3H03A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to ubp277
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanisms of antagonism of the GluR2 AMPA receptor: structure and dynamics of the complex of two willardiine antagonists with the glutamate binding domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A02
4F31B 1PDAA 4RPOA 1MXXA 2PYYA 3O66A 3E3KA 4LATA 4R6KA 4F3SA 3OSRA 4FJPA 3O9PA 3OO9A 3SEUA 3C34A 1B58A 4E0XA 4R6HA 2G93A 1MY1A 3MP6A 4IO6A 3UN6A 4NF4A 5AA2A 5AA2B 4NF4B 4N6PA 4P0IA 2HCAA 3HHFA 4X1DA 4ZE8A 4NF8A 3RNNA 1B32A 3IOTA 4DDDA 3RGYA 4H65A 1ZIUA 3MZ1A 1BLFA 3TELA 1N3WA 3CSGA 5KCJA 4YKJA 3EHTA 4ZECA 5KCJB 3M3FA 4IGRA 2O1LA 5CC2A 4H5GA 3K4UA 2ZYOA 1SI0A 1B7UA 4ZEDA 1A40A 3MWBA 1SW4A 1A54A 1Q1KA 1MH4A 1USYH 2OZZA 4F2QA 1SVXB 1N84A 5FHNA 3VXCA 2DS9A 4LQ2A 1NH7A 5DT6A 1JETA 3OXNA 4R2FA 1ZBMA 5ITOA 3IO4A 2QS4A 2A5SA 4RYAA 2XXTA 3OO7A 1BTJA 1A55A 4F3PA 3FXQA 1FQCA 2WKYA 3EHUA 2H25A 1IITA 3TFLA 1LBBA 5I56A 3DP4A 2YLNA 2HEUA 2I58A 2NXOA 5I56B 1OQGA 3HSTA 2Q2AA 3N5LA 4XKPA 3Q27A 1LCFA 1SDXA 4EDPA 4TLMB 3KZGA 4O3CA 3IB1A 3IK6B 3TEPA 3R7XA 3OD7A 1UTHA 3TCGA 2XHDA 1B05A 3VLWA 3UP9A 1B6HA 1UTHB 3PUVE 2I3WA 1D4NA 5I2KA 3MAMA 1MXUA 2RC8A 4ONYA 3S9MC 3RLFE 2Y7IA 2PMSA 3IX1A 4KYEA 4U1ZA 4FECA 1B3EA 3SDFA 1S50A 1B51A 3O28A 3U8QA 1H45A 3DP8A 3OMBA 1MPDA 2XXPA 3IAZA 2X26A 3M8UA 4AB5A 2FYIA 4NF5A 1SI1A 4GL8A 3CSBA 4G4PA 4NF5B 2DSFA 1DSNA 1EZ9A 1AMFA 1YPNA 4QFNA 3QXMA 1NNTA 1PBPA 1A8EA 4OFLA 3UIFA 4IO2A 2H4IA 1MQGA 4OETA 1OMPA 4LZ8A 2V84A 3T9UA 4OFOA 4FEBA 1QKBA 3OSQA 2F36A 4RNSA 3TCHA 2HXWA 5CMKA 4YB6A 3LSFB 4F29A 3QSLA 3VVFA 2DE3A 1B5HA 4GIZA 1XHYA 3UORA 3LSLA 3N6TA 1EU8A 5ITPA 4JDFA 4F1VA 