1N0TA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-atpo at 2.1 a resolution.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Competitive antagonism of AMPA receptors by ligands of different classes: crystal structure of ATPO bound to the GluR2 ligand-binding core, in comparison with DNQX.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA01
2DQVA 4I8CA 1MQHA 1I6QA 2DWHA 3E13X 4TQUQ 5AA4A 4OETA 4GD5A 1L5TA 1IXGA 4DCXA 3DM0A 4OFOA 1SW2A 3EF7A 2ESNA 2A5TB 2QPQA 3FXUA 1QVSA 2F34A 3KOSA 1DPPA 3B6QA 4PFYA 3MVZA 4BDNA 1YPNA 4U22A 1B0LA 4F1YA 4P11A 3BBRA 3KN8A 3TCHA 2V3UA 4TLMB 3H3GA 1DOTA 4HTGA 1XVXA 4IO3A 3T93B 5LOMA 4LVQA 3H03A 1H3DA 2I48A 4PP0A 1BLFA 2DSFA 5CC2A 3OD7A 2FNCA 2Y7WA 4EQBA 1N3WA 4P0IA 3A09A 5BUUA 2F97A 5H8NA 1MXUA 2ZYOA 1FQBA 2DVCA 1AH5A 2BJJX 4ZEKA 2OBGA 5EHSA 2F8DA 1B58A 3FIRA 1NL5A 1BKAA 4RPNA 4HCWA 4YAHX 5KDTB 3PU5A 1P1WA 4JSOA 4OHNA 4AB5A 3E9XA 1B46A 3LSXA 3IO4A 1TXFA 2P0SA 1MPDA 3I5OA 3MAMA 4O3AA 1Q35A 3A3UA 3MJNA 5DEXA 1PB7A 3TAJA 1M5FA 2E1SA 1MH4A 3PMVA 2RF1A 3M3KA 1ZKBA 3BFTA 2X26A 4IO7A 3OEMA 1B2HA 2XXHA 4THIA 5H8QA 1GGGA 1N04A 1QUIA 1LFGA 4ZE8A 4BDRA 3PUWE 3IK6B 4UACA 4QSCA 1Y3NA 4GF8A 3TKDA 4DXCA 2X7PA 5FHOA 4YZZA 3T9HB 3K0VA 1MXZA 1ZBMA 4PE5B 3KG2A 4XKNA 3K1MA 1NKXA 1URSA 3A3CA 1SI1A 4QFNA 3IX1A 1NNKA 3K01A 4F3SA 2REGA 2F78A 3FVNA 2E0SA 2H25A 3DLNA 1O63A 3T9UA 1S7YA 3HHGA 3TQLA 1PB8A 1B32A 4LA9A 1XOCA 3IR1A 2UVGA 4JWYA 2O7UA 1QUJA 2W7YA 4U1OA 1B3GA 3PPOA 3HCQA 3FD3A 1RYXA 1MXYA 1WDNA 4EDPA 3ECRA 3O9PA 3R7XA 2F36A 2GH9A 3O6GA 2OWSA 4U1ZA 4YMAA 1FQFA 1M5EA 4P0GA 2HCAA 3K6VA 2P1SA 2RKMA 1EZOA 1XHYA 2ZYKA 2B3FA 3MW0A 4F3BA 4XKQA 5A5XB 4N13A 3TODA 4EQ9A 3CSGA 3VV5A 2Q2AA 