2D21A

Nmr structure of stereo-array isotope labelled (sail) maltodextrin-binding protein (mbp)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Optimal isotope labelling for NMR protein structure determinations.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 89
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d21A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d21A01
1IUDA 2OLBA 1N7XA 2GHAA 4NF4B 4XKNA 2P0SA 4O3CA 4OERA 4FJPA 1N76A 1R1NA 3PMXA 4XKRA 3VXBA 2DYXA 3QUJA 5AA4B 1B3FA 4NTLA 4YU0A 4N6PA 1BLFA 2I49A 4QSEA 4NWDA 1JW1A 4M4GA 2FNCA 3TPAA 4YKJA 1UTHB 3D4CA 2Z23A 3FASA 2UYEA 3KFMA 1HSLA 3VVEA 3DM0A 3W9VA 2AL5A 3T9XB 4JXIA 1Y4TA 1JEUA 2F97A 3MZ1A 5IAIA 2HFBA 1FTOA 5DVJA 2REGA 4QFOA 1O7TA 1P99A 3GBBA 4LVQA 1RKMA 3M3KA 3TDJA 1Y1ZA 2DWJA 2RCBA 2UVGA 1A8EA 2X7PA 4DXUA 1MQJA 1NNPA 5H8FB 3SESA 1MH3A 3PU5A 4QFKA 1VFEA 3FJGA 1WODA 2D3IA 2NXOA 1FCKA 4ZEDA 2PT2A 4GIZA 3N6UA 1NL5A 1LGBC 4ELOA 2V84A 4NE4A 1MG1A 1ZTYA 4NF6A 2H5YA 1B4ZA 3V5AA 5ELVA 3PUXE 5EHMA 5I59A 2QJEA 4OWDA 3CIJA 4LQ5A 5KCJB 1DMBA 3Q25A 3E4RA 3OSRA 1T0KA 1FQCA 2HXWA 4PQJA 4PE5B 3BKIB 3U8QA 1OLCA 3FVKA 3WAFA 2RF1A 1OVBA 4C0RA 1B52A 3JZJA 3EHSA 3TTLA 5FTHA 5DT6A 3ZKKA 2F34A 1DPEA 5IKBA 2W7YA 4LZ5A 3KOTA 3O29A 3G3IA 4U2RA 5CBRA 2NWJA 3MPKA 1LB8A 3MQ9A 3N94A 3F11A 1QW0A 4FAJA 3QYTA 4G4PA 1P1NA 1FW0A 2E0SA 4EXKA 4N07A 3SERA 2UVJA 1H76A 2H4IA 1IXHA 2XX9A 1N3XA 3G3GA 2VD2A 3DLNA 5I59B 3CG3A 4P0GA 1UIUA 3K1NA 3FJMA 5CMCA 1YPNA 4ZE8A 1WDNA 3IB0A 5DEXA 1MXWA 2FA7A 4ZE9A 2Q8JA 4LONB 3CFZA 1SI1A 4U1ZA 1LAGE 3O9PA 2THIA 1XS5A 1NNKA 2FYIA 3EPEA 1ZIUA 2OWSA 4OZ9A 2QL3A 1UIVA 3MVYA 2YLNA 4MBPA 2F78A 5CBSA 2OJTA 1US5A 4AB5A 2VD3A 1UTBB 4OVJA 3PUYE 4ND9A 1B0LA 1MXXA 3P7IA 1SYHA 4PFWA 3IR1A 3UN6A 1Q35A 1B7HA 4K3FA 1PB9A 5AA1A 1R9QA 2CZLA 1NKXA 3S9NC 2XXHA 3CFXA 4WXJA 4KD5A 3A3CA 4GQOA 1URDA 3PPPA 5L8DA 5DVIA 4OENA 5DEXB 1XOCA 5CMBA 3IOUA 3K6VA 2ZMBA 1B5IA 