1N0TA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-atpo at 2.1 a resolution.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Competitive antagonism of AMPA receptors by ligands of different classes: crystal structure of ATPO bound to the GluR2 ligand-binding core, in comparison with DNQX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA01
2R71A 2VD2A 2VGQA 2QS4A 1DMBA 1N3WA 2XX9A 2XXQA 4F3SA 3C35A 2GHAA 3T66A 3KG2A 3JYRA 4NF8B 1FQEA 4X1BA 1VSOA 2Z8FA 3K6WA 3TUSA 4PFWA 4Q0CA 4DCXA 3IO6A 1N04A 3E9XA 3UP9A 3TTLA 4OMBA 3PUZE 3RQTA 5AA4B 2HEUA 3CFLA 2PMSA 5BWJA 4ZZAA 4M1VA 2XD2A 4KFQA 2F6PA 1JVYA 4R6KA 1F9BA 4H67A 2AL5A 5CI5A 4OENA 4X9TA 4XTCQ 3LUYA 3IOUA 2XXWA 2ZMBA 3O9PA 4EQ7A 2XHDA 1N84A 5AA2A 1M5EA 1FQBA 2RC8A 2QS1A 1B05A 1OQHA 3T96B 1I6AA 2HQ0A 1OVBA 2P2AA 1SD3A 4EF2A 5FHNA 1R9LA 2QSXA 1JETA 2OCUA 1USYH 4R9GA 1FTOA 2DWAA 3O28A 4DXBA 1N76A 5ICQA 4OETA 5BUUA 2HXWA 2H98A 4JBZA 3FASA 3MVYA 1LB8A 2I0BA 2I4BA 3MPKA 2DWHA 4NF6A 1PC3A 3G7WA 4FECA 4JSOA 3TCHA 2DP8A 4TLLB 3V5AA 1PB7A 3G3FA 3MPLA 5CC2A 1NFTA 4OFJA 4QSEA 2OZZA 1A55A 2R9JA 3EPEA 4ZE8A 2XD3A 2E0SA 4OEVA 1VFEA 4WEPA 4R75A 2F7AA 2Q2AA 3DP6A 4U2RA 5CMMA 3HN0A 4ZECA 3MVZA 4TLMB 3B6QA 3U93A 3L6HA 4KYDA 3PGFA 1NH8A 2QPQA 4XXUA 1LAGE 1LSTA 1HSJA 1B3GA 2E1SA 1ZIUA 2DVCA 4RXLA 1II5A 3IOWA 4IY5A 2DE2A 3HPIA 5IKBA 5DT6A 3N5LA 1ZU0A 3RTFB 5I57A 4MF3A 1FTJA 1IXIA 2A5TB 3MUQA 1LAXA 5I56A 4QF9A 4DZ1A 4ELOA 4JB7A 2IA4A 1JEVA 2D5WA 2Z22A 1MRPA 1DOTA 4I1DA 5I2NA 3USDA 3PPPA 5DVFA 4C1UA 4QFKA 1BP5A 2B3FA 1OQGA 3PV0E 1N0TA 4QSDA 2XXIA 4LZ5A 1HSEA 1SYHA 3LBSA 1Y4TA 1LB9A 3H4ZA 4JWOA 2PT2A 1MDQA 2I3WA 1DTZA 1B4ZA 2UVIA 5EYFA 4KCCA 1S50A 3PD8A 3QUJA 1GV8A 