4QSCA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltose
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter Atu4361 from Agrobacterium Fabrum, Target Efi-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
total genus 134
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qscA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qscA02
5IAIA 1M5CA 2DYXA 1MQJA 2O84X 5A5XB 1FQDA 3G7WA 3TFLA 5JTYB 4EUOA 4ZEDA 1N76A 3Q29A 1SBPA 4LONB 5JEIA 1II5A 4EF1A 5CC2A 3OO8A 5J1DA 1ATGA 2XXYA 4IGRA 2DXRA 1N0TA 1Z7ME 3U94A 5TU0A 2PT1A 1VR5A 5FHOA 5H8QA 5I57A 4O3AA 1MPDA 4OFLA 4FECA 1MQDA 1RKMA 4RY1A 4OYVA 4U4SA 4GQOA 1R6ZA 1B5JA 3MVYA 3RT6B 3RLFE 4NF8B 3FXQA 2PMSA 3CI8A 3ECRA 4R72A 1L5TA 4ZEKA 3IB1A 2I49A 1S7YA 3K6WA 4KYEA 2PBWA 1B7HA 4ZZEA 3MW0A 5AA2A 4U1OA 1Q35A 4PE5B 1ZIUA 4OENA 1MPBA 3QSLA 2HFBA 3TCGA 1Y9UA 4DXBA 3O66A 5ICQA 4U2RA 4R6KA 3PPPA 1Y4CA 5LOMA 4PFYA 3ZKLA 4F18A 1B05A 2HAVA 4NWCA 3EF7A 2A5TB 4JXIA 5KCJA 2GFEA 1GR2A 3SEYA 2V3TA 3K1PA 3MZBA 4GL8A 3TZAA 4YKKA 4OESA 5CRYA 1B0LA 3FXUA 3ONMA 3IO6A 1AH5A 1B7ZA 1TFDA 5K2YA 4BDQA 1MY0A 3JYRA 2X26A 4FE8A 4FORA 1P1OA 3VLWA 3C9HA 1FTLA 2Y7IA 4P11A 1QKBA 1YAEA 1SYIA 2H99A 4R74A 3HV1A 1IUDA 2V3UA 1A54A 1WDNA 1IXIA 1B46A 1MH3A 4N13A 3KZGA 1PBQA 3IX1A 1MM7A 2QSXA 1BTJA 4UACA 4I8CA 1SD3A 1XOCA 2Q8JA 4RK9A 3QXMA 4JBZA 4F3BA 3ILUB 1JW5A 3S9EA 1FQBA 1QJMA 4RJZA 1A40A 3E3KA 3W9VA 4IGTA 1H44A 4FIMA 5I58B 1URGA 4WKMA 2B3BA 4LUBA 1H43A 5B70A 1FCKA 3C32A 2O68A 3S9LC 1GTKA 1IQ7A 1US4A 3RGYA 2Z8DA 4Q8RA 1LBBA 3GBBA 2O51A 5DYHA 2REGA 5H8FB 4NE4A 4QSCA 3PMVA 2Q89A 3FVKA 1PB8A 3T96B 2UYEA 1B1HA 3RN8A 5KZTA 2XD3A 5A5XA 2F7BA 2B65A 5JTYA 3TKDA 3IO4A 4N6PA 1MM6A 1QUKA 2Y7RA 4YICA 3SETA 5ELVA 3MQ9A 1SDXA 3K6VA 4JWYA 1EZOA 1LCTA 3TMGA 1SQYA 3KG2A 3U92A 4F29A 2DVZA 3OEKA 4YMBA 4F1YA 1MY2A 2GH9A 3O9PA 3KOSA 2H5YA 3I3VA 1AMFA 4XXUA 4NF8A 2DOJA 1XHYA 1N3XA 4OQOA 2NUVA 4YKIA 4IO3A 1JNFA 1P1UA 5HPQA 4F3PA 1MPCA 1B40A 3D4GA 1Y1ZA 4EXKA 4TLMB 2ZYKA 3U1OA 5EHMA 1DTZA 1Y20A 1LB9A 4JB7A 3TQWA 2F36A 2VHAA 2RCBA 2AIXA 4F2QA 5ITPA 2A5TA 2I4CA 4OFOA 1FQCA 1NL5A 4YAHX 3Q28A 2ABHA 4R2FA 2R9JA 