3H03A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to ubp277
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms of antagonism of the GluR2 AMPA receptor: structure and dynamics of the complex of two willardiine antagonists with the glutamate binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A02
5H8SA 4OFLA 5F7VA 1B3GA 1N0TA 1P1QA 1PBQA 2G93A 2Z22A 3LSWA 4EQ9A 3U8QA 3EHUA 4FEDA 1XVXA 3GZGA 1YAEA 4NF5B 3D4GA 1MXVA 3C32A 3ILUB 4G8MA 4E0XA 3SKPA 5AA2D 1B5IA 4KFQA 1R6ZA 1NL5A 3ZKLA 4G2ZA 4X1BA 1LLSA 1B3FA 2QMWA 3K1MA 3C4MA 3KN3A 2XXXA 2ZYMA 4U1ZA 3UGWA 5H8NA 4EUOA 4LQ5A 5I56A 1ZBMA 4RPNA 4NF8B 3G7WA 1BTJA 4DXBA 2F6PA 3KSXA 4F1VA 4WEDA 4YMBA 1XVYA 3RTFB 4BDNA 3OXNA 4GF8A 1MQDA 3UP9A 1MS7A 5HM4B 1M5FA 1LFHA 5JTYA 2FA7A 1XS5A 2I6EA 5DVIA 3U92A 1B05A 1QKBA 2HEUA 4MF3A 3H03A 3MJNA 1MY2A 3EHTA 2D21A 3V8XB 1RKMA 2VOZA 4OWDA 3GLBA 4Z7EA 4GOTA 4IO6A 3ONMA 4KI0E 2A5SA 1M5EA 5DT6A 4GIZA 3T9XB 2I3VA 1J1NA 3SEXA 3E9XA 1MY3A 3B7DA 1IZ1A 3CG3A 5TPAB 1Z7ME 2ABHA 4QFOA 4L17A 3LBSA 3H6TA 2Q89A 4GXSB 1I6BA 4IO7A 1AMFA 3MWBA 4NF6A 2RC7A 2HQ0A 5AA2B 3T93B 1USYE 3DP4A 1IIWA 2GHBA 3M3KA 2DWAA 1MY1A 2RKMA 5KDTA 2F34A 1B58A 2THIA 3I6VA 1MXZA 5FHMA 3PPPA 1FTMA 4LA9A 3VVEA 5CBSA 4KQPA 3R26A 3S9LC 3TODA 1P1NA 3VE1B 4RA1A 2ZNTA 4ONYA 3V5AA 2GHAA 5ISUA 2XXIA 3IL1B 1SYHA 2P0SA 4NF4A 4MLQA 3CSBA 1N04A 3USDA 4IGTA 4IY5A 4YB6A 1B52A 4JWXA 3G3HA 3H6WA 3IOVA 3I3VA 4X9TA 1IITA 3RLFE 1A99A 3DP8A 3ILTB 1QJMA 4KCDA 4GL0A 5I56B 3FXRA 4F3PA 3C31A 3CVGA 4F18A 4H0WA 2DWIA 1MQGA 3HN0A 1TFAA 4I9DA 2B65A 4R6YA 1I6AA 2Q2CA 3TTKA 3RPWA 1MXUA 3DLNA 1FQBA 3K6WA 2NVUB 1HSEA 5JTYB 3HHGA 4C1UA 3G3KA 2V25A 4NWDA 1IQ7A 2V3QA 3K6XA 3T22A 