3IL1B 2QMWA 5AA2A 2F6GA 2WKYA 3LBSA 4DCYA 4I62A 3KGCA 1IZ1A 4ZEKA 3ECRA 2ZNUA 3IX1A 4BDMA 3FJ7A 1IXGA 1FTKA 1SQYA 3GBAA 1H45A 2Q89A 5FHNA 4KYSA 1MPDA 5M2VA 1A54A 4FIMA 3R7XA 3EHUA 1ZLQA 3C32A 3L6GA 4PFTA 2H9BA 5I58A 2X7QA 4QSCA 4IO7A 2B3FA 3G3HA 4ZEIA 3SEUA 4LZ7A 4RPOA 1QUJA 3U94A 1JVXA 3Q29A 1BIYA 4F2OA 2DWAA 1Y3PA 1A99A 3TELA 2AIXA 2I0BA 3CR9A 4NF5A 4GWOA 3UK4A 4G8NA 1LFGA 2F36A 1S50A 3GXAA 1N3WA 3FD3A 4JWYA 5AA2B 3KSJA 3IO6A 1EZPA 4R73A 3DP8A 2RC9A 1GV8A 1DPPA 1GVCA 4EXLA 1SW4A 3UP9A 3TTRA 1MY2A 4GVOA 2AL4A 5I2KA 1VE4A 3FUZA 5AA2D 4RY1A 3TUSA 4PP0A 1QULA 1ZJLA 5I58B 3G3KA 3EF7A 4F1YA 2G93A 1B3LA 2XXRA 4Q5TA 1MY1A 1URSA 2RC8A 2R71A 4THIA 4ZEFA 2R9JA 1FQBA 3PGFA 2P2AA 4I8CA 1HSEA 4NF5B 1B0HA 2X26A 4G8HA 3OO7A 2I0CA 2ZYOA 3K4UA 1XC1A 4I1DA 3DP4A 3WAEA 3T66A 1Z7NE 2QS2A 1A55A 3HHFA 3K00A 1EH3A 1FQAA 5FHOA 5CI5A 2F7BA 1KWHA 3C36A 2CMOA 5I2KB 2DE2A 3UORA 4YICA 4F1VA 4G77A 1POY1 5TPAB 3GZGA 3I5OA 3IB1A 1M5DA 2I4BA 3LSFB 3QIMA 3O6GA 1FTJA 3Q26A 3T9VA 4LUBA 2VHAA 4LP2B 3IOWA 4GF8A 1MH4A 4M1VA 4H0WA 4FEBA 4H8JA 4H65A 1B05A 3HHGA 3LUYA 5H8HB 3UIFA 3VLWA 3SDFA 4BDOA 3OEKA 3U93A 2QMXA 4GXAA 5H8FA 1SW5A 4X48A 4ELPA 5TP9A 1XVXA 1MXVA 4GD5A 2I6EA 4AB6A 3PPRA 4TLLB 1B2HA 4LZ8A 3V89B 1LAFE 3K6XA 3N5LA 1BP5A 4U4SA 4BDLA 4F19A 2Z8FA 2O68A 1M5CA 1USYH 3IJXB 1SDXA 4OXVA 3RPWA 4U23A 5KCJA 2KLFA 2YJPA 2OBGA 3H06B 2HAUA 3OD7A 5I57A 5EHSA 1Q1KA 4BLAA 3S4UA 3G7WA 3I6VA 3C35A 4KR5A 3PD9A 4EQ7A 1XVYA 4GLIA 3E9XA 4X1BA 3ILUB 3KG2A 5JK4A 4R6KA 1SBPA 4C1UA 2D5WA 1P1OA 3O66A 4NF8B 4OHNA 1M5EA 3PPQA 3USDA 1P1UA 4JSDA 3T9HB 3K6WA 3LC8A 4AQ4A 3IO4A 5TP9B 4IY6A 4YKPA 4KYEA 1B7ZA 2XD3A 1B58A 4ELQA 3MC2A 3BBRA 5ITOA 5ICTA 4OETA 5H8SA 5CM6A 2I48A 2B3BA 3RN8A 5ITPA 3B6QA 1B1XA 1A7LA 1O63A 2DVCA 2RC7A 2OK2A 5I57B 4H6DA 1US4A 2O7IA 3VLVA 4YKKA 2OCUA 3OMBA 4Q0CA 5HM4B 4DLDA 3TAJA 3HCQA 2F5XA 4U4XA 4RNSA 1H44A 1RYXA 3CI8A 4MF3A 1N84A 2QS1A 4HCYA 3FV2A 