3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
2Q2AA 3VLUA 3FVGA 4ND9A 4I1DA 3Q26A 3TELA 1MPDA 4QSEA 5EHMA 4THIA 4E0WA 2KLFA 1B5HA 2RC9A 1DTZA 4F3PA 4LZ5A 1FQEA 3MP6A 3RTWB 1N3WA 3G3GA 1B46A 3BFUA 1P1NA 4R6HA 4JSOA 4XTCQ 1N04A 1MQIA 3K02A 1CE2A 2ANJA 4IO7A 2DP8A 3TYHA 3MPKA 3MP8A 2YPNA 4ZEFA 1QUIA 4OFLA 4FECA 4KHZE 4OTEA 3C35A 1MXZA 2H25A 1JW5A 3UA8A 3V8XB 3G3FA 3OEKA 2GH9A 4JXIA 3V83A 1ZTYA 2XD3A 4F3GA 2DSFA 2XXHA 3G3KA 3B6WA 1M5FA 4DLDA 1B51A 1PBPA 1MXYA 1B3GA 3PGFA 2P2AA 1GGGA 4OESA 3I5OA 2DQVA 2O84X 3K6XA 2F6PA 5L9OA 1VSOA 4F31B 4R75A 4HTGA 1OVTA 1POY1 4QFNA 3PV0E 2Y7PA 4NWDA 1SVXB 3O28A 3R6UA 2ESNA 4F18A 3IOVA 1S50A 1JETA 4KD5A 3RUMA 1B3FA 4C0RA 4G2ZA 3IB0A 5AA4A 4U22A 3VE1B 4AB5A 1A55A 3E9XA 1UTBA 2Q9TA 4X1DA 2PT2A 2QS3A 3SKPA 3LBSA 4RPOA 3U72A 1P1OA 2XXYA 4H8IA 3MVZA 1TFDA 4R9FA 3LR1A 2YJPA 1BKAA 3TTMA 2UXAA 3MAMA 5AA2A 4DCYA 1JEUA 2PYYA 4RA1A 3DLNA 4OWDA 1ZBMA 3H3GA 3GZGA 1BIYA 3IORA 3L6HA 1QUKA 4OERA 2OCUA 2DWAA 3C33A 3QUJA 3R7XA 2O7IA 1SYIA 3BKIB 2Z8EA 4GFRA 2UVHA 3EPEA 1FTOA 1UTBB 3MZ9A 4YAHX 4O3AA 2XX7A 2Y7RA 1B7HA 2DXRA 4WXJA 1A8EA 4OMBA 5I58A 1H76A 1OLCA 2VP1A 4ZE8A 2F34A 2NVUB 3C36A 1D9VA 4DXUA 1JW1A 1I6QA 4C1TA 1MXXA 3JYRA 1B7ZA 1P1UA 4F22A 3E3KA 1OQHA 5AA2B 3TQWA 2OBGA 3V5AA 3H4ZA 4ZEBA 1EZOA 2HAVA 2GFEA 1FTMA 4POWA 4Q0CA 3V89B 1AH5A 5JTYA 5LOMA 4GL8A 3RTFB 3FV1A 3OSRA 4IGRA 1Y20A 3LSXA 3D4CA 1H44A 3K1PA 3P7IA 2O1LA 3E13X 2VGQA 3RQTA 1QULA 5I58B 1S9TA 3U1OA 3KJTA 3M3KA 2UVGA 3HHFA 3EHSA 4DXCA 2P0SA 3O9PA 4KPTA 5DEXA 4IO6A 4DE8A 3OENA 4FORA 1QW0A 1VR5A 3E4RA 3HN0A 3AXFA 1QJMA 4OFJA 1T0KA 3C4MA 3C34A 5CMBA 4IO5A 3K1MA 3T9VA 3KN3A 2QS4A 5H8FA 1R6ZA 2REGA 5KCJA 4LA9A 1IIWA 3IB2A 1SD3A 2DVZA 5JTYB 2DE2A 2I3VA 1CB6A 2PBWA 1IXHA 2F78A 3KG2A 5L9MA 1JVXA 2HCAA 3GLBA 3O97A 2RKMA 1WODA 3N6TA 3PPOA 1MY0A 5CC2A 5KZTA 3C32A 3HPIA 2DS9A 