4GXSB 1SD3A 4POWA 1OLCA 4QSDA 1SYIA 5DTBA 2NWJA 3K0VA 4OVJA 3A3CA 1WODA 1IQ7A 3EN3A 4YB7A 1BIYA 3V5AA 3H6VA 4IO5A 4PETA 1HSEA 1LB9A 4F18A 4P0GA 1LAHE 4RK2A 2IA4A 3EPEA 1QUJA 3C36A 1IIWA 5B7DA 1M5DA 2CMOA 4QFPA 4DCYA 2DP8A 3MQ9A 3H3GA 2I0CA 3K02A 5DYHA 1UIUA 2F35A 2HZKA 4HCWA 2YJPA 1Y20A 4G77A 3BKIB 2DXYA 3V89B 4ISUA 2BJJX 4G8MA 3W15C 2NOOA 1SW5A 4G8NA 3IB2A 2W7YA 3EF7A 3K1MA 1CE2A 3QYTA 3UK4A 2DE4A 1B5JA 3EHSA 5FTHA 2VOZA 3O6IA 3GXAA 1URSA 1FQFA 3OEMA 2F7CA 3K2DA 4C1TA 2O7UA 1US5A 2QMXA 2AL4A 4G68A 2F6GA 4U4SA 4GOTA 4NE4A 1DPPA 4G68B 3IJXB 3CFLA 1Q35A 1NH8A 3M3LA 4DZ1A 3KEIA 1B46A 3Q25A 2P1SA 3ZSFA 4RPNA 3MC2A 2V3UA 3CVGA 5LOMA 2B3FA 3D4CA 3MW0A 3U94A 4AB6A 5CI5A 2HAVA 5IKBA 4ECFA 1ATGA 1QW0A 4YKKA 2O6AA 4FAJA 1B4HA 1SW1A 4TQUQ 1B3HA 1N76A 3PPNA 3DELB 2F6PA 1ZU0A 2GRVA 3KBRA 3G3HA 5I84A 1I6AA 1O7TA 3ZKLA 1IXGA 3T22A 1USYE 3OENA 4PFTA 3V8XB 2UVJA 4H1XA 4F1UA 3PUZE 1LB8A 4G8HA 1VSOA 5TP9A 4JSOA 3O6GA 3KSJA 4L17A 4OFJA 2ANJA 2V3TA 1D3KA 1PB8A 5TP9B 2UVGA 1MDQA 3S9NC 3RY3A 5CMBA 3HHGA 1FTMA 3HV1A 3PUYE 2NVUB 4IY6A 4RXLA 1TFAA 4U23A 3G3FA 1B4ZA 2ABHA 3FJ7A 2XD3A 2B3BA 1N0TA 4JXIA 3S4UA 3FV1A 1NMUA 4QSEA 1GTKA 2I0BA 3MPKA 3CIJA 3A3UA 4THIA 1MDP1 3CI8A 1UIVA 4Q8RA 5BUUA 2ZNTA 2DWAA 5F7VA 1P1WA 3Q29A 4H8JA 2F8DA 2VD3A 4TLLB 3PUXE 4LZ5A 2I48A 4DLDA 3G7WA 3PGFA 4PE5B 4RK9A 1IEJA 4EQBA 3I3VA 3QUFA 4LP2B 1M5BA 1J1NA 1UQWA 3TTNA 2REGA 3VLVA 1P1UA 2GFEA 3L6HA 5TPAA 5DVJA 1LGBC 3O6HA 3CFZA 2QMWA 3PD9A 5FHOA 5TPAB 2OWTA 2Z8FA 3VXBA 5I58A 4ELOA 4LONB 3JZJA 5I58B 1MQIA 1JEVA 2PT2A 4F22A 2I4CA 1JEUA 5I59A 4OEUA 3QAXA 4NF8B 5L9MA 2R71A 5I59B 1Y3NA 1JW1A 1IZ1A 5EHMA 2XXYA 3T9XB 4UACA 2RCAA 4OHNA 3G3IA 1N7WA 4YMAA 2D21A 