1SI1A

Crystal structure of mannheimia haemolytica ferric iron-binding protein a in an open conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADKGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for iron binding and release by a novel class of periplasmic iron-binding proteins found in gram-negative pathogens.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Mannheimia haemolytica
molecule keywords iron binding protein FbpA
total genus 126
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si1A02
1P1UA 1LCFA 2V25A 3ZSFA 5ISUA 4Q8RA 5JK4A 1GR2A 1VFEA 4NEDA 4FAJA 4H5GA 4TOZA 2DWAA 3QK6A 3GBAA 1JEVA 1DOTA 3IB2A 3PUZE 1BIYA 4DDDA 3E4RA 3TMGA 1F9BA 4GFRA 3T9VA 3N94A 3IB1A 1B7ZA 4JXIA 1PEBA 4HTGA 3TDJA 2F7AA 3TCHA 2H9BA 3FVKA 2P2AA 1HSJA 1SW4A 2I49A 3IOWA 1NFTA 1M5BA 1NL5A 4E0WA 4XKRA 1B58A 4QFNA 2VD2A 3Q28A 3FXQA 3W15C 4BLAA 5TP9A 2DP8A 3K00A 5AA2D 3TAJA 4F1YA 3UA8A 4XKNA 1MG1A 1SDXA 4IB2A 1MQJA 4LP2B 3CR9A 1TFAA 1OLAA 4NF8A 3SEXA 1SQYA 2E0SA 2O1LA 1MPBA 4U22A 5F1QA 5AA1A 5DVIA 3DLNA 2Y7PA 4OXVA 4ONYA 4DLDA 4U21A 1N3XA 3RTFB 1Y20A 1FQDA 2I0BA 3DP6A 1OVTA 4LATA 3QUFA 5H8NB 1DTGA 1B5JA 3O97A 4Z0IA 3EHTA 4EXKA 3OOAA 3MW0A 4JWXA 4OETA 4LZ8A 4U4SA 2OCUA 1WODA 3PV0E 4LZ7A 2ESNA 4QFKA 1ZTYA 3C4MA 4EUOA 4NF4B 4KCCA 4RPOA 4HCWA 5CM6A 3S4UA 3CFZA 1NMUA 2X7QA 1Y1ZA 3OENA 3UN6A 5I2KB 3Q26A 2XXTA 4I8CA 2Z23A 2NOOA 3T9HB 2PVUA 4X9TA 2YJPA 1XOCA 5IAIA 1H3DA 5I59B 5H8FA 3U94A 1Y3PA 4DCYA 3THIA 1O7TA 2V84A 5CMCA 3PPOA 3G3IA 4KD5A 4GF8A 4BDMA 1O63A 5DYHA 3JV9A 1LB8A 3VVFA 3OEKA 4EQ9A 1S50A 2OWSA 1QUJA 3G7WA 3VE1B 1N7WA 4GQOA 2UVIA 4HW8A 3IORA 2VD3A 2RC9A 4OTEA 4G68A 3N6TA 4OFOA 3C35A 5KDTB 4KR5A 1AH5A 4TLMB 1MXUA 1UTHA 2HAVA 4GXAA 4R6HA 4EXLA 