1MXZA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 um brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA01
3VE1B 3S2VA 4NF4B 1Y9UA 3VLWA 4AQ4A 2ZYNA 3TKDA 2F6PA 3M8UA 4H5GA 2IEEA 3A3UA 5CMMA 3BFTA 4RYAA 1JW1A 3K6VA 3E4RA 4LA9A 4QFOA 5HM4B 3E13X 3MC2A 1ZTYA 1XVYA 2UVIA 4OYVA 3K4UA 4JDFA 4RXLA 3G3FA 1TWYA 2HZLA 3SERA 5ITPA 2H4IA 1MH4A 3MZ9A 3USDA 5CRYA 4F3BA 4FE8A 4OFJA 3TAJA 2LAOA 2UVJA 3CVGA 4I8CA 5CM6A 1MH3A 2H99A 3OO7A 3RGYA 1M5CA 3FJ7A 1MDQA 3KEIA 3P7IA 4ELOA 3K1NA 1FQEA 1QUKA 1IXGA 4Z0IA 4YU0A 1Z7ME 4H8JA 1USYE 3L6GA 2VHAA 3IAZA 2XXVA 1XC1A 3MP1A 4MFIA 3SEXA 5DT6A 1USYH 4HW8A 3TUSA 4ZEKA 4XKQA 3LUYA 4F1YA 2Y7PA 3LR1A 3EPEA 3U93A 3H6UA 1II5A 3JZJA 3T9VA 2QJEA 4RK9A 3IOVA 4EDPA 3C9HA 4IY6A 3OSRA 4JB7A 4F2OA 4FECA 4KQPA 3UA8A 3MP6A 3O9PA 3MZBA 2ZNTA 5DEXB 4GF8A 2AL5A 1A8FA 2XXYA 3B7DA 3CRBA 2ALUA 3F11A 5BWJA 2QS4A 3UIFA 1XVXA 1MPCA 1ZBMA 1SW5A 3MVXA 4XKRA 1M5DA 3IOTA 1FTJA 5M2VA 3T9UA 1OLAA 2QMXA 3ZKLA 3OD7A 3VLVA 4IO3A 1PC3A 2REJA 4U1ZA 3D4GA 2XX8A 4MF3A 1AL3A 4QHQA 1GGGA 5L9MA 4YKJA 1MY0A 2P1SA 3K6WA 1VE4A 5H8SA 2XXUA 2E0SA 3MVWA 2O6AA 4BDNA 3C36A 4GWOA 1CE2A 1A55A 4UACA 2V25A 3K02A 4MLVA 2Q2CA 5AA2D 3FIRA 1AH5A 3RN8A 2B3FA 2XX9A 2RINA 1QVSA 1OVBA 4THIA 2X26A 3N5LA 5H8NA 5FTHA 3IO6A 1MXWA 1JEVA 1FQDA 3IB2A 1O63A 4LZ8A 4POXA 3TCHA 3LSXA 3A09A 1Z7NE 1MXXA 3JYRA 3T93B 4H67A 1SQYA 1IEJA 3S9LC 3RY3A 3IK6B 5JTYA 3FV2A 3PPQA 1JETA 1B7ZA 4ELPA 4KCCA 4KYEA 3CI8A 1TFDA 3CFXA 1TXFA 2ONKE 4YKPA 4R2FA 1H76A 1IXCA 4X48A 1SVXB 4TOZA 3C33A 4H0WA 2F34A 1RYOA 5EYFA 3FVGA 3R7XA 1POTA 4NEDA 4MLQA 1Y1MA 3V5AA 3EN3A 3CFLA 3EF7A 4F1VA 3IORA 4KPTA 1MS7A 3CR9A 3UN6A 1MM7A 2QS2A 4NF8A 4ZEFA 4F2QA 2DWJA 1B3EA 1NNFA 4TLLB 5CMBA 3V83A 4BDQA 4EQ9A 1VFEA 2DSFA 4NWDA 4BDRA 4KI0E 3VXBA 3OELA 4NF6B 3T22A 1SI0A 1URDA 1D4NA 4OFOA 4RY1A 1MY2A 1I6AA 2O51A 3IO4A 1F9BA 4PE5B 1B2HA 2HFBA 1B5JA 3C32A 3LBSA 1LSTA 4H8IA 4LQ5A 3Q27A 2I0BA 2A5TA 3MVYA 1IQ7A 2X7PA 1QUJA 2DWHA 3FXQA 3PV0E 4KYDA 3N6UA 3GBAA 3FD3A 1NMUA 4JXIA 2DS9A 2GH9A 5H8FB 2ZYMA 1MXUA 1PDAA 4G68A 5J1DA 1NKXA 