2AL4A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate and cx614.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al4A02
2ABHA 2X7PA 3Q27A 5DTBA 2XXRA 2B3BA 2RCAA 2ESNA 4H8IA 2P1SA 5H8SA 2VP1A 1XVXA 3EHUA 5DT6A 1ZU0A 2KLFA 1P1UA 2OLBA 4NF8A 4P0IA 3E9XA 1I6QA 4L17A 3MW0A 5AA2B 1FW0A 4KYDA 1Z7NE 1IXHA 4OFOA 3T66A 3PUXE 3HV1A 4P11A 2WKYA 4TQUQ 1PBPA 4KHZE 3JZJA 1JW5A 2F78A 3KJTA 3MC2A 1TFAA 1FQEA 1QUJA 4OZ9A 1YAEA 3Q28A 3OELA 3V8XB 4JWXA 2A5TB 3UP9A 1NH8A 2O68A 1A40A 3PPNA 5EHSA 4IO6A 3IX1A 3MQ9A 3M8UA 3SETA 1VE4A 4JWYA 4MH5A 3N6UA 4BLAA 1N7XA 1YPNA 3K1NA 3OO9A 1SW2A 4NWDA 4GWOA 4OXVA 2Z23A 4GXSB 3QAXA 5H8QB 3FUZA 1UIVA 1Y1MA 4H5GA 1BP5A 4F3PA 2XX9A 2QL3A 1Y4CA 2ONRA 1URSA 1XOCA 2XXTA 4Q30B 4NF6A 3CFZA 5H8NA 4OESA 4YB6A 3DP8A 3KN3A 1YTVA 3LSWA 3U72A 1FQDA 1TXFA 5I57A 4IO2A 3T93B 3TZAA 3SERA 1USYE 4THIA 3SKPA 3MVXA 5TP9B 3ZS6A 2VGQA 4ESXA 3TCFA 1B9JA 4F18A 1IXGA 4G8NA 4ZZEA 2H4IA 1H45A 3PUWE 3G7WA 1TFDA 4QRZA 4NMYA 3JV9A 2AYSA 4BDNA 3C4MA 1B3HA 4PFTA 3R6UA 3CG1A 2H9BA 1JVYA 1M5CA 3TAJA 5AA2A 2X26A 3C36A 3SEWA 3KZGA 1SW1A 4U2RA 1LB9A 4NEDA 5CC2A 1IEJA 5I58B 1P1OA 4QSEA 2DE4A 3P7IA 3N94A 3MZBA 1I6BA 3ZKKA 2DQVA 4KD5A 3UN6A 1JQFA 4F19A 1MXXA 3VLUA 1AMFA 3TFLA 1TWYA 5FHOA 5TPAB 3W9VA 3FATA 2F97A 4U23A 3A09A 4BDRA 1BLFA 3O6IA 1VR5A 2RC9A 1N04A 4ELQA 3MUQA 1L5TA 2UXAA 4EQ7A 1M5BA 2DWHA 1FQFA 4EXKA 2XXVA 3C33A 4YICA 3L6HA 4F3GA 1P99A 2Y7RA 2LAOA 3CFLA 2VOZA 4OETA 3MBPA 1NH7A 3TTLA 4M4GA 3IOWA 1M5DA 3PUVE 2ZYKA 3B6WA 1O63A 3E3KA 2QSXA 3IL1B 5EYFA 4OHNA 4R9FA 4U4SA 5CI5A 5KZTA 4KPTA 3HSTA 4OVJA 1MY0A 1D4NA 2PYYA 1ZIUA 3K6UA 1A55A 1DOTA 4U21A 3H06B 4FATA 1A99A 4H1XA 3IB2A 3B7DA 2D21A 4X48A 4QFOA 3TEPA 5TU0A 5I84A 4YKPA 3IOVA 3R26A 1Y3QA 5JK4A 1JETA 3MPLA 4ELOA 3H6UA 5DVIA 2DE2A 3N5LA 1LAXA 3CSBA 5CBSA 4PFUA 2Y7KA 4PETA 3Q29A 2W7YA 3T9HB 3KN8A 1S50A 3TCHA 3OO8A 3QSLA 