3IJXB 3LSFB 5TU0A 5FHNA 2KLFA 3U1OA 5ICTA 3O6HA 1OLCA 1GTKA 2I0CA 4H1XA 1ELJA 4F22A 3HSTA 4Q0CA 3TMGA 1RKMA 3MPLA 2ZYMA 3KSXA 2XXQA 3H7MA 3JYRA 1XT8A 3MVWA 4R74A 2H5YA 2DOJA 2UYEA 5ITPA 1TFDA 5JEIA 1KWHA 1SD3A 3H6UA 1POTA 3QXMA 5AA4B 3F11A 4NWDA 5TPAA 2DXYA 1UQWA 1LCFA 3QAXA 1IITA 1OIBA 3AXFA 3SESA 1B6HA 4POXA 3S9NC 5F7VA 2NWJA 3VXBA 4GXSB 2H98A 4KYDA 1T0KA 3WAEA 2YJPA 1IEJA 3KJ7A 3FVOA 1B05A 4G68C 1N0TA 4EUOA 4ZEFA 3HPIA 3W9WA 4YICA 3OSQA 1YAEA 3VDFA 5L9OA 1B7HA 4OENA 2LAOA 2F35A 2HAUA 3O29A 3S2VA 2XX7A 4R2BA 3UA8A 1SBPA 1MH3A 5I58A 2WKYA 2YPNA 3UN6A 3FJMA 2UYFA 1QULA 4U4SA 3MWBA 3OOAA 4HS7A 4N07A 2QS4A 4I9DA 2RCAA 2ONRA 5CI5A 3RNNA 3MZBA 5FTIA 1NFTA 1P1NA 1TFAA 2I6EA 3LUYA 4F29A 1Y1MA 5ISUA 3O2AA 2V84A 3SERA 1AMFA 1P1UA 3KSJA 2Y84A 2RCBA 4X1BA 5DEXB 4ELOA 4R6KA 4GFRA 4K3FA 3G3KA 1JW5A 4H8JA 3PPQA 1XC1A 2PMSA 2ZMBA 5H8QB 2DE2A 4LZ7A 3ZKKA 4RYAA 3HV1A 4H0WA 3QIMA 3S9EA 4HW8A 1BTJA 4F2OA 4E0WA 5B7DA 2GRVA 2QJEA 4YB5A 1R1NA 3JZJA 5CMMA 3SEXA 2HZLA 1LAGE 1A8EA 3Q28A 5KCJA 1MY0A 2Z8FA 1IIWA 1LFHA 2VGQA 4MH5A 4IO5A 4IY6A 3PGFA 4PFTA 4O3BA 5DVIA 4RK2A 1QUKA 1MXXA 3MP6A 3K1PA 3EHUA 5EYFA 3W9VA 1LFIA 2I4BA 3V5AA 1ZU0A 3CI8A 3CR9A 1D9YA 3G7WA 4GOTA 4ZS9A 3K6XA 4XKPA 3KEIA 1P99A 4E0XA 3K4UA 3EHSA 3L6GA 3C32A 3CG3A 4X9TA 2H4IA 4MLVA 1XVYA 5ITOA 1YCJA 5FHMA 3MQ9A 3KN3A 1R9LA 2I49A 4O3CA 5AE4A 3CG1A 2UVIA 2OCUA 2ZNUA 5I59A 1URDA 1QKBA 1Z7NE 1B7ZA 1JW1A 4ELPA 1A7LA 4YKKA 5K2YA 1HSJA 1PC3A 3RGYA 2Y7RA 4F1UA 1ATGA 2V3TA 4ZDMA 3P7IA 5AA2D 2VHAA 2V93A 3FXRA 3O6IA 1BIYA 1SQYA 1A55A 3U94A 3O66A 3PV0E 4GL8A 3CFXA 4OESA 2AYSA 2Q8JA 5DTBA 2ABHA 4JXIA 1SW5A 2XXTA 4RA1A 1FTLA 2IA4A 3TCFA 3T9XB 2XXPA 4H5FA 1LAFE 5TPAB 2DWIA 3EHTA 