4F3BA

Glutamate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/substrate
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA02
5HM4B 2VGQA 2OBGA 1QVSA 4OXVA 2H5YA 2ZYMA 3E3KA 1AL3A 3SEVA 5L8DA 4PFTA 1UTBA 3TCGA 4ZZEA 3T66A 1SI0A 3ZS6A 2DWHA 3RT6B 5HBCA 3IX1A 1I6BA 2F6GA 4OWDA 3OEMA 3OO9A 2O7IA 4H8JA 4BDQA 3THIA 3U93A 1US5A 2ALUA 4NF8B 2DE3A 3G7WA 1CE2A 4ZE9A 3MPKA 3MUQA 4OQOA 2ZYKA 2O69A 3FXRA 2XXHA 4YKKA 3T93B 2ZNSA 1MPCA 5FHOA 1NFTA 4UACA 1NNPA 3TQLA 2XX8A 3LC8A 1SQYA 3MZ1A 4BDRA 3TYHA 1ATGA 2X7PA 1A40A 3G3GA 4R75A 4HS7A 2ESNA 2QS4A 3EQ1A 3T96B 3ZKLA 3LUYA 3TMGA 2DXYA 2GH9A 4WXJA 4EXKA 3D4CA 2Z8EA 3KJ7A 2YJPA 4Z7EA 3K1PA 1IUDA 4ELPA 4OETA 1ZBMA 3IJOB 4OFJA 1QULA 1A7LA 3TELA 3PPNA 5BWJA 2OZZA 4FEBA 1SI1A 1OIBA 4LP2B 4F2QA 4JXIA 2M8CA 1FQAA 4JDFA 1MY0A 5L9SA 3K00A 3RNNA 2PX1A 2WKYA 5CMKA 3FV2A 4Q5TA 1P1UA 1XT8A 1HSJA 3FVNA 2XXQA 2V3UA 3M8UA 2OLBA 3RGYA 4U2RA 3RLFE 4ELRA 3UP9A 4E0XA 5CRYA 3CG3A 3IB0A 5B70A 3PU5A 3QYTA 5AA4B 4GXSB 3VFJA 5I59A 1L5TA 3ECRA 3C4MA 4TLMB 4IO7A 3UGWA 3A09A 3IR1A 2F5XA 3M3LA 1O7TA 4H5FA 2P2AA 3Q26A 1Y3PA 4ISUA 2UVJA 1LCFA 1XC1A 1B9JA 1MQGA 2I3WA 1N0TA 1ZKBA 3KFMA 4X1BA 1SYIA 5JEIA 4XIGQ 2ZXTA 2Q9TA 2O6AA 3QAXA 2X7QA 1Q1KA 2DOJA 3H3GA 3KOTA 5HPQA 4QFKA 4FECA 5AA2D 2QRYA 4NWCA 1LGBC 4QFPA 4ONYA 4EDPA 5I84A 3HSTA 3MZBA 1JNFA 2R9JA 1MY2A 1B7UA 3VXCA 3MVWA 5I2NA 3SEYA 1B40A 1DTGA 1HSLA 2DVCA 4JSDA 1US4A 4QSEA 4XKNA 2YLNA 4YB5A 4E0WA 3FATA 2ONRA 1M5DA 1B7ZA 4IGTA 4TOZA 1FTLA 2DYXA 2Q89A 3K6XA 4Q30B 3WAFA 2A5SA 2O1LA 1MRPA 4G68B 4GIZA 4C0RA 4R2FA 4DDDA 4F3GA 4RY1A 1PB8A 3C9HA 3PPPA 1H76A 4FORA 3PUXE 3MP6A 3CVGA 5CI5A 5I2KA 5DEXA 2ZNUA 1MQIA 1IIWA 2O84X 4ELQA 4I1DA 1LAGE 5TPAB 2F78A 3PPQA 4F3PA 2THIA 1P1NA 4MLVA 5CC2A 4G8MA 3H6UA 5AA2A 2XXYA 3N6UA 3KEIA 1PBQA 4H6DA 4FATA 4YKPA 1VSOA 5H8FA 3TUSA 4NF5B 3C32A 3ZKKA 1RYXA 4KD5A 4KPTA 1AOVA 4ESXA 2PVUA 2VD3A 4R6YA 3QXMA 2HFBA 5TP9B 3PMVA 4ZEDA 1TXFA 3KJTA 1H43A 4OERA 3ILUB 3C35A 4ZZAA 1MS7A 1B3LA 4L17A 3TFLA 3Q28A 1S9TA 3QIMA 3VVFA 2HAVA 5CMBA 4GLIA 4F39A 4H0WA 2PBWA 4GFRA 3H6VA 