3UIFA

Crystal structure of putative sulfonate abc transporter, periplasmic sulfonate-binding protein ssua from methylobacillus flagellatus kt
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
b'VEDLKVVRIASVATNVGGKTVYAGSASLVVNGAFPEELRKQGIKVEWVPAAMASVGPVINEGFASGKIDFGIYGDLPPIILNASKPTVQLVAPWGTTSNSYLVVPKNSTAKSIKDLKGKKIALHRGRPWELAFSNLLQSEGLTFKDFKIVNVNPQVGAAALASGTVDGFFSLFDSYILEDRGVGKIIWSTKTAPVDWKLMGGVWARNDFVKQNPEITQAIVTAYLKSVHWVAQDENKETYIREYSNKIYPESVNRREYDQDNVSWRQRWSPLYDVALQEHYRKAVAYAQASGLTRTQADVQQMLNPHFVATALKELKLEGFWTPNAENLY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title CRYSTAL STRUCTURE OF putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein SsuA from Methylobacillus flagellatus KT
rcsb
molecule keywords Sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding pro
source organism Methylobacillus flagellatus
molecule tags Transport protein
total genus 111
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uifA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3uifA01
1ATGA 1CE2A 3WAFA 1B4HA 5AA1A 3PU5A 2Q2CA 4LONB 2QS2A 3PPPA 4WKMA 4YB5A 3IO4A 3OD7A 2YJPA 4EUOA 3MVYA 1CB6A 1B3LA 4RXLA 2XXRA 3I6VA 3RN8A 4X1DA 4EF1A 4YZZA 2X7PA 4NF8A 4IB2A 4EQ7A 2I0CA 3D4GA 3D4CA 2RINA 3IR1A 1Y3PA 4X9TA 3KN3A 2QMXA 5H8SA 5FHMA 2ZYKA 5I58A 3MVXA 2ALUA 3PPOA 1B46A 2NOOA 1RKMA 2ABHA 4YKKA 4JWXA 1FTJA 4R6YA 3EHUA 3F11A 1Y20A 4TOZA 4FE8A 3JZJA 2O1MA 4OMBA 1B3FA 3IORA 2H4IA 3V83A 3AXFA 1JEUA 4LVQA 4HS7A 4U4SA 2O84X 5I57B 1S9TA 1B1HA 4R74A 4XKRA 1OQHA 3K00A 4YAHX 5AE4A 2UVGA 4Z7EA 5HPQA 1SD3A 4DXCA 3FVOA 4OVJA 2OWTA 5AA4A 2HFBA 4G68A 1SYHA 2UYFA 2D21A 1A99A 3HHFA 3VLVA 2H99A 3HCQA 4ZS9A 5CI5A 1VFDA 2QSXA 3G7WA 3UP9A 4LZ8A 5B70A 2I48A 1MH4A 5KCJA 1MRPA 3MVZA 2W7YA 1L5TA 2XHDA 3RTFB 1FW0A 3VXCA 4NWCA 3VVFA 1A54A 1H43A 4IY6A 3BFUA 4KD5A 