3SERA 3IAZA 3KBRA 1GV8A 3ILUB 3TTKA 1ZBMA 1TXFA 4F1VA 3G3GA 1MY1A 2YLNA 4G68C 4F18A 2ZMBA 1YCJA 4KCDA 3PMVA 1ELJA 4R73A 2P0SA 4WXJA 3FJMA 3M3FA 5FHMA 4IO7A 3C34A 4QFOA 3MUQA 3VV5A 3RLFE 1CB6A 1POY1 3T9XB 1MDP1 4C0RA 3TUSA 3RY3A 3KOSA 1MQGA 3MAMA 1LAHE 3DELB 5A5XA 3VLUA 3PPRA 2HFBA 1TFDA 4QSEA 4YB5A 2XXIA 3OD7A 1JW1A 2XXHA 3F11A 2ZNTA 2H25A 4F3PA 5KCJA 4R9GA 4F39A 4WKMA 3FXUA 2Y84A 2Z22A 3PD9A 3R7XA 1P99A 2X26A 4XIGQ 3KFMA 4F3BA 5H8SA 3M8UA 2DQVA 1Z7NE 5ICQA 4YKPA 1RYOA 4U2RA 4HCYA 2OZZA 1N7XA 1SI1A 1ZU0A 1B1HA 2Y7KA 4JSDA 1OQGA 4JBZA 4LVQA 1B4ZA 4U1OA 1ZMGA 4ZS9A 2PX1A 5CC2A 1P1OA 4EDPA 2H99A 2ONSA 2Y7WA 5H8HA 3TKDA 3LR1A 3K1NA 3M3KA 4H67A 2X7PA 5DEXA 2XXYA 1B05A 2REGA 2Y7IA 1I6BA 3V83A 1LLSA 4C1TA 3E9XA 5CBSA 4QSCA 3EQ1A 5DTBA 2GRVA 4F3GA 4P0IA 2QS4A 4TLLB 1MH3A 3S9NC 2Q89A 1XC1A 2DE4A 5ITOA 1JW5A 2XX7A 2Q2CA 3LSXA 2YPNA 1B4HA 2KLFA 2I58A 2XD3A 3MC2A 3QIMA 4AQ4A 5EYFA 3ILTB 1JVXA 5K2YA 3IOTA 3K6VA 2QMXA 4NF5B 3Q25A 5AA4A 3TPAA 4H65A 2A5SA 4WEDA 5H8QB 2VP1A 4OEVA 3VXCA 2QRYA 1B51A 2XX9A 4ELRA 3TQWA 1LBBA 2G93A 3FUZA 3A3CA 1DTZA 1PDAA 4PFUA 1M5FA 1MXZA 4ZEDA 4LQ2A 4XKPA 3CG3A 4YU0A 2REJA 1LFIA 3SESA 4P11A 4DZ1A 3PUVE 1B3LA 3O6GA 4OYVA 4LQ5A 3CFXA 4H6DA 3MWBA 1B40A 5I56A 3T66A 1US4A 1FQAA 4F3SA 2UYFA 3QUJA 3HPIA 2BJJX 1RYXA 4FEDA 5JTYB 2D21A 2DXYA 5AA2B 4N6PA 3H6TA 3GLBA 1IXIA 4LONB 1MXYA 2F7BA 3FATA 2VHAA 2XD2A 2F36A 3PPNA 5M2VA 3OO8A 4EF2A 4RA1A 2QSXA 2HZKA 5JEIA 3K4UA 4GWOA 1O64A 3B7DA 3LSWA 1NNTA 4XKQA 1B5IA 1UIVA 4H1XA 3U93A 3IO4A 1PBPA 2XXVA 5ELVA 3IOVA 2UXAA 2RC8A 2XXRA 4YMAA 4ZECA 1XVYA 4C1UA 4WEPA 1JW4A 2F78A 1D4NA 4I9DA 5TPAA 1I6AA 2H5YA 4RXLA 1B0LA 2F35A 1N76A 3MVZA 4U23A 4EF1A 3IX1A 4XTCQ 5L9SA 2OJTA 2FYIA 1IIWA 4F31B 4ZDMA 