4THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus with covalently bound 4-amino-2,5-dimethylpyrimidine
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA02
4MH5A 4JWYA 3FUZA 3QUJA 2ALUA 2D5WA 3W9WA 1EU8A 5JK4A 5TPAA 1Y9UA 3Q28A 4P0IA 3LC8A 5TU0A 2GFEA 1BIYA 3C35A 3TCHA 4F19A 1H3DA 4NTLA 2RC8A 3RLFE 5JTYB 1T0KA 3TODA 1Y3QA 2XXPA 1ANFA 4XKRA 4YZZA 1B1HA 1TT1A 3N6TA 3OOAA 5L8DA 5CM6A 4KR5A 4M1VA 2Y7IA 4FORA 1S50A 2ONKE 4ZS9A 5H8QA 1H43A 4R6YA 1B3LA 3CG3A 4FEDA 1IXCA 4EDPA 3CG1A 2V84A 4F29A 3QK6A 2QS3A 2F6PA 2Q89A 5BUUA 4GWOA 4OFLA 1LGBC 2NOOA 4O3AA 3PMXA 1IQ7A 2RINA 2Z23A 4KYEA 1AMFA 3T93B 1IXHA 3PMWA 3O2AA 2R6GE 3H7MA 4ELPA 1POTA 3FATA 5I2NA 4KYSA 4X48A 2B3FA 2HFBA 4GL8A 1B5HA 2NWJA 5H8QB 3FVNA 1IUDA 2I48A 4GF8A 5L9MA 5HPQA 3N5LA 4FEBA 4Q5TA 2H98A 1JVXA 3QIMA 3R7XA 1B32A 4EQBA 4YKJA 4QSDA 4U1ZA 2ZNUA 4ZE8A 5I2KA 1LAFE 1B9JA 2UVJA 4R9GA 4KCCA 5FHNA 4F2OA 2CMOA 2FA7A 2UXAA 3I5OA 3IB1A 4YU0A 1AOVA 3H6TA 1B7HA 2Z8EA 3MPKA 3R26A 5H8HB 4YMBA 5ICTA 4IGRA 4RPNA 4EXLA 3O6GA 3EN3A 4ZZEA 1GV8A 2DQVA 5DYHA 3UGWA 5KZTA 2B3BA 3EF7A 3THIA 1B3HA 1JEUA 1XS5A 2GH9A 1B7UA 1DPPA 1LBBA 1P1QA 1PBQA 2ONRA 3BFUA 3ILTB 4GQOA 3Q29A 5H8FB 4F31B 4YMAA 3FJGA 1S9TA 2HAVA 1AH5A 4G8HA 3SEXA 1EZ9A 4OERA 5ICQA 1Q35A 2QRYA 2VGQA 1QUJA 1VR5A 4R2BA 4LP2B 1O7TA 5TP9A 5CRYA 4DXCA 5I84A 2DXYA 5KCJA 3A09A 3SKPA 4NE4A 2Y7WA 5EYFA 5M2VA 4YKPA 3ZKKA 4G4PA 1B40A 1ELJA 4G8NA 2GRVA 4DDDA 2AL4A 1MY4A 4I62A 4HW8A 3T22A 1QKAA 2XD2A 4GOTA 4NEDA 4OESA 4OTEA 1M5CA 4U4XA 2F7BA 1GVCA 3VXBA 5H8FA 2XXUA 4KQPA 5CC2A 2QJEA 1B7ZA 1NNPA 2Q2CA 1UIUA 2I3VA 4G68B 2YLNA 3L6GA 1FTKA 3TCGA 2Z8FA 5CMBA 3TQWA 3VLVA 3QSLA 2ZYOA 1DMBA 4QFNA 1EZOA 3MUQA 3PUZE 1UQWA 3T9HB 4GXAA 4LVQA 3U1OA 2F7AA 5I56A 5ITOA 4ZEKA 2WKYA 1MXUA 1ZU0A 3GXAA 1PEBA 4LZ5A 5K2XA 3RQTA 3VE1B 3VLWA 4ESXA 1B0LA 3DELB 3GLBA 3MP1A 2P1SA 3CI8A 1SW2A 3A3CA 3S9EA 