1LAHE 3G3IA 3MWBA 4F2OA 1KWHA 3E4RA 1BTJA 1XT8A 4IO7A 4GWOA 4UA8A 2QS2A 3VLVA 1S7YA 4YB7A 4HS7A 5FTHA 1XC1A 3FVNA 2ANJA 1CE2A 1DPPA 2X7QA 3CSBA 1NMUA 5I58B 4BDMA 1VR5A 4MLQA 4YICA 2OK2A 3ZS6A 3K1NA 1B7ZA 2RC7A 3FVOA 1MXXA 4BDOA 2PX1A 4I9DA 4YAHX 4N13A 4KYSA 3L6GA 3FXQA 1LGBC 2CZLA 3W9WA 4FE8A 3D4GA 5A5XB 3MW0A 4LATA 2V3TA 3S4UA 5KDTB 2VP1A 4G2ZA 3C34A 3CRBA 1PB8A 3IJOB 1I6QA 1MG1A 5JTYA 1FTLA 3VFJA 2Y7KA 4ZE9A 1TFAA 2ESNA 4G68A 1RYXA 1PBPA 3N6UA 3CVGA 4FJPA 1URSA 3Q26A 1ATGA 2HAVA 1IXHA 3PUXE 3BFTA 3SEWA 1Q35A 3E13X 4ECFA 5CBRA 2KLFA 4PFUA 1FQFA 1OVTA 4YKKA 4YB5A 1MQGA 4WXJA 1YPNA 1Z7NE 4PP0A 5CBSA 2ZYMA 3K6XA 1B3HA 3FIRA 4ELRA 4BDNA 3K00A 1P1WA 3TMGA 1B58A 4GF8A 4TOZA 5TP9A 4I62A 2XXYA 3U72A 3FVGA 2ONKE 2RC9A 3RY3A 3KN8A 3PUWE 2HCAA 1POTA 4XKQA 2LAOA 5J1DA 3OO6A 4R73A 4EDPA 2THIA 4Q8RA 1GVCA 2B3BA 3K0VA 4GVOA 3MP1A 1MY0A 3G3JA 5JEIA 1ZJLA 2O1MA 5HPQA 4G68C 5H8HB 4PQJA 2QMXA 3OENA 4YMAA 3AXFA 2DOJA 1QULA 1JEUA 4LZ8A 1B1XA 1MDP1 5LOMA 3OSQA 3PUYE 1US5A 3PMWA 1TT1A 1OLAA 3GZGA 1ZTYA 1MQJA 5ITPA 4ONYA 4IO2A 4R74A 3KFMA 1EZOA 1R1NA 5KZTA 3MBPA 3C36A 2GH9A 3EF7A 1MPCA 3V83A 1TWYA 4C0RA 4E0WA 1IXCA 1JVXA 4PE5B 1JNFA 1AOVA 2HFBA 4THIA 4QRZA 1P1UA 2XXXA 3MVXA 1MM7A 3H3GA 2X26A 3LSXA 4O3AA 2I49A 2DQVA 3M3FA 1JQFA 4Q30B 1B5HA 3TPAA 4BDQA 3B6TA 3OOAA 2Z8DA 5B70A 3K1MA 3IO4A 1H43A 4H0WA 5I2KB 1TFDA 1WVJA 2PT1A 4XIGQ 4XKNA 4OHNA 2I4CA 2F8DA 3HHGA 4HTGA 5I59A 1D9VA 3S9NC 4NMYA 2RCBA 1IQ7A 4F3BA 4JDFA 3RPWA 1B9JA 4HCYA 3UA8A 2F78A 4O3BA 3FVKA 3IB2A 4U1OA 1Y3NA 3GBAA 1SW1A 1XS5A 2RINA 3R26A 4YU0A 2AIXA 3N94A 3H7MA 3KJ7A 1AMFA 1LFHA 1DSNA 5FTIA 2HAUA 3C31A 2ZNSA 3FATA 5KDTA 3U92A 3T93B 4F1VA 1NNFA 3GXAA 2Q9TA 4G8NA 5TPAA 