3HN0A 1QKBA 1ZJLA 3TEPA 4QF9A 4U4XA 3T9HB 4Q8RA 3TMGA 2OK2A 1B6HA 1MG1A 3O6HA 5KZTA 4NMYA 2F78A 3TDJA 2RC9A 2XXQA 2NOOA 4QFLA 4U4SA 2PVUA 3MVZA 1EZ9A 2R6GE 2DE3A 3I3VA 3FVNA 1R6ZA 2O1LA 1OQHA 1MRPA 1OQGA 1B1HA 2VOZA 3U94A 2THIA 1UTHB 4OEVA 3LSFB 1MPDA 4DXCA 1B0HA 4GIZA 4H5FA 2RC8A 3G7WA 3K1MA 5HPQA 2PBWA 2PT1A 3I6VA 4GQOA 1PBQA 2W7YA 4YKKA 1JW5A 3O29A 2DVZA 1M5BA 3SEYA 2OLBA 1B4ZA 1UQWA 3K1PA 4IB2A 4QFPA 4QFNA 1HSLA 4JWXA 3Q29A 4U1OA 4IGTA 5B7DA 1WODA 1B1XA 2YJPA 3QUJA 4GOTA 4O3BA 3TPAA 3MPKA 1MXZA 4BDOA 3TTLA 2RF1A 2Y7IA 2P0SA 2UXAA 4ELQA 1MQIA 1I6BA 1LFGA 1H43A 4H65A 1MPBA 4WXJA 3U72A 4DE8A 2XXXA 1ANFA 4KCDA 4NF5A 1FTLA 3G3IA 1B05A 4KFQA 1LB8A 4LZ5A 4BDMA 5I2KA 5H8HB 4XKPA 2ZMBA 1RKMA 2Z22A 3Q25A 5KCJB 4U21A 2DXRA 2V84A 3KBRA 4GLIA 4X9TA 5I56A 4DZ1A 3ILUB 1LBCA 4GD5A 4HCYA 4LATA 1P1UA 1MDP1 3G3JA 4X1BA 2D21A 4DIGA 2H98A 2XX7A 2B65A 4ZS9A 3H03A 1BP5A 4Q30B 3TELA 4PFWA 4GL8A 3ZKKA 1LCTA 1ZMGA 5H8QA 4JWYA 5TPAB 3IR1A 4PFYA 1MM6A 3QXMA 3UORA 3FJGA 1GV8A 3GXAA 3TFLA 1N7WA 4GXAA 2ZYOA 1VFDA 2DWIA 3FUZA 4NF4A 1WDNA 2HCAA 1NL5A 1SI1A 4R6YA 1LB9A 3ZSFA 4IY5A 2I58A 3RT8A 2D5WA 2PX1A 3EHSA 4N13A 3R6UA 3TCGA 1YTVA 1B40A 4MH5A 2OZZA 4F18A 5TP9B 3M3KA 5EHSA 2G29A 3OO9A 3TODA 4C0RA 1MXYA 1N7XA 1LFHA 1NNKA 1DOTA 4IO6A 1AOVA 3MWBA 4OZ9A 2ABHA 5CBSA 1AIVA 1R1NA 1UIVA 3PU5A 3HPIA 1DPEA 2I4BA 2HEUA 3W9WA 2I49A 5CMCA 4FEBA 3H06B 3IL1B 4EQBA 2F7BA 4OENA 4OESA 4WKMA 4R72A 4KHZE 3O6IA 4OVJA 2QMWA 3B6WA 4XTCQ 4N07A 3SEUA 5L9SA 2G93A 2X7QA 3C35A 3WAEA 4RNSA 1EZPA 3N6TA 4YAHX 1EZOA 1Y20A 4GRKA 5JTYB 5BUUA 4QSCA 2QRYA 3MW0A 3IB1A 5A5XA 1JQFA 2YLNA 4OTEA 1SYHA 2R9JA 1LAFE 1IZ1A 3KN8A 4KYSA 3ZS6A 1A99A 3QYTA 4TLMB 2V3QA 3CSBA 4OETA 2DQVA 5DEXA 1JEUA 3SEWA 3BBRA 1IXIA 4G4PA 3MZ1A 4LP2B 1NNTA 5F1QA 1WVJA 5FHOA 2XD2A 1HSJA 1UIUA 4OQOA 3QSLA 3PD9A 1N84A 2NWJA 4R2BA 4Q5TA 3GZGA 4IO5A 1P1OA 4Z7EA 1Y4CA 1ZLQA 3K2DA 1IUDA 3DP6A 4IO4A 1ELJA 5FTIA 2O7IA 3IJXB 3IOUA 4ZEDA 1XOCA 1A54A 4JSOA 4NTLA 1MQHA 3PUVE 2F5XA 4OERA 1MXVA 3DP8A 1PEBA 2OJTA 4ZDMA 2PT2A 5I84A 3VVFA 2Q89A 2XXRA 3HSTA 