2P2AA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-bn-tet-ampa at 2.26a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A tetrazolyl-substituted subtype-selective AMPA receptor agonist.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA02
3Q25A 2RC7A 4EQ9A 1NFTA 5H8FA 3N6UA 4PFUA 4U21A 4PFTA 3T93B 1LCFA 4G8MA 1VE4A 2O69A 3T9XB 1SBPA 2IEEA 2Z22A 1MQHA 1SQYA 3L6GA 4R72A 4YKJA 1OLCA 4NTLA 5IAIA 2H9BA 2NUVA 3B6WA 3S2VA 5ITPA 3MUQA 4ZEIA 2PBWA 1O64A 3IX1A 5FTIA 3SKPA 4TQUQ 4QFNA 4ESWA 4F18A 4I1DA 1B4ZA 4PE5B 4R2BA 1P99A 1QULA 1LFIA 1CE2A 1MXWA 4F29A 2HEUA 4XXUA 3FVNA 1YCJA 2VP1A 3GXAA 4KI0E 4QFPA 4YAHX 5L8DA 4ECFA 2I4CA 3TQLA 3SEXA 4DE8A 3H6UA 4JDFA 1BIYA 4DZ1A 4WEPA 1MDP1 2ZYOA 1B9JA 1VFEA 4JSOA 3VFJA 2I49A 3QXMA 4U23A 1QJMA 3HN0A 4R2FA 3KN7A 3GLBA 1XVXA 4OTEA 1RKMA 4WKMA 1B46A 1QW0A 2Q2CA 3VE1B 2O68A 1N76A 4R75A 1DTGA 3ZSFA 3OSQA 3BFUA 3FD3A 4KD5A 1Y20A 2DP8A 2ZNUA 4HCYA 3MZ1A 1B7ZA 4QSEA 4ZDMA 1UTBB 4NF6B 2Z8DA 3VVFA 3HCQA 1MH4A 1ZU0A 1OLAA 1MXVA 4H6DA 2HFBA 2WKYA 1B3EA 1AMFA 4E0WA 1QUKA 4IO3A 1JW4A 3OXNA 3U93A 2XXYA 2F78A 4NWCA 5CM6A 1IUDA 1SW1A 3H06B 1N7WA 2H5YA 1ANFA 2OLBA 4KCCA 2HZLA 3LBSA 3OMBA 3PUVE 2O1LA 5H8QA 3UIFA 3LR1A 4ZE8A 5I2NA 4GFRA 5L9SA 2NWJA 5I57B 3U94A 1SVXB 2UVHA 4G68B 4EUOA 1ZMGA 1RYOA 2V93A 4H8JA 4R6YA 4PQJA 2P2AA 3FUZA 3TZAA 3VXBA 5K2YA 1ZJLA 2QMWA 4KYEA 2Q2AA 1PB7A 3BFTA 3HHGA 1JEUA 3T22A 4XKQA 3CFXA 2QS3A 2THIA 2XX9A 4NMYA 1JW1A 4OHNA 1B2HA 1JQFA 4M4GA 4KCDA 5CC2A 1PDAA 2E0SA 3EN3A 4OEVA 4YMBA 3KGCA 4GIZA 1UTHB 1B51A 3HV1A 4F3BA 1DPEA 2REGA 4EXKA 5KCJA 3MQ9A 2DWHA 3PPPA 4FORA 3UN6A 3IO6A 1XS5A 4GF8A 2QJEA 3MVXA 5BWJA 1TT1A 1B3FA 2QPQA 4ISUA 2F6GA 1SI1A 2P0SA 3OSRA 1IEJA 1IXCA 3C4MA 3OEKA 3MP8A 1I6AA 4C1TA 4AB6A 1DTZA 3FASA 1IQ7A 3O6HA 3QUJA 1TWYA 4XKRA 2A5SA 1IITA 4BDOA 2RC8A 5AA2D 4KR5A 1BLFA 1Y1ZA 1SW5A 2Z23A 3EHTA 3SEVA 3RNNA 1MM7A 4JWXA 4QFOA 3M8UA 3O97A 4HS7A 1EZOA 4UACA 4IY5A 4H5GA 2OWTA 2PVUA 3THIA 4FEBA 4C1UA 4EQ7A 1D9VA 4F1YA 1VFDA 1OVBA 1O7TA 2FA7A 3U8QA 5LOMA 1MY1A 1URGA 2H99A 1I69A 1B3LA 3MPLA 2DE3A 2ANJA 1UTHA 3K6VA 5H8FB 1A99A 