3VVDA 4POWA 1B3HA 3MBPA 3SETA 1JW4A 2O1MA 2R6GE 4G77A 3Q28A 3IAZA 3U93A 4HW8A 4RNSA 1LCFA 3PD9A 3LSLA 4Q0CA 2NOOA 5A5XA 4JB7A 4F2QA 1H45A 3TTNA 1O63A 4PFWA 5ELVA 1PB7A 2P1SA 1QVSA 3EHSA 4DCYA 1SI1A 4PQJA 1N3XA 1DTGA 1H44A 5BWJA 3E4RA 4JXIA 4NF6B 1VFDA 5CMCA 5DVJA 4IGRA 4DXCA 3S4UA 3QSLA 4GQOA 3PPQA 1QULA 2XXPA 2O69A 1S9TA 5JEIA 3VLWA 4Q5TA 2F78A 1POY1 3IOTA 4QFPA 2QS2A 5KDTB 1FQDA 5TP9A 4BDLA 1DMBA 4LATA 2H99A 5FTHA 3K6VA 3PU5A 1B7HA 4PP0A 4YU0A 1N84A 3PV0E 1B3EA 2IEEA 1JETA 5I58B 5L9MA 2HCAA 4G68B 4DDDA 4FJPA 3LC8A 2X7PA 3RGYA 3MPKA 4BDQA 2V3TA 2WKYA 1ZJLA 1D4NA 4XXUA 1UQWA 4FE8A 1JW5A 4F3GA 1FCKA 3V83A 1MQJA 1GR2A 2O7IA 1P99A 5K2XA 2XXQA 3A3UA 2I48A 3IOWA 5KCJA 1Y4TA 1ZKBA 4BDRA 4LZ8A 1A55A 4EF2A 3PUWE 2I3WA 4THIA 2W7YA 3KJ7A 3CFLA 1P1UA 3U1OA 1R9LA 4MBPA 3PD8A 3MVXA 1IEJA 3T9VA 4H6DA 4P0IA 5FHNA 4F3SA 2QS4A 2CMOA 2XXTA 4YKJA 4LZ7A 3K1PA 4XIGQ 2Z8FA 3BKIB 5IAIA 4NMYA 4YKIA 2I0BA 5B7DA 3IO6A 4N07A 1B5HA 3TYHA 2DWJA 3DP6A 4WKMA 5A5XB 2UXAA 1MH4A 1SI0A 4N6PA 2ONSA 5KZTA 4ELOA 3Q27A 4ND9A 1QW0A 1T0KA 2D3IA 3SEWA 4OXVA 3TKDA 4NE4A 2DE4A 1LFGA 3K6UA 3QUJA 3Q25A 4GWOA 2AL5A 3THIA 2O68A 1US5A 1LB8A 2E1SA 4ZECA 1JEUA 1URSA 2DYXA 3S2VA 5I57A 3K01A 4WEPA 4XKPA 3U72A 3RQTA 1F9BA 1B3LA 1SBPA 4MLVA 1SW1A 2H4IA 3MP1A 5ICTA 2ZYNA 1MY0A 5TP9B 4ZEFA 4EDPA 4XKRA 2XX8A 2HXWA 2QS3A 3TCFA 2P2AA 1M5BA 3LSFB 4U21A 2Y7KA 4U23A 4OETA 3ZKKA 2ZXTA 5H8FA 3O6IA 3MC2A 3MP8A 4Q30B 4RYAA 3S9MC 1I69A 2F5XA 3JYRA 2G29A 3TELA 3B6QA 4YKPA 1D3KA 4EQ7A 1NNKA 2RC9A 4F19A 4PFTA 5B70A 2RC8A 3TTRA 2DWHA 3C36A 4GVOA 3L6HA 1B46A 2QJEA 2LAOA 4FIMA 1B9JA 4R2FA 3R7XA 3KN8A 1AH5A 4ZEBA 1FTLA 3N5LA 4TQUQ 1IXIA 4OFJA 4FECA 1L5TA 3QYTA 3LUYA 