3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
4QFOA 1XVXA 2PT2A 3K6XA 3FVGA 4IB2A 4QF9A 2OCUA 1PC3A 1MY0A 2OLBA 4LQ2A 1NFTA 2Y7IA 5FTIA 2F78A 3G3FA 3V5AA 1VR5A 2I48A 3ONMA 3KN7A 2R71A 3C36A 1B51A 2E0SA 3RY3A 3M3FA 3RUMA 2I6EA 1A8FA 1KWHA 4U4XA 5TPAB 4OFLA 4MH5A 5TU0A 3LR1A 5L9SA 3MVXA 3SKPA 3FJMA 4FEBA 4XKQA 3BKIB 3Q27A 4P11A 4H6DA 1LFIA 1B32A 4WEDA 2F6GA 3KJ7A 4GWOA 3L6HA 3FATA 4G77A 3ODBA 4IO6A 2HCAA 1JW5A 2ANJA 3JZJA 2RC9A 4JSOA 4ELOA 4N6PA 5A5XA 1MQGA 1P1NA 2ZYKA 5TP9B 2A5TA 5I56B 1N0TA 3MZ9A 1US5A 2F35A 4OESA 3CFXA 5FHNA 1HSEA 2QS2A 4QHQA 3O2AA 5CRYA 3VVDA 3U94A 3GXAA 2UVIA 3FXQA 3FD3A 1FQAA 3SEWA 3KFMA 1B58A 5M2VA 1VFDA 2GFEA 5CBRA 1T0KA 3M8UA 4POWA 3A3CA 1SYIA 1PB9A 1UIUA 2HXWA 1B5IA 2OJTA 3GZGA 1UTBB 2XXYA 3RTFB 1MXUA 1EU8A 3T9VA 4DDDA 1LB9A 2ONSA 2P2AA 1NNKA 3B6WA 3C9HA 3FVKA 3OOAA 3R6UA 4JDFA 1FW0A 4BDOA 4DZ1A 1MS7A 5LOMA 4QSEA 1B3LA 2DSFA 4U2RA 4XTCQ 2DE2A 4YAHX 3SEYA 1Y20A 5CMMA 2NXOA 4KQPA 4I9DA 4YMBA 1CB6A 1UIVA 1BLFA 1SW5A 2W7YA 1QKBA 3LSWA 3VXCA 3G3JA 4AQ4A 4I8CA 1H44A 2H98A 2NWJA 1D9YA 2D21A 3IB2A 3IOWA 3VLUA 1BKAA 1AMFA 1B3EA 1SW2A 3C4MA 4KYEA 1NH8A 4XXUA 2NVUB 3TODA 3ILTB 1LAGE 3OELA 3OMBA 3K0VA 3TYHA 1DPEA 1Y3PA 1SD3A 3H6WA 4QSDA 3IAZA 4GQOA 5CMBA 5IAIA 3W15C 1GV8A 4ND9A 4KYDA 2NOOA 4LVQA 4GF8A 2NUVA 3QUFA 4ZEBA 4FEDA 4DXBA 2O6AA 2AIXA 5K2YA 2O1MA 1DPPA 1MPBA 1B0LA 3OXNA 1AL3A 4YKIA 3RN8A 3RNNA 4F2OA 1IEJA 1MXVA 1XHYA 3IOTA 3MWBA 4JSDA 2DVCA 4NF8A 5HBCA 4EF1A 1A99A 1A54A 4EXKA 4OXVA 5B70A 4I62A 2Z8FA 4R9FA 4F39A 2F7CA 2I3WA 1OQHA 2VD2A 2P0SA 1XOCA 3S4UA 5IKBA 2XHDA 1A7LA 5H8SA 3CVGA 3OO6A 4N13A 2H4IA 3K2DA 4LONB 1MPCA 1XS5A 1ZTYA 2DQVA 2PT1A 1SQYA 3LSLA 3PD9A 3CSBA 3LUYA 4YB6A 3SEVA 3ZKLA 2VD3A 1OVTA 3EQ1A 3KN8A 2YJPA 3K6UA 3PPNA 1YCJA 2Q2CA 3RTWB 2Q88A 3K1PA 1I69A 1CE2A 3HHFA 3MW0A 1B3HA 4Q5TA 4U23A 4F22A 2HAVA 2QMXA 