2NUVA 4Q8RA 1YAEA 1MDP1 5DEXB 5I57B 3ZS6A 4NTLA 3QAXA 2Z8FA 3KOTA 4ONYA 4GLIA 3O29A 1JEVA 3K00A 1MH4A 3SEYA 3KN8A 5H8FB 4ZEDA 2GHAA 1DPEA 3KGCA 5KCJB 1NKXA 4GOTA 5ITPA 2ONSA 3IOTA 2QS2A 2NXOA 3IL1B 2UVJA 1LCFA 3MP1A 4R2FA 1QUJA 1SW2A 2RC8A 5ELVA 3TMGA 3TTKA 4JB7A 3OXNA 2WKYA 4R74A 5ICQA 4GRKA 2XHDA 3RN8A 2XX9A 3O6IA 2PVUA 2UYFA 3PD8A 4EF1A 1B3EA 1PB7A 1B7UA 4H65A 3CIJA 5EYFA 4WEDA 3B7DA 4QSCA 5CMCA 3FIRA 2B3BA 4G8MA 3W9WA 5CBRA 4H5GA 4O3BA 3MVXA 3FVOA 4PQJA 1Y3NA 1MQJA 1H3DA 4N6PA 2OJTA 3HCQA 2OWTA 2RINA 4IY6A 3TQLA 3TCGA 3U93A 1PB9A 1MG1A 1I6AA 5FHOA 1MY4A 1B40A 3G3JA 3CVGA 4GVOA 1A8FA 1B3HA 2B65A 3H6TA 1B52A 5F1QA 4QRZA 3SEVA 3CG3A 1LGBC 4HW8A 4F1YA 4H8JA 1NNPA 1Z7ME 3MUQA 3VVFA 1SW5A 4EQ7A 3S9LC 2B3FA 1MM7A 1N7WA 1IITA 2XXUA 2HZLA 3GBBA 1QKBA 3K01A 2HFBA 4U23A 3ILUB 4U4SA 4GWOA 3ZKLA 1NH7A 4LONB 4LUBA 3H7MA 3LSLA 4F3SA 3B6QA 3EN3A 5HPQA 2FNCA 2XXIA 1B4ZA 2P1SA 3FXQA 1B5JA 1LFGA 4E0XA 3LUYA 3OSQA 3Q29A 5ITOA 2DE4A 4TOZA 4EUOA 1EZ9A 2Q89A 3CSBA 2H99A 4F19A 3SEUA 2G93A 5F7VA 2E1SA 1R1NA 3KBRA 4RYAA 3CSGA 4OETA 4FAJA 2AL4A 1IXCA 3RY3A 4PFYA 3U8QA 5FTIA 3PUYE 2Y84A 1PB8A 1R9LA 1M5DA 4OQOA 3OD7A 3FASA 2AIXA 3KOSA 4X9TA 4G68A 4WEPA 1DMBA 3QK6A 2QPQA 1B6HA 5J1DA 2ONRA 3W9VA 1B3LA 2XXPA 4U1OA 1OLAA 5FHMA 3MQ9A 5I56A 4Q30B 1VFDA 1MDQA 4MBPA 2V3TA 2Z8DA 2ZYNA 2REJA 1I6BA 4PFTA 3G3HA 3I6VA 2O6AA 3UORA 1DOTA 5BUUA 2OWSA 1RYOA 4O3CA 2VD3A 3TODA 4LQ2A 2QMXA 4DDDA 2O51A 4F39A 2ZYKA 2OK2A 4ZEKA 1N76A 3RLFE 3DM0A 4KR5A 1Y3PA 1TFAA 1B4HA 4AB6A 3MBPA 3S4UA 2ZYMA 4F1VA 2XX8A 4FIMA 4FJPA 4G68B 5L8DA 3BFTA 4I62A 4RK2A 2GRVA 1OQGA 4QF9A 3FZVA 4GXSB 4XXUA 4QSDA 4YKKA 2XXXA 5I56B 3QXMA 4ZS9A 3UK4A 3Q27A 1P1QA 2I58A 1DSNA 1ZKBA 3IX1A 2E0SA 5TU0A 3B6TA 4QFKA 5DT6A 1UQWA 1IXIA 1ZLQA 3M8UA 3PPPA 4Q5TA 3M3LA 4U4XA 2V93A 2QL3A 1NFTA 3EQ1A 2CMOA 5CM6A 3UN6A 1KWHA 3USDA 1ELJA 2AL5A 