1MDQA

Refined structures of two insertion(slash)deletion mutants probe function of the maltodextrin binding protein
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGGSVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN
publication title Refined structures of two insertion/deletion mutants probe function of the maltodextrin binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar transport
total genus 114
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mdqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mdqA01
4ZEBA 1H76A 4OQOA 3DLNA 5IAIA 4LQ2A 1B05A 1CB6A 1POTA 4ONYA 3V83A 2CZLA 4LATA 4FAJA 5TPAA 2Q9TA 4RPNA 2E0SA 1LCFA 4HS7A 5I59B 1Y1MA 1M5BA 3TODA 3H4ZA 5BUUA 1FQAA 3MAMA 1H45A 4BDRA 3LBSA 1AL3A 1B58A 2XD2A 1A99A 2OZZA 3MVYA 1T0KA 3LSXA 3CG3A 1Y20A 1MXYA 4GL0A 5JTYA 3SEVA 3OSQA 1SW4A 1BLFA 3ZKLA 3ODBA 1Y9UA 2B3BA 5TPAB 1ATGA 3GXAA 2QMWA 1RYOA 3EQ1A 3FXQA 4F2QA 2X7QA 2PVUA 5H8NA 3W9VA 1Y4CA 5L8DA 3IOUA 3ZKKA 3O6IA 2THIA 3CIJA 2CMOA 3BFTA 4R6KA 1MXVA 4IO7A 4QSCA 2LAOA 3TYHA 3UP9A 3DELB 1OLAA 3QXMA 4RYAA 3EF7A 1MQJA 1URSA 4R74A 3Q27A 3JZJA 2NUVA 1LFGA 4DXCA 1FW0A 3L6HA 3DM0A 3CFLA 2Q8JA 3PUZE 2O51A 4YKJA 1LB8A 3MW0A 1AOVA 2ZYNA 1MY4A 1WODA 3F11A 1OVTA 1B0HA 1XVYA 1I6AA 4NMYA 3G3IA 4QSDA 2ANJA 1QUJA 4H8JA 5CMMA 1UTHB 4U4XA 2XXUA 1SYIA 3IX1A 3UIFA 3VLWA 1PBPA 2RINA 2VHAA 3C32A 3K6VA 3G3JA 4KFQA 4NWDA 1MQHA 3IJXB 1R9LA 2Y7PA 1NMUA 4P0IA 3SEWA 3G3GA 3KN7A 2R6GE 4BDOA 3FJGA 1I6QA 3SDFA 1B2HA 4KI0E 4F3BA 4QSEA 4MFIA 1JW4A 1SDXA 3U72A 1VSOA 3N6UA 3EN3A 1QJMA 1OVBA 4LUBA 5I84A 1IEJA 1POY1 4F3PA 2UVGA 1L5TA 1HSLA 3K1MA 3C36A 3HSTA 2Q89A 3T93B 2XXRA 4HCWA 4G77A 2H99A 3I3VA 2HXWA 4XTCQ 1FTOA 3OMBA 4FECA 4Z0IA 1GR2A 1LCTA 4THIA 3QYTA 5K2YA 4U23A 5DEXB 3V89B 3FGSA 4DXBA 3K2DA 3LR1A 3Q26A 3K6WA 1QULA 1QW0A 3RTFB 3M3LA 3EPEA 2FYIA 4HW8A 1LB9A 4G8MA 1P1OA 3R26A 4X9TA 4KR5A 2NXOA 1MDP1 2XXIA 1O7TA 1J1NA 4JSDA 3PUWE 4GVOA 1US5A 3TELA 4KYDA 