3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
3WAFA 4F3PA 2F8DA 4OERA 4PE5B 4DIGA 2ZXTA 3VXBA 1SQYA 3PD9A 4GQOA 2QRYA 1BIYA 3KEIA 3N5LA 4NEDA 2XXIA 1ATGA 3BBRA 1N7XA 3KZGA 2WKYA 1Y4TA 1B3EA 1B1XA 3KG2A 1OIBA 4RNSA 2VOZA 4O3CA 4HCWA 3FXRA 3RY3A 2Y7PA 3FVGA 3O6IA 2QSXA 3G3FA 4JSDA 4NF6B 1R9QA 1SD3A 2NOOA 4RA1A 3SETA 3KJTA 3B7DA 3UORA 1SW2A 4YB7A 1MPDA 2XXHA 3ILUB 5H8SA 4LATA 1MM7A 3RLFE 2F97A 5BUUA 1LAHE 1B3GA 3K6XA 1GGGA 4YKJA 2DWHA 5IKBA 1LCFA 1N84A 1VFEA 4ESXA 4EXKA 1Y3NA 3VFJA 3R7XA 1SDXA 5H8QA 4EUOA 3JYRA 4KYEA 3PUWE 3IO4A 3N94A 5I57A 1R1NA 3HPIA 2AL5A 4KCCA 2VP1A 1H45A 2AYSA 5ICTA 4YKPA 4H65A 3MZBA 4NMYA 4PFYA 2GRVA 1PB7A 1IXHA 1ZU0A 4DXUA 1MXUA 3K1MA 2UYEA 4QSEA 4OXVA 3BKIB 2FNCA 3LBSA 4F39A 5I2KA 2OWTA 4IO3A 4BDOA 4KYSA 1LSTA 4OFOA 1QJMA 3PPNA 4YKIA 4MF3A 1TWYA 1Y3QA 4R6KA 3PU5A 1XOCA 3FATA 2NWJA 3EHTA 1B32A 1UTBA 4DDDA 1QUIA 2VHAA 4ELQA 1B9JA 4YKKA 1MXVA 4RJZA 5DYHA 2UVHA 1H3DA 1LFIA 2P0SA 3MVYA 3GLBA 2IEEA 2NXOA 3R26A 1CB6A 5FTIA 3SEUA 3K2DA 5KZTA 3O97A 3S9EA 4Q30B 2THIA 5B7DA 5H8HB 1NNKA 4DXCA 3C33A 4U22A 3TAJA 1XC1A 4FORA 2XXRA 3T9UA 4OMBA 1LFGA 2O68A 3LC8A 4M4GA 5I56A 3H4ZA 2I48A 2Y7RA 1P1WA 4ZZEA 1RYOA 1AMFA 1M5DA 1FQFA 2XHDA 3DP8A 1IXIA 3PMXA 1MQHA 3K0VA 5HM4B 1YTVA 4U4XA 3ZKLA 1GVCA 3T96B 3VXCA 2F6GA 1MRPA 3IORA 4IO6A 3MP8A 3LR1A 3ODBA 1Y4CA 3UGWA 2F34A 5B70A 2D5WA 4RK2A 1JW4A 1A8EA 3ZKKA 3H7MA 5L9SA 1FTMA 3QK6A 3EF7A 3GBBA 3Q27A 4LA9A 2ZYMA 4YMBA 4RK9A 3VVDA 3G3IA 3LSXA 1XVXA 3FVOA 2F36A 4GXAA 4GOTA 1B7ZA 3TCGA 1A54A 4XTCQ 3DLNA 1MDP1 4G8NA 2QL3A 4F3SA 1B3HA 4G8HA 5K2XA 3CIJA 3U8QA 1MXYA 1P1NA 3SEYA 3TUSA 3T93B 2ALUA 4HS7A 1B05A 3V8XB 3KGCA 1WVJA 1NL5A 1UQWA 1LCTA 4BDQA 1LBBA 1LAFE 5AA4B 1Y20A 3VDFA 3U94A 4YAHX 3CRBA 1JEVA 2XX9A 3ECRA 4EQ7A 4LONB 2RC9A 3HCQA 3KOSA 1DPPA 2E1SA 3FXUA 3EN3A 2DE4A 2HFBA 4WEPA 1B6HA 3C9HA 4QSCA 1GR2A 4R72A 5AA3A 4UA8A 3K6UA 2FA7A 1A40A 4JB7A 3P7IA 3MP1A 3H6TA 3TKDA 1MQGA 3IR1A 4XKRA 3MVXA 3G3GA 1M5EA 3OOAA 1FQAA 5CMMA 4EDPA 1B5HA 1MQDA 2V3TA 3KN3A 3D4CA 2I6EA 3S9NC 4KCDA 4ZEFA 