2P2AA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-bn-tet-ampa at 2.26a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A tetrazolyl-substituted subtype-selective AMPA receptor agonist.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA02
1B7UA 1HSLA 3IX1A 1P1QA 2NOOA 4EQ9A 5TP9B 2B3FA 3UP9A 4R72A 1MXUA 4ELQA 1GVCA 3PD8A 3T22A 3KN8A 1SW4A 3IR1A 4DXUA 4WXJA 2O7IA 2OWSA 3GBBA 1I6AA 2XXQA 3MAMA 4ELRA 4H5FA 4OESA 4YKKA 2HZKA 2Q88A 3ILTB 1JEVA 1FTMA 5CI5A 4G68B 2V93A 4AB6A 4QFKA 3U72A 3RTFB 3CFZA 1SDXA 3PMVA 1IZ1A 4H6DA 3D4GA 3DP4A 4HCYA 2F7CA 3LR1A 1ZMGA 3BFUA 3W15C 4POXA 2UVIA 2HAUA 1B52A 3AXFA 2OK2A 1H45A 5HBCA 2DYXA 2O7UA 1MM6A 1B3EA 4RPNA 1B32A 4LZ7A 3RT8A 1PC3A 3GBAA 1AOVA 3N94A 4LQ2A 2QMWA 3U92A 1SBPA 1YPNA 3G3HA 1FQDA 3CR9A 4TOZA 4UA8A 3USDA 3B6WA 4QSEA 3OO9A 4ZEKA 1MY1A 4M1VA 1LGBC 4MBPA 4PFTA 1B7HA 5KDTA 4RA1A 1N04A 3CG3A 1Y3PA 5KDTB 1RKMA 4OYVA 4RNSA 3S4UA 4O3AA 2O69A 3RN8A 4F3GA 4H67A 1MPDA 1OQGA 3H6TA 3OXNA 4NF6A 1B51A 5DTBA 4BDNA 3WAFA 5L9OA 3QUFA 3GXAA 3V5AA 4NF6B 3VVEA 4U21A 1MH3A 3FD3A 1ANFA 4HW8A 1DMBA 1L5TA 1Y9UA 1YTVA 1LSTA 1MY2A 3IO4A 5KCJA 1MG1A 3TUSA 4H5GA 4WEDA 4F22A 5I59A 1A54A 5AA1A 3VLVA 1IXHA 4GF8A 1USYE 1WVJA 2VP1A 1GTKA 4XKNA 1LAFE 1B7ZA 2ONRA 2O68A 1B3GA 4IO2A 4NWCA 1LLSA 2ZYNA 3KOTA 4LQ5A 2H25A 2QSXA 1LBBA 2P0SA 2DSFA 1ELJA 1LFGA 5IKBA 4F1UA 4GQOA 4QRZA 4Q5TA 4FEBA 4OVJA 3G3KA 5EHSA 2VHAA 4TLMB 2XXRA 3TCFA 1D9VA 3K1MA 4JBZA 1ZBMA 2VD3A 1POTA 1SI0A 5I57A 3RUMA 2DWHA 1SVXB 3K1NA 2OZZA 5FHOA 1JW1A 4C0RA 3QIMA 1GV8A 3GZGA 2VD2A 2DVCA 2I4BA 1URDA 1JVXA 3MVYA 4FE8A 4NF8A 1USYH 3PPRA 5J1DA 2Q2CA 3FIRA 5CMMA 1TWYA 2THIA 1LBCA 1FQFA 5AA3A 4ZS9A 3O28A 1DTGA 3VE1B 2Q9TA 2AL5A 3PD9A 4PP0A 2XXUA 4OWDA 3R7XA 4O3CA 1N3WA 4FATA 5I2KA 4RXLA 1T0KA 1LAGE 2UXAA 4QF9A 5I2KB 2A5TB 4GVOA 5ITPA 4KI0E 4OHNA 3OOAA 3CFXA 5HPQA 4LZ5A 2D21A 1M5FA 3TTRA 2V3UA 2RINA 4YB6A 4LUBA 2ZXTA 3MVXA 4MF3A 4YU0A 3FJ7A 3K6UA 5DVJA 4DXBA 4IY5A 3M8UA 1ZKBA 2I49A 4EDPA 1HSJA 2D5WA 3DLNA 3F11A 2VGQA 3H06B 2DXRA 3C32A 1B1HA 1FCKA 3SEUA 3H7MA 1B5IA 3MVZA 1EH3A 3I3VA 3OEMA 4GLIA 2UVHA 