3K4UA 1A40A 4N07A 2X7QA 4KYEA 4GOTA 3C36A 4GFRA 4WEPA 1ZIUA 4JB7A 1QULA 1D9YA 3IOUA 2P1SA 4NF5B 1OIBA 4BDRA 5HM4B 1UTBA 3FJGA 1II5A 3FJ7A 3CSGA 4F2QA 3H7MA 2XXYA 4DXBA 4AQ4A 1DTZA 4RK9A 4PP0A 3K02A 2I4CA 2VHAA 4NF6B 4KI0E 5DVFA 1FCKA 3QUFA 3G3GA 4HTGA 1SYIA 1JW4A 5FTHA 4P0IA 4LUBA 1SW1A 4F29A 4F1VA 3C9HA 3IAZA 5EHMA 3TTMA 3RGYA 3W9VA 4THIA 2FYIA 2REJA 3A3CA 3T9UA 3H3GA 3OMBA 2HQ0A 1A8EA 3C32A 1BLFA 2DWIA 3E3KA 4PFWA 2H9BA 1JNFA 5JTYA 3SEXA 2D5WA 1FTMA 3KG2A 3OEKA 4KR5A 1ZJLA 1PEBA 1N3XA 2RCAA 3IX1A 4OQOA 1XOCA 1Z7NE 3W15C 4YKIA 3N94A 2IA4A 2I4BA 5H8HB 1B3HA 1LAHE 4Q0CA 5KDTA 1F9BA 2XXXA 5AA4B 4F19A 3KEIA 3IL1B 2XXIA 3GLBA 2RCBA 2RC8A 2Y7KA 3DM0A 3FIRA 1B32A 5AA2A 3LR1A 4RK2A 3ZKLA 5JEIA 4GVOA 3BFTA 3MUQA 1JW5A 4PQJA 1JW1A 3B7DA 3FV1A 3TAJA 3H03A 4ELRA 3HN0A 1R1NA 3C35A 4OYVA 3PPRA 4H65A 3CG1A 1EZ9A 1IIWA 4F18A 4ZEDA 4RY1A 4YMAA 3U92A 3QXMA 1USYH 4H5FA 3MP1A 2PX1A 1ANFA 1MY2A 1XC1A 2DQVA 3VDFA 5AA2D 2CZLA 4G8MA 3FV2A 1EZOA 1A55A 3B6TA 4C1TA 3TUSA 2QS4A 3K2DA 3DP4A 4TLLB 2PT1A 2V84A 3IK6B 1IXCA 1NL5A 3T96B 3CFLA 5DVIA 3EN3A 1URDA 4XTCQ 3U94A 1Y9UA 5ELVA 5H8QA 3OENA 3FXQA 4FJPA 4H5GA 3B6WA 1OVBA 2B65A 4LATA 3OSQA 4F2OA 4OESA 4PFUA 3PMWA 1MXWA 3ODBA 2F36A 2F78A 4ZEFA 4ZEBA 1NH8A 2E0SA 1Y1ZA 4F31B 2DVZA 3QYTA 4FIMA 3M8UA 3USDA 4HCWA 4R2FA 2I6EA 3Q26A 2R71A 3SEVA 3HHGA 4KHZE 4GQOA 3GBBA 3ONMA 4BLAA 2R9JA 3O2AA 1OMPA 3FD3A 2RKMA 1GGGA 4EXKA 4TLMB 3PUVE 4ZE9A 3HPIA 1YAEA 1LBBA 2OWSA 3K6WA 4KCDA 3FASA 3H4ZA 3LSLA 5A5XA 2D3IA 1SVXB 1IEJA 1R9LA 1IITA 3IOVA 1USYE 4UACA 4U22A 4GL0A 1MXXA 5I2NA 1JQFA 3MVWA 4OFLA 4NF4B 1N04A 3SERA 4ND9A 4ZZEA 3K1NA 3V8XB 5I84A 2THIA 4F1UA 3CVGA 4C0RA 1B0LA 1QJMA 2O6AA 3FATA 4DLDA 4OHNA 4ELPA 3HV1A 1HSLA 4O3BA 1I6QA 1PBPA 4MBPA 3VLUA 1LCTA 2QS3A 4JBZA 4KQPA 3T93B 2I0BA 3MQ9A 5F7VA 1B05A 1FQFA 1LGBC 1DOTA 5I56B 