2P2AA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-bn-tet-ampa at 2.26a resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
b'NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A tetrazolyl-substituted subtype-selective AMPA receptor agonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2p2aA02
1TFDA 1HSLA 4F19A 5I2NA 1B32A 4YICA 2H98A 1AL3A 5CM6A 5DT6A 2Y7KA 1A40A 3OEMA 3MC2A 2H9BA 4MH5A 2ONRA 1WVJA 2YLNA 4X1BA 1YAEA 1SQYA 2A5SA 2V3QA 3TTRA 3MP1A 3WAFA 1MXVA 3TELA 1N7WA 5L9MA 4EF2A 2V84A 3LBSA 2VD3A 3TZAA 3RN8A 2H5YA 2Z22A 3E4RA 3KJ7A 3RT8A 4FATA 4Q8RA 1PC3A 1B1XA 2XXXA 3SEYA 1ANFA 4ELPA 3EF7A 4UACA 4ZEKA 1LAXA 3TCHA 4GRKA 3IK6B 2I0BA 3VXCA 1MXYA 1LAFE 4OENA 5FHOA 4NMYA 3TQWA 1QJMA 1B2HA 3D4CA 4H0WA 3E9XA 4MFIA 3JZJA 3QK6A 3S9NC 2E0SA 3TTMA 3MPLA 3IORA 3O6HA 3PPQA 4LQ2A 5EHSA 2VD2A 4GFRA 4I1DA 1LAHE 2ONKE 5I84A 1AH5A 1A7LA 3C32A 3KG2A 3RLFE 1L5TA 1PDAA 1LLSA 4NE4A 1AOVA 1B5JA 2P1SA 3IB2A 3B6QA 1FCKA 5CMMA 4GQOA 4KYSA 4KI0E 1MQGA 4YMBA 1N7XA 1PB7A 3FVKA 1P1WA 1QW0A 4TOZA 3MP6A 5K2XA 4ND9A 4KCDA 5CI5A 4YKJA 4LVQA 3FIRA 3LSXA 3TTKA 2WKYA 4PP0A 3MVZA 2D5WA 1QKBA 1MH4A 3TEPA 2CMOA 3SKPA 3O6GA 5H8SA 3N6UA 1NH8A 4R73A 4DIGA 1SI1A 2GHBA 4RA1A 4LQ5A 2NWJA 3IX1A 3MW0A 3KSJA 2X7PA 1A8FA 2I4BA 1EZPA 3K2DA 3W15C 3ONMA 5AE4A 2AIXA 1A54A 2DWIA 4C0RA 3MPKA 1B4HA 4P11A 4JWXA 1D9VA 1QKAA 2O84X 2I49A 1S9TA 5B70A 2ONSA 3PUWE 4PFTA 1DOTA 1NNTA 1R1NA 5AA1A 4LUBA 3VE1B 4H8IA 2ABHA 1MM6A 1YTVA 1B9JA 2Y7WA 4EQ7A 4IGRA 2VOZA 1JEVA 4DXBA 3O97A 4ZDMA 5I2KA 4RPOA 1M5EA 2UXAA 1ATGA 3Q28A 3HCQA 4OYVA 5DYHA 4R9GA 2UYEA 2GRVA 1LBBA 3UGWA 2O7IA 2V3UA 3FJ7A 1SBPA 4RJZA 4EQBA 4RK2A 1TWYA 4IO7A 4U4XA 3L6HA 4OZ9A 