2AL4A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate and cx614.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A02
1DPEA 3LSWA 2ZMBA 4KYSA 4EUOA 1Y3QA 4C1TA 1T0KA 4KHZE 3PV0E 5BWJA 4XKRA 3FUZA 4F29A 1ZMGA 4OERA 1OVTA 1CB6A 2QS1A 4TLMB 2UVGA 3OO7A 1EZPA 2PBWA 1UTBA 4H8JA 2P2AA 5CMKA 3VE1B 4ZECA 3G3IA 1N0TA 2O1MA 3C31A 3O6HA 3EQ1A 3FATA 3PMVA 2DVCA 3HCQA 4RA1A 1NNPA 5JK4A 4R74A 3G3FA 4F19A 3FGSA 3S9LC 3T93B 4U4XA 3A09A 3MVWA 3N5LA 5ISUA 4PFTA 3VDFA 3IB1A 2OK2A 1H44A 2NUVA 4F2QA 2DP8A 4X48A 2Z23A 4ONYA 4I9DA 3PU5A 4JBZA 4IY6A 1AL3A 1FTKA 1N3WA 3VLVA 2G93A 3TPAA 3PUYE 4RJZA 3KG2A 4GXSB 4MLQA 3FIRA 4PQJA 2HAVA 3O28A 1ZU0A 2V25A 3FV2A 4NWDA 1MS7A 2XX7A 2AL4A 3IOTA 3PD9A 3LUYA 2ZXTA 3MVXA 5H8NB 1OVBA 5DT6A 3MAMA 3TODA 4JB7A 5IAIA 2R71A 4WKMA 3BFUA 1B7ZA 4DDDA 1FTLA 4KCCA 4H65A 3O66A 4HTGA 2IEEA 1PB7A 1MY3A 3OO8A 4RK9A 4GOTA 1NH7A 1LGBC 2Y7RA 4LA9A 4ESXA 3TCHA 2A5TB 3KN8A 3RT8A 3FJGA 5CBRA 3LSXA 2Y7PA 4LZ8A 3O6IA 4AB6A 1TXFA 3TZAA 1MY2A 3MUQA 1LB9A 3UK4A 1HSLA 4PE5B 3OSQA 2UVHA 4GXAA 2ALUA 4YB7A 3OO6A 4Q8RA 1KWHA 5L9MA 3I6VA 1MG1A 1R6ZA 2F8DA 4F31B 1B3EA 2Q2AA 3Q26A 2ZYKA 4F3SA 3WAEA 2XHDA 3PGFA 1FQFA 5H8NA 2H98A 2H25A 4QSEA 3S4UA 1NNKA 1BLFA 1DTZA 3KOSA 4YB5A 4RY1A 1QULA 2DQVA 2XD2A 1YTVA 3TTMA 2XXUA 1B5HA 4DXUA 1NNTA 2VD3A 5I56B 1LB8A 3JYRA 3TTNA 4GIZA 1OQGA 3T96B 4ZDMA 3SDFA 3H6UA 2PVUA 2A5TA 1JEUA 3TKDA 1H3DA 3PMWA 1J1NA 2DYXA 2REJA 1MQGA 4WXJA 4OFOA 3I5OA 1F9BA 3PUZE 4ZEKA 4H5FA 3CR9A 3TQLA 3PPOA 5FHMA 3CFLA 3IB2A 4LATA 4U4SA 4JSOA 2AL5A 2W7YA 1Y3PA 3K2DA 1VE4A 3SESA 1IXCA 3V89B 1M5FA 1UIUA 3T9XB 2ABHA 2IA4A 3FASA 1B32A 2XX8A 1ANFA 4N6PA 3UA8A 2QRYA 2OCUA 3MZBA 5FTHA 4THIA 3R7XA 3OOAA 2YPNA 4LQ5A 4GVOA 1BIYA 3DP4A 3O2AA 1B9JA 4YB6A 2F34A 1QUKA 3IO4A 1O63A 2KLFA 1LLSA 2HFBA 3V5AA 4FE8A 4IO4A 1D4NA 4ZZAA 1VSOA 4U23A 4G4PA 2Z8FA 1B40A 1PDAA 5TU0A 1B3FA 4FIMA 