1MXZA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 um brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA01
1AH5A 1B3FA 1O7TA 2PX1A 1WODA 1OLCA 2HEUA 3FASA 1M5DA 3C33A 3TAJA 2XXPA 3K6UA 5TPAB 1LBCA 3VVFA 1YPNA 1TFDA 4DCXA 3RPWA 1BP5A 3TKDA 3RGYA 4JB7A 4RJZA 3MPLA 3ZKLA 1FQCA 1LB8A 4ZEKA 4NF4A 2E1SA 5AA3A 2XXHA 3H6UA 2O1LA 4KR5A 1P1WA 4MFIA 3OO6A 5FHMA 2DVZA 3IOWA 1B7HA 1XVYA 1SYIA 2F7CA 5CMCA 3GZGA 4IY5A 1B5HA 1FW0A 5H8QA 1JVYA 1JEUA 3K6XA 4FEDA 1GGGA 3E9XA 3Q27A 4KCDA 5H8QB 2QS1A 3U92A 5DVJA 4G8NA 5L8DA 5AA4A 5AA1A 4H8JA 4EXLA 4KFQA 3O6GA 4U4XA 1A40A 5CC2A 1QW0A 4IB2A 5AA4B 3KFMA 3GXAA 4H8IA 1MPBA 3SKPA 1JW4A 2Z23A 4LP2B 1LGBC 4F2OA 4BDLA 3MZ9A 4GXAA 1IXCA 4EXKA 4QRZA 3PD8A 2P0SA 4YB7A 4MLQA 1FQDA 3SEVA 2XXTA 3G7WA 2AL5A 3M3KA 4NWCA 3PPPA 1VE4A 1R1NA 1GTKA 3Q25A 4YKIA 3IL1B 3JYRA 3FJ7A 3C32A 2V93A 3PMVA 3IB1A 4F31B 4TQUQ 3H03A 2XX8A 3MVXA 4H0WA 3I6VA 1MY4A 2ONRA 3UIFA 3IX1A 3EN3A 1A8FA 4DIGA 4ELQA 3LR1A 4GRKA 1PBPA 3FVKA 4OZ9A 4PQJA 3KOSA 3WAFA 5L9SA 4FE8A 1FTOA 2GHAA 4KI0E 2Q89A 2ESNA 1YCJA 1PB7A 5I2KA 4F3BA 4QSEA 5H8HA 4BLAA 3PPNA 3THIA 5M2VA 2X7PA 3IJXB 4JXIA 2Q88A 2ZXTA 2XD2A 1MQDA 5H8HB 4OEVA 4EQ9A 4GXSB 4QF9A 1QJMA 3QUJA 4ND9A 2P1SA 1N7WA 2O69A 3KBRA 1LLSA 3K2DA 1BKAA 2AIXA 1MM6A 3UORA 4OETA 4RNSA 2DYXA 2P2AA 2ANJA 2NOOA 1B1HA 4N6PA 4MLVA 1EZPA 3TEPA 2RCBA 3BBRA 1MXXA 2FYIA 3RTWB 4K3FA 1MPDA 2XXXA 4FECA 4IO3A 3HO7A 4OESA 4GL8A 3FIRA 4F3SA 1J1NA 4NF6B 4QFKA 3V89B 4YICA 5TP9A 4GQOA 3K01A 3OEMA 4H5GA 5ITOA 2UVGA 2OBGA 2QRYA 4R75A 2O84X 5I59A 3OSRA 3R6UA 1TXFA 4OHNA 3KSJA 3TODA 3VE1B 2O51A 1JW5A 1I6BA 4O3AA 3G3FA 4Z0IA 3TTNA 3Q29A 1MQJA 4E0XA 5L9OA 2DWAA 4M1VA 4F2QA 1IZ1A 1IXIA 1SD3A 2B3FA 5CM6A 3LSXA 1NNPA 3C31A 1SVXB 5H8NA 3U1OA 1OVTA 2QL3A 4LATA 1H76A 3KEIA 1SI1A 1S7YA 3TCHA 4H5FA 4TLMB 4ZDMA 3QSLA 4ZZEA 1URGA 1D9YA 5I56B 3HHGA 2ZNUA 3O6HA 4IGRA 1A8EA 1P1UA 1M5FA 4R6HA 2I0CA 2QPQA 3TCGA 4ESWA 5DTBA 3SETA 3MC2A 2O7IA 3MVZA 3N6TA 2QSXA 1VFDA 3M3FA 1Y1ZA 4YKKA 1POTA 5B70A 3LUYA 3IAZA 1GVCA 4JWYA 4ZEBA 3T96B 1IEJA 3E3KA 4GD5A 3SEUA 