5DEXA 5ELVA 2OK2A 1N3WA 4OENA 3N26A 1FQCA 1EZ9A 1MH4A 3O6GA 1FQFA 2A5TB 5H8HB 3EN3A 1DMBA 4QRZA 1IITA 3FZVA 1I6BA 3MPKA 2ZNTA 4FECA 4R2BA 3RLFE 1TFAA 4EQBA 1FQEA 1MXZA 1Y1ZA 1B1HA 1B3FA 1GTKA 3PD8A 3PUWE 4F2QA 5FHMA 3G3IA 3MP6A 4YU0A 1Y4CA 2PVUA 2REGA 3KOTA 3UA8A 3Q25A 2VGQA 4G68B 3TEPA 1GR2A 4OTEA 5DTBA 1A55A 1BTJA 1OMPA 1MDQA 1LBCA 1Q1KA 2LAOA 3BFTA 3FJGA 3TCFA 4C1UA 3IO4A 3MJNA 1URSA 4IO3A 4PETA 5I57A 5I84A 2ZXTA 3PV0E 4R72A 1XVYA 1H76A 2RCBA 4TLLB 1JQFA 1SI0A 1OIBA 2HQ0A 2PYYA 3OEMA 2XX7A 3O6HA 2I3VA 2VP1A 3ILUB 1N04A 3D4GA 1FCKA 4HCWA 3O9PA 4OFOA 4OWDA 3U93A 5I59B 1NKXA 4MLVA 1B40A 2F6PA 2F36A 3C33A 2ZNUA 3ZSFA 3TPAA 5ISUA 4UA8A 3I6VA 5H8NB 3IOVA 5B7DA 1PBQA 1MQIA 1PB7A 3B7DA 3KSJA 3O29A 3OSQA 4ZZAA 4E0WA 5L9MA 1GGGA 3MP8A 3SERA 2DE4A 3UORA 3WAFA 5I2NB 2XD2A 1II5A 1HSJA 2ABHA 1QVSA 3B6TA 4KCDA 4U22A 3U1OA 2I49A 3O28A 3KGCA 4YB5A 4R9GA 4NMYA 2UVGA 2XXTA 1NH7A 3K1MA 3OO8A 4FE8A 1IXIA 3FXRA 3JV9A 3QXMA 4FAJA 3KZGA 1NNFA 4C1TA 1YTVA 4WEPA 4EQ9A 1LLSA 1DTGA 4THIA 3K6VA 1SYHA 2G29A 2AL4A 3U92A 3TFLA 3TUSA 1B0HA 2QMWA 1ANFA 1ZIUA 3Q28A 4L17A 3JYRA 3V89B 1P1OA 1TWYA 1PBPA 2E1SA 1RKMA 3H6UA 2PBWA 4IO7A 1MG1A 5DVJA 4RPOA 3K6WA 2F97A 5JTYA 5KDTA 5KZTA 4BDNA 1P1QA 2O7IA 3USDA 2Z23A 4JBZA 1J1NA 4GXSB 4UACA 4ZE8A 3WAEA 4PFYA 3V83A 2QL3A 2RCAA 2XXPA 3BFUA 2WKYA 3D4CA 2CZLA 2XXQA 4GIZA 4Q30B 4QFKA 4R6KA 1B05A 3IB0A 5AA2B 2DWHA 4PFTA 5I59A 2O1LA 4OHNA 3MZBA 2Q89A 3K1NA 3G3HA 5AE4A 2A5SA 4RY1A 3RT6B 3IORA 1BIYA 2FYIA 4YKPA 3U72A 1UTHA 4YKKA 1JEVA 2ONRA 4ELRA 4F29A 1N7XA 1QKAA 1MM6A 4YICA 4FATA 5DYHA 4NF5B 3GLBA 1ZLQA 3MUQA 5I57B 3S9LC 2F5XA 2XXIA 3PUVE 1NMUA 1SDXA 2UVJA 1R9QA 4NF4A 3S2VA 4NF4B 2V3QA 2V25A 4R6HA 3ECRA 2AL5A 3KBRA 4H67A 1O7TA 2H9BA 2V3TA 4F18A 1MY2A 4PFWA 5I2KB 3CFZA 1PEBA 4N07A 5L9OA 2YPNA 1ZKBA 2I4CA 1ZJLA 2Y84A 3PMVA 4GLIA 4OVJA 4DXUA 3H03A 5I2KA 