1OLAA 3E4RA 4K3FA 1N04A 1NH7A 3KGCA 3C36A 3PUXE 5I58A 1RKMA 1Y4CA 4PETA 4RJZA 3M3LA 3SDFA 3IK6B 3W15C 1QULA 3PGFA 4OQOA 4JWOA 4BLAA 2ESNA 1H44A 2O69A 2XX7A 3SEVA 1D9VA 2Z22A 3ODBA 4IO4A 4UACA 3FVOA 3Q26A 3DP4A 1B6HA 3TTLA 3HHFA 4H0WA 1ZIUA 4YB6A 5DTBA 3PUWE 4O3BA 3QYTA 4F3PA 2V93A 3MVYA 3PUYE 1OVTA 4QFKA 3TDJA 3TYHA 3E13X 3H6VA 1OMPA 1IXIA 3IAZA 4XKPA 1B0HA 5EHSA 1URDA 2XXTA 1M5DA 3C31A 2QPQA 4GIZA 1JW4A 3PPOA 2QS1A 4LZ8A 4WEPA 3UORA 4DZ1A 5HM4B 3I6VA 3CSGA 3TQLA 1MH3A 1B4HA 5DVIA 3PUVE 3FVKA 3LR1A 3MBPA 1D9YA 4BDNA 4FATA 4Q8RA 3CFXA 4YKIA 3TZAA 4ELOA 5JTYA 1POY1 3EHUA 4OVJA 3EPEA 3Q27A 3TUSA 2DWIA 4NWCA 1UIVA 3D4GA 3PPQA 2RC9A 4NMYA 3IB2A 3KN7A 4NF5B 4OYVA 5CMKA 1LCFA 1WDNA 3G3IA 3K6VA 1FQDA 1MDQA 3TELA 3IL1B 3KN3A 3PU5A 4EUOA 1LSTA 4ZZAA 3IORA 1F9BA 2DE3A 3O28A 4LA9A 3VV5A 4DCYA 4EF1A 2UYFA 1MY2A 4RY1A 3IOUA 4TLMB 1JETA 3M8UA 1EZPA 4O3CA 4FJPA 2VD2A 3TTMA 2FNCA 1TXFA 4MLVA 1M5EA 2O68A 1R1NA 4EQ7A 1JW1A 1NL5A 1DSNA 5AA3A 3D4CA 4PFYA 3BFTA 3U72A 1IITA 3QXMA 2UYEA 4U4SA 4I1DA 1ZJLA 4RYAA 5H8NA 5I56B 1DTZA 4JDFA 3C9HA 2H99A 3MC2A 3T96B 1JVYA 4KD5A 3UK4A 2GHAA 2W7YA 3AXFA 3TAJA 5CMCA 3TEPA 2R9JA 3G3KA 2QMXA 1DPEA 4MLQA 1MXWA 1XHYA 1Q1KA 4JSOA 4PE5B 3U92A 2V25A 2RC7A 3V89B 1VFEA 3C34A 4WKMA 3W9VA 2OBGA 3O9PA 3O29A 4AQ4A 4TLLB 5I57A 5IKBA 2O1LA 1MM7A 3FD3A 3UP9A 3MZ9A 3RPWA 5I59A 2RCBA 3SEUA 3LSLA 4PFUA 3FJ7A 2LAOA 3PPNA 1LB9A 4DXUA 1MXVA 1WVJA 2H4IA 2M8CA 2D21A 2O1MA 4IGTA 3RT6B 1I69A 4E0XA 1BLFA 1N7XA 1P1WA 5AA1A 5I58B 4DLDA 1NMUA 4IY6A 2H25A 1N7WA 2X26A 3K2DA 3LBSA 4IO6A 3KOSA 3KN8A 5F7VA 1I6QA 4ELQA 1PDAA 3WAEA 2XXIA 4RA1A 2D3IA 5ELVA 2VHAA 3PD9A 2XXQA 5L9OA 1FQCA 3RN8A 4KPTA 4XTCQ 1VE4A 1MPCA 2F34A 1AL3A 1JNFA 2HZLA 2ZYNA 4OHNA 4IO2A 4NF4A 1O64A 2B65A 4NWDA 4P11A 2O51A 3FGSA 3B7DA 4R75A 1VSOA 4I9DA 1N3WA 2R71A 1PB8A 3OO7A 4H65A 3DLNA 3DP8A 2A5TB 3T9UA 3USDA 3WAFA 3IOTA 