3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
4H8IA 5AA4A 3C34A 3QAXA 4QSEA 4DE8A 4XKRA 1LAGE 3MPKA 1A40A 2G29A 3M3LA 5KCJA 4U2RA 3EHTA 3MP8A 1MM7A 1M5DA 1MXZA 2AYSA 3HSTA 1ATGA 3C33A 4HTGA 1JETA 5AE4A 4BDMA 1ELJA 1JW1A 4KYDA 5DEXA 3O6GA 1FTMA 1R6ZA 3LSWA 4GWOA 4XKPA 5I57A 1FCKA 5I56B 4O3CA 2Y84A 4F3SA 3VLVA 1FQAA 3KZGA 3ZSFA 3TTNA 2UYFA 2GFEA 3TQWA 2P1SA 3P7IA 3HPIA 1P1WA 1MQIA 1MPCA 5I2NA 3K02A 1LB9A 3RGYA 3M3KA 2ZNTA 3PMXA 4RJZA 3U72A 3MP6A 5B7DA 1LAHE 4KD5A 3PMWA 3HN0A 1B5JA 3H3GA 2R9JA 2I4BA 1H43A 3GZGA 5CBRA 3VLWA 1NFTA 3W9VA 4JBZA 5CM6A 3IX1A 5JEIA 3IK6B 1I6AA 4IO2A 1Y4TA 3PUYE 2OCUA 3VXBA 1AOVA 3MAMA 3TCFA 2HAVA 3DP6A 2PT2A 1II5A 2LAOA 3CRBA 3FVKA 3BFUA 5H8SA 1H45A 2NWJA 3TFLA 1VFDA 1DSNA 2XXVA 2QMWA 3TDJA 4G77A 3N26A 2DE2A 5CMCA 1SQYA 4YMBA 3R7XA 4ZECA 4QFOA 4F2OA 1ZKBA 2I0BA 2M8CA 2Q9TA 3A3UA 1IIWA 2NUVA 4OXVA 1B1XA 3CSBA 5FHMA 3FJMA 4QHQA 1NNTA 3KFMA 5I2KA 2O6AA 4OFLA 4Q8RA 4KPTA 3PUVE 4BDLA 3A09A 3SEYA 1N3XA 1B7UA 2VD3A 5EHMA 4PQJA 1AMFA 5CC2A 2ZYKA 3HHFA 3TPAA 4RPNA 1MY2A 2PMSA 5CRYA 4XKNA 2HCAA 2HAUA 3PD9A 1IEJA 2XHDA 4NF8B 2ZNUA 2HEUA 4QSCA 2B3FA 4QF9A 3UK4A 4LVQA 3H6TA 5H8QB 4EQBA 1EU8A 5AA2B 4ZE8A 4IO4A 4EF1A 2O1MA 3S4UA 5BUUA 1LCTA 5CI5A 3UGWA 4EQ9A 1LFHA 2AL5A 1OVTA 1QJMA 3G3KA 1LLSA 4ND9A 2DYXA 1ZLQA 2X7PA 2H98A 3OXNA 4F3PA 5FTHA 1AIVA 3C35A 3VV5A 3UIFA 4GLIA 2Z8FA 2VHAA 4BDRA 1MY0A 4JSOA 1BLFA 4WEDA 3FD3A 1QVSA 3OEKA 3KN3A 4TOZA 3IOWA 4ZEIA 4F22A 1S9TA 4X1BA 2QSXA 3I6VA 4OETA 1JVXA 2XXXA 3U93A 2PT1A 1URSA 3OO7A 1M5EA 2XXYA 4O3BA 1IXGA 3TTMA 3IB2A 3O2AA 3RQTA 3RT8A 2Y7KA 3R6UA 3G7WA 2HFBA 3T93B 2Z8DA 3CFLA 1B1HA 4PP0A 5LOMA 3IOVA 4ZEDA 2KLFA 4GFRA 1MDP1 1A8EA 2RKMA 3PGFA 3IOUA 1M5BA 3Q29A 1GGGA 2RINA 4NF6B 1AL3A 3FXRA 4IO5A 5AA3A 4N07A 4P0GA 4GL8A 2DWJA 4GQOA 4KR5A 2AL4A 1RYOA 1EZPA 4LP2B 1NNPA 3KG2A 5L9SA 2Y7RA 3G3JA 