5CMKA 1FQFA 4LQ5A 3MVYA 5TPAA 1UTHA 3CFZA 4RY1A 1M5BA 4C1UA 1ATGA 4PP0A 2O69A 1Y4TA 3H06B 4ZDMA 4H0WA 2RCAA 3RNNA 4M4GA 4G68C 4MLQA 1XT8A 1J1NA 2THIA 3MW0A 3MZBA 4N07A 4G8HA 3KN7A 3Q25A 5I84A 1JVYA 3T93B 4JWYA 3FUZA 3C9HA 2V3QA 3OO9A 2F7CA 4QFPA 1AL3A 4NF5A 3N6UA 2UYEA 5B7DA 2F6GA 4YB7A 3K1NA 5H8SA 1Q1KA 1B1XA 3C31A 2HQ0A 3TFLA 1Q35A 3L6GA 2PX1A 5TPAB 1UTHB 2F35A 3ONMA 3RT6B 2F7AA 2BJJX 2H5YA 2QJEA 3O6GA 3PMXA 1H45A 3ECRA 3VV5A 4JWXA 4I8CA 1JNFA 3KJ7A 5I59A 3ODBA 1M5CA 4G8NA 3DELB 2Z23A 2VOZA 3CFXA 3A3UA 1NH8A 3CG1A 3PD9A 4QFOA 4TQUQ 5I57A 2I6EA 3T96B 2RF1A 4JDFA 2I49A 3OO6A 2RCBA 2XXWA 4IO4A 1PC3A 5B70A 1A7LA 4NF5B 3VLVA 3RT8A 2ABHA 5K2YA 3PPNA 1PEBA 3EHTA 4RJZA 2NOOA 4KI0E 4X1BA 4YZZA 3RPWA 4H67A 3T22A 5H8HB 5I2KA 5I59B 4IY5A 4OHNA 3S9EA 1O63A 4GIZA 2IA4A 3LSWA 1BLFA 4BDLA 1SI0A 2ZNTA 1SI1A 1XVYA 4EQ9A 1POTA 3IAZA 4HCWA 4YB6A 3HHGA 2XXTA 4KYSA 2X7PA 1LB8A 4NE4A 1F9BA 4GD5A 4EDPA 4EXLA 3KSXA 4X48A 4ECFA 1FQDA 1FQBA 4KQPA 2DOJA 4F2OA 3N26A 3T9HB 1USYH 4YICA 4OEVA 2H98A 4RNSA 5H8QA 4ELQA 3O6HA 4JWOA 1B0HA 3JV9A 5I2KB 1SQYA 1N84A 2I4BA 3IJOB 5M2VA 1TXFA 4MH5A 4H5FA 3HSTA 1DTGA 2OLBA 3IR1A 3MVWA 4ESWA 5DYHA 2M8CA 3IO4A 2QS1A 5DVJA 4NMYA 3BBRA 2Q2CA 3LC8A 2ONKE 3UIFA 2W7YA 3OO8A 1GVCA 4P11A 5BWJA 2QRYA 2ZNUA 3TDJA 1OIBA 4DZ1A 3VDFA 5CMMA 3T9UA 5H8QB 2IEEA 4RK9A 1FCKA 4JBZA 1MRPA 3CI8A 2D3IA 2D5WA 2FA7A 4DIGA 1AMFA 1MPCA 1Y4CA 1LLSA 4WKMA 5FHNA 4U2RA 1XVXA 4FE8A 4TLLB 2PT1A 4AQ4A 3PPRA 4RPNA 1TT1A 1LSTA 4ELPA 4ZEIA 2A5TA 1BP5A 5AA3A 4OVJA 3VVEA 2V84A 1LFIA 4NF6B 3N5LA 2I48A 4PFUA 4YKIA 3PMWA 4NWCA 1US4A 4GQOA 3M3FA 3HV1A 1IXGA 1MY3A 2DYXA 2DWJA 1II5A 4BDQA 4TLMB 1OMPA 2ZYOA 2Y7IA 4OYVA 5ICTA 3GXAA 3KFMA 1SDXA 2ZXTA 3FXRA 1MS7A 3CR9A 1MPBA 3FJGA 4R9GA 1HSLA 3SEWA 4NF8A 1US5A 4QHQA 4ELRA 1SW1A 5L9SA 2A5TB 3EF7A 3KZGA 1ZIUA 3LSFB 3W15C 4BDRA 1MY1A 3MWBA 