4AB6A 2PYYA 4EQ9A 4HCYA 4PFWA 3TCFA 2QS4A 3DM0A 4R73A 3V5AA 4I8CA 3G3HA 4G68A 4LQ2A 3T9XB 3IO6A 5F1QA 5FHMA 4OENA 4ZEFA 4JB7A 4FAJA 3MAMA 5H8SA 4H67A 4GD5A 3FXUA 3A3UA 3FJMA 5KCJB 1MY3A 3K6XA 1ZLQA 3OSQA 1N0TA 5L9SA 4BDRA 3KZGA 2HAUA 2X7PA 4KI0E 1D3KA 1MQIA 1B1XA 2PBWA 1A54A 3HN0A 4QF9A 3MPLA 4LATA 5I2NB 1SW1A 1MXZA 1IZ1A 5DEXA 1SW5A 4GFRA 2NUVA 3MZ1A 5LOMA 4POXA 3U93A 1HSLA 3KSJA 1GTKA 3T66A 1MQGA 1MH4A 2I0CA 3BKIB 3K01A 4ND9A 5EHMA 1JQFA 2F35A 3U8QA 3ZSFA 2V3UA 3MJNA 3EQ1A 4H1XA 4ONYA 2ZYMA 1URGA 1XT8A 3FXRA 3K1NA 5K2YA 1PB7A 1MQHA 1NKXA 5JEIA 1B58A 1YCJA 3TFLA 1VFDA 5AA2B 4H5GA 1P99A 4Q0CA 1B5IA 2XXVA 1FQFA 3PPPA 2E1SA 4BDMA 4ESWA 3FV2A 1BKAA 2F5XA 3S9NC 3OO6A 4JWXA 1FTLA 1MPDA 3H03A 1DOTA 5AA2A 1AIVA 1KWHA 2KLFA 2Y7KA 3GBBA 2DS9A 3H3GA 3I3VA 4KYDA 1I6AA 3MVWA 4NF6B 4F3GA 1ZMGA 2QSXA 1BP5A 1QKBA 1UTBB 2UVGA 3FV1A 4H6DA 4F18A 3IJOB 3E9XA 5A5XA 4G2ZA 3S9LC 2Q8JA 3IB0A 1M5BA 2UVIA 3QUFA 3SEYA 4IO3A 4QSEA 2RKMA 3MW0A 4BDOA 1PBPA 1SW4A 2F97A 2O7IA 1UTHA 2ZXTA 4TOZA 4ZEDA 2I4CA 4WXJA 2I3WA 4H8IA 3OD7A 4XKNA 2HCAA 1PC3A 1LB8A 2F36A 3OO9A 3MVXA 1IIWA 1BTJA 1XVXA 4QFPA 4F22A 1URSA 1DTGA 2H9BA 2H5YA 3HHGA 4ELRA 1TFDA 2OWTA 2OLBA 3IR1A 3K00A 3K4UA 1MQDA 2NXOA 1SYHA 2V3QA 4OETA 4IO5A 1B51A 2I49A 1FTOA 3EHSA 4YB5A 1SBPA 5CBSA 1MY0A 4Z7EA 5BWJA 3K0VA 1R9QA 1A40A 1QVSA 4H5FA 1QW0A 4YB7A 3CIJA 3CVGA 3IJXB 3ZS6A 1QUKA 3OSRA 2ONSA 3ZKLA 3K02A 4OXVA 4R72A 3MP8A 4JSDA 2OCUA 1Y4TA 1A99A 2F7CA 4ZEBA 3RTWB 3HCQA 2I58A 2DE2A 4THIA 3FXQA 2DYXA 3V8XB 2Y7PA 2Q2AA 3ILUB 4R6KA 4RPOA 3RUMA 2CZLA 2VD3A 3Q25A 3SEWA 1M5FA 2XXRA 4PQJA 4EF2A 5AA4A 1GGGA 1UTHB 1Z7NE 1B05A 2REJA 1QJMA 1S7YA 2UVHA 4FE8A 4HS7A 3E3KA 4MBPA 4ECFA 3VFJA 2THIA 4KFQA 2AYSA 2DWJA 2ZNTA 3BBRA 3VVFA 2X7QA 3B6QA 4WEDA 1B3FA 1QUIA 2ABHA 2OJTA 3RTFB 1SI0A 4G77A 2HXWA 2YJPA 4ZDMA 3UIFA 4ZECA 1MG1A 2O84X 3OENA 3ONMA 1YAEA 2Z8DA 2ZYKA 1SQYA 