3O6GA 1F9BA 3FXQA 4QFKA 2QS4A 3KSXA 1P1OA 3MC2A 1RKMA 2UYFA 3CVGA 3I6VA 1FTOA 1LAXA 3N6TA 5L8DA 1OMPA 1NFTA 1ZLQA 1S9TA 5F1QA 1QW0A 5ITOA 1DSNA 4OYVA 1OVTA 3TODA 3PV0E 4X48A 2DQVA 3SKPA 5H8NB 2PT1A 4DCXA 5CBSA 1JVYA 3S9LC 4GXSB 4F31B 4WEDA 1S50A 5DTBA 2A5TB 3TQLA 4DZ1A 5KDTB 4EXLA 3K6VA 2OZZA 1NNTA 3MPKA 3W9VA 1R9LA 3KOTA 4POWA 5EHSA 1QUJA 3KBRA 2HAVA 4O3AA 1FCKA 1Q35A 3MZ9A 5I59B 5AA2A 3B6QA 2X7PA 2RC8A 4PFWA 4OEUA 1DTGA 1D4NA 1B7UA 4GFRA 4YB6A 1POTA 5K2YA 4UACA 1O63A 5JTYA 1EH3A 3UN6A 5FHOA 1TFAA 5BWJA 3BFTA 2P2AA 3PD8A 4LQ2A 4IO7A 4QF9A 4G8MA 3R6UA 4LVQA 4EQBA 3QAXA 1D9YA 5H8FB 2XX8A 2CZLA 4QFNA 1PDAA 2Y7WA 2OLBA 1JVXA 1NMUA 4H5GA 5HBCA 1TFDA 1XVYA 2F5XA 1IXCA 3Q29A 3TTKA 4F29A 3HSTA 4TOZA 4IGRA 1CE2A 3K1NA 4KYDA 4FATA 4DXBA 5FHMA 1SYHA 1WODA 4NF4A 2DVZA 3Q26A 3BFUA 3GXAA 1LLSA 2VD3A 2ZMBA 1JW5A 4XKPA 4IO5A 1Z7NE 3K1PA 1AL3A 1XT8A 3G3HA 4IB2A 3MVWA 4L17A 3S4UA 5DVFA 1UTHB 3CR9A 2QJEA 4K3FA 4X9TA 1B4ZA 2DVCA 5DEXB 3TTNA 3TTMA 3E3KA 5TP9B 5HPQA 3QIMA 1DMBA 2ONSA 1A7LA 1QUKA 3O66A 3TYHA 1IIWA 3FV2A 2REGA 3OELA 3O2AA 2R6GE 2XX7A 3CFLA 4QHQA 4GIZA 4PFTA 1ZMGA 2ZNUA 1YPNA 4IO2A 2R9JA 2ONRA 4ISUA 3M3LA 2UVGA 3FIRA 3L6HA 2HAUA 4RPOA 3DM0A 3W9WA 1SBPA 3H06B 1MG1A 1N76A 4XIGQ 3M3FA 4RY1A 3F11A 1S7YA 2HQ0A 4G68A 4ND9A 1MXWA 3SESA 2PX1A 4KQPA 4ECFA 3MPLA 3LSLA 1IXGA 4ZS9A 5TPAA 2F7AA 1SW4A 3FASA 2A5SA 1URGA 2R71A 1MY0A 3N6UA 1IUDA 2PYYA 1IITA 3S9MC 3I5OA 3IK6B 4LZ5A 5H8NA 1AOVA 1DPEA 2Q9TA 3DP6A 3EHUA 3FVKA 3ILTB 4NE4A 3ZS6A 4GL0A 1FQEA 3KJ7A 3THIA 1OLAA 3MZ1A 3FV1A 1NKXA 1JETA 1USYH 2O7UA 5KDTA 4YB5A 1NNPA 3EPEA 1XS5A 4BDRA 3L6GA 2ZYKA 4JSOA 1J1NA 4ZEIA 1Y9UA 2O51A 4ZE9A 4C1UA 3SEXA 3OEMA 3TZAA 4LZ7A 3E9XA 4OQOA 3MJNA 1B46A 1TT1A 1PC3A 3PMVA 2I0BA 4IY5A 3VLUA 1ANFA 3U93A 3ZSFA 3DP4A 4TLMB 1PB8A 5H8FA 4QRZA 1D3KA 1M5FA 1YAEA 3A3UA 3U72A 4KR5A 2XD2A 1MXXA 3KN8A 4LQ5A 3RUMA 2XD3A 3PGFA 1BTJA 1GTKA 3FZVA 1VE4A 4FJPA 2DSFA 2F7BA 2XXTA 1A99A 3AXFA 2Q88A 4EF2A 2OJTA 4HTGA 2OBGA 1UIVA 1Y3PA 3GBAA 2DXRA 2H5YA 3H6VA 4FEDA 4I1DA 4JWOA 1I69A 4YMAA 