5J1DA 4DLDA 3QUFA 5KCJB 5HBCA 1H43A 3H06B 3FVNA 4U4SA 4ZE8A 3HCQA 4QRZA 3W9WA 1MXXA 4LZ5A 3H6VA 3IX1A 4TLMB 3UORA 1MDQA 3IB1A 1NNFA 4XTCQ 5TU0A 4R6KA 2B3FA 3JV9A 2XXYA 2Y7WA 1Y9UA 4ZZEA 4RK9A 3BFUA 1MXYA 1VFEA 4QF9A 1WVJA 3M3FA 1DOTA 1IUDA 3TUSA 3KOTA 3RT6B 3MZBA 4Z0IA 3KEIA 1ZU0A 4KYEA 1A54A 3K02A 2IA4A 1QUJA 2OCUA 3HV1A 3KBRA 4IO2A 1B0LA 1MM7A 1D9VA 1O64A 2RINA 4EXLA 4X48A 1Y4CA 4YICA 1MQHA 1D9YA 1N76A 3O6HA 3SDFA 5I2KA 4U2RA 4POXA 2XX7A 3TEPA 3K00A 2RCBA 1SVXB 1S7YA 2YPNA 4O3CA 2RCAA 3FZVA 2KLFA 5K2YA 5I57B 1HSJA 5FHOA 3TAJA 2Z23A 3Q26A 2O6AA 4ZEDA 1WODA 3PUXE 2V84A 4NTLA 4R73A 5I59A 2O51A 3VXBA 3N94A 3MP6A 5BUUA 5H8FB 2DXYA 5CBRA 1N3WA 5AA3A 1LCTA 3FV2A 3DM0A 2ZYKA 3C33A 4HS7A 1IXGA 4IY6A 1EZ9A 1ZIUA 4FEBA 2I58A 3FJMA 3KZGA 4ECFA 2F97A 1NFTA 2F36A 4QFNA 4OHNA 1B4ZA 1LAXA 4OENA 1B1HA 4ELRA 3G3GA 3K0VA 3K2DA 3VV5A 1LSTA 3CI8A 5H8NB 2AYSA 2M8CA 1OQHA 4EXKA 2R9JA 2Y7PA 4BDOA 3IB2A 2DOJA 2XHDA 2XD2A 4I1DA 3FXQA 2ONKE 1OIBA 3H3GA 4F29A 4EQBA 2OJTA 1FQFA 3EF7A 2O84X 3O2AA 4OMBA 4YB7A 1LAHE 2DVCA 1MM6A 4OEVA 1R9QA 5I84A 1MPBA 2ZMBA 3VFJA 1ZLQA 1OLCA 3CFZA 3R6UA 3N6TA 1I6QA 2D5WA 1AIVA 4ELQA 2Q8JA 1QKAA 2AL4A 3MAMA 3Q29A 2I0CA 1OLAA 2XXRA 3B6WA 5L9SA 4F3BA 3P7IA 4TLLB 3PUZE 5I2KB 3JZJA 1MY4A 1PB8A 5AE4A 1MG1A 4GXAA 1ANFA 4E0WA 3MW0A 2FYIA 4KD5A 3D4CA 4RJZA 3PPOA 3OO8A 1B51A 3VXCA 2OWTA 1O7TA 4GFRA 1BP5A 3PPNA 1JW1A 1JQFA 1A7LA 2DQVA 3AXFA 4H8JA 1B7UA 3H4ZA 1H3DA 1HSLA 4KR5A 1RYXA 5I59B 3M8UA 5CI5A 3VLUA 4R9GA 1MQIA 3WAFA 1GVCA 1CE2A 2PX1A 4OFOA 1Y3QA 4NF4B 3FVOA 3ZS6A 3N26A 1JVXA 2H98A 3OELA 4NF5A 2NWJA 1LBCA 3T96B 3CSGA 3QXMA 4ISUA 1MXWA 2OZZA 4QHQA 5AA4A 4IO5A 3VLVA 1B40A 4R2BA 1Q1KA 4NEDA 2H9BA 3W15C 