4LVQA 2RKMA 1IIWA 1VSOA 5I59B 3T9XB 1LGBC 1DSNA 3Q27A 3UA8A 5DTBA 3C35A 3N5LA 4EXLA 3G3FA 1BP5A 1B5HA 5EYFA 5I2NB 3T9VA 4OZ9A 2OLBA 2PX1A 3LBSA 1D9VA 3E13X 4ZE8A 3KN3A 3CG1A 3UK4A 4KYSA 1B9JA 3KN8A 4U4XA 2O1MA 5CI5A 2VD2A 3TUSA 2ONKE 3Q25A 2DWJA 3A3CA 3W9WA 3FD3A 4F1VA 1LFHA 4GF8A 4HTGA 1QVSA 3G3JA 1FTJA 2QMWA 1QULA 4POWA 3PUXE 3AXFA 3FJMA 1YTVA 4G68C 5CMMA 3SKPA 1OVTA 4GXAA 3I5OA 2A5SA 4KFQA 5DVJA 3O97A 4C1TA 3O6HA 5I58A 2XXWA 4KCDA 3VVEA 3LSXA 5DEXB 1SW2A 4YKJA 3MPKA 4IO6A 1UIUA 2W7YA 1VFDA 1LSTA 3T9UA 1Y3NA 1ZU0A 2CZLA 3C34A 2H9BA 1D9YA 3OXNA 5H8HB 4NF4B 4ZZAA 5HM4B 4LZ5A 4BDRA 5H8FA 5I2KB 1SI0A 1SI1A 3N94A 1MY1A 1R1NA 2GHAA 1MY4A 4QFLA 4DIGA 5AA1A 2RC9A 3RNNA 2ALUA 2AYSA 4MLVA 4RPNA 3QK6A 1T0KA 1UQWA 1I6AA 4MFIA 2P2AA 4RNSA 5DT6A 3S9NC 1ANFA 1LCFA 1JW4A 2DS9A 3SEXA 2H25A 3TTLA 4C1UA 1PBPA 4MLQA 1LBCA 4M1VA 3KSJA 1EH3A 3OOAA 4WEDA 1AOVA 1MDP1 4G8HA 4F31B 3TEPA 2D3IA 4O3BA 2CMOA 4IB2A 1SW5A 4G8NA 5L9SA 2ZYNA 4DXUA 1HSEA 5ISUA 4QFNA 3FVOA 3LC8A 2V3QA 4QSDA 4KR5A 3KSXA 3PD9A 4FEDA 4Z7EA 3L6GA 5TPAB 1AL3A 2V84A 3IL1B 4F3GA 4ZE9A 1URDA 4OFJA 1IXCA 3VLVA 3TAJA 3M3FA 4DCXA 3T9HB 2RC8A 4AQ4A 2QPQA 1QUJA 3MP1A 3QUJA 5JK4A 3E9XA 3RPWA 2NXOA 2E0SA 4N07A 3LUYA 1JW1A 4BDLA 2OCUA 4C0RA 2IEEA 3O2AA 3O28A 2B3FA 1RYXA 5F1QA 2D5WA 2Z22A 3DP4A 1EU8A 4JWOA 2I58A 2UVJA 4QF9A 4EDPA 2GRVA 5I59A 3KEIA 4GRKA 4GIZA 3CFZA 4OERA 4G68B 2QJEA 3LR1A 4RPOA 3IR1A 3PMWA 3FATA 5I2NA 1MQHA 1P99A 2FA7A 2O69A 4QRZA 3WAFA 1R9LA 1GV8A 2I0CA 3R26A 4FEBA 1UTHB 3HHFA 4P0GA 1S50A 4YZZA 3GBAA 1IZ1A 4YU0A 1H3DA 4IY5A 1FQAA 2XX8A 2F7CA 2DE2A 5H8NB 1P1QA 3TTRA 3FIRA 4R73A 4WXJA 4MBPA 4EQBA 2XD2A 3ODBA 4Q0CA 3QIMA 3PV0E 4MF3A 2ZMBA 3V8XB 2REJA 3IB2A 4X1DA 1ZKBA 5CMBA 1QKAA 3OELA 3D4CA 3PPRA 4IO4A 2UVGA 5DEXA 4U23A 1NH7A 4GVOA 4RK2A 5AA3A 3TDJA 4BDNA 3T22A 4H67A 4E0XA 2RF1A 3RQTA 1MXXA 4ONYA 3ILTB 3THIA 2FNCA 3OENA 2O6AA 3RTFB 2V25A 4JDFA 2DXYA 1BKAA 1EZ9A 4R6YA 3V5AA 4KHZE 5H8HA 4KYDA 4DZ1A 4LZ8A 2HXWA 3FVNA 4OTEA 3K6UA 3B6TA 4OETA 1B32A 5I2KA 3ZKKA 5K2XA 3B6QA 1MRPA 3HO7A 3BFTA 4BDMA 4E0WA 1POTA 1MY3A 3VVFA 2QL3A 1B51A 1Q1KA 4G2ZA 1MS7A 2UVHA 