3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
2YLNA 4O3AA 1B0HA 3MZ1A 4OEUA 2Y7RA 4RK2A 5AA1A 3SEYA 1FTJA 2QS4A 3RTWB 1LLSA 1YCJA 2QS2A 1B3FA 1RYXA 1JETA 1N7XA 4DXUA 4POWA 3U72A 1B7UA 1MXZA 3OO8A 5AE4A 4ISUA 2DQVA 4PFUA 3IK6B 1B5HA 3CIJA 2A5SA 4G8HA 3IX1A 3UK4A 3OENA 5J1DA 1B40A 3CSBA 2VP1A 1FQAA 1ZIUA 1YPNA 1B46A 4H5GA 4KFQA 3CI8A 3BFTA 2NUVA 1R9QA 4ZZEA 3T22A 1D9YA 3N26A 2REJA 3TDJA 2VGQA 2RKMA 4QSCA 3RGYA 4YMAA 4F29A 4IO7A 1H44A 3FV1A 2VHAA 2Z8DA 3HCQA 2GRVA 5EHMA 2H99A 1O63A 2I49A 4G8NA 2P2AA 2O1LA 1VFEA 3FATA 4GL0A 1MY2A 1DTGA 1SI0A 1MRPA 2AL4A 2F78A 5TPAB 2I6EA 1POTA 3MVZA 2FYIA 3C32A 1N3XA 3QUJA 4MLVA 5DEXA 1H43A 2O1MA 4JSDA 5H8QB 4Q30B 5K2YA 1IUDA 2PYYA 5CI5A 3K6VA 4F3PA 4BDLA 4EQ7A 2YPNA 4KPTA 4OFJA 3C4MA 4ECFA 2M8CA 4P11A 4X9TA 1BP5A 1H45A 3LBSA 3T66A 1URSA 3FIRA 3C33A 1PC3A 3OEMA 4F19A 3I5OA 4KI0E 4JSOA 3H7MA 2XXPA 1N7WA 4E0WA 4IO3A 2O51A 2QS3A 2W7YA 1EH3A 3IB0A 5ELVA 4QSEA 4NF6B 4QF9A 3TCHA 4Q0CA 3ZSFA 3GBAA 2E0SA 1SBPA 1MPDA 2V84A 2DE4A 3CVGA 5TU0A 1OQGA 3OELA 3JV9A 3PD9A 3G3JA 3IL1B 1XS5A 4NF4B 1O64A 1A8FA 2H98A 3A3CA 4YKPA 3C31A 2H4IA 4F3SA 2OLBA 2F34A 4LUBA 5KCJB 1LSTA 2ZMBA 4U21A 4BLAA 3DM0A 1EZ9A 2X7QA 2GHBA 3P7IA 2DXRA 2REGA 5FTHA 1N76A 1MDQA 4K3FA 1Y3PA 1XT8A 2OJTA 4IO2A 5KDTB 3R6UA 1UIUA 3VVEA 1IXIA 5TPAA 2OCUA 4U4XA 1JEUA 4QFNA 3IOUA 1VFDA 1DSNA 4XKRA 5H8QA 2RF1A 3O9PA 4G4PA 5A5XB 3EF7A 3PPPA 4WKMA 1JEVA 3H6UA 3FGSA 3H6VA 1OVBA 3E9XA 3HV1A 4QSDA 2ONRA 4H0WA 4NEDA 5DYHA 1AOVA 3EHTA 3CFLA 1DTZA 2I0CA 4NWDA 2Q88A 4H67A 4RXLA 3UORA 2XXUA 4X48A 1LB9A 3Q29A 1LCTA 2Z23A 3LC8A 3I3VA 4H8JA 3VLWA 1ZMGA 2ANJA 1ZKBA 1MDP1 3MQ9A 4NF6A 3TTKA 1Z7ME 2X7PA 3GBBA 3MJNA 1FCKA 5JEIA 1HSEA 1MPBA 4R74A 1LAGE 1USYE 1FQBA 1OQHA 3L6GA 1S50A 3JZJA 4EXKA 4R6HA 3ILTB 4YB6A 4Q5TA 1MXWA 3K1NA 4JWXA 3RT8A 1SQYA 2DYXA 5I84A 3IORA 3Q25A 1EZOA 3U93A 4ZEFA 1XOCA 4C1UA 4QFOA 1PB7A 4NF4A 3BKIB 1SYHA 3G7WA 1I6QA 3IB2A 1B3HA 1NNPA 2DP8A 3VXBA 3VLVA 3T96B 4DE8A 1ZTYA 1MQDA 3PUVE 4GVOA 4XXUA 2Y7WA 2DE3A 4ND9A 3HHFA 3PPNA 5KCJA 3PGFA 3U94A 