1QUKA 4M4GA 5AA2A 4X9TA 3IJOB 4IO2A 3DLNA 3KOTA 4MLVA 3A09A 4F29A 1POY1 5H8QA 4OFOA 1B0HA 5CC2A 4GOTA 5I2KB 2XXYA 3IO4A 1IXCA 3GXAA 2D21A 3ILTB 1M5CA 3CVGA 2I4CA 3N6TA 1BLFA 3CR9A 1USYH 4DDDA 1DPEA 2NVUB 3PPOA 4LZ8A 2NXOA 4QSEA 3T96B 4E0WA 2F5XA 4F39A 5AA2B 3PGFA 3G3FA 4XIGQ 2QS1A 4OQOA 1FQCA 3KEIA 2ZYOA 5H8QB 5F7VA 3MBPA 4F1UA 4OXVA 1JETA 3C35A 3HPIA 1R9LA 4OWDA 3RUMA 3U92A 2XD3A 3T9HB 5M2VA 4NTLA 1NL5A 3PUVE 4OFLA 1II5A 1OQGA 2ZYMA 4ZEIA 2PT1A 1IXIA 2DWJA 4R72A 2Q88A 3S2VA 4O3CA 3K0VA 4GXSB 2OWSA 3LSFB 1PB9A 3C31A 4H67A 4M1VA 2G29A 4NWDA 1MRPA 1R6ZA 1N04A 4DLDA 2PX1A 5TP9A 3EPEA 2QL3A 1JNFA 4ESXA 3H06B 1Q1KA 2B65A 2UVIA 1A8EA 3TFLA 4X48A 5FTHA 2HQ0A 1OLCA 4I62A 4H8JA 4F18A 2XX8A 4AQ4A 2DE4A 1IEJA 5I59A 4C1UA 3O28A 4NF5A 2HEUA 2Z23A 1CE2A 4R6KA 3FVNA 3TUSA 1A55A 4KR5A 1VR5A 3Q25A 4MBPA 1FQEA 1OVBA 3DELB 3PU5A 1B46A 1O7TA 1YPNA 3UP9A 1OIBA 5TP9B 3U94A 2DSFA 1O64A 3OO9A 4U1ZA 1OVTA 3T93B 5I59B 2HZKA 1D4NA 4NF5B 1MY1A 3GZGA 1AIVA 3TDJA 2Q9TA 4QF9A 5TPAB 1Z7NE 4EUOA 2RC8A 1MXUA 1I6BA 3PMXA 3PPNA 3SEWA 2AL5A 3MQ9A 1URDA 4GXAA 5HBCA 4AB6A 1B7HA 2OZZA 3GLBA 2W7YA 1GR2A 1NNKA 2F97A 2ZNSA 2OBGA 1Y20A 2ZXTA 3KJTA 3S9LC 4XKNA 2F7BA 2F6PA 4ZE8A 2DYXA 2REGA 4U1OA 1SVXB 3K01A 1NFTA 1Y3PA 1N3WA 3RQTA 3CFZA 4FE8A 3M3FA 4YZZA 2DE3A 3HN0A 5I57A 4XTCQ 1CB6A 1D9YA 1DMBA 1JVXA 5CBSA 1LB8A 4H5FA 4R74A 2GH9A 5H8FA 4BDNA 4MF3A 5LOMA 3V89B 3BBRA 1B3HA 4BDMA 4QFOA 3T66A 1B51A 4OETA 2NOOA 3KGCA 3FV1A 1H45A 1BTJA 4OHNA 5IKBA 3RT6B 3TTLA 2X7QA 4UA8A 4NF6B 4FORA 4X1DA 4FIMA 5KZTA 4LATA 4WEDA 5AA3A 3Q27A 1IXGA 1B05A 1SI0A 5I57B 3IOWA 1H43A 4R75A 1WODA 4R6HA 1ZBMA 5AA2D 1OMPA 4PFYA 5H8FB 3KN8A 3SERA 3TAJA 1Y1MA 1JW4A 4ZS9A 