3H03A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur2 bound to ubp277
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanisms of antagonism of the GluR2 AMPA receptor: structure and dynamics of the complex of two willardiine antagonists with the glutamate binding domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h03A02
1ZU0A 1XT8A 3CSBA 3B6QA 3UK4A 3N6UA 3CI8A 4KQPA 3MZ1A 3TDJA 3L6GA 1DTGA 1F9BA 4R2BA 3K1PA 1B7HA 3LSLA 4TOZA 1A40A 4QSDA 1A54A 4U1ZA 5AA1A 1I6AA 2F34A 5I2NA 3BFTA 5JEIA 3O6HA 1NKXA 4RPNA 4YKIA 2DQVA 4GXSB 2OCUA 3OO6A 4I8CA 4LATA 5TP9B 2ABHA 3RY3A 2NUVA 4QFOA 2PMSA 5DYHA 2GHAA 2THIA 5JK4A 3KEIA 4EUOA 4OZ9A 2VP1A 5DTBA 4F1UA 2Y7PA 1UTHA 4KHZE 4QF9A 1URGA 1PDAA 2Z23A 4JWOA 4HS7A 3MJNA 3TTNA 3OSRA 3SEYA 4IO5A 1SW5A 2DVCA 2F7BA 1EZ9A 5H8HA 3EN3A 1EZOA 4I62A 1VR5A 3TFLA 4EXKA 3PUZE 3RGYA 1HSJA 4IO3A 1QKBA 4I1DA 1S50A 2V3QA 1N04A 3FVOA 2ZNTA 1NNKA 5HBCA 5TP9A 2Q88A 2QS1A 2B3BA 1LSTA 3FIRA 4G68B 2XXQA 2H25A 2I6EA 4U1OA 2PT2A 4U23A 3U93A 4AQ4A 1JVXA 1ANFA 1JQFA 2DOJA 5AA3A 2PX1A 2O7UA 1N0TA 1RYOA 2H5YA 3TYHA 4GXAA 3OMBA 5F1QA 4U21A 1SVXB 2O6AA 3MP8A 3UA8A 4GL0A 5EHSA 2F7AA 3IOVA 3I5OA 1EH3A 2O69A 3MP6A 4H1XA 4IO6A 4OVJA 4FORA 3IJOB 1ZBMA 3D4CA 4R72A 2X7PA 1O64A 4GQOA 5AA2B 5AA4B 3C33A 1Y3NA 3QAXA 4HW8A 1MPBA 1JW4A 3PPPA 4ELOA 4ELRA 3DP8A 3RTWB 4WEPA 2XXYA 1D9YA 3FJMA 1PB9A 2GHBA 1N3WA 3C34A 2YJPA 3U8QA 3CR9A 1EZPA 2D3IA 5DVIA 1URDA 5I2KB 2D5WA 1MY4A 2UVJA 3SDFA 4Z0IA 3RLFE 2P1SA 3JZJA 2HCAA 3PUYE 1DPPA 4YKPA 4OWDA 3N6TA 2HQ0A 2OZZA 1B3EA 3RNNA 4OENA 1A8FA 1LBBA 3CG3A 5FTHA 4H8JA 2XXRA 3RT8A 1TXFA 1POTA 1MM7A 1DPEA 4H65A 3E9XA 3LSFB 1L5TA 1UQWA 2ONSA 2AL5A 3GBAA 3PPOA 2Y7KA 3HO7A 