2O84X 1UTBA 1SYIA 4YAHX 3UGWA 3C31A 4YB5A 5H8NA 5F1QA 2DWIA 4GXSB 5DVFA 3MP6A 4DXBA 5L9OA 5A5XA 3S2VA 1Y4CA 2GHBA 2XXYA 4ZZEA 3K02A 4TQUQ 3FZVA 4R9GA 3H6UA 3H3GA 3PUWE 3U92A 3A09A 4WEPA 5I84A 5TU0A 5HBCA 3KN7A 1B46A 3E13X 1N7WA 1JW4A 1DTZA 2XXQA 2V3QA 5FTIA 1P1WA 3C9HA 1M5BA 1ATGA 3JV9A 3ILTB 1EU8A 2DXRA 4KFQA 4FEDA 1EZOA 4R2FA 3QAXA 3HO7A 5H8NB 3U1OA 2F6PA 2AYSA 3FGSA 2QS4A 4U22A 1MQIA 5A5XB 4IO6A 4G68A 4F3SA 1YAEA 4GFRA 3ZS6A 1A8FA 2NUVA 2A5TA 3VXCA 3LSLA 1LBBA 2QPQA 1I6AA 4F3BA 1LSTA 4C1TA 1NNFA 2QRYA 4F18A 2DS9A 5ICQA 1LLSA 4MFIA 3B7DA 3QK6A 3TYHA 1AOVA 4U1OA 3PMVA 2XX8A 3RLFE 1IXIA 2H98A 3EHTA 5CMMA 5B70A 4DDDA 1UQWA 1B5JA 4QRZA 2Z8EA 1B6HA 4KYDA 4ONYA 4KHZE 4EDPA 3MVXA 5KDTA 3OO9A 4N13A 1POTA 1LAHE 4YB6A 2IA4A 5J1DA 4BDNA 3SEWA 3JYRA 1TT1A 2R6GE 1JEVA 3KZGA 4H5GA 1TXFA 3W9WA 4IO2A 5H8QA 5BUUA 3T96B 4G68B 3FVOA 2IEEA 1XT8A 5BWJA 2A5TB 3RUMA 4QFLA 4F22A 1QUIA 2ONRA 2F7AA 2DVZA 2ANJA 4F2QA 3RTFB 3CVGA 1IIWA 2Y7IA 2RKMA 4O3AA 3TMGA 4POWA 2ZYMA 4PFUA 3VVDA 3OELA 4UACA 3A3UA 1WVJA 3IJOB 2GFEA 1IEJA 1MXYA 2XHDA 4JB7A 1MQHA 3RT6B 4BDQA 2PT1A 2DWHA 2XXTA 5KDTB 1B3EA 3K1PA 3FXQA 4LQ2A 2HCAA 2ABHA 3LSWA 1XHYA 2Y7RA 2QS3A 2HEUA 4O3BA 5TPAA 4JDFA 4H1XA 5F7VA 4NWCA 2Q88A 3MZ9A 5H8QB 1LCTA 1S9TA 2V93A 1CE2A 4QFNA 4G2ZA 5K2YA 3HN0A 3K1MA 3DELB 1FQEA 1MY4A 3C34A 1ZMGA 3SEYA 4RPNA 3TCGA 2I58A 1D4NA 5H8HA 1H3DA 2UXAA 5DYHA 1J1NA 4OFLA 4RXLA 4P0IA 4OQOA 3HV1A 3U72A 3ONMA 1AL3A 4YB7A 3S9LC 4QFPA 1B9JA 4EUOA 4IB2A 2HQ0A 2ZXTA 2PBWA 1IXCA 4XKPA 2YPNA 3E3KA 4JBZA 3FXRA 1AIVA 4DCXA 2QSXA 4ECFA 5I2NA 3MP8A 2D21A 1N0TA 1OQHA 1AH5A 1PDAA 3QXMA 3SKPA 1SW2A 3H03A 1SW1A 4FE8A 3KEIA 1I6QA 4OFOA 2Y7KA 3OXNA 3IAZA 4IO5A 1MM6A 3TTKA 1LFHA 4JSOA 4Z0IA 3EN3A 4XKQA 2O69A 1SD3A 3H6VA 3IB2A 3O28A 4FORA 1SVXB 4OFJA 3TZAA 3FVGA 3IK6B 1MM7A 4UA8A 4NF8A 4FECA 3L6HA 3TQLA 4DE8A 5JTYB 3FATA 3IORA 1LCFA 3TCFA 1TWYA 1MDP1 3KBRA 5L9SA 2V3UA 1P1QA 1B32A 2DSFA 