4ONYA 1IXCA 4Z0IA 3F11A 4X9TA 4X1BA 1B3GA 2OZZA 3HSTA 2XXXA 3RT8A 5TPAA 3OO9A 2FA7A 1QULA 3DELB 5CBSA 4DCXA 4ZZEA 5J1DA 4NTLA 3SEUA 1M5CA 5KDTB 5JTYB 4NEDA 4JB7A 3UN6A 3T96B 3N6TA 2XX9A 3CI8A 3DM0A 4FIMA 4EQ7A 4XIGQ 5AA3A 5CC2A 3OO7A 5DVFA 1QUIA 2KLFA 4M1VA 4KPTA 4ZEKA 1QW0A 4U1ZA 3H7MA 5ITPA 1LFGA 3H6VA 5AA2A 3QIMA 1IZ1A 1P99A 1L5TA 3CFLA 3TTMA 1Y3QA 3PPRA 2RINA 2HFBA 3C32A 3G7WA 3VVFA 1RYOA 4R74A 5JEIA 3H06B 4ESWA 1MQJA 5AA1A 1OQGA 4ZS9A 4R75A 5FHOA 5H8FB 4KHZE 2O7UA 2UYFA 4LZ8A 3K4UA 1N3XA 1MQDA 3THIA 1ELJA 3UK4A 4RXLA 3PPOA 2UYEA 3I5OA 5H8FA 1I6AA 1JVYA 4Q0CA 3HO7A 3LBSA 1B4ZA 4YZZA 3UP9A 4KR5A 1FTJA 1USYH 2M8CA 3FGSA 3GBBA 2DYXA 3OSRA 1LSTA 1DOTA 3FASA 5CI5A 4QFNA 1LGBC 2X7PA 1S9TA 2YLNA 1FTLA 1WODA 3KOSA 3M3LA 4GVOA 3VLVA 4WXJA 3LSXA 4G8NA 4BDQA 3RQTA 1URDA 1MQHA 1M5BA 1B7UA 1O63A 1AH5A 2QS1A 2XXHA 3A09A 3K00A 4U4SA 3TTRA 1Y3NA 2DOJA 3T93B 1YPNA 3FXUA 5EYFA 3DP6A 1FTMA 3IL1B 3MQ9A 4PE5B 3OENA 4JWXA 4QFLA 4F19A 5I58B 3UGWA 3IOUA 3VDFA 2XXRA 3T66A 1XC1A 4LP2B 5DVIA 3FV1A 3ZS6A 5H8QB 1LBBA 4FORA 1LAHE 4OEUA 4GL8A 1YAEA 2UVHA 4OFJA 4H5FA 2VOZA 4I1DA 4G8MA 1A40A 3FVNA 3M3KA 5ITOA 4C0RA 2HZLA 3E9XA 1M5EA 3HPIA 3HCQA 3KN3A 4G68A 4HTGA 5DEXB 3HV1A 1MXWA 4HCYA 4RJZA 4F1UA 4Z7EA 4ZECA 4NF5A 1SVXB 1B46A 3K01A 1B7ZA 2Y7KA 3MVWA 4EUOA 2VHAA 4QFPA 3EHSA 1D9VA 3IK6B 3MAMA 4X1DA 3EHTA 3G3GA 3MVYA 4HW8A 5I2NA 2Q9TA 1S50A 2REJA 4G8HA 4F1YA 2HEUA 2O51A 1QUKA 4NWDA 4P0GA 4RA1A 4U21A 2PX1A 3IX1A 5A5XB 2Q2AA 1WDNA 1OLCA 3IR1A 4H8IA 1AIVA 1B5JA 1B52A 1MY1A 2GH9A 4ECFA 4H8JA 1IXGA 3FIRA 3QAXA 3T9HB 4XKPA 4LZ5A 3SESA 1DTZA 2HZKA 3P7IA 2CMOA 5BUUA 2QRYA 3T9XB 3PGFA 3MVZA 5KCJB 4NF6B 2D5WA 4JWYA 1DSNA 1H3DA 3IO6A 3HHGA 4ZDMA 3TCGA 4F1VA 3CG1A 2Z8DA 4LATA 4IY5A 3EF7A 4R6YA 4WKMA 4F3SA 2RC8A 1P1UA 2QS3A 2H25A 3TDJA 5HM4B 2DWJA 2QS4A 3LSFB 3Q29A 3FVOA 3OD7A 4LZ7A 1B2HA 2ZYOA 