2O51A 1RKMA 2DVZA 4GVOA 3K1NA 4G77A 2QS2A 1Y1ZA 3UIFA 1NH7A 2RCBA 1P1QA 4QFKA 4YKPA 1R9QA 3H7MA 3PMWA 3FXQA 4F3SA 1MY2A 3T9VA 2QS3A 3IJXB 3FASA 4GLIA 4ONYA 2UVHA 4IY6A 1FQDA 2Y84A 3LSWA 3TODA 3MVYA 2F7AA 3IL1B 3KN3A 5FTIA 1PBQA 4DCYA 4QHQA 4ZEFA 5CBRA 4FECA 1VE4A 3PUZE 4H1XA 1VFEA 2DWHA 2PMSA 1POTA 3OO6A 1SD3A 1LFHA 4BDOA 4YKIA 2H25A 2XXTA 4Q30B 1RYXA 3CG1A 4F31B 2KLFA 3VLVA 1LB9A 3RGYA 4PE5B 3JYRA 3TTNA 3WAEA 4YB7A 3FZVA 2HAUA 2XXWA 1AMFA 4N07A 1LCFA 3HHGA 3MVXA 5H8HB 3QXMA 3VXBA 3KBRA 1B58A 1IXHA 1FTJA 1I6QA 3H6UA 1XVYA 3PD9A 2Q2AA 4I9DA 4YAHX 1B3FA 4IGTA 3FXUA 2OK2A 2Q8JA 2QPQA 3S9EA 4KYDA 1Q35A 3PMVA 2LAOA 3BFUA 4ZZAA 2O1LA 4L17A 1IIWA 1VFDA 3OMBA 3SEXA 1B4ZA 3UA8A 3ZKKA 5CMKA 3H03A 2HZLA 3IB0A 1JVYA 3N5LA 4ZECA 2I3WA 4GL0A 1J1NA 1MS7A 4Q0CA 1XC1A 5DTBA 5KCJA 4GD5A 1MQDA 2DXYA 4YU0A 1SYIA 2E1SA 3FXRA 3R7XA 1FQFA 4PETA 1JEUA 1MY4A 2G93A 1QUIA 3C34A 1M5BA 3HHFA 5IAIA 3I5OA 4QFNA 4IO3A 5ISUA 2V25A 3MZBA 3SEUA 1GVCA 3AXFA 4PFWA 2O1MA 1Y4CA 2F6GA 3G3HA 1Z7ME 4LONB 1MPBA 1GV8A 2IA4A 4O3AA 3CI8A 3KZGA 4FAJA 1B7ZA 2F78A 2XXRA 5KCJB 4N6PA 4DXUA 4C1TA 4E0XA 1IQ7A 3M8UA 4PFUA 4EXKA 2XXHA 1MH3A 5F1QA 5H8NA 1US5A 4NEDA 2UVGA 3PD8A 5EHMA 1SDXA 2R9JA 4G2ZA 5AA4A 3IB1A 2HCAA 3TKDA 4F2QA 1MDQA 2QMWA 5KDTA 3FVGA 3G7WA 2VGQA 4FEDA 1FTMA 1DPPA 3H6WA 1Y3QA 3T9XB 4RNSA 3ZKLA 2ESNA 4F1YA 4XKRA 3U93A 4DCXA 5H8NB 1LSTA 4G68B 3MAMA 3TCGA 3FJMA 1MQHA 2Z8DA 2R6GE 3SDFA 5AA4B 3PV0E 3Q26A 2QJEA 3IR1A 4ELOA 3H3GA 4JBZA 1ZKBA 1M5DA 3FD3A 1USYE 3FVOA 5KDTB 2THIA 2A5TA 3O29A 1MY3A 1UTHA 4FEBA 1HSJA 3C9HA 4LP2B 4IO6A 3ZSFA 3CFLA 3THIA 2I0CA 3VLUA 1MG1A 4IY5A 3MJNA 1LFGA 3CSBA 1UIVA 2O7UA 4JWOA 4YB6A 3UN6A 1EZOA 4OTEA 2F34A 