3H4ZA 1BKAA 4R74A 4HCWA 1OIBA 4ZECA 4JWXA 1H43A 1FTLA 3M3LA 5I2NB 3H6TA 2VOZA 1VR5A 4R72A 4MLQA 3MAMA 4F39A 3UA8A 2ZNTA 3K6UA 4IO3A 4MLVA 4YMAA 3MZBA 1OVTA 4Q30B 2ZNSA 3HPIA 2E1SA 1MY3A 4BDRA 1PC3A 4E0WA 3KN3A 3KN8A 4R6HA 4GOTA 5I56A 3DP6A 2DXYA 3C33A 3OO8A 2Z22A 3ODBA 3TTNA 5CC2A 2DE4A 2RCAA 2A5SA 2V25A 2VGQA 3CFLA 3CSBA 2PX1A 2P1SA 5AA3A 1ANFA 2XXUA 4KCCA 3KJTA 4Z7EA 2BJJX 1OMPA 5JEIA 1VFDA 1JW5A 1D3KA 3FVNA 2PVUA 3PPNA 3VVFA 4WKMA 2XXWA 2Z8DA 4OYVA 4X9TA 2VP1A 1B51A 3IOTA 1NH8A 1B3HA 1QVSA 5L9MA 1TFAA 2HAVA 4WEDA 3RGYA 4X1DA 3FXUA 2G29A 3G3FA 3N26A 4G8MA 3R26A 2I4CA 1NH7A 2DE3A 4GRKA 3TCHA 3BFUA 1F9BA 2H25A 1MXZA 4OEVA 3THIA 4XXUA 4ZDMA 3V8XB 1JNFA 3Q27A 4KI0E 1PBQA 2O6AA 4F1UA 2H99A 4F3PA 1JQFA 5I56B 1Y20A 4H8IA 1FQDA 1AMFA 4ZZAA 1B40A 4EQBA 3OO6A 4EF2A 3PUZE 2XXVA 1YTVA 3TEPA 1QKBA 3M3FA 4F31B 1JETA 4OMBA 4EF1A 2O1LA 3D4GA 5AE4A 4QHQA 3EQ1A 4R75A 4LA9A 3MJNA 2DQVA 1PB8A 2ONSA 3LR1A 2B65A 1ELJA 4XTCQ 4PETA 3PUVE 3KOSA 1MRPA 3OEMA 3S9MC 2RINA 3SETA 4GL8A 4NF6B 1LBCA 1IQ7A 2XXIA 2O7UA 3V83A 1MQDA 3RT8A 4RYAA 4GL0A 3FIRA 3B6WA 4TLMB 4ISUA 3O2AA 1D9VA 3SEXA 3VE1B 1MPCA 3M8UA 4OTEA 2ALUA 1B4HA 1Y1MA 4F3GA 3MWBA 1ZBMA 1PBPA 2Q9TA 4NMYA 1OLAA 3O97A 3MBPA 1URGA 5FHMA 3TTMA 4L17A 3BFTA 3QSLA 3FV1A 1PEBA 1I6BA 3RQTA 4R9FA 3TFLA 4KQPA 1MS7A 4E0XA 3PMWA 2UYFA 2XX7A 1QUKA 3C4MA 4R2BA 4XIGQ 4H67A 2O1MA 1Z7ME 1II5A 4R6YA 4PFYA 1B5HA 4YKIA 3H7MA 1N04A 2ESNA 5CMKA 2Y7PA 3VV5A 4FATA 4ZEBA 3CG1A 1SI0A 3T22A 2OZZA 3QUFA 2O51A 4ZS9A 3VDFA 3T9UA 4OESA 1ZU0A 3OSQA 4P11A 4IGRA 1MXUA 1PB7A 1M5FA 2ONKE 1IITA 1I69A 3T93B 4TOZA 2DOJA 3I3VA 2F8DA 2NOOA 4HS7A 1ZKBA 3MVWA 4JWOA 3OENA 1NMUA 3S9EA 3RNNA 1GGGA 1B1HA 3SEVA 1EZ9A 4QSDA 1GTKA 4U21A 5HPQA 5CRYA 2PMSA 3TODA 3PD8A 4G68C 2GH9A 1YCJA 3HSTA 1DTGA 1LAXA 4Q8RA 1MY0A 4LATA 2F7CA 1MPBA 2XXXA 2Y84A 2I3WA 3CRBA 1TFDA 3MVZA 4I9DA 2M8CA 3O6HA 3K2DA 3ZKLA 2XD2A 4RA1A 2GRVA 3KJ7A 1OQGA 1FQFA 3W15C 