1VSOA 2RF1A 1FQDA 1QUJA 3PU5A 4H5GA 4LA9A 4OQOA 2I58A 1IQ7A 3IJOB 5ICTA 2DVZA 1EZPA 3SEXA 1M5DA 4ISUA 2V84A 4LUBA 3I3VA 3QUJA 4IGTA 4E0XA 2I0BA 3PUYE 4GOTA 3N6UA 5KCJA 1BP5A 1F9BA 1R9LA 1US4A 3EHUA 5BWJA 2XX8A 1LAFE 3H6TA 2B65A 4MFIA 1NNPA 3OEKA 1MM7A 3E4RA 4OETA 5H8QA 4ZE9A 1N84A 4FJPA 3VLWA 2OWSA 3W9VA 1Y9UA 3E13X 2X7QA 1TFDA 3O97A 2H5YA 5F1QA 1TXFA 1Y4TA 5I58A 3VFJA 1EZOA 4G4PA 4RYAA 1MH3A 4P0IA 1H43A 1GVCA 4Q8RA 3W9WA 4ZEDA 5HPQA 3CRBA 4IO4A 2XXWA 3TKDA 1MXXA 2QPQA 1Z7NE 1JEUA 3UIFA 4ELQA 2THIA 4NE4A 2O68A 1XT8A 3QYTA 3TTLA 1NNTA 4LQ5A 2IA4A 1QJMA 3QSLA 4TLMB 2DWAA 3KEIA 2Z22A 4RPNA 3EPEA 1R6ZA 4O3AA 3N94A 5H8NA 3PPQA 1B4HA 4RK2A 5L8DA 2GHBA 1R1NA 1RYXA 1LAXA 2XD3A 3FUZA 3GBAA 3TTNA 4F3GA 2B3BA 3FJ7A 1JNFA 1NL5A 1OVBA 2UXAA 3MPLA 2ESNA 4DIGA 2V93A 1LCFA 1EH3A 1H45A 1JW4A 2B3FA 2ZNSA 4KD5A 2F34A 2Z8EA 4MLQA 5H8HA 2O69A 2DWIA 5K2XA 3TTKA 3VVEA 4BLAA 1ZBMA 3S9EA 4HS7A 4IO2A 4NF6A 1B6HA 1PB8A 1POY1 1ZU0A 4DCYA 1A8EA 4POXA 2F8DA 4F31B 3C35A 5F7VA 3V8XB 3T22A 2QJEA 4F3PA 1WVJA 4H65A 3T9UA 1SI1A 3ZKKA 3C34A 1S7YA 2I0CA 3R26A 5ICQA 4XKNA 2QSXA 4ZEFA 3VV5A 4BDLA 3DP4A 4O3CA 3CSGA 2DE3A 5TP9A 1LCTA 4KI0E 5EHSA 2ZMBA 4NWCA 3TQWA 1N7WA 1FTOA 1LB8A 4GRKA 4YKJA 3S9NC 4MBPA 4BDRA 2FNCA 3TAJA 2DXYA 2Y7WA 3PPPA 4AB6A 4OMBA 1MY4A 2BJJX 4IY6A 2O84X 3CIJA 3R7XA 4NF8B 2P1SA 3IB1A 2DS9A 2OWTA 5CM6A 3TQLA 1Q35A 1LFHA 2DP8A 1N76A 3RGYA 3H4ZA 4EDPA 3B6QA 5AA2D 3PMXA 4ESXA 3N5LA 3A3UA 4U1OA 3KSXA 4OEVA 4PQJA 2ONKE 5EHMA 2G93A 4QSCA 2R6GE 1JETA 4KFQA 1URGA 3MP1A 1TT1A 2F7BA 1MDP1 1USYE 4ZEIA 2GHAA 4GL0A 2DXRA 1M5FA 4XKRA 1SBPA 3U8QA 4JWOA 3AXFA 2R9JA 4TQUQ 4F3BA 3S9MC 4YB7A 1MRPA 2Q8JA 3FV2A 2ZYMA 2H99A 4G2ZA 2RKMA 1UTHB 1SW4A 3VXBA 2Y7PA 4RK9A 4H0WA 3TELA 2D3IA 4R73A 4EF2A 4H1XA 5JK4A 1JW1A 1ATGA 1MPDA 1B9JA 2GRVA 3DLNA 4KYSA 4DLDA 3BBRA 2IEEA 2F7AA 1ZMGA 3Q26A 1OLAA 