1MQHA 4GLIA 1R9LA 3CRBA 1LBBA 4FAJA 1A7LA 1B0HA 1JEVA 4U22A 1OVTA 1B46A 1BIYA 3OEKA 2O69A 5BUUA 1Z7ME 3QUFA 1Q1KA 5KDTB 1PB7A 2V93A 1ATGA 3V5AA 3G3GA 3KOSA 4C1UA 3U1OA 4OMBA 1SI1A 2Q2CA 3CIJA 2I58A 5TPAA 1II5A 1FQCA 3G3HA 1F9BA 4WEPA 1VFEA 2A5SA 2OWSA 1JW4A 5J1DA 3EF7A 3OSQA 2X7QA 3MP6A 3G3JA 3OXNA 2GHAA 2QJEA 3RT8A 3OEMA 1GR2A 5DEXA 1BKAA 3IOTA 3KSJA 3S9EA 1ZMGA 2I0BA 3KN7A 2HZKA 1US4A 4PQJA 2RF1A 4R2BA 3ILTB 3GLBA 4ELRA 3FXUA 2Q8JA 3O9PA 2PT2A 4I1DA 1B3FA 1B6HA 3RQTA 2QMXA 3N26A 4ZE9A 4R74A 1IUDA 1SVXB 3FD3A 4LONB 4ZEDA 4LA9A 5AA3A 4H8JA 2E0SA 2XXHA 3PD8A 2UVIA 2E1SA 1MY4A 1PDAA 2DWAA 3U93A 3MZ1A 1LCTA 1IZ1A 4OEVA 3O2AA 2HFBA 4F1VA 1PC3A 4BDOA 5I59B 4F22A 2XXUA 1B7HA 5FTHA 4JXIA 3PMWA 5B70A 1B5JA 3MWBA 3T9UA 3TTKA 4KCDA 4PFWA 3D4CA 5H8NB 1US5A 1H3DA 3MAMA 3N6TA 3A3UA 3OOAA 4RYAA 1N76A 4EXLA 4X9TA 4HCWA 2ZXTA 3O6HA 1B7ZA 2FNCA 4UA8A 4ZEBA 3VXCA 4XKNA 3H7MA 5KDTA 4R72A 2F34A 4OTEA 4XKQA 3FXQA 5H8FB 4QSDA 3D4GA 4GOTA 1QULA 4FJPA 2I49A 4LUBA 1SYHA 4MBPA 3MZ9A 2XD3A 3HN0A 2ZNSA 2I4CA 3S9MC 2R9JA 3TTMA 2H5YA 4P0GA 1JVXA 1D9YA 5DVJA 4KYEA 1ZTYA 5H8HB 1MY1A 1NNKA 2ZYOA 5K2XA 3VVFA 4JSOA 4EF1A 4RPOA 1GVCA 4QF9A 3LSLA 4QFKA 1NL5A 3UA8A 2CZLA 4AQ4A 1NNTA 3RNNA 2QS2A 2UYEA 3E4RA 2PBWA 3RTWB 3MVZA 4XXUA 4RJZA 1SI0A 2RINA 1LB8A 2F6GA 2QS4A 3OMBA 1I6AA 4DXUA 4ECFA 3V83A 5AA4A 2F5XA 4GL8A 3KFMA 1XT8A 3VLWA 2DSFA 1MM7A 3MPKA 2OCUA 3CI8A 1NNPA 1JNFA 3EHSA 4IY5A 1OLCA 1B7UA 3A3CA 1VSOA 3FJ7A 2OBGA 5I59A 2YPNA 3O29A 2FYIA 3RPWA 4PE5B 4NF4A 4IO3A 3WAEA 1QJMA 1EU8A 1IXIA 4LP2B 3G3FA 1EZ9A 5HPQA 3KGCA 2DVZA 1DPPA 1LBCA 3FIRA 1P1NA 3T96B 3HPIA 4HW8A 3MVYA 2F36A 2Q2AA 4ZEIA 4JBZA 4YMBA 2NVUB 4H65A 4DLDA 4R6HA 3K1PA 4EUOA 4FECA 5H8FA 4ESWA 2IEEA 3H3GA 3E13X 4YKJA 1H43A 4QHQA 1NNFA 2DS9A 4IGRA 2F35A 4WEDA 1FCKA 3TODA 4G8MA 2AIXA 1LFGA 3T22A 4M1VA 4R9GA 3EHTA 1B1XA 1POTA 3C31A 3H6TA 1FTLA 