4THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus with covalently bound 4-amino-2,5-dimethylpyrimidine
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA02
2PYYA 4QFPA 2GH9A 3Q28A 3OELA 1MPDA 5I2KA 4OYVA 1DPEA 2H4IA 2M8CA 2Q8JA 3T22A 1PBQA 4Z7EA 1MH3A 3K1PA 4KD5A 4F1VA 1N04A 4MBPA 3KG2A 2HFBA 4XIGQ 4YAHX 1B4HA 1SI1A 4RJZA 1ATGA 1IXGA 4GOTA 4G4PA 1LLSA 3LBSA 3Q25A 1MY1A 3PUVE 4H65A 3QXMA 2QS2A 2DWJA 4ESWA 3F11A 3B7DA 3W9VA 4RPNA 2DQVA 1Z7NE 5H8FB 4ECFA 1MXUA 1S9TA 2HEUA 2ZYKA 2G93A 2X26A 2QS4A 1MPCA 2W7YA 5IAIA 1MDP1 4RNSA 3FJMA 2B65A 3PPPA 3TKDA 2D21A 3K1MA 4FJPA 1IXCA 1URGA 1FQEA 1GV8A 2XXPA 3R7XA 4WKMA 2VHAA 3B6TA 1PB8A 3IOUA 1IUDA 2X7PA 3JV9A 3TQLA 4BLAA 4UACA 1DTGA 2VD3A 1LBCA 1MS7A 4R6YA 4JXIA 4EUOA 3IAZA 3OO7A 2FNCA 3SERA 2RCAA 4P11A 1ANFA 4OWDA 4PETA 2HAUA 3BFTA 3OO6A 3IJXB 1Y4TA 2DE4A 3CFXA 3PV0E 4X1BA 2F36A 4F39A 2ZMBA 2DVZA 4QF9A 1VFDA 1QUKA 3LC8A 3TCGA 3Q27A 5FHNA 5I59A 1DPPA 3WAFA 2O7IA 3MUQA 1R1NA 3MPKA 5BUUA 3OMBA 3FV1A 4U21A 3FXQA 4TOZA 4DZ1A 1MXYA 4YMBA 2XXQA 3MAMA 4I1DA 3E3KA 3H03A 2H9BA 3PMVA 4EXLA 3CFLA 3T96B 1YTVA 3DLNA 3IB2A 2R71A 3FD3A 5FHOA 4DE8A 4YICA 3SKPA 4IO3A 1D9YA 5ITOA 3HCQA 3W15C 1XVXA 1AIVA 2QJEA 2ONSA 4OEUA 4TQUQ 1B3LA 3IOTA 5CMBA 4R9GA 4OMBA 1N76A 1FCKA 4O3AA 1BKAA 3FATA 5I2NA 3TODA 3KSXA 1IITA 1LAFE 2UVIA 3ODBA 2Y7KA 1FW0A 3SEXA 1MQIA 1JEUA 1Q1KA 4Q0CA 1MH4A 1NFTA 4JDFA 1D4NA 3BKIB 4KPTA 3VVFA 4OVJA 1B1XA 5HPQA 3DP8A 4IB2A 2AL4A 2QPQA 4OERA 2ESNA 2H98A 1A40A 1SDXA 1MY0A 4R2FA 1AL3A 2F5XA 3O66A 4GL0A 3OO8A 2O51A 3U8QA 3EPEA 1VSOA 2UVHA 3HV1A 3UORA 1XS5A 4EDPA 4F2QA 1CE2A 1QUJA 4G8MA 1FQCA 2V93A 4WXJA 3RT8A 3FVKA 1J1NA 1AMFA 1DMBA 3IX1A 4PFWA 2D5WA 1SYHA 4QFNA 2DXRA 2XXTA 4XKQA 5JTYB 4HS7A 3H6WA 4WEDA 4X1DA 3ONMA 4BDLA 3H6TA 5LOMA 5H8NB 1SW4A 3K6UA 1SYIA 4DCXA 1QUIA 4NF6B 1LFGA 4LZ8A 3R6UA 5CI5A 3C31A 1EZOA 1M5CA 3OENA 5DVFA 