1Z7ME 3KJTA 2QS3A 2I49A 4FE8A 1AOVA 2ESNA 3C32A 1YTVA 4NWCA 2OCUA 3C9HA 3C33A 3W9VA 3TTLA 5AA4A 3QK6A 4JB7A 2P2AA 4IGTA 5AA4B 3MZ9A 3IOVA 3KG2A 3TTRA 3H6UA 5EYFA 1MXWA 1MXYA 4OENA 1LCTA 2Q89A 3PV0E 1FQDA 3IO6A 4EUOA 3TODA 5JEIA 1AH5A 4WEPA 5HPQA 2XXVA 1IXHA 1B5IA 1LAFE 2VD2A 3G3JA 4FORA 4GD5A 3ILTB 2O68A 4KYDA 5DVFA 2V3QA 2VGQA 1FQEA 2O51A 3TTMA 4YAHX 4MH5A 4H0WA 3K6UA 2Z8DA 1Y3PA 4GLIA 2AL5A 3OEKA 4KD5A 1FQAA 3O2AA 1XT8A 3S9EA 3VV5A 3O29A 4POXA 4FATA 3FVNA 1R6ZA 1TXFA 2Q2CA 2F7AA 5JK4A 5I2KB 1TT1A 3U1OA 3VFJA 2O69A 5L9OA 4F3GA 1S7YA 3RT8A 5HM4B 3U93A 3K00A 2X7PA 2Q8JA 2DYXA 3Q26A 5CBRA 3PPQA 3ZKKA 2ZNUA 4OMBA 1P1QA 2DVCA 4Z7EA 4WXJA 4IO7A 4LUBA 1EZPA 4P11A 1FTJA 4GQOA 2RCBA 3S2VA 3IOUA 4YB5A 1H3DA 4LVQA 4M4GA 4BDOA 1Y4CA 4DXBA 3TCFA 2I4BA 1HSLA 4DE8A 4H5FA 1B0HA 2D5WA 3FXRA 3SESA 4F39A 2VP1A 5AA1A 2R9JA 1AL3A 1NNKA 3PU5A 2HZLA 2Y7RA 2XXIA 5EHSA 2XXUA 1ZTYA 1NNPA 1HSJA 1AIVA 2GHBA 4PFWA 4MFIA 3DLNA 2F78A 3H7MA 3E4RA 4C1UA 3MJNA 3A09A 3W9WA 4GVOA 5KDTA 4I8CA 1OQHA 1DTGA 4M1VA 3FD3A 2FA7A 2QJEA 1B1XA 2I6EA 4LZ7A 1A7LA 2P0SA 5FTIA 2ONKE 3KN3A 1Y4TA 3OOAA 2ONRA 1OVBA 2RF1A 2XX8A 2H9BA 4KCDA 1DOTA 3OO8A 4U2RA 4ZZAA 3R26A 1IUDA 3ODBA 4X9TA 4R9FA 4F2OA 4XTCQ 4OERA 1JVXA 3T9VA 5AE4A 1I6QA 3E13X 2UYFA 4X1BA 4KI0E 1MXVA 4LA9A 5M2VA 2AIXA 1B9JA 1DTZA 4XKRA 4I62A 2UVHA 3L6GA 1M5EA 3FZVA 4PQJA 1POY1 3SEVA 3RUMA 2OWSA 3IJOB 1GVCA 3QIMA 3TPAA 4KYSA 3PPPA 3RN8A 2QL3A 3R6UA 1ZKBA 5AA2D 3T9HB 1M5CA 2REJA 3BFUA 1Y3QA 3KGCA 1P1OA 4OESA 1F9BA 3SKPA 5H8QA 3UA8A 5H8QB 5ICQA 3C35A 1LBCA 5H8NA 2AYSA 4MBPA 5CMCA 4ZEKA 1WVJA 3JYRA 3WAEA 2DXRA 2CZLA 1P99A 4R74A 3LSXA 3RT6B 4ZZEA 3THIA 1MPBA 4BLAA 4KQPA 4DCXA 2E1SA 2XX7A 1H44A 