4G68C 1KWHA 5TPAA 4ZEDA 2V3TA 2Y7RA 2A5TB 1XVXA 3IOVA 3D4GA 1UTHB 2DS9A 2O68A 4BLAA 4GIZA 3FJGA 3JV9A 2ZYKA 4PQJA 2ZNUA 1MM7A 4G4PA 1UTBA 2VHAA 2OLBA 4XKPA 2R71A 4JSDA 1BP5A 3K02A 5ICTA 3TQLA 3T9UA 2QSXA 2QS4A 1Y4TA 3L6GA 1GGGA 2UVJA 3HV1A 3VFJA 2HXWA 2YPNA 2ZNTA 3EN3A 4RK9A 3H6TA 3U8QA 4YKKA 1MQIA 1ZLQA 4XXUA 1FTKA 3R26A 4Q5TA 4EDPA 3VVEA 4EQ9A 5I58A 2I3VA 4TQUQ 5L9OA 2XXUA 4U2RA 1SYHA 5HPQA 3EHTA 4G8MA 1UTBB 4O3BA 3B6TA 4LA9A 1B3GA 1DTGA 4DXCA 3RY3A 2AL4A 3FUZA 4F3GA 1MXWA 2P2AA 2RC9A 2M8CA 3PUYE 4YMAA 4XKQA 5DVFA 1MQJA 2NUVA 2O6AA 3C36A 1OQHA 2FNCA 4GF8A 4NF6A 3ODBA 4QSDA 5DVJA 2ZMBA 4JXIA 5EYFA 4R2FA 1I6AA 2REJA 3O9PA 3DP4A 1MPCA 3IAZA 3U72A 2V93A 3EHSA 4IB2A 5I58B 2XXVA 3RTWB 5L9SA 4LZ5A 3MWBA 2Y7PA 3SETA 4QSCA 4H6DA 4MLQA 3A3CA 1ZMGA 1N3XA 4OERA 3G3KA 1URGA 3KN7A 3CIJA 1MY0A 2F7CA 3EHUA 3FV2A 1MXZA 3K6XA 1IZ1A 4LZ7A 5JTYA 4ISUA 4G8NA 2AYSA 4ZEBA 1N76A 1GTKA 2ANJA 3M3LA 4QFPA 3K4UA 1I69A 3RTFB 4DE8A 2XHDA 3B6WA 1VSOA 3MVWA 3HSTA 5ITPA 3KOSA 1TFAA 2YJPA 5CRYA 3ILUB 4NF4B 2XD2A 4H5GA 3E13X 2DP8A 4RPNA 1B6HA 1PB8A 3VLWA 5ICQA 1QUJA 3OO8A 3E3KA 1JW5A 5JTYB 4IO5A 1NNFA 1B40A 2BJJX 5I2NB 3OOAA 1XT8A 3LR1A 3USDA 1ZIUA 2XXPA 2H99A 4WXJA 1Y3NA 2XXIA 1B0LA 2PT2A 1HSEA 5DEXA 4NWCA 4WKMA 3K6VA 3W9WA 4H65A 4JSOA 5H8HA 2Q89A 2HFBA 4QFLA 4KFQA 1ZJLA 4JB7A 5L8DA 3OELA 3OSRA 4TLLB 1B5HA 4GL8A 3QAXA 2QRYA 5FHNA 2B3BA 3K1PA 1IUDA 2DVCA 3PUXE 4OFJA 1PEBA 3G3IA 2CZLA 5DEXB 3LUYA 5I56A 4F1VA 2B3FA 2I58A 3N94A 4R2BA 3IO6A 2I6EA 4HS7A 4RY1A 3VVDA 3P7IA 2QMXA 2Z8FA 1ELJA 4HCYA 4BDQA 1M5FA 4NF8A 5K2YA 3OO7A 1NMUA 2X26A 3MZ1A 2RCAA 3C4MA 1QULA 3OEKA 4F22A 2XX9A 3B7DA 3BKIB 4POWA 4ELRA 5I56B 4OVJA 5BWJA 3KSXA 2OCUA 4QRZA 