4G77A 3DP4A 1B05A 3FJMA 3IORA 3V5AA 3BKIB 3KN7A 1CB6A 1MDP1 2F35A 5F7VA 3T22A 2DSFA 1J1NA 1RYOA 5I58A 2E0SA 4R73A 3PPRA 5J1DA 2XXVA 5DYHA 2DVZA 3BFTA 1Y1MA 1LAFE 1FQCA 4ZS9A 4I9DA 4IGRA 3OENA 1JQFA 3OMBA 3FXUA 1AMFA 1MM7A 3OO7A 1N3XA 4DZ1A 3VE1B 3I3VA 3OSQA 3JZJA 2G93A 2HEUA 4ZEIA 4F3SA 3C34A 1VFDA 3T9HB 2DWIA 1YAEA 4YZZA 3RTFB 4U22A 3OEKA 5CM6A 1UTHA 1LB9A 4F19A 2F7AA 3MJNA 4G4PA 3DELB 1JEVA 2AIXA 1DSNA 4NMYA 1MXUA 5DVFA 3PUYE 2XXRA 5H8QA 4JSOA 2HZLA 3HV1A 3N26A 3U94A 4X1DA 5K2YA 2A5TA 4O3CA 1MH4A 2V84A 2OWSA 5KDTB 1T0KA 2QSXA 1OLCA 2RF1A 1BIYA 1OVTA 4F29A 1Y4TA 1OQHA 4EUOA 4FIMA 2QPQA 3FIRA 3CRBA 5F1QA 3T9VA 4XKQA 3ILTB 3PUZE 5AA3A 2RKMA 5DTBA 2HQ0A 5DVIA 4OFLA 5FTIA 2Y7KA 2XHDA 3M3FA 4F1YA 3FZVA 4U4SA 4NWDA 1BLFA 4BDOA 2DP8A 2CMOA 3TTNA 2V25A 1ZTYA 1SW2A 3HPIA 4KYEA 1XVYA 2YPNA 1URGA 4QSDA 1GV8A 2QJEA 2FNCA 4DIGA 4C1UA 3N94A 2O1MA 4LZ8A 5FTHA 3K2DA 1MPDA 2F8DA 4DXBA 1SW1A 2VP1A 4X9TA 1M5CA 1UTBB 4NF6A 4QRZA 3KN3A 4RXLA 3SEUA 1Z7NE 1D9VA 2UXAA 1FTKA 1PBPA 4HCWA 3G3HA 4DXCA 3IJXB 1LB8A 1PC3A 5BUUA 3VLVA 3U8QA 1GR2A 4EF2A 4MH5A 5I57A 3R6UA 2F6PA 3WAEA 4LZ7A 1TFAA 1A55A 1XHYA 4HCYA 2QS3A 4F1UA 1LAXA 3IOWA 3KGCA 2UVGA 1GGGA 2UVIA 3KN8A 4R74A 1TFDA 2W7YA 5KCJB 3EHSA 1O64A 3TZAA 3OELA 2XXIA 4GL0A 2GRVA 4PQJA 3AXFA 4KQPA 4YU0A 4N6PA 1H44A 1NMUA 1KWHA 1JEUA 5AA4A 3B6QA 5ITOA 2DWAA 4WEDA 1ANFA 2I0CA 5ICQA 3FJ7A 5CMCA 3CSBA 4IB2A 3HCQA 1B1XA 3TTLA 3KSXA 4MLQA 3K1MA 3MWBA 3O2AA 3IO4A 3T9UA 1N04A 3L6HA 3LSWA 3QUJA 5AE4A 3UIFA 4R6KA 1MXZA 2OK2A 1B0LA 3PV0E 1QUKA 5M2VA 4PFWA 2D5WA 4MBPA 3ZSFA 4AB5A 2NXOA 4YMBA 1DTZA 5B7DA 1FW0A 1MXWA 4RK2A 4QFNA 3QUFA 1NH8A 5I59B 1N84A 4Q8RA 3VVDA 4RPNA 2XD3A 4ZE8A 2QS2A 5DVJA 4GXAA 3H7MA 2NWJA 4NF4A 1S7YA 2XXWA 3FASA 5L9OA 2PT1A 2GHAA 3FGSA 2OJTA 4NE4A 2I4BA 1ZU0A 2HXWA 3K01A 4EXLA 1LBBA 2REGA 4UA8A 3V83A 4M4GA 4BDNA 1Q35A 4KFQA 1GVCA 3MBPA 4PE5B 2Y7WA 4XTCQ 3PUWE 3VLWA 4G8HA 2ZYNA 1S50A 3MVYA 1YPNA 4G68A 3S9LC 4O3AA 2B3BA 3CI8A 3SETA 4EQ7A 4FAJA 2ZMBA 3CFXA 2REJA 2DQVA 1MXYA 2OWTA 2BJJX 4LONB 3F11A 1I69A 1M5EA 3PMXA 1I6QA 