1SI1A

Crystal structure of mannheimia haemolytica ferric iron-binding protein a in an open conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADKGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords iron binding protein FbpA
publication title Structural basis for iron binding and release by a novel class of periplasmic iron-binding proteins found in gram-negative pathogens.
pubmed doi rcsb
source organism Mannheimia haemolytica
molecule tags Metal binding protein
total genus 126
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si1A02
5IAIA 4POXA 3DLNA 5I2KA 4XKRA 4LA9A 3O2AA 1Y3PA 4YICA 4GFRA 2X26A 2ALUA 5AE4A 4LZ5A 2DE3A 4E0WA 1FW0A 1LFHA 1B4ZA 2Z8EA 3KN8A 1B7ZA 2AL5A 2O69A 2YPNA 5HM4B 2XXRA 2Q2CA 1TWYA 4OQOA 5H8FB 2O7UA 3KGCA 3IK6B 1H45A 1MM6A 5KCJA 1USYH 4TOZA 3FD3A 4OFJA 3C9HA 1MXZA 3U93A 3VVFA 4JSOA 3L6GA 2I0CA 1URGA 3CFZA 4EXKA 3RUMA 3H3GA 3R7XA 3V5AA 1ATGA 1FQDA 2AL4A 3OELA 3MWBA 2Q89A 2WKYA 4Q0CA 1FTOA 1QVSA 1OMPA 4IGTA 5CMKA 5JEIA 1I69A 2DWJA 4F3BA 3RPWA 1B05A 1PDAA 4ZE8A 4I1DA 4F22A 2RC7A 5I56B 1B5JA 1XHYA 2XXYA 5EHSA 4C1TA 2BJJX 4U21A 1JEUA 3I6VA 1US5A 2QJEA 3JV9A 2O84X 1DPEA 3GZGA 3U8QA 1BLFA 3EQ1A 4RJZA 4TQUQ 3FJMA 1MQDA 4X1DA 2XXXA 1Z7ME 4FIMA 3IOVA 4F1YA 5CC2A 2HXWA 3IO6A 2KLFA 1N3XA 5CM6A 4ZZAA 3MBPA 2F36A 4JBZA 2E0SA 3TPAA 2H4IA 2HCAA 1B9JA 3W9VA 3RQTA 4F31B 4O3AA 2Y7KA 3TKDA 4QFLA 1AH5A 3O6GA 3FVGA 3MZBA 2ZYMA 5CMMA 5H8QB 1LGBC 3W9WA 5I2KB 3K2DA 1LAGE 4KPTA 2REJA 2PYYA 4F18A 4LVQA 4WEPA 4G4PA 2FYIA 2IA4A 4PFYA 1DMBA 3ECRA 3EHTA 3VDFA 2Y7WA 3TTRA 1BKAA 3KFMA 4LQ5A 4YMAA 1ZBMA 4YB7A 1R1NA 3VLWA 4ZS9A 4RA1A 2PX1A 1SQYA 4U23A 1UTBA 4F19A 1QW0A 3GXAA 2GHBA 2UXAA 2Q2AA 3K1MA 4OWDA 4EQ9A 1OIBA 4JWYA 3FIRA 2O7IA 4M1VA 3MW0A 1QJMA 3VE1B 3E9XA 2I58A 4XTCQ 3IOUA 3ILTB 4Q30B 4YKIA 3WAFA 4X9TA 4H8IA 3T9VA 1FQFA 3MP1A 3PPPA 3Q29A 5AA2B 3TAJA 1A7LA 4IO3A 5AA4A 5BUUA 2Y7RA 3TDJA 5JK4A 4GVOA 1MXUA 4QFKA 1B3FA 5CBSA 4ZDMA 3E4RA 1DTGA 