3OO8A 3OMBA 3FXRA 4F2QA 2R6GE 4ESXA 3Q29A 4AB5A 2Q89A 4H65A 4LA9A 3OD7A 3O29A 2O69A 5DTBA 3H6VA 1B6HA 4Z0IA 2Z8EA 1I6BA 4H8IA 2YJPA 4G4PA 1A8EA 5KCJB 3QXMA 4NEDA 3O6HA 3VLWA 2RF1A 2VD3A 2V25A 5CMKA 1SVXB 3DP8A 1MQDA 4E0XA 3ZKKA 4YKIA 1LCFA 2F5XA 2CMOA 2IEEA 4U23A 2UXAA 3MZ9A 3EHTA 4GL0A 3KSXA 3VVFA 1LAFE 4NF5B 1MM6A 1SQYA 2WKYA 3PMVA 1XOCA 2Y7IA 4DLDA 3TYHA 3ZSFA 1TXFA 1P1QA 3HHFA 5H8FB 4F1UA 5AA3A 1UTBB 5H8HA 3MAMA 4ZEFA 1PBQA 3KSJA 1P99A 3DM0A 3FGSA 3C33A 2I0CA 3C9HA 3IR1A 1MY1A 1B3EA 5CRYA 3ECRA 1Y1ZA 4YKPA 5H8QB 1PDAA 1NL5A 4ZEBA 4PFTA 3T9VA 3KBRA 3SEUA 3M3LA 2NVUB 4QFLA 3SESA 1M5BA 2O6AA 4FEBA 1ANFA 4RY1A 4IY6A 4OFOA 2O68A 5TU0A 4RPOA 2GRVA 4OQOA 1P1OA 4NF4B 4RJZA 5F1QA 3A3CA 4RPNA 1SBPA 1B2HA 1QUIA 1ZMGA 3LR1A 5DEXB 4LP2B 4LUBA 4YB6A 4F18A 2ABHA 4AQ4A 3KOTA 3O2AA 1J1NA 3IOVA 4LQ5A 4DXUA 1YTVA 1N3XA 3VLUA 4JXIA 2O7IA 3TQWA 4EUOA 3EN3A 2ZYNA 3VV5A 5ICTA 2UVHA 1URGA 3Q27A 2RKMA 3VXCA 3WAFA 4NF8A 3TZAA 2F36A 4DCYA 1WODA 1NNPA 3VVDA 5AA4A 4Q5TA 2ONSA 5DYHA 1B4HA 4G77A 2H25A 1D4NA 2RCAA 3TQLA 3FUZA 2PYYA 4ZS9A 4KPTA 4FATA 1D3KA 1Q1KA 3MP8A 2UYEA 1DTGA 4KD5A 3I6VA 4GOTA 4H5FA 3N6TA 1IEJA 4YZZA 1B0HA 1Y3QA 4KHZE 4F19A 5H8SA 1LBCA 3CFZA 2YPNA 2I48A 2VHAA 4LVQA 2ZXTA 4NTLA 3RN8A 2H99A 4K3FA 1BIYA 5M2VA 1RKMA 2DSFA 4DXCA 4ZEDA 1MQIA 3QAXA 2FNCA 4BDLA 1UTHB 1EH3A 3PMXA 2I58A 3B7DA 2DVZA 1B5IA 1YCJA 4OVJA 3G3HA 3PPNA 1HSLA 2O84X 4RYAA 3QUFA 2PVUA 3RT8A 4OXVA 1B7HA 1MY4A 4ELQA 2DS9A 3IAZA 4U21A 3ONMA 4H5GA 4R6YA 4FEDA 5CMCA 2G29A 1USYE 1DPEA 1T0KA 3THIA 4P0GA 4P11A 2Q8JA 2F35A 3CFXA 3RTWB 2O7UA 3FV2A 1FCKA 4H6DA 4PFYA 1ZBMA 1B46A 1B32A 3H6WA 4OEUA 2Q2CA 1SI0A 5B7DA 1WDNA 3IK6B 2OBGA 4HCWA 3UIFA 3K6VA 5EHSA 5H8QA 