3ILTB 1ZIUA 4ZEDA 1Y3NA 1JW5A 2AYSA 1S9TA 4AB5A 5CRYA 1FQCA 2PT1A 4IO4A 1WVJA 1B7UA 1B3EA 1JW1A 2VOZA 4FATA 2QPQA 2H25A 3MPLA 3VV5A 2HFBA 4F1UA 4ZECA 4ELQA 1LAGE 3FV2A 1JEVA 3PMVA 4ELRA 1NKXA 4OVJA 3VXBA 1WDNA 1LLSA 1EU8A 1MQIA 4KHZE 3PU5A 4L17A 4YB6A 5IKBA 2VGQA 4ELPA 3OOAA 3KOSA 3MVXA 1PC3A 2QJEA 1A55A 3KOTA 2D5WA 1NNKA 4OFOA 1XOCA 5M2VA 3K1PA 4R6YA 3OEKA 4R9GA 1A7LA 2V93A 2Z8EA 1A8EA 4ZS9A 4FE8A 2F5XA 3RY3A 2DP8A 2F6PA 1SW2A 1OQHA 3FZVA 4ZE8A 1N7XA 3M8UA 4MLVA 4U2RA 5I58A 4H1XA 3RTWB 4WEDA 1TXFA 2X7PA 5I57A 3TCGA 4JWOA 1NNTA 4IGTA 3I5OA 3R7XA 5DTBA 4TLMB 4OEUA 4YMBA 5AE4A 1ZU0A 4R6HA 1TFDA 3HN0A 3PD8A 3HV1A 1KWHA 2XXHA 2YLNA 3K01A 3H6UA 3S9NC 1EH3A 4F3SA 3TDJA 3V5AA 4JDFA 1LSTA 2VD3A 2F35A 2DSFA 1B9JA 4E0XA 2X26A 2H5YA 4NF4A 5DVJA 3DP8A 2QMXA 2XXTA 4Q5TA 2VD2A 3TEPA 5ICTA 3R6UA 4Q8RA 2NOOA 1LAFE 3MBPA 1JQFA 5I56A 2Y7IA 4GFRA 5CBSA 1YCJA 1P1NA 5I58B 4TOZA 4NF5A 4H5GA 1NFTA 3B7DA 4R2FA 5KCJA 2OCUA 3S9EA 3THIA 4XKPA 4ESWA 4PFYA 3V8XB 3FVGA 2V3QA 4XIGQ 3H6TA 3OO8A 4N07A 1S50A 1FQEA 5F7VA 3LSLA 1Y1ZA 1MG1A 1GGGA 3TTRA 2DWHA 5CBRA 2OK2A 1JNFA 3T22A 4YU0A 1GV8A 4GWOA 3TMGA 3T9VA 2ONSA 3VDFA 5ITPA 4FJPA 4FEBA 4M1VA 3KGCA 1QUKA 2GHAA 2I0CA 3O2AA 5I56B 5KDTA 4GD5A 1N84A 4IB2A 1OMPA 2I6EA 4X1BA 3MP1A 1FTMA 4I8CA 3O97A 5KCJB 1DSNA 3HHFA 1I69A 5DYHA 4TLLB 3FVOA 4KD5A 3LUYA 4H8IA 3RLFE 3IB0A 1H44A 2RC8A 3KEIA 5TP9A 1D9YA 1R9QA 4ELOA 1PB7A 4IO6A 4ZEIA 3C31A 2PT2A 1IXIA 4XXUA 3QSLA 4BLAA 4LP2B 4LQ5A 1MM7A 4GIZA 2YJPA 3C34A 3PUXE 1MDQA 2UYFA 4OHNA 4AQ4A 3CI8A 1MPCA 1URDA 3FXUA 3OO6A 2UYEA 5KDTB 3O28A 4BDMA 1MXWA 4JWXA 4QHQA 2A5TA 4F3GA 2XD3A 2ONRA 4F1VA 3RUMA 2D3IA 3LC8A 5HBCA 2HAUA 1A8FA 4H5FA 2XXVA 1P1QA 5BWJA 2DXRA 3IAZA 4LZ5A 2I3WA 2F7CA 5J1DA 4R73A 1P99A 2OJTA 1BP5A 2B65A 3SERA 2G29A 5FTHA 1ZJLA 3SEXA 3PV0E 1NL5A 4G8NA 1IXCA 1TFAA 2A5TB 2DYXA 2B3FA 1JVYA 4GF8A 1FQBA 4OMBA 4G68C 1VFEA 3K6XA 1TWYA 2I0BA 3TCFA 5JTYB 3BFUA 4OFLA 5TU0A 3TZAA 4O3CA 4N13A 3M3FA 