3IK6B 1Y1ZA 3T9VA 3SDFA 1FTOA 2XXYA 4F39A 2P2AA 1ZIUA 4QFLA 4NF4B 3OD7A 3FJMA 2O6AA 3FVGA 3IJXB 1Z7ME 3HCQA 3MZBA 2CZLA 4OERA 1IXIA 2PBWA 1BP5A 3OENA 5H8QA 3V8XB 4IB2A 4PFWA 3T93B 1AL3A 1NFTA 3S9EA 2I58A 4PQJA 2GHBA 4IY6A 3OSQA 1NH8A 4H1XA 3RY3A 1MS7A 4IGRA 4JWOA 1A7LA 1QKAA 3LSXA 2HAVA 4TLLB 4RPOA 1NH7A 2GH9A 1JVYA 4ELOA 3D4CA 2AYSA 4N6PA 3K02A 4I62A 3C34A 3IOTA 3OO6A 1P99A 1AIVA 3IOUA 4GOTA 5I56A 3TEPA 3PMXA 4FEDA 4DCYA 2HQ0A 5BWJA 1O63A 4JSDA 1B5HA 3IORA 1RYOA 1UTBA 3DELB 3S2VA 1B5JA 3H3GA 1UIVA 1B4HA 2XXTA 1MM7A 3MZ1A 1UTHA 4ONYA 2DXYA 3QK6A 2XXIA 2I0CA 1FQAA 2NVUB 4GL0A 3FVNA 2QJEA 3MQ9A 4OETA 5TPAB 1R9LA 1GR2A 3LSLA 4Q8RA 4ZEBA 4NTLA 2F5XA 2XXVA 2AL4A 4U4XA 4BDMA 3EHTA 4G8NA 3Q25A 4OFLA 3TODA 5JEIA 5AE4A 4YKIA 3THIA 3N6TA 4PETA 1XVXA 4G4PA 1VSOA 3CRBA 5ICTA 4NEDA 1M5DA 1QJMA 1B58A 4IO7A 5TP9A 5TU0A 2RC7A 4F3PA 3L6HA 3T9XB 3DP8A 2XX8A 3H4ZA 3SEWA 2E0SA 5K2YA 5CMCA 2PYYA 1P1OA 4M4GA 4KCCA 1MY0A 1MQDA 2KLFA 1F9BA 1B4ZA 1B9JA 4OENA 3VV5A 4QHQA 3O2AA 4G68A 3VVDA 2XX9A 4YB7A 3ZKLA 1URGA 4X1DA 2F7BA 2Q89A 3K6VA 1QVSA 1B05A 3ECRA 3IAZA 2Y7IA 1DTZA 2YPNA 1VFDA 3QAXA 4NF5B 4BDOA 1URSA 3S9NC 3O97A 4R9FA 2XXHA 3VLUA 4GWOA 4OQOA 3MPLA 3TQWA 2F34A 5A5XB 4NE4A 1N3XA 3EF7A 3FV2A 1D9YA 4POWA 2H4IA 4Q0CA 3SEYA 1LFIA 4DE8A 4K3FA 3FXQA 4QFPA 4P11A 2GFEA 1Y4TA 3PUYE 1SW2A 3TCHA 4DCXA 2ESNA 2ZYKA 5LOMA 1RYXA 1XVYA 1YAEA 5F7VA 1SW1A 3M3FA 5ITOA 2PMSA 3BKIB 3ZKKA 4UACA 4O3BA 1VR5A 4X9TA 1MPBA 3I6VA 1AMFA 2RC9A 2H99A 1DPPA 2RC8A 4N13A 2Y7KA 4N07A 3VXBA 1H43A 2O84X 1BIYA 3C9HA 1ZLQA 5H8HB 4ZEIA 2DWIA 3IB2A 2XHDA 3LSFB 1AH5A 4HS7A 4IO6A 4E0WA 4GXSB 3RTWB 4JWXA 2ZYMA 1NNPA 2RCBA 3K01A 4R74A 2QS4A 4YAHX 3K0VA 3MVWA 2UYEA 3VDFA 3I5OA 3MP6A 3B6QA 3LSWA 2FA7A 3B6TA 1YCJA 2QMXA 4LP2B 4F3SA 1Y3NA 4H8JA 3ONMA 4EQ7A 3TAJA 1IEJA 3EPEA 5H8SA 1B3LA 4DDDA 1SQYA 4E0XA 3PPQA 3IOWA 5DVIA 3A3UA 4MLVA 2AIXA 4GD5A 1TXFA 4F19A 3H6UA 1IIWA 3OMBA 3K6XA 1N84A 3TPAA 1I6BA 1FW0A 1XC1A 2QS1A 4R9GA 1UIUA 4F31B 2Y84A 2WKYA 5F1QA 1LB8A 3KN3A 3OEKA 1P1NA 4R75A 2DVZA 1Y3QA 4YMBA 3VFJA 1B6HA 1ZJLA 4WEPA 4KPTA 1A8FA 1GGGA 2XXPA 