3G3GA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer k665r mutant with glutamate and nacl at 1.3 angstrom resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
256
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 253
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3gA02
1P99A 3Q27A 3FUZA 3IOWA 1H45A 3OSRA 4E0WA 1S7YA 5JEIA 4QHQA 2I0CA 4GRKA 5K2YA 1SI0A 1Y1MA 1B6HA 1MQJA 4OEVA 3OSQA 3O9PA 3N6TA 4ZZEA 5AA4B 1SD3A 2PMSA 5A5XB 1S9TA 2GHBA 2XXYA 3THIA 3RN8A 4IGTA 3FVNA 3RY3A 2GHAA 2V93A 5DT6A 1URSA 2RKMA 3TTMA 4YKPA 2V3QA 1OIBA 1R1NA 3MBPA 2DE2A 1QULA 3MWBA 4KQPA 2HAUA 3T9XB 1USYE 3K6UA 4O3BA 3UIFA 4U21A 3A3UA 3ODBA 3KZGA 1TT1A 4O3CA 4DXBA 3IB0A 3SDFA 5JTYA 4OMBA 2Q9TA 1POTA 3H6VA 3OO8A 2H5YA 2Y7KA 1D4NA 3VDFA 3BBRA 5CBSA 3CSBA 1M5CA 1MH3A 4KCDA 4I8CA 3ZKLA 4GD5A 4ECFA 4HTGA 5K2XA 1ZLQA 3IL1B 4H8IA 3TCGA 3EHTA 4RYAA 2Z22A 2DWAA 2QRYA 3IAZA 1ZMGA 2D3IA 1AIVA 1S50A 3VXCA 3O6HA 2UVIA 3GXAA 5IAIA 1JVYA 3V83A 4HCWA 4YAHX 1B3EA 5HBCA 3I3VA 1ZIUA 1I6BA 2I4BA 3K4UA 4POXA 3VFJA 3DP4A 4KR5A 1AOVA 3O28A 1J1NA 1NKXA 1FQAA 4G8NA 3C9HA 2XXIA 1MQIA 4DZ1A 4M4GA 4C1UA 1LAXA 5H8SA 3OEKA 4Q30B 4ZE8A 1TXFA 5I59A 1LSTA 3OENA 3N26A 5I2KA 2ZYNA 3KFMA 1M5FA 1MM6A 1D9YA 3HN0A 1R9QA 5ICTA 4UACA 3PUYE 3FJGA 3OO9A 5DYHA 4KYEA 1NFTA 2DXRA 4NF5B 1MPDA 1MXXA 3CVGA 4ELRA 3RTFB 2PX1A 2XXPA 4G68A 2DS9A 3W9VA 3TYHA 1GVCA 2F97A 2FNCA 2I3VA 4F2QA 3T66A 3T9VA 1GTKA 3ONMA 1BTJA 4JB7A 5CMBA 4F1UA 1B51A 2I58A 3QUJA 1LFIA 5H8HB 4POWA 1CE2A 4O3AA 1B7UA 5DVIA 3FXQA 2Q2CA 3TKDA 3IB2A 4OHNA 1A99A 3PPOA 4I9DA 1FQDA 4GL0A 3E4RA 3IO6A 1H44A 1XC1A 4KI0E 2I6EA 3CFXA 1Y3NA 1TFAA 3PUWE 2IEEA 1MRPA 1OVBA 1FQFA 4F3PA 1MY3A 1ELJA 1NNTA 2Z23A 4DIGA 1LBBA 4H1XA 4PFYA 1B0HA 3MP1A 4RK2A 3M3FA 3I6VA 1Q1KA 4LONB 3M3KA 3FVKA 5ELVA 2XXWA 1SQYA 1QUJA 4U4SA 4GF8A 4JSOA 1JQFA 1LAHE 3MC2A 5FHOA 2QS1A 1NMUA 3IJXB 3FV2A 4NF4B 1ZJLA 4LA9A 3KN8A 4U4XA 3OO7A 1UTBB 4BDOA 3KSXA 2R71A 5BUUA 4N6PA 3CSGA 5ITOA 1QUKA 4LQ5A 3HSTA 4AB5A 1Y20A 1SVXB 2UVJA 3RT6B 1DPEA 2ZXTA 4IO5A 1B7HA 1XHYA 2NXOA 5I57A 2HXWA 4ND9A 4YKIA 1Y4CA 4EF1A 3S9EA 3O97A 5EHSA 