1POY1 2VP1A 4XTCQ 5FTIA 2OJTA 1LFGA 3OO6A 1ZBMA 1NFTA 1FQEA 1P1WA 1JVXA 3MJNA 4LATA 3DP8A 4QFKA 5I84A 3MBPA 4OVJA 3U72A 1ZTYA 2I3WA 1SVXB 4I1DA 3HHGA 3TCFA 4H65A 1B0HA 2ZNUA 3Q26A 4ISUA 2XXVA 5HBCA 2XXHA 2Y7PA 1MXUA 2HZKA 2Q88A 4R9FA 5TPAA 1SYHA 3FUZA 4H6DA 1EZPA 2OZZA 1OQGA 4GXSB 5FHMA 1B3LA 3FASA 4AB6A 4NEDA 3O29A 3IOVA 3SDFA 4ESWA 2AL4A 4DDDA 2UYFA 3C4MA 2H98A 3USDA 3B6WA 2Z23A 3SESA 1FTMA 2DP8A 4ZEBA 3K01A 4OWDA 3RTWB 1O63A 4TLLB 3C33A 3MVWA 4X48A 1Y4TA 1MXVA 1M5FA 3C31A 3FV2A 4H8JA 2QS1A 1NMUA 2XXTA 1PC3A 4G8MA 1PB7A 4G68A 3KGCA 4QHQA 4AB5A 3OO9A 2XXIA 2Y7WA 3CR9A 2O7UA 4OEUA 1URSA 1B3HA 5BUUA 1M5EA 4DE8A 3O6GA 3KJTA 2NVUB 2R71A 3L6HA 4FATA 2IA4A 3LSLA 3DLNA 4IO5A 1UTHA 4KPTA 3QUFA 4UA8A 1ZLQA 4ESXA 2M8CA 4PP0A 1MDQA 3KFMA 1HSLA 1Y3PA 2XHDA 1GVCA 5AE4A 2Q2CA 2DWAA 4L17A 4G77A 2DQVA 4X9TA 3KJ7A 4ELRA 4HS7A 3CFXA 4QFPA 4I9DA 5H8NA 3JV9A 1PB9A 4GLIA 1B6HA 3H4ZA 1TXFA 2XX9A 1DPPA 4NF5B 2D21A 1I6QA 4K3FA 3K2DA 1LAXA 4PFTA 2R6GE 3EHTA 4I62A 1A8FA 3BFUA 4ZEIA 3PPOA 1YCJA 1Z7NE 1DOTA 1UTBB 4ZEFA 2PVUA 3H06B 2F8DA 2VD3A 4IO7A 2BJJX 4R75A 4ZDMA 3UP9A 1B3GA 4PQJA 3U93A 5CBSA 2P0SA 3IOTA 5M2VA 1P1NA 4XKRA 1OIBA 1MXYA 5I56B 3FXRA 5AA2D 4EQ7A 3CRBA 3N26A 3MVXA 4RYAA 3R7XA 4PFUA 1OMPA 5CBRA 2F35A 1MQGA 3LSFB 4QSEA 2ZNSA 4F19A 1DTGA 3FJGA 3S2VA 3CVGA 4ZECA 2I48A 5IKBA 2UXAA 4OHNA 1BIYA 4F2OA 1D4NA 4F39A 4H5FA 3VVDA 4JSOA 2DE3A 2ONSA 5TP9B 3K02A 3MVZA 1BLFA 1QUIA 3C36A 1PDAA 1O64A 3CSGA 3OEMA 3DM0A 3TTKA 2F5XA 5L8DA 2PT2A 1FQFA 2Z8EA 4GFRA 4H1XA 3GXAA 2I4BA 4RA1A 4U1ZA 1VE4A 4ELPA 3K6XA 1D3KA 3MZ9A 1B7UA 4Z0IA 4Q30B 2HEUA 3GZGA 3M8UA 3FZVA 4BLAA 3H6VA 4IO2A 1IXHA 3BKIB 2ZXTA 4RXLA 3OMBA 3VE1B 2P1SA 1B4ZA 4NWDA 1TT1A 1NNTA 2F78A 3W15C 1SW1A 4NF6B 4GD5A 2PYYA 3QYTA 2THIA 3B7DA 4NMYA 3SEUA 2G29A 5ITOA 3DELB 3TPAA 3JZJA 3TCHA 4F1UA 3BBRA 1LFIA 1RYOA 2F6PA 3PPNA 3FVGA 2RCAA 4XKPA 4ND9A 1ZJLA 3VXCA 2XXRA 1S9TA 2XXUA 1A55A 3OO7A 3CFLA 3P7IA 1LB8A 2QMXA 4YB6A 3O6IA 2I6EA 1OLAA 1H76A 2KLFA 3PPQA 4TQUQ 3IAZA 3PUVE 4KI0E 4H0WA 1MG1A 4PETA 1A7LA 3EHSA 3HPIA 4ELOA 4LZ7A 4BDOA 3S4UA 2G93A 3RT8A 2XX7A 1JQFA 2V93A 4NTLA 4LA9A 3EHUA 