1MXZA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 um brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA01
2OWTA 3PUXE 4RNSA 3CFZA 4IO5A 4OEUA 1ATGA 3I3VA 4LQ2A 4F22A 4GF8A 5L8DA 5I58A 2GH9A 1O64A 1Y4CA 3RTWB 4WEDA 3LSXA 2H5YA 5DVJA 3DP6A 3MJNA 3RGYA 2B3BA 3CFXA 2Y7IA 2X26A 2Z8DA 2IEEA 1JW1A 3LC8A 3RQTA 1TXFA 1JW5A 2E1SA 5B70A 1GV8A 3SETA 3KOTA 4XTCQ 3VV5A 2RC8A 1PB8A 3MPLA 2NWJA 1OIBA 2DXRA 5L9SA 1VFEA 2DSFA 4OHNA 1IEJA 4YKPA 3TPAA 1B2HA 5B7DA 1NH7A 3FJ7A 1FQAA 1NNPA 4YICA 4EF1A 1ZLQA 2I58A 4Q8RA 1S7YA 3G3HA 3MQ9A 4GFRA 5DVFA 3UGWA 2A5TB 4IO3A 3IO6A 1LB8A 3T22A 1WVJA 3FVNA 5JTYA 2O1MA 3IOWA 2BJJX 3PMVA 3PU5A 4IO6A 4U23A 3K1PA 2F8DA 1SBPA 3O2AA 2HXWA 3KZGA 4NEDA 3FV1A 3MZBA 4JWOA 4RK9A 1M5BA 2ONSA 4L17A 1TFDA 3SKPA 3ECRA 2XX7A 1EZPA 1NL5A 4RXLA 5TPAB 3TAJA 5ISUA 5IKBA 1LGBC 1TFAA 2UVIA 1JEUA 2ZXTA 3FVOA 2G93A 4WKMA 5JEIA 3EQ1A 5FHMA 5KCJB 4KCCA 1MXZA 3PPPA 4OQOA 2NOOA 3S2VA 3OEKA 2ZNUA 4KHZE 3BFUA 3B6QA 4PFTA 3KOSA 1MH4A 1MQJA 1PEBA 4Q0CA 1DTGA 2DS9A 1ELJA 3KSXA 2H25A 3PPRA 1SYIA 4GOTA 4KI0E 4R6HA 2DWHA 4YAHX 4KYDA 4QRZA 4U2RA 4U1OA 4NMYA 2DQVA 3H6TA 3L6GA 4QFOA 4TLMB 4OTEA 1H76A 3G3FA 1POY1 3HSTA 3LSFB 4ZECA 4ELPA 2H99A 2DWAA 2ESNA 3MZ1A 4PE5B 4LZ5A 4TOZA 4ESWA 4DCXA 3VVDA 4HW8A 2DE2A 1P99A 2DYXA 2V93A 2X7PA 4ZZAA 3MP8A 4LZ8A 4NF8B 3UN6A 3CIJA 5DVIA 1QKBA 4O3CA 3S9NC 4OFJA 3RN8A 4DXBA 3MP1A 1MDQA 1NNTA 1BTJA 1YAEA 1ZIUA 3PD8A 2F6PA 2XXVA 3QSLA 1DOTA 4FE8A 4MLQA 2WKYA 1JNFA 1MXWA 3T96B 1MPCA 2M8CA 4AB5A 1B3EA 1D9VA 2O1LA 5AA4A 5LOMA 1I6BA 4H0WA 4DXUA 5H8HA 4E0XA 2G29A 5KCJA 3Q28A 1FTLA 2XD3A 4H6DA 5JK4A 4MF3A 3BKIB 3IOTA 2PX1A 4R73A 1UTHA 3H3GA 3K2DA 3R6UA 1EZ9A 2UVGA 3FJGA 3GBBA 4U22A 5DEXB 4LA9A 4UACA 3K02A 2Q9TA 5CI5A 3T93B 3U92A 5CBRA 1MY0A 1KWHA 1D4NA 2ZYOA 2Y7KA 2HFBA 4FEBA 4ND9A 1N04A 2A5TA 5H8SA 1H43A 3ZSFA 3A3UA 1FQCA 2QSXA 1Z7ME 3QUJA 4JDFA 3C9HA 1I6AA 1MY1A 2XXRA 1IUDA 1UIUA 3TFLA 2ZYMA 3BFTA 1NNKA 4K3FA 3K01A 1QUKA 3G3GA 5CMBA 4OERA 4KD5A 3TTRA 3B6WA 1O7TA 2D3IA 4EF2A 1DTZA 4HCYA 3UK4A 2Y7RA 3O6GA 3TQWA 4OEVA 3UA8A 3OO6A 