4QSCA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltose
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter Atu4361 from Agrobacterium Fabrum, Target Efi-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 134
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qscA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qscA02
5H8HA 3SKPA 4EF1A 2QS4A 4OVJA 1R9LA 3KFMA 4ESWA 5I57B 1RYOA 3OELA 5ITOA 3O9PA 1FTOA 5L9MA 1LFIA 5CMMA 1URDA 4BDOA 3OO7A 2F7AA 3K1PA 1ZIUA 1A99A 5AA1A 1B32A 3T22A 5I59B 1B9JA 2HXWA 1RYXA 4X48A 3GBAA 4G68B 3RTFB 4EXLA 3DM0A 1P1UA 2NOOA 5ELVA 2QMWA 1Q35A 1I69A 2Z22A 5CMCA 3VLWA 4OERA 1CB6A 1MPDA 1EZ9A 4DCYA 2OBGA 4G68C 4R75A 4H5FA 2Q9TA 1VE4A 4FORA 2ZYNA 5L9SA 1DTGA 3Q29A 2I4CA 5AA2A 3UN6A 1I6AA 4LZ5A 1B4HA 5JTYA 3OMBA 2YLNA 5TPAA 3VXBA 5L9OA 5KDTB 3W9VA 3OOAA 1S50A 4GVOA 3T9UA 3KOSA 4ZS9A 4H8IA 5I59A 4F3PA 2REGA 3K6XA 1MPBA 4ONYA 3ZKLA 4DCXA 2GHBA 2P1SA 1B7HA 3KSJA 4ZE8A 2OWSA 2Q89A 4I9DA 4IO2A 3T9HB 4HCYA 1O7TA 4Z7EA 2DWIA 3SETA 2XX7A 4LVQA 4NEDA 1JNFA 3TFLA 1ANFA 3HHGA 4U4XA 2GH9A 2QS2A 4C1TA 1SD3A 3R6UA 3U1OA 3G3KA 4IB2A 2O6AA 3JV9A 1ZJLA 3WAEA 1D9VA 3SESA 4GXAA 5CBRA 4RA1A 2RC8A 2O1MA 3OO8A 1FQAA 1SW2A 1BLFA 1Y20A 3QYTA 2Y7RA 4DZ1A 4F22A 3FXRA 1Y9UA 3M3KA 2UVGA 4BDRA 1HSLA 3SERA 5FHNA 3U93A 3MW0A 3LSLA 4RK2A 3N5LA 3VLUA 3QK6A 1MDP1 3C32A 1H44A 1AOVA 4BLAA 2RCAA 3O28A 3PUVE 5ICTA 1GGGA 1Z7NE 1GR2A 2YJPA 1QULA 4QFPA 4F39A 2F7CA 3A09A 3FXQA 1LCTA 4C0RA 1H3DA 2REJA 2HAVA 2AIXA 3PD9A 4G8HA 3SEVA 1PBQA 4GL8A 1SW1A 2OCUA 2RF1A 4PFYA 3MPKA 2H99A 2XXIA 1LBCA 2RC9A 5H8NA 1B5HA 1PB7A 2V3TA 4NF8B 4P0IA 3TQWA 4POWA 4HS7A 2O51A 4JWYA 2P0SA 3V5AA 4FECA 5AE4A 3CSBA 3HV1A 2I0CA 4GF8A 4YKJA 3FJGA 3IB2A 2UYEA 4ELOA 3PMWA 2I3VA 1XS5A 4LA9A 2DVCA 4H65A 4QSEA 2THIA 4FJPA 4WKMA 2ZMBA 3ILUB 1DPEA 1FTKA 3MQ9A 4AQ4A 5JK4A 4U23A 3KZGA 3EQ1A 1BP5A 3C35A 2QRYA 4JBZA 3IL1B 3O97A 3RY3A 3M8UA 4H5GA 