2AL4A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate and cx614.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A02
1Y20A 3LC8A 2XXYA 5I59A 3DLNA 5A5XB 4THIA 4GIZA 1GTKA 1Q1KA 2F97A 4R9GA 3ZSFA 1I6AA 4NF6A 1Y3QA 1WVJA 2DWJA 2IA4A 5CMMA 1S7YA 4WXJA 1SD3A 5EHSA 1OVBA 4EF2A 5I58B 4QRZA 4XKRA 3FXRA 3EHUA 1QUIA 1ZLQA 2I3VA 4QFPA 1SBPA 2XXRA 2XXUA 4LP2B 2E1SA 3FJMA 1MQGA 5FTHA 3S4UA 3KSJA 4HTGA 4FIMA 3CFZA 1IUDA 1MQHA 2XXVA 2RC9A 3K0VA 1FTMA 2OLBA 3IOWA 1ANFA 3MPLA 3SETA 4ELOA 1LLSA 2OWTA 5I2NA 3K2DA 1OIBA 1N84A 2H9BA 1TFDA 1ZKBA 2YJPA 3K1MA 3HV1A 4AB5A 1N04A 3TODA 4YU0A 4H8IA 3EPEA 3PU5A 1EH3A 4JWXA 1D9VA 3WAEA 3H3GA 1FTOA 3E13X 2CMOA 3ZS6A 1SW4A 1UTBA 5K2YA 3A3UA 1URSA 4KI0E 3QIMA 4RPNA 3BFTA 3KN3A 4Q5TA 2W7YA 2D3IA 3FXQA 4YZZA 3FVOA 2ZMBA 3OENA 4KHZE 5F1QA 3T22A 1FTJA 3KSXA 4OETA 3H6VA 1XS5A 4RYAA 4QFKA 1Y3PA 2QSXA 4KR5A 5CMKA 3EF7A 1I6QA 2DS9A 2Z22A 1LAFE 3T9VA 3KZGA 1A40A 1MXWA 3JV9A 4RXLA 1DOTA 2F78A 3ZKLA 2XD2A 2NOOA 2RCBA 1NNFA 1M5EA 4FEBA 4G77A 1LB8A 4ZZEA 5CI5A 2F35A 2Z8EA 3SDFA 3KOSA 4HCYA 4O3CA 1DPEA 3PMXA 3EHTA 3W9WA 1GVCA 3TCFA 3G3JA 3TQLA 1B1XA 2V3UA 1N7WA 4R75A 3IO4A 3DP8A 3KBRA 2NUVA 5H8NB 4O3AA 2Q2AA 1D4NA 4ELPA 4IB2A 4XKNA 1M5DA 5DYHA 4YMBA 1XVYA 4WEDA 4YICA 1POTA 3IJOB 4EUOA 5AA3A 1MXYA 2DE4A 5CBSA 5H8QA 2KLFA 3FVKA 4L17A 3FATA 2UVHA 4N13A 1MXXA 5TP9B 1A99A 2QMWA 4MLQA 2XX8A 3UK4A 1ELJA 3MPKA 4GL8A 3DELB 3W15C 4ZE9A 1FQAA 5B7DA 1BLFA 4F22A 2I4CA 4NMYA 1A8EA 3ECRA 3IOTA 1Y4CA 1B7HA 4I1DA 3CSBA 3KEIA 1QUJA 1DSNA 3M3LA 5I2KA 2G93A 3C36A 4G8HA 4GXAA 1D3KA 2OCUA 5JTYB 3TELA 2ZXTA 1VR5A 3TTMA 3G7WA 1LSTA 5CC2A 3BFUA 1PB8A 2ZNSA 3O9PA 2F34A 4MBPA 4OWDA 5I56B 1MRPA 3HHGA 2GH9A 4R2BA 3FZVA 2D21A 5L9MA 2H99A 4ZECA 3V5AA 4NF8A 4E0WA 2ESNA 5DEXB 1PEBA 4JBZA 3V89B 3K6WA 1S50A 1ZIUA 3MAMA 2UVJA 2Y7WA 3LSFB 3PPOA 1QKAA 3M3FA 1EZPA 2Q9TA 1VFEA 2XX9A 4PFTA 2DSFA 3ONMA 3MZ1A 1JW5A 1I69A 1OLCA 2O1MA 3PUYE 4F3BA 4U2RA 3MBPA 4GD5A 1MY1A 3Q26A 5H8HB 1TWYA 1SW2A 1D9YA 4F18A 3MVYA 3U93A 4ESXA 4F2OA 1BIYA 1II5A 2F7AA 4GL0A 1B5HA 4QFNA 3SEWA 3W9VA 