2HAVA 4H5GA 4XIGQ 4ZZEA 3B6TA 4F39A 1MPDA 1P1UA 1QUIA 2F35A 3R6UA 1N84A 2DVCA 4HCWA 1LB9A 2ZYKA 1VFEA 5I59A 5A5XA 1LBBA 3TTNA 1JETA 4U2RA 3DP8A 1XOCA 1Y4CA 1I6BA 1PBPA 2F6PA 5I84A 3G3FA 3JYRA 4IO5A 4O3CA 3U72A 1Y3NA 3N6UA 3OEMA 2P1SA 1MXVA 3FVNA 4GIZA 3IB1A 2ONKE 1VSOA 2ZNTA 3OO7A 1WVJA 2GH9A 3K4UA 3M3FA 3C35A 4FJPA 3N6TA 2F7AA 3T96B 4RYAA 3UP9A 5L8DA 4AB6A 3KZGA 3HHFA 4XKPA 1N7WA 4DDDA 3MP6A 2DSFA 1MY2A 3FV2A 2UVGA 4O3BA 1ANFA 4M4GA 1OQHA 4C1UA 1GTKA 3MZ1A 3IJXB 4ZEIA 2QL3A 2OCUA 5H8FA 3IOWA 4GL0A 4QRZA 1P1NA 5KZTA 2XX7A 3UN6A 1IQ7A 5F7VA 4OFLA 2VOZA 1LCTA 2OZZA 3IO4A 4BDMA 3GBAA 4IY6A 1MG1A 3FUZA 1MPBA 3WAEA 3O66A 5KDTB 5AA4B 4ESWA 3EHUA 3CRBA 4BDOA 4KFQA 4OMBA 2HAUA 1URDA 2R9JA 3G3HA 3T93B 2XXVA 3H6WA 3MVXA 4PFWA 3RGYA 2DYXA 3K0VA 2A5TA 1EU8A 3QXMA 2Z22A 5I56A 2B3BA 3RTFB 3TEPA 5A5XB 3SEXA 1P99A 4PE5B 2H98A 4R6YA 3VLVA 1D9VA 1Y9UA 3CG3A 3CG1A 4ND9A 5H8NA 3PUZE 1M5FA 2NUVA 4QF9A 3VVEA 1JW1A 1FCKA 1MXWA 5DTBA 3BFTA 1J1NA 3MPKA 1NFTA 1HSEA 3G7WA 4Q8RA 4BLAA 4GRKA 5B7DA 4EQBA 1D3KA 1MQIA 2UYEA 2XXWA 2Y7PA 4U22A 1L5TA 4EXLA 3KSXA 1MXXA 4RPOA 1B40A 3VFJA 4FAJA 4IO6A 4FEDA 2UVIA 3V8XB 4F1VA 3FV1A 2ZMBA 1B5HA 5LOMA 1DTZA 1VR5A 1P1WA 5K2YA 2I49A 1MY0A 5DEXA 4MLVA 2F34A 1EZPA 1N76A 3KSJA 5CI5A 1A54A 4JXIA 3UORA 4EDPA 2NWJA 1OLAA 3O97A 3CSBA 3FZVA 1II5A 3PD8A 3PUXE 4RK9A 4KHZE 1R6ZA 4U4SA 3PUWE 4P0IA 2I4CA 1LLSA 3H6VA 3OO9A 2OWSA 2M8CA 3RN8A 3FATA 3PPRA 3A3CA 2VD3A 2G93A 5M2VA 1CE2A 3LUYA 4NWCA 4G2ZA 5J1DA 2V3QA 3H6TA 2V84A 4L17A 4OVJA 4FE8A 4R73A 1JW5A 3E13X 1IUDA 1PBQA 4OFOA 4GLIA 3FASA 4IB2A 4OEVA 3FVOA 5AA2A 2A5TB 3T66A 3G3KA 3UGWA 3ILUB 2ANJA 2QS2A 3FXRA 3OO6A 4ELOA 4OENA 5FHNA 5H8NB 2QRYA 3PMVA 2I0BA 1I6AA 1POTA 3O6HA 1TT1A 4NF8A 4QSDA 3UA8A 3V83A 3IAZA 1AIVA 1O64A 2I6EA 2DOJA 2Q88A 4YB5A 4F2QA 1PB9A 1XVXA 2XD3A 3ZKLA 1B32A 3IL1B 3D4GA 4PQJA 3RTWB 5H8HA 4HCYA 3SEUA 1B4HA 4U4XA 2DWHA 2XX8A 4JWOA 5AA2D 1VFDA 4DXBA 4OETA 2XXHA 1UQWA 1PB8A 4R9GA 3H4ZA 