3KN8A 4H65A 4ESXA 3I5OA 1RYXA 3S2VA 3GXAA 1FTKA 3T96B 1GVCA 4H5GA 1AH5A 4G8MA 3PPQA 4R9FA 3LSXA 1B6HA 1GV8A 1DPPA 2B65A 3O6IA 3OO8A 4YKJA 1SD3A 4G8NA 3TZAA 4YB6A 3CR9A 1DTGA 2I58A 3MBPA 3WAFA 3T9VA 1LAFE 5I58A 1FTOA 4YKKA 4Q0CA 3KGCA 5L8DA 2UVJA 3T22A 3FJGA 4NF4B 2Y7PA 1HSJA 3V83A 3AXFA 4DXCA 4POXA 2VOZA 4H1XA 3Q28A 2Z22A 4HCWA 1NH7A 1SW4A 1J1NA 1QUIA 2FYIA 3N94A 3SEXA 3QUJA 1MY3A 3IO6A 3DM0A 1JQFA 1IITA 5I56A 2ESNA 1FQBA 3K0VA 1JEUA 3ODBA 3Q26A 1D3KA 3F11A 3TCGA 5DYHA 4R6HA 3RNNA 2DOJA 3C36A 4KQPA 2XD2A 2A5TB 2XXQA 3K4UA 3FATA 4DXBA 3CIJA 2GRVA 4WKMA 3UA8A 2Z23A 1SW5A 3CG1A 3C4MA 3W9WA 3H7MA 5DVIA 1MPDA 1LAXA 1WVJA 1S50A 5J1DA 3MZBA 4Q5TA 4HW8A 1B32A 4NWDA 3IR1A 2WKYA 4G68C 3BFTA 1B0LA 4KHZE 3ECRA 1Y3PA 1MY4A 3PPPA 3DP4A 3SDFA 4ZDMA 3H6WA 4EF2A 1PBQA 2UVGA 1EZ9A 4LATA 4OVJA 4JWYA 2RC8A 3DLNA 4I8CA 1SI1A 1T0KA 3K1PA 1XS5A 3THIA 2E0SA 5CMMA 4F39A 2Z8EA 1MXUA 3EQ1A 2FNCA 5I59A 4MFIA 4OERA 4PFTA 4DDDA 3B7DA 1IUDA 4OQOA 3KN7A 3PV0E 1B9JA 4DCXA 1WDNA 1MH4A 1USYE 3QUFA 1A55A 1LBCA 1B52A 2F78A 4XKQA 4AB5A 1NMUA 3IB1A 3G3GA 3M8UA 1H44A 1N3WA 1Y3NA 2YPNA 4XIGQ 3FVNA 2QJEA 3K6UA 2H99A 1MXXA 4YB5A 4BDQA 4E0WA 2QS2A 2DSFA 4QSDA 3EN3A 1P1UA 2REJA 3RY3A 5A5XB 2YJPA 3MWBA 2HXWA 3FASA 2X26A 3RN8A 1KWHA 5DVFA 3UN6A 3HV1A 2XXHA 3H4ZA 2Q8JA 2ONSA 1OVBA 1QKBA 3OSQA 5CBSA 2IA4A 4JB7A 4E0XA 4XTCQ 3IORA 4R2FA 3IJOB 4X48A 4NF8A 4RNSA 5CMKA 4LZ8A 4FEBA 2DXRA 5H8QA 5AA2A 3O29A 2O51A 1OMPA 3O66A 5TPAB 2ZMBA 3O97A 4KYEA 1QUJA 3TTKA 1SYIA 1I6BA 1UTBB 3CG3A 1JW4A 4YKPA 1MH3A 3VDFA 3HO7A 4HS7A 3K01A 1ZJLA 5TP9B 1N7XA 2VGQA 3RTFB 5KCJB 1URGA 1LBBA 4KI0E 1Q1KA 4F31B 3K2DA 1US5A 2Q2AA 2HQ0A 2V93A 3G3FA 2R6GE 2DXYA 3V89B 4P11A 1DTZA 1YTVA 4K3FA 5AA1A 1MXWA 3O6HA 1XOCA 3K6WA 4PFWA 3W15C 4FE8A 4TLLB 4KCCA 2DWIA 3BKIB 3K6VA 1SVXB 3JYRA 3OEMA 3ILTB 3LSLA 1ZU0A 3E13X 1B3EA 5EHSA 2OWTA 1HSLA 