3CIJA 1B3LA 4TOZA 2LAOA 3DM0A 5I2NB 4MFIA 1N3WA 1Y3QA 3CI8A 3FXRA 4IO2A 3CG3A 1B0LA 1P1WA 1LCFA 3MW0A 3Q25A 4F19A 3OD7A 3TZAA 2XX9A 4GQOA 4WEDA 1CB6A 5H8FA 4JXIA 1UQWA 3KGCA 3QSLA 1YAEA 2XXVA 4G4PA 2QS4A 1MPCA 4R9FA 1PBPA 3H6WA 3LBSA 4DDDA 4F2OA 2G93A 3K0VA 1SI1A 2DVZA 1SYIA 3V89B 1Z7NE 5AA4A 4U1ZA 3C32A 2VD3A 4R75A 2THIA 1KWHA 4F39A 3LSLA 1L5TA 3KBRA 3LSXA 3A09A 1I6QA 4OZ9A 1PBQA 3MPLA 4YKJA 1UTHA 1EH3A 4GXAA 3FASA 1YCJA 2XXTA 3EF7A 1B5JA 4E0XA 4QFOA 4H5FA 5L9MA 2ZNUA 1FTMA 3MP6A 5CMCA 4BDLA 3FV1A 1AL3A 1I69A 5B70A 1LAFE 1P1UA 2W7YA 3K2DA 1JNFA 3TUSA 1MG1A 3M8UA 3PPRA 2O84X 2RCAA 1FQEA 3OXNA 3IB1A 3SEYA 1ZU0A 3VLVA 3DP8A 4KYDA 3V8XB 1B5HA 4G68C 3TPAA 3PMVA 2DQVA 3VE1B 4LZ5A 3USDA 1SDXA 4AQ4A 3C36A 1JEVA 2V3UA 4PETA 2QMWA 3SESA 1B9JA 4NWDA 1R6ZA 2H4IA 4RY1A 1URGA 3FJMA 4R9GA 3PGFA 4N13A 5I56B 1B40A 3C34A 2HQ0A 4NMYA 4M1VA 2O7IA 3SETA 4K3FA 4EQ9A 5L9OA 4GVOA 2I49A 3WAFA 3PUVE 3GBAA 3O6IA 1B7ZA 3L6GA 1MXZA 1Y3PA 2P0SA 3K6XA 3MJNA 3CFLA 2ESNA 3S9MC 2FA7A 2F78A 4EQ7A 2HEUA 4XIGQ 3C4MA 4PFWA 1AH5A 4NF5A 1LBCA 3B6TA 3B7DA 3FGSA 3ILUB 2VGQA 3QYTA 3MVYA 2HZLA 1NNFA 2QS2A 1D3KA 1RYXA 1OMPA 1QKBA 3O66A 4PFUA 3GLBA 4IGRA 3K00A 5CBRA 2QL3A 3Q28A 2UVGA 3MAMA 5JK4A 1A8FA 5ITPA 3HHFA 4U1OA 5CM6A 5DEXB 2G29A 4MF3A 5AA2B 1DPPA 2F6PA 4ZS9A 5H8HA 1A54A 2VP1A 1PEBA 2F8DA 4P11A 1IITA 3UORA 5DVJA 3H7MA 1WDNA 2Y7PA 3EN3A 3O6GA 2AL5A 2V84A 5FHNA 4OWDA 2RCBA 3I5OA 1O63A 4H65A 1Y1ZA 3UK4A 1B3GA 1FTLA 4ESWA 4H8JA 1N84A 3G3IA 3JV9A 2ONRA 3K1PA 3K1MA 4IO7A 2DVCA 2H9BA 5AE4A 5I58B 1MH4A 3G3GA 4JSDA 4NF4A 3ZSFA 3PPPA 3KN3A 1US5A 1MXUA 3TFLA 4OFOA 2DWIA 2E0SA 1PB8A 3PPNA 1FCKA 2ZMBA 2VD2A 1VFDA 3G3JA 2XX7A 3SEWA 2B65A 4C1TA 2XHDA 3OELA 3EHUA 1MPBA 4U22A 3PPQA 3KOTA 2OBGA 1T0KA 1XVYA 4JWYA 4H0WA 4R6KA 1PC3A 4TQUQ 2QSXA 4PFTA 5I2NA 1PB9A 5I84A 3SEXA 3S2VA 4PQJA 2WKYA 4R72A 3IK6B 2ONKE 4ESXA 4KFQA 1EZ9A 3C35A 4I62A 4FEDA 1EU8A 3OO6A 3QXMA 3TQLA 1NNKA 1N04A 3B6WA 1WVJA 3U72A 3MZBA 4NEDA 4DLDA 2F34A 3T22A 2XXHA 4G8HA 1B1XA 1QJMA 2Q88A 5TP9B 4F31B 2I4CA 5FHMA 1I6AA 4JWXA 2B3BA 3F11A 3D4GA 2Y7RA 1IUDA 5KZTA 2Q8JA 4YKKA 1Z7ME 