1MXZA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 um brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA01
2HQ0A 2F7BA 1LGBC 1B2HA 1PC3A 1N7XA 3N26A 5HPQA 2NUVA 4U4SA 4DDDA 4NF6B 3HHGA 2CZLA 3CRBA 3TKDA 3LSLA 2GRVA 1US4A 1QKBA 2XXHA 4NMYA 4H0WA 4OEUA 4PFYA 3IORA 1RKMA 5L9OA 2BJJX 1IITA 2X26A 3A09A 4R6HA 3MQ9A 2QMXA 2P0SA 2F5XA 3OO9A 2AYSA 1B4HA 2HZLA 2I3VA 4LZ8A 4DIGA 1B52A 3IK6B 4KYSA 5CMCA 4IO5A 3M3KA 2QMWA 2I4CA 3O97A 5I84A 4IO2A 1UTHB 3MC2A 3K0VA 2XD3A 1OQGA 5DEXB 4G8MA 3GBAA 1D3KA 1JW1A 3KN7A 2RKMA 3ZKKA 3PUVE 2ONRA 1P1NA 3N94A 2DWHA 1LBCA 3MBPA 2OJTA 3FASA 1GTKA 1MY2A 3UP9A 4EXKA 2FYIA 4O3AA 3EQ1A 1MQDA 5I56B 4YAHX 4IO6A 4IGRA 2VP1A 1FQDA 5CC2A 4R6YA 3IB0A 1AOVA 3PMVA 3UORA 3Q27A 2A5TB 1JETA 1FTOA 1B7UA 3OO6A 4ZEKA 4F1UA 4NE4A 1XS5A 5ISUA 2XXRA 1POTA 4KFQA 3TTNA 5H8QA 2ZNUA 1JQFA 2UVIA 4NTLA 4KQPA 3MPLA 3CFXA 1BP5A 3TTMA 3C32A 4ZDMA 3K01A 1R6ZA 2QS2A 3PPQA 1UTBA 1LFGA 3IOTA 3H4ZA 4NF5A 3THIA 4U21A 4PFUA 1QUIA 3EHSA 1PB9A 1MXZA 4IB2A 1VFEA 3VVFA 5H8NB 4TQUQ 3S9LC 3PU5A 2F36A 4BDQA 1JVYA 1M5DA 3ILTB 5ICTA 3W9VA 4PFTA 3DLNA 2I6EA 5DVIA 3E9XA 1FTLA 5DVFA 2ZYKA 1PB8A 3U72A 1II5A 4R6KA 2DS9A 1DMBA 4E0XA 2I49A 4C1TA 3FVGA 1B5IA 3RNNA 4GD5A 2H25A 1Y3PA 4G8NA 1P1OA 1IZ1A 4XKPA 4DCXA 1SI1A 4IY6A 2AL5A 2V3TA 2OWSA 3K6WA 4IO7A 5EHSA 4ZE9A 4JWXA 3F11A 4F3SA 1R9LA 3MVYA 4H8JA 5M2VA 1LCFA 3K2DA 3PMWA 1XVXA 4JSOA 1JW4A 3QXMA 2NWJA 3FXQA 1OQHA 4NF6A 2H9BA 3BFTA 1EZOA 3FD3A 3V5AA 2DE4A 3FUZA 3IOWA 5H8SA 5B7DA 4X1DA 4EF2A 3Q25A 1H3DA 4F3PA 3EF7A 3FV1A 1M5FA 2XXIA 5K2YA 1I6BA 4R2BA 4YKPA 5CMMA 2VD3A 5H8FA 2HEUA 3SEWA 1MQHA 1I69A 2D21A 4DXCA 1MG1A 2H99A 4G8HA 4QFPA 3WAFA 2OK2A 1MXWA 2P2AA 4ISUA 2XX8A 4EUOA 3QIMA 4ZZAA 1ZIUA 4R74A 2E0SA 3U1OA 3SEXA 1A55A 1MQIA 1B3EA 1MY4A 4DLDA 1AIVA 2HAUA 4YB7A 4OESA 3MZBA 2VD2A 1UTHA 5BWJA 3IB2A 3FJMA 3K00A 3OEMA 4QFNA 4RXLA 2F8DA 3TDJA 1PEBA 4L17A 4XXUA 1MH4A 3U94A 3U8QA 4G68A 3TCGA 2Y7WA 4M1VA 2XXXA 3PPNA 3OSQA 4XKNA 5CBSA 1ZU0A 3PD9A 4PE5B 5I56A 4RPNA 3ZKLA 1SW5A 4GIZA 4Z0IA 3RTFB 4I8CA 1BKAA 3O66A 2HZKA 3IOVA 