2F6GA 3R6UA 1Y3PA 3IO4A 3KBRA 3MWBA 3N26A 1H45A 4U1OA 5H8HA 4ZEIA 2ZMBA 2DXRA 2XXYA 1JW5A 3CFZA 3KJ7A 2DP8A 3H6WA 1Y1ZA 2XX8A 4G68C 1N84A 4NF6A 4PP0A 1B46A 3S2VA 3TMGA 1HSJA 3MVZA 1B3GA 4JXIA 1P1UA 2A5TA 4PFTA 1FCKA 3VLUA 5KDTB 1MM6A 3JYRA 1LCTA 1LAXA 1L5TA 1R9LA 2P0SA 1ZKBA 3B6TA 1IXGA 3LSWA 4G8MA 1CE2A 3SERA 1A8EA 1MRPA 3OO8A 1B4ZA 2IEEA 3KJTA 3CFLA 5I57B 1LFHA 3VXCA 3ECRA 2F78A 2VP1A 1Y3NA 2DVZA 4UA8A 1FTJA 2AIXA 4DIGA 1US5A 3C4MA 3PPRA 3G3FA 2ANJA 3RY3A 1USYH 2A5SA 3VVEA 1II5A 1NFTA 2AL5A 1ATGA 2VOZA 4RK9A 2G29A 1LLSA 3N94A 2IA4A 3FASA 4HCWA 4OFOA 2Y84A 5CI5A 1H76A 2REGA 5FTIA 4OWDA 5DVFA 3S4UA 2QMWA 1XVYA 1MDP1 4OEUA 4DXBA 1MS7A 2OK2A 3KOTA 1FTMA 3IX1A 3C32A 1I6BA 4F3BA 1B52A 3RT8A 4GRKA 5J1DA 3LUYA 5I59B 3G7WA 5TPAB 3TTRA 3MQ9A 3RNNA 1N3XA 5AE4A 1LAHE 3K6WA 1IEJA 1B2HA 1JEVA 1OQGA 3MP6A 2F8DA 1Y1MA 2XD3A 3OXNA 1UTBA 3KG2A 3B6WA 4AB5A 5B7DA 4YAHX 4QRZA 3JV9A 2E0SA 3K6UA 3KEIA 4JBZA 4U23A 2V3TA 3HPIA 4X1DA 4YICA 5TP9B 4BDLA 3FVGA 1Y20A 2DWHA 1NNKA 1J1NA 1OQHA 2PVUA 4E0WA 2NVUB 2DSFA 4C1TA 1YPNA 2PX1A 4EXKA 2DWAA 5B70A 3TTNA 4N6PA 1B5JA 2DE4A 1PB9A 4XXUA 1MQJA 5HBCA 4YKKA 2PMSA 3T9VA 5DT6A 1NNFA 1FQAA 2I0BA 4IY5A 4LQ5A 4R74A 4F1YA 4X9TA 1A8FA 4F1VA 5DVJA 1US4A 1NH8A 4IB2A 4OFJA 3IOVA 5A5XB 2OWSA 1SYIA 1EH3A 3C33A 3LSXA 2XXWA 3V83A 4FIMA 2DOJA 3OEKA 5DEXB 4RXLA 1LFGA 4N13A 2HZKA 3DP6A 3N6UA 2HQ0A 1RYOA 3O66A 1N76A 1USYE 4ZE9A 4LONB 4NF8B 4Q30B 1R6ZA 2PT2A 4C0RA 3M3KA 1ZTYA 3GZGA 5I2KB 3H4ZA 4QSCA 3UA8A 3VDFA 3VVDA 4M4GA 4GVOA 4RNSA 3G3JA 1MXXA 3O6IA 4P0GA 1FW0A 4IO7A 4QFLA 4QFOA 1HSEA 2PT1A 3CSBA 4TQUQ 3CRBA 3H06B 4KHZE 1B3EA 1P1OA 2O6AA 3PD8A 4F3SA 4N07A 2XXXA 5AA4B 3OMBA 4GLIA 1SVXB 2OZZA 3UN6A 2ZNSA 2XHDA 3FZVA 2XX9A 4U21A 5ITPA 1ZBMA 4FECA 1LAGE 1YTVA 3QAXA 2Q9TA 1TWYA 2G93A 3IOWA 5CMMA 4Z0IA 4H8JA 1FQBA 4R2FA 3L6HA 4QHQA 1O63A 1GR2A 4R6HA 2GHBA 3HV1A 3S9MC 3KSXA 