1IITA 3C35A 4XKQA 2ESNA 3CG1A 3LSWA 3N26A 3K0VA 2VP1A 3IOTA 3OENA 1B3HA 2E1SA 1QKAA 2H9BA 4RJZA 5H8NB 1JVXA 3IO4A 3D4GA 1OIBA 4I9DA 3IO6A 4OWDA 1AMFA 1Z7NE 3S9LC 1SYHA 4DE8A 1XC1A 3TQWA 3QIMA 1FQDA 1EZOA 2V3UA 4RA1A 4AB6A 1IUDA 3MP6A 4EXKA 1PB9A 1DPEA 3Q29A 4ESXA 3C33A 3T9HB 5A5XA 3TKDA 3FATA 3TCHA 3B6TA 5EYFA 1B3GA 2NWJA 2RC9A 1B51A 4KCCA 2Y7KA 1GTKA 3KJTA 5ICQA 3KN8A 5CI5A 2O84X 3FV1A 4JBZA 3O66A 4BDQA 5FHMA 4LA9A 4NF8A 4QFLA 1AIVA 4WKMA 5AA2D 4KPTA 4C0RA 1MPDA 1MXZA 5JEIA 3U1OA 2ZYKA 4NE4A 2Z22A 3VLUA 2HCAA 3H3GA 3MC2A 3DP4A 1LFIA 2HAVA 4RK9A 4EDPA 1B1HA 3MZ9A 2H98A 3VXCA 3UGWA 4FORA 2F36A 5H8HA 2O69A 3H7MA 4NWCA 5A5XB 1B5HA 1FQFA 4U1ZA 3OD7A 1ZMGA 3CR9A 3I6VA 2OBGA 2XXPA 2OWSA 3TTMA 1IIWA 4YMAA 4F18A 3UORA 1PDAA 1H3DA 1N0TA 3VVEA 2W7YA 4LZ7A 1B3FA 5L9SA 3IB1A 5F1QA 2AIXA 3IORA 4IO3A 5H8FA 2QS1A 4G4PA 2UVIA 2UXAA 2O1LA 4IY5A 3VFJA 1R1NA 1SI1A 1MH3A 3QUJA 4MH5A 4E0WA 4DCXA 1VFDA 4F1YA 2AL4A 1PEBA 4F39A 1MPBA 1FTJA 5H8HB 3G3KA 1UIUA 2O7IA 1OLCA 2PBWA 4F31B 1SQYA 3RN8A 4XKRA 5JK4A 3JV9A 5B7DA 3IR1A 1S7YA 1QVSA 4M4GA 3VVDA 3SKPA 1OQGA 4F2OA 2OLBA 1MY2A 2Z8FA 2FNCA 1N04A 1IZ1A 5CMBA 3T9XB 4KCDA 2P1SA 1LFHA 3KSXA 4PQJA 4HCYA 4R72A 2QS3A 3MQ9A 2RCBA 3FXRA 3RT8A 1B40A 1JEUA 4PFUA 3PPRA 4FEDA 3IOVA 1CE2A 3FD3A 4FIMA 4YZZA 4DLDA 3WAEA 3A3CA 5B70A 1B0LA 4NF6A 4K3FA 4YKKA 3PPNA 3ONMA 5CMKA 3HO7A 2REGA 2DVZA 1B5JA 2XXYA 2O1MA 1M5EA 2ZNUA 4YKPA 1RYXA 3B6QA 4H6DA 2R71A 1N7WA 5HM4B 5CM6A 3WAFA 3E13X 2RF1A 1NH7A 1YPNA 1ZKBA 5I57B 2V25A 4IO5A 1EZPA 3HCQA 2F97A 4GXAA 5DT6A 1MXXA 1PB8A 4DZ1A 2HZLA 5KZTA 1B7HA 3VLVA 4LZ8A 4ECFA 3PUYE 2UVJA 2QSXA 3KN3A 1ZLQA 3PMWA 3ZSFA 2ZNTA 1UIVA 4MLQA 3MWBA 2O7UA 3MP8A 3VVFA 1MS7A 2Y7RA 2RKMA 4DDDA 4OESA 4NF6B 2F78A 4MBPA 2O68A 3RGYA 1NH8A 4JXIA 4NF4B 2DS9A 2F8DA 4X1DA 4RY1A 3U93A 2F7AA 4JWYA 2P2AA 5ELVA 3IB2A 2IEEA 3ZS6A 3EHTA 4UA8A 4UACA 4C1UA 3RT6B 2DE2A 1MY3A 1BTJA 4R2BA 3CRBA 4NF5B 4GOTA 1QUIA 4RK2A 3EHSA 3KSJA 4YB7A 1I6BA 