3N6UA 1Y4CA 4X48A 2VP1A 3UK4A 5ICQA 1AMFA 1FCKA 3UGWA 1YAEA 3SESA 2V25A 1RYOA 5CI5A 4LZ8A 2VD2A 4GIZA 4QSCA 4PFYA 5J1DA 2XD3A 1OIBA 5CMKA 1MXYA 5K2XA 5DEXA 4OMBA 4E0WA 1B6HA 2F34A 4LQ2A 4EF1A 5I58A 2A5SA 5DEXB 5HM4B 5I57A 2QMWA 5EYFA 2PBWA 1I6QA 2RCAA 3KOTA 3Q28A 4G4PA 1Y9UA 5I58B 3UN6A 4R72A 1XHYA 3BFUA 1PBQA 1ANFA 3PPOA 1DOTA 2DWHA 2DXYA 3DP8A 5H8SA 1PB9A 4KCCA 4OVJA 4U1ZA 2M8CA 1LCFA 3TFLA 3DELB 4X9TA 3RQTA 3TZAA 4GOTA 3B7DA 1AOVA 4ZEIA 1NL5A 1QKAA 3ILTB 3O29A 5I2NB 3LSWA 4FORA 1RKMA 4X1BA 4M4GA 3VFJA 4ELRA 2DQVA 4OQOA 3RLFE 2XX7A 4Q0CA 2OZZA 1SDXA 4G8MA 1JW1A 4BDMA 1Y4TA 3PMWA 1LCTA 4ESXA 3O66A 2VOZA 4HS7A 2XXRA 2D21A 5EHMA 1MY1A 2F6PA 2I3VA 4F19A 3T9XB 3H6VA 3FUZA 4R9GA 4H65A 4H6DA 3H06B 4UA8A 2F35A 5CBRA 4H1XA 1UTBA 4RK9A 3R7XA 1B3EA 4C0RA 4NF5A 1LAGE 4BDRA 4F3PA 1B7UA 5JTYA 3VLVA 3T9VA 4F1VA 1B52A 4NF5B 1B51A 3KN7A 3A3CA 4NF4B 4R2BA 5CMBA 2I0BA 3V5AA 3KN8A 2HFBA 4RA1A 4RXLA 2THIA 4POWA 1FTJA 2F7AA 1DPEA 3VVEA 2VGQA 1HSLA 2UYEA 1NNFA 3WAEA 2A5TA 3LC8A 4HCYA 5ICTA 1LBBA 2V3UA 5AA2D 1IXHA 2H25A 4G68C 3QK6A 4IGTA 4GFRA 2Z8EA 1NH8A 3TQWA 3USDA 4BDNA 3TTRA 3ZKKA 3OELA 3W15C 1LB9A 3TELA 3PV0E 3MP8A 3EHSA 4F29A 1A7LA 4NWDA 1KWHA 2DWJA 1EU8A 1VSOA 2QMXA 4DXCA 5HBCA 3HSTA 3DM0A 4ZS9A 4QHQA 3JZJA 2DSFA 3S9LC 3MBPA 1B4ZA 1D4NA 2Q2AA 4Z7EA 1MY0A 4ZECA 3PUXE 1MQGA 3CFXA 1WVJA 2WKYA 4G2ZA 3O28A 3MW0A 1AIVA 2DOJA 4OWDA 4ELOA 3R26A 4G68A 4IO6A 1MXZA 1USYE 4F22A 3IORA 2ZYOA 4R74A 4JSOA 1Z7NE 4G68B 4EDPA 4IY6A 3S2VA 3S9NC 5TU0A 1II5A 1ZIUA 1ZKBA 3FZVA 4BDQA 3C36A 1M5EA 1N0TA 5FTHA 3MQ9A 5FTIA 3VV5A 3H3GA 4QFPA 4XKNA 2ZYNA 3H4ZA 3OEKA 2Y7KA 3HCQA 1B3GA 3IR1A 3T22A 4FEBA 1CE2A 4KHZE 2R71A 2R9JA 3IB2A 3KN3A 3GBBA 5I2KB 3CFZA 3I5OA 2V84A 1R6ZA 3OO8A 2GRVA 2G93A 3K02A 3OENA 3ECRA 3S9EA 2DWIA 4FJPA 3PU5A 3CIJA 2REGA 1H3DA 4LA9A 1TWYA 2OWSA 1MDQA 3L6GA 4ZE8A 2RC9A 3T66A 1DTGA 1F9BA 3KGCA 3MVYA 3FVNA 1LFGA 3O97A 1LFIA 3LBSA 4EF2A 2H98A 3IOUA 5IKBA 2X26A 1UQWA 1MY2A 5I84A 2D5WA 3HHFA 1DPPA 3T9HB 2I49A 2VHAA 3MWBA 2W7YA 4NF8A 1O63A 3U94A 3KZGA 1Q35A 3FXUA 4EQ7A 3VLWA 