5CMBA 2P0SA 5CMKA 5H8HA 2HAVA 4F2OA 2YJPA 3B6TA 1R6ZA 2ZYMA 3OSRA 4EQBA 3K6WA 2R6GE 1N84A 3K01A 1WDNA 3H6VA 1MXUA 1LSTA 5FHNA 2QPQA 4H0WA 3I6VA 4F1YA 1MQDA 3TQLA 3UIFA 3VVDA 3WAFA 4C0RA 1B51A 3LUYA 4GD5A 1OLAA 4OYVA 4GVOA 2D5WA 3HO7A 3Q25A 3CFXA 1AOVA 3B6QA 3PMVA 1LAGE 4OERA 2B65A 1LLSA 5CBRA 4I9DA 1XS5A 4ZE8A 5AA2D 1MXZA 2QS3A 3FVNA 4H6DA 2O7IA 5ISUA 4G2ZA 4ONYA 5DEXB 4YU0A 1MQGA 3OENA 4OWDA 3CG3A 2ZYNA 3O28A 3Q26A 1MXYA 4GF8A 1QVSA 2ZNUA 2ALUA 3GBBA 1EZOA 3IB0A 4XKPA 4GFRA 2NUVA 5BWJA 4LQ5A 4GQOA 5I56B 4ISUA 2V3UA 1EZPA 4LZ8A 5M2VA 3RLFE 5IAIA 3K4UA 2XHDA 2I3VA 3RY3A 1OQGA 3KOTA 2QS1A 2RCBA 3IAZA 3VLVA 1MS7A 1MPDA 5ITPA 1FTJA 1LGBC 3W15C 3TYHA 4NTLA 2Z8DA 4ZEKA 2I6EA 3K2DA 2YLNA 3M3LA 3AXFA 3O6GA 3O66A 3RT6B 3PV0E 3PPOA 4FEBA 4LZ5A 4I62A 4KCCA 3UK4A 2OZZA 4WKMA 1B58A 1KWHA 3LR1A 1UIUA 4G77A 3EN3A 1R1NA 3TTRA 5F7VA 1D9VA 3ZSFA 3DP4A 1QKAA 4HTGA 1S9TA 4R6YA 1Y3PA 1H44A 3IJXB 2UVHA 4MLQA 2PT1A 3FZVA 1HSJA 1HSLA 3GBAA 3CSGA 1MRPA 2RC8A 2V3QA 1QW0A 1FTMA 1B3LA 1TT1A 2V3TA 4FE8A 4QSCA 2AL4A 4BDQA 4DXBA 4U1OA 1JEUA 1OIBA 4QFLA 4Z7EA 5L8DA 2M8CA 1LFHA 4C1TA 1DPEA 5ITOA 4MLVA 4RNSA 3DP6A 3TQWA 3VFJA 3RTFB 3K0VA 1FQBA 3H03A 1MPCA 2O1MA 3ILUB 3OD7A 4K3FA 4GIZA 1MH3A 1OMPA 2DWJA 4F2QA 3R7XA 2ZNTA 4IB2A 4F39A 3CVGA 3SEXA 1MXWA 5AA4B 5I56A 1O64A 2XXXA 3SDFA 3VXBA 4U1ZA 4QFNA 2XX7A 5KCJA 4R6KA 2HXWA 2G29A 4NF5B 2DVCA 4JB7A 3KJ7A 3IO6A 4JSDA 5L9MA 1MDP1 4E0XA 5HM4B 3M3KA 4DXCA 4NF4B 3UGWA 1R9QA 2F6PA 1PB8A 1M5EA 4KFQA 3FJGA 3LC8A 1DMBA 4ZDMA 1ZKBA 1MQIA 5AA1A 4AB5A 1P1QA 2IA4A 4QFPA 1URDA 1B2HA 1B1HA 4ELPA 3S9NC 3HCQA 5A5XB 2O1LA 3KSXA 4Q8RA 4E0WA 4YB7A 4UACA 2AL5A 4GRKA 3IK6B 3C32A 2Q89A 3QXMA 4O3BA 2UVJA 4OENA 2ANJA 3IO4A 2XX8A 1XC1A 1B0LA 1LCFA 1SW4A 2F7BA 1SD3A 2D3IA 1VFDA 2B3FA 4O3AA 3PPRA 4EDPA 4LATA 4IO4A 2NWJA 1EH3A 4YKKA 4R73A 3I3VA 3QYTA 1Y20A 3U92A 1CB6A 3JYRA 4DIGA 