3O66A 4GLIA 4H5GA 3HHFA 4O3BA 4R72A 5DEXA 5CRYA 1B0HA 3TZAA 2Z8EA 4U4XA 1FW0A 4EF1A 1Z7NE 4H65A 1A8EA 3MZ1A 4DIGA 4JBZA 2HAUA 1SD3A 1N7WA 3TDJA 1VR5A 4H67A 1A40A 1IXHA 3FVKA 1B7ZA 3C34A 2H5YA 2YLNA 1OQGA 3T9UA 2A5TA 3H6UA 4OYVA 1JEVA 3MUQA 4ELPA 2DVZA 2PMSA 2DE2A 4HTGA 3LSXA 1UTBA 3EN3A 4ZEKA 3MQ9A 1LAFE 3CRBA 1DSNA 5FTIA 2UVJA 4P0GA 4R6HA 2X26A 1PB9A 5CM6A 3MPLA 4N13A 2H25A 5TPAA 4P11A 4OZ9A 2QL3A 3IOUA 1JVYA 2Q88A 3C35A 2ESNA 3OD7A 4X1DA 1US4A 1BIYA 1NKXA 5HPQA 1SW2A 4H1XA 1XT8A 1B2HA 2GRVA 4U1OA 4HCWA 1VE4A 5ICQA 4JSDA 1LAGE 3RTWB 3S9EA 3TCHA 1Q35A 3RT8A 2Y84A 2I4CA 3OSQA 3OEMA 4PFUA 4KPTA 3MVZA 5IKBA 1BLFA 3FJ7A 5CMMA 2OWSA 2DSFA 5EHSA 1MRPA 2XXHA 1AL3A 3I5OA 3H7MA 1USYH 3PMWA 1P1WA 4BLAA 1UTHA 2F7AA 3BFTA 1POTA 3KFMA 2VD2A 3PGFA 3T9HB 4Q8RA 5H8QA 1Y1ZA 4KHZE 5AA4B 1FTKA 1ZMGA 4OTEA 1FTOA 3OENA 3TFLA 2HFBA 3FUZA 2VHAA 2ANJA 5DEXB 1MDP1 3KN7A 2QPQA 2GFEA 3GBBA 4AB5A 2UVGA 4YZZA 2OBGA 3IJXB 4ZDMA 3QAXA 5DYHA 3TCGA 4YAHX 4QFLA 3CG1A 4BDMA 2PYYA 4F22A 2R71A 4DE8A 2PT2A 3C9HA 2VP1A 3TQLA 3SEUA 3VDFA 2A5TB 3DELB 2QS1A 2ZYOA 4G8NA 2XXUA 1LBBA 1UTBB 5DTBA 4NWCA 3IO4A 2X7QA 1TFDA 1M5DA 4PFYA 1YTVA 3CIJA 4JSOA 4FATA 1QUIA 4R75A 3OEKA 2Y7IA 3A09A 1EZOA 4F1UA 3RY3A 3K4UA 4ESWA 4YMAA 3K1NA 4C1TA 3RN8A 3QK6A 3T66A 2DP8A 1MH3A 3HO7A 2XXVA 1ZTYA 4JWYA 3KSJA 1DPEA 2HZKA 3E3KA 1FQCA 1NNTA 2ONRA 4OERA 1B32A 1IXCA 3OO7A 1FQAA 4QSDA 2Z8DA 1FQEA 1PDAA 1B1XA 2I4BA 2Q9TA 3OMBA 4HCYA 3SESA 5LOMA 3FD3A 2DE3A 4K3FA 3A3CA 4KYSA 5CMKA 1H76A 1PBPA 5AA1A 4H8IA 5ITPA 5F1QA 3SEVA 4ZEIA 3W9VA 2O1LA 2VGQA 1WDNA 1UTHB 5I58A 3EQ1A 1TWYA 1Y20A 5H8HA 4G68A 3E13X 1DTZA 1EH3A 1FTJA 3O97A 5H8QB 2NXOA 4JWOA 4F39A 2UYEA 4ESXA 2PBWA 