1GV8A 5F1QA 4U22A 5KCJB 1MXVA 2V25A 4RK9A 5ITOA 4ECFA 2WKYA 3CVGA 4EXLA 1SW2A 1PBPA 3FZVA 3ONMA 1NH7A 3KZGA 2X7QA 2W7YA 4PETA 3O29A 3S9MC 1VE4A 1QUJA 1N0TA 5H8QB 4IGTA 3FVOA 4H6DA 3N5LA 4FORA 1FQAA 3O2AA 3MVZA 3SERA 4ZECA 3B6TA 4F29A 2F6PA 1N7WA 2O84X 1VR5A 3KBRA 4OWDA 4GXAA 2GHAA 1LFIA 1XT8A 4TLMB 2PX1A 4NF5B 4KCCA 4G4PA 4GL0A 3TPAA 4UA8A 3O6GA 4GRKA 1XOCA 1OLAA 3LSXA 4BLAA 1DPEA 4JSDA 1FW0A 3MVWA 3CR9A 4KI0E 2ALUA 3H06B 3FJGA 4QF9A 2ONSA 2DWAA 3I3VA 3DP4A 4E0WA 4MH5A 1A7LA 3MJNA 2I0BA 3C31A 1A40A 1OLCA 3K6XA 4LVQA 1JNFA 2OWTA 3VLUA 1SVXB 1SYHA 4H65A 1MM6A 3VLVA 4OYVA 5B70A 3T9UA 1YTVA 1B5JA 5F7VA 4F1VA 5AA1A 4P0IA 4UACA 4BDNA 2UYFA 3CFZA 3VLWA 4TOZA 3IJXB 1ELJA 4XKRA 1H44A 1YPNA 3OOAA 4GOTA 1LAFE 1IXCA 2PT2A 5AA4B 3I6VA 1HSLA 4DCYA 2Q8JA 3W15C 2F35A 3PUZE 3RPWA 3GBBA 4BDOA 1FTKA 2ESNA 2I58A 3K1MA 5CMBA 4R73A 5H8FB 3R26A 1DSNA 4NF4B 5HM4B 1PB7A 1Y3NA 4H5FA 4N07A 1AH5A 4RA1A 4ZEFA 2QPQA 2ABHA 4ND9A 4Q0CA 3IR1A 3C9HA 4RYAA 3O6IA 2O7UA 1TFAA 1OIBA 4GQOA 3G3HA 3HN0A 3K4UA 3TCHA 4YB5A 1FQFA 1NKXA 2IA4A 1D9VA 4KYDA 3HO7A 4IY5A 1WODA 1QVSA 3USDA 2DXYA 3V8XB 4F22A 3IB1A 2KLFA 4DZ1A 1A8FA 1JEUA 1NFTA 2V3QA 3SETA 5ITPA 2NVUB 2G93A 1OVBA 4QFKA 3FXUA 4G68B 2B65A 4MF3A 1PDAA 2VOZA 5KCJA 1B9JA 2DSFA 2F6GA 4G68C 1ZKBA 3TCFA 4Z7EA 2Q2CA 2XXWA 4YMBA 3EN3A 4U1OA 4EQ9A 5AA2A 1LFHA 1B1HA 2ZYMA 3DP6A 2Z8DA 2O51A 2RCAA 3MWBA 1P1WA 2Q9TA 2F34A 1NNTA 2ONKE 5CI5A 4LZ7A 3BBRA 2RINA 2ZMBA 1LBBA 5L8DA 3KG2A 3IL1B 1N76A 1R1NA 3IX1A 4ZE8A 3M3FA 1IXHA 4MLVA 1Y20A 2Y7RA 1RYOA 1N84A 2RCBA 3FXRA 2YPNA 1UQWA 4YU0A 3LUYA 3MZ9A 5DVJA 3G3KA 2OCUA 4HW8A 3QAXA 2PVUA 5HBCA 3B6WA 1NL5A 2DYXA 3VV5A 1TWYA 2GFEA 5FHNA 4XIGQ 1QULA 3OXNA 3KOTA 1HSEA 1B58A 3MP6A 4YZZA 1JEVA 4YB6A 1B5HA 5I2KB 4MFIA 1QKAA 4R2FA 4ESWA 4M4GA 5AA3A 1IQ7A 3PMXA 1B7HA 2XXYA 4JB7A 4JXIA 4DE8A 4MLQA 2F97A 5FTHA 3HCQA 2DQVA 3IJOB 3OENA 2QRYA 4NF8A 3HV1A 4YICA 1F9BA 3TUSA 4FATA 4KPTA 1B0LA 2GHBA 3ODBA 2UVJA 1ZJLA 4EF1A 4FEDA 3PPOA 3GLBA 1GVCA 3UIFA 1B32A 1WDNA 1D9YA 3CG3A 4ZEIA 3PUXE 1MPBA 1MXYA 2H4IA 5AA4A 4AQ4A 