1POTA 1N7XA 3KJ7A 4IY5A 5H8SA 3U72A 2DWIA 1MM6A 4YKIA 5ICTA 4IO3A 1R9LA 3KSXA 1B7ZA 3KFMA 3WAFA 3TYHA 5BWJA 4R9GA 3SEXA 4YMBA 1PB9A 4KHZE 1S9TA 3MBPA 1I69A 3ECRA 3N94A 4EF1A 3PMXA 3CRBA 3DM0A 3H6WA 4EXLA 1CB6A 4R72A 1ZLQA 1H76A 4E0WA 1XVXA 3O97A 1US4A 3MVZA 3TTKA 3VLUA 3PPRA 4K3FA 3GBAA 1ELJA 4QFKA 4QRZA 3SEYA 2FNCA 1DPEA 1O64A 2M8CA 2Q88A 4U21A 1GV8A 4NF6A 2OK2A 4DIGA 5J1DA 4Q5TA 2G29A 4NF6B 2Y84A 3LC8A 4ELQA 5FHMA 1B3FA 3GLBA 2UXAA 1UTBA 4ZDMA 3TMGA 3C31A 1UTBB 3M3KA 4ELRA 1A8FA 1QKAA 4BDLA 1LSTA 4XKQA 5CRYA 4R75A 2D3IA 2HFBA 2XD2A 1OLAA 1M5FA 3FXUA 3B6TA 3I5OA 3H6TA 4QF9A 2B65A 1FTKA 3DP6A 3CR9A 3PUWE 1SBPA 4C0RA 1XS5A 3FJMA 1B3GA 2ZYNA 1XOCA 3SEWA 2XXHA 1FCKA 3TKDA 4OZ9A 4QSCA 3KN8A 4WKMA 3QUJA 3CG1A 3IR1A 4AQ4A 3CG3A 4BDMA 3RTWB 2DVZA 3TUSA 1NL5A 5DEXA 1B0LA 3TAJA 5DEXB 2XXWA 4ELPA 3UGWA 1B2HA 4FEDA 1FQBA 1NFTA 2YPNA 1LFGA 1ZMGA 3MP8A 3RTFB 4OTEA 3K6WA 2DWJA 4NEDA 4G68C 3LUYA 3G3KA 2ZNSA 3MUQA 3VVEA 1QUKA 3D4GA 1Y9UA 1BP5A 5H8HA 3FVKA 3FJGA 1N04A 3TQWA 5H8HB 1T0KA 2QSXA 4GF8A 1SW2A 1MQJA 2OLBA 4JSDA 4GRKA 4TOZA 3G3GA 5L8DA 4Q0CA 2QRYA 3HN0A 1D9VA 4ZEBA 5L9SA 1DMBA 1NNFA 4H6DA 4QHQA 2XXXA 4UA8A 4YZZA 2O84X 5AA3A 5B70A 4BDNA 4RY1A 3Q28A 4PFUA 1QULA 1LLSA 2OBGA 4IB2A 3FIRA 4DXCA 3B6QA 2XXRA 4EF2A 1TFDA 3TQLA 3FATA 2H99A 4KPTA 4F3BA 4N13A 1OVTA 5JTYA 4PFYA 1JW5A 3SETA 3P7IA 4ZEIA 5JTYB 3I6VA 1URDA 3K1NA 2F7BA 1JNFA 5F1QA 1IXIA 5CMMA 3U92A 1VFDA 3E9XA 4HCYA 3TDJA 1GR2A 4BDQA 1OIBA 2RC7A 5K2YA 3ZS6A 1LAXA 2DE2A 1MG1A 3K6XA 5I57A 2IEEA 3FVGA 3FVOA 2UVIA 5I57B 3IOWA 1D9YA 4YICA 4JBZA 2Z23A 1A99A 1R1NA 2E0SA 4G2ZA 5H8FA 2OJTA 5H8FB 3MVXA 1FW0A 2ALUA 4X48A 4JWXA 1ZJLA 4IO4A 4KR5A 4OQOA 2ZXTA 4NTLA 