1B4HA 4R6YA 4EXLA 3N6UA 3RPWA 1GGGA 4R73A 3MVWA 5EHMA 2UVHA 3R26A 4EDPA 3ECRA 4QFKA 4OQOA 1H43A 3EPEA 5KCJB 4OETA 2V25A 4F3SA 2DXYA 1SBPA 3RQTA 4MBPA 4IO6A 3FVGA 3S9NC 3C33A 1P1NA 4DXUA 3TAJA 5HPQA 3K1NA 3BFTA 5H8QB 4BDRA 2YLNA 2Z8FA 4GLIA 5AA1A 1QW0A 4BDQA 3TTLA 3K01A 1OQHA 1MS7A 1NH8A 3MUQA 4LZ7A 5H8NB 3PU5A 4F3GA 4H67A 2REGA 1N0TA 1POY1 3LUYA 4QFPA 5BWJA 5I56A 4BDMA 5FTIA 1HSLA 3H6UA 5M2VA 2X7PA 3V5AA 3HPIA 2HCAA 2ZYMA 2VOZA 5TU0A 2OWTA 4ZECA 1NL5A 3KEIA 2O7UA 4QSCA 1QUIA 3LC8A 4IY5A 2H98A 1DMBA 1XT8A 3SEVA 5LOMA 1MXVA 2I3WA 2HAVA 3IR1A 3HV1A 3FIRA 3E9XA 2FYIA 3TCHA 5ISUA 5F7VA 2RINA 4RA1A 3K02A 1P1QA 4ISUA 4OERA 4FJPA 1PDAA 4EUOA 2RF1A 4YMAA 2YJPA 3BKIB 1EZOA 5A5XA 3SEUA 3HHGA 4KYSA 3QIMA 2GH9A 2GRVA 2OCUA 1A8EA 1ATGA 3DELB 1XS5A 4QSDA 4RPNA 4AB6A 1LB9A 3UN6A 1II5A 4PP0A 4HS7A 5DEXA 3R7XA 5AA2A 1JW4A 2O69A 3G3KA 1ANFA 4IO4A 1B32A 1Y9UA 4OEUA 1JEUA 3RT8A 5TPAB 1MDQA 3OEMA 3H4ZA 3R6UA 1MXYA 4QFLA 4F1YA 1FW0A 3W9WA 1JW5A 4GL8A 3K6WA 2NOOA 3BFUA 4RK9A 3C31A 4P0GA 3IOUA 4F1VA 2Y7IA 3D4CA 1SW5A 2X26A 1UIVA 1RKMA 4XKRA 4BDNA 2P2AA 3P7IA 4F3BA 1IXGA 4FIMA 3CR9A 5I58A 4ZDMA 5J1DA 2XXUA 1HSEA 4OESA 1NH7A 2M8CA 1YPNA 4ZEIA 3OOAA 1DTZA 3RGYA 1B46A 3H06B 1BIYA 4X1BA 2QS3A 3FXUA 1ZBMA 1MXWA 1OVTA 2ZNTA 4QSEA 1BKAA 3VVDA 3TQWA 3FJ7A 1MY4A 4L17A 3QAXA 4LP2B 1H3DA 2ALUA 4GFRA 4OVJA 4LZ8A 4NF6B 2XD2A 3B6QA 1B58A 2F7BA 3LSFB 2D21A 3U8QA 2F7CA 2A5SA 2Q89A 5DTBA 3O29A 2DYXA 3T9HB 3TTRA 4I1DA 2O68A 1GR2A 4GIZA 3KOSA 3SKPA 4F18A 1B1HA 2V3TA 2A5TB 3U93A 4DCXA 1DTGA 3RLFE 3VV5A 2ONSA 4ZEFA 4IB2A 4RPOA 1OLAA 2F36A 3EQ1A 3Q26A 5TP9A 4OENA 3S9LC 4NTLA 3IX1A 1SYHA 3PUZE 4FEBA 3UA8A 4DXCA 2QPQA 3UP9A 3MP8A 3KJ7A 4OFJA 1DSNA 4JWOA 4KPTA 4YB5A 4YICA 1B52A 4GXSB 1D9VA 1UTHB 1XOCA 2IA4A 5KDTB 1USYH 1US4A 1B4ZA 2DWHA 4YB6A 3T9UA 5CMKA 4FECA 4FAJA 3Q29A 1GV8A 4NF8B 3AXFA 5KCJA 2XXQA 3T96B 1VE4A 2PVUA 3VVFA 2DSFA 2Z8EA 2OJTA 4ELOA 4OXVA 1A55A 3U92A 3A3CA 1B3HA 2Y84A 1M5DA 2UYFA 1IZ1A 4EQBA 5F1QA 4P0IA 4Q5TA 1M5EA 1UTBA 1UIUA 5H8QA 4XKPA 3HCQA 3TDJA 1XVXA 4RXLA 5CC2A 3CRBA 4Z7EA 3IOTA 1N7XA 1B05A 1OQGA 4ELPA 5H8NA 4XKNA 