4THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus with covalently bound 4-amino-2,5-dimethylpyrimidine
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
b'ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA02
4F3BA 3UK4A 3RT6B 3EHTA 1BTJA 3PUVE 3Q29A 5CMBA 5AA2D 1B1XA 2D5WA 4QFKA 1XHYA 4EDPA 4KD5A 3QK6A 3G3GA 3QUJA 3SESA 2PYYA 3FASA 2H25A 3V5AA 2Y7KA 3OSQA 3RUMA 3PU5A 2XX7A 3TFLA 2A5TA 3U92A 3SDFA 3OO6A 1DPPA 4LZ7A 4MBPA 3U72A 3IOVA 3VV5A 4JSOA 3T9XB 1LFHA 3PGFA 3MAMA 1FQDA 3KZGA 3H4ZA 4R73A 4IO7A 4GWOA 2X7QA 3GXAA 2OK2A 4PE5B 5AA4B 1UIUA 3CSGA 2F6PA 4YZZA 1B3GA 1Y1MA 2RC7A 1XC1A 1ZJLA 2YJPA 3Q27A 2VD2A 1S50A 2UVGA 4QFNA 2XXUA 4IGRA 3E9XA 1QJMA 5EHMA 3K2DA 1H43A 2XX9A 3H6UA 4F18A 4IO2A 1QUIA 1R9QA 3TDJA 2OLBA 1GGGA 5TP9B 2F35A 5H8HB 5I2KB 1D9YA 4LATA 4N07A 4DE8A 2PX1A 1MG1A 4TOZA 5DYHA 4K3FA 4TQUQ 2Y84A 2GRVA 3ILUB 1B7UA 3O6HA 2NWJA 4IO5A 4GF8A 2NUVA 1US4A 1O63A 3OXNA 2F7AA 1OLCA 1IQ7A 1ZMGA 4C0RA 2DSFA 1MDQA 4JSDA 5ISUA 5CBSA 1XT8A 4GL8A 4GD5A 1H3DA 1I69A 1FTOA 2RKMA 3RQTA 1KWHA 4WEDA 3C33A 3TAJA 2DQVA 4YAHX 4EQ7A 5F7VA 3BKIB 3IO6A 2THIA 1Y20A 1SW5A 1SI1A 3K01A 1TFAA 2H9BA 1A7LA 1R1NA 2Z22A 3MVZA 4OERA 3C36A 4ZEDA 1LAFE 1MY2A 3IOWA 3UORA 1UTBB 5FHOA 1B9JA 4JB7A 3KN3A 3CRBA 3TODA 1LSTA 3BBRA 4MFIA 3QSLA 4QSEA 1D9VA 3S9EA 2I3WA 2ESNA 1UIVA 3OSRA 2PMSA 2VP1A 2Z23A 4YB5A 2PBWA 3R26A 4ESWA 1QKAA 1MY3A 4OFLA 4XIGQ 3PUYE 2O51A 4PFWA 5CI5A 3RT8A 4X48A 1JNFA 5L9OA 2BJJX 1I6AA 3O28A 2HAUA 4ELOA 1HSEA 1A8FA 4RK2A 3E4RA 3U1OA 1M5FA 1Y4CA 1MM7A 4DDDA 1TXFA 4FAJA 3SKPA 3A3CA 5DTBA 3B6WA 1EZPA 4BDMA 1B3LA 1L5TA 3KG2A 4NF4B 1URGA 5JTYB 3PMXA 3RPWA 4ZEKA 4F2QA 3LSLA 3CIJA 4U4SA 2DXYA 3RGYA 1OVBA 4FECA 2QL3A 3ZKKA 3PPQA 4ND9A 2V3UA 3FVNA 2G93A 4H5FA 4JXIA 3P7IA 4R74A 2XD3A 1SYHA 2F7BA 3O29A 1PB9A 5AA4A 3O6IA 3H7MA 1LBBA 4AB5A 1B40A 3G7WA 1QVSA 2HZLA 2Q89A 5B7DA 2UYFA 2CZLA 3TYHA 1AIVA 1UQWA 1MY1A 1IUDA 2B3BA 3UGWA 2ZXTA 5TP9A 1JW1A 5I2KA 4R9FA 2A5SA 4KYDA 1XOCA 3CFXA 2FNCA 3T9HB 4EXKA 1FQBA 2R71A 3ILTB 1Q35A 2KLFA 3TPAA 3CSBA 4NWCA 3TTKA 3HN0A 1LLSA 4PP0A 4GQOA 5FHMA 1N04A 