3SETA 4K3FA 4FE8A 3CIJA 3FASA 5EHSA 1EU8A 1M5EA 4F2QA 4MBPA 4U1ZA 3N5LA 4GL0A 1QVSA 3EHUA 4R72A 1AOVA 2HCAA 3KSXA 2D5WA 1B5HA 4TQUQ 4PFYA 1URGA 3VVEA 5CMMA 4O3BA 2O84X 3ZS6A 1D9YA 1B52A 3FIRA 3SKPA 3ONMA 4R2FA 2V93A 3L6GA 1ZKBA 1Y4TA 1FQBA 1VE4A 1NNFA 4JWOA 1Z7ME 3UORA 4H5FA 4PFWA 3M3LA 4IO2A 2ZXTA 1R9QA 1UQWA 3OO6A 4H8IA 4KFQA 4QHQA 4YZZA 5DVFA 2DOJA 2DE3A 1QUIA 4QSDA 2RC7A 4NWCA 4G2ZA 1MQIA 1QUKA 4UA8A 4BDOA 4PE5B 3O6IA 2VOZA 3H06B 2CMOA 5EHMA 3MP8A 5H8NA 2O69A 4ISUA 4N13A 3MPLA 3L6HA 2Z8FA 3RPWA 3SEUA 2F34A 1SBPA 4YKIA 1UIUA 4YICA 2G29A 3CFLA 1QULA 1UTBA 4EQ7A 4MFIA 4IY6A 4NF4A 4RYAA 3MP6A 4HS7A 4N07A 1Y3QA 2H98A 5I59A 4KYEA 1IQ7A 2ZYKA 4NF6B 2HZLA 1MY4A 3RN8A 2DE2A 1NNPA 1HSEA 1IXHA 2F8DA 4NMYA 4Q5TA 1VSOA 3CSGA 4KPTA 1FTKA 4FATA 1L5TA 4KQPA 3LBSA 2UVJA 3TCFA 3K6WA 1MQHA 4ELOA 4FORA 4R74A 3JYRA 1FQFA 5KDTA 4YKJA 1N3WA 1SYHA 2V3TA 4YB7A 1FTJA 1Y3NA 3OO7A 2DYXA 4G77A 3I3VA 3DP4A 3MZ1A 3W9VA 1B3GA 1B3HA 5I58A 4RY1A 2ONRA 1NH7A 3O2AA 1MDQA 1EZOA 1QKAA 3KOTA 1AMFA 2ANJA 3VLVA 3KGCA 3CG1A 1B6HA 1ZIUA 3G3FA 3PPPA 1R1NA 3HO7A 3MVWA 5CMKA 1MXVA 4RJZA 4G8MA 2B65A 1LFGA 1P1WA 2DS9A 5CBRA 2XXUA 3EPEA 1MS7A 1ATGA 4L17A 4KYSA 2NXOA 2XXWA 5FTHA 3LSFB 4DXUA 1I6QA 1IXCA 3TYHA 4R6YA 3MQ9A 3QSLA 4LUBA 3MZ9A 4DXCA 2Z8EA 3T96B 2O1MA 3RTWB 5F7VA 3UIFA 3EN3A 5ITPA 5BWJA 3RT8A 5A5XB 1MM7A 3K01A 1H45A 3O6HA 2PBWA 3FJ7A 2XX8A 3G3KA 4OENA 3V5AA 1XT8A 4NE4A 1M5DA 5KCJB 3H6UA 4QFPA 2DWIA 4YKKA 3T9UA 5I57A 3KG2A 3PMWA 1MRPA 4BDNA 5FHOA 1OMPA 3O28A 4ZE8A 3KN7A 3TODA 4DIGA 1URDA 4X1DA 3U1OA 1MXXA 2AYSA 4FIMA 3O9PA 2RF1A 5I2NA 3PU5A 1BKAA 3EHSA 3VXBA 4OVJA 1QJMA 1QW0A 1SI0A 3C9HA 3IB0A 3HN0A 5L9OA 5AE4A 4R75A 5H8HB 4OMBA 3HCQA 1S9TA 3TTRA 2QL3A 4JDFA 3USDA 3KSJA 