1Y3QA 2HZLA 4NEDA 1NNTA 5KZTA 4DXCA 1NFTA 5LOMA 1DSNA 2UVHA 4DZ1A 4ESWA 2LAOA 4OEUA 4EQ9A 4ESXA 1R9LA 3K0VA 1MQGA 3ZSFA 4RJZA 1VSOA 3AXFA 1HSJA 4YMBA 1GR2A 3LSXA 4H5FA 3RTWB 2PYYA 1RYOA 3PPOA 1QKAA 4POXA 1FTMA 2UVIA 5JTYA 4QF9A 2NVUB 1LFIA 1B7UA 3PV0E 4IGTA 2OWTA 3OOAA 1R6ZA 1O64A 1LB9A 3MP1A 4RK9A 1JVYA 1BTJA 3R6UA 4HW8A 3TQWA 2DP8A 1Y9UA 2I3VA 4KCDA 3VLUA 3KSXA 4F29A 4NF4A 3TKDA 1QJMA 3B6TA 2Y7WA 3N6TA 1CB6A 2V3TA 3RY3A 5AA4A 4YZZA 3H6WA 2XXPA 5EYFA 1A40A 2Q2CA 1DOTA 4MH5A 2Q2AA 3GLBA 3MW0A 1S7YA 3G3JA 1UTHA 2ZYKA 4ELRA 1USYE 5ISUA 1Y3NA 3VFJA 4RK2A 3Q28A 2REJA 4KPTA 3MUQA 4DIGA 3CSGA 3IOVA 3MPLA 4IY5A 5K2XA 1B3GA 5B7DA 2F35A 5DTBA 1L5TA 1D9YA 4HTGA 1MDQA 3K01A 2ZYNA 4IO4A 3O6IA 2HZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IUDA 2OLBA 1N7XA 2FIEA 2GHAA 4NF4B 4XKNA 2P0SA 4O3CA 4OERA 4FJPA 1N76A 1R1NA 3PMXA 4XKRA 4P1LA 2DYXA 3QUJA 3VXBA 5AA4B 1B3FA 3IFCA 4NTLA 4YU0A 4N6PA 1IMDA 1BLFA 4HE0A 2I49A 4QSEA 4NWDA 1JW1A 4M4GA 2FNCA 1YXIA 3TPAA 4YKJA 1UTHB 3D4CA 2Z23A 3FASA 2UYEA 3KFMA 1HSLA 3VVEA 3DM0A 3W9VA 2AL5A 3T9XB 4PF6A 4JXIA 2XWIA 1Y4TA 1JEUA 2F97A 3MZ1A 5IAIA 2HFBA 2QFLA 4IR8A 1FTOA 1NV4A 5DVJA 2REGA 4QFOA 1O7TA 1P99A 3GBBA 4LVQA 1RKMA 3M3KA 3TDJA 1Y1ZA 2DWJA 2RCBA 2CEXA 2UVGA 1A8EA 2X7PA 4DXUA 1MQJA 1NNPA 4I40A 5H8FB 3SESA 1MH3A 1NUZA 3PU5A 4QFKA 1NV2A 4PC9A 1VFEA 3FJGA 1WODA 2D3IA 2NXOA 1FCKA 4ZEDA 2PT2A 4GIZA 3N6UA 1NL5A 1LGBC 2GQ1A 4ELOA 2V84A 1FPLA 4NE4A 1MG1A 1ZTYA 4NF6A 2H5YA 5EYGA 1B4ZA 3V5AA 5ELVA 3PUXE 5EHMA 5I59A 2QJEA 4OWDA 3CIJA 4LQ5A 5KCJB 1DMBA 3Q25A 3E4RA 3PTYA 3OSRA 1T0KA 1FQCA 2HXWA 4PQJA 4PE5B 3BKIB 3U8QA 2R8TA 1DK4A 1OLCA 3FVKA 1FPJA 3WAFA 2RF1A 1OVBA 4MCOA 4C0RA 1B52A 3JZJA 3EHSA 1G0IA 2P3VA 3TTLA 5FTHA 5DT6A 3ZKKA 2F34A 1DPEA 5IKBA 2W7YA 4LZ5A 3KOTA 3T0JA 3O29A 3G3IA 4U2RA 5CBRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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