3K1PA 3B6QA 4YU0A 1B05A 3E13X 2F36A 3EQ1A 4H0WA 4NF5B 1ZLQA 3M3LA 3MBPA 1LCTA 4YB7A 3V8XB 2Y84A 3CI8A 2PT1A 3R7XA 3VLVA 4E0XA 2I6EA 1LAFE 2OWSA 2Z8FA 3M3FA 4R6HA 2V25A 5CBRA 3PPQA 4KYSA 1OQHA 1PB8A 3WAFA 1B0HA 1II5A 2CZLA 3W15C 1QUJA 1XOCA 3MPKA 5FTHA 4MFIA 3U92A 3CRBA 1B7HA 1US4A 2X26A 4N13A 5DVIA 1OMPA 3HPIA 2HAVA 3C31A 3FXRA 4G68C 4QF9A 3T66A 2Y7PA 3KZGA 3VLUA 1S7YA 1HSJA 3H3GA 1R6ZA 3IR1A 1SW4A 4KPTA 1I6QA 3KFMA 4EXLA 3VDFA 5CBSA 3QUFA 2B3BA 3EPEA 3IJXB 3KBRA 1PC3A 4NE4A 4YMAA 1I6BA 3GBAA 1MY4A 1USYH 2Q8JA 4NF5A 4IO2A 3TMGA 3FJGA 4MBPA 4F2QA 4HW8A 4WXJA 2DYXA 1IXHA 3MVZA 5AA4B 5H8NB 5AE4A 4EQBA 1H43A 3Q27A 1FQCA 2V3TA 3O28A 1IXGA 2OCUA 4NF8B 2PX1A 1QUIA 5JTYB 3K2DA 2O1MA 3OEMA 4Z7EA 1IIWA 1GGGA 5TPAB 2I0CA 1LAXA 2GRVA 4I62A 4JSDA 4RXLA 5DYHA 1Y4TA 3U72A 1B52A 1M5BA 1JEVA 3GBBA 5DEXB 5H8SA 3ZKLA 2DXYA 5H8HA 1AOVA 2VHAA 2UVIA 3TTRA 3FZVA 2ONKE 1Y1MA 3CVGA 1MY3A 4JWOA 4ND9A 1QVSA 4FE8A 2XX8A 4IB2A 5AA2B 4OERA 4K3FA 5KDTB 1N04A 4ZZEA 2UYEA 2NXOA 1JW5A 1LFHA 1GR2A 3E9XA 1B3GA 3FV2A 3K0VA 1Q1KA 4QRZA 4BDLA 5J1DA 4FIMA 1D3KA 2ABHA 2NOOA 4F3PA 4G8HA 4DDDA 1A8EA 2A5TA 3IOWA 3O2AA 3PUYE 1FW0A 5KCJB 3MP6A 1RYXA 1H3DA 4TLLB 3PD9A 2O84X 1Y4CA 1DMBA 4G4PA 4N6PA 4BDQA 2PT2A 2DSFA 3RTFB 4ELPA 1ATGA 1MQJA 2DVZA 4IGRA 4DXUA 5CMBA 5FHMA 4YB5A 3LSWA 3N5LA 3KOSA 2DQVA 1NNFA 5CMMA 1QKBA 2YJPA 1FTJA 3G7WA 4XTCQ 4GLIA 4RA1A 4F1VA 4DLDA 2QS4A 3CG1A 3PV0E 1R1NA 2HZKA 3PMWA 3Q26A 4G68A 4I8CA 4ZS9A 5EHSA 3USDA 4F31B 2YLNA 2XD2A 3EHUA 2QS2A 3LSFB 5CRYA 1O63A 3H6VA 3UP9A 3K6UA 4H65A 4JB7A 3ONMA 2XXIA 3LC8A 2QL3A 1B5JA 1N7XA 3TYHA 1M5CA 4QSDA 1IZ1A 4G8NA 2R71A 3WAEA 3QAXA 3RY3A 4ELRA 3FVKA 5DEXA 2F6PA 2XX7A 4LATA 3N6TA 3CSBA 5I59A 4AB5A 3PGFA 5TP9A 5A5XA 1A40A 4F39A 5CMKA 2ZMBA 1A55A 4FATA 3S9LC 1WDNA 1BTJA 2KLFA 3O6GA 2UYFA 1R9QA 1XHYA 1YPNA 3FXUA 4GOTA 4H5FA 3R6UA 2IA4A 4LP2B 4POWA 3D4CA 3CFLA 3FATA 4OMBA 4Q8RA 1B1XA 2A5TB 1TFDA 4LZ7A 3ZS6A 3U1OA 3KOTA 4LVQA 1BKAA 1MY0A 3MVWA 1FTKA 3L6HA 2PYYA 2ONRA 3EHSA 4JBZA 3TCFA 3UGWA 2XXTA 5KDTA 2OBGA 3MW0A 1N0TA 4JXIA 1UQWA 1JNFA 2F97A 4GRKA 5K2XA 3TQWA 4EDPA 