5H8QA 4LA9A 1IITA 1SBPA 3M3FA 2RINA 4P0GA 2B65A 1NNPA 1SQYA 4MLVA 2F5XA 4ELPA 3MPLA 3KN7A 4U23A 4UA8A 3MWBA 4O3CA 4KQPA 1SDXA 4AB6A 4MF3A 4DCXA 2V3QA 4ZEFA 4H8JA 5FHNA 2DVCA 4BDQA 1B32A 5I2NB 1WVJA 2XXRA 1H76A 1JVXA 2P2AA 1FTJA 2XXVA 3VVDA 3RNNA 1SYIA 3E13X 1A54A 4IB2A 3KJTA 1B2HA 3EHUA 1UTBA 1URDA 3JYRA 4QF9A 1QKBA 5JEIA 4ISUA 2XXPA 3MP8A 1JETA 3QUFA 3RTFB 3ZS6A 3EPEA 3OEMA 4BLAA 2Y7WA 4KPTA 4YKPA 3CVGA 1OQHA 3T96B 3KSXA 2IEEA 1Z7NE 4YB7A 1B0HA 2OWTA 1VFDA 4ZE8A 3UIFA 1JVYA 2Q2CA 4WEPA 4QHQA 2ALUA 5JK4A 3G3FA 2I49A 2XXXA 4HCYA 2DWIA 1OQGA 5CM6A 2I4BA 1DPEA 2H99A 1USYE 2HQ0A 2Y7PA 3FVOA 1MH3A 4NF4A 3HPIA 5HBCA 3EF7A 5JTYA 1MH4A 2I3VA 1FTKA 1EH3A 1EZ9A 2VHAA 1QUJA 4OEVA 5TPAB 2F8DA 3VLUA 5L9MA 3CG3A 3H06B 4N13A 1IEJA 1F9BA 1FQFA 5M2VA 1N0TA 3PUXE 3VFJA 3GZGA 4LQ5A 3LC8A 2DE4A 4RY1A 5I58B 3MP6A 3I6VA 4R2FA 3LBSA 4QRZA 1A40A 4G2ZA 1LCTA 2OBGA 1BP5A 3U94A 2AYSA 3MC2A 3RLFE 4DIGA 2DWJA 1TT1A 4JBZA 2O1LA 4G8NA 3S2VA 1M5BA 4KFQA 4H67A 1DOTA 1MPBA 3TEPA 4U22A 5I56B 4H0WA 2F7CA 1SW2A 4QFPA 4WXJA 4F29A 2D3IA 1GVCA 1FCKA 1B3EA 3K6VA 4FIMA 5LOMA 1B7HA 3PV0E 3GBAA 4IY6A 3TTLA 4ZECA 4IO6A 3S9MC 1B4ZA 1JQFA 4LUBA 1M5EA 1IXHA 1PB8A 1B05A 1DTGA 2QS3A 5H8FB 2DVZA 5H8SA 1US5A 2RC8A 4YMAA 3V89B 4G77A 4EF2A 4EXLA 4QSDA 4R6KA 1BKAA 4GOTA 4ZS9A 1JW5A 3PD9A 1B0LA 1BIYA 2ZYOA 5I2NA 2DYXA 1GV8A 5H8QB 4Z7EA 1Z7ME 1DTZA 1N3XA 1PDAA 4GRKA 4HCWA 4QSCA 3PUZE 3ZSFA 2FYIA 4F2OA 2Y7RA 3GBBA 3A09A 3IR1A 4YKKA 2Y7IA 3OEKA 4F3PA 1OLAA 1WDNA 4FEBA 2XXIA 4U1OA 3MVYA 3MZ9A 3G3IA 3FVGA 2FA7A 1GTKA 1S7YA 3USDA 2HEUA 4F39A 4UACA 3O6GA 4GXAA 1SW1A 5I57A 4POWA 4XTCQ 1NNFA 4EUOA 1YPNA 4GVOA 4TLMB 2OZZA 4PQJA 5A5XA 3TCGA 1ZTYA 1ZU0A 3C31A 1I6BA 1MQIA 4OZ9A 4RJZA 3OOAA 3B7DA 3TQWA 3OENA 3WAEA 2ZNTA 2R6GE 3CFZA 4OVJA 3IAZA 3H6WA 4PFTA 4ZEBA 2OJTA 2I6EA 4EQBA 3K6UA 2I58A 3JV9A 2WKYA 3C4MA 5TPAA 3MZBA 4GLIA 3JZJA 3SEVA 1MPCA 1MQDA 1IIWA 4NF6B 2V93A 1P1NA 2D21A 3ONMA 4DXUA 4IO4A 1AH5A 3GLBA 4I9DA 1FQAA 3LUYA 5HM4B 2GHAA 4C1TA 5AA1A 1NKXA 5I58A 4DLDA 4IGTA 3FXQA 1YCJA 1CB6A 4E0XA 4OEUA 4ZZAA 3DELB 1P1UA 2PT2A 3VVFA 1NH7A 