3OSRA 4YB7A 1B4ZA 2A5SA 1IUDA 2RC9A 4ECFA 4QF9A 4U4XA 3UGWA 2UVHA 2DWJA 4KPTA 1Y4CA 2CMOA 3TQWA 4GL0A 2ALUA 3RN8A 4IO6A 3CFLA 1B3LA 4EXKA 3H4ZA 3TZAA 1DSNA 3MP8A 2XXVA 1OVBA 3GZGA 2Y7IA 3PUZE 3G3IA 4IY5A 2O6AA 4JWOA 3ZKLA 1US5A 3T66A 1MM6A 3EN3A 1B3HA 1TT1A 4AQ4A 3IL1B 5I58B 3ONMA 4XTCQ 1PBPA 4ONYA 3MBPA 4QRZA 1PBQA 4DXUA 1H43A 4G77A 1OMPA 3IJOB 3KJTA 1MQDA 4H65A 2ONKE 1MG1A 1LBCA 3T22A 4X48A 3W15C 3CRBA 4N6PA 1SYIA 1YTVA 1NNFA 3UORA 5I56A 2XD2A 4MLQA 3TTKA 3S4UA 4JDFA 2NVUB 1MY2A 4DZ1A 3IAZA 3C33A 1JETA 2PT2A 2GHBA 4ND9A 1QJMA 1DMBA 1UIVA 3VVEA 3MZ9A 5HM4B 2I3VA 4YU0A 4ISUA 1TWYA 4GRKA 4DXBA 2VD3A 1B1XA 4IGTA 5DVJA 4C0RA 1MDQA 2DP8A 1B52A 1GVCA 4G68B 3L6HA 2O1LA 4PFWA 1SDXA 5TP9A 3IORA 4NF4A 3N6UA 3RY3A 5CM6A 3LSLA 3V83A 4JBZA 1B3FA 2REJA 3K1NA 2XX9A 3TTNA 1SW1A 5BWJA 5DT6A 4KI0E 2F7BA 3PUXE 3G3HA 5KCJB 4R73A 2Q88A 3QUFA 3KN7A 1A99A 2NXOA 3CSBA 1J1NA 3DP6A 1IQ7A 2AL4A 3U92A 3JV9A 1MPBA 4I62A 1NNPA 3MZ1A 2F7AA 3ZS6A 1MQIA 4KR5A 2PX1A 1VFEA 5CMCA 1B3EA 3RTFB 4F1VA 1EZPA 3PPPA 4ZEBA 4OMBA 3FJ7A 3C4MA 2M8CA 1B5IA 1H76A 4NWCA 4PQJA 3V8XB 1NNTA 5CMKA 4YB6A 1MY4A 1N7WA 2O1MA 4OEVA 2XXYA 2GHAA 5K2XA 1LCTA 4ESXA 3V89B 1QKAA 1CE2A 5CBRA 3TTRA 1B4HA 1OVTA 5I59B 3SEUA 4G8HA 1B9JA 5I2KA 3GLBA 2XD3A 3VLVA 3G3GA 4FAJA 2VOZA 4GLIA 1SVXB 1O64A 3Q25A 3TUSA 1EH3A 4MBPA 1O7TA 4DIGA 1UTBA 5F1QA 3RUMA 2Z23A 3MVYA 3U72A 2VD2A 4NF8A 1OQGA 1Q1KA 4NF6A 3TEPA 3BFUA 1AOVA 3OO8A 2VP1A 1PEBA 4EQ7A 1EZ9A 1VE4A 2F5XA 2THIA 4LZ8A 2QSXA 4C1TA 4LATA 2O51A 2O69A 2RC7A 4BDMA 1N84A 1S50A 1N3XA 2ANJA 4GQOA 2XHDA 4NTLA 4LZ5A 4I1DA 3E4RA 3FGSA 4H8IA 1I69A 2DS9A 3IO6A 1ZTYA 2B3BA 2Y7PA 3FXQA 5I2NA 4JWXA 1B40A 3KGCA 2O68A 4OZ9A 1MY3A 3IOVA 2ONSA 