1MDQA

Refined structures of two insertion(slash)deletion mutants probe function of the maltodextrin binding protein
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGGSVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar transport
molecule keywords MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN
publication title Refined structures of two insertion/deletion mutants probe function of the maltodextrin binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mdqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mdqA01
3TELA 1P1OA 1UTHA 4GXSB 5IAIA 4ELOA 2I4BA 1JNFA 4M1VA 2O6AA 4QFNA 3C9HA 3S9NC 5FHNA 1PC3A 3QYTA 4NF5A 1XOCA 3B6QA 4JSOA 2OBGA 3VXCA 1O64A 1UQWA 2HZKA 1QJMA 4XTCQ 3JYRA 3Q28A 2GFEA 5CC2A 4DCXA 2I49A 1MS7A 1EZ9A 3H6TA 3FV2A 1LCTA 2XHDA 5DT6A 5CMKA 5L9SA 1B3HA 4ZEIA 1NMUA 4LZ7A 3MBPA 3RLFE 5DVFA 3IL1B 3N6TA 2H4IA 2F35A 2CZLA 1QKAA 5AA4A 1OQGA 4OFOA 4U4SA 5JEIA 5FTHA 1H3DA 3DLNA 1TWYA 4I9DA 3SDFA 2FA7A 5H8FB 3RPWA 5I59A 1QW0A 1B3FA 2AYSA 3HHGA 5CMCA 2ONRA 4OFLA 2QPQA 3TZAA 1B51A 4BDOA 3GLBA 2I3VA 5BUUA 2GHAA 5AA2B 1R6ZA 5DVIA 4MBPA 3OEMA 4POWA 1OMPA 2PX1A 3VVFA 2XXUA 4G4PA 1DMBA 2O7UA 4XKPA 3K1MA 3FATA 3VLVA 3K1NA 4R75A 4XKQA 3GBAA 4F3PA 5CM6A 3RT8A 3PPRA 1HSEA 3D4CA 4H1XA 1L5TA 2F5XA 1NNTA 3SKPA 1IXIA 4OFJA 4FAJA 5I2NB 5I58B 1CB6A 1SW5A 1FQAA 3IJOB 5L9MA 3HCQA 2H25A 3Q25A 4EXKA 2PYYA 2ZNUA 4HCYA 2ABHA 3FVGA 1B52A 1EZOA 2V3QA 3O9PA 3CI8A 2UYEA 3ILTB 4ECFA 1LFGA 3M3FA 3ZS6A 2XD2A 5I56A 4WKMA 1MXZA 3TTNA 2CMOA 2ZYOA 5M2VA 4GWOA 3PPQA 4BDNA 2D21A 4NF4A 1ZBMA 4G68B 2Y84A 3I5OA 3W15C 2H98A 4E0WA 3PU5A 1PB9A 3QAXA 1PEBA 1UTHB 1ZLQA 4OVJA 1UIUA 4OETA 1S50A 2F8DA 3K02A 1US5A 4YKKA 3A3UA 4DE8A 1IXHA 3MJNA 2ZNSA 3OO6A 3SETA 4Q8RA 5TU0A 5DYHA 1TXFA 1UTBA 2REJA 1NKXA 2V25A 4UACA 4U2RA 1N7WA 1FTJA 3MPKA 3B6TA 5A5XA 5L8DA 2RC9A 4YB5A 4O3AA 1GV8A 1B7HA 1LSTA 1MXXA 5K2XA 1N3XA 1D4NA 4KHZE 2KLFA 3PUVE 4POXA 3LBSA 2HFBA 5I2KA 1MH4A 5F7VA 