2GHAA 4F3SA 5B70A 3QSLA 1MXXA 4RPNA 4OESA 3RQTA 3IORA 1SD3A 2B65A 4U4SA 5H8HB 3W9VA 2DWIA 3OO8A 4QHQA 5DVJA 4DCYA 1S50A 1EH3A 1NH8A 2O7IA 1MPDA 1WVJA 4IGTA 4LUBA 2ZYKA 4LONB 4NWDA 1GVCA 2RC9A 3RPWA 2UVGA 3ZKKA 1JETA 5TPAA 3V89B 2OZZA 2RCAA 1B6HA 3H6WA 3G3IA 1JVYA 3PU5A 3FJMA 2ZNTA 4O3AA 4RK9A 4TOZA 4U22A 1Z7ME 1FTMA 2XXXA 4G77A 4GVOA 4BDNA 3VLWA 3HO7A 2XXWA 1LAGE 3G3KA 4IY6A 3Q29A 1CB6A 1LBCA 1NMUA 1NNTA 2I48A 2QSXA 1NKXA 3O29A 2VD2A 2R6GE 2NVUB 4BLAA 5JEIA 1D4NA 1Y9UA 4YZZA 2ZYMA 3H6TA 1N3XA 1MQIA 3K4UA 2V3UA 4MLQA 4XKNA 2GFEA 1H76A 1MQGA 3QYTA 5ITOA 3V5AA 2ZXTA 1MQDA 5CMCA 5I58A 2QMXA 4F19A 3PD8A 4ESXA 1BP5A 2ALUA 4JWYA 5BUUA 1B5HA 1H44A 1B4HA 4FEDA 4R74A 2F7AA 4YKPA 3C35A 4ZEKA 3RLFE 1TXFA 2YPNA 3RGYA 3MWBA 5AA2A 3P7IA 3MC2A 2Y7IA 4IO5A 4F22A 1B5IA 1ZIUA 2XXUA 4QSCA 3TTNA 1M5DA 2XXHA 4X1DA 4HTGA 1MM6A 4N07A 3S4UA 3DP6A 3OO6A 1FTLA 4R9GA 3KJ7A 4MF3A 3DP4A 3N94A 3VV5A 5ISUA 4OETA 2BJJX 4Z0IA 2UVJA 3FV1A 4DCXA 1MS7A 4IO7A 4RK2A 4L17A 1MXUA 3K00A 2RCBA 1D9YA 3IAZA 4GL0A 1M5FA 1SYIA 4IO4A 4PFWA 2F7BA 2AIXA 4RJZA 3RTWB 4X48A 4OVJA 5F7VA 2RINA 3E4RA 3IL1B 3Q28A 3S9EA 1POY1 3CR9A 1P1WA 4FJPA 4GD5A 4GWOA 2I58A 3TKDA 4NF8A 5DTBA 3TTKA 2VD3A 3RN8A 1EZPA 1EU8A 1MXZA 5ICTA 1OVTA 4KYDA 1FQAA 5AA3A 1FCKA 3B7DA 3H4ZA 4DXCA 2HQ0A 1UIVA 4LZ5A 4ZEBA 2I4BA 4ZEFA 4G2ZA 4NEDA 4YKKA 4U2RA 3K1NA 3M3KA 1B58A 4NF4A 5TU0A 1PEBA 3SERA 2O51A 3PUZE 4C0RA 1AIVA 4RYAA 1SDXA 2B3FA 2R9JA 3DM0A 2O7UA 3FXQA 3C32A 3MJNA 3PPOA 5HPQA 2H25A 5I2NB 1L5TA 4KFQA 5H8QB 2Y7RA 3MP1A 1B0LA 2DVCA 1Z7NE 2OJTA 3JV9A 4OENA 3TDJA 5I58B 4GL8A 4ZEDA 5FHOA 4ZZAA 3K6WA 3FVGA 3SEWA 2I0BA 1MDQA 2V3QA 4OFJA 1KWHA 2XXPA 3KN8A 3IB0A 4TLMB 5L9MA 5I2KB 3OO7A 3OD7A 4YB6A 2ESNA 3PMXA 1Y3NA 4O3BA 3ODBA 1UTBA 2W7YA 4NF6A 4XKPA 5EYFA 3W9WA 2QRYA 2H4IA 2XD3A 2DOJA 2D3IA 3C9HA 4XIGQ 3A3CA 1DSNA 2D5WA 4P0IA 2FYIA 4H67A 3O9PA 1FTOA 3QIMA 1DPPA 3OENA 4FECA 1ZBMA 2M8CA 3G3HA 1B40A 3K02A 4Q5TA 4THIA 3KJTA 3OOAA 1LBBA 2Z8EA 2HAUA 5KZTA 1NNKA 4OFOA 2Y7KA 5I57A 2F35A 4EF1A 4BDMA 1XT8A 2REJA 1AL3A 3T9UA 3TTMA 1MY2A 1SYHA 1FQBA 1IXIA 4F1UA 2AL4A 3B6TA 1HSEA 