4F1VA 4NTLA 3QK6A 4MF3A 2UYEA 3Q29A 1FQDA 3MC2A 3M3KA 4QSCA 2H99A 1Y20A 3E9XA 4NEDA 3IOUA 3C31A 3C33A 3S4UA 1MPBA 4OVJA 5JTYB 4NF5A 1BP5A 3K6WA 1A99A 4DCXA 3PD8A 3UORA 3DP8A 1SW5A 3OO8A 1P99A 3B6TA 1Y1ZA 3IB2A 2DE4A 1PEBA 1RKMA 3K1NA 4R9GA 3TTKA 5KZTA 3PPOA 3GLBA 5DEXB 1Z7ME 2FA7A 3TCFA 1NNKA 3R26A 1JVYA 4U1OA 3TPAA 1VR5A 3G3IA 1SW4A 1UIUA 4PFUA 4ZEFA 1M5BA 4YKJA 3USDA 1OLAA 1IZ1A 4AB6A 1JW5A 4XXUA 2Q8JA 3MZ9A 4YB6A 2B65A 3RN8A 1D3KA 4RYAA 4U21A 1N7XA 3OOAA 2I6EA 3N6TA 4YAHX 4GOTA 1XOCA 2XD2A 4KYDA 2ONSA 4LVQA 2Y84A 3MW0A 2RC7A 5I56A 4GQOA 4LZ5A 4QFLA 3UA8A 3Q27A 4I62A 1QUJA 1IXIA 3UK4A 1WVJA 4U1ZA 3CFLA 2V93A 1TT1A 2ONKE 3S9EA 3O6HA 2UVHA 2O7UA 1SBPA 3SESA 3K4UA 3IK6B 4OMBA 3GBAA 4GWOA 3U1OA 1R9LA 5A5XA 2HCAA 2RC9A 2VD2A 3PMWA 4HW8A 1B4HA 3MQ9A 3BBRA 3IOVA 5IAIA 2XXXA 2XX7A 2Y7RA 3U92A 4ZEKA 1MQHA 1ZJLA 2ZNTA 3TAJA 5I58B 1EH3A 2RC8A 1D4NA 5AA1A 4GD5A 3R7XA 3GZGA 1POTA 3KBRA 3K6VA 3FV1A 4TQUQ 2XX9A 3DM0A 1NKXA 3OSRA 2PT2A 1LCTA 5H8HB 4GVOA 4XKRA 2KLFA 1UQWA 4C1TA 4DLDA 1B46A 4ZEBA 1NNTA 3DLNA 2NUVA 3OD7A 4R72A 5FHNA 3SDFA 4KCCA 3SEWA 3IOTA 1B4ZA 1UTHB 2UYFA 3L6GA 5DT6A 1FTOA 4KCDA 1Y3NA 4ZECA 3O6IA 3FVOA 1ZMGA 1A8FA 1B52A 4M1VA 4BLAA 4JWOA 3LSFB 5H8QB 1B0HA 1SVXB 4QHQA 4GRKA 2NOOA 2F7BA 5EHSA 1LFGA 2A5TB 3FXQA 1JETA 1URDA 1JW4A 2I58A 4RJZA 4WEPA 2XXUA 4G8NA 1LFIA 2LAOA 5H8NB 4YICA 2GFEA 1QKBA 5LOMA 3KOSA 4IY5A 4NF8A 4QFOA 3H4ZA 4H67A 3LSLA 3KSJA 2DS9A 4EQBA 3HHFA 1DPPA 3MAMA 4H8IA 2HAUA 4R9FA 4RA1A 1UIVA 3FUZA 1WDNA 2PMSA 1B3EA 3TEPA 4ZDMA 3GXAA 3O9PA 1PB7A 4BDMA 1P1WA 2AYSA 2DE2A 3H06B 4RK9A 3O66A 4P0GA 1N3WA 1SYHA 1ZIUA 4R6HA 3IL1B 2AL5A 4ND9A 4RNSA 2XXTA 3MVZA 4LQ5A 4U23A 5H8SA 1B51A 3D4GA 2QS1A 3G3KA 5TU0A 2QMXA 4Z0IA 5KCJA 2Q88A 3CR9A 5ICTA 4KI0E 1QW0A 3B6WA 4KYSA 2H98A 3EHUA 4NF6B 4ESWA 2P0SA 1USYE 1MY1A 1IXGA 4LUBA 2H4IA 3VVEA 2H25A 4YB7A 4I8CA 1A8EA 4YKIA 4P11A 5I57B 2E1SA 3IB1A 1N76A 1ZLQA 1Y4CA 1B6HA 2I3VA 4OEVA 1FTJA 1ELJA 4XKPA 5CBSA 4OENA 3O97A 3Q25A 3SKPA 4H1XA 4IO4A 4KR5A 3O29A 1LLSA 3KZGA 2P1SA 4GF8A 3CG1A 2DXRA 4IY6A 2HZKA 3RY3A 3E4RA 