1MQIA 4PFUA 4LUBA 1B0LA 3HPIA 3S9EA 1URGA 1LAFE 3FJ7A 2DSFA 1TFDA 2X7PA 3ZKKA 3KN8A 1FTKA 1RKMA 4DXCA 4ZE9A 3RTWB 2DE2A 4ELRA 5KCJA 2DE4A 4YU0A 3SEUA 1QUIA 3IAZA 4JSDA 2LAOA 1H76A 3MAMA 2F6GA 4R73A 3SEWA 1ATGA 1H44A 2PT2A 4R72A 4LONB 3RUMA 2DE3A 1URSA 1B1XA 1Q35A 3KGCA 4EF2A 3KEIA 2Q8JA 1OQHA 3TQWA 3FIRA 2DOJA 4C1UA 2I3WA 4QSEA 4LP2B 3CR9A 4KYSA 5EYFA 4F29A 3IOWA 3U1OA 4ZEFA 4YKPA 2Z8DA 5I84A 1MH3A 1S9TA 4R6KA 4R6YA 2XX8A 3C33A 3EHUA 3Q29A 4GLIA 4X1BA 1VSOA 4NWCA 1OVTA 4PE5B 2V84A 2ZMBA 3IOUA 2QL3A 4NE4A 3Q27A 2B65A 1N7XA 3L6HA 1A7LA 1AOVA 4R74A 4LQ5A 4ZEDA 3RY3A 1F9BA 5I56B 1YTVA 1AIVA 4KI0E 4I1DA 3MZ9A 2PMSA 3Q26A 4NF4B 1P1UA 1ZMGA 1HSLA 2NVUB 2G29A 4G8MA 3LC8A 3FXUA 1MDQA 1FQCA 1Y3QA 2RC7A 3GXAA 1O7TA 3SEXA 3KJ7A 5HBCA 4DDDA 3RGYA 4MH5A 5H8NA 3AXFA 3C35A 1FQFA 2H99A 3H7MA 2F7BA 4EXLA 4RY1A 1IEJA 3H6WA 1IIWA 5TP9A 3GZGA 4YMAA 2QMWA 1MPCA 1LB9A 4TOZA 1MXWA 3KOSA 3N26A 4U1OA 1H45A 4R2FA 1ZKBA 1DPEA 1LBCA 1YAEA 4GQOA 3GBBA 1XHYA 1I69A 1P99A 1MY4A 4U21A 1POY1 4YZZA 2E0SA 3L6GA 3V8XB 1MM6A 3D4GA 4JB7A 4ZZAA 1B3EA 4F19A 3P7IA 5I2KB 2DVCA 3H03A 4QSDA 2HQ0A 3TPAA 5KZTA 5JK4A 5H8QA 4FEBA 3K1PA 4MFIA 2R6GE 2X26A 1B3GA 5AE4A 2WKYA 4OEUA 1FQEA 2RC8A 3WAFA 3W9WA 2VD3A 4QFKA 3PPOA 2ZNTA 4RYAA 1MDP1 2QS2A 5DEXA 1IXGA 1B0HA 4M4GA 3KN3A 4EDPA 1H43A 3RNNA 3QK6A 5CI5A 4KCCA 4F2QA 3LR1A 5JTYA 4FORA 1SYIA 5CBRA 3KFMA 3MVWA 1N04A 4KFQA 2BJJX 4PFYA 2AL5A 5H8HA 5LOMA 5H8SA 2VGQA 3FJMA 3QXMA 4RPNA 1WDNA 3M8UA 3OSRA 2XD3A 4ONYA 3OMBA 3CIJA 5KDTA 1PDAA 3CSBA 4IY5A 3SEYA 3TAJA 2O7IA 4F39A 1LFIA 4LA9A 1II5A 2E1SA 2OZZA 3PPNA 4PFTA 1M5FA 4GL8A 3W9VA 4ESXA 1YPNA 4OTEA 3I3VA 1MXVA 3JV9A 1B32A 4RJZA 3VFJA 2O68A 5EHMA 3MVZA 3FXRA 1J1NA 3G3JA 1YCJA 3VE1B 3TEPA 1Y4CA 1M5DA 4GRKA 2I0CA 3F11A 3M3LA 4WEDA 4U4XA 3QSLA 3SESA 4Q5TA 5ELVA 4QSCA 2ZXTA 3C36A 3UA8A 2QS4A 5H8NB 3PPPA 3MVYA 3I6VA 3N5LA 2XX9A 1EU8A 1FW0A 1A55A 3FD3A 4KQPA 1LB8A 4H67A 3MW0A 3S2VA 3FGSA 2PBWA 5TP9B 2I6EA 