4ZZAA 3QUJA 3N94A 5H8HA 2Z8DA 1IXCA 1LB8A 3BKIB 3CVGA 5EHMA 1P1QA 3HN0A 3H6TA 4M1VA 4Q30B 4NEDA 3TYHA 4F39A 2O7IA 2Y7KA 3IOTA 3H06B 5H8SA 4C1UA 5CRYA 4EF2A 2ZYNA 1I6BA 1Z7ME 5JTYA 3M3LA 1Y20A 4IO2A 1JEUA 5I57A 1QW0A 4IO4A 3C34A 4QFOA 5ELVA 4Q8RA 4G68A 2V3QA 3M3FA 2HXWA 4F3PA 5IAIA 3GBBA 3C31A 3RT6B 2DE4A 5I56B 3S9MC 4DDDA 1IZ1A 1VSOA 3G3JA 3VLUA 1Y3QA 1B0HA 4POWA 1FTMA 4M4GA 4U2RA 1ZLQA 4GIZA 2F7CA 5H8FA 4HCYA 4QFPA 1LBBA 4WEDA 5J1DA 3T9VA 1Y9UA 3THIA 1MDP1 2QMXA 1SYHA 5TP9B 1B51A 4NF4B 3GXAA 1H45A 4IB2A 2G29A 4RJZA 3O28A 1AL3A 3PPRA 2V25A 1JW4A 1D4NA 3LR1A 4Z7EA 1MS7A 1MQJA 3PD8A 5L9MA 3UIFA 4YKIA 4G8MA 3B6TA 1BP5A 3CFZA 1S9TA 3G3FA 3LC8A 2DE3A 3PUVE 1JNFA 3OEKA 2ZNSA 1SI0A 3QSLA 3PMXA 4X1DA 2DVZA 4Q5TA 1FQCA 3RTWB 4H6DA 4H67A 2HAVA 5L8DA 2DYXA 3PD9A 1IXIA 3Q29A 2PBWA 2OWTA 3Q27A 2XXRA 3OO7A 4R6HA 2D21A 1M5DA 4LQ2A 3FVKA 4U23A 4GWOA 2I4CA 2QS2A 5AA3A 1POY1 3TFLA 3DP4A 5CBSA 1JEVA 5CMBA 4OFJA 1MXVA 4KCDA 1FQDA 1LAXA 4KQPA 3IOWA 4ZEDA 3MPKA 4XKRA 4KFQA 2G93A 1NH7A 1JVYA 3DELB 3DP8A 3VXCA 4JSDA 4ZECA 5I2KB 3LSWA 3VVFA 2ZNTA 5L9SA 3ILUB 2X7QA 2CZLA 2P2AA 4FEBA 3OXNA 4RK9A 1UTBB 4RNSA 3I6VA 3OO9A 4OXVA 4NF8B 4PETA 1UIUA 1WODA 2UXAA 2GFEA 4FE8A 4NF6B 2ZXTA 4RPOA 3EQ1A 1MQGA 5FTHA 3OMBA 3K02A 4ZE9A 2QMWA 1A40A 2H9BA 2F6GA 3VLWA 3K2DA 2HQ0A 1JVXA 3ZSFA 4GVOA 1FTOA 3IOUA 1FTKA 2QL3A 1WVJA 1URGA 4RXLA 2XX8A 4OQOA 4NF5A 1NMUA 4EF1A 1B5JA 4F19A 3HO7A 5I2NB 2HZKA 4WKMA 4IGRA 3C36A 1XS5A 1DPEA 4R72A 4OVJA 5H8HB 4TLLB 4KYSA 3UK4A 2Q2CA 3TDJA 1MXWA 5M2VA 2YLNA 1JQFA 3IB1A 3SETA 1MM7A 3UP9A 2RC8A 3H6WA 2PT1A 2OLBA 1R9QA 3SEVA 1Y4TA 4F18A 4MF3A 5JTYB 1M5CA 4L17A 5I57B 4G2ZA 4UA8A 4YKPA 1USYE 4NE4A 4KHZE 4Z0IA 2AL5A 3TCGA 