4ISUA 5DVIA 2RC7A 5H8NA 4OXVA 5K2XA 4YU0A 5KDTA 2HEUA 3TUSA 1Z7NE 4ZZEA 2X7QA 3TTRA 2DVCA 1L5TA 5JK4A 1QVSA 1Y1ZA 3F11A 1BTJA 2Q8JA 4ZE9A 3IOWA 3QYTA 3PUWE 1YPNA 2XXQA 1VFEA 4F1UA 1FTKA 1MY2A 5CRYA 4ELOA 4NF8B 4XKRA 3IJXB 5HM4B 4H6DA 3OMBA 3CFLA 4FATA 3TTNA 2VD2A 5H8NB 4XKNA 2YLNA 2R9JA 3PPQA 1VE4A 5KDTB 1D3KA 3K4UA 3H6VA 4HCYA 4JSDA 3S9MC 3MJNA 1B1HA 1LFHA 4M1VA 4K3FA 2DXYA 5AA2D 2X26A 1Y3QA 4OZ9A 4FEDA 3PUXE 3H6UA 4NF4A 4BDNA 1IQ7A 2Z22A 2V25A 3G3IA 1IEJA 4YKJA 1USYE 1LAXA 3FJMA 4KYEA 2R6GE 3TCFA 3EHUA 2G29A 2O7UA 2F5XA 2OZZA 3THIA 4YKPA 5EHSA 1JW4A 3SERA 4IB2A 3TZAA 1EU8A 1URDA 4MLVA 1N0TA 1HSEA 3WAEA 1GV8A 4IGTA 4R2BA 4G77A 4P0GA 2DWHA 3FV2A 3ILTB 1SW4A 2F8DA 3Q28A 4BLAA 1XC1A 4EF2A 4PETA 2H9BA 4I9DA 3IO6A 1ZMGA 3A09A 1LBBA 1B32A 4IO2A 4DXBA 5AA4B 1D4NA 4XKQA 4KYDA 4YMBA 1NMUA 3IK6B 4NF4B 1QKAA 1FW0A 5IAIA 5I2NA 1IZ1A 3VLWA 3CRBA 3OEMA 4MFIA 3VXBA 4U21A 3TKDA 4H1XA 1XHYA 5AA1A 2DE3A 4GXAA 1WDNA 3SDFA 3H03A 1M5EA 4GF8A 1B9JA 1I69A 3IB1A 1LB9A 4LP2B 1NL5A 1A54A 3SETA 3K6WA 3OELA 1MXVA 5DTBA 3MC2A 4Z7EA 4G4PA 5H8HA 3PUZE 5HBCA 1S7YA 3I3VA 1FTJA 4UA8A 1MQGA 2I0CA 2CZLA 4LVQA 3K6UA 4DCXA 2D21A 4U1ZA 3FVKA 3ZSFA 1ZJLA 3U94A 4ZECA 3S9NC 1MXUA 3T9XB 2QSXA 4BDMA 1N7XA 5I2NB 2AYSA 1DPPA 4UACA 2QMWA 4F2QA 1P1WA 4R73A 1XS5A 4R6KA 2VHAA 1P99A 1A40A 2R71A 4NEDA 2F36A 4YB5A 4PE5B 3JZJA 3H6WA 2NWJA 1WVJA 5A5XA 4XKPA 3FVNA 4OFOA 3K2DA 4N13A 1D9YA 1URSA 3MPLA 4YMAA 3TEPA 1Y9UA 2O1MA 3K6VA 1FQAA 1B58A 5CBSA 1SBPA 2PMSA 1EH3A 2XXVA 2HAUA 1NNFA 3GBAA 1LBCA 1ZU0A 4KFQA 4QFLA 2ZMBA 2Y7WA 4F29A 2ALUA 3FATA 1LAHE 4LZ7A 5IKBA 3T66A 4RXLA 3R26A 1H43A 2O68A 4GL0A 3G7WA 4XIGQ 1MXWA 1O64A 1UIVA 3N94A 4HS7A 4EXKA 3O2AA 4OENA 4R6YA 3FXUA 2HXWA 4EQBA 1AIVA 2XD2A 5A5XB 3FD3A 2Y7KA 3FGSA 1MQHA 3DP4A 4LATA 1A99A 3UP9A 1AOVA 3QIMA 1N3XA 4Z0IA 1OVBA 2I4CA 4F3BA 5JEIA 2H4IA 3TPAA 3TTLA 