3FJ7A 2Y7IA 4YKKA 5AA3A 2V93A 2HFBA 4U1OA 2NOOA 1DOTA 1ZU0A 5DEXB 3TFLA 3U94A 4UA8A 1UIVA 4N6PA 2CZLA 4PP0A 1LFGA 2F7BA 3HPIA 2UVHA 1O63A 2NVUB 4IY5A 3W15C 1P1OA 3DP4A 4EUOA 2ZYOA 3TZAA 2I3VA 3MVWA 3LSFB 3QIMA 3VVDA 3EF7A 1BIYA 4LUBA 3MUQA 3THIA 4ONYA 1BP5A 3E3KA 4IO4A 1NNKA 2XD2A 2HZLA 3HV1A 3TTKA 5DVFA 2HZKA 2OJTA 1DPPA 3MVYA 4BDQA 3BBRA 5HPQA 3DM0A 1RYOA 3IB2A 4AB5A 3O6IA 4F29A 4H65A 2IEEA 3LR1A 4R75A 3RNNA 1QUJA 3B6QA 5KDTA 4LP2B 1B2HA 3C4MA 3OENA 1NH8A 2B65A 4RK2A 3N26A 4RPNA 3PMWA 4R6KA 1FQEA 2W7YA 3PPOA 1USYE 2XXTA 3D4CA 3M8UA 4NF8B 3KN3A 4NF6A 4BDLA 5EYFA 3S9LC 1N7XA 3FXQA 1O7TA 4OEUA 3OSRA 4NE4A 3IOTA 2ESNA 4TLLB 4XKQA 4EQ7A 3M3LA 5H8HB 3K6XA 4OZ9A 3T9XB 1GGGA 3C32A 3CIJA 1H3DA 5DVIA 3O28A 3G3GA 3B6WA 3S9EA 4GWOA 1LAFE 3BKIB 2I48A 1MM7A 5ICQA 1RKMA 3ZS6A 2GRVA 1SW4A 3SDFA 2X7QA 2DQVA 3EHSA 3JZJA 3QAXA 2D21A 3K1PA 1SI1A 1IXIA 3VXBA 3IJOB 1TFAA 1A8FA 2XXQA 4F1UA 2THIA 4GL8A 3LBSA 4OESA 3UIFA 3OO8A 3T22A 1A55A 5CMCA 4LQ2A 3TTLA 4DXCA 1B3GA 1NNFA 2AIXA 3A09A 1S7YA 4WKMA 2OK2A 2DWAA 3RLFE 1FTKA 3PV0E 3T9HB 1CB6A 3TQLA 4I8CA 3MC2A 1MQGA 3O9PA 4P0GA 4H67A 4Z0IA 1SI0A 1B7HA 2DWIA 3CI8A 1OQGA 1SW2A 3C33A 4YKPA 4PETA 3KOTA 4OHNA 2I4BA 3MAMA 3GLBA 3OOAA 4KD5A 3QUFA 5K2XA 1QKAA 1OLCA 1US4A 5DT6A 2P0SA 2G29A 4JDFA 1PEBA 2XXIA 2ZXTA 4MH5A 3K02A 1EZOA 3TODA 3H7MA 4QSEA 1SBPA 3KG2A 1GV8A 4Q5TA 4NF6B 1OVTA 1SW5A 5CMBA 2UYFA 4FORA 2ONRA 5I58B 3QK6A 1IITA 1IEJA 1B3EA 1IIWA 4F2OA 3CVGA 1A99A 4UACA 4KR5A 4KYDA 1MQJA 1XVYA 2QS3A 4DLDA 4I62A 4RXLA 1B46A 1DSNA 5JTYB 4DZ1A 1NMUA 4YAHX 3CFLA 1N04A 3QYTA 1RYXA 4HW8A 2Q8JA 1Z7NE 3FJGA 4KCCA 4ZEFA 1KWHA 4PFTA 1UTHA 1GVCA 3DP6A 3UK4A 3U92A 5ELVA 1XT8A 4QFNA 3K1NA 5FHMA 1Q35A 4LZ8A 3LSXA 2F6GA 2PT2A 4DE8A 1IXCA 2ZYNA 4F3PA 1ZKBA 3PMXA 3OEKA 5BWJA 3LSLA 4HS7A 5DVJA 1T0KA 3KOSA 4XXUA 3KBRA 5ITPA 2B3FA 2VP1A 5CBRA 3BFUA 4JWXA 4NF4A 4FECA 2QS4A 1LCFA 4MLQA 4H6DA 1H43A 2Q9TA 4X1BA 1MS7A 4RNSA 4N07A 2RCBA 3H6UA 4KCDA 4NTLA 