1ANFA 4OXVA 3DELB 5I2NA 3OO7A 1IUDA 4NF4A 3KSXA 3IO6A 5A5XA 4EQ7A 2F7AA 2UXAA 4Q30B 2Y84A 4WXJA 4OMBA 2I4BA 1MXXA 4BDLA 1HSJA 2M8CA 2AIXA 1Y3QA 1B4ZA 3QYTA 4OTEA 2VGQA 5TU0A 3VVEA 3LSWA 5AE4A 3QK6A 4QSEA 3RUMA 2Z22A 5DYHA 3G3FA 4ESXA 5TPAB 3EHTA 3A3CA 5FHOA 4QSDA 2AL4A 4BDMA 4Q5TA 2B3FA 1UIUA 2NOOA 3L6HA 3T96B 1GGGA 1URGA 3MZ1A 3Q29A 3S4UA 5KZTA 3W9WA 4HS7A 1ZLQA 2PT1A 5JK4A 3SKPA 3OEKA 1T0KA 1MH3A 3PUWE 5TP9A 3OSRA 3KOSA 3OD7A 1B3HA 4YKKA 4R9GA 2NXOA 4OFOA 3K1NA 5JTYB 2QSXA 5BUUA 1SW4A 3MW0A 5I58B 2XX9A 4FIMA 5KDTB 4EDPA 3FATA 2HFBA 4FEBA 3FIRA 4GWOA 5AA2B 3KN3A 1LSTA 4C1UA 3VDFA 3CG1A 2DVZA 1O64A 2IEEA 3CFLA 1S9TA 5CBRA 2RC8A 2H5YA 4RK2A 4EQBA 4XKQA 4HTGA 2F78A 3N6UA 2DE3A 2HCAA 2O6AA 3FV2A 1L5TA 1B7ZA 4GFRA 1MDQA 3C35A 4ZS9A 2R6GE 4QRZA 3MUQA 3U93A 4F3GA 1O63A 4G2ZA 3D4GA 3CSBA 5FHMA 3KJ7A 3DM0A 5CMKA 1AMFA 2I0CA 2O7IA 5H8HA 1SDXA 1SBPA 4AB5A 3T93B 3MP8A 3RT6B 1VFDA 4GXSB 5I2KA 4WEPA 1IXGA 2D5WA 1TXFA 1SQYA 2XXUA 2PMSA 3FJ7A 4ELQA 1N04A 4KCDA 4QSCA 4ZEBA 5FTIA 2QJEA 1NNFA 3R7XA 4H5GA 3QUFA 1H43A 3U92A 1VSOA 5K2XA 4NF8B 1JW5A 2Z8EA 3MAMA 3L6GA 2DVCA 1IEJA 4R72A 1LLSA 4P0GA 3VXBA 4H67A 3KFMA 3IAZA 1SD3A 4JDFA 1MY1A 1Z7ME 3TZAA 1EU8A 3TTLA 3FVNA 4POWA 3B7DA 3LC8A 1B51A 1H45A 2DWJA 1US5A 1M5EA 2QL3A 1XC1A 5L9MA 1URSA 1MY0A 1FQEA 4NWCA 4KYEA 4U1ZA 3T66A 3QUJA 5DTBA 2DP8A 1TFDA 4LP2B 3SDFA 3N6TA 4HCWA 3H03A 3M3LA 4N6PA 4POXA 3TEPA 5I2NB 1USYE 4TLLB 2O1LA 1H76A 5I57B 1A99A 4H8IA 2QS3A 2Z8FA 5A5XB 1Q1KA 3CIJA 3OMBA 1Y1MA 4IO3A 3SEYA 2THIA 3C34A 4H1XA 5I59A 5TPAA 2YLNA 3TELA 3S9NC 3I5OA 4N13A 3MPKA 5J1DA 3UGWA 1I6QA 3MVXA 3JYRA 1FTMA 4F3BA 1QUKA 1A54A 2LAOA 3WAEA 3E13X 3M8UA 4GF8A 3BKIB 1MDP1 1NH8A 3VXCA 3TTKA 1B0HA 1USYH 3RQTA 3JZJA 2XXTA 3AXFA 2Q88A 2OZZA 3KSJA 4RPOA 4F18A 4X48A 3A3UA 1FTJA 4F2OA 4OENA 4GL8A 1IXIA 3G7WA 4DXUA 3H3GA 2I3WA 5JTYA 4NWDA 3O28A 5I58A 5TP9B 3HPIA 2XHDA 5KDTA 3CI8A 2PBWA 3FGSA 4JBZA 3OO8A 4OVJA 1D4NA 1ZBMA 1FQCA 2R71A 3UN6A 3K6UA 1B3GA 5DT6A 1UIVA 3TFLA 1A8EA 1NNPA 4K3FA 4FECA 3PD8A 1OMPA 1MY3A 1PBQA 4LATA 3RN8A 1LAGE 3DP8A 