4IO2A 1SVXB 4OENA 3S9MC 2I4CA 3L6GA 3FJMA 3T96B 4EQ9A 3PPPA 1FCKA 3PD9A 4I62A 4GQOA 4EQ7A 3IJOB 5LOMA 3N6TA 2DOJA 1XS5A 5ISUA 1LBBA 3K00A 3N94A 4EXLA 4Q30B 3OELA 2I4BA 4PFTA 3O9PA 2ZNSA 2Z8DA 4KYEA 2BJJX 3KFMA 4BDLA 4XKNA 1II5A 3KBRA 4EF2A 1BIYA 2V84A 4OTEA 4P11A 4HTGA 1XVXA 4I1DA 2XX9A 3C9HA 3FASA 3KJ7A 3S2VA 1UQWA 4U4SA 2D21A 4WXJA 3CSGA 3E3KA 5TP9B 3IK6B 3Q25A 3RPWA 3GBBA 3GBAA 3DP6A 2AL5A 4OZ9A 1HSJA 1ZBMA 2R9JA 4RXLA 2HZKA 3OEMA 1Y3PA 2DXYA 2DWAA 2RC7A 4GRKA 3KZGA 3EHUA 3ILUB 3N5LA 1Q35A 1JETA 3BKIB 4EUOA 4DXUA 1UTHA 2UVHA 2I58A 4H67A 4R9FA 2PMSA 1NNFA 1FTKA 4H65A 5CMCA 3MZBA 2M8CA 1EZ9A 4RPOA 2Z23A 4EQBA 3IL1B 1H43A 3M3KA 4KQPA 5EHSA 3T9UA 1B1XA 5L9MA 1A54A 4ZDMA 3A3UA 2ZMBA 3LSFB 1DTGA 4JB7A 1DTZA 2DWIA 5K2XA 1SBPA 3G3FA 1ANFA 4G8HA 1USYH 1LAXA 3K6UA 1M5FA 2Q2CA 3MVWA 1FTLA 3VE1B 1DOTA 3RNNA 1SW1A 1SI0A 4F22A 3UN6A 1TT1A 5DEXA 2ZYOA 4POWA 1O63A 1M5CA 3H06B 4QFKA 4ISUA 1QKBA 1B32A 2Q88A 4KYSA 2O6AA 4BDNA 3HHGA 5CC2A 2QS2A 3U92A 3OO7A 5AA1A 3T66A 3FJ7A 1B4HA 5I2NA 1DMBA 3G7WA 3PMXA 1MXUA 4OYVA 4TQUQ 3TFLA 1IQ7A 5AA3A 4GLIA 1F9BA 3H6VA 4QRZA 2GRVA 2WKYA 3FUZA 1P1WA 2F6GA 2GHBA 1VR5A 2F7BA 3B6WA 3SESA 4P0GA 4U22A 4X48A 5I2KA 2A5SA 4PP0A 1YAEA 4QF9A 1LBCA 4YKIA 4O3AA 1HSEA 4PE5B 4C1TA 3BBRA 2HQ0A 4LONB 5DVFA 3MUQA 2XXWA 5AA4A 1GVCA 2DVCA 1MQGA 2F34A 3U8QA 3CVGA 3W15C 1Y3QA 4U1OA 3D4CA 3CFXA 5I2NB 3PGFA 2I49A 3IOWA 3H6WA 4NF8B 1B6HA 1LGBC 3MJNA 1N3XA 4RNSA 2HEUA 1LAHE 4EF1A 2DE4A 5I2KB 4R75A 4WEPA 4OEVA 1IXHA 3OSRA 1UTBA 3TPAA 1B3LA 4ZZAA 2XXQA 1M5DA 5H8QA 3KG2A 3JYRA 4PETA 3E9XA 4H0WA 4ZE9A 2ABHA 1ELJA 5AA4B 3H03A 1Z7ME 4QFNA 2H4IA 3UA8A 4DIGA 3A09A 1NNPA 3PPOA 3K02A 3MPKA 4NEDA 1MQDA 4OETA 1RKMA 3FIRA 3O29A 4PFWA 3K4UA 5EHMA 2OWTA 1B52A 3SEUA 3S4UA 4O3BA 3SETA 2DWJA 2XHDA 3K1NA 4Q0CA 4ZZEA 5H8FB 4NTLA 3QUFA 1YTVA 1BKAA 1ZTYA 2YPNA 4G2ZA 4ND9A 3PUVE 2I48A 1UTBB 3USDA 5FTIA 3GLBA 5H8QB 1PBQA 2G93A 4DCYA 3CFZA 5FHOA 4F29A 2I3VA 2Y7WA 2XXXA 