1LAGE 1B2HA 4LONB 3I3VA 4M4GA 3TFLA 3VVFA 2RF1A 4EXLA 4KYDA 1A99A 4OEUA 2Q8JA 2YLNA 2HEUA 1P99A 1USYH 4IGTA 1FCKA 5DEXA 4ZS9A 1US5A 3KJ7A 3OO9A 2DXRA 2XXWA 3W15C 3IL1B 3RLFE 2ESNA 1B7HA 2DXYA 5DVIA 2ONSA 4GF8A 3H06B 2OWSA 3H6WA 4MBPA 4ZEDA 2Q89A 5AA2B 1N76A 4QSCA 4POWA 2Z8EA 1JW1A 2Q2CA 1S7YA 3H4ZA 4GFRA 4ZEFA 1B58A 5DYHA 2F7CA 2AIXA 2ONRA 4F22A 3T9VA 4ELOA 3SEWA 5A5XB 3EHSA 3U93A 3TTKA 4LZ7A 3MWBA 4GLIA 1PBQA 4YU0A 4ELQA 1AIVA 3GBBA 2GH9A 2ZYMA 1SVXB 3G3HA 4R2FA 1B3LA 4R9GA 3IO6A 2X7PA 1B5JA 3MJNA 3ZSFA 3V8XB 2Q9TA 1SQYA 3TAJA 3SEYA 1A8EA 4JSDA 4BDMA 2H9BA 4H67A 5L9OA 1URGA 4YMAA 3F11A 1XOCA 1XVXA 5KZTA 2VD2A 3RPWA 3G3GA 3CIJA 3K6UA 4Z7EA 3H6TA 2I58A 3MP8A 1SI1A 1LSTA 4Q5TA 1MH3A 3JZJA 1PBPA 3Q28A 4OZ9A 2LAOA 3C36A 5AA2A 2QL3A 1Z7NE 2GFEA 3V83A 2Q88A 1QKBA 3OELA 3CFXA 2BJJX 4ESWA 1R9LA 4KPTA 5A5XA 1MM7A 3M3FA 3FJMA 4FEDA 3N26A 1Q1KA 1XHYA 2VHAA 3ILTB 3K6XA 3B7DA 4U21A 4E0WA 5CI5A 4DE8A 3E3KA 1MH4A 2DE4A 3QSLA 5DVJA 5I59B 2XXVA 5BUUA 3QIMA 4LUBA 2B65A 1Y1ZA 3DLNA 1B1HA 1H76A 5TP9B 2OZZA 1FTJA 3VXCA 3KOTA 1Y4CA 4X1BA 1MXVA 3PPRA 5L9SA 4HW8A 1HSEA 2THIA 1IEJA 1Y3NA 3DELB 4DXBA 3PPQA 3PPPA 2YJPA 4P0IA 3UORA 4C1UA 1OQHA 1GTKA 2CMOA 4R2BA 3L6HA 3MPLA 2E0SA 3OSRA 4XKNA 4QFLA 3PMXA 1Y20A 1B52A 4P11A 3A3UA 1B46A 4DCXA 2QS2A 4F1UA 4OETA 4OQOA 4Z0IA 4ECFA 2NOOA 2NWJA 3UIFA 1ATGA 4ZE9A 4KR5A 1URSA 3T9HB 4RPNA 4N07A 2F7AA 4C0RA 2UXAA 2PT2A 1JVXA 3ZS6A 1I6BA 5KCJB 5EHMA 3RNNA 1O64A 1SYIA 5ELVA 1ZKBA 2PMSA 4X1DA 4BDRA 5I59A 1SW5A 3R26A 4XKPA 1QUJA 3FV1A 5TP9A 4L17A 1QUIA 3U92A 4RK2A 4IGRA 4F39A 1AMFA 4ELPA 1YPNA 5I58B 3KN3A 4NMYA 3TQWA 3SEXA 4QFOA 3TCGA 2I49A 3MC2A 1ZLQA 1MY1A 4UA8A 1D3KA 3W9VA 2F78A 5FHNA 1PB9A 5AA3A 2Y7IA 3SEUA 2XXTA 2VGQA 3RN8A 3FXQA 3SKPA 3IJXB 1MXUA 1Y4TA 1Y9UA 5DVFA 2F7BA 4YKKA 3VVEA 3ONMA 1SW4A 1VFEA 1POTA 3L6GA 5KCJA 1MPBA 3LC8A 2B3FA 3K4UA 5CRYA 2FYIA 