1QW0A 1R1NA 2PT2A 1B3FA 3IOVA 4P11A 3SEVA 3OELA 3IORA 2Z8FA 1POY1 5M2VA 4BDRA 3RTFB 1A8FA 2YLNA 4JSOA 3C4MA 3EN3A 4GLIA 5H8SA 1GGGA 3O2AA 3E4RA 4JWYA 2HAUA 4R74A 2GFEA 4OENA 4NF4A 1EZ9A 3IJXB 3GBBA 4PFWA 1SYIA 1VSOA 1R9QA 1FTKA 5BUUA 5H8FA 4FEDA 3EQ1A 1QKBA 1H76A 2F6GA 4QF9A 5F7VA 3K01A 4FE8A 1DMBA 4U1ZA 5DTBA 5ITPA 2HAVA 4MFIA 4FJPA 4OVJA 3VVFA 1S9TA 1MXUA 3FV1A 1NH8A 4OFJA 2V25A 3MWBA 1IXIA 4IY6A 4N6PA 3U1OA 4OERA 4PE5B 1L5TA 4DDDA 2A5TA 1EZOA 4BDLA 1MQJA 1IXGA 5L8DA 4G4PA 1US5A 3M8UA 1DTZA 4NEDA 4IY5A 4OFLA 5HPQA 4ELRA 1WDNA 4DZ1A 3A09A 3MZ9A 4Z7EA 1OQGA 5ICQA 1SDXA 1Y4TA 1NL5A 2UYFA 4XXUA 2DXRA 3TDJA 3S9LC 4G2ZA 5ICTA 1QULA 4JB7A 1LFIA 2AIXA 3CI8A 5DVFA 3K4UA 3VFJA 3CFLA 1JVXA 2GRVA 2RINA 3IOUA 3SKPA 4ZEDA 3G3IA 1Y9UA 3TTLA 3TPAA 1UTHA 3L6GA 3HN0A 2RCAA 4ECFA 1H45A 4JWOA 1P1OA 4C1UA 4OEVA 3MVXA 3C33A 2ONSA 3SEUA 4G8MA 3TCGA 4F2QA 3CIJA 5TPAA 2V3QA 4OYVA 3VVEA 3FJGA 3B6QA 4MLVA 3SEYA 3D4CA 5KCJB 4KYSA 4R73A 2PX1A 4ISUA 4PQJA 2Z8DA 4H6DA 2HEUA 1KWHA 4IO4A 3QYTA 4EQBA 3RUMA 2XXPA 1P1UA 3IO6A 5ISUA 3USDA 4PP0A 2R71A 3CR9A 1BP5A 2B65A 3UA8A 3IK6B 4P0IA 1B4ZA 2DYXA 3RLFE 3IX1A 3KGCA 4KYDA 3U92A 1Z7NE 4C0RA 1HSLA 3N6TA 3C35A 2O84X 5K2XA 5AE4A 3PGFA 3IR1A 1M5CA 2FYIA 4KFQA 1LAGE 1I6BA 1NNKA 4F1UA 4KYEA 5FHMA 2REJA 1IITA 4F3PA 3O97A 4HW8A 1M5FA 4F19A 1B3LA 1IEJA 2H4IA 4OTEA 1B9JA 2QRYA 1FCKA 1YAEA 3THIA 1NFTA 1N3WA 5AA4A 5FHNA 1B46A 4LA9A 4F31B 4QSDA 2DVZA 2HZLA 4KCCA 3C9HA 4AQ4A 1PDAA 4Z0IA 4ELQA 1GR2A 1F9BA 3OEKA 1GV8A 2QMXA 4LQ5A 5I59B 2F7BA 1JEUA 3KG2A 3PPQA 3B6TA 4TLLB 2H25A 4NF5A 4E0XA 1TFAA 4TQUQ 4ZS9A 4KCDA 4R2FA 4NF6B 1H43A 4XTCQ 1SQYA 3RT8A 1US4A 2GHAA 1UIVA 2V3TA 3H06B 1P1WA 4FAJA 1AIVA 3TKDA 4P0GA 4YB7A 4JDFA 3QXMA 4ZEKA 2I0CA 2Y7RA 4GWOA 4PFUA 5BWJA 3DP6A 1B52A 4K3FA 2DOJA 3OO9A 1UQWA 4EXKA 1OMPA 4H5FA 4F39A 4OEUA 1Q35A 1QVSA 3T9XB 2DWHA 4RNSA 2P2AA 2XX7A 2M8CA 3LBSA 1FQEA 3JZJA 5I2NB 2P1SA 3PUVE 2NXOA 3TFLA 1JQFA 3LSWA 1PBPA 4OESA 1PC3A 2CZLA 3F11A 3QUFA 1SI1A 3JYRA 1SYHA 3O6HA 1NH7A 2ZYKA 5AA2A 3MP8A 4QSCA 4ZEFA 2P0SA 4H67A 2RF1A 1MQDA 