2QS2A 3RTWB 4MH5A 2REJA 1JW4A 1JEUA 4FE8A 2ANJA 4F1VA 2DWAA 5AA2B 3DP8A 1YTVA 2PT1A 4E0WA 4FATA 2H4IA 4G68C 3LSWA 1D4NA 3W9VA 1NFTA 1MY0A 3C35A 4OTEA 1ELJA 2QSXA 3PPRA 5I56A 1B46A 2F36A 4JDFA 3HCQA 4R2BA 3T9UA 4KYEA 4YICA 1IXIA 3TKDA 2OCUA 2P0SA 3VXCA 4OETA 1OMPA 4HTGA 3VXBA 2RCAA 5K2XA 1HSLA 5J1DA 1Q1KA 5H8FA 5AA3A 3H3GA 2F97A 4LONB 1B4HA 1A55A 3EN3A 4ELRA 1NNTA 5L8DA 2F78A 4O3AA 4OWDA 3S4UA 2PVUA 1LAXA 3KOTA 2RCBA 5CMCA 2UVJA 2OWSA 1TFDA 3IJOB 3N6TA 5KCJB 2NOOA 3EHSA 1ZLQA 3K00A 5ICQA 2ONKE 2O69A 2Q9TA 3W15C 2XXHA 4MLQA 2O6AA 2DP8A 3OD7A 3U8QA 3UN6A 1Y9UA 1VE4A 2XHDA 3I5OA 5DVFA 2CMOA 4LVQA 3SEXA 4ZE9A 3TELA 1RYXA 4NEDA 4KCDA 3OO8A 4Q0CA 3AXFA 3VDFA 2E0SA 4XKRA 4DXCA 3FATA 4I1DA 5I59B 3HSTA 4POXA 2GH9A 4GXSB 2UXAA 1IXGA 2V84A 5DVJA 3MPKA 4ELQA 3PPNA 2Z8FA 4L17A 3ECRA 1LB9A 4XKPA 1ATGA 2I4CA 4U21A 2HCAA 5B70A 3KSJA 4OXVA 3V8XB 4NF8B 1Y3QA 4LQ2A 1QW0A 5I57B 1B5IA 1IZ1A 4GFRA 5A5XB 4PFYA 4KCCA 2DE2A 5FTHA 1HSJA 3ZKLA 3FD3A 3MQ9A 4NF6A 4R6HA 1XS5A 1O64A 1DSNA 3T22A 2LAOA 3PD8A 4ONYA 3WAFA 4F1UA 1N3WA 1PBQA 3OELA 1YAEA 3MBPA 3MJNA 1NNKA 3FJ7A 3TCFA 1UTHB 5KDTB 3TCHA 4U2RA 2IA4A 3F11A 3KOSA 1IXCA 4F1YA 3L6HA 2P1SA 4H65A 4P0IA 4N6PA 4YMBA 3S9NC 3IORA 3MZ1A 2UVIA 4XXUA 1O7TA 1LB8A 3K0VA 3SETA 3Q28A 3N26A 3B6TA 5AA2A 5CC2A 2Z8EA 3T9VA 1QUKA 2W7YA 3QXMA 2E1SA 4I8CA 2QMXA 2QS4A 1LCFA 4ESXA 1R9LA 4Z0IA 3SERA 1MQHA 3HV1A 4M1VA 3MVXA 1OVTA 1MQGA 3IO4A 2V25A 3DM0A 1AMFA 3IK6B 3W9WA 3M8UA 3PPOA 5DVIA 3BFTA 2UVHA 2V3TA 3D4CA 1AOVA 3CR9A 1JEVA 5CRYA 5ITPA 1B5HA 1MY4A 5CMKA 1LBCA 1M5CA 1B1HA 5IAIA 1Y3NA 4U1ZA 2M8CA 3DP4A 1II5A 4QFOA 4TLLB 2HZKA 4P11A 4LP2B 4KR5A 4I62A 1N84A 1LAGE 3OO7A 1B3HA 1WODA 4R75A 4OYVA 4NF5B 1CE2A 2Q88A 2I0CA 3SEUA 4R72A 5KCJA 4YB6A 1POTA 4X1BA 2VD3A 3LSXA 3D4GA 3SEWA 3Q25A 3G3KA 1SVXB 2ZYKA 4X1DA 3PUWE 3R7XA 4X9TA 1NL5A 3MUQA 1TWYA 1Y4TA 3IX1A 1GR2A 1H45A 4G4PA 2NXOA 4FEDA 4RXLA 4OFJA 3FXRA 3C32A 1MXWA 3K6WA 3IL1B 3G3JA 5H8NA 3N94A 1A8EA 2F6GA 3IOTA 3KEIA 3HO7A 5I59A 3ODBA 2GFEA 2YLNA 1A99A 3DLNA 3FGSA 3MW0A 4F31B 5BUUA 1DMBA 2B3FA 1NMUA 3THIA 1VR5A 2QMWA 3IJXB 