1BTJA 2RF1A 4YMBA 3E13X 4NMYA 1MH4A 4IO2A 1RYXA 1LSTA 1JVXA 3IOVA 4RPOA 1GV8A 1P1OA 4ELPA 4U4SA 1MG1A 3E4RA 3L6HA 5TP9B 3FVOA 1B5IA 4F3GA 2OCUA 2DE4A 4LVQA 1N04A 1P1QA 4YKPA 1A54A 5LOMA 3V83A 5I59B 2XXIA 2RC7A 2O1MA 4XKRA 3K00A 4P0IA 2DP8A 2X7QA 2ZYKA 1B58A 4AB6A 1L5TA 2IEEA 3D4GA 3MJNA 1HSEA 2AYSA 1Y20A 5ELVA 3MP1A 1IITA 2H4IA 4RPNA 3RN8A 2DXRA 3DLNA 4U1OA 5FHNA 2Q2CA 5H8NB 2F6GA 2YLNA 2XXQA 4C1TA 3BFTA 3S9MC 5JK4A 4WKMA 4G8HA 1UTHA 1N84A 1VFEA 4N07A 3RT6B 1SW5A 1USYH 4F18A 1QUIA 1UIVA 2XXVA 4PE5B 4DDDA 2H5YA 1NMUA 2GH9A 2DVCA 5FHOA 3ZSFA 3QXMA 2H99A 3N26A 2H9BA 1R9LA 4RYAA 2Z22A 4MH5A 3O2AA 3G3HA 3GLBA 3ONMA 1IUDA 3B6QA 1SW4A 2I58A 3FV2A 4PFTA 4YU0A 1Y3NA 5CBSA 1DSNA 2QS2A 3CG1A 1EH3A 4KYSA 4DZ1A 1PB8A 2O6AA 2XXUA 2Q8JA 2O68A 3C4MA 4I9DA 4PETA 4XTCQ 2OWTA 5ITPA 5IAIA 3KJTA 1NKXA 1OLAA 4PFWA 4UACA 1NNTA 1TT1A 3FATA 5H8FA 3IO6A 3EHTA 4R6YA 4EUOA 4QFNA 4R73A 1LAHE 3C35A 2D3IA 3ODBA 2NXOA 3CFLA 1FQFA 1BLFA 3K1PA 5I57B 1S9TA 1NFTA 3IK6B 1URSA 3RUMA 4WXJA 1CB6A 3CR9A 2XXYA 2GFEA 2I3WA 3CVGA 1S50A 3C34A 3T93B 2G29A 3UP9A 3FXRA 5ISUA 3PPRA 3CI8A 4KYEA 3H7MA 4ZEFA 1QUJA 3OSQA 5JEIA 4GF8A 1N76A 3PUVE 2F8DA 3RTFB 3EF7A 1US5A 1XT8A 2E0SA 1YTVA 1IIWA 1EZOA 3JV9A 5AA2A 3HPIA 4F1UA 1Y3PA 2I4BA 2Y7RA 5F1QA 2HQ0A 5AA2B 3S4UA 3A09A 3MZ1A 2Q9TA 4X1DA 1D3KA 4PP0A 4HTGA 4OFOA 4MF3A 3UA8A 4I1DA 2NUVA 2HAUA 3OO9A 2UXAA 1QKBA 2I48A 3SEXA 3EQ1A 4HW8A 1MQHA 5AE4A 1XC1A 1D9VA 3FVGA 1SW2A 1FTLA 5TPAA 4Q30B 3HV1A 3QIMA 4NEDA 3OOAA 5KDTA 2NWJA 3PD9A 4ZE9A 1UTBB 2ABHA 4TLLB 3BKIB 4P0GA 3U93A 5DYHA 5KDTB 1B5JA 5BUUA 5JTYB 4GLIA 3SERA 1JETA 4R2FA 5K2YA 5CRYA 3VLUA 1MY3A 2PYYA 3GBAA 2FNCA 4YB6A 3IJOB 2F97A 2QS3A 1B1XA 3M3LA 1HSJA 1SI0A 2NVUB 3KG2A 2ONSA 3TUSA 4NTLA 3SDFA 2VD3A 4OTEA 1FQEA 3SEYA 5KZTA 2A5TB 3KJ7A 4R6KA 1MXUA 4C1UA 1MM7A 1UIUA 4JWOA 3EHUA 1B2HA 3OD7A 3G3IA 3ILUB 4LUBA 4FATA 1B0LA 3N5LA 4OFLA 4OENA 1FQAA 3PUYE 4YKJA 4LQ5A 3CG3A 4GL0A 4N13A 1B32A 1IXGA 4KD5A 1B4HA 1ATGA 3U72A 1Y3QA 3K1NA 1Y1MA 2HZLA 5F7VA 4WEPA 3K1MA 3VDFA 1US4A 2HXWA 3TYHA 3CSGA 2V3QA 4R9FA 