1N0TA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-atpo at 2.1 a resolution.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Competitive antagonism of AMPA receptors by ligands of different classes: crystal structure of ATPO bound to the GluR2 ligand-binding core, in comparison with DNQX.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA01
2O7UA 1SW2A 5DT6A 1D4NA 3U8QA 3HV1A 2XX7A 2DXYA 3T9UA 3BKIB 3IK6B 3PGFA 3TKDA 1R6ZA 4MF3A 5A5XB 3UA8A 2A5SA 1MQGA 3MPLA 3U93A 2NUVA 4FJPA 3P7IA 4GXSB 1FTMA 1IEJA 3G3HA 2XXHA 1IQ7A 1MY1A 3FUZA 5H8FA 3IB2A 1LFHA 3K01A 4H65A 3Q27A 4O3CA 2H98A 3KG2A 5F1QA 1DSNA 4QHQA 4GIZA 5H8HA 1WVJA 3LR1A 4DZ1A 4OERA 4XKQA 4QFPA 1MXUA 2F7BA 4YZZA 4H6DA 3QAXA 4IY5A 2OZZA 4EF2A 1ZJLA 2M8CA 4DCXA 1A54A 4G8MA 4U1ZA 2A5TB 3TEPA 3BFTA 2XXVA 3FASA 1IXGA 4ZEIA 3ZSFA 4H5GA 5I57B 3DP6A 1N7WA 1B6HA 3HHFA 2DYXA 3VVDA 1B40A 1MXVA 1MXZA 4OWDA 4R75A 2R71A 3RT8A 1MS7A 4ND9A 3K4UA 3KOTA 3JYRA 1QUIA 1JVYA 2UVIA 2DXRA 4H8IA 3RNNA 4ELOA 2ZYNA 4ESXA 3RN8A 2HAUA 2B3FA 4F39A 1UTBB 2PBWA 3EQ1A 5AA2D 2I4CA 3E4RA 4G77A 3SEUA 1SDXA 2Q2CA 4X9TA 1O63A 2Y84A 2XXTA 3H6TA 4LVQA 4OMBA 5KCJA 2DQVA 3MP1A 3C35A 2GH9A 2HEUA 2ANJA 1VE4A 5CMCA 3PUVE 5JEIA 1MRPA 4EQ7A 1YAEA 4TLLB 3MUQA 2I0CA 4OVJA 4H5FA 4JSOA 1A8EA 1A99A 2HZLA 5DEXA 3R6UA 4L17A 1H43A 4C0RA 3S2VA 1PC3A 4NF6A 4KCCA 3EHUA 5ITPA 3TTKA 4AB6A 3W9VA 1UTHA 4NE4A 1JW1A 3KN3A 3RT6B 3SEXA 2HCAA 4LATA 1LB9A 4KQPA 3QUFA 4OENA 2Y7WA 2THIA 2OJTA 5AE4A 1H3DA 1Z7ME 3PV0E 1DTGA 3FD3A 1Z7NE 1Y3NA 1LLSA 1MXWA 1FQFA 4Q5TA 4LUBA 3TQWA 5B70A 5JTYA 3EHSA 4XKNA 2VHAA 4GQOA 2D5WA 4DLDA 3VE1B 2I0BA 4DXUA 4K3FA 1M5EA 3B6TA 1MH3A 2Z8DA 5ELVA 1S7YA 2QJEA 4ISUA 4KYDA 3FATA 