1B3HA 1USYH 3LUYA 3V8XB 3O6HA 3EN3A 3TPAA 1B32A 3FXUA 1YAEA 4RK2A 4R6KA 4RA1A 3N26A 3IB1A 4RY1A 1M5BA 3TTMA 4BDRA 4ISUA 5H8HB 3MP8A 4OQOA 3TTLA 3QYTA 3KZGA 3TCFA 3S9LC 3KN3A 4IO6A 5EHSA 5AA2B 1NNTA 4GRKA 3V83A 4NWCA 4YMAA 4U4SA 1B40A 2ZYNA 4JB7A 1O63A 4JWXA 3CR9A 4F31B 3OSQA 3FV2A 4FECA 5ISUA 5DYHA 3TTKA 4HW8A 4G8NA 2O69A 3JZJA 3E9XA 4DLDA 1GR2A 5L8DA 1POY1 3KN7A 3C9HA 2F78A 1PC3A 4R75A 4U22A 1UTBA 2Z22A 2KLFA 1ZKBA 2XX8A 3A3CA 1MY3A 1RYOA 4L17A 4N07A 3C32A 1D3KA 1LAGE 3FJ7A 1B1HA 1SW5A 4MLVA 4F19A 3K6XA 4H8JA 3TELA 3MVXA 2XXIA 2V25A 3UA8A 3CG1A 3T9XB 2ONRA 3I3VA 4IO2A 3M3FA 4GQOA 1FQDA 1H45A 1LSTA 3FXRA 1JVXA 4ZE8A 2P2AA 4RYAA 3H4ZA 3KOTA 4JWYA 3O29A 1LB9A 4LVQA 3A09A 2HZLA 1IEJA 4LQ5A 5EYFA 2H5YA 2Q9TA 4HCWA 3ILUB 4YKKA 4OFLA 4GIZA 4AB6A 3MVYA 4HTGA 2UYEA 4GXSB 4I9DA 3BFUA 4G68A 1B7ZA 1FQBA 1OIBA 4AQ4A 1MY2A 2THIA 3RNNA 4M1VA 4ZEDA 1B0HA 1Y20A 3G3HA 3O28A 3U93A 5AE4A 2FYIA 2PBWA 3N6UA 4R74A 2X7QA 5DT6A 3U92A 3C34A 2QSXA 2UXAA 4R9FA 3QK6A 3D4GA 5L9OA 3KOSA 2ZNSA 4FE8A 1OQGA 4G68C 4ZZAA 3T9VA 4BDNA 1FTKA 4NMYA 4OFOA 4F29A 4R2BA 4GWOA 3PPRA 1XC1A 3FJGA 3PPNA 1BIYA 3O2AA 1MRPA 4XTCQ 1EZPA 2F35A 1TT1A 3ZS6A 4ZE9A 3IORA 2YPNA 1PDAA 1SBPA 4PFUA 2V3QA 5K2YA 4NF4B 1GGGA 3OD7A 3TCHA 1PB7A 3QUJA 5DEXB 5H8FA 2A5SA 2A5TB 2HXWA 2ALUA 2Y7RA 2F34A 3GBAA 2R9JA 1AOVA 3K01A 3MZ1A 1MQDA 5CMMA 3LSFB 4LP2B 2RC7A 4ZS9A 4H8IA 3MC2A 5I56B 1T0KA 1IZ1A 2XHDA 2Z23A 2F6GA 4KFQA 5AA4B 3MZ9A 1B58A 2ZYOA 2DOJA 2ANJA 5ICQA 4QSEA 3O6IA 1B52A 1BP5A 1WODA 4F2OA 4KI0E 1SQYA 2XXYA 4HCYA 1SD3A 5KZTA 4ELQA 4KQPA 1TFDA 2D3IA 4FATA 4RK9A 2VP1A 1P1NA 2RC9A 2I4CA 3PD9A 2Z8DA 1MG1A 2I58A 4XXUA 1FTJA 3SESA 5KCJB 3GBBA 4GD5A 1N3XA 3QIMA 5ELVA 1Y1MA 3VLUA 4EQBA 1IQ7A 1VE4A 5DTBA 2Y84A 5CRYA 3CIJA 3RUMA 3V89B 1IXHA 1ZIUA 4U1ZA 1GTKA 2VOZA 2ONKE 4N6PA 5HBCA 1F9BA 4LZ7A 4H0WA 1M5EA 3SDFA 2G29A 2DSFA 4X48A 2RKMA 4G8HA 1DTZA 