1II5A 3RUMA 1YTVA 3EHTA 1EZOA 1O63A 1Y9UA 3TTMA 2B3FA 3TQWA 2Z23A 2DWJA 2G29A 3V89B 2Q2CA 2RCBA 1XVXA 3TTRA 1B5HA 1MM6A 4PP0A 5K2XA 1IITA 3S2VA 3B7DA 3CFZA 4OYVA 1XS5A 4P0IA 3W9VA 3C36A 1OMPA 4OEUA 3IO6A 4PFYA 1R9QA 2VHAA 2R71A 2O51A 3W15C 1OVBA 2QL3A 4POWA 2OCUA 3SEXA 4DXUA 1H3DA 1YCJA 3CIJA 3K02A 1P1OA 4H5GA 3MP1A 1P1QA 3O28A 3RT8A 3UN6A 4OZ9A 3I6VA 4N13A 5CBRA 1QJMA 3MPLA 3FVGA 3S9MC 3RTWB 1IQ7A 3N5LA 4F2OA 4QF9A 1H45A 1EZPA 5JK4A 3EF7A 4F22A 1B3GA 3MVXA 4DE8A 3EN3A 1MQJA 4NF4B 3FJGA 2I4CA 3A3UA 2H9BA 1B7HA 5I2NB 4F31B 2V3QA 4FE8A 4YMAA 2Y7IA 1R6ZA 2X26A 1URSA 1QKAA 1AH5A 5TPAA 2Z22A 1MH3A 5JTYA 1JVXA 3RPWA 2PYYA 3MP8A 5ELVA 3VV5A 3PUVE 4PETA 1BKAA 3HHGA 1AIVA 4JBZA 2RCAA 2V3TA 2ABHA 3DP6A 3K0VA 4G2ZA 4IO2A 4H65A 4TLLB 5TP9A 3S9NC 2AL4A 1B1HA 4WKMA 1MQDA 3LR1A 4EF1A 1NH7A 2R6GE 2D21A 2ZYOA 1POY1 5I2KB 5EHMA 2F7CA 4AQ4A 3FVKA 1FQBA 1EU8A 3HN0A 1LSTA 4KHZE 3U72A 3OXNA 2QMWA 4OFOA 3P7IA 1HSEA 4THIA 3PD9A 5AA2B 2F97A 4R2BA 1TWYA 4N07A 1MXVA 2I48A 1MG1A 1DOTA 4MFIA 1VFEA 1IXHA 5H8FB 1MY3A 4RPOA 2F34A 1QUIA 3VLUA 1USYH 1MXXA 5EYFA 4OTEA 1B32A 3BFUA 1B58A 1JW1A 3JYRA 2NVUB 4OHNA 5IKBA 3TKDA 1IEJA 2Z8FA 1LFHA 2CZLA 1Y3QA 5ITPA 4FEDA 4ECFA 2GHBA 1I6AA 3H6WA 4F18A 1B3HA 1M5FA 1F9BA 2XXPA 3TDJA 3I5OA 4O3BA 4JB7A 1FQEA 2Y7PA 4JWYA 3VXBA 3LBSA 1VE4A 2RINA 1FCKA 1SD3A 4X48A 2IEEA 1A54A 1OQGA 3T9XB 1MY4A 5I56B 4LATA 3ODBA 1B3FA 2IA4A 3H6TA 2O68A 5H8HA 2I0BA 3G3JA 4ELOA 4OESA 2D3IA 2ANJA 3IAZA 1PDAA 1BTJA 4GL8A 4IO3A 3EPEA 5KDTA 1MDQA 3G3FA 5A5XB 3K6UA 3TCHA 5ISUA 3LSXA 1WODA 1FQFA 3H03A 5CMMA 5L9MA 4HTGA 1GTKA 1N7WA 3CSGA 3W9WA 3RQTA 3QSLA 4JWXA 2Q2AA 3GBBA 3E13X 4IO6A 4U4XA 1B5JA 2FYIA 4EQ9A 1DMBA 2I49A 1LAHE 4IO5A 1IXCA 3V8XB 3SERA 4K3FA 1DPEA 1FTMA 1NNFA 4FJPA 2F36A 1EZ9A 1B2HA 4F3BA 5H8NA 3O6GA 4Q0CA 4G68C 4POXA 4LA9A 3JV9A 4BDLA 3ONMA 3TODA 3FD3A 1PB9A 2Z8DA 1D9YA 3OO6A 1B5IA 1LBCA 1NL5A 1R1NA 1SDXA 3HO7A 3VDFA 3KG2A 4LQ2A 3PGFA 3A3CA 4DCYA 2VOZA 5FHMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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