2D5WA 3V83A 1MY0A 4EQ7A 1N0TA 2AL4A 4KYEA 2XXIA 4H8JA 4F2OA 1B7UA 2P1SA 3CRBA 2Q9TA 4YB7A 1XVXA 3K6VA 4JXIA 4GIZA 3G7WA 1SQYA 2QSXA 4QFLA 1Y3NA 2GH9A 3IJXB 1FTOA 3B7DA 3FASA 5FHMA 4EF1A 3RQTA 1DTGA 2ONKE 3MZ1A 3TODA 5AA2D 1D9YA 4XIGQ 3IK6B 1R9LA 3IB0A 3UP9A 1TT1A 2Z22A 4RPOA 1B4ZA 4ZDMA 4H65A 2V3UA 3EPEA 4F1VA 4AQ4A 2HAVA 1SD3A 4BDQA 3UORA 1ZTYA 4LATA 2DP8A 1MPDA 1SW1A 3T9VA 3VV5A 3HN0A 4IO4A 4MF3A 4IO3A 4R9FA 3TCHA 3MP6A 5JTYB 4AB5A 2RINA 1Z7ME 4U1ZA 4NF5B 1B5IA 3MUQA 4NF8A 1B5HA 4PP0A 3ONMA 3HHFA 4O3CA 4ZEBA 3K0VA 2XXVA 5H8HB 3FVKA 3G3FA 2F36A 4MLQA 3S4UA 2NWJA 3O66A 4U22A 3T22A 2OLBA 3LSLA 5IKBA 5KDTB 2O1LA 4NEDA 1ZJLA 3IOVA 4ESWA 2DVZA 3VLUA 1JQFA 3G3HA 2FNCA 3G3IA 5AA4B 3O2AA 1BKAA 3OO9A 3PD8A 3SEVA 2I48A 1B05A 2DQVA 3FV1A 4G2ZA 1OIBA 3UN6A 1LCFA 4F3GA 4NTLA 2Z8FA 5I59B 3OO8A 1EZPA 4OWDA 2I58A 1XVYA 3RN8A 3M3KA 4R2BA 2I0BA 1TFAA 4JDFA 1LAXA 3E3KA 4LQ2A 5CMMA 4QFOA 1Q1KA 2DXYA 4PQJA 2YLNA 2XXRA 4G8NA 3KZGA 4OMBA 4F3BA 2RCBA 4JBZA 3BKIB 4BDMA 5ICTA 1JVYA 4ZS9A 2R71A 1O63A 3KN7A 2GHBA 1I6QA 3MQ9A 3CFLA 4EUOA 3TFLA 4IO6A 2AIXA 2QRYA 4F18A 1AL3A 2VD2A 2ANJA 1MY3A 2Q2AA 1B40A 4JWXA 1N3WA 4IGTA 1XT8A 3PD9A 4IO5A 2XXHA 3TUSA 4OENA 2Y7IA 4C1TA 2RKMA 4GL0A 3IO6A 2NOOA 3CVGA 2HEUA 1OVBA 1A8FA 1FTMA 1P1NA 4RK2A 2M8CA 3T9UA 3MC2A 3H3GA 4HCWA 1BP5A 2HXWA 4OYVA 5J1DA 3OXNA 3KBRA 2H9BA 3U8QA 3HO7A 1JETA 3G3GA 3H4ZA 1B2HA 2NXOA 3LSFB 3R6UA 2DWAA 4GVOA 3KSJA 1FCKA 3KG2A 1B58A 3EHTA 4XKNA 1BLFA 4ELQA 1B3LA 4YMBA 2B3BA 3BBRA 3K4UA 2REGA 2XXTA 2Q89A 1AMFA 3CFZA 4NF6A 4X1DA 1FTLA 4OHNA 1B7ZA 3K00A 2YJPA 4F22A 3QUFA 4ELPA 2Q2CA 2QJEA 3FZVA 3K6UA 4LZ8A 2PT1A 1LAGE 3TTLA 2Q88A 3IR1A 4KCDA 2RF1A 4NF8B 3CSGA 1T0KA 3CG1A 1DOTA 4FJPA 3O28A 2UYFA 1UTBB 3B6WA 4O3BA 3K6WA 5FHOA 5A5XB 4TLLB 1Y1ZA 4L17A 5AA3A 3S9MC 4P11A 4XKRA 3O97A 5I2NA 1KWHA 3DP6A 3MZBA 3IB2A 3VXBA 1R9QA 4RNSA 1NFTA 2HAUA 3PMVA 3C4MA 3WAEA 4G68C 3RT6B 5I57A 2H5YA 3MPLA 3EN3A 1M5CA 4IGRA 1LGBC 2ONSA 1P1QA 