3M3FA 1UTHA 1P1WA 4HCYA 1IXCA 2PMSA 2ONSA 5L9OA 5CM6A 3BBRA 1Y4TA 4XKRA 2XXYA 4F31B 2DE3A 3K00A 4OEUA 1B3GA 5LOMA 3T9XB 4RY1A 3VV5A 2Y84A 5FTIA 2DOJA 5I2KB 1A8FA 1LFIA 1IIWA 5ELVA 1GTKA 4YKIA 3RGYA 3FVOA 1XVYA 4NF5A 4YZZA 3ONMA 3MP1A 2RC7A 1FQAA 1N3XA 5CMCA 1Y9UA 2GH9A 3W9WA 3H4ZA 2FA7A 5I2NB 3HHGA 3U94A 1B5IA 3TTNA 4G68C 3C35A 3PUZE 2XXQA 4F1UA 2V84A 3FVGA 4IO7A 4WXJA 3HHFA 1M5FA 1IITA 2HQ0A 4DE8A 3MVWA 3FGSA 4H67A 4TOZA 1GV8A 5F1QA 5JEIA 3RN8A 2XD2A 1SDXA 4LVQA 4ND9A 1RKMA 4KQPA 5A5XA 1B3EA 1BTJA 1H76A 3SEUA 4G4PA 4RA1A 4X1DA 3IB1A 5AE4A 4DCYA 2QMWA 1DTGA 4XIGQ 3BKIB 3MP8A 4EQ9A 1XHYA 3QUJA 4KR5A 1IQ7A 2O84X 2CMOA 1RYOA 4GL0A 1LAHE 3LSXA 4EF2A 3TCGA 3K1MA 3TPAA 1UTBB 1PEBA 1ELJA 3FASA 2PVUA 2NXOA 2H25A 2Z8EA 1GGGA 1WVJA 4IGTA 2XXWA 3OO7A 4KYSA 1RYXA 1B32A 3ZKLA 4LQ2A 4YAHX 5HBCA 3USDA 1CE2A 4YB5A 2GRVA 1AH5A 1URGA 1S7YA 3PMXA 1N7WA 4XTCQ 5ICQA 1OVBA 4F3BA 4RPNA 2QRYA 3EQ1A 2HAUA 2A5TA 1SW5A 3S9LC 4Q5TA 2I48A 5I2KA 3IJOB 4IY6A 4R2FA 3EPEA 2THIA 5DYHA 1B5HA 4RK9A 3I5OA 3QIMA 2OK2A 1FTOA 3S2VA 4I8CA 1HSEA 4IO5A 5EHMA 5I2NA 1POY1 4GXAA 5H8QA 2DP8A 3TELA 2UYFA 2R71A 3GZGA 3VE1B 2I4BA 3KG2A 3QK6A 1QUIA 2REGA 3DLNA 3LSFB 5IKBA 3PUYE 1B52A 3VVEA 2V25A 4OFJA 3V89B 3K6XA 1SBPA 1MQJA 2Z22A 4PP0A 3S4UA 4RK2A 3ODBA 4R75A 2BJJX 3PU5A 1Y3NA 1ZBMA 2Y7PA 2Q9TA 1B40A 1MM6A 5JTYB 2Y7IA 2HZLA 4ZZAA 5TP9A 5KCJB 3F11A 4PFYA 1WODA 3L6GA 3FV1A 3PGFA 2XXIA 3KBRA 4ZECA 5DVFA 1MG1A 3C34A 4DCXA 4BDMA 4YMAA 3KEIA 2DXYA 2P2AA 4AB6A 3IORA 2H98A 4Z0IA 3BFTA 1UTBA 2UVGA 3VDFA 4NWCA 1NMUA 1JW1A 3CR9A 1MY2A 3RUMA 1USYH 3T9VA 2OJTA 2DYXA 2HCAA 4BDLA 3O97A 4FEDA 4ZEFA 5ICTA 1NKXA 1Y1ZA 1ZLQA 3K02A 1MH4A 2RKMA 1UQWA 3TMGA 5I58A 4NE4A 2O51A 2OWTA 1QKBA 4LZ7A 3IOUA 1O7TA 3TDJA 3IR1A 4Q0CA 1D3KA 1J1NA 1NFTA 1OQHA 4DZ1A 2F8DA 3FV2A 4G68B 1MDQA 5L9SA 2GHBA 3THIA 1A54A 5CMMA 3K6VA 1PBQA 3FVKA 2ZMBA 4NF8B 3SESA 