2Q2CA 3AXFA 1MM7A 2DYXA 1B52A 1LB9A 2VP1A 3MWBA 1Y4CA 1B5IA 4ELQA 1A54A 5EHMA 1UTHB 2IA4A 1KWHA 3TCHA 5HPQA 1B3GA 3DELB 2XXWA 5ICQA 4YKPA 1Y3PA 4NF4B 4YMAA 1ZMGA 1GTKA 1N3XA 2W7YA 2F6PA 2OK2A 4NF8A 5FHOA 5TP9B 4P11A 1US5A 4Q30B 2ZNTA 3G3IA 4GOTA 3IX1A 1MG1A 1MXWA 1N84A 2CMOA 3PUXE 2ZXTA 3QUJA 2DQVA 3HN0A 5DVJA 4JDFA 4LZ7A 1A8EA 1MY0A 1MH3A 1LAHE 2B3BA 1OIBA 4GRKA 5TU0A 3U72A 3M3FA 2F78A 3CFLA 2O68A 2Y7IA 4QFOA 1MPCA 3CR9A 3PPPA 1XT8A 2HZKA 4FEDA 2V3QA 2XXYA 3K4UA 4N6PA 1M5CA 3KBRA 1GVCA 1NKXA 3U94A 2H9BA 4FIMA 5BUUA 1US4A 1P1OA 2XXRA 4M4GA 1SYIA 1IEJA 4DDDA 3P7IA 4NF4A 1AL3A 4Z0IA 4OYVA 1O64A 5H8SA 4F3SA 4XXUA 3TKDA 1HSEA 3O66A 3BKIB 3EHUA 5AA4A 5TP9A 4YAHX 2XD3A 3GZGA 3RN8A 5DVFA 2ONKE 1XOCA 3PUYE 5KCJB 3FUZA 3SEXA 3OENA 1TFDA 1B0HA 4KD5A 2B65A 1URGA 1ELJA 4E0XA 4WXJA 1AIVA 3USDA 4H8JA 2PX1A 4MF3A 3ODBA 5DEXB 2Y7WA 1EU8A 4YB6A 4G8NA 1SI1A 4THIA 2CZLA 1POY1 2XXQA 3U8QA 1OQHA 3MVZA 5HM4B 4FAJA 4JSOA 3MP8A 1OLCA 2GFEA 3KG2A 4F19A 4MLQA 3T9VA 5CBSA 4H0WA 1ZKBA 4G77A 4R2BA 1R6ZA 1MXUA 1UQWA 1NNPA 4R6YA 2Z8EA 3C4MA 2GHAA 1XVYA 1UTBB 4ZEBA 1B3FA 1SVXB 2DWJA 2UVJA 4ZECA 1FW0A 3DLNA 3IO6A 4Q0CA 3E13X 3TTRA 4QFKA 1SW4A 3UGWA 2O69A 4WEDA 5ISUA 5KCJA 4OESA 3WAFA 4KQPA 4YU0A 1BTJA 1B58A 2PBWA 3O6GA 5ITPA 3N26A 3G3GA 2UVHA 3RNNA 2G93A 3K2DA 4LATA 1MQHA 3L6HA 3CIJA 2DE3A 5DEXA 1MH4A 3MP6A 1MQJA 4GXSB 2I6EA 1FQEA 1B1HA 4XKQA 3C34A 5I57A 4F3BA 3TTMA 4DE8A 2Q88A 1UIUA 5K2YA 4JB7A 4JXIA 4TOZA 3D4CA 2F7BA 4H6DA 5I2KB 4R2FA 5HBCA 2XHDA 3LSFB 4JWOA 4XKRA 3QUFA 3RT8A 3C33A 2Q8JA 1B0LA 3MC2A 4UA8A 4YB7A 5EHSA 2UYFA 5JEIA 4FEBA 2ESNA 4PQJA 3H7MA 2NXOA 4IY6A 4G68A 3UP9A 2ZNUA 1MY4A 4XTCQ 1MDQA 2V3UA 1R1NA 3PD8A 1S7YA 2FNCA 1MQDA 1POTA 4FE8A 3G7WA 4I8CA 4YB5A 3RPWA 1USYE 1IXHA 2X26A 3THIA 2AL4A 2H5YA 3K0VA 1VFEA 1N0TA 4RXLA 5AA3A 3ONMA 3PPOA 5CRYA 4NE4A 2XXUA 2D21A 3PGFA 1JVXA 2PYYA 1FTMA 4ISUA 1ATGA 1AMFA 3C9HA 3UIFA 4X1DA 5I56B 