1PBPA 3E4RA 3FVOA 1MG1A 3VLWA 5F1QA 3R26A 3MP8A 1IUDA 5KCJB 2Y7KA 4C0RA 2R9JA 3BFTA 1N84A 2ZYKA 5B70A 4E0XA 1P1WA 3RTFB 4MLVA 4OXVA 3KSXA 2PVUA 4F31B 2XXPA 4R6HA 1UIVA 2UVGA 3DP4A 1NNKA 3E9XA 4YAHX 4LZ5A 1VR5A 1NNFA 1PB8A 2DS9A 2O69A 3ILUB 3SERA 4FECA 3A3CA 4N13A 1GVCA 2ALUA 3FJGA 3OD7A 2HCAA 4U23A 3PUYE 1GGGA 2YPNA 4JWOA 1IITA 3VDFA 1WODA 4H5FA 3MP1A 1IQ7A 4QRZA 2F7CA 5ISUA 2DYXA 1EH3A 3DELB 3N94A 4F3SA 5AA1A 1D9VA 1HSJA 2W7YA 3PMWA 4HTGA 1MM7A 4TLMB 1ELJA 1A99A 3VVEA 2QS1A 1Y4TA 1RYXA 1LBBA 4WXJA 5ICQA 2XXWA 1B9JA 1I6BA 3O6IA 3PV0E 1N76A 2P0SA 4IY6A 1ZIUA 3H6VA 3MVXA 3U92A 4HW8A 4IO2A 1MY1A 1MQGA 3PUZE 3E13X 1B6HA 5B7DA 4ISUA 3N6UA 3PMXA 4NF6B 1GR2A 1JVXA 1VFDA 1SI0A 5EHSA 3V89B 3OOAA 3IOTA 2DWHA 4FEDA 5CMBA 1FQDA 2V3TA 3FXQA 1RYOA 3KJTA 3FUZA 1S7YA 2DWIA 1OLCA 2OK2A 2HZLA 4OERA 2UVHA 4OQOA 5CBSA 3JZJA 4XXUA 4X48A 1SBPA 1US4A 1QUJA 1QULA 2Y7RA 4F1YA 2UVIA 1MXUA 1MPBA 4QF9A 2O84X 1SI1A 1ANFA 2D3IA 4PFWA 2P2AA 4R9GA 2OJTA 5ITOA 1NH7A 3THIA 4WEPA 1MY2A 5I57B 5H8QB 4RA1A 1URDA 4DZ1A 2A5TA 2QS3A 3DM0A 4GXAA 1OLAA 1VE4A 3IORA 2NUVA 3TKDA 4GFRA 1JEUA 4N6PA 3IO4A 3ZSFA 1SW2A 1R1NA 1MQHA 1WVJA 4NMYA 2ZYNA 3A09A 5DEXB 1XS5A 2Z23A 4PETA 4I62A 3UK4A 4DXUA 4YICA 3C31A 1QUKA 4EQ9A 1JEVA 3OEKA 1MQJA 1PB7A 4G8HA 3PUXE 4RK9A 1JW1A 3H06B 3ECRA 5TPAA 3HSTA 5ITPA 4QFPA 4BDRA 4Q30B 2ZYMA 3OO7A 1NH8A 1LFHA 2F6PA 4N07A 1CE2A 2FYIA 3MWBA 4GD5A 4DXBA 3K01A 2DWJA 4DIGA 5FTIA 1A8EA 1JW5A 4KYDA 3TCFA 1MQDA 1DSNA 4OZ9A 1A54A 2OWSA 3TDJA 4IB2A 1USYH 3KOTA 2O51A 4P0GA 3OENA 4G77A 4Z7EA 1DTZA 1ZU0A 3ODBA 4ND9A 1DPPA 1M5EA 2THIA 2IEEA 2XXXA 5HPQA 1SVXB 3LUYA 4H6DA 2I4CA 1B1HA 4ZECA 4AB6A 1USYE 3C32A 1FQBA 3T9XB 4FIMA 3TTKA 3TTRA 2GRVA 5CRYA 4Q0CA 3TTMA 4KD5A 3T93B 3O6HA 1I6AA 3USDA 1D3KA 4EQBA 1GTKA 3V5AA 3TQLA 3R7XA 2UVJA 4DCYA 3DP8A 3PGFA 5K2YA 3OSQA 2IA4A 1Y20A 3T66A 2XX7A 1MXYA 2F7AA 3U93A 3QIMA 4Z0IA 4BDLA 2VHAA 2Y7WA 3H6UA 3EHSA 1B4HA 2F78A 3T9HB 3HV1A 4K3FA 4NWDA 3O29A 