4LP2B 1I6AA 1QJMA 4OQOA 1LAXA 4UACA 3HSTA 5I58B 4OFOA 3TMGA 1MY3A 2PT2A 2ZYOA 3IOTA 3PPQA 4FJPA 4RPNA 5KDTA 1BKAA 3DELB 1DPEA 2O69A 1S7YA 5CBSA 3S2VA 1MY0A 1N3WA 1OMPA 3LUYA 4GXSB 2ESNA 2UVJA 1B3LA 3TTMA 5A5XA 4KR5A 3E3KA 4KYDA 4YKIA 3OD7A 1MH4A 2F7CA 2G29A 1II5A 2VD2A 1QVSA 3K1MA 3RQTA 1MS7A 1J1NA 2THIA 2HAUA 3HO7A 1PB9A 1QUIA 2Z22A 5B70A 4OETA 4Z7EA 3TTRA 2H25A 3MAMA 3G3GA 3UIFA 3O28A 3M8UA 4XIGQ 4UA8A 1LB8A 1XVXA 4GD5A 1ELJA 1LFIA 4Z0IA 4LZ5A 3CG1A 3LSXA 3MP8A 4EUOA 4KCCA 2UYEA 1QUKA 1B5IA 1IIWA 4DIGA 1MXVA 1A7LA 3I6VA 4WEPA 1A54A 1NMUA 1AH5A 2OK2A 1R6ZA 3OSQA 4F3GA 2NOOA 2I3VA 1MXXA 1NFTA 1Y9UA 1ATGA 3HHGA 5AA4A 3KFMA 3FXQA 3M3LA 3CR9A 4RY1A 2ZYKA 3N5LA 3FJMA 1NL5A 1FTMA 3MVYA 1Y4CA 4MLQA 1FQFA 1XC1A 3Q27A 2B65A 3IOWA 4FIMA 1EZPA 4MFIA 5HPQA 4OHNA 4IB2A 4GXAA 3TCGA 1OIBA 4YICA 3QYTA 1MQIA 4IGRA 1B4HA 3PPRA 4F2QA 2DS9A 4KD5A 5CRYA 3IAZA 2R71A 3JYRA 1D4NA 5DTBA 1QUJA 2OWTA 2Y7KA 5H8HB 3N94A 1USYH 2I4BA 1B32A 3U1OA 2R9JA 4ZZAA 2IA4A 2B3FA 2H9BA 3KOTA 3FV2A 3TKDA 1B6HA 2QSXA 3OXNA 2ALUA 3VV5A 2O7IA 1MY1A 2D3IA 1PB8A 3SDFA 3Q28A 2F97A 3H3GA 1SI1A 1FQCA 3IO4A 2F6PA 4JDFA 3GLBA 4MF3A 3B6WA 1H3DA 2XXTA 2XD3A 3PUXE 2P0SA 3KBRA 1N04A 1QKAA 2ONSA 4IO4A 2F7AA 2Y7IA 2QMWA 2D21A 1JVXA 2QMXA 2NVUB 2QPQA 3SEXA 2YJPA 1TWYA 5TP9B 1I6BA 3WAFA 3F11A 3C36A 1A40A 5ISUA 1N0TA 2HQ0A 3FVGA 4NMYA 3WAEA 3MC2A 2Y7PA 1UTHB 1SW2A 2V93A 4F31B 1T0KA 3VVFA 4THIA 1MY4A 1FTKA 3TQLA 4KQPA 2Q9TA 1NH7A 2QJEA 2DVZA 3T9XB 3O2AA 2XXWA 4OYVA 2X26A 2GFEA 3RUMA 3PMVA 3B6TA 1A55A 2F8DA 5H8FB 3FZVA 4OTEA 1R1NA 2V3TA 1P1NA 1S9TA 4ZEDA 2XXIA 3IO6A 1GTKA 4EQBA 3CFXA 1QKBA 3PUWE 4R72A 2DWAA 3TTNA 2RC9A 1RKMA 3FXRA 3FD3A 1DPPA 3UGWA 4LA9A 2DWJA 4BDNA 3UN6A 5ICQA 5CMBA 4NTLA 4LZ7A 3KN3A 4U1OA 3H4ZA 5DVJA 1Y20A 3IB1A 4R2FA 4OZ9A 3RY3A 1JW1A 5H8HA 3G3KA 1PEBA 4NF5B 1O7TA 3CRBA 4EDPA 2AIXA 4G77A 3FJGA 2ZNUA 4YU0A 3KEIA 3TFLA 4HS7A 4DCYA 3H03A 4OMBA 4G8MA 1P99A 1CB6A 4HCWA 3RN8A 2DXYA 2Y84A 1LAHE 2ZXTA 2XX8A 4H65A 4LONB 1IXGA 2R6GE 1Y3NA 5TP9A 5BWJA 5I56B 4QFPA 3TQWA 3K2DA 1B2HA 