4EQ9A 2VD3A 4LZ5A 1DPPA 5EYFA 2XXWA 1MXVA 3K1PA 3KN8A 3VVDA 1ZTYA 2HXWA 4Q30B 4U23A 4X9TA 3HCQA 1M5BA 2UVIA 3PD9A 1AMFA 4ND9A 3T9UA 4YMAA 4TLMB 1AL3A 2QJEA 3TTRA 4GQOA 5KDTA 3E3KA 1O7TA 3U94A 4EXLA 4MH5A 3Q25A 2O68A 3V83A 4X1BA 1SW5A 2ABHA 3TCHA 1IIWA 2PMSA 4HS7A 1B6HA 3N6UA 4BDNA 4YKIA 3IAZA 3RT6B 3PD8A 3CG1A 5J1DA 4KPTA 3OOAA 5I57A 2DXYA 1FTLA 1EU8A 3O6GA 3N5LA 3IL1B 4DE8A 3D4GA 1YTVA 3OXNA 4H0WA 1MM7A 1B58A 3G3HA 3UN6A 1B05A 3OO7A 4IO5A 4X48A 3FVNA 4N07A 1MPCA 3GBAA 3CSGA 1URGA 1LCTA 3FVGA 3H6UA 5H8QB 4ZDMA 2G29A 2O69A 4U21A 4KQPA 1LAHE 4RK2A 3TTKA 2YPNA 3G3KA 4X1DA 4QHQA 3S9MC 3PMWA 3MP1A 2XXTA 3HPIA 3UORA 2NVUB 1FW0A 1B5IA 2REGA 3FV2A 2DQVA 4UACA 4BLAA 2F8DA 2V84A 1Z7ME 2QS4A 1B0LA 2O1LA 2X26A 3PPRA 3TYHA 3OSRA 1B2HA 4EDPA 3N26A 3TZAA 3MZBA 1YPNA 2E0SA 5I2KB 4H1XA 4BDMA 3PMVA 3RN8A 1MQIA 1LAXA 4WEPA 4DXUA 4G68A 1R9LA 4F3GA 3GXAA 3HO7A 1B7ZA 1ZBMA 3G3FA 3N94A 2ZNUA 4U4XA 3PPPA 2DE2A 5A5XA 2DWIA 1AH5A 3BKIB 4OZ9A 1CB6A 3OMBA 2PYYA 3VXBA 3QSLA 4OXVA 4NTLA 4YKPA 1N76A 2HZKA 4DIGA 4NF8B 4FECA 3C32A 2QS3A 1A54A 4O3BA 3K02A 5I58A 1XC1A 1Y3NA 2ZYNA 3SERA 2R9JA 1B3HA 2Q88A 2AYSA 2UYEA 4QSEA 3E9XA 4HCWA 4QFLA 4R9FA 1A7LA 3H4ZA 2DWAA 2Y84A 3A3CA 1TXFA 1OLAA 3C31A 3RY3A 3K6VA 5EHMA 4KD5A 4U4SA 3SEXA 4GXSB 4TOZA 3OD7A 2BJJX 1LBCA 1NKXA 2GHBA 5FTIA 3IB1A 5CMCA 3PUXE 2PVUA 3TEPA 3UP9A 3H6WA 1HSJA 3H03A 1SVXB 2OK2A 4F29A 1ZMGA 4ZEBA 2O6AA 1LBBA 1P1QA 3FD3A 4NF4B 4F3SA 3AXFA 1XVXA 3T66A 2THIA 1JETA 3C34A 4IO3A 3FASA 5DVIA 2Q89A 3CFXA 1MM6A 4ZEIA 1B0HA 3VE1B 5H8FB 3S2VA 1MY4A 3VDFA 2Y7PA 2RC7A 4RA1A 3FJ7A 4XKPA 2I4BA 2H98A 4OFOA 1B40A 2O7UA 3ILTB 2V93A 1ZJLA 5CM6A 2F36A 4LUBA 4QFOA 4DXBA 4NWDA 1ATGA 2IEEA 4F1VA 1XT8A 1H44A 3TAJA 3PV0E 3TQWA 1WODA 4H65A 2VD2A 3GLBA 2DE3A 4ZZAA 4YB6A 2A5TB 3T9HB 5HM4B 3LUYA 1LB9A 4RJZA 3K00A 1HSEA 5H8NA 3S9NC 5IKBA 4LZ8A 1QJMA 1TT1A 4RPOA 4GFRA 1MXZA 1QUKA 2O51A 4IGRA 1OVTA 4LQ2A 3EHSA 1B32A 3U72A 5IAIA 2ONRA 3R6UA 1SI0A 5AA1A 1MG1A 4YB5A 5TP9A 1CE2A 3MW0A 4IO6A 4DCYA 1B7UA 1NMUA 2D5WA 1MPDA 5KZTA 3OEMA 2VHAA 3T93B 3CG3A 3ODBA 