4F1VA 3K6XA 3AXFA 2VD3A 5KDTB 2Q8JA 4GL8A 2Y7WA 3V8XB 2I0BA 2GRVA 1LCTA 4QHQA 4QFKA 5ICQA 2OCUA 3U93A 2OWSA 2Q2AA 3ZKKA 1USYH 3DP4A 3ONMA 3HO7A 2I4CA 3PV0E 3OXNA 1VR5A 2RC9A 2XXQA 3ZS6A 3CVGA 1MPDA 2R6GE 3EF7A 3MVWA 3RUMA 3B7DA 2THIA 1H45A 4DDDA 4MLVA 3U94A 1ZU0A 3I6VA 3FXRA 4DIGA 4F31B 3THIA 5CMCA 1B52A 5EHSA 1SW1A 2F7CA 3PMXA 4WXJA 4GXAA 4OMBA 2FNCA 3K4UA 4R75A 3VVEA 1FW0A 1FTKA 1B7HA 3L6HA 1DSNA 4LATA 4P0IA 3TQLA 3RPWA 4OFOA 3VDFA 5H8FA 1AOVA 3FASA 2O7UA 1Y1MA 3O6HA 4G68C 3D4CA 3FZVA 1POTA 1ZMGA 2UVJA 3JZJA 3TCFA 4Q30B 1MG1A 3IOUA 1ZJLA 1SD3A 3TUSA 3ODBA 1GTKA 3C32A 4E0WA 1BKAA 3PUVE 4P0GA 5DTBA 2ZYNA 1IQ7A 4GL0A 2VD2A 3H03A 2XXTA 2KLFA 4X1BA 4U21A 3SEWA 4PFWA 1B05A 2AL4A 3M3KA 5IAIA 5K2XA 4PQJA 1B3GA 1N3XA 4KYSA 5ELVA 2D5WA 3TTLA 1PB7A 2ONKE 2UVHA 4F29A 1UTBB 2XXUA 3Q27A 1AMFA 1DPPA 3QUFA 5CRYA 3FJMA 4OYVA 1LLSA 2V25A 3LSLA 2YPNA 4OETA 3Q26A 1L5TA 3TEPA 3C34A 4RY1A 1I6QA 2VOZA 4FECA 3C31A 2R9JA 2R71A 3O66A 4NF4A 3R7XA 3RNNA 3VXBA 3S9LC 4U4XA 1Y9UA 1LFHA 1B46A 2I0CA 3IB0A 2O84X 1B32A 2REJA 3CG3A 3G3JA 3SERA 1O63A 2I3WA 4PETA 2AYSA 3A3CA 3EPEA 4C1UA 4FAJA 5I57B 1P1NA 2YJPA 1AH5A 1MM7A 2AIXA 2GFEA 2ZNSA 3C36A 1VFDA 3CRBA 3GXAA 4G77A 4IO7A 4LZ7A 4NF5B 4R6KA 1N3WA 1MY3A 2H9BA 4DZ1A 2NXOA 3TDJA 1B51A 1MQHA 3FVGA 5H8FB 3T9UA 2DOJA 4DXCA 4H5GA 5I59A 1H44A 3I5OA 3LR1A 5EHMA 1FTJA 3MZ9A 4LONB 2Y7PA 3OD7A 1LFGA 5H8HB 3HPIA 1N84A 3OSRA 3SDFA 4AQ4A 5AA4B 5ITPA 1GGGA 3M3LA 4LQ5A 2V3TA 4BLAA 2QRYA 4Z7EA 1IITA 1LSTA 2P1SA 4GRKA 3WAFA 3W9VA 1EZOA 3QAXA 4XXUA 4G8NA 2O68A 3ZKLA 3FATA 3PPQA 2QS1A 5BUUA 5ICTA 3MPKA 2RCBA 2Z8FA 1CE2A 3K6WA 4FEDA 4HTGA 3S4UA 4F2OA 3PD9A 4GLIA 4ZZEA 4YB7A 4LVQA 1IXHA 3G3KA 2RINA 2ZMBA 4NWDA 4O3BA 4R9GA 1PC3A 5F7VA 4ECFA 3TMGA 2V3QA 4DLDA 3A09A 1A8FA 2ZNTA 4G2ZA 4POWA 3IJOB 5EYFA 1R1NA 1B5IA 2PMSA 1N7XA 3OO8A 3HV1A 3V89B 1WDNA 5TU0A 4YB6A 5I59B 3H6UA 2UYFA 1D9YA 2Z8EA 3C4MA 4OWDA 4YB5A 2XXHA 3BBRA 5I2KA 4F3BA 3RTFB 2QPQA 2VP1A 5M2VA 1FCKA 4MBPA 4RYAA 4JSOA 4IO4A 1PBPA 1HSEA 1JVXA 2DE4A 2HAUA 3MVYA 4NF5A 4OZ9A 4R72A 3LUYA 4THIA 