2O7IA 1BLFA 3OO6A 5FHNA 2QPQA 3A09A 4F22A 3T9VA 1LFHA 3LUYA 1BP5A 2NVUB 4ZECA 2AL4A 5H8QB 2Z22A 3S2VA 2HZKA 4OHNA 1TXFA 2ZNSA 4NF6A 2D3IA 1Y1ZA 5I57B 1DTZA 5CMBA 2QS1A 4F19A 1GV8A 4HCYA 4LZ8A 4XXUA 2V25A 5CMCA 3CG1A 1SW5A 4ZE8A 3RNNA 2ANJA 3TCFA 2B3BA 3SEWA 2VGQA 4GD5A 3IJOB 1N3WA 2GHBA 1EU8A 3PPPA 3C35A 4F18A 2QMWA 4E0XA 2DOJA 1Q1KA 5I2KB 1II5A 3IOWA 4F1VA 3C32A 2QMXA 5A5XB 3M8UA 3VE1B 4G2ZA 1B0LA 5M2VA 4M1VA 2I3VA 1MQJA 5TU0A 3G3JA 4FEBA 4AQ4A 4IY6A 1QULA 2PBWA 3PUVE 1N7WA 2BJJX 4U4SA 5JK4A 3RPWA 5CMKA 4GF8A 3UK4A 2DYXA 4QFLA 2QS3A 1UTBB 4IO4A 4P0IA 3PUYE 2Z8EA 1MPBA 3PMWA 4FECA 4KD5A 4GVOA 1FQBA 1EZ9A 4ZEDA 5ISUA 4U1ZA 1P1UA 2VD2A 2X7QA 1JW1A 4ELOA 2FYIA 2RKMA 3B6TA 4R9FA 2I3WA 5ITPA 1IEJA 2Z23A 4NWCA 3A3CA 1HSEA 4POXA 4F3GA 3QUJA 2V3UA 4JXIA 3IAZA 3UP9A 4MLQA 1P1QA 1LB9A 1EZPA 3HHFA 1LAGE 3U92A 1US5A 4GWOA 1L5TA 1M5CA 1D9VA 1VFDA 1JEUA 3ONMA 3KN7A 4C1TA 4OESA 3SEVA 1FW0A 3T9HB 2XXVA 2DWAA 2O69A 3TPAA 1ZTYA 3T9XB 4BDLA 3C36A 5ELVA 3OSQA 1USYE 2ZNTA 4N6PA 1HSLA 4IGTA 4R75A 4FIMA 1T0KA 4NF8B 4R6HA 1LBCA 2Q89A 4ZEKA 5H8HA 2ZYNA 4R9GA 1SI0A 1PBQA 1EZOA 1OVBA 4U23A 1IQ7A 1H76A 3MWBA 2NUVA 5IAIA 1BKAA 1B40A 2HCAA 4C0RA 2W7YA 4X1BA 3U1OA 2CMOA 2GH9A 2ONKE 5LOMA 4DCYA 3W15C 1B52A 4YZZA 3OXNA 2HEUA 4DE8A 1VSOA 2PT2A 3IB2A 4I9DA 4NTLA 5KCJB 2RC7A 3PPQA 4G4PA 5CC2A 1MM6A 5JEIA 4G68C 2GHAA 1NH7A 4H8JA 3RTFB 2RF1A 5I58B 1Z7ME 4MLVA 4F1UA 4F2OA 2RCAA 2G93A 2KLFA 1OQGA 3VLVA 4H0WA 3QXMA 2O1LA 4Q0CA 1SW1A 3FD3A 3IOUA 4GRKA 4OEVA 2OCUA 4H1XA 1I6BA 3QUFA 4H67A 2XXWA 1ELJA 1YCJA 1PBPA 4EQ9A 3MAMA 3IX1A 2G29A 3H3GA 2F35A 2H98A 4I62A 4OTEA 3SERA 3OMBA 1R6ZA 4KPTA 4F2QA 2B65A 1VR5A 3TCHA 4TQUQ 5AA4A 1MPCA 1OLCA 4BLAA 3CSBA 4MFIA 4OWDA 3Q28A 3RT8A 4MH5A 3OEKA 4R73A 4ESWA 3RGYA 2DS9A 1PB9A 2HZLA 3VVFA 3QYTA 2V3QA 2B3FA 2I49A 4ZEBA 3C34A 2Z8DA 2DE2A 4TLLB 4MBPA 2YPNA 2V84A 2I4BA 4BDNA 5I2NB 2XXYA 3IL1B 2YJPA 3VV5A 3MW0A 2XXQA 3TFLA 1FTLA 4QSDA 4E0WA 1LB8A 4NF5B 1ZBMA 2PMSA 2I58A 1MS7A 1B3FA 1POY1 2XXUA 5CRYA 3TMGA 4R2BA 1US4A 3E4RA 3O6HA 4Q5TA 2H25A 