1B1HA 2X7QA 4R73A 2UVHA 3VLVA 2RKMA 2O1LA 3C31A 3OXNA 4RK2A 1O64A 3FV1A 4PP0A 1DPEA 3FIRA 4XIGQ 2QS2A 1JEUA 1M5CA 2FNCA 3W9WA 2ZNTA 4PFWA 3EN3A 4R2BA 2O6AA 1MY4A 3UGWA 5KDTA 3VXCA 4ZE8A 4ZZAA 3OEKA 1J1NA 3IAZA 2DP8A 2I6EA 3TMGA 4AB5A 4PQJA 3IJOB 3QUJA 4LZ5A 1M5FA 3H6VA 3TCFA 3DELB 2PT1A 3B7DA 4JWXA 4M4GA 3MZBA 4NF8B 3H4ZA 2ONSA 1L5TA 4F31B 4GLIA 3SDFA 2ZYKA 2O84X 4BDLA 3C34A 1MY0A 5IAIA 4FIMA 3K1PA 3TFLA 4X48A 3PPQA 2F34A 3MW0A 2I3VA 5TP9B 4OZ9A 3FXRA 1XHYA 4WEDA 1NNTA 5I59A 3GXAA 4N13A 1EZPA 1B3LA 2VGQA 2D21A 4HS7A 1S50A 3PUXE 2QL3A 2Z23A 3PU5A 1ANFA 2NXOA 1SVXB 3T93B 1XS5A 3GBAA 3IB0A 2X7PA 1IITA 3VV5A 2VOZA 5HBCA 5AA1A 2DS9A 3QK6A 4M1VA 1LAGE 4QF9A 4H67A 2Q8JA 5EYFA 3L6HA 1DOTA 2AYSA 2OWTA 2E1SA 3CI8A 4G4PA 2HAVA 4EDPA 4ZEKA 3KN7A 3PPOA 5I56A 1I6QA 4LP2B 4POXA 4F1VA 4ELPA 2PX1A 3CRBA 3VLWA 4R6KA 4NF5B 3ZKKA 3LSFB 3TTNA 1IXIA 4O3BA 3RLFE 2Y7RA 4F18A 5AA4B 2DOJA 4DXBA 4NMYA 5TPAA 5L9MA 3I5OA 2PT2A 4R9GA 3TAJA 2RCAA 4IO7A 3PUWE 1SW5A 1YPNA 4RXLA 1LB8A 4QSEA 3IR1A 4F2QA 4DDDA 2RINA 1P1UA 1US4A 2CZLA 4RPNA 4P0IA 3LUYA 1HSLA 4ZEBA 3OSQA 5FHMA 4GF8A 2HZKA 1B0HA 4JBZA 4EXKA 1FCKA 4IB2A 1POY1 3MP8A 1MQHA 5ITOA 4BDNA 3MWBA 4YU0A 2DE2A 4WEPA 2RC9A 3SKPA 2QRYA 4IY6A 3TUSA 5I2KA 1H44A 1CE2A 2XHDA 2F35A 5IKBA 1WODA 2PVUA 1B3GA 4OXVA 4QRZA 2P2AA 4O3AA 3VVFA 1II5A 5CI5A 3VDFA 3CR9A 3K02A 1AIVA 1ZBMA 1LAXA 3TTRA 3N6TA 1EU8A 1MXYA 3KN8A 4FEBA 1PBQA 4KCDA 1CB6A 4RYAA 3TQLA 3FGSA 3S9NC 1Y3PA 2UXAA 2KLFA 3PPPA 2WKYA 3E9XA 3MVXA 1MDQA 2YJPA 4R72A 2YPNA 1FTOA 2Z8FA 3MP6A 4Q0CA 2VD3A 3KSXA 4I62A 4JB7A 3LC8A 2H4IA 4EXLA 4BDMA 1MQIA 2GHAA 3V83A 3T9VA 4PE5B 4UA8A 1TT1A 4F3BA 5HM4B 4KYEA 4RPOA 1URSA 1ZLQA 2F6PA 3KEIA 4BDRA 3EPEA 