4NTLA 4NF6A 1XT8A 1FW0A 3MVWA 4JXIA 2D21A 1IQ7A 1BTJA 1PDAA 4G8HA 1Y9UA 3OD7A 1F9BA 4M4GA 1NKXA 4ELRA 1B5HA 2G93A 1Y20A 1PBPA 1QUKA 3TEPA 1FQDA 1WODA 3TQLA 4NMYA 4L17A 4PFUA 3QXMA 5KDTA 3ZKKA 1DPEA 2W7YA 3GBBA 3N5LA 4ZEBA 4Q30B 4RYAA 3RPWA 3KOSA 4Z7EA 2OK2A 1P1QA 4XXUA 3IB0A 3H6UA 1A99A 4OTEA 2QL3A 3MVYA 3EHSA 1IXCA 4FATA 2NXOA 1Z7ME 3RT6B 3B6TA 4RK9A 5F7VA 3TUSA 1NH8A 1OQGA 1R1NA 1B0HA 1UTHB 1PC3A 5DTBA 3SEVA 1Y3QA 3LSFB 5DT6A 4OFJA 3SKPA 4NF4A 3IL1B 2F6GA 4GXAA 2OLBA 4OYVA 3K1NA 2F35A 5JTYB 4G68A 1B2HA 1MDQA 2O7UA 3T9UA 4MLVA 2I4CA 5H8FB 2F7CA 2ALUA 4F19A 3CI8A 1PB9A 5ITPA 1B46A 3MW0A 5TU0A 4JWXA 4U1ZA 4U21A 5HPQA 3LR1A 3ZKLA 2H25A 1NL5A 3GBAA 1URDA 2O69A 4YZZA 4AQ4A 3EPEA 3FJ7A 4FORA 2A5TA 1FTLA 4EXKA 3DP8A 1S7YA 4F1YA 1PEBA 3R26A 2ONKE 1MY1A 1QW0A 3CFXA 2P2AA 5DVJA 5KZTA 2RCAA 4R2BA 4PE5B 1RKMA 3QK6A 1B3GA 5H8HB 3N6UA 3CSGA 2D5WA 2ZYMA 3LC8A 2ZNSA 2F8DA 1D4NA 4GOTA 3N6TA 1R9QA 1GR2A 2FA7A 2DVCA 1UIUA 2I3WA 1M5FA 3OO9A 2V3QA 2X7QA 4LZ7A 4F1VA 4IY5A 3JV9A 3IAZA 4Z0IA 1FQFA 1B4HA 2F97A 3MJNA 1NNFA 1SW1A 5K2XA 2GHBA 3VVDA 2OWSA 3H6VA 1M5CA 3EHUA 1OIBA 3KJTA 5ICQA 3TTRA 1TXFA 4QFLA 4F2QA 1QKAA 5BWJA 4HCYA 4ZZAA 2Q89A 1ZBMA 3PPRA 2F7AA 2QS1A 1A54A 4FIMA 4RY1A 2R71A 1D9VA 4IGTA 4F1UA 4YKIA 1P1NA 2F7BA 1EH3A 3ILUB 4C0RA 5A5XA 4DZ1A 1IZ1A 4OEVA 1I6QA 3C9HA 1MM6A 1UQWA 5EYFA 1SDXA 3KBRA 1IXIA 1Q35A 2O84X 2V3UA 3K1MA 2REGA 4OENA 4X9TA 1IXHA 1SW2A 4YICA 4EUOA 2ZYNA 2QS4A 2HZLA 1ZIUA 1JEVA 2IEEA 2AIXA 5F1QA 2QS3A 1LCFA 3FVOA 4RXLA 2XX7A 1XC1A 1VR5A 4U1OA 4NF5B 2V3TA 4UACA 3G3IA 1B5IA 1ANFA 5FTIA 3PPOA 3B6WA 1B40A 4X1DA 4C1TA 2PX1A 1H76A 5AA2D 4OESA 4G4PA 3S9LC 1TFDA 3S9MC 1MQDA 5IKBA 2P0SA 2I6EA 1UTBA 3DELB 2UVHA 4IO7A 4N6PA 1BP5A 3RTWB 3QIMA 5B70A 3TELA 4U23A 2ABHA 4I9DA 1GTKA 3VFJA 1POTA 1ZMGA 2RC7A 3WAEA 2OZZA 1N0TA 3SESA 2I0CA 3VVEA 3MUQA 2CZLA 2A5SA 