1SD3A 1B52A 2Q9TA 4M1VA 3LSLA 3S4UA 3KN7A 3KZGA 2F97A 2I4CA 4RPNA 1FTMA 5AA4B 1PB9A 3DM0A 3RT6B 4F39A 1SDXA 5HBCA 4QRZA 5I58B 5ELVA 2WKYA 4HCWA 2F7CA 1QUIA 3GBBA 4HTGA 3VLUA 3B6QA 3Q28A 1TFAA 5AE4A 3OO8A 3ECRA 4TQUQ 4FATA 3VFJA 1B3FA 2DWAA 3PGFA 3R26A 4G2ZA 3QIMA 3OEMA 1S7YA 2FNCA 2GRVA 3H6WA 1N76A 5I59B 5I2NA 1B7UA 5I57B 1Y3QA 4F29A 3SETA 1NH7A 5AA2A 3IB0A 1BIYA 2H9BA 3K6XA 1I69A 2I3WA 3G3HA 4GL0A 2PMSA 2NUVA 2RCBA 4BLAA 3I5OA 1JVXA 4E0XA 1AMFA 4GXSB 1D3KA 3MJNA 4DLDA 3IX1A 3OXNA 2NXOA 1M5FA 3SDFA 3MAMA 4QSDA 3PUYE 1B9JA 3RPWA 2RCAA 4LQ2A 2O84X 3L6HA 1MQJA 1XHYA 2FA7A 4OFLA 2GHBA 2OWTA 3VXCA 2Y7WA 4POWA 1LAGE 4E0WA 1GR2A 2ESNA 2GFEA 1NFTA 4IO7A 3PPOA 1B3LA 1LBBA 3U8QA 2DXYA 3T66A 3S9EA 2Z8DA 5L8DA 3HCQA 4G8MA 4NF6A 4DDDA 3PUXE 3OENA 3RUMA 1GTKA 2Y84A 1UTBB 1LGBC 3N26A 4ONYA 2QL3A 2Y7KA 2HZKA 1JW4A 1B3GA 4QFKA 1B32A 2KLFA 4YICA 1LFIA 3M3LA 3ODBA 3ILTB 3FJMA 2AYSA 1A8EA 1FTKA 1IITA 1DTGA 4JSDA 3EQ1A 5DVIA 3PPNA 1B5IA 3T96B 3K0VA 1OIBA 1DPPA 1MY1A 5DVFA 5JEIA 3PMWA 2O7UA 5LOMA 1I6QA 2O1MA 1MY4A 5I2KB 2V3TA 3TTNA 2O68A 3UP9A 3TCFA 5DYHA 3S9MC 3PD8A 2ONRA 4QSEA 4XXUA 2I48A 1OLCA 5I56B 3FV1A 2F8DA 3TYHA 2O69A 5KDTA 1IIWA 4KR5A 2DOJA 4ZEBA 1IXHA 3KOSA 5K2XA 3VDFA 1JNFA 2VP1A 1A7LA 4DXUA 4NE4A 1Q35A 4G8HA 1S9TA 1SBPA 1UTHA 3MQ9A 2V93A 3U92A 1FCKA 1ZKBA 3PMXA 3PPRA 2ZNSA 5JK4A 4LZ7A 1S50A 5CC2A 4C1TA 4H1XA 3AXFA 4FEDA 4F19A 3IJOB 1GVCA 4C1UA 4F1UA 3TQWA 3U1OA 4OEUA 2XXPA 4PETA 4OXVA 3W9VA 4ND9A 1PBPA 3SEVA 3BKIB 2F36A 5ICTA 3G3GA 3C31A 1LCFA 1YAEA 4UA8A 1URGA 4NWCA 4LONB 3OO6A 3T9XB 4GFRA 4ECFA 4DXBA 1DMBA 1KWHA 1MQDA 3D4CA 4EXKA 3OMBA 4R9GA 4F31B 3VVEA 1FW0A 3TTMA 3RNNA 3KG2A 4ELRA 1B0LA 5ICQA 1CB6A 5ITOA 1D9YA 1T0KA 3H3GA 4LVQA 4RJZA 4FIMA 3O66A 3W15C 3LC8A 1FQBA 1QKAA 1BKAA 1B3HA 5H8HA 3C34A 3O28A 2ZXTA 3E3KA 3BFUA 3KSXA 1FQAA 5KCJA 4RA1A 3FGSA 2VD2A 1J1NA 3THIA 5IAIA 2Z23A 2NVUB 2HAVA 4H6DA 1Y3NA 2ANJA 4P11A 1BTJA 3VV5A 4M4GA 3PPPA 3UGWA 3FATA 1B7HA 2XXWA 2CMOA 1URSA 1QJMA 1DTZA 2M8CA 4G8NA 4R73A 3FASA 5TPAA 1RYXA 1N0TA 4O3AA 4JBZA 5A5XB 5FHNA 