4LZ5A 1SYHA 4OEUA 4ONYA 3T9UA 3ZS6A 3RY3A 1PDAA 3O9PA 4ISUA 4O3CA 1B46A 1B40A 1NNKA 4ZZAA 1AL3A 1VR5A 3B6TA 1ZLQA 3KSXA 1MS7A 1B3LA 1MPCA 3FJMA 3RT8A 5DVFA 4U22A 4IO7A 4AQ4A 3FXQA 2PVUA 1M5CA 1XOCA 3IO4A 4O3BA 2UVHA 1T0KA 3QYTA 3K4UA 4PFUA 2FA7A 2RINA 1JEVA 4ZEDA 3PMXA 4FIMA 3PUWE 2Z8DA 4RY1A 1POY1 3C9HA 3FGSA 1ZTYA 2OK2A 3IOTA 1WDNA 1OQGA 4H67A 4I8CA 3M8UA 1ELJA 4POXA 4ECFA 2O7UA 1MRPA 4GWOA 4U2RA 5A5XA 4YZZA 3TDJA 4Q8RA 4U21A 1SBPA 5BWJA 4F1YA 3PUZE 4XKQA 3B6WA 1LAFE 2RKMA 4OYVA 5A5XB 3QUFA 1P99A 4P11A 4DXUA 2DS9A 1Q1KA 1I69A 2ZMBA 1XVXA 1H43A 4OXVA 1N3XA 3Q26A 3VXBA 1PC3A 3G3GA 4IO4A 4KYDA 4XXUA 3FV1A 2ALUA 1LFHA 1B7ZA 1URDA 4JBZA 1B0HA 4LONB 4THIA 3PGFA 3SEWA 4YAHX 2UVIA 4NF8B 3U8QA 1EZ9A 4WEDA 5DT6A 1DMBA 5HPQA 2LAOA 4NF6A 2PT2A 4FAJA 1B3HA 3F11A 3TTMA 2DE2A 2DE3A 2IA4A 3K6WA 3MUQA 3G3JA 3I3VA 3G3KA 3TTKA 2F5XA 2REJA 5B7DA 4IO5A 2R6GE 1MXWA 3QAXA 1B9JA 2BJJX 1M5BA 1MH3A 3TQLA 3OXNA 5DVIA 3HN0A 1H44A 3MAMA 3MPKA 2HAVA 3V8XB 4OERA 3TMGA 4KPTA 4F39A 5CMMA 4TOZA 4G77A 1B05A 3FJGA 3N94A 4GVOA 3H6WA 4U23A 4QSDA 2QJEA 3K6VA 1A99A 5L9MA 3RNNA 2UYFA 4EQBA 1ZBMA 1JNFA 3DP6A 2I6EA 1N7XA 1P1NA 3PPQA 4QFOA 5I56A 4QFLA 2Y84A 2CMOA 1UTHB 2AL4A 1QUKA 3MVWA 4BDOA 4DLDA 3VVDA 3DP4A 3AXFA 5KCJA 3MZBA 3FD3A 4DXBA 2ZYMA 1FQBA 1ZJLA 2B65A 1QULA 4OFJA 4DE8A 5KCJB 3TTLA 1LAXA 4LZ7A 3CSBA 4MBPA 1OQHA 3EPEA 1N3WA 1IQ7A 2XXWA 3VXCA 2F36A 2UVJA 1DTZA 2YJPA 2ZNSA 1R9QA 4HCWA 4XIGQ 2GHBA 3MP6A 1NH7A 4JWXA 4DCYA 2I4CA 4RK2A 4NE4A 2B3BA 1ZMGA 4L17A 3IB0A 2XX9A 1XS5A 1QVSA 2XHDA 3TCFA 5H8FB 2PMSA 2CZLA 1GR2A 1MDP1 1Z7ME 4I62A 1H45A 3D4CA 1MQIA 2OLBA 1FTMA 1MXVA 2ONKE 3P7IA 2PT1A 1A55A 1O64A 4AB5A 4JDFA 3OMBA 1JQFA 2HZKA 3OO7A 3LSLA 2Y7PA 4KQPA 3CRBA 3H6TA 4YB5A 1SW1A 2V3TA 1PEBA 1BIYA 2Z8FA 4JSDA 2OJTA 3W9VA 2Y7WA 5I2NA 3A3UA 1OVBA 2F78A 1SQYA 3O6IA 2RC8A 4XKPA 3LSFB 2ZNTA 1ZU0A 3K0VA 2KLFA 1I6AA 1OMPA 4Q5TA 2YPNA 2F7BA 2Y7IA 3W9WA 3TPAA 2HCAA 2QS4A 1FTKA 4YMAA 5EHSA 1TFAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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