1Y1MA 4YKJA 1NNKA 1B52A 3K6WA 1Q35A 1UTHA 1OLCA 2WKYA 2B3BA 1WVJA 3QXMA 3RLFE 1AL3A 5LOMA 1TFAA 1ZJLA 3HN0A 2UVIA 3FUZA 3IOVA 3T9VA 3SKPA 5H8FA 3H6WA 1UTBB 1MH3A 1P1UA 1B5JA 3UP9A 4PFYA 4ZECA 2RC7A 4JXIA 1P1QA 3D4CA 2IEEA 3ODBA 3MW0A 2PX1A 5CMMA 3E4RA 3SERA 1JW5A 3PUZE 1MQHA 4IGTA 2RCAA 4U2RA 3BBRA 4XKQA 5AA2B 4Q8RA 2HZLA 3V8XB 5JTYB 4EF2A 4OESA 3MP1A 1JQFA 3SEUA 1TFDA 4F1YA 2VD3A 2F5XA 2PVUA 3SEWA 1B3GA 2DWIA 4BDQA 4EXLA 1Z7NE 4AQ4A 3QIMA 4G68C 5L9OA 1B51A 4RA1A 2UXAA 3TPAA 1B1HA 4AB5A 4GRKA 2Z8FA 4H1XA 4M4GA 2H5YA 5DVIA 4ZS9A 3PMWA 2KLFA 2AYSA 1LFGA 4GFRA 1IZ1A 3DP4A 4TQUQ 4QHQA 4GF8A 3QAXA 4NWCA 2F35A 1M5EA 3W15C 4N07A 4GQOA 3EQ1A 2ABHA 2F6GA 1B9JA 1B1XA 4OVJA 1IEJA 3S9LC 3C34A 4ELRA 5ITOA 3UA8A 2O7UA 1PBQA 1Y1ZA 5FTIA 3S4UA 3ZKLA 4QFLA 5CM6A 3QSLA 5I56A 1MQJA 3OSRA 3TUSA 1IXCA 1FQDA 4G68B 1VE4A 4WEDA 1UQWA 3G3HA 4TLLB 3QK6A 1ANFA 4ESWA 5FHMA 3K6UA 3ILUB 1US4A 2ZNSA 3K00A 1MM7A 4TOZA 1FTOA 4I8CA 1HSLA 1US5A 3G3IA 1MXYA 4OXVA 2UYFA 2ZYNA 3DP6A 4LATA 1N84A 2VOZA 4KYSA 3VLUA 4YZZA 3LSFB 1UTBA 5FHNA 3E13X 3V83A 3MZ9A 3N6TA 3O6HA 4EF1A 4NE4A 3GXAA 3LSLA 4F2OA 4FEDA 2BJJX 4NF8B 2Z8EA 1BTJA 2DOJA 3OO7A 5AA2A 5DT6A 3MPLA 4PE5B 4P0GA 2I3WA 4HW8A 1LGBC 2PBWA 4HTGA 1KWHA 3ZKKA 2ZNTA 3EN3A 3O6IA 4GWOA 4P0IA 3OO9A 4ZEBA 4R6KA 3KJ7A 3IR1A 3MWBA 4MH5A 3SEVA 4HCYA 1UIVA 3ONMA 5I2KB 4IY5A 2DVCA 1AIVA 1M5FA 1GGGA 4ONYA 1M5CA 4ESXA 4OWDA 1D9VA 3MVWA 2RC8A 1GR2A 4KCDA 3FJ7A 2NWJA 5H8SA 4DLDA 4X1BA 2F36A 4JBZA 5I58A 3CG3A 2LAOA 1MPCA 1XHYA 3KOSA 2P1SA 2XXRA 4I62A 3PU5A 2AL5A 2V3UA 4DZ1A 3LR1A 1LBBA 4E0XA 3HPIA 3H6TA 4G68A 3PV0E 4FECA 1URDA 4ZEIA 4DXCA 1IXHA 2DWHA 1SW4A 5DVFA 4R73A 1NNTA 1M5BA 3TEPA 2CMOA 5IKBA 4OERA 3R26A 1TT1A 3K02A 2XX7A 3FASA 2Q89A 3FVNA 3CSGA 1A99A 3U92A 2I0BA 1NH8A 3TYHA 3MPKA 2FA7A 4FORA 3N6UA 5I2NB 2DSFA 3O66A 1DOTA 1AMFA 5KZTA 2O6AA 1JW4A 4NF8A 1VSOA 3TODA 5I59B 4WXJA 2V3QA 1B05A 5JK4A 3K4UA 1SW5A 3FXUA 4I9DA 3RT6B 3VDFA 3MZBA 1ZBMA 5I57B 2I48A 4ZE9A 3K6XA 4F18A 1FW0A 2ONKE 4MBPA 1CE2A 4N6PA 2RCBA 2E1SA 2I4CA 1B7HA 3KSXA 