4EF2A 1FTKA 5AA4B 1NKXA 3PUZE 3TODA 4X1BA 4O3CA 2X7PA 3H3GA 2DE4A 4U22A 4F3SA 2VGQA 1YPNA 2OK2A 4HCYA 1SW4A 4GOTA 2H4IA 1M5BA 3H7MA 1LLSA 3QAXA 4POXA 2XXXA 1OQHA 3K00A 3N6UA 1USYE 2OWTA 1B4HA 5H8SA 3RY3A 4TOZA 3ZS6A 1O7TA 1LAHE 4NF5A 2F34A 2I0BA 3CSBA 5DVFA 3EPEA 4R6HA 5CMKA 4HW8A 4ECFA 4GWOA 4KQPA 3IORA 4YB7A 3PMXA 1A8EA 1KWHA 3UIFA 1UTBA 2ZNTA 4LP2B 3G3KA 1IITA 1GGGA 1I6BA 3N6TA 1TFAA 3OSQA 5KDTB 5F7VA 1NNPA 3IOWA 1N3WA 1XS5A 3MZ1A 5I56A 1ELJA 1J1NA 2HCAA 3VXBA 4NF4A 2Q9TA 3H6TA 3MC2A 3OSRA 1B58A 4G4PA 3IJXB 2X7QA 2F6GA 1N7WA 1ZMGA 2HAUA 4R2BA 3DP6A 2Z8FA 1AIVA 1WVJA 1R9QA 2ONRA 1JETA 3MPLA 5TP9A 3HCQA 4DXCA 1QW0A 2LAOA 1LAFE 2F97A 4M4GA 1MXZA 5DVIA 3MP6A 5L9OA 1H45A 1B1XA 3VV5A 3R6UA 3VDFA 1MH4A 3OD7A 2QS2A 1Y1MA 3HN0A 4U21A 3FGSA 1PEBA 2XXQA 4P0IA 4KCCA 1LAGE 3CIJA 1B5IA 1IEJA 3FJ7A 3MUQA 3EQ1A 1OVBA 3HSTA 1JEVA 2DSFA 5H8QB 5I57B 3V89B 3F11A 3K4UA 4ZS9A 4FAJA 3TELA 4XKNA 4XIGQ 1B3FA 1N7XA 4NF6A 1B52A 4YB5A 3UORA 2WKYA 2OWSA 3H03A 3I6VA 2DWIA 4R9GA 1US5A 4HCWA 3T66A 3K0VA 3MAMA 4H5GA 4ELQA 4EQ9A 1B2HA 1NNKA 1VFEA 3WAEA 3FV1A 5AA2B 3A3UA 2ZYMA 1USYH 3PUWE 3S9MC 3M3KA 5CM6A 3KBRA 1FTOA 4YMAA 3MWBA 2NWJA 3IB0A 1MXWA 2DVCA 4Q5TA 3G3IA 4IY6A 5KCJB 3TTNA 3PGFA 1N84A 1UIVA 3RUMA 5AA4A 3PD8A 2QRYA 4MH5A 3PUYE 2RINA 3E4RA 2UVIA 1CB6A 2ANJA 5L9MA 3A09A 4DCYA 1JEUA 2Q2AA 2GHBA 3KN7A 2Y7KA 1M5DA 4LQ5A 2OBGA 2RC7A 2YLNA 2FYIA 1DPEA 1XT8A 1CE2A 5BWJA 2Y84A 3GLBA 3TYHA 2YPNA 4GL0A 2QS4A 1A99A 3MP8A 1FW0A 2F7AA 4H8IA 1HSJA 1IXGA 1B3EA 3M3LA 1TWYA 3V83A 3ZSFA 2VOZA 1DMBA 3U8QA 3G3GA 3PU5A 2HZLA 4FJPA 1I69A 5CMCA 3T93B 5ICTA 4OMBA 5EHSA 4F22A 3H6WA 5KDTA 2XXPA 3KOTA 1NH8A 4OEVA 1N04A 3VFJA 5FTHA 3IK6B 5FHNA 2QS3A 4XKQA 4PFWA 2HQ0A 3UN6A 3CG3A 3TQLA 3LSWA 3SERA 1XVYA 3UGWA 3EN3A 4JWXA 2NOOA 3IJOB 4WEPA 2YJPA 3H6UA 1Y3QA 2O1LA 3SEVA 4KD5A 4JSDA 1F9BA 2O7IA 5B7DA 2DWHA 2AL5A 3IOUA 2E1SA 4YKPA 1WODA 4QFOA 4LQ2A 1MQIA 1JVYA 1XC1A 3G3HA 3TTMA 2ESNA 4DLDA 1NNFA 3VLUA 2ZYOA 3SEWA 2I3VA 3K1NA 4THIA 3K1MA 1XVXA 4OXVA 1OLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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