4DDDA 1J1NA 3OSQA 4FEDA 5CMCA 5ITPA 3H3GA 4ND9A 2QMWA 4LZ8A 4XKQA 5CC2A 4QHQA 3A3UA 3TTLA 2RCBA 4O3AA 4NMYA 5J1DA 1Q1KA 3PD8A 4GRKA 1B3FA 2V25A 5I59A 2P2AA 1BLFA 1TFAA 3UIFA 3UN6A 2PYYA 1UTBB 4YU0A 4GIZA 2V93A 3MBPA 1IXIA 1R9LA 4EQ9A 1MXUA 3S9NC 4GD5A 2A5SA 3I3VA 3KN7A 5JTYA 4FECA 3LSXA 3ZS6A 4RY1A 1YAEA 3O29A 1OVBA 3PD9A 3P7IA 3GBBA 2FA7A 1PC3A 2UVIA 1XVYA 4WKMA 2RF1A 4ZE8A 3VLWA 1LFHA 4NF8B 5HPQA 1CE2A 5KDTB 4OTEA 3SKPA 3CG1A 3E4RA 2DE2A 3N94A 2H4IA 3DELB 2B3FA 5K2XA 1FTOA 1QUJA 5H8FB 3IB2A 3MPLA 5H8QA 5EYFA 2NXOA 1JEUA 1LB8A 2F5XA 3ONMA 1BIYA 1P1UA 5AA2D 3KOTA 4C0RA 2DWAA 4ZDMA 3TEPA 3FVGA 3RN8A 3V5AA 2AIXA 4ECFA 4R74A 5L8DA 2A5TA 1B05A 3WAFA 1IIWA 1RKMA 4L17A 2W7YA 4OMBA 3KBRA 4DCYA 2ZYNA 4N07A 4NE4A 1LGBC 4KD5A 4N13A 3A09A 1USYE 4P0GA 1H43A 3MC2A 4K3FA 1BTJA 1XOCA 4GLIA 3RQTA 1MRPA 1AH5A 2IA4A 1MDQA 3K02A 3PUWE 3KSJA 2DWJA 5LOMA 2XXHA 3TZAA 3CFLA 3M3FA 1Y3PA 3HHGA 3KFMA 3K6WA 1OQHA 4RXLA 1B1XA 2I49A 1DTZA 4IO2A 1BKAA 1R9QA 1NNTA 3OEKA 3WAEA 3R26A 3E13X 1SW1A 3EHTA 5B7DA 2O84X 4ELQA 4NF4A 1QVSA 3UGWA 3GXAA 2DXYA 4YB7A 3H6TA 3QK6A 4OERA 2I0BA 2H9BA 2ALUA 3IR1A 1MH3A 1QJMA 4ZEBA 1O63A 3C9HA 4C1UA 3QXMA 3BFUA 1EU8A 5KCJA 3HN0A 1DOTA 3IB0A 1JEVA 3LUYA 3PMVA 3DP4A 3O66A 4YAHX 4IGRA 4U22A 2FYIA 1ZKBA 5H8NB 1JNFA 1N76A 4U4XA 4IGTA 1Y4TA 4H6DA 4X9TA 3K0VA 1IXHA 3H4ZA 3DLNA 4IY6A 3EHUA 1US5A 1FQAA 4I9DA 3IOUA 5HM4B 3MWBA 4MH5A 3V8XB 4IO4A 1OIBA 2E0SA 3TODA 1WVJA 2Q2CA 5DVJA 3S9MC 1LAXA 4PQJA 3PU5A 5KZTA 3QIMA 4OEUA 3E3KA 3VLUA 1UIUA 3MQ9A 3OENA 2QSXA 1S9TA 4BDMA 1ELJA 1Q35A 1D9VA 4E0XA 2VD3A 3BKIB 2NOOA 1D4NA 1PB8A 5CBSA 4KYSA 1Y1MA 1ZJLA 4QFNA 1B0HA 2LAOA 3BBRA 4ISUA 3IO6A 2M8CA 4F22A 4R6KA 2F78A 4ZECA 