2XD3A 2RC7A 3OEKA 2VD3A 3CIJA 3N94A 3TZAA 3ONMA 3KFMA 3EHUA 4EXLA 2QSXA 5H8NB 4EUOA 4K3FA 4L17A 4ZZEA 4X1DA 3K6UA 1B4HA 3VVDA 2A5SA 3OSQA 2H25A 2BJJX 1FTOA 3O97A 4N6PA 2R71A 4R6KA 4GVOA 3FXRA 4RK2A 4AB5A 3V89B 5TP9A 4R6HA 1TT1A 2Y7RA 5K2YA 1N04A 1P1NA 4JWOA 1H44A 1QW0A 2E1SA 1XS5A 5EHMA 1A40A 1R9LA 3PMVA 3V8XB 3H6VA 3RTFB 3MP8A 2I6EA 2IA4A 5IKBA 4DCYA 4PQJA 3EHTA 2HXWA 1Q1KA 1VR5A 2XXHA 3S9NC 3PUWE 3SKPA 1US5A 1YCJA 4MBPA 3KSJA 4IGRA 4YB5A 1SYIA 1N3WA 1B5HA 3RTWB 3RQTA 3SESA 5CI5A 3FZVA 3QUFA 2Q8JA 3FXUA 3KN3A 4KD5A 4WEPA 3IOWA 3Q26A 4YMAA 3WAFA 2OCUA 4PFTA 2Z8EA 4NF8B 1BLFA 1NNPA 5TU0A 2REGA 3LSWA 5CMKA 1Y1ZA 1FQCA 1LAHE 4P0IA 4YB7A 1POY1 3CSGA 4FAJA 4ZECA 4EF1A 3H6TA 4FJPA 1P1QA 1VSOA 4G77A 2CZLA 2PYYA 1B51A 1O7TA 1B46A 2YPNA 5I2NB 1H3DA 5AA1A 1MQGA 4BDLA 3DELB 3B6TA 1FQFA 1P1WA 4ZE8A 5AA2B 1B58A 2Q2AA 3JV9A 4IO2A 4U23A 3O6GA 4F3SA 1SW4A 1SW1A 2A5TB 1NH8A 2DE4A 3DLNA 2Z8FA 1OVTA 1QULA 3MPLA 2HQ0A 4ESWA 4ESXA 4OWDA 4I1DA 1Y3PA 4O3CA 4G68B 1R9QA 3HV1A 1EU8A 2I3VA 1PB7A 3E9XA 3KJ7A 3H7MA 5CBRA 2I0CA 3MUQA 3HO7A 2ZNUA 3CG3A 3FVOA 2ONSA 2VGQA 2ZYKA 5AA4A 2DYXA 4YZZA 2RKMA 2F6GA 2V3UA 5I58A 3FVKA 1DSNA 1P99A 4PFUA 1LAXA 2P2AA 2UVHA 2AIXA 3K00A 3M3FA 1JVYA 3TTRA 3TTKA 2OBGA 1M5EA 4OHNA 2DVCA 3KGCA 2H5YA 4F3GA 1ATGA 4EF2A 3CG1A 2XHDA 4R9FA 2QS1A 1MY3A 5FHMA 3RLFE 1Y4TA 2FYIA 4HS7A 4U22A 2XXIA 5DVJA 1YPNA 1ZIUA 4Q0CA 5DTBA 4U2RA 2DP8A 4P0GA 5I59A 1US4A 1H45A 3K01A 5I57A 4RPOA 1SW2A 2QS3A 2B3BA 1PB8A 2QPQA 4EQ7A 3DP4A 4R75A 5ISUA 3TQLA 5KDTB 2GHAA 3KJTA 1EH3A 2UYEA 5B70A 2D3IA 4ZEIA 4ZE9A 1LLSA 1L5TA 4AB6A 3UK4A 4YB6A 3QAXA 4I62A 2F7AA 5F7VA 4FORA 4WEDA 2F35A 2XXTA 5H8FA 4NF5B 3QK6A 4I9DA 4R74A 3HHFA 5L9OA 4G68C 4PP0A 4LUBA 2UVGA 3GLBA 4DCXA 3KOTA 4XIGQ 1ZU0A 2HAUA 1UTBA 3O2AA 1N3XA 2Q88A 2UYFA 3G3KA 1OMPA 2OWSA 4ZZAA 5AA3A 4YKIA 1HSEA 4OMBA 4ISUA 4F3PA 3C4MA 3A3CA 3HHGA 5H8QB 1D9VA 2DE2A 4XKNA 3OOAA 1XT8A 3MBPA 4YMBA 2AL4A 3PUZE 1O64A 4F22A 3H4ZA 3CFZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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