4MH5A 3SDFA 4OERA 2XXTA 2XXRA 5AA2B 1H76A 3OEKA 4BDRA 4JWYA 3CI8A 2UVGA 4KI0E 4NE4A 1MXYA 2H9BA 1QKAA 1POY1 3MZBA 2XXPA 1R9QA 3TTNA 2A5TA 3TEPA 3TCFA 3SKPA 4OZ9A 3M8UA 3RGYA 1LBBA 3TODA 3RT6B 1JW4A 3KEIA 3RNNA 3EHUA 1FTMA 4F29A 1FTKA 1SDXA 1XVYA 3S2VA 4YMBA 4F1YA 2A5SA 3TTRA 1N7WA 4NF6B 2G93A 3SEVA 1MH3A 1MQHA 3IOTA 4WEDA 4IB2A 3OO9A 4G8MA 1IITA 3LSLA 3F11A 1VFDA 2Y84A 1UIUA 3VE1B 4ESWA 3H6TA 1IZ1A 3R6UA 3CR9A 5HBCA 3PU5A 3QSLA 1B1HA 1FW0A 2W7YA 3BFUA 4EXLA 3EQ1A 3LSWA 2GFEA 4R2FA 3S9MC 3SETA 3S9EA 4U4SA 4P0IA 3TTMA 3V89B 4GRKA 3K02A 3C4MA 5ITOA 1IUDA 5K2YA 1I69A 2QRYA 2DE3A 3VXBA 4X1DA 2F34A 1O63A 4MBPA 3V8XB 3TDJA 1SYIA 3SEXA 2Y7WA 1VE4A 5L9MA 4N6PA 3KN3A 2FYIA 5I57B 3PPRA 1CB6A 3CSGA 4PETA 3G3GA 5I58A 2ONRA 3VDFA 5I56B 5I84A 2FA7A 2Z23A 3IL1B 5ISUA 2OLBA 2XXHA 3WAEA 4OYVA 5AA1A 3JZJA 5I2NB 3DLNA 3B6WA 4Z7EA 1MY3A 1B3FA 5EHMA 5A5XA 4ZZEA 3TTKA 4KR5A 3VVEA 3IJXB 4U4XA 4FORA 5FHOA 3QYTA 4FAJA 2OWSA 2M8CA 2YLNA 4DIGA 1EZPA 3PPQA 4EQ9A 3ZKLA 4R9FA 3OELA 1QJMA 3G3KA 1A99A 4LQ2A 3SEYA 2V3UA 2QJEA 1PB9A 4GFRA 4ZEKA 4DDDA 3KGCA 2AYSA 3I5OA 3MZ1A 4C1TA 1MY2A 5CMBA 3TELA 3U8QA 4GL8A 3U1OA 5DVIA 3CG1A 3C32A 1NH7A 3PPOA 4F3PA 2VOZA 3Q28A 3JV9A 3KJTA 4NWCA 4GQOA 1AH5A 3QK6A 3LC8A 1FQDA 5DVJA 1EU8A 3TAJA 4QSCA 1IIWA 4F31B 2ZYOA 4ZEIA 3N26A 4U22A 3TFLA 1MH4A 1ZKBA 4ZDMA 5AE4A 5K2XA 3QIMA 1Y3PA 2XXUA 3O6GA 1SW2A 2OJTA 4RK2A 4JWXA 4OFLA 1MPBA 5FHMA 1B0LA 2AL4A 3O6IA 1Y1MA 3SERA 4R72A 1QUKA 1ELJA 4F39A 5JTYB 1A7LA 1OIBA 4ELPA 4QFPA 4UACA 4G68B 1M5DA 4QFOA 1URDA 4IO4A 1M5CA 2B65A 4R2BA 2XX8A 5F7VA 1XVXA 1Y20A 5H8NB 3Q25A 1ZLQA 4OWDA 3OEMA 4R6HA 3IORA 2PBWA 3BBRA 2ALUA 2DXYA 1BLFA 1QVSA 1MXVA 2DXRA 4X48A 2HZLA 3OSRA 