4OYVA 1MXZA 1NKXA 3CFXA 2RINA 1B1HA 2RKMA 4ESXA 1I6BA 1LFIA 2UYEA 3GZGA 3RQTA 2R6GE 4O3AA 1EZOA 4QFLA 3HCQA 4R6YA 1RKMA 4F19A 4H8IA 3N26A 2Q9TA 4EQ9A 2DOJA 3PPOA 3BFTA 3B6WA 5KDTB 4OEVA 3K01A 1QUIA 4ND9A 3H06B 3VE1B 1WDNA 3AXFA 2PVUA 2QPQA 1B3LA 3MPLA 3FV2A 4FIMA 3BBRA 2QS2A 1MH3A 2O1MA 1VE4A 1R9QA 1PBQA 1RYXA 4RJZA 4I1DA 1QVSA 3VDFA 1GGGA 5ELVA 4ZE9A 4ESWA 2ZMBA 1IXCA 2THIA 3IORA 1N3XA 3GBBA 1H43A 1MS7A 4GWOA 3MZBA 2H5YA 5I2NA 5CM6A 1LAGE 5I2NB 3C4MA 1II5A 2XX9A 2X7QA 3USDA 4ZS9A 1L5TA 1MRPA 5HBCA 3S9LC 2RC9A 2PT1A 2H98A 4XIGQ 2HQ0A 4F1YA 2Y7PA 3MP1A 5ISUA 3IL1B 1XC1A 4HS7A 3N6UA 4GFRA 3H4ZA 1MM7A 4NMYA 3LR1A 3MVYA 1ANFA 1SQYA 4HTGA 1JW4A 4MLQA 4R2BA 3T96B 1PEBA 4BDRA 2Z8EA 3K6VA 1MPCA 3T66A 1PB7A 1FTLA 5H8NB 4H67A 4KFQA 1TWYA 5TU0A 3T93B 1B52A 4Q30B 2F34A 1JVYA 2ZYKA 3FGSA 1YAEA 2A5TA 1EH3A 4O3BA 2KLFA 2DWHA 4YU0A 3JV9A 1KWHA 3EQ1A 2A5TB 1MQHA 3VVDA 1Y1ZA 3K1PA 4XKNA 4U1OA 2DQVA 5A5XA 4YKPA 2Y7KA 1B7HA 4GXAA 5A5XB 3MVWA 2NUVA 1Z7NE 4I9DA 1MY3A 1MY2A 1O63A 4GL0A 3FASA 1BKAA 2ONSA 1PC3A 1LFHA 3IB0A 4LQ5A 3KN7A 1XVYA 4R73A 4PP0A 4OXVA 3FUZA 1MQDA 3PMWA 4Z0IA 3OELA 3HPIA 4XXUA 3OO6A 4QFOA 1VFEA 1YCJA 4ZEFA 3TZAA 3F11A 2Y7WA 4NWDA 4JWYA 4U22A 3RPWA 3KOTA 4MF3A 1P1NA 2GHAA 2V93A 3PD8A 2O7IA 1MY4A 3ONMA 2Z22A 1Y1MA 4JWOA 1FTOA 4U4XA 4EQ7A 4OWDA 4WEDA 3V83A 5CBSA 5KZTA 2XXQA 1VR5A 5IAIA 2ZYMA 1SYHA 2PX1A 2LAOA 4MLVA 5K2XA 2F97A 4HW8A 2F5XA 1JQFA 3HO7A 3SERA 1B40A 5DVIA 1URGA 2QS1A 3LSWA 3LBSA 4DXUA 4EXKA 2VHAA 4KCCA 4N07A 3KOSA 1RYOA 3ILUB 3PMVA 3H03A 2PBWA 1QJMA 2V25A 1MY0A 2GH9A 4RA1A 2I3VA 2HAUA 3B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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