4X9TA 3TZAA 1OLAA 4BDMA 5K2YA 4EQBA 4F1UA 1S50A 1BLFA 3U1OA 1PB9A 1OVTA 1QKAA 3JV9A 1XS5A 2F5XA 2F34A 3MC2A 4GIZA 2QMXA 3FV2A 1MXXA 1A40A 4R9FA 2P2AA 5AA3A 3CSGA 5CM6A 4NTLA 1M5FA 2V3UA 4H8IA 1ZBMA 4KQPA 4JB7A 4M4GA 4R74A 3PPOA 5J1DA 2F7AA 3FGSA 2I3VA 3C33A 4OVJA 2NVUB 3TTKA 4FJPA 2QS4A 2X7QA 4BDRA 3DM0A 4F3PA 1MXUA 1S9TA 5AA2D 4ZDMA 1NMUA 1B3FA 4UA8A 1IXCA 2OK2A 3IX1A 3T66A 1B40A 3VE1B 1URGA 5HM4B 4P11A 4H1XA 2GHBA 4OXVA 4NF6B 1MDP1 2Q88A 1LAHE 1IXGA 2VGQA 1QJMA 1LAXA 1UIVA 4N07A 3USDA 5I2NB 1I69A 3E3KA 4ZE9A 3CG1A 3VXCA 3PMWA 3MVXA 3MVZA 1SI1A 3KBRA 3TODA 1M5EA 2V84A 1M5DA 2CMOA 5ITOA 4JXIA 1R9QA 4XKPA 2XXPA 3H6WA 5JTYB 3KJTA 2I4BA 1Y20A 4XKNA 4NE4A 2ALUA 3EHSA 4MH5A 3DELB 3H4ZA 2FYIA 3M3FA 4ONYA 5CMKA 3GBAA 4I9DA 1MM6A 1OMPA 4JWYA 5HBCA 2RF1A 2W7YA 5DT6A 3TKDA 4OENA 2DXYA 4ZEFA 1A8EA 1Q1KA 2B3FA 3WAEA 3ILUB 1SQYA 3U72A 2F97A 2XD2A 2ONRA 3N6TA 3IR1A 4GD5A 4N6PA 3O29A 4QFNA 4R2BA 4EQ9A 1MY4A 1OVBA 3O9PA 1Q35A 5AE4A 3TELA 2RC7A 1XOCA 1B3HA 2H4IA 3VLWA 3K1MA 4F19A 2NUVA 3OO9A 5TPAA 2YLNA 3N26A 3O6IA 3W15C 1JETA 2PYYA 5FHNA 3QIMA 4I62A 4BDNA 5I58B 3G7WA 1J1NA 1OQGA 3IJXB 4NWCA 1QUJA 1LBCA 3MUQA 1XC1A 3OMBA 4FORA 1MY2A 3MWBA 1B1HA 1SVXB 4C0RA 1USYE 3IAZA 3M8UA 3Q25A 4G68A 1AL3A 4ESXA 2O7IA 1R9LA 3Q29A 4EUOA 3V83A 2Z22A 4TLLB 1SW2A 1FQDA 1F9BA 2PVUA 2VHAA 3KSJA 3LSWA 4QSDA 4RJZA 3N6UA 4U4SA 4GXSB 1B9JA 1B6HA 2IA4A 1Y4TA 3CR9A 3FXQA 3O97A 3C35A 2D21A 2DVCA 1RYXA 2HZKA 3K6VA 1B58A 4GWOA 1NKXA 4N13A 4X48A 4EXKA 3E4RA 3PUWE 1TT1A 1D3KA 1Y3PA 2PBWA 3IORA 3OENA 1R6ZA 4YU0A 5FTIA 5CBSA 5HPQA 5KZTA 4JSDA 4BDQA 3OO7A 4PP0A 5H8QA 1N7WA 1IZ1A 3OOAA 4XKRA 3VFJA 4F39A 4F18A 4IY6A 3T9HB 3UIFA 1A55A 1SDXA 1SYHA 1CB6A 4QFLA 4X1DA 4ZEIA 1VSOA 4G8MA 1GR2A 3VLUA 4H67A 1QULA 4YKKA 3TTNA 4LP2B 4EQ7A 5A5XA 2QS2A 2GHAA 2QMWA 2XXIA 2Y84A 3P7IA 4I1DA 4KR5A 1NFTA 4NF8A 5H8QB 2F36A 3LBSA 1Y3QA 5CC2A 1A54A 3FXUA 1JQFA 2RKMA 4IGTA 5H8NA 2QL3A 3GZGA 4F3SA 3FVKA 4R2FA 5L9MA 4KCDA 1GVCA 3TCHA 4BDOA 2Z23A 1NNFA 5FHOA 1VE4A 1US4A 3OELA 2QJEA 3PUYE 3H6VA 3SEYA 1AIVA 1HSLA 1LB9A 3HCQA 