2HAVA 3MW0A 1UTHB 2NUVA 5TP9B 1UTHA 4OHNA 4YB7A 4BDMA 3RGYA 4FEDA 2AYSA 1A8FA 3KFMA 2PVUA 2Z8EA 3OOAA 4U23A 4N13A 1XOCA 4YKIA 5B7DA 3N5LA 4DXBA 1N0TA 3EQ1A 2AL5A 4F3GA 2IA4A 3VLWA 2HZKA 1DOTA 1BTJA 3RN8A 3BBRA 2OWTA 3VVEA 1M5DA 1Y4CA 4IY5A 2I4BA 1H3DA 5TPAB 5FTHA 3EF7A 5TPAA 3K6VA 3K00A 4ND9A 3IO4A 1LCFA 3LR1A 2UVGA 2O7UA 2XXHA 5FHMA 2OBGA 3T9UA 4KYEA 1MPBA 2DE2A 4JSOA 2YJPA 2P0SA 2QS3A 2NWJA 2B3BA 2RF1A 4C1UA 4YB5A 1OVBA 4IO5A 3C33A 1I6AA 1IIWA 5I58B 3IOVA 5CMCA 5CM6A 3FIRA 1B3FA 4POXA 3VLVA 1QULA 3FVNA 4G2ZA 4QSDA 1JNFA 5F7VA 5AA2D 3LSXA 3C36A 2F97A 1Y1ZA 3T66A 2XD3A 1UIUA 3EHUA 2V3UA 5JTYA 4P0IA 3CRBA 4RXLA 2DP8A 4GXAA 3U1OA 3ZKKA 4KCDA 5H8NA 3U72A 4DXCA 4KYDA 4NF6A 1Z7ME 3Q29A 2REGA 3TYHA 3B6WA 3HHFA 1P99A 2VGQA 3UGWA 1R9LA 3G3IA 3PMXA 3UIFA 2NVUB 1XVYA 2O6AA 4C0RA 4LZ5A 3OO9A 3D4CA 3MP6A 3T9HB 1O64A 1OQHA 3MBPA 3EHSA 4DXUA 3GZGA 5H8HA 4ZZEA 4IGRA 1POTA 1A54A 4QHQA 4ONYA 1EH3A 3FVOA 4H6DA 5HM4B 2E1SA 2Q89A 1SI0A 2PX1A 2CZLA 4KYSA 2FA7A 5AA2A 1P1QA 5AA1A 1YCJA 4DIGA 5BWJA 2O68A 4Z0IA 3DELB 4OEVA 1JW4A 3K4UA 2LAOA 2QL3A 1NL5A 4MH5A 2CMOA 1ZMGA 4IGTA 1HSEA 1SVXB 3AXFA 3E13X 3G3JA 2GHAA 4EQ7A 1NNPA 1URDA 1A8EA 1LAXA 3USDA 3FVGA 4LA9A 3N6TA 5I84A 4F18A 1QKBA 1Y9UA 2F7CA 1CB6A 1NKXA 3K1NA 3M3KA 3PU5A 3G3GA 4XKRA 2OJTA 3H7MA 1B5JA 4MF3A 2Z8FA 3IL1B 4POWA 1N3WA 4YKJA 3G3FA 2REJA 2QRYA 2OCUA 4F1YA 3S9EA 2Y7WA 3SEWA 4OETA 1RKMA 4JBZA 1OLCA 4FIMA 4Q8RA 1I6BA 3RTFB 3P7IA 2RCBA 5F1QA 3JYRA 1N84A 4MFIA 2I0CA 2ZNUA 3N94A 4ZECA 1JQFA 1A7LA 1PB9A 4XKPA 1B05A 1B3EA 2O1LA 4AB5A 2QS1A 3RLFE 3SEYA 4THIA 2VD2A 1P1OA 4GVOA 1ZJLA 4O3BA 1MQJA 3EHTA 1US5A 1ZU0A 1OLAA 3GXAA 1N7WA 1M5FA 1L5TA 2DS9A 4BDQA 3G7WA 3H3GA 4ELRA 1Y3QA 2AIXA 1D9VA 1H76A 2E0SA 5H8QB 3VV5A 4H5FA 5H8QA 2UYFA 1H44A 3RT6B 4JSDA 5JEIA 3IK6B 1ELJA 3K0VA 4UA8A 3G3KA 4ZEFA 1SW1A 4I8CA 3HHGA 3TTNA 3H6UA 5I2KB 3DP6A 4E0XA 1A99A 