2ZYNA 2RC7A 3HN0A 3PUZE 4G68C 4OERA 4OYVA 4OZ9A 4RNSA 4ELPA 4BDMA 5FTHA 5AA4B 1Z7ME 3MZ1A 3PUXE 1UTBA 3SDFA 1AOVA 3L6GA 4GFRA 3LC8A 3K02A 4IGRA 3MC2A 2V3UA 5CMKA 1D3KA 3PMWA 4K3FA 2XXVA 1FQBA 3TZAA 2ALUA 1UQWA 1B1XA 5DT6A 1P1WA 4TOZA 4EXLA 1B5HA 2XXUA 5AA4A 4KCCA 1PDAA 3RPWA 1IXHA 3C31A 3SETA 2Y7RA 3VE1B 1JVXA 3G3KA 3KJTA 1HSLA 1O64A 4M4GA 4PP0A 3H3GA 1Y1MA 4DE8A 5I56A 1POTA 3E3KA 3KG2A 3TCHA 4DXCA 1IUDA 1VFEA 4X48A 1I6QA 3DP8A 4MF3A 3TMGA 1FTKA 5CMCA 2PMSA 4YMAA 4JXIA 1VE4A 1B7HA 3IJXB 4IO5A 2X26A 3O6IA 1MY3A 2AYSA 4GXAA 4PFUA 1IIWA 2I4BA 1MXYA 2OBGA 3CG3A 3CR9A 2HAUA 4O3BA 3O66A 3MBPA 4GD5A 4R2FA 3QK6A 4AB5A 1SW1A 1D4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K6XA 1PC3A 5FTIA 3C36A 1B51A 2E0SA 3RUMA 1A8FA 3SKPA 4FEBA 1D9QA 2FVZA 4WEDA 3ODBA 2ANJA 4JSOA 2RC9A 2A5TA 5I56B 5FHNA 2QS2A 2WEFA 3O2AA 5CRYA 2UVIA 2GFEA 4MEVA 1T0KA 4POWA 1SYIA 2OJTA 2XXYA 1EU8A 3B6WA 3CHGA 5LOMA 4YAHX 1Y20A 2NXOA 1CB6A 3LSWA 2NWJA 3VLUA 1BKAA 4N17A 3TODA 2DDKA 1DPEA 3IAZA 5IAIA 4ND9A 4XFEA 2QVRA 4OA4A 2NUVA 3QUFA 4ZEBA 2O6AA 2O1MA 3OXNA 4O8MA 1IEJA 4GWUA 1A99A 2Z8FA 4IR8A 4FBPA 2I3WA 2VD2A 3OO6A 2H4IA 3D1RA 3K2DA 1XS5A 3LUYA 3ZKLA 1OVTA 3K6UA 1YCJA 1I69A 4F22A 2Y5LA 3HHFA 2HAVA 2QMXA 2CZKA 4FECA 3RLFE 2ZNTA 4EQBA 3PUWE 3G3IA 1Y4CA 3UA8A 1Q1KA 1MDQA 3IO4A 3MJNA 5I57A 2ZXTA 4P47A 1JQFA 2HQ0A 2PYYA 2VP1A 1N04A 4OWDA 1NUYA 2F36A 3ZSFA 2ZNUA 1MQIA 1PB7A 3KSJA 4ZZAA 1FPBA 3SERA 4UABA 3U1OA 2I49A 3KGCA 4R9GA 4NMYA 2XWKA 3JV9A 3QXMA 4FAJA 1NNFA 4P8BA 1YTVA 4EQ9A 4P9KA 1ANFA 3JYRA 3H6UA 2PBWA 4IO7A 5KZTA 5KDTA 1NV5A 4JBZA 4PFYA 3D4CA 4QFKA 2XXQA 3IB0A 5IZ1A 2A5SA 3RT6B 1BIYA 4PDDA 4I3YA 1UTHA 4YKKA 1N7XA 1QKAA 4YICA 5DYHA 4NF5B 3GLBA 2F5XA 1NMUA 1SDXA 4N6KA 3KBRA 4H67A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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