3V5AA 1B7ZA 4GVOA 1MXVA 4FIMA 1H3DA 3MW0A 1PDAA 3TCGA 5I57A 5L9OA 5I56A 2REGA 2PT1A 1MH3A 1OQHA 5TP9A 4ZEBA 1RKMA 1FTOA 3GLBA 2OJTA 4XKQA 1DPEA 5I2KB 2E0SA 3H7MA 1P1UA 2F7BA 3UORA 4EDPA 1Z7NE 1BP5A 1MRPA 4YMBA 2F35A 3IOVA 3KEIA 3K0VA 4HCWA 1EU8A 3IB2A 2DWJA 4F1YA 4RPOA 5CMMA 2H98A 3RLFE 2XHDA 3SEUA 3W9WA 1XHYA 1XT8A 3RY3A 1ANFA 3S9EA 3ILTB 3KN8A 5AA2A 2Q89A 3K6UA 1RYOA 2OZZA 2ABHA 3D4GA 3OSQA 1SW5A 4LUBA 4ZS9A 4ELOA 2LAOA 1BIYA 2F78A 5I56B 4ELQA 1MS7A 4C1TA 4RA1A 1URSA 1P1QA 5F1QA 3HHFA 1MQIA 3KG2A 1FQEA 2ZYKA 2XXXA 4ZE8A 4RK2A 4QSEA 5DYHA 4EXLA 2DP8A 1LFIA 2F6GA 2HCAA 4YZZA 1HSJA 4TQUQ 3IO4A 2I6EA 3DLNA 3EHTA 3K1NA 4KPTA 4NF4B 1A7LA 3TYHA 3CSBA 1QW0A 1B3LA 1QVSA 1SW4A 2XXWA 3VLVA 5H8NB 2ANJA 3EHUA 2HZLA 1MQDA 1YPNA 1ZTYA 1UTBA 3JYRA 5AA1A 1UTHB 3FIRA 2OLBA 3R26A 5DEXA 5I2NA 3N94A 4JBZA 2O6AA 4PFYA 4I8CA 1NH8A 3F11A 1FQFA 1XVXA 2HQ0A 3KGCA 2HEUA 1M5CA 1P1OA 3KJ7A 3SEVA 1IIWA 1B4HA 3T9XB 4RPNA 1YCJA 4ISUA 4Z0IA 1T0KA 2FA7A 3FD3A 4OFLA 4YMAA 3DP8A 1A99A 3PUZE 1LCFA 4Q5TA 4ZEDA 4GQOA 5TP9B 3N5LA 1XVYA 3G3IA 3OEMA 1JEVA 2O69A 2CZLA 3IL1B 1IXIA 1YTVA 1JVYA 1MPBA 1Y1ZA 1Y3NA 1N76A 4G8HA 4QF9A 4XIGQ 2XX9A 4G4PA 4IO2A 3RT6B 4DE8A 3MBPA 3UP9A 4R6YA 1B5JA 1FQBA 2I49A 3MP6A 3S9MC 3QK6A 4IY5A 5FTHA 2XX8A 4O3AA 3IK6B 3QXMA 3HHGA 2DWIA 2QS3A 1EH3A 2UXAA 4HS7A 5AA2B 4POXA 1SI0A 4ELRA 2Q2CA 1MQGA 1PBQA 3QYTA 4H65A 1WODA 4H8JA 3O28A 3B6TA 4KYEA 4DCYA 3K00A 3FUZA 1B7UA 4AB6A 4M1VA 4FATA 1LAFE 2OBGA 5I84A 4MFIA 2DE3A 3TTMA 2HAVA 4QSCA 2A5SA 4IGRA 4F2QA 4NF6A 4F3GA 1B5HA 3SESA 3KN3A 1II5A 2P0SA 3EN3A 1LBBA 1LAGE 1JW4A 1OLCA 2AL5A 2PT2A 4PFUA 4YKJA 4H5FA 4KFQA 2RCAA 3PGFA 1TWYA 2B65A 4U1ZA 1P1WA 1QUIA 4IB2A 5KDTA 2O51A 1URDA 2DVZA 1ZKBA 3CFLA 4YKIA 1B0HA 1B4ZA 4BDLA 5A5XB 1N0TA 4ZEKA 3RT8A 2UYEA 1FTMA 1UQWA 3E13X 1B1XA 3KFMA 1DMBA 3SEXA 3U8QA 3PPNA 3CI8A 3VVFA 1MXYA 5BWJA 3H06B 3IB1A 3MAMA 2XXYA 3E9XA 2I48A 4JWXA 3HN0A 3KN7A 4G68B 4OESA 3T9VA 1B0LA 4QFPA 1US5A 4WEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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