3RGYA 1YCJA 5AE4A 1FQCA 2Q88A 3TCHA 1JQFA 3TAJA 4OEUA 3O66A 3VVDA 1EZPA 1NNKA 2F7BA 2I0BA 4PFWA 4KCCA 5TP9A 4NF6A 3VFJA 1R9QA 1GTKA 4ZZAA 3A3CA 4BDOA 4FEBA 3DP8A 2GHBA 3MZ1A 1MM6A 1RYXA 1HSJA 3D4GA 4IO3A 4KCDA 1B5IA 4R72A 4MF3A 1B0LA 2F97A 3U92A 1MH3A 3WAFA 1URGA 3KSJA 1SYHA 2XXRA 4LZ8A 5ISUA 1PDAA 3UGWA 2HZKA 2LAOA 1LAFE 3PMVA 3OOAA 1RKMA 3OO7A 4POXA 2ZNSA 2UVIA 2DWIA 3HO7A 1FTLA 2FYIA 1MQDA 3KEIA 4ESXA 3DP6A 1TWYA 1O7TA 3SESA 4P0IA 3ZKKA 5FTHA 1UIUA 3VXCA 1IUDA 3PUVE 1B05A 3SEXA 1XOCA 3IOUA 1ANFA 3S2VA 1LAGE 1YTVA 3K0VA 3QSLA 5TP9B 3QUFA 3PU5A 2A5SA 1LCTA 1Y1MA 1NNTA 2I3WA 3FJ7A 4L17A 2V3UA 1PBQA 1GR2A 5CI5A 1B2HA 5DVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q2AA 3VLUA 3FVGA 4ND9A 4I1DA 3Q26A 3TELA 4I3YA 1MPDA 4QSEA 5EHMA 4PAKA 1LBXA 4THIA 4E0WA 2KLFA 1B5HA 5I5PA 2RC9A 1DTZA 4F3PA 3T0JA 4LZ5A 1FQEA 3MP6A 3RTWB 2CEXA 1N3WA 2HPGA 3G3GA 1B46A 3BFUA 1P1NA 4R6HA 4JSOA 4XTCQ 1N04A 5I7IA 1MQIA 3K02A 1CE2A 4PGNA 2ANJA 4IO7A 2DP8A 3TYHA 3MPKA 3MP8A 2YPNA 4ZEFA 1QUIA 4OFLA 4FECA 4KHZE 4OTEA 3C35A 1MXZA 4MIJA 2H25A 3GYYA 1JW5A 3UA8A 3V8XB 2CEYA 3G3FA 3OEKA 2GH9A 4JXIA 3V83A 1ZTYA 1Q9DA 4GWSA 3KC1A 1NV3A 2XD3A 4F3GA 2DSFA 2XXHA 3G3KA 3B6WA 1M5FA 1G0HA 4DLDA 1B51A 1PBPA 1MXYA 2QVUA 1B3GA 5EQAA 3PGFA 2P2AA 1GGGA 4OESA 2XWIA 3I5OA 2DQVA 2O84X 3K6XA 2F6PA 5L9OA 1VSOA 4F31B 4R75A 4HTGA 2R8TA 1OVTA 1POY1 4QFNA 3PV0E 2Y7PA 4NWDA 1SVXB 3O28A 3ISPA 3R6UA 4O94A 2ESNA 4F18A 3IOVA 2XXKA 1FBHA 1S50A 1JETA 4KD5A 3RUMA 4JVIA 1B3FA 4C0RA 4G2ZA 3IB0A 4GWUA 3A29A 5AA4A 4U22A 3VE1B 4AB5A 1A55A 3E9XA 1UTBA 2Q9TA 4X1DA 2PT2A 2QS3A 3BIHA 3SKPA 3LBSA 4RPOA 3U72A 1P1OA 2XXYA 4H8IA 3MVZA 1TFDA 4R9FA 3LR1A 2YJPA 2QVVA 1BKAA 4O7IA 3TTMA 2UXAA 3MAMA 5AA2A 4DCYA 1JEUA 2PYYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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