3E4RA 3TQLA 1USYE 3ECRA 3C4MA 3OXNA 1A40A 1B4ZA 4U21A 1AH5A 1DPPA 1P1UA 4N6PA 2Q2AA 4POXA 4MF3A 3Q28A 1N3WA 1MH4A 3FVKA 2ZXTA 2QS4A 4OERA 2GFEA 1MM6A 4GXSB 1B5IA 1URGA 1D4NA 1XT8A 2DE3A 3TTNA 3HPIA 1MY1A 2XX8A 1IXGA 3P7IA 3FVNA 4IY6A 2QL3A 2QRYA 3OO9A 2ALUA 3CSBA 3O6GA 2ZYMA 5HPQA 4OXVA 4Z7EA 3TUSA 1O64A 2PX1A 5H8SA 2NVUB 4IGRA 1Y4TA 3MVZA 3AXFA 4YB5A 4F19A 1VE4A 2GH9A 2XX7A 4LVQA 4YICA 3W9WA 2ONKE 5FHNA 5AA2A 5ITOA 4G68A 4JSOA 3RQTA 1MY0A 2REJA 1B46A 1D9VA 2PYYA 3QAXA 3QK6A 5L9OA 3TTLA 1N76A 1XHYA 4ZEKA 3O6HA 4QFOA 3TAJA 3MZ1A 3TTKA 1SD3A 3U94A 3SEYA 3PPQA 3G3HA 1Q1KA 2P0SA 2IA4A 4QFPA 2DQVA 5I59A 1B7ZA 1MRPA 5DVIA 1R6ZA 2FA7A 4ZEFA 1SW5A 4GL8A 2KLFA 4YAHX 3GZGA 4OFJA 1D3KA 2V3TA 5AA2B 1US4A 2RCAA 3UK4A 2Y84A 4G68B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FBEA 4ZEBA 1H76A 4OQOA 3DLNA 5IAIA 4LQ2A 1B05A 1CB6A 1POTA 4ONYA 4GWZA 3V83A 2CZLA 1IMCA 1FBDA 4LATA 4FAJA 1FJ6A 2QFLA 2XWKA 5FBPA 3B50A 5TPAA 2Q9TA 4RPNA 4NN3A 2E0SA 1LCFA 4HS7A 5I59B 1Y1MA 2VPNA 4N8YA 4GWUA 1M5BA 3PTYA 3TODA 5EQ9A 3H4ZA 5BUUA 1FQAA 3MAMA 1H45A 4BDRA 3LBSA 1AL3A 1B58A 2XD2A 1A99A 2OZZA 4GX4A 3MVYA 4O94A 1T0KA 4NAPA 3LSXA 3CG3A 1Y20A 1MXYA 4GL0A 5JTYA 3SEVA 3OSQA 1SW4A 1BLFA 3ZKLA 2CEXA 1FSAA 3T0JA 3ODBA 1Y9UA 2B3BA 5TPAB 1IMBA 1ATGA 3GXAA 2QMWA 4IR8A 1RYOA 3EQ1A 3FXQA 1LEVA 4F2QA 2X7QA 2PVUA 5H8NA 2FHYA 3W9VA 1Y4CA 5L8DA 3IOUA 3ZKKA 3O6IA 2THIA 3CIJA 2CMOA 3BFTA 4R6KA 1MXVA 2P3NA 4IO7A 4QSCA 3LV0A 2LAOA 3TYHA 3UP9A 3DELB 1OLAA 3QXMA 4RYAA 3EF7A 1MQJA 1URSA 4R74A 3Q27A 3JZJA 2NUVA 1LFGA 4DXCA 1FW0A 3L6HA 3DM0A 2WBBA 3CFLA 2Q8JA 3PUZE 2O51A 4YKJA 1LB8A 3MW0A 1AOVA 2ZYNA 1MY4A 1WODA 3F11A 1OVTA 1B0HA 1XVYA 2MKZA 1I6AA 4NMYA 3G3IA 4QSDA 2ANJA 1QUJA 4H8JA 5CMMA 1RDYA 1UTHB 4U4XA 3RPLA 2XXUA 2XWIA 1SYIA 3IX1A 3UIFA 3VLWA 1PBPA 2RINA 2VHAA 3C32A 3K6VA 3G3JA 4KFQA 3KC1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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