1S9TA 4NWDA 1B3LA 3M3KA 2X7PA 4IO3A 1IXGA 1OLCA 2ZNUA 2DWJA 3IB1A 3H06B 5TP9B 4EF1A 5I2KA 2QMWA 4KCDA 4BLAA 1NNKA 3E3KA 1P1NA 2ZYKA 1LLSA 3PD9A 3T22A 3S9LC 1FQCA 4GD5A 4MFIA 2NUVA 3A3UA 3K6UA 1MPDA 1GGGA 2O1LA 2BJJX 3HCQA 3TKDA 3H6UA 3K1PA 3D4CA 4RK9A 3O66A 3PUVE 3P7IA 4M4GA 3BKIB 4GXSB 3OO7A 4N07A 3H03A 1O7TA 4WKMA 4QFNA 2UVJA 4I8CA 3FJGA 1GTKA 2XX7A 2P0SA 2REJA 4EQBA 4GIZA 4JSDA 4ND9A 3DELB 1UQWA 1SI1A 2GHBA 3FXUA 1Z7ME 1Y4CA 4F3GA 1H44A 3HO7A 2Y7PA 3RLFE 2V93A 1A40A 5KCJA 1MS7A 2Y7RA 4IGRA 2ZNTA 1B7UA 1RYOA 1NKXA 4AB6A 3FZVA 1QUJA 3GLBA 3TCGA 2F97A 1B40A 1B5JA 4QHQA 5L8DA 1YAEA 1A8FA 4KQPA 3FJMA 2DYXA 4IGTA 4NF5A 1L5TA 5I59B 2D3IA 3ODBA 2QS3A 4H8JA 3FD3A 3MJNA 2XXVA 4YKJA 1OMPA 5CM6A 5H8FA 1QW0A 2F7BA 2DE4A 2O51A 1UTBA 2V84A 1H3DA 3CG3A 5IAIA 3MP6A 3K4UA 1NNTA 1SW5A 3CIJA 4TQUQ 5L9OA 3LSFB 4IO5A 3IX1A 5TPAB 4XKRA 2D21A 1N7XA 4IO6A 4H1XA 3MC2A 3K2DA 3GBBA 4FIMA 2F6GA 5H8NA 5L9SA 1D9YA 1AL3A 3ILTB 1LCTA 1JW1A 1GR2A 3EHSA 1EZ9A 3FV1A 4NF4A 1FQAA 4MLVA 1H45A 5DEXA 2V3QA 1LFIA 4G8HA 2OWTA 3HV1A 4U1ZA 1MXUA 4LZ7A 3I3VA 2NOOA 1US4A 2NXOA 2H4IA 2UYFA 3KOSA 3MQ9A 3FJ7A 5HM4B 2HZKA 5ELVA 2Q88A 5AA2D 1O64A 3T9HB 1QKBA 3O97A 4GXAA 4L17A 1B51A 2I3VA 1MXWA 2DWIA 4HW8A 3UORA 3W15C 1AIVA 3UGWA 2QL3A 3UN6A 1M5FA 1Y9UA 3KN7A 2F7CA 4O3CA 1R6ZA 3W9VA 3HSTA 4KYEA 4XKPA 3K01A 1UIVA 3DP4A 4OESA 3T9XB 2H5YA 4POWA 1A54A 3T9UA 3IB0A 3A09A 3ILUB 5JK4A 1UTHA 4DE8A 1SW4A 3KZGA 2P1SA 3U94A 3R7XA 2NWJA 4LONB 1BKAA 4RA1A 4F22A 4OTEA 1MXZA 2REGA 3RUMA 3MVWA 4ISUA 4EXKA 1LFGA 4RNSA 1B52A 3OXNA 1PEBA 1XHYA 1JW5A 3UK4A 4GLIA 4POXA 2I6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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