1BIYA 2PMSA 4GOTA 4JB7A 2DE2A 5EYFA 1YTVA 3DP8A 1P1WA 3S9MC 5CBRA 5I2KA 4H6DA 3TCFA 3PUYE 5H8NB 3OO6A 4M1VA 4XTCQ 4IY6A 3FVOA 4PFTA 4U23A 4BDOA 4OFLA 2UVHA 2FNCA 5F1QA 1LAFE 3PPOA 5L9MA 4QRZA 2UVGA 3ECRA 3OEKA 4TLMB 1WDNA 2CZLA 1GVCA 2HEUA 4BDRA 4RK9A 3U8QA 2XD2A 2I58A 1SYIA 3TTLA 4R6YA 2HFBA 4R2BA 3W9WA 1F9BA 3TAJA 4L17A 1XVYA 3MBPA 3VE1B 4KYEA 4N13A 4ELOA 1H76A 1D3KA 3IJOB 2G93A 1B0LA 1JVYA 1LCFA 1GV8A 5M2VA 3QUFA 1MM6A 4YB5A 4O3CA 2F7BA 5ITPA 4YKKA 4ELQA 4JWOA 4PQJA 4F3BA 4H8IA 1JNFA 3SESA 3IJXB 3RPWA 2QS1A 1QW0A 3S9NC 4FE8A 1OVTA 4DXBA 4U1ZA 3RTFB 3TZAA 5I2NA 3AXFA 5EHSA 2XX9A 3KJTA 4QFKA 1RYOA 3T93B 4IO5A 3RNNA 5I59A 4R9FA 5AA3A 2NXOA 1FQEA 2XXYA 4R9GA 1LBCA 4RNSA 2A5TB 3K0VA 2HZKA 1NNFA 1P1OA 5I57A 1VR5A 3O29A 2O68A 1YAEA 2GHAA 4IO6A 4KHZE 5CMCA 4O3BA 3V5AA 4JWYA 2OWSA 2XHDA 3A09A 1EU8A 3BFUA 3KG2A 4YMBA 5CC2A 3KN7A 3KZGA 4LVQA 5AA2D 2XXVA 3DLNA 3MVXA 5H8NA 3K1PA 1B4ZA 2XXQA 4F39A 3GZGA 1MQGA 5CMKA 4OEVA 3LSWA 1IQ7A 5F7VA 2HXWA 1B7ZA 4ZDMA 4H5FA 3EPEA 2O84X 4U22A 3THIA 5B7DA 2XXHA 1PBPA 3KGCA 2PT1A 4NF5A 4C0RA 3PMXA 4LQ5A 4ELPA 2OBGA 2HAVA 1FTLA 3OMBA 5AA4B 3M3FA 4DDDA 1MG1A 3VFJA 5IAIA 4AB6A 1L5TA 4FAJA 4FEBA 1Y3QA 4PP0A 4LZ8A 1BLFA 1OLAA 2D5WA 3ZS6A 5BUUA 4U4SA 5ICTA 4GLIA 1LFHA 2OZZA 4YB7A 1SD3A 4RJZA 2RINA 4FATA 1A8EA 3H06B 1DMBA 3T9HB 3V89B 1I69A 2Q2AA 4OENA 2GH9A 1Q1KA 4X1DA 3CFZA 1ZLQA 1HSJA 5L9SA 3FVKA 1SVXB 2HCAA 1IITA 3MUQA 1WODA 1B58A 2A5TA 3D4GA 3EHUA 4GL8A 4ZE8A 1M5DA 1R9LA 4R75A 3VVDA 5FHOA 4PETA 5K2XA 4F1UA 3S9EA 3OOAA 2QL3A 4EQ9A 3C35A 3M3KA 3B7DA 4PFWA 3O97A 4RYAA 5HBCA 2ZYMA 3TELA 3G3FA 2Q2CA 3A3UA 5HM4B 3W9VA 1TXFA 1SW1A 1B3EA 4XKNA 4I1DA 1SDXA 1ZU0A 3O6GA 5DEXB 2XXXA 5JTYA 4GIZA 3L6HA 4C1TA 2QRYA 3VXCA 3Q26A 3MP6A 2Q8JA 4XKPA 4BDMA 3R7XA 1QULA 3B6QA 4DCXA 3C9HA 3USDA 4G2ZA 3KN8A 3T9UA 4RPOA 1POY1 4F1VA 1MXUA 4LQ2A 3PD8A 4ZEKA 3SETA 1URGA 4F22A 3K01A 5L8DA 1PDAA 4YAHX 4POXA 1NKXA 3KSJA 2V25A 1Y4TA 3EHSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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