1Q35A 3T96B 3FIRA 2PMSA 3C34A 2I3VA 3A09A 1LB8A 2AYSA 3UA8A 5AA1A 1OQGA 4H1XA 3DP8A 3TCHA 5EHMA 3LSLA 1GTKA 3I5OA 3OO9A 2G29A 4F2OA 4P0GA 3R26A 3E3KA 3ECRA 4KQPA 3CFZA 2F34A 4PP0A 4YICA 1ELJA 1DOTA 3TEPA 4QFLA 4OXVA 4M1VA 5CI5A 2AL5A 1PBQA 5I59B 5ICQA 1XVYA 1MPBA 1QKAA 3PPNA 1US5A 3TPAA 5I56B 1UIUA 3TAJA 4MH5A 1MG1A 1B7UA 2I3WA 2O6AA 4OZ9A 3G3JA 2DE4A 1MPCA 2ONSA 3SDFA 1A7LA 3F11A 3S9MC 4RY1A 1FQDA 1SW2A 3SEYA 4R6KA 3PUWE 3K6XA 3FJ7A 3IK6B 1A8FA 3TFLA 4Q30B 1HSLA 4ZECA 3HSTA 1YAEA 3IJOB 2HCAA 1P1NA 1URDA 2VGQA 1J1NA 4POXA 4OQOA 4OEUA 4WEDA 4QFKA 4GQOA 3TTLA 3UORA 4OYVA 4U1ZA 3K1MA 3KG2A 4MLVA 3TCGA 3VVDA 4OWDA 3CG3A 3AXFA 3MAMA 1T0KA 4GXSB 5JTYA 1PB9A 3TUSA 3SESA 3TELA 2F7CA 3CSGA 4Q0CA 4X1BA 4BDRA 1LLSA 3D4GA 4KHZE 3VXCA 3TODA 3MVYA 2HXWA 5I84A 5I2KA 3DELB 1LSTA 1B32A 1MRPA 2V84A 3H03A 3IB1A 4U4XA 4EF2A 3LUYA 4LQ5A 5F1QA 1VSOA 1OIBA 3A3UA 1URSA 2Y7WA 4LQ2A 4RNSA 5FHNA 5HM4B 1A54A 3I6VA 4FAJA 4R73A 3SEUA 3PUXE 3IB2A 1LFGA 1S9TA 3BKIB 3KSXA 3T9HB 3PPRA 2XXQA 5JK4A 3V83A 1ZTYA 2F8DA 1Y3PA 3G3GA 2G93A 4NF4B 3I3VA 1N3WA 2VOZA 1MXYA 3SETA 1MH3A 5DVFA 1NH7A 4P11A 3VVEA 2CMOA 2QS1A 2FNCA 4OFLA 5IKBA 2GHBA 1POTA 2DWJA 4YKIA 3GZGA 3IO4A 4LA9A 5L9OA 2XXRA 3PMVA 1H45A 3MZ9A 1AH5A 4UA8A 4F3GA 1NL5A 2X7QA 1PBPA 5B7DA 2ZNSA 3H7MA 5M2VA 3KN3A 4R9FA 3MZBA 1LB9A 4PETA 5H8NA 1JVXA 5AA4A 2UXAA 3C36A 2GH9A 1B3HA 1GV8A 4ELQA 2F5XA 1Y3QA 3BBRA 1WODA 2Q9TA 4X9TA 5TP9B 3EF7A 4O3CA 5A5XB 1F9BA 1N84A 3IOVA 2D21A 5DT6A 1P1QA 3OELA 2Q89A 5ELVA 4H8IA 3T9VA 3UK4A 2LAOA 3IOUA 1B1HA 2X7PA 4RPOA 2ZYNA 4DXBA 4ZE9A 4HCWA 2DWAA 3HHFA 4I9DA 3KSJA 1FQEA 3RT8A 3N26A 3QK6A 2Q88A 3CIJA 3KEIA 2P1SA 3ILUB 3O66A 1P1OA 4GXAA 1XC1A 3S9NC 1EZ9A 4PFYA 5HBCA 1USYE 3RUMA 3JZJA 2OK2A 3O6IA 2XHDA 1LAHE 4LZ8A 3RT6B 4IO6A 4AQ4A 1YTVA 1FQFA 3IOTA 1NNPA 1R9LA 2DXRA 2RKMA 3ILTB 3K01A 1TFAA 2DS9A 3DLNA 4ONYA 2E1SA 3LSXA 1VR5A 3C33A 3G3FA 1P1UA 4DIGA 4ELOA 2H98A 1M5EA 1LGBC 3FVOA 4U1OA 5I56A 2XXVA 1ZKBA 2RF1A 1SI0A 2DE2A 3FGSA 3JYRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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