4F1YA 3VVDA 1TWYA 1P1OA 2OWTA 1POY1 3MP1A 2YLNA 1MH4A 2QPQA 2XX7A 2Q8JA 5ELVA 4ONYA 4F1VA 1B51A 5I56B 4YMBA 1R1NA 3Q29A 4ZEIA 5I58B 3S9LC 1ZTYA 2XXTA 2XXVA 4MFIA 1SDXA 2DE3A 4PFWA 2Y7IA 3ECRA 1FTLA 1MXYA 4OQOA 4AB5A 4JWYA 4GF8A 3K1MA 2RCAA 1P1NA 4NF6B 4YKKA 1LLSA 3G7WA 5ITOA 3KSXA 3TELA 1H44A 1UIVA 3B6TA 3SEUA 3K1NA 4QSCA 1B4HA 3QUJA 1B6HA 3O6GA 4YMAA 1I69A 4F3BA 4R6HA 2XXUA 1KWHA 1LFIA 1OMPA 2NWJA 4MLQA 3DM0A 5FHNA 2RKMA 4F19A 4OETA 4F31B 4POXA 1TT1A 1DSNA 4H0WA 1JETA 1B52A 4G2ZA 4R2FA 3HPIA 4TQUQ 5K2YA 3FXRA 2RC9A 3W9WA 4H67A 2XHDA 1II5A 1MXZA 1B2HA 1MPCA 3OO7A 3CFZA 1NH8A 1VSOA 3KN3A 4IO7A 4ZS9A 2Z8FA 1B5IA 1GR2A 4JBZA 2R6GE 4G68A 4RA1A 2QS4A 3OEMA 3K01A 3PMXA 3O97A 2H98A 1LFGA 4PETA 3GZGA 4Q30B 4JSOA 2O68A 1B5JA 4N6PA 4QRZA 2H99A 3OXNA 2OWSA 3EPEA 4EF2A 4NWDA 4Q0CA 4EDPA 2WKYA 4RK9A 5IKBA 4KCCA 5A5XB 4BDQA 5L9MA 4DLDA 4G8NA 3K6UA 3MZBA 3KOSA 5DEXB 1YTVA 2RC7A 3O9PA 4ESWA 4F29A 4KPTA 5AA2A 4ELPA 3V89B 5AA4A 2DXRA 1MY3A 1NNFA 1DMBA 2I4BA 3UORA 2Y7RA 2XD3A 3MVYA 4NF5B 3USDA 4ZZAA 4E0WA 5CMKA 4ZZEA 2GRVA 3IORA 3FXQA 2PVUA 1A7LA 4POWA 1ZMGA 3DP6A 3AXFA 4Q8RA 1TFDA 2Q89A 5I2KA 1GVCA 1FW0A 3LC8A 1R6ZA 5L9OA 1Y1ZA 1SI1A 3O6IA 3SEWA 4JDFA 4MBPA 5TPAB 3M3LA 4TLMB 2F7CA 2DWHA 3FATA 4JXIA 3TQWA 4M1VA 3RT6B 5A5XA 2V3TA 4DZ1A 1OLAA 2OK2A 3ODBA 4OFLA 2PBWA 1MQJA 2Q2AA 1B7UA 4BDOA 4O3BA 2OJTA 1FQFA 4U2RA 4YB5A 1SYIA 2F35A 1USYH 4R6YA 1B3GA 4LVQA 4EF1A 3T93B 3QSLA 1Z7ME 3TQLA 3G3KA 4THIA 1MQGA 4KR5A 3CVGA 3PUVE 3H7MA 2V84A 2DYXA 1XVXA 4NWCA 3OELA 1M5DA 2UVHA 2I0CA 2ZXTA 1PEBA 2GFEA 1FQCA 3VDFA 2HAUA 1ZIUA 3TPAA 3FUZA 1MY2A 1YPNA 1MM6A 4FIMA 3OO8A 1OVTA 2RC8A 4X1DA 1UTBA 3T9HB 4QFLA 3U92A 1FTKA 2Z8DA 5TU0A 3U94A 