1MPBA 4POWA 1B4ZA 2O7UA 1SQYA 4HS7A 4OFLA 1Q35A 1FTKA 1UTHB 3GXAA 3SEVA 5B7DA 4TLLB 1B4HA 1QUKA 4JDFA 1SYIA 2F7CA 3OO6A 3FJMA 4N6PA 3FXRA 3SEYA 1AL3A 3ECRA 3G3IA 3PPQA 1B05A 1DSNA 1A8EA 3TUSA 4JWOA 2HEUA 2O6AA 5K2YA 5JTYA 1LAFE 1MXVA 3DM0A 4N13A 3MJNA 4DDDA 3G3KA 1N0TA 4O3CA 5FHMA 2Q88A 2Y7WA 2DWIA 2PX1A 4N07A 2I0CA 3BFUA 1YCJA 4TLMB 1ANFA 4OQOA 2H99A 4F29A 4KI0E 2F7AA 3DELB 3PD9A 4X1BA 4ZS9A 4MF3A 2Z8FA 2G93A 2VHAA 1AIVA 4H5FA 4NF6B 1ZJLA 3LBSA 4POXA 2GFEA 5CRYA 2XXPA 2DXRA 1MY3A 4MFIA 2VD3A 2NOOA 5I57B 1I69A 4FORA 4RXLA 3UORA 3PPPA 3C9HA 3H6WA 4FIMA 4G8HA 3U8QA 1N3WA 2REJA 2VD2A 2I3WA 4U4XA 4G68A 1PB9A 1DTZA 3TKDA 4F3SA 2ONKE 1T0KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CNQA 2ABHA 2X7PA 3Q27A 5DTBA 2XXRA 2B3BA 2RCAA 2ESNA 4H8IA 3NOHA 3A29A 2P1SA 5H8SA 2WBBA 2VP1A 1XVXA 1DK4A 2B4MA 3EHUA 5DT6A 1ZU0A 2KLFA 1P1UA 2OLBA 4NF8A 4P0IA 3E9XA 1I6QA 4L17A 3MW0A 5AA2B 1FW0A 4KYDA 1Z7NE 4H45A 1IXHA 4OFOA 3T66A 3PUXE 5EQAA 3HV1A 4P11A 2WKYA 4TQUQ 1PBPA 4KHZE 3JZJA 1JW5A 2F78A 2PFYA 3KJTA 3MC2A 1TFAA 1FQEA 1QUJA 1FPLA 4OZ9A 1YAEA 3Q28A 3OELA 3V8XB 4JWXA 2A5TB 4LN5A 3UP9A 1NH8A 2O68A 1A40A 3PPNA 5EHSA 4IO6A 3IX1A 3MQ9A 3M8UA 2WEFA 1VE4A 4JWYA 3SETA 4MH5A 3N6UA 4BLAA 4OANA 1N7XA 1YPNA 4OVRA 3K1NA 3OO9A 1SW2A 4NWDA 4GWOA 4OXVA 2Z23A 2F3BA 4GWUA 4GXSB 3QAXA 5H8QB 3FUZA 1UIVA 1Y1MA 4H5GA 4I3YA 3PTYA 1BP5A 4F3PA 2XX9A 2QL3A 5IZ3B 1Y4CA 2ONRA 1NV2A 1URSA 1XOCA 2XXTA 4Q30B 4NF6A 3CFZA 5H8NA 4MNCA 4OESA 4YB6A 1FPIA 3DP8A 3KN3A 1YTVA 3LSWA 3U72A 1FQDA 1TXFA 5I57A 4IO2A 3T93B 3TZAA 3SERA 1USYE 4THIA 3SKPA 3MVXA 1EYKA 5TP9B 3ZS6A 2VGQA 4ESXA 3TCFA 1G0HA 1B9JA 4F18A 1IXGA 4G8NA 4ZZEA 2H4IA 1H45A 5F24A 3PUWE 2CZIA 3G7WA 1TFDA 4QRZA 2FBPA 4NMYA 3JV9A 4FBPA 2AYSA 4BDNA 3C4MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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