1HSLA 5TU0A 4IGTA 2VD3A 4XKNA 1Y3QA 3PPNA 4XKPA 4I1DA 3TCGA 4QFLA 2XHDA 3G7WA 4C1TA 1B5IA 5F7VA 4GD5A 1ZKBA 2VOZA 2XXHA 5HM4B 3QXMA 3OOAA 2Q8JA 1LGBC 4WEDA 1B4HA 4H0WA 3SETA 2CMOA 1B3HA 3M3LA 1TXFA 3N5LA 4C1UA 1UTHA 4QSEA 2A5SA 3FVOA 1Y4CA 1H44A 1B9JA 2D5WA 1ANFA 1D3KA 2NVUB 3ZKLA 3TTNA 2LAOA 2WKYA 2I3WA 3MP1A 4DCXA 5I2NA 1A7LA 3TPAA 3DM0A 5H8NB 3VFJA 4PFYA 3VLVA 1A8FA 3O6HA 3TTKA 2DYXA 4YMBA 1Y1MA 4C0RA 5K2YA 1VR5A 3K1MA 4QF9A 4ZEKA 2UVGA 1B0HA 3PGFA 2DWIA 4OETA 4MLQA 3VDFA 2G93A 3ZKKA 2GRVA 5B7DA 5L9MA 2ONSA 1JW5A 1MQDA 4KYEA 4OYVA 1IXGA 1MH3A 3B6QA 1POTA 3OSRA 4FE8A 2DSFA 4GIZA 3RPWA 2NWJA 3PMWA 3M3FA 2Z8DA 5I56A 1B4ZA 1B7HA 2E1SA 1QUIA 1IXIA 3MJNA 2F8DA 2Q2AA 3IK6B 5F1QA 4ZE8A 1ZIUA 2F97A 2YJPA 4MBPA 1MM7A 3W15C 2X26A 3VVFA 1NKXA 4LZ5A 1N04A 5B70A 3GBAA 3IOWA 3KOSA 1P1UA 3V5AA 3RGYA 4MFIA 3PV0E 3U1OA 4R9FA 1SVXB 4R2FA 3FATA 2FYIA 2THIA 4U2RA 4ELOA 4JSDA 3GBBA 3PD9A 4DLDA 2VGQA 4R6HA 3EN3A 1OVBA 3KG2A 2Z8FA 4XKRA 1NNFA 2ABHA 4DXCA 5I84A 1R9LA 4IY5A 2FA7A 4OMBA 3VLWA 4YICA 4DCYA 2ESNA 1MXVA 3VVEA 4F2OA 1TFAA 2RC8A 3MAMA 3K01A 4JSOA 4NF8B 5H8NA 3QSLA 3B7DA 2REGA 3RNNA 3O9PA 3K6WA 2O84X 3MZBA 4TLMB 1S50A 4QFPA 2O6AA 1VFDA 4JWOA 4KYDA 3RQTA 2H99A 3EHTA 1SW5A 1FTKA 4RK2A 1WDNA 4DXUA 1A55A 4G68C 1URGA 2QMXA 1DTGA 4BDRA 1QJMA 4FECA 1UTBA 3FJGA 4JWYA 3R7XA 4ZE9A 2I4BA 3K6UA 2X7PA 4U21A 4XXUA 4LP2B 4GWOA 3TMGA 3DELB 4DZ1A 3OSQA 4RNSA 3QUJA 1SYIA 4O3CA 1QKAA 4ONYA 5CM6A 2Q2CA 1UQWA 3O6GA 2GHAA 3T66A 2H9BA 3K1PA 2XD2A 3KEIA 4NF4A 4R6YA 1AH5A 4LZ7A 4Q0CA 4F29A 3H06B 2I3VA 3W9WA 1FQAA 4F3GA 1MY4A 2XXRA 1EZPA 2NXOA 2F6GA 3HV1A 3RUMA 2DS9A 4NTLA 4Q5TA 1J1NA 4WXJA 3MPKA 3SERA 3KZGA 4FATA 4OVJA 3DP8A 3C36A 1SI0A 3MUQA 2Z22A 4U1OA 5L9SA 1Y20A 2XX7A 4YKIA 1Y3PA 4U4SA 4IY6A 3S9NC 4NF8A 4GQOA 2DE3A 3E3KA 1MY0A 4GOTA 3A09A 4POXA 4H5FA 2XXWA 1EU8A 4F3BA 4GL0A 4YZZA 1MY2A 3KN8A 4EQ7A 3K0VA 2GHBA 4WEPA 3CR9A 2P2AA 3LUYA 3IB1A 2UVJA 5DT6A 4AQ4A 1UIVA 3M3KA 2F36A 3HSTA 1ZJLA 5CC2A 3IB2A 2REJA 4LQ5A 3E9XA 4ZEIA 1P1WA 3T96B 5J1DA 2OWTA 3FVKA 2XXTA 2HZLA 2ZYKA 3FV1A 1QUJA 5I59B 3H6WA 3PMXA 1B32A 3OMBA 4DE8A 1YPNA 3U72A 5EHSA 4ZEFA 5I57B 2D3IA 4FJPA 3TAJA 2XXYA 3IOTA 1QUKA 2I6EA 1Z7ME 3U93A 2VHAA 3FJMA 3SEWA 3VVDA 1GR2A 3CG1A 1QKBA 3OO8A 4KFQA 4RXLA 5JEIA 3Q29A 3OEKA 4I8CA 1FTMA 