2RINA 4JB7A 2D3IA 3B7DA 3TCFA 1SDXA 1XC1A 3TYHA 4R72A 5TP9A 2PT1A 5H8SA 4QHQA 2REGA 1N0TA 3IX1A 1NKXA 4K3FA 2F8DA 3C31A 2FA7A 2RF1A 1ZLQA 2XXPA 2E1SA 1FQAA 3SEVA 3OSQA 1LFIA 1A40A 4F3SA 4G8HA 4G8NA 4LZ7A 2H25A 5F1QA 2VGQA 1B0HA 1HSJA 4IGRA 1SYIA 3MP8A 3MPLA 5TU0A 2GHAA 1LBCA 2Z8FA 3ZKKA 3HSTA 4R74A 1QULA 4OTEA 4ELQA 1SVXB 4GF8A 3VLUA 1YAEA 3K01A 1JVYA 3GBBA 5ITOA 1M5CA 4ZEDA 3TCGA 2VHAA 4H1XA 2YJPA 3SKPA 1H76A 4ESXA 2R6GE 1GR2A 3RT6B 1UTHB 1FQBA 1MDQA 2H99A 2Z8DA 5L9SA 2O1MA 5TPAB 2DS9A 2YLNA 1NL5A 1LAHE 2A5SA 3MVZA 4EF1A 4R9FA 3H06B 3ODBA 2OBGA 2ONSA 3KJ7A 1ZMGA 1MY4A 4YU0A 3USDA 4R6HA 1NNTA 2O51A 4IO2A 3CFXA 3A3UA 4MBPA 1LAXA 1MRPA 4QSCA 3Q27A 3IR1A 2CMOA 4NF4B 1TFDA 1B5IA 5ISUA 1B1XA 4MFIA 4THIA 2DXRA 4ELRA 2UVJA 4RY1A 2LAOA 3U1OA 4R2FA 3SERA 2ABHA 3R26A 5L9OA 2V25A 4G68C 3PUVE 1S50A 1JNFA 4R2BA 3MZ9A 1QUKA 5I2NA 3Q25A 4QFOA 4OXVA 5TP9B 3EPEA 5KCJB 3EN3A 4ZE9A 2NXOA 1AL3A 2OLBA 3K6VA 4BDNA 1UIUA 4HTGA 1FTLA 2O68A 3HO7A 3N5LA 1MDP1 3P7IA 1F9BA 1LSTA 1YPNA 4NF5A 1Y3QA 3PPNA 3G3IA 1ELJA 1MY1A 4YB6A 1Y1MA 3VXCA 2DE2A 4LATA 1ZJLA 3AXFA 4DXUA 2DXYA 4I9DA 3SESA 3HHGA 1M5BA 1MH4A 2VD2A 4G68A 3CSGA 4JSDA 1EZ9A 1JQFA 4YKJA 1A8EA 1B0LA 3ZSFA 3T9UA 3S4UA 2RC9A 2FNCA 2F5XA 2X7PA 1NH7A 3MQ9A 3C34A 1M5EA 4OERA 5ICTA 4ZEBA 4P11A 1M5DA 3VV5A 3I5OA 5AA1A 5I58A 3MJNA 2HEUA 2QS1A 4YMBA 1JVXA 3SETA 3TCHA 4GXAA 3SEWA 2XXUA 5IKBA 4GQOA 2R71A 1R9LA 1MPCA 3S9NC 4LONB 2Y84A 1BTJA 1D4NA 1Y1ZA 1YCJA 2QMXA 5JTYA 1HSLA 1AOVA 4NWDA 2AYSA 4ECFA 4ZECA 3G3JA 4IO7A 1NNPA 4H5FA 1I6QA 2H9BA 2F7CA 2Z23A 3FGSA 1D9YA 1B6HA 1Y20A 2DVZA 3TELA 3OD7A 1FTMA 2RKMA 2XX9A 4F3GA 3PGFA 3KJTA 3Q26A 3O29A 4OYVA 4GD5A 4WXJA 4KYEA 2ZNSA 1EH3A 1POY1 5CRYA 1B3HA 5DYHA 3HCQA 5I2NB 5I57A 4X48A 3RT8A 3TTMA 1FQCA 1SYHA 1UTBB 5FHOA 1B7UA 2F97A 3PU5A 1B51A 1IZ1A 2OWTA 1P1QA 3TUSA 5L9MA 4NF5B 3KEIA 2F78A 4N13A 3HN0A 1VE4A 1PC3A 3F11A 5B70A 3TMGA 2H5YA 3L6HA 3PUYE 2QMWA 4KYSA 5FTHA 2PBWA 4G68B 1WDNA 5FTIA 