3FXUA 5I84A 1FQCA 4YMAA 1FQBA 4FECA 2DP8A 2HXWA 1Y4CA 3H6VA 2G29A 3MP1A 3ZS6A 3IB0A 4DZ1A 1M5BA 4L17A 4RYAA 3RQTA 4XKQA 1M5CA 1FTKA 3PUXE 1US4A 4OTEA 3U93A 3M3KA 2OBGA 1EZPA 2I48A 4FJPA 4YB5A 4EXKA 1OVTA 4YKJA 3H6WA 4Q30B 2XD3A 4IO4A 4QSCA 3DM0A 1OVBA 3FATA 3JZJA 2PVUA 1HSEA 1XT8A 1S7YA 4OMBA 2A5TA 4LA9A 2Y7RA 4EF1A 1LCFA 3W9WA 3FJGA 1QW0A 4RY1A 1IUDA 2V3QA 3E4RA 2Q8JA 2RKMA 2UYFA 2ONSA 2RCAA 4ECFA 2HCAA 3VXCA 3CFLA 1TFAA 5IAIA 5H8FA 2I3WA 4I1DA 4QSDA 4ZE8A 5H8FB 2ZNTA 3O29A 1LAXA 5DT6A 3MJNA 5H8NA 4KYEA 3KSXA 1NMUA 4X1BA 1CB6A 3O66A 3FV1A 2X7QA 5H8NB 3PUVE 5DVFA 1IXGA 3LBSA 3G3IA 5B7DA 3TTLA 4KR5A 4R6YA 3H03A 1JW5A 1MY4A 3V83A 1QKBA 1Z7NE 3N6UA 1J1NA 2G93A 4I9DA 1EZOA 3HHFA 2V3TA 4NF4A 5I58A 4JSOA 1Y1MA 2H98A 2XD2A 3SEVA 5CBRA 2D3IA 3CI8A 3FGSA 5AA2D 2REJA 3HSTA 2F7AA 5I58B 1B46A 4AB5A 4X48A 4NWDA 1B0LA 2O51A 4ZE9A 1Q35A 3ILUB 4LVQA 5CMKA 3Q27A 3TCGA 2HFBA 2OJTA 4GRKA 1I6QA 1KWHA 3DP6A 1PBQA 2M8CA 4ZECA 5M2VA 4KD5A 2QL3A 4G68C 3SKPA 3ZSFA 2PT2A 2OCUA 2QPQA 3PMWA 4PE5B 4EUOA 2DE2A 4FAJA 3A3CA 4XKPA 1Q1KA 1IITA 2Q2AA 5L8DA 2HZLA 3PU5A 2QS2A 3L6GA 1JNFA 4IGTA 4ELPA 5AA2B 2XX7A 3HHGA 2NXOA 4WKMA 2UVJA 4QFOA 5TPAA 3MW0A 3RNNA 2GRVA 3G3FA 4Z7EA 5K2XA 4OFJA 1A8EA 2HEUA 2CMOA 3IJOB 3TQLA 2H5YA 2Z8FA 4BLAA 3TMGA 3K1PA 1LFHA 3O9PA 3HPIA 1MPCA 3UORA 2R9JA 4JB7A 3FZVA 2REGA 4THIA 4OEUA 3OELA 1MY3A 5AA4B 3C33A 4JWYA 4YICA 1XS5A 3V89B 3MBPA 3TKDA 2DS9A 5CRYA 2F97A 3PPNA 5DYHA 3CVGA 4BDQA 2O1MA 2Y7WA 1PB9A 3IL1B 3B7DA 3UN6A 4Z0IA 3G7WA 3M3LA 3BBRA 4TQUQ 1NNKA 1SW5A 2Z22A 4NMYA 4NF5A 3U8QA 4EQBA 5FTIA 1NL5A 2ZNUA 1S50A 1MXZA 2DWAA 3VLWA 1BTJA 3G3JA 5A5XA 3SERA 3KZGA 1OQHA 1MQGA 3HV1A 1MQHA 4OEVA 1MXXA 3E3KA 4F29A 4U4SA 2ONKE 1MQIA 1B2HA 4G8MA 1R6ZA 4IO3A 3MPKA 1R9QA 2XXXA 3Q29A 3TTKA 1MH4A 3PUZE 2I3VA 1O7TA 5ICQA 4P0GA 1II5A 5B70A 3A09A 2OWTA 1H44A 1MDP1 4XXUA 1O64A 2FNCA 4F18A 3E9XA 3MC2A 2Z8DA 2A5SA 1B1XA 1QUJA 1NKXA 5H8HA 3OO7A 2X7PA 3QUJA 3C4MA 2I0BA 1OMPA 2OLBA 3SESA 4HTGA 1NNFA 2V25A 4OXVA 1S9TA 3R6UA 1OLCA 4ND9A 3TTNA 2R71A 3KFMA 3SEXA 3RLFE 3EHUA 3U1OA 3HN0A 2B3BA 4GIZA 5CMBA 3EHSA 2YLNA 