3VV5A 4PFTA 4LONB 3U92A 3C36A 1GV8A 2RINA 1JVYA 1N76A 3MVYA 3TCFA 1F9BA 4F1YA 4H1XA 3PMVA 1A8FA 4GWOA 5KDTA 2P2AA 4MBPA 3OD7A 1LAXA 2R9JA 3IOVA 3QIMA 3K1MA 3KN8A 3K02A 4ECFA 3VFJA 1TFAA 1S9TA 3D4GA 3MBPA 1TXFA 1T0KA 1URSA 2KLFA 3HCQA 2V25A 3K00A 2GRVA 5I2NB 4DIGA 2VGQA 2HAUA 3UK4A 4EDPA 3GXAA 3HPIA 2XXPA 4IY5A 5KZTA 4MFIA 4KYDA 2AYSA 2O84X 3CRBA 3VXCA 1VSOA 3FGSA 3EHSA 2OJTA 1M5EA 3H6UA 1IQ7A 1FQCA 4NMYA 1B3EA 4OENA 5F7VA 3FVOA 4OEVA 4OMBA 1FCKA 4O3CA 1MM6A 3T9XB 3TMGA 2XXTA 1DOTA 5I56A 3TTKA 1NNKA 3TCGA 2DWHA 2H4IA 1B05A 2IEEA 4R9GA 5H8QB 1MXYA 3A3CA 1QVSA 4I62A 4KCCA 2QMXA 1EZOA 4KYSA 2DVZA 5CM6A 1IXGA 2OLBA 1P1QA 3PU5A 5CC2A 3LR1A 4IGRA 2A5TB 4KFQA 1PDAA 4JSDA 2PT1A 2XXXA 1FTJA 4NF6B 2XXHA 2DE2A 1LFGA 3H6VA 2QS3A 1I6BA 3RT6B 1IXIA 3CFZA 2ALUA 4WEPA 3E3KA 3S2VA 3M3LA 5I58B 4R6HA 2LAOA 3LSWA 4QSDA 4BDNA 4DXUA 3MZ9A 4F1VA 3IB0A 1NNTA 4KHZE 4Q8RA 2YPNA 2UVIA 4XKPA 4H67A 1HSJA 5H8FB 3G3HA 1LFHA 1P1NA 1EZPA 1NNFA 1JEVA 1VR5A 3IB1A 3KSXA 4ESXA 4NWCA 3IJXB 3I6VA 1A55A 3EF7A 4EUOA 2I3WA 3SDFA 5L8DA 4G4PA 2XX9A 3FVNA 3K6WA 3B6WA 5K2XA 1MXZA 1SYHA 3V8XB 1Q1KA 4C1UA 3BFUA 1UIVA 2Z23A 4QF9A 1LBBA 5H8HB 3W15C 4U21A 3OO6A 3TUSA 5F1QA 4R74A 3E4RA 5DVIA 3MAMA 1B7UA 2ABHA 2ZNSA 3O6IA 4X1BA 1UTHA 3O6HA 2ZYKA 1SBPA 3H03A 1JEUA 4LP2B 4U1OA 3KEIA 1EH3A 2E1SA 4NF5B 3EHTA 4PP0A 5AA2D 2A5SA 1MXVA 4LQ5A 1ZTYA 4ZEIA 2H25A 1O63A 3MJNA 2F5XA 3MVWA 1D4NA 4IO7A 4OHNA 1B51A 5B7DA 3VVFA 4U4SA 4EQ9A 4F29A 3S9MC 3SEYA 3JZJA 2DE4A 3IK6B 1MS7A 3TYHA 5BWJA 5LOMA 1LCFA 2ZYOA 3BBRA 2D3IA 1D9YA 3S4UA 2E0SA 3OO9A 1RKMA 3T96B 3B6QA 2Z8DA 4FATA 4OZ9A 1Z7ME 3LC8A 2PVUA 3H3GA 4IO3A 1XHYA 3S9LC 3KJ7A 2NUVA 5J1DA 4R6KA 5CMBA 3GLBA 1I6QA 4QFLA 1BKAA 4IO6A 3H4ZA 3IORA 4HTGA 1DSNA 5CI5A 2R6GE 1CE2A 3E9XA 5FTHA 1H43A 1A40A 1DMBA 1MY3A 5AA2B 2V93A 1BIYA 2X7QA 3TDJA 3ZKKA 5JTYB 1JW1A 1XVXA 5M2VA 4LQ2A 3MP1A 3V83A 3PPQA 4GL0A 1AH5A 3VLVA 5TPAB 4HCWA 2M8CA 