4GRKA 2NVUB 2RC9A 2RKMA 3O29A 1GR2A 3KJTA 1Q35A 1MDP1 1MPDA 1M5CA 4MH5A 2GRVA 3M8UA 3TCFA 3FZVA 1FQDA 3OEMA 2XXQA 4H1XA 1HSJA 1PEBA 1OMPA 3C4MA 3UN6A 4MLVA 2ANJA 4QFPA 1OLAA 3T66A 4RYAA 3QK6A 2XXRA 5I58A 4PFUA 4U2RA 3R6UA 4BDOA 3H6VA 1BTJA 3VFJA 3O97A 5ITPA 4JXIA 4NF5B 1A55A 2DWIA 3GXAA 4K3FA 4EXKA 1VR5A 1OLCA 4IY5A 3K01A 4IO6A 4FJPA 2O7UA 5KDTB 5ICTA 1SBPA 1OIBA 4G68B 3S9NC 1IZ1A 2V3TA 2OJTA 5DEXB 4DXCA 1LBBA 1CE2A 4G8NA 4NF4B 5M2VA 4PFYA 2DWJA 3LR1A 4WEPA 5EHSA 3O6GA 5J1DA 1SD3A 3TYHA 3MZ1A 3RT6B 1P1NA 3EHTA 2DWAA 5I2KB 1NKXA 1ZTYA 4EDPA 3JV9A 2P1SA 3VXBA 2GHAA 3UP9A 4ISUA 4I62A 1B3HA 1ZJLA 2XX9A 1EZ9A 3HPIA 3TDJA 2RC8A 1US4A 3MP1A 2XXPA 1I69A 3HN0A 4HCYA 3FJ7A 4NF5A 1ZBMA 5I57B 2ONKE 3E13X 1QJMA 4H5GA 1P1OA 2H5YA 3E9XA 2P0SA 4OMBA 4X9TA 3BFTA 5KDTA 4FAJA 4G68A 3K00A 4FECA 5TPAA 3RUMA 4WEDA 1PC3A 4NF4A 5JTYB 1RYXA 1LFHA 3MPKA 4OESA 3IOUA 3EN3A 2QMWA 3PUXE 4G8HA 4R73A 2DE2A 3IOVA 3USDA 3PD8A 4NF6B 5CMCA 1NNFA 1D9VA 5I2KA 2XXXA 3M3LA 3QUJA 3KBRA 3BKIB 4IO2A 2QMXA 4BDLA 1VFDA 1DOTA 2HCAA 2RC7A 1S9TA 5JEIA 2AYSA 5CMBA 3CI8A 4OVJA 1NH8A 3S9EA 2DVZA 2UVJA 3TMGA 4F3BA 3TTRA 2WKYA 2UYEA 2PYYA 3OMBA 2HZLA 3CSGA 2O69A 5I57A 3PUVE 4GWOA 1N3XA 4I1DA 3U94A 4MFIA 3IOWA 5F7VA 3GBAA 1IQ7A 2UYFA 1XS5A 1L5TA 1LAFE 5IKBA 4LZ5A 2HQ0A 3TUSA 1FW0A 1MXWA 3KZGA 3RGYA 5EYFA 2I4CA 4LP2B 2V3QA 5JTYA 4O3AA 4H6DA 1WVJA 1QVSA 2CZLA 3KEIA 3RTFB 3ZKLA 4GQOA 1GGGA 4KYEA 1JNFA 4R72A 4NF6A 3C33A 2V84A 4NE4A 4OHNA 3ILUB 3Q29A 1XC1A 1DPPA 3AXFA 2H4IA 3VVDA 4O3CA 1R9QA 1MY4A 1H45A 3T22A 3B6WA 4HS7A 1H43A 5ICQA 4ZEIA 5HM4B 1A40A 3U72A 3PPNA 4H0WA 3B6TA 1LBCA 1A7LA 1RKMA 3PUWE 1I6QA 4EQ7A 1MQDA 3U1OA 1R1NA 4H8IA 4QFKA 3FVGA 1NL5A 3DM0A 4OFJA 1I6AA 1ELJA 4FATA 1EZOA 3K6VA 2I0BA 4TOZA 4IB2A 1SW2A 4P0GA 4R75A 1TWYA 5H8QB 2O6AA 3TELA 4FORA 1URDA 5I84A 1B51A 2Y7WA 5CM6A 5H8HB 4QF9A 4LVQA 3MVZA 4FEBA 2ZNTA 