5KZTA 5FTIA 3DP6A 1P1WA 1B51A 3T66A 5I84A 5K2YA 3VE1B 4NF8A 4RA1A 3TZAA 1N76A 2ZNUA 4NMYA 1MM6A 1VFEA 4NWDA 3TTRA 3FV1A 1QULA 1FW0A 3FV2A 4BDNA 3SEYA 2AL5A 2QS1A 4OQOA 4LZ8A 4XKNA 1FQCA 1S9TA 4H6DA 1P1QA 4C1UA 1UTHA 2NVUB 5KDTA 1J1NA 3H03A 2ONSA 3N5LA 5ELVA 3PMWA 3K1PA 2QRYA 2ZYMA 3KFMA 3CI8A 1T0KA 2G29A 4OFOA 1FTMA 4G68B 4JWXA 4BDOA 3V83A 3C9HA 1MXUA 3BFUA 2HFBA 5DEXA 5TU0A 2DS9A 2RF1A 3FXUA 4H5GA 1RKMA 3A3UA 3RN8A 3Q26A 1N7WA 3O97A 4RNSA 2R9JA 1B58A 4G8MA 2ZMBA 1R6ZA 3IOUA 4EQ9A 3OO9A 3M3LA 3HHFA 1SI0A 2QPQA 1ANFA 4F19A 4ZEIA 1B6HA 3LR1A 4KYSA 1XVXA 4XKQA 1B5JA 1LGBC 1BLFA 4QFLA 4OENA 3H6VA 4YU0A 1P99A 4FORA 2I48A 2GHBA 1MPDA 5HPQA 1B52A 4F3GA 1LAHE 4ECFA 5EYFA 1MRPA 1PB7A 5IKBA 3FVKA 3UA8A 2HAVA 2XD2A 2VOZA 1MDP1 3OMBA 1H44A 1OIBA 2H98A 1MS7A 3VVEA 3R6UA 2XXQA 1PEBA 2UYEA 3LSFB 5L9SA 2DOJA 3KGCA 3FJMA 3B6QA 4BDLA 3FZVA 2A5TB 1P1OA 1PBPA 3TTNA 3TQLA 4H8IA 4DCYA 1Y1ZA 4YKJA 4NF5A 4F22A 2YPNA 3U93A 4U4XA 3KBRA 4R6YA 1NH8A 2Z8DA 3K1MA 3G3HA 3CFLA 4Q8RA 3I3VA 3CG1A 3VLWA 3K6XA 3KJ7A 1MXXA 3O66A 5H8HA 2O68A 3VLVA 2XX8A 1M5DA 4O3BA 1EU8A 3QYTA 1MXZA 1FTLA 1LFIA 1POY1 1ZKBA 3O2AA 4G8HA 4OMBA 4OESA 4IO3A 4Q30B 2XXYA 4OHNA 4KHZE 1MQJA 1D3KA 3FIRA 3FUZA 1ZIUA 4GL0A 4R9GA 2X26A 3HHGA 3MVWA 2X7PA 3T93B 1XVYA 4F3SA 2ZNSA 3K1NA 2RC9A 5F1QA 2VGQA 3FJGA 3TMGA 2DWHA 2DXRA 2QJEA 1LFGA 2AIXA 3EQ1A 4KI0E 3N6UA 2ONRA 5ICTA 4IY5A 5H8NB 2I0BA 4JWYA 1MXVA 4FJPA 4NTLA 3RY3A 3UP9A 5BWJA 2XXWA 4M4GA 2O1MA 4H1XA 3PPPA 1I6QA 3M3KA 2ABHA 1PC3A 2REGA 3E3KA 4AQ4A 1Y3PA 3MP1A 1ZBMA 1MXYA 1RYOA 4ZDMA 2H5YA 4LZ5A 3K02A 1AL3A 5DT6A 1SW4A 3PMVA 3H6TA 3QIMA 2Q2AA 2DE3A 2O84X 4EF1A 3TTMA 4THIA 3QAXA 3TUSA 5AE4A 4DZ1A 4DXBA 3IB2A 2AL4A 4RYAA 3O9PA 2O7IA 3KN8A 3K4UA 4PETA 1EZOA 4WKMA 4G68A 2F34A 1URSA 4GIZA 2Q8JA 3IB1A 4HW8A 4HS7A 1B3FA 2ZYNA 3L6GA 3S9LC 4Q5TA 5CBRA 4ZZEA 4RPNA 4RK9A 4NE4A 1N7XA 2O7UA 4JWOA 4RPOA 5EHSA 5CMMA 1SD3A 4BDRA 3IB0A 2XXTA 2HXWA 1B7ZA 1USYH 4YKIA 5DEXB 4PFUA 3C34A 5ITOA 1VSOA 1FQEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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