5DTBA 3S2VA 2HCAA 1M5CA 1IUDA 2G29A 4GD5A 1N7WA 2XXUA 3C31A 4RPOA 1YPNA 3G3HA 3S9NC 1A8FA 1B7UA 4FEBA 3V89B 2XXVA 4IO4A 5H8NB 1P1NA 3MPKA 4H1XA 1QUKA 2O51A 2X26A 1KWHA 3IJXB 2F35A 1P1OA 1N84A 1OQGA 2PT2A 2NWJA 3BBRA 3IOWA 4DCXA 1US5A 2Q8JA 5TPAB 4EDPA 1WDNA 2QS1A 3KFMA 2F5XA 1B52A 2QPQA 3Q28A 3M3FA 5KZTA 1DMBA 3OEMA 3CSBA 1GTKA 3T66A 3S9LC 4RYAA 3MZ1A 2DXYA 4DIGA 1FQAA 3FUZA 4I62A 4OZ9A 5EYFA 1O63A 1M5EA 1JVYA 2G93A 1YTVA 3FXUA 1MH3A 3MJNA 4KCCA 1MXVA 1Y3NA 5TP9B 3MW0A 4KYSA 3C33A 4WEDA 1B3GA 3LUYA 2ZXTA 5CMKA 3UN6A 4GXSB 2XXTA 1ZTYA 3N26A 1M5DA 4F3PA 4DDDA 1S7YA 1LFIA 3DP6A 3R6UA 1MG1A 3H6TA 1NH7A 1QW0A 4MF3A 5CMCA 4F3GA 2O7UA 4JXIA 2Y84A 3VXBA 3PGFA 3LC8A 1NKXA 4YB6A 3SEWA 2FA7A 4PETA 4F3SA 5I59B 3N5LA 3N6TA 2IEEA 3T9VA 2AIXA 2H98A 2PMSA 5CRYA 4NMYA 1B1XA 2QJEA 3DLNA 2F7BA 4JWYA 1RYXA 1TXFA 2HZLA 1N3WA 3O6HA 1M5FA 2NVUB 2V3UA 1VFEA 3G3KA 1SW2A 4BDNA 1B4ZA 5BUUA 3CR9A 1NFTA 1PB9A 2Z8FA 2UXAA 3VFJA 4ZDMA 4ESWA 4LZ7A 3H6UA 1IZ1A 3ILTB 5ICTA 4F3BA 3KJTA 4N6PA 3I5OA 2Q88A 1HSJA 1MXZA 5FHOA 4ZZAA 1JEVA 4NEDA 1O7TA 4I9DA 2HEUA 1PC3A 4NF8B 3UIFA 1PB8A 1Y4CA 1B7HA 3MP8A 2V25A 1MQDA 3TCHA 5I58B 2XX8A 2QMWA 1MQJA 3P7IA 4GF8A 5F1QA 4DCYA 1M5BA 3OELA 4OENA 3RPWA 3LSFB 4OFOA 3IOTA 1DSNA 1LB8A 4I8CA 4XKPA 4XIGQ 5I2KA 2F7AA 3EPEA 4QFLA 2Q89A 5BWJA 3TDJA 1B0HA 4ZECA 3PUYE 1VSOA 4G2ZA 3N6UA 3QUJA 4M4GA 2UVJA 3FZVA 1R6ZA 4XXUA 3LSXA 5DEXA 4DZ1A 3FXRA 1PDAA 4RNSA 1B7ZA 4QHQA 4G68B 4EXLA 4C1UA 4QSDA 3FVNA 1NNTA 2I58A 1LFHA 4ZEIA 3U93A 2DS9A 2XD2A 3O6IA 3PUWE 4R72A 1XT8A 2Q9TA 2DWJA 3TCFA 2XX9A 3ZKKA 2GH9A 3KN7A 1AOVA 5KCJB 3H6WA 4FATA 4OEVA 2F6GA 1P1WA 3O29A 1MPDA 3O6GA 1ELJA 3VVEA 5CMMA 1LB9A 4X48A 4LZ5A 3VE1B 4FORA 1NNPA 5L8DA 3K1MA 3L6HA 4U1OA 1QUJA 3RY3A 1XHYA 1J1NA 2DWAA 4ZE8A 2ZNSA 1ZKBA 1VE4A 2LAOA 2OJTA 4P0GA 3PPQA 3SKPA 1UTHA 1MY0A 1H45A 