1IXGA 1QKBA 4EF2A 1MH3A 1SW1A 1S9TA 3I3VA 3TQWA 3N94A 4TLMB 1LB8A 4G8MA 2GFEA 2XHDA 3PPQA 4POWA 3PD9A 1URSA 4DIGA 4G77A 3SEYA 1YTVA 2O6AA 2P2AA 1TXFA 1B3LA 1B58A 4GXSB 3K00A 1R9QA 1B1HA 3S2VA 4U1ZA 2O1LA 4NEDA 4QFPA 4E0XA 3H03A 1N3WA 2RC8A 4WEDA 3FVKA 4KQPA 2V3TA 4Z7EA 3FXUA 2DP8A 5HBCA 5I59B 3DELB 3K6WA 1MQHA 1OVBA 1B52A 4FEBA 2ZNUA 1SD3A 2QSXA 4ELPA 3LC8A 2RCAA 4PFUA 3V89B 1MXYA 1PB7A 4GOTA 3OMBA 3S9MC 3QUJA 1JW4A 3IB0A 1Y4TA 1FTJA 2V3UA 3IORA 2D5WA 4H0WA 4C0RA 4NMYA 1JEVA 1ZIUA 4YZZA 4FATA 3Q28A 2I3WA 2DE4A 5EHMA 1XS5A 5TPAA 4MF3A 2PMSA 3C36A 3KN7A 3ONMA 3QSLA 4XKNA 2QPQA 4KI0E 3RY3A 1ZTYA 4AQ4A 1AMFA 4BDRA 4H8JA 3OXNA 4ISUA 4DCXA 1WODA 3LSWA 1IXHA 3M3KA 4DCYA 4ZEKA 2PVUA 2HQ0A 3K6UA 5I57B 1Q1KA 1MY3A 5H8QA 1H44A 3CR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IAIA 4POXA 3DLNA 5I2KA 4XKRA 4LA9A 3O2AA 1Y3PA 4YICA 4GFRA 2X26A 2ALUA 5AE4A 4LZ5A 2DE3A 4E0WA 1FW0A 1LFHA 1B4ZA 4DI3D 2Z8EA 2F3BA 3KN8A 1B7ZA 2AL5A 2O69A 2YPNA 5HM4B 2XXRA 2Q2CA 1TWYA 4OQOA 5H8FB 2O7UA 3KGCA 3IK6B 1YXIA 1H45A 1MM6A 5KCJA 1USYH 4MNIA 4OVTA 4TOZA 3FD3A 4OFJA 3C9HA 3IFAA 4I3EA 1MXZA 3U93A 3VVFA 4JSOA 3KC1A 3L6GA 4N6KA 2I0CA 1URGA 3CFZA 4EXKA 3RUMA 3H3GA 2XXKA 3R7XA 5IZ3A 1FPBA 3GYYA 3V5AA 1ATGA 1FQDA 2AL4A 3OELA 3MWBA 4Q0CA 2Q89A 2WKYA 1FTOA 1QVSA 1OMPA 4IGTA 5CMKA 5JEIA 1I69A 2DWJA 4F3BA 2Y5LA 3RPWA 1B05A 1PDAA 4ZE8A 4I1DA 4F22A 2RC7A 5I56B 1B5JA 4KXPA 1XHYA 2XXYA 5EHSA 4C1TA 2BJJX 4U21A 1JEUA 3I6VA 1US5A 2QJEA 3JV9A 2O84X 1DPEA 3GZGA 3U8QA 1BLFA 3EQ1A 4RJZA 4TQUQ 3FJMA 4PFRA 1MQDA 2QVUA 4X1DA 2XXXA 1Z7ME 4FIMA 4FBPA 3IOVA 4F1YA 5CC2A 2HXWA 3IO6A 2KLFA 1N3XA 5CM6A 4ZZAA 2XA5A 3MBPA 2F36A 4GWUA 4JBZA 2E0SA 3TPAA 2H4IA 4QBAA 4NN3A 2XWKA 2HCAA 1B9JA 3W9VA 3RQTA 4F31B 4O3AA 2CZHA 2Y7KA 3TKDA 4QFLA 1AH5A 3O6GA 3FVGA 3MZBA 2ZYMA 1LBYA 5CMMA 2PFYA 5H8QB 1LGBC 3W9WA 5I2KB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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