3W9VA 5FTIA 5CBRA 4GXAA 4H1XA 1OQGA 3IR1A 2UVIA 4NMYA 4H6DA 1QVSA 4RK9A 3MZ9A 1RYOA 2H98A 3OO7A 4R75A 1FCKA 4FEBA 4RY1A 4P11A 3N94A 3G3FA 1XVYA 3T22A 2XX9A 3G3IA 3SDFA 1A8EA 4YB7A 3QIMA 4JWXA 1SBPA 1IITA 2XXIA 4I9DA 4G4PA 3TFLA 1CB6A 1JQFA 2P0SA 1JW4A 3TCFA 4JB7A 2RC9A 5DEXB 4PFUA 5FHNA 1URSA 2I0CA 2V3UA 4K3FA 1M5FA 4X48A 2O1MA 4THIA 1MRPA 4NF5B 4R9GA 3S2VA 3UN6A 4UA8A 3HPIA 1USYH 4R74A 1B3GA 1B3FA 5H8QB 1ZMGA 3VV5A 3G3HA 3A3CA 4Z7EA 5TP9B 4YB6A 5JK4A 2O69A 4E0WA 4BDOA 4OHNA 5I59A 2DVCA 3SEVA 3C32A 1ZBMA 1DSNA 4QHQA 4G8NA 4OTEA 2QSXA 3H7MA 5I57A 1N7XA 1B5HA 2FNCA 5H8FB 4G2ZA 3PUZE 4EXLA 4G8MA 3MWBA 4U4XA 4EUOA 4UACA 1P1OA 1NFTA 3DP4A 2O7IA 1MS7A 3ILUB 1BKAA 1PBPA 4MH5A 5FHOA 1B1XA 4ELRA 1IIWA 3FGSA 3M8UA 1B7ZA 3IO6A 4N13A 5DVIA 3O66A 1O63A 2I48A 3FVGA 1ELJA 3RTWB 1R6ZA 4IO6A 1JVYA 2P1SA 1R1NA 2I0BA 5I58B 3CIJA 2OCUA 2O51A 4KCCA 4BDNA 1MM6A 3KSJA 3SEUA 3KN3A 2X7QA 3LSFB 3DLNA 1JEVA 4M4GA 2O68A 3O97A 3LR1A 1VSOA 1JEUA 5ISUA 4OXVA 2OK2A 4F19A 3O29A 2RCAA 2DE4A 4OFJA 3H3GA 1JNFA 2Y7RA 1WVJA 3RT6B 3RN8A 1R9QA 3C34A 4ZZAA 2Z8EA 4F2QA 4RA1A 2QJEA 4ZEBA 5ICTA 3AXFA 1B51A 4EXKA 2F7CA 4BDLA 3F11A 5H8QA 2QS1A 1DPEA 5I2KB 2UVHA 2I49A 2RKMA 4QSCA 2NUVA 1PB9A 4YU0A 2XXXA 4IB2A 4XKQA 1UIUA 4ELPA 4GLIA 1B3EA 3ZS6A 1DPPA 1MQIA 3UIFA 3TCHA 1B5JA 3N6TA 2RF1A 4F31B 2NOOA 4LZ8A 2V3TA 3Q25A 4PFTA 5H8FA 3IJXB 1XVXA 1PB7A 3UGWA 5HBCA 3B6WA 2HCAA 2QMWA 3PUXE 2F7AA 2HAUA 3PD8A 1I6AA 5EHMA 3U94A 4NWDA 4FAJA 5CMKA 1FQDA 1F9BA 2OLBA 1LSTA 4Q30B 4ZDMA 1GGGA 1H45A 3IJOB 3OO9A 1N0TA 3D4CA 5L9OA 5KZTA 4XTCQ 3KBRA 4MF3A 3O2AA 4WKMA 3CFLA 4QRZA 2D21A 3TTRA 2A5TB 1OIBA 4RPNA 5I58A 3KGCA 1SD3A 5ITOA 3RT8A 1FQBA 3G3KA 3T9XB 2HQ0A 4KCDA 4X9TA 3E4RA 5BUUA 2G29A 3IOVA 1MXZA 1RKMA 4QFKA 4Z0IA 3CFZA 3T93B 4EF1A 1Y3NA 4P0IA 4IO3A 1CE2A 4HTGA 5ELVA 2ZYOA 3PPOA 3G3JA 4L17A 4JDFA 1MH4A 2XX8A 4YMAA 1MXYA 3RTFB 4N6PA 4ZZEA 4PP0A 2QS3A 3R6UA 1XHYA 2OBGA 1HSJA 3JYRA 4ND9A 4QSDA 1L5TA 3THIA 2PT2A 3KJTA 3MW0A 5AA4B 1OLAA 5IAIA 1P1NA 1FTOA 3ZSFA 1OQHA 2PVUA 2ZXTA 4M1VA 5L8DA 4LVQA 4KHZE 1OVTA 5CBSA 5DYHA 1SW2A 5K2XA 1M5EA 3C9HA 4O3AA 2H4IA 5KCJB 1D4NA 3LSXA 2HFBA 1NNPA 1NNTA 5CI5A 2O7UA 3EPEA 3KFMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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