4GL0A 4MFIA 2Y7RA 1TFAA 3TKDA 5FHOA 1WODA 4RK2A 3TPAA 3GBAA 1CB6A 3K1PA 2I4BA 4XKQA 2QS2A 4GXSB 4NF8A 1MPBA 1OLCA 4MF3A 5IAIA 3EHTA 3OELA 3U94A 1MXYA 3G3GA 4LUBA 1SD3A 4U2RA 1OVBA 1SDXA 4NF5A 4XIGQ 4F1UA 2I6EA 1LBCA 4R9FA 4OEVA 4C1UA 3JZJA 3PMVA 5ISUA 3PV0E 1D4NA 4X1BA 1MY1A 3HSTA 5FTHA 1SI1A 2RCAA 4POWA 5CBRA 2BJJX 2P2AA 2YPNA 3H6UA 3MZBA 3SETA 3O97A 3SESA 5AA2D 3M3FA 4BDQA 2DVCA 3K1MA 1RYXA 4OZ9A 4DCXA 1P1NA 4U22A 4NF4B 4LZ7A 4F2QA 3P7IA 1A55A 1XOCA 2RF1A 3F11A 2Q88A 2XXHA 3LSFB 1Z7ME 1FQEA 3OEMA 4KCDA 5KDTA 3CR9A 3HO7A 5H8NB 4ISUA 3RGYA 4DE8A 1OIBA 1XC1A 2FYIA 2O7UA 4L17A 3TTKA 4F39A 3FIRA 1LFIA 4OMBA 3KFMA 4HTGA 2QL3A 1NNTA 1A7LA 3O6HA 2HEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MH5A 4JWYA 2WX9A 5IZZA 5JK4A 4P0IA 2RC8A 1T0KA 1ANFA 5L8DA 1TT1A 4KR5A 1RDYA 4FEDA 4PE3A 4AS4A 2QS3A 4GWOA 4OFLA 2NOOA 2RINA 4OVSA 1NV3A 3O2AA 1POTA 4PAFA 2B3FA 4GL8A 5H8QB 5L9MA 4FEBA 4Q5TA 2H98A 1JVXA 1B32A 1RDXA 4U1ZA 4UABA 2ZNUA 5I2KA 2UVJA 4R9GA 1NV7A 2CMOA 4MNCA 3BIHA 3R26A 4NQ8A 5IZ3B 4IGRA 1IMEA 3EN3A 4PGPA 5KZTA 5DYHA 1B3HA 1JEUA 2GH9A 3FJGA 2WYKA 2ONRA 4GQOA 3Q29A 2HAVA 1AH5A 1EZ9A 1QUJA 1VR5A 1O7TA 1FTAA 3A09A 3IFAA 5EYGA 5M2VA 1QKAA 4OTEA 1M5CA 3D1RA 4MJOA 5CC2A 1YYZA 1B7ZA 3TQWA 2Z8FA 1K9ZA 3MUQA 4NF0A 5ITOA 3GXAA 3VE1B 1PEBA 3RQTA 4K3FA 4FBPA 1YXIA 2XX7A 2Z22A 1XI6A 4UACA 2WBDA 3DP4A 5IZ1A 3TDJA 3PUYE 3E13X 3IAZA 3V5AA 2XXTA 3C31A 4GIZA 4LZ8A 2QVRA 1EYKA 5HM4B 3CSGA 3MBPA 1D9YA 1NV5A 1NUZA 3CFXA 3TZAA 4OVJA 4NWCA 4PF6A 4NMYA 4OYVA 2QVUA 1FQDA 3KN3A 1LSTA 3IOUA 1EZPA 1TXFA 4MLVA 2O68A 3D4CA 3T0JA 2UYEA 4I1DA 1ZJLA 5H8NA 1DTZA 4KD5A 3G3KA 4MLQA 2V25A 3V89B 1VFEA 4AQ4A 5IKBA 3O29A 3FD3A 3MZ9A 3LSLA 4PFUA 2LAOA 4OANA 1WVJA 3RT6B 1N7XA 4P8BA 1I6QA 3PD9A 2XXQA 1MPCA 5T3JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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