3GLBA 4MF3A 1B7HA 5CMBA 4U22A 4IGRA 4H67A 4F3BA 2ONRA 3PD8A 1JVYA 4LUBA 2O7IA 5M2VA 4MH5A 3G3HA 4OEUA 3V5AA 2O1LA 2F34A 3FXQA 1N7WA 4ZEFA 3OENA 3I3VA 4GRKA 4KCDA 2ZYOA 3KOTA 4H8JA 4DLDA 3IOTA 4I62A 5H8NB 4WEPA 2XXRA 2BJJX 3PMVA 1CE2A 2XXTA 3QSLA 1MG1A 1FQCA 1I69A 2E1SA 4H6DA 3S9EA 3KEIA 2PVUA 2ANJA 2GHAA 5IAIA 4ECFA 1XVYA 4GVOA 2QRYA 3H03A 5L9OA 1MPBA 3PUWE 1A7LA 2O68A 1USYH 3MVZA 1O7TA 4KFQA 1LSTA 1DOTA 2XXUA 1LFIA 4LONB 1A8FA 2VD2A 2NVUB 4JSDA 3OELA 1XHYA 2V25A 1B05A 2VP1A 3FGSA 2UVIA 4WXJA 3D4CA 4ONYA 5AA4B 3QYTA 4M1VA 2XX8A 3IJXB 3TCHA 3FXUA 1QULA 3K00A 4DXUA 2DVZA 4UA8A 3UP9A 2I3VA 3PPNA 3MPLA 3RLFE 3T9HB 5I59B 2XXIA 3B6QA 1UTHA 2UXAA 2H5YA 4FEDA 3VVFA 4C1UA 1L5TA 4YB7A 2HZKA 5DEXB 3FZVA 4NE4A 2H9BA 5JTYA 4OFOA 3D4GA 3MQ9A 4R6YA 3Q25A 5I57B 5H8FA 2CMOA 3UORA 4GL0A 3O9PA 2THIA 2DS9A 5JK4A 4IO3A 4KYSA 1EZOA 3U94A 5I2NB 3FV1A 3PUZE 1US4A 4QFNA 3OO6A 3V8XB 2DP8A 1TFAA 1B3FA 1OQHA 4R75A 3C32A 3U92A 1YPNA 1PB8A 2V84A 4TLMB 1JW5A 1OLCA 4MBPA 1PB7A 4LQ2A 4DIGA 5H8HA 5ITOA 2I48A 4NWCA 1LFGA 3VXCA 4ISUA 1MXVA 3TAJA 3OOAA 4POWA 3S9NC 3T66A 3L6GA 1Y4CA 1Y1ZA 2Q2CA 3E3KA 2OJTA 2RC9A 3SEWA 4U4XA 3LBSA 4RPOA 4R9GA 2PYYA 2F6PA 5ISUA 2RCBA 3PUXE 1P99A 4GF8A 3SERA 1MQHA 1VE4A 4JWOA 4RK2A 1MXYA 3H06B 1P1OA 3FVGA 4FAJA 1N04A 3BBRA 3JZJA 2DQVA 4EXLA 1XVXA 3Q27A 3M3FA 3A3CA 1B4ZA 3MP1A 2OBGA 4R73A 1N76A 4LZ5A 4F3GA 5FHOA 4GXSB 4N13A 1SYHA 1MS7A 1VSOA 3MZ1A 1SI0A 4JDFA 2Y7WA 4G2ZA 4PETA 3O28A 1UIVA 3E4RA 4P0IA 4FECA 5I2KB 4ZS9A 2DE4A 3FUZA 2QMXA 1ZTYA 3HHGA 1H3DA 1VFEA 5ELVA 4R74A 3OSRA 1JNFA 1CB6A 3KJ7A 3C31A 3PU5A 2DWAA 3ONMA 4AB6A 3TTLA 1OLAA 5FHNA 1O63A 2Q88A 4O3AA 1Y1MA 2QPQA 4GIZA 2D3IA 2YLNA 1TWYA 2XD3A 2F5XA 2DE3A 4R72A 3CVGA 1LB8A 1D9YA 4NF5A 4QFKA 3VE1B 2B3BA 2XXPA 1HSEA 3U8QA 5KDTB 4BLAA 1B51A 2RF1A 4ESWA 3MVXA 3TKDA 4ZE9A 4R6KA 4I1DA 3T9XB 4IY6A 1LGBC 4LQ5A 