5L9SA 3MP1A 5ITPA 3IB0A 3V5AA 4DCYA 1EU8A 3PD8A 3TTRA 3PUYE 4JWOA 3IR1A 4QSCA 2IEEA 3H6VA 4I62A 4NF4A 5DEXA 3O6GA 1VR5A 2OWSA 3M8UA 2A5TA 5H8SA 1ZTYA 3L6GA 3ECRA 1MXWA 3PPQA 2NXOA 1TXFA 3M3LA 2F6PA 1NH8A 5I57B 5I57A 5A5XB 5A5XA 5I56A 2UVJA 2O84X 3HSTA 1FQAA 2PMSA 4PP0A 1QJMA 3SEVA 2ABHA 3QUFA 3IO6A 4LUBA 5J1DA 5AA4A 4EF1A 1QKAA 2DXYA 1USYE 3S4UA 1OVTA 5CBRA 2H25A 4O3CA 3VVDA 4FAJA 2OZZA 2RINA 2XXUA 3CFZA 4ESXA 2ZXTA 2WKYA 1JEVA 2R6GE 1TFAA 2V3TA 4OFJA 5K2XA 1FTOA 5KCJA 4P0GA 1B5HA 1MQGA 1FQFA 2F7AA 3UN6A 4M4GA 4R73A 4F3PA 1S50A 3PUWE 3MZBA 3QSLA 1R6ZA 4MLQA 1LGBC 4F1UA 2P1SA 4EXKA 1B9JA 3U94A 5I59B 2F8DA 2QMXA 3FZVA 4FEBA 4ELOA 2Q2AA 1NNFA 3OEMA 3K6WA 4NF5B 3L6HA 4NF5A 5TP9A 2I6EA 1SW2A 3MVWA 5CBSA 5JK4A 3VXBA 3K2DA 1MM6A 4QFLA 4WEPA 3TMGA 1B0LA 4EQ9A 3S9NC 3HO7A 1NH7A 4KHZE 3IOWA 4C1TA 4ELPA 3DP4A 4DDDA 1N7XA 4YU0A 3TFLA 2DWIA 4YB6A 5L9MA 2H99A 3CG3A 1FTLA 4QFKA 4H1XA 1B46A 3MWBA 1MDQA 4TLLB 1UIVA 2DYXA 4XKNA 2RC8A 3FUZA 3CVGA 4GL8A 1B3GA 1LAHE 4PFYA 1US4A 4R6HA 2XX9A 3S9MC 2XXVA 1AH5A 3RPWA 1P1UA 1B7UA 5I2NB 3HPIA 2ZYMA 4PQJA 1MM7A 2GRVA 1LFIA 4GFRA 1Y3NA 4OENA 3TUSA 1NNKA 2XX7A 3SETA 1H43A 1I6QA 2XD2A 1JETA 1DSNA 4H5GA 4RPOA 1O7TA 4YZZA 3KJTA 3PUXE 5I58A 4TLMB 3HN0A 3IJOB 3RTWB 4F3SA 3TAJA 2DWHA 1ZBMA 1URSA 3KGCA 5IKBA 4IO7A 1B5IA 4U4XA 3MJNA 4LQ2A 3CSGA 4Q30B 4Q5TA 5DVJA 4YKPA 3KN8A 3FGSA 3O9PA 2DWAA 4K3FA 4R72A 1B7HA 1B51A 4OXVA 1A55A 4OTEA 1MQHA 1XT8A 4GLIA 1XHYA 4NEDA 3S2VA 1LB8A 3WAEA 3ILTB 3LSLA 5CC2A 2QMWA 4BDOA 4NTLA 3C4MA 3H06B 3OEKA 2I48A 1WDNA 3PMWA 1JW1A 1ZLQA 1B2HA 1IXIA 1Y3PA 3PGFA 5M2VA 3TEPA 3C35A 1MXZA 4E0WA 4OESA 1BLFA 1S7YA 2HCAA 2Q2CA 1RYXA 1QVSA 4ZEIA 2Y7IA 3MVZA 1P1WA 2DE3A 4H67A 4PFTA 3VFJA 1NMUA 3KSJA 2XXWA 4QFOA 2HQ0A 4ZDMA 3TZAA 3VDFA 4F22A 2OLBA 2GFEA 1R9QA 1WVJA 2PT2A 4KCCA 2BJJX 3DM0A 3KEIA 3LSWA 1QW0A 5B70A 3FASA 3TDJA 3MPLA 3ZKLA 1Q35A 