3KZGA 3FUZA 2QRYA 2AIXA 2R71A 1N76A 2NUVA 1HSEA 1DTZA 3TTLA 5AA2A 4FECA 4F2QA 1CB6A 1Y3PA 2DWAA 3T96B 4QSDA 5I84A 3TPAA 4XIGQ 3U8QA 1US4A 4JB7A 3IB2A 3PPNA 3HHFA 5AA1A 1I6AA 5H8FB 3R6UA 3IB0A 3MVXA 1UTHA 1R6ZA 1OQHA 2F6PA 1RYOA 4QFLA 4U21A 4DCYA 5HPQA 4WEPA 1H44A 4YMBA 4AB6A 2O84X 1FCKA 1LAHE 4FEDA 3K6UA 3KFMA 4TOZA 4QFKA 4R2FA 4KD5A 2OZZA 3OENA 1MY1A 2A5TA 1N7XA 4YKJA 1B1HA 4DE8A 4FORA 2DXRA 2PVUA 3KOTA 3PUYE 3Q26A 2RINA 3N6TA 2Z8EA 1Y1ZA 3FV1A 1HSLA 3N26A 4ZZEA 4OERA 3CIJA 2IEEA 5DYHA 3EPEA 1M5BA 4G8NA 2I58A 3SDFA 3S9LC 2I3WA 3M8UA 3VE1B 4LP2B 4DLDA 3FATA 4PFUA 3C35A 4FIMA 4G4PA 4LQ5A 2H99A 3FVGA 4R6YA 2OK2A 3C9HA 1B5HA 3ODBA 1GV8A 3VVDA 4F3GA 4GXAA 5DVFA 3OELA 3RQTA 3TELA 3D4GA 5KDTA 1OLAA 2XXIA 3I3VA 1D9VA 3QK6A 3QYTA 4QSEA 1LB9A 3E3KA 2QS1A 3RT8A 3B6WA 3MC2A 4LONB 1FTJA 5ICQA 4ZEIA 3MUQA 3VFJA 1IXHA 4RY1A 2UVJA 5H8NB 4FJPA 1LGBC 2XXXA 3N5LA 1FW0A 1MRPA 3O97A 1A54A 2R6GE 4ELRA 1MPCA 1FQEA 5JK4A 4WXJA 2Z22A 3TTMA 4OFLA 2D5WA 1LSTA 3ILTB 1SW4A 4BDLA 4NF5B 1FQAA 1B7UA 2Q9TA 3U93A 1NH8A 5KZTA 3OO6A 2HEUA 1PDAA 3KBRA 3B7DA 3LBSA 3PMWA 1ZIUA 3FASA 4R75A 3RPWA 4H5GA 4BDOA 3H6VA 4LUBA 4ELQA 4XXUA 3FJGA 2OJTA 4OEUA 4R9FA 1PB9A 4EXLA 4QHQA 4F31B 1VFDA 4OWDA 4ESWA 3WAFA 3SKPA 2B65A 1DTGA 1A8FA 1ZJLA 3USDA 3SEYA 4BDQA 3K6WA 4NMYA 3GBAA 1AIVA 4KYEA 2D3IA 4FATA 2FYIA 1ZMGA 5AA2B 5A5XA 3FV2A 4KCCA 3SEWA 4OYVA 1USYH 4R9GA 2QS3A 2Q89A 3D4CA 3RLFE 5B70A 3FZVA 2XXUA 1II5A 2NOOA 1UTHB 1ANFA 2XXWA 1VR5A 2HFBA 1EU8A 3R26A 2R9JA 4OTEA 2PYYA 5HBCA 1LLSA 5IKBA 4BLAA 1GR2A 2FA7A 1F9BA 1D3KA 2I0BA 1P1OA 3K00A 3MP1A 4MFIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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