3OO7A 1N76A 1ZMGA 1FTOA 4OWDA 1SDXA 3CRBA 1UTBB 3CFXA 2YPNA 2VD3A 2BJJX 4ELQA 1IQ7A 1BIYA 2UYEA 4JWOA 4R6KA 3FGSA 1I6AA 3OO6A 3A3UA 1US4A 1P1UA 1MXUA 4R9FA 3PD8A 2ONSA 4OFJA 3IB0A 4TQUQ 3MPLA 5EHSA 3IJOB 2P0SA 1EZPA 1FTLA 1PB7A 3PUXE 2Z8EA 2HXWA 1MM7A 1B5IA 1H44A 5CMBA 1EH3A 5JTYB 3G3FA 4IO6A 4ONYA 3SDFA 1MY3A 2WKYA 3DELB 2O1LA 2O68A 3TEPA 3EQ1A 1WODA 1MPCA 3W9WA 2H25A 4ZEKA 4X1BA 2ZYNA 5L9OA 4O3CA 4ISUA 5I57A 5DEXB 3UK4A 5KDTB 4GL8A 4IO2A 2QRYA 1QKBA 1D3KA 3K1PA 1HSEA 1FQEA 1B5HA 1UIVA 3MC2A 1B40A 2V3QA 1Y3QA 4QSCA 2B3FA 2DE4A 3C34A 4EQBA 1BKAA 1B51A 4EF2A 3GBAA 5AA2B 4DXUA 1IXHA 3U1OA 1B6HA 3TFLA 4BDOA 2UVHA 3SEUA 4QFOA 1Q35A 3CFZA 3TYHA 2M8CA 1OLCA 2AL4A 1Z7ME 2XXQA 1N0TA 4F1YA 4OEUA 2GFEA 1TFAA 2H5YA 4KPTA 4RA1A 3RT6B 3HO7A 4F39A 3RUMA 1MQGA 3L6GA 3O97A 3TKDA 3UA8A 1B5JA 4JSOA 1ZU0A 4NTLA 4I1DA 4YICA 2FNCA 2ZNUA 4GWOA 2DSFA 3PMVA 3MZBA 3T22A 1AH5A 2QL3A 2OBGA 4YU0A 4NF5A 5IAIA 1TWYA 3VVDA 3TODA 2XX7A 3O66A 1LAFE 3MWBA 1LAGE 5CBRA 3RNNA 5H8QB 4PFTA 3TZAA 4MFIA 3QK6A 2F6PA 4LA9A 4NF6A 1NNKA 4H0WA 1QVSA 1DPEA 3MP6A 1AL3A 3ILUB 1OVTA 3EHTA 3KZGA 2Z8DA 3KOTA 4LQ5A 4Q30B 1VR5A 4H67A 4IGRA 4P11A 4FECA 5M2VA 4RPNA 4QRZA 1B58A 3KSJA 2YLNA 1QKAA 3H6VA 2P2AA 2DVCA 2HZKA 3R26A 4U1ZA 1GV8A 3ECRA 1URSA 4MH5A 4L17A 1IXIA 4E0WA 4NWDA 4KFQA 5A5XB 4POWA 1A7LA 5L9MA 1SQYA 2GHAA 2GRVA 1WVJA 4BDLA 4YKPA 5B7DA 1AIVA 5H8HA 3M3LA 5I2NB 1ZBMA 3S9MC 2ZNTA 1RYOA 2UVIA 5K2YA 4RJZA 1LLSA 5AA3A 2ANJA 3U72A 3E9XA 2VOZA 2GHBA 1MQIA 3OOAA 1DTGA 4H8JA 3UGWA 4QSEA 3KSXA 3MBPA 2KLFA 2CMOA 2V3TA 3PPNA 3B6QA 5H8FA 1LFGA 4U21A 1LCFA 4H6DA 3LBSA 1POTA 2Y7IA 4G68C 3KGCA 3QSLA 1FQBA 3RLFE 4H8IA 3RT8A 2VD2A 2AYSA 2I3VA 4G8HA 2V93A 2A5TA 2ONRA 4IY5A 3OO8A 3TQWA 4NE4A 3RQTA 5DYHA 4IO7A 1XVXA 4GRKA 2AL5A 5ITPA 3THIA 3UORA 2ZYOA 1P99A 2Z22A 3DP8A 1T0KA 3IO6A 1B9JA 2Y7RA 4AB6A 