4EF2A 3QAXA 3KJ7A 2O1MA 1PEBA 3OXNA 4IY6A 2F7BA 3VE1B 2Y7PA 1MXXA 1JVYA 1MXVA 3TQWA 3K02A 3E4RA 2Q88A 4LONB 1HSLA 1UTBB 2B3FA 4U1OA 2PT1A 4NWDA 4NF8B 1TWYA 4NF8A 3SEUA 3PPOA 3MQ9A 1LFHA 1I69A 3VXCA 2XXXA 1II5A 2XXRA 2ZNTA 3O97A 3T93B 1GVCA 4OZ9A 4KR5A 4ZEBA 3RQTA 5AA3A 3UP9A 1VFEA 1EZ9A 4QRZA 1LCTA 5TU0A 4GF8A 2NOOA 2DVCA 3A3UA 1MY4A 3RY3A 3UK4A 5KDTB 5KDTA 2GHBA 4ZEKA 4IO4A 3KBRA 1YPNA 1FTMA 3OSRA 1UQWA 3B6QA 2I3VA 3Q26A 1JW5A 4G77A 3ZSFA 4X9TA 3CI8A 5EHMA 5DVIA 1HSJA 3CSBA 2I0BA 4F3BA 4LATA 4G68B 5CMKA 3GLBA 1B4ZA 1KWHA 2I49A 2I3WA 5FTIA 2OK2A 1PBPA 5ICTA 3PUZE 4U2RA 3I5OA 4NE4A 1LBBA 2YLNA 1OMPA 3I6VA 4PE5B 1B6HA 3W9WA 2V84A 4FORA 3THIA 3R26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PYYA 4QFPA 2GH9A 3Q28A 3OELA 1MPDA 5I2KA 4OYVA 4UABA 1NUYA 1DPEA 2H4IA 2M8CA 2Q8JA 3T22A 4GBVA 1FPFA 1PBQA 4Z7EA 2VPNA 4GX4A 1MH3A 3K1PA 4KD5A 4F1VA 1N04A 1BK4A 4MBPA 5LTCA 3KG2A 2HFBA 3PTYA 4XIGQ 4YAHX 1B4HA 1SI1A 4RJZA 1ATGA 4PFBA 1IXGA 4GOTA 4PDDA 4G4PA 1LLSA 3LBSA 3Q25A 1MY1A 2MKZA 3PUVE 4H65A 3E79A 3QXMA 4QXDA 2QS2A 2DWJA 4ESWA 3F11A 3B7DA 3W9VA 4RPNA 2DQVA 1Z7NE 5H8FB 4ECFA 1MXUA 1S9TA 2HEUA 4NG7A 2ZYKA 2G93A 2X26A 1FSAA 2QS4A 5IZ3B 2FIEA 1MPCA 2W7YA 5ET7A 5IAIA 1MDP1 4RNSA 3FJMA 2B65A 3PPPA 3TKDA 2D21A 3K1MA 4FJPA 1NUWA 1IXCA 1URGA 2WEFA 4XFEA 1FQEA 1GV8A 2XXPA 3R7XA 4WKMA 2VHAA 3B6TA 1PB8A 3IOUA 1IUDA 2X7PA 5ET8A 3JV9A 3TQLA 4BLAA 4UACA 1DTGA 2VD3A 1LBCA 1MS7A 4R6YA 4JXIA 4EUOA 3IAZA 3OO7A 2FNCA 3SERA 2RCAA 4P11A 1ANFA 2R8TA 2Q8MA 4OWDA 4PETA 2HAUA 3BFTA 3OO6A 3IJXB 1Y4TA 2DE4A 2ZZVA 3CFXA 3PV0E 4X1BA 2F36A 4F39A 1FBFA 2ZMBA 2DVZA 4QF9A 1VFDA 1QUKA 3LC8A 3TCGA 3Q27A 5FHNA 5I59A 1DPPA 3WAFA 2WYKA 2O7IA 3MUQA 1R1NA 3MPKA 5BUUA 3OMBA 3FV1A 4U21A 3FXQA 1FJ6A 4TOZA 4DZ1A 1MXYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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