3C4MA 3FVNA 3C32A 2DP8A 3FJ7A 3VFJA 3G3JA 4LA9A 5I57B 4RJZA 1FCKA 4G68C 3S4UA 1P99A 1H76A 4FEBA 4U4SA 4PE5B 2ZYMA 1B3HA 3CSGA 3OO9A 1B5HA 2O51A 1Y20A 3T22A 4LQ2A 5ICQA 3TTRA 4KFQA 4DXUA 1WODA 2ONRA 4NF8A 1A55A 1B32A 3SESA 5KDTA 1AL3A 4R75A 5AE4A 2ZMBA 4LONB 3RUMA 4YICA 3CRBA 4DIGA 3H03A 3MW0A 4UA8A 1MXWA 1MY1A 2XX8A 4PP0A 3FGSA 5H8FA 1SI0A 4YZZA 1FTMA 2I4CA 1IUDA 3RTFB 2DWIA 3IL1B 2QS3A 3LSWA 3H06B 3CFXA 2E1SA 4DXCA 5CBRA 1GTKA 4O3CA 1HSLA 3R6UA 3FV2A 1CB6A 2O1LA 1ZLQA 3U1OA 4Q5TA 2CMOA 4C1TA 5CRYA 3KJ7A 4X1BA 4X48A 4KYDA 1N7XA 3MVXA 5I2NB 4F39A 2XXXA 2UYFA 3MZ9A 1N84A 2VHAA 4F3PA 1MXVA 1IXCA 1S7YA 5FHMA 1SBPA 2G93A 1LAHE 4EQBA 3M3KA 2X7QA 3RPWA 3W15C 1M5FA 1I6QA 2UYEA 3K6VA 2V3UA 3Q26A 1PBQA 1Y4CA 4XKNA 3D4GA 4RYAA 1UTHB 3IB1A 4F3GA 4PFTA 1XHYA 3G3FA 1B40A 5DT6A 2DSFA 3VVEA 1LAFE 5ISUA 2KLFA 5CMMA 5H8HB 5FHOA 5BWJA 1GV8A 2ZNSA 4WXJA 1MQHA 5L9SA 2DE4A 3IAZA 3KZGA 1AMFA 4KYEA 4OESA 4FATA 4DXBA 1B46A 1B0LA 4EQ7A 4P0IA 4BDRA 2NVUB 1LCFA 5CMBA 1D3KA 3H6VA 1HSEA 1P1WA 4LZ7A 4M4GA 4P11A 4BDLA 2I48A 2VOZA 4XKPA 5H8NA 3A3CA 4YB6A 2IEEA 2YPNA 4G8HA 3CIJA 2QL3A 3IOTA 2HAVA 3EF7A 1Y3QA 4R73A 4WEDA 3T9XB 2XD2A 4XKRA 2ZYOA 3QYTA 1SW2A 4NTLA 3S9EA 1NL5A 3IOWA 1LB9A 1VE4A 4DCXA 4OYVA 3G3IA 3G3GA 1IZ1A 1LBCA 3O2AA 3LR1A 1SQYA 1B1HA 2DS9A 5CM6A 5CI5A 4F18A 3Q27A 3PPRA 1FQEA 3Q25A 3N26A 1RYXA 3V83A 3N5LA 3B7DA 1MG1A 5B70A 2ONKE 3FVKA 3TTKA 1ATGA 2PT1A 1NFTA 3IX1A 4OEVA 4JB7A 4OHNA 5I56A 3JYRA 3T96B 5I58A 3T9VA 2F6PA 3FJGA 3GLBA 3KJTA 3SERA 2QJEA 2REGA 3R7XA 4DE8A 3TTMA 4FE8A 3FZVA 4OXVA 2HFBA 1BP5A 2ANJA 3ZKKA 1MPDA 1M5CA 3MAMA 3JV9A 3MUQA 4G77A 3SETA 3W9VA 1Z7NE 1A99A 4NF6A 3K6XA 4PFUA 1QUIA 3C35A 2QS2A 3FD3A 1MDP1 