3CFXA 3TPAA 4GD5A 4JDFA 5M2VA 4F1YA 1URGA 3FATA 1OMPA 2AIXA 2I49A 1UIVA 2F8DA 3O9PA 1GGGA 5ITOA 3PUVE 4LQ2A 1Y1MA 2V93A 3KGCA 4UACA 2F7BA 3HPIA 1VSOA 1Y3NA 1II5A 2XX9A 2UYFA 3MVWA 3WAEA 2NUVA 2E0SA 1NH8A 5CMBA 3OSRA 4F2OA 3KG2A 5CC2A 4QFKA 2UVIA 3QIMA 1B6HA 4PE5B 3LR1A 4FAJA 1A8FA 3HSTA 3FGSA 5L9OA 4LUBA 1OVTA 3N6UA 4LP2B 3O6GA 4LVQA 3PMVA 3OO9A 3GBAA 1XHYA 1SDXA 2FNCA 5I2NA 3L6GA 4ZS9A 3B6TA 3G3FA 4H5FA 1LFIA 1SW5A 1GTKA 2DXRA 3BBRA 1XC1A 4G68C 5DVFA 2F6GA 4R9FA 3KOSA 4WXJA 3TMGA 2XD3A 2OK2A 2YJPA 5JK4A 4R74A 1EU8A 4XKQA 1TXFA 2DS9A 4IB2A 1URDA 4GL8A 4M4GA 4UA8A 4RPOA 2F35A 1MPDA 3S9NC 3UIFA 1DPPA 4G4PA 4TOZA 2ZNSA 5EHMA 1KWHA 1QUKA 1ATGA 1EZPA 3ECRA 3CR9A 1PC3A 1SQYA 3FXUA 3PPRA 3FASA 5L8DA 1Y3PA 2OLBA 3ODBA 3G3IA 3V89B 4RY1A 4I62A 3FJGA 1TT1A 4RXLA 3M3LA 3IK6B 3TQWA 3UN6A 1B4HA 3GXAA 3SERA 5H8HB 3RUMA 1SYIA 2HZLA 2Y7RA 3MVYA 2ZNUA 4YB5A 1NMUA 1S50A 1N7XA 2B3BA 4MFIA 4RK2A 1SW4A 4IO3A 4ZZAA 3ZSFA 2HAVA 2O7UA 1PEBA 2PVUA 1GV8A 3IR1A 3IJOB 1MPCA 4KCCA 4LONB 2GH9A 3PUYE 3KJTA 2BJJX 1AOVA 4NF8A 4ZE9A 1P1OA 2REGA 4AQ4A 2UVHA 3UA8A 3FVGA 2Q2AA 1BKAA 4DXUA 1RYOA 2V3UA 1LB9A 3G3JA 3OOAA 4O3AA 4I8CA 3FIRA 3TTMA 1R1NA 2QSXA 3FV1A 3IORA 2VD3A 1NH7A 1YPNA 1B5JA 3O28A 4IO4A 3RNNA 1LGBC 1YCJA 2PT1A 1M5CA 5I2NB 4DCXA 4OEUA 1ELJA 1CB6A 4YKKA 4C0RA 2RF1A 2F7CA 4F31B 2QRYA 2ALUA 1OVBA 4U22A 4GRKA 3F11A 4G8HA 4QSEA 4AB6A 1NNPA 4KYDA 4OESA 3U94A 4OVJA 2QMXA 3UK4A 5AA2A 3MZ9A 4PETA 1UIUA 3TTLA 4MH5A 3OO6A 4M1VA 1JNFA 2CZLA 4QSCA 3O29A 2XXWA 4XKNA 4DZ1A 3SEYA 3PMXA 2REJA 3IB0A 1XOCA 4FORA 4OQOA 3EPEA 5EYFA 3VVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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