4ECFA 1O7TA 1UIVA 3BBRA 1QKBA 2QMWA 4KHZE 4G68B 1LFIA 4Q8RA 1URDA 3RUMA 4G8HA 5CMKA 1I6BA 4G8NA 2I49A 1B5IA 2P1SA 3OD7A 1B3FA 4DXCA 4RJZA 4XTCQ 4Z0IA 3H6WA 3PMXA 2NWJA 2F7CA 4RY1A 2DWHA 5ISUA 4PFTA 4NF4A 3ECRA 2DE3A 1GTKA 4QFOA 2DWJA 3IB1A 1SW1A 3PUYE 1TFDA 4OFOA 3O29A 1B4ZA 3RQTA 1YTVA 1OQHA 1US5A 3SETA 1OLAA 3C32A 2QS4A 5JK4A 4YMAA 2XXWA 5L9SA 4NTLA 2W7YA 4NF5A 3USDA 3HSTA 2AL5A 4LA9A 4DIGA 4NWDA 2V84A 4PFUA 4F3GA 3TPAA 2XXRA 1P1WA 4YKKA 4TLMB 1PDAA 3KOSA 3ODBA 3TZAA 4U21A 4QFKA 3D4GA 2Y7KA 1FTKA 4NEDA 1LGBC 5DVJA 2I4BA 3K6UA 5AA2B 1JEVA 2VP1A 2OLBA 1GV8A 1AH5A 4G68C 4ESWA 3VLUA 1ZIUA 2Z22A 4N6PA 1N0TA 2Z8EA 5H8QA 3IO4A 4GVOA 5FTIA 2H5YA 3C4MA 2PYYA 3MAMA 3O9PA 5I58B 4OESA 1JW4A 3FZVA 4GXAA 4MLQA 2NOOA 1NH8A 3C9HA 1RKMA 4U1OA 4R6YA 1LCTA 2V93A 1JW5A 3O6HA 3JZJA 2GFEA 4HTGA 3AXFA 2RCBA 3IX1A 2H9BA 4XXUA 3Q25A 3RPWA 4DCYA 1A8FA 3E3KA 1URGA 2R6GE 1M5DA 4P0GA 3N6UA 2V3UA 3LBSA 3FJGA 5F7VA 5A5XA 3OEMA 3OENA 1N76A 3QYTA 4I8CA 1R9QA 1F9BA 1BKAA 2ZYMA 4H1XA 2F6GA 3FVNA 4OTEA 3ONMA 3IOVA 5I2NB 1BTJA 4HW8A 3O66A 1B58A 3FJ7A 1D3KA 4XKPA 2DVZA 4MLVA 3CIJA 4NWCA 3TELA 2I58A 2OWSA 1S9TA 2F97A 3MVZA 2O1MA 3O6GA 2AIXA 2ALUA 3M3FA 4U23A 2H25A 5HPQA 1N04A 4ZE9A 1B7ZA 4OHNA 5DVIA 1IUDA 4ZZEA 3G3FA 4MFIA 1LBCA 4GRKA 1B9JA 4IO6A 3MVYA 1NKXA 1PB8A 2A5TA 3K00A 4RA1A 3CVGA 5I57A 3RTFB 2OCUA 1OVBA 5CBSA 2RC8A 5EHMA 3KZGA 1FQCA 1PB9A 3VVEA 5H8FB 3B6WA 4ZDMA 1OVTA 3CFLA 3UORA 3F11A 4ELRA 3CSGA 5J1DA 1PBPA 2F7AA 2O51A 3OO6A 1DMBA 3VXBA 5H8HB 3OO8A 1UTBA 2DWAA 2GHBA 1Y4CA 2ESNA 4QSCA 1SQYA 4I1DA 3QXMA 3V8XB 1POTA 4IO5A 3S9EA 2Q9TA 4Z7EA 5DTBA 2ZNSA 4KYSA 1ZMGA 3DP4A 2Q2AA 3E13X 1LCFA 2XXQA 3KBRA 5FHNA 4OETA 4YMBA 1B7UA 1N84A 1IXHA 