3IB1A 2B3FA 1A40A 4H8IA 4BLAA 4JWYA 2A5TB 4ZE8A 3UIFA 4UA8A 2O1MA 1B46A 1LAHE 5DTBA 2X7QA 5H8FA 4YKIA 1PBQA 4RXLA 4OEVA 1Y9UA 1POTA 3O6GA 2DXRA 3OELA 4QHQA 2G93A 3C34A 4FE8A 4KR5A 1B5JA 4ZZEA 1SDXA 4IO7A 2XXYA 4HS7A 1MRPA 4GOTA 4GF8A 2F97A 1BTJA 5AA2A 4P0IA 4FATA 2RCAA 2VOZA 3EQ1A 4TQUQ 1NNPA 2OWTA 3K2DA 5TPAB 3LSWA 4ZEKA 2QMXA 4KPTA 4OESA 4YKJA 3TYHA 4H5GA 1QKBA 4THIA 2ESNA 1XC1A 3CG3A 3UGWA 4I8CA 5I58A 3CFXA 2UXAA 4X9TA 4LVQA 1Y3PA 3U72A 1LLSA 1IXCA 4H0WA 4DLDA 1IZ1A 2V93A 3G3KA 3IX1A 3ZKLA 1AH5A 4YB6A 3FVNA 5L9OA 3EF7A 3K6XA 3PUWE 2A5SA 1JW4A 2Y7PA 1SW4A 2VP1A 1Z7NE 5DVJA 1M5BA 3S9LC 5BWJA 1BIYA 2Z8EA 3U94A 3VVDA 3QUJA 3TCGA 1Y1MA 2OCUA 2F34A 2XXQA 4F1UA 1VFEA 4G68A 3TMGA 1SYHA 3BFUA 3T96B 1QVSA 5HM4B 1NL5A 3LSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TELA 1P1OA 1LBVA 1UTHA 3A29A 4GXSB 5IAIA 4ELOA 2I4BA 1JNFA 4N6KA 4M1VA 2O6AA 4QFNA 3C9HA 3S9NC 5FHNA 1PC3A 3QYTA 4NF5A 1K9YA 1XOCA 3B6QA 4JSOA 2OBGA 3VXCA 1O64A 1UQWA 2HZKA 1QJMA 4XTCQ 3JYRA 3Q28A 2GFEA 5CC2A 4DCXA 2I49A 5EQ7A 1MS7A 1EZ9A 3H6TA 4JVIA 3FV2A 1LCTA 2XHDA 2DDKA 5DT6A 5CMKA 5L9SA 1B3HA 4ZEIA 1NMUA 4LZ7A 3MBPA 3RLFE 5DVFA 3IL1B 3N6TA 2H4IA 2F35A 2CZLA 1QKAA 4P1LA 5AA4A 1OQGA 4OFOA 2B4LA 4U4SA 5FTHA 5JEIA 1H3DA 3DLNA 1TWYA 4I9DA 3SDFA 2FA7A 5H8FB 3MYUA 3RPWA 5IZZA 2XWIA 5I59A 1XI6A 1QW0A 1B3FA 2AYSA 3FBPA 3HHGA 5CMCA 2ONRA 4OFLA 2QPQA 4MMPA 1B51A 3TZAA 4BDOA 3GLBA 2I3VA 5BUUA 1NUZA 2GHAA 1NV7A 5AA2B 1R6ZA 5DVIA 4MBPA 3OEMA 4POWA 1OMPA 4I3EA 2PX1A 4PGNA 3VVFA 2XXUA 4G4PA 1DMBA 2O7UA 4PDHA 4XKPA 3K1MA 3NOHA 3FATA 3VLVA 3K1NA 4R75A 4XKQA 3GBAA 4F3PA 5CM6A 3RT8A 2P3VA 3PPRA 1HSEA 3D4CA 4H1XA 1L5TA 2F5XA 1NNTA 3SKPA 1IXIA 4MEVA 4OFJA 4FAJA 5I2NB 5I58B 1CB6A 1SW5A 2ZZWA 2CEYA 1FQAA 3IJOB 5L9MA 1K9ZA 1IMFA 3HCQA 2H25A 3Q25A 4EXKA 2PYYA 1FPGA 4HCYA 2ZNUA 2ABHA 2CEXA 1FPDA 3FVGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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