4NF5A 3PPNA 1MQGA 2RKMA 2O7IA 1FQDA 3MUQA 3LSXA 4I1DA 3MVXA 3FVGA 4OFJA 1MQIA 1Y1ZA 4ZEFA 1QKBA 3ZSFA 1LAFE 1WDNA 4KPTA 1MRPA 1PEBA 4GD5A 2OWTA 4EF2A 4ELRA 4X9TA 1QW0A 4EQBA 1M5FA 4RPOA 3PV0E 3VVEA 3FVKA 2DXYA 4RK9A 4ND9A 1TWYA 1IZ1A 4G2ZA 2X7PA 1P1WA 3FV1A 1NH8A 3IOUA 1M5BA 1Y1MA 1JW5A 3PPRA 2AL5A 2FYIA 3PUWE 4POXA 5A5XB 3S9NC 4ZEDA 1OVTA 3FZVA 3TTNA 3O2AA 2PMSA 3Q26A 4U2RA 1QUIA 4F2QA 1H76A 4O3BA 3IR1A 1B46A 3EPEA 1SW5A 4RPNA 3GBBA 2XXVA 5IAIA 1NFTA 1SQYA 4PETA 1UTBA 1XC1A 3FIRA 3MPLA 3OSQA 4L17A 2O1LA 2DWAA 3MZBA 2ONSA 1FQFA 3N94A 1H45A 2RC7A 5DYHA 4UACA 4N07A 2DXRA 4EXKA 1NMUA 3K6VA 4GFRA 4Q5TA 3K6UA 4KYEA 1ZBMA 4RJZA 4QHQA 1ZLQA 4U22A 4F3GA 3PMXA 4DXBA 4RNSA 3OSRA 2RCBA 3TZAA 1TT1A 4TQUQ 1PC3A 3QAXA 3L6GA 1N3WA 3ZS6A 4ZEKA 1M5DA 4ZE9A 3IOWA 4ZZEA 5A5XA 3RTWB 3K1NA 4M1VA 2I58A 1B4ZA 1NH7A 1QKAA 4MH5A 4QFNA 5H8NB 3F11A 5I2KA 3CG1A 2DOJA 4U1ZA 3Q28A 2DSFA 1FTLA 3I5OA 2NWJA 1JQFA 4IGTA 1B6HA 4PE5B 3R7XA 3VVDA 2Y7KA 1IIWA 2BJJX 3S9EA 3W9WA 4OTEA 5I84A 2F6GA 4JWXA 4TLLB 1QUJA 3H6TA 2HQ0A 2F97A 3QSLA 3R26A 4YMBA 3UA8A 4F2OA 3RUMA 1LLSA 4QRZA 3V89B 4OWDA 4GQOA 4GIZA 3SEUA 4YKKA 1II5A 4AB6A 4ZDMA 2QS1A 1B2HA 4YZZA 1A7LA 3HSTA 3N6UA 1IXCA 1SI0A 3G3JA 4HW8A 1JETA 4R72A 1B1XA 1PB9A 2H98A 2QJEA 3KN7A 1B3HA 2ANJA 1NL5A 5IKBA 5CMKA 1WODA 2O7UA 2Q2AA 5DTBA 1B40A 2B3FA 2I4BA 3UORA 1L5TA 3FASA 1OVBA 1WVJA 2QSXA 5DT6A 4E0WA 3N6TA 3CFXA 4GLIA 1FQBA 2HZLA 2VD3A 1LSTA 4KR5A 4YKIA 3LUYA 3K01A 4BDLA 3EN3A 1LAGE 5EYFA 4IO5A 4ELPA 4KI0E 4IO4A 1QUKA 4OFOA 1YCJA 2I49A 3OXNA 3TEPA 2ZYMA 5I2NA 4ZZAA 1D3KA 3DP6A 3VDFA 4EQ7A 1Y4TA 3FV2A 3KJTA 3DP4A 1LGBC 4DLDA 3O29A 2DS9A 5B70A 2R71A 1B3LA 2UXAA 2QPQA 2F35A 4N13A 2NVUB 2HFBA 1N7WA 1R9QA 2I0BA 2WKYA 1MXXA 4BDQA 1MY2A 3VE1B 3RQTA 1DPPA 2OZZA 3FJ7A 1P99A 1Y3QA 3QXMA 2ONRA 1OQGA 4OEUA 2VOZA 3PUZE 3HO7A 4XIGQ 3C31A 1IUDA 2F36A 3I3VA 3CG3A 2QL3A 2VHAA 3T66A 2HEUA 5FHMA 2Y84A 3H06B 4PFUA 