4AB5A 1EU8A 1P1QA 1MQHA 2PBWA 5IKBA 2XD3A 3SEYA 3G3IA 2XXHA 2VP1A 3K6XA 5J1DA 1QUIA 4WXJA 3TTNA 3GXAA 3TCGA 1BTJA 3FVGA 3CI8A 2DE2A 3M3KA 4FEDA 4MLQA 1NMUA 5CM6A 4G77A 3KN8A 4PE5B 3OO9A 3HSTA 2Y7WA 4IO5A 1BP5A 2OCUA 2RC9A 1FQDA 3CIJA 4R75A 2I49A 1JETA 1ZLQA 5L9SA 5DT6A 2O7IA 3JYRA 4F22A 4QFNA 4PFYA 4R73A 2F34A 2ONKE 1O64A 4XKQA 1AMFA 3PV0E 2XXWA 3OSRA 3E13X 2ZYMA 3R7XA 3IB1A 2E1SA 1SW5A 3EHSA 2HAVA 3V5AA 3TQLA 3OXNA 2PYYA 4JSDA 2RC7A 5CC2A 4ECFA 3QIMA 4JDFA 4R6HA 4LQ2A 4K3FA 3TPAA 2PVUA 1NNFA 2R6GE 3K0VA 4POXA 1LBCA 1LSTA 1I6BA 4GLIA 4NF4A 3VLWA 5TU0A 4U2RA 1LAXA 1FQCA 4OTEA 2DP8A 5H8FB 4R2BA 3K01A 5FTIA 1N7XA 2Q2AA 3Q29A 3S9EA 4M1VA 4Q5TA 1MM6A 1D9VA 3CG3A 1MDQA 4R9GA 2A5TB 3SESA 2NXOA 4E0XA 4G4PA 4QFKA 4UA8A 3RTWB 5ISUA 3WAEA 3PUZE 1H76A 1MPBA 3FVKA 4O3AA 3BKIB 3Q27A 2DYXA 1Y4TA 5I56A 4ESXA 3PMXA 4QF9A 1OLAA 2HAUA 2DOJA 3T9HB 1D4NA 3G3JA 3E4RA 3KJ7A 3K6VA 4Q8RA 1GVCA 3ZS6A 1UQWA 1B3EA 1H3DA 1SW4A 5LOMA 2F7CA 2A5SA 2ESNA 1SBPA 4XKNA 2DE3A 5K2XA 3U8QA 2OZZA 4KYDA 5H8NA 3GZGA 1MDP1 3TTKA 1GR2A 1B2HA 1POY1 1Y1MA 3TMGA 2ZMBA 4GXAA 2RF1A 3FJMA 4Z0IA 4LP2B 5TPAA 1XVYA 4IO3A 5JK4A 5I2KB 3VV5A 1UIUA 3Q25A 3JV9A 2F97A 4BDMA 5CBSA 3KOSA 1MY4A 3KBRA 2O69A 1DPPA 3TTLA 5ICQA 3TELA 2NUVA 2B3BA 4HCYA 4YMBA 4FAJA 2OK2A 2OLBA 2DWHA 4DE8A 4G8NA 5ITOA 4MLVA 3EF7A 4HW8A 1R9QA 4OERA 5TP9A 3S4UA 1MS7A 2Y7PA 5FHNA 3TTRA 3IB2A 1XS5A 2REGA 1IXGA 4YB7A 3PD9A 5HBCA 4BDQA 1SI0A 4U4XA 3T9XB 2I3WA 3LSWA 3O28A 1JVXA 1URGA 1TFDA 2XXPA 1PBQA 4IGTA 1TT1A 1YCJA 1FTKA 3MZ9A 4EQ9A 2Z23A 3ZSFA 2DXRA 3K6UA 3O9PA 3SETA 3A09A 1SI1A 1MY1A 3C4MA 1Q1KA 4GIZA 4QFPA 4YKJA 5I59A 1S50A 4OETA 4U23A 4ELOA 1UTHB 3I3VA 2VGQA 5DVJA 4N13A 1I69A 4OXVA 3H06B 3QAXA 1MXYA 2F8DA 3MAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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