4MLQA 2I49A 4ELOA 4YMAA 4OZ9A 4OMBA 3LUYA 4H0WA 3HCQA 3VLUA 1FQEA 4EDPA 1FTJA 1TT1A 3TODA 4EQ7A 1B7ZA 4QRZA 4U4SA 4NEDA 3E9XA 2Y7IA 4QFPA 5ICTA 1YAEA 3SETA 5K2YA 3ZS6A 4G68B 2NOOA 1N84A 4FJPA 3L6HA 2UYEA 2XXWA 3EF7A 5I84A 4ZZEA 2DWHA 1BKAA 3CFZA 2F36A 5HM4B 1MQGA 4RA1A 4DCYA 1NNKA 2XX9A 1MQJA 2PBWA 3U1OA 2ZXTA 5H8NA 4ELPA 3KSJA 1SBPA 4THIA 1YCJA 4IO6A 4GD5A 4OHNA 4PFYA 3MC2A 4F18A 1B3LA 1DMBA 3RUMA 5L9MA 4OWDA 4H5FA 4TQUQ 3SEUA 1Z7NE 1BIYA 2H4IA 1O64A 4BDNA 1B3HA 3MZ9A 3OMBA 4BDOA 3TMGA 3IO4A 4ELQA 3K6XA 5TPAA 1MRPA 4YU0A 2GH9A 4IB2A 4LA9A 1POY1 3FV2A 4ZEKA 5HBCA 1R9LA 4F29A 4YAHX 1B58A 5I58B 3KSXA 3FIRA 3USDA 3TYHA 5TP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8IA 5AA4A 3C34A 3QAXA 4QSEA 4DE8A 4XKRA 1LAGE 3MPKA 1A40A 2G29A 3M3LA 5KCJA 4U2RA 2B4LA 3EHTA 1G0IA 3MP8A 1MM7A 1M5DA 1MXZA 2AYSA 3HSTA 5LTCA 1ATGA 3C33A 4HTGA 4P3LA 1JETA 5AE4A 4BDMA 1ELJA 1JW1A 4KYDA 5DEXA 3O6GA 1FTMA 1R6ZA 3LSWA 4GWOA 4XKPA 5I57A 1FCKA 5I56B 4O3CA 2Y84A 2JJKA 4F3SA 3VLVA 1FQAA 2WYPA 3KZGA 3ZSFA 3TTNA 2UYFA 2GFEA 3TQWA 2P1SA 3P7IA 3HPIA 1DCUA 1P1WA 1MQIA 1MPCA 4UABA 5I2NA 4N4UA 3K02A 1NUXA 3BIGA 4OVQA 1LB9A 3RGYA 3M3KA 2ZNTA 5DW8A 3PMXA 3KBZA 4RJZA 3U72A 3MP6A 5B7DA 1LAHE 4KD5A 3PMWA 2WYKA 3HN0A 1B5JA 2HPGA 4OA4A 3H3GA 2R9JA 2I4BA 1H43A 1NV4A 3GZGA 5CBRA 3VLWA 1NFTA 3W9VA 4JBZA 5CM6A 3IX1A 5JEIA 3IK6B 1I6AA 4IO2A 1Y4TA 3PUYE 1YXIA 2OCUA 1FSAA 3VXBA 1AOVA 3MAMA 3TCFA 2HAVA 3DP6A 2VT5A 2PT2A 5ET8A 2Y5KA 1II5A 2LAOA 1FBDA 3CRBA 3FVKA 3BFUA 1FJ9A 1RDZA 1K9YA 5H8SA 2FIEA 1H45A 2NWJA 5FBPA 4I3EA 3TFLA 1VFDA 4NGUA 1DSNA 4H45A 2XXVA 2QMWA 3TDJA 4G77A 3N26A 2DE2A 5CMCA 1SQYA 4YMBA 3R7XA 4ZECA 4O8MA 4QFOA 4F2OA 1LBZA 1ZKBA 2I0BA 3KC1A 2M8CA 2Q9TA 3A3UA 1IIWA 2NUVA 4OXVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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