3P7IA 4R6HA 1D9YA 4PETA 3FXRA 1PB8A 1N84A 3IJOB 1MXZA 2I4BA 4U22A 3QUFA 2DOJA 1B5IA 3S9MC 3IX1A 1JW5A 4KI0E 3K1PA 1UIVA 4YAHX 1M5BA 4EQBA 3G3KA 3MP6A 4DZ1A 3DP6A 3GZGA 1B4HA 2RCBA 4BLAA 2I48A 2HXWA 4NWCA 3CVGA 3HSTA 5H8QA 4IO3A 2QSXA 2QS4A 4PFWA 1TT1A 3FVKA 4DLDA 4XKQA 3OXNA 3KFMA 4OEVA 2A5SA 1RYOA 2V93A 4TQUQ 5AA1A 3MW0A 1SYHA 5H8HA 2O1LA 2VP1A 1LAHE 1SW1A 3ODBA 2DSFA 1N04A 1LAXA 1MQJA 4ZE8A 2I3VA 1LCTA 1JQFA 2O7IA 3A3CA 1NFTA 2H99A 4OYVA 5CC2A 1DMBA 1SDXA 2GHBA 3WAFA 2D5WA 1B0HA 3H3GA 3HHFA 3DP8A 1N7WA 4RPOA 4YICA 4OFLA 3FVOA 3KSXA 3RTWB 1YAEA 3VV5A 1B0LA 4BDNA 1YCJA 4QFNA 3N6TA 1WODA 1MY0A 2Z8DA 4RXLA 2O51A 4N13A 3TEPA 1EU8A 4OXVA 3G3JA 4R6KA 4YKJA 4U1ZA 3C9HA 1MPCA 4ND9A 2X7QA 1B4ZA 3RQTA 1XT8A 3ECRA 1B6HA 5FTIA 4EF1A 4KCDA 2F36A 4Q30B 2Y84A 4ZEBA 4TLLB 3OD7A 3CSBA 3FXUA 2PX1A 5CBSA 2OLBA 4G77A 3VLUA 3FVNA 2XXHA 4F18A 5F1QA 1JW4A 1MM6A 4EF2A 1BKAA 1MQHA 2I6EA 3LSFB 2DE3A 4QRZA 3K1MA 3M3KA 1IXIA 3G7WA 3SERA 3MQ9A 2HAUA 1BP5A 4KFQA 5AA2D 3EF7A 1FTMA 4KD5A 2ZNSA 3THIA 2PT1A 4UACA 2B3BA 4E0XA 4R6YA 3QYTA 1JETA 1XVYA 5H8SA 5TPAB 5AA4B 1WDNA 1IXHA 4F3GA 3LBSA 1FQEA 1UTHB 2NXOA 3C35A 4F3PA 2Z22A 4R9FA 1POY1 4MF3A 5L8DA 1M5DA 1TFDA 4DIGA 3EPEA 4GL0A 2E1SA 1B05A 3SEVA 2D3IA 2QS3A 3EHUA 4HCWA 3H7MA 1O7TA 4RNSA 2F6PA 1FQBA 3K0VA 4BDQA 1P1QA 1IXGA 1IIWA 1AOVA 4U1OA 2HZKA 3HO7A 3Q25A 1MRPA 2XD3A 3K02A 1QKAA 1A8FA 3IAZA 1LFIA 3N6UA 1B1XA 3MVYA 2O68A 2D21A 3K1NA 3VLWA 3HV1A 5HPQA 3MZ9A 2DS9A 2F35A 3FD3A 5I56A 4YKIA 4NEDA 1MXYA 2FNCA 4JWYA 3OENA 4M1VA 3MBPA 4XXUA 4G68C 2F5XA 5AA4A 3IORA 4YKPA 1JEVA 1TFAA 2XXIA 4XIGQ 3KN7A 3QXMA 2ZYNA 2ZYOA 1UTHA 3W9WA 1B7UA 3HHGA 1LCFA 2VOZA 1MQIA 5HBCA 2XXYA 4PP0A 4F1YA 1II5A 2UVIA 3GLBA 4G2ZA 3OEKA 1GVCA 4YZZA 4JDFA 4QHQA 3S2VA 4ELRA 3CG3A 1MDQA 5H8FB 4GD5A 2F6GA 1SI0A 5B70A 4JWOA 2OBGA 2FA7A 1N7XA 4NF8B 5ITOA 2QPQA 1GV8A 3TTLA 4LQ2A 4OENA 