1WDNA 3SEVA 3M8UA 4F2OA 4H5GA 2AL4A 2CZLA 2OBGA 2ZNUA 4HCYA 1IEJA 5ICTA 4GVOA 2ESNA 4LP2B 1PBPA 3IO4A 2O7IA 2XXPA 2REJA 5F7VA 3VLVA 2OLBA 1VFEA 2DVZA 4BLAA 1FTJA 4GOTA 5FTIA 1M5BA 2D21A 2AYSA 1QW0A 3U72A 3ZKLA 3MVWA 3C31A 3TCFA 3ILTB 1GGGA 1MQIA 3T9UA 5I59B 1B4ZA 4JSDA 5BUUA 4EXLA 2Z8EA 1MXXA 2HXWA 1OQGA 1IQ7A 3PGFA 3K2DA 1IXGA 2R9JA 2F36A 1VFDA 4YKJA 4G4PA 3OD7A 5JTYB 4KI0E 1QKAA 1LAGE 2QRYA 1URSA 1FQBA 3IJXB 4LUBA 4RPOA 3TCHA 3FV1A 2HZKA 4FJPA 2XXIA 4GL8A 4R9FA 1B58A 2O1MA 1JW1A 4XXUA 3L6HA 1B3LA 1XS5A 2ZYKA 4F3SA 4IB2A 1LCTA 5DEXA 1SYHA 3HSTA 1XC1A 4H8IA 5H8QB 3S2VA 4NEDA 4FAJA 1NH7A 5EHMA 1IITA 3I6VA 1I6BA 4JWXA 1H45A 3K4UA 3VV5A 2F6GA 1N7WA 4F2QA 1NNPA 4NF5A 2HZLA 4OFOA 2F97A 4OFJA 1AOVA 2I3VA 2A5TB 3ILUB 3TMGA 4LZ5A 1AIVA 4BDNA 1P1QA 4PFYA 5M2VA 1QUKA 2XX9A 2HEUA 4QFKA 3PPQA 3TKDA 5I84A 5TPAA 1OLCA 3HHFA 3OOAA 1JW5A 1O7TA 3O28A 5IAIA 4HCWA 3QUFA 2Z22A 3IK6B 2R71A 2UXAA 1M5EA 4IY5A 2G29A 4QSEA 3TAJA 2P0SA 2X26A 3TCGA 3F11A 1SD3A 3VXBA 2VGQA 1FQDA 1MS7A 4ESXA 3B6WA 3KN8A 4GWOA 3T66A 2F8DA 4MF3A 2BJJX 4R9GA 4ZEFA 1T0KA 5DVFA 4RK2A 1MQDA 3PMWA 2QMXA 4UACA 4NF4B 4QFPA 1B7ZA 3KG2A 3HCQA 3MPKA 1B9JA 4AB6A 3H6UA 4MLVA 3EHSA 1NMUA 3TUSA 4ZEDA 1MY0A 2I58A 3Q28A 5KCJB 2Q9TA 3LBSA 4XIGQ 4H5FA 3UP9A 3FXUA 3K00A 2RINA 3FASA 4ZEKA 2VD2A 3G3HA 1US4A 1QULA 3PPNA 4KCDA 3HV1A 3H6WA 4GFRA 4RNSA 5I57A 1PB7A 3ZSFA 3THIA 1N3XA 2I3WA 3PV0E 3VE1B 1H3DA 2B65A 3SEXA 3MVZA 2UVGA 4LQ5A 1A8EA 2Y7WA 1JVYA 3KGCA 3VXCA 3C36A 5H8SA 4XTCQ 4G8MA 3EQ1A 4TLLB 3PUXE 3VVFA 1SW4A 2FNCA 4Z7EA 1Y9UA 4ZE9A 2XXWA 1YCJA 4HTGA 2GH9A 2Y84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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