3M3KA 3QSLA 2DQVA 3IOTA 2RF1A 4OMBA 4BDLA 1QVSA 5ITOA 4FJPA 3TYHA 1JQFA 4OEVA 3S4UA 3QYTA 5FHMA 4NF8B 1FTOA 3K6UA 1LBCA 1SW2A 3EQ1A 1ZU0A 3HO7A 4RXLA 1IITA 3O66A 1N0TA 5TU0A 2ALUA 3K00A 1F9BA 4N13A 2Z8EA 3T22A 2FYIA 3ZS6A 3C33A 2GFEA 3DM0A 2GHAA 1NKXA 3MZ9A 1ZTYA 1SW4A 4KD5A 4OEUA 3BFTA 3OD7A 3H6VA 4ELQA 1LGBC 1WDNA 4DZ1A 1FW0A 4U4SA 4R9FA 3UK4A 3A3UA 3RNNA 3LC8A 4G68A 3F11A 4YB5A 4G8HA 3QIMA 1RYOA 5ELVA 4ZZEA 1UIUA 3K6WA 2UYFA 4KQPA 2PYYA 3QUFA 2D3IA 1D3KA 2RKMA 3I3VA 4U21A 5J1DA 5JEIA 2DXRA 5CMBA 1P1OA 3I6VA 3CRBA 3CG3A 2RINA 5HM4B 4U22A 1T0KA 4F3BA 4KPTA 4EF1A 3OSQA 1Y9UA 1XHYA 3OENA 4Z7EA 1LFIA 5A5XA 3MP8A 2O69A 1LCTA 4ECFA 3PPRA 4JWYA 3H4ZA 1FTLA 2OWTA 1URSA 1NNPA 1H44A 3FATA 3GBBA 1EZ9A 2Y7IA 3VV5A 4F3PA 1A99A 3G3JA 1H3DA 1B3LA 3K1MA 3TPAA 1B52A 3W9VA 3V83A 1O63A 1DTZA 3ECRA 2XXQA 4HCWA 5B7DA 5A5XB 3DP6A 4P0GA 3PPPA 1B5IA 2DOJA 3S9MC 4KCCA 2RC7A 4BDRA 3V5AA 2OJTA 4OESA 1P1NA 1B3EA 4R6YA 3V8XB 4U23A 3LSLA 1B7UA 1DSNA 1UQWA 3CFXA 2P0SA 4HTGA 3MUQA 4I8CA 4HW8A 3Q29A 4AB5A 4JDFA 2F35A 3QUJA 1US4A 2I48A 3TMGA 4EXLA 1MXXA 4P0IA 3N26A 5BUUA 4F2OA 3SEVA 2IEEA 4ESWA 1MDP1 5JK4A 5DVIA 1FQBA 1S50A 3OXNA 2ZYNA 1FQAA 2F36A 3CSGA 1SW1A 2XX7A 2FA7A 4K3FA 3O6IA 1EU8A 2DWAA 1P99A 1P1UA 2Q2CA 3FGSA 3VDFA 1YCJA 4GWOA 1BKAA 4Z0IA 4KHZE 5CMCA 3KFMA 3DP8A 4IO4A 4TLMB 4KYEA 1XOCA 2PVUA 1JW1A 3VVFA 1TXFA 4RYAA 1MPDA 3RPWA 3GBAA 3SESA 1OLAA 2DE2A 3U1OA 1B1HA 3IOUA 1PBPA 3G3GA 2VP1A 1S7YA 3TCFA 1XS5A 2H4IA 4THIA 1TT1A 1BIYA 1EH3A 4POXA 3R6UA 1N84A 3O2AA 2PBWA 4WEPA 3UORA 4NF4A 4ZE9A 1H76A 2HAVA 2F8DA 1LAGE 1SW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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