1NH8A 3FVNA 1I6AA 1MY3A 3IB1A 1MY1A 5A5XA 3UIFA 3RTWB 3FJGA 4QFPA 4PP0A 5CI5A 2Q2CA 4HW8A 3TQWA 3KSJA 3USDA 1MH3A 3TDJA 4FE8A 3O28A 4KFQA 1B7HA 2E0SA 2IA4A 3OO8A 4Z0IA 4THIA 2GFEA 1RYXA 1QKAA 3TTRA 3FJMA 3TTLA 2M8CA 2RCBA 1B3LA 2ABHA 5DVIA 3O9PA 3DELB 2Q8JA 2DWJA 2UXAA 3IO6A 3N26A 3FJ7A 4H5FA 4WKMA 1QKBA 5AA2B 3B6WA 3PUXE 4R2FA 3LSWA 4P0GA 2RINA 4OENA 4AB5A 4I8CA 2Y7KA 1MY4A 2A5TA 2ZYOA 3CG3A 5JTYB 4WXJA 1B5IA 4ZDMA 4EF1A 1XHYA 3CSGA 1MQIA 3K00A 2QS2A 2Z8FA 1B51A 2O6AA 4G77A 4OETA 1JNFA 4PQJA 5I59A 2YLNA 2DXYA 1PEBA 3OSRA 2REJA 4NF8A 4RYAA 4F3BA 5DT6A 4FAJA 4YU0A 2OK2A 1URDA 1MH4A 2DE3A 2F7CA 3HN0A 5AA2D 4PFUA 4GLIA 2Y7IA 1H44A 1FQCA 1QVSA 2H9BA 1SVXB 2DP8A 5J1DA 3G7WA 2PVUA 4NWDA 4DLDA 4NF4B 4P11A 3HHGA 3V5AA 1O64A 3JZJA 5L9OA 5F7VA 4U2RA 4XKQA 3PPRA 3M3KA 1OQHA 1IZ1A 1FTKA 3IB0A 2P1SA 5AA1A 3GZGA 2Q2AA 4R6YA 4U21A 5KCJA 4R74A 1SYIA 2LAOA 5FTHA 5I58A 3MP6A 1B4HA 3EHSA 4RPNA 1KWHA 1AH5A 4LP2B 2H99A 4JBZA 4ONYA 3FGSA 1MXZA 3D4GA 2XXPA 2V93A 1B58A 3MBPA 3O29A 3K6WA 3EQ1A 3VVEA 4X1DA 4PETA 1MY2A 2D21A 1ZIUA 1NNFA 3RN8A 1FTJA 1UTHA 3IJXB 3K02A 2Y84A 1FQDA 2OWSA 1A8FA 4LUBA 1JQFA 2UVJA 3RQTA 5AE4A 3OO9A 4RXLA 1ZKBA 1O7TA 3PUZE 4N07A 3HV1A 5DEXA 1SI1A 2I4CA 2O1MA 5CM6A 5TP9A 4ELRA 3IOVA 4KI0E 4ZZAA 1I6QA 4OFJA 3K01A 3V89B 3H6UA 4OZ9A 2F6PA 3QSLA 4OVJA 1DOTA 2F78A 4XKNA 4H6DA 2I0CA 3OO7A 3T66A 2XXXA 1Y1MA 3C4MA 1N0TA 4G68B 5I2NA 5EYFA 4AB6A 4GL8A 1HSJA 3CFZA 5L9MA 3G3KA 4YICA 1A55A 5ICQA 4NF5A 5TPAB 2X26A 3T22A 3FUZA 1LGBC 3V83A 3LSFB 4JWXA 2O84X 5EHMA 3TEPA 5DVJA 3E13X 3H6WA 3IOTA 1ZJLA 3CI8A 1B5JA 3MUQA 1MDQA 3C31A 3UA8A 4H8IA 4KHZE 3PPOA 1WDNA 5I56B 3H03A 4Z7EA 4O3BA 1M5BA 3JV9A 1URSA 3OENA 3MVZA 3CFXA 3OD7A 4QFOA 4F1YA 4ELPA 4OFLA 4U1OA 3MQ9A 3K4UA 1N3XA 2HXWA 4JDFA 4N13A 3KFMA 1B2HA 3TELA 2UVIA 2DWIA 3RT6B 2ESNA 1N04A 1UIUA 1B0HA 3SDFA 1AIVA 5I84A 1P99A 3HO7A 1H43A 3I3VA 4BDMA 3VLWA 3WAEA 2AIXA 2H4IA 3Q25A 4JWYA 4Q8RA 5CBRA 1B1HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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