5FTHA 3PMXA 5ICQA 1MY1A 1LB8A 2XD3A 5L8DA 4JBZA 3RTWB 2AL4A 1O64A 1MM7A 4OYVA 4XXUA 4C0RA 1BLFA 2AYSA 4EXKA 3IO4A 3KN7A 3DLNA 3QUFA 2DOJA 2O1MA 4LUBA 4FORA 5B7DA 3E13X 4IO3A 4ELQA 4X1DA 3VVEA 3H03A 3TCFA 4MH5A 4QFNA 1FTKA 1VR5A 1N76A 4R74A 1A7LA 2RC9A 1QKAA 4YU0A 2P1SA 4Z0IA 4ZEDA 2DWJA 1SW1A 3H3GA 3L6HA 3PD9A 2B3FA 3MVXA 3PV0E 2KLFA 3RNNA 1ZTYA 2E1SA 3MZ9A 1O7TA 2Q2AA 2X7QA 4NE4A 2UYEA 3TTKA 5HM4B 3MQ9A 4R2BA 3CG1A 2NWJA 1VSOA 2Y7WA 2QJEA 4X48A 2DE4A 1MQHA 1LFHA 5DVFA 2PYYA 2YPNA 3IOVA 1SW4A 4THIA 4G8MA 2XXXA 2AIXA 1Q35A 4R2FA 3S4UA 2H25A 3G7WA 1M5BA 3MZ1A 1QVSA 3MVZA 4G77A 1N3XA 4GWOA 5TPAA 5JTYB 3U94A 1IXIA 3TELA 3VXBA 3WAEA 4YMBA 1JVXA 1MQGA 2PBWA 2HFBA 1LLSA 3LR1A 1LFGA 4Q8RA 4EF2A 1VFEA 4X9TA 4N07A 2NVUB 4YZZA 2H99A 3TODA 4NWCA 3FATA 4KHZE 2RC7A 3GZGA 4UA8A 4QF9A 5AA2D 1MDP1 3IORA 2ABHA 3PUXE 4FATA 3N5LA 1MY0A 3IJOB 4WXJA 2XX8A 3DP6A 4ZEBA 4XKQA 1JETA 4TLMB 1HSJA 4MLQA 1JW1A 4U23A 2BJJX 4LATA 3FVOA 3EHSA 3OMBA 2CMOA 1P1OA 4RNSA 4HW8A 4G2ZA 2XXRA 3KJTA 1WODA 4KD5A 5I59B 3PMWA 4JDFA 4LQ2A 2PT1A 3PD8A 5CMMA 1F9BA 2F7AA 3TMGA 5I2KB 2OZZA 2F5XA 3TTNA 4F22A 4U2RA 2REJA 2ZYOA 2O6AA 4ONYA 4BLAA 4NF6A 2R9JA 2CZLA 3JYRA 2DE3A 1FTJA 1IQ7A 2UXAA 3SERA 3MPKA 3KSJA 4MLVA 4G68B 4ZEKA 1B5IA 2R6GE 5IKBA 2QMXA 4YB7A 1FTOA 3O2AA 2HZKA 1B3FA 1H76A 1URDA 2A5TA 3FD3A 2I0BA 2ANJA 2OWSA 4LVQA 2RC8A 4ZE9A 1IXCA 4OTEA 1YTVA 4GOTA 2NUVA 4DCYA 3GBBA 3ILTB 3CFZA 3FZVA 2Z8DA 1IXHA 3JZJA 1OLCA 2F6GA 2PT2A 1A40A 4XTCQ 1LCTA 2GFEA 3LSWA 4RJZA 1MY2A 2O1LA 1NNPA 2VHAA 4KCCA 2OLBA 5KDTA 3KG2A 1PB7A 4F29A 3QK6A 1TWYA 1SW2A 4NF8A 3TEPA 1FQCA 4Q0CA 1LAGE 3H6TA 3N94A 1RYOA 1B2HA 1IIWA 1AMFA 2OK2A 3U1OA 2ZNSA 3UGWA 5CRYA 3G3FA 4R6HA 4H5GA 4HCYA 5L9SA 2DP8A 1MQDA 1EZPA 1N7WA 4ZZAA 3RUMA 4FE8A 4PE5B 1IEJA 4WKMA 3W15C 5CI5A 1TFDA 1BP5A 3HO7A 4QRZA 3K6VA 3VLUA 2O51A 2D5WA 4TLLB 1DOTA 3VLWA 4H6DA 1ZKBA 1R9LA 5I57B 3T93B 3E3KA 3G3HA 3ZS6A 3M3LA 1FQBA 4WEPA 1LGBC 4IY6A 2F35A 5EYFA 3ZKKA 4OFLA 4DE8A 2ZYKA 5H8FB 5AA3A 2I48A 1Y4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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