1GGGA 3CVGA 1KWHA 1PBQA 4MH5A 5H8QA 3IK6B 3OSQA 3Q29A 3FD3A 3S9MC 1USYE 2ZYOA 4R6KA 4GD5A 3IO6A 5K2XA 3K6UA 3OSRA 3MPKA 4ZZAA 4M1VA 3JZJA 4OEUA 2Q8JA 1D9VA 2I6EA 2HXWA 4OQOA 1JQFA 2A5TB 3FZVA 4IO4A 1XHYA 5JTYA 1NKXA 1RKMA 5J1DA 3CI8A 5AA2A 3IJOB 2AL5A 1PB9A 2Z8DA 3SEVA 5BUUA 1PB8A 3N26A 3H7MA 3TELA 3K02A 1YTVA 3RNNA 1FW0A 1J1NA 3DM0A 4ZZEA 4ZEBA 3DP8A 4ESWA 1PB7A 1Y9UA 4G8HA 4XXUA 1WVJA 1FCKA 2O6AA 2LAOA 5KZTA 3R6UA 4ZEKA 1OQHA 4O3CA 3BBRA 4AB6A 3TTNA 4ND9A 4ELQA 3H3GA 4G8NA 2AIXA 4R9FA 3VDFA 1FTMA 2PT2A 3VLWA 3U8QA 3CRBA 2B3FA 4Q0CA 4F29A 1NNKA 1LSTA 2IEEA 3BFUA 3IJXB 2XXXA 1DMBA 1QKBA 4KHZE 1II5A 4ZEIA 4MLVA 3IL1B 2FA7A 2ABHA 5AA3A 4JSOA 3V89B 1US5A 4NWDA 1LAXA 1SW5A 1CE2A 1A8FA 1A55A 3ZKLA 2DSFA 2OBGA 3SEWA 2ZYMA 3OO9A 3CSBA 2V3QA 3C33A 1N0TA 3E13X 5TPAB 1JVYA 3RUMA 1DPEA 4OESA 3R26A 5IKBA 2ZNUA 3O66A 4DCXA 3QAXA 4X1BA 3N6UA 1MY2A 4OWDA 1P1QA 4ECFA 2F6GA 4JWYA 2NVUB 4BDRA 3OXNA 1OVBA 4GLIA 2RINA 5ICTA 2DXRA 4DE8A 3RT6B 3FVGA 3PD8A 5L8DA 4ESXA 5B70A 1T0KA 2HEUA 3B6WA 3AXFA 2XXPA 1VFDA 1IXGA 4MLQA 3KN3A 1AL3A 2M8CA 1SW2A 2CZLA 1LAFE 1GVCA 4PQJA 3IOUA 1B7UA 1JNFA 1VR5A 1Y1MA 1Y4CA 3C36A 1ZJLA 3KJ7A 5TP9B 3HHFA 1A8EA 2QJEA 4GXSB 3VFJA 1DPPA 1XS5A 4NF8B 1LFHA 1B3EA 3IR1A 2DWHA 5CMBA 4FJPA 4F1UA 2GFEA 1MH4A 3FXRA 3FJGA 1MXWA 2QS2A 4E0XA 5HBCA 1HSLA 3K0VA 5I2KA 3C32A 4H8JA 4IO5A 3P7IA 4NF6A 1MM6A 2B3BA 2VGQA 1A54A 1EZ9A 4IO6A 2ZYNA 4U4XA 4POWA 2Q88A 3EF7A 3PPQA 3OELA 1DSNA 1UTBB 3C31A 3OEMA 2Q9TA 4G4PA 2XHDA 3SDFA 3HSTA 4BDQA 1JETA 4OFLA 4YMBA 3KJTA 3LSLA 3K2DA 4UACA 2GHAA 2E1SA 1S7YA 4EQBA 1MQDA 2O51A 3VVDA 1LB9A 1BLFA 2F5XA 1USYH 2OK2A 3BKIB 3TQLA 5H8FB 3E3KA 4QFLA 2XXQA 1PC3A 1POTA 1M5CA 2V3UA 3U72A 1IZ1A 3OMBA 5DT6A 2R9JA 4ELPA 3T93B 