3I3VA 4G68C 1UTHB 4LONB 2HCAA 3S9EA 3G3GA 2FA7A 3O28A 2F5XA 5JK4A 4GRKA 4OHNA 5FHOA 4AB6A 3OO6A 5AA2D 3RTWB 5TPAB 3QK6A 1AOVA 5JTYA 1O64A 1JW4A 4XIGQ 4RY1A 4ESWA 3PUZE 1O63A 1DTGA 2LAOA 5I56A 3Q29A 1IXHA 5CMBA 2ZYMA 1P1NA 1PBQA 2QPQA 1JEVA 1UIUA 3MQ9A 5DEXA 2RC8A 3R7XA 3VV5A 4M1VA 4Q8RA 2F6PA 3TTNA 2Y7KA 3I5OA 2X7PA 5ELVA 4NWCA 4H8JA 4I8CA 3RPWA 2NWJA 1XHYA 3O6IA 3IB2A 1Y1ZA 3KJ7A 3PUWE 3VXCA 4JXIA 3P7IA 3MJNA 2O7IA 3RNNA 4POWA 2HQ0A 5H8HA 2F7CA 1UTBB 4ZE8A 4Q0CA 2ALUA 2WKYA 1SW1A 4DCXA 2I58A 4DXCA 2VOZA 5AA4B 4C1TA 1FQCA 3MP6A 1Y1MA 3MUQA 1VE4A 1MH4A 1B3EA 3KFMA 2HFBA 4I9DA 4UA8A 3KN7A 4R72A 5ITOA 3K1NA 5L9SA 3GZGA 2XXIA 4NF5B 1USYH 4G8NA 3I6VA 2AL5A 3H6TA 2H5YA 3B7DA 4LATA 4GOTA 3QAXA 1IQ7A 1OQHA 3Q28A 1URDA 2ONKE 4IO2A 1FQBA 1PB7A 2XXXA 2XXQA 1MH3A 4JSDA 3UGWA 2DVCA 2UXAA 3KJTA 1IXCA 3L6HA 3UIFA 3FXUA 4XKQA 2PT1A 4R6YA 3HHFA 1B51A 2I3WA 3KOTA 1N7XA 4BDOA 4NE4A 2B3FA 3K6XA 1FQFA 2Q8JA 2RKMA 1USYE 2I6EA 1MY0A 5LOMA 2VGQA 2ANJA 2R6GE 3V8XB 3VLUA 3OO8A 4R6HA 1LFGA 4RK9A 4FORA 1IZ1A 3O29A 1A55A 4U22A 2XHDA 4PFYA 5AA2B 1NNPA 3O66A 1MDP1 1N3XA 1VFDA 4BDQA 1P99A 2AL4A 1J1NA 1B4HA 3H7MA 2XXHA 1R6ZA 2QS1A 1YCJA 3VLVA 4GF8A 5L9OA 1JW1A 1RKMA 3LSLA 4DLDA 1T0KA 2Y7IA 5DT6A 4IGTA 3DP4A 1NNTA 2UVGA 3LSXA 5KDTB 2I48A 4PETA 4U1OA 1FQDA 1B3GA 4GVOA 3ZKKA 4EF1A 3OSQA 1B5JA 5HBCA 3U8QA 5B70A 3RQTA 4YKJA 2A5SA 3SESA 2FNCA 1RYXA 3QUJA 3CVGA 1LCFA 3BBRA 3IB0A 3FIRA 5I84A 4ONYA 4YKKA 5I57B 3HSTA 3LR1A 4F1YA 5KCJA 4POXA 1RYOA 3MC2A 1B1HA 5CBRA 2DP8A 1MS7A 1MDQA 4LVQA 3B6WA 1PB9A 4I62A 4IO7A 1LGBC 3WAFA 1N0TA 1MY3A 3Q27A 5TU0A 3VLWA 2OBGA 1MPBA 2QS2A 2ZYOA 1XOCA 1JNFA 1JVYA 2VP1A 2B3BA 1H3DA 3TMGA 2OJTA 3PPNA 3MVWA 4MF3A 4H5GA 1LFHA 3DM0A 4M4GA 3FUZA 3T96B 3MVZA 2X7QA 5JEIA 2I0BA 3FGSA 2PBWA 2OWSA 1MY2A 4YAHX 4FATA 3RGYA 1ZU0A 5CRYA 2Z23A 2XD3A 3TUSA 3K6UA 4OQOA 3CRBA 2OZZA 2Q2CA 3M3KA 4EQ7A 4OMBA 4WKMA 3ILUB 4LZ7A 1BKAA 2QL3A 4R6KA 2I49A 5DVJA 2ZNTA 3R26A 1BTJA 4G68B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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