1MDQA 3TFLA 4R6KA 3T9HB 1SI1A 2F8DA 1MXYA 1SYHA 3JV9A 3KG2A 1LCTA 3UK4A 1B40A 1IQ7A 3R26A 4PFUA 2RF1A 5BUUA 3C35A 5HM4B 3FASA 2F6PA 2F36A 3S9MC 3KOSA 3Q28A 4MH5A 3MZ9A 1JEUA 1DOTA 3HO7A 4EXLA 5L9SA 1TFDA 4EF2A 4H8IA 2ZNSA 5ELVA 1BKAA 4GFRA 4F2OA 3KSJA 4QFNA 3N26A 4KYSA 4ZZAA 1QUKA 4H65A 3CSGA 5KCJB 1D4NA 5EYFA 3K00A 3S9LC 5I59B 4GXAA 2F35A 5I2NA 5CBSA 3QSLA 3FUZA 4XKRA 2F78A 4P0IA 3P7IA 5I2NB 3O6GA 3KBRA 5FHNA 3TELA 4U22A 3IO6A 4U1ZA 2O1LA 3PGFA 1MRPA 4LATA 1TT1A 3FVOA 4BDRA 3KEIA 5CM6A 3UGWA 3UIFA 4JDFA 2ZYOA 3MUQA 1A99A 1US5A 2YJPA 4U2RA 4C1TA 1H76A 4AQ4A 2Z8EA 2Z23A 1MQJA 1LB9A 1R1NA 4OFOA 1ATGA 4KQPA 1A40A 4G2ZA 5I57B 2BJJX 5JK4A 1PDAA 3PV0E 1PB7A 4F3BA 1N76A 3TTMA 1B3HA 1QUIA 4C1UA 4KHZE 3FVKA 4NF8B 1PBPA 1SD3A 1CE2A 3T66A 4PFYA 3BFTA 4RK9A 4U1OA 1JETA 4OZ9A 2ALUA 2NWJA 4G8HA 1VFEA 1N7WA 4R2FA 3W9VA 1B3FA 3U94A 1ZTYA 2H9BA 4R6HA 3PPPA 3O6HA 3OSRA 3GLBA 5CC2A 3KGCA 1POY1 3Q26A 3CIJA 1OIBA 2LAOA 2ZMBA 2F6GA 1OLAA 1P1UA 4YKPA 1SYIA 1JW4A 4ZDMA 2V84A 4KFQA 2B65A 4ZEFA 1MXVA 1FTJA 4BDLA 3E13X 1ZU0A 2PX1A 3PPOA 1P1WA 4ZZEA 1FTLA 4DLDA 3UA8A 3N5LA 5EHMA 2XXWA 3TZAA 3WAEA 3C31A 2QS3A 4R73A 3JYRA 4G77A 4F1YA 1UQWA 2PT1A 3FXRA 1LAHE 3T9UA 2IA4A 4U23A 3KJ7A 2DQVA 3RGYA 4HCWA 1N0TA 3KN7A 2FYIA 5JTYA 1PEBA 3MWBA 4DXCA 5JTYB 1H3DA 1XOCA 4FIMA 4XTCQ 3RT6B 1EZ9A 4ESWA 1WODA 1N7XA 5DEXA 1EU8A 3C36A 3QYTA 3CSBA 2E1SA 4ESXA 1IXCA 5DEXB 5FTHA 2UVGA 4FORA 1BLFA 4F1VA 2DE4A 3LC8A 3PUWE 2ANJA 2I4CA 4RJZA 3QXMA 2DE3A 5H8QB 1B0HA 1JQFA 3EQ1A 2ABHA 3IOVA 1Y20A 3TYHA 3IB1A 5FHMA 5AA2A 2DWJA 4GL8A 3CG1A 1NNTA 2I6EA 4KYDA 4DIGA 3K2DA 5L9MA 4R2BA 3ODBA 3KJTA 1VE4A 2QRYA 3G3GA 4I8CA 1DPEA 3LUYA 5I56B 4ISUA 2IEEA 4LONB 3OO8A 2NUVA 2X26A 4KCDA 5AA4A 4IO5A 3T96B 1MXWA 4JXIA 1A55A 5KZTA 3EN3A 1M5EA 1I69A 1UTBB 4H0WA 4MLQA 1PB8A 1DSNA 2R6GE 2P1SA 3K4UA 1UTHB 3MP8A 2Y7PA 1D3KA 4LZ8A 3VVFA 1XHYA 3RPWA 4F2QA 3TDJA 5ISUA 2VOZA 3K6WA 4MFIA 4RK2A 4YZZA 2W7YA 2GHAA 4ZEDA 3O6IA 2DOJA 3SETA 1QULA 1WDNA 4XIGQ 1FQEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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