3IO4A 4O3CA 1KWHA 1XVYA 2X7PA 4RNSA 4I9DA 2Y7IA 3R6UA 2F7CA 2DOJA 3UK4A 5ICQA 2Q89A 3SESA 1EZPA 4PFWA 2ANJA 1M5CA 3E3KA 4LZ5A 3VVDA 3H7MA 2Q2AA 4FJPA 1BIYA 2ZNTA 1B40A 1P99A 1BLFA 3IOUA 3S2VA 2O69A 2Y7PA 3BFUA 4XTCQ 1WVJA 3LSFB 3UA8A 5H8HB 1S50A 1NNKA 4X9TA 4F19A 1P1UA 2V84A 4P11A 2UVGA 1Y1ZA 4QHQA 3LR1A 1FQBA 4LA9A 1XHYA 3O6HA 1B46A 5EYFA 2H98A 1Y4CA 3G3IA 1MM7A 2I48A 5L9SA 2V93A 2XXVA 1B05A 3Q26A 1SI0A 3H6UA 4F1YA 2O68A 4F2QA 3K1PA 4WKMA 2XD2A 1MS7A 4QFLA 1I6AA 1FCKA 2QS4A 3P7IA 3KJTA 3PUYE 1R9QA 4OZ9A 1M5BA 4NEDA 3C36A 4I1DA 3OELA 2A5SA 2ZNSA 1AL3A 1GR2A 3RLFE 3EPEA 2FNCA 4O3BA 3H6VA 3JV9A 3GZGA 4R75A 2UVHA 4LUBA 3T9XB 5I57A 2XXQA 2HAVA 1O7TA 3O9PA 1JVXA 4I62A 4LQ2A 4OFLA 4KR5A 3Q28A 4KD5A 2RF1A 2QS1A 2P1SA 2G29A 4OQOA 1OVTA 2GH9A 2PYYA 3B6QA 4FE8A 3LBSA 3PPRA 2V3UA 1LAXA 4U2RA 1CB6A 1Y9UA 2REJA 1Q35A 1B6HA 3MP1A 5I59B 2R9JA 5ELVA 3RY3A 4ONYA 5AA2D 2D3IA 4YMAA 1B3LA 4OERA 4OFJA 4F39A 3PPPA 4JWOA 3GXAA 1ZMGA 1MQGA 4U23A 3TYHA 4YKIA 1URDA 3C4MA 1SYIA 1TT1A 1LB9A 3T9VA 3RTWB 4PQJA 5DEXA 3TODA 4ZZEA 4ZEDA 3RGYA 2XXPA 2Z23A 2E1SA 4PP0A 3TAJA 2DXRA 2RC9A 1IIWA 1LB8A 3G3GA 5IAIA 3CSGA 1ATGA 3C33A 5JEIA 3KEIA 4BDRA 1B1XA 1LCTA 1MRPA 1CE2A 3EHUA 4F31B 1DPPA 4LQ5A 3KGCA 3VE1B 1BTJA 1POY1 2A5TA 2RC7A 3T9HB 1Z7NE 2ZYOA 5EHMA 5LOMA 1B3FA 2OBGA 1MQJA 3RT8A 4ELRA 1NMUA 1SW1A 1P1QA 3SEUA 1MPDA 4THIA 1N3WA 1EH3A 1DTZA 1LAHE 5IKBA 3D4CA 4R9FA 4LONB 4MBPA 2Y7KA 4KHZE 5CM6A 3ILUB 3E4RA 1MXUA 2CMOA 5CRYA 4FAJA 4JWYA 3ZS6A 2ZYNA 3V89B 3HHFA 3FVKA 3V83A 4OETA 2DE2A 4RJZA 3KN8A 1S7YA 3PGFA 4IO4A 1UTBB 1N3XA 4RY1A 1J1NA 4C0RA 3H6TA 3TQLA 2UYEA 3S9EA 5H8NA 2XX7A 4QFOA 3K6VA 2ZXTA 4WEDA 4OEVA 4Q8RA 3ZSFA 1QW0A 4DXBA 2REGA 1QJMA 3VFJA 1Y4TA 1EZ9A 4X1BA 4HCYA 1DOTA 3H6WA 4GLIA 4ELOA 2YJPA 1ZTYA 3QSLA 1MPCA 2DWIA 2O1MA 3SEVA 3TQWA 4AB6A 3G3JA 2FA7A 3TMGA 4U4XA 4ELPA 2OLBA 3ECRA 2B3BA 4OHNA 1DTGA 3K02A 1RYXA 3TTRA 3PV0E 1YAEA 2HXWA 4YKJA 2VHAA 3HSTA 4G77A 3T22A 1YCJA 4GVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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