2GHBA 2F7CA 3B6QA 4X48A 3WAFA 1Q1KA 3B6TA 3MBPA 5DVJA 1OLCA 3S2VA 2R71A 2IA4A 2NUVA 5FHNA 2DVCA 3H4ZA 4NTLA 2R6GE 2OLBA 4G68B 4IGTA 1N04A 2D3IA 4OHNA 1H44A 1UTHB 4RPNA 4GIZA 4R2BA 5L9MA 3TTLA 2Y7RA 2W7YA 1SD3A 3FVNA 1BP5A 1FQEA 4ZE9A 3PUXE 3D4CA 3Q27A 3BFTA 3V8XB 5I58B 1GTKA 1P1NA 1BTJA 1YAEA 1AIVA 1ZLQA 4RK9A 2FNCA 5HPQA 1Q35A 4FEBA 3TFLA 4OFJA 3UK4A 3GBBA 2NWJA 3T22A 4GL8A 3D4GA 2QS1A 3TZAA 5TU0A 2THIA 3GXAA 3G3JA 1MY0A 2QMWA 2Q2AA 4RNSA 4PP0A 4GOTA 1R9LA 1D3KA 4IGRA 3A3UA 1N84A 4QF9A 1B2HA 4ZEFA 1WDNA 4LZ5A 2AL4A 2I0CA 3ZKKA 1TT1A 3MVYA 1EZPA 3FGSA 3MZBA 3U92A 1R6ZA 4DXBA 2OWTA 2F6PA 1URSA 4IO3A 2GH9A 3MJNA 3TCGA 4OERA 3RQTA 2I48A 1A40A 2I4BA 3GZGA 3TTMA 4PETA 1LGBC 3H03A 1SVXB 2O68A 5CRYA 3K1PA 3ODBA 4O3AA 4KYDA 4P0GA 1FQCA 2PT1A 3WAEA 4YB6A 4Z7EA 1IUDA 2F97A 5I84A 3QXMA 1YPNA 2QS3A 2ONKE 5I57B 3S9LC 3O29A 3FV2A 4OZ9A 1B7HA 1OIBA 2HAUA 3TEPA 3RGYA 5DEXB 3K6XA 4F19A 1MPDA 3PUYE 4FECA 3MVXA 4NF5A 1B46A 1SW1A 4JB7A 5I2NB 2DVZA 3HV1A 2RCBA 2UVGA 2RCAA 3KEIA 3PUWE 3LUYA 1I69A 2RKMA 3KZGA 1B0HA 5LOMA 1JEUA 4RK2A 1A7LA 4M4GA 4YAHX 2UYEA 1EH3A 3SEYA 1FTOA 3LC8A 4IY5A 3FVOA 2O7IA 2A5TA 3G3HA 4H0WA 1ANFA 1B9JA 3S9EA 2PYYA 3FV1A 3H6VA 4BDLA 5AA4B 1XVXA 4PFTA 4GVOA 5B7DA 3PGFA 4MF3A 4QRZA 4GRKA 1H76A 5FTIA 2QPQA 2I4CA 3I6VA 1LBCA 1B1XA 1B32A 4KI0E 5HM4B 1TWYA 2O7UA 3HHGA 3ECRA 1SYIA 2I3WA 4I1DA 3W9WA 2DWJA 4POXA 4Q30B 4AB5A 1IEJA 4I62A 3UP9A 1NH8A 1H43A 1IITA 2H4IA 2PMSA 1FTLA 5I56B 3PMXA 4F22A 2HQ0A 3I5OA 2I3VA 4THIA 2P1SA 2WKYA 3K1MA 1A99A 2ALUA 1MY3A 3A09A 2ZNSA 3H6WA 3KN8A 4LA9A 3QYTA 3UGWA 4F2OA 1B3FA 1LAGE 5CI5A 1MPCA 1LCTA 2UVHA 3MP1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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