2R6GE 3IB0A 3SETA 2DWHA 4GL8A 1FQCA 5B7DA 3N94A 4EQ9A 3ZKKA 2QJEA 4DCYA 3IR1A 4G8MA 5DTBA 1DTGA 4OTEA 3O9PA 4NTLA 3CRBA 3CFZA 5I2NB 2OWTA 2ZNUA 3B6QA 5K2YA 1LFGA 1FQAA 1USYE 3D4GA 1P1WA 3KSJA 2V3UA 3UGWA 3C32A 1M5EA 1Z7ME 3E4RA 1DSNA 1Y1MA 3D4CA 1NMUA 2Y7KA 1EH3A 1MXXA 3IK6B 1UTBB 2I0CA 4AB5A 1UQWA 5K2XA 2X26A 4XTCQ 1A54A 4O3BA 2R9JA 4I8CA 1ZIUA 4IO5A 4F1VA 2REGA 1B3GA 4QSDA 4AQ4A 5FHOA 4JWXA 2M8CA 5H8FA 4POXA 3RY3A 1IUDA 1FTOA 5LOMA 4IO7A 1P1UA 2O84X 3Q27A 4NF8A 2RCAA 4F2OA 1AH5A 3K6WA 1IITA 1S50A 3U8QA 3LSLA 3KGCA 4OWDA 5CMMA 4KQPA 2G29A 5AE4A 2I3WA 3T9UA 1QW0A 2RINA 3QAXA 4ZZEA 4YMBA 3H03A 3CG1A 3BBRA 3C34A 2F97A 5I2NA 1JVYA 4Q0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DPEA 3LSWA 2ZMBA 4KYSA 4EUOA 1Y3QA 4C1TA 1T0KA 4KHZE 3PV0E 1NUXA 5BWJA 4XKRA 3FUZA 4I40A 4FBPA 4F29A 1ZMGA 4OERA 1OVTA 4PGPA 1FSAA 1CB6A 2QS1A 4GWWA 4TLMB 2UVGA 3OO7A 1EZPA 2PBWA 1FPIA 1UTBA 4H8JA 2P2AA 2XA5A 5CMKA 3VE1B 4ZECA 3G3IA 4MX6A 1N0TA 2O1MA 3C31A 3O6HA 3EQ1A 3FATA 3PMVA 4GX6A 5ET6A 2DVCA 3HCQA 4RA1A 1NNPA 3MSTA 5JK4A 4R74A 3G3FA 4F19A 4N4UA 3HFUA 3FGSA 3S9LC 3T93B 4U4XA 3A09A 3MVWA 3N5LA 1YXIA 4HXVA 5ISUA 4PFTA 3VDFA 3IB1A 2OK2A 1H44A 2NUVA 4F2QA 1RDZA 2DP8A 4X48A 2Z23A 4ONYA 4I9DA 3B50A 3PU5A 4JBZA 4IY6A 1AL3A 4GWUA 2B4LA 1FTKA 2BJIA 1N3WA 3VLVA 2G93A 3TPAA 3PUYE 4RJZA 3KG2A 4GXSB 4MLQA 3FIRA 4PQJA 2HAVA 3O28A 3T0JA 1ZU0A 2V25A 3FV2A 4NWDA 1MS7A 2XX7A 4OA4A 2AL4A 3IOTA 1FJ9A 3PD9A 3LUYA 2ZXTA 3MVXA 5H8NB 1OVBA 5DT6A 2Q8MA 3MAMA 4O94A 3TODA 4JB7A 5IAIA 2R71A 4WKMA 3BFUA 3BIHA 1B7ZA 2Y5LA 4DDDA 1FTLA 4KCCA 3NOHA 4H65A 3O66A 4HTGA 2IEEA 1PB7A 1MY3A 3GYYA 3OO8A 4RK9A 4GOTA 2CZKA 1NH7A 1LGBC 2Y7RA 4LA9A 1DK4A 4ESXA 3TCHA 2A5TB 3KN8A 3RT8A 3FJGA 5CBRA 1NI9A 3LSXA 1IMAA 2Y7PA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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