4F1UA 1MQDA 2YLNA 3G3KA 2DE4A 2QMXA 2OK2A 1OQGA 1MM6A 2DSFA 4FAJA 3U72A 3OOAA 2ZNUA 4OYVA 1GGGA 4OEVA 1B0LA 3RY3A 2XX9A 2D3IA 3ILUB 2O69A 3GBBA 5CC2A 2QPQA 4R74A 3I3VA 3N26A 3DLNA 5I84A 3SERA 1JVXA 2BJJX 1JNFA 3T96B 1EZ9A 1B3EA 4YKIA 1JQFA 5KCJB 4BLAA 4ZECA 1MPBA 1RYOA 1ZKBA 3IOWA 2AL4A 4FATA 3GLBA 3N94A 5FTHA 3SEWA 5DEXB 2V25A 4GL8A 3M3KA 3QIMA 1LFGA 3FVKA 4NF6B 2ONKE 4KD5A 1OLCA 4YB7A 1MG1A 3PD8A 2R9JA 1UTHB 4RNSA 2E0SA 3A09A 4N07A 4TQUQ 1Y4TA 2XXYA 4E0XA 1MQJA 4QFLA 3UN6A 3HHGA 4X1DA 2F5XA 3C36A 1WDNA 3CG3A 1EH3A 3D4CA 4BDQA 1LAHE 3S4UA 4H8JA 1DTZA 1QKAA 1LSTA 1MDP1 3O6IA 3G3IA 3CFXA 3TODA 3MPKA 3EF7A 1NNPA 3HPIA 3T9HB 3FJMA 1NNKA 4JDFA 3KSJA 4IO2A 4LQ5A 1MXXA 3OO9A 5TU0A 4TOZA 4YKJA 5CRYA 2G29A 4F3PA 1R9LA 5CMBA 5FHOA 3U1OA 4NF8A 1QUJA 3UIFA 5L9OA 3V5AA 3B6QA 1HSJA 3HO7A 1D9VA 2PMSA 1ZU0A 2XXIA 5AA3A 4WXJA 3DP8A 5KDTB 2B65A 3QSLA 3K2DA 3KFMA 5H8NB 4PFYA 2CMOA 5TP9A 4H0WA 4IO4A 3PMVA 4KPTA 3LSXA 1RYXA 2ONRA 3H3GA 1AMFA 1SI1A 4KI0E 3O2AA 2XX8A 4MH5A 1XC1A 5DVFA 1I69A 4MBPA 2DVCA 4EUOA 2UYEA 3BFUA 3Q28A 1AL3A 4AQ4A 4F2OA 4LZ7A 2IA4A 4UACA 3L6GA 2V3QA 2REGA 3JV9A 1XT8A 3IJXB 4OQOA 4U2RA 4GL0A 3PUZE 1Y9UA 1KWHA 3K0VA 2REJA 5CMMA 4LZ8A 1FQBA 4WKMA 4C1TA 1Y1ZA 3CFZA 3S9MC 4QFNA 1B3HA 2ABHA 3MZ1A 3TDJA 4JWYA 5I59B 1SI0A 2FA7A 3I6VA 1MM7A 5AA4A 3MJNA 4ELQA 3RGYA 3KGCA 5CM6A 3T66A 4FE8A 3ILTB 3KJ7A 5BUUA 1A55A 3IL1B 2GRVA 4FEDA 2X26A 3IOTA 3IO6A 4THIA 4R9FA 1QW0A 1VFDA 4U4XA 1N3XA 1B05A 1FTJA 3LSWA 1ZTYA 3PPRA 3TCGA 2P0SA 3TTLA 3Q26A 3K6XA 5K2YA 3FVOA 3H6UA 1HSEA 3W15C 1H45A 1MY2A 5I56B 1XVXA 1A7LA 1UIUA 1NFTA 2Y7PA 3SESA 4PETA 1SD3A 4G2ZA 1EZOA 3H7MA 5KZTA 1FQEA 1B1XA 4JXIA 1TXFA 2O68A 3M8UA 4LQ2A 1TFAA 