4F31B 5AA4B 3KOTA 5H8QA 1YTVA 2F8DA 3B7DA 3CSGA 1OMPA 4XKNA 1IITA 1USYH 4QSCA 3FATA 1VFDA 3CVGA 1MY1A 4NWDA 3H6WA 1ZU0A 3IAZA 2VD2A 4RYAA 1YAEA 2XD2A 3DP8A 2Y7PA 3Q25A 4F18A 2PT2A 4OQOA 1J1NA 2A5TA 3A3UA 1PB8A 3FXUA 3KGCA 1DTZA 2DP8A 4AB5A 3IJOB 3G3FA 3IO4A 4DXCA 4NF6A 4OFLA 4P0GA 4MLVA 4RY1A 3KN3A 2XX8A 3OEKA 3TPAA 1Y3NA 2V84A 4YICA 3CI8A 4R73A 1YPNA 1B5JA 3TELA 4TLMB 1N7XA 3FD3A 2G29A 1JW4A 3Q27A 5I58A 3TQLA 2FA7A 4KCDA 1B7ZA 3BFTA 3HHFA 3LBSA 3ILTB 4R9FA 3TAJA 2F34A 1N04A 5H8FA 4BDMA 3TTLA 4OETA 4PFWA 3RLFE 3RGYA 3TODA 1OLAA 2I48A 2Z8FA 3FJMA 3JYRA 4O3AA 4LUBA 3B6TA 4K3FA 4F1UA 4LZ8A 4G8MA 3ECRA 1PBPA 2D5WA 1SDXA 3MZ1A 3IOTA 4NTLA 2HCAA 3OEMA 3SEWA 1QJMA 3T93B 5FTIA 1LB8A 4OXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H8HA 1EYIA 3SKPA 4EF1A 4X04A 2QS4A 4OVJA 1R9LA 3KFMA 4ESWA 5I57B 1RYOA 3OELA 5ITOA 3E78A 3RPLB 3O9PA 2XWKA 1FTOA 5L9MA 4HE2A 1LFIA 1FPLA 5CMMA 1URDA 4BDOA 3OO7A 1NI9A 2F7AA 3K1PA 1ZIUA 1A99A 4MNPA 5AA1A 1B32A 3T22A 5I59B 5EQ9A 1B9JA 2HXWA 1RYXA 4X48A 3GBAA 4G68B 3RTFB 4EXLA 3DM0A 1P1UA 2NOOA 5ELVA 2QMWA 1Q35A 1I69A 2Z22A 4N8GA 5CMCA 3VLWA 4OERA 1NV1A 1CB6A 1MPDA 1EZ9A 4DCYA 2OBGA 4G68C 5IZ3A 4R75A 4H5FA 2Q9TA 1VE4A 2Q8MA 4FORA 2OX3A 2ZYNA 5L9SA 4PE3A 1DTGA 3Q29A 2I4CA 5AA2A 3UN6A 1I6AA 4LZ5A 2Q74A 2WX9A 1B4HA 5JTYA 3OMBA 2YLNA 5TPAA 3VXBA 5L9OA 5KDTB 2PFZA 3W9VA 3OOAA 1S50A 4GVOA 4P56A 3T9UA 3KOSA 4ZS9A 4H8IA 5I59A 4F3PA 2REGA 3K6XA 1MPBA 4ONYA 3ZKLA 4DCXA 2GHBA 2P1SA 1B7HA 3KSJA 4QBAA 4ZE8A 2OWSA 2Q89A 4I9DA 4IO2A 3T9HB 4HCYA 4NQ8A 1O7TA 4Z7EA 4P3LA 4OA4A 2JJKA 4GX6A 2DWIA 3SETA 2XX7A 4LVQA 4NEDA 1JNFA 3TFLA 1ANFA 3HHGA 2WBDA 4U4XA 2GH9A 2OWZA 2QS2A 1SD3A 3LV0A 4C1TA 3R6UA 3U1OA 3G3KA 4IB2A 2O6AA 3JV9A 1ZJLA 2CZIA 2FBPA 3WAEA 1D9VA 1FPKA 3SESA 4GXAA 5CBRA 2XXKA 4RA1A 2RC8A 2O1MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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