3Q29A 5TPAB 1MH4A 2ZYOA 5H8SA 3K1MA 1QVSA 2F8DA 2XD2A 1SYIA 1GVCA 2LAOA 4EQ9A 1MY3A 4EF1A 4ZS9A 4OEUA 3PPNA 1XOCA 1USYE 2DWIA 3VFJA 5ICTA 4I9DA 1FTLA 3FXUA 4ZEDA 1B5JA 3GZGA 2Y7IA 2NVUB 3ZKLA 4YICA 1IIWA 3DM0A 1N3WA 3OSRA 4F1YA 2HQ0A 4RK9A 3KJTA 4F29A 4IO3A 5ICQA 4YKPA 1BIYA 1IZ1A 3CG1A 5K2XA 1LBBA 1ATGA 2XXPA 5I2KB 2ZXTA 4P11A 5LOMA 3FVGA 4JSDA 3HN0A 1NH7A 1YCJA 3R7XA 4U4SA 2FYIA 3K6WA 5H8NA 3MZ9A 5BWJA 1OMPA 1P99A 2XXXA 4GOTA 1B46A 4XKRA 1MPDA 1NL5A 4F3SA 3O28A 3SEVA 4G68A 4ONYA 3SEYA 1XVYA 1B4HA 3K1NA 4HCYA 5M2VA 2XXUA 4IGTA 2HXWA 1P1NA 2I48A 1BP5A 3R26A 3WAEA 4BDOA 1B51A 1PEBA 3H03A 1P1QA 1Y3QA 4FECA 4GFRA 3IORA 1Q1KA 2UYFA 4YAHX 1QUKA 1AOVA 3T22A 2RC7A 4Q30B 1FQAA 4IGRA 2I3WA 1QULA 1QJMA 1BLFA 4YB6A 1B5HA 2RF1A 3LSLA 4FORA 3G3GA 2QSXA 1GR2A 1I6AA 2QS1A 3U94A 3RTWB 3OMBA 1DPPA 4ZEFA 3V89B 1SBPA 2F36A 2OBGA 1P1OA 2V3TA 3IOUA 5L8DA 5EHSA 1TWYA 1T0KA 3U92A 3CSBA 1JETA 4NF4B 4X1BA 5DYHA 3OO7A 1Q35A 1M5BA 5AA2A 4F19A 4YB5A 3O97A 3MVWA 1IXCA 1D9YA 5CBRA 3T9XB 3FXQA 4LONB 1B32A 1MPCA 1R1NA 3H06B 3ZS6A 1OIBA 4GWOA 4EQBA 5I58A 3TTMA 2Q88A 2H99A 3TCHA 1FW0A 2Q89A 2HFBA 2QS3A 1B7HA 4R2FA 3FV2A 4POWA 3G3JA 1FQDA 4HCWA 2O7IA 3MBPA 1VR5A 4R6HA 1USYH 3WAFA 3MC2A 1Y1MA 3A3UA 4QSDA 2IEEA 1SYHA 2G93A 3A3CA 4C1UA 1B52A 2F78A 3M3LA 4KFQA 2B3BA 3PMWA 4U22A 2UVGA 1NMUA 1ELJA 1VFEA 5H8QB 1LAFE 3EHTA 2VD2A 2XD3A 3THIA 4F22A 1N7XA 4DE8A 1H76A 3UP9A 4JWOA 3K6VA 3G7WA 5I2NA 1A40A 1B2HA 4OFLA 4OFJA 3C33A 4E